SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CA265_RS20015 FitnessBrowser__Pedo557:CA265_RS20015 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P00962 Glutamine--tRNA ligase; Glutaminyl-tRNA synthetase; GlnRS; EC 6.1.1.18 from Escherichia coli (strain K12) (see 7 papers)
58% identity, 99% coverage: 2:549/551 of query aligns to 4:551/554 of P00962

query
sites
P00962
S
 
A
E
 
E
E
 
A
K
 
R
S
 
P
L
 
T
N
 
N
F
 
F
I
 
I
E
 
R
E
 
Q
I
 
I
V
 
I
E
 
D
N
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
A
S
 
S
G
 
G
K
 
K
Y
 
H
E
 
T
T
 
T
L
 
V
V
 
H
T
 
T
R
|
R
F
 
F
P
 
P
P
 
P
E
|
E
P
|
P
N
|
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
|
H
I
|
I
G
|
G
H
|
H
A
|
A
K
|
K
A
x
S
I
 
I
C
 
C
L
 
L
N
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
I
T
 
A
Q
 
Q
K
 
D
Y
 
Y
G
 
K
G
 
G
Y
 
Q
T
 
C
N
 
N
L
 
L
R
 
R
F
 
F
D
|
D
D
 
D
T
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
V
T
 
K
E
 
E
K
 
D
T
 
I
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
N
 
E
S
 
S
Q
 
I
Q
 
K
E
 
N
D
 
D
I
 
V
R
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
F
 
F
N
 
H
W
 
W
K
 
S
-
 
G
N
 
N
E
 
V
L
 
R
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
E
 
Q
L
 
L
Y
 
H
G
 
A
F
 
Y
A
 
A
V
 
I
K
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
N
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
L
S
 
T
A
 
P
D
 
E
E
 
Q
I
 
I
A
 
R
A
 
E
L
 
Y
K
 
R
G
 
G
T
 
T
P
 
L
T
 
T
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
Q
 
K
D
 
N
S
 
S
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
S
 
D
R
 
R
S
 
S
I
 
V
E
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
D
 
A
I
 
L
F
 
F
T
 
E
K
 
K
M
 
M
K
 
R
N
 
A
G
 
G
E
 
G
F
 
F
A
 
E
D
 
E
G
 
G
A
 
K
Y
 
A
I
 
C
L
 
L
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
D
M
 
M
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
F
M
 
I
L
 
V
M
 
M
R
 
R
D
 
D
P
 
P
I
 
V
I
 
L
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
K
 
K
H
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
H
H
 
H
R
 
Q
T
 
T
G
 
G
N
 
N
K
 
K
W
 
W
C
 
C
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
 
M
Y
|
Y
D
 
D
F
 
F
A
 
T
H
 
H
G
 
C
Q
 
I
S
 
S
D
 
D
S
 
A
I
 
L
E
 
E
N
 
G
I
 
I
T
 
T
H
 
H
S
 
S
I
 
L
C
|
C
T
|
T
L
 
L
E
 
E
Y
 
F
V
 
Q
S
 
D
H
 
N
R
 
R
E
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
W
 
W
F
 
V
I
 
L
E
 
D
K
 
N
L
 
I
E
 
T
I
 
I
-
 
P
F
 
V
P
 
H
S
 
P
K
 
R
Q
|
Q
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
A
 
S
R
|
R
L
|
L
N
 
N
L
 
L
T
 
E
S
 
Y
T
 
T
V
 
V
M
|
M
S
|
S
K
|
K
R
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
N
Q
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
T
E
 
D
N
 
K
L
 
H
V
 
V
N
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
T
 
T
P
 
A
K
 
A
S
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
C
E
 
K
R
 
R
I
 
I
G
 
G
I
 
V
A
x
T
K
|
K
R
x
Q
E
x
D
N
|
N
L
x
T
I
|
I
E
|
E
L
 
M
S
 
A
L
 
S
L
 
L
E
 
E
F
 
S
C
 
C
I
 
I
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
N
K
 
E
T
 
N
A
 
A
N
 
P
R
 
R
V
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
I
D
 
D
P
 
P
I
 
V
K
 
K
L
 
L
V
 
V
I
 
I
T
 
E
N
 
N
Y
 
Y
E
 
Q
K
 
G
G
 
E
T
 
G
E
 
E
D
 
M
L
 
V
I
 
T
G
 
M
E
 
P
N
 
N
N
 
H
P
 
P
E
 
N
A
 
K
E
 
P
D
 
E
G
 
-
G
 
M
G
 
G
T
 
S
R
 
R
V
 
Q
I
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
N
 
G
E
 
E
L
 
I
W
 
W
I
 
I
E
 
D
R
 
R
E
 
A
D
 
D
F
 
F
M
 
R
E
 
E
V
 
E
P
 
A
A
 
N
K
 
K
K
 
Q
W
 
Y
F
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
V
P
 
L
G
 
G
A
 
K
M
 
E
V
 
V
R
 
R
L
 
L
K
 
R
F
 
N
A
 
A
Y
 
Y
I
 
V
V
 
I
K
 
K
C
 
A
E
 
E
D
 
R
F
 
V
V
 
E
K
 
K
D
 
D
E
 
A
N
 
E
G
 
G
N
 
N
V
 
I
T
 
T
E
 
T
I
 
I
R
 
F
C
 
C
T
 
T
Y
 
Y
I
 
D
P
 
A
E
 
D
S
 
T
K
 
L
S
 
S
G
 
K
N
 
D
D
 
P
T
 
A
S
 
D
G
 
G
I
 
R
N
 
K
V
 
V
K
 
K
G
 
G
T
 
V
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
A
H
 
H
A
 
A
K
 
L
T
 
P
A
 
V
E
 
E
I
 
I
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
L
F
 
F
T
 
S
S
 
V
E
 
P
T
 
N
P
 
P
D
 
G
A
 
A
E
 
A
E
 
D
G
 
-
D
 
D
F
 
F
K
 
L
D
 
S
Y
 
V
L
 
I
N
 
N
P
 
P
E
 
E
S
 
S
L
 
L
T
 
-
V
 
V
L
 
I
P
 
K
N
 
Q
V
 
G
Y
 
F
I
 
A
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
A
D
 
V
L
 
A
E
 
G
S
 
K
R
 
A
Y
 
F
Q
 
Q
F
 
F
I
 
E
R
 
R
K
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
C
 
C
L
 
L
D
 
D
-
 
S
K
 
R
D
 
H
S
 
S
T
 
T
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
P
V
 
V
F
 
F
N
 
N
R
 
R
T
 
T
V
 
V
T
 
G
L
 
L
K
 
R
D
 
D
T
 
T
F
 
W
K
 
A
K
 
K

Sites not aligning to the query:

4jyzA Crystal structure of e. Coli glutaminyl-tRNA synthetase bound to atp and native tRNA(gln) containing the cmnm5s2u34 anticodon wobble base (see paper)
58% identity, 98% coverage: 8:547/551 of query aligns to 3:542/542 of 4jyzA

query
sites
4jyzA
N
 
N
F
 
F
I
 
I
E
 
R
E
x
Q
I
 
I
V
 
I
E
 
D
N
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
A
S
 
S
G
 
G
K
 
K
Y
 
H
E
 
T
T
 
T
L
 
V
V
 
H
T
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
P
P
 
P
E
|
E
P
 
P
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
|
H
I
 
I
G
|
G
H
|
H
A
 
A
K
 
K
A
x
S
I
 
I
C
 
C
L
 
L
N
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
I
T
 
A
Q
 
Q
K
 
D
Y
 
Y
G
 
K
G
 
G
Y
 
Q
T
 
C
N
 
N
L
 
L
R
 
R
F
 
F
D
 
D
D
 
D
T
|
T
N
|
N
P
 
P
V
 
V
T
 
K
E
 
E
K
 
D
T
 
I
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
N
 
E
S
 
S
Q
 
I
Q
 
K
E
 
N
D
 
D
I
 
V
R
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
F
 
F
N
 
H
W
 
W
K
 
S
-
 
G
N
 
N
E
 
V
L
 
R
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
E
 
Q
L
 
L
Y
 
H
G
 
A
F
 
Y
A
 
A
V
 
I
K
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
N
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
L
S
 
T
A
x
P
D
 
E
E
 
Q
I
 
I
A
x
R
A
 
E
L
 
Y
K
x
R
G
 
G
T
|
T
P
x
L
T
 
T
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
Q
 
K
D
 
N
S
 
S
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
S
 
D
R
 
R
S
 
S
I
 
V
E
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
D
 
A
I
 
L
F
 
F
T
 
E
K
 
K
M
 
M
K
 
R
N
 
A
G
 
G
E
 
G
F
 
F
A
 
E
D
 
E
G
|
G
A
 
K
Y
 
A
I
x
C
L
 
L
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
D
M
 
M
A
 
A
S
 
S
P
|
P
N
x
F
M
x
I
L
 
V
M
 
M
R
 
R
D
 
D
P
 
P
I
x
V
I
 
L
Y
 
Y
R
|
R
I
 
I
K
|
K
H
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
H
H
 
H
R
 
Q
T
 
T
G
 
G
N
 
N
K
 
K
W
 
W
C
 
C
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
|
M
Y
|
Y
D
 
D
F
 
F
A
 
T
H
 
H
G
 
C
Q
 
I
S
 
S
D
 
D
S
 
A
I
 
L
E
 
E
N
 
G
I
 
I
T
 
T
H
 
H
S
 
S
I
 
L
C
 
C
T
|
T
L
 
L
E
 
E
Y
x
F
V
x
Q
S
x
D
H
 
N
R
 
R
E
x
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
W
 
W
F
 
V
I
 
L
E
 
D
K
 
N
L
 
I
E
 
T
I
 
I
-
 
P
F
 
V
P
 
H
S
 
P
K
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
A
 
S
R
|
R
L
|
L
N
 
N
L
 
L
T
 
E
S
 
Y
T
 
T
V
 
V
M
|
M
S
 
S
K
|
K
R
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
N
Q
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
T
E
 
D
N
 
K
L
 
H
V
 
V
N
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
T
 
T
P
 
A
K
 
A
S
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
C
E
 
K
R
 
R
I
|
I
G
 
G
I
 
V
A
x
T
K
|
K
R
x
Q
E
x
D
N
|
N
L
x
T
I
 
I
E
|
E
L
 
M
S
x
A
L
x
S
L
 
L
E
 
E
F
x
S
C
 
C
I
 
I
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
|
N
K
 
E
T
 
N
A
 
A
N
 
P
R
|
R
V
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
I
D
 
D
P
 
P
I
 
V
K
 
K
L
 
L
V
 
V
I
 
I
T
 
E
N
 
N
Y
 
Y
E
 
Q
K
 
G
G
 
E
T
 
G
E
 
E
D
 
M
L
 
V
I
 
T
G
 
M
E
 
P
N
 
N
N
 
H
P
 
P
E
x
N
A
 
K
E
 
P
D
 
E
G
 
-
G
 
M
G
 
G
T
 
S
R
 
R
V
 
Q
I
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
N
 
G
E
 
E
L
 
I
W
 
W
I
 
I
E
 
D
R
 
R
E
 
A
D
 
D
F
 
F
M
 
R
E
 
E
V
 
E
P
 
A
A
 
N
K
 
K
K
x
Q
W
 
Y
F
x
K
R
|
R
L
 
L
A
 
V
P
 
L
G
 
G
A
 
K
M
 
E
V
 
V
R
|
R
L
 
L
K
x
R
F
 
N
A
 
A
Y
 
Y
I
 
V
V
 
I
K
 
K
C
 
A
E
 
E
D
 
R
F
 
V
V
 
E
K
 
K
D
 
D
E
 
A
N
 
E
G
 
G
N
 
N
V
 
I
T
 
T
E
 
T
I
 
I
R
 
F
C
 
C
T
 
T
Y
 
Y
I
 
D
P
 
A
E
 
D
S
 
T
K
 
L
S
|
S
G
x
K
N
 
D
D
 
P
T
 
A
S
 
D
G
 
G
I
 
R
N
 
K
V
 
V
K
 
K
G
 
G
T
x
V
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
A
H
 
H
A
 
A
K
 
L
T
 
P
A
 
V
E
 
E
I
 
I
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
L
F
 
F
T
 
S
S
 
V
E
 
P
T
 
N
P
 
P
D
 
G
A
 
A
E
 
A
E
 
D
G
 
-
D
 
D
F
 
F
K
 
L
D
 
S
Y
 
V
L
 
I
N
 
N
P
 
P
E
 
E
S
 
S
L
 
L
T
 
-
V
 
V
L
 
I
P
 
K
N
 
Q
V
 
G
Y
 
F
I
 
A
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
A
D
 
V
L
 
A
E
 
G
S
 
K
R
 
A
Y
 
F
Q
|
Q
F
 
F
I
x
E
R
|
R
K
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
C
 
C
L
 
L
D
 
D
-
 
S
K
 
R
D
 
H
S
 
S
T
 
T
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
P
V
 
V
F
 
F
N
 
N
R
 
R
T
 
T
V
 
V
T
 
G
L
|
L
K
x
R
D
 
D
T
|
T
F
x
W

1o0cA Crystal structure of l-glutamate and ampcpp bound to glutamine aminoacyl tRNA synthetase (see paper)
58% identity, 98% coverage: 8:546/551 of query aligns to 2:529/529 of 1o0cA

query
sites
1o0cA
N
 
N
F
 
F
I
 
I
E
 
R
E
x
Q
I
 
I
V
 
I
E
 
D
N
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
A
S
 
S
G
 
G
K
 
K
Y
 
H
E
 
T
T
 
T
L
 
V
V
 
H
T
 
T
R
|
R
F
|
F
P
 
P
P
|
P
E
|
E
P
 
P
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
|
H
I
 
I
G
|
G
H
|
H
A
 
A
K
 
K
A
x
S
I
 
I
C
 
C
L
 
L
N
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
I
T
 
A
Q
 
Q
K
 
D
Y
 
Y
G
 
K
G
 
G
Y
 
Q
T
 
C
N
 
N
L
 
L
R
 
R
F
 
F
D
 
D
D
 
D
T
|
T
N
|
N
P
 
P
V
 
V
T
 
K
E
 
E
K
 
D
T
 
I
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
N
 
E
S
 
S
Q
 
I
Q
 
K
E
 
N
D
 
D
I
 
V
R
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
F
 
F
N
 
H
W
 
W
K
 
S
-
 
G
N
 
N
E
 
V
L
 
R
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
E
 
Q
L
 
L
Y
 
H
G
 
A
F
 
Y
A
 
A
V
 
I
K
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
N
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
L
S
 
T
A
x
P
D
 
E
E
 
Q
I
 
I
A
x
R
A
 
E
L
 
Y
K
x
R
G
 
G
T
|
T
P
x
L
T
|
T
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
Q
 
K
D
 
N
S
 
S
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
S
 
D
R
 
R
S
 
S
I
 
V
E
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
D
 
A
I
 
L
F
 
F
T
 
E
K
 
K
M
 
M
K
 
R
N
 
A
G
 
G
E
 
G
F
 
F
A
 
E
D
 
E
G
|
G
A
 
K
Y
 
A
I
 
C
L
 
L
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
D
M
 
M
A
 
A
S
 
S
P
|
P
N
x
F
M
x
I
L
 
V
M
 
M
R
 
R
D
 
D
P
 
P
I
 
V
I
 
L
Y
 
Y
R
|
R
I
 
I
K
|
K
H
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
H
H
 
H
R
 
Q
T
 
T
G
 
G
N
 
N
K
 
K
W
 
W
C
 
C
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
|
M
Y
|
Y
D
 
D
F
 
F
A
 
T
H
|
H
G
 
C
Q
 
I
S
 
S
D
 
D
S
 
A
I
 
L
E
 
E
N
 
G
I
 
I
T
 
T
H
 
H
S
 
S
I
 
L
C
|
C
T
|
T
L
 
L
E
 
E
Y
x
F
V
x
Q
S
x
D
H
 
N
R
 
R
E
x
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
W
 
W
F
 
V
I
 
L
E
 
D
K
 
N
L
 
I
E
 
T
I
 
I
-
 
P
F
 
V
P
 
H
S
 
P
K
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
A
 
S
R
|
R
L
|
L
N
 
N
L
 
L
T
 
E
S
 
Y
T
 
T
V
 
V
M
 
M
S
 
S
K
|
K
R
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
N
Q
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
T
E
 
D
N
 
K
L
 
H
V
 
V
N
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
T
 
T
P
 
A
K
 
A
S
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
C
E
 
K
R
 
R
I
|
I
G
 
G
I
 
V
A
x
T
K
|
K
R
x
Q
E
 
D
N
|
N
L
x
T
I
 
I
E
|
E
L
 
M
S
x
A
L
x
S
L
 
L
E
 
E
F
x
S
C
 
C
I
 
I
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
|
N
K
 
E
T
 
N
A
 
A
N
 
P
R
|
R
V
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
I
D
 
D
P
 
P
I
 
V
K
 
K
L
 
L
V
 
V
I
 
I
T
 
E
N
 
N
Y
 
Y
E
 
Q
K
 
G
G
 
E
T
 
G
E
 
E
D
 
M
L
 
V
I
 
T
G
 
M
E
 
P
N
 
N
N
 
H
P
|
P
E
 
N
A
 
K
E
 
P
D
 
E
G
 
-
G
 
M
G
 
G
T
 
S
R
 
R
V
 
Q
I
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
N
 
G
E
 
E
L
 
I
W
 
W
I
 
I
E
 
D
R
 
R
E
 
A
D
 
D
F
 
F
M
 
R
E
 
E
V
 
E
P
 
A
A
 
N
K
 
K
K
x
Q
W
 
Y
F
x
K
R
|
R
L
 
L
A
 
V
P
 
L
G
 
G
A
 
K
M
 
E
V
 
V
R
|
R
L
 
L
K
x
R
F
x
N
A
 
A
Y
 
Y
I
 
V
V
 
I
K
 
K
C
 
A
E
 
E
D
 
R
F
 
V
V
 
E
K
 
K
D
 
D
E
 
A
N
 
E
G
 
G
N
 
N
V
 
I
T
 
T
E
 
T
I
 
I
R
 
F
C
 
C
T
 
T
Y
 
Y
I
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
D
N
 
A
D
 
D
T
 
T
S
x
L
G
 
G
I
 
V
N
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
T
 
-
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
A
H
 
H
A
 
A
K
 
L
T
 
P
A
 
V
E
 
E
I
 
I
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
L
F
 
F
T
 
S
S
 
V
E
 
P
T
 
N
P
 
P
D
 
G
A
 
A
E
 
A
E
 
D
G
 
-
D
 
D
F
 
F
K
 
L
D
 
S
Y
 
V
L
 
I
N
 
N
P
 
P
E
 
E
S
 
S
L
 
L
T
 
-
V
 
V
L
 
I
P
 
K
N
 
Q
V
 
G
Y
 
F
I
 
A
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
A
D
 
V
L
 
A
E
 
G
S
 
K
R
 
A
Y
 
F
Q
|
Q
F
 
F
I
x
E
R
|
R
K
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
C
 
C
L
 
L
D
 
D
-
 
S
K
 
R
D
 
H
S
 
S
T
 
T
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
P
V
 
V
F
 
F
N
 
N
R
 
R
T
 
T
V
 
V
T
 
G
L
 
L
K
x
R
D
 
D
T
 
T

1o0bA Crystal structure of l-glutamine and ampcpp bound to glutamine aminoacyl tRNA synthetase (see paper)
58% identity, 98% coverage: 8:546/551 of query aligns to 2:529/529 of 1o0bA

query
sites
1o0bA
N
 
N
F
 
F
I
 
I
E
 
R
E
x
Q
I
 
I
V
 
I
E
 
D
N
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
A
S
 
S
G
 
G
K
 
K
Y
 
H
E
 
T
T
 
T
L
 
V
V
 
H
T
 
T
R
 
R
F
|
F
P
|
P
P
|
P
E
|
E
P
 
P
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
|
H
I
 
I
G
|
G
H
|
H
A
 
A
K
 
K
A
x
S
I
 
I
C
 
C
L
 
L
N
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
I
T
 
A
Q
 
Q
K
 
D
Y
 
Y
G
 
K
G
 
G
Y
 
Q
T
 
C
N
 
N
L
 
L
R
 
R
F
 
F
D
|
D
D
 
D
T
|
T
N
|
N
P
 
P
V
 
V
T
 
K
E
 
E
K
 
D
T
 
I
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
N
 
E
S
 
S
Q
 
I
Q
 
K
E
 
N
D
 
D
I
 
V
R
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
F
 
F
N
 
H
W
 
W
K
 
S
-
 
G
N
 
N
E
 
V
L
 
R
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
E
 
Q
L
 
L
Y
 
H
G
 
A
F
 
Y
A
 
A
V
 
I
K
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
N
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
L
S
 
T
A
x
P
D
 
E
E
 
Q
I
 
I
A
x
R
A
 
E
L
 
Y
K
x
R
G
 
G
T
|
T
P
x
L
T
|
T
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
Q
 
K
D
 
N
S
 
S
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
S
 
D
R
 
R
S
 
S
I
 
V
E
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
D
 
A
I
 
L
F
 
F
T
 
E
K
 
K
M
 
M
K
 
R
N
 
A
G
 
G
E
 
G
F
 
F
A
 
E
D
 
E
G
|
G
A
 
K
Y
 
A
I
 
C
L
 
L
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
D
M
 
M
A
 
A
S
 
S
P
|
P
N
x
F
M
x
I
L
 
V
M
 
M
R
 
R
D
 
D
P
 
P
I
x
V
I
 
L
Y
 
Y
R
|
R
I
 
I
K
|
K
H
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
H
H
 
H
R
 
Q
T
 
T
G
 
G
N
 
N
K
 
K
W
 
W
C
 
C
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
|
M
Y
|
Y
D
 
D
F
 
F
A
 
T
H
|
H
G
 
C
Q
 
I
S
 
S
D
 
D
S
 
A
I
 
L
E
 
E
N
 
G
I
 
I
T
 
T
H
 
H
S
 
S
I
 
L
C
|
C
T
 
T
L
 
L
E
 
E
Y
x
F
V
x
Q
S
x
D
H
 
N
R
 
R
E
x
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
W
 
W
F
 
V
I
 
L
E
 
D
K
 
N
L
 
I
E
 
T
I
 
I
-
 
P
F
 
V
P
 
H
S
 
P
K
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
A
 
S
R
|
R
L
|
L
N
 
N
L
 
L
T
 
E
S
 
Y
T
 
T
V
 
V
M
 
M
S
 
S
K
 
K
R
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
N
Q
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
T
E
 
D
N
 
K
L
 
H
V
 
V
N
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
T
 
T
P
 
A
K
 
A
S
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
C
E
 
K
R
 
R
I
|
I
G
 
G
I
 
V
A
x
T
K
|
K
R
x
Q
E
x
D
N
|
N
L
x
T
I
 
I
E
|
E
L
 
M
S
x
A
L
 
S
L
 
L
E
 
E
F
x
S
C
 
C
I
 
I
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
|
N
K
 
E
T
 
N
A
 
A
N
 
P
R
|
R
V
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
I
D
 
D
P
 
P
I
 
V
K
 
K
L
 
L
V
 
V
I
 
I
T
 
E
N
 
N
Y
 
Y
E
 
Q
K
 
G
G
 
E
T
 
G
E
 
E
D
 
M
L
 
V
I
 
T
G
 
M
E
 
P
N
 
N
N
 
H
P
|
P
E
x
N
A
 
K
E
 
P
D
 
E
G
 
-
G
 
M
G
 
G
T
 
S
R
 
R
V
 
Q
I
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
N
 
G
E
 
E
L
 
I
W
 
W
I
 
I
E
 
D
R
 
R
E
 
A
D
 
D
F
 
F
M
 
R
E
 
E
V
 
E
P
 
A
A
 
N
K
 
K
K
x
Q
W
 
Y
F
x
K
R
|
R
L
 
L
A
 
V
P
 
L
G
 
G
A
 
K
M
 
E
V
 
V
R
|
R
L
 
L
K
x
R
F
x
N
A
 
A
Y
 
Y
I
 
V
V
 
I
K
 
K
C
 
A
E
 
E
D
 
R
F
 
V
V
 
E
K
 
K
D
 
D
E
 
A
N
 
E
G
 
G
N
 
N
V
 
I
T
 
T
E
 
T
I
 
I
R
 
F
C
 
C
T
 
T
Y
 
Y
I
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
D
N
 
A
D
 
D
T
 
T
S
x
L
G
 
G
I
x
V
N
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
T
 
-
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
A
H
 
H
A
 
A
K
 
L
T
 
P
A
 
V
E
 
E
I
 
I
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
L
F
 
F
T
 
S
S
 
V
E
 
P
T
 
N
P
 
P
D
 
G
A
 
A
E
 
A
E
 
D
G
 
-
D
 
D
F
 
F
K
 
L
D
 
S
Y
 
V
L
 
I
N
 
N
P
 
P
E
 
E
S
 
S
L
 
L
T
 
-
V
 
V
L
 
I
P
 
K
N
 
Q
V
 
G
Y
 
F
I
 
A
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
A
D
 
V
L
 
A
E
 
G
S
 
K
R
 
A
Y
 
F
Q
|
Q
F
 
F
I
x
E
R
|
R
K
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
C
 
C
L
 
L
D
 
D
-
 
S
K
 
R
D
 
H
S
 
S
T
 
T
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
P
V
 
V
F
 
F
N
 
N
R
 
R
T
 
T
V
 
V
T
 
G
L
 
L
K
x
R
D
 
D
T
 
T

1gtsA Structural basis for transfer RNA aminoaceylation by escherichia coli glutaminyl-tRNA synthetase (see paper)
58% identity, 98% coverage: 8:546/551 of query aligns to 2:529/529 of 1gtsA

query
sites
1gtsA
N
 
N
F
 
F
I
 
I
E
 
R
E
x
Q
I
 
I
V
 
I
E
 
D
N
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
A
S
 
S
G
 
G
K
 
K
Y
 
H
E
 
T
T
 
T
L
 
V
V
 
H
T
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
P
P
 
P
E
|
E
P
 
P
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
|
G
H
|
H
A
 
A
K
 
K
A
x
S
I
 
I
C
 
C
L
 
L
N
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
I
T
 
A
Q
 
Q
K
 
D
Y
 
Y
G
 
K
G
 
G
Y
 
Q
T
 
C
N
 
N
L
 
L
R
 
R
F
 
F
D
|
D
D
 
D
T
|
T
N
|
N
P
 
P
V
 
V
T
 
K
E
 
E
K
 
D
T
 
I
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
N
 
E
S
 
S
Q
 
I
Q
 
K
E
 
N
D
 
D
I
 
V
R
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
F
 
F
N
 
H
W
 
W
K
 
S
-
 
G
N
 
N
E
 
V
L
 
R
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
E
 
Q
L
 
L
Y
 
H
G
 
A
F
 
Y
A
 
A
V
 
I
K
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
N
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
L
S
 
T
A
x
P
D
 
E
E
 
Q
I
 
I
A
 
R
A
 
E
L
 
Y
K
x
R
G
 
G
T
 
T
P
x
L
T
 
T
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
Q
 
K
D
 
N
S
 
S
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
S
 
D
R
 
R
S
 
S
I
 
V
E
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
D
 
A
I
 
L
F
 
F
T
 
E
K
 
K
M
 
M
K
 
R
N
 
A
G
 
G
E
 
G
F
 
F
A
 
E
D
 
E
G
|
G
A
 
K
Y
 
A
I
 
C
L
 
L
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
D
M
 
M
A
 
A
S
 
S
P
|
P
N
x
F
M
x
I
L
 
V
M
 
M
R
 
R
D
 
D
P
 
P
I
x
V
I
 
L
Y
 
Y
R
|
R
I
 
I
K
|
K
H
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
H
H
 
H
R
 
Q
T
 
T
G
 
G
N
 
N
K
 
K
W
 
W
C
 
C
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
|
M
Y
|
Y
D
 
D
F
 
F
A
 
T
H
 
H
G
 
C
Q
 
I
S
 
S
D
 
D
S
 
A
I
 
L
E
 
E
N
 
G
I
 
I
T
 
T
H
 
H
S
 
S
I
 
L
C
 
C
T
|
T
L
 
L
E
 
E
Y
x
F
V
x
Q
S
x
D
H
 
N
R
 
R
E
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
W
 
W
F
 
V
I
 
L
E
 
D
K
 
N
L
 
I
E
 
T
I
 
I
-
 
P
F
 
V
P
 
H
S
 
P
K
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
A
 
S
R
|
R
L
|
L
N
 
N
L
 
L
T
 
E
S
 
Y
T
 
T
V
 
V
M
 
M
S
 
S
K
|
K
R
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
N
Q
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
T
E
 
D
N
 
K
L
 
H
V
 
V
N
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
T
 
T
P
 
A
K
 
A
S
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
C
E
 
K
R
 
R
I
|
I
G
 
G
I
 
V
A
x
T
K
|
K
R
x
Q
E
 
D
N
|
N
L
x
T
I
 
I
E
|
E
L
 
M
S
x
A
L
 
S
L
 
L
E
 
E
F
x
S
C
 
C
I
 
I
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
|
N
K
 
E
T
 
N
A
 
A
N
 
P
R
|
R
V
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
I
D
 
D
P
 
P
I
 
V
K
 
K
L
 
L
V
 
V
I
 
I
T
 
E
N
 
N
Y
 
Y
E
 
Q
K
 
G
G
 
E
T
 
G
E
 
E
D
 
M
L
 
V
I
 
T
G
 
M
E
 
P
N
 
N
N
 
H
P
 
P
E
 
N
A
 
K
E
 
P
D
 
E
G
 
-
G
 
M
G
 
G
T
 
S
R
 
R
V
 
Q
I
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
N
 
G
E
 
E
L
 
I
W
 
W
I
 
I
E
 
D
R
 
R
E
 
A
D
 
D
F
 
F
M
 
R
E
 
E
V
 
E
P
 
A
A
 
N
K
 
K
K
x
Q
W
x
Y
F
x
K
R
|
R
L
 
L
A
 
V
P
 
L
G
 
G
A
 
K
M
 
E
V
 
V
R
|
R
L
 
L
K
x
R
F
x
N
A
 
A
Y
 
Y
I
 
V
V
 
I
K
 
K
C
 
A
E
 
E
D
 
R
F
 
V
V
 
E
K
 
K
D
 
D
E
 
A
N
 
E
G
 
G
N
 
N
V
 
I
T
 
T
E
 
T
I
 
I
R
 
F
C
 
C
T
 
T
Y
 
Y
I
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
D
N
 
A
D
 
D
T
 
T
S
 
L
G
 
G
I
x
V
N
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
T
 
-
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
A
H
 
H
A
 
A
K
 
L
T
 
P
A
 
V
E
 
E
I
 
I
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
L
F
 
F
T
 
S
S
 
V
E
 
P
T
 
N
P
 
P
D
 
G
A
 
A
E
 
A
E
 
D
G
 
-
D
 
D
F
 
F
K
 
L
D
 
S
Y
 
V
L
 
I
N
 
N
P
 
P
E
 
E
S
 
S
L
 
L
T
 
-
V
 
V
L
 
I
P
 
K
N
 
Q
V
 
G
Y
 
F
I
 
A
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
A
D
 
V
L
 
A
E
 
G
S
 
K
R
 
A
Y
 
F
Q
 
Q
F
 
F
I
x
E
R
|
R
K
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
C
 
C
L
 
L
D
 
D
-
 
S
K
 
R
D
 
H
S
 
S
T
 
T
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
P
V
 
V
F
 
F
N
 
N
R
 
R
T
 
T
V
 
V
T
 
G
L
 
L
K
x
R
D
 
D
T
|
T

1exdA Crystal structure of a tight-binding glutamine tRNA bound to glutamine aminoacyl tRNA synthetase (see paper)
58% identity, 98% coverage: 8:546/551 of query aligns to 2:529/529 of 1exdA

query
sites
1exdA
N
 
N
F
 
F
I
 
I
E
 
R
E
 
Q
I
 
I
V
 
I
E
 
D
N
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
A
S
 
S
G
 
G
K
 
K
Y
 
H
E
 
T
T
 
T
L
 
V
V
 
H
T
 
T
R
 
R
F
|
F
P
 
P
P
|
P
E
|
E
P
 
P
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
|
G
H
|
H
A
 
A
K
 
K
A
x
S
I
 
I
C
 
C
L
 
L
N
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
I
T
 
A
Q
 
Q
K
 
D
Y
 
Y
G
 
K
G
 
G
Y
 
Q
T
 
C
N
 
N
L
 
L
R
 
R
F
 
F
D
|
D
D
 
D
T
|
T
N
|
N
P
 
P
V
 
V
T
 
K
E
 
E
K
 
D
T
 
I
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
N
 
E
S
 
S
Q
 
I
Q
 
K
E
 
N
D
 
D
I
 
V
R
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
F
 
F
N
 
H
W
 
W
K
 
S
-
 
G
N
 
N
E
 
V
L
 
R
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
E
 
Q
L
 
L
Y
 
H
G
 
A
F
 
Y
A
 
A
V
 
I
K
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
N
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
L
S
 
T
A
x
P
D
 
E
E
 
Q
I
 
I
A
x
R
A
 
E
L
 
Y
K
x
R
G
 
G
T
 
T
P
x
L
T
|
T
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
Q
 
K
D
 
N
S
 
S
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
S
 
D
R
 
R
S
 
S
I
 
V
E
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
D
 
A
I
 
L
F
 
F
T
 
E
K
 
K
M
 
M
K
 
R
N
 
A
G
 
G
E
 
G
F
 
F
A
 
E
D
 
E
G
|
G
A
 
K
Y
 
A
I
 
C
L
 
L
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
D
M
 
M
A
 
A
S
 
S
P
|
P
N
x
F
M
x
I
L
 
V
M
 
M
R
 
R
D
 
D
P
 
P
I
x
V
I
 
L
Y
 
Y
R
|
R
I
 
I
K
|
K
H
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
H
H
 
H
R
 
Q
T
 
T
G
 
G
N
 
N
K
 
K
W
 
W
C
 
C
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
|
M
Y
|
Y
D
 
D
F
 
F
A
 
T
H
 
H
G
 
C
Q
 
I
S
 
S
D
 
D
S
 
A
I
 
L
E
 
E
N
 
G
I
 
I
T
 
T
H
 
H
S
 
S
I
 
L
C
 
C
T
 
T
L
 
L
E
 
E
Y
x
F
V
x
Q
S
x
D
H
 
N
R
 
R
E
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
W
 
W
F
 
V
I
 
L
E
 
D
K
 
N
L
 
I
E
 
T
I
 
I
-
 
P
F
 
V
P
 
H
S
 
P
K
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
A
 
S
R
|
R
L
|
L
N
 
N
L
 
L
T
 
E
S
 
Y
T
 
T
V
|
V
M
|
M
S
|
S
K
|
K
R
 
R
K
|
K
L
 
L
L
 
N
Q
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
T
E
 
D
N
 
K
L
 
H
V
 
V
N
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
T
 
T
P
 
A
K
 
A
S
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
C
E
 
K
R
 
R
I
|
I
G
 
G
I
 
V
A
x
T
K
|
K
R
x
Q
E
x
D
N
|
N
L
x
T
I
 
I
E
|
E
L
 
M
S
x
A
L
x
S
L
 
L
E
 
E
F
x
S
C
 
C
I
 
I
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
|
N
K
 
E
T
 
N
A
 
A
N
 
P
R
|
R
V
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
I
D
 
D
P
 
P
I
 
V
K
 
K
L
 
L
V
 
V
I
 
I
T
 
E
N
 
N
Y
 
Y
E
 
Q
K
 
G
G
 
E
T
 
G
E
 
E
D
 
M
L
 
V
I
 
T
G
 
M
E
 
P
N
 
N
N
 
H
P
|
P
E
 
N
A
 
K
E
 
P
D
 
E
G
 
-
G
 
M
G
 
G
T
 
S
R
 
R
V
 
Q
I
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
N
 
G
E
 
E
L
 
I
W
 
W
I
 
I
E
 
D
R
 
R
E
 
A
D
 
D
F
 
F
M
 
R
E
 
E
V
 
E
P
 
A
A
 
N
K
 
K
K
x
Q
W
 
Y
F
x
K
R
|
R
L
 
L
A
 
V
P
 
L
G
 
G
A
 
K
M
 
E
V
 
V
R
|
R
L
 
L
K
x
R
F
x
N
A
 
A
Y
 
Y
I
 
V
V
 
I
K
 
K
C
 
A
E
 
E
D
 
R
F
 
V
V
 
E
K
 
K
D
 
D
E
 
A
N
 
E
G
 
G
N
 
N
V
 
I
T
 
T
E
 
T
I
 
I
R
 
F
C
 
C
T
 
T
Y
 
Y
I
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
D
N
 
A
D
 
D
T
 
T
S
 
L
G
 
G
I
x
V
N
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
T
 
-
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
A
H
 
H
A
 
A
K
 
L
T
 
P
A
 
V
E
 
E
I
 
I
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
L
F
 
F
T
 
S
S
 
V
E
 
P
T
 
N
P
 
P
D
 
G
A
 
A
E
 
A
E
 
D
G
 
-
D
 
D
F
 
F
K
 
L
D
 
S
Y
 
V
L
 
I
N
 
N
P
 
P
E
 
E
S
 
S
L
 
L
T
 
-
V
 
V
L
 
I
P
 
K
N
 
Q
V
 
G
Y
 
F
I
 
A
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
A
D
 
V
L
 
A
E
 
G
S
 
K
R
 
A
Y
 
F
Q
|
Q
F
 
F
I
x
E
R
|
R
K
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
C
 
C
L
 
L
D
 
D
-
 
S
K
 
R
D
 
H
S
 
S
T
 
T
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
P
V
 
V
F
 
F
N
 
N
R
 
R
T
 
T
V
 
V
T
 
G
L
|
L
K
x
R
D
 
D
T
 
T

1euqA Crystal structure of glutaminyl-tRNA synthetase complexed with a tRNA- gln mutant and an active-site inhibitor (see paper)
58% identity, 98% coverage: 8:546/551 of query aligns to 2:529/529 of 1euqA

query
sites
1euqA
N
 
N
F
 
F
I
 
I
E
 
R
E
x
Q
I
 
I
V
 
I
E
 
D
N
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
A
S
 
S
G
 
G
K
 
K
Y
 
H
E
 
T
T
 
T
L
 
V
V
 
H
T
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
P
P
|
P
E
|
E
P
 
P
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
|
H
I
 
I
G
|
G
H
|
H
A
 
A
K
 
K
A
x
S
I
 
I
C
 
C
L
 
L
N
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
I
T
 
A
Q
 
Q
K
 
D
Y
 
Y
G
 
K
G
 
G
Y
 
Q
T
 
C
N
 
N
L
 
L
R
 
R
F
 
F
D
|
D
D
 
D
T
|
T
N
|
N
P
 
P
V
 
V
T
 
K
E
 
E
K
 
D
T
 
I
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
N
 
E
S
 
S
Q
 
I
Q
 
K
E
 
N
D
 
D
I
 
V
R
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
F
 
F
N
 
H
W
 
W
K
 
S
-
 
G
N
 
N
E
 
V
L
 
R
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
E
 
Q
L
 
L
Y
 
H
G
 
A
F
 
Y
A
 
A
V
 
I
K
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
N
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
L
S
 
T
A
x
P
D
 
E
E
 
Q
I
 
I
A
x
R
A
 
E
L
 
Y
K
x
R
G
 
G
T
 
T
P
x
L
T
 
T
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
Q
 
K
D
 
N
S
 
S
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
S
 
D
R
 
R
S
 
S
I
 
V
E
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
D
 
A
I
 
L
F
 
F
T
 
E
K
 
K
M
 
M
K
 
R
N
 
A
G
 
G
E
 
G
F
 
F
A
 
E
D
 
E
G
|
G
A
 
K
Y
 
A
I
x
C
L
 
L
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
D
M
 
M
A
 
A
S
 
S
P
|
P
N
x
F
M
x
I
L
 
V
M
 
M
R
 
R
D
 
D
P
 
P
I
x
V
I
 
L
Y
 
Y
R
|
R
I
 
I
K
|
K
H
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
H
H
 
H
R
 
Q
T
 
T
G
 
G
N
 
N
K
 
K
W
 
W
C
 
C
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
|
M
Y
|
Y
D
 
D
F
 
F
A
 
T
H
|
H
G
 
C
Q
 
I
S
 
S
D
 
D
S
 
A
I
 
L
E
 
E
N
 
G
I
 
I
T
 
T
H
 
H
S
 
S
I
 
L
C
|
C
T
 
T
L
 
L
E
 
E
Y
x
F
V
 
Q
S
 
D
H
 
N
R
 
R
E
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
W
 
W
F
 
V
I
 
L
E
 
D
K
 
N
L
 
I
E
 
T
I
 
I
-
 
P
F
 
V
P
 
H
S
 
P
K
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
A
 
S
R
|
R
L
 
L
N
 
N
L
 
L
T
 
E
S
 
Y
T
 
T
V
 
V
M
 
M
S
 
S
K
|
K
R
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
N
Q
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
T
E
 
D
N
 
K
L
 
H
V
 
V
N
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
T
 
T
P
 
A
K
 
A
S
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
C
E
 
K
R
 
R
I
|
I
G
 
G
I
 
V
A
x
T
K
|
K
R
x
Q
E
 
D
N
|
N
L
x
T
I
 
I
E
|
E
L
 
M
S
x
A
L
 
S
L
 
L
E
 
E
F
x
S
C
 
C
I
 
I
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
|
N
K
 
E
T
 
N
A
 
A
N
 
P
R
|
R
V
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
I
D
 
D
P
 
P
I
 
V
K
 
K
L
 
L
V
 
V
I
 
I
T
 
E
N
 
N
Y
 
Y
E
 
Q
K
 
G
G
 
E
T
 
G
E
 
E
D
 
M
L
 
V
I
 
T
G
 
M
E
 
P
N
 
N
N
 
H
P
 
P
E
x
N
A
 
K
E
 
P
D
 
E
G
 
-
G
 
M
G
 
G
T
 
S
R
 
R
V
 
Q
I
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
N
 
G
E
 
E
L
 
I
W
 
W
I
 
I
E
 
D
R
 
R
E
 
A
D
 
D
F
 
F
M
 
R
E
 
E
V
 
E
P
 
A
A
 
N
K
 
K
K
x
Q
W
 
Y
F
x
K
R
 
R
L
 
L
A
 
V
P
 
L
G
 
G
A
 
K
M
 
E
V
 
V
R
|
R
L
 
L
K
x
R
F
x
N
A
 
A
Y
 
Y
I
 
V
V
 
I
K
 
K
C
 
A
E
 
E
D
 
R
F
 
V
V
 
E
K
 
K
D
 
D
E
 
A
N
 
E
G
 
G
N
 
N
V
 
I
T
 
T
E
 
T
I
 
I
R
 
F
C
 
C
T
 
T
Y
 
Y
I
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
D
N
 
A
D
 
D
T
 
T
S
 
L
G
 
G
I
x
V
N
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
T
 
-
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
A
H
 
H
A
 
A
K
 
L
T
 
P
A
 
V
E
 
E
I
 
I
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
L
F
 
F
T
 
S
S
 
V
E
 
P
T
 
N
P
 
P
D
 
G
A
 
A
E
 
A
E
 
D
G
 
-
D
 
D
F
 
F
K
 
L
D
 
S
Y
 
V
L
 
I
N
 
N
P
 
P
E
 
E
S
 
S
L
 
L
T
 
-
V
 
V
L
 
I
P
 
K
N
 
Q
V
 
G
Y
 
F
I
 
A
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
A
D
 
V
L
 
A
E
 
G
S
 
K
R
 
A
Y
 
F
Q
|
Q
F
 
F
I
x
E
R
|
R
K
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
C
 
C
L
 
L
D
 
D
-
 
S
K
 
R
D
 
H
S
 
S
T
 
T
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
P
V
 
V
F
 
F
N
 
N
R
 
R
T
 
T
V
 
V
T
 
G
L
|
L
K
x
R
D
 
D
T
 
T

2re8A Glutaminyl-tRNA synthetase mutant c229r with bound analog 5'-o-[n-(l- glutamyl)-sulfamoyl]adenosine (see paper)
58% identity, 98% coverage: 8:546/551 of query aligns to 2:529/529 of 2re8A

query
sites
2re8A
N
 
N
F
 
F
I
 
I
E
 
R
E
x
Q
I
 
I
V
 
I
E
 
D
N
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
A
S
 
S
G
 
G
K
 
K
Y
 
H
E
 
T
T
 
T
L
 
V
V
 
H
T
 
T
R
 
R
F
 
F
P
|
P
P
|
P
E
|
E
P
 
P
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
|
G
H
|
H
A
 
A
K
 
K
A
 
S
I
 
I
C
 
C
L
 
L
N
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
I
T
 
A
Q
 
Q
K
 
D
Y
 
Y
G
 
K
G
 
G
Y
 
Q
T
 
C
N
 
N
L
 
L
R
 
R
F
 
F
D
|
D
D
 
D
T
|
T
N
|
N
P
 
P
V
 
V
T
 
K
E
 
E
K
 
D
T
 
I
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
N
 
E
S
 
S
Q
 
I
Q
 
K
E
 
N
D
 
D
I
 
V
R
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
F
 
F
N
 
H
W
 
W
K
 
S
-
 
G
N
 
N
E
 
V
L
 
R
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
E
 
Q
L
 
L
Y
 
H
G
 
A
F
 
Y
A
 
A
V
 
I
K
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
N
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
x
L
S
 
T
A
x
P
D
 
E
E
 
Q
I
 
I
A
x
R
A
 
E
L
 
Y
K
x
R
G
 
G
T
|
T
P
x
L
T
 
T
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
Q
 
K
D
 
N
S
 
S
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
S
 
D
R
 
R
S
 
S
I
 
V
E
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
D
 
A
I
 
L
F
 
F
T
 
E
K
 
K
M
 
M
K
 
R
N
 
A
G
 
G
E
 
G
F
 
F
A
 
E
D
 
E
G
|
G
A
 
K
Y