SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CA265_RS10630 FitnessBrowser__Pedo557:CA265_RS10630 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5vt3B High resolution structure of thioredoxin-disulfide reductase from vibrio vulnificus cmcp6 in complex with NADP and fad
53% identity, 96% coverage: 6:309/318 of query aligns to 7:315/319 of 5vt3B

query
sites
5vt3B
E
 
K
H
 
H
V
 
S
Q
 
K
C
 
L
L
 
L
I
 
I
I
 
L
G
|
G
S
|
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
N
L
 
L
K
 
N
P
 
P
I
 
V
M
 
L
Y
 
I
T
|
T
G
|
G
M
 
M
Q
|
Q
A
 
Q
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
L
|
L
T
 
T
Q
 
T
T
|
T
T
 
T
D
 
E
V
 
V
E
 
E
N
|
N
F
 
W
P
 
P
G
 
G
Y
 
D
P
 
P
Q
 
E
G
 
G
I
 
L
M
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
G
M
 
L
M
 
M
E
 
D
D
 
R
F
 
M
R
 
K
K
 
E
Q
 
H
A
 
A
E
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
E
T
 
T
D
 
E
I
 
I
R
 
I
F
 
F
G
 
D
Y
x
H
V
x
I
S
 
N
S
 
E
V
 
V
D
 
D
F
 
F
S
 
S
S
 
T
T
 
R
P
 
P
H
 
F
K
 
-
V
 
V
V
 
L
V
 
K
D
 
G
E
 
D
I
 
A
K
 
A
T
 
S
I
 
Y
T
 
S
A
 
C
D
 
D
T
 
A
V
 
L
I
 
I
I
 
I
A
x
S
T
|
T
G
|
G
A
 
A
T
 
S
A
 
A
K
 
K
W
 
Y
L
|
L
G
 
G
L
 
L
P
 
E
S
 
S
E
 
E
Q
 
E
Q
 
A
Y
 
F
N
 
K
G
 
G
F
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
S
A
 
A
C
|
C
A
 
A
V
 
T
C
|
C
D
|
D
G
 
G
F
 
F
F
 
F
F
 
Y
K
 
R
G
 
N
Q
 
Q
D
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
V
V
 
V
G
 
G
A
x
G
G
|
G
D
x
N
T
|
T
A
 
A
A
 
V
E
|
E
E
 
E
A
 
A
T
 
L
Y
 
Y
L
 
L
A
 
S
K
 
N
L
 
I
C
 
A
K
 
A
T
 
E
V
 
V
H
 
H
L
 
L
L
 
I
V
x
H
R
|
R
R
|
R
D
 
D
E
 
S
F
 
F
R
|
R
A
 
A
S
 
E
K
 
K
A
 
I
M
 
L
V
 
I
S
 
N
R
 
R
V
 
L
L
 
M
-
 
D
-
 
K
-
 
V
A
 
Q
T
 
N
P
 
G
N
 
N
I
 
I
V
 
V
V
 
L
H
 
H
Y
 
T
N
 
D
T
 
R
E
 
V
T
 
L
Q
 
D
E
 
E
I
 
V
L
 
L
G
 
G
N
 
D
G
 
E
K
 
M
N
 
G
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
V
K
 
R
V
 
L
L
 
K
N
 
D
N
 
V
K
 
K
T
 
T
G
 
G
V
 
G
E
 
T
S
 
E
D
 
E
I
 
L
A
 
D
V
 
V
E
 
M
G
 
G
F
 
A
F
 
F
V
 
I
A
 
A
I
|
I
G
|
G
H
|
H
K
 
S
P
 
P
N
 
N
T
 
T
D
 
Q
I
 
I
F
 
F
K
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
M
 
M
D
 
K
E
 
D
T
 
-
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
A
 
L
T
 
V
K
 
K
P
 
S
G
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
N
S
 
A
T
 
T
L
 
Q
T
 
T
N
 
S
I
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
I
F
 
F
A
 
A
C
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
V
Q
 
M
D
 
D
M
 
H
Y
 
N
Y
 
Y
R
|
R
Q
|
Q
A
|
A
V
 
I
T
 
T
A
x
S
A
 
A
G
 
G
S
 
T
G
 
G
C
 
C
M
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L

5u63B Crystal structure of putative thioredoxin reductase from haemophilus influenzae
52% identity, 97% coverage: 6:312/318 of query aligns to 8:319/319 of 5u63B

query
sites
5u63B
E
 
K
H
 
H
V
 
A
Q
 
K
C
 
L
L
 
L
I
 
I
I
 
L
G
|
G
S
|
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
I
 
V
M
 
L
Y
 
V
T
|
T
G
|
G
M
 
L
Q
|
Q
A
 
Q
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
L
|
L
T
 
T
Q
 
T
T
|
T
T
 
D
D
 
E
V
 
I
E
 
E
N
|
N
F
 
W
P
 
P
G
 
G
Y
 
D
P
 
F
Q
 
E
G
 
M
I
 
T
M
 
T
G
 
G
P
 
S
E
 
G
M
 
L
M
 
M
E
 
Q
D
 
R
F
 
M
R
 
L
K
 
Q
Q
 
H
A
 
A
E
 
E
R
 
K
F
 
F
G
 
E
T
 
T
D
 
E
I
 
I
R
 
V
F
 
F
G
 
D
Y
x
H
V
x
I
S
 
N
S
 
R
V
 
V
D
 
D
F
 
L
S
 
S
S
 
S
T
 
R
P
 
P
H
 
F
K
 
K
V
 
L
V
 
F
V
 
G
D
 
D
E
 
-
I
 
V
K
 
Q
T
 
N
I
 
F
T
 
T
A
 
C
D
 
D
T
 
A
V
 
L
I
 
I
I
 
I
A
|
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
T
 
S
A
 
A
K
x
R
W
 
Y
L
 
I
G
 
G
L
 
L
P
 
P
S
 
S
E
 
E
Q
 
E
Q
 
N
Y
 
Y
N
 
K
G
 
G
F
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
S
A
 
A
C
|
C
A
 
A
V
 
T
C
|
C
D
|
D
G
 
G
F
 
F
F
 
F
F
 
Y
K
 
R
G
 
N
Q
 
K
D
 
P
V
 
V
A
 
G
I
 
V
V
 
I
G
 
G
A
x
G
G
 
G
D
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
T
 
L
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
K
 
N
L
 
I
C
 
A
K
 
S
T
 
T
V
 
V
H
 
H
L
 
L
L
 
I
V
x
H
R
|
R
R
|
R
D
 
D
E
 
S
F
 
F
R
 
R
A
 
A
S
 
E
K
 
K
A
 
I
M
 
L
V
 
I
S
 
D
R
 
R
V
 
L
-
 
Y
-
 
K
-
 
K
L
 
V
A
 
E
T
 
E
P
 
G
N
 
K
I
 
I
V
 
V
V
 
L
H
 
H
Y
 
T
N
 
D
T
 
R
E
 
T
T
 
L
Q
 
D
E
 
E
I
 
V
L
 
L
G
 
G
N
 
D
G
 
N
K
 
M
N
 
G
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
A
N
 
N
N
 
T
K
 
K
T
 
T
G
 
G
V
 
E
E
 
K
S
 
E
D
 
E
I
 
L
A
 
K
V
 
L
E
 
D
G
 
G
F
 
L
F
 
F
V
 
V
A
 
A
I
|
I
G
|
G
H
|
H
K
 
S
P
 
P
N
 
N
T
 
T
D
 
E
I
 
I
F
 
F
K
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
D
 
E
M
 
L
D
 
N
E
 
-
T
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
A
 
V
T
 
V
K
 
K
P
 
S
G
 
G
-
 
L
-
 
D
-
 
G
-
 
N
S
 
A
T
 
T
L
 
A
T
 
T
N
 
S
I
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
A
C
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
V
Q
 
M
D
 
D
M
 
H
Y
 
N
Y
 
Y
R
|
R
Q
|
Q
A
|
A
V
 
I
T
 
T
A
x
S
A
 
A
G
 
G
S
 
T
G
 
G
C
 
C
M
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
A
 
D
A
 
A
K
 
Q

6bpyA Aspergillus fumigatus thioredoxin reductase (see paper)
53% identity, 97% coverage: 7:313/318 of query aligns to 2:323/324 of 6bpyA

query
sites
6bpyA
H
 
H
V
 
T
Q
 
K
C
 
V
L
 
V
I
 
I
I
|
I
G
|
G
S
|
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
A
Y
 
H
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
A
D
 
E
L
 
L
K
 
K
P
 
P
I
 
V
M
 
L
Y
|
Y
T
x
E
G
|
G
M
 
M
-
 
L
-
x
A
-
 
N
-
x
T
Q
x
A
A
 
A
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
L
|
L
T
 
T
Q
 
T
T
|
T
T
 
T
D
 
D
V
x
I
E
 
E
N
|
N
F
 
F
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
I
 
I
M
 
G
G
 
G
P
 
A
E
 
E
M
 
L
M
 
M
E
 
E
D
 
N
F
 
M
R
 
R
K
 
K
Q
 
Q
A
 
S
E
 
I
R
 
R
F
 
F
G
 
G
T
 
T
D
 
E
I
 
V
R
 
I
F
 
T
G
 
E
Y
x
T
V
x
I
S
 
S
S
 
R
V
 
V
D
 
D
F
 
L
S
 
S
S
 
S
T
 
K
P
 
P
H
 
F
K
 
K
V
 
L
V
 
W
V
 
T
-
 
E
-
 
W
-
 
N
-
 
D
-
 
G
-
 
P
D
 
D
E
 
K
I
 
E
K
 
P
T
 
A
I
 
C
T
 
T
A
 
A
D
 
D
T
 
A
V
 
V
I
 
I
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
T
 
N
A
 
A
K
 
R
W
 
R
L
 
L
G
 
N
L
 
L
P
 
P
S
 
G
E
 
E
Q
 
E
Q
 
T
Y
 
Y
N
 
W
G
 
Q
F
 
N
G
 
G
V
 
I
S
 
S
A
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
V
C
|
C
D
 
D
G
 
G
F
 
A
-
 
V
-
 
P
F
 
I
F
 
F
K
 
R
G
 
N
Q
 
K
D
 
P
V
 
L
A
 
Y
I
 
V
V
 
I
G
 
G
A
x
G
G
|
G
D
 
D
T
x
S
A
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
T
 
M
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
Y
C
 
G
K
 
S
T
 
S
V
 
V
H
 
T
L
 
V
L
 
L
V
 
V
R
|
R
R
|
R
D
 
D
E
 
K
F
 
L
R
|
R
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
M
 
M
V
 
A
S
 
K
R
 
R
V
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
H
P
 
P
N
 
K
I
 
V
V
 
T
V
 
V
H
 
R
Y
 
F
N
 
N
T
 
T
E
 
V
T
 
A
Q
 
T
E
 
E
I
 
V
L
 
L
G
 
G
N
 
E
G
 
K
K
 
K
N
 
P
-
 
N
-
 
G
-
 
L
V
 
M
T
 
T
A
 
H
V
 
L
K
 
R
V
 
I
L
 
K
N
 
N
N
 
T
K
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
E
E
 
E
S
 
E
D
 
I
I
 
V
A
 
D
V
 
A
E
 
N
G
 
G
F
 
L
F
 
F
V
 
Y
A
 
A
I
x
V
G
 
G
H
 
H
K
 
D
P
 
P
N
 
A
T
 
T
D
 
A
I
 
L
F
 
V
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
L
 
I
D
 
D
M
 
L
D
 
D
E
 
E
T
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
A
 
I
T
 
T
K
 
K
P
 
P
G
 
G
S
 
T
T
 
S
L
 
Y
T
 
T
N
 
S
I
 
R
E
 
E
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
A
C
 
C
G
|
G
D
|
D
V
 
V
Q
 
Q
D
 
D
M
 
K
Y
 
R
Y
 
Y
R
|
R
Q
|
Q
A
|
A
V
 
I
T
 
T
A
x
S
A
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
G
C
 
C
M
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
K
Y
 
F
L
 
I
A
 
A
A
 
E
K
 
A
E
 
E

Q70G58 Thioredoxin reductase NTRC; NADPH-dependent thioredoxin reductase C; OsNTRC; EC 1.8.1.9 from Oryza sativa subsp. japonica (Rice) (see 2 papers)
53% identity, 97% coverage: 11:317/318 of query aligns to 73:385/515 of Q70G58

query
sites
Q70G58
L
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
I
 
V
M
 
V
Y
 
F
T
 
E
G
 
G
M
 
Y
Q
 
Q
A
 
V
G
 
G
G
 
G
-
 
V
-
 
P
-
 
G
-
 
G
Q
 
Q
L
 
L
T
 
M
Q
 
T
T
 
T
T
 
T
D
 
E
V
 
V
E
 
E
N
 
N
F
 
F
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
I
 
V
M
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
D
M
 
L
M
 
M
E
 
D
D
 
K
F
 
M
R
 
R
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
R
F
 
W
G
 
G
T
 
A
D
 
E
I
 
L
R
 
H
F
 
Q
G
 
E
Y
 
D
V
 
V
S
 
E
S
 
F
V
 
V
D
 
N
F
 
V
S
 
K
S
 
S
T
 
R
P
 
P
H
 
F
K
 
-
V
 
V
V
 
I
V
 
R
D
 
S
E
 
S
I
 
D
K
 
R
T
 
E
I
 
V
T
 
K
A
 
C
D
 
H
T
 
S
V
 
V
I
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
A
A
 
A
K
 
K
W
 
R
L
 
L
G
 
R
L
 
L
P
 
P
S
 
R
E
 
E
Q
 
D
Q
 
E
Y
 
F
N
 
W
G
 
S
F
 
R
G
 
G
V
 
I
S
 
S
A
 
A
C
|
C
A
 
A
V
 
I
C
|
C
D
 
D
G
 
G
F
 
A
-
 
S
-
 
P
F
 
L
F
 
F
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
D
 
V
V
 
L
A
 
A
I
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
G
D
 
D
T
 
T
A
|
A
A
 
T
E
 
E
E
 
E
A
 
A
T
 
I
Y
 
Y
L
 
L
A
 
T
K
 
K
L
 
Y
C
 
A
K
 
R
T
 
H
V
 
V
H
 
H
L
 
L
L
 
L
V
|
V
R
|
R
R
 
K
D
 
D
E
 
Q
F
 
L
R
 
R
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
M
 
M
V
 
Q
S
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
N
T
 
N
P
 
P
N
 
N
I
 
I
V
 
T
V
 
V
H
 
H
Y
 
F
N
 
N
T
 
T
E
 
E
T
 
A
Q
 
V
E
 
D
I
 
V
L
 
V
G
 
S
N
 
N
G
 
P
K
 
K
-
 
G
N
 
Q
V
 
M
T
 
S
A
 
G
V
 
I
K
 
Q
V
 
L
L
 
K
N
 
R
N
 
T
K
 
D
T
 
T
G
 
G
V
 
E
E
 
E
S
 
S
D
 
V
I
 
L
A
 
E
V
 
V
E
 
K
G
 
G
F
 
L
F
 
F
V
 
Y
A
 
G
I
 
I
G
 
G
H
 
H
K
 
T
P
 
P
N
 
N
T
 
S
D
 
Q
I
 
L
F
 
L
K
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
L
 
I
D
 
D
M
 
L
D
 
D
E
 
D
T
 
A
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
A
 
L
T
 
V
K
 
E
P
 
E
G
 
G
S
 
T
T
 
A
L
 
K
T
 
T
N
 
S
I
 
V
E
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
A
C
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
Q
 
Q
D
 
D
M
 
H
Y
 
E
Y
 
W
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
G
C
 
C
M
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
S
A
 
V
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
A
 
V
A
 
A
K
 
N
E
 
D
H
 
L
A
 
L
V
 
V
E
 
E

Sites not aligning to the query:

5w4cA Crystal structure of thioredoxin reductase from cryptococcus neoformans in complex with fad (fo conformation)
52% identity, 97% coverage: 7:313/318 of query aligns to 17:334/356 of 5w4cA

query
sites
5w4cA
H
 
H
V
 
S
Q
 
K
C
 
V
L
 
V
I
 
I
I
|
I
G
|
G
S
|
S
G
 
G
P
|
P
A
x
G
G
 
G
Y
 
H
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
N
L
 
L
K
 
E
P
 
P
I
 
V
M
 
L
Y
|
Y
T
 
E
G
|
G
M
 
M
Q
 
L
A
|
A
-
 
N
-
 
G
-
x
F
-
 
A
-
 
P
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
L
|
L
T
 
T
Q
 
T
T
|
T
T
 
T
D
 
D
V
 
V
E
 
E
N
|
N
F
 
F
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
Q
 
E
G
 
G
I
 
V
M
 
T
G
 
G
P
 
T
E
 
E
M
 
M
M
 
M
E
 
D
D
 
K
F
 
F
R
 
R
K
 
A
Q
 
Q
A
 
S
E
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
T
 
T
D
 
K
I
 
I
R
 
I
F
 
T
G
x
E
Y
 
T
V
|
V
S
 
A
S
 
R
V
 
V
D
 
D
F
 
L
S
 
S
S
 
V
T
 
R
P
 
P
H
 
F
K
 
K
V
 
Y
V
 
W
V
 
T
D
x
E
E
 
G
I
x
E
K
 
E
T
 
E
-
 
E
-
 
H
-
 
E
-
 
F
I
 
M
T
 
T
A
 
A
D
 
D
T
 
T
V
 
I
I
 
I
I
 
L
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
T
 
S
A
 
A
K
 
K
W
 
R
L
 
L
G
 
F
L
 
L
P
 
P
S
 
G
E
 
E
Q
 
E
Q
 
T
Y
 
Y
N
 
W
G
 
Q
F
 
S
G
 
G
V
 
I
S
 
S
A
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
V
C
 
C
D
 
D
G
 
G
F
 
A
-
 
V
-
 
P
F
 
I
F
 
F
K
 
R
G
 
Q
Q
 
K
D
 
P
V
 
L
A
 
A
I
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
D
 
D
T
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
T
 
T
Y
 
Y
L
 
L
A
 
T
K
 
K
L
 
Y
C
 
G
K
 
S
T
 
H
V
 
V
H
 
Y
L
 
V
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
R
D
 
D
E
 
E
F
 
L
R
 
R
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
I
M
 
M
V
 
A
S
 
K
R
 
R
V
 
L
L
 
T
A
 
S
T
 
H
P
 
P
N
 
K
I
 
V
V
 
T
V
 
V
H
 
L
Y
 
W
N
 
N
T
 
T
E
 
V
T
 
A
Q
 
T
E
 
E
I
 
A
L
 
K
G
 
G
N
 
D
G
 
G
K
 
E
N
 
V
V
 
L
T
 
T
A
 
S
V
 
L
K
 
T
V
 
I
L
 
K
N
 
N
N
 
T
K
 
K
T
 
T
G
 
G
V
 
E
E
 
T
S
 
G
D
 
D
I
 
L
A
 
P
V
 
V
E
 
N
G
 
G
F
 
L
F
 
F
V
 
Y
A
 
A
I
 
I
G
 
G
H
 
H
K
 
E
P
 
P
N
 
A
T
 
T
D
 
S
I
 
L
F
 
V
K
 
K
G
 
S
Q
 
Q
L
 
V
D
 
E
M
 
L
D
 
D
E
 
S
T
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
A
 
K
T
 
T
K
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
T
T
 
S
L
 
Q
T
 
T
N
 
S
I
 
V
E
 
H
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
A
C
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
V
Q
 
Q
D
 
D
M
 
K
Y
 
K
Y
 
Y
R
|
R
Q
|
Q
A
|
A
V
 
I
T
 
T
A
x
S
A
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
G
C
 
C
M
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
R
Y
 
L
L
 
I
A
 
S
A
 
E
K
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

P0A9P4 Thioredoxin reductase; TRXR; EC 1.8.1.9 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
51% identity, 96% coverage: 6:309/318 of query aligns to 5:314/321 of P0A9P4

query
sites
P0A9P4
E
 
K
H
 
H
V
 
S
Q
 
K
C
 
L
L
 
L
I
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
N
L
 
L
K
 
Q
P
 
P
I
 
V
M
 
L
Y
 
I
T
|
T
G
|
G
M
|
M
Q
x
E
A
x
K
G
|
G
G
|
G
Q
|
Q
L
 
L
T
 
T
Q
 
T
T
 
T
T
 
T
D
 
E
V
 
V
E
 
E
N
 
N
F
 
W
P
 
P
G
 
G
Y
 
D
P
 
P
Q
 
N
G
 
D
I
 
L
M
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
L
M
 
L
M
 
M
E
 
E
D
 
R
F
 
M
R
 
H
K
 
E
Q
 
H
A
 
A
E
 
T
R
 
K
F
 
F
G
 
E
T
 
T
D
 
E
I
 
I
R
 
I
F
 
F
G
 
D
Y
 
H
V
 
I
S
 
N
S
 
K
V
 
V
D
 
D
F
 
L
S
 
Q
S
 
N
T
 
R
P
 
P
H
 
F
K
 
R
V
 
L
V
 
N
V
 
G
D
 
D
E
 
N
I
 
-
K
 
G
T
 
E
I
 
Y
T
 
T
A
 
C
D
 
D
T
 
A
V
 
L
I
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
A
 
A
K
 
R
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
S
 
S
E
 
E
Q
 
E
Q
 
A
Y
 
F
N
 
K
G
 
G
F
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
S
A
 
A
C
|
C
A
 
A
V
 
T
C
|
C
D
 
D
G
 
G
F
 
F
F
 
F
F
 
Y
K
 
R
G
 
N
Q
 
Q
D
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
D
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
T
 
L
Y
 
Y
L
 
L
A
 
S
K
 
N
L
 
I
C
 
A
K
 
S
T
 
E
V
 
V
H
 
H
L
 
L
L
 
I
V
 
H
R
 
R
R
 
R
D
 
D
E
 
G
F
 
F
R
 
R
A
 
A
S
 
E
K
 
K
A
 
I
M
 
L
V
 
I
S
 
K
R
 
R
V
 
L
L
 
M
-
 
D
-
 
K
-
 
V
A
 
E
T
 
N
P
 
G
N
 
N
I
 
I
V
 
I
V
 
L
H
 
H
Y
 
T
N
 
N
T
 
R
E
 
T
T
 
L
Q
 
E
E
 
E
I
 
V
L
 
T
G
 
G
N
 
D
G
 
Q
K
 
M
N
 
G
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
V
K
 
R
V
 
L
L
 
R
N
 
D
-
 
T
-
 
Q
N
 
N
K
 
S
T
 
D
G
 
N
V
 
I
E
 
E
S
 
S
D
 
-
I
 
L
A
 
D
V
 
V
E
 
A
G
 
G
F
 
L
F
 
F
V
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
G
H
 
H
K
 
S
P
 
P
N
 
N
T
 
T
D
 
A
I
 
I
F
 
F
K
 
E
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
D
 
E
M
 
L
D
 
-
E
 
E
T
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
A
 
K
T
 
V
K
 
Q
P
 
S
G
 
G
-
 
I
-
 
H
-
 
G
-
 
N
S
 
A
T
 
T
L
 
Q
T
 
T
N
 
S
I
 
I
E
 
P
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
A
C
 
A
G
 
G
D
|
D
V
|
V
Q
x
M
D
|
D
M
x
H
Y
x
I
Y
|
Y
R
|
R
Q
|
Q
A
|
A
V
 
I
T
 
T
A
 
S
A
 
A
G
 
G
S
 
T
G
 
G
C
 
C
M
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3d8xA Crystal structure of saccharomyces cerevisiae ndpph dependent thioredoxin reductase 1 (see paper)
51% identity, 97% coverage: 7:313/318 of query aligns to 2:318/318 of 3d8xA

query
sites
3d8xA
H
 
H
V
 
N
Q
 
K
C
 
V
L
 
T
I
 
I
I
|
I
G
 
G
S
|
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
A
Y
 
H
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
E
L
 
I
K
 
K
P
 
P
I
 
I
M
 
L
Y
|
Y
T
 
E
G
|
G
M
 
M
Q
 
M
A
|
A
-
 
N
-
 
G
-
x
I
-
 
A
-
 
A
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
L
 
L
T
 
T
Q
 
T
T
 
T
T
 
T
D
 
E
V
x
I
E
 
E
N
|
N
F
 
F
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
I
 
L
M
 
T
G
 
G
P
 
S
E
 
E
M
 
L
M
 
M
E
 
D
D
 
R
F
 
M
R
 
R
K
 
E
Q
 
Q
A
 
S
E
 
T
R
 
K
F
 
F
G
 
G
T
 
T
D
 
E
I
 
I
R
 
I
F
 
T
G
 
E
Y
x
T
V
|
V
S
 
S
S
 
K
V
 
V
D
 
D
F
 
L
S
 
S
S
 
S
T
 
K
P
 
P
H
 
F
K
 
K
V
 
L
V
 
W
V
 
T
D
 
E
-
 
F
-
 
N
-
 
E
E
 
D
I
 
A
K
 
E
T
 
P
I
 
V
T
 
T
A
 
T
D
 
D
T
 
A
V
 
I
I
 
I
I
 
L
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
T
 
S
A
 
A
K
 
K
W
 
R
L
x
M
G
 
H
L
 
L
P
 
P
S
 
G
E
 
E
Q
 
E
Q
 
T
Y
 
Y
N
 
W
G
 
Q
F
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
S
A
 
A
C
|
C
A
 
A
V
 
V
C
|
C
D
|
D
G
 
G
F
 
A
-
 
V
-
 
P
F
 
I
F
 
F
K
 
R
G
 
N
Q
 
K
D
 
P
V
 
L
A
 
A
I
 
V
V
 
I
G
|
G
A
 
G
G
 
G
D
 
D
T
x
S
A
 
A
A
 
C
E
 
E
E
 
E
A
 
A
T
 
Q
Y
 
F
L
 
L
A
 
T
K
 
K
L
 
Y
C
 
G
K
 
S
T
 
K
V
 
V
H
 
F
L
 
M
L
 
L
V
 
V
R
|
R
R
x
K
D
 
D
E
 
H
F
 
L
R
|
R
A
 
A
S
 
S
K
 
T
A
 
I
M
 
M
V
 
Q
S
 
K
R
 
R
V
 
A
L
 
E
A
 
K
T
 
N
P
 
E
N
 
K
I
 
I
V
 
E
V
 
I
H
 
L
Y
 
Y
N
 
N
T
 
T
E
 
V
T
 
A
Q
 
L
E
 
E
I
 
A
L
 
K
G
 
G
N
 
D
G
 
G
K
 
K
N
 
L
V
 
L
T
 
N
A
 
A
V
 
L
K
 
R
V
 
I
L
 
K
N
 
N
N
 
T
K
 
K
T
 
K
G
 
N
V
 
E
E
 
E
S
 
T
D
 
D
I
 
L
A
 
P
V
 
V
E
 
S
G
 
G
F
 
L
F
 
F
V
 
Y
A
 
A
I
|
I
G
 
G
H
 
H
K
 
T
P
 
P
N
 
A
T
 
T
D
 
K
I
 
I
F
 
V
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
D
 
D
M
 
T
D
 
D
E
 
E
T
 
A
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
A
 
K
T
 
T
K
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
S
T
 
S
L
 
L
T
 
T
N
 
S
I
 
V
E
 
P
G
 
G
V
 
F
F
 
F
A
 
A
C
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
V
Q
 
Q
D
 
D
M
 
S
Y
 
K
Y
 
Y
R
|
R
Q
|
Q
A
|
A
V
 
I
T
 
T
A
x
S
A
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
G
C
 
C
M
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
A
 
T
A
 
S
K
 
L
E
 
E

P29509 Thioredoxin reductase 1; TR; TrxR; Thioredoxin peroxidase 1; TPx; Thioredoxin-dependent peroxide reductase 1; EC 1.8.1.9 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see 3 papers)
51% identity, 97% coverage: 7:313/318 of query aligns to 3:319/319 of P29509

query
sites
P29509
H
 
H
V
 
N
Q
 
K
C
 
V
L
 
T
I
 
I
I
 
I
G
 
G
S
|
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
A
Y
 
H
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
E
L
 
I
K
 
K
P
 
P
I
 
I
M
 
L
Y
 
Y
T
 
E
G
 
G
M
 
M
Q
 
M
A
 
A
-
 
N
-
 
G
-
x
I
-
x
A
-
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
|
Q
L
 
L
T
 
T
Q
 
T
T
 
T
T
 
T
D
 
E
V
 
I
E
 
E
N
|
N
F
 
F
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
I
 
L
M
 
T
G
 
G
P
 
S
E
 
E
M
 
L
M
 
M
E
 
D
D
 
R
F
 
M
R
 
R
K
 
E
Q
 
Q
A
 
S
E
 
T
R
 
K
F
 
F
G
 
G
T
 
T
D
 
E
I
 
I
R
 
I
F
 
T
G
 
E
Y
 
T
V
|
V
S
 
S
S
 
K
V
 
V
D
 
D
F
 
L
S
 
S
S
 
S
T
 
K
P
 
P
H
 
F
K
 
K
V
 
L
V
 
W
V
 
T
D
 
E
-
 
F
-
 
N
-
 
E
E
 
D
I
 
A
K
 
E
T
 
P
I
 
V
T
 
T
A
 
T
D
 
D
T
 
A
V
 
I
I
 
I
I
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
A
 
A
K
 
K
W
 
R
L
 
M
G
 
H
L
 
L
P
 
P
S
 
G
E
 
E
Q
 
E
Q
 
T
Y
 
Y
N
 
W
G
 
Q
F
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
S
A
 
A
C
|
C
A
 
A
V
 
V
C
|
C
D
 
D
G
 
G
F
 
A
-
 
V
-
 
P
F
 
I
F
 
F
K
 
R
G
 
N
Q
 
K
D
 
P
V
 
L
A
 
A
I
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
D
 
D
T
 
S
A
 
A
A
 
C
E
 
E
E
 
E
A
 
A
T
 
Q
Y
 
F
L
 
L
A
 
T
K
 
K
L
 
Y
C
 
G
K
 
S
T
 
K
V
 
V
H
 
F
L
 
M
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
K
D
 
D
E
 
H
F
 
L
R
 
R
A
 
A
S
 
S
K
 
T
A
 
I
M
 
M
V
 
Q
S
 
K
R
 
R
V
 
A
L
 
E
A
 
K
T
 
N
P
 
E
N
 
K
I
 
I
V
 
E
V
 
I
H
 
L
Y
 
Y
N
 
N
T
 
T
E
 
V
T
 
A
Q
 
L
E
 
E
I
 
A
L
 
K
G
 
G
N
 
D
G
 
G
K
 
K
N
 
L
V
 
L
T
 
N
A
 
A
V
 
L
K
 
R
V
 
I
L
 
K
N
 
N
N
 
T
K
 
K
T
 
K
G
 
N
V
 
E
E
 
E
S
 
T
D
 
D
I
 
L
A
 
P
V
 
V
E
 
S
G
 
G
F
 
L
F
 
F
V
 
Y
A
 
A
I
 
I
G
 
G
H
 
H
K
 
T
P
 
P
N
 
A
T
 
T
D
 
K
I
 
I
F
 
V
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
D
 
D
M
 
T
D
 
D
E
 
E
T
 
A
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
A
 
K
T
 
T
K
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
S
T
 
S
L
 
L
T
 
T
N
 
S
I
 
V
E
 
P
G
 
G
V
 
F
F
 
F
A
 
A
C
 
A
G
 
G
D
|
D
V
 
V
Q
 
Q
D
 
D
M
 
S
Y
 
K
Y
 
Y
R
|
R
Q
|
Q
A
|
A
V
 
I
T
 
T
A
 
S
A
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
G
C
 
C
M
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
A
 
T
A
 
S
K
 
L
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1f6mA Crystal structure of a complex between thioredoxin reductase, thioredoxin, and the NADP+ analog, aadp+ (see paper)
51% identity, 96% coverage: 6:309/318 of query aligns to 4:313/320 of 1f6mA

query
sites
1f6mA
E
 
K
H
 
H
V
 
S
Q
 
K
C
 
L
L
 
L
I
 
I
I
 
L
G
|
G
S
|
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
N
L
 
L
K
 
Q
P
 
P
I
 
V
M
 
L
Y
 
I
T
|
T
G
|
G
M
 
M
Q
x
E
A
 
K
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
L
|
L
T
 
T
Q
 
T
T
|
T
T
 
T
D
 
E
V
|
V
E
 
E
N
|
N
F
 
W
P
 
P
G
 
G
Y
 
D
P
 
P
Q
 
N
G
 
D
I
 
L
M
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
L
M
 
L
M
 
M
E
 
E
D
 
R
F
 
M
R
 
H
K
 
E
Q
 
H
A
 
A
E
 
T
R
 
K
F
 
F
G
 
E
T
 
T
D
 
E
I
 
I
R
 
I
F
 
F
G
 
D
Y
x
H
V
x
I
S
 
N
S
 
K
V
 
V
D
 
D
F
 
L
S
 
Q
S
 
N
T
 
R
P
 
P
H
 
F
K
 
R
V
 
L
V
 
N
V
 
G
D
 
D
E
 
N
I
 
-
K
 
G
T
 
E
I
 
Y
T
 
T
A
 
C
D
 
D
T
 
A
V
 
L
I
 
I
I
 
I
A
|
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
T
 
S
A
 
A
K
 
R
W
 
Y
L
|
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
S
 
S
E
 
E
Q
 
E
Q
 
A
Y
 
F
N
 
K
G
 
G
F
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
S
A
 
A
C
x
S
A
 
A
V
 
T
C
|
C
D
|
D
G
 
G
F
 
F
F
 
F
F
 
Y
K
 
R
G
 
N
Q
 
Q
D
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
V
V
 
I
G
 
G
A
x
G
G
|
G
D
x
N
T
|
T
A
 
A
A
 
V
E
|
E
E
 
E
A
 
A
T
 
L
Y
 
Y
L
 
L
A
 
S
K
 
N
L
 
I
C
 
A
K
 
S
T
 
E
V
 
V
H
 
H
L
 
L
L
 
I
V
x
H
R
|
R
R
|
R
D
 
D
E
 
G
F
 
F
R
|
R
A
 
A
S
 
E
K
 
K
A
 
I
M
 
L
V
 
I
S
 
K
R
 
R
V
 
L
L
 
M
-
 
D
-
 
K
-
 
V
A
 
E
T
 
N
P
 
G
N
 
N
I
 
I
V
 
I
V
 
L
H
 
H
Y
 
T
N
 
N
T
 
R
E
 
T
T
 
L
Q
 
E
E
 
E
I
 
V
L
 
T
G
 
G
N
 
D
G
 
Q
K
 
M
N
 
G
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
V
K
 
R
V
 
L
L
 
R
N
 
D
-
 
T
-
 
Q
N
 
N
K
 
S
T
 
D
G
 
N
V
 
I
E
 
E
S
 
S
D
 
-
I
 
L
A
 
D
V
 
V
E
 
A
G
 
G
F
 
L
F
 
F
V
 
V
A
 
A
I
|
I
G
|
G
H
|
H
K
 
S
P
 
P
N
 
N
T
 
T
D
 
A
I
 
I
F
 
F
K
 
E
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
D
 
E
M
 
L
D
 
-
E
 
E
T
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
A
 
K
T
 
V
K
 
Q
P
 
S
G
 
G
-
 
I
-
 
H
-
 
G
-
 
N
S
 
A
T
 
T
L
 
Q
T
 
T
N
 
S
I
 
I
E
 
P
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
A
C
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
V
Q
 
M
D
 
D
M
 
H
Y
 
I
Y
 
Y
R
|
R
Q
|
Q
A
|
A
V
 
I
T
 
T
A
x
S
A
 
A
G
 
G
S
 
T
G
 
G
C
 
C
M
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L

3itjB Crystal structure of saccharomyces cerevisiae thioredoxin reductase 1 (trr1) (see paper)
51% identity, 97% coverage: 7:313/318 of query aligns to 3:319/319 of 3itjB

query
sites
3itjB
H
 
H
V
 
N
Q
 
K
C
 
V
L
 
T
I
 
I
I
|
I
G
|
G
S
|
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
A
Y
 
H
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
E
L
 
I
K
 
K
P
 
P
I
 
I
M
 
L
Y
|
Y
T
x
E
G
|
G
M
 
M
Q
 
M
A
|
A
-
 
N
-
 
G
-
x
I
-
x
A
-
 
A
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
L
 
L
T
 
T
Q
 
T
T
|
T
T
 
T
D
 
E
V
x
I
E
 
E
N
|
N
F
 
F
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
I
 
L
M
 
T
G
 
G
P
 
S
E
 
E
M
 
L
M
 
M
E
 
D
D
 
R
F
 
M
R
 
R
K
 
E
Q
 
Q
A
 
S
E
 
T
R
 
K
F
 
F
G
 
G
T
 
T
D
 
E
I
 
I
R
 
I
F
 
T
G
 
E
Y
x
T
V
|
V
S
 
S
S
 
K
V
 
V
D
 
D
F
 
L
S
 
S
S
 
S
T
 
K
P
 
P
H
 
F
K
 
K
V
 
L
V
 
W
V
 
T
D
 
E
-
 
F
-
 
N
-
 
E
E
 
D
I
 
A
K
 
E
T
 
P
I
 
V
T
 
T
A
 
T
D
 
D
T
 
A
V
 
I
I
 
I
I
 
L
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
T
 
S
A
 
A
K
 
K
W
 
R
L
 
M
G
 
H
L
 
L
P
 
P
S
 
G
E
 
E
Q
 
E
Q
 
T
Y
 
Y
N
x
W
G
 
Q
F
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
S
A
 
A
C
|
C
A
 
A
V
 
V
C
|
C
D
|
D
G
 
G
F
 
A
-
 
V
-
 
P
F
 
I
F
 
F
K
 
R
G
 
N
Q
 
K
D
 
P
V
 
L
A
 
A
I
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
D
 
D
T
 
S
A
 
A
A
 
C
E
 
E
E
 
E
A
 
A
T
 
Q
Y
 
F
L
 
L
A
 
T
K
 
K
L
 
Y
C
 
G
K
 
S
T
 
K
V
 
V
H
 
F
L
 
M
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
K
D
 
D
E
 
H
F
 
L
R
 
R
A
 
A
S
 
S
K
 
T
A
 
I
M
 
M
V
 
Q
S
 
K
R
 
R
V
 
A
L
 
E
A
 
K
T
 
N
P
 
E
N
 
K
I
 
I
V
 
E
V
 
I
H
 
L
Y
 
Y
N
 
N
T
 
T
E
 
V
T
 
A
Q
 
L
E
 
E
I
 
A
L
 
K
G
 
G
N
 
D
G
 
G
K
 
K
N
 
L
V
 
L
T
 
N
A
 
A
V
 
L
K
 
R
V
 
I
L
 
K
N
 
N
N
 
T
K
 
K
T
 
K
G
 
N
V
 
E
E
 
E
S
 
T
D
 
D
I
 
L
A
 
P
V
 
V
E
 
S
G
 
G
F
 
L
F
 
F
V
 
Y
A
 
A
I
 
I
G
 
G
H
 
H
K
 
T
P
 
P
N
 
A
T
 
T
D
 
K
I
 
I
F
 
V
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
D
 
D
M
 
T
D
 
D
E
 
E
T
 
A
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
A
 
K
T
 
T
K
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
S
T
 
S
L
 
L
T
 
T
N
 
S
I
 
V
E
 
P
G
 
G
V
 
F
F
 
F
A
 
A
C
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
V
Q
 
Q
D
 
D
M
 
S
Y
 
K
Y
 
Y
R
|
R
Q
|
Q
A
|
A
V
 
I
T
 
T
A
x
S
A
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
G
C
 
C
M
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
A
 
T
A
 
S
K
 
L
E
 
E

1tdfA Crystal structure of escherichia coli thioredoxin reductase refined at 2 angstrom resolution: implications for a large conformational change during catalysis (see paper)
51% identity, 96% coverage: 6:309/318 of query aligns to 4:313/316 of 1tdfA

query
sites
1tdfA
E
 
K
H
 
H
V
 
S
Q
 
K
C
 
L
L
 
L
I
 
I
I
 
L
G
|
G
S
|
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
N
L
 
L
K
 
Q
P
 
P
I
 
V
M
 
L
Y
 
I
T
|
T
G
|
G
M
 
M
Q
x
E
A
 
K
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
L
|
L
T
 
T
Q
 
T
T
|
T
T
 
T
D
 
E
V
|
V
E
 
E
N
|
N
F
 
W
P
 
P
G
 
G
Y
 
D
P
 
P
Q
 
N
G
 
D
I
 
L
M
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
L
M
 
L
M
 
M
E
 
E
D
 
R
F
 
M
R
 
H
K
 
E
Q
 
H
A
 
A
E
 
T
R
 
K
F
 
F
G
 
E
T
 
T
D
 
E
I
 
I
R
 
I
F
 
F
G
 
D
Y
x
H
V
x
I
S
 
N
S
 
K
V
 
V
D
 
D
F
 
L
S
 
Q
S
 
N
T
 
R
P
 
P
H
 
F
K
 
R
V
 
L
V
 
N
V
 
G
D
 
D
E
 
N
I
 
-
K
 
G
T
 
E
I
 
Y
T
 
T
A
 
C
D
 
D
T
 
A
V
 
L
I
 
I
I
 
I
A
|
A
T
|
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
A
 
A
K
 
R
W
 
Y
L
|
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
S
 
S
E
 
E
Q
 
E
Q
 
A
Y
 
F
N
 
K
G
 
G
F
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
S
A
 
A
C
|
C
A
 
A
V
 
T
C
x
S
D
|
D
G
 
G
F
 
F
F
 
F
F
 
Y
K
 
R
G
 
N
Q
 
Q
D
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
V
V
x
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
D
 
N
T
|
T
A
 
A
A
 
V
E
|
E
E
 
E
A
 
A
T
 
L
Y
 
Y
L
 
L
A
 
S
K
 
N
L
 
I
C
 
A
K
 
S
T
 
E
V
 
V
H
 
H
L
 
L
L
 
I
V
x
H
R
|
R
R
 
R
D
 
D
E
 
G
F
 
F
R
|
R
A
 
A
S
x
E
K
 
K
A
 
I
M
 
L
V
 
I
S
 
K
R
 
R
V
 
L
L
 
M
-
 
D
-
 
K
-
 
V
A
 
E
T
 
N
P
 
G
N
 
N
I
 
I
V
 
I
V
 
L
H
 
H
Y
 
T
N
 
N
T
 
R
E
 
T
T
 
L
Q
 
E
E
 
E
I
 
V
L
 
T
G
 
G
N
 
D
G
 
Q
K
 
M
N
 
G
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
V
K
 
R
V
 
L
L
 
R
N
 
D
-
 
T
-
 
Q
N
 
N
K
 
S
T
 
D
G
 
N
V
 
I
E
 
E
S
 
S
D
 
-
I
 
L
A
 
D
V
 
V
E
 
A
G
 
G
F
 
L
F
 
F
V
 
V
A
 
A
I
|
I
G
|
G
H
 
H
K
 
S
P
 
P
N
 
N
T
 
T
D
 
A
I
 
I
F
 
F
K
 
E
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
D
 
E
M
 
L
D
 
-
E
 
E
T
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
A
 
K
T
 
V
K
 
Q
P
 
S
G
 
G
-
 
I
-
 
H
-
 
G
-
 
N
S
 
A
T
 
T
L
 
Q
T
 
T
N
 
S
I
 
I
E
 
P
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
A
C
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
V
Q
 
M
D
 
D
M
x
H
Y
 
I
Y
 
Y
R
|
R
Q
|
Q
A
|
A
V
 
I
T
 
T
A
x
S
A
 
A
G
 
G
S
 
T
G
 
G
C
 
C
M
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L

4jnqA Crystal structure of a thioredoxin reductase from brucella melitensis
53% identity, 98% coverage: 2:313/318 of query aligns to 1:315/315 of 4jnqA

query
sites
4jnqA
S
 
S
Q
 
M
E
 
T
N
 
Q
E
 
R
H
 
H
V
 
A
Q
 
P
C
 
V
L
 
I
I
 
V
I
|
I
G
|
G
S
|
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
M
L
 
L
K
 
K
P
 
P
I
 
V
M
 
V
Y
 
I
T
x
A
G
|
G
M
 
L
Q
|
Q
A
 
Q
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
L
|
L
T
 
M
Q
 
I
T
 
T
T
 
T
D
 
D
V
 
V
E
 
E
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
P
 
A
Q
 
E
G
 
P
I
 
V
M
 
Q
G
 
G
P
 
P
E
 
W
M
 
M
M
 
M
E
 
E
D
 
Q
F
 
M
R
 
A
K
 
R
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
N
F
 
V
G
 
G
T
 
A
D
 
Q
I
 
I
R
 
V
F
 
H
G
 
D
Y
 
I
V
x
I
S
 
T
S
 
E
V
 
V
D
 
E
F
 
T
S
 
T
S
 
V
T
 
R
P
 
P
H
 
F
K
 
R
V
 
L
V
 
K
V
 
G
D
 
D
E
 
S
I
 
G
K
 
T
T
 
I
I
 
Y
T
 
T
A
 
C
D
 
D
T
 
A
V
 
L
I
 
I
I
 
I
A
|
A
T
|
T
G
 
G
A
 
A
T
 
Q
A
 
A
K
 
K
W
 
W
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
E
S
 
S
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
T
Y
 
F
N
 
M
G
 
G
F
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
S
A
 
A
C
|
C
A
 
A
V
 
T
C
|
C
D
|
D
G
 
G
F
 
F
F
 
F
F
 
Y
K
 
R
G
 
G
Q
 
K
D
 
D
V
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
G
D
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
T
 
L
Y
 
Y
L
 
L
A
 
S
K
 
H
L
 
I
C
 
A
K
 
K
T
 
S
V
 
V
H
 
T
L
 
I
L
 
V
V
 
H
R
 
R
R
 
R
D
 
D
E
 
G
F
 
F
R
 
R
A
 
A
S
 
E
K
 
K
A
 
I
M
 
M
V
 
Q
S
 
D
R
 
R
V
 
L
L
 
L
A
 
S
T
 
R
P
 
E
N
 
N
I
 
V
V
 
S
V
 
V
H
 
V
Y
 
W
N
 
N
T
 
S
E
 
V
T
 
I
Q
 
D
E
 
E
I
 
I
L
 
L
G
 
G
-
 
T
-
 
E
-
 
A
N
 
R
G
 
G
K
 
A
N
 
T
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
V
K
 
R
V
 
L
L
 
K
N
 
N
N
 
I
K
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
E
E
 
T
S
 
Q
D
 
E
I
 
R
A
 
A
V
 
T
E
 
H
G
 
G
F
 
V
F
 
F
V
 
I
A
 
A
I
 
I
G
 
G
H
 
H
K
 
A
P
 
P
N
 
A
T
 
V
D
 
S
I
 
L
F
 
F
K
 
E
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
D
 
K
M
 
Q
D
 
K
E
 
P
T
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
A
 
W
T
 
T
K
 
A
P
 
P
G
 
D
S
 
S
T
 
T
L
 
A
T
 
T
N
 
D
I
 
V
E
 
P
G
 
G
V
 
I
F
 
F
A
 
A
C
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
V
Q
 
T
D
 
D
M
 
D
Y
 
I
Y
 
Y
R
|
R
Q
|
Q
A
|
A
V
 
V
T
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
M
G
 
G
C
 
C
M
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
R
Y
 
W
L
 
L
A
 
A
A
 
A
K
 
Q
E
 
E

5uthA Crystal structure of thioredoxin reductase from mycobacterium smegmatis in complex with fad
52% identity, 95% coverage: 10:312/318 of query aligns to 6:306/306 of 5uthA

query
sites
5uthA
C
 
V
L
 
I
I
 
I
I
|
I
G
|
G
S
|
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
K
 
K
P
 
P
I
 
L
M
 
V
Y
x
F
T
x
E
G
|
G
M
 
T
Q
|
Q
A
 
F
G
 
G
G
|
G
Q
x
A
L
|
L
T
 
M
Q
 
T
T
 
T
T
 
T
D
 
E
V
 
V
E
 
E
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
P
 
R
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
M
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
E
M
 
L
M
 
M
E
 
D
D
 
Q
F
 
M
R
 
R
K
 
E
Q
 
Q
A
 
A
E
 
L
R
 
R
F
 
F
G
 
G
T
 
A
D
 
D
I
 
L
R
 
R
F
 
M
G
 
E
Y
x
D
V
|
V
S
 
D
S
 
A
V
 
V
D
 
Q
F
 
L
S
 
E
S
 
G
T
 
-
P
 
P
H
 
V
K
 
K
V
 
T
V
 
V
V
 
V
D
 
V
E
 
G
I
 
D
K
 
E
T
 
T
I
 
H
T
 
Q
A
 
A
D
 
R
T
 
A
V
 
V
I
 
I
I
 
L
A
 
A
T
x
M
G
|
G
A
 
A
T
 
A
A
 
A
K
 
R
W
 
H
L
 
L
G
 
G
L
 
V
P
 
P
S
 
G
E
 
E
Q
 
E
Q
 
A
Y
 
L
N
 
T
G
 
G
F
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
S
A
 
T
C
|
C
A
 
A
V
 
T
C
|
C
D
|
D
G
 
G
F
 
F
F
 
F
F
 
F
K
 
R
G
 
D
Q
 
Q
D
 
D
V
 
I
A
 
V
I
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
G
D
 
D
T
 
S
A
 
A
A
 
M
E
 
E
E
 
E
A
 
A
T
 
T
Y
 
F
L
 
L
A
 
T
K
 
R
L
 
F
C
 
A
K
 
R
T
 
S
V
 
V
H
 
T
L
 
L
L
 
I
V
 
H
R
 
R
R
 
R
D
 
D
E
 
E
F
 
F
R
 
R
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
I
M
 
M
V
 
L
S
 
E
R
 
R
V
 
A
L
 
R
A
 
A
T
 
N
P
 
E
N
 
K
I
 
I
V
 
T
V
 
F
H
 
L
Y
 
T
N
 
N
T
 
T
E
 
E
T
 
I
Q
 
T
E
 
Q
I
 
I
L
 
E
G
 
G
N
 
D
G
 
P
K
 
K
N
 
-
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
V
K
 
R
V
 
L
L
 
R
N
 
D
N
 
T
K
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
E
E
 
E
S
 
S
D
 
K
I
 
L