SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CA265_RS19325 FitnessBrowser__Pedo557:CA265_RS19325 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1h5sB Thymidylyltransferase complexed with tmp (see paper)
67% identity, 100% coverage: 2:286/286 of query aligns to 5:290/291 of 1h5sB

query
sites
1h5sB
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
|
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
Y
P
 
P
L
 
V
T
 
T
L
 
M
A
 
A
C
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
M
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
I
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
R
E
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
S
 
Q
L
 
W
G
 
G
C
 
L
K
 
N
F
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
K
V
 
V
Q
|
Q
A
 
P
E
 
S
P
|
P
N
x
D
G
|
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
K
 
G
D
 
D
K
 
D
V
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
H
x
Y
S
x
G
D
x
H
G
x
D
L
 
L
A
 
P
K
 
K
L
 
L
L
 
M
Q
 
E
A
 
A
S
 
A
S
 
V
D
 
N
P
 
K
D
 
E
-
 
S
G
 
G
G
 
A
V
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
A
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
G
 
K
S
 
N
N
 
G
K
 
T
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
P
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
E
 
D
V
 
V
V
 
V
E
 
Q
I
 
M
A
 
A
K
 
K
N
 
N
I
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
I
N
 
N
R
 
R
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
K
 
R
L
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
A
V
 
L
L
 
M
S
x
G
R
|
R
G
|
G
T
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
H
T
 
Q
S
 
S
L
 
L
M
 
I
Q
 
E
A
 
A
G
 
S
Q
 
N
F
 
F
V
 
I
Q
 
A
I
 
T
I
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
V
G
x
S
C
 
C
I
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
Y
 
F
R
|
R
M
 
K
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
D
A
 
V
E
 
E
Q
 
Q
L
 
V
R
 
R
A
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
I
K
 
K
S
 
N
G
 
N
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
L
 
Y
K
 
K
Q
 
Q
I
 
T
K
 
K

1h5tA Thymidylyltransferase complexed with thymidylyldiphosphate-glucose (see paper)
66% identity, 100% coverage: 2:286/286 of query aligns to 4:289/290 of 1h5tA

query
sites
1h5tA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
Y
P
 
P
L
 
V
T
 
T
L
 
M
A
 
A
C
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
M
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
I
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
R
E
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
S
 
Q
L
 
W
G
 
G
C
 
L
K
 
N
F
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
K
V
 
V
Q
|
Q
A
 
P
E
 
S
P
|
P
N
 
D
G
|
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
K
 
G
D
 
D
K
 
D
V
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
|
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
H
x
Y
S
x
G
D
x
H
G
x
D
L
 
L
A
 
P
K
 
K
L
 
L
L
 
M
Q
 
E
A
 
A
S
 
A
S
 
V
D
 
N
P
 
K
D
 
E
-
 
S
G
 
G
G
 
A
V
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
A
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
G
 
K
S
 
N
N
 
G
K
 
T
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
V
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
|
V
P
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
E
 
D
V
 
V
V
 
V
E
 
Q
I
 
M
A
 
A
K
 
K
N
 
N
I
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
A
R
|
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
I
N
 
N
R
 
R
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
K
 
R
L
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
A
V
 
M
L
 
M
S
 
G
R
|
R
G
|
G
T
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
H
T
 
Q
S
 
S
L
 
L
M
 
I
Q
 
E
A
 
A
G
 
S
Q
 
N
F
 
F
V
 
I
Q
 
A
I
 
T
I
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
G
x
S
C
 
C
I
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
Y
 
F
R
 
R
M
 
K
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
D
A
 
V
E
 
E
Q
 
Q
L
 
V
R
 
R
A
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
I
K
 
K
S
 
N
G
 
N
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
L
 
Y
K
 
K
Q
 
M
I
 
T
K
 
K

1h5rA Thymidylyltransferase complexed with thimidine and glucose-1-phospate (see paper)
66% identity, 100% coverage: 2:286/286 of query aligns to 4:289/290 of 1h5rA

query
sites
1h5rA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
|
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
Y
P
 
P
L
 
V
T
 
T
L
 
M
A
 
A
C
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
M
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
I
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
R
E
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
S
 
Q
L
 
W
G
 
G
C
 
L
K
 
N
F
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
K
V
 
V
Q
|
Q
A
 
P
E
 
S
P
|
P
N
 
D
G
|
G
L
|
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
K
 
G
D
 
D
K
 
D
V
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
H
x
Y
S
x
G
D
 
H
G
 
D
L
 
L
A
 
P
K
 
K
L
 
L
L
 
M
Q
 
E
A
 
A
S
 
A
S
 
V
D
 
N
P
 
K
D
 
E
-
 
S
G
 
G
G
 
A
V
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
A
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
G
 
K
S
 
N
N
 
G
K
 
T
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
V
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
|
V
P
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
E
 
D
V
 
V
V
 
V
E
 
Q
I
 
M
A
 
A
K
 
K
N
 
N
I
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
I
N
 
N
R
 
R
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
K
 
R
L
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
A
V
 
M
L
 
M
S
 
G
R
 
R
G
 
G
T
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
H
T
 
Q
S
 
S
L
 
L
M
 
I
Q
 
E
A
 
A
G
 
S
Q
 
N
F
 
F
V
 
I
Q
 
A
I
 
T
I
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
G
x
S
C
 
C
I
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
Y
 
F
R
 
R
M
 
K
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
D
A
 
V
E
 
E
Q
 
Q
L
 
V
R
 
R
A
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
I
K
 
K
S
 
N
G
 
N
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
L
 
Y
K
 
K
Q
 
M
I
 
T
K
 
K

P26393 Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase; dTDP-glucose pyrophosphorylase; Ep; dTDP-glucose synthase; EC 2.7.7.24 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
66% identity, 100% coverage: 2:286/286 of query aligns to 5:290/292 of P26393

query
sites
P26393
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
Y
P
 
P
L
 
V
T
 
T
L
 
M
A
 
A
C
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
M
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
I
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
R
E
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
S
 
Q
L
 
W
G
 
G
C
 
L
K
 
N
F
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
K
V
 
V
Q
 
Q
A
 
P
E
 
S
P
 
P
N
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
K
 
H
D
 
D
K
 
D
V
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
H
 
Y
S
 
G
D
 
H
G
 
D
L
 
L
A
 
P
K
 
K
L
 
L
L
 
M
Q
 
E
A
 
A
S
 
A
S
 
V
D
 
N
P
 
K
D
 
E
-
 
S
G
 
G
G
 
A
V
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
A
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
G
 
Q
S
 
K
N
 
G
K
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
L
Q
 
Q
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
P
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
E
 
S
V
 
V
V
 
V
E
 
E
I
 
M
A
 
A
K
 
K
N
 
N
I
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
L
E
 
E
I
 
I
T
|
T
D
 
D
V
 
I
N
 
N
R
 
R
V
 
I
Y
 
Y
L
 
M
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
K
 
R
L
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
A
V
 
M
L
 
M
S
 
G
R
 
R
G
 
G
T
 
Y
A
 
A
W
|
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
H
T
 
Q
S
 
S
L
 
L
M
 
I
Q
 
E
A
 
A
G
 
S
Q
 
N
F
 
F
V
 
I
Q
 
A
I
 
T
I
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
V
G
 
S
C
 
C
I
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
Y
 
F
R
 
R
M
 
K
G
 
N
F
 
F
I
 
I
D
 
N
A
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
L
 
V
R
 
I
A
 
E
I
 
L
A
 
A
T
 
G
P
 
P
L
 
L
V
 
S
K
 
K
S
 
N
G
 
D
Y
 
Y
G
 
G
S
 
K
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
K
 
K
Q
 
M
I
 
V
K
 
K

4b2xB Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
68% identity, 98% coverage: 2:281/286 of query aligns to 13:293/302 of 4b2xB

query
sites
4b2xB
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
C
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
M
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
S
 
N
L
 
W
G
 
G
C
 
L
K
 
D
F
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
A
 
P
E
 
S
P
 
P
N
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
K
 
N
D
 
D
K
 
L
V
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
H
 
Y
S
 
G
D
 
H
G
 
D
L
 
F
A
 
H
K
 
E
L
 
L
L
 
L
-
 
G
Q
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
Q
D
 
R
P
 
Q
D
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
A
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
G
 
Q
S
 
G
N
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
P
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
I
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
E
V
 
I
L
 
M
S
 
G
R
 
R
G
 
G
T
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
H
T
 
D
S
 
S
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
Q
 
A
I
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
V
G
 
A
C
 
C
I
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
M
x
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
R
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

4arwA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
68% identity, 98% coverage: 2:281/286 of query aligns to 5:285/294 of 4arwA

query
sites
4arwA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
C
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
M
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
S
 
N
L
 
W
G
 
G
C
 
L
K
 
D
F
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
A
 
P
E
 
S
P
 
P
N
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
K
 
N
D
 
D
K
 
L
V
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
H
x
Y
S
x
G
D
 
H
G
 
D
L
 
F
A
 
H
K
 
E
L
 
L
L
 
L
-
 
G
Q
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
Q
D
 
R
P
 
Q
D
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
A
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
G
 
Q
S
 
G
N
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
P
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
I
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
E
V
 
I
L
 
M
S
 
G
R
 
R
G
 
G
T
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
H
T
 
D
S
 
S
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
Q
 
A
I
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
G
x
A
C
 
C
I
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
M
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
R
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

5fuhA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
68% identity, 98% coverage: 2:281/286 of query aligns to 9:289/298 of 5fuhA

query
sites
5fuhA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
C
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
M
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
|
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
S
 
N
L
 
W
G
 
G
C
 
L
K
 
D
F
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
A
 
P
E
 
S
P
 
P
N
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
K
 
N
D
 
D
K
 
L
V
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
H
 
Y
S
x
G
D
 
H
G
 
D
L
x
F
A
 
H
K
 
E
L
 
L
L
 
L
-
 
G
Q
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
Q
D
 
R
P
 
Q
D
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
A
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
G
 
Q
S
 
G
N
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
P
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
I
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
E
V
 
I
L
 
M
S
 
G
R
 
R
G
 
G
T
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
H
T
 
D
S
 
S
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
Q
 
A
I
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
V
G
x
A
C
 
C
I
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
R
|
R
M
x
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
R
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

4b4bA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
68% identity, 98% coverage: 2:281/286 of query aligns to 9:289/298 of 4b4bA

query
sites
4b4bA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
C
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
M
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
S
 
N
L
 
W
G
 
G
C
 
L
K
 
D
F
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
A
 
P
E
 
S
P
 
P
N
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
K
 
N
D
 
D
K
 
L
V
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
 
Y
H
 
Y
S
 
G
D
 
H
G
 
D
L
 
F
A
 
H
K
 
E
L
 
L
L
 
L
-
 
G
Q
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
Q
D
 
R
P
 
Q
D
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
A
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
G
 
Q
S
 
G
N
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
P
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
I
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
E
V
 
I
L
 
M
S
 
G
R
 
R
G
 
G
T
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
H
T
 
D
S
 
S
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
Q
 
A
I
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
G
x
A
C
 
C
I
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
Y
 
Y
R
|
R
M
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
R
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

4b4mA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
68% identity, 98% coverage: 2:281/286 of query aligns to 7:287/296 of 4b4mA

query
sites
4b4mA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
C
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
M
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
S
 
N
L
 
W
G
 
G
C
 
L
K
 
D
F
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
A
 
P
E
 
S
P
 
P
N
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
K
 
N
D
 
D
K
 
L
V
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
H
 
Y
S
x
G
D
 
H
G
 
D
L
 
F
A
 
H
K
 
E
L
 
L
L
 
L
-
 
G
Q
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
Q
D
 
R
P
 
Q
D
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
A
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
G
 
Q
S
 
G
N
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
P
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
I
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
E
V
 
I
L
 
M
S
 
G
R
 
R
G
 
G
T
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
H
T
 
D
S
 
S
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
Q
 
A
I
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
G
x
A
C
 
C
I
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
Y
 
Y
R
|
R
M
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
R
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

5fyeA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
68% identity, 98% coverage: 2:281/286 of query aligns to 7:287/296 of 5fyeA

query
sites
5fyeA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
C
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
M
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
S
 
N
L
 
W
G
 
G
C
 
L
K
 
D
F
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
A
 
P
E
 
S
P
 
P
N
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
K
 
N
D
 
D
K
 
L
V
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
H
 
Y
S
x
G
D
 
H
G
 
D
L
 
F
A
 
H
K
 
E
L
 
L
L
 
L
-
 
G
Q
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
Q
D
 
R
P
 
Q
D
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
A
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
G
 
Q
S
 
G
N
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
P
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
I
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
E
V
 
I
L
 
M
S
 
G
R
 
R
G
 
G
T
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
H
T
 
D
S
 
S
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
Q
 
A
I
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
G
x
A
C
 
C
I
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
R
|
R
M
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
R
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

5fu0A Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
68% identity, 98% coverage: 2:281/286 of query aligns to 7:287/296 of 5fu0A

query
sites
5fu0A
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
C
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
M
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
S
 
N
L
 
W
G
 
G
C
 
L
K
 
D
F
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
A
 
P
E
 
S
P
 
P
N
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
K
 
N
D
 
D
K
 
L
V
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
H
x
Y
S
x
G
D
 
H
G
 
D
L
 
F
A
x
H
K
 
E
L
 
L
L
 
L
-
 
G
Q
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
Q
D
 
R
P
 
Q
D
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
A
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
G
 
Q
S
 
G
N
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
P
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
I
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
E
V
 
I
L
 
M
S
 
G
R
 
R
G
 
G
T
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
H
T
 
D
S
 
S
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
Q
 
A
I
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
G
x
A
C
 
C
I
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
M
x
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
R
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

5ftvA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
68% identity, 98% coverage: 2:281/286 of query aligns to 7:287/296 of 5ftvA

query
sites
5ftvA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
C
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
M
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
S
 
N
L
 
W
G
 
G
C
 
L
K
 
D
F
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
A
 
P
E
 
S
P
 
P
N
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
K
 
N
D
 
D
K
 
L
V
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
H
x
Y
S
x
G
D
 
H
G
 
D
L
x
F
A
 
H
K
 
E
L
 
L
L
 
L
-
 
G
Q
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
Q
D
 
R
P
 
Q
D
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
A
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
G
 
Q
S
 
G
N
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
P
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
I
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
E
V
 
I
L
 
M
S
 
G
R
 
R
G
 
G
T
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
H
T
 
D
S
 
S
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
Q
 
A
I
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
G
x
A
C
 
C
I
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
R
|
R
M
x
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
R
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

5ftsA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
68% identity, 98% coverage: 2:281/286 of query aligns to 7:287/296 of 5ftsA

query
sites
5ftsA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
C
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
M
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
S
 
N
L
 
W
G
 
G
C
 
L
K
 
D
F
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
A
 
P
E
 
S
P
 
P
N
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
K
 
N
D
 
D
K
 
L
V
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
H
 
Y
S
x
G
D
 
H
G
 
D
L
 
F
A
x
H
K
 
E
L
 
L
L
 
L
-
 
G
Q
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
Q
D
 
R
P
 
Q
D
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
A
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
G
 
Q
S
 
G
N
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
P
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
I
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
E
V
 
I
L
 
M
S
 
G
R
 
R
G
 
G
T
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
H
T
 
D
S
 
S
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
Q
 
A
I
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
G
x
A
C
 
C
I
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
M
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
R
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

3zllA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
68% identity, 98% coverage: 2:281/286 of query aligns to 8:288/297 of 3zllA

query
sites
3zllA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
C
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
M
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
S
 
N
L
 
W
G
 
G
C
 
L
K
 
D
F
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
A
 
P
E
 
S
P
 
P
N
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
K
 
N
D
 
D
K
 
L
V
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
 
Y
H
 
Y
S
 
G
D
 
H
G
 
D
L
 
F
A
 
H
K
 
E
L
 
L
L
 
L
-
 
G
Q
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
Q
D
 
R
P
 
Q
D
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
A
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
G
 
Q
S
 
G
N
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
P
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
I
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
E
V
 
I
L
 
M
S
 
G
R
 
R
G
 
G
T
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
H
T
 
D
S
 
S
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
Q
 
A
I
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
V
G
 
A
C
 
C
I
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
Y
 
Y
R
|
R
M
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
R
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

3zlkA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
68% identity, 98% coverage: 2:281/286 of query aligns to 8:288/297 of 3zlkA

query
sites
3zlkA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
C
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
M
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
S
 
N
L
 
W
G
 
G
C
 
L
K
 
D
F
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
A
 
P
E
 
S
P
 
P
N
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
K
 
N
D
 
D
K
 
L
V
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
H
x
Y
S
x
G
D
 
H
G
 
D
L
 
F
A
 
H
K
 
E
L
 
L
L
 
L
-
 
G
Q
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
Q
D
 
R
P
 
Q
D
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
A
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
G
 
Q
S
 
G
N
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
P
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
I
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
E
V
 
I
L
 
M
S
 
G
R
 
R
G
 
G
T
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
H
T
 
D
S
 
S
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
Q
 
A
I
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
G
x
A
C
 
C
I
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
M
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
R
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

5fu8A Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
68% identity, 98% coverage: 2:281/286 of query aligns to 8:288/297 of 5fu8A

query
sites
5fu8A
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
C
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
M
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
S
 
N
L
 
W
G
 
G
C
 
L
K
 
D
F
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
A
 
P
E
 
S
P
 
P
N
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
K
 
N
D
 
D
K
 
L
V
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
H
x
Y
S
x
G
D
 
H
G
 
D
L
 
F
A
x
H
K
 
E
L
 
L
L
 
L
-
 
G
Q
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
Q
D
 
R
P
 
Q
D
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
A
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
G
 
Q
S
 
G
N
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
P
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
I
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
E
V
 
I
L
 
M
S
 
G
R
 
R
G
 
G
T
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
H
T
 
D
S
 
S
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
Q
 
A
I
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
G
 
A
C
 
C
I
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
R
|
R
M
x
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
R
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

4b2wA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
68% identity, 98% coverage: 2:281/286 of query aligns to 8:288/297 of 4b2wA

query
sites
4b2wA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
C
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
M
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
S
 
N
L
 
W
G
 
G
C
 
L
K
 
D
F
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
A
 
P
E
 
S
P
 
P
N
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
K
 
N
D
 
D
K
 
L
V
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
 
Y
H
 
Y
S
 
G
D
 
H
G
 
D
L
 
F
A
 
H
K
 
E
L
 
L
L
 
L
-
 
G
Q
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
Q
D
 
R
P
 
Q
D
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
A
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
G
 
Q
S
 
G
N
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
P
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
I
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
E
V
 
I
L
 
M
S
 
G
R
 
R
G
 
G
T
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
H
T
 
D
S
 
S
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
Q
 
A
I
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
V
G
 
A
C
 
C
I
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
Y
 
Y
R
|
R
M
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
R
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

4asjA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
68% identity, 98% coverage: 2:281/286 of query aligns to 3:283/292 of 4asjA

query
sites
4asjA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
C
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
M
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
S
 
N
L
 
W
G
 
G
C
 
L
K
 
D
F
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
A
 
P
E
 
S
P
 
P
N
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
K
 
N
D
 
D
K
 
L
V
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
H
 
Y
S
x
G
D
 
H
G
 
D
L
x
F
A
 
H
K
 
E
L
 
L
L
 
L
-
 
G
Q
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
Q
D
 
R
P
 
Q
D
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
A
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
G
 
Q
S
 
G
N
 
G
K
 
K
A
|
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
P
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
I
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
K
 
S
V
|
V
G
 
E
V
 
I
L
 
M
S
 
G
R
 
R
G
 
G
T
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
H
T
 
D
S
 
S
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
Q
 
A
I
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
G
 
A
C
 
C
I
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
M
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
R
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

1g3lA The structural basis of the catalytic mechanism and regulation of glucose-1-phosphate thymidylyltransferase (rmla). Tdp-l-rhamnose complex. (see paper)
68% identity, 98% coverage: 2:281/286 of query aligns to 3:283/292 of 1g3lA

query
sites
1g3lA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
|
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
C
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
M
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
S
 
N
L
 
W
G
 
G
C
 
L
K
 
D
F
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
|
Q
A
 
P
E
 
S
P
|
P
N
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
K
 
N
D
 
D
K
 
L
V
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
L
F
 
Y
H
x
Y
S
x
G
D
x
H
G
x
D
L
x
F
A
x
H
K
 
E
L
 
L
L
 
L
-
 
G
Q
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
Q
D
 
R
P
 
Q
D
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
A
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
G
 
Q
S
 
G
N
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
V
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
|
V
P
x
T
G
|
G
L
 
L
Y
|
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
I
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
|
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
E
V
 
I
L
 
M
S
x
G
R
|
R
G
|
G
T
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
H
T
 
D
S
 
S
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
Q
 
A
I
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
V
G
 
A
C
 
C
I
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
Y
 
Y
R
|
R
M
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
R
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

1g2vA The structural basis of the catalytic mechanism and regulation of glucose-1-phosphate thymidylyltransferase (rmla). Ttp complex. (see paper)
68% identity, 98% coverage: 2:281/286 of query aligns to 3:283/292 of 1g2vA

query
sites
1g2vA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
|
A
G
|
G
G
|
G
S
 
S
G
|
G
T
|
T
R
|
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
C
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
|
Q
M
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
S
 
N
L
 
W
G
 
G
C
 
L
K
 
D
F
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
|
Q
A
 
P
E
 
S
P
|
P
N
 
D
G
 
G
L
|
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
K
 
N
D
 
D
K
 
L
V
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
L
F
 
Y
H
x
Y
S
x
G
D
x
H
G
x
D
L
x
F
A
x
H
K
 
E
L
 
L
L
 
L
-
 
G
Q
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
Q
D
 
R
P
 
Q
D
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
A
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
G
 
Q
S
 
G
N
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
P
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
I
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
E
V
 
I
L
 
M
S
x
G
R
|
R
G
|
G
T
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
H
T
 
D
S
 
S
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
Q
 
A
I
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
V
G
 
A
C
 
C
I
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
M
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
R
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

Query Sequence

>CA265_RS19325 FitnessBrowser__Pedo557:CA265_RS19325
MKGIILAGGSGTRLHPLTLACSKQMMPVYDKPMIYYPLSTLMLAGIKEILIISTPHDLPN
FQKLLGDGTSLGCKFSYAVQAEPNGLAQAFVIGEEFIGKDKVALVLGDNIFHSDGLAKLL
QASSDPDGGVVFAYQVADPERYGVVEFDGSNKAISIEEKPVQPKSSYAVPGLYFYDNEVV
EIAKNIKPSPRGEYEITDVNRVYLERGKLKVGVLSRGTAWLDTGTFTSLMQAGQFVQIIE
ERQGLKIGCIEEIAYRMGFIDAEQLRAIATPLVKSGYGSYLLKQIK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory