SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CA265_RS12240 FitnessBrowser__Pedo557:CA265_RS12240 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
36% identity, 83% coverage: 42:299/311 of query aligns to 45:317/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
E
 
D
V
 
V
H
 
D
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
R
x
M
G
x
L
K
 
S
K
 
E
H
 
R
I
 
I
D
 
D
K
 
Q
T
 
E
L
 
V
M
 
F
D
 
E
A
 
N
C
 
A
P
 
P
H
 
R
L
 
L
E
 
R
V
 
I
A
 
V
A
 
A
R
 
N
C
x
Y
G
x
A
V
|
V
G
|
G
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
V
 
I
D
 
D
V
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
A
S
 
T
A
 
R
R
 
R
K
 
G
I
 
I
R
 
Y
V
 
V
I
 
T
N
 
N
A
 
T
P
 
P
G
 
D
S
 
V
N
x
L
A
 
T
A
 
N
T
 
A
I
x
T
A
 
A
E
 
D
H
 
H
T
 
A
L
 
F
A
 
A
L
 
L
M
 
L
L
 
L
M
 
A
L
 
T
M
 
A
R
 
R
D
 
H
M
 
V
H
 
V
R
 
K
S
 
G
V
 
D
N
 
K
H
 
F
V
 
V
K
 
R
Q
 
S
N
 
G
N
 
E
W
 
W
N
 
K
-
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
A
W
 
W
R
 
H
N
 
P
Q
 
K
-
 
W
Y
 
F
A
 
L
G
 
G
D
 
Y
E
 
E
L
 
L
N
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
 
G
L
x
F
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
Q
R
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
R
L
 
R
G
 
A
D
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
K
 
R
V
 
I
L
 
L
C
 
Y
W
 
Y
S
|
S
R
|
R
S
 
T
-
 
R
-
 
K
-
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
G
V
 
A
Q
 
E
D
 
Y
L
 
R
P
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
V
L
 
L
Q
 
K
Q
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
F
V
 
V
S
 
I
L
 
L
H
x
A
L
x
V
P
|
P
L
 
L
S
 
T
N
 
K
E
 
E
T
|
T
N
 
M
E
 
Y
I
 
M
I
 
I
G
 
N
A
 
E
S
 
E
Q
 
R
L
 
L
A
 
K
L
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
K
 
T
A
 
A
F
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
T
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
A
 
K
L
 
V
I
 
V
D
 
D
H
 
T
A
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
I
D
 
K
A
 
A
L
 
L
N
 
K
A
 
E
G
 
G
T
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
F
 
A
A
 
G
A
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
F
P
 
E
D
 
E
E
|
E
P
 
P
P
 
Y
L
 
Y
Q
 
N
S
 
E
L
 
-
A
 
E
V
 
L
V
 
F
Q
 
S
H
 
L
P
 
D
N
 
N
A
 
V
L
 
V
V
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
A
 
I
A
x
G
S
 
S
L
 
A
T
 
T
A
 
F
S
 
E
T
 
A
Y
 
R
K
 
E
Q
 
A
M
 
M
C
 
A
L
 
E
L
 
L
T
 
V
V
 
A
R
 
R
N
 
N
V
 
L
L
 
I
S
 
A
V
 
F
L
 
K
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
Q
 
I
P
 
P

2eklA Structure of st1218 protein from sulfolobus tokodaii
33% identity, 80% coverage: 46:294/311 of query aligns to 49:306/312 of 2eklA

query
sites
2eklA
I
 
I
I
 
V
T
 
V
R
 
R
G
 
S
K
 
R
K
 
T
H
 
K
I
 
V
D
 
T
K
 
K
T
 
D
L
 
V
M
 
I
D
 
E
A
 
K
C
 
G
P
 
K
H
 
K
L
 
L
E
 
K
V
 
I
A
 
I
A
 
A
R
 
R
C
 
A
G
 
G
V
x
I
G
 
G
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
I
D
 
D
V
 
T
D
 
E
E
 
E
A
 
A
S
 
E
A
 
K
R
 
R
K
 
N
I
 
I
R
 
K
V
 
V
I
 
V
N
 
Y
A
 
A
P
 
P
G
 
G
S
 
A
N
x
S
A
 
T
A
 
D
T
 
S
I
 
A
A
 
V
E
 
E
H
 
L
T
 
T
L
 
I
A
 
G
L
 
L
M
 
M
L
 
I
M
 
A
L
 
A
M
 
A
R
 
R
D
 
K
M
 
M
H
 
Y
R
 
T
S
 
S
V
 
M
N
 
A
H
 
L
V
 
A
K
 
K
Q
 
S
N
 
G
N
 
I
W
 
F
N
 
K
W
 
-
R
 
-
N
 
-
Q
 
K
Y
 
I
A
 
E
G
 
G
D
 
L
E
 
E
L
 
L
N
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
|
G
L
 
F
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
T
R
 
K
V
 
V
A
 
G
K
 
I
L
 
I
G
 
A
D
 
N
A
 
A
F
 
M
G
 
G
M
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
L
C
 
A
W
x
Y
-
x
D
-
x
I
-
x
L
-
 
D
-
 
I
-
 
R
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
E
S
 
K
R
 
I
S
 
N
V
 
A
Q
 
K
D
 
A
L
 
V
P
 
S
L
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
L
L
 
L
Q
 
K
Q
 
N
S
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
I
S
 
S
L
 
L
H
|
H
L
x
V
P
x
T
L
 
V
S
 
S
N
 
K
E
 
D
T
 
A
N
 
K
E
 
P
I
|
I
I
 
I
G
 
D
A
 
Y
S
 
P
Q
 
Q
L
 
F
A
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
D
K
 
N
A
 
V
F
 
I
L
 
I
I
 
V
N
 
N
T
|
T
A
x
S
R
|
R
G
 
A
A
 
V
L
 
A
I
 
V
D
 
N
H
 
G
A
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
Y
L
 
I
N
 
K
A
 
K
G
 
G
T
 
K
I
 
V
A
 
Y
G
 
A
F
 
Y
A
 
A
A
 
T
D
|
D
V
 
V
L
 
F
P
 
W
D
 
N
E
|
E
P
 
P
P
 
P
L
 
K
Q
 
E
-
 
E
-
 
W
S
 
E
L
 
L
A
 
E
V
 
L
V
 
L
Q
 
K
H
 
H
P
 
E
N
 
R
A
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
T
H
|
H
A
 
I
A
x
G
S
 
A
L
 
Q
T
 
T
A
 
K
S
 
E
T
 
A
Y
 
Q
K
 
K
Q
 
R
M
 
V
C
 
A
L
 
E
L
 
M
T
 
T
V
 
T
R
 
Q
N
 
N
V
 
L
L
 
L
S
 
N
V
 
A
L
 
M

3kb6B Crystal structure of d-lactate dehydrogenase from aquifex aeolicus complexed with NAD and lactic acid (see paper)
31% identity, 94% coverage: 6:296/311 of query aligns to 3:320/334 of 3kb6B

query
sites
3kb6B
L
 
V
L
 
L
L
 
F
E
 
T
T
 
S
I
 
V
A
 
P
E
 
Q
E
 
E
A
 
D
L
 
V
A
 
P
L
 
F
L
 
Y
Q
 
Q
E
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
L
N
 
S
V
 
L
N
 
K
V
 
I
F
 
Y
T
 
T
G
 
T
Y
 
D
D
 
V
E
 
S
A
 
K
G
 
V
L
 
P
K
 
E
D
 
N
T
 
E
L
 
L
N
 
K
N
 
K
V
 
A
E
 
E
V
 
L
H
 
I
A
 
S
I
 
V
I
x
F
T
 
V
R
 
Y
G
 
D
K
 
K
K
 
-
H
 
-
I
 
L
D
 
T
K
 
E
T
 
E
L
 
L
M
 
L
D
 
S
A
 
K
C
 
M
P
 
P
H
 
R
L
 
L
E
 
K
V
 
L
A
 
I
A
 
H
R
 
T
C
 
R
G
x
S
V
|
V
G
|
G
L
 
F
D
 
D
N
 
H
V
 
I
D
 
D
V
 
L
D
 
D
E
 
Y
A
 
C
S
 
K
A
 
K
R
 
K
K
 
G
I
 
I
R
 
L
V
 
V
I
 
T
N
 
H
A
 
I
P
 
P
G
 
A
S
x
Y
N
x
S
A
 
P
A
 
E
T
 
S
I
x
V
A
 
A
E
 
E
H
 
H
T
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
M
M
 
I
L
 
L
M
 
T
L
 
L
M
 
V
R
 
K
D
 
R
M
 
L
H
 
K
R
 
R
S
 
I
V
 
E
N
 
D
H
 
R
V
 
V
K
 
K
Q
 
K
N
 
L
N
 
N
W
 
F
N
 
S
W
 
Q
R
 
D
N
 
S
Q
 
E
Y
 
I
A
 
L
G
 
A
D
 
R
E
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
R
K
 
L
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
T
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
S
R
 
R
V
 
V
A
 
A
K
 
M
L
 
Y
G
 
G
D
 
L
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
L
C
 
C
W
 
Y
S
x
D
-
x
V
R
 
V
S
 
K
V
 
R
Q
 
E
D
 
D
L
 
L
P
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
G
-
 
C
-
 
V
-
 
Y
-
 
T
-
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
L
L
 
L
Q
 
K
Q
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
I
S
 
S
L
 
L
H
 
H
L
 
V
P
|
P
L
 
Y
S
 
T
N
 
K
E
 
E
T
 
T
N
 
H
E
 
H
I
 
M
I
 
I
G
 
N
A
 
E
S
 
E
Q
 
R
L
 
I
A
 
S
L
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
D
K
 
G
A
 
V
F
 
Y
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
|
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
A
 
K
L
 
V
I
 
V
D
 
D
H
 
T
A
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
Y
D
 
R
A
 
A
L
 
Y
N
 
Q
A
 
R
G
 
G
T
 
K
I
 
F
A
 
S
G
 
G
F
 
L
A
 
G
A
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
F
P
 
E
D
 
D
E
|
E
P
 
E
P
 
I
L
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
K
-
 
K
-
 
Y
-
 
T
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
T
-
 
D
Q
 
K
S
 
N
L
 
L
A
 
K
V
 
I
V
 
L
Q
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
C
H
 
K
P
 
D
N
 
N
A
 
V
L
 
I
V
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
A
 
I
A
|
A
S
x
Y
L
 
Y
T
 
T
A
 
D
S
 
K
T
 
S
Y
 
L
K
 
E
Q
 
R
M
 
I
C
 
R
L
 
E
L
 
E
T
 
T
V
 
V
R
 
K
N
 
V
V
 
V
L
 
K
S
 
A
V
 
F
L
 
V
A
 
K
G
 
G

7dkmA Phgdh covalently linked to oridonin (see paper)
37% identity, 77% coverage: 42:280/311 of query aligns to 43:286/306 of 7dkmA

query
sites
7dkmA
E
 
D
V
 
C
H
 
E
A
 
G
I
 
L
I
 
I
T
 
V
R
 
R
G
 
S
K
 
A
K
 
T
H
 
K
I
 
V
D
 
T
K
 
A
T
 
D
L
 
V
M
 
I
D
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
H
 
K
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
R
C
 
A
G
 
G
V
x
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
E
E
 
A
A
 
A
S
 
T
A
 
R
R
 
K
K
 
G
I
 
I
R
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
G
 
N
S
 
G
N
 
N
A
 
S
A
 
L
T
 
S
I
x
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
M
 
C
L
 
L
M
 
A
R
 
R
D
 
Q
M
 
I
H
 
P
R
 
Q
S
 
A
V
 
T
N
 
A
H
 
S
V
 
M
K
 
K
Q
 
D
N
 
G
N
 
K
W
 
W
N
 
E
W
 
-
R
 
R
N
 
K
Q
 
K
Y
 
F
A
 
M
G
 
G
D
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
|
G
L
 
L
G
 
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
L
 
R
G
 
M
D
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
K
 
K
V
 
T
L
 
I
C
 
G
W
x
Y
-
x
D
-
x
P
-
x
I
-
 
I
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
-
 
S
-
 
A
S
 
S
R
 
F
S
 
G
V
 
V
Q
 
Q
D
 
Q
L
 
L
P
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
W
Q
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
S
 
L
N
 
P
E
 
S
T
|
T
N
 
T
E
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
N
A
 
D
S
 
N
Q
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
K
 
G
A
 
V
F
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
A
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
H
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
N
 
Q
A
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
F
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
F
P
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
L
 
-
Q
 
R
S
 
D
L
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
V
Q
 
D
H
 
H
P
 
E
N
 
N
A
 
V
L
 
I
V
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
L
T
x
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
Y
 
K
K
 
E

Sites not aligning to the query:

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
37% identity, 77% coverage: 42:280/311 of query aligns to 42:285/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
E
 
D
V
 
C
H
 
E
A
 
G
I
 
L
I
 
I
T
 
V
R
 
R
G
 
S
K
 
A
K
 
T
H
 
K
I
 
V
D
 
T
K
 
A
T
 
D
L
 
V
M
 
I
D
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
H
 
K
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
R
C
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
E
E
 
A
A
 
A
S
 
T
A
 
R
R
 
K
K
 
G
I
 
I
R
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
G
 
N
S
 
G
N
 
N
A
 
S
A
 
L
T
 
S
I
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
M
 
C
L
 
L
M
 
A
R
 
R
D
 
Q
M
 
I
H
 
P
R
 
Q
S
 
A
V
 
T
N
 
A
H
 
S
V
 
M
K
 
K
Q
 
D
N
 
G
N
 
K
W
 
W
N
 
E
W
 
-
R
 
R
N
 
K
Q
 
K
Y
 
F
A
 
M
G
 
G
D
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
|
L
G
|
G
L
|
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
|
G
K
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
L
 
R
G
 
M
D
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
K
 
K
V
 
T
L
 
I
C
 
G
W
 
Y
-
x
D
-
 
P
-
 
I
-
 
I
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
-
 
S
-
 
A
S
 
S
R
 
F
S
 
G
V
 
V
Q
 
Q
D
 
Q
L
 
L
P
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
W
Q
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
S
 
L
N
 
P
E
 
S
T
 
T
N
 
T
E
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
N
A
 
D
S
 
N
Q
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
K
 
G
A
 
V
F
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
H
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
N
 
Q
A
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
F
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
F
P
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
L
 
-
Q
 
R
S
 
D
L
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
V
Q
 
D
H
 
H
P
 
E
N
 
N
A
 
V
L
 
I
V
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
L
T
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
Y
 
K
K
 
E

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
37% identity, 77% coverage: 42:280/311 of query aligns to 42:285/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
E
 
D
V
 
C
H
 
E
A
 
G
I
 
L
I
 
I
T
 
V
R
 
R
G
 
S
K
 
A
K
 
T
H
 
K
I
 
V
D
 
T
K
 
A
T
 
D
L
 
V
M
 
I
D
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
H
 
K
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
R
C
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
E
E
 
A
A
 
A
S
 
T
A
 
R
R
 
K
K
 
G
I
 
I
R
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
G
 
N
S
 
G
N
 
N
A
 
S
A
 
L
T
 
S
I
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
M
 
C
L
 
L
M
 
A
R
 
R
D
 
Q
M
 
I
H
 
P
R
 
Q
S
 
A
V
 
T
N
 
A
H
 
S
V
 
M
K
 
K
Q
 
D
N
 
G
N
 
K
W
 
W
N
 
E
W
 
-
R
 
R
N
 
K
Q
 
K
Y
 
F
A
 
M
G
 
G
D
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
L
 
R
G
 
M
D
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
K
 
K
V
 
T
L
 
I
C
 
G
W
x
Y
-
x
D
-
x
P
-
x
I
-
x
I
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
-
 
S
-
 
A
S
 
S
R
 
F
S
 
G
V
 
V
Q
 
Q
D
 
Q
L
 
L
P
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
W
Q
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
S
 
L
N
 
P
E
 
S
T
 
T
N
 
T
E
 
G
I
x
L
I
 
L
G
 
N
A
 
D
S
 
N
Q
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
K
 
G
A
 
V
F
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
H
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
N
 
Q
A
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
F
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
F
P
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
L
 
-
Q
 
R
S
 
D
L
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
V
Q
 
D
H
 
H
P
 
E
N
 
N
A
 
V
L
 
I
V
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
L
T
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
Y
 
K
K
 
E

6rj3A Crystal structure of phgdh in complex with compound 15 (see paper)
37% identity, 77% coverage: 42:280/311 of query aligns to 41:284/297 of 6rj3A

query
sites
6rj3A
E
 
D
V
 
C
H
 
E
A
 
G
I
 
L
I
 
I
T
 
V
R
 
R
G
 
S
K
 
A
K
 
T
H
 
K
I
 
V
D
 
T
K
 
A
T
 
D
L
 
V
M
 
I
D
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
H
 
K
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
R
C
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
E
E
 
A
A
 
A
S
 
T
A
 
R
R
 
K
K
 
G
I
 
I
R
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
G
 
N
S
 
G
N
 
N
A
 
S
A
 
L
T
 
S
I
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
M
 
C
L
 
L
M
 
A
R
 
R
D
 
Q
M
 
I
H
 
P
R
 
Q
S
 
A
V
 
T
N
 
A
H
 
S
V
 
M
K
 
K
Q
 
D
N
 
G
N
 
K
W
 
W
N
 
E
W
 
-
R
 
R
N
 
K
Q
 
K
Y
 
F
A
 
M
G
 
G
D
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
|
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
L
 
R
G
 
M
D
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
K
 
K
V
 
T
L
 
I
C
 
G
W
x
Y
-
x
D
-
x
P
-
x
I
-
x
I
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
-
 
S
-
 
A
S
 
S
R
 
F
S
 
G
V
 
V
Q
 
Q
D
 
Q
L
 
L
P
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
W
Q
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
S
 
L
N
 
P
E
 
S
T
 
T
N
 
T
E
 
G
I
x
L
I
 
L
G
 
N
A
 
D
S
 
N
Q
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
K
 
G
A
 
V
F
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
H
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
N
 
Q
A
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
F
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
F
P
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
L
 
-
Q
 
R
S
 
D
L
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
V
Q
 
D
H
 
H
P
 
E
N
 
N
A
 
V
L
 
I
V
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
L
T
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
Y
 
K
K
 
E

6plgA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 15 (see paper)
37% identity, 77% coverage: 42:280/311 of query aligns to 42:285/303 of 6plgA

query
sites
6plgA
E
 
D
V
 
C
H
 
E
A
 
G
I
 
L
I
 
I
T
 
V
R
 
R
G
 
S
K
 
A
K
 
T
H
 
K
I
 
V
D
 
T
K
 
A
T
 
D
L
 
V
M
 
I
D
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
H
 
K
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
R
C
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
E
E
 
A
A
 
A
S
 
T
A
 
R
R
 
K
K
 
G
I
 
I
R
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
G
 
N
S
 
G
N
 
N
A
 
S
A
 
L
T
 
S
I
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
M
 
C
L
 
L
M
 
A
R
 
R
D
 
Q
M
 
I
H
 
P
R
 
Q
S
 
A
V
 
T
N
 
A
H
 
S
V
 
M
K
 
K
Q
 
D
N
 
G
N
 
K
W
 
W
N
 
E
W
 
-
R
 
R
N
 
K
Q
 
K
Y
 
F
A
 
M
G
 
G
D
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
N
x
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
L
 
R
G
 
M
D
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
K
 
K
V
 
T
L
 
I
C
 
G
W
 
Y
-
x
D
-
x
P
-
x
I
-
x
I
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
-
 
S
-
 
A
S
 
S
R
 
F
S
 
G
V
 
V
Q
 
Q
D
 
Q
L
 
L
P
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
W
Q
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
P
 
P
L
 
L
S
x
L
N
 
P
E
 
S
T
 
T
N
 
T
E
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
N
A
 
D
S
 
N
Q
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
K
 
G
A
 
V
F
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
H
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
N
 
Q
A
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
F
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
F
P
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
L
 
-
Q
 
R
S
 
D
L
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
V
Q
 
D
H
 
H
P
 
E
N
 
N
A
 
V
L
 
I
V
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
L
T
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
Y
 
K
K
 
E

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
37% identity, 77% coverage: 42:280/311 of query aligns to 42:285/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
E
 
D
V
 
C
H
 
E
A
 
G
I
 
L
I
 
I
T
 
V
R
 
R
G
 
S
K
 
A
K
 
T
H
 
K
I
 
V
D
 
T
K
 
A
T
 
D
L
 
V
M
 
I
D
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
H
 
K
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
R
C
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
E
E
 
A
A
 
A
S
 
T
A
 
R
R
 
K
K
 
G
I
 
I
R
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
G
 
N
S
 
G
N
 
N
A
 
S
A
 
L
T
 
S
I
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
M
 
C
L
 
L
M
 
A
R
 
R
D
 
Q
M
 
I
H
 
P
R
 
Q
S
 
A
V
 
T
N
 
A
H
 
S
V
 
M
K
 
K
Q
 
D
N
 
G
N
 
K
W
 
W
N
 
E
W
 
-
R
 
R
N
 
K
Q
 
K
Y
 
F
A
 
M
G
 
G
D
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
|
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
L
 
R
G
 
M
D
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
K
 
K
V
 
T
L
 
I
C
 
G
W
x
Y
-
x
D
-
x
P
-
 
I
-
x
I
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
-
 
S
-
 
A
S
 
S
R
 
F
S
 
G
V
 
V
Q
 
Q
D
 
Q
L
 
L
P
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
W
Q
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
S
 
L
N
 
P
E
 
S
T
 
T
N
 
T
E
 
G
I
x
L
I
 
L
G
 
N
A
 
D
S
 
N
Q
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
K
 
G
A
 
V
F
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
H
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
N
 
Q
A
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
F
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
F
P
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
L
 
-
Q
 
R
S
 
D
L
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
V
Q
 
D
H
 
H
P
 
E
N
 
N
A
 
V
L
 
I
V
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
L
T
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
Y
 
K
K
 
E

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
37% identity, 77% coverage: 42:280/311 of query aligns to 43:286/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
E
 
D
V
 
C
H
 
E
A
 
G
I
 
L
I
 
I
T
 
V
R
 
R
G
 
S
K
 
A
K
 
T
H
 
K
I
 
V
D
 
T
K
 
A
T
 
D
L
 
V
M
 
I
D
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
H
 
K
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
R
C
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
E
E
 
A
A
 
A
S
 
T
A
 
R
R
 
K
K
 
G
I
 
I
R
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
G
 
N
S
 
G
N
 
N
A
 
S
A
 
L
T
 
S
I
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
M
 
C
L
 
L
M
 
A
R
 
R
D
 
Q
M
 
I
H
 
P
R
 
Q
S
 
A
V
 
T
N
 
A
H
 
S
V
 
M
K
 
K
Q
 
D
N
 
G
N
 
K
W
 
W
N
 
E
W
 
-
R
 
R
N
 
K
Q
 
K
Y
 
F
A
 
M
G
 
G
D
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
L
 
R
G
 
M
D
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
K
 
K
V
 
T
L
 
I
C
 
G
W
x
Y
-
x
D
-
x
P
-
 
I
-
 
I
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
-
 
S
-
 
A
S
 
S
R
 
F
S
 
G
V
 
V
Q
 
Q
D
 
Q
L
 
L
P
 
P
L
|
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
W
Q
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
S
 
L
N
 
P
E
 
S
T
 
T
N
 
T
E
 
G
I
x
L
I
 
L
G
 
N
A
 
D
S
 
N
Q
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
K
 
G
A
 
V
F
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
H
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
N
 
Q
A
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
F
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
F
P
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
L
 
-
Q
 
R
S
 
D
L
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
V
Q
 
D
H
 
H
P
 
E
N
 
N
A
 
V
L
 
I
V
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
L
T
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
Y
 
K
K
 
E

6cwaA Crystal structure phgdh in complex with nadh and 3-phosphoglycerate at 1.77 a resolution (see paper)
37% identity, 77% coverage: 42:280/311 of query aligns to 41:284/299 of 6cwaA

query
sites
6cwaA
E
 
D
V
 
C
H
 
E
A
 
G
I
 
L
I
 
I
T
 
V
R
 
R
G
 
S
K
 
A
K
 
T
H
 
K
I
 
V
D
 
T
K
 
A
T
 
D
L
 
V
M
 
I
D
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
H
 
K
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
R
C
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
E
E
 
A
A
 
A
S
 
T
A
 
R
R
 
K
K
 
G
I
 
I
R
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
G
 
N
S
 
G
N
|
N
A
 
S
A
 
L
T
 
S
I
x
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
M
 
C
L
 
L
M
 
A
R
 
R
D
 
Q
M
 
I
H
 
P
R
 
Q
S
 
A
V
 
T
N
 
A
H
 
S
V
 
M
K
 
K
Q
 
D
N
 
G
N
 
K
W
 
W
N
 
E
W
 
-
R
 
R
N
 
K
Q
 
K
Y
 
F
A
 
M
G
 
G
D
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
L
 
R
G
 
M
D
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
K
 
K
V
 
T
L
 
I
C
 
G
W
x
Y
-
x
D
-
x
P
-
x
I
-
 
I
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
-
 
S
-
 
A
S
 
S
R
 
F
S
 
G
V
 
V
Q
 
Q
D
 
Q
L
 
L
P
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
W
Q
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
S
 
L
N
 
P
E
 
S
T
|
T
N
 
T
E
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
N
A
 
D
S
 
N
Q
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
K
 
G
A
 
V
F
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
A
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
H
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
N
 
Q
A
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
F
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
F
P
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
L
 
-
Q
 
R
S
 
D
L
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
V
Q
 
D
H
 
H
P
 
E
N
 
N
A
 
V
L
 
I
V
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
L
T
x
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
Y
 
K
K
 
E

6rj2A Crystal structure of phgdh in complex with compound 40 (see paper)
37% identity, 77% coverage: 42:280/311 of query aligns to 39:282/299 of 6rj2A

query
sites
6rj2A
E
 
D
V
 
C
H
 
E
A
 
G
I
 
L
I
 
I
T
 
V
R
 
R
G
 
S
K
 
A
K
 
T
H
 
K
I
 
V
D
 
T
K
 
A
T
 
D
L
 
V
M
 
I
D
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
H
 
K
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
R
C
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
E
E
 
A
A
 
A
S
 
T
A
 
R
R
 
K
K
 
G
I
 
I
R
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
G
 
N
S
 
G
N
 
N
A
 
S
A
 
L
T
 
S
I
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
M
 
C
L
 
L
M
 
A
R
 
R
D
 
Q
M
 
I
H
 
P
R
 
Q
S
 
A
V
 
T
N
 
A
H
 
S
V
 
M
K
 
K
Q
 
D
N
 
G
N
 
K
W
 
W
N
 
E
W
 
-
R
 
R
N
 
K
Q
 
K
Y
 
F
A
 
M
G
 
G
D
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
N
 
R
I
|
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
L
 
R
G
 
M
D
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
K
 
K
V
 
T
L
 
I
C
 
G
W
x
Y
-
x
D
-
x
P
-
x
I
-
x
I
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
-
 
S
-
 
A
S
 
S
R
 
F
S
 
G
V
 
V
Q
 
Q
D
 
Q
L
 
L
P
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
W
Q
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
P
 
P
L
 
L
S
 
L
N
 
P
E
 
S
T
 
T
N
 
T
E
 
G
I
x
L
I
 
L
G
 
N
A
 
D
S
 
N
Q
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
K
 
G
A
 
V
F
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
|
R
G
 
G
A
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
H
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
N
 
Q
A
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
F
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
F
P
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
L
 
-
Q
 
R
S
 
D
L
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
V
Q
 
D
H
 
H
P
 
E
N
 
N
A
 
V
L
 
I
V
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
L
T
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
Y
 
K
K
 
E

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
37% identity, 77% coverage: 42:280/311 of query aligns to 47:290/533 of O43175

query
sites
O43175
E
 
D
V
 
C
H
 
E
A
 
G
I
 
L
I
 
I
T
 
V
R
 
R
G
 
S
K
 
A
K
 
T
H
 
K
I
 
V
D
 
T
K
 
A
T
 
D
L
 
V
M
 
I
D
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
H
 
K
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
R
C
 
A
G
 
G
V
x
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
E
E
 
A
A
 
A
S
 
T
A
 
R
R
 
K
K
 
G
I
 
I
R
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
G
 
N
S
 
G
N
 
N
A
 
S
A
 
L
T
 
S
I
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
M
 
C
L
 
L
M
 
A
R
 
R
D
 
Q
M
 
I
H
 
P
R
 
Q
S
 
A
V
 
T
N
 
A
H
 
S
V
 
M
K
 
K
Q
 
D
N
 
G
N
 
K
W
 
W
N
 
E
W
 
-
R
|
R
N
 
K
Q
 
K
Y
 
F
A
 
M
G
 
G
D
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
L
 
R
G
 
M
D
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
K
 
K
V
 
T
L
 
I
C
 
G
W
 
Y
-
x
D
-
 
P
-
 
I
-
 
I
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
-
 
S
-
 
A
S
 
S
R
 
F
S
 
G
V
 
V
Q
 
Q
D
 
Q
L
 
L
P
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
W
Q
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
L
x
T
P
 
P
L
 
L
S
 
L
N
 
P
E
 
S
T
 
T
N
 
T
E
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
N
A
 
D
S
 
N
Q
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
K
 
G
A
 
V
F
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
A
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
H
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
N
 
Q
A
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
F
 
A
A
 
A
A
 
L
D
|
D
V
|
V
L
 
F
P
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
L
 
-
Q
 
R
S
 
D
L
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
V
Q
 
D
H
 
H
P
 
E
N
 
N
A
 
V
L
 
I
V
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
|
L
T
x
G
A
|
A
S
 
S
T
 
T
Y
 
K
K
 
E

Sites not aligning to the query:

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
33% identity, 96% coverage: 2:299/311 of query aligns to 1:316/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
R
 
K
K
 
P
N
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
I
L
 
T
E
 
R
T
 
A
I
 
I
A
 
P
E
 
E
E
 
N
A
 
G
L
 
I
A
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
E
 
E
N
 
H
V
 
F
N
 
E
V
 
V
F
 
E
T
 
V
G
 
W
Y
 
E
D
 
H
E
 
E
A
 
H
G
 
E
L
 
I
K
 
P
D
 
R
T
 
E
-
 
V
-
 
L
L
 
L
N
 
E
N
 
K
V
 
V
-
 
K
E
 
D
V
 
V
H
 
D
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
R
 
M
G
 
L
K
 
S
K
 
E
H
 
K
I
 
I
D
 
D
K
 
R
T
 
E
L
 
V
M
 
F
D
 
D
A
 
A
C
 
A
P
 
P
H
 
R
L
 
L
E
 
R
V
 
I
A
 
V
A
 
A
R
 
N
C
 
Y
G
 
A
V
|
V
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
V
 
I
D
 
D
V
 
I
D
 
E
E
 
E
A
 
A
S
 
T
A
 
K
R
 
R
K
 
G
I
 
I
R
 
Y
V
 
V
I
 
T
N
 
N
A
 
T
P
 
P
G
 
D
S
 
V
N
x
L
A
 
T
A
 
D
T
 
A
I
x
T
A
 
A
E
 
D
H
 
L
T
 
A
L
 
W
A
 
A
L
 
L
M
 
L
L
 
L
M
 
A
L
 
A
M
 
A
R
 
R
D
 
H
M
 
V
H
 
V
R
 
K
S
 
G
V
 
D
N
 
K
H
 
F
V
 
V
K
 
R
Q
 
S
N
 
G
N
 
E
W
 
W
N
 
K
W
 
R
R
 
R
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
N
 
K
Q
 
M
Y
 
F
A
 
L
G
 
G
D
 
Y
E
 
D
L
 
V
N
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
|
G
L
x
F
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
Q
R
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
K
L
 
R
G
 
A
D
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
G
M
 
M
K
 
R
V
 
I
L
 
L
C
 
Y
W
 
T
S
x
A
R
|
R
S
|
S
-
 
R
-
x
K
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
G
V
 
A
Q
 
E
D
 
F
L
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
L
L
 
L
Q
 
R
Q
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
F
V
 
V
S
 
V
L
 
L
H
 
A
L
x
V
P
|
P
L
 
L
S
 
T
N
 
K
E
|
E
T
|
T
N
 
Y
E
 
H
I
 
M
I
 
I
G
 
N
A
 
E
S
 
E
Q
 
R
L
 
L
A
 
R
L
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
K
 
T
A
 
A
F
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
T
x
V
A
|
A
R
|
R
G
 
G
A
 
K
L
 
V
I
 
V
D
 
D
H
 
T
A
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
I
D
 
R
A
 
A
L
 
L
N
 
K
A
 
E
G
 
G
T
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
A
F
 
A
A
 
G
A
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
F
P
 
E
D
 
E
E
|
E
P
 
P
P
 
Y
L
 
Y
Q
 
D
S
 
E
L
 
-
A
 
E
V
 
L
V
 
F
Q
 
A
H
 
L
P
 
D
N
 
N
A
 
V
L
 
V
V
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
A
 
I
A
x
G
S
 
S
L
 
A
T
 
T
A
 
F
S
 
G
T
 
A
Y
 
R
K
 
E
Q
 
G
M
 
M
C
 
A
L
 
E
L
 
L
T
 
V
V
 
A
R
 
K
N
 
N
V
 
L
L
 
I
S
 
A
V
 
F
L
 
K
A
 
N
G
 
G
Q
 
E
Q
 
V
P
 
P

6plfB Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
38% identity, 72% coverage: 58:280/311 of query aligns to 49:276/292 of 6plfB

query
sites
6plfB
L
 
V
M
 
I
D
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
H
 
K
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
R
C
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
E
E
 
A
A
 
A
S
 
T
A
 
R
R
 
K
K
 
G
I
 
I
R
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
G
 
N
S
 
G
N
 
N
A
 
S
A
 
L
T
 
S
I
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
M
 
C
L
 
L
M
 
A
R
 
R
D
 
Q
M
 
I
H
 
P
R
 
Q
S
 
A
V
 
T
N
 
A
H
 
S
V
 
M
K
 
K
Q
 
D
N
 
G
N
 
K
W
 
W
N
 
E
W
 
-
R
 
R
N
 
K
Q
 
K
Y
 
F
A
 
M
G
 
G
D
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
x
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
L
 
R
G
 
M
D
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
K
 
K
V
 
T
L
 
I
C
 
G
W
x
Y
-
x
D
-
x
P
-
 
I
-
x
I
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
-
 
S
-
 
A
S
 
S
R
 
F
S
 
G
V
 
V
Q
 
Q
D
 
Q
L
 
L
P
 
P
L
|
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
W
Q
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
S
 
L
N
 
P
E
x
S
T
 
T
N
 
T
E
 
G
I
x
L
I
 
L
G
 
N
A
 
D
S
 
N
Q
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
K
 
G
A
 
V
F
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
H
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
N
 
Q
A
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
F
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
F
P
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
L
 
-
Q
 
R
S
 
D
L
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
V
Q
 
D
H
 
H
P
 
E
N
 
N
A
 
V
L
 
I
V
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
L
T
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
Y
 
K
K
 
E

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
34% identity, 94% coverage: 4:296/311 of query aligns to 2:304/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
N
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
V
L
 
A
E
 
A
T
 
P
I
 
L
A
 
H
E
 
E
E
 
K
A
 
A
L
 
I
A
 
Q
L
 
V
L
 
L
Q
 
K
E
 
-
N
 
D
V
 
A
N
 
G
V
 
L
F
 
E
T
 
V
G
 
I
Y
 
Y
D
 
E
E
 
E
A
 
Y
G
 
P
L
 
D
K
 
E
D
 
D
T
 
R
L
 
L
N
 
V
N
 
E
V
 
L
-
 
V
-
 
K
E
 
D
V
 
V
H
 
E
A
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
V
R
 
R
G
 
S
K
 
K
K
 
P
H
 
K
I
 
V
D
 
T
K
 
R
T
 
R
L
 
V
M
 
I
D
 
E
A
 
S
C
 
A
P
 
P
H
 
K
L
 
L
E
 
K
V
 
V
A
 
I
A
 
A
R
 
R
C
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
I
D
 
D
V
 
V
D
 
E
E
 
A
A
 
A
S
 
K
A
 
E
R
 
K
K
 
G
I
 
I
R
 
E
V
 
V
I
 
V
N
 
N
A
 
A
P
 
P
G
 
A
S
 
A
N
x
S
A
 
S
A
 
R
T
 
S
I
x
V
A
 
A
E
 
E
H
 
L
T
 
A
L
 
V
A
 
G
L
 
L
M
 
M
L
 
F
M
 
S
L
 
V
M
 
A
R
 
R
D
 
K
M
 
I
H
 
A
R
 
F
S
 
A
V
 
D
N
 
R
H
 
K
V
 
M
K
 
R
Q
 
E
N
 
G
N
 
V
W
 
W
N
 
A
W
 
-
R
 
K
N
 
K
Q
 
E
Y
 
A
A
 
M
G
 
G
D
 
I
E
 
E
L
 
L
N
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
|
G
L
x
F
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
Y
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
K
 
K
L
 
I
G
 
A
D
 
N
A
 
A
F
 
L
G
 
G
M
 
M
K
 
N
V
 
I
L
 
L
C
 
L
W
x
Y
-
x
D
-
x
P
-
 
Y
-
 
P
-
 
N
-
 
E
-
 
E
-
 
R
S
 
A
R
 
K
S
 
E
V
 
V
-
 
N
-
 
G
Q
 
K
D
 
F
L
 
V
P
 
D
L
 
L
D
 
E
E
 
T
V
 
L
L
 
L
Q
 
K
Q
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
S
 
T
L
 
I
H
 
H
L
x
V
P
|
P
L
 
L
S
 
V
N
 
E
E
 
S
T
|
T
N
 
Y
E
 
H
I
 
L
I
 
I
G
 
N
A
 
E
S
 
E
Q
 
R
L
 
L
A
 
K
L
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
K
K
 
T
A
 
A
F
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
|
T
A
x
S
R
|
R
G
 
G
A
 
P
L
 
V
I
 
V
D
 
D
H
 
T
A
 
N
A
 
A
L
 
L
L
 
V
D
 
K
A
 
A
L
 
L
N
 
K
A
 
E
G
 
G
T
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
F
 
A
A
 
G
A
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
F
P
 
E
D
 
E
E
|
E
P
 
P
P
 
L
L
 
P
Q
 
K
S
 
D
L
 
H
A
 
P
V
 
L
V
 
T
Q
 
K
H
 
F
P
 
D
N
 
N
A
 
V
L
 
V
V
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
A
 
I
A
x
G
S
 
A
L
 
S
T
 
T
A
 
V
S
 
E
T
 
A
Y
 
Q
K
 
E
Q
 
R
M
 
A
C
 
G
L
 
V
L
 
E
T
 
V
V
 
A
R
 
E
N
 
K
V
 
V
L
 
V
S
 
K
V
 
I
L
 
L
A
 
K
G
 
G

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
37% identity, 94% coverage: 5:297/311 of query aligns to 5:305/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
V
 
V
L
 
L
L
 
I
L
 
A
E
 
D
T
 
K
I
 
L
A
 
A
E
 
P
E
 
S
A
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
A
L
 
L
Q
 
G
E
 
D
N
 
Q
V
 
V
N
 
E
V
 
V
-
 
R
-
 
W
F
 
V
T
 
D
G
 
G
Y
 
P
D
 
D
E
 
R
A
 
D
G
 
K
L
 
L
K
 
L
D
 
A
T
 
A
L
 
V
N
 
P
N
 
-
V
 
-
E
 
E
V
 
A
H
 
D
A
 
A
I
 
L
I
 
L
T
 
V
R
 
R
G
 
S
K
 
A
K
 
T
H
 
T
I
 
V
D
 
D
K
 
A
T
 
E
L
 
V
M
 
L
D
 
A
A
 
A
C
 
A
P
 
P
H
 
K
L
 
L
E
 
K
V
 
I
A
 
V
A
 
A
R
|
R
C
 
A
G
 
G
V
|
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
V
 
V
D
 
D
E
 
A
A
 
A
S
 
T
A
 
A
R
 
R
K
 
G
I
 
V
R
 
L
V
 
V
I
 
V
N
 
N
A
 
A
P
 
P
G
 
T
S
 
S
N
|
N
A
 
I
A
 
H
T
 
S
I
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
H
T
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
M
 
L
L
 
L
M
 
A
L
 
A
M
 
S
R
 
R
D
 
Q
M
 
I
H
 
P
R
 
A
S
 
A
V
 
D
N
 
A
H
 
S
V
 
L
K
 
R
Q
 
E
N
 
H
N
 
T
W
 
W
N
 
K
W
 
-
R
 
R
N
 
S
Q
 
S
Y
 
F
A
 
S
G
 
G
D
 
T
E
 
E
L
 
I
N
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
Q
R
 
L
V
 
V
A
 
A
K
 
Q
L
 
R
G
 
I
D
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
A
K
 
Y
V
 
V
L
 
V
C
 
A
W
 
Y
S
 
D
R
 
P
S
 
Y
V
 
V
Q
 
S
D
 
P
-
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
E
-
 
L
L
 
L
P
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
V
 
L
L
 
L
Q
 
A
Q
 
R
S
 
A
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
S
L
 
V
H
 
H
L
 
L
P
 
P
L
 
K
S
 
T
N
 
P
E
 
E
T
 
T
N
 
A
E
 
G
I
 
L
I
 
I
G
 
D
A
 
K
S
 
E
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
K
M
 
T
K
 
K
P
 
P
K
 
G
A
 
V
F
 
I
L
 
I
I
 
V
N
 
N
T
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
A
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
H
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
N
 
T
A
 
G
G
 
G
T
 
H
I
 
V
A
 
R
G
 
A
F
 
A
A
 
G
A
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
F
P
 
A
D
 
T
E
|
E
P
 
P
-
 
C
-
 
T
-
 
D
-
 
S
P
 
P
L
 
L
Q
 
F
S
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
Q
V
 
V
Q
 
-
H
 
-
P
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
A
 
L
A
 
G
S
x
A
L
 
S
T
 
T
A
 
A
S
 
E
T
 
A
Y
x
Q
K
 
D
Q
 
R
M
 
A
C
 
G
L
 
T
L
 
D
T
 
V
V
 
A
R
 
E
N
 
S
V
 
V
L
 
R
S
 
L
V
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Q
 
E

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
37% identity, 94% coverage: 5:297/311 of query aligns to 4:304/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
V
 
V
L
 
L
L
 
I
L
 
A
E
 
D
T
 
K
I
 
L
A
 
A
E
 
P
E
 
S
A
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
A
L
 
L
Q
 
G
E
 
D
N
 
Q
V
 
V
N
 
E
V
 
V
-
 
R
-
 
W
F
 
V
T
 
D
G
 
G
Y
 
P
D
 
D
E
 
R
A
 
D
G
 
K
L
 
L
K
 
L
D
 
A
T
 
A
L
 
V
N
 
P
N
 
-
V
 
-
E
 
E
V
 
A
H
 
D
A
 
A
I
 
L
I
 
L
T
 
V
R
 
R
G
 
S
K
 
A
K
 
T
H
 
T
I
 
V
D
 
D
K
 
A
T
 
E
L
 
V
M
 
L
D
 
A
A
 
A
C
 
A
P
 
P
H
 
K
L
 
L
E
 
K
V
 
I
A
 
V
A
 
A
R
 
R
C
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
V
 
V
D
 
D
E
 
A
A
 
A
S
 
T
A
 
A
R
 
R
K
 
G
I
 
V
R
 
L
V
 
V
I
 
V
N
 
N
A
 
A
P
 
P
G
 
T
S
 
S
N
|
N
A
 
I
A
 
H
T
 
S
I
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
H
T
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
M
 
L
L
 
L
M
 
A
L
 
A
M
 
S
R
 
R
D
 
Q
M
 
I
H
 
P
R
 
A
S
 
A
V
 
D
N
 
A
H
 
S
V
 
L
K
 
R
Q
 
E
N
 
H
N
 
T
W
 
W
N
 
K
W
 
-
R
 
R
N
 
S
Q
 
S
Y
 
F
A
 
S
G
 
G
D
 
T
E
 
E
L
 
I
N
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
Q
R
 
L
V
 
V
A
 
A
K
 
Q
L
 
R
G
 
I
D
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
A
K
 
Y
V
 
V
L
 
V
C
 
A
W
 
Y
S
 
D
R
 
P
S
 
Y
V
 
V
Q
 
S
D
 
P
-
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
E
-
 
L
L
 
L
P
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
V
 
L
L
 
L
Q
 
A
Q
 
R
S
 
A
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
S
L
 
V
H
 
H
L
 
L
P
 
P
L
 
K
S
 
T
N
 
P
E
 
E
T
 
T
N
 
A
E
 
G
I
 
L
I
 
I
G
 
D
A
 
K
S
 
E
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
K
M
 
T
K
 
K
P
 
P
K
 
G
A
 
V
F
 
I
L
 
I
I
 
V
N
 
N
T
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
A
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
H
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
N
 
T
A
 
G
G
 
G
T
 
H
I
 
V
A
 
R
G
 
A
F
 
A
A
 
G
A
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
F
P
 
A
D
 
T
E
|
E
P
 
P
-
 
C
-
 
T
-
 
D
-
 
S
P
 
P
L
 
L
Q
 
F
S
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
Q
V
 
V
Q
 
-
H
 
-
P
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
A
 
L
A
 
G
S
 
A
L
 
S
T
 
T
A
 
A
S
 
E
T
 
A
Y
 
Q
K
 
D
Q
 
R
M
 
A
C
 
G
L
 
T
L
 
D
T
 
V
V
 
A
R
 
E
N
 
S
V
 
V
L
 
R
S
 
L
V
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

8wpiA Anabaena mcyi with prebound NAD and soaked NADP
35% identity, 83% coverage: 42:299/311 of query aligns to 40:309/318 of 8wpiA

query
sites
8wpiA
E
 
D
V
 
V
H
 
S
A
 
G
I
 
V
I
 
F
T
 
V
R
 
R
G
x
Y
K
 
P
K
 
T
H
 
K
I
 
L
D
 
D
K
 
A
T
 
Q
L
 
A
M
 
I
D
 
G
A
 
L
C
 
A
P
 
K
H
 
N
L
 
L
E
 
K
V
 
V
A
 
I
A
 
S
R
 
T
C
x
S
G
|
G
V
x
F
G
|
G
L
 
T
D
 
D
N
 
A
V
 
I
D
 
D
V
 
I
D
 
A
E
 
A
A
 
A
S
 
T
A
 
K
R
 
R
K
 
G
I
 
I
R
 
V
V
 
V
I
 
V
N
 
N
A
 
N
P
 
P
G
 
G
S
 
L
N
 
S
A
 
T
A
 
T
T
 
A
I
x
V
A
 
T
E
 
E
H
 
H
T
 
T
L
 
L
A
 
S
L
 
M
M
 
I
L
 
L
M
 
A
L
|
L
M
 
A
R
 
K
D
x
K
M
 
L
H
 
T
R
x
F
S
 
L
V
 
N
N
 
Q
H
 
C
V
 
V
K
 
K
Q
 
A
N
 
G
N
 
N
W
 
Y
N
 
L
W
 
I
R
 
R
N
 
N
Q
 
Q
Y
 
V
A
 
Q
G
 
P
D
 
I
E
 
Q
L
 
L
N
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
|
G
L
 
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
S
R
 
A
V
 
V
A
 
A
K
 
K
L
 
I
-
 
C
G
 
S
D
 
T
A
 
A
F
 
L
G
 
Q
M
 
M
K
 
R
V
 
V
L
 
L
C
 
A
W
x
Y
-
x
D
-
x
P
-
x
Y
-
 
V
-
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
R
S
 
A
R
 
T
S
 
L
V
 
V
Q
 
Q
D
 
D
L
 
L
P
 
-
L
 
-
D
 
D
E
 
Y
V
 
L
L
 
L
Q
 
T
Q
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
F
V
 
V
S
 
S
L
 
L
H
|
H
L
x
P
P
x
E
L
 
L
S
 
T
N
 
D
E
|
E
T
|
T
N
 
C
E
 
E
I
 
M
I
 
F
G
 
D
A
 
L
S
 
E
Q
 
A
L
 
F
A
 
K
L
 
K
M
 
M
K
 
K
P
 
P
K
 
S
A
 
A
F
|
F
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
|
T
A
x
S
R
|
R
G
 
G
A
 
K
L
 
V
I
 
V
D
 
R
H
 
Q
A
 
P
A
 
D
L
 
L
L
 
V
D
 
T
A
 
A
L
 
I
N
 
R
A
 
E
G
 
K
T
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
G
F
 
A
A
 
A
A
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
F
P
 
E
D
 
P
E
 
E
P
 
P
P
 
P
L
 
A
Q
 
I
S
 
N
L
 
N
A
 
P
V
 
L
V
 
Y
Q
 
E
H
 
F
P
x
D
N
|
N
A
 
V
L
 
I
V
 
F
T
 
S
P
 
P
H
|
H
A
 
L
A
 
A
S
 
G
L
x
V
T
|
T
A
 
P
S
 
E
T
 
A
Y
x
G
K
 
M
Q
 
A
M
 
A
C
 
A
L
 
L
L
 
S
T
 
A
V
 
A
R
 
N
N
 
Q
V
 
I
L
 
L
S
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
Q
 
E
Q
 
K
P
 
P

Sites not aligning to the query:

8wprA Anabaena mcyi r166a with prebound NAD and malate
35% identity, 83% coverage: 42:299/311 of query aligns to 42:311/320 of 8wprA

query
sites
8wprA
E
 
D
V
 
V
H
 
S
A
 
G
I
 
V
I
 
F
T
 
V
R
 
R
G
 
Y
K
 
P
K
 
T
H
 
K
I
 
L
D
 
D
K
 
A
T
 
Q
L
 
A
M
 
I
D
 
G
A
 
L
C
 
A
P
 
K
H
 
N
L
 
L
E
 
K
V
 
V
A
 
I
A
 
S
R
 
T
C
 
S
G
 
G
V
 
F
G
 
G
L
 
T
D
 
D
N
 
A
V
 
I
D
 
D
V
 
I
D
 
A
E
 
A
A
 
A
S
 
T
A
 
K
R
 
R
K
 
G
I
 
I
R
 
V
V
 
V
I
 
V
N
 
N
A
 
N
P
 
P
G
 
G
S
 
L
N
x
S
A
 
T
A
 
T
T
 
A
I
x
V
A
 
T
E
 
E
H
 
H
T
 
T
L
 
L
A
 
S
L
 
M
M
 
I
L
 
L
M
 
A
L
 
L
M
 
A
R
 
K
D
 
K
M
 
L
H
 
T
R
 
F
S
 
L
V
 
N
N
 
Q
H
 
C
V
 
V
K
 
K
Q
 
A
N
 
G
N
 
N
W
 
Y
N
 
L
W
 
I
R
 
R
N
 
N
Q
 
Q
Y
 
V
A
 
Q
G
 
P
D
 
I
E
 
Q
L
 
L
N
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
 
G
L
 
L
G
|
G
N
x
A
I
|
I
G
 
G
K
 
S
R
 
A
V
 
V
A
 
A
K
 
K
L
 
I
-
 
C
G
 
S
D
 
T
A
 
A
F
 
L
G
 
Q
M
 
M
K
 
R
V
 
V
L
 
L
C
 
A
W
x
Y
-
x
D
-
x
P
-
x
Y
-
 
V
-
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
R
S
 
A
R
 
T
S
 
L
V
 
V
Q
 
Q
D
 
D
L
 
L
P
 
-
L
 
-
D
 
D
E
 
Y
V
 
L
L
 
L
Q
 
T
Q
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
F
V
 
V
S
 
S
L
 
L
H
 
H
L
x
P
P
x
E
L
 
L
S
 
T
N
 
D
E
|
E
T
|
T
N
 
C
E
 
E
I
 
M
I
 
F
G
 
D
A
 
L
S
 
E
Q
 
A
L
 
F
A
 
K
L
 
K
M
 
M
K
 
K
P
 
P
K
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
|
T
A
x
S
R
|
R
G
 
G
A
 
K
L
 
V
I
 
V
D
 
R
H
 
Q
A
 
P
A
 
D
L
 
L
L
 
V
D
 
T
A
 
A
L
 
I
N
 
R
A
 
E
G
 
K
T
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
G
F
 
A
A
 
A
A
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
F
P
 
E
D
 
P
E
 
E
P
 
P
P
 
P
L
 
A
Q
 
I
S
 
N
L
 
N
A
 
P
V
 
L
V
 
Y
Q
 
E
H
 
F
P
 
D
N
 
N
A
 
V
L
 
I
V
 
F
T
 
S
P
 
P
H
|
H
A
 
L
A
 
A
S
x
G
L
 
V
T
 
T
A
 
P
S
 
E
T
 
A
Y
 
G
K
 
M
Q
 
A
M
 
A
C
 
A
L
 
L
L
 
S
T
 
A
V
 
A
R
 
N
N
 
Q
V
 
I
L
 
L
S
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
Q
 
E
Q
 
K
P
 
P

Query Sequence

>CA265_RS12240 FitnessBrowser__Pedo557:CA265_RS12240
MRKNVLLLETIAEEALALLQENVNVFTGYDEAGLKDTLNNVEVHAIITRGKKHIDKTLMD
ACPHLEVAARCGVGLDNVDVDEASARKIRVINAPGSNAATIAEHTLALMLMLMRDMHRSV
NHVKQNNWNWRNQYAGDELNGKTLGILGLGNIGKRVAKLGDAFGMKVLCWSRSVQDLPLD
EVLQQSDVVSLHLPLSNETNEIIGASQLALMKPKAFLINTARGALIDHAALLDALNAGTI
AGFAADVLPDEPPLQSLAVVQHPNALVTPHAASLTASTYKQMCLLTVRNVLSVLAGQQPE
LNSIYNRNAFI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory