SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CA265_RS14275 FitnessBrowser__Pedo557:CA265_RS14275 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 3 hits to proteins with known functional sites (download)

8tdeA Structure of glucose bound bacteroides thetaiotaomicron 3-keto-2- hydroxy-glucal-hydratase bt2 (see paper)
38% identity, 47% coverage: 242:454/454 of query aligns to 26:255/256 of 8tdeA

query
sites
8tdeA
S
 
A
E
 
D
G
 
G
Y
 
Y
K
 
I
L
 
T
L
 
I
F
 
F
D
 
D
G
 
G
K
 
K
S
 
T
H
 
F
A
 
N
G
 
G
W
 
W
V
 
R
G
 
G
A
 
Y
Y
 
G
K
 
K
T
 
D
T
 
R
F
 
V
P
 
P
A
 
S
K
 
K
G
 
-
W
 
W
K
 
T
I
 
I
A
 
E
D
 
D
G
 
G
V
 
C
I
 
I
S
 
K
V
 
F
E
 
N
P
 
G
S
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
G
E
|
E
S
 
A
T
 
Q
N
 
D
G
 
G
-
 
D
-
 
G
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
I
T
 
F
K
 
A
A
 
H
E
 
K
Y
 
F
A
 
K
A
 
N
F
 
F
D
 
E
L
 
L
S
 
E
F
 
M
E
 
E
F
 
W
K
 
K
L
 
V
T
 
S
P
 
K
G
 
G
A
 
G
N
 
N
S
 
S
G
 
G
V
 
I
K
 
F
Y
 
Y
F
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
E
V
 
V
T
 
T
L
 
S
S
 
K
E
 
D
K
 
K
N
 
D
T
 
G
G
 
N
S
 
D
A
 
V
I
 
L
-
 
E
-
 
P
-
 
I
-
x
Y
-
 
I
-
 
S
G
 
A
L
 
P
E
|
E
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
D
 
D
D
 
N
V
 
D
L
 
N
H
 
H
P
 
P
D
 
D
A
 
A
K
 
K
L
 
L
G
 
G
R
 
K
D
 
D
G
 
N
N
 
N
R
 
R
T
 
Q
L
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
L
Y
|
Y
D
 
D
L
 
M
M
 
I
T
 
P
S
 
A
K
 
V
K
 
P
E
 
Q
A
 
N
R
 
-
Y
 
-
L
 
A
R
 
K
P
 
P
I
 
F
G
 
G
S
 
E
W
 
W
N
 
N
N
 
K
G
 
A
R
 
K
L
 
I
V
 
M
V
 
V
Y
 
Y
P
 
K
N
 
G
N
 
T
K
 
V
V
 
V
E
 
-
H
 
H
Y
 
G
L
 
Q
N
 
N
G
 
D
V
 
E
K
 
N
V
 
V
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
T
 
H
R
 
L
G
 
W
S
 
T
E
 
K
E
 
Q
F
 
W
K
 
T
K
 
D
L
 
L
V
 
L
A
 
Q
I
 
A
S
 
S
K
|
K
Y
 
F
K
 
S
D
 
Q
W
 
D
K
 
K
-
 
W
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
F
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
N
-
 
N
N
 
C
F
 
G
G
 
G
E
 
E
A
 
N
P
 
H
K
 
E
G
 
G
H
 
F
I
 
I
L
 
G
L
 
M
Q
|
Q
D
 
D
H
|
H
G
 
G
N
 
D
K
 
D
V
 
V
D
 
W
F
 
F
R
 
R
T
 
N
I
 
I
K
 
R
I
 
V
K
 
K
T
 
V
L
 
L

8rr2A 3-keto-disaccharide hydrolase domain-containing protein (see paper)
38% identity, 47% coverage: 242:454/454 of query aligns to 25:254/255 of 8rr2A

query
sites
8rr2A
S
 
A
E
 
D
G
 
G
Y
 
Y
K
 
I
L
 
T
L
 
I
F
 
F
D
 
D
G
 
G
K
 
K
S
 
T
H
 
F
A
 
N
G
 
G
W
 
W
V
 
R
G
 
G
A
 
Y
Y
 
G
K
 
K
T
 
D
T
 
R
F
 
V
P
 
P
A
 
S
K
 
K
G
 
-
W
 
W
K
 
T
I
 
I
A
 
E
D
 
D
G
 
G
V
 
C
I
 
I
S
 
K
V
 
F
E
 
N
P
 
G
S
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
G
E
|
E
S
 
A
T
 
Q
N
 
D
G
 
G
-
 
D
-
 
G
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
I
T
 
F
K
 
A
A
 
H
E
 
K
Y
 
F
A
 
K
A
 
N
F
 
F
D
 
E
L
 
L
S
 
E
F
 
M
E
 
E
F
 
W
K
 
K
L
 
V
T
 
S
P
 
K
G
 
G
A
 
G
N
|
N
S
|
S
G
 
G
V
 
I
K
 
F
Y
 
Y
F
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
E
V
 
V
T
 
T
L
 
S
S
 
K
E
 
D
K
 
K
N
 
D
T
 
G
G
 
N
S
 
D
A
 
V
I
 
L
-
 
E
-
 
P
-
 
I
-
x
Y
-
 
I
-
 
S
G
 
A
L
 
P
E
|
E
Y
 
Y
Q
|
Q
V
 
V
L
 
L
D
 
D
D
 
N
V
 
D
L
 
N
H
 
H
P
 
P
D
|
D
A
 
A
K
 
K
L
 
L
G
 
G
R
 
K
D
 
D
G
 
N
N
 
N
R
 
R
T
 
Q
L
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
L
Y
|
Y
D
 
D
L
 
M
M
 
I
T
 
P
S
 
A
K
 
V
K
 
P
E
 
Q
A
 
N
R
 
-
Y
 
-
L
 
A
R
 
K
P
 
P
I
 
F
G
 
G
S
 
E
W
 
W
N
 
N
N
 
K
G
 
A
R
 
K
L
 
I
V
 
M
V
 
V
Y
 
Y
P
 
K
N
 
G
N
 
T
K
 
V
V
 
V
E
 
-
H
 
H
Y
 
G
L
 
Q
N
 
N
G
 
D
V
 
E
K
 
N
V
 
V
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
T
 
H
R
 
L
G
 
W
S
 
T
E
 
K
E
 
Q
F
 
W
K
 
T
K
 
D
L
 
L
V
 
L
A
 
Q
I
 
A
S
 
S
K
|
K
Y
 
F
K
 
S
D
 
Q
W
 
D
K
 
K
-
 
W
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
F
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
N
-
 
N
N
 
C
F
 
G
G
 
G
E
 
E
A
 
N
P
 
H
K
 
E
G
 
G
H
 
F
I
 
I
L
 
G
L
 
M
Q
|
Q
D
 
D
H
|
H
G
 
G
N
 
D
K
 
D
V
 
V
D
 
W
F
 
F
R
 
R
T
 
N
I
 
I
K
 
R
I
 
V
K
 
K
T
 
V
L
 
L

8v31C Structure of alistipes sp. 3-keto-2-hydroxy-glucal-hydratase al2
37% identity, 52% coverage: 221:454/454 of query aligns to 1:250/251 of 8v31C

query
sites
8v31C
A
 
A
F
 
V
P
 
P
K
 
E
G
 
Y
I
 
T
Y
 
V
T
 
I
V
 
N
N
 
N
L
 
A
T
 
T
P
 
V
N
 
D
T
 
L
L
 
A
S
 
G
A
 
F
Y
 
P
E
 
Q
K
 
D
S
 
K
E
 
D
G
 
G
Y
 
Y
K
 
Y
L
 
V
L
 
I
F
 
F
D
 
D
G
 
G
K
 
K
S
 
T
H
 
F
A
 
N
G
 
G
W
 
W
V
 
R
G
 
G
A
 
Y
Y
 
G
K
 
K
T
 
D
T
 
H
F
 
V
P
 
P
A
 
S
K
 
K
G
 
-
W
 
W
K
 
T
I
 
I
A
 
D
D
 
N
G
 
G
V
 
A
I
 
I
S
 
K
V
 
F
E
 
N
P
 
G
S
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
G
E
 
E
S
 
A
T
 
Q
N
 
D
G
 
G
-
 
D
-
 
G
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
I
T
 
F
K
 
T
A
 
H
E
 
K
Y
 
F
A
 
K
A
 
N
F
 
F
D
 
E
L
 
L
S
 
E
F
 
V
E
 
E
F
 
W
K
 
K
L
 
V
T
 
A
P
 
K
G
 
G
A
 
S
N
|
N
S
|
S
G
 
G
V
 
I
K
 
F
Y
 
Y
F
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
E
-
 
V
-
 
A
V
 
T
T
 
T
L
 
K
S
 
D
E
 
G
K
 
K
N
 
Q
T
 
R
G
 
M
S
 
E
A
 
P
I
 
I
G
 
Y
L
 
I
-
 
S
-
 
C
-
 
P
E
|
E
Y
 
Y
Q
|
Q
V
 
V
L
 
L
D
 
D
D
 
N
V
 
E
L
 
N
H
 
H
P
 
P
D
 
D
A
 
A
K
 
K
L
 
L
G
 
G
R
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
N
R
 
R
T
 
K
L
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
L
 
M
M
 
I
T
 
P
S
 
A
K
 
V
K
 
P
E
 
Q
A
 
N
R
 
-
Y
 
-
L
 
A
R
 
K
P
 
P
I
 
Y
G
 
G
S
 
E
W
 
W
N
 
N
N
 
K
G
 
A
R
 
K
L
 
I
V
 
M
V
 
V
Y
 
Y
P
 
-
N
 
K
N
 
G
K
 
T
V
 
V
E
 
V
H
 
H
Y
 
G
L
 
Q
N
 
N
G
 
D
V
 
Q
K
 
N
V
 
V
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
T
 
H
R
 
L
G
 
W
S
 
T
E
 
P
E
 
Q
F
 
W
K
 
T
K
 
E
L
 
M
V
 
L
A
 
E
I
 
K
S
 
S
K
 
K
Y
 
F
-
 
S
-
 
P
K
 
E
D
 
K
W
 
W
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
F
-
 
E
-
 
L
-
 
L
K
 
N
N
 
N
F
 
C
G
 
G
E
 
G
A
 
A
P
 
Q
K
 
R
-
 
E
G
 
G
H
 
Y
I
 
I
L
 
G
L
 
F
Q
|
Q
D
 
D
H
 
H
G
 
G
N
 
D
K
 
D
V
 
V
D
 
W
F
 
F
R
 
R
T
 
N
I
 
I
K
 
R
I
 
I
K
 
K
T
 
V
L
 
L

Query Sequence

>CA265_RS14275 FitnessBrowser__Pedo557:CA265_RS14275
MLNLKKYSILALSLISLSAAAQKAKPLFDGKTLTGWKAVAGVAPYKVEDGMIIGTMTKGT
PNSFLITEKEYGDFILELDVKLEGETTNSGVQTRSHIKPEGNNGKGLVFGRQMEIDPTPR
AWTGGIYDEARRLWLYPLELNPSAKPLYKKNEFNHYKIECIGNETKTWVNGTPVAYVIDT
LDKSGFIGLQVHGIGANLDNDGKKVYFKNINIQTEGLKAKAFPKGIYTVNLTPNTLSAYE
KSEGYKLLFDGKSHAGWVGAYKTTFPAKGWKIADGVISVEPSGGAESTNGGDIVTKAEYA
AFDLSFEFKLTPGANSGVKYFVTLSEKNTGSAIGLEYQVLDDVLHPDAKLGRDGNRTLAS
LYDLMTSKKEARYLRPIGSWNNGRLVVYPNNKVEHYLNGVKVLEYTRGSEEFKKLVAISK
YKDWKNFGEAPKGHILLQDHGNKVDFRTIKIKTL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory