SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CA265_RS23295 FitnessBrowser__Pedo557:CA265_RS23295 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8tdfA Structure of alistipes sp. Glucoside-3-dehydrogenase al3 (see paper)
42% identity, 87% coverage: 45:465/484 of query aligns to 1:396/452 of 8tdfA

query
sites
8tdfA
S
 
S
D
 
D
R
 
K
L
 
L
Q
 
N
L
 
I
A
 
L
G
 
G
I
 
V
G
|
G
A
 
I
G
|
G
G
|
G
K
x
R
G
 
G
E
 
-
S
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
S
S
 
S
I
 
V
V
 
L
R
 
R
G
 
G
G
 
L
K
 
E
T
 
S
-
 
Q
D
 
N
V
 
I
A
 
I
F
 
G
L
 
L
C
 
C
D
|
D
V
|
V
D
 
D
D
 
W
R
 
K
R
x
Y
A
 
A
A
 
D
N
 
H
S
 
V
L
 
F
K
 
K
N
 
R
F
 
Y
P
 
P
K
 
A
A
 
A
K
 
K
Y
 
K
Y
 
Y
K
 
N
D
 
D
Y
 
Y
R
 
R
E
 
K
L
 
M
L
 
F
D
 
D
K
 
E
E
 
M
G
 
L
K
 
K
N
 
S
I
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
M
V
 
V
S
x
A
T
|
T
P
 
A
D
|
D
H
 
H
T
|
T
H
|
H
A
 
A
Q
 
I
I
 
I
A
 
A
M
 
A
A
 
D
A
 
A
M
 
M
Q
 
T
L
 
A
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
T
 
T
H
 
H
D
 
T
I
 
V
Y
 
Y
E
 
E
A
 
S
R
 
R
M
 
L
L
 
L
T
 
T
E
 
K
A
 
L
A
 
A
N
 
D
R
 
K
Y
 
Y
K
 
K
V
 
V
V
 
A
T
 
T
Q
 
Q
M
 
M
G
 
G
N
 
N
Q
|
Q
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
D
D
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
R
R
 
K
L
 
V
Q
 
C
E
 
E
W
 
W
Y
 
I
D
 
W
A
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
I
G
 
G
K
 
E
V
 
V
H
 
R
T
 
K
V
 
V
Y
 
E
C
 
T
W
 
F
T
 
T
N
 
D
R
 
R
P
 
P
V
 
I
W
 
W
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
I
 
L
S
 
S
W
 
R
P
 
P
T
 
E
G
 
D
K
 
D
A
 
Q
E
 
R
I
 
I
P
 
P
K
 
K
E
 
T
L
 
L
D
 
N
W
 
W
D
 
D
L
 
A
W
 
F
L
 
I
G
 
G
S
 
P
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
K
 
R
E
 
P
Y
 
Y
V
 
N
N
 
A
K
 
I
L
 
Y
V
 
T
P
 
P
F
x
W
N
 
N
W
x
F
R
|
R
G
 
G
W
 
W
W
 
W
D
 
D
Y
 
F
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
L
G
 
G
D
 
D
M
 
M
G
 
A
C
 
C
H
|
H
L
 
I
V
 
L
E
 
H
P
 
P
P
 
V
F
 
F
R
 
K
V
 
G
L
 
L
G
 
K
L
 
L
D
 
G
T
 
Y
P
 
P
I
 
T
S
 
K
V
 
V
E
 
Q
C
 
G
S
 
S
V
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
Y
 
-
V
 
-
D
 
-
E
 
-
F
 
-
K
 
S
R
 
T
A
 
L
Y
 
L
L
 
L
P
 
N
E
 
E
S
 
S
C
 
A
P
 
P
P
 
M
S
 
A
S
 
Q
H
 
T
V
 
V
I
 
K
L
 
F
T
 
V
F
 
F
A
 
P
-
 
A
-
 
R
-
 
D
K
 
N
T
 
M
P
 
P
K
 
K
T
 
V
K
 
A
H
 
M
-
 
P
E
 
E
V
 
V
Q
 
E
V
 
V
H
 
Y
W
 
W
M
 
Y
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
A
R
 
R
P
 
P
E
 
E
E
 
G
L
 
L
-
 
P
-
 
A
G
 
G
P
 
K
N
 
D
E
 
L
S
 
N
F
 
M
G
 
A
D
 
G
N
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
I
F
 
F
I
 
Y
G
 
G
T
 
T
K
 
K
G
 
D
K
 
T
M
 
L
I
 
I
C
 
C
E
 
G
T
 
C
Y
 
Y
G
 
G
K
 
V
N
 
N
P
 
P
K
 
Y
L
 
L
L
 
V
P
 
S
L
 
G
S
 
R
R
 
V
N
 
P
E
 
N
S
 
A
D
 
P
K
 
K
T
 
V
K
 
L
I
 
R
T
 
E
I
 
I
P
 
-
R
 
-
I
 
-
A
 
-
N
 
-
Q
 
-
E
 
K
E
 
E
G
 
S
H
 
H
Y
 
Q
T
 
M
Q
 
D
F
 
W
A
 
V
E
 
R
A
 
A
A
 
C
I
 
K
A
 
E
-
 
D
G
 
A
Y
 
D
G
 
D
K
 
R
M
 
V
E
 
P
L
 
S
S
 
A
S
 
S
P
 
D
F
 
F
E
 
S
I
 
E
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
 
F
T
 
N
E
 
E
T
 
M
L
 
V
L
 
V
I
 
M
A
 
G
N
 
V
L
 
L
A
 
A
I
 
V
R
 
R
G
 
L
T
 
Q
D
 
N
V
 
L
Q
 
N
R
 
R
R
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
-
S
 
-
Y
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
D
 
-
I
 
-
K
 
E
M
 
L
L
 
L
W
 
W
D
 
D
K
 
G
V
 
P
K
 
N
M
 
M
K
 
R
V
 
F
T
 
T
N
 
N
F
 
I

8tdhA Structure of trehalose bound alistipes sp. Glucoside-3-dehydrogenase al3 (see paper)
42% identity, 87% coverage: 46:465/484 of query aligns to 1:395/451 of 8tdhA

query
sites
8tdhA
D
 
D
R
 
K
L
 
L
Q
 
N
L
 
I
A
 
L
G
 
G
I
 
V
G
|
G
A
 
I
G
|
G
G
|
G
K
x
R
G
 
G
E
 
-
S
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
S
S
 
S
I
 
V
V
 
L
R
 
R
G
 
G
G
 
L
K
 
E
T
 
S
-
 
Q
D
 
N
V
 
I
A
 
I
F
 
G
L
 
L
C
 
C
D
|
D
V
|
V
D
 
D
D
 
W
R
 
K
R
x
Y
A
 
A
A
 
D
N
 
H
S
 
V
L
 
F
K
 
K
N
 
R
F
 
Y
P
 
P
K
 
A
A
 
A
K
 
K
Y
 
K
Y
 
Y
K
 
N
D
 
D
Y
 
Y
R
 
R
E
 
K
L
 
M
L
 
F
D
 
D
K
 
E
E
 
M
G
 
L
K
 
K
N
 
S
I
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
M
V
 
V
S
x
A
T
|
T
P
 
A
D
|
D
H
 
H
T
 
T
H
|
H
A
 
A
Q
 
I
I
 
I
A
 
A
M
 
A
A
 
D
A
 
A
M
 
M
Q
 
T
L
x
A
G
|
G
K
|
K
H
 
H
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
T
 
T
H
 
H
D
 
T
I
 
V
Y
 
Y
E
 
E
A
 
S
R
 
R
M
 
L
L
 
L
T
 
T
E
 
K
A
 
L
A
 
A
N
 
D
R
 
K
Y
 
Y
K
 
K
V
 
V
V
 
A
T
 
T
Q
 
Q
M
 
M
G
 
G
N
 
N
Q
|
Q
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
D
D
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
R
R
 
K
L
 
V
Q
 
C
E
 
E
W
 
W
Y
 
I
D
 
W
A
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
I
G
 
G
K
 
E
V
 
V
H
x
R
T
 
K
V
 
V
Y
 
E
C
 
T
W
 
F
T
 
T
N
 
D
R
|
R
P
 
P
V
 
I
W
 
W
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
I
 
L
S
 
S
W
 
R
P
 
P
T
 
E
G
 
D
K
 
D
A
 
Q
E
 
R
I
 
I
P
 
P
K
 
K
E
 
T
L
 
L
D
 
N
W
 
W
D
 
D
L
 
A
W
x
F
L
 
I
G
 
G
S
 
P
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
K
 
R
E
 
P
Y
 
Y
V
 
N
N
 
A
K
 
I
L
 
Y
V
 
T
P
 
P
F
x
W
N
 
N
W
x
F
R
|
R
G
 
G
W
 
W
W
 
W
D
|
D
Y
 
F
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
L
G
 
G
D
|
D
M
 
M
G
 
A
C
 
C
H
|
H
L
 
I
V
 
L
E
 
H
P
 
P
P
 
V
F
 
F
R
 
K
V
 
G
L
 
L
G
 
K
L
 
L
D
 
G
T
 
Y
P
 
P
I
 
T
S
 
K
V
 
V
E
 
Q
C
 
G
S
 
S
V
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
Y
 
-
V
 
-
D
 
-
E
 
-
F
 
-
K
 
S
R
 
T
A
 
L
Y
 
L
L
 
L
P
x
N
E
 
E
S
 
S
C
 
A
P
 
P
P
 
M
S
 
A
S
 
Q
H
 
T
V
 
V
I
 
K
L
 
F
T
 
V
F
 
F
A
 
P
-
 
A
-
 
R
-
 
D
K
 
N
T
 
M
P
 
P
K
 
K
T
 
V
K
 
A
H
 
M
-
 
P
E
 
E
V
 
V
Q
 
E
V
 
V
H
 
Y
W
 
W
M
 
Y
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
A
R
 
R
P
 
P
E
 
E
E
 
G
L
 
L
-
 
P
-
 
A
G
 
G
P
 
K
N
 
D
E
 
L
S
 
N
F
 
M
G
 
A
D
 
G
N
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
I
F
 
F
I
x
Y
G
 
G
T
 
T
K
 
K
G
 
D
K
 
T
M
 
L
I
 
I
C
 
C
E
 
G
T
 
C
Y
|
Y
G
 
G
K
 
V
N
 
N
P
 
P
K
 
Y
L
 
L
L
 
V
P
 
S
L
 
G
S
 
R
R
 
V
N
 
P
E
 
N
S
 
A
D
 
P
K
 
K
T
 
V
K
 
L
I
 
R
T
 
E
I
 
I
P
 
-
R
 
-
I
 
-
A
 
-
N
 
-
Q
 
-
E
 
K
E
 
E
G
 
S
H
 
H
Y
 
Q
T
 
M
Q
 
D
F
 
W
A
 
V
E
 
R
A
 
A
A
 
C
I
 
K
A
 
E
-
 
D
G
 
A
Y
 
D
G
 
D
K
 
R
M
 
V
E
 
P
L
 
S
S
 
A
S
 
S
P
 
D
F
 
F
E
 
S
I
 
E
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
 
F
T
 
N
E
 
E
T
 
M
L
 
V
L
 
V
I
 
M
A
 
G
N
 
V
L
 
L
A
 
A
I
 
V
R
|
R
G
 
L
T
 
Q
D
 
N
V
 
L
Q
 
N
R
 
R
R
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
-
S
 
-
Y
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
D
 
-
I
 
-
K
 
E
M
 
L
L
 
L
W
 
W
D
 
D
K
 
G
V
 
P
K
 
N
M
 
M
K
 
R
V
 
F
T
 
T
N
 
N
F
 
I

Sites not aligning to the query:

7xreC Crystal structure of dgpa (see paper)
30% identity, 25% coverage: 73:193/484 of query aligns to 32:152/363 of 7xreC

query
sites
7xreC
D
 
E
V
 
I
A
 
V
F
 
A
L
 
F
C
 
C
D
|
D
V
x
I
D
 
Q
D
 
I
R
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
E
N
 
K
S
 
A
L
 
A
K
 
A
N
 
E
F
 
F
P
 
G
K
 
A
A
 
E
-
 
G
-
 
A
K
 
Q
Y
 
V
Y
 
T
K
 
A
D
 
D
Y
 
Y
R
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
-
K
 
-
E
 
A
G
 
N
K
 
P
N
 
E
I
 
V
D
 
E
A
 
V
V
 
V
T
 
H
V
 
V
S
 
C
T
|
T
P
|
P
D
x
N
H
 
V
T
 
S
H
|
H
A
 
S
Q
 
E
I
 
I
A
 
T
M
 
I
A
 
A
A
 
A
M
 
F
Q
 
E
L
 
A
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
Y
 
Y
V
 
C
Q
x
E
K
|
K
P
|
P
L
 
M
T
 
S
H
 
H
D
 
S
I
 
T
Y
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
E
M
 
K
L
 
M
T
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
W
N
 
K
R
 
K
Y
 
S
K
 
G
V
 
K
V
 
Q
T
 
F
Q
 
T
M
 
I
G
 
G
N
 
Y
Q
 
Q
G
 
N
A
 
R
S
 
F
G
 
R
D
 
E
G
 
E
V
 
V
R
 
M
R
 
N
L
 
L
Q
 
K
E
 
K
W
 
S
Y
 
C
D
 
D
A
 
K
G
 
G
R
 
E
I
 
L
G
 
G
K
 
E
V
 
I
H
 
Y

Sites not aligning to the query:

7xr9A Crystal structure of dgpa with glucose (see paper)
33% identity, 20% coverage: 95:193/484 of query aligns to 46:142/344 of 7xr9A

query
sites
7xr9A
A
 
A
K
 
Q
Y
 
V
Y
 
T
K
 
A
D
|
D
Y
|
Y
R
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
-
K
 
-
E
 
A
G
 
N
K
 
P
N
 
E
I
 
V
D
 
E
A
 
V
V
 
V
T
 
H
V
 
V
S
x
C
T
|
T
P
|
P
D
 
N
H
 
V
T
 
S
H
|
H
A
 
S
Q
 
E
I
 
I
A
 
T
M
 
I
A
 
A
A
 
A
M
 
F
Q
 
E
L
 
A
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
Y
 
Y
V
 
C
Q
x
E
K
|
K
P
|
P
L
 
M
T
 
S
H
 
H
D
 
S
I
 
T
Y
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
E
M
 
K
L
 
M
T
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
W
N
 
K
R
 
K
Y
 
S
K
 
G
V
 
K
V
 
Q
T
 
F
Q
 
T
M
 
I
G
 
G
N
 
Y
Q
|
Q
G
 
N
A
 
R
S
 
F
G
 
R
D
 
E
G
 
E
V
 
V
R
 
M
R
 
N
L
 
L
Q
 
K
E
 
K
W
 
S
Y
 
C
D
 
D
A
 
K
G
 
G
R
 
E
I
 
L
G
 
G
K
 
E
V
 
I
H
 
Y

Sites not aligning to the query:

3ec7A Crystal structure of putative dehydrogenase from salmonella typhimurium lt2
28% identity, 38% coverage: 50:233/484 of query aligns to 7:190/336 of 3ec7A

query
sites
3ec7A
L
 
I
A
 
V
G
 
G
I
 
I
G
|
G
A
x
M
G
x
I
G
 
G
K
 
S
G
 
D
E
 
H
-
 
L
S
 
R
D
 
R
I
 
L
A
 
A
S
 
N
I
 
T
V
 
V
R
 
S
G
 
G
G
 
-
K
 
-
T
 
V
D
 
E
V
 
V
A
 
V
F
 
A
L
 
V
C
 
C
D
|
D
V
x
I
D
 
V
D
 
A
R
 
G
R
|
R
A
 
A
A
 
Q
N
 
A
S
 
A
L
 
L
K
 
D
N
 
K
F
 
Y
P
 
A
-
 
I
K
 
E
A
 
A
K
 
K
Y
 
D
Y
 
Y
K
 
N
D
 
D
Y
 
Y
R
 
H
E
 
D
L
 
L
L
 
I
D
 
N
K
 
D
E
 
-
G
 
-
K
 
K
N
 
D
I
 
V
D
 
E
A
 
V
V
 
V
T
 
I
V
 
I
S
x
T
T
x
A
P
x
S
D
x
N
H
 
E
T
 
A
H
|
H
A
 
A
Q
 
D
I
 
V
A
 
A
M
 
V
A
 
A
A
 
A
M
 
L
Q
 
N
L
 
A
G
 
N
K
 
K
H
 
Y
V
 
V
Y
 
F
V
 
C
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
T
 
A
H
 
V
D
 
T
I
 
A
Y
 
A
E
 
D
A
 
C
R
 
Q
M
 
R
L
 
V
T
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
E
N
 
Q
R
 
K
Y
 
N
-
 
G
K
 
K
V
 
R
V
 
M
T
 
V
Q
 
Q
M
 
I
G
 
G
N
 
F
Q
x
M
G
 
R
A
 
R
S
 
Y
G
 
D
D
 
K
G
 
G
V
 
Y
R
 
V
R
 
Q
L
 
L
Q
 
K
E
 
N
W
 
I
Y
 
I
D
 
D
A
 
S
G
 
G
R
 
E
I
 
I
G
 
G
K
 
Q
V
 
P
H
 
L
T
 
M
V
 
V
-
 
H
-
 
G
-
 
R
-
 
H
Y
 
Y
C
 
N
W
 
A
T
 
S
N
 
T
R
 
V
P
 
P
V
 
E
W
 
Y
-
 
K
-
 
T
P
 
P
Q
 
Q
G
 
A
I
 
I
S
 
-
W
 
Y
P
 
E
T
 
T
G
 
-
K
 
-
A
 
-
E
 
-
I
 
L
P
 
I
K
x
H
E
 
E
L
 
I
D
 
D
W
 
V
D
 
M
L
 
H
W
 
W
L
 
L
G
 
L
S
 
N
A
 
E
P
 
D
Y
 
Y
K
 
K

Sites not aligning to the query:

3dtyA Crystal structure of an oxidoreductase from pseudomonas syringae
28% identity, 29% coverage: 56:196/484 of query aligns to 13:164/374 of 3dtyA

query
sites
3dtyA
G
 
G
G
 
G
K
 
G
G
 
S
E
 
Q
S
 
S
D
 
Q
I
 
I
A
 
G
S
 
Y
I
 
I
V
 
H
R
 
R
G
 
C
G
 
A
K
 
A
T
 
L
D
 
R
-
 
D
-
 
N
-
 
T
-
 
F
-
 
V
-
 
L
V
 
V
A
 
A
F
 
G
L
 
A
C
 
F
D
 
D
V
 
I
D
 
D
D
 
P
R
 
I
R
 
R
-
 
G
-
 
S
A
 
A
A
 
F
N
 
G
S
 
E
L
 
Q
K
 
L
N
 
G
F
 
V
P
 
D
K
 
S
A
 
E
K
 
R
Y
 
C
Y
 
Y
K
 
A
D
 
D
Y
 
Y
R
 
L
E
 
S
L
 
M
L
 
F
D
 
E
K
 
Q
E
 
E
G
 
A
K
 
R
N
 
R
I
 
A
D
 
D
-
 
G
-
 
I
-
 
Q
A
 
A
V
 
V
T
 
S
V
 
I
S
 
A
T
 
T
P
 
P
D
 
N
H
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
Y
Q
 
S
I
 
I
A
 
T
M
 
K
A
 
A
A
 
A
M
 
L
Q
 
E
L
 
A
G
 
G
K
 
L
H
 
H
V
 
V
Y
 
V
V
 
C
Q
 
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
T
 
C
H
 
F
D
 
T
I
 
V
Y
x
E
E
 
Q
A
 
A
R
 
E
M
x
N
L
 
L
T
 
R
E
 
E
A
 
L
A
 
S
N
 
H
R
 
K
Y
 
H
K
 
N
V
 
R
V
 
I
T
 
V
Q
 
G
M
 
V
G
 
T
N
 
Y
Q
 
G
G
 
Y
A
 
A
S
 
G
G
 
H
D
 
Q
G
 
L
V
 
I
R
 
E
R
 
Q
L
 
A
Q
 
R
E
 
E
W
 
M
Y
 
I
D
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
E
I
 
L
G
 
G
K
 
D
V
 
V
H
 
R
T
 
M
V
 
V
Y
 
H

Sites not aligning to the query:

8tdiG Structure of p2b11 glucuronide-3-dehydrogenase (see paper)
22% identity, 45% coverage: 77:295/484 of query aligns to 40:273/386 of 8tdiG

query
sites
8tdiG
L
 
L
C
 
C
D
|
D
V
x
I
D
 
D
D
 
P
R
 
Q
R
x
K
A
 
E
A
 
E
N
 
M
S
 
C
L
 
K
K
 
E
N
 
K
F
 
Y
P
 
P
K
 
D
A
 
V
K
 
P
Y
 
F
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
Y
 
W
R
 
K
E
 
D
L
 
M
L
 
V
D
 
-
K
 
-
E
 
A
G
 
S
K
 
G
N
 
D
I
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
I
V
 
T
S
x
T
T
x
V
P
 
P
D
x
H
H
 
Y
T
 
L
H
|
H
A
 
T
Q
 
E
I
 
I
A
 
A
M
 
I
A
 
Y
A
 
C
M
 
L
Q
 
E
L
 
H
G
 
G
K
 
M
H
 
N
V
 
V
Y
 
L
V
 
V
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
A
T
 
G
H
 
V
D
 
Y
I
 
A
Y
 
K
E
 
S
A
 
V
R
 
R
M
 
E
L
 
M
T
 
N
E
 
E
A
 
C
A
 
A
N
 
A
R
 
A
Y
 
H
K
 
P
V
 
E
V
 
V
T
 
T
-
 
F
-
 
G
Q
 
I
M
 
M
G
 
F
N
|
N
Q
 
Q
G
 
-
A
 
R
S
 
T
G
 
N
D
 
K
G
 
L
V
 
Y
R
 
Q
R
 
K
L
 
I
Q
 
R
E
 
E
W
 
I
Y
 
V
D
 
A
A
 
S
G
 
G
R
 
E
I
 
L
G
 
G
K
 
E
V
 
I
H
 
R
-
 
R
-
 
S
-
 
N
-
 
W
T
 
I
V
 
I
Y
 
N
C
 
N
W
 
W
T
 
Y
N
 
R
R
 
P
P
 
D
V
 
S
W
 
Y
P
 
Y
Q
 
R
G
 
L
I
 
S
S
 
D
W
|
W
P
x
R
T
 
A
-
 
T
-
 
W
-
 
G
G
 
G
K
 
E
A
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
V
-
 
N
E
 
Q
I
 
A
P
 
P
K
x
H
E
 
Q
L
 
L
D
 
D
W
 
L
D
 
W
L
 
Q
W
 
W
L
 
I
G
 
C
S
 
G
A
 
I
P
 
P
Y
 
T
K
 
T
E
 
V
Y
 
Y
V
 
A
N
 
N
K
 
C
L
 
I
-
 
N
-
 
G
-
 
S
-
 
H
-
 
R
-
 
D
-
 
I
-
 
A
V
 
V
P
 
E
F
 
N
N
 
D
W
 
V
R
 
T
G
 
V
W
 
L
W
 
T
D
 
E
Y
 
Y
G
 
E
T
 
N
G
 
G
A
 
A
I
 
T
G
 
G
D
 
S
M
 
-
G
 
-
C
 
-
H
 
-
L
 
F
V
 
I
E
 
T
P
 
C
P
 
T
F
 
H
R
 
D
V
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
T
D
 
D
T
 
R
P
 
-
I
 
F
S
 
E
V
 
I
E
 
D
C
 
L
S
 
D
V
 
G
G
 
G
S
 
K
V
 
I
Y
 
V
V
 
V
D
 
E
E
 
D
F
 
S
K
 
K
R
 
K
A
 
A
Y
 
Y
L
 
I

Sites not aligning to the query:

7d5nB Crystal structure of inositol dehydrogenase homolog complexed with nadh and myo-inositol from azotobacter vinelandii
42% identity, 14% coverage: 96:165/484 of query aligns to 65:140/389 of 7d5nB

query
sites
7d5nB
K
 
R
Y
 
C
Y
 
Y
K
 
P
D
 
D
Y
 
Y
R
 
R
E
 
T
L
 
L
L
 
F
D
 
E
K
 
Q
E
 
E
G
 
A
K
 
R
N
 
R
-
 
P
-
 
D
-
 
G
I
 
I
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
T
 
S
V
 
V
S
 
A
T
|
T
P
|
P
D
x
N
H
 
G
T
 
T
H
|
H
A
 
F
Q
 
A
I
 
I
A
 
T
M
 
R
A
 
A
A
 
A
M
 
L
Q
 
E
L
 
A
G
 
G
K
 
L
H
 
H
V
 
V
Y
 
V
V
 
C
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
T
 
C
H
 
F
D
 
T
I
 
L
Y
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
E
M
 
T
L
 
L
T
 
R
E
 
E
A
 
I
A
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
N
N
 
N
R
 
R
Y
 
V
K
 
V
V
 
G
V
 
V
T
 
T

Sites not aligning to the query:

7d5mA Crystal structure of inositol dehydrogenase homolog complexed with NAD+ from azotobacter vinelandii
42% identity, 14% coverage: 96:165/484 of query aligns to 66:141/389 of 7d5mA

query
sites
7d5mA
K
 
R
Y
 
C
Y
 
Y
K
 
P
D
 
D
Y
 
Y
R
 
R
E
 
T
L
 
L
L
 
F
D
 
E
K
 
Q
E
 
E
G
 
A
K
 
R
N
 
R
-
 
P
-
 
D
-
 
G
I
 
I
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
T
 
S
V
 
V
S
 
A
T
|
T
P
|
P
D
x
N
H
 
G
T
 
T
H
|
H
A
 
F
Q
 
A
I
 
I
A
 
T
M
 
R
A
 
A
A
 
A
M
 
L
Q
 
E
L
 
A
G
 
G
K
 
L
H
 
H
V
 
V
Y
 
V
V
 
C
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
T
 
C
H
 
F
D
 
T
I
 
L
Y
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
E
M
 
T
L
 
L
T
 
R
E
 
E
A
 
I
A
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
N
N
 
N
R
 
R
Y
 
V
K
 
V
V
 
G
V
 
V
T
 
T

Sites not aligning to the query:

7d5nA Crystal structure of inositol dehydrogenase homolog complexed with nadh and myo-inositol from azotobacter vinelandii
42% identity, 14% coverage: 96:165/484 of query aligns to 65:140/379 of 7d5nA

query
sites
7d5nA
K
 
R
Y
 
C
Y
 
Y
K
 
P
D
 
D
Y
 
Y
R
 
R
E
 
T
L
 
L
L
 
F
D
 
E
K
 
Q
E
 
E
G
 
A
K
 
R
N
 
R
-
 
P
-
 
D
-
 
G
I
 
I
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
T
 
S
V
 
V
S
 
A
T
|
T
P
|
P
D
x
N
H
 
G
T
 
T
H
|
H
A
 
F
Q
 
A
I
 
I
A
 
T
M
 
R
A
 
A
A
 
A
M
 
L
Q
 
E
L
 
A
G
 
G
K
 
L
H
 
H
V
 
V
Y
 
V
V
 
C
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
T
 
C
H
 
F
D
 
T
I
 
L
Y
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
E
M
 
T
L
 
L
T
 
R
E
 
E
A
 
I
A
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
N
N
 
N
R
 
R
Y
 
V
K
 
V
V
 
G
V
 
V
T
 
T

Sites not aligning to the query:

3e18A Crystal structure of NAD-binding protein from listeria innocua
28% identity, 25% coverage: 47:166/484 of query aligns to 3:121/348 of 3e18A

query
sites
3e18A
R
 
K
L
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
A
 
V
G
 
I
I
 
V
G
 
G
A
 
Y
G
|
G
G
|
G
K
x
M
G
 
G
E
 
S
S
 
Y
D
 
H
I
 
V
A
 
T
S
 
L
I
 
A
V
 
S
R
 
A
G
 
A
G
 
D
K
 
N
T
 
L
D
 
E
V
 
V
A
 
H
F
 
G
L
 
V
C
x
F
D
|
D
V
x
I
-
 
L
D
 
A
D
 
E
R
x
K
R
 
R
A
 
E
A
 
A
N
 
A
S
 
A
L
 
Q
K
 
K
N
 
G
F
 
L
P
 
-
K
 
-
A
 
-
K
 
K
Y
 
I
Y
 
Y
K
 
E
D
 
S
Y
 
Y
R
 
E
E
 
A
L
 
V
L
 
L
D
 
A
K
 
D
E
 
E
G
 
-
K
 
-
N
 
K
I
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
L
V
 
I
S
x
A
T
|
T
P
|
P
D
x
N
H
 
D
T
 
S
H
|
H
A
 
K
Q
 
E
I
 
L
A
 
A
M
 
I
A
 
S
A
 
A
M
 
L
Q
 
E
L
 
A
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
Y
 
V
V
 
C
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
V
T
 
T
-
 
M
-
 
T
-
 
S
H
 
E
D
 
D
I
 
L
Y
 
L
E
 
A
A
 
I
R
 
M
M
 
D
L
 
V
T
 
A
E
 
K
A
 
R
A
 
V
N
 
N
R
 
K
Y
 
H
K
 
F
V
 
M
V
 
V
T
 
H
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

3m2tA The crystal structure of dehydrogenase from chromobacterium violaceum
26% identity, 32% coverage: 50:205/484 of query aligns to 8:162/342 of 3m2tA

query
sites
3m2tA
L
 
L
A
 
V
G
|
G
I
 
I
G
|
G
A
|
A
G
x
Q
G
 
M
K
 
Q
G
 
-
E
 
E
S
 
N
D
 
L
I
 
L
A
 
P
S
 
S
I
 
L
V
 
L
R
 
Q
G
 
M
G
 
Q
K
 
D
T
 
I
D
 
R
V
 
I
A
 
V
F
 
A
L
 
A
C
 
C
D
|
D
V
x
S
D
 
D
D
 
L
R
 
E
R
|
R
A
 
A
A
 
R
N
 
R
S
 
V
L
 
H
K
 
R
N
 
F
F
 
I
P
 
S
K
 
D
A
 
I
K
 
P
Y
 
V
Y
 
L
K
 
D
D
 
N
Y
 
V
R
 
P
E
 
A
L
 
M
L
 
L
D
 
N
K
 
Q
E
 
-
G
 
-
K
 
V
N
 
P
I
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
V
V
 
M
S
x
A
T
x
G
P
 
P
D
 
P
H
 
Q
T
x
L
H
 
H
A
 
F
Q
 
E
I
 
M
A
 
G
M
 
L
A
 
L
A
 
A
M
 
M
Q
 
S
L
 
K
G
 
G
K
 
V
H
 
N
V
 
V
Y
 
F
V
 
V
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
P
T
 
C
H
 
A
D
 
T
I
 
L
Y
 
E
E
 
E
A
 
L
R
 
E
M
 
T
L
 
L
T
 
I
E
 
D
A
 
A
A
 
A
N
 
R
R
 
R
Y
 
S
K
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
S
Q
 
G
M
 
V
G
 
G
N
 
M
Q
x
N
G
 
F
A
 
K
S
 
F
G
 
A
D
 
R
G
 
P
V
 
V
R
 
R
R
 
Q
L
 
L
Q
 
R
E
 
E
W
 
M
Y
 
T
D
 
Q
A
 
V
G
 
D
R
 
E
I
 
F
G
 
G
K
 
E
V
 
T
H
 
L
T
 
H
V
 
I
Y
 
Q
C
 
L
-
 
N
-
 
H
W
 
Y
T
 
A
N
 
N
R
 
K
P
 
P
V
 
R
W
 
A
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4mjlD Crystal structure of myo-inositol dehydrogenase from lactobacillus casei in complex with NAD and d-chiro-inositol
29% identity, 30% coverage: 47:190/484 of query aligns to 4:146/339 of 4mjlD

query
sites
4mjlD
R
 
K
L
 
V
Q
 
G
L
 
V
A
 
I
G
 
G
I
 
T
G
|
G
A
|
A
G
x
M
G
 
G
K
 
R
G
 
A
E
 
H
S
 
I
D
 
D
I
 
R
A
 
L
S
 
T
I
 
N
V
 
V
R
 
L
G
 
T
G
 
G
K
 
-
T
 
A
D
 
E
V
 
V
A
 
V
F
 
A
L
 
V
C
 
T
D
|
D
V
x
I
D
 
D
D
 
H
R
 
E
R
 
A
A
 
A
A
 
E
N
 
A
S
 
A
L
 
V
K
 
R
N
 
D
F
 
F
P
 
H
-
 
L
K
 
N
A
 
A
K
 
K
Y
 
V
Y
 
Y
K
 
P
D
 
D
Y
 
D
R
 
T
E
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
-
K
 
-
E
 
Q
G
 
D
K
 
P
N
 
D
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
F
V
 
V
S
x
V
T
x
S
P
 
F
D
 
G
H
 
G
T
 
A
H
|
H
A
 
E
Q
 
A
I
 
T
A
 
V
M
 
L
A
 
K
A
 
A
M
 
L
Q
 
D
L
 
T
G
 
D
K
 
K
H
 
F
V
 
I
Y
 
F
V
 
T
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
T
 
A
H
 
T
D
 
T
I
 
L
Y
 
E
E
 
G
A
 
A
-
 
K
R
 
R
M
 
I
L
 
V
T
 
D
E
 
K
A
 
E
A
 
L
N
 
T
R
 
K
Y
 
S
K
 
K
V
 
K
V
 
V
T
 
I
Q
 
Q
M
 
V
G
 
G
N
 
F
Q
x
M
G
 
R
A
 
R
S
 
Y
G
 
D
D
 
Q
G
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
A
L
 
L
Q
 
K
E
 
E
W
 
K
Y
 
L
D
 
D
A
 
T
G
 
G
R
 
I
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4mioD Crystal structure of myo-inositol dehydrogenase from lactobacillus casei in complex with NAD(h) and myo-inositol
29% identity, 30% coverage: 47:190/484 of query aligns to 4:146/339 of 4mioD

query
sites
4mioD
R
 
K
L
 
V
Q
 
G
L
 
V
A
 
I
G
 
G
I
 
T
G
 
G
A
|
A
G
x
M
G
 
G
K
 
R
G
 
A
E
 
H
S
 
I
D
 
D
I
 
R
A
 
L
S
 
T
I
 
N
V
 
V
R
 
L
G
 
T
G
 
G
K
 
-
T
 
A
D
 
E
V
 
V
A
 
V
F
 
A
L
 
V
C
 
T
D
|
D
V
x
I
D
 
D
D
 
H
R
 
E
R
 
A
A
 
A
A
 
E
N
 
A
S
 
A
L
 
V
K
 
R
N
 
D
F
 
F
P
 
H
-
 
L
K
 
N
A
 
A
K
 
K
Y
 
V
Y
 
Y
K
 
P
D
 
D
Y
 
D
R
 
T
E
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
-
K
 
-
E
 
Q
G
 
D
K
 
P
N
 
D
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
F
V
 
V
S
 
V
T
x
S
P
 
F
D
 
G
H
 
G
T
x
A
H
|
H
A
 
E
Q
 
A
I
 
T
A
 
V
M
 
L
A
 
K
A
 
A
M
 
L
Q
 
D
L
 
T
G
 
D
K
 
K
H
 
F
V
 
I
Y
 
F
V
 
T
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
T
 
A
H
 
T
D
 
T
I
 
L
Y
 
E
E
 
G
A
 
A
-
 
K
R
 
R
M
 
I
L
 
V
T
 
D
E
 
K
A
 
E
A
 
L
N
 
T
R
 
K
Y
 
S
K
 
K
V
 
K
V
 
V
T
 
I
Q
 
Q
M
 
V
G
 
G
N
 
F
Q
x
M
G
 
R
A
 
R
S
 
Y
G
 
D
D
 
Q
G
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
A
L
 
L
Q
 
K
E
 
E
W
 
K
Y
 
L
D
 
D
A
 
T
G
 
G
R
 
I
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4mioA Crystal structure of myo-inositol dehydrogenase from lactobacillus casei in complex with NAD(h) and myo-inositol
29% identity, 30% coverage: 47:190/484 of query aligns to 4:146/339 of 4mioA

query
sites
4mioA
R
 
K
L
 
V
Q
 
G
L
 
V
A
 
I
G
 
G
I
 
T
G
|
G
A
|
A
G
x
M
G
 
G
K
 
R
G
 
A
E
 
H
S
 
I
D
 
D
I
 
R
A
 
L
S
 
T
I
 
N
V
 
V
R
 
L
G
 
T
G
 
G
K
 
-
T
 
A
D
 
E
V
 
V
A
 
V
F
 
A
L
 
V
C
 
T
D
|
D
V
x
I
D
 
D
D
 
H
R
 
E
R
 
A
A
 
A
A
 
E
N
 
A
S
 
A
L
 
V
K
 
R
N
 
D
F
 
F
P
 
H
-
 
L
K
 
N
A
 
A
K
 
K
Y
 
V
Y
 
Y
K
 
P
D
 
D
Y
 
D
R
 
T
E
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
-
K
 
-
E
 
Q
G
 
D
K
 
P
N
 
D
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
F
V
 
V
S
 
V
T
x
S
P
x
F
D
 
G
H
 
G
T
 
A
H
|
H
A
 
E
Q
 
A
I
 
T
A
 
V
M
 
L
A
 
K
A
 
A
M
 
L
Q
 
D
L
 
T
G
 
D
K
 
K
H
 
F
V
 
I
Y
 
F
V
 
T
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
T
 
A
H
 
T
D
 
T
I
 
L
Y
 
E
E
 
G
A
 
A
-
 
K
R
 
R
M
 
I
L
 
V
T
 
D
E
 
K
A
 
E
A
 
L
N
 
T
R
 
K
Y
 
S
K
 
K
V
 
K
V
 
V
T
 
I
Q
 
Q
M
 
V
G
 
G
N
 
F
Q
 
M
G
 
R
A
 
R
S
 
Y
G
 
D
D
 
Q
G
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
A
L
 
L
Q
 
K
E
 
E
W
 
K
Y
 
L
D
 
D
A
 
T
G
 
G
R
 
I
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4minA Crystal structure of myo-inositol dehydrogenase from lactobacillus casei with bound cofactor NAD
29% identity, 30% coverage: 47:190/484 of query aligns to 4:146/339 of 4minA

query
sites
4minA
R
 
K
L
 
V
Q
 
G
L
 
V
A
 
I
G
 
G
I
 
T
G
|
G
A
|
A
G
x
M
G
 
G
K
 
R
G
 
A
E
 
H
S
 
I
D
 
D
I
 
R
A
 
L
S
 
T
I
 
N
V
 
V
R
 
L
G
 
T
G
 
G
K
 
-
T
 
A
D
 
E
V
 
V
A
 
V
F
 
A
L
 
V
C
 
T
D
|
D
V
x
I
D
 
D
D
 
H
R
 
E
R
 
A
A
 
A
A
 
E
N
 
A
S
 
A
L
 
V
K
 
R
N
 
D
F
 
F
P
 
H
-
 
L
K
 
N
A
 
A
K
 
K
Y
 
V
Y
 
Y
K
 
P
D
 
D
Y
 
D
R
 
T
E
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
-
K
 
-
E
 
Q
G
 
D
K
 
P
N
 
D
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
F
V
 
V
S
x
V
T
x
S
P
x
F
D
 
G
H
 
G
T
 
A
H
|
H
A
 
E
Q
 
A
I
 
T
A
 
V
M
 
L
A
 
K
A
 
A
M
 
L
Q
 
D
L
 
T
G
 
D
K
 
K
H
 
F
V
 
I
Y
 
F
V
 
T
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
T
 
A
H
 
T
D
 
T
I
 
L
Y
 
E
E
 
G
A
 
A
-
 
K
R
 
R
M
 
I
L
 
V
T
 
D
E
 
K
A
 
E
A
 
L
N
 
T
R
 
K
Y
 
S
K
 
K
V
 
K
V
 
V
T
 
I
Q
 
Q
M
 
V
G
 
G
N
 
F
Q
 
M
G
 
R
A
 
R
S
 
Y
G
 
D
D
 
Q
G
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
A
L
 
L
Q
 
K
E
 
E
W
 
K
Y
 
L
D
 
D
A
 
T
G
 
G
R
 
I
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6t2bB Glycoside hydrolase family 109 from akkermansia muciniphila in complex with galnac and NAD+.
29% identity, 27% coverage: 40:171/484 of query aligns to 25:167/439 of 6t2bB

query
sites
6t2bB
G
 
G
F
 
F
L
 
K
A
 
A
P
 
P
S
 
R
-
 
L
D
 
G
R
 
R
L
 
I
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
F
I
 
I
G
|
G
A
 
V
G
 
G
G
|
G
K
x
R
G
 
G
E
 
F
S
 
S
D
 
H
I
 
L
A
 
A
S
 
Q
I
 
M
V
 
C
R
 
V
G
 
M
G
 
D
K
 
G
T
 
V
D
 
E
V
 
I
A
 
V
F
 
G
L
 
I
C
 
C
D
|
D
V
x
L
D
 
K
D
 
E
R
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
V
-
 
D
R
 
R
A
 
V
A
 
L
N
 
S
S
 
R
L
 
M
K
 
G
N
 
K
F
 
S
P
 
P
K
 
L
A
 
G
K
 
Y
Y
 
S
Y
 
G
K
 
G
D
|
D
Y
 
M
R
 
E
E
 
Y
L
 
L
L
 
T
D
 
M
K
 
L
E
 
K
G
 
E
K
 
L
N
 
K
I
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
I
V
 
I
S
|
S
T
|
T
P
 
D
D
x
W
H
 
S
T
 
S
H
|
H
A
 
A
Q
 
R
I
 
I
A
 
A
M
 
C
A
 
D
A
 
S
M
 
M
Q
 
K
L
 
H
G
 
G
K
 
A
H
 
H
V
 
A
Y
 
F
V
 
V
Q
x
E
K
x
V
P
 
P
L
 
L
T
 
A
H
 
V
D
 
S
I
 
L
Y
 
E
E
 
E
A
 
L
R
 
W
M
 
S
L
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
T
T
 
S
E
 
E
A
 
A
A
 
T
N
 
R
R
 
K
Y
 
H
K
 
C
V
 
M
V
 
M
T
 
M
Q
 
E
M
x
N
G
 
V
N
 
N
Q
 
Y
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q2I8V6 1,5-anhydro-D-fructose reductase; Anhydrofructose reductase; 1,5-anhydro-D-fructose reductase (1,5-anhydro-D-mannitol-forming); EC 1.1.1.292 from Ensifer adhaerens (Sinorhizobium morelense) (see paper)
29% identity, 28% coverage: 63:197/484 of query aligns to 18:155/333 of Q2I8V6

query
sites
Q2I8V6
I
 
I
A
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
R
R
 
A
G
 
T
G
 
G
K
 
G
T
 
E
D
 
V
V
 
V
A
 
S
F
 
M
L
 
M
C
x
S
D
x
T
V
 
S
D
 
A
D
 
E
R
|
R
R
 
G
A
 
A
A
 
A
N
 
Y
S
 
A
L
 
T
K
 
E
N
 
N
F
 
-
P
 
G
K
 
I
A
 
G
K
 
K
Y
 
S
Y
 
V
K
 
T
D
 
S
Y
 
V
R
 
E
E
 
E
L
 
L
L
 
V
D
 
G
K
 
D
E
 
-
G
 
-
K
 
P
N
 
D
I
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
Y
V
 
V
S
 
S
T
|
T
P
x
T
D
x
N
H
x
E
T
x
L
H
|
H
A
 
R
Q
 
E
I
 
Q
A
 
T
M
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
I
Q
 
R
L
 
A
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
Y
 
L
V
 
C
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
T
 
A
H
 
M
D
 
T
I
 
L
Y
 
E
E
 
D
A
 
A
R
 
R
M
 
E
L
 
M
T
 
V
E
 
V
A
 
A
A
 
A
N
 
R
R
 
E
Y
 
A
K
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
L
Q
 
G
M
 
T
G
x
N
N
 
H
Q
 
H
G
 
L
A
 
R
S
 
N
G
 
A
D
 
A
G
 
A
V
 
H
R
 
R
R
 
A
L
 
M
Q
 
R
E
 
D
W
 
A
Y
 
I
D
 
A
A
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
-
 
P
-
 
I
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
V
V
 
F
H
 
H
T
 
A
V
 
V
Y
 
Y
C
 
L

Sites not aligning to the query:

2glxA Crystal structure analysis of bacterial 1,5-af reductase (see paper)
29% identity, 28% coverage: 63:197/484 of query aligns to 17:154/332 of 2glxA

query
sites
2glxA
I
 
I
A
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
R
R
 
A
G
 
T
G
 
G
K
 
G
T
 
E
D
 
V
V
 
V
A
 
S
F
 
M
L
 
M
C
x
S
D
x
T
V
 
S
D
 
A
D
 
E
R
|
R
R
 
G
A
 
A
A
 
A
N
 
Y
S
 
A
L
 
T
K
 
E
N
 
N
F
 
-
P
 
G
K
 
I
A
 
G
K
 
K
Y
 
S
Y
 
V
K
 
T
D
 
S
Y
 
V
R
 
E
E
 
E
L
 
L
L
 
V
D
 
G
K
 
D
E
 
-
G
 
-
K
 
P
N
 
D
I
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
Y
V
 
V
S
|
S
T
|
T
P
 
T
D
x
N
H
 
E
T
 
L
H
|
H
A
 
R
Q
 
E
I
 
Q
A
 
T
M
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
I
Q
 
R
L
 
A
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
Y
 
L
V
 
C
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
T
 
A
H
 
M
D
 
T
I
 
L
Y
 
E
E
 
D
A
 
A
R
 
R
M
 
E
L
 
M
T
 
V
E
 
V
A
 
A
A
 
A
N
 
R
R
 
E
Y
 
A
K
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
L
Q
 
G
M
 
T
G
 
N
N
 
H
Q
x
H
G
 
L
A
 
R
S
 
N
G
 
A
D
 
A
G
 
A
V
 
H
R
 
R
R
 
A
L
 
M
Q
 
R
E
 
D
W
 
A
Y
 
I
D
 
A
A
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
-
 
P
-
 
I
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
V
V
 
F
H
 
H
T
 
A
V
 
V
Y
 
Y
C
 
L

Sites not aligning to the query:

3ceaA Crystal structure of myo-inositol 2-dehydrogenase (np_786804.1) from lactobacillus plantarum at 2.40 a resolution
27% identity, 30% coverage: 48:192/484 of query aligns to 5:149/342 of 3ceaA

query
sites
3ceaA
L
 
L
Q
 
R
L
 
A
A
 
A
G
 
I
I
 
I
G
|
G
A
 
L
G
|
G
G
x
R
K
x
L
G
 
G
E
 
E
S
 
R
D
 
H
-
 
A
-
 
R
-
 
H
I
 
L
A
 
V
S
 
N
I
 
K
V
 
I
R
 
Q
G
 
G
G
 
V
K
 
K
T
 
L
D
 
V
V
 
A
A
 
A
F
 
-
L
 
-
C
 
C
D
 
A
V
x
L
D
 
D
D
 
S
R
 
N
R
x
Q
A
 
L
A
 
E
N
 
W
S
 
A
L
 
K
K
 
N
N
 
E
F
 
L
P
 
G
K
 
V
A
 
E
K
 
T
Y
 
T
Y
 
Y
K
 
T
D
 
N
Y
 
Y
R
 
K
E
 
D
L
 
M
L
 
I
D
 
D
K
 
T
E
 
E
G
 
-
K
 
-
N
 
N
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
F
V
 
I
S
x
V
T
x
A
P
|
P
D
x
T
H
 
P
T
x
F
H
|
H
A
 
P
Q
 
E
I
x
M
A
 
T
M
 
I
A
 
Y
A
 
A
M
 
M
Q
 
N
L
 
A
G
 
G
K
 
L
H
 
N
V
 
V
Y
 
F
V
 
C
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
T
 
G
H
 
L
D
 
D
I
 
F
Y
 
N
E
 
E
A
 
V
R
 
D
M
 
E
L
 
M
T
 
A
E
 
K
A
 
V
A
 
I
N
 
K
R
 
S
Y
 
H
-
 
P
K
 
N
V
 
Q
V
 
I
T
 
F
Q
 
Q
M
 
S
G
 
G
N
 
F
Q
x
M
G
 
R
A
 
R
S
 
Y
G
 
D
D
 
D
G
 
S
V
 
Y
R
 
R
R
 
Y
L
 
A
Q
 
K
E
 
K
W
 
I
Y
 
V
D
 
D
A
 
N
G
 
G
R
 
D
I
 
I
G
 
G
K
 
K
V
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>CA265_RS23295 FitnessBrowser__Pedo557:CA265_RS23295
MIEDKANSKTENSRRNFIKTTALAAAGFMIVPRHVLGGPGFLAPSDRLQLAGIGAGGKGE
SDIASIVRGGKTDVAFLCDVDDRRAANSLKNFPKAKYYKDYRELLDKEGKNIDAVTVSTP
DHTHAQIAMAAMQLGKHVYVQKPLTHDIYEARMLTEAANRYKVVTQMGNQGASGDGVRRL
QEWYDAGRIGKVHTVYCWTNRPVWPQGISWPTGKAEIPKELDWDLWLGSAPYKEYVNKLV
PFNWRGWWDYGTGAIGDMGCHLVEPPFRVLGLDTPISVECSVGSVYVDEFKRAYLPESCP
PSSHVILTFAKTPKTKHEVQVHWMDGGIKPERPEELGPNESFGDNGVLFIGTKGKMICET
YGKNPKLLPLSRNESDKTKITIPRIANQEEGHYTQFAEAAIAGYGKMELSSPFEIAGPLT
ETLLIANLAIRGTDVQRRDAAGKISYPGRDIKMLWDKVKMKVTNFDEVNQFVKREYRKGW
TLGV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory