SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CA265_RS19165 FitnessBrowser__Pedo557:CA265_RS19165 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6ymdA Crystal structure of serine hydroxymethyltransferase from aphanothece halophytica in the covalent complex with malonate (see paper)
57% identity, 100% coverage: 1:422/423 of query aligns to 8:414/420 of 6ymdA

query
sites
6ymdA
M
 
L
T
 
Q
R
 
T
D
 
D
N
 
P
Q
 
T
I
 
I
F
 
S
E
 
G
L
 
M
I
 
M
D
 
Q
K
 
K
E
 
E
L
 
L
N
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
E
 
R
H
 
E
G
 
H
L
 
L
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
T
S
 
S
K
 
P
Q
 
A
V
 
V
M
 
M
E
 
A
A
 
T
A
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
K
K
 
K
R
 
R
Y
 
Y
Y
|
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
Q
 
E
V
 
F
V
 
I
D
 
D
V
 
E
V
 
I
E
 
E
Q
 
Q
I
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
A
W
 
S
V
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
|
S
G
|
G
A
|
A
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
F
A
 
A
V
 
V
M
 
F
L
 
L
A
 
T
I
 
L
L
 
L
Q
 
K
P
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
K
I
 
I
L
 
M
G
 
G
F
 
M
D
 
D
L
 
L
S
 
S
H
 
H
G
 
G
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
A
N
 
N
F
 
V
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
W
Y
 
F
Q
 
E
P
 
A
L
 
V
F
 
H
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
E
 
S
K
 
Q
E
 
E
T
 
T
G
 
E
L
 
Q
I
 
L
D
 
D
Y
 
Y
K
 
D
K
 
H
L
 
I
E
 
L
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
R
A
 
Q
E
 
E
K
 
R
P
 
P
K
 
K
L
 
L
I
 
I
I
 
I
C
 
C
G
 
G
A
x
Y
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
R
 
R
E
 
I
W
 
I
D
 
N
Y
 
F
A
 
E
F
 
K
I
 
F
R
 
R
S
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
Y
V
 
L
L
 
L
A
 
A
D
|
D
I
 
I
S
x
A
H
|
H
P
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
S
G
 
G
L
 
H
L
 
H
A
 
P
N
 
N
P
 
P
L
 
V
P
 
P
H
 
H
C
 
C
H
 
D
I
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
|
T
T
 
T
H
 
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
M
 
L
I
 
I
M
 
L
M
 
T
G
 
-
Q
 
-
D
 
-
F
 
-
E
 
-
N
 
-
P
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
R
T
 
D
P
 
P
K
 
E
G
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
L
S
 
G
N
 
K
L
 
K
L
 
F
D
 
N
M
 
K
A
 
S
V
 
V
F
 
F
P
 
P
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
G
|
G
P
 
P
L
 
L
E
 
E
H
 
H
I
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
K
E
 
P
E
 
E
Y
 
F
G
 
K
T
 
A
Y
 
Y
I
 
S
K
 
G
Q
 
Q
V
 
V
A
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
M
 
M
A
 
A
K
 
Q
A
 
Q
F
 
L
V
 
Q
A
 
N
K
 
R
G
 
G
Y
 
F
G
 
K
I
 
I
I
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
M
 
M
L
 
L
I
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
N
 
S
K
 
V
N
 
N
I
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
Q
A
 
A
E
 
D
N
 
Q
A
 
L
L
 
V
E
 
S
K
 
D
A
 
V
E
 
N
I
 
I
T
 
T
V
 
A
N
 
N
K
 
K
N
 
N
M
 
T
V
 
V
P
 
P
F
 
F
D
 
D
D
 
P
K
 
E
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
L
R
|
R
V
 
L
G
 
G
T
 
S
A
 
P
A
 
A
I
 
M
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
L
K
 
G
E
 
T
T
 
E
E
 
D
M
 
F
E
 
A
K
 
E
I
 
I
V
 
A
D
 
N
L
 
I
I
 
I
D
 
A
Q
 
D
V
 
R
L
 
L
T
 
Q
N
 
N
P
 
P
E
 
E
D
 
D
E
 
E
A
 
Q
N
 
V
L
 
K
N
 
Q
S
 
A
V
 
C
K
 
V
A
 
Q
E
 
R
V
 
V
I
 
A
K
 
A
L
 
L
V
 
C
S
 
E
A
 
R
F
 
F
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y

6ymfA Crystal structure of serine hydroxymethyltransferase from aphanothece halophytica in the plp-serine external aldimine state (see paper)
57% identity, 100% coverage: 1:422/423 of query aligns to 8:414/418 of 6ymfA

query
sites
6ymfA
M
 
L
T
 
Q
R
 
T
D
 
D
N
 
P
Q
 
T
I
 
I
F
 
S
E
 
G
L
 
M
I
 
M
D
 
Q
K
 
K
E
 
E
L
 
L
N
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
E
 
R
H
 
E
G
 
H
L
 
L
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
T
S
 
S
K
 
P
Q
 
A
V
 
V
M
 
M
E
 
A
A
 
T
A
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
K
K
 
K
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
Q
 
E
V
 
F
V
 
I
D
 
D
V
 
E
V
 
I
E
 
E
Q
 
Q
I
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
A
W
 
S
V
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
|
S
G
|
G
A
|
A
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
F
A
 
A
V
 
V
M
 
F
L
 
L
A
 
T
I
 
L
L
 
L
Q
 
K
P
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
K
I
 
I
L
 
M
G
 
G
F
 
M
D
 
D
L
 
L
S
 
S
H
 
H
G
 
G
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
A
N
 
N
F
 
V
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
W
Y
 
F
Q
 
E
P
 
A
L
 
V
F
 
H
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
E
 
S
K
 
Q
E
 
E
T
 
T
G
 
E
L
 
Q
I
 
L
D
 
D
Y
 
Y
K
 
D
K
 
H
L
 
I
E
 
L
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
R
A
 
Q
E
 
E
K
 
R
P
 
P
K
 
K
L
 
L
I
 
I
I
 
I
C
 
C
G
 
G
A
 
Y
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
R
 
R
E
 
I
W
 
I
D
 
N
Y
 
F
A
 
E
F
 
K
I
 
F
R
 
R
S
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
Y
V
 
L
L
 
L
A
 
A
D
|
D
I
 
I
S
x
A
H
|
H
P
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
S
G
 
G
L
 
H
L
 
H
A
 
P
N
 
N
P
 
P
L
 
V
P
 
P
H
 
H
C
 
C
H
 
D
I
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
|
T
T
 
T
H
 
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
M
 
L
I
 
I
M
 
L
M
 
T
G
 
-
Q
 
-
D
 
-
F
 
-
E
 
-
N
 
-
P
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
R
T
 
D
P
 
P
K
 
E
G
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
L
S
 
G
N
 
K
L
 
K
L
 
F
D
 
N
M
 
K
A
 
S
V
 
V
F
 
F
P
 
P
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
E
H
 
H
I
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
K
E
 
P
E
 
E
Y
 
F
G
 
K
T
 
A
Y
 
Y
I
 
S
K
 
G
Q
 
Q
V
 
V
A
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
M
 
M
A
 
A
K
 
Q
A
 
Q
F
 
L
V
 
Q
A
 
N
K
 
R
G
 
G
Y
 
F
G
 
K
I
 
I
I
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
M
 
M
L
 
L
I
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
N
 
S
K
 
V
N
 
N
I
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
Q
A
 
A
E
 
D
N
 
Q
A
 
L
L
 
V
E
 
S
K
 
D
A
 
V
E
 
N
I
 
I
T
 
T
V
 
A
N
 
N
K
 
K
N
 
N
M
 
T
V
 
V
P
 
P
F
 
F
D
 
D
D
 
P
K
 
E
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
L
R
|
R
V
 
L
G
 
G
T
 
S
A
 
P
A
 
A
I
 
M
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
L
K
 
G
E
 
T
T
 
E
E
 
D
M
 
F
E
 
A
K
 
E
I
 
I
V
 
A
D
 
N
L
 
I
I
 
I
D
 
A
Q
 
D
V
 
R
L
 
L
T
 
Q
N
 
N
P
 
P
E
 
E
D
 
D
E
 
E
A
 
Q
N
 
V
L
 
K
N
 
Q
S
 
A
V
 
C
K
 
V
A
 
Q
E
 
R
V
 
V
I
 
A
K
 
A
L
 
L
V
 
C
S
 
E
A
 
R
F
 
F
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y

Q5SI56 Serine hydroxymethyltransferase; SHMT; Serine methylase; EC 2.1.2.1 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8)
56% identity, 100% coverage: 1:421/423 of query aligns to 5:406/407 of Q5SI56

query
sites
Q5SI56
M
 
L
T
 
K
R
 
R
D
 
D
N
 
E
Q
 
A
I
 
L
F
 
F
E
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
A
K
 
L
E
 
E
L
 
E
N
 
K
R
 
R
Q
 
Q
E
 
R
H
 
E
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
S
E
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
V
 
V
M
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
A
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
Q
 
E
V
 
V
V
 
I
D
 
D
V
 
R
V
 
V
E
 
E
Q
 
S
I
 
L
A
 
A
I
 
I
D
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
K
E
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
A
W
 
W
V
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
 
S
G
|
G
A
x
S
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
M
A
 
A
V
 
V
M
 
Y
L
 
M
A
 
A
I
 
L
L
 
M
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
T
I
 
L
L
 
M
G
 
G
F
 
M
D
 
D
L
 
L
S
 
A
H
 
A
G
 
G
G
 
G
H
 
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
S
 
S
P
 
R
V
 
V
N
 
N
F
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
K
P
 
V
L
 
V
F
 
S
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
E
 
R
K
 
P
E
 
D
T
 
T
G
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
L
K
 
E
K
 
E
L
 
V
E
 
R
E
 
R
V
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
E
E
 
H
K
 
R
P
 
P
K
 
K
L
 
V
I
 
I
I
 
V
C
 
A
G
 
G
A
 
A
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
R
 
R
E
 
F
W
 
W
D
 
D
Y
 
F
A
 
K
F
 
A
I
 
F
R
 
R
S
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
Y
V
 
L
L
 
V
A
 
V
D
 
D
I
 
M
S
 
A
H
|
H
P
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
H
A
 
P
N
 
N
P
 
P
L
 
L
P
 
P
H
 
Y
C
 
A
H
 
H
I
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
S
T
 
T
T
 
T
H
|
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
 
R
G
 
G
G
 
G
M
 
L
I
 
I
M
 
-
M
 
L
G
 
S
Q
 
N
D
 
D
F
 
P
E
 
E
N
 
-
P
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
L
S
 
G
N
 
K
L
 
R
L
 
I
D
 
D
M
 
K
A
 
L
V
 
I
F
 
F
P
 
P
G
 
G
T
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
|
G
P
 
P
L
 
L
E
 
E
H
 
H
I
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
F
E
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
E
 
P
E
 
E
Y
 
F
G
 
K
T
 
E
Y
 
Y
I
 
S
K
 
R
Q
 
L
V
 
V
A
 
V
A
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
K
A
 
R
M
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
E
F
 
L
V
 
A
A
 
R
K
 
R
G
 
G
Y
 
Y
G
 
R
I
 
I
I
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
M
 
F
L
 
L
I
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
N
 
P
K
 
K
N
 
G
I
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
E
A
 
A
E
 
E
N
 
E
A
 
R
L
 
L
E
 
D
K
 
A
A
 
V
E
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
 
N
M
 
A
V
 
I
P
 
P
F
 
F
D
 
D
D
 
P
K
 
K
S
 
P
P
 
P
F
 
R
V
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
P
A
 
A
I
 
I
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
F
K
 
T
E
 
P
T
 
E
E
 
E
M
 
M
E
 
P
K
 
L
I
 
V
V
 
A
D
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Q
 
R
V
 
A
L
 
L
T
 
L
N
 
E
P
 
G
E
 
P
D
 
S
E
 
E
A
 
A
N
 
-
L
 
-
N
 
-
S
 
-
V
 
L
K
 
R
A
 
E
E
 
E
V
 
V
I
 
R
K
 
R
L
 
L
V
 
A
S
 
L
A
 
A
F
 
H
P
 
P
L
 
M

8suiB Joint x-ray/neutron structure of thermus thermophilus serine hydroxymethyltransferase (tthshmt) in internal aldimine state with l- ser bound in a pre-michalis complex (see paper)
56% identity, 99% coverage: 3:421/423 of query aligns to 2:401/402 of 8suiB

query
sites
8suiB
R
 
R
D
 
D
N
 
E
Q
 
A
I
 
L
F
 
F
E
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
A
K
 
L
E
 
E
L
 
E
N
 
K
R
 
R
Q
 
Q
E
 
R
H
 
E
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
S
E
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
V
 
V
M
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
A
R
 
R
Y
|
Y
Y
|
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
Q
 
E
V
 
V
V
 
I
D
 
D
V
 
R
V
 
V
E
 
E
Q
 
S
I
 
L
A
 
A
I
 
I
D
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
K
E
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
A
W
 
W
V
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
 
S
G
 
G
A
 
S
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
M
A
 
A
V
 
V
M
 
Y
L
 
M
A
 
A
I
 
L
L
 
M
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
T
I
 
L
L
 
M
G
 
G
F
 
M
D
 
D
L
 
L
S
 
A
H
 
A
G
 
G
G
 
G
H
 
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
S
 
S
P
 
R
V
 
V
N
 
N
F
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
K
P
 
V
L
 
V
F
 
S
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
E
 
R
K
 
P
E
 
D
T
 
T
G
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
L
K
 
E
K
 
E
L
 
V
E
 
R
E
 
R
V
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
E
E
 
H
K
 
R
P
 
P
K
 
K
L
 
V
I
 
I
I
 
V
C
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
R
 
R
E
 
F
W
 
W
D
 
D
Y
 
F
A
 
K
F
 
A
I
 
F
R
 
R
S
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
Y
V
 
L
L
 
V
A
 
V
D
 
D
I
 
M
S
 
A
H
 
H
P
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
H
A
 
P
N
 
N
P
 
P
L
 
L
P
 
P
H
 
Y
C
 
A
H
 
H
I
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
S
T
 
T
T
 
T
H
 
H
K
 
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
 
R
G
 
G
G
 
G
M
 
L
I
 
I
M
 
-
M
 
L
G
 
S
Q
 
N
D
 
D
F
 
P
E
 
E
N
 
-
P
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
L
S
 
G
N
 
K
L
 
R
L
 
I
D
 
D
M
 
K
A
 
L
V
 
I
F
 
F
P
 
P
G
 
G
T
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
E
H
 
H
I
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
F
E
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
E
 
P
E
 
E
Y
 
F
G
 
K
T
 
E
Y
 
Y
I
 
S
K
 
R
Q
 
L
V
 
V
A
 
V
A
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
K
A
 
R
M
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
E
F
 
L
V
 
A
A
 
R
K
 
R
G
 
G
Y
 
Y
G
 
R
I
 
I
I
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
M
 
F
L
 
L
I
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
N
 
P
K
 
K
N
 
G
I
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
E
A
 
A
E
 
E
N
 
E
A
 
R
L
 
L
E
 
D
K
 
A
A
 
V
E
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
 
N
M
 
A
V
 
I
P
 
P
F
 
F
D
 
D
D
 
P
K
 
K
S
 
P
P
 
P
F
 
R
V
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
P
A
 
A
I
 
I
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
F
K
 
T
E
 
P
T
 
E
E
 
E
M
 
M
E
 
P
K
 
L
I
 
V
V
 
A
D
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Q
 
R
V
 
A
L
 
L
T
 
L
N
 
E
P
 
G
E
 
P
D
 
S
E
 
E
A
 
A
N
 
-
L
 
-
N
 
-
S
 
-
V
 
L
K
 
R
A
 
E
E
 
E
V
 
V
I
 
R
K
 
R
L
 
L
V
 
A
S
 
L
A
 
A
F
 
H
P
 
P
L
 
M

8ssyA Room-temperature x-ray structure of thermus thermophilus serine hydroxymethyltransferase (shmt) bound with d-ser in a pseudo- michaelis complex (see paper)
56% identity, 99% coverage: 3:421/423 of query aligns to 2:401/402 of 8ssyA

query
sites
8ssyA
R
 
R
D
 
D
N
 
E
Q
 
A
I
 
L
F
 
F
E
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
A
K
 
L
E
 
E
L
 
E
N
 
K
R
 
R
Q
 
Q
E
 
R
H
 
E
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
V
 
V
M
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
A
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
Q
 
E
V
 
V
V
 
I
D
 
D
V
 
R
V
 
V
E
 
E
Q
 
S
I
 
L
A
 
A
I
 
I
D
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
K
E
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
A
W
 
W
V
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
 
S
G
 
G
A
 
S
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
M
A
 
A
V
 
V
M
 
Y
L
 
M
A
 
A
I
 
L
L
 
M
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
T
I
 
L
L
 
M
G
 
G
F
 
M
D
 
D
L
 
L
S
 
A
H
 
A
G
 
G
G
 
G
H
 
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
S
 
S
P
 
R
V
 
V
N
 
N
F
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
K
P
 
V
L
 
V
F
 
S
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
E
 
R
K
 
P
E
 
D
T
 
T
G
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
L
K
 
E
K
 
E
L
 
V
E
 
R
E
 
R
V
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
E
E
 
H
K
 
R
P
 
P
K
 
K
L
 
V
I
 
I
I
 
V
C
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
R
 
R
E
 
F
W
 
W
D
 
D
Y
 
F
A
 
K
F
 
A
I
 
F
R
 
R
S
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
Y
V
 
L
L
 
V
A
 
V
D
 
D
I
 
M
S
 
A
H
|
H
P
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
H
A
 
P
N
 
N
P
 
P
L
 
L
P
 
P
H
 
Y
C
 
A
H
 
H
I
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
S
T
 
T
T
 
T
H
 
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
 
R
G
 
G
G
 
G
M
 
L
I
 
I
M
 
-
M
 
L
G
 
S
Q
 
N
D
 
D
F
 
P
E
 
E
N
 
-
P
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
L
S
 
G
N
 
K
L
 
R
L
 
I
D
 
D
M
 
K
A
 
L
V
 
I
F
 
F
P
 
P
G
 
G
T
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
E
H
 
H
I
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
F
E
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
E
 
P
E
 
E
Y
 
F
G
 
K
T
 
E
Y
 
Y
I
 
S
K
 
R
Q
 
L
V
 
V
A
 
V
A
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
K
A
 
R
M
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
E
F
 
L
V
 
A
A
 
R
K
 
R
G
 
G
Y
 
Y
G
 
R
I
 
I
I
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
M
 
F
L
 
L
I
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
N
 
P
K
 
K
N
 
G
I
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
E
A
 
A
E
 
E
N
 
E
A
 
R
L
 
L
E
 
D
K
 
A
A
 
V
E
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
 
N
M
 
A
V
 
I
P
 
P
F
 
F
D
 
D
D
 
P
K
 
K
S
 
P
P
 
P
F
 
R
V
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
|
R
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
P
A
 
A
I
 
I
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
F
K
 
T
E
 
P
T
 
E
E
 
E
M
 
M
E
 
P
K
 
L
I
 
V
V
 
A
D
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Q
 
R
V
 
A
L
 
L
T
 
L
N
 
E
P
 
G
E
 
P
D
 
S
E
 
E
A
 
A
N
 
-
L
 
-
N
 
-
S
 
-
V
 
L
K
 
R
A
 
E
E
 
E
V
 
V
I
 
R
K
 
R
L
 
L
V
 
A
S
 
L
A
 
A
F
 
H
P
 
P
L
 
M

2dkjA Crystal structure of t.Th.Hb8 serine hydroxymethyltransferase
56% identity, 99% coverage: 3:421/423 of query aligns to 2:401/402 of 2dkjA

query
sites
2dkjA
R
 
R
D
 
D
N
 
E
Q
 
A
I
 
L
F
 
F
E
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
A
K
 
L
E
 
E
L
 
E
N
 
K
R
 
R
Q
 
Q
E
 
R
H
 
E
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
S
E
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
V
 
V
M
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
L
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
A
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
Q
 
E
V
 
V
V
 
I
D
 
D
V
 
R
V
 
V
E
 
E
Q
 
S
I
 
L
A
 
A
I
 
I
D
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
K
E
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
A
W
 
W
V
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
|
S
G
|
G
A
x
S
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
M
A
 
A
V
 
V
M
 
Y
L
 
M
A
 
A
I
 
L
L
 
M
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
T
I
 
L
L
 
M
G
 
G
F
 
M
D
 
D
L
 
L
S
 
A
H
 
A
G
 
G
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
S
 
S
P
 
R
V
 
V
N
 
N
F
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
K
P
 
V
L
 
V
F
 
S
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
E
 
R
K
 
P
E
 
D
T
 
T
G
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
L
K
 
E
K
 
E
L
 
V
E
 
R
E
 
R
V
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
E
E
 
H
K
 
R
P
 
P
K
 
K
L
 
V
I
 
I
I
 
V
C
 
A
G
 
G
A
 
A
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
R
 
R
E
 
F
W
 
W
D
 
D
Y
 
F
A
 
K
F
 
A
I
 
F
R
 
R
S
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
Y
V
 
L
L
 
V
A
 
V
D
|
D
I
 
M
S
x
A
H
 
H
P
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
H
A
 
P
N
 
N
P
 
P
L
 
L
P
 
P
H
 
Y
C
 
A
H
 
H
I
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
S
T
|
T
T
 
T
H
|
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
M
 
L
I
 
I
M
 
-
M
 
L
G
 
S
Q
 
N
D
 
D
F
 
P
E
 
E
N
 
-
P
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
L
S
 
G
N
 
K
L
 
R
L
 
I
D
 
D
M
 
K
A
 
L
V
 
I
F
 
F
P
 
P
G
 
G
T
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
E
H
 
H
I
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
F
E
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
E
 
P
E
 
E
Y
 
F
G
 
K
T
 
E
Y
 
Y
I
 
S
K
 
R
Q
 
L
V
 
V
A
 
V
A
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
K
A
 
R
M
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
E
F
 
L
V
 
A
A
 
R
K
 
R
G
 
G
Y
 
Y
G
 
R
I
 
I
I
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
M
 
F
L
 
L
I
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
N
 
P
K
 
K
N
 
G
I
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
E
A
 
A
E
 
E
N
 
E
A
 
R
L
 
L
E
 
D
K
 
A
A
 
V
E
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
 
N
M
 
A
V
 
I
P
 
P
F
 
F
D
 
D
D
 
P
K
 
K
S
 
P
P
 
P
F
 
R
V
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
P
A
 
A
I
 
I
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
F
K
 
T
E
 
P
T
 
E
E
 
E
M
 
M
E
 
P
K
 
L
I
 
V
V
 
A
D
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Q
 
R
V
 
A
L
 
L
T
 
L
N
 
E
P
 
G
E
 
P
D
 
S
E
 
E
A
 
A
N
 
-
L
 
-
N
 
-
S
 
-
V
 
L
K
 
R
A
 
E
E
 
E
V
 
V
I
 
R
K
 
R
L
 
L
V
 
A
S
 
L
A
 
A
F
 
H
P
 
P
L
 
M

1kl2A Crystal structure of serine hydroxymethyltransferase complexed with glycine and 5-formyl tetrahydrofolate (see paper)
55% identity, 98% coverage: 3:415/423 of query aligns to 7:403/405 of 1kl2A

query
sites
1kl2A
R
 
Q
D
 
D
N
 
P
Q
 
Q
I
 
V
F
 
F
E
 
A
L
 
A
I
 
I
D
 
E
K
 
Q
E
 
E
L
 
R
N
 
K
R
 
R
Q
 
Q
E
 
H
H
 
A
G
 
K
L
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
R
Q
 
A
V
 
V
M
 
M
E
 
E
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
L
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Y
|
Y
Y
|
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
Q
 
E
V
 
Y
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
A
 
A
I
 
R
D
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
K
E
 
Q
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
E
W
 
H
V
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
|
S
G
|
G
A
|
A
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
M
A
 
A
V
 
V
M
 
Y
L
 
F
A
 
T
I
 
V
L
 
L
Q
 
E
P
 
H
G
 
G
D
 
D
K
 
T
I
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
M
D
 
N
L
 
L
S
 
S
H
 
H
G
 
G
G
|
G
H
|
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
V
N
 
N
F
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
V
L
 
Q
Y
 
Y
Q
 
N
P
 
F
L
 
V
F
 
A
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
E
 
D
K
 
P
E
 
E
T
 
T
G
 
H
L
 
V
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
K
 
D
K
 
D
L
 
V
E
 
R
E
 
E
V
 
K
A
 
A
L
 
R
A
 
L
E
 
H
K
 
R
P
 
P
K
 
K
L
 
L
I
 
I
I
 
V
C
 
A
G
 
A
A
 
A
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
R
 
R
E
 
I
W
 
I
D
 
D
Y
 
F
A
 
A
F
 
K
I
 
F
R
 
R
S
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
Y
V
 
L
L
 
M
A
 
V
D
|
D
I
 
M
S
x
A
H
|
H
P
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
H
A
 
P
N
 
N
P
 
P
L
 
V
P
 
P
H
 
Y
C
 
A
H
 
H
I
 
F
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
|
T
T
 
T
H
|
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
M
 
M
I
 
I
M
 
L
M
 
C
G
 
Q
Q
 
E
D
 
Q
F
 
F
E
 
-
N
 
-
P
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
-
S
 
A
N
 
K
L
 
Q
L
 
I
D
 
D
M
 
K
A
 
A
V
 
I
F
|
F
P
 
P
G
 
G
T
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
M
H
 
H
I
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
E
 
D
E
 
D
Y
 
F
G
 
K
T
 
A
Y
 
Y
I
 
A
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
A
 
V
A
 
D
N
 
N
A
 
A
Q
 
K
A
 
R
M
 
L
A
 
A
K
 
S
A
 
A
F
 
L
V
 
Q
A
 
N
K
 
E
G
 
G
Y
 
F
G
 
T
I
 
L
I
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
M
 
L
L
 
L
I
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
N
 
P
K
 
Q
N
 
Q
I
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
E
 
E
N
 
K
A
 
V
L
 
L
E
 
D
K
 
E
A
 
V
E
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
|
N
M
 
T
V
 
I
P
 
P
F
 
Y
D
 
D
D
 
P
K
 
E
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
|
R
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
F
K
 
G
E
 
L
T
 
E
E
 
E
M
 
M
E
 
D
K
 
E
I
 
I
V
 
A
D
 
A
L
 
I
I
 
I
D
 
G
Q
 
L
V
 
V
L
 
L
T
 
K
N
 
N
P
 
V
E
 
G
D
 
S
E
 
E
A
 
Q
N
 
A
L
 
L
N
 
E
S
 
E
V
 
A
K
 
R
A
 
Q
E
 
R
V
 
V
I
 
A
K
 
A
L
 
L

1kl1A Crystal structure of serine hydroxymethyltransferase complexed with glycine (see paper)
55% identity, 98% coverage: 3:415/423 of query aligns to 7:403/405 of 1kl1A

query
sites
1kl1A
R
 
Q
D
 
D
N
 
P
Q
 
Q
I
 
V
F
 
F
E
 
A
L
 
A
I
 
I
D
 
E
K
 
Q
E
 
E
L
 
R
N
 
K
R
 
R
Q
 
Q
E
 
H
H
 
A
G
 
K
L
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
R
Q
 
A
V
 
V
M
 
M
E
 
E
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
L
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
Q
 
E
V
 
Y
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
A
 
A
I
 
R
D
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
K
E
 
Q
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
E
W
 
H
V
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
|
S
G
|
G
A
|
A
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
M
A
 
A
V
 
V
M
 
Y
L
 
F
A
 
T
I
 
V
L
 
L
Q
 
E
P
 
H
G
 
G
D
 
D
K
 
T
I
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
M
D
 
N
L
 
L
S
 
S
H
 
H
G
 
G
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
V
N
 
N
F
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
V
L
 
Q
Y
 
Y
Q
 
N
P
 
F
L
 
V
F
 
A
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
E
 
D
K
 
P
E
 
E
T
 
T
G
 
H
L
 
V
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
K
 
D
K
 
D
L
 
V
E
 
R
E
 
E
V
 
K
A
 
A
L
 
R
A
 
L
E
 
H
K
 
R
P
 
P
K
 
K
L
 
L
I
 
I
I
 
V
C
 
A
G
 
A
A
|
A
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
R
 
R
E
 
I
W
 
I
D
 
D
Y
 
F
A
 
A
F
 
K
I
 
F
R
 
R
S
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
Y
V
 
L
L
 
M
A
 
V
D
|
D
I
 
M
S
x
A
H
|
H
P
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
H
A
 
P
N
 
N
P
 
P
L
 
V
P
 
P
H
 
Y
C
 
A
H
 
H
I
 
F
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
|
T
T
 
T
H
|
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
M
 
M
I
 
I
M
 
L
M
 
C
G
 
Q
Q
 
E
D
 
Q
F
 
F
E
 
-
N
 
-
P
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
-
S
 
A
N
 
K
L
 
Q
L
 
I
D
 
D
M
 
K
A
 
A
V
 
I
F
 
F
P
 
P
G
 
G
T
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
M
H
 
H
I
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
E
 
D
E
 
D
Y
 
F
G
 
K
T
 
A
Y
 
Y
I
 
A
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
A
 
V
A
 
D
N
 
N
A
 
A
Q
 
K
A
 
R
M
 
L
A
 
A
K
 
S
A
 
A
F
 
L
V
 
Q
A
 
N
K
 
E
G
 
G
Y
 
F
G
 
T
I
 
L
I
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
M
 
L
L
 
L
I
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
N
 
P
K
 
Q
N
 
Q
I
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
E
 
E
N
 
K
A
 
V
L
 
L
E
 
D
K
 
E
A
 
V
E
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
 
N
M
 
T
V
 
I
P
 
P
F
 
Y
D
 
D
D
 
P
K
 
E
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
|
R
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
F
K
 
G
E
 
L
T
 
E
E
 
E
M
 
M
E
 
D
K
 
E
I
 
I
V
 
A
D
 
A
L
 
I
I
 
I
D
 
G
Q
 
L
V
 
V
L
 
L
T
 
K
N
 
N
P
 
V
E
 
G
D
 
S
E
 
E
A
 
Q
N
 
A
L
 
L
N
 
E
S
 
E
V
 
A
K
 
R
A
 
Q
E
 
R
V
 
V
I
 
A
K
 
A
L
 
L

1kkpA Crystal structure of serine hydroxymethyltransferase complexed with serine (see paper)
55% identity, 98% coverage: 3:415/423 of query aligns to 7:403/405 of 1kkpA

query
sites
1kkpA
R
 
Q
D
 
D
N
 
P
Q
 
Q
I
 
V
F
 
F
E
 
A
L
 
A
I
 
I
D
 
E
K
 
Q
E
 
E
L
 
R
N
 
K
R
 
R
Q
 
Q
E
 
H
H
 
A
G
 
K
L
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
R
Q
 
A
V
 
V
M
 
M
E
 
E
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
L
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
Q
 
E
V
 
Y
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
A
 
A
I
 
R
D
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
K
E
 
Q
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
E
W
 
H
V
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
|
S
G
|
G
A
|
A
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
M
A
 
A
V
 
V
M
 
Y
L
 
F
A
 
T
I
 
V
L
 
L
Q
 
E
P
 
H
G
 
G
D
 
D
K
 
T
I
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
M
D
 
N
L
 
L
S
 
S
H
 
H
G
 
G
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
V
N
 
N
F
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
V
L
 
Q
Y
 
Y
Q
 
N
P
 
F
L
 
V
F
 
A
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
E
 
D
K
 
P
E
 
E
T
 
T
G
 
H
L
 
V
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
K
 
D
K
 
D
L
 
V
E
 
R
E
 
E
V
 
K
A
 
A
L
 
R
A
 
L
E
 
H
K
 
R
P
 
P
K
 
K
L
 
L
I
 
I
I
 
V
C
 
A
G
 
A
A
 
A
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
R
 
R
E
 
I
W
 
I
D
 
D
Y
 
F
A
 
A
F
 
K
I
 
F
R
 
R
S
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
Y
V
 
L
L
 
M
A
 
V
D
|
D
I
 
M
S
x
A
H
|
H
P
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
H
A
 
P
N
 
N
P
 
P
L
 
V
P
 
P
H
 
Y
C
 
A
H
 
H
I
 
F
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
|
T
T
 
T
H
 
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
M
 
M
I
 
I
M
 
L
M
 
C
G
 
Q
Q
 
E
D
 
Q
F
 
F
E
 
-
N
 
-
P
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
-
S
 
A
N
 
K
L
 
Q
L
 
I
D
 
D
M
 
K
A
 
A
V
 
I
F
 
F
P
 
P
G
 
G
T
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
M
H
 
H
I
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
E
 
D
E
 
D
Y
 
F
G
 
K
T
 
A
Y
 
Y
I
 
A
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
A
 
V
A
 
D
N
 
N
A
 
A
Q
 
K
A
 
R
M
 
L
A
 
A
K
 
S
A
 
A
F
 
L
V
 
Q
A
 
N
K
 
E
G
 
G
Y
 
F
G
 
T
I
 
L
I
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
M
 
L
L
 
L
I
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
N
 
P
K
 
Q
N
 
Q
I
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
E
 
E
N
 
K
A
 
V
L
 
L
E
 
D
K
 
E
A
 
V
E
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
 
N
M
 
T
V
 
I
P
 
P
F
 
Y
D
 
D
D
 
P
K
 
E
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
|
R
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
F
K
 
G
E
 
L
T
 
E
E
 
E
M
 
M
E
 
D
K
 
E
I
 
I
V
 
A
D
 
A
L
 
I
I
 
I
D
 
G
Q
 
L
V
 
V
L
 
L
T
 
K
N
 
N
P
 
V
E
 
G
D
 
S
E
 
E
A
 
Q
N
 
A
L
 
L
N
 
E
S
 
E
V
 
A
K
 
R
A
 
Q
E
 
R
V
 
V
I
 
A
K
 
A
L
 
L

1kkjA Crystal structure of serine hydroxymethyltransferase from b.Stearothermophilus (see paper)
55% identity, 98% coverage: 3:415/423 of query aligns to 7:403/405 of 1kkjA

query
sites
1kkjA
R
 
Q
D
 
D
N
 
P
Q
 
Q
I
 
V
F
 
F
E
 
A
L
 
A
I
 
I
D
 
E
K
 
Q
E
 
E
L
 
R
N
 
K
R
 
R
Q
 
Q
E
 
H
H
 
A
G
 
K
L
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
S
E
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
R
Q
 
A
V
 
V
M
 
M
E
 
E
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
L
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
Q
 
E
V
 
Y
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
A
 
A
I
 
R
D
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
K
E
 
Q
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
E
W
 
H
V
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
|
S
G
|
G
A
|
A
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
M
A
 
A
V
 
V
M
 
Y
L
 
F
A
 
T
I
 
V
L
 
L
Q
 
E
P
 
H
G
 
G
D
 
D
K
 
T
I
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
M
D
 
N
L
 
L
S
 
S
H
 
H
G
 
G
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
V
N
 
N
F
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
V
L
 
Q
Y
 
Y
Q
 
N
P
 
F
L
 
V
F
 
A
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
E
 
D
K
 
P
E
 
E
T
 
T
G
 
H
L
 
V
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
K
 
D
K
 
D
L
 
V
E
 
R
E
 
E
V
 
K
A
 
A
L
 
R
A
 
L
E
 
H
K
 
R
P
 
P
K
 
K
L
 
L
I
 
I
I
 
V
C
 
A
G
 
A
A
 
A
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
R
 
R
E
 
I
W
 
I
D
 
D
Y
 
F
A
 
A
F
 
K
I
 
F
R
 
R
S
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
Y
V
 
L
L
 
M
A
 
V
D
|
D
I
 
M
S
x
A
H
|
H
P
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
H
A
 
P
N
 
N
P
 
P
L
 
V
P
 
P
H
 
Y
C
 
A
H
 
H
I
 
F
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
|
T
T
 
T
H
|
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
M
 
M
I
 
I
M
 
L
M
 
C
G
 
Q
Q
 
E
D
 
Q
F
 
F
E
 
-
N
 
-
P
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
-
S
 
A
N
 
K
L
 
Q
L
 
I
D
 
D
M
 
K
A
 
A
V
 
I
F
 
F
P
 
P
G
 
G
T
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
M
H
 
H
I
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
E
 
D
E
 
D
Y
 
F
G
 
K
T
 
A
Y
 
Y
I
 
A
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
A
 
V
A
 
D
N
 
N
A
 
A
Q
 
K
A
 
R
M
 
L
A
 
A
K
 
S
A
 
A
F
 
L
V
 
Q
A
 
N
K
 
E
G
 
G
Y
 
F
G
 
T
I
 
L
I
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
M
 
L
L
 
L
I
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
N
 
P
K
 
Q
N
 
Q
I
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
E
 
E
N
 
K
A
 
V
L
 
L
E
 
D
K
 
E
A
 
V
E
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
 
N
M
 
T
V
 
I
P
 
P
F
 
Y
D
 
D
D
 
P
K
 
E
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
F
K
 
G
E
 
L
T
 
E
E
 
E
M
 
M
E
 
D
K
 
E
I
 
I
V
 
A
D
 
A
L
 
I
I
 
I
D
 
G
Q
 
L
V
 
V
L
 
L
T
 
K
N
 
N
P
 
V
E
 
G
D
 
S
E
 
E
A
 
Q
N
 
A
L
 
L
N
 
E
S
 
E
V
 
A
K
 
R
A
 
Q
E
 
R
V
 
V
I
 
A
K
 
A
L
 
L

2vmyA Crystal structure of f351gbsshmt in complex with gly and fthf (see paper)
55% identity, 98% coverage: 3:415/423 of query aligns to 7:403/405 of 2vmyA

query
sites
2vmyA
R
 
Q
D
 
D
N
 
P
Q
 
Q
I
 
V
F
 
F
E
 
A
L
 
A
I
 
I
D
 
E
K
 
Q
E
 
E
L
 
R
N
 
K
R
 
R
Q
 
Q
E
 
H
H
 
A
G
 
K
L
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
R
Q
 
A
V
 
V
M
 
M
E
 
E
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
L
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Y
|
Y
Y
|
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
Q
 
E
V
 
Y
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
A
 
A
I
 
R
D
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
K
E
 
Q
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
E
W
 
H
V
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
|
S
G
|
G
A
|
A
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
M
A
 
A
V
 
V
M
 
Y
L
 
F
A
 
T
I
 
V
L
 
L
Q
 
E
P
 
H
G
 
G
D
 
D
K
 
T
I
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
M
D
 
N
L
|
L
S
 
S
H
 
H
G
 
G
G
|
G
H
|
H
L
|
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
V
N
 
N
F
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
V
L
 
Q
Y
 
Y
Q
 
N
P
 
F
L
 
V
F
 
A
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
E
 
D
K
 
P
E
 
E
T
 
T
G
 
H
L
 
V
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
K
 
D
K
 
D
L
 
V
E
 
R
E
 
E
V
 
K
A
 
A
L
 
R
A
 
L
E
 
H
K
 
R
P
 
P
K
 
K
L
 
L
I
 
I
I
 
V
C
 
A
G
 
A
A
 
A
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
R
 
R
E
 
I
W
 
I
D
 
D
Y
 
F
A
 
A
F
 
K
I
 
F
R
 
R
S
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
Y
V
 
L
L
 
M
A
 
V
D
|
D
I
 
M
S
x
A
H
|
H
P
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
H
A
 
P
N
 
N
P
 
P
L
 
V
P
 
P
H
 
Y
C
 
A
H
 
H
I
 
F
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
|
T
T
 
T
H
 
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
M
 
M
I
 
I
M
 
L
M
 
C
G
 
Q
Q
 
E
D
 
Q
F
 
F
E
 
-
N
 
-
P
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
-
S
 
A
N
 
K
L
 
Q
L
 
I
D
 
D
M
x
K
A
 
A
V
 
I
F
|
F
P
 
P
G
 
G
T
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
|
G
P
 
P
L
 
L
E
 
M
H
 
H
I
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
E
 
D
E
 
D
Y
 
F
G
 
K
T
 
A
Y
 
Y
I
 
A
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
A
 
V
A
 
D
N
 
N
A
 
A
Q
 
K
A
 
R
M
 
L