SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CA265_RS13660 FitnessBrowser__Pedo557:CA265_RS13660 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
33% identity, 96% coverage: 7:258/262 of query aligns to 3:248/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
L
 
L
K
 
D
G
 
N
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
V
 
A
T
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
H
M
 
S
M
 
Y
A
 
A
K
 
K
A
 
E
G
 
G
C
 
A
T
 
K
V
 
V
I
 
I
G
 
-
C
 
V
A
 
S
E
x
D
Q
x
I
S
 
N
E
 
E
T
 
-
S
 
-
D
 
D
V
 
H
A
 
G
Q
 
N
R
 
K
F
 
A
L
 
V
A
 
E
E
 
D
M
 
I
E
 
K
S
 
A
F
 
Q
D
 
G
A
 
G
H
 
E
T
 
A
D
 
S
Y
 
F
F
 
V
K
 
K
A
|
A
D
|
D
M
x
T
V
 
S
V
 
N
T
 
P
E
 
E
D
 
E
I
 
V
D
 
E
G
 
A
L
 
L
V
 
V
S
 
K
D
 
R
I
 
T
T
 
V
N
 
E
D
 
I
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
C
S
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
-
 
I
-
 
G
-
 
G
Q
 
E
N
 
Q
V
 
A
F
 
L
T
 
A
G
 
G
L
 
-
E
 
-
N
 
D
S
 
Y
T
 
G
E
 
L
K
 
D
N
 
S
W
 
W
Q
 
R
F
 
K
N
 
V
L
 
L
D
 
S
L
 
I
N
 
N
L
 
L
S
 
D
A
 
G
H
 
V
W
 
F
R
 
Y
L
 
G
A
 
C
K
 
K
-
 
Y
R
 
E
C
 
L
K
 
E
S
 
Q
L
 
M
L
 
E
N
 
K
T
 
N
N
 
G
N
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
I
I
 
V
V
 
N
M
|
M
A
 
A
S
|
S
N
 
I
H
 
H
A
 
G
F
 
I
A
 
V
S
 
A
I
 
A
P
 
P
G
 
L
C
 
S
A
 
S
P
 
A
Y
|
Y
N
 
T
I
 
S
A
 
A
K
|
K
T
 
H
A
 
A
L
 
V
T
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
T
R
 
K
S
 
N
L
 
I
A
 
G
I
 
A
E
 
E
W
 
Y
G
 
G
-
 
Q
P
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
T
 
C
I
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
G
P
|
P
G
x
A
F
x
Y
I
|
I
D
 
E
T
 
T
P
 
P
G
 
-
N
 
-
Q
 
-
Q
 
-
W
x
L
F
 
L
N
 
E
S
 
S
F
 
L
I
 
T
Q
 
K
P
 
-
E
 
-
E
 
E
E
 
M
R
 
K
Q
 
E
R
 
A
T
 
L
I
 
I
N
 
S
L
 
K
H
 
H
P
 
P
V
 
M
K
 
G
K
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
K
V
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
G
 
A
G
 
E
W
 
L
C
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
S
 
S
S
 
S
E
 
E
Y
 
K
A
 
S
G
 
S
F
 
F
A
 
M
S
 
T
G
 
G
T
 
G
T
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
S
 
T
A
 
A
M
 
V

Q9BTZ2 Dehydrogenase/reductase SDR family member 4; NADPH-dependent carbonyl reductase; CR; NADPH-dependent retinol dehydrogenase/reductase; NRDR; humNRDR; Peroxisomal short-chain alcohol dehydrogenase; PSCD; SCAD-SRL; Short chain dehydrogenase/reductase family 25C member 2; Protein SDR25C2; Short-chain dehydrogenase/reductase family member 4; EC 1.1.1.184 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
34% identity, 95% coverage: 7:254/262 of query aligns to 30:273/278 of Q9BTZ2

query
sites
Q9BTZ2
L
 
L
K
 
A
G
 
N
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
A
V
 
S
T
 
T
S
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
F
G
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
M
 
R
M
 
L
A
 
A
K
 
Q
A
 
D
G
 
G
C
 
A
T
 
H
V
 
V
I
 
V
G
 
V
C
 
S
A
 
S
E
 
R
Q
 
K
S
 
Q
E
 
Q
T
 
N
S
 
V
D
 
D
V
 
Q
A
 
A
Q
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
V
A
 
A
E
 
T
M
 
L
E
 
Q
S
 
G
F
 
E
D
 
G
A
 
L
H
 
S
T
 
V
D
 
T
Y
 
G
F
 
T
K
 
V
A
 
C
D
 
H
M
 
V
V
 
G
V
 
K
T
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
R
D
 
E
G
 
R
L
 
L
V
 
V
S
 
A
D
 
T
I
 
A
T
 
V
N
 
K
D
 
L
Y
 
H
G
 
G
R
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
A
 
A
G
 
A
Q
 
V
N
 
N
V
 
P
F
 
F
T
 
F
G
 
G
-
 
S
L
 
I
E
 
M
N
 
D
S
 
V
T
 
T
E
 
E
K
 
E
N
 
V
W
 
W
Q
 
D
F
 
K
N
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
I
N
 
N
L
 
V
S
 
K
A
 
A
H
 
P
W
 
A
R
 
L
L
 
M
A
 
T
K
 
K
R
 
A
C
 
V
-
 
V
K
 
P
S
 
E
L
 
M
L
 
E
N
 
K
T
 
R
N
 
G
N
 
G
G
 
G
V
 
S
I
 
V
I
 
V
V
 
I
M
 
V
A
 
S
S
 
S
N
 
I
H
 
A
A
 
A
F
 
F
A
 
S
S
 
P
I
x
S
P
 
P
G
 
G
C
x
F
A
 
S
P
 
P
Y
 
Y
N
 
N
I
 
V
A
 
S
K
 
K
T
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
T
R
 
K
S
x
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
W
 
L
G
 
A
P
 
P
-
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
R
T
 
V
I
 
N
G
 
C
I
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
L
I
 
I
D
 
K
T
 
T
P
 
S
G
 
F
N
 
S
Q
 
R
Q
 
M
-
 
L
W
 
W
F
 
M
N
 
D
S
 
K
F
 
-
I
 
-
Q
 
E
P
 
K
E
 
E
E
 
E
E
 
S
R
 
M
Q
 
K
R
 
E
T
 
T
I
 
L
N
 
R
L
 
-
H
 
-
P
 
-
V
 
I
K
 
R
K
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
E
V
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
C
G
 
A
G
 
G
W
 
I
C
 
V
V
 
S
F
 
F
L
 
L
S
 
C
S
 
S
E
 
E
Y
 
D
A
 
A
G
 
S
F
 
Y
A
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
E
T
 
T
Y
 
V
L
 
V
I
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

3o4rA Crystal structure of human dehydrogenase/reductase (sdr family) member 4 (dhrs4)
34% identity, 95% coverage: 7:254/262 of query aligns to 6:249/254 of 3o4rA

query
sites
3o4rA
L
 
L
K
 
A
G
 
N
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
x
A
V
 
S
T
|
T
S
x
D
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
F
G
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
M
 
R
M
 
L
A
 
A
K
 
Q
A
 
D
G
 
G
C
 
A
T
 
H
V
 
V
I
 
V
G
 
V
C
 
S
A
x
S
E
x
R
Q
x
K
S
 
Q
E
 
Q
T
x
N
S
 
V
D
 
D
V
 
Q
A
 
A
Q
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
V
A
 
A
E
 
T
M
 
L
E
 
Q
S
 
G
F
 
E
D
 
G
A
 
L
H
 
S
T
 
V
D
 
T
Y
 
G
F
 
T
K
 
V
A
 
C
D
x
H
M
x
V
V
 
G
V
 
K
T
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
R
D
 
E
G
 
R
L
 
L
V
 
V
S
 
A
D
 
T
I
 
A
T
 
V
N
 
K
D
 
L
Y
 
H
G
 
G
R
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
S
N
|
N
A
 
A
G
x
A
Q
 
V
N
 
N
V
 
P
F
 
F
T
 
F
G
 
G
-
 
S
L
 
I
E
 
M
N
 
D
S
 
V
T
 
T
E
 
E
K
 
E
N
 
V
W
 
W
Q
 
D
F
 
K
N
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
I
N
 
N
L
 
V
S
 
K
A
 
A
H
 
P
W
 
A
R
 
L
L
 
M
A
 
T
K
 
K
R
 
A
C
 
V
-
 
V
K
 
P
S
 
E
L
 
M
L
 
E
N
 
K
T
 
R
N
 
G
N
 
G
G
 
G
V
 
S
I
 
V
I
 
V
V
 
I
M
 
V
A
 
S
S
|
S
N
 
I
H
 
A
A
 
A
F
 
F
A
 
S
S
 
P
I
 
S
P
 
P
G
 
G
C
x
F
A
 
S
P
 
P
Y
|
Y
N
 
N
I
 
V
A
 
S
K
|
K
T
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
T
R
 
K
S
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
W
 
L
G
 
A
P
 
P
-
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
R
T
 
V
I
 
N
G
 
C
I
 
L
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
x
L
I
|
I
D
 
K
T
|
T
P
 
S
G
x
F
N
x
S
Q
 
R
Q
 
M
-
 
L
W
 
W
F
 
M
N
 
D
S
x
K
F
 
-
I
 
-
Q
 
E
P
 
K
E
 
E
E
 
E
E
 
S
R
 
M
Q
 
K
R
 
E
T
 
T
I
 
L
N
 
R
L
 
-
H
 
-
P
 
-
V
 
I
K
 
R
K
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
E
V
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
C
G
 
A
G
 
G
W
 
I
C
 
V
V
 
S
F
 
F
L
 
L
S
 
C
S
 
S
E
 
E
Y
 
D
A
 
A
G
 
S
F
 
Y
A
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
E
T
 
T
Y
 
V
L
 
V
I
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

4urfB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
34% identity, 95% coverage: 7:254/262 of query aligns to 3:244/248 of 4urfB

query
sites
4urfB
L
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
I
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
V
 
A
T
x
G
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
G
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
L
M
 
T
M
 
Y
A
 
A
K
 
A
A
 
E
G
 
G
C
 
A
T
 
N
V
 
V
I
 
V
G
 
-
C
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
V
S
 
S
E
x
D
T
x
I
S
 
S
D
 
D
V
 
E
-
 
W
A
 
G
Q
 
R
R
 
E
F
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
L
M
 
I
E
 
E
S
 
G
F
 
K
D
 
G
A
 
G
H
 
K
T
 
A
D
 
V
Y
 
F
F
 
Q
K
 
H
A
 
A
D
|
D
M
x
T
V
 
A
V
 
H
T
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
H
D
 
D
G
 
E
L
 
L
V
 
I
S
 
A
D
 
A
I
 
A
T
 
K
N
 
R
D
 
A
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
C
S
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
-
x
I
Q
 
S
N
x
G
V
 
E
F
 
F
T
 
T
G
 
P
L
 
T
E
 
A
N
 
E
S
 
T
T
 
T
E
 
D
K
 
A
N
 
Q
W
 
W
Q
 
Q
F
x
R
N
 
V
L
 
I
D
 
G
L
 
I
N
 
N
L
 
L
S
 
S
A
 
G
-
 
V
H
 
F
W
 
Y
R
 
G
L
 
V
A
 
R
K
 
A
R
 
Q
C
 
I
K
 
R
S
 
A
L
 
M
L
 
L
N
 
E
T
 
T
N
 
G
N
 
G
G
 
G
V
 
A
I
 
I
I
 
V
V
 
N
M
x
I
A
 
S
S
|
S
N
 
I
H
 
A
A
 
G
F
 
Q
A
 
I
S
 
G
I
 
I
P
 
E
G
 
G
C
x
I
A
 
T
P
 
P
Y
|
Y
N
 
T
I
 
A
A
 
A
K
|
K
T
 
H
A
 
G
L
 
V
T
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
T
R
 
K
S
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
W
E
 
E
W
 
Y
G
 
G
-
 
S
P
 
K
G
 
G
I
 
I
R
|
R
T
 
I
I
 
N
G
 
S
I
 
V
A
 
G
P
|
P
G
x
A
F
 
F
I
|
I
D
 
N
T
|
T
P
 
-
G
 
-
N
 
-
Q
 
-
Q
 
-
W
 
-
F
 
-
N
 
-
S
 
T
F
 
L
I
 
V
Q
 
Q
-
 
N
-
 
V
P
 
P
E
 
L
E
 
E
E
 
T
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
T
 
L
I
 
E
N
 
Q
L
 
M
H
 
H
P
 
A
V
x
L
K
x
R
K
x
R
L
 
L
G
 
G
T
 
E
V
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
V
G
 
A
G
 
N
W
 
L
C
 
V
V
 
A
F
 
W
L
 
L
S
 
S
S
|
S
E
 
D
Y
 
K
A
 
A
G
 
S
F
 
F
A
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
Y
Y
 
Y
L
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4urfA Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
34% identity, 95% coverage: 7:254/262 of query aligns to 3:244/248 of 4urfA

query
sites
4urfA
L
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
I
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
V
 
A
T
x
G
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
G
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
L
M
 
T
M
 
Y
A
 
A
K
 
A
A
 
E
G
 
G
C
 
A
T
 
N
V
 
V
I
 
V
G
 
-
C
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
V
S
 
S
E
x
D
T
x
I
S
 
S
D
 
D
V
 
E
-
x
W
A
 
G
Q
 
R
R
 
E
F
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
L
M
 
I
E
 
E
S
 
G
F
 
K
D
 
G
A
 
G
H
 
K
T
 
A
D
 
V
Y
 
F
F
 
Q
K
 
H
A
 
A
D
|
D
M
x
T
V
 
A
V
 
H
T
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
H
D
 
D
G
 
E
L
 
L
V
 
I
S
 
A
D
 
A
I
 
A
T
 
K
N
 
R
D
 
A
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
C
S
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
-
x
I
Q
x
S
N
x
G
V
x
E
F
 
F
T
|
T
G
 
P
L
 
T
E
 
A
N
x
E
S
 
T
T
|
T
E
 
D
K
 
A
N
x
Q
W
 
W
Q
 
Q
F
x
R
N
 
V
L
 
I
D
 
G
L
 
I
N
 
N
L
 
L
S
 
S
A
 
G
-
 
V
H
 
F
W
 
Y
R
 
G
L
 
V
A
 
R
K
 
A
R
 
Q
C
 
I
K
 
R
S
 
A
L
 
M
L
 
L
N
 
E
T
 
T
N
 
G
N
 
G
G
 
G
V
 
A
I
 
I
I
 
V
V
 
N
M
x
I
A
 
S
S
|
S
N
 
I
H
 
A
A
 
G
F
 
Q
A
 
I
S
 
G
I
 
I
P
 
E
G
 
G
C
x
I
A
 
T
P
 
P
Y
|
Y
N
 
T
I
 
A
A
 
A
K
|
K
T
 
H
A
 
G
L
 
V
T
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
T
R
 
K
S
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
W
E
 
E
W
 
Y
G
 
G
-
x
S
P
 
K
G
|
G
I
 
I
R
 
R
T
 
I
I
 
N
G
 
S
I
 
V
A
 
G
P
|
P
G
 
A
F
 
F
I
|
I
D
 
N
T
|
T
P
 
-
G
 
-
N
 
-
Q
 
-
Q
 
-
W
 
-
F
 
-
N
 
-
S
 
T
F
 
L
I
 
V
Q
 
Q
-
 
N
-
 
V
P
 
P
E
 
L
E
 
E
E
 
T
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
T
 
L
I
 
E
N
 
Q
L
 
M
H
 
H
P
 
A
V
 
L
K
 
R
K
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
E
V
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
V
G
 
A
G
 
N
W
 
L
C
 
V
V
 
A
F
 
W
L
 
L
S
 
S
S
 
S
E
 
D
Y
 
K
A
 
A
G
 
S
F
 
F
A
 
V
S
 
T
G
 
G
T
x
S
T
x
Y
Y
 
Y
L
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4ureB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
34% identity, 95% coverage: 7:254/262 of query aligns to 3:244/248 of 4ureB

query
sites
4ureB
L
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
I
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
A
T
 
G
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
G
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
L
M
 
T
M
 
Y
A
 
A
K
 
A
A
 
E
G
 
G
C
 
A
T
 
N
V
 
V
I
 
V
G
 
-
C
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
V
S
 
S
E
 
D
T
 
I
S
 
S
D
 
D
V
 
E
-
 
W
A
 
G
Q
 
R
R
 
E
F
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
L
M
 
I
E
 
E
S
 
G
F
 
K
D
 
G
A
 
G
H
 
K
T
 
A
D
 
V
Y
 
F
F
 
Q
K
 
H
A
 
A
D
 
D
M
 
T
V
 
A
V
 
H
T
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
H
D
 
D
G
 
E
L
 
L
V
 
I
S
 
A
D
 
A
I
 
A
T
 
K
N
 
R
D
 
A
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
C
S
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
-
 
I
Q
 
S
N
 
G
V
 
E
F
 
F
T
 
T
G
 
P
L
 
T
E
 
A
N
 
E
S
 
T
T
 
T
E
 
D
K
 
A
N
 
Q
W
 
W
Q
 
Q
F
 
R
N
 
V
L
 
I
D
 
G
L
 
I
N
 
N
L
 
L
S
 
S
A
 
G
-
 
V
H
 
F
W
 
Y
R
 
G
L
 
V
A
 
R
K
 
A
R
 
Q
C
 
I
K
 
R
S
 
A
L
 
M
L
 
L
N
 
E
T
 
T
N
 
G
N
 
G
G
 
G
V
 
A
I
 
I
I
 
V
V
 
N
M
 
I
A
 
S
S
|
S
N
 
I
H
 
A
A
 
G
F
 
Q
A
 
I
S
 
G
I
 
I
P
 
E
G
 
G
C
x
I
A
 
T
P
 
P
Y
|
Y
N
 
T
I
 
A
A
 
A
K
|
K
T
 
H
A
 
G
L
 
V
T
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
T
R
 
K
S
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
W
E
 
E
W
 
Y
G
 
G
-
 
S
P
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
T
 
I
I
 
N
G
 
S
I
 
V
A
 
G
P
|
P
G
x
A
F
 
F
I
 
I
D
 
N
T
 
T
P
 
-
G
 
-
N
 
-
Q
 
-
Q
 
-
W
 
-
F
 
-
N
 
-
S
 
T
F
 
L
I
 
V
Q
 
Q
-
 
N
-
 
V
P
 
P
E
 
L
E
 
E
E
 
T
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
T
 
L
I
 
E
N
 
Q
L
 
M
H
 
H
P
 
A
V
 
L
K
 
R
K
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
E
V
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
V
G
 
A
G
 
N
W
 
L
C
 
V
V
 
A
F
 
W
L
 
L
S
 
S
S
 
S
E
 
D
Y
 
K
A
 
A
G
 
S
F
 
F
A
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
Y
Y
 
Y
L
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

2zatA Crystal structure of a mammalian reductase (see paper)
32% identity, 97% coverage: 7:259/262 of query aligns to 3:251/251 of 2zatA

query
sites
2zatA
L
 
L
K
 
E
G
 
N
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
x
A
V
 
S
T
|
T
S
x
D
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
M
 
R
M
 
L
A
 
A
K
 
Q
A
 
D
G
 
G
C
 
A
T
 
H
V
 
V
I
 
V
G
 
V
C
 
S
A
x
S
E
x
R
Q
x
K
S
 
Q
E
 
E
T
x
N
S
 
V
D
 
D
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
R
F
 
T
L
 
V
A
 
A
E
 
T
M
 
L
E
 
Q
S
 
G
F
 
E
D
 
G
A
 
L
H
 
S
T
 
V
D
 
T
Y
 
G
F
 
T
K
 
V
A
 
C
D
x
H
M
 
V
V
 
G
V
 
K
T
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
R
D
 
E
G
 
R
L
 
L
V
 
V
S
 
A
D
 
M
I
 
A
T
 
V
N
 
N
D
 
L
Y
 
H
G
 
G
R
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
S
N
|
N
A
 
A
G
x
A
Q
 
V
N
 
N
V
 
P
F
 
F
T
 
F
G
 
G
-
 
N
L
 
I
E
 
I
N
 
D
S
 
A
T
 
T
E
 
E
K
 
E
N
 
V
W
 
W
Q
 
D
F
 
K
N
 
I
L
 
L
D
 
H
L
 
V
N
 
N
L
 
V
S
 
K
A
 
A
H
 
T
W
 
V
R
 
L
L
 
M
A
 
T
K
 
K
R
 
A
C
 
V
-
 
V
K
 
P
S
 
E
L
 
M
L
 
E
N
 
K
T
 
R
N
 
G
N
 
G
G
 
G
V
 
S
I
 
V
I
 
L
V
 
I
M
x
V
A
 
S
S
|
S
N
 
V
H
 
G
A
 
A
F
 
Y
A
 
H
S
 
P
I
 
F
P
 
P
G
 
N
C
x
L
A
 
G
P
 
P
Y
|
Y
N
 
N
I
 
V
A
 
S
K
|
K
T
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
T
R
 
K
S
 
N
L
 
L
A
 
A
I
 
V
E
 
E
W
 
L
G
 
A
P
 
P
-
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
R
T
 
V
I
 
N
G
 
C
I
 
L
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
L
I
|
I
D
 
K
T
|
T
P
 
N
G
x
F
N
x
S
Q
 
Q
Q
 
V
W
 
L
F
 
W
N
 
M
S
 
D
F
x
K
I
 
A
Q
 
R
P
 
K
E
 
E
E
 
Y
E
 
M
R
 
K
Q
 
E
R
 
S
T
 
L
I
 
-
N
 
-
L
 
-
H
 
-
P
 
R
V
 
I
K
 
R
K
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
N
V
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
C
G
 
A
G
 
G
W
 
I
C
 
V
V
 
S
F
 
F
L
 
L
S
 
C
S
 
S
E
 
E
Y
 
D
A
 
A
G
 
S
F
 
Y
A
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
E
T
 
T
Y
 
V
L
 
V
I
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
T
S
 
A
A
 
S
M
 
R
M
 
L

Q8WNV7 Dehydrogenase/reductase SDR family member 4; NADPH-dependent carbonyl reductase; CR; PHCR; NADPH-dependent retinol dehydrogenase/reductase; NDRD; Peroxisomal carbonyl reductase; PerCR; Peroxisomal short-chain alcohol dehydrogenase; PSCD; Short chain dehydrogenase/reductase family 25C member 2; Protein SDR25C2; EC 1.1.1.184; EC 1.1.1.300 from Sus scrofa (Pig) (see 2 papers)
32% identity, 97% coverage: 7:259/262 of query aligns to 31:279/279 of Q8WNV7

query
sites
Q8WNV7
L
 
L
K
 
E
G
 
N
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
|
L
V
|
V
T
|
T
G
x
A
V
x
S
T
|
T
S
x
D
G
|
G
I
|
I
G
|
G
L
|
L
G
x
A
I
|
I
A
|
A
K
x
R
M
x
R
M
x
L
A
|
A
K
x
Q
A
x
D
G
|
G
C
x
A
T
x
H
V
|
V
I
x
V
G
 
V
C
 
S
A
 
S
E
 
R
Q
 
K
S
 
Q
E
 
E
T
 
N
S
 
V
D
 
D
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
R
F
 
T
L
 
V
A
 
A
E
 
T
M
 
L
E
 
Q
S
 
G
F
 
E
D
 
G
A
 
L
H
 
S
T
 
V
D
 
T
Y
 
G
F
 
T
K
 
V
A
 
C
D
 
H
M
 
V
V
 
G
V
 
K
T
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
R
D
 
E
G
 
R
L
 
L
V
 
V
S
 
A
D
 
M
I
 
A
T
 
V
N
 
N
D
 
L
Y
 
H
G
 
G
R
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
A
 
A
G
 
A
Q
 
V
N
 
N
V
 
P
F
 
F
T
 
F
G
 
G
-
 
N
L
 
I
E
 
I
N
 
D
S
 
A
T
 
T
E
 
E
K
 
E
N
 
V
W
 
W
Q
 
D
F
 
K
N
 
I
L
 
L
D
 
H
L
 
V
N
 
N
L
 
V
S
 
K
A
 
A
H
 
T
W
 
V
R
 
L
L
 
M
A
 
T
K
 
K
R
 
A
C
 
V
-
 
V
K
 
P
S
 
E
L
 
M
L
 
E
N
 
K
T
 
R
N
 
G
N
 
G
G
 
G
V
 
S
I
 
V
I
 
L
V
 
I
M
 
V
A
 
S
S
 
S
N
 
V
H
 
G
A
 
A
F
 
Y
A
 
H
S
 
P
I
x
F
P
 
P
G
 
N
C
x
L
A
 
G
P
 
P
Y
|
Y
N
 
N
I
 
V
A
 
S
K
|
K
T
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
T
R
 
K
S
x
N
L
 
L
A
 
A
I
 
V
E
 
E
W
 
L
G
 
A
P
 
P
-
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
R
T
 
V
I
 
N
G
 
C
I
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
L
I
 
I
D
 
K
T
 
T
P
 
N
G
 
F
N
 
S
Q
 
Q
Q
 
V
W
 
L
F
 
W
N
 
M
S
 
D
F
 
K
I
 
A
Q
 
R
P
 
K
E
 
E
E
 
Y
E
 
M
R
 
K
Q
 
E
R
 
S
T
 
L
I
 
-
N
 
-
L
 
-
H
 
-
P
 
R
V
 
I
K
 
R
K
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
N
V
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
C
G
 
A
G
 
G
W
 
I
C
 
V
V
 
S
F
 
F
L
 
L
S
 
C
S
 
S
E
 
E
Y
 
D
A
 
A
G
 
S
F
 
Y
A
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
E
T
 
T
Y
 
V
L
 
V
I
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
T
S
 
A
A
x
S
M
x
R
M
x
L

1vl8B Crystal structure of gluconate 5-dehydrogenase (tm0441) from thermotoga maritima at 2.07 a resolution
30% identity, 97% coverage: 4:257/262 of query aligns to 1:251/252 of 1vl8B

query
sites
1vl8B
T
 
V
I
 
F
D
 
D
L
 
L
K
 
R
G
 
G
K
 
R
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
V
 
G
T
 
S
S
x
R
G
|
G
I
x
L
G
 
G
L
 
F
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
Q
M
 
G
M
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
A
G
 
G
C
 
C
T
 
S
V
 
V
I
 
V
G
 
V
C
 
A
A
x
S
E
x
R
Q
 
N
-
 
L
S
 
E
E
 
E
T
 
A
S
 
S
D
 
E
V
 
A
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
F
 
L
L
 
-
A
 
-
E
 
-
M
 
T
E
 
E
S
 
K
F
 
Y
D
 
G
A
 
V
H
 
E
T
 
T
D
 
M
Y
 
A
F
 
F
K
 
R
A
x
C
D
|
D
M
x
V
V
 
S
V
 
N
T
 
Y
E
 
E
D
 
E
I
 
V
D
 
K
G
 
K
L
 
L
V
 
L
S
 
E
D
 
A
I
 
V
T
 
K
N
 
E
D
 
K
Y
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
T
L
 
V
V
 
V
S
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
Q
x
I
N
 
N
V
 
R
F
 
R
T
 
H
G
 
P
L
 
A
E
 
E
N
 
E
S
 
F
T
 
P
E
 
L
K
 
D
N
 
E
W
 
F
Q
 
R
F
 
Q
N
 
V
L
 
I
D
 
E
L
x
V
N
 
N
L
 
L
S
 
F
A
 
G
H
 
T
W
 
Y
R
 
Y
L
 
V
A
 
C
K
 
R
R
 
E
C
 
A
K
 
F
S
 
S
L
 
L
L
 
L
-
 
R
-
 
E
N
 
S
T
 
D
N
 
N
N
 
P
G
 
S
V
 
I
I
 
I
I
 
N
V
x
I
M
 
G
A
x
S
S
 
L
N
 
T
H
 
V
A
 
E
F
 
E
A
 
V
S
 
T
I
 
M
P
 
P
G
 
N
C
x
I
A
 
S
P
 
A
Y
|
Y
N
 
A
I
 
A
A
 
S
K
|
K
T
 
G
A
 
G
L
 
V
T
 
A
G
 
S
L
 
L
V
 
T
R
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
K
E
 
E
W
 
W
G
 
G
P
 
R
-
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
T
 
V
I
 
N
G
 
V
I
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
W
I
x
Y
D
 
R
T
|
T
P
 
K
G
x
M
N
x
T
Q
 
E
Q
 
A
W
 
V
F
 
F
N
 
S
S
 
D
F
 
-
I
 
-
Q
 
-
P
 
-
E
 
P
E
 
E
E
 
K
R
 
L
Q
 
D
R
 
Y
T
 
M
I
 
L
N
 
K
L
 
R
H
 
I
P
 
P
V
 
L
K
 
G
K
 
R
L
 
T
G
 
G
T
 
V
V
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
L
G
 
K
G
 
G
W
 
V
C
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
E
 
E
Y
 
E
A
 
A
G
 
K
F
 
Y
A
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
I
Y
 
I
L
 
F
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
W
S
 
T
A
 
A

6jhbB Crystal structure of NADPH and 4-hydroxyphenylpyruvic acid bound aerf from microcystis aeruginosa (see paper)
29% identity, 97% coverage: 3:257/262 of query aligns to 1:263/264 of 6jhbB

query
sites
6jhbB
L
 
M
T
 
D
I
 
L
D
 
G
L
 
L
K
 
K
G
 
D
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
V
 
S
T
x
S
S
x
A
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
F
G
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
E
M
 
K
M
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
E
G
 
G
C
 
C
T
 
H
V
 
L
I
 
I
G
 
I
C
 
C
A
x
G
E
x
R
Q
x
N
S
 
S
E
 
Q
T
 
R
S
 
L
D
 
E
V
 
Q
A
 
A
Q
 
Y
R
 
Q
F
 
S
L
 
L
A
 
A
E
 
-
M
 
-
E
 
Q
S
 
A
F
 
Y
D
 
P
A
 
A
H
 
Q
T
 
Q
D
 
I
Y
 
L
-
 
R
F
 
L
K
 
V
A
|
A
D
|
D
M
x
V
V
x
H
V
 
Q
T
 
A
E
 
Q
D
 
D
I
 
S
D
 
E
G
 
Q
L
 
L
V
 
I
S
 
Q
D
 
D
I
 
S
T
 
L
N
 
N
D
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
R
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
N
N
|
N
A
x
S
-
x
E
G
 
G
Q
 
A
N
 
N
V
 
F
F
 
A
T
 
E
G
 
N
L
 
L
-
 
I
E
 
E
N
 
N
S
 
L
T
 
S
E
 
D
K
 
E
N
 
D
W
 
W
Q
 
L
F
 
N
N
 
V
L
 
F
D
 
Q
L
 
G
N
x
K
L
 
L
S
 
I
A
 
G
H
 
Y
W
 
I
R
 
R
L
 
L
A
 
T
K
 
N
R
 
L
C
 
V
K
 
L
S
 
P
L
 
I
L
 
M
N
 
K
T
 
K
N
 
Q
N
 
H
-
 
W
G
 
G
V
 
R
I
 
I
I
 
V
V
 
N
M
x
I
A
x
I
S
x
G
N
 
T
H
x
S
A
 
G
F
 
K
A
 
E
S
 
P
I
 
S
P
 
P
G
 
R
C
x
L
A
 
V
P
 
K
Y
x
S
N
 
G
I
 
V
A
 
V
K
x
N
T
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
M
G
 
N
L
 
F
V
 
T
R
 
K
S
 
S
L
 
V
A
 
A
I
 
R
E
 
Q
W
 
T
G
 
A
P
 
P
-
 
Y
G
 
N
I
 
V
R
 
L
T
 
I
I
 
N
G
 
S
I
 
V
A
 
N
P
|
P
G
 
G
F
 
V
I
|
I
D
 
D
T
|
T
P
|
P
G
x
R
N
 
H
Q
 
R
Q
 
E
W
 
Y
F
 
L
N
 
E
S
 
I
F
 
Y
I
 
A
Q
 
K
-
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
T
-
 
T
P
 
P
E
 
D
E
 
L
E
 
I
R
 
R
Q
 
E
R
 
R
T
 
I
I
 
L
N
 
K
L
 
T
H
 
I
P
 
P
V
 
M
K
 
N
K
 
R
L
 
I
G
 
G
T
 
T
V
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
F
G
 
A
G
 
N
W
 
L
C
 
V
V
 
V
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
E
 
E
Y
 
C
A
 
A
G
 
S
F
 
Y
A
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
I
T
 
T
Y
 
I
L
 
P
I
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
S
 
S
A
 
S

2ztlA Closed conformation of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase complexed with NAD+ and l-3-hydroxybutyrate (see paper)
34% identity, 96% coverage: 7:257/262 of query aligns to 2:259/260 of 2ztlA

query
sites
2ztlA
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
V
 
S
T
 
T
S
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
T
M
 
A
M
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
Q
G
 
G
C
 
A
T
 
D
V
 
I
I
 
V
-
 
L
-
 
N
G
 
G
C
x
F
A
 
G
E
 
D
Q
 
A
S
 
A
E
 
E
T
 
I
S
 
E
D
 
K
V
 
V
A
 
R
Q
 
A
R
 
G
F
 
L
L
 
A
A
 
A
E
 
Q
M
 
-
E
 
-
S
 
-
F
 
H
D
 
G
A
 
V
H
 
K
T
 
V
D
 
L
Y
 
Y
F
 
D
K
 
G
A
 
A
D
 
D
M
x
L
V
 
S
V
 
K
T
 
G
E
 
E
D
 
A
I
 
V
D
 
R
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
D
D
 
N
I
 
A
T
 
V
N
 
R
D
 
Q
Y
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
Q
 
I
N
x
Q
V
 
H
F
 
T
T
 
A
G
 
L
L
 
I
E
 
E
N
 
D
S
 
F
T
 
P
E
 
T
K
 
E
N
 
K
W
 
W
Q
 
D
F
 
A
N
 
I
L
 
L
D
 
A
L
|
L
N
|
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
H
 
V
W
 
F
R
 
H
-
 
G
L
 
T
A
 
A
K
 
A
R
 
A
C
 
L
K
 
P
S
 
H
L
 
M
L
 
K
N
 
K
T
 
Q
N
 
G
N
 
F
G
 
G
V
 
R
I
 
I
I
 
I
V
 
N
M
 
I
A
 
A
S
|
S
N
 
A
H
|
H
A
 
G
F
 
L
A
 
V
S
 
A
I
 
S
P
 
A
G
 
N
C
x
K
A
 
S
P
 
A
Y
|
Y
N
 
V
I
 
A
A
 
A
K
|
K
T
 
H
A
 
G
L
 
V
T
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
T
R
 
K
S
 
V
L
 
T
A
 
A
I
 
L
E
 
E
-
 
T
W
 
A
G
 
G
P
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
T
T
 
A
I
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
C
P
|
P
G
 
G
F
x
W
I
x
V
D
 
R
T
|
T
P
 
P
G
 
L
N
x
V
Q
 
E
Q
 
K
W
x
Q
F
 
I
-
 
S
-
 
A
-
x
L
-
 
A
-
 
E
-
 
K
N
 
N
S
 
G
F
 
V
I
 
D
Q
 
Q
P
 
E
E
 
T
E
 
A
E
 
A
R
 
R
Q
 
E
R
 
L
T
 
L
I
 
S
N
 
E
L
 
K
H
 
Q
P
 
P
V
 
S
K
 
L
K
 
Q
L
 
F
G
 
V
T
 
T
V
 
P
E
 
E
E
 
Q
I
 
L
G
 
G
G
 
G
W
 
T
C
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
E
 
D
Y
 
A
A
 
A
G
 
A
F
 
Q
A
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
T
Y
 
V
L
 
S
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
W
S
 
T
A
 
A

1wmbA Crystal structure of NAD dependent d-3-hydroxybutylate dehydrogenase (see paper)
34% identity, 96% coverage: 7:257/262 of query aligns to 2:259/260 of 1wmbA

query
sites
1wmbA
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
S
T
 
T
S
 
S
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
T
M
 
A
M
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
Q
G
 
G
C
 
A
T
 
D
V
 
I
I
 
V
-
 
L
-
 
N
G
 
G
C
 
F
A
 
G
E
 
D
Q
 
A
S
 
A
E
 
E
T
 
I
S
 
E
D
 
K
V
 
V
A
 
R
Q
 
A
R
 
G
F
 
L
L
 
A
A
 
A
E
 
Q
M
 
-
E
 
-
S
 
-
F
 
H
D
 
G
A
 
V
H
 
K
T
 
V
D
 
L
Y
 
Y
F
 
D
K
 
G
A
 
A
D
 
D
M
 
L
V
 
S
V
 
K
T
 
G
E
 
E
D
 
A
I
 
V
D
 
R
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
D
D
 
N
I
 
A
T
 
V
N
 
R
D
 
Q
Y
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
I
N
 
Q
V
 
H
F
 
T
T
 
A
G
 
L
L
 
I
E
 
E
N
 
D
S
 
F
T
 
P
E
 
T
K
 
E
N
 
K
W
 
W
Q
 
D
F
 
A
N
 
I
L
 
L
D
 
A
L
 
L
N
|
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
H
 
V
W
 
F
R
 
H
-
 
G
L
 
T
A
 
A
K
 
A
R
 
A
C
 
L
K
 
P
S
 
H
L
 
M
L
 
K
N
 
K
T
 
Q
N
 
G
N
 
F
G
 
G
V
 
R
I
 
I
I
 
I
V
 
N
M
 
I
A
 
A
S
|
S
N
 
A
H
 
H
A
 
G
F
 
L
A
 
V
S
 
A
I
 
S
P
 
A
G
 
N
C
 
K
A
 
S
P
 
A
Y
|
Y
N
 
V
I
 
A
A
 
A
K
|
K
T
 
H
A
 
G
L
 
V
T
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
T
R
 
K
S
 
V
L
 
T
A
 
A
I
 
L
E
 
E
-
 
T
W
 
A
G
 
G
P
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
T
T
 
A
I
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
C
P
 
P
G
 
G
F
 
W
I
 
V
D
 
R
T
 
T
P
 
P
G
 
L
N
 
V
Q
 
E
Q
 
K
W
 
Q
F
 
I
-
 
S
-
 
A
-
x
L
-
 
A
-
 
E
-
 
K
N
 
N
S
 
G
F
 
V
I
 
D
Q
 
Q
P
 
E
E
 
T
E
 
A
E
 
A
R
 
R
Q
 
E
R
 
L
T
 
L
I
 
S
N
 
E
L
 
K
H
 
Q
P
 
P
V
 
S
K
 
L
K
 
Q
L
 
F
G
 
V
T
 
T
V
 
P
E
 
E
E
 
Q
I
 
L
G
 
G
G
 
G
W
 
T
C
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
E
 
D
Y
 
A
A
 
A
G
 
A
F
 
Q
A
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
T
Y
 
V
L
 
S
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
x
W
S
 
T
A
 
A

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
30% identity, 95% coverage: 7:256/262 of query aligns to 3:244/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
L
 
I
K
 
Q
G
 
N
K
 
R
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
S
T
 
A
S
|
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
L
 
K
G
 
Q
I
 
T
A
 
A
K
 
L
M
 
R
M
 
F
A
 
A
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
C
 
A
T
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
-
C
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
S
 
-
E
 
-
T
 
I
S
 
N
D
|
D
V
 
I
-
 
D
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
F
 
V
L
 
R
A
 
A
E
 
T
M
 
V
E
 
D
S
 
E
F
 
F
D
 
S
A
 
A
H
 
R
T
 
G
D
 
H
Y
 
R
F
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
A
K
 
V
A
 
A
D
|
D
M
x
I
V
 
G
V
 
N
T
 
K
E
 
A
D
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
L
 
M
V
 
V
S
 
K
D
 
Q
I
 
T
T
 
I
N
 
D
D
 
A
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
M
N
 
E
V
 
R
F
 
A
T
 
G
G
 
A
L
 
L
E
 
R
N
 
K
S
 
L
T
 
S
E
 
E
K
 
A
N
 
D
W
 
W
Q
 
D
F
 
V
N
 
T
L
 
I
D
 
N
L
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
K
A
 
G
H
 
T
W
 
F
R
 
L
L
 
C
A
 
T
K
 
Q
R
 
A
C
 
V
K
 
H
S
 
G
L
 
H
L
 
M
N
 
V
T
 
E
N
 
N
N
 
K
G
 
H
V
 
G
I
 
R
I
 
I
V
 
V
M
 
N
A
 
I
S
 
A
N
 
S
H
 
R
A
 
A
F
 
W
A
 
L
S
 
G
I
 
G
P
 
A
G
 
G
C
 
Q
A
 
T
P
 
P
Y
|
Y
N
 
S
I
 
S
A
 
A
K
|
K
T
 
A
A
 
G
L
 
V
T
 
V
G
 
G
L
 
M
V
 
T
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
W
 
L
G
 
G
-
 
R
P
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
T
T
 
V
I
 
N
G
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
L
I
 
I
D
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
-
N
 
-
Q
 
-
Q
 
M
W
 
W
F
 
D
N
 
E
S
 
-
F
 
-
I
 
-
Q
 
L
P
 
P
E
 
E
E
 
K
E
 
D
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
F
T
 
L
I
 
L
N
 
S
L
 
R
H
 
Q
P
 
P
V
 
T
K
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
E
V
 
P
E
 
D
E
 
D
I
 
I
G
 
A
G
 
N
W
 
T
C
 
L
V
 
L
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
D
E
 
D
Y
 
D
A
 
S
G
 
G
F
 
F
A
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
V
Y
 
L
L
 
Y
I
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
R
S
 
S

Sites not aligning to the query:

3ai2A The crystal structure of l-sorbose reductase from gluconobacter frateurii complexed with NADPH (see paper)
31% identity, 96% coverage: 3:254/262 of query aligns to 1:258/263 of 3ai2A

query
sites
3ai2A
L
 
M
T
 
D
I
 
M
D
 
G
L
 
I
K
 
S
G
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
V
 
S
T
x
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
E
M
 
G
M
 
F
A
 
A
K
 
K
A
 
E
G
 
G
C
 
A
T
 
H
V
 
I
I
 
V
G
 
L
C
 
V
A
|
A
E
x
R
Q
|
Q
S
 
V
E
 
D
T
 
R
S
 
L
D
 
H
V
 
E
A
 
A
Q
 
A
R
 
R
F
 
S
L
 
L
A
 
K
E
 
E
M
 
-
E
 
-
S
 
K
F
 
F
D
 
G
A
 
V
H
 
R
T
 
V
D
 
L
Y
 
E
F
 
V
K
 
A
A
x
V
D
|
D
M
x
V
V
 
A
V
 
T
T
 
P
E
 
E
D
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
A
L
 
V
V
 
V
S
 
E
D
 
S
I
 
V
T
 
R
N
 
S
D
 
S
Y
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
A
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
Q
 
T
N
 
G
V
 
S
F
 
N
T
 
E
G
 
T
L
 
I
E
 
M
N
 
E
S
 
A
T
 
A
E
 
D
K
 
E
N
 
K
W
 
W
Q
 
Q
F
 
F
N
 
Y
L
 
W
D
 
E
L
 
L
N
 
H
L
 
V
S
 
M
A
 
A
H
 
A
W
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
K
 
R
-
 
G
R
 
L
C
 
V
K
 
P
S
 
G
L
 
M
L
 
R
N
 
A
T
 
R
N
 
G
N
 
G
G
 
G
V
 
A
I
 
I
I
 
I
V
 
H
M
x
N
A
 
A
S
|
S
N
 
I
H
 
C
A
 
A
F
 
V
A
 
Q
S
 
P
I
 
L
P
 
W
G
 
Y
C
 
E
A
 
P
P
 
I
Y
|
Y
N
 
N
I
 
V
A
 
T
K
|
K
T
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
M
G
 
M
L
 
F
V
 
S
R
 
K
S
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
T
E
 
E
-
 
V
W
 
I
G
 
K
P
 
D
G
 
N
I
 
I
R
 
R
T
 
V
I
 
N
G
 
C
I
 
I
A
 
N
P
|
P
G
 
G
F
 
L
I
|
I
D
 
L
T
|
T
P
 
P
G
 
-
N
 
-
Q
 
-
Q
 
D
W
|
W
F
 
I
N
 
K
S
 
T
F
 
A
I
 
K
Q
 
E
P
 
L
E
 
T
E
 
K
E
 
D
R
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
W
-
 
K
-
 
G
-
 
Y
-
 
L
Q
 
Q
R
 
S
T
 
V
I
 
A
N
 
D
L
 
E
H
 
H
-
 
A
P
 
P
V
 
I
K
 
K
K
 
R
L
 
F
G
 
A
T
 
S
V
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
L
G
 
A
G
 
N
W
 
F
C
 
F
V
 
V
F
 
F
L
 
L
S
 
C
S
 
S
E
 
E
Y
 
R
A
 
A
G
 
T
F
 
Y
A
 
S
S
 
V
G
 
G
T
 
S
T
 
A
Y
 
Y
L
 
F
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
30% identity, 95% coverage: 7:256/262 of query aligns to 2:243/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
K
 
Q
G
 
N
K
 
R
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
V
 
S
T
 
A
S
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
L
 
K
G
 
Q
I
 
T
A
 
A
K
 
L
M
 
R
M
 
F
A
 
A
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
C
 
A
T
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
-
C
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
S
 
-
E
 
-
T
 
I
S
 
N
D
|
D
V
x
I
-
 
D
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
F
 
V
L
 
R
A
 
A
E
 
T
M
 
V
E
 
D
S
 
E
F
 
F
D
 
S
A
 
A
H
 
R
T
 
G
D
 
H
Y
 
R
F
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
A
K
 
V
A
 
A
D
 
D
M
x
I
V
 
G
V
 
N
T
 
K
E
 
A
D
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
L
 
M
V
 
V
S
 
K
D
 
Q
I
 
T
T
 
I
N
 
D
D
 
A
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
Q
 
M
N
 
E
V
 
R
F
 
A
T
 
G
G
 
A
L
 
L
E
 
R
N
 
K
S
 
L
T
 
S
E
 
E
K
 
A
N
 
D
W
 
W
Q
 
D
F
 
V
N
 
T
L
 
I
D
 
N
L
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
K
A
 
G
H
 
T
W
 
F
R
 
L
L
 
C
A
 
T
K
 
Q
R
 
A
C
 
V
K
 
H
S
 
G
L
 
H
L
 
M
N
 
V
T
 
E
N
 
N
N
 
K
G
 
H
V
 
G
I
 
R
I
 
I
V
 
V
M
 
N
A
x
I
S
 
A
N
x
S
H
 
R
A
 
A
F
 
W
A
 
L
S
 
G
I
 
G
P
 
A
G
 
G
C
 
Q
A
 
T
P
 
P
Y
|
Y
N
 
S
I
 
S
A
 
A
K
|
K
T
 
A
A
 
G
L
 
V
T
 
V
G
 
G
L
 
M
V
 
T
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
W
 
L
G
 
G
-
 
R
P
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
T
T
 
V
I
 
N
G
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
L
I
|
I
D
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
-
N
 
-
Q
 
-
Q
 
M
W
 
W
F
 
D
N
 
E
S
 
-
F
 
-
I
 
-
Q
 
L
P
 
P
E
 
E
E
 
K
E
 
D
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
F
T
 
L
I
 
L
N
 
S
L
 
R
H
 
Q
P
 
P
V
 
T
K
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
E
V
 
P
E
 
D
E
 
D
I
 
I
G
 
A
G
 
N
W
 
T
C
 
L
V
 
L
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
D
E
 
D
Y
 
D
A
 
S
G
 
G
F
 
F
A
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
V
Y
 
L
L
 
Y
I
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
R
S
 
S

6jhaA Crystal structure of NADPH bound aerf from microcystis aeruginosa (see paper)
30% identity, 97% coverage: 3:257/262 of query aligns to 1:240/242 of 6jhaA

query
sites
6jhaA
L
 
M
T
 
D
I
 
L
D
 
G
L
 
L
K
 
K
G
 
D
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
V
 
S
T
x
S
S
 
A
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
F
G
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
E
M
 
K
M
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
E
G
 
G
C
 
C
T
 
H
V
 
L
I
 
I
G
 
I
C
 
C
A
x
G
E
x
R
Q
x
N
S
 
S
E
 
Q
T
 
R
S
 
L
D
 
E
V
 
Q
A
 
A
Q
 
Y
R
 
Q
F
 
S
L
 
L
A
 
A
E
 
-
M
 
-
E
 
Q
S
 
A
F
 
Y
D
 
P
A
 
A
H
 
Q
T
 
Q
D
 
I
Y
 
L
-
 
R
F
 
L
K
 
V
A
 
A
D
|
D
M
x
V
V
 
H
V
 
Q
T
 
A
E
 
Q
D
 
D
I
 
S
D
 
E
G
 
Q
L
 
L
V
 
I
S
 
Q
D
 
D
I
 
S
T
 
L
N
 
N
D
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
R
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
N
N
|
N
A
x
S
G
x
E
Q
 
G
N
 
N
V
 
L
F
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
I
E
 
E
N
 
N
S
 
L
T
 
S
E
 
D
K
 
E
N
 
D
W
 
W
Q
 
L
F
 
N
N
 
V
L
 
F
D
 
Q
L
 
G
N
x
K
L
 
L
S
 
I
A
 
G
H
 
Y
W
 
I
R
 
R
L
 
L
A
 
T
K
 
-
R
 
-
C
 
-
K
 
-
S
 
-
L
 
-
L
 
-
N
 
-
T
 
-
N
 
-
N
 
N
G
 
L
V
 
V
I
 
L
I
 
P
V
 
I
M
 
M
A
 
K
S
 
K
N
 
Q
H
 
H
-
 
W
-
 
G
A
 
R
F
 
I
A
 
V
S
 
N
I
|
I
P
 
I
G
 
-
C
x
L
A
 
V
P
 
K
Y
x
S
N
 
G
I
 
V
A
 
V
K
 
N
T
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
M
G
 
N
L
 
F
V
 
T
R
 
K
S
 
S
L
 
V
A
 
A
I
 
R
E
 
Q
W
 
T
G
 
A
P
 
P
-
 
Y
G
 
N
I
 
V
R
 
L
T
 
I
I
 
N
G
 
S
I
 
V
A
 
N
P
|
P
G
 
G
F
 
V
I
 
I
D
 
D
T
|
T
P
 
P
G
x
R
N
 
H
Q
 
R
Q
 
E
W
 
Y
F
 
L
N
 
E
S
 
I
F
 
Y
I
 
-
Q
 
-
P
 
-
E
 
D
E
 
L
E
 
I
R
 
R
Q
 
E
R
 
R
T
 
I
I
 
L
N
 
K
L
 
T
H
 
I
P
 
P
V
 
M
K
 
N
K
 
R
L
 
I
G
 
G
T
 
T
V
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
F
G
 
A
G
 
N
W
 
L
C
 
V
V
 
V
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
E
 
E
Y
 
C
A
 
A
G
 
S
F
 
Y
A
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
I
T
 
T
Y
 
I
L
 
P
I
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
S
 
S
A
 
S

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
31% identity, 95% coverage: 5:254/262 of query aligns to 4:239/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
I
 
M
D
 
N
L
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
V
 
A
T
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
K
G
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
E
M
 
L
M
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
R
G
 
G
C
 
A
T
 
K
V
 
V
I
 
I
G
 
G
C
 
T
A
 
A
E
x
T
Q
 
S
S
 
E
E
 
S
T
 
G
S
 
A
D
 
Q
V
 
A
A
 
I
Q
 
S
R
 
D
F
 
Y
L
 
L
A
 
G
E
 
D
M
 
-
E
 
-
S
 
-
F
 
-
D
 
-
A
 
-
H
 
N
T
 
G
D
 
K
Y
 
G
F
 
M
K
 
A
A
 
L
D
x
N
M
x
V
V
 
T
V
 
N
T
 
P
E
 
E
D
 
S
I
 
I
D
 
E
G
 
A
L
 
V
V
 
L
S
 
K
D
 
A
I
 
I
T
 
T
N
 
D
D
 
E
Y
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
Q
 
I
N
 
T
V
 
R
F
 
D
T
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
M
N
 
R
S
 
M
T
 
K
E
 
E
K
 
E
N
 
E
W
 
W
Q
 
S
F
 
D
N
 
I
L
 
M
D
 
E
L
 
T
N
|
N
L
 
L
S
 
T
A
 
S
H
 
I
W
 
F
R
 
R
L
 
L
A
 
S
K
 
K
R
 
A
C
 
V
-
 
L
K
 
R
S
 
G
L
 
M
L
 
M
N
 
K
T
 
K
N
 
R
N
 
Q
G
 
G
V
 
R
I
 
I
I
 
I
V
 
N
M
 
V
A
x
G
S
|
S
N
 
V
H
 
V
A
 
G
F
 
T
A
 
M
S
 
G
I
 
N
P
 
A
G
 
G
C
x
Q
A
 
A
P
 
N
Y
|
Y
N
 
A
I
 
A
A
 
A
K
|
K
T
 
A
A
 
G
L
 
V
T
 
I
G
 
G
L
 
F
V
 
T
R
 
K
S
 
S
L
 
M
A
 
A
I
 
R
E
 
E
W
 
V
G
 
A
P
 
S
-
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
T
 
V
I
 
N
G
 
T
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
 
I
D
 
E
T
|
T
P
 
D
G
 
M
N
 
N
Q
 
-
Q
 
-
W
 
-
F
 
-
N
 
-
S
 
-
F
 
-
I
 
-
Q
 
-
P
 
-
E
 
D
E
 
E
E
 
Q
R
 
R
Q
 
T
R
 
A
T
 
T
I
 
L
N
 
A
L
 
Q
H
 
V
P
 
P
V
 
A
K
 
G
K
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
D
V
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
I
G
 
A
G
 
S
W
 
A
C
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
E
 
P
Y
 
E
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
A
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
E
T
 
T
Y
 
L
L
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

3ai3C The crystal structure of l-sorbose reductase from gluconobacter frateurii complexed with NADPH and l-sorbose (see paper)
31% identity, 96% coverage: 3:254/262 of query aligns to 1:258/263 of 3ai3C

query
sites
3ai3C
L
 
M
T
 
D
I
 
M
D
 
G
L
 
I
K
 
S
G
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
V
 
S
T
x
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
E
M
 
G
M
 
F
A
 
A
K
 
K
A
 
E
G
 
G
C
 
A
T
 
H
V
 
I
I
 
V
G
 
L
C
 
V
A
|
A
E
x
R
Q
|
Q
S
 
V
E
 
D
T
x
R
S
 
L
D
 
H
V
 
E
A
 
A
Q
 
A
R
 
R
F
 
S
L
 
L
A
 
K
E
 
E
M
 
-
E
 
-
S
 
K
F
 
F
D
 
G
A
 
V
H
 
R
T
 
V
D
 
L
Y
 
E
F
 
V
K
 
A
A
 
V
D
|
D
M
x
V
V
 
A
V
 
T
T
 
P
E
 
E
D
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
A
L
 
V
V
 
V
S
 
E
D
 
S
I
 
V
T
 
R
N
 
S
D
 
S
Y
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
A
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
Q
 
T
N
x
G
V
 
S
F
 
N
T
 
E
G
 
T
L
 
I
E
 
M
N
 
E
S
 
A
T
 
A
E
 
D
K
 
E
N
 
K
W
 
W
Q
 
Q
F
 
F
N
 
Y
L
 
W
D
 
E
L
 
L
N
 
L
L
 
V
S
 
M
A
 
A
H
 
A
W
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
K
 
R
-
 
G
R
 
L
C
 
V
K
 
P
S
 
G
L
 
M
L
 
R
N
 
A
T
 
R
N
 
G
N
 
G
G
 
G
V
 
A
I
 
I
I
 
I
V
 
H
M
x
N
A
 
A
S
|
S
N
 
I
H
 
C
A
 
A
F
 
V
A
 
Q
S
 
P
I
 
L
P
 
W
G
 
Y
C
x
E
A
 
P
P
 
I
Y
|
Y
N
 
N
I
 
V
A
 
T
K
|
K
T
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
M
G
 
M
L
 
F
V
 
S
R
 
K
S
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
T
E
 
E
-
 
V
W
 
I
G
 
K
P
 
D
G
 
N
I
 
I
R
 
R
T
 
V
I
 
N
G
 
C
I
 
I
A
 
N
P
|
P
G
|
G
F
 
L
I
|
I
D
 
L
T
|
T
P
 
P
G
 
-
N
 
-
Q
 
-
Q
 
D
W
|
W
F
 
I
N
 
K
S
 
T
F
 
A
I
 
K
Q
 
E
P
 
L
E
 
T
E
 
K
E
 
D
R
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
W
-
 
K
-
 
G
-
 
Y
-
 
L
Q
 
Q
R
 
S
T
 
V
I
 
A
N
 
D
L
 
E
H
 
H
-
 
A
P
 
P
V
 
I
K
 
K
K
 
R
L
 
F
G
 
A
T
 
S
V
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
L
G
 
A
G
 
N
W
 
F
C
 
F
V
 
V
F
 
F
L
 
L
S
 
C
S
 
S
E
 
E
Y
 
R
A
 
A
G
 
T
F
 
Y
A
 
S
S
 
V
G
 
G
T
 
S
T
x
A
Y
 
Y
L
x
F
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3ai3A The crystal structure of l-sorbose reductase from gluconobacter frateurii complexed with NADPH and l-sorbose (see paper)
31% identity, 96% coverage: 3:254/262 of query aligns to 1:258/263 of 3ai3A

query
sites
3ai3A
L
 
M
T
 
D
I
 
M
D
 
G
L
 
I
K
 
S
G
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
V
 
S
T
x
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
E
M
 
G
M
 
F
A
 
A
K
 
K
A
 
E
G
 
G
C
 
A
T
 
H
V
 
I
I
 
V
G
 
L
C
 
V
A
|
A
E
x
R
Q
|
Q
S
 
V
E
 
D
T
x
R
S
 
L
D
 
H
V
 
E
A
 
A
Q
 
A
R
 
R
F
 
S
L
 
L
A
 
K
E
 
E
M
 
-
E
 
-
S
 
K
F
 
F
D
 
G
A
 
V
H
 
R
T
 
V
D
 
L
Y
 
E
F
 
V
K
 
A
A
x
V
D
|
D
M
x
V
V
 
A
V
 
T
T
 
P
E
 
E
D
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
A
L
 
V
V
 
V
S
 
E
D
 
S
I
 
V
T
 
R
N
 
S
D
 
S
Y
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
A
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
Q
 
T
N
x
G
V
 
S
F
 
N
T
 
E
G
 
T
L
 
I
E
 
M
N
 
E
S
 
A
T
 
A
E
 
D
K
 
E
N
 
K
W
 
W
Q
 
Q
F
 
F
N
 
Y
L
 
W
D
 
E
L
 
L
N
 
L
L
 
V
S
 
M
A
 
A
H
 
A
W
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
K
 
R
-
 
G
R
 
L
C
 
V
K
 
P
S
 
G
L
 
M
L
 
R
N
 
A
T
 
R
N
 
G
N
 
G
G
 
G
V
 
A
I
 
I
I
 
I
V
 
H
M
x
N
A
 
A
S
|
S
N
 
I
H
 
C
A
 
A
F
 
V
A
 
Q
S
 
P
I
x
L
P
 
W
G
 
Y
C
x
E
A
 
P
P
 
I
Y
|
Y
N
 
N
I
 
V
A
 
T
K
|
K
T
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
M
G
 
M
L
 
F
V
 
S
R
 
K
S
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
T
E
 
E
-
 
V
W
 
I
G
 
K
P
 
D
G
 
N
I
 
I
R
 
R
T
 
V
I
 
N
G
 
C
I
 
I
A
 
N
P
|
P
G
|
G
F
 
L
I
|
I
D
 
L
T
|
T
P
 
P
G
 
-
N
 
-
Q
 
-
Q
 
D
W
|
W
F
 
I
N
 
K
S
 
T
F
 
A
I
 
K
Q
 
E
P
 
L
E
 
T
E
 
K
E
 
D
R
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
W
-
 
K
-
 
G
-
 
Y
-
 
L
Q
 
Q
R
 
S
T
 
V
I
 
A
N
 
D
L
 
E
H
 
H
-
 
A
P
 
P
V
 
I
K
 
K
K
 
R
L
 
F
G
 
A
T
 
S
V
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
L
G
 
A
G
 
N
W
 
F
C
 
F
V
 
V
F
 
F
L
 
L
S
 
C
S
 
S
E
 
E
Y
 
R
A
 
A
G
 
T
F
 
Y
A
 
S
S
 
V
G
 
G
T
 
S
T
 
A
Y
 
Y
L
 
F
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
30% identity, 95% coverage: 5:254/262 of query aligns to 4:243/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
I
 
M
D
 
N
L
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
V
 
A
T
x
S
S
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
L
 
K
G
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
E
M
 
L
M
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
R
G
 
G
C
 
A
T
 
K
V
 
V
I
 
I
G
 
G
C
 
T
A
 
A
E
x
T
Q
 
S
S
 
E
E
 
S
T
 
G
S
 
A
D
 
Q
V
 
A
A
 
I
Q
 
S
R
 
D
F
 
Y
L
 
L
A
 
G
E
 
D
M
 
-
E
 
-
S
 
-
F
 
-
D
 
-
A
 
-
H
 
N
T
 
G
D
 
K
Y
 
G
F
 
M
K
 
A
A
 
L
D
x
N
M
x
V
V
 
T
V
 
N
T
 
P
E
 
E
D
 
S
I
 
I
D
 
E
G
 
A
L
 
V
V
 
L
S
 
K
D
 
A
I
 
I
T
 
T
N
 
D
D
 
E
Y
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
Q
x
I
N
 
T
V
 
R
F
 
D
T
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
M
N
 
R
S
 
M
T
 
K
E
 
E
K
 
E
N
 
E
W
 
W
Q
 
S
F
 
D
N
 
I
L
 
M
D
 
E
L
 
T
N
 
N
L
 
L
S
 
T
A
 
S
H
 
I
W
 
F
R
 
R
L
 
L
A
 
S
K
 
K
R
 
A
C
 
V
-
 
L
K
 
R
S
 
G
L
 
M
L
 
M
N
 
K
T
 
K
N
 
R
N
 
Q
G
 
G
V
 
R
I
 
I
I
 
I
V
 
N
M
x
V
A
 
G
S
|
S
N
 
V
H
 
V
A
 
G
F
 
T
A
 
M
S
 
G
I
 
N
P
 
A
G
 
G
C
 
Q
A
 
A
P
 
N
Y
|
Y
N
 
A
I
 
A
A
 
A
K
|
K
T
 
A
A
 
G
L
 
V
T
 
I
G
 
G
L
 
F
V
 
T
R
 
K
S
 
S
L
 
M
A
 
A
I
 
R
E
 
E
W
 
V
G
 
A
P
 
S
-
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
T
 
V
I
 
N
G
 
T
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
D
 
E
T
|
T
P
 
D
G
x
M
N
 
T
Q
 
K
Q
 
A
W
 
L
F
 
-
N
 
-
S
 
-
F
 
-
I
 
-
Q
 
-
P
 
N
E
 
D
E
 
E
E
 
Q
R
 
R
Q
 
T
R
 
A
T
 
T
I
 
L
N
 
A
L
 
Q
H
 
V
P
 
P
V
 
A
K
 
G
K
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
D
V
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
I
G
 
A
G
 
S
W
 
A
C
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
E
 
P
Y
 
E
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
A
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
E
T
 
T
Y
 
L
L
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>CA265_RS13660 FitnessBrowser__Pedo557:CA265_RS13660
MALTIDLKGKIALVTGVTSGIGLGIAKMMAKAGCTVIGCAEQSETSDVAQRFLAEMESFD
AHTDYFKADMVVTEDIDGLVSDITNDYGRLDILVSNAGQNVFTGLENSTEKNWQFNLDLN
LSAHWRLAKRCKSLLNTNNGVIIVMASNHAFASIPGCAPYNIAKTALTGLVRSLAIEWGP
GIRTIGIAPGFIDTPGNQQWFNSFIQPEEERQRTINLHPVKKLGTVEEIGGWCVFLSSEY
AGFASGTTYLIDGGRSAMMQDS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory