SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CA265_RS15090 CA265_RS15090 NAD kinase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7mh7A Crystal structure of NAD kinase from pseudomonas aeruginosa pao1
31% identity, 97% coverage: 3:287/293 of query aligns to 6:287/290 of 7mh7A

query
sites
7mh7A
I
 
I
A
 
G
I
 
I
Y
 
I
G
 
G
R
 
R
D
 
L
F
 
G
N
 
S
D
 
T
T
 
Q
V
 
V
L
 
L
P
 
D
Y
 
T
V
 
I
Q
 
R
E
 
R
V
 
L
F
 
K
N
 
K
H
 
F
L
 
L
A
 
I
E
 
D
H
 
R
H
 
H
I
 
L
Q
 
H
P
 
V
V
 
I
L
 
L
Y
 
E
S
 
D
K
 
T
F
 
I
K
 
A
T
 
E
S
 
V
L
 
L
H
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
-
K
 
-
L
 
-
P
 
P
A
 
G
N
 
H
T
 
G
V
 
L
I
 
Q
F
 
T
H
 
C
N
 
S
H
 
R
T
 
K
E
 
I
L
 
M
K
 
G
E
 
E
L
 
I
A
 
C
D
 
D
V
 
L
L
 
V
L
 
V
S
 
V
L
 
V
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
T
 
S
L
 
M
L
 
L
D
 
G
T
 
A
L
 
A
S
 
R
L
 
A
I
 
L
R
 
A
N
 
R
S
 
H
G
 
K
I
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
G
 
G
I
 
I
N
 
N
F
x
R
G
 
G
R
 
S
L
 
L
G
 
G
F
|
F
L
 
L
A
 
T
S
 
D
I
 
I
N
 
R
K
 
P
N
 
D
E
 
E
I
 
L
A
 
E
S
 
A
A
 
K
L
 
V
K
 
G
A
 
E
L
 
V
I
 
L
N
 
D
K
 
G
E
 
Q
Y
 
Y
T
 
I
L
 
V
D
 
E
S
 
S
R
 
R
S
 
F
L
 
L
L
 
L
T
 
D
L
 
A
E
 
Q
S
 
V
D
 
R
N
 
R
G
 
G
L
 
I
-
 
D
-
 
S
F
 
M
G
 
G
E
 
Q
E
 
G
N
 
D
F
 
-
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
|
D
I
 
V
T
 
V
I
 
L
H
 
H
R
 
P
R
 
G
D
 
K
N
 
S
S
 
T
A
 
R
M
 
M
M
 
I
I
 
E
I
 
F
H
 
E
A
 
L
S
 
Y
M
 
I
N
 
D
D
 
G
E
 
Q
F
 
F
I
 
V
N
 
C
S
 
S
Y
 
Q
W
 
K
A
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
S
 
A
L
 
L
S
|
S
C
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
I
I
 
M
Y
 
H
P
 
P
D
 
K
S
 
L
E
 
D
N
 
A
F
 
I
V
 
V
I
 
I
T
 
V
P
 
P
I
 
M
A
 
Y
P
 
P
H
 
H
N
 
M
L
 
L
N
 
S
V
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
I
I
 
V
L
 
V
P
 
D
D
 
G
D
 
N
N
 
S
K
 
E
L
 
L
S
 
K
F
 
I
E
 
V
V
 
V
E
 
S
A
 
P
R
 
N
E
 
M
S
 
Q
K
 
I
F
 
Y
-
 
P
L
 
Q
V
 
V
S
 
S
C
 
C
D
|
D
S
 
G
R
 
Q
T
 
N
-
 
H
V
 
F
T
 
T
V
 
C
E
 
A
R
 
P
S
 
G
V
 
D
K
 
T
I
 
V
S
 
T
I
 
I
K
 
S
K
 
K
A
 
K
D
 
P
F
 
Q
C
 
K
V
 
L
N
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
H
L
 
P
N
 
I
N
 
D
E
 
H
T
 
N
Y
 
Y
L
 
Y
N
 
E
T
 
I
L
 
C
R
 
R
N
 
T
K
|
K
L
 
L
L
 
G
W
 
W
G
 
G

P0A7B3 NAD kinase; ATP-dependent NAD kinase; EC 2.7.1.23 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
33% identity, 78% coverage: 59:286/293 of query aligns to 58:287/292 of P0A7B3

query
sites
P0A7B3
T
 
A
E
 
E
L
 
I
K
 
G
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
D
V
 
L
L
 
A
L
 
V
S
 
V
L
 
V
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
N
L
 
M
L
 
L
D
 
G
T
 
A
L
 
A
S
 
R
L
 
T
I
 
L
R
 
A
N
 
R
S
 
Y
G
 
D
I
 
I
P
 
K
V
 
V
I
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
N
F
 
R
G
 
G
R
 
N
L
 
L
G
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
T
S
 
D
I
 
L
N
 
D
K
 
P
N
 
D
E
 
N
I
 
A
A
 
Q
S
 
Q
A
 
Q
L
 
L
K
 
A
A
 
D
L
 
V
I
 
L
N
 
E
K
 
G
E
 
H
Y
 
Y
T
 
I
L
 
S
D
 
E
S
 
K
R
 
R
S
 
F
L
 
L
L
 
L
T
 
E
L
 
A
E
 
Q
-
 
V
S
 
C
D
 
Q
N
 
Q
G
 
D
L
 
C
F
 
Q
G
 
K
E
 
R
E
 
I
N
 
S
F
 
T
A
 
A
L
 
I
N
 
N
D
 
E
I
 
V
T
 
V
I
 
L
H
 
H
R
 
P
R
 
G
D
 
K
N
 
V
S
 
A
A
 
H
M
 
M
M
 
I
I
 
E
I
 
F
H
 
E
A
 
V
S
 
Y
M
 
I
N
 
D
D
 
E
E
 
I
F
 
F
I
 
A
N
 
F
S
 
S
Y
 
Q
W
x
R
A
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
I
I
 
I
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
T
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
S
 
S
C
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
I
I
 
L
Y
 
T
P
 
P
D
 
S
S
 
L
E
 
D
N
 
A
F
 
I
V
 
T
I
 
L
T
 
V
P
 
P
I
 
M
A
 
F
P
 
P
H
 
H
N
 
T
L
 
L
N
 
S
V
 
A
R
 
R
P
 
P
V
 
L
I
 
V
L
 
I
P
 
N
D
 
S
D
 
S
N
 
S
K
 
T
L
 
I
S
 
R
F
 
L
E
 
R
V
 
F
E
 
S
A
 
H
R
 
R
E
 
R
S
 
N
K
 
D
F
 
L
L
 
E
V
 
I
S
 
S
C
 
C
D
 
D
S
 
S
R
 
Q
-
 
I
T
 
A
V
 
L
T
 
P
V
 
I
E
 
Q
R
 
E
S
 
G
V
 
E
K
 
D
I
 
V
S
 
L
I
 
I
K
 
R
K
 
R
A
 
C
D
 
D
F
 
Y
C
 
H
V
 
L
N
 
N
L
 
L
I
 
I
R
 
H
L
 
P
N
 
K
N
 
D
E
 
Y
T
 
S
Y
 
Y
L
 
F
N
 
N
T
 
T
L
 
L
R
 
S
N
 
T
K
 
K
L
 
L
L
 
G
W
 
W

P9WHV7 NAD kinase; ATP-dependent NAD kinase; Poly(P)-dependent NAD kinase; PPNK; EC 2.7.1.23 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 3 papers)
30% identity, 75% coverage: 66:284/293 of query aligns to 77:297/307 of P9WHV7

query
sites
P9WHV7
D
 
E
V
 
L
L
 
V
L
 
L
S
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
 
G
T
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
R
T
 
A
L
 
A
S
 
E
L
 
L
I
 
A
R
 
R
N
 
N
S
 
A
G
 
S
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
L
G
 
G
I
 
V
N
 
N
F
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
I
G
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
E
I
 
A
N
 
E
K
 
A
N
 
E
E
 
A
I
 
I
A
 
D
S
 
A
A
 
V
L
 
L
K
 
E
A
 
H
L
 
V
I
 
V
N
 
A
K
 
Q
E
 
D
Y
 
Y
T
 
R
L
 
V
D
 
E
S
 
D
R
 
R
-
 
L
S
 
T
L
 
L
L
 
D
T
 
V
L
 
V
E
 
V
S
 
R
D
 
Q
N
 
G
G
 
G
L
 
R
F
 
I
G
 
V
E
 
N
E
 
R
N
 
G
F
 
W
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
x
E
I
 
V
T
 
S
I
 
L
H
 
E
R
 
K
R
 
G
D
 
P
N
 
R
S
 
L
A
 
G
M
 
V
M
 
L
I
 
G
I
 
V
H
 
V
A
 
V
S
 
E
M
 
I
N
 
D
D
 
G
E
 
R
F
 
P
I
 
V
N
 
S
S
 
A
Y
 
F
W
 
G
A
 
C
D
 
D
G
|
G
L
 
V
I
x
L
I
 
V
A
 
S
T
|
T
P
|
P
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
S
x
A
L
x
F
S
|
S
C
 
A
G
|
G
G
|
G
P
 
P
I
 
V
I
 
L
Y
 
W
P
 
P
D
 
D
S
 
L
E
 
E
N
 
A
F
 
I
V
 
L
I
 
V
T
 
V
P
 
P
I
 
N
A
 
N
P
 
A
H
 
H
N
 
A
L
 
L
N
 
F
V
 
G
R
 
R
P
 
P
V
 
M
I
 
V
L
 
T
P
 
S
D
 
P
D
 
E
N
 
A
K
 
T
L
 
I
S
 
A
F
 
I
E
 
E
V
 
I
E
 
E
A
 
A
R
 
D
E
 
G
S
 
H
K
 
D
F
 
A
L
 
L
V
 
V
S
 
F
C
 
C
D
 
D
S
 
G
-
 
R
R
 
R
T
 
E
V
 
M
T
 
L
V
 
I
E
 
P
R
 
A
S
 
G
V
 
S
K
 
R
I
 
L
S
 
E
I
 
V
K
 
T
K
 
R
A
 
C
D
 
V
F
 
T
C
 
S
V
 
V
N
 
K
L
 
W
I
 
A
R
 
R
L
 
L
N
 
D
N
 
S
E
 
A
T
 
P
Y
 
F
L
 
T
N
 
D
T
 
R
L
 
L
R
 
V
N
 
R
K
 
K
L
 
F

Sites not aligning to the query:

1y3iA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis NAD kinase-NAD complex (see paper)
30% identity, 73% coverage: 72:284/293 of query aligns to 12:226/231 of 1y3iA

query
sites
1y3iA
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
T
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
R
T
 
A
L
 
A
S
 
E
L
 
L
I
 
A
R
 
R
N
 
N
S
 
A
G
 
S
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
L
G
 
G
I
 
V
N
 
N
F
 
L
G
 
G
R
|
R
L
 
I
G
 
G
F
|
F
L
|
L
A
 
A
S
 
E
I
 
A
N
 
E
K
 
A
N
 
E
E
 
A
I
 
I
A
 
D
S
 
A
A
 
V
L
 
L
K
 
E
A
 
H
L
 
V
I
 
V
N
 
A
K
 
Q
E
 
D
Y
 
Y
T
 
R
L
 
V
D
 
E
S
 
D
R
 
R
-
 
L
S
 
T
L
 
L
L
 
D
T
 
V
L
 
V
E
 
V
S
 
R
D
 
Q
N
 
G
G
 
G
L
 
R
F
 
I
G
 
V
E
 
N
E
 
R
N
 
G
F
 
W
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
x
E
I
 
V
T
 
S
I
 
L
H
 
E
R
 
K
R
 
G
D
 
P
N
 
R
S
 
L
A
 
G
M
 
V
M
 
L
I
 
G
I
 
V
H
 
V
A
 
V
S
 
E
M
 
I
N
 
D
D
 
G
E
 
R
F
 
P
I
 
V
N
 
S
S
 
A
Y
 
F
W
 
G
A
 
C
D
 
D
G
 
G
L
 
V
I
 
L
I
 
V
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
S
 
A
L
 
F
S
|
S
C
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
V
I
 
L
Y
 
W
P
 
P
D
 
D
S
 
L
E
 
E
N
 
A
F
 
I
V
 
L
I
 
V
T
 
V
P
 
P
I
 
N
A
 
N
P
 
A
H
 
H
N
 
A
L
 
L
N
 
F
V
 
G
R
 
R
P
 
P
V
 
M
I
 
V
L
 
T
P
 
S
D
 
P
D
 
E
N
 
A
K
 
T
L
 
I
S
 
A
F
 
I
E
 
E
V
 
I
E
 
E
A
 
A
R
 
D
E
 
G
S
 
H
K
 
D
F
 
A
L
 
L
V
 
V
S
 
F
C
 
C
D
 
D
S
 
G
-
 
R
R
 
R
T
 
E
V
 
M
T
 
L
V
 
I
E
 
P
R
 
A
S
 
G
V
 
S
K
 
R
I
 
L
S
 
E
I
 
V
K
 
T
K
 
R
A
 
C
D
 
V
F
 
T
C
 
S
V
 
V
N
 
K
L
 
W
I
 
A
R
 
R
L
 
L
N
 
D
N
 
S
E
 
A
T
 
P
Y
 
F
L
 
T
N
 
D
T
 
R
L
 
L
R
 
V
N
 
R
K
 
K
L
 
F

3afoA Crystal structure of yeast nadh kinase complexed with nadh
34% identity, 59% coverage: 65:236/293 of query aligns to 111:285/360 of 3afoA

query
sites
3afoA
A
 
T
D
 
D
V
 
L
L
 
L
L
 
V
S
 
T
L
 
L
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
T
 
T
L
 
I
L
|
L
D
 
H
T
 
G
L
 
V
S
 
S
L
 
M
I
 
F
R
 
G
N
 
N
S
 
T
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
-
 
P
V
 
V
I
 
L
G
 
A
I
 
F
N
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
T
L
 
L
G
 
G
F
|
F
L
 
L
A
 
S
S
 
P
I
 
F
N
 
D
K
 
F
N
 
K
E
 
E
I
 
H
A
 
K
S
 
K
A
 
V
L
 
F
K
 
Q
A
 
E
L
 
V
I
 
I
N
 
S
K
 
S
E
 
R
Y
 
A
T
 
K
L
 
C
D
 
L
S
 
H
R
 
R
S
 
T
L
 
R
L
 
L
T
 
E
-
 
C
-
 
H
L
 
L
E
 
K
S
 
K
D
 
K
N
 
D
G
 
S
L
 
N
F
 
S
G
 
S
E
 
I
E
 
V
N
 
T
F
 
H
A
 
A
L
 
M
N
|
N
D
|
D
I
 
I
T
 
F
I
 
L
H
 
H
R
 
R
R
 
G
D
 
N
N
 
S
S
 
P
A
 
H
M
 
L
M
 
T
I
 
N
I
 
L
H
 
D
A
 
I
S
 
F
M
 
I
N
 
D
D
 
G
E
 
E
F
 
F
I
 
L
N
 
T
S
 
R
Y
 
T
W
 
T
A
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
V
I
 
A
I
 
L
A
 
A
T
 
T
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
S
 
S
L
 
L
S
|
S
C
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
S
I
 
I
I
 
V
Y
 
S
P
 
P
D
 
L
S
 
V
E
 
P
N
 
A
F
 
I
V
 
L
I
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
I
A
 
C
P
 
P
H
 
R
N
 
S
L
 
L
N
 
S
V
 
F
R
 
R
P
 
P
V
 
L
I
 
I
L
 
L
P
 
P
D
 
H
D
 
S
N
 
S
K
 
H
L
 
I
S
 
R
F
 
I
E
 
K
V
 
I
E
 
G
A
 
S
R
 
K

Sites not aligning to the query:

1z0zA Crystal structure of a NAD kinase from archaeoglobus fulgidus in complex with NAD (see paper)
27% identity, 81% coverage: 47:284/293 of query aligns to 22:245/249 of 1z0zA

query
sites
1z0zA
K
 
R
L
 
L
P
 
E
A
 
V
N
 
E
T
 
V
V
 
E
I
 
L
F
 
F
H
 
N
N
 
Q
H
 
P
T
 
S
E
 
E
L
 
E
K
 
L
E
 
E
L
 
N
A
 
F
D
 
D
V
 
F
L
 
I
L
 
V
S
 
S
L
 
V
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
I
L
 
L
D
 
R
T
 
I
L
 
L
S
 
Q
L
 
K
I
 
L
R
 
K
N
 
R
S
 
C
G
 
P
I
 
-
P
 
P
V
 
I
I
 
F
G
 
G
I
 
I
N
 
N
F
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
V
G
 
G
F
 
L
L
 
L
A
 
T
S
 
H
I
 
A
N
 
S
K
 
P
N
 
E
E
 
N
I
 
F
A
 
E
S
 
V
A
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
K
L
 
A
I
 
V
N
 
E
K
 
K
E
 
-
Y
 
F
T
x
E
L
 
V
D
 
E
S
 
R
R
 
F
S
 
P
L
 
R
L
 
V
T
 
S
L
x
C
E
 
S
S
 
A
D
 
M
N
 
P
G
 
D
L
 
V
F
 
L
G
 
-
E
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
x
E
I
 
I
T
 
A
I
 
V
H
 
L
R
 
S
R
 
R
D
 
K
N
 
P
S
 
A
A
 
K
M
|
M
M
 
I
I
 
D
I
 
V
H
 
A
A
 
L
S
 
R
M
 
V
N
 
D
D
 
G
E
 
V
F
 
E
I
 
V
N
 
D
S
 
R
Y
 
I
W
x
R
A
 
C
D
|
D
G
 
G
L
 
F
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
Q
T
 
I
G
 
G
S
 
S
T
|
T
A
 
G
Y
|
Y
S
 
A
L
 
F
S
|
S
C
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
V
I
 
V
Y
 
E
P
 
P
D
 
Y
S
 
L
E
 
E
N
 
C
F
 
F
V
 
I
I
 
L
T
 
I
P
 
P
I
 
I
A
 
A
P
 
P
H
x
F
N
 
R
L
 
F
N
 
G
V
 
W
R
 
K
P
 
P
V
 
Y
I
 
V
L
 
V
P
 
S
D
 
M
D
 
E
N
 
R
K
 
K
L
 
-
S
 
-
F
 
-
E
 
-
V
 
I
E
 
E
A
 
V
R
 
I
E
 
A
S
 
E
K
 
K
F
 
A
L
 
I
V
 
V
S
 
V
C
 
A
D
|
D
S
x
G
R
 
Q
T
 
K
V
 
-
T
 
S
V
 
V
E
 
D
R
 
F
S
 
D
V
 
G
K
 
E
I
 
I
S
 
T
I
 
I
K
 
E
K
 
K
A
 
S
D
 
E
F
 
F
C
 
-
V
 
-
N
 
P
L
 
A
I
 
V
R
 
F
L
 
F
N
 
K
N
 
N
E
 
E
T
 
K
Y
 
R
L
 
F
N
 
R
T
 
N
L
 
L
R
 
F
N
 
G
K
 
K
L
 
V

1z0sA Crystal structure of an NAD kinase from archaeoglobus fulgidus in complex with atp (see paper)
27% identity, 81% coverage: 47:284/293 of query aligns to 22:245/249 of 1z0sA

query
sites
1z0sA
K
 
R
L
 
L
P
 
E
A
 
V
N
 
E
T
 
V
V
 
E
I
 
L
F
 
F
H
 
N
N
 
Q
H
 
P
T
 
S
E
 
E
L
 
E
K
 
L
E
 
E
L
 
N
A
 
F
D
 
D
V
 
F
L
 
I
L
 
V
S
 
S
L
 
V
G
 
G
G
|
G
D
 
D
G
|
G
T
|
T
L
 
I
L
 
L
D
x
R
T
 
I
L
 
L
S
 
Q
L
 
K
I
 
L
R
 
K
N
 
R
S
 
C
G
 
P
I
 
-
P
 
P
V
 
I
I
 
F
G
 
G
I
 
I
N
 
N
F
 
T
G
 
G
R
|
R
L
 
V
G
 
G
F
 
L
L
 
L
A
 
T
S
 
H
I
 
A
N
 
S
K
 
P
N
 
E
E
 
N
I
 
F
A
 
E
S
 
V
A
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
K
L
 
A
I
 
V
N
 
E
K
 
K
E
 
-
Y
 
F
T
x
E
L
 
V
D
 
E
S
 
R
R
 
F
S
 
P
L
 
R
L
 
V
T
 
S
L
x
C
E
 
S
S
 
A
D
 
M
N
 
P
G
 
D
L
 
V
F
 
L
G
 
-
E
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
x
E
I
 
I
T
 
A
I
 
V
H
 
L
R
 
S
R
 
R
D
 
K
N
 
P
S
x
A
A
x
K
M
|
M
M
 
I
I
 
D
I
 
V
H
 
A
A
 
L
S
 
R
M
 
V
N
 
D
D
 
G
E
 
V
F
 
E
I
 
V
N
 
D
S
 
R
Y
 
I
W
 
R
A
 
C
D
|
D
G
 
G
L
 
F
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
Q
T
 
I
G
 
G
S
 
S
T
 
T
A
x
G
Y
|
Y
S
 
A
L
 
F
S
|
S
C
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
V
I
 
V
Y
 
E
P
 
P
D
 
Y
S
 
L
E
 
E
N
 
C
F
 
F
V
 
I
I
 
L
T
 
I
P
 
P
I
 
I
A
|
A
P
 
P
H
x
F
N
 
R
L
 
F
N
 
G
V
 
W
R
 
K
P
 
P
V
 
Y
I
 
V
L
 
V
P
 
S
D
 
M
D
 
E
N
 
R
K
 
K
L
 
-
S
 
-
F
 
-
E
 
-
V
 
I
E
 
E
A
 
V
R
 
I
E
 
A
S
 
E
K
 
K
F
 
A
L
 
I
V
 
V
S
 
V
C
 
A
D
|
D
S
 
G
R
 
Q
T
 
K
V
 
-
T
 
S
V
 
V
E
 
D
R
 
F
S
 
D
V
 
G
K
 
E
I
 
I
S
 
T
I
 
I
K
 
E
K
 
K
A
 
S
D
 
E
F
 
F
C
 
-
V
 
-
N
 
P
L
 
A
I
 
V
R
 
F
L
 
F
N
 
K
N
 
N
E
 
E
T
 
K
Y
 
R
L
 
F
N
 
R
T
 
N
L
 
L
R
 
F
N
 
G
K
 
K
L
 
V

Sites not aligning to the query:

1suwA Crystal structure of a NAD kinase from archaeoglobus fulgidus in complex with its substrate and product: insights into the catalysis of NAD kinase (see paper)
27% identity, 81% coverage: 47:284/293 of query aligns to 22:245/249 of 1suwA

query
sites
1suwA
K
 
R
L
 
L
P
 
E
A
 
V
N
 
E
T
 
V
V
 
E
I
 
L
F
 
F
H
 
N
N
 
Q
H
 
P
T
 
S
E
 
E
L
 
E
K
 
L
E
 
E
L
 
N
A
 
F
D
 
D
V
 
F
L
 
I
L
 
V
S
 
S
L
 
V
G
 
G
G
|
G
D
|
D
G
|
G
T
 
T
L
 
I
L
 
L
D
 
R
T
 
I
L
 
L
S
 
Q
L
 
K
I
 
L
R
 
K
N
 
R
S
 
C
G
 
P
I
 
-
P
 
P
V
 
I
I
 
F
G
 
G
I
 
I
N
 
N
F
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
V
G
 
G
F
 
L
L
 
L
A
 
T
S
 
H
I
 
A
N
 
S
K
 
P
N
 
E
E
 
N
I
 
F
A
 
E
S
 
V
A
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
K
L
 
A
I
 
V
N
 
E
K
 
K
E
 
-
Y
 
F
T
 
E
L
 
V
D
 
E
S
 
R
R
 
F
S
 
P
L
 
R
L
 
V
T
 
S
L
 
C
E
 
S
S
 
A
D
 
M
N
 
P
G
 
D
L
 
V
F
 
L
G
 
-
E
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
x
E
I
 
I
T
 
A
I
 
V
H
 
L
R
 
S
R
 
R
D
 
K
N
 
P
S
x
A
A
 
K
M
|
M
M
 
I
I
 
D
I
 
V
H
 
A
A
 
L
S
 
R
M
 
V
N
 
D
D
 
G
E
 
V
F
 
E
I
 
V
N
 
D
S
 
R
Y
 
I
W
x
R
A
 
C
D
|
D
G
 
G
L
 
F
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
Q
T
 
I
G
 
G
S
 
S
T
|
T
A
 
G
Y
|
Y
S
 
A
L
 
F
S
|
S
C
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
V
I
 
V
Y
 
E
P
 
P
D
 
Y
S
 
L
E
 
E
N
 
C
F
 
F
V
 
I
I
 
L
T
 
I
P
 
P
I
 
I
A
 
A
P
 
P
H
x
F
N
 
R
L
 
F
N
 
G
V
 
W
R
 
K
P
 
P
V
 
Y
I
 
V
L
 
V
P
 
S
D
 
M
D
 
E
N
 
R
K
 
K
L
 
-
S
 
-
F
 
-
E
 
-
V
 
I
E
 
E
A
 
V
R
 
I
E
 
A
S
 
E
K
 
K
F
 
A
L
 
I
V
 
V
S
 
V
C
 
A
D
|
D
S
x
G
R
 
Q
T
 
K
V
 
-
T
 
S
V
 
V
E
 
D
R
 
F
S
 
D
V
 
G
K
 
E
I
 
I
S
 
T
I
 
I
K
 
E
K
 
K
A
 
S
D
 
E
F
 
F
C
 
-
V
 
-
N
 
P
L
 
A
I
 
V
R
 
F
L
 
F
N
 
K
N
 
N
E
 
E
T
 
K
Y
 
R
L
 
F
N
 
R
T
 
N
L
 
L
R
 
F
N
 
G
K
 
K
L
 
V

O30297 NAD kinase; ATP-dependent NAD kinase; EC 2.7.1.23 from Archaeoglobus fulgidus (strain ATCC 49558 / DSM 4304 / JCM 9628 / NBRC 100126 / VC-16) (see paper)
27% identity, 81% coverage: 47:284/293 of query aligns to 22:245/249 of O30297

query
sites
O30297
K
 
R
L
 
L
P
 
E
A
 
V
N
 
E
T
 
V
V
 
E
I
 
L
F
 
F
H
 
N
N
 
Q
H
 
P
T
 
S
E
 
E
L
 
E
K
 
L
E
 
E
L
 
N
A
 
F
D
 
D
V
 
F
L
 
I
L
 
V
S
 
S
L
 
V
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
T
 
T
L
 
I
L
 
L
D
x
R
T
 
I
L
 
L
S
 
Q
L
 
K
I
 
L
R
 
K
N
 
R
S
 
C
G
 
P
I
 
-
P
 
P
V
 
I
I
 
F
G
 
G
I
 
I
N
 
N
F
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
V
G
 
G
F
 
L
L
 
L
A
 
T
S
 
H
I
 
A
N
 
S
K
 
P
N
 
E
E
 
N
I
 
F
A
 
E
S
 
V
A
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
K
L
 
A
I
 
V
N
 
E
K
 
K
E
 
-
Y
 
F
T
 
E
L
 
V
D
 
E
S
 
R
R
 
F
S
 
P
L
 
R
L
 
V
T
 
S
L
 
C
E
 
S
S
 
A
D
 
M
N
 
P
G
 
D
L
 
V
F
 
L
G
 
-
E
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
x
E
I
 
I
T
 
A
I
 
V
H
 
L
R
 
S
R
 
R
D
 
K
N
 
P
S
 
A
A
x
K
M
 
M
M
 
I
I
 
D
I
 
V
H
 
A
A
 
L
S
 
R
M
 
V
N
 
D
D
 
G
E
 
V
F
 
E
I
 
V
N
 
D
S
 
R
Y
 
I
W
x
R
A
 
C
D
 
D
G
 
G
L
 
F
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
Q
T
x
I
G
 
G
S
 
S
T
|
T
A
x
G
Y
|
Y
S
x
A
L
x
F
S
|
S
C
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
V
I
 
V
Y
 
E
P
 
P
D
 
Y
S
 
L
E
 
E
N
 
C
F
 
F
V
 
I
I
 
L
T
 
I
P
 
P
I
 
I
A
 
A
P
 
P
H
 
F
N
 
R
L
 
F
N
 
G
V
 
W
R
 
K
P
 
P
V
 
Y
I
 
V
L
 
V
P
 
S
D
 
M
D
 
E
N
 
R
K
 
K
L
 
-
S
 
-
F
 
-
E
 
-
V
 
I
E
 
E
A
 
V
R
 
I
E
 
A
S
 
E
K
 
K
F
 
A
L
 
I
V
 
V
S
 
V
C
 
A
D
 
D
S
 
G
R
x
Q
T
 
K
V
 
-
T
 
S
V
 
V
E
 
D
R
 
F
S
 
D
V
 
G
K
 
E
I
 
I
S
 
T
I
 
I
K
 
E
K
 
K
A
 
S
D
 
E
F
 
F
C
 
-
V
 
-
N
 
P
L
 
A
I
 
V
R
 
F
L
 
F
N
 
K
N
 
N
E
 
E
T
 
K
Y
 
R
L
 
F
N
 
R
T
 
N
L
 
L
R
 
F
N
 
G
K
 
K
L
 
V

Q9P7K3 Uncharacterized kinase C24B10.02c; EC 2.7.1.- from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
27% identity, 77% coverage: 66:292/293 of query aligns to 176:412/449 of Q9P7K3

query
sites
Q9P7K3
D
 
D
V
 
L
L
 
A
L
 
I
S
 
T
L
 
I
G
 
G
G
 
D
D
 
N
G
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
Y
T
 
T
L
 
S
S
 
W
L
 
L
I
 
F
R
 
Q
N
 
K
S
 
I
G
 
G
I
 
P
P
 
P
V
 
V
I
 
L
G
 
S
I
 
F
N
 
S
F
 
D
G
 
D
R
 
D
L
 
V
-
 
P
G
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
T
S
 
H
I
 
F
N
 
S
K
 
L
N
 
S
E
 
N
I
 
Y
A
 
Q
S
 
Q
A
 
H
L
 
L
K
 
Y
A
 
Q
L
 
V
I
 
L
N
 
T
K
 
Q
E
 
N
Y
 
V
T
 
S
L
 
L
D
 
R
S
 
F
R
 
C
S
 
S
L
 
R
L
 
L
T
 
Q
L
 
C
-
 
S
-
 
F
-
 
H
-
 
K
-
 
Y
-
 
D
-
 
E
E
 
K
S
 
T
D
 
K
N
 
Q
G
 
Y
L
 
S
F
 
L
G
 
A
E
 
S
E
 
T
N
 
T
F
 
Y
A
 
S
L
 
L
N
 
D
D
 
E
I
 
I
T
 
L
I
 
I
H
 
S
R
 
R
R
 
G
D
 
E
N
 
H
S
 
P
A
 
F
M
 
I
M
 
S
I
 
N
I
 
L
H
 
N
A
 
V
S
 
Y
M
 
N
N
 
N
D
 
S
E
 
E
F
 
L
I
 
M
N
 
T
S
 
V
Y
 
V
W
 
Q
A
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
V
I
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
T
A
 
N
Y
 
I
S
 
S
L
 
A
S
 
N
C
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
S
I
 
L
I
 
V
Y
 
H
P
 
P
D
 
A
S
 
L
E
 
N
N
 
A
F
 
I
V
 
L
I
 
V
T
 
T
P
 
P
I
 
V
A
 
C
P
 
P
H
 
H
N
 
T
L
 
L
N
 
S
V
 
F
R
 
R
P
 
P
V
 
I
I
 
I
L
 
L
P
 
P
D
 
D
D
 
Y
N
 
N
K
 
V
L
 
L
S
 
N
F
 
V
E
 
E
V
 
I
-
 
P
-
 
L
E
 
D
A
 
S
R
 
R
E
 
S
S
 
S
K
 
A
F
 
F
L
 
F
V
 
S
S
 
V
C
 
D
D
 
R
S
 
H
R
 
E
T
 
S
V
 
V
T
 
E
V
 
M
E
 
H
R
 
R
S
 
G
V
 
D
K
 
Y
I
 
L
S
 
S
I
 
I
K
 
V
K
 
T
A
 
S
D
 
H
F
 
Y
C
 
P
V
 
F
N
 
T
L
 
T
I
 
I
R
 
Q
L
 
N
N
 
P
N
 
G
E
 
Y
T
 
Q
Y
 
W
L
 
T
N
 
K
T
 
V
L
 
L
R
 
E
N
 
D
K
 
K
L
 
F
L
 
N
W
 
W
G
 
N
I
 
V
D
 
R
T
 
E
R
 
R
N
 
Q

Sites not aligning to the query:

O13863 Uncharacterized kinase C1B1.02c; EC 2.7.1.- from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
27% identity, 78% coverage: 59:286/293 of query aligns to 273:511/537 of O13863

query
sites
O13863
T
 
T
E
 
Q
L
 
C
K
 
P
E
 
N
L
 
L
A
 
F
D
 
D
V
 
C
L
 
V
L
 
I
S
 
T
L
 
V
G
 
G
G
 
D
D
 
D
G
 
S
T
 
A
L
 
A
L
 
L
D
 
R
T
 
A
L
 
S
S
 
W
L
 
L
I
 
F
R
 
Q
N
 
D
S
 
V
G
 
V
I
 
P
P
 
P
V
 
V
I
 
L
G
 
S
I
 
F
N
 
S
F
 
T
G
 
A
R
 
K
L
 
A
G
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
I
I
 
L
N
 
P
K
 
I
N
 
A
E
 
E
I
 
Y
A
 
T
S
 
K
A
 
T
L
 
L
K
 
D
A
 
L
L
 
I
I
 
F
N
 
H
K
 
R
E
 
G
Y
 
F
T
 
T
L
 
V
D
 
N
S
 
L
R
 
R
S
 
M
L
 
R
L
 
F
T
 
Q
L
 
C
-
 
S
-
 
I
-
 
M
-
 
R
-
 
Y
-
 
V
-
 
G
E
 
E
S
 
H
D
 
S
N
 
T
G
 
H
L
 
I
F
 
C
G
 
E
E
 
G
E
 
Q
N
 
Y
F
 
S
A
 
V
L
 
L
N
 
N
D
 
E
I
 
L
T
 
L
I
 
I
H
 
D
R
 
R
R
 
G
D
 
P
N
 
N
S
 
P
A
 
F
M
 
M
M
 
I
I
 
S
I
 
L
H
 
D
A
 
L
S
 
Y
M
 
V
N
 
E
D
 
N
E
 
E
F
 
Y
I
 
I
N
 
T
S
 
T
Y
 
L
W
 
Q
A
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
V
I
 
C
I
 
V
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
T
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
L
 
V
S
 
A
C
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
S
I
 
L
I
 
C
Y
 
H
P
 
P
D
 
G
S
 
I
E
 
P
N
 
A
F
 
I
V
 
L
I
 
I
T
 
S
P
 
A
I
 
I
A
 
C
P
 
P
H
 
H
N
 
S
L
 
L
N
 
S
V
 
F
R
 
R
P
 
P
V
 
I
I
 
I
L
 
L
P
 
P
D
 
D
D
 
S
N
 
M
K
 
T
L
 
L
S
 
R
F
 
I
E
 
V
V
 
V
-
 
P
-
 
L
E
 
D
A
 
A
R
 
R
E
 
S
S
 
N
K
 
A
F
 
W
L
 
C
V
 
A
S
 
F
C
 
D
D
 
G
S
 
H
R
 
H
T
 
R
V
 
I
T
 
E
V
 
L
E
 
G
R
 
L
S
 
G
V
 
D
K
 
Y
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
S
K
 
A
A
 
S
D
 
S
F
 
F
C
 
P
V
 
F
-
 
P
N
 
S
L
 
V
I
 
I
R
 
R
L
 
S
N
 
K
-
 
Y
N
 
S
E
 
K
T
 
D
Y
 
W
L
 
F
N
 
D
T
 
I
L
 
L
R
 
R
N
 
Q
K
 
T
L
 
L
L
 
N
W
 
W

Sites not aligning to the query:

7zzdA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complex with a linear di-adenosine derivative (see paper)
29% identity, 68% coverage: 66:265/293 of query aligns to 37:244/262 of 7zzdA

query
sites
7zzdA
D
 
E
V
 
I
L
 
V
L
 
I
S
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
T
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
S
T
 
A
L
 
F
S
 
H
L
 
Q
I
 
Y
-
 
E
-
 
E
R
 
R
N
 
L
S
 
D
G
 
E
I
 
I
P
 
A
V
 
F
I
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
H
F
 
T
G
 
G
R
 
H
L
 
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
A
 
A
S
 
D
I
 
W
N
 
R
K
 
P
N
 
A
E
 
E
I
 
A
A
 
D
S
 
K
A
 
L
L
 
V
K
 
K
A
 
L
L
 
L
I
 
A
N
 
K
K
 
G
E
 
E
Y
 
Y
T
 
Q
L
 
K
D
 
V
S
 
S
R
 
Y
S
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
K
L
 
T
E
 
T
S
 
V
D
 
K
N
 
Y
G
 
G
L
 
I
F
 
K
G
 
E
E
 
A
E
 
T
N
 
Y
F
 
L
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
x
E
I
 
S
T
 
T
I
 
V
H
 
-
R
 
-
R
 
K
D
 
S
N
 
S
S
 
G
A
 
G
M
 
P
M
 
F
I
 
V
I
 
V
H
 
D
A
 
V
S
 
V
M
 
I
N
 
N
D
 
D
E
 
I
F
 
H
I
 
F
N
 
E
S
 
R
Y
 
F
W
 
R
A
 
G
D
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
C
I
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
S
 
N
L
 
K
S
|
S
C
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
I
 
M
Y
 
H
P
 
P
D
 
S
S
 
I
E
 
E
N
 
A
F
 
M
V
 
Q
I
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
A
 
A
P
 
S
H
 
I
N
 
N
L
 
N
N
 
R
V
 
V
-
 
Y
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
G
R
 
S
P
 
P
V
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
D
 
K
D
 
H
N
 
H
K
 
V
L
 
V
S
 
S
F
 
L
E
 
Q
V
 
-
E
 
P
A
 
V
R
 
N
E
 
D
S
 
K
K
 
D
F
 
F
L
 
Q
V
 
I
S
 
S
C
 
V
D
 
D
S
x
H
R
 
L
T
 
S
V
 
I
-
 
L
-
 
H
-
 
R
-
 
D
T
 
V
V
 
Q
E
 
E
R
 
I
S
 
R
V
 
Y
K
 
E
I
 
V
S
 
S
I
 
A
K
 
K
K
 
K
A
 
I
D
 
H
F
 
F
C
 
A

7zz9A Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complex with a linear di-adenosine derivative (see paper)
29% identity, 68% coverage: 66:265/293 of query aligns to 37:244/262 of 7zz9A

query
sites
7zz9A
D
 
E
V
 
I
L
 
V
L
 
I
S
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
T
 
T
L
 
F
L
|
L
D
 
S
T
 
A
L
 
F
S
 
H
L
 
Q
I
 
Y
-
 
E
-
 
E
R
 
R
N
 
L
S
 
D
G
 
E
I
 
I
P
 
A
V
 
F
I
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
H
F
 
T
G
 
G
R
 
H
L
 
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
A
 
A
S
 
D
I
 
W
N
 
R
K
 
P
N
 
A
E
 
E
I
 
A
A
 
D
S
 
K
A
 
L
L
 
V
K
 
K
A
 
L
L
 
L
I
 
A
N
 
K
K
 
G
E
 
E
Y
 
Y
T
 
Q
L
 
K
D
 
V
S
 
S
R
 
Y
S
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
K
L
 
T
E
 
T
S
 
V
D
 
K
N
 
Y
G
 
G
L
 
I
F
 
K
G
 
E
E
 
A
E
 
T
N
 
Y
F
 
L
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
x
E
I
 
S
T
 
T
I
 
V
H
 
-
R
 
-
R
 
K
D
 
S
N
 
S
S
 
G
A
 
G
M
 
P
M
 
F
I
 
V
I
 
V
H
 
D
A
 
V
S
 
V
M
 
I
N
 
N
D
 
D
E
 
I
F
 
H
I
 
F
N
 
E
S
 
R
Y
 
F
W
 
R
A
 
G
D
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
C
I
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
S
 
N
L
 
K
S
|
S
C
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
I
 
M
Y
 
H
P
 
P
D
 
S
S
 
I
E
 
E
N
 
A
F
 
M
V
 
Q
I
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
A
 
A
P
 
S
H
 
I
N
 
N
L
 
N
N
 
R
V
 
V
-
 
Y
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
G
R
 
S
P
 
P
V
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
D
 
K
D
 
H
N
 
H
K
 
V
L
 
V
S
 
S
F
 
L
E
 
Q
V
 
-
E
 
P
A
 
V
R
 
N
E
 
D
S
 
K
K
 
D
F
 
F
L
 
Q
V
 
I
S
 
S
C
 
V
D
 
D
S
 
H
R
 
L
T
 
S
V
 
I
-
 
L
-
 
H
-
 
R
-
 
D
T
 
V
V
 
Q
E
 
E
R
 
I
S
 
R
V
 
Y
K
 
E
I
 
V
S
 
S
I
 
A
K
 
K
K
 
K
A
 
I
D
 
H
F
 
F
C
 
A

6z64A Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complex with a di-adenosine derivative (see paper)
29% identity, 68% coverage: 66:265/293 of query aligns to 37:244/262 of 6z64A

query
sites
6z64A
D
 
E
V
 
I
L
 
V
L
 
I
S
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
 
G
T
 
T
L
 
F
L
|
L
D
 
S
T
 
A
L
 
F
S
 
H
L
 
Q
I
 
Y
-
 
E
-
 
E
R
 
R
N
 
L
S
 
D
G
 
E
I
 
I
P
 
A
V
 
F
I
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
H
F
 
T
G
 
G
R
 
H
L
 
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
A
 
A
S
 
D
I
 
W
N
 
R
K
 
P
N
 
A
E
 
E
I
 
A
A
 
D
S
 
K
A
 
L
L
 
V
K
 
K
A
 
L
L
 
L
I
 
A
N
 
K
K
 
G
E
 
E
Y
 
Y
T
 
Q
L
 
K
D
 
V
S
 
S
R
 
Y
S
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
K
L
 
T
E
 
T
S
 
V
D
 
K
N
 
Y
G
 
G
L
 
I
F
 
K
G
 
E
E
 
A
E
 
T
N
 
Y
F
 
L
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
x
E
I
 
S
T
 
T
I
 
V
H
 
-
R
 
-
R
 
K
D
 
S
N
 
S
S
 
G
A
 
G
M
 
P
M
 
F
I
 
V
I
 
V
H
 
D
A
 
V
S
 
V
M
 
I
N
 
N
D
 
D
E
 
I
F
 
H
I
 
F
N
 
E
S
 
R
Y
 
F
W
 
R
A
 
G
D
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
C
I
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
S
 
N
L
 
K
S
|
S
C
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
I
 
M
Y
 
H
P
 
P
D
 
S
S
 
I
E
 
E
N
 
A
F
 
M
V
 
Q
I
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
A
 
A
P
 
S
H
 
I
N
 
N
L
 
N
N
 
R
V
 
V
-
 
Y
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
G
R
 
S
P
 
P
V
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
D
 
K
D
 
H
N
 
H
K
 
V
L
 
V
S
 
S
F
 
L
E
 
Q
V
 
-
E
 
P
A
 
V
R
 
N
E
 
D
S
 
K
K
 
D
F
 
F
L
 
Q
V
 
I
S
 
S
C
 
V
D
 
D
S
 
H
R
 
L
T
 
S
V
 
I
-
 
L
-
 
H
-
 
R
-
 
D
T
 
V
V
 
Q
E
 
E
R
 
I
S
 
R
V
 
Y
K
 
E
I
 
V
S
 
S
I
 
A
K
 
K
K
 
K
A
 
I
D
 
H
F
 
F
C
 
A

5dhuA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complex with a novel inhibitor (see paper)
29% identity, 68% coverage: 66:265/293 of query aligns to 37:245/263 of 5dhuA

query
sites
5dhuA
D
 
E
V
 
I
L
 
V
L
 
I
S
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
S
T
 
A
L
 
F
S
 
H
L
 
Q
I
 
Y
-
 
E
-
 
E
R
 
R
N
 
L
S
 
D
G
 
E
I
 
I
P
 
A
V
 
F
I
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
H
F
 
T
G
 
G
R
 
H
L
 
L
G
 
G
F
 
F
L
 
Y
A
 
A
S
 
D
I
 
W
N
 
R
K
 
P
N
 
A
E
 
E
I
 
A
A
 
D
S
 
K
A
 
L
L
 
V
K
 
K
A
 
L
L
 
L
I
 
A
N
 
K
K
 
G
E
 
E
Y
 
Y
T
 
Q
L
 
K
D
 
V
S
 
S
R
 
Y
S
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
K
L
 
T
E
 
T
S
 
V
D
 
K
N
 
Y
G
 
G
L
 
I
F
 
K
G
 
K
E
 
E
E
 
A
N
 
T
F
 
Y
-
 
L
A
 
A
L
 
L
N
 
N
D
x
E
I
 
S
T
 
T
I
 
V
H
 
-
R
 
-
R
 
K
D
 
S
N
 
S
S
 
G
A
x
G
M
x
P
M
 
F
I
 
V
I
 
V
H
 
D
A
 
V
S
 
V
M
 
I
N
 
N
D
 
D
E
 
I
F
 
H
I
 
F
N
 
E
S
 
R
Y
 
F
W
x
R
A
x
G
D
|
D
G
 
G
L
 
L
I
 
C
I
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
T
T
 
T
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
L
 
K
S
|
S
C
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
I
 
M
Y
 
H
P
 
P
D
 
S
S
 
I
E
 
E
N
 
A
F
 
M
V
 
Q
I
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
A
|
A
P
 
S
H
 
I
N
 
N
L
 
N
N
 
R
V
 
V
-
 
Y
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
G
R
 
S
P
 
P
V
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
D
 
K
D
 
H
N
 
H
K
 
V
L
 
V
S
 
S
F
 
L
E
 
Q
V
 
-
E
 
P
A
 
V
R
 
N
E
 
D
S
 
K
K
 
D
F
 
F
L
 
Q
V
 
I
S
 
S
C
 
V
D
 
D
S
x
H
R
 
L
T
 
S
V
 
I
-
 
L
-
 
H
-
 
R
-
 
D
T
 
V
V
 
Q
E
 
E
R
 
I
S
 
R
V
 
Y
K
 
E
I
 
V
S
 
S
I
 
A
K
 
K
K
 
K
A
 
I
D
 
H
F
 
F
C
 
A

5dhtA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complex with a novel inhibitor (see paper)
29% identity, 68% coverage: 66:265/293 of query aligns to 37:245/263 of 5dhtA

query
sites
5dhtA
D
 
E
V
 
I
L
 
V
L
 
I
S
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
S
T
 
A
L
 
F
S
 
H
L
 
Q
I
 
Y
-
 
E
-
 
E
R
 
R
N
 
L
S
 
D
G
 
E
I
 
I
P
 
A
V
 
F
I
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
H
F
 
T
G
 
G
R
 
H
L
 
L
G
 
G
F
 
F
L
 
Y
A
 
A
S
 
D
I
 
W
N
 
R
K
 
P
N
 
A
E
 
E
I
 
A
A
 
D
S
 
K
A
 
L
L
 
V
K
 
K
A
 
L
L
 
L
I
 
A
N
 
K
K
 
G
E
 
E
Y
 
Y
T
 
Q
L
 
K
D
 
V
S
 
S
R
 
Y
S
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
K
L
 
T
E
 
T
S
 
V
D
 
K
N
 
Y
G
 
G
L
 
I
F
 
K
G
 
K
E
 
E
E
 
A
N
 
T
F
 
Y
-
 
L
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
x
E
I
 
S
T
 
T
I
 
V
H
 
-
R
 
-
R
 
K
D
 
S
N
 
S
S
 
G
A
 
G
M
x
P
M
 
F
I
 
V
I
 
V
H
 
D
A
 
V
S
 
V
M
 
I
N
 
N
D
 
D
E
 
I
F
 
H
I
 
F
N
 
E
S
 
R
Y
 
F
W
 
R
A
x
G
D
|
D
G
 
G
L
 
L
I
 
C
I
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
T
T
 
T
A
|
A
Y
|
Y
S
 
N
L
 
K
S
|
S
C
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
I
 
M
Y
 
H
P
 
P
D
 
S
S
 
I
E
 
E
N
 
A
F
 
M
V
 
Q
I
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
A
|
A
P
 
S
H
 
I
N
 
N
L
 
N
N
 
R
V
 
V
-
 
Y
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
G
R
 
S
P
 
P
V
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
D
 
K
D
 
H
N
 
H
K
 
V
L
 
V
S
 
S
F
 
L
E
 
Q
V
 
-
E
 
P
A
 
V
R
 
N
E
 
D
S
 
K
K
 
D
F
 
F
L
 
Q
V
 
I
S
 
S
C
 
V
D
 
D
S
 
H
R
 
L
T
 
S
V
 
I
-
 
L
-
 
H
-
 
R
-
 
D
T
 
V
V
 
Q
E
 
E
R
 
I
S
 
R
V
 
Y
K
 
E
I
 
V
S
 
S
I
 
A
K
 
K
K
 
K
A
 
I
D
 
H
F
 
F
C
 
A

5dhsA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complex with a novel inhibitor (see paper)
29% identity, 68% coverage: 66:265/293 of query aligns to 37:245/263 of 5dhsA

query
sites
5dhsA
D
 
E
V
 
I
L
 
V
L
 
I
S
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
S
T
 
A
L
 
F
S
 
H
L
 
Q
I
 
Y
-
 
E
-
 
E
R
 
R
N
 
L
S
 
D
G
 
E
I
 
I
P
 
A
V
 
F
I
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
H
F
 
T
G
 
G
R
 
H
L
 
L
G
 
G
F
 
F
L
 
Y
A
 
A
S
 
D
I
 
W
N
 
R
K
 
P
N
 
A
E
 
E
I
 
A
A
 
D
S
 
K
A
 
L
L
 
V
K
 
K
A
 
L
L
 
L
I
 
A
N
 
K
K
 
G
E
 
E
Y
 
Y
T
 
Q
L
 
K
D
 
V
S
 
S
R
 
Y
S
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
K
L
 
T
E
 
T
S
 
V
D
 
K
N
 
Y
G
 
G
L
 
I
F
 
K
G
 
K
E
 
E
E
 
A
N
 
T
F
 
Y
-
 
L
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
x
E
I
 
S
T
 
T
I
 
V
H
 
-
R
 
-
R
 
K
D
 
S
N
 
S
S
 
G
A
x
G
M
x
P
M
 
F
I
 
V
I
 
V
H
 
D
A
 
V
S
 
V
M
 
I
N
 
N
D
 
D
E
 
I
F
 
H
I
 
F
N
 
E
S
 
R
Y
 
F
W
x
R
A
x
G
D
|
D
G
 
G
L
 
L
I
 
C
I
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
T
T
 
T
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
L
 
K
S
|
S
C
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
I
 
M
Y
 
H
P
 
P
D
 
S
S
 
I
E
 
E
N
 
A
F
 
M
V
 
Q
I
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
A
|
A
P
 
S
H
 
I
N
 
N
L
 
N
N
 
R
V
 
V
-
 
Y
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
G
R
 
S
P
 
P
V
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
D
 
K
D
 
H
N
 
H
K
 
V
L
 
V
S
 
S
F
 
L
E
 
Q
V
 
-
E
 
P
A
 
V
R
 
N
E
 
D
S
 
K
K
 
D
F
 
F
L
 
Q
V
 
I
S
 
S
C
 
V
D
 
D
S
x
H
R
 
L
T
 
S
V
 
I
-
 
L
-
 
H
-
 
R
-
 
D
T
 
V
V
 
Q
E
 
E
R
 
I
S
 
R
V
 
Y
K
 
E
I
 
V
S
 
S
I
 
A
K
 
K
K
 
K
A
 
I
D
 
H
F
 
F
C
 
A

5dhrA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complex with a novel inhibitor (see paper)
29% identity, 68% coverage: 66:265/293 of query aligns to 37:245/263 of 5dhrA

query
sites
5dhrA
D
 
E
V
 
I
L
 
V
L
 
I
S
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
S
T
 
A
L
 
F
S
 
H
L
 
Q
I
 
Y
-
 
E
-
 
E
R
 
R
N
 
L
S
 
D
G
 
E
I
 
I
P
 
A
V
 
F
I
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
H
F
 
T
G
 
G
R
 
H
L
 
L
G
 
G
F
 
F
L
 
Y
A
 
A
S
 
D
I
 
W
N
 
R
K
 
P
N
 
A
E
 
E
I
 
A
A
 
D
S
 
K
A
 
L
L
 
V
K
 
K
A
 
L
L
 
L
I
 
A
N
 
K
K
 
G
E
 
E
Y
 
Y
T
 
Q
L
 
K
D
 
V
S
 
S
R
 
Y
S
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
K
L
 
T
E
 
T
S
 
V
D
 
K
N
 
Y
G
 
G
L
 
I
F
 
K
G
 
K
E
 
E
E
 
A
N
 
T
F
 
Y
-
 
L
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
x
E
I
 
S
T
 
T
I
 
V
H
 
-
R
 
-
R
 
K
D
 
S
N
 
S
S
 
G
A
x
G
M
x
P
M
 
F
I
 
V
I
 
V
H
 
D
A
 
V
S
 
V
M
 
I
N
 
N
D
 
D
E
 
I
F
 
H
I
 
F
N
 
E
S
 
R
Y
 
F
W
x
R
A
x
G
D
|
D
G
 
G
L
 
L
I
 
C
I
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
T
T
 
T
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
L
 
K
S
|
S
C
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
I
 
M
Y
 
H
P
 
P
D
 
S
S
 
I
E
 
E
N
 
A
F
 
M
V
 
Q
I
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
A
 
A
P
 
S
H
 
I
N
 
N
L
 
N
N
 
R
V
 
V
-
 
Y
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
G
R
 
S
P
 
P
V
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
D
 
K
D
 
H
N
 
H
K
 
V
L
 
V
S
 
S
F
 
L
E
 
Q
V
 
-
E
 
P
A
 
V
R
 
N
E
 
D
S
 
K
K
 
D
F
 
F
L
 
Q
V
 
I
S
 
S
C
 
V
D
 
D
S
x
H
R
 
L
T
 
S
V
 
I
-
 
L
-
 
H
-
 
R
-
 
D
T
 
V
V
 
Q
E
 
E
R
 
I
S
 
R
V
 
Y
K
 
E
I
 
V
S
 
S
I
 
A
K
 
K
K
 
K
A
 
I
D
 
H
F
 
F
C
 
A

5dhqA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complex with a novel inhibitor (see paper)
29% identity, 68% coverage: 66:265/293 of query aligns to 37:245/263 of 5dhqA

query
sites
5dhqA
D
 
E
V
 
I
L
 
V
L
 
I
S
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
S
T
 
A
L
 
F
S
 
H
L
 
Q
I
 
Y
-
 
E
-
 
E
R
 
R
N
 
L
S
 
D
G
 
E
I
 
I
P
 
A
V
 
F
I
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
H
F
 
T
G
 
G
R
 
H
L
 
L
G
 
G
F
 
F
L
 
Y
A
 
A
S
 
D
I
 
W
N
 
R
K
 
P
N
 
A
E
 
E
I
 
A
A
 
D
S
 
K
A
 
L
L
 
V
K
 
K
A
 
L
L
 
L
I
 
A
N
 
K
K
 
G
E
 
E
Y
 
Y
T
 
Q
L
 
K
D
 
V
S
 
S
R
 
Y
S
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
K
L
 
T
E
 
T
S
 
V
D
 
K
N
 
Y
G
 
G
L
 
I
F
 
K
G
 
K
E
 
E
E
 
A
N
 
T
F
 
Y
-
 
L
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
x
E
I
 
S
T
 
T
I
 
V
H
 
-
R
 
-
R
 
K
D
 
S
N
 
S
S
 
G
A
x
G
M
x
P
M
 
F
I
 
V
I
 
V
H
 
D
A
 
V
S
 
V
M
 
I
N
 
N
D
 
D
E
 
I
F
 
H
I
 
F
N
 
E
S
 
R
Y
 
F
W
x
R
A
x
G
D
|
D
G
 
G
L
 
L
I
 
C
I
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
T
T
 
T
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
L
 
K
S
|
S
C
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
I
 
M
Y
 
H
P
 
P
D
 
S
S
 
I
E
 
E
N
 
A
F
 
M
V
 
Q
I
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
A
 
A
P
 
S
H
 
I
N
 
N
L
 
N
N
 
R
V
 
V
-
 
Y
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
G
R
 
S
P
 
P
V
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
D
 
K
D
 
H
N
 
H
K
 
V
L
 
V
S
 
S
F
 
L
E
 
Q
V
 
-
E
 
P
A
 
V
R
 
N
E
 
D
S
 
K
K
 
D
F
 
F
L
 
Q
V
 
I
S
 
S
C
 
V
D
 
D
S
x
H
R
 
L
T
 
S
V
 
I
-
 
L
-
 
H
-
 
R
-
 
D
T
 
V
V
 
Q
E
 
E
R
 
I
S
 
R
V
 
Y
K
 
E
I
 
V
S
 
S
I
 
A
K
 
K
K
 
K
A
 
I
D
 
H
F
 
F
C
 
A

5dhpA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complex with a novel inhibitor (see paper)
29% identity, 68% coverage: 66:265/293 of query aligns to 37:245/263 of 5dhpA

query
sites
5dhpA
D
 
E
V
 
I
L
 
V
L
 
I
S
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
S
T
 
A
L
 
F
S
 
H
L
 
Q
I
 
Y
-
 
E
-
 
E
R
 
R
N
 
L
S
 
D
G
 
E
I
 
I
P
 
A
V
 
F
I
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
H
F
 
T
G
 
G
R
 
H
L
 
L
G
 
G
F
 
F
L
 
Y
A
 
A
S
 
D
I
 
W
N
 
R
K
 
P
N
 
A
E
 
E
I
 
A
A
 
D
S
 
K
A
 
L
L
 
V
K
 
K
A
 
L
L
 
L
I
 
A
N
 
K
K
 
G
E
 
E
Y
 
Y
T
 
Q
L
 
K
D
 
V
S
 
S
R
 
Y
S
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
K
L
 
T
E
 
T
S
 
V
D
 
K
N
 
Y
G
 
G
L
 
I
F
 
K
G
 
K
E
 
E
E
 
A
N
 
T
F
 
Y
-
 
L
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
x
E
I
 
S
T
 
T
I
 
V
H
 
-
R
 
-
R
 
K
D
 
S
N
 
S
S
 
G
A
x
G
M
x
P
M
 
F
I
 
V
I
 
V
H
 
D
A
 
V
S
 
V
M
 
I
N
 
N
D
 
D
E
 
I
F
 
H
I
 
F
N
 
E
S
 
R
Y
 
F
W
 
R
A
 
G
D
|
D
G
 
G
L
 
L
I
 
C
I
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
T
T
 
T
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
L
 
K
S
|
S
C
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
I
 
M
Y
 
H
P
 
P
D
 
S
S
 
I
E
 
E
N
 
A
F
 
M
V
 
Q
I
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
A
 
A
P
 
S
H
 
I
N
 
N
L
 
N
N
 
R
V
 
V
-
 
Y
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
G
R
 
S
P
 
P
V
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
D
 
K
D
 
H
N
 
H
K
 
V
L
 
V
S
 
S
F
 
L
E
 
Q
V
 
-
E
 
P
A
 
V
R
 
N
E
 
D
S
 
K
K
 
D
F
 
F
L
 
Q
V
 
I
S
 
S
C
 
V
D
 
D
S
x
H
R
 
L
T
 
S
V
 
I
-
 
L
-
 
H
-
 
R
-
 
D
T
 
V
V
 
Q
E
 
E
R
 
I
S
 
R
V
 
Y
K
 
E
I
 
V
S
 
S
I
 
A
K
 
K
K
 
K
A
 
I
D
 
H
F
 
F
C
 
A

Query Sequence

>CA265_RS15090 CA265_RS15090 NAD kinase
MRIAIYGRDFNDTVLPYVQEVFNHLAEHHIQPVLYSKFKTSLHGKIKLPANTVIFHNHTE
LKELADVLLSLGGDGTLLDTLSLIRNSGIPVIGINFGRLGFLASINKNEIASALKALINK
EYTLDSRSLLTLESDNGLFGEENFALNDITIHRRDNSAMMIIHASMNDEFINSYWADGLI
IATPTGSTAYSLSCGGPIIYPDSENFVITPIAPHNLNVRPVILPDDNKLSFEVEARESKF
LVSCDSRTVTVERSVKISIKKADFCVNLIRLNNETYLNTLRNKLLWGIDTRNY

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory