SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CA265_RS15640 FitnessBrowser__Pedo557:CA265_RS15640 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5f7qE Rok repressor lmo0178 from listeria monocytogenes bound to operator (see paper)
28% identity, 97% coverage: 12:395/395 of query aligns to 16:391/396 of 5f7qE

query
sites
5f7qE
R
 
R
A
 
Y
D
 
T
I
 
V
I
 
L
K
 
N
L
 
L
L
 
I
Y
 
R
Y
 
E
K
 
K
K
 
G
K
 
E
S
 
I
S
 
T
L
 
R
T
|
T
D
 
E
L
 
I
S
 
A
K
 
K
R
 
K
T
 
C
K
 
D
K
 
F
S
 
G
L
 
M
P
x
S
L
x
T
I
 
L
T
 
T
S
 
Y
T
 
I
V
 
L
N
 
D
A
 
D
L
 
L
I
 
Q
E
 
Q
D
 
E
G
 
G
L
 
I
I
 
I
I
 
L
E
 
E
Q
 
G
G
 
A
L
 
E
A
 
T
P
 
S
S
 
S
T
|
T
G
|
G
G
|
G
R
|
R
R
|
R
P
x
A
L
x
K
N
 
L
F
 
V
L
 
R
L
 
F
N
 
N
P
 
K
D
 
D
Y
 
Y
K
 
G
R
 
-
Y
 
F
I
 
V
I
 
V
A
 
S
V
 
V
A
 
K
M
 
V
D
 
E
Q
 
E
L
 
E
T
 
Q
S
 
L
Q
 
L
L
 
F
T
 
A
I
 
L
Y
 
T
D
 
D
L
 
L
S
 
-
N
 
N
H
 
A
Q
 
E
V
 
I
L
 
I
P
 
E
T
 
N
Q
 
T
V
 
S
I
 
I
D
 
P
L
 
F
D
 
-
M
 
-
T
 
S
Q
 
S
S
 
E
K
 
K
S
 
K
A
 
P
D
 
E
T
 
E
L
 
A
I
 
I
E
 
E
F
 
L
I
 
I
D
 
A
H
 
K
C
 
N
I
 
V
K
 
K
K
 
K
-
 
M
-
 
C
S
 
G
T
 
N
I
 
R
D
 
D
K
 
M
E
 
N
N
 
H
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
A
M
 
I
P
 
S
G
 
G
F
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
R
E
 
K
K
 
K
G
 
G
-
 
T
-
 
V
M
 
I
N
 
R
Y
 
S
S
 
T
F
 
M
M
 
L
Q
 
G
V
 
W
E
 
E
N
 
N
D
 
-
I
 
V
S
 
A
L
 
L
Q
 
E
D
 
A
Y
 
M
L
 
L
A
 
H
K
 
A
K
 
H
L
 
F
-
 
P
R
 
D
L
 
I
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
I
 
V
D
 
D
N
 
K
D
 
N
S
 
I
S
 
N
L
 
C
I
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
N
 
W
F
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
G
R
 
K
N
 
Q
L
 
S
K
 
N
D
 
N
V
 
F
L
 
A
V
 
T
V
 
V
N
 
S
I
 
V
G
 
G
W
 
A
G
 
G
T
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
S
M
 
V
I
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
R
K
 
Q
L
 
I
Y
 
Y
R
 
Y
G
 
G
S
 
A
S
 
Q
G
 
G
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
F
S
 
G
H
|
H
I
 
T
P
 
T
L
 
I
S
 
Q
N
 
P
S
 
G
N
 
G
T
 
Y
L
 
K
C
|
C
S
 
H
C
|
C
G
 
G
K
 
Q
R
 
K
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
V
 
M
E
 
Y
T
 
A
S
 
S
L
 
E
L
 
F
V
 
Y
M
 
F
V
 
R
Q
 
N
K
 
R
A
 
G
E
 
E
E
 
E
A
 
L
V
 
-
K
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
K
E
 
E
T
 
A
S
 
Y
L
 
P
K
 
T
T
 
S
L
 
E
F
 
L
N
 
N
D
 
D
K
 
-
S
 
-
K
 
-
S
 
F
H
 
H
V
 
F
D
 
D
H
 
K
F
 
V
L
 
A
N
 
K
A
 
S
V
 
A
V
 
R
K
 
A
Q
 
G
D
 
D
P
 
E
V
 
M
A
 
A
I
 
T
S
 
E
I
 
L
L
 
M
A
 
G
D
 
K
A
 
M
A
 
G
F
 
E
Q
 
Y
I
 
L
G
 
G
K
 
Y
G
 
G
L
 
I
A
 
R
T
 
N
L
 
I
I
 
I
H
 
N
I
 
T
M
 
F
N
 
N
P
 
P
E
 
E
R
 
K
I
 
V
V
 
I
L
 
I
S
 
V
G
 
G
R
 
E
G
 
G
A
 
L
K
 
H
A
 
H
G
 
R
K
 
D
M
 
L
L
 
F
L
 
L
P
 
T
P
 
K
I
 
I
Q
 
D
Q
 
E
A
 
I
I
 
A
N
 
S
E
 
Q
F
 
N
C
 
F
I
 
F
P
 
S
R
 
G
V
 
A
A
 
G
E
 
F
Q
 
E
T
 
T
E
 
E
I
 
I
K
 
T
C
 
T
S
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
E
D
 
D
E
 
P
A
 
A
E
 
-
L
 
W
L
 
L
A
 
Q
A
 
G
A
 
A
S
 
A
L
 
L
M
 
L
V
 
V
E
 
I
N
 
H
S
 
Q
L
 
L
F
 
F
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

1z05A Crystal structure of the rok family transcriptional regulator, homolog of e.Coli mlc protein.
25% identity, 96% coverage: 15:395/395 of query aligns to 11:386/396 of 1z05A

query
sites
1z05A
I
 
V
I
 
Y
K
 
K
L
 
L
L
 
I
Y
 
D
Y
 
Q
K
 
K
K
 
G
K
 
P
S
 
I
S
 
S
L
 
R
T
 
I
D
 
D
L
 
L
S
 
S
K
 
K
R
 
E
T
 
S
K
 
E
K
 
L
S
 
A
L
 
P
P
 
A
L
 
S
I
 
I
T
 
T
S
 
K
T
 
I
V
 
T
N
 
R
A
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
D
D
 
A
G
 
H
L
 
L
I
 
I
I
 
H
E
 
E
Q
 
T
G
 
T
L
 
V
A
 
Q
P
 
E
S
 
A
T
 
I
G
 
S
G
 
R
R
 
G
R
 
R
P
 
P
L
 
A
N
 
V
F
 
G
L
 
L
L
 
Q
N
 
T
P
 
N
D
 
N
Y
 
L
K
 
G
R
 
W
Y
 
Q
I
 
F
I
 
L
A
 
S
V
 
M
A
 
R
M
 
L
D
 
G
Q
 
R
L
 
G
T
 
Y
S
 
L
Q
 
T
L
 
I
T
 
A
I
 
L
Y
 
H
D
 
E
L
 
L
S
 
G
N
 
G
H
 
E
Q
 
V
V
 
L
L
 
I
P
 
D
T
 
T
Q
 
K
V
 
I
I
 
D
D
 
I
L
 
H
D
 
E
M
 
I
T
 
D
Q
 
Q
S
 
D
K
 
D
S
 
V
A
 
L
D
 
A
T
 
R
L
 
L
I
 
L
E
 
F
F
 
E
I
 
I
D
 
E
H
 
E
C
 
F
I
 
F
K
 
Q
K
 
T
S
 
Y
T
 
A
I
 
A
D
 
Q
K
 
L
E
 
D
N
 
R
L
 
V
L
 
T
G
 
S
I
 
I
G
 
A
I
 
I
G
 
T
M
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
S
E
 
E
K
 
Q
G
 
G
-
 
I
-
 
V
M
 
L
N
 
Q
Y
 
M
S
 
P
F
 
H
M
 
Y
Q
 
N
V
 
V
E
 
K
N
 
N
D
 
-
I
 
L
S
 
A
L
 
L
Q
 
G
D
 
P
Y
 
E
L
 
I
A
 
Y
K
 
K
K
 
A
L
 
T
R
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
F
I
 
V
D
 
A
N
 
N
D
 
D
S
 
T
S
 
R
L
 
A
I
 
W
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
K
N
 
L
F
 
F
G
 
G
E
 
H
A
 
S
R
 
Q
N
 
D
L
 
V
K
 
D
D
 
N
V
 
S
L
 
V
V
 
L
V
 
I
N
 
S
I
 
I
G
 
H
W
 
H
G
 
G
T
 
L
G
 
G
L
 
A
G
 
G
M
 
I
I
 
V
I
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
R
L
 
V
Y
 
L
R
 
Q
G
 
G
S
 
R
S
 
H
G
 
G
Y
 
N
A
 
I
G
 
G
E
 
E
F
 
L
S
 
G
H
|
H
I
 
I
P
 
Q
L
 
I
S
 
D
N
 
P
S
 
Q
N
 
G
T
 
K
L
 
R
C
|
C
S
 
H
C
|
C
G
 
G
K
 
N
R
 
Y
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
V
 
T
E
 
V
T
 
A
S
 
S
L
 
S
L
 
Q
V
 
A
M
 
I
V
 
R
Q
 
D
K
 
Q
A
 
V
E
 
T
E
 
A
A
 
R
V
 
I
K
 
Q
N
 
A
G
 
G
E
 
E
E
 
P
T
 
S
S
 
C
L
 
L
K
 
A
T
 
T
L
 
V
F
 
-
N
 
-
D
 
-
K
 
-
S
 
E
K
 
E
S
 
I
H
 
S
V
 
I
D
 
E
H
 
D
F
 
I
L
 
C
N
 
A
A
 
A
V
 
A
V
 
A
K
 
D
Q
 
G
D
 
D
P
 
P
V
 
L
A
 
A
I
 
V
S
 
D
I
 
V
L
 
I
A
 
Q
D
 
Q
A
 
L
A
 
G
F
 
R
Q
 
Y
I
 
L
G
 
G
K
 
A
G
 
A
L
 
I
A
 
A
T
 
I
L
 
V
I
 
I
H
 
N
I
 
L
M
 
F
N
 
N
P
 
P
E
 
E
R
 
K
I
 
I
V
 
L
L
 
I
S
 
G
G
 
G
R
 
V
G
 
I
A
 
N
K
 
Q
A
 
A
G
 
K
K
 
S
M
 
I
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
P
 
S
I
 
I
Q
 
E
Q
 
Q
A
 
C
I
 
I
N
 
R
E
 
E
F
 
Q
C
 
S
I
 
L
P
 
P
R
 
V
V
 
Y
A
 
H
E
 
Q
Q
 
D
T
 
L
E
 
K
I
 
L
K
 
V
C
 
E
S
 
S
S
 
R
L
 
F
S
 
Y
D
 
K
E
 
Q
A
 
A
E
 
T
L
 
M
L
 
P
A
 
G
A
 
A
A
 
A
S
 
-
L
 
-
M
 
L
V
 
I
E
 
K
N
 
Q
S
 
A
L
 
L
F
 
Y
E
 
D

2qm1B Crystal structure of glucokinase from enterococcus faecalis
31% identity, 69% coverage: 121:392/395 of query aligns to 49:323/325 of 2qm1B

query
sites
2qm1B
T
 
S
L
 
I
I
 
I
E
 
E
F
 
S
I
 
I
D
 
R
H
 
H
C
 
R
I
 
I
K
 
D
K
 
L
S
 
Y
T
 
N
I
 
M
D
 
K
K
 
K
E
 
E
N
 
D
L
 
F
L
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
I
 
M
G
 
G
M
 
T
P
 
P
G
 
G
F
 
S
V
 
V
N
 
D
A
 
I
E
 
E
K
 
K
G
 
G
-
 
T
-
 
V
-
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
N
M
 
L
N
 
N
Y
 
W
S
 
T
F
 
T
M
 
V
Q
 
Q
V
 
-
E
 
-
N
 
-
D
 
-
I
 
-
S
 
P
L
 
V
Q
 
K
D
 
E
Y
 
Q
L
 
I
A
 
E
K
 
S
K
 
A
L
 
L
R
 
G
L
 
I
P
 
P
V
 
F
Y
 
A
I
 
L
D
 
D
N
|
N
D
 
D
S
 
A
S
x
N
L
 
V
I
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
G
E
 
E
L
 
R
N
 
W
F
 
K
G
 
G
E
 
A
A
 
G
R
 
E
N
 
N
L
 
N
K
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
I
V
 
F
V
 
I
N
 
T
I
 
L
G
 
G
W
 
T
G
 
G
T
 
V
G
 
G
L
x
G
G
 
G
M
 
I
I
 
V
I
 
A
N
 
A
G
 
G
K
 
K
L
 
L
Y
 
L
R
 
H
G
 
G
S
 
V
S
 
A
G
 
G
Y
 
C
A
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
V
S
 
G
H
|
H
I
 
V
P
 
T
L
 
V
S
 
D
N
 
P
S
 
N
N
 
G
T
 
F
L
 
D
C
|
C
S
 
T
C
|
C
G
 
G
K
 
K
R
 
R
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
V
 
T
E
 
V
T
 
S
S
 
S
L
 
A
L
 
T
V
 
G
M
 
V
V
 
V
Q
 
R
K
 
V
A
 
A
-
 
R
-
 
H
-
 
L
-
 
S
-
 
E
-
 
E
-
 
F
-
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
S
-
 
E
-
 
L
E
 
K
E
 
Q
A
 
A
V
 
I
K
 
D
N
 
D
G
 
G
E
 
Q
E
 
D
T
 
V
S
 
S
L
 
S
K
 
K
T
 
D
L
 
V
F
 
F
N
 
E
D
 
F
K
 
A
S
 
E
K
 
K
S
 
G
H
 
-
V
 
-
D
 
D
H
 
H
F
 
F
L
 
-
N
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
-
K
 
-
Q
 
-
D
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
A
I
 
L
S
 
M
I
 
V
L
 
V
A
 
D
D
 
R
A
 
V
A
 
C
F
 
F
Q
 
Y
I
 
L
G
 
G
K
 
L
G
 
A
L
 
T
A
 
G
T
 
N
L
 
L
I
 
G
H
 
N
I
 
T
M
 
L
N
 
N
P
 
P
E
 
D
R
 
S
I
 
V
V
 
V
L
 
I
S
 
G
G
 
G
R
 
G
G
 
V
A
 
S
K
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
E
M
 
F
L
 
L
L
 
R
P
 
S
P
 
R
I
 
V
Q
 
E
Q
 
K
A
 
Y
I
 
F
N
 
Q
E
 
E
F
 
F
C
 
T
I
 
F
P
 
P
R
 
Q
V
 
V
A
 
R
E
 
N
Q
 
S
T
 
T
E
 
K
I
 
I
K
 
K
C
 
L
S
 
A
S
 
E
L
 
L
S
 
G
D
 
N
E
 
E
A
 
A
E
 
G
L
 
V
L
 
I
A
 
G
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
M
 
A
V
 
L
E
 
Q
N
 
F
S
 
S

5f7rA Rok repressor lmo0178 from listeria monocytogenes bound to inducer (see paper)
28% identity, 80% coverage: 80:394/395 of query aligns to 2:306/306 of 5f7rA

query
sites
5f7rA
Y
 
F
I
 
V
I
 
V
A
 
S
V
 
V
A
x
K
M
 
V
D
 
E
Q
x
E
L
 
E
T
 
Q
S
 
L
Q
 
L
L
 
F
T
 
A
I
 
L
Y
 
T
D
 
D
L
 
L
S
 
-
N
 
N
H
 
A
Q
 
E
V
 
I
L
 
I
P
 
E
T
 
N
Q
 
T
V
 
S
I
 
I
D
 
P
L
 
F
D
 
-
M
 
-
T
 
S
Q
 
S
S
 
E
K
 
K
S
 
K
A
 
P
D
 
E
T
 
E
L
 
A
I
 
I
E
 
E
F
 
L
I
 
I
D
 
A
H
 
K
C
 
N
I
 
V
K
 
K
K
 
K
-
 
M
-
 
C
S
 
G
T
 
N
I
 
R
D
 
D
K
 
M
E
 
N
N
 
H
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
A
M
 
I
P
 
S
G
|
G
F
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
R
E
 
K
K
 
K
G
 
G
-
 
T
-
 
V
M
 
I
N
 
R
Y
 
S
S
 
T
F
 
M
M
 
L
Q
 
G
V
 
W
E
 
E
N
 
N
D
 
-
I
 
V
S
 
A
L
 
L
Q
 
E
D
 
A
Y
 
M
L
 
L
A
 
H
K
 
A
K
 
H
L
 
F
-
 
P
R
 
D
L
 
I
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
I
 
V
D
 
D
N
 
K
D
x
N
S
 
I
S
 
N
L
 
C
I
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
N
 
W
F
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
G
R
 
K
N
 
Q
L
 
S
K
 
N
D
 
N
V
 
F
L
 
A
V
 
T
V
 
V
N
x
S
I
x
V
G
 
G
W
 
A
G
|
G
T
x
L
G
|
G
L
 
L
G
 
S
M
 
V
I
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
R
K
 
Q
L
 
I
Y
 
Y
R
 
Y
G
 
G
S
 
A
S
 
Q
G
 
G
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
E
|
E
F
 
F
S
 
G
H
|
H
I
 
T
P
 
T
L
 
I
S
 
Q
N
 
P
S
 
G
N
 
G
T
 
Y
L
 
K
C
|
C
S
 
H
C
|
C
G
 
G
K
 
Q
R
 
K
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
|
E
V
 
M
E
 
Y
T
 
A
S
 
S
L
 
E
L
 
F
V
 
Y
M
 
F
V
 
R
Q
 
N
K
 
R
A
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
K
 
-
N
 
-
G
 
G
E
 
E
E
 
E
T
 
L
S
 
K
L
 
E
K
 
A
T
 
Y
L
 
P
F
 
L
N
 
N
D
 
D
K
 
-
S
 
-
K
 
-
S
 
F
H
 
H
V
 
F
D
 
D
H
 
K
F
 
V
L
 
A
N
 
K
A
 
S
V
 
A
V
 
R
K
 
A
Q
 
G
D
 
D
P
 
E
V
 
M
A
 
A
I
 
T
S
 
E
I
 
L
L
 
M
A
 
G
D
 
K
A
 
M
A
 
G
F
 
E
Q
 
Y
I
 
L
G
 
G
K
 
Y
G
 
G
L
 
I
A
 
R
T
 
N
L
 
I
I
 
I
H
 
N
I
 
T
M
 
F
N
 
N
P
 
P
E
 
E
R
 
K
I
 
V
V
 
I
L
 
I
S
 
V
G
 
G
R
x
E
G
 
G
A
 
L
K
 
H
A
 
H
G
 
R
K
 
D
M
 
L
L
 
F
L
 
L
P
 
T
P
 
K
I
 
I
Q
 
D
Q
 
E
A
 
I
I
 
A
N
 
S
E
 
Q
F
 
N
C
 
F
I
 
F
P
 
S
R
 
G
V
 
A
A
 
G
E
 
F
Q
 
E
T
 
T
E
 
E
I
 
I
K
 
T
C
 
T
S
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
E
D
 
D
E
 
P
A
 
A
E
 
-
L
x
W
L
 
L
A
 
Q
A
 
G
A
 
A
S
 
A
L
 
L
M
 
L
V
 
V
E
 
I
N
 
H
S
 
Q
L
 
L
F
 
F

1z6rA Crystal structure of mlc from escherichia coli (see paper)
26% identity, 93% coverage: 26:394/395 of query aligns to 21:371/382 of 1z6rA

query
sites
1z6rA
S
 
S
L
 
R
T
 
I
D
 
D
L
 
L
S
 
S
K
 
R
R
 
L
T
 
A
K
 
Q
K
 
L
S
 
A
L
 
P
P
 
A
L
 
S
I
 
I
T
 
T
S
 
K
T
 
I
V
 
V
N
 
H
A
 
E
L
 
M
I
 
L
E
 
E
D
 
A
G
 
H
L
 
L
I
 
V
I
 
Q
E
 
E
Q
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
V
P
 
V
S
 
E
T
 
T
G
 
E
G
 
A
R
 
W
R
 
H
P
 
Y
L
 
L
N
 
S
F
 
L
L
 
R
L
 
I
N
 
S
P
 
-
D
 
-
Y
 
-
K
 
-
R
 
R
Y
 
G
I
 
E
I
 
I
A
 
F
V
 
L
A
 
A
M
 
L
D
 
R
Q
 
D
L
 
L
T
 
S
S
 
S
Q
 
K
L
 
L
T
 
V
I
 
V
Y
 
E
D
 
E
L
 
-
S
 
S
N
 
Q
H
 
E
Q
 
L
V
 
A
L
 
L
P
 
K
T
 
D
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
D
L
 
L
D
 
P
M
 
L
T
 
L
Q
 
-
S
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
-
D
 
D
T
 
R
L
 
I
I
 
I
E
 
S
F
 
H
I
 
I
D
 
D
H
 
Q
C
 
F
I
 
F
K
 
I
K
 
R
S
 
H
T
 
Q
I
 
K
D
 
K
K
 
L
E
 
E
N
 
R
L
 
L
L
 
T
G
 
S
I
 
I
G
 
A
I
 
I
G
 
T
M
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
I
V
 
I
N
 
D
A
 
T
E
 
E
K
 
N
G
 
G
M
 
I
N
 
V
Y
 
H
S
 
R
-
 
M
-
 
P
F
 
F
M
 
Y
Q
 
E
V
 
D
E
 
V
N
 
K
D
 
E
I
 
M
S
 
P
L
 
L
Q
 
G
D
 
E
Y
 
A
L
 
L
A
 
E
K
 
Q
K
 
H
L
 
T
R
 
G
L
 
V
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
I
 
I
D
 
Q
N
 
H
D
 
D
S
 
I
S
 
S
L
 
A
I
 
W
A
 
T
L
 
M
A
 
A
E
 
E
L
 
A
N
 
L
F
 
F
G
 
G
E
 
A
A
 
S
R
 
R
N
 
G
L
 
A
K
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
I
V
 
Q
V
 
V
N
 
V
I
 
I
G
 
D
W
 
H
G
 
N
T
 
V
G
 
G
L
 
A
G
 
G
M
 
V
I
 
I
I
 
T
N
 
D
G
 
G
K
 
H
L
 
L
Y
 
L
R
 
H
G
 
A
S
 
G
S
 
S
G
 
S
Y
 
S
A
 
L
G
 
V
E
 
E
F
 
I
S
 
G
H
|
H
I
 
T
P
 
Q
L
 
V
S
 
D
N
 
P
S
 
Y
N
 
G
T
 
K
L
 
R
C
|
C
S
 
Y
C
|
C
G
 
G
K
 
N
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
V
 
T
E
 
I
T
 
A
S
 
S
L
 
V
L
 
D
V
 
S
M
 
I
V
 
L
Q
 
E
K
 
L
A
 
A
E
 
Q
E
 
L
A
 
R
V
 
L
K
 
N
N
 
Q
G
 
-
E
 
-
E
 
-
T
 
-
S
 
S
L
 
M
K
 
S
T
 
S
L
 
M
F
 
L
N
 
H
D
 
G
K
 
Q
S
 
P
K
 
L
S
 
T
H
 
-
V
 
V
D
 
D
H
 
S
F
 
L
L
 
C
N
 
Q
A
 
A
V
 
A
V
 
L
K
 
R
Q
 
G
D
 
D
P
 
L
V
 
L
A
 
A
I
 
K
S
 
D
I
 
I
L
 
I
A
 
T
D
 
G
A
 
V
A
 
G
F
 
A
Q
 
H
I
 
V
G
 
G
K
 
R
G
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
I
L
 
M
I
 
V
H
 
N
I
 
L
M
 
F
N
 
N
P
 
P
E
 
Q
R
 
K
I
 
I
V
 
L
L
 
I
S
 
G
G
 
S
R
 
P
G
 
L
A
 
S
K
 
K
A
 
A
G
 
A
K
 
D
M
 
I
L
 
L
L
 
F
P
 
P
P
 
V
I
 
I
Q
 
S
Q
 
D
A
 
S
I
 
I
N
 
R
E
 
Q
F
 
Q
C
 
A
I
 
L
P
 
P
R
 
A
V
 
Y
A
 
S
E
 
Q
Q
 
H
T
 
I
E
 
S
I
 
V
K
 
E
C
 
S
S
 
T
S
 
Q
L
 
F
S
 
S
D
 
N
E
 
Q
A
 
G
E
 
T
L
 
M
L
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
S
 
-
L
 
-
M
 
L
V
 
V
E
 
K
N
 
D
S
 
A
L
 
M
F
 
Y

P50456 DNA-binding transcriptional repressor Mlc; Making large colonies protein; Membrane linked control from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
24% identity, 93% coverage: 26:394/395 of query aligns to 32:395/406 of P50456

query
sites
P50456
S
 
S
L
 
R
T
 
I
D
 
D
L
 
L
S
 
S
K
 
R
R
 
L
T
 
A
K
 
Q
K
 
L
S
 
A
L
 
P
P
 
A
L
 
S
I
 
I
T
 
T
S
 
K
T
 
I
V
 
V
N
x
R
A
 
E
L
 
M
I
 
L
E
 
E
D
 
A
G
 
H
L
 
L
I
 
V
I
 
Q
E
 
E
Q
 
L
G
 
E
L
 
I
A
 
K
P
 
E
S
 
A
T
 
G
G
 
N
G
 
R
R
 
G
R
 
R
P
 
P
-
 
A
L
 
V
N
 
G
F
 
L
L
 
V
L
 
V
N
 
E
P
 
T
D
 
E
Y
 
A
K
 
W
R
x
H
Y
 
Y
I
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
R
-
 
I
-
 
S
-
 
R
-
 
G
-
 
E
I
 
I
A
 
F
V
 
L
A
 
A
M
 
L
D
 
R
Q
 
D
L
 
L
T
 
S
S
 
S
Q
 
K
L
 
L
T
 
V
I
 
V
Y
 
E
D
 
E
L
 
-
S
 
S
N
 
Q
H
 
E
Q
 
L
V
 
A
L
 
L
P
 
K
T
 
D
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
D
L
 
L
D
 
P
M
 
L
T
 
L
Q
 
-
S
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
-
D
 
D
T
 
R
L
 
I
I
 
I
E
 
S
F
 
H
I
 
I
D
 
D
H
 
Q
C
 
F
I
x
F
K
 
I
K
 
R
S
 
H
T
 
Q
I
 
K
D
 
K
K
 
L
E
 
E
N
 
R
L
 
L
L
 
T
G
 
S
I
 
I
G
 
A
I
 
I
G
 
T
M
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
I
V
 
I
N
 
D
A
 
T
E
 
E
K
 
N
G
 
G
M
 
I
N
 
V
Y
 
H
S
 
R
-
 
M
-
 
P
F
 
F
M
 
Y
Q
 
E
V
 
D
E
 
V
N
 
K
D
 
E
I
 
M
S
 
P
L
 
L
Q
 
G
D
 
E
Y
 
A
L
 
L
A
 
E
K
 
Q
K
 
H
L
 
T
R
 
G
L
 
V
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
I
 
I
D
 
Q
N
 
H
D
 
D
S
 
I
S
 
S
L
 
A
I
 
W
A
 
T
L
 
M
A
 
A
E
 
E
L
 
A
N
 
L
F
 
F
G
 
G
E
 
A
A
 
S
R
 
R
N
 
G
L
 
A
K
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
I
V
 
Q
V
 
V
N
 
V
I
 
I
G
 
D
W
 
H
G
 
N
T
 
V
G
 
G
L
 
A
G
 
G
M
 
V
I
 
I
I
 
T
N
 
D
G
 
G
K
 
H
L
 
L
Y
 
L
R
 
H
G
 
A
S
 
G
S
 
S
G
 
S
Y
 
S
A
 
L
G
 
V
E
 
E
F
 
I
S
 
G
H
|
H
I
 
T
P
 
Q
L
 
V
S
 
D
N
 
P
S
 
Y
N
 
G
T
 
K
L
 
R
C
|
C
S
 
Y
C
|
C
G
 
G
K
 
N
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
V
 
T
E
 
I
T
 
A
S
 
S
L
 
V
L
 
D
V
 
S
M
 
I
V
 
L
Q
 
E
K
 
L
A
 
A
E
 
Q
E
 
L
A
 
R
V
 
L
K
 
N
N
 
Q
G
 
-
E
 
-
E
 
-
T
 
-
S
 
S
L
 
M
K
 
S
T
 
S
L
 
M
F
 
L
N
 
H
D
 
G
K
 
Q
S
 
P
K
 
L
S
 
T
H
 
-
V
 
V
D
 
D
H
 
S
F
 
L
L
 
C
N
 
Q
A
 
A
V
 
A
V
 
L
K
x
R
Q
 
G
D
 
D
P
 
L
V
x
L
A
 
A
I
 
K
S
 
D
I
 
I
L
 
I
A
 
T
D
 
G
A
 
V
A
 
G
F
 
A
Q
 
H
I
 
V
G
 
G
K
 
R
G
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
I
L
 
M
I
 
V
H
 
N
I
 
L
M
 
F
N
 
N
P
 
P
E
 
Q
R
 
K
I
 
I
V
 
L
L
 
I
S
 
G
G
 
S
R
 
P
G
 
L
A
 
S
K
 
K
A
 
A
G
 
A
K
 
D
M
 
I
L
 
L
L
 
F
P
 
P
P
 
V
I
 
I
Q
 
S
Q
 
D
A
 
S
I
 
I
N
 
R
E
 
Q
F
 
Q
C
 
A
I
 
L
P
 
P
R
 
A
V
 
Y
A
 
S
E
 
Q
Q
 
H
T
 
I
E
 
S
I
 
V
K
 
E
C
 
S
S
 
T
S
 
Q
L
 
F
S
 
S
D
 
N
E
 
Q
A
 
G
E
 
T
L
 
M
L
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
S
 
-
L
 
-
M
 
L
V
 
V
E
 
K
N
 
D
S
 
A
L
 
M
F
 
Y

3vglA Crystal structure of a rok family glucokinase from streptomyces griseus in complex with glucose and amppnp (see paper)
27% identity, 68% coverage: 118:387/395 of query aligns to 35:308/312 of 3vglA

query
sites
3vglA
S
 
T
A
 
A
D
 
E
T
 
G
L
 
I
I
 
V
E
 
D
F
 
A
I
 
I
D
 
C
H
 
A
C
 
A
I
 
V
K
 
A
K
 
G
S
 
A
T
 
S
I
 
-
D
 
E
K
 
G
E
 
H
N
 
D
L
 
V
L
 
E
G
 
A
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
M
 
A
P
 
A
G
|
G
F
 
Y
V
 
V
N
 
D
A
 
D
E
 
K
K
 
R
G
 
A
M
 
T
N
 
V
Y
 
L
S
 
F
F
 
A
M
x
P
Q
 
N
V
 
I
E
 
D
-
 
W
N
 
R
D
 
H
I
 
E
S
 
P
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
Y
 
K
L
 
V
A
 
E
K
 
Q
K
 
R
L
 
V
R
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
V
I
 
V
D
 
E
N
|
N
D
|
D
S
 
A
S
 
N
L
 
A
I
 
A
A
 
A
L
 
W
A
 
G
E
 
E
L
 
Y
N
 
R
F
 
F
G
 
G
E
 
A
A
 
G
R
 
Q
N
 
G
L
 
H
K
 
D
D
 
D
V
 
V
L
 
I
V
 
C
V
 
I
N
 
T
I
 
L
G
|
G
W
x
T
G
 
G
T
x
L
G
|
G
L
 
G
G
 
G
M
 
I
I
 
I
I
 
I
N
 
G
G
 
N
K
 
K
L
 
L
Y
 
R
R
 
R
G
 
G
S
 
R
S
 
F
G
 
G
Y
 
V
A
 
A
G
 
A
E
|
E
F
 
F
S
 
G
H
|
H
I
 
I
P
 
R
L
 
V
S
 
V
N
 
P
S
 
D
N
 
G
T
 
L
L
 
L
C
|
C
S
 
G
C
|
C
G
 
G
K
 
S
R
 
Q
G
 
G
C
|
C
L
 
W
E
|
E
V
 
Q
E
 
Y
T
 
A
S
 
S
L
x
G
L
 
R
V
 
A
M
 
L
V
 
V
Q
 
R
K
 
Y
A
 
A
E
 
K
E
 
Q
A
 
R
V
 
A
K
 
N
N
 
A
G
 
T
E
 
P
E
 
E
T
 
N
S
 
A
L
 
A
K
 
V
T
 
L
L
 
L
-
 
G
F
 
L
N
 
G
D
 
D
K
 
G
S
 
S
K
 
V
S
 
D
H
 
G
V
 
I
D
 
E
-
x
G
-
 
K
H
 
H
F
 
I
L
x
S
N
 
E
A
 
A
V
 
A
V
 
R
K
 
Q
Q
 
G
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
A
I
 
V
S
 
D
I
 
S
L
 
F
A
 
R
D
 
E
A
 
L
A
 
A
F
 
R
Q
 
W
I
 
A
G
 
G
K
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
D
L
 
L
I
 
A
H
 
S
I
 
L
M
 
F
N
 
D
P
 
P
E
 
S
R
 
A
I
 
F
V
 
I
L
 
V
S
 
G
G
 
G
R
x
G
G
x
V
A
 
S
K
 
D
A
x
E
G
 
G
K
 
E
M
 
L
L
 
V
L
 
L
P
 
D
P
 
P
I
 
I
Q
 
R
Q
 
K
A
 
S
I
 
F
N
 
R
E
 
R
F
 
W
C
 
L
I
 
I
-
 
G
P
 
G
R
 
E
V
 
W
A
 
R
E
 
P
Q
 
H
T
 
A
E
 
Q
I
 
V
K
 
L
C
 
A
S
 
A
S
 
Q
L
 
L
S
 
G
D
 
G
E
 
K
A
 
A
E
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
G
A
 
A
A
 
A
S
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3vgkB Crystal structure of a rok family glucokinase from streptomyces griseus (see paper)
27% identity, 68% coverage: 118:387/395 of query aligns to 35:308/312 of 3vgkB

query
sites
3vgkB
S
 
T
A
 
A
D
 
E
T
 
G
L
 
I
I
 
V
E
 
D
F
 
A
I
 
I
D
 
C
H
 
A
C
 
A
I
 
V
K
 
A
K
 
G
S
 
A
T
 
S
I
 
-
D
 
E
K
 
G
E
 
H
N
 
D
L
 
V
L
 
E
G
 
A
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
M
 
A
P
 
A
G
 
G
F
 
Y
V
 
V
N
 
D
A
 
D
E
 
K
K
 
R
G
 
A
M
 
T
N
 
V
Y
 
L
S
 
F
F
 
A
M
 
P
Q
 
N
V
 
I
E
 
D
-
 
W
N
 
R
D
 
H
I
 
E
S
 
P
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
Y
 
K
L
 
V
A
 
E
K
 
Q
K
 
R
L
 
V
R
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
V
I
 
V
D
 
E
N
 
N
D
 
D
S
 
A
S
 
N
L
 
A
I
 
A
A
 
A
L
 
W
A
 
G
E
 
E
L
 
Y
N
 
R
F
 
F
G
 
G
E
 
A
A
 
G
R
 
Q
N
 
G
L
 
H
K
 
D
D
 
D
V
 
V
L
 
I
V
 
C
V
 
I
N
 
T
I
 
L
G
 
G
W
 
T
G
 
G
T
 
L
G
 
G
L
 
G
G
 
G
M
 
I
I
 
I
I
 
I
N
 
G
G
 
N
K
 
K
L
 
L
Y
 
R
R
 
R
G
 
G
S
 
R
S
 
F
G
 
G
Y
 
V
A
 
A
G
 
A
E
 
E
F
 
F
S
 
G
H
|
H
I
 
I
P
 
R
L
 
V
S
 
V
N
 
P
S
 
D
N
 
G
T
 
L
L
 
L
C
|
C
S
 
G
C
|
C
G
 
G
K
 
S
R
 
Q
G
 
G
C
|
C
L
 
W
E
 
E
V
 
Q
E
 
Y
T
 
A
S
 
S
L
 
G
L
 
R
V
 
A
M
 
L
V
 
V
Q
 
R
K
 
Y
A
 
A
E
 
K
E
 
Q
A
 
R
V
 
A
K
 
N
N
 
A
G
 
T
E
 
P
E
 
E
T
 
N
S
 
A
L
 
A
K
 
V
T
 
L
L
 
L
-
 
G
F
 
L
N
 
G
D
 
D
K
 
G
S
 
S
K
 
V
S
 
D
H
 
G
V
 
I
D
 
E
-
 
G
-
 
K
H
 
H
F
 
I
L
 
S
N
 
E
A
 
A
V
 
A
V
 
R
K
 
Q
Q
 
G
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
A
I
 
V
S
 
D
I
 
S
L
 
F
A
 
R
D
 
E
A
 
L
A
 
A
F
 
R
Q
 
W
I
 
A
G
 
G
K
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
D
L
 
L
I
 
A
H
 
S
I
 
L
M
 
F
N
 
D
P
 
P
E
 
S
R
 
A
I
 
F
V
 
I
L
 
V
S
 
G
G
 
G
R
 
G
G
 
V
A
 
S
K
 
D
A
 
E
G
 
G
K
 
E
M
 
L
L
 
V
L
 
L
P
 
D
P
 
P
I
 
I
Q
 
R
Q
 
K
A
 
S
I
 
F
N
 
R
E
 
R
F
 
W
C
 
L
I
 
I
-
 
G
P
 
G
R
 
E
V
 
W
A
 
R
E
 
P
Q
 
H
T
 
A
E
 
Q
I
 
V
K
 
L
C
 
A
S
 
A
S
 
Q
L
 
L
S
 
G
D
 
G
E
 
K
A
 
A
E
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
G
A
 
A
A
 
A
S
 
D
L
 
L

2yi1A Crystal structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetyl mannosamine 6-phosphate and adp. (see paper)
34% identity, 51% coverage: 140:339/395 of query aligns to 63:260/308 of 2yi1A

query
sites
2yi1A
L
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
S
M
 
T
P
x
G
G
|
G
F
x
R
V
 
V
N
 
N
A
 
P
E
 
R
K
 
E
G
 
G
M
 
I
-
 
V
-
 
L
-
 
H
N
x
S
Y
x
T
S
 
K
F
x
L
M
 
I
Q
 
Q
V
 
E
E
 
W
N
 
N
D
 
S
I
 
V
S
 
D
L
 
L
Q
 
R
D
 
T
Y
 
P
L
 
L
A
 
S
K
 
D
K
 
T
L
 
L
R
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
W
I
 
V
D
 
D
N
|
N
D
|
D
S
 
G
S
x
N
L
 
C
I
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
R
N
 
K
F
 
F
G
 
G
E
 
Q
A
 
G
R
 
K
N
 
G
L
 
L
K
 
E
D
 
N
V
 
F
L
 
V
V
 
T
V
 
L
N
 
I
I
 
T
G
|
G
W
x
T
G
|
G
T
x
I
G
 
G
L
x
G
G
 
G
M
 
I
I
 
I
I
 
H
N
 
Q
G
 
H
K
 
E
L
 
L
Y
 
I
R
 
H
G
 
G
S
 
S
S
 
S
G
 
F
Y
 
C
A
 
A
G
x
A
E
|
E
F
 
L
S
 
G
H
|
H
I
 
L
P
 
V
L
 
V
S
 
S
N
 
L
S
 
D
N
 
G
T
 
P
L
 
D
C
|
C
S
 
S
C
|
C
G
 
G
K
 
S
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
|
E
V
 
A
E
 
Y
T
 
A
S
 
S
L
x
G
L
 
M
V
 
A
M
 
L
V
 
-
Q
 
-
K
 
-
A
 
Q
E
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
K
K
 
K
N
 
L
G
 
H
E
 
D
E
 
E
T
 
D
S
 
L
L
 
L
K
 
-
T
 
-
L
 
L
F
 
V
N
 
E
D
 
G
K
 
M
S
 
S
K
 
A
S
 
V
H
 
G
V
 
A
D
x
L
H
 
H
F
 
L
L
 
I
N
 
Q
A
 
A
V
 
A
V
 
K
K
 
L
Q
 
G
D
 
N
P
 
A
V
 
K
A
 
A
I
 
Q
S
 
S
I
 
I
L
 
L
A
 
R
D
 
T
A
 
A
A
 
G
F
 
T
Q
 
A
I
 
L
G
 
G
K
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
V
T
 
N
L
 
I
I
 
L
H
 
H
I
 
T
M
 
M
N
 
N
P
 
P
E
 
S
R
 
L
I
 
V
V
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2yhyA Structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetylmannosamine and adp (see paper)
34% identity, 51% coverage: 140:339/395 of query aligns to 63:260/308 of 2yhyA

query
sites
2yhyA
L
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
S
M
 
T
P
 
G
G
 
G
F
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
P
E
 
R
K
 
E
G
 
G
M
 
I
-
 
V
-
 
L
-
 
H
N
 
S
Y
 
T
S
 
K
F
 
L
M
 
I
Q
 
Q
V
 
E
E
 
W
N
 
N
D
 
S
I
 
V
S
 
D
L
 
L
Q
 
R
D
 
T
Y
 
P
L
 
L
A
 
S
K
 
D
K
 
T
L
 
L
R
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
W
I
 
V
D
 
D
N
|
N
D
 
D
S
 
G
S
x
N
L
 
C
I
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
R
N
 
K
F
 
F
G
 
G
E
 
Q
A
 
G
R
 
K
N
 
G
L
 
L
K
 
E
D
 
N
V
 
F
L
 
V
V
 
T
V
 
L
N
 
I
I
 
T
G
 
G
W
x
T
G
 
G
T
 
I
G
 
G
L
x
G
G
 
G
M
 
I
I
 
I
I
 
H
N
 
Q
G
 
H
K
 
E
L
 
L
Y
 
I
R
 
H
G
 
G
S
 
S
S
 
S
G
 
F
Y
 
C
A
 
A
G
x
A
E
 
E
F
 
L
S
 
G
H
|
H
I
 
L
P
 
V
L
 
V
S
 
S
N
 
L
S
 
D
N
 
G
T
 
P
L
 
D
C
|
C
S
 
S
C
|
C
G
 
G
K
 
S
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
E
V
 
A
E
 
Y
T
 
A
S
 
S
L
x
G
L
 
M
V
 
A
M
 
L
V
 
-
Q
 
-
K
 
-
A
 
Q
E
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
K
K
 
K
N
 
L
G
 
H
E
 
D
E
 
E
T
 
D
S
 
L
L
 
L
K
 
-
T
 
-
L
 
L
F
 
V
N
 
E
D
 
G
K
 
M
S
 
S
K
 
A
S
 
V
H
 
G
V
 
A
D
x
L
H
 
H
F
 
L
L
 
I
N
 
Q
A
 
A
V
 
A
V
 
K
K
 
L
Q
 
G
D
 
N
P
 
A
V
 
K
A
 
A
I
 
Q
S
 
S
I
 
I
L
 
L
A
 
R
D
 
T
A
 
A
A
 
G
F
 
T
Q
 
A
I
 
L
G
 
G
K
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
V
T
 
N
L
 
I
I
 
L
H
 
H
I
 
T
M
 
M
N
 
N
P
 
P
E
 
S
R
 
L
I
 
V
V
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q9Y223 Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase; UDP-GlcNAc-2-epimerase/ManAc kinase; EC 3.2.1.183; EC 2.7.1.60 from Homo sapiens (Human) (see 18 papers)
33% identity, 51% coverage: 140:339/395 of query aligns to 467:669/722 of Q9Y223

query
sites
Q9Y223
L
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
G
I
|
I
G
 
S
M
 
T
P
 
G
G
|
G
F
x
R
V
 
V
N
 
N
A
 
P
E
 
R
K
 
E
G
 
G
M
 
I
-
 
V
-
 
L
-
 
H
N
 
S
Y
x
T
S
 
K
F
 
L
M
 
I
Q
 
Q
V
 
E
E
 
W
N
 
N
D
 
S
I
 
V
S
 
D
L
 
L
Q
 
R
D
 
T
Y
 
P
L
 
L
A
 
S
K
 
D
K
 
T
L
 
L
R
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
W
I
 
V
D
 
D
N
|
N
D
|
D
S
 
G
S
x
N
L
 
C
I
 
A
A
 
A
L
 
L
A
|
A
E
 
E
L
 
R
N
 
K
F
|
F
G
 
G
E
 
Q
A
 
G
R
 
K
N
 
G
L
 
L
K
 
E
D
 
N
V
 
F
L
 
V
V
 
T
V
 
L
N
 
I
I
 
T
G
 
G
W
 
T
G
|
G
T
 
I
G
 
G
L
 
G
G
 
G
M
 
I
I
 
I
I
 
H
N
 
Q
G
 
H
K
 
E
L
 
L
Y
 
I
R
 
H
G
 
G
S
 
S
S
 
S
G
 
F
Y
 
C
A
 
A
G
 
A
E
|
E
F
 
L
S
 
G
H
|
H
I
 
L
P
 
V
L
x
V
S
 
S
N
 
L
S
 
D
N
x
G
T
 
P
L
 
D
C
|
C
S
 
S
C
|
C
G
 
G
K
 
S
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
x
I
E
|
E
V
 
A
E
 
Y
T
 
A
S
 
S
L
 
G
L
 
M
V
 
A
M
 
L
V
 
-
Q
 
-
K
 
-
A
 
Q
E
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
K
K
 
K
N
 
L
G
 
H
E
 
D
E
 
E
T
 
D
S
 
L
L
 
L
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
G
K
 
M
T
 
S
L
 
V
F
 
P
N
 
K
D
 
D
K
 
E
S
 
A
K
 
V
S
 
G
H
 
A
V
 
L
D
 
-
H
 
H
F
 
L
L
 
I
N
 
Q
A
|
A
V
x
A
V
 
K
K
 
L
Q
 
G
D
 
N
P
 
A
V
 
K
A
 
A
I
 
Q
S
 
S
I
 
I
L
 
L
A
 
R
D
 
T
A
 
A
A
 
G
F
 
T
Q
 
A
I
 
L
G
 
G
K
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
V
T
 
N
L
 
I
I
 
L
H
 
H
I
 
T
M
 
M
N
 
N
P
 
P
E
 
S
R
 
L
I
 
V
V
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2yhwA High-resolution crystal structures of n-acetylmannosamine kinase: insights about substrate specificity, activity and inhibitor modelling. (see paper)
33% identity, 51% coverage: 140:339/395 of query aligns to 63:261/309 of 2yhwA

query
sites
2yhwA
L
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
S
M
 
T
P
 
G
G
 
G
F
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
P
E
 
R
K
 
E
G
 
G
M
 
I
-
 
V
-
 
L
-
 
H
N
 
S
Y
 
T
S
 
K
F
 
L
M
 
I
Q
 
Q
V
 
E
E
 
W
N
 
N
D
 
S
I
 
V
S
 
D
L
 
L
Q
 
R
D
 
T
Y
 
P
L
 
L
A
 
S
K
 
D
K
 
T
L
 
L
R
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
W
I
 
V
D
 
D
N
|
N
D
 
D
S
 
G
S
x
N
L
 
C
I
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
R
N
 
K
F
 
F
G
 
G
E
 
Q
A
 
G
R
 
K
N
 
G
L
 
L
K
 
E
D
 
N
V
 
F
L
 
V
V
 
T
V
 
L
N
 
I
I
 
T
G
 
G
W
 
T
G
 
G
T
 
I
G
 
G
L
x
G
G
 
G
M
 
I
I
 
I
I
 
H
N
 
Q
G
 
H
K
 
E
L
 
L
Y
 
I
R
 
H
G
 
G
S
 
S
S
 
S
G
 
F
Y
 
C
A
 
A
G
x
A
E
 
E
F
 
L
S
 
G
H
|
H
I
 
L
P
 
V
L
 
V
S
 
S
N
 
L
S
 
N
N
 
G
T
 
P
L
 
D
C
|
C
S
 
S
C
|
C
G
 
G
K
 
S
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
E
V
 
A
E
 
Y
T
 
A
S
 
S
L
 
G
L
 
M
V
 
A
M
 
L
V
 
Q
Q
 
R
K
 
E
A
 
A
E
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
K
 
K
N
 
K
G
 
L
E
 
H
E
 
D
T
 
E
S
 
D
L
 
L
K
 
L
T
 
L
L
 
V
F
 
E
N
 
G
D
 
M
K
 
S
S
 
V
K
 
A
S
 
V
H
 
G
V
 
A
D
 
L
H
 
H
F
 
L
L
 
I
N
 
Q
A
 
A
V
 
A
V
 
K
K
 
L
Q
 
G
D
 
N
P
 
A
V
 
K
A
 
A
I
 
Q
S
 
S
I
 
I
L
 
L
A
 
R
D
 
T
A
 
A
A
 
G
F
 
T
Q
 
A
I
 
L
G
 
G
K
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
V
T
 
N
L
 
I
I
 
L
H
 
H
I
 
T
M
 
M
N
 
N
P
 
P
E
 
S
R
 
L
I
 
V
V
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
G

O35826 Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase; UDP-GlcNAc-2-epimerase/ManAc kinase; EC 3.2.1.183; EC 2.7.1.60 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
32% identity, 51% coverage: 140:339/395 of query aligns to 467:669/722 of O35826

query
sites
O35826
L
x
I
L
|
L
G
|
G
I
x
V
G
|
G
I
|
I
G
x
S
M
x
T
P
x
G
G
|
G
F
x
R
V
|
V
N
|
N
A
x
P
E
x
Q
K
x
E
G
|
G
M
x
V
-
x
V
-
x
L
-
x
H
N
x
S
Y
x
T
S
x
K
F
x
L
M
x
I
Q
|
Q
V
x
E
E
x
W
N
|
N
D
x
S
I
x
V
S
x
D
L
|
L
Q
x
R
D
x
T
Y
x
P
L
|
L
A
x
S
K
x
D
K
x
T
L
|
L
R
x
H
L
|
L
P
|
P
V
|
V
Y
x
W
I
x
V
D
|
D
N
|
N
D
|
D
S
x
G
S
x
N
L
x
C
I
x
A
A
|
A
L
x
M
A
|
A
E
|
E
L
x
R
N
x
K
F
|
F
G
|
G
E
x
Q
A
x
G
R
x
K
N
x
G
L
x
Q
K
x
E
D
x
N
V
x
F
L
x
V
V
x
T
V
x
L
N
x
I
I
x
T
G
|
G
W
x
T
G
|
G
T
x
I
G
|
G
L
x
G
G
|
G
M
x
I
I
|
I
I
x
H
N
x
Q
G
x
H
K
x
E
L
|
L
Y
x
I
R
x
H
G
|
G
S
|
S
S
|
S
G
x
F
Y
x
C
A
|
A
G
x
A
E
|
E
F
x
L
S
x
G
H
|
H
I
x
L
P
x
V
L
x
V
S
|
S
N
x
L
S
x
D
N
x
G
T
x
P
L
x
D
C
|
C
S
|
S
C
|
C
G
|
G
K
x
S
R
x
H
G
|
G
C
|
C
L
x
I
E
|
E
V
x
A
E
x
Y
T
x
A
S
|
S
L
x
G
L
x
M
V
x
A
M
x
L
V
 
-
Q
 
-
K
 
-
A
x
Q
E
x
R
E
|
E
A
|
A
V
x
K
K
|
K
N
x
L
G
x
H
E
x
D
E
|
E
T
x
D
S
x
L
L
|
L
-
x
L
-
x
V
-
x
E
-
x
G
K
x
M
T
x
S
L
x
V
F
x
P
N
x
K
D
|
D
K
x
E
S
x
A
K
x
V
S
x
G
H
x
A
V
x
L
D
 
-
H
|
H
F
x
L
L
x
I
N
x
Q
A
|
A
V
x
A
V
x
K
K
x
L
Q
x
G
D
x
N
P
x
V
V
x
K
A
|
A
I
x
Q
S
|
S
I
|
I
L
|
L
A
x
R
D
x
T
A
|
A
A
x
G
F
x
T
Q
x
A
I
x
L
G
|
G
K
x
L
G
|
G
L
x
V
A
x
V
T
x
N
L
x
I
I
x
L
H
|
H
I
x
T
M
|
M
N
|
N
P
|
P
E
x
S
R
x
L
I
x
V
V
x
I
L
|
L
S
|
S
G
|
G

Sites not aligning to the query:

3eo3A Crystal structure of the n-acetylmannosamine kinase domain of human gne protein (see paper)
32% identity, 46% coverage: 157:339/395 of query aligns to 58:240/288 of 3eo3A

query
sites
3eo3A
M
 
L
N
 
N
Y
 
C
S
 
R
F
 
I
M
 
L
Q
 
G
V
 
V
E
 
G
N
 
I
D
 
S
I
 
T
S
 
D
L
 
L
Q
 
R
D
 
T
Y
 
P
L
 
L
A
 
S
K
 
D
K
 
T
L
 
L
R
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
W
I
 
V
D
 
D
N
 
N
D
 
D
S
 
G
S
 
N
L
 
C
I
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
R
N
 
K
F
 
F
G
 
G
E
 
Q
A
 
G
R
 
K
N
 
G
L
 
L
K
 
E
D
 
N
V
 
F
L
 
V
V
 
T
V
 
L
N
 
I
I
 
T
G
 
G
W
 
T
G
 
G
T
 
I
G
 
G
L
 
G
G
 
G
M
 
I
I
 
I
I
 
H
N
 
Q
G
 
H
K
 
E
L
 
L
Y
 
I
R
 
H
G
 
G
S
 
S
S
 
S
G
 
F
Y
 
C
A
 
A
G
 
A
E
 
E
F
 
L
S
 
G
H
|
H
I
 
L
P
 
V
L
 
V
S
 
S
N
 
L
S
 
D
N
 
G
T
 
P
L
 
D
C
|
C
S
 
S
C
|
C
G
 
G
K
 
S
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
E
V
 
A
E
 
Y
T
 
A
S
 
S
L
 
G
L
 
M
V
 
A
M
 
L
V
 
Q
Q
 
R
K
 
E
A
 
A
E
 
K
E
 
K
A
 
L
V
 
-
K
 
-
N
 
H
G
 
D
E
 
E
E
 
D
T
 
L
S
 
L
L
 
L
K
 
V
T
 
E
L
 
G
F
 
M
N
 
S
D
 
V
K
 
P
S
 
K
K
 
D
S
 
E
H
 
A
V
 
V
D
 
G
-
 
A
-
 
L
H
 
H
F
 
L
L
 
I
N
 
Q
A
 
A
V
 
A
V
 
K
K
 
L
Q
 
G
D
 
N
P
 
A
V
 
K
A
 
A
I
 
Q
S
 
S
I
 
I
L
 
L
A
 
R
D
 
T
A
 
A
A
 
G
F
 
T
Q
 
A
I
 
L
G
 
G
K
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
V
T
 
N
L
 
I
I
 
L
H
 
H
I
 
T
M
 
M
N
 
N
P
 
P
E
 
S
R
 
L
I
 
V
V
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
G

P32718 D-allose kinase; Allokinase; EC 2.7.1.55 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
29% identity, 50% coverage: 142:339/395 of query aligns to 66:246/309 of P32718

query
sites
P32718
G
 
G
I
 
L
G
 
V
I
 
M
G
 
G
M
 
F
P
 
P
G
x
A
F
 
L
V
 
V
N
 
S
A
 
K
E
 
D
K
 
K
G
 
R
M
 
T
N
 
I
Y
 
I
S
 
S
F
 
T
-
 
P
-
 
N
-
 
L
-
 
P
M
 
L
Q
 
T
V
 
A
E
 
A
N
 
D
D
 
L
I
 
Y
S
 
D
L
 
L
Q
 
A
D
 
D
Y
 
K
L
 
L
A
 
E
K
 
N
K
 
T
L
 
L
R
 
N
L
 
C
P
 
P
V
 
V
Y
 
E
I
 
F
D
 
S
N
 
R
D
 
D
S
 
V
S
 
N
L
 
L
I
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
Q
L
 
L
N
 
S
F
 
W
G
 
D
E
 
V
A
 
V
R
 
E
N
 
N
L
 
R
-
 
L
-
 
T
-
 
Q
K
 
Q
D
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
A
V
 
A
N
 
Y
I
 
L
G
 
G
W
 
T
G
 
G
T
 
M
G
 
G
L
x
F
G
 
A
M
 
V
I
 
W
I
 
M
N
 
N
G
 
G
K
 
A
L
 
P
Y
 
W
R
 
T
G
 
G
S
 
A
S
 
H
G
 
G
Y
 
V
A
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
L
S
 
G
H
 
H
I
 
I
P
 
P
L
 
L
S
 
G
N
 
D
S
 
M
N
 
T
T
 
Q
L
 
H
C
 
C
S
 
A
C
 
C
G
 
G
K
 
N
R
 
P
G
 
G
C
 
C
L
 
L
E
 
E
V
 
T
E
 
N
T
 
C
S
 
S
L
 
G
L
 
M
V
 
A
M
 
L
V
 
R
Q
 
R
K
 
W
A
 
Y
E
 
E
E
 
Q
A
 
Q
V
 
P
K
 
R
N
 
N
G
 
-
E
 
-
E
 
-
T
 
Y
S
 
P
L
 
L
K
 
R
T
 
D
L
 
L
F
 
F
N
 
V
D
 
-
K
 
-
S
 
-
K
 
-
S
 
-
H
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
H
F
 
A
L
 
E
N
 
N
A
 
A
V
 
-
V
 
-
K
 
-
Q
 
-
D
 
-
P
 
P
V
 
F
A
 
V
I
 
Q
S
 
S
I
 
L
L
 
L
A
 
E
D
 
N
A
 
A
A
 
A
F
 
-
Q
 
-
I
 
-
G
 
-
K
 
R
G
 
A
L
 
I
A
 
A
T
 
T
L
 
S
I
 
I
H
 
N
I
 
L
M
 
F
N
 
D
P
 
P
E
 
D
R
 
A
I
 
V
V
 
I
L
 
L
S
 
G
G
 
G

Q93LQ8 Beta-glucoside kinase; EC 2.7.1.85 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
24% identity, 50% coverage: 142:339/395 of query aligns to 56:242/297 of Q93LQ8

query
sites
Q93LQ8
G
 
G
I
 
I
G
 
A
I
 
I
G
 
S
M
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
V
 
I
N
 
D
A
 
P
E
 
H
K
 
S
G
 
G
-
 
L
-
 
I
-
 
T
M
 
M
N
 
G
Y
 
G
S
 
A
F
 
I
M
 
R
Q
 
R
V
 
F
E
 
D
N
 
N
D
 
-
I
 
F
S
 
A
L
 
M
Q
 
K
D
 
S
Y
 
W
L
 
L
A
 
E
K
 
T
K
 
R
L
 
T
R
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
S
I
 
V
D
 
E
N
 
N
D
|
D
S
 
A
S
 
N
L
 
C
I
 
V
A
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
R
N
 
W
F
 
Q
G
 
G
E
 
K
A
 
A
R
 
A
N
 
E
L
 
M
K
 
A
D
 
N
V
 
F
L
 
L
V
 
V
V
 
L
N
 
T
I
 
I
G
 
G
W
 
T
G
|
G
T
 
I
G
|
G
L
 
G
G
 
A
M
 
I
I
 
F
I
 
C
N
 
Q
G
 
H
K
 
Q
L
 
L
Y
 
I
R
 
N
G
 
G
S
 
A
S
 
R
G
 
F
Y
 
R
A
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
F
S
 
G
H
 
Y
I
 
M
P
 
L
L
 
T
S
 
D
N
 
R
S
 
P
N
 
G
T
 
G
L
 
R
C
 
D
S
 
P
C
 
-
G
 
-
K
 
R
R
 
R
G
 
Y
C
 
S
L
 
M
E
 
N
V
 
E
E
 
N
T
 
C
S
 
T
L
 
L
L
 
R
V
 
V
M
 
L
V
 
R
Q
 
H
K
 
R
A
 
Y
E
 
A
E
 
Q
A
 
H
V
 
I
K
 
G
N
 
A
G
 
P
E
 
L
E
 
D
T
 
S
S
 
V
L
 
T
K
 
G
T
 
E
L
 
L
F
 
I
N
 
F
D
 
D
K
 
R
S
 
Y
K
 
D
S
 
A
H
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
-
F
 
-
L
 
-
N
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
-
K
 
-
Q
 
G
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
C
I
 
Q
S
 
R
I
 
L
L
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
F
A
 
F
F
 
N
Q
 
G
I
 
L
G
 
G
K
 
H
G
 
G
L
 
L
A
 
Y
T
 
N
L
 
L
I
 
V
H
 
H
I
 
I
M
 
F
N
 
D
P
 
P
E
 
Q
R
 
T
I
 
I
V
 
F
L
 
I
S
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3vovB Crystal structure of rok hexokinase from thermus thermophilus (see paper)
28% identity, 48% coverage: 143:332/395 of query aligns to 61:236/298 of 3vovB

query
sites
3vovB
I
 
I
G
 
G
I
 
L
G
 
G
M
 
T
P
 
P
G
 
G
F
 
P
V
 
L
N
 
D
A
 
F
E
 
R
K
 
R
G
 
G
M
 
V
N
 
I
Y
 
R
S
 
P
F
 
N
M
 
I
Q
 
P
V
 
G
E
 
V
N
 
Q
D
 
D
I
 
F
S
 
P
L
 
I
Q
 
R
D
 
R
Y
 
I
L
 
L
A
 
E
K
 
E
K
 
A
L
 
T
R
 
G
L
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
F
I
 
L
D
 
E
N
 
N
D
 
D
S
 
A
S
 
N
L
 
A
I
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
H
N
 
H
F
 
L
G
 
G
E
 
A
A
 
A
R
 
Q
N
 
G
L
 
E
K
 
E
D
 
S
V
 
S
L
 
L
V
 
Y
V
 
L
N
 
T
I
 
V
G
 
S
W
 
T
G
 
G
T
 
I
G
 
G
L
 
G
G
 
G
M
 
V
I
 
V
I
 
L
N
 
G
G
 
G
K
 
R
L
 
V
Y
 
L
R
 
R
G
 
G
S
 
E
S
 
R
G
 
G
Y
 
Q
A
 
G
G
 
G
E
 
E
F
 
L
S
 
G
H
|
H
I
 
L
P
 
T
L
 
L
S
 
L
N
 
P
S
 
G
N
 
G
T
 
P
L
 
A
C
|
C
S
 
G
C
|
C
G
 
G
K
 
L
R
 
E
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
V
 
A
E
 
L
T
 
A
S
 
A
L
 
G
L
 
R
V
 
A
M
 
L
V
 
E
Q
 
R
K
 
D
A
 
A
E
 
T
E
 
Y
A
 
A
V
 
F
K
 
Q
N
 
R
G
 
P
E
 
V
E
 
D
T
 
T
-
 
R
S
 
E
L
 
L
K
 
F
T
 
R
L
 
L
F
 
F
N
 
Q
D
 
-
K
 
-
S
 
-
K
 
-
S
 
-
H
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
-
F
 
-
L
 
-
N
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
-
K
 
A
Q
 
G
D
 
D
P
 
P
V
 
K
A
 
A
I
 
E
S
 
R
I
 
L
L
 
V
A
 
L
D
 
Q
A
 
A
A
 
A
F
 
R
Q
 
Y
I
 
V
G
 
G
K
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
S
L
 
L
I
 
V
H
 
K
I
 
A
M
 
F
N
 
D
P
 
P

2gupA Structural genomics, the crystal structure of a rok family protein from streptococcus pneumoniae tigr4 in complex with sucrose
34% identity, 30% coverage: 135:253/395 of query aligns to 47:171/289 of 2gupA

query
sites
2gupA
I
 
L
D
 
S
K
 
E
E
 
Q
N
 
D
L
 
Y
L
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
A
I
 
M
G
 
S
M
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
Q
E
 
E
K
 
T
G
 
G
M
 
V
N
 
I
Y
 
D
S
 
G
F
 
F
M
 
S
Q
 
A
V
 
V
E
 
P
N
 
Y
D
 
I
I
 
H
S
 
G
L
 
F
Q
 
S
D
 
W
Y
|
Y
L
 
E
A
 
A
-
 
L
K
x
S
K
 
S
L
 
Y
R
x
Q
L
 
L
P
|
P
V
|
V
Y
 
H
I
 
L
D
 
E
N
 
N
D
 
D
S
 
A
S
 
N
L
 
C
I
x
V
A
 
G
L
 
L
A
 
S
E
 
E
L
 
L
N
 
L
F
 
-
G
 
-
E
 
A
A
 
H
R
 
P
N
 
E
L
 
L
K
 
E
D
 
N
V
 
A
L
 
A
V
 
C
V
 
V
N
 
V
I
 
I
G
 
G
W
 
T
G
 
G
T
 
I
G
 
G
L
 
G
G
 
A
M
 
M
I
 
I
I
 
I
N
 
N
G
 
G
K
 
R
L
 
L
Y
 
H
R
 
R
G
 
G
S
 
R
S
 
H
G
 
G
Y
 
L
A
 
G
G
 
G
E
 
E
F
 
F
S
 
G
H
 
Y
I
 
M
P
 
T
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
K
L
 
L
S
 
N
N
 
N
S
 
W
N
 
S
T
 
Q
L
 
L
C
 
A
S
 
S
C
 
T
G
 
G
K
 
N

Sites not aligning to the query:

7p9lAAA Ubiquitin-like protein SMT3,N-acetyl-D-glucosamine kinase
32% identity, 29% coverage: 143:258/395 of query aligns to 61:188/303 of 7p9lAAA

query
sites
7p9lAAA
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
M
 
I
P
|
P
G
|
G
F
 
I
V
 
A
N
 
D
A
 
V
E
 
E
K
 
T
G
 
G
-
 
K
M
 
L
N
 
L
Y
 
T
S
|
S
F
 
N
M
 
I
Q
 
P
V
 
A
E
 
A
N
 
M
D
 
G
I
 
H
S
 
T
L
 
L
Q
 
Q
D
 
R
Y
 
D
L
 
L
A
 
E
K
 
E
K
 
R
L
 
L
R
 
Q
L
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
K
I
 
I
D
 
E
N
|
N
D
|
D
S
 
A
S
 
N
L
 
C
I
 
F
A
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
E
L
 
A
N
 
W
F
 
D
G
 
E
E
 
D
A
 
L
R
 
R
N
 
G
L
 
E
K
 
P
D
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
G
V
 
L
N
 
I
I
 
L
G
|
G
W
x
T
G
|
G
T
x
V
G
|
G
L
 
G
G
 
G
M
 
L
I
 
I
I
 
F
N
 
N
G
 
G
K
 
K
L
 
V
Y
 
H
R
 
S
G
 
G
S
 
R
S
 
A
G
 
N
Y
 
I
A
 
A
G
 
G
E
|
E
F
 
I
S
 
G
H
|
H
-
 
T
-
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
Y
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
K
-
 
L
I
 
L
P
 
G
L
 
M
S
 
E
N
 
N
S
 
A
N
 
P
T
 
I
L
 
F
-
 
P
C
|
C
S
 
G
C
|
C
G
 
K
K
 
N
R
 
S
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
x
D

Sites not aligning to the query:

7p9pAAA Ubiquitin-like protein SMT3,N-acetyl-D-glucosamine kinase
32% identity, 29% coverage: 143:258/395 of query aligns to 62:189/304 of 7p9pAAA

query
sites
7p9pAAA
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
M
 
I
P
 
P
G
 
G
F
 
I
V
 
A
N
 
D
A
 
V
E
 
E
K
 
T
G
 
G
-
 
K
M
 
L
N
 
L
Y
 
T
S
 
S
F
 
N
M
 
I
Q
 
P
V
 
A
E
 
A
N
 
M
D
 
G
I
 
H
S
 
T
L
 
L
Q
 
Q
D
 
R
Y
 
D
L
 
L
A
 
E
K
 
E
K
 
R
L
 
L
R
 
Q
L
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
K
I
 
I
D
 
E
N
 
N
D
 
D
S
 
A
S
 
N
L
 
C
I
 
F
A
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
E
L
 
A
N
 
W
F
 
D
G
 
E
E
 
D
A
 
L
R
 
R
N
 
G
L
 
E
K
 
P
D
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
G
V
 
L
N
 
I
I
 
L
G
|
G
W
x
T
G
 
G
T
 
V
G
 
G
L
 
G
G
 
G
M
 
L
I
 
I
I
 
F
N
 
N
G
 
G
K
 
K
L
 
V
Y
 
H
R
 
S
G
 
G
S
 
R
S
 
A
G
 
N
Y
 
I
A
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
I
S
 
G
H
|
H
-
 
T
-
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
Y
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
K
-
 
L
I
 
L
P
 
G
L
 
M
S
 
E
N
 
N
S
 
A
N
 
P
T
 
I
L
 
F
-
 
P
C
|
C
S
 
G
C
|
C
G
 
K
K
 
N
R
 
S
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
D

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>CA265_RS15640 FitnessBrowser__Pedo557:CA265_RS15640
MSATIKKAQRLRADIIKLLYYKKKSSLTDLSKRTKKSLPLITSTVNALIEDGLIIEQGLA
PSTGGRRPLNFLLNPDYKRYIIAVAMDQLTSQLTIYDLSNHQVLPTQVIDLDMTQSKSAD
TLIEFIDHCIKKSTIDKENLLGIGIGMPGFVNAEKGMNYSFMQVENDISLQDYLAKKLRL
PVYIDNDSSLIALAELNFGEARNLKDVLVVNIGWGTGLGMIINGKLYRGSSGYAGEFSHI
PLSNSNTLCSCGKRGCLEVETSLLVMVQKAEEAVKNGEETSLKTLFNDKSKSHVDHFLNA
VVKQDPVAISILADAAFQIGKGLATLIHIMNPERIVLSGRGAKAGKMLLPPIQQAINEFC
IPRVAEQTEIKCSSLSDEAELLAAASLMVENSLFE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory