SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CA265_RS09910 FitnessBrowser__Pedo557:CA265_RS09910 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
34% identity, 73% coverage: 1:203/280 of query aligns to 1:212/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
M
 
M
G
 
K
K
 
M
K
 
T
K
 
K
V
 
S
W
 
A
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
K
 
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
L
 
R
S
 
S
L
 
I
V
 
A
H
 
L
Q
 
Q
L
 
L
L
 
A
N
 
E
A
 
E
G
 
G
Q
 
Y
Y
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
V
T
 
N
S
 
Y
R
 
A
N
 
G
I
 
S
G
 
K
E
 
E
L
 
K
K
 
A
K
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
V
N
 
E
D
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
K
G
 
G
G
 
V
K
 
D
F
 
S
L
 
F
P
 
A
L
 
I
A
 
Q
V
 
A
N
 
N
L
 
V
A
 
A
N
 
D
E
 
A
Q
 
D
S
 
E
V
 
V
E
 
K
D
 
A
A
 
M
I
 
I
K
 
K
A
 
E
T
 
V
I
 
V
A
 
S
K
 
Q
F
 
F
E
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
G
 
T
I
 
R
G
 
D
G
 
N
S
 
L
I
 
L
E
 
M
E
 
R
L
 
M
S
 
K
D
 
E
A
 
Q
E
 
E
T
 
W
R
 
D
N
 
D
S
 
V
F
 
I
D
 
D
V
 
T
N
 
N
V
 
L
F
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
F
N
 
N
V
 
C
I
 
I
R
 
Q
K
 
K
A
 
A
S
 
T
P
 
P
Y
 
Q
L
 
M
R
 
L
A
 
R
Q
 
Q
R
 
R
A
 
S
G
 
G
H
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
L
A
 
S
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
A
A
 
V
G
 
G
A
 
N
T
 
P
G
 
G
W
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
S
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
T
E
 
K
V
 
S
S
 
A
A
 
A
E
 
R
D
 
E
L
 
L
K
 
A
E
 
S
F
 
R
G
 
G
I
 
I
K
 
T
V
 
V
T
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
-
F
 
F
R
 
I
T
 
V
S
 
S
F
 
D
L
 
M
T
 
T
-
 
D
-
 
A
-
 
L
A
 
S
D
 
D
S
 
E
L
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
Q
I
 
M
L
 
L
A
 
T
A
 
Q
N
 
I
P
 
P
I
 
L
A
 
A
A
 
R
Y
 
F

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
35% identity, 71% coverage: 5:203/280 of query aligns to 2:205/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
K
 
K
V
 
S
W
 
A
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
K
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
S
 
S
L
 
I
V
 
A
H
 
L
Q
 
Q
L
 
L
L
 
A
N
 
E
A
 
E
G
 
G
Q
 
Y
Y
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
V
T
x
N
S
x
Y
R
x
A
N
x
G
I
x
S
G
 
K
E
 
E
L
 
K
K
 
A
K
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
V
N
 
E
D
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
K
G
 
G
G
 
V
K
 
D
F
 
S
L
 
F
P
 
A
L
 
I
A
 
Q
V
x
A
N
|
N
L
x
V
A
 
A
N
 
D
E
 
A
Q
 
D
S
 
E
V
 
V
E
 
K
D
 
A
A
 
M
I
 
I
K
 
K
A
 
E
T
 
V
I
 
V
A
 
S
K
 
Q
F
 
F
E
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
Y
 
I
G
 
T
I
 
R
G
 
D
G
 
N
S
 
L
I
 
L
E
 
M
E
 
R
L
 
M
S
 
K
D
 
E
A
 
Q
E
 
E
T
 
W
R
 
D
N
 
D
S
 
V
F
 
I
D
 
D
V
x
T
N
 
N
V
 
L
F
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
F
N
 
N
V
 
C
I
 
I
R
 
Q
K
 
K
A
 
A
S
 
T
P
 
P
Y
 
Q
L
 
M
R
 
L
A
 
R
Q
 
Q
R
 
R
A
 
S
G
 
G
H
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
L
A
 
S
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
A
A
 
V
G
 
G
A
 
N
T
 
P
G
 
G
W
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
S
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
T
E
 
K
V
 
S
S
 
A
A
 
A
E
 
R
D
 
E
L
 
L
K
 
A
E
 
S
F
 
R
G
 
G
I
 
I
K
 
T
V
 
V
T
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
A
 
-
F
 
F
R
 
I
T
 
V
S
 
S
F
 
D
L
 
M
T
 
T
A
 
-
D
 
D
S
 
E
L
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
Q
I
 
M
L
 
L
A
 
T
A
 
Q
N
 
I
P
 
P
I
 
L
A
 
A
A
 
R
Y
 
F

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
32% identity, 84% coverage: 5:238/280 of query aligns to 7:228/247 of P73574

query
sites
P73574
K
 
Q
V
 
V
W
 
A
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
|
A
S
 
S
K
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
K
S
 
A
L
 
T
V
 
A
H
 
L
Q
 
A
L
 
L
L
 
A
N
 
A
A
 
T
G
 
G
Q
 
M
Y
 
K
V
 
V
-
 
V
-
 
V
-
 
N
-
 
Y
A
 
A
A
 
Q
T
 
S
S
 
S
R
 
T
N
 
A
I
 
A
G
 
D
E
 
A
L
 
V
K
 
V
K
 
A
A
 
E
V
 
I
N
 
I
N
 
A
D
 
N
G
 
G
G
 
G
K
 
E
F
 
A
L
 
I
P
 
A
L
 
V
A
 
Q
V
 
A
N
 
N
L
 
V
A
 
A
N
 
N
E
 
A
Q
 
D
S
 
E
V
 
V
E
 
D
D
 
Q
A
 
L
I
 
I
K
 
K
A
 
T
T
 
T
I
 
L
A
 
D
K
 
K
F
 
F
E
 
S
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
G
 
T
I
 
R
G
 
D
G
 
T
S
 
L
I
 
L
E
 
L
E
 
R
L
 
M
S
 
K
D
 
L
A
 
E
E
 
D
T
 
W
R
 
Q
N
 
A
S
 
V
F
 
I
D
 
D
V
 
L
N
 
N
V
 
L
F
 
T
G
 
G
T
 
V
L
 
F
N
 
L
V
 
C
I
 
T
R
 
K
K
 
A
A
 
V
S
 
S
P
 
K
Y
 
L
L
 
M
R
 
L
A
 
K
Q
 
Q
R
 
K
A
 
S
G
 
G
H
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
T
S
 
S
I
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
M
A
 
M
G
 
G
A
 
N
T
x
P
G
 
G
W
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
S
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
F
S
 
T
E
 
K
V
 
T
S
 
V
A
 
A
E
 
K
D
 
E
L
 
L
K
 
A
E
 
S
F
 
R
G
 
G
I
 
V
K
 
T
V
 
V
T
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
-
F
|
F
R
 
I
T
 
A
S
 
T
F
 
D
L
 
M
T
 
T
A
 
E
D
 
N
S
 
-
L
 
-
I
 
-
L
 
L
A
x
N
A
 
A
N
 
E
P
 
P
I
 
I
A
 
L
A
 
Q
Y
 
F
E
 
I
E
 
P
V
 
L
R
 
-
A
 
-
I
 
-
H
 
-
S
 
A
K
 
R
Y
 
Y
L
 
-
K
 
-
M
 
-
D
 
-
G
 
-
Q
 
-
Q
 
-
I
 
-
G
 
G
D
 
Q
P
 
P
E
 
E
K
 
E
A
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
T
M
 
I
I
 
R
S
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
T
M
 
D
P
 
P

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
30% identity, 84% coverage: 3:236/280 of query aligns to 6:225/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
K
 
Q
K
 
D
K
 
K
V
 
V
W
 
A
F
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
A
K
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
L
S
 
E
L
 
A
V
 
A
H
 
R
Q
 
V
L
 
F
L
 
M
N
 
K
A
 
E
G
 
G
Q
 
A
Y
 
K
V
 
V
A
 
V
A
 
I
T
 
A
S
x
D
R
x
F
N
 
N
I
 
E
G
 
A
E
 
A
L
 
G
K
 
K
K
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
E
N
 
A
D
 
N
G
 
P
G
 
G
K
 
V
F
 
V
L
 
F
P
 
-
L
 
I
A
 
R
V
|
V
N
x
D
L
x
V
A
 
S
N
 
D
E
 
R
Q
 
E
S
 
S
V
 
V
E
 
H
D
 
R
A
 
L
I
 
V
K
 
E
A
 
N
T
 
V
I
 
A
A
 
E
K
 
R
F
 
F
E
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
V
 
I
V
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
Y
x
I
G
 
T
I
 
R
G
x
D
G
 
S
S
 
M
I
 
L
E
 
S
E
x
K
L
 
M
S
 
T
D
 
V
A
 
D
E
 
Q
T
 
F
R
 
Q
N
 
Q
S
 
V
F
 
I
D
 
N
V
 
V
N
|
N
V
 
L
F
 
T
G
 
G
T
 
V
L
 
F
N
 
H
V
 
C
I
 
T
R
 
Q
K
 
A
A
 
V
S
 
L
P
 
P
Y
 
Y
L
 
M
R
 
A
A
 
E
Q
 
Q
R
 
G
A
 
K
G
 
G
H
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
S
S
|
S
I
 
V
A
 
T
G
 
G
I
 
T
A
 
Y
G
 
G
A
x
N
T
x
V
G
 
G
W
x
Q
A
 
T
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
S
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
M
S
 
T
E
 
K
V
 
T
S
 
W
A
 
A
E
 
K
D
 
E
L
 
L
K
 
A
E
 
R
F
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
N
V
 
V
T
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
A
x
F
F
x
T
R
 
E
T
|
T
S
 
A
F
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
I
x
M
L
 
V
A
 
A
A
 
E
N
 
V
P
 
P
I
 
E
A
 
K
A
 
V
Y
 
I
E
 
E
E
x
K
V
 
M
R
 
K
A
 
A
I
 
-
H
 
-
S
 
-
K
 
-
Y
 
-
L
 
-
K
 
Q
M
 
V
D
 
P
G
 
M
Q
 
G
Q
 
R
I
 
L
G
 
G
D
 
K
P
 
P
E
 
E
K
 
D
A
 
I
A
 
A
A
 
N
A
 
A
M
 
Y
I
 
L
S
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S

1vl8B Crystal structure of gluconate 5-dehydrogenase (tm0441) from thermotoga maritima at 2.07 a resolution
33% identity, 67% coverage: 3:190/280 of query aligns to 5:197/252 of 1vl8B

query
sites
1vl8B
K
 
R
K
 
G
K
 
R
V
 
V
W
 
A
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
S
K
x
R
G
|
G
L
|
L
G
 
G
L
 
F
S
 
G
L
 
I
V
 
A
H
 
Q
Q
 
G
L
 
L
L
 
A
N
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
C
Y
 
S
V
 
V
A
 
V
A
 
V
T
 
A
S
|
S
R
|
R
N
 
N
I
 
L
G
 
E
E
 
E
L
 
A
K
 
S
K
 
E
A
 
A
V
 
A
N
 
Q
N
 
K
D
 
L
G
 
T
G
 
E
K
 
K
F
 
Y
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
T
L
 
M
P
 
A
L
 
F
A
 
R
V
x
C
N
x
D
L
x
V
A
 
S
N
 
N
E
 
Y
Q
 
E
S
 
E
V
 
V
E
 
K
D
 
K
A
 
L
I
 
L
K
 
E
A
 
A
T
 
V
I
 
K
A
 
E
K
 
K
F
 
F
E
 
G
R
 
K
I
 
L
D
 
D
V
 
T
V
 
V
I
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
Y
x
I
G
 
N
I
 
R
G
 
R
G
 
H
S
 
P
I
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
F
S
 
P
D
 
L
A
 
D
E
 
E
T
 
F
R
 
R
N
 
Q
S
 
V
F
 
I
D
 
E
V
|
V
N
 
N
V
 
L
F
 
F
G
 
G
T
 
T
L
 
Y
N
 
Y
V
 
V
I
 
C
R
 
R
K
 
E
A
 
A
S
 
F
P
 
S
Y
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
E
Q
 
S
R
 
D
A
 
N
G
 
P
H
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
G
S
|
S
I
 
L
A
 
T
G
 
-
I
 
V
A
 
E
G
 
E
A
 
V
T
 
T
-
 
M
-
 
P
G
 
N
W
x
I
A
 
S
V
 
A
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
S
K
|
K
S
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
A
A
 
S
L
 
L
S
 
T
E
 
K
V
 
A
S
 
L
A
 
A
E
 
K
D
 
E
L
 
W
K
 
G
E
 
R
F
 
Y
G
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
T
 
N
V
 
V
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
A
 
W
F
x
Y
R
 
R
T
|
T
S
 
K
F
x
M
L
x
T
T
 
E
A
 
A

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
33% identity, 66% coverage: 5:188/280 of query aligns to 8:194/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
K
 
K
V
 
V
W
 
A
F
 
F
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
S
 
A
K
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
L
S
 
E
L
 
I
V
 
A
H
 
K
Q
 
K
L
 
F
L
 
A
N
 
Q
A
 
E
G
 
G
Q
 
A
Y
 
K
V
 
V
A
 
V
A
 
I
T
 
S
S
x
D
R
x
M
N
 
N
I
 
A
G
 
E
E
 
K
L
 
C
K
 
Q
K
 
E
A
 
T
V
 
A
N
 
N
N
 
S
-
 
L
-
 
K
-
 
E
D
 
Q
G
 
G
G
 
F
K
 
D
F
 
A
L
 
L
P
 
S
L
 
A
A
 
P
V
 
C
N
x
D
L
x
V
A
 
T
N
 
D
E
 
E
Q
 
D
S
 
A
V
 
Y
E
 
K
D
 
Q
A
 
A
I
 
I
K
 
E
A
 
L
T
 
T
I
 
Q
A
 
K
K
 
T
F
 
F
E
 
G
R
 
T
I
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
Y
 
F
G
x
Q
I
 
H
G
 
V
G
 
A
S
 
P
I
 
I
E
 
E
E
 
E
L
 
F
S
 
P
D
 
T
A
 
A
E
 
V
T
 
F
R
 
Q
N
 
K
S
 
L
F
 
V
D
 
Q
V
 
V
N
 
M
V
 
L
F
 
T
G
 
G
T
 
A
L
 
F
N
 
I
V
 
G
I
 
I
R
 
K
K
 
H
A
 
V
S
 
L
P
 
P
Y
 
I
L
 
M
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
A
 
Y
G
 
G
H
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
M
A
|
A
S
|
S
I
 
I
A
x
N
G
 
G
I
 
L
A
 
I
G
 
G
A
 
F
T
 
A
G
 
G
W
x
K
A
 
A
V
 
G
Y
|
Y
A
 
N
A
 
S
A
 
A
K
|
K
S
 
H
A
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
T
E
 
K
V
 
V
S
 
A
A
 
A
E
 
L
D
 
E
L
 
C
K
 
A
E
 
R
F
 
D
G
 
G
I
 
I
K
 
T
V
 
V
T
 
N
V
 
A
V
 
L
A
 
C
P
|
P
G
|
G
A
 
Y
F
x
V
R
 
D
T
|
T
S
 
P
F
x
L
L
 
V

Sites not aligning to the query:

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
33% identity, 66% coverage: 5:188/280 of query aligns to 7:193/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
K
 
K
V
 
V
W
 
A
F
 
F
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
S
 
A
K
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
L
S
 
E
L
 
I
V
 
A
H
 
K
Q
 
K
L
 
F
L
 
A
N
 
Q
A
 
E
G
 
G
Q
 
A
Y
 
K
V
 
V
A
 
V
A
 
I
T
 
S
S
x
D
R
x
M
N
 
N
I
 
A
G
 
E
E
 
K
L
 
C
K
 
Q
K
 
E
A
 
T
V
 
A
N
 
N
N
 
S
-
 
L
-
 
K
-
 
E
D
 
Q
G
 
G
G
 
F
K
 
D
F
 
A
L
 
L
P
 
S
L
 
A
A
 
P
V
 
C
N
x
D
L
x
V
A
 
T
N
 
D
E
 
E
Q
 
D
S
 
A
V
 
Y
E
 
K
D
 
Q
A
 
A
I
 
I
K
 
E
A
 
L
T
 
T
I
 
Q
A
 
K
K
 
T
F
 
F
E
 
G
R
 
T
I
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
Y
 
F
G
x
Q
I
 
H
G
 
V
G
 
A
S
 
P
I
 
I
E
 
E
E
 
E
L
 
F
S
 
P
D
 
T
A
 
A
E
 
V
T
 
F
R
 
Q
N
 
K
S
 
L
F
 
V
D
 
Q
V
 
V
N
 
M
V
 
L
F
 
T
G
 
G
T
 
A
L
 
F
N
 
I
V
 
G
I
 
I
R
 
K
K
 
H
A
 
V
S
 
L
P
 
P
Y
 
I
L
 
M
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
A
 
Y
G
 
G
H
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
M
A
|
A
S
|
S
I
 
I
A
 
N
G
 
G
I
 
L
A
 
I
G
 
G
A
 
F
T
 
A
G
 
G
W
x
K
A
 
A
V
 
G
Y
|
Y
A
 
N
A
 
S
A
 
A
K
|
K
S
 
H
A
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
T
E
 
K
V
 
V
S
 
A
A
 
A
E
 
L
D
 
E
L
 
C
K
 
A
E
 
R
F
 
D
G
 
G
I
 
I
K
 
T
V
 
V
T
 
N
V
 
A
V
 
L
A
 
C
P
 
P
G
 
G
A
x
Y
F
x
V
R
 
D
T
|
T
S
 
P
F
 
L
L
 
V

Sites not aligning to the query:

1zemA Crystal structure of NAD+-bound xylitol dehydrogenase (see paper)
27% identity, 88% coverage: 5:250/280 of query aligns to 6:247/260 of 1zemA

query
sites
1zemA
K
 
K
V
 
V
W
 
C
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
G
K
x
G
G
x
N
L
x
I
G
 
G
L
 
L
S
 
A
L
 
T
V
 
A
H
 
L
Q
 
R
L
 
L
L
 
A
N
 
E
A
 
E
G
 
G
Q
 
T
Y
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
L
T
 
L
S
x
D
R
x
M
N
 
N
I
 
R
G
 
E
E
 
A
L
 
L
K
 
E
K
 
K
A
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
S
V
 
V
N
 
R
N
 
E
D
 
K
G
 
G
G
 
V
K
 
E
F
 
A
L
 
R
P
 
S
L
 
Y
A
 
V
V
 
C
N
x
D
L
x
V
A
 
T
N
 
S
E
 
E
Q
 
E
S
 
A
V
 
V
E
 
I
D
 
G
A
 
T
I
 
V
K
 
D
A
 
S
T
 
V
I
 
V
A
 
R
K
 
D
F
 
F
E
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
V
 
F
V
 
L
I
 
F
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
Y
 
Y
-
 
Q
G
 
G
I
 
A
G
 
F
G
 
A
S
 
P
I
 
V
E
 
Q
E
 
D
L
 
Y
S
 
P
D
 
S
A
 
D
E
 
D
T
 
F
R
 
A
N
 
R
S
 
V
F
 
L
D
 
T
V
 
I
N
 
N
V
 
V
F
 
T
G
 
G
T
 
A
L
 
F
N
 
H
V
 
V
I
 
L
R
 
K
K
 
A
A
 
V
S
 
S
P
 
R
Y
 
Q
L
 
M
R
 
I
A
 
T
Q
 
Q
R
 
N
A
 
Y
G
 
G
H
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
I
 
M
A
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
K
G
 
G
A
 
P
T
 
P
G
 
N
W
 
M
A
 
A
V
 
A
Y
|
Y
A
 
G
A
 
T
A
 
S
K
|
K
S
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
I
A
 
A
L
 
L
S
 
T
E
 
E
V
 
T
S
 
A
A
 
A
E
 
L
D
 
D
L
 
L
K
 
A
E
 
P
F
 
Y
G
 
N
I
 
I
K
 
R
V
 
V
T
 
N
V
 
A
V
 
I
A
 
S
P
|
P
G
 
G
A
 
Y
F
x
M
R
 
G
T
 
P
S
 
G
F
 
F
L
 
M
T
 
W
A
 
E
D
 
R
S
 
Q
L
 
V
I
 
E
L
 
L
A
 
Q
A
 
A
N
 
K
P
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
E
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
V
H
 
G
S
 
S
K
 
Q
Y
 
Y
L
 
F
K
 
S
M
 
T
D
|
D
G
 
P
Q
 
K
Q
 
V
I
 
V
G
 
A
D
 
Q
P
 
Q
E
 
M
K
 
I
A
 
G
A
 
S
A
 
V
A
 
P
M
 
M
I
 
R
S
 
R
L
 
Y
A
 
G
S
 
D
M
 
I
P
 
N
N
 
E
P
 
I
P
 
P
-
 
G
-
 
V
L
 
V
H
 
A
L
 
F
L
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
D
D
 
D
A
 
S

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
32% identity, 75% coverage: 5:214/280 of query aligns to 6:224/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
K
 
K
V
 
V
W
 
A
F
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
|
S
K
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
S
 
D
L
 
I
V
 
A
H
 
I
Q
 
N
L
 
L
L
 
A
N
 
K
A
 
E
G
 
G
Q
 
A
Y
 
N
V
 
I
-
 
F
-
 
F
-
x
N
-
x
Y
A
x
N
A
x
G
T
x
S
S
 
P
R
 
E
N
 
A
I
 
A
G
 
E
E
 
E
L
 
T
K
 
A
K
 
K
A
 
L
V
 
V
N
 
A
N
 
E
D
 
H
G
 
G
G
 
V
K
 
E
F
 
V
L
 
E
P
 
A
L
 
M
A
 
K
V
 
A
N
|
N
L
x
V
A
 
A
N
 
I
E
 
A
Q
 
E
S
 
D
V
 
V
E
 
D
D
 
A
A
 
F
I
 
F
K
 
K
A
 
Q
T
 
A
I
 
I
A
 
E
K
 
R
F
 
F
E
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
Y
x
I
G
 
T
I
 
R
G
 
D
G
 
N
S
 
L
I
 
L
E
 
M
E
 
R
L
 
M
S
 
K
D
 
E
A
 
D
E
 
E
T
 
W
R
 
D
N
 
D
S
 
V
F
 
I
D
 
N
V
x
I
N
 
N
V
 
L
F
 
K
G
 
G
T
 
T
L
 
F
N
 
L
V
 
C
I
 
T
R
 
K
K
 
A
A
 
V
S
 
S
P
 
R
Y
 
T
L
 
M
R
 
M
A
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
A
G
 
G
H
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
A
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
I
G
 
G
A
 
N
T
 
A
G
 
G
W
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
S
K
|
K
S
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
T
E
 
K
V
 
T
S
 
T
A
 
A
E
 
R
D
 
E
L
 
L
K
 
A
E
 
P
F
 
R
G
 
G
I
 
I
K
 
N
V
 
V
T
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
A
 
-
F
 
F
R
x
I
T
 
T
S
x
T
F
 
D
L
 
M
T
 
T
A
 
-
D
 
D
S
 
K
L
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
K
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
A
I
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
N
 
I
P
 
P
I
 
L
A
 
G
A
 
A
Y
 
Y
E
 
G
E
 
T
V
 
T
R
 
E
A
 
D
I
 
I
H
 
A
S
 
N
K
 
A
Y
 
V
L
 
L

1e3wD Rat brain 3-hydroxyacyl-coa dehydrogenase binary complex with nadh and 3-keto butyrate (see paper)
34% identity, 67% coverage: 3:189/280 of query aligns to 3:201/255 of 1e3wD

query
sites
1e3wD
K
 
K
K
 
G
K
 
L
V
 
V
W
 
A
F
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
A
K
x
S
G
|
G
L
|
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
T
V
 
A
H
 
K
Q
 
R
L
 
L
L
 
V
N
 
G
A
 
Q
G
 
G
Q
 
A
Y
 
T
V
 
A
A
 
V
A
 
L
T
 
L
S
x
D
R
x
V
N
 
P
I
 
N
G
 
S
E
 
E
L
 
G
K
 
E
K
 
T
A
 
E
V
 
A
N
 
K
N
 
K
D
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
N
F
 
C
L
 
I
P
 
F
L
 
A
A
 
P
V
 
A
N
|
N
L
x
V
A
 
T
N
 
S
E
 
E
Q
 
K
S
 
E
V
 
V
E
 
Q
D
 
A
A
 
A
I
 
L
K
 
T
A
 
L
T
 
A
I
 
K
A
 
E
K
 
K
F
 
F
E
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
A
I
 
V
N
 
N
N
x
C
A
|
A
G
|
G
Y
 
I
G
 
A
I
 
V
G
 
A
G
 
I
S
 
K
I
 
T
-
 
Y
-
 
H
E
 
E
E
 
K
L
 
K
S
 
N
D
 
Q
A
 
V
E
 
H
T
 
T
R
 
L
N
 
E
S
 
D
F
 
F
-
 
Q
-
 
R
-
 
V
-
 
I
D
 
N
V
|
V
N
|
N
V
 
L
F
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
F
N
 
N
V
 
V
I
 
I
R
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
M
-
 
G
K
 
Q
A
 
N
S
 
E
P
 
P
Y
 
D
L
 
Q
R
 
G
A
 
G
Q
 
Q
R
 
R
A
 
-
G
 
G
H
 
V
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
I
 
V
A
 
A
G
 
A
I
 
F
A
 
E
G
 
G
A
 
Q
T
 
V
G
 
G
W
 
Q
A
 
A
V
 
A
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
S
 
G
A
 
G
V
 
I
I
 
V
A
 
G
L
 
M
S
 
T
E
 
L
V
 
P
S
 
I
A
 
A
E
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
A
E
 
P
F
 
I
G
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
T
 
V
V
 
T
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
 
G
A
x
L
F
|
F
R
 
A
T
|
T
S
 
P
F
x
L
L
 
L
T
 
T

Sites not aligning to the query:

O70351 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2; 17-beta-estradiol 17-dehydrogenase; 2-methyl-3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase; MHBD; 3-alpha-(17-beta)-hydroxysteroid dehydrogenase (NAD(+)); 3-hydroxy-2-methylbutyryl-CoA dehydrogenase; 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type II; 3alpha(or 20beta)-hydroxysteroid dehydrogenase; 7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase; Endoplasmic reticulum-associated amyloid beta-peptide-binding protein; Mitochondrial ribonuclease P protein 2; Mitochondrial RNase P protein 2; Short chain dehydrogenase/reductase family 5C member 1; Short-chain type dehydrogenase/reductase XH98G2; Type II HADH; EC 1.1.1.35; EC 1.1.1.62; EC 1.1.1.239; EC 1.1.1.178; EC 1.1.1.53; EC 1.1.1.159 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
34% identity, 67% coverage: 3:189/280 of query aligns to 9:207/261 of O70351

query
sites
O70351
K
 
K
K
 
G
K
 
L
V
 
V
W
 
A
F
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
G
S
 
A
K
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
T
V
 
A
H
 
K
Q
 
R
L
 
L
L
 
V
N
 
G
A
 
Q
G
 
G
Q
 
A
Y
 
T
V
 
A
A
 
V
A
 
L
T
 
L
S
 
D
R
 
V
N
 
P
I
 
N
G
 
S
E
 
E
L
 
G
K
 
E
K
 
T
A
 
E
V
 
A
N
 
K
N
 
K
D
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
N
F
 
C
L
 
I
P
 
F
L
 
A
A
 
P
V
 
A
N
 
N
L
 
V
A
 
T
N
 
S
E
 
E
Q
 
K
S
 
E
V
 
V
E
 
Q
D
 
A
A
 
A
I
 
L
K
 
T
A
 
L
T
 
A
I
 
K
A
 
E
K
 
K
F
 
F
E
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
A
I
 
V
N
 
N
N
 
C
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
G
 
A
I
 
V
G
 
A
G
 
I
S
 
K
I
 
T
-
 
Y
-
 
H
E
 
E
E
 
K
L
 
K
S
 
N
D
 
Q
A
 
V
E
 
H
T
 
T
R
 
L
N
 
E
S
 
D
F
 
F
-
 
Q
-
 
R
-
 
V
-
 
I
D
 
N
V
 
V
N
 
N
V
 
L
F
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
F
N
 
N
V
 
V
I
 
I
R
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
M
-
 
G
K
 
Q
A
 
N
S
 
E
P
 
P
Y
 
D
L
 
Q
R
 
G
A
 
G
Q
 
Q
R
 
R
A
 
-
G
 
G
H
 
V
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
T
A
 
A
S
|
S
I
 
V
A
 
A
G
 
A
I
 
F
A
 
E
G
 
G
A
 
Q
T
 
V
G
 
G
W
 
Q
A
 
A
V
 
A
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
A
 
S
K
 
K
S
 
G
A
 
G
V
 
I
I
 
V
A
 
G
L
 
M
S
 
T
E
 
L
V
 
P
S
 
I
A
 
A
E
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
A
E
 
P
F
 
I
G
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
T
 
V
V
 
T
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
L
F
 
F
R
 
A
T
 
T
S
 
P
F
 
L
L
 
L
T
 
T

1e6wC Rat brain 3-hydroxyacyl-coa dehydrogenase binary complex with nadh and estradiol (see paper)
34% identity, 67% coverage: 3:189/280 of query aligns to 3:201/248 of 1e6wC

query
sites
1e6wC
K
 
K
K
 
G
K
 
L
V
 
V
W
 
A
F
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
A
K
x
S
G
|
G
L
|
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
T
V
 
A
H
 
K
Q
 
R
L
 
L
L
 
V
N
 
G
A
 
Q
G
 
G
Q
 
A
Y
 
T
V
 
A
A
 
V
A
 
L
T
 
L
S
x
D
R
x
V
N
 
P
I
 
N
G
 
S
E
 
E
L
 
G
K
 
E
K
 
T
A
 
E
V
 
A
N
 
K
N
 
K
D
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
N
F
 
C
L
 
I
P
 
F
L
 
A
A
 
P
V
 
A
N
|
N
L
x
V
A
 
T
N
 
S
E
 
E
Q
 
K
S
 
E
V
 
V
E
 
Q
D
 
A
A
 
A
I
 
L
K
 
T
A
 
L
T
 
A
I
 
K
A
 
E
K
 
K
F
 
F
E
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
A
I
 
V
N
 
N
N
x
C
A
|
A
G
 
G
Y
 
I
G
 
A
I
 
V
G
 
A
G
 
I
S
 
K
I
 
T
-
 
Y
-
 
H
E
 
E
E
 
K
L
 
K
S
 
N
D
 
Q
A
 
V
E
 
H
T
 
T
R
 
L
N
 
E
S
 
D
F
 
F
-
 
Q
-
 
R
-
 
V
-
 
I
D
 
N
V
 
V
N
|
N
V
 
L
F
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
F
N
 
N
V
 
V
I
 
I
R
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
M
-
 
G
K
 
Q
A
 
N
S
 
E
P
 
P
Y
 
D
L
 
Q
R
 
G
A
 
G
Q
 
Q
R
 
R
A
 
-
G
 
G
H
 
V
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
I
 
V
A
 
A
G
 
A
I
 
F
A
 
E
G
 
G
A
 
Q
T
 
V
G
 
G
W
x
Q
A
 
A
V
 
A
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
S
 
G
A
 
G
V
 
I
I
 
V
A
 
G
L
 
M
S
 
T
E
 
L
V
 
P
S
 
I
A
 
A
E
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
A
E
 
P
F
 
I
G
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
T
 
V
V
 
T
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
 
G
A
x
L
F
|
F
R
 
A
T
|
T
S
 
P
F
x
L
L
|
L
T
 
T

4bmsF Short chain alcohol dehydrogenase from ralstonia sp. Dsm 6428 in complex with NADPH
29% identity, 83% coverage: 5:236/280 of query aligns to 7:229/249 of 4bmsF

query
sites
4bmsF
K
 
K
V
 
T
W
 
A
F
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
x
N
K
x
S
G
 
G
L
x
I
G
 
G
L
 
L
S
 
A
L
 
T
V
 
A
H
 
K
Q
 
R
L
 
F
L
 
V
N
 
A
A
 
E
G
 
G
Q
 
A
Y
 
Y
V
 
V
A
 
F
A
 
I
T
 
V
S
 
G
R
|
R
N
x
R
I
 
R
G
 
K
E
 
E
L
 
L
K
 
E
K
 
Q
A
 
A
V
 
A
N
 
A
N
 
E
D
 
I
G
 
G
G
 
R
K
 
N
F
 
V
L
 
T
P
 
A
L
 
V
A
 
K
V
x
A
N
x
D
L
x
V
A
 
T
N
 
K
E
 
L
Q
 
E
S
 
D
V
 
L
E
 
D
D
 
R
A
 
L
I
 
Y
K
 
A
A
 
I
T
 
V
I
 
R
A
 
E
K
 
Q
F
 
R
E
 
G
R
 
S
I
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
L
I
 
F
N
 
A
N
|
N
A
x
S
G
|
G
Y
 
A
G
 
I
I
 
E
G
 
Q
G
 
K
S
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
I
S
 
T
D
 
P
A
 
E
E
 
H
T
 
Y
R
 
D
N
 
R
S
 
T
F
 
F
D
 
D
V
|
V
N
 
N
V
 
V
F
 
R
G
 
G
T
 
L
L
 
I
N
 
F
V
 
T
I
 
V
R
 
Q
K
 
K
A
 
A
S
 
L
P
 
P
Y
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
D
Q
 
-
R
 
-
A
 
G
G
 
G
H
 
S
I
 
V
I
 
I
N
 
L
I
 
T
A
 
S
S
|
S
I
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
L
G
 
G
A
 
L
T
 
Q
G
 
A
W
x
H
A
 
D
V
 
T
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
S
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
R
A
 
S
L
 
L
S
 
A
E
 
R
V
 
T
S
 
W
A
 
T
E
 
T
D
 
E
L
 
L
K
 
K
E
 
G
F
 
R
G
 
S
I
 
I
K
 
R
V
 
V
T
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
S
P
 
P
G
|
G
A
 
A
F
x
I
R
 
D
T
|
T
S
 
P
F
x
I
L
 
I
T
 
E
A
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
N
P
 
Q
I
 
V
A
 
S
A
 
T
Y
x
Q
E
 
E
E
 
E
V
 
A
R
 
D
A
 
E
I
 
L
H
 
R
S
 
A
K
 
K
Y
 
F
L
 
A
K
 
A
M
 
A
D
 
T
G
 
P
-
 
L
Q
 
G
Q
 
R
I
 
V
G
 
G
D
 
R
P
 
P
E
 
E
K
 
E
A
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
V
I
 
L
S
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
33% identity, 66% coverage: 5:188/280 of query aligns to 6:185/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
K
 
K
V
 
V
W
 
A
F
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
A
K
|
K
G
|
G
L
|
L
G
 
G
L
 
Q
S
 
A
L
 
I
V
 
A
H
 
L
Q
 
A
L
 
Y
L
 
A
N
 
E
A
 
E
G
 
G
Q
 
A
Y
 
K
V
 
V
A
 
I
A
 
A
T
 
G
S
 
-
R
 
-
N
x
D
I
x
L
G
 
G
E
 
D
L
 
L
K
 
T
K
 
Y
A
 
S
V
 
H
N
 
P
N
 
N
D
 
V
G
 
E
G
 
G
K
 
M
F
 
Y
L
|
L
P
 
-
L
 
-
A
 
-
V
 
-
N
|
N
L
x
V
A
 
T
N
 
D
E
 
V
Q
 
T
S
 
G
V
 
V
E
 
E
D
 
K
A
 
F
I
 
Y
K
 
Q
A
 
S
T
 
V
I
 
I
A
 
D
K
 
K
F
 
Y
E
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
V
 
I
V
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
Y
 
I
G
 
T
I
 
K
G
 
D
G
 
A
S
 
M
I
 
T
E
 
R
E
 
K
L
 
M
S
 
T
D
 
E
A
 
A
E
 
Q
T
 
W
R
 
D
N
 
A
S
 
V
F
 
I
D
 
D
V
 
V
N
 
N
V
 
L
F
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
F
N
 
N
V
 
L
I
 
T
R
 
R
K
 
L
A
 
V
S
 
G
P
 
P
Y
 
Q
L
 
M
R
 
Q
A
 
T
Q
 
N
R
 
G
A
 
Y
G
 
G
H
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
V
A
 
F
G
 
G
A
 
N
T
 
I
G
 
G
W
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
T
K
|
K
S
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
T
E
 
M
V
 
T
S
 
W
A
 
A
E
 
K
D
 
E
-
 
F
-
 
A
L
 
L
K
 
K
E
 
G
F
 
A
G
 
N
I
 
V
K
 
R
V
 
V
T
 
N
V
 
A
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
A
 
Y
F
x
I
R
 
M
T
|
T
S
 
D
F
 
I
L
 
L

1edoA The x-ray structure of beta-keto acyl carrier protein reductase from brassica napus complexed with NADP+ (see paper)
34% identity, 66% coverage: 6:190/280 of query aligns to 3:190/244 of 1edoA

query
sites
1edoA
V
 
V
W
 
V
F
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
K
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
K
S
 
A
L
 
I
V
 
A
H
 
L
Q
 
S
L
 
L
L
 
G
N
 
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
C
Y
 
K
V
 
V
-
 
L
-
 
V
-
x
N
-
x
Y
A
|
A
A
x
R
T
x
S
S
 
A
R
 
K
N
 
A
I
 
A
G
 
E
E
 
E
L
 
V
K
 
S
K
 
K
A
 
Q
V
 
I
N
 
E
N
 
A
D
 
Y
G
 
G
G
 
G
K
 
Q
F
 
A
L
 
I
P
 
T
L
 
F
A
 
G
V
 
G
N
x
D
L
x
V
A
 
S
N
 
K
E
 
E
Q
 
A
S
 
D
V
 
V
E
 
E
D
 
A
A
 
M
I
 
M
K
 
K
A
 
T
T
 
A
I
 
I
A
 
D
K
 
A
F
 
W
E
 
G
R
 
T
I
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
Y
 
I
G
 
T
I
 
R
G
 
D
G
 
T
S
 
L
I
 
L
E
 
I
E
 
R
L
 
M
S
 
K
D
 
K
A
 
S
E
 
Q
T
 
W
R
 
D
N
 
E
S
 
V
F
 
I
D
 
D
V
 
L
N
 
N
V
 
L
F
 
T
G
 
G
T
 
V
L
 
F
N
 
L
V
 
C
I
 
T
R
 
Q
K
 
A
A
 
A
S
 
T
P
 
K
Y
 
I
L
 
M
R
 
M
A
 
K
Q
 
K
R
 
R
A
 
K
G
 
G
H
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
I
G
 
G
A
 
N
T
 
I
G
 
G
W
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
S
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
F
S
 
S
E
 
K
V
 
T
S
 
A
A
 
A
E
 
R
D
 
E
L
 
G
K
 
A
E
 
S
F
 
R
G
 
N
I
 
I
K
 
N
V
 
V
T
 
N
V
 
V
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
A
 
-
F
 
F
R
x
I
T
 
A
S
|
S
F
 
D
L
x
M
T
 
T
A
 
A

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
29% identity, 83% coverage: 5:236/280 of query aligns to 9:227/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
K
 
K
V
 
V
W
 
A
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
K
x
R
G
 
G
L
x
I
G
 
G
L
 
K
S
 
A
L
 
I
V
 
A
H
 
E
Q
 
L
L
 
L
L
 
A
N
 
E
A
 
R
G
 
G
Q
 
A
Y
 
K
V
 
V
-
 
I
-
 
G
A
 
T
A
 
A
T
|
T
S
 
S
R
 
E
N
 
S
I
 
G
G
 
A
E
 
Q
L
 
A
K
 
I
K
 
S
A
 
D
V
 
Y
N
 
L
N
 
G
D
 
D
G
 
N
G
 
G
K
 
K
F
 
-
L
 
-
P
 
G
L
 
M
A
 
A
V
 
L
N
|
N
L
x
V
A
 
T
N
 
N
E
 
P
Q
 
E
S
 
S
V
 
I
E
 
E
D
 
A
A
 
V
I
 
L
K
 
K
A
 
A
T
 
I
I
 
T
A
 
D
K
 
E
F
 
F
E
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
Y
x
I
G
 
T
I
 
R
G
 
D
G
 
N
S
 
L
I
 
L
E
 
M
E
 
R
L
 
M
S
 
K
D
 
E
A
 
E
E
 
E
T
 
W
R
 
S
N
 
D
S
 
I
F
 
M
D
 
E
V
 
T
N
 
N
V
 
L
F
 
T
G
 
S
T
 
I
L
 
F
N
 
R
V
 
L
I
 
S
R
 
K
K
 
A
A
 
V
S
 
L
P
 
R
Y
 
G
L
 
M
R
 
M
A
 
K
Q
 
K
R
 
R
A
 
Q
G
 
G
H
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
V
A
 
G
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
T
A
 
M
G
 
G
A
 
N
T
 
A
G
 
G
W
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
S
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
F
S
 
T
E
 
K
V
 
S
S
 
M
A
 
A
E
 
R
D
 
E
L
 
V
K
 
A
E
 
S
F
 
R
G
 
G
I
 
V
K
 
T
V
 
V
T
 
N
V
 
T
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
A
 
F
F
x
I
R
 
E
T
|
T
S
 
D
F
x
M
L
 
T
T
 
K
A
 
A
D
 
L
S
 
N
L
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
E
 
D
E
 
E
V
 
Q
R
 
R
A
 
T
I
 
-
H
 
-
S
 
A
K
 
T
Y
 
L
L
 
A
K
 
Q
M
 
V
D
 
P
G
 
A
Q
 
G
Q
 
R
I
 
L
G
 
G
D
 
D
P
 
P
E
 
R
K
 
E
A
 
I
A
 
A
A
 
S
A
 
A
M
 
V
I
 
A
S
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S

6ihhA Crystal structure of rasadh f12 from ralstonia.Sp in complex with NADPH and a6o
30% identity, 83% coverage: 5:236/280 of query aligns to 7:229/249 of 6ihhA

query
sites
6ihhA
K
 
K
V
 
T
W
 
A
F
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
x
N
K
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
L
S
 
A
L
 
T
V
 
A
H
 
K
Q
 
R
L
 
F
L
 
V
N
 
A
A
 
E
G
 
G
Q
 
A
Y
 
Y
V
 
V
A
 
F
A
 
I
T
 
V
S
 
G
R
|
R
N
x
R
I
 
R
G
 
K
E
 
E
L
 
L
K
 
E
K
 
Q
A
 
A
V
 
A
N
 
A
N
 
E
D
 
I
G
 
G
G
 
R
K
 
N
F
 
V
L
 
T
P
 
A
L
 
V
A
 
K
V
 
A
N
x
D
L
x
V
A
 
T
N
 
K
E
 
L
Q
 
E
S
 
D
V
 
L
E
 
D
D
 
R
A
 
L
I
 
Y
K
 
A
A
 
I
T
 
V
I
 
R
A
 
E
K
 
Q
F
 
R
E
 
G
R
 
S
I
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
L
I
 
F
N
 
A
N
|
N
A
x
S
G
|
G
Y
 
A
G
 
V
I
 
E
G
 
Q
G
 
K
S
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
I
S
 
T
D
 
P
A
 
E
E
 
H
T
 
Y
R
 
D
N
 
R
S
 
T
F
 
F
D
 
D
V
|
V
N
 
N
V
 
V
F
 
R
G
 
G
T
 
L
L
 
I
N
 
F
V
 
T
I
 
V
R
 
Q
K
 
K
A
 
A
S
 
L
P
 
P
Y
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
D
Q
 
-
R
 
-
A
 
G
G
 
G
H
 
S
I
 
V
I
 
I
N
 
L
I
x
T
A
 
S
S
|
S
I
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
L
G
 
G
A
 
L
T
 
Q
G
 
A
W
x
H
A
 
D
V
 
T
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
S
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
R
A
 
S
L
 
L
S
 
A
E
 
R
V
 
T
S
 
W
A
 
T
E
 
T
D
 
E
L
 
L
K
 
K
E
 
G
F
 
R
G
 
S
I
 
I
K
 
R
V
 
V
T
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
S
P
|
P
G
|
G
A
|
A
F
x
I
R
 
D
T
|
T
S
 
P
F
x
S
L
|
L
T
 
E
A
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
N
P
 
N
I
 
V
A
 
S
A
 
T
Y
 
Q
E
 
E
E
 
E
V
 
A
R
 
D
A
 
E
I
 
L
H
 
R
S
 
A
K
 
K
Y
 
A
L
 
A
K
 
A
M
 
A
D
 
T
G
 
P
-
 
L
Q
 
G
Q
 
R
I
 
V
G
 
G
D
 
R
P
 
P
E
 
E
K
 
E
A
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
V
I
 
L
S
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S

Sites not aligning to the query:

4dmmB 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from synechococcus elongatus pcc 7942 in complex with NADP
31% identity, 76% coverage: 5:218/280 of query aligns to 6:235/240 of 4dmmB

query
sites
4dmmB
K
 
R
V
 
I
W
 
A
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
K
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
S
 
A
L
 
I
V
 
A
H
 
L
Q
 
E
L
 
L
L
 
A
N
 
A
A
 
A
G
 
G
Q
 
A
Y
 
K
V
 
V
A
 
A
-
 
V
-
 
N
-
 
Y
-
x
A
A
x
S
T
x
S
S
 
A
R
 
G
N
 
A
I
 
A
G
 
D
E
 
E
L
 
V
K
 
V
K
 
A
A
 
A
V
 
I
N
 
A
N
 
A
D
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
E
F
 
A
L
 
F
P
 
A
L
 
V
A
 
K
V
x
A
N
x
D
L
x
V
A
 
S
N
 
Q
E
 
E
Q
 
S
S
 
E
V
 
V
E
 
E
D
 
A
A
 
L
I
 
F
K
 
A
A
 
A
T
 
V
I
 
I
A
 
E
K
 
R
F
 
W
E
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
Y
 
I
G
 
T
I
 
R
G
 
D
G
 
T
S
 
L
I
 
L
E
 
L
E
 
R
L
 
M
S
 
K
D
 
R
A
 
D
E
 
D
T
 
W
R
 
Q
N
 
S
S
 
V
F
 
L
D
 
D
V
x
L
N
 
N
V
 
L
F
 
G
G
 
G
T
 
V
L
 
F
N
 
L
V
 
C
I
 
S
R
 
R
K
 
A
A
 
A
S
 
A
P
 
K
Y
 
I
L
 
M
R
 
L
A
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
S
G
 
G
H
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
E
A
 
M
G
 
G
A
 
N
T
 
P
G
 
G
W
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
S
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
T
E
 
K
V
 
T
S
 
V
A
 
A
E
 
K
D
 
E
L
 
L
K
 
A
E
 
S
F
 
R
G
 
G
I
 
I
K
 
T
V
 
V
T
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
A
 
F
F
x
I
R
 
A
T
|
T
S
 
D
F
x
M
L
 
T
T
 
S
A
 
L
D
 
L
S
 
E
L
 
V
I
 
I
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
R
-
 
Y
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
R
-
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
A
N
 
D
P
 
P
I
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
E
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
I
H
 
T
S
 
G
K
 
Q
Y
 
V
L
 
I
K
 
N
M
 
I
D
 
D
G
 
G

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
29% identity, 83% coverage: 5:236/280 of query aligns to 9:223/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
K
 
K
V
 
V
W
 
A
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
K
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
K
S
 
A
L
 
I
V
 
A
H
 
E
Q
 
L
L
 
L
L
 
A
N
 
E
A
 
R
G
 
G
Q
 
A
Y
 
K
V
 
V
-
 
I
-
 
G
A
 
T
A
 
A
T
|
T
S
 
S
R
 
E
N
 
S
I
 
G
G
 
A
E
 
Q
L
 
A
K
 
I
K
 
S
A
 
D
V
 
Y
N
 
L
N
 
G
D
 
D
G
 
N
G
 
G
K
 
K
F
 
-
L
 
-
P
 
G
L
 
M
A
 
A
V
 
L
N
|
N
L
x
V
A
 
T
N
 
N
E
 
P
Q
 
E
S
 
S
V
 
I
E
 
E
D
 
A
A
 
V
I
 
L
K
 
K
A
 
A
T
 
I
I
 
T
A
 
D
K
 
E
F
 
F
E
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
Y
 
I
G
 
T
I
 
R
G
 
D
G
 
N
S
 
L
I
 
L
E
 
M
E
 
R
L
 
M
S
 
K
D
 
E
A
 
E
E
 
E
T
 
W
R
 
S
N
 
D
S
 
I
F
 
M
D
 
E
V
 
T
N
|
N
V
 
L
F
 
T
G
 
S
T
 
I
L
 
F
N
 
R
V
 
L
I
 
S
R
 
K
K
 
A
A
 
V
S
 
L
P
 
R
Y
 
G
L
 
M
R
 
M
A
 
K
Q
 
K
R
 
R
A
 
Q
G
 
G
H
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
V
A
x
G
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
T
A
 
M
G
 
G
A
 
N
T
 
A
G
 
G
W
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
S
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
F
S
 
T
E
 
K
V
 
S
S
 
M
A
 
A
E
 
R
D
 
E
L
 
V
K
 
A
E
 
S
F
 
R
G
 
G
I
 
V
K
 
T
V
 
V
T
 
N
V
 
T
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
A
 
F
F
 
I
R
 
E
T
|
T
S
 
D
F
 
M
L
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
N
E
 
D
E
 
E
V
 
Q
R
 
R
A
 
T
I
 
-
H
 
-
S
 
A
K
 
T
Y
 
L
L
 
A
K
 
Q
M
 
V
D
 
P
G
 
A
Q
 
G
Q
 
R
I
 
L
G
 
G
D
 
D
P
 
P
E
 
R
K
 
E
A
 
I
A
 
A
A
 
S
A
 
A
M
 
V
I
 
A
S
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
30% identity, 67% coverage: 5:192/280 of query aligns to 6:193/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
K
 
K
V
 
I
W
 
A
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
K
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
R
S
 
A
L
 
I
V
 
A
H
 
E
Q
 
T
L
 
L
L
 
V
N
 
A
A
 
R
G
 
G
Q
 
A
Y
 
K
V
 
V
A
 
I
A
 
G
T
 
T
S
 
A
R
 
T
N
 
S
I
 
E
G
 
N
E
 
G
L
 
A
K
 
K
K
 
N
A
 
I
V
 
S
N
 
D
N
 
Y
D
 
L
G
 
G
G
 
A
K
 
N
F
 
G
L
 
K
P
 
G
L
 
L
A
 
M
V
 
L
N
 
N
L
 
V
A
 
T
N
 
D
E
 
P
Q
 
A
S
 
S
V
 
I
E
 
E
D
 
S
A
 
V
I
 
L
K
 
E
A
 
N
T
 
I
I
 
R
A
 
A
K
 
E
F
 
F
E
 
G
R
 
E
I
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
G
 
T
I
 
R
G
 
D
G
 
N
S
 
L
I
 
L
E
 
M
E
 
R
L
 
M
S
 
K
D
 
D
A
 
D
E
 
E
T
 
W
R
 
N
N
 
D
S
 
I
F
 
I
D
 
E
V
 
T
N
 
N
V
 
L
F
 
S
G
 
S
T
 
V
L
 
F
N
 
R
V
 
L
I
 
S
R
 
K
K
 
A
A
 
V
S
 
M
P
 
R
Y
 
A
L
x
M
R
 
M
A
 
K
Q
 
K
R
 
R
A
 
C
G
 
G
H
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
 
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
T
A
 
M
G
 
G
A
 
N
T
 
A
G
 
G
W
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
S
 
A
A
 
G
V
 
L
I
 
I
A
 
G
L
 
F
S
 
S
E
 
K
V
 
S
S
 
L
A
 
A
E
 
R
D
 
E
L
 
V
K
 
A
E
 
S
F
 
R
G
 
G
I
 
I
K
 
T
V
 
V
T
 
N
V
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
F
F
 
I
R
 
E
T
 
T
S
 
D
F
 
M
L
 
T
T
 
R
A
 
A
D
 
L
S
 
S

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>CA265_RS09910 FitnessBrowser__Pedo557:CA265_RS09910
MGKKKVWFITGASKGLGLSLVHQLLNAGQYVAATSRNIGELKKAVNNDGGKFLPLAVNLA
NEQSVEDAIKATIAKFERIDVVINNAGYGIGGSIEELSDAETRNSFDVNVFGTLNVIRKA
SPYLRAQRAGHIINIASIAGIAGATGWAVYAAAKSAVIALSEVSAEDLKEFGIKVTVVAP
GAFRTSFLTADSLILAANPIAAYEEVRAIHSKYLKMDGQQIGDPEKAAAAMISLASMPNP
PLHLLLGNDAFQRANTKIESLQKEFKDWKAITISTDFDEN

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory