SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CA265_RS08565 FitnessBrowser__Pedo557:CA265_RS08565 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 15 hits to proteins with known functional sites (download)

B9JK80 D-apiose dehydrogenase; EC 1.1.1.420 from Rhizobium rhizogenes (strain K84 / ATCC BAA-868) (Agrobacterium radiobacter)
22% identity, 89% coverage: 31:350/360 of query aligns to 20:336/345 of B9JK80

query
sites
B9JK80
H
 
Q
L
 
M
P
 
H
A
 
A
Y
x
W
K
|
K
-
 
D
I
x
V
A
 
K
G
 
G
F
x
A
E
 
G
V
 
I
H
 
A
G
 
A
I
 
I
V
 
C
N
x
D
R
 
R
T
 
D
K
 
P
E
 
K
R
 
R
A
 
L
Q
 
K
K
 
L
L
 
V
A
 
G
D
 
D
T
 
Q
F
 
F
G
 
G
I
 
I
L
 
E
N
 
R
V
 
R
Y
 
Y
N
 
G
S
 
D
V
 
A
A
 
A
E
 
A
A
 
L
V
 
F
K
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
A
N
 
D
A
 
G
V
 
G
Y
 
F
D
 
D
L
 
F
T
 
V
I
 
D
M
 
I
P
 
A
E
 
T
Q
 
T
Y
 
-
I
 
V
E
 
Q
T
x
S
L
 
H
K
 
R
Q
 
A
L
 
L
P
 
V
D
 
E
G
 
M
S
 
A
A
 
A
V
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
V
-
 
P
-
 
A
L
 
I
I
 
C
Q
|
Q
K
|
K
P
 
P
M
 
F
G
 
A
D
 
K
D
 
S
F
 
L
T
 
S
Q
 
D
A
 
A
K
 
K
E
 
A
I
 
M
L
 
V
E
 
R
L
 
T
C
 
C
R
 
E
A
 
N
K
 
A
N
 
D
L
 
I
K
 
P
A
 
L
A
 
M
I
 
V
N
 
H
F
 
E
Q
x
N
L
 
F
R
 
R
F
 
W
A
 
Q
P
 
T
F
 
P
V
 
I
S
 
Q
A
 
A
A
 
V
K
 
K
Y
 
A
L
 
V
I
 
L
D
 
E
K
 
S
G
 
G
L
 
A
I
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
P
Y
 
F
D
 
-
M
 
-
E
 
W
V
 
G
R
 
R
V
 
F
T
 
S
V
 
F
K
 
R
T
 
S
P
 
G
W
 
F
E
 
D
I
 
V
F
 
F
-
 
S
-
 
G
-
x
Q
P
|
P
H
x
Y
V
 
L
I
 
A
I
 
E
H
 
G
P
 
E
R
 
R
L
 
F
E
 
I
I
 
I
Q
 
E
Y
 
D
H
 
L
S
 
G
I
 
I
H
 
H
Y
 
T
V
 
L
D
 
D
L
 
I
I
 
A
R
 
R
S
 
F
F
 
I
L
 
L
G
 
G
N
 
D
P
 
V
E
 
A
S
 
T
I
 
L
L
 
T
A
 
A
K
 
R
T
 
T
L
 
K
K
 
R
H
 
V
P
 
N
A
 
P
K
 
K
N
 
I
L
 
K
S
 
G
S
 
E
S
 
D
R
 
V
S
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
F
 
L
D
 
D
Y
 
H
G
 
Q
D
 
N
T
 
G
M
 
A
H
 
T
A
 
S
V
 
I
I
 
V
N
 
D
T
 
V
N
 
S
H
 
Y
D
 
A
H
 
T
D
 
K
F
 
L
G
 
G
P
 
T
N
 
E
-
 
P
H
 
F
Q
 
P
E
 
E
S
 
T
Y
 
L
I
 
I
K
 
D
W
 
I
E
 
D
G
 
G
T
 
T
K
 
Q
G
 
G
A
 
T
I
 
I
V
 
R
A
 
L
K
 
S
I
 
Q
G
 
G
L
 
Y
L
 
R
M
 
L
D
 
E
Y
 
V
-
 
T
-
 
G
P
 
P
H
 
N
G
 
G
V
 
M
-
 
T
-
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
A
-
 
S
P
 
P
D
 
Q
V
 
L
F
 
L
E
 
S
Y
 
W
C
 
A
I
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
S
A
 
R
A
 
P
W
 
W
Q
 
H
T
 
N
V
 
I
K
 
Q
L
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
-
W
 
-
F
 
-
P
 
-
E
 
E
A
 
S
F
 
V
I
 
L
G
 
A
T
 
I
M
 
Q
A
 
Q
N
 
H
L
 
W
M
 
T
-
 
D
R
 
R
Y
 
L
N
 
S
E
 
S
G
 
G
S
 
G
A
 
E
A
 
T
I
 
-
L
 
-
H
 
S
T
 
T
S
 
S
V
 
G
E
 
A
D
 
D
V
 
N
I
 
L
Q
 
K
T
 
T
M
 
F
A
 
A
V
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
A
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
E
S
 
S
S
 
A
D
 
A
I
 
N
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5uiaA Crystal structure of an oxidoreductase from agrobacterium radiobacter in complex with NAD+, r-2,3-dihydroxyisovalerate and magnesium
22% identity, 89% coverage: 31:350/360 of query aligns to 17:333/342 of 5uiaA

query
sites
5uiaA
H
 
Q
L
 
M
P
 
H
A
 
A
Y
x
W
K
|
K
-
 
D
I
x
V
A
 
K
G
 
G
F
x
A
E
 
G
V
 
I
H
 
A
G
 
A
I
 
I
V
 
C
N
x
D
R
|
R
T
 
D
K
 
P
E
 
K
R
 
R
A
 
L
Q
 
K
K
 
L
L
 
V
A
 
G
D
 
D
T
 
Q
F
 
F
G
 
G
I
 
I
L
 
E
N
 
R
V
 
R
Y
 
Y
N
 
G
S
 
D
V
 
A
A
 
A
E
 
A
A
 
L
V
 
F
K
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
A
N
 
D
A
 
G
V
 
G
Y
 
F
D
 
D
L
 
F
T
 
V
I
 
D
M
 
I
P
 
A
E
x
T
Q
 
T
Y
 
-
I
 
V
E
 
Q
T
 
S
L
 
H
K
 
R
Q
 
A
L
 
L
P
 
V
D
 
E
G
 
M
S
 
A
A
 
A
V
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
V
-
 
P
-
 
A
L
 
I
I
 
C
Q
|
Q
K
|
K
P
 
P
M
 
F
G
 
A
D
 
K
D
 
S
F
 
L
T
 
S
Q
 
D
A
 
A
K
 
K
E
 
A
I
 
M
L
 
V
E
 
R
L
 
T
C
 
C
R
 
E
A
 
N
K
 
A
N
 
D
L
 
I
K
 
P
A
 
L
A
 
M
I
 
V
N
 
H
F
 
E
Q
x
N
L
 
F
R
 
R
F
 
W
A
 
Q
P
 
T
F
 
P
V
 
I
S
 
Q
A
 
A
A
 
V
K
 
K
Y
 
A
L
 
V
I
 
L
D
 
E
K
 
S
G
 
G
L
 
A
I
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
P
Y
 
F
D
 
-
M
 
-
E
 
W
V
 
G
R
 
R
V
 
F
T
 
S
V
 
F
K
 
R
T
 
S
P
 
G
W
 
F
E
 
D
I
 
V
F
 
F
-
 
S
-
 
G
-
x
Q
P
 
P
H
x
Y
V
 
L
I
 
A
I
 
E
H
 
G
P
 
E
R
 
R
L
 
F
E
 
I
I
 
I
Q
 
E
Y
x
D
H
 
L
S
 
G
I
 
I
H
|
H
Y
 
T
V
 
L
D
 
D
L
 
I
I
 
A
R
 
R
S
 
F
F
 
I
L
 
L
G
 
G
N
 
D
P
 
V
E
 
A
S
 
T
I
 
L
L
 
T
A
 
A
K
 
R
T
 
T
L
 
K
K
 
R
H
 
V
P
 
N
A
 
P
K
 
K
N
 
I
L
 
K
S
 
G
S
 
E
S
 
D
R
 
V
S
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
F
 
L
D
 
D
Y
 
H
G
 
Q
D
 
N
T
 
G
M
 
A
H
 
T
A
 
S
V
 
I
I
 
V
N
 
D
T
 
V
N
 
S
H
x
Y
D
 
A
H
 
T
D
 
K
F
 
L
G
 
G
P
 
T
N
 
E
-
 
P
H
 
F
Q
 
P
E
 
E
S
 
T
Y
 
L
I
 
I
K
 
D
W
 
I
E
 
D
G
 
G
T
 
T
K
 
Q
G
 
G
A
 
T
I
 
I
V
 
R
A
 
L
K
 
S
I
 
Q
G
 
G
L
 
Y
L
 
R
M
 
L
D
 
E
Y
 
V
-
 
T
-
 
G
P
 
P
H
 
N
G
 
G
V
 
M
-
 
T
-
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
A
-
 
S
P
 
P
D
 
Q
V
 
L
F
 
L
E
 
S
Y
 
W
C
 
A
I
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
S
A
 
R
A
 
P
W
 
W
Q
 
H
T
 
N
V
 
I
K
 
Q
L
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
-
W
 
-
F
 
-
P
 
-
E
 
E
A
 
S
F
 
V
I
 
L
G
 
A
T
 
I
M
 
Q
A
 
Q
N
 
H
L
 
W
M
 
T
-
 
D
R
 
R
Y
 
L
N
 
S
E
 
S
G
 
G
S
 
G
A
 
E
A
 
T
I
 
-
L
 
-
H
 
S
T
 
T
S
 
S
V
 
G
E
 
A
D
 
D
V
 
N
I
 
L
Q
 
K
T
 
T
M
 
F
A
 
A
V
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
A
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
E
S
 
S
S
 
A
D
 
A
I
 
N
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5ui9A Crystal structure of an oxidoreductase from agrobacterium radiobacter in complex with NAD+, 2 -hydroxy-2-hydroxymethyl propanoic acid and magnesium
22% identity, 89% coverage: 31:350/360 of query aligns to 17:333/342 of 5ui9A

query
sites
5ui9A
H
 
Q
L
 
M
P
 
H
A
 
A
Y
x
W
K
|
K
-
 
D
I
x
V
A
 
K
G
 
G
F
x
A
E
 
G
V
 
I
H
 
A
G
 
A
I
 
I
V
 
C
N
x
D
R
|
R
T
 
D
K
 
P
E
 
K
R
 
R
A
 
L
Q
 
K
K
 
L
L
 
V
A
 
G
D
 
D
T
 
Q
F
 
F
G
 
G
I
 
I
L
 
E
N
 
R
V
 
R
Y
 
Y
N
 
G
S
 
D
V
 
A
A
 
A
E
 
A
A
 
L
V
 
F
K
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
A
N
 
D
A
 
G
V
 
G
Y
 
F
D
 
D
L
 
F
T
 
V
I
 
D
M
 
I
P
 
A
E
x
T
Q
 
T
Y
 
-
I
 
V
E
 
Q
T
x
S
L
 
H
K
 
R
Q
 
A
L
 
L
P
 
V
D
 
E
G
 
M
S
 
A
A
 
A
V
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
V
-
 
P
-
 
A
L
 
I
I
 
C
Q
|
Q
K
|
K
P
|
P
M
 
F
G
 
A
D
 
K
D
 
S
F
 
L
T
 
S
Q
 
D
A
 
A
K
 
K
E
 
A
I
 
M
L
 
V
E
 
R
L
 
T
C
 
C
R
 
E
A
 
N
K
 
A
N
 
D
L
 
I
K
 
P
A
 
L
A
 
M
I
 
V
N
 
H
F
 
E
Q
x
N
L
 
F
R
 
R
F
 
W
A
 
Q
P
 
T
F
 
P
V
 
I
S
 
Q
A
 
A
A
 
V
K
 
K
Y
 
A
L
 
V
I
 
L
D
 
E
K
 
S
G
 
G
L
 
A
I
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
P
Y
 
F
D
 
-
M
 
-
E
 
W
V
 
G
R
 
R
V
 
F
T
 
S
V
 
F
K
 
R
T
 
S
P
 
G
W
 
F
E
 
D
I
 
V
F
 
F
-
 
S
-
 
G
-
x
Q
P
 
P
H
x
Y
V
 
L
I
 
A
I
 
E
H
 
G
P
 
E
R
 
R
L
 
F
E
 
I
I
 
I
Q
 
E
Y
x
D
H
 
L
S
 
G
I
 
I
H
|
H
Y
 
T
V
 
L
D
 
D
L
 
I
I
 
A
R
 
R
S
 
F
F
 
I
L
 
L
G
 
G
N
 
D
P
 
V
E
 
A
S
 
T
I
 
L
L
 
T
A
 
A
K
 
R
T
 
T
L
 
K
K
 
R
H
 
V
P
 
N
A
 
P
K
 
K
N
 
I
L
 
K
S
 
G
S
 
E
S
 
D
R
 
V
S
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
F
 
L
D
 
D
Y
 
H
G
 
Q
D
 
N
T
 
G
M
 
A
H
 
T
A
 
S
V
 
I
I
 
V
N
 
D
T
 
V
N
 
S
H
x
Y
D
 
A
H
 
T
D
 
K
F
 
L
G
 
G
P
 
T
N
 
E
-
 
P
H
 
F
Q
 
P
E
 
E
S
 
T
Y
 
L
I
 
I
K
 
D
W
 
I
E
 
D
G
 
G
T
 
T
K
 
Q
G
 
G
A
 
T
I
 
I
V
 
R
A
 
L
K
 
S
I
 
Q
G
 
G
L
 
Y
L
 
R
M
 
L
D
 
E
Y
 
V
-
 
T
-
 
G
P
 
P
H
 
N
G
 
G
V
 
M
-
 
T
-
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
A
-
 
S
P
 
P
D
 
Q
V
 
L
F
 
L
E
 
S
Y
 
W
C
 
A
I
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
S
A
 
R
A
 
P
W
|
W
Q
 
H
T
 
N
V
 
I
K
 
Q
L
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
-
W
 
-
F
 
-
P
 
-
E
 
E
A
 
S
F
 
V
I
 
L
G
 
A
T
 
I
M
 
Q
A
 
Q
N
 
H
L
 
W
M
 
T
-
 
D
R
 
R
Y
 
L
N
 
S
E
 
S
G
 
G
S
 
G
A
 
E
A
 
T
I
 
-
L
 
-
H
 
S
T
 
T
S
 
S
V
 
G
E
 
A
D
 
D
V
 
N
I
 
L
Q
 
K
T
 
T
M
 
F
A
 
A
V
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
A
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
E
S
 
S
S
 
A
D
 
A
I
 
N
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5uhzA Crystal structure of an oxidoreductase from agrobacterium radiobacter in complex with NAD+, d-apionate and magnesium
22% identity, 89% coverage: 31:350/360 of query aligns to 17:333/342 of 5uhzA

query
sites
5uhzA
H
 
Q
L
 
M
P
 
H
A
 
A
Y
x
W
K
|
K
-
 
D
I
x
V
A
 
K
G
 
G
F
x
A
E
 
G
V
 
I
H
 
A
G
 
A
I
 
I
V
 
C
N
x
D
R
|
R
T
 
D
K
 
P
E
 
K
R
 
R
A
 
L
Q
 
K
K
 
L
L
 
V
A
 
G
D
 
D
T
 
Q
F
 
F
G
 
G
I
 
I
L
 
E
N
 
R
V
 
R
Y
 
Y
N
 
G
S
 
D
V
 
A
A
 
A
E
 
A
A
 
L
V
 
F
K
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
A
N
 
D
A
 
G
V
 
G
Y
 
F
D
 
D
L
 
F
T
 
V
I
 
D
M
 
I
P
 
A
E
x
T
Q
 
T
Y
 
-
I
 
V
E
 
Q
T
x
S
L
 
H
K
 
R
Q
 
A
L
 
L
P
 
V
D
 
E
G
 
M
S
 
A
A
 
A
V
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
V
-
 
P
-
 
A
L
 
I
I
 
C
Q
|
Q
K
|
K
P
|
P
M
 
F
G
 
A
D
 
K
D
 
S
F
 
L
T
 
S
Q
 
D
A
 
A
K
 
K
E
 
A
I
 
M
L
 
V
E
 
R
L
 
T
C
 
C
R
 
E
A
 
N
K
 
A
N
 
D
L
 
I
K
 
P
A
 
L
A
 
M
I
 
V
N
 
H
F
 
E
Q
x
N
L
 
F
R
 
R
F
 
W
A
 
Q
P
 
T
F
 
P
V
 
I
S
 
Q
A
 
A
A
 
V
K
 
K
Y
 
A
L
 
V
I
 
L
D
 
E
K
 
S
G
 
G
L
 
A
I
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
P
Y
 
F
D
 
-
M
 
-
E
 
W
V
 
G
R
 
R
V
 
F
T
 
S
V
 
F
K
 
R
T
 
S
P
 
G
W
 
F
E
 
D
I
 
V
F
 
F
-
 
S
-
 
G
-
x
Q
P
 
P
H
x
Y
V
 
L
I
 
A
I
 
E
H
 
G
P
 
E
R
 
R
L
 
F
E
 
I
I
 
I
Q
 
E
Y
x
D
H
 
L
S
 
G
I
 
I
H
|
H
Y
 
T
V
 
L
D
 
D
L
 
I
I
 
A
R
 
R
S
 
F
F
 
I
L
 
L
G
 
G
N
 
D
P
 
V
E
 
A
S
 
T
I
 
L
L
 
T
A
 
A
K
 
R
T
 
T
L
 
K
K
 
R
H
 
V
P
 
N
A
 
P
K
 
K
N
 
I
L
 
K
S
 
G
S
 
E
S
 
D
R
 
V
S
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
F
 
L
D
 
D
Y
 
H
G
 
Q
D
 
N
T
 
G
M
 
A
H
 
T
A
 
S
V
 
I
I
 
V
N
 
D
T
 
V
N
 
S
H
x
Y
D
 
A
H
 
T
D
 
K
F
 
L
G
 
G
P
 
T
N
 
E
-
 
P
H
 
F
Q
 
P
E
 
E
S
 
T
Y
 
L
I
 
I
K
 
D
W
 
I
E
 
D
G
 
G
T
 
T
K
 
Q
G
 
G
A
 
T
I
 
I
V
 
R
A
 
L
K
 
S
I
 
Q
G
 
G
L
 
Y
L
 
R
M
 
L
D
 
E
Y
 
V
-
 
T
-
 
G
P
 
P
H
 
N
G
 
G
V
 
M
-
 
T
-
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
A
-
 
S
P
 
P
D
 
Q
V
 
L
F
 
L
E
 
S
Y
 
W
C
 
A
I
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
S
A
 
R
A
 
P
W
 
W
Q
 
H
T
 
N
V
 
I
K
 
Q
L
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
-
W
 
-
F
 
-
P
 
-
E
 
E
A
 
S
F
 
V
I
 
L
G
 
A
T
 
I
M
 
Q
A
 
Q
N
 
H
L
 
W
M
 
T
-
 
D
R
 
R
Y
 
L
N
 
S
E
 
S
G
 
G
S
 
G
A
 
E
A
 
T
I
 
-
L
 
-
H
 
S
T
 
T
S
 
S
V
 
G
E
 
A
D
 
D
V
 
N
I
 
L
Q
 
K
T
 
T
M
 
F
A
 
A
V
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
A
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
E
S
 
S
S
 
A
D
 
A
I
 
N
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5uhwA Crystal structure of an oxidoreductase from agrobacterium radiobacter in complex with NAD+ and magnesium
22% identity, 89% coverage: 31:350/360 of query aligns to 17:333/342 of 5uhwA

query
sites
5uhwA
H
 
Q
L
 
M
P
 
H
A
 
A
Y
x
W
K
|
K
-
 
D
I
x
V
A
 
K
G
 
G
F
x
A
E
 
G
V
 
I
H
 
A
G
 
A
I
 
I
V
 
C
N
x
D
R
|
R
T
 
D
K
 
P
E
 
K
R
 
R
A
 
L
Q
 
K
K
 
L
L
 
V
A
 
G
D
 
D
T
 
Q
F
 
F
G
 
G
I
 
I
L
 
E
N
 
R
V
 
R
Y
 
Y
N
 
G
S
 
D
V
 
A
A
 
A
E
 
A
A
 
L
V
 
F
K
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
A
N
 
D
A
 
G
V
 
G
Y
 
F
D
 
D
L
 
F
T
 
V
I
 
D
M
 
I
P
 
A
E
x
T
Q
 
T
Y
 
-
I
 
V
E
 
Q
T
 
S
L
 
H
K
 
R
Q
 
A
L
 
L
P
 
V
D
 
E
G
 
M
S
 
A
A
 
A
V
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
V
-
 
P
-
 
A
L
 
I
I
 
C
Q
|
Q
K
|
K
P
 
P
M
 
F
G
 
A
D
 
K
D
 
S
F
 
L
T
 
S
Q
 
D
A
 
A
K
 
K
E
 
A
I
 
M
L
 
V
E
 
R
L
 
T
C
 
C
R
 
E
A
 
N
K
 
A
N
 
D
L
 
I
K
 
P
A
 
L
A
 
M
I
 
V
N
 
H
F
 
E
Q
x
N
L
 
F
R
 
R
F
 
W
A
 
Q
P
 
T
F
 
P
V
 
I
S
 
Q
A
 
A
A
 
V
K
 
K
Y
 
A
L
 
V
I
 
L
D
 
E
K
 
S
G
 
G
L
 
A
I
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
P
Y
 
F
D
 
-
M
 
-
E
 
W
V
 
G
R
 
R
V
 
F
T
 
S
V
 
F
K
 
R
T
 
S
P
 
G
W
 
F
E
 
D
I
 
V
F
 
F
-
 
S
-
 
G
-
x
Q
P
 
P
H
 
Y
V
 
L
I
 
A
I
 
E
H
 
G
P
 
E
R
 
R
L
 
F
E
 
I
I
 
I
Q
 
E
Y
 
D
H
 
L
S
 
G
I
 
I
H
 
H
Y
 
T
V
 
L
D
 
D
L
 
I
I
 
A
R
 
R
S
 
F
F
 
I
L
 
L
G
 
G
N
 
D
P
 
V
E
 
A
S
 
T
I
 
L
L
 
T
A
 
A
K
 
R
T
 
T
L
 
K
K
 
R
H
 
V
P
 
N
A
 
P
K
 
K
N
 
I
L
 
K
S
 
G
S
 
E
S
 
D
R
 
V
S
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
F
 
L
D
 
D
Y
 
H
G
 
Q
D
 
N
T
 
G
M
 
A
H
 
T
A
 
S
V
 
I
I
 
V
N
 
D
T
 
V
N
 
S
H
 
Y
D
 
A
H
 
T
D
 
K
F
 
L
G
 
G
P
 
T
N
 
E
-
 
P
H
 
F
Q
 
P
E
 
E
S
 
T
Y
 
L
I
 
I
K
 
D
W
 
I
E
 
D
G
 
G
T
 
T
K
 
Q
G
 
G
A
 
T
I
 
I
V
 
R
A
 
L
K
 
S
I
 
Q
G
 
G
L
 
Y
L
 
R
M
 
L
D
 
E
Y
 
V
-
 
T
-
 
G
P
 
P
H
 
N
G
 
G
V
 
M
-
 
T
-
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
A
-
 
S
P
 
P
D
 
Q
V
 
L
F
 
L
E
 
S
Y
 
W
C
 
A
I
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
S
A
 
R
A
 
P
W
 
W
Q
 
H
T
 
N
V
 
I
K
 
Q
L
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
-
W
 
-
F
 
-
P
 
-
E
 
E
A
 
S
F
 
V
I
 
L
G
 
A
T
 
I
M
 
Q
A
 
Q
N
 
H
L
 
W
M
 
T
-
 
D
R
 
R
Y
 
L
N
 
S
E
 
S
G
 
G
S
 
G
A
 
E
A
 
T
I
 
-
L
 
-
H
 
S
T
 
T
S
 
S
V
 
G
E
 
A
D
 
D
V
 
N
I
 
L
Q
 
K
T
 
T
M
 
F
A
 
A
V
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
A
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
E
S
 
S
S
 
A
D
 
A
I
 
N
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1zh8A Crystal structure of oxidoreductase (tm0312) from thermotoga maritima at 2.50 a resolution
29% identity, 56% coverage: 20:219/360 of query aligns to 8:210/325 of 1zh8A

query
sites
1zh8A
I
 
I
I
 
V
G
|
G
A
x
C
G
|
G
G
x
I
I
x
A
V
 
A
G
 
R
D
 
E
A
 
L
H
 
H
L
 
L
P
 
P
A
 
A
Y
 
L
K
 
K
I
 
N
A
 
L
G
 
S
-
 
H
-
 
L
F
 
F
E
 
E
V
 
I
H
 
T
G
 
A
I
 
V
V
 
T
N
x
S
R
|
R
T
|
T
K
 
R
E
 
S
R
x
H
A
 
A
Q
 
E
K
 
E
L
 
F
A
 
A
D
 
K
T
 
M
F
 
V
G
 
G
I
 
N
L
 
P
N
 
A
V
 
V
Y
 
F
N
 
D
S
 
S
V
 
Y
A
 
E
E
 
E
A
 
L
V
 
L
K
 
E
L
 
S
A
 
G
P
 
L
A
 
V
N
 
D
A
 
A
V
 
V
Y
 
-
D
 
D
L
 
L
T
|
T
I
x
L
M
x
P
P
 
V
E
 
E
-
x
L
-
 
N
-
 
L
Q
 
P
Y
 
F
I
 
I
E
 
E
T
 
-
L
 
-
K
 
K
Q
 
A
L
 
L
P
 
R
D
 
K
G
 
G
S
 
V
A
 
H
V
 
V
L
 
I
I
 
C
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
M
 
I
G
 
S
D
 
T
D
 
D
F
 
V
T
 
E
Q
 
T
A
 
G
K
 
K
E
 
K
I
 
V
L
 
V
E
 
E
L
 
L
C
 
S
R
 
E
A
 
K
K
 
S
N
 
E
L
 
K
K
 
T
A
 
V
A
 
Y
I
 
I
N
 
A
F
 
E
Q
x
N
L
 
F
R
 
R
F
 
H
A
 
V
P
 
P
F
 
A
V
 
F
S
 
W
A
 
K
A
 
A
K
 
K
Y
 
E
L
 
L
I
 
V
D
 
E
K
 
S
G
 
G
L
 
A
I
 
I
G
 
G
E
 
D
L
 
P
Y
 
V
D
 
F
M
 
M
E
 
N
V
 
W
R
 
Q
V
 
I
-
 
W
-
 
V
-
 
G
-
 
M
-
 
D
-
 
E
-
 
N
-
 
N
-
 
K
T
x
Y
V
 
V
K
 
H
T
 
T
P
 
D
W
|
W
E
x
R
I
 
K
F
 
K
P
 
P
H
 
K
V
 
-
I
 
-
I
 
-
H
 
H
P
 
V
R
 
G
L
 
G
E
 
F
I
 
L
Q
 
S
Y
 
D
H
 
G
S
 
G
I
 
V
H
|
H
Y
 
H
V
 
A
D
 
A
L
 
A
I
 
M
R
 
R
S
 
L
F
 
I
L
 
L
G
 
G
N
 
E
P
 
I
E
 
E
S
 
W
I
 
I
L
 
S
A
 
A
K
 
-
T
 
-
L
 
-
K
 
-
H
 
-
P
 
V
A
 
A
K
 
K
N
 
D
L
 
L
S
 
S

Sites not aligning to the query:

2glxA Crystal structure analysis of bacterial 1,5-af reductase (see paper)
26% identity, 69% coverage: 20:266/360 of query aligns to 5:252/332 of 2glxA

query
sites
2glxA
I
 
L
I
 
I
G
|
G
A
|
A
G
x
S
G
x
T
I
|
I
V
 
A
G
 
R
D
 
E
A
 
W
H
 
V
L
 
I
P
 
G
A
 
A
Y
 
I
K
 
R
I
 
A
A
 
T
G
 
G
F
 
G
E
 
E
V
 
V
H
 
V
G
 
S
I
 
M
V
 
M
N
x
S
R
x
T
T
 
S
K
 
A
E
 
E
R
|
R
A
 
G
Q
 
A
K
 
A
L
 
Y
A
 
A
D
 
T
T
 
E
F
 
N
G
 
G
I
 
I
L
 
G
N
 
K
V
 
S
Y
 
V
N
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
E
E
 
E
A
 
L
V
 
V
K
 
G
L
 
D
A
 
P
P
 
D
A
 
V
N
 
D
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
V
L
x
S
T
|
T
I
 
T
M
x
N
P
 
E
E
 
L
Q
x
H
Y
 
R
I
 
E
E
 
Q
T
 
T
L
 
L
K
 
A
Q
 
A
L
 
I
P
 
R
D
 
A
G
 
G
S
 
K
A
 
H
V
 
V
L
 
L
I
 
C
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
M
 
L
G
 
A
D
 
M
D
 
T
F
 
L
T
 
E
Q
 
D
A
 
A
K
 
R
E
 
E
I
 
M
L
 
V
E
 
V
L
 
A
C
 
A
R
 
R
A
 
E
K
 
A
N
 
G
L
 
V
K
 
V
A
 
L
A
 
G
I
 
T
N
 
N
F
 
H
Q
x
H
L
 
L
R
 
R
F
 
N
A
 
A
P
 
A
F
 
A
V
 
H
S
 
R
A
 
A
A
 
M
K
 
R
Y
 
D
L
 
A
I
 
I
D
 
A
K
 
E
G
 
G
L
 
R
I
 
I
G
 
G
E
 
R
L
 
P
Y
 
I
D
 
A
M
 
A
E
 
R
V
 
V
R
 
F
V
 
H
T
 
A
V
 
V
K
 
Y
T
 
L
P
 
P
W
 
-
E
 
-
I
 
-
F
 
-
P
 
P
H
 
H
V
 
-
I
 
L
I
 
Q
H
 
G
P
x
W
R
|
R
L
 
L
E
 
E
-
 
R
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
V
I
 
I
Q
 
L
Y
 
D
H
 
I
S
 
T
I
 
V
H
|
H
Y
 
D
V
 
A
D
 
D
L
 
T
I
 
L
R
 
R
S
 
-
F
 
F
L
 
V
G
 
L
N
 
N
P
 
D
E
 
D
S
 
P
I
 
A
L
 
E
A
 
A
K
 
V
T
 
A
L
 
I
K
 
S
H
 
H
P
 
S
A
 
A
K
 
G
N
 
M
L
 
G
S
 
K
S
 
E
S
 
G
R
 
V
S
 
E
T
 
D
I
 
G
L
 
V
F
 
M
D
 
G
Y
 
V
G
 
L
D
 
R
T
 
F
M
 
Q
H
 
S
A
 
G
V
 
V
I
 
I
N
 
A
T
 
Q
N
 
F
H
 
H
D
 
D
H
 
-
D
 
A
F
 
F
G
 
T
P
 
T
N
 
K
H
 
F
Q
 
A
E
 
E
S
 
T
Y
 
G
I
 
F
K
 
E
W
 
V
E
 
H
G
 
G
T
 
T
K
 
E
G
 
G
A
 
S
I
 
L
V
 
I
A
 
G
K
 
R

Sites not aligning to the query:

4koaA Crystal structure analysis of 1,5-anhydro-d-fructose reductase from sinorhizobium meliloti (see paper)
26% identity, 69% coverage: 20:266/360 of query aligns to 6:253/333 of 4koaA

query
sites
4koaA
I
 
L
I
 
I
G
|
G
A
|
A
G
x
S
G
x
T
I
|
I
V
 
A
G
 
R
D
 
E
A
 
W
H
 
V
L
 
I
P
 
G
A
 
A
Y
 
I
K
 
R
I
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
G
E
 
E
V
 
V
H
 
V
G
 
S
I
 
V
V
 
M
N
x
S
R
x
S
T
 
S
K
 
A
E
 
E
R
|
R
A
 
G
Q
 
E
K
 
A
L
 
Y
A
 
A
D
 
A
T
 
E
F
 
N
G
 
G
I
 
I
L
 
A
N
 
K
V
 
A
Y
 
V
N
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
D
E
 
D
A
 
L
V
 
V
K
 
G
L
 
D
A
 
P
P
 
D
A
 
V
N
 
D
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
I
L
 
S
T
|
T
I
 
T
M
x
N
P
 
E
E
 
L
Q
x
H
Y
 
H
I
 
G
E
 
Q
T
 
A
L
 
L
K
 
A
Q
 
A
L
 
I
P
 
R
D
 
A
G
 
G
S
 
K
A
 
H
V
 
V
L
 
L
I
 
C
Q
 
E
K
|
K
P
 
P
M
 
L
G
 
A
D
 
M
D
 
N
F
 
L
T
 
N
Q
 
D
A
 
G
K
 
C
E
 
E
-
 
M
I
 
V
L
 
L
E
 
K
L
 
A
C
 
C
R
 
E
A
 
A
K
 
-
N
 
G
L
 
V
K
 
V
A
 
L
A
 
G
I
 
T
N
 
N
F
 
H
Q
 
H
L
 
L
R
 
R
F
 
N
A
 
A
P
 
A
F
 
T
V
 
H
S
 
R
A
 
A
A
 
M
K
 
R
Y
 
E
L
 
A
I
 
I
D
 
A
K
 
A
G
 
G
L
 
R
I
 
I
G
 
G
E
 
R
L
 
P
Y
 
I
D
 
A
M
 
A
E
 
R
V
 
V
R
 
F
V
 
H
T
 
A
V
 
V
K
 
Y
T
 
L
P
 
P
-
 
P
-
 
H
-
 
L
-
x
Q
-
 
G
W
 
W
E
 
R
I
 
L
-
 
D
F
 
K
P
 
P
H
 
E
V
 
A
I
 
G
I
 
G
H
 
G
P
 
V
R
 
I
L
 
L
E
 
D
I
 
I
Q
 
-
Y
 
-
H
 
-
S
 
T
I
 
V
H
|
H
Y
 
D
V
 
A
D
 
D
L
 
T
I
 
L
R
 
R
S
 
-
F
 
F
L
 
V
G
 
L
N
 
N
P
 
D
E
 
D
S
 
P
I
 
I
L
 
E
A
 
A
K
 
V
T
 
A
L
 
I
K
 
S
H
 
H
P
 
S
A
 
A
K
 
G
N
 
M
L
 
G
S
 
K
S
 
E
S
 
G
R
 
L
S
 
E
T
 
D
I
 
G
L
 
V
F
 
M
D
 
G
Y
 
V
G
 
L
D
 
R
T
 
F
M
 
R
H
 
S
A
 
G
V
 
V
I
 
I
N
 
A
T
 
Q
N
 
F
H
 
H
D
 
D
H
 
-
D
 
A
F
 
F
G
 
T
P
 
T
N
 
K
H
 
F
Q
 
A
E
 
E
S
 
T
Y
 
G
I
 
L
K
 
E
W
 
V
E
 
H
G
 
G
T
 
T
K
 
A
G
 
G
A
 
S
I
 
L
V
 
I
A
 
G
K
 
R

Q2I8V6 1,5-anhydro-D-fructose reductase; Anhydrofructose reductase; 1,5-anhydro-D-fructose reductase (1,5-anhydro-D-mannitol-forming); EC 1.1.1.292 from Ensifer adhaerens (Sinorhizobium morelense) (see paper)
26% identity, 69% coverage: 20:266/360 of query aligns to 6:253/333 of Q2I8V6

query
sites
Q2I8V6
I
 
L
I
 
I
G
 
G
A
|
A
G
x
S
G
x
T
I
|
I
V
x
A
G
 
R
D
 
E
A
 
W
H
 
V
L
 
I
P
 
G
A
 
A
Y
 
I
K
 
R
I
 
A
A
 
T
G
 
G
F
 
G
E
 
E
V
 
V
H
 
V
G
 
S
I
 
M
V
 
M
N
x
S
R
x
T
T
 
S
K
 
A
E
 
E
R
|
R
A
 
G
Q
 
A
K
 
A
L
 
Y
A
 
A
D
 
T
T
 
E
F
 
N
G
 
G
I
 
I
L
 
G
N
 
K
V
 
S
Y
 
V
N
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
E
E
 
E
A
 
L
V
 
V
K
 
G
L
 
D
A
 
P
P
 
D
A
 
V
N
 
D
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
V
L
 
S
T
|
T
I
x
T
M
x
N
P
x
E
E
x
L
Q
x
H
Y
 
R
I
 
E
E
 
Q
T
 
T
L
 
L
K
 
A
Q
 
A
L
 
I
P
 
R
D
 
A
G
 
G
S
 
K
A
 
H
V
 
V
L
 
L
I
 
C
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
M
 
L
G
 
A
D
 
M
D
 
T
F
 
L
T
 
E
Q
 
D
A
 
A
K
 
R
E
 
E
I
 
M
L
 
V
E
 
V
L
 
A
C
 
A
R
 
R
A
 
E
K
 
A
N
 
G
L
 
V
K
 
V
A
 
L
A
 
G
I
 
T
N
|
N
F
 
H
Q
 
H
L
 
L
R
 
R
F
 
N
A
 
A
P
 
A
F
 
A
V
 
H
S
 
R
A
 
A
A
 
M
K
 
R
Y
 
D
L
 
A
I
 
I
D
 
A
K
 
E
G
 
G
L
 
R
I
 
I
G
 
G
E
 
R
L
 
P
Y
 
I
D
 
A
M
 
A
E
 
R
V
 
V
R
 
F
V
 
H
T
 
A
V
 
V
K
 
Y
T
 
L
P
 
P
W
 
-
E
 
-
I
 
-
F
 
-
P
 
P
H
 
H
V
 
-
I
 
L
I
 
Q
H
 
G
P
x
W
R
|
R
L
 
L
E
 
E
-
 
R
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
V
I
 
I
Q
 
L
Y
x
D
H
 
I
S
 
T
I
 
V
H
|
H
Y
 
D
V
 
A
D
 
D
L
 
T
I
 
L
R
 
R
S
 
-
F
 
F
L
 
V
G
 
L
N
 
N
P
 
D
E
 
D
S
 
P
I
 
A
L
 
E
A
 
A
K
 
V
T
 
A
L
 
I
K
 
S
H
 
H
P
 
S
A
 
A
K
 
G
N
 
M
L
x
G
S
 
K
S
 
E
S
 
G
R
 
V
S
 
E
T
 
D
I
 
G
L
 
V
F
 
M
D
 
G
Y
 
G
G
 
V
D
 
R
T
 
F
M
 
Q
H
 
S
A
 
G
V
 
V
I
 
I
N
 
A
T
 
Q
N
 
F
H
 
H
D
 
D
H
 
-
D
 
A
F
 
F
G
 
T
P
 
T
N
 
K
H
 
F
Q
 
A
E
 
E
S
 
T
Y
 
G
I
 
F
K
 
E
W
 
V
E
 
H
G
 
G
T
 
T
K
 
E
G
 
G
A
 
S
I
 
L
V
 
I
A
 
G
K
 
R

Sites not aligning to the query:

Q7JK39 Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase; D-xylose 1-dehydrogenase; D-xylose-NADP dehydrogenase; Dimeric dihydrodiol dehydrogenase; Jmo2DD; EC 1.3.1.20; EC 1.1.1.179 from Macaca fuscata fuscata (Japanese macaque) (see paper)
27% identity, 33% coverage: 41:158/360 of query aligns to 30:147/334 of Q7JK39

query
sites
Q7JK39
E
 
Q
V
 
V
H
 
V
G
 
A
I
 
V
V
 
A
N
 
A
R
 
R
T
 
D
K
 
L
E
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
K
K
 
E
L
 
F
A
 
A
D
 
Q
T
 
K
F
 
H
G
 
D
I
 
I
L
 
P
N
 
K
V
 
A
Y
 
Y
N
 
G
S
 
S
V
 
Y
A
 
E
E
 
E
A
 
L
V
 
A
K
 
K
L
 
D
A
 
P
P
 
N
A
 
V
N
 
E
A
 
V
V
 
A
Y
 
Y
D
 
V
L
 
G
T
 
T
I
 
Q
M
 
H
P
 
P
E
 
Q
Q
x
H
Y
 
K
I
 
A
E
 
A
T
 
V
L
 
M
K
 
L
Q
 
C
L
 
L
P
 
A
D
 
A
G
 
G
S
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
I
 
C
Q
 
E
K
 
K
P
 
P
M
 
M
G
 
G
D
 
V
D
 
N
F
 
A
T
 
A
Q
 
E
A
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
M
L
 
V
E
 
T
L
 
E
C
 
A
R
 
R
A
 
S
K
 
R
N
 
G
L
 
L
K
 
F
A
 
L
A
 
M
I
 
E
N
 
A
F
 
I
Q
 
W
L
 
T
R
 
R
F
 
F
A
 
F
P
 
P
F
 
A
V
 
S
S
 
E
A
 
A
A
 
L
K
 
R
Y
 
S
L
 
V
I
 
L
D
 
A
K
 
Q
G
 
G
L
 
T
I
 
L
G
 
G
E
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q9TQS6 Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase; Cmo2DD; D-xylose 1-dehydrogenase; D-xylose-NADP dehydrogenase; Dimeric dihydrodiol dehydrogenase; EC 1.3.1.20; EC 1.1.1.179 from Macaca fascicularis (Crab-eating macaque) (Cynomolgus monkey) (see paper)
27% identity, 33% coverage: 41:158/360 of query aligns to 30:147/334 of Q9TQS6

query
sites
Q9TQS6
E
 
Q
V
 
V
H
 
V
G
 
A
I
 
V
V
 
A
N
 
A
R
 
R
T
 
D
K
 
L
E
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
K
K
 
E
L
 
F
A
 
A
D
 
Q
T
 
K
F
 
H
G
 
D
I
 
I
L
 
P
N
 
K
V
 
A
Y
 
Y
N
 
G
S
 
S
V
 
Y
A
 
E
E
 
E
A
 
L
V
 
A
K
 
K
L
 
D
A
 
P
P
 
N
A
 
V
N
 
E
A
 
V
V
 
A
Y
 
Y
D
 
V
L
 
G
T
 
T
I
 
Q
M
 
H
P
 
P
E
 
Q
Q
 
H
Y
 
K
I
 
A
E
 
A
T
 
V
L
 
M
K
 
L
Q
 
C
L
 
L
P
 
A
D
 
A
G
 
G
S
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
I
 
C
Q
 
E
K
 
K
P
 
P
M
 
M
G
 
G
D
 
V
D
 
N
F
 
A
T
 
A
Q
 
E
A
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
M
L
 
V
E
 
T
L
 
E
C
 
A
R
 
R
A
 
S
K
 
R
N
 
G
L
 
L
K
 
F
A
 
L
A
 
M
I
 
E
N
 
A
F
 
I
Q
 
W
L
 
T
R
 
R
F
 
F
A
 
F
P
 
P
F
 
A
V
 
S
S
 
E
A
 
A
A
 
L
K
 
R
Y
 
S
L
 
V
I
 
L
D
 
A
K
 
Q
G
 
G
L
 
T
I
 
L
G
 
G
E
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

2poqX Dimeric dihydrodiol dehydrogenase complexed with inhibitor, isoascorbic acid (see paper)
27% identity, 33% coverage: 41:158/360 of query aligns to 29:146/331 of 2poqX

query
sites
2poqX
E
 
Q
V
 
V
H
 
V
G
 
A
I
 
V
V
 
A
N
 
A
R
 
R
T
 
D
K
 
L
E
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
K
K
 
E
L
 
F
A
 
A
D
 
Q
T
 
K
F
 
H
G
 
D
I
 
I
L
 
P
N
 
K
V
 
A
Y
 
Y
N
 
G
S
 
S
V
 
Y
A
 
E
E
 
E
A
 
L
V
 
A
K
 
K
L
 
D
A
 
P
P
 
N
A
 
V
N
 
E
A
 
V
V
 
A
Y
 
Y
D
 
V
L
 
G
T
 
T
I
 
Q
M
 
H
P
 
P
E
 
Q
Q
 
H
Y
 
K
I
 
A
E
 
A
T
 
V
L
 
M
K
 
L
Q
 
C
L
 
L
P
 
A
D
 
A
G
 
G
S
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
I
 
C
Q
 
E
K
 
K
P
 
P
M
 
M
G
 
G
D
 
V
D
 
N
F
 
A
T
 
A
Q
 
E
A
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
M
L
 
V
E
 
T
L
 
E
C
 
A
R
 
R
A
 
S
K
 
R
N
 
G
L
 
L
K
 
F
A
 
L
A
 
M
I
 
E
N
 
A
F
 
I
Q
 
W
L
 
T
R
 
R
F
 
F
A
 
F
P
 
P
F
 
A
V
 
S
S
 
E
A
 
A
A
 
L
K
 
R
Y
 
S
L
 
V
I
 
L
D
 
A
K
 
Q
G
 
G
L
 
T
I
 
L
G
 
G
E
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

2o4uX Crystal structure of mammalian dimeric dihydrodiol dehydrogenase (see paper)
27% identity, 33% coverage: 41:158/360 of query aligns to 29:146/331 of 2o4uX

query
sites
2o4uX
E
 
Q
V
 
V
H
 
V
G
 
A
I
 
V
V
 
A
N
x
A
R
|
R
T
 
D
K
 
L
E
 
S
R
|
R
A
 
A
Q
 
K
K
 
E
L
 
F
A
 
A
D
 
Q
T
 
K
F
 
H
G
 
D
I
 
I
L
 
P
N
 
K
V
 
A
Y
 
Y
N
 
G
S
 
S
V
x
Y
A
 
E
E
 
E
A
 
L
V
 
A
K
 
K
L
 
D
A
 
P
P
 
N
A
 
V
N
 
E
A
 
V
V
 
A
Y
 
Y
D
 
V
L
 
G
T
 
T
I
 
Q
M
 
H
P
 
P
E
 
Q
Q
 
H
Y
 
K
I
 
A
E
 
A
T
 
V
L
 
M
K
 
L
Q
 
C
L
 
L
P
 
A
D
 
A
G
 
G
S
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
I
 
C
Q
 
E
K
 
K
P
 
P
M
 
M
G
 
G
D
 
V
D
x
N
F
 
A
T
x
A
Q
 
E
A
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
M
L
 
V
E
 
T
L
 
E
C
 
A
R
 
R
A
 
S
K
 
R
N
 
G
L
 
L
K
 
F
A
 
L
A
 
M
I
 
E
N
 
A
F
 
I
Q
 
W
L
 
T
R
 
R
F
 
F
A
 
F
P
 
P
F
 
A
V
 
S
S
 
E
A
 
A
A
 
L
K
 
R
Y
 
S
L
 
V
I
 
L
D
 
A
K
 
Q
G
 
G
L
 
T
I
 
L
G
 
G
E
x
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

B3TMR8 dTDP-3,4-didehydro-2,6-dideoxy-alpha-D-glucose 3-reductase; 3-ketoreductase; NADPH-dependent C3-ketoreductase; EC 1.1.1.384 from Actinomadura kijaniata (see paper)
27% identity, 43% coverage: 12:167/360 of query aligns to 4:161/332 of B3TMR8

query
sites
B3TMR8
P
 
P
E
 
A
T
 
N
K
 
A
Q
 
N
P
 
P
I
 
I
I
 
R
I
 
V
-
 
G
-
 
V
I
 
I
G
 
G
A
x
C
G
x
A
G
x
D
I
|
I
V
x
A
G
x
W
D
x
R
A
 
R
H
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
A
Y
 
L
K
 
E
I
 
A
A
 
E
G
 
P
F
 
L
-
 
T
E
 
E
V
 
V
H
 
T
G
 
A
I
 
I
V
 
A
N
x
S
R
|
R
T
 
R
K
 
W
E
 
D
R
 
R
A
 
A
Q
 
K
K
 
R
L
 
F
A
 
T
D
 
E
T
 
R
F
 
F
G
 
G
I
 
-
L
 
-
N
 
-
V
 
-
Y
 
-
N
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
G
E
 
E
A
 
P
V
 
V
K
 
E
L
 
G
A
x
Y
P
 
P
A
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
D
-
 
D
-
 
V
N
 
D
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
V
L
 
P
-
x
L
-
 
P
T
 
A
I
 
V
M
 
L
P
x
H
E
 
A
Q
 
E
Y
 
W
I
 
I
E
 
D
T
 
-
L
 
-
K
 
R
Q
 
A
L
 
L
P
 
R
D
 
A
G
 
G
S
 
K
A
 
H
V
 
V
L
 
L
I
 
A
Q
 
E
K
|
K
P
 
P
M
 
L
G
 
T
D
 
T
D
 
D
F
 
R
T
 
P
Q
 
Q
A
 
A
K
 
E
E
 
R
I
 
L
L
 
F
E
 
A
L
 
V
C
 
A
R
 
R
A
 
E
K
 
R
N
 
G
L
 
L
K
 
L
A
 
L
A
 
M
I
 
E
N
 
N
F
 
F
Q
 
M
L
 
F
R
 
L
F
 
H
A
 
H
P
 
P
F
 
Q
V
 
H
S
 
R
A
 
Q
A
 
V
K
 
A
Y
 
D
L
 
M
I
 
L
D
 
D
K
 
E
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
I
Y
 
R
D
 
S
M
 
F
E
 
A
V
 
A
R
 
S
V
 
F
T
 
T
V
 
I

Sites not aligning to the query:

3rc1A Crystal structure of kijd10, a 3-ketoreductase from actinomadura kijaniata incomplex with NADP and tdp-benzene (see paper)
27% identity, 41% coverage: 20:167/360 of query aligns to 7:154/325 of 3rc1A

query
sites
3rc1A
I
 
V
I
 
I
G
 
G
A
x
C
G
x
A
G
x
D
I
|
I
V
 
A
G
 
W
D
x
R
A
x
R
H
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
A
Y
 
L
K
 
E
I
 
A
A
 
E
G
 
P
F
 
L
-
 
T
E
 
E
V
 
V
H
 
T
G
 
A
I
 
I
V
 
A
N
x
S
R
|
R
T
 
R
K
 
W
E
 
D
R
 
R
A
 
A
Q
 
K
K
 
R
L
 
F
A
 
T
D
 
E
T
 
R
F
 
F
G
 
G
I
 
-
L
 
-
N
 
-
V
 
-
Y
 
-
N
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
G
E
 
E
A
 
P
V
 
V
K
 
E
L
 
G
A
x
Y
P
 
P
A
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
D
-
 
D
-
 
V
N
 
D
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
V
L
x
P
-
x
L
-
x
P
T
 
A
I
 
V
M
 
L
P
x
H
E
 
A
Q
 
E
Y
 
W
I
 
I
E
 
D
T
 
-
L
 
-
K
 
R
Q
 
A
L
 
L
P
 
R
D
 
A
G
 
G
S
 
K
A
 
H
V
 
V
L
 
L
I
 
A
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
M
 
L
G
 
T
D
 
T
D
 
D
F
 
R
T
 
P
Q
 
Q
A
 
A
K
 
E
E
 
R
I
 
L
L
 
F
E
 
A
L
 
V
C
 
A
R
 
R
A
 
E
K
 
R
N
 
G
L
 
L
K
 
L
A
 
L
A
 
M
I
 
E
N
 
N
F
 
F
Q
 
M
L
 
F
R
 
L
F
 
H
A
 
H
P
 
P
F
 
Q
V
 
H
S
 
R
A
 
Q
A
 
V
K
 
A
Y
 
D
L
 
M
I
 
L
D
 
D
K
 
E
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
I
Y
 
R
D
 
S
M
 
F
E
 
A
V
 
A
R
 
S
V
x
F
T
 
T
V
x
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>CA265_RS08565 FitnessBrowser__Pedo557:CA265_RS08565
MSIEIKYKPDLPETKQPIIIIGAGGIVGDAHLPAYKIAGFEVHGIVNRTKERAQKLADTF
GILNVYNSVAEAVKLAPANAVYDLTIMPEQYIETLKQLPDGSAVLIQKPMGDDFTQAKEI
LELCRAKNLKAAINFQLRFAPFVSAAKYLIDKGLIGELYDMEVRVTVKTPWEIFPHVIIH
PRLEIQYHSIHYVDLIRSFLGNPESILAKTLKHPAKNLSSSRSTILFDYGDTMHAVINTN
HDHDFGPNHQESYIKWEGTKGAIVAKIGLLMDYPHGVPDVFEYCIVEDGKQAAWQTVKLE
GSWFPEAFIGTMANLMRYNEGSAAILHTSVEDVIQTMAVVESAYQSSDIGGVKVKEQLNK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory