SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CA265_RS25460 FitnessBrowser__Pedo557:CA265_RS25460 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

I3VE77 2-hydroxyisobutanoyl-CoA mutase large subunit; 2-hydroxyisobutyryl-CoA mutase large subunit; HCM large subunit; EC 5.4.99.64 from Aquincola tertiaricarbonis (see 2 papers)
49% identity, 99% coverage: 8:515/515 of query aligns to 40:556/562 of I3VE77

query
sites
I3VE77
T
 
T
T
 
I
S
 
G
G
 
D
I
 
F
E
 
P
I
 
V
K
 
Q
A
 
R
L
 
T
Y
 
Y
T
 
T
K
 
A
A
 
A
K
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
D
-
 
T
P
 
P
M
 
L
E
 
E
E
 
D
-
 
I
-
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
G
E
 
R
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
T
 
T
R
 
R
G
 
G
I
 
P
Q
x
Y
K
x
P
D
x
T
M
|
M
Y
 
Y
R
 
R
G
 
S
R
 
R
L
 
T
W
 
W
T
|
T
M
|
M
R
|
R
Q
 
Q
Y
x
I
A
 
A
G
 
G
F
 
F
S
 
G
T
 
T
A
 
G
E
 
E
E
 
D
S
 
T
N
 
N
K
 
K
R
 
R
Y
 
F
H
 
K
Y
 
Y
L
 
L
L
 
I
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
T
 
Q
T
 
T
G
 
G
L
 
I
S
 
S
V
 
T
A
x
D
F
 
F
D
 
D
L
 
M
P
 
P
T
 
T
Q
 
L
I
 
M
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
H
E
 
P
M
 
M
A
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
R
V
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
S
 
T
L
 
L
K
 
A
D
 
D
I
 
M
E
 
E
I
 
A
L
 
L
F
 
L
D
 
A
G
 
D
I
 
I
Q
 
D
L
 
L
K
 
E
D
 
K
I
 
I
T
 
S
T
 
V
S
 
S
M
 
F
T
 
T
I
 
I
N
 
N
A
 
P
T
 
S
A
 
A
S
 
W
I
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
A
M
 
M
Y
 
Y
I
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
G
K
 
E
K
 
K
Q
 
R
G
 
G
A
 
Y
D
 
D
L
 
L
K
 
N
Q
 
K
I
 
L
S
 
S
G
 
G
T
|
T
I
x
V
Q
|
Q
N
 
A
D
 
D
I
 
I
L
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
Y
A
 
M
A
 
A
R
 
Q
G
 
K
T
 
E
Y
 
Y
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
P
 
I
K
 
A
Q
 
P
S
 
S
M
 
V
R
 
R
L
 
I
I
 
V
T
 
R
D
 
D
I
 
I
F
 
I
E
 
T
F
 
Y
C
 
S
S
 
A
K
 
K
E
 
N
V
 
L
P
 
K
K
x
R
W
 
Y
N
 
N
T
 
P
I
 
I
S
x
N
I
 
I
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
H
|
H
I
 
I
R
 
S
E
 
E
A
 
A
G
 
G
S
 
S
T
 
S
A
 
P
V
 
L
Q
 
Q
E
 
E
L
 
A
A
 
A
F
 
F
T
 
T
L
 
L
A
 
A
N
 
N
G
 
L
K
 
I
T
 
T
Y
 
Y
L
 
V
K
 
N
A
 
E
A
 
V
L
 
T
D
 
K
K
 
T
G
 
G
L
 
M
D
 
H
I
 
V
N
 
D
V
 
E
F
 
F
A
 
A
K
 
P
R
|
R
L
 
L
S
 
A
F
 
F
F
 
F
F
 
F
N
 
V
C
 
S
H
 
Q
N
 
G
N
 
D
F
 
F
F
 
F
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
K
F
 
F
R
 
R
A
 
A
A
 
L
R
 
R
R
 
R
M
 
C
W
 
Y
A
 
A
K
 
K
I
 
I
T
 
M
K
 
K
D
 
E
-
 
R
L
 
F
G
 
G
A
 
A
T
 
R
D
 
N
E
 
P
K
 
E
A
 
S
Q
 
M
M
 
R
L
 
L
R
 
R
F
 
F
H
 
H
T
 
C
Q
 
Q
T
 
T
G
 
A
G
 
A
S
 
A
T
 
T
L
 
L
T
 
T
A
 
K
Q
 
P
Q
 
Q
P
 
Y
L
 
M
N
 
V
N
 
N
V
 
V
I
 
V
R
 
R
V
 
T
S
 
S
N
 
L
Q
 
Q
A
 
A
M
 
L
A
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
A
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
H
 
H
T
 
T
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
F
S
 
A
L
 
I
P
 
P
T
 
T
E
 
E
S
 
D
A
 
A
A
 
M
K
 
K
I
 
M
A
 
A
L
 
L
R
 
R
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
I
 
I
A
 
A
F
 
E
E
 
E
S
 
S
G
 
G
V
 
V
T
 
A
D
 
D
T
 
V
V
 
I
D
 
D
P
 
P
L
 
L
A
 
G
G
 
G
S
 
S
F
 
Y
F
 
Y
V
 
V
E
 
E
N
 
A
L
 
L
T
 
T
D
 
T
E
 
E
V
 
Y
E
 
E
T
 
K
A
 
K
A
 
I
W
 
F
A
 
E
Y
 
I
I
 
L
D
 
E
R
 
E
I
 
V
D
 
E
A
 
K
M
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
T
V
 
I
N
 
K
A
 
L
I
 
I
E
 
E
S
 
Q
D
 
G
Y
 
W
M
 
F
Q
 
Q
N
 
K
E
 
Q
I
 
I
A
 
A
G
 
D
A
 
F
S
 
A
Y
 
Y
Q
 
E
Y
 
T
Q
 
A
K
 
L
E
 
R
I
 
K
E
 
Q
S
 
S
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
I
 
P
S
 
V
V
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
R
F
 
F
T
 
V
Q
 
E
E
 
N
E
 
E
E
 
E
G
 
D
L
 
V
-
 
K
T
 
I
E
 
E
V
 
I
F
 
H
N
 
P
I
 
Y
D
 
D
D
 
N
S
 
T
I
 
T
R
 
A
K
 
E
L
 
R
Q
 
Q
S
 
I
E
 
S
K
 
R
L
 
T
E
 
R
I
 
R
L
 
V
K
 
R
T
 
A
T
 
E
R
 
R
D
 
D
N
 
E
D
 
A
A
 
K
V
 
V
E
 
Q
K
 
A
A
 
M
L
 
L
Q
 
D
S
 
Q
L
 
L
H
 
V
E
 
A
A
 
V
A
 
A
K
 
K
G
 
D
E
 
E
T
 
S
-
 
Q
N
 
N
L
 
L
M
 
M
P
 
P
L
 
L
I
 
T
I
 
I
D
 
E
A
 
L
V
 
V
E
 
K
K
 
A
Y
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
M
G
 
G
E
 
D
I
 
I
A
 
V
D
 
E
V
 
K
F
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
I
F
 
W
G
 
G
V
 
T
Y
 
Y

4r3uA Crystal structure of 2-hydroxyisobutyryl-coa mutase (see paper)
49% identity, 99% coverage: 8:515/515 of query aligns to 39:555/557 of 4r3uA

query
sites
4r3uA
T
 
T
T
 
I
S
 
G
G
 
D
I
 
F
E
 
P
I
 
V
K
 
Q
A
 
R
L
 
T
Y
 
Y
T
 
T
K
 
A
A
 
A
K
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
D
-
 
T
P
 
P
M
 
L
E
 
E
E
 
D
-
 
I
-
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
G
E
 
R
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
T
 
T
R
 
R
G
 
G
I
 
P
Q
x
Y
K
 
P
D
x
T
M
|
M
Y
 
Y
R
 
R
G
 
S
R
|
R
L
 
T
W
 
W
T
|
T
M
 
M
R
|
R
Q
 
Q
Y
x
I
A
 
A
G
 
G
F
 
F
S
 
G
T
 
T
A
 
G
E
 
E
E
 
D
S
 
T
N
 
N
K
 
K
R
 
R
Y
 
F
H
 
K
Y
 
Y
L
 
L
L
 
I
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
T
 
Q
T
 
T
G
 
G
L
 
I
S
 
S
V
 
T
A
x
D
F
 
F
D
 
D
L
x
M
P
 
P
T
 
T
Q
 
L
I
 
M
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
H
E
 
P
M
 
M
A
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
R
V
x
E
G
 
G
V
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
S
 
T
L
 
L
K
 
A
D
 
D
I
 
M
E
 
E
I
 
A
L
 
L
F
 
L
D
 
A
G
 
D
I
 
I
Q
 
D
L
 
L
K
 
E
D
 
K
I
 
I
T
 
S
T
 
V
S
|
S
M
 
F
T
|
T
I
 
I
N
 
N
A
 
P
T
 
S
A
 
A
S
 
W
I
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
A
M
 
M
Y
 
Y
I
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
G
K
 
E
K
 
K
Q
 
R
G
 
G
A
 
Y
D
 
D
L
 
L
K
 
N
Q
 
K
I
 
L
S
 
S
G
 
G
T
|
T
I
 
V
Q
|
Q
N
 
A
D
 
D
I
 
I
L
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
Y
A
 
M
A
 
A
R
x
Q
G
 
K
T
x
E
Y
 
Y
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
P
 
I
K
 
A
Q
 
P
S
 
S
M
 
V
R
 
R
L
 
I
I
 
V
T
 
R
D
 
D
I
 
I
F
 
I
E
 
T
F
 
Y
C
 
S
S
 
A
K
 
K
E
 
N
V
 
L
P
 
K
K
x
R
W
 
Y
N
|
N
T
 
P
I
 
I
S
x
N
I
 
I
S
 
S
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
I
 
I
R
 
S
E
|
E
A
 
A
G
 
G
S
 
S
T
 
S
A
 
P
V
 
L
Q
 
Q
E
 
E
L
 
A
A
 
A
F
 
F
T
 
T
L
 
L
A
 
A
N
 
N
G
 
L
K
 
I
T
 
T
Y
 
Y
L
 
V
K
 
N
A
 
E
A
 
V
L
 
T
D
 
K
K
 
T
G
 
G
L
 
M
D
 
H
I
 
V
N
 
D
V
 
E
F
 
F
A
 
A
K
 
P
R
|
R
L
 
L
S
 
A
F
 
F
F
|
F
F
 
F
N
 
V
C
 
S
H
 
Q
N
 
G
N
 
D
F
 
F
F
 
F
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
K
F
 
F
R
 
R
A
 
A
A
 
L
R
 
R
R
 
R
M
 
C
W
 
Y
A
 
A
K
 
K
I
 
I
T
 
M
K
 
K
D
 
E
-
 
R
L
 
F
G
 
G
A
 
A
T
 
R
D
 
N
E
 
P
K
 
E
A
 
S
Q
 
M
M
 
R
L
 
L
R
|
R
F
|
F
H
|
H
T
 
C
Q
|
Q
T
 
T
G
 
A
G
x
A
S
 
A
T
 
T
L
 
L
T
 
T
A
 
K
Q
 
P
Q
 
Q
P
 
Y
L
 
M
N
 
V
N
 
N
V
 
V
I
 
V
R
 
R
V
 
T
S
 
S
N
 
L
Q
 
Q
A
 
A
M
 
L
A
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
A
Q
|
Q
S
 
S
L
 
L
H
 
H
T
 
T
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
E
|
E
A
|
A
L
 
F
S
x
A
L
 
I
P
 
P
T
 
T
E
 
E
S
 
D
A
 
A
A
 
M
K
 
K
I
 
M
A
 
A
L
 
L
R
 
R
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
I
 
I
A
 
A
F
 
E
E
 
E
S
 
S
G
 
G
V
 
V
T
 
A
D
 
D
T
 
V
V
 
I
D
 
D
P
 
P
L
 
L
A
 
G
G
 
G
S
 
S
F
 
Y
F
 
Y
V
 
V
E
 
E
N
 
A
L
 
L
T
 
T
D
 
T
E
 
E
V
 
Y
E
 
E
T
 
K
A
 
K
A
 
I
W
 
F
A
 
E
Y
 
I
I
 
L
D
 
E
R
 
E
I
 
V
D
 
E
A
 
K
M
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
T
V
 
I
N
 
K
A
 
L
I
 
I
E
 
E
S
 
Q
D
 
G
Y
 
W
M
 
F
Q
 
Q
N
 
K
E
 
Q
I
 
I
A
 
A
G
 
D
A
 
F
S
 
A
Y
 
Y
Q
 
E
Y
 
T
Q
 
A
K
 
L
E
 
R
I
 
K
E
 
Q
S
 
S
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
I
 
P
S
 
V
V
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
R
F
 
F
T
 
V
Q
 
E
E
 
N
E
 
E
E
 
E
G
 
D
L
 
V
-
 
K
T
 
I
E
 
E
V
 
I
F
 
H
N
 
P
I
 
Y
D
 
D
D
 
N
S
 
T
I
 
T
R
 
A
K
 
E
L
 
R
Q
 
Q
S
 
I
E
 
S
K
 
R
L
 
T
E
 
R
I
 
R
L
 
V
K
 
R
T
 
A
T
 
E
R
 
R
D
 
D
N
 
E
D
 
A
A
 
K
V
 
V
E
 
Q
K
 
A
A
 
M
L
 
L
Q
 
D
S
 
Q
L
 
L
H
 
V
E
 
A
A
 
V
A
 
A
K
 
K
G
 
D
E
 
E
T
 
S
-
 
Q
N
 
N
L
 
L
M
 
M
P
 
P
L
 
L
I
 
T
I
 
I
D
 
E
A
 
L
V
 
V
E
 
K
K
 
A
Y
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
M
G
 
G
E
 
D
I
 
I
A
 
V
D
 
E
V
 
K
F
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
I
F
 
W
G
 
G
V
 
T
Y
 
Y

2xiqA Crystal structure of human methylmalonyl-coa mutase in complex with adenosylcobalamin and malonyl-coa (see paper)
49% identity, 98% coverage: 8:513/515 of query aligns to 28:539/714 of 2xiqA

query
sites
2xiqA
T
 
T
T
 
P
S
 
E
G
 
G
I
 
I
E
 
S
I
 
I
K
 
K
A
 
P
L
 
L
Y
 
Y
T
 
S
K
 
K
A
 
R
K
 
D
P
 
T
M
 
M
-
 
D
-
 
L
-
 
P
E
 
E
E
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
G
E
 
V
F
 
K
P
 
P
F
 
F
T
 
T
R
 
R
G
 
G
I
 
P
Q
x
Y
K
 
P
D
x
T
M
|
M
Y
 
Y
R
 
T
G
 
F
R
|
R
L
 
P
W
 
W
T
|
T
M
 
I
R
|
R
Q
 
Q
Y
|
Y
A
 
A
G
 
G
F
 
F
S
 
S
T
 
T
A
 
V
E
 
E
E
 
E
S
 
S
N
 
N
K
 
K
R
 
F
Y
 
Y
H
 
K
Y
 
D
L
 
N
L
 
I
A
 
K
Q
 
A
G
 
G
T
 
Q
T
 
Q
G
 
G
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
F
 
F
D
 
D
L
|
L
P
 
A
T
 
T
Q
x
H
I
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
N
E
 
P
M
 
R
A
 
V
D
 
R
G
 
G
E
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
M
V
x
A
G
 
G
V
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
S
 
T
L
 
V
K
 
E
D
 
D
I
 
T
E
 
K
I
 
I
L
 
L
F
 
F
D
 
D
G
 
G
I
 
I
Q
 
P
L
 
L
K
 
E
D
 
K
I
 
M
T
 
S
T
 
V
S
|
S
M
 
M
T
|
T
I
 
M
N
 
N
A
 
G
T
 
A
A
 
V
S
 
I
I
 
P
L
 
V
L
 
L
A
 
A
M
 
N
Y
 
F
I
 
I
A
 
V
L
 
T
A
 
G
K
 
E
K
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
D
 
P
L
 
K
K
 
E
Q
 
K
I
 
L
S
 
T
G
 
G
T
|
T
I
 
I
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
I
 
I
L
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
A
 
M
A
 
V
R
|
R
G
 
N
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
Y
 
F
P
 
P
P
 
P
K
 
E
Q
 
P
S
 
S
M
 
M
R
 
K
L
 
I
I
 
I
T
 
A
D
 
D
I
 
I
F
 
F
E
 
E
F
 
Y
C
 
T
S
 
A
K
 
K
E
 
H
V
 
M
P
 
P
K
|
K
W
 
F
N
 
N
T
 
S
I
 
I
S
 
S
I
 
I
S
 
S
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
I
 
M
R
 
Q
E
|
E
A
 
A
G
 
G
S
 
A
T
 
D
A
 
A
V
 
I
Q
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
L
 
L
A
 
A
N
 
D
G
 
G
K
 
L
T
 
E
Y
 
Y
L
 
S
K
 
R
A
 
T
A
 
G
L
 
L
D
 
Q
K
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
T
I
 
I
N
 
D
V
 
E
F
 
F
A
 
A
K
 
P
R
|
R
L
 
L
S
|
S
F
 
F
F
|
F
F
 
W
N
 
G
C
 
I
H
 
G
N
 
M
N
 
N
F
 
F
F
 
Y
E
 
M
E
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
F
 
M
R
 
R
A
 
A
A
 
G
R
 
R
R
 
R
M
 
L
W
 
W
A
 
A
K
 
H
-
 
L
I
 
I
T
 
E
K
 
K
D
 
M
L
 
F
G
 
Q
A
 
P
T
 
K
D
 
N
E
 
S
K
 
K
A
 
S
Q
 
L
M
 
L
L
 
L
R
|
R
F
x
A
H
|
H
T
 
C
Q
|
Q
T
 
T
G
 
S
G
|
G
S
x
W
T
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
E
Q
 
Q
Q
 
D
P
 
P
L
 
Y
N
 
N
N
 
N
V
 
I
I
 
V
R
 
R
V
 
T
S
 
A
N
 
I
Q
 
E
A
 
A
M
 
M
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
F
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
|
Q
S
 
S
L
 
L
H
 
H
T
 
T
N
 
N
G
 
S
Y
 
F
D
 
D
E
|
E
A
 
A
L
 
L
S
x
G
L
|
L
P
 
P
T
 
T
E
 
V
S
 
K
A
 
S
A
 
A
K
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
R
R
 
N
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
I
I
 
I
I
 
I
A
 
Q
F
 
E
E
 
E
S
 
S
G
 
G
V
 
I
T
 
P
D
 
K
T
 
V
V
 
A
D
 
D
P
 
P
L
 
W
A
 
G
G
 
G
S
 
S
F
 
Y
F
 
M
V
 
M
E
 
E
N
 
C
L
 
L
T
 
T
D
 
N
E
 
D
V
 
V
E
 
Y
T
 
D
A
 
A
A
 
A
W
 
L
A
 
K
Y
 
L
I
 
I
D
 
N
R
 
E
I
 
I
D
 
E
A
 
E
M
 
M
G
 
G
G
 
G
S
 
M
V
 
A
N
 
K
A
 
A
I
 
V
E
 
A
S
 
E
D
 
G
Y
 
I
M
 
P
Q
 
K
N
 
L
E
 
R
I
 
I
A
 
E
G
 
E
A
 
C
S
 
A
Y
 
A
Q
 
R
Y
 
R
Q
 
Q
K
 
A
E
 
R
I
 
I
E
 
D
S
 
S
G
 
G
E
 
S
R
 
E
I
 
V
S
 
I
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
K
F
 
Y
T
 
Q
Q
 
L
E
 
E
E
 
K
E
 
E
G
 
D
L
 
T
T
 
V
E
 
E
V
 
V
F
 
L
N
 
A
I
 
I
D
 
D
D
 
N
-
 
T
S
 
S
I
 
V
R
 
R
K
 
N
L
 
R
Q
 
Q
S
 
I
E
 
E
K
 
K
L
 
L
E
 
K
I
 
K
L
 
I
K
 
K
T
 
S
T
 
S
R
 
R
D
 
D
N
 
Q
D
 
A
A
 
L
V
 
A
E
 
E
K
 
R
A
 
C
L
 
L
Q
 
A
S
 
A
L
 
L
H
 
T
E
 
E
-
 
C
A
 
A
A
 
A
K
 
S
G
 
G
E
 
D
T
 
G
N
 
N
L
 
I
M
 
L
P
 
A
L
 
L
I
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
S
E
 
R
K
 
A
Y
 
R
A
 
C
T
 
T
L
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
T
D
 
D
V
 
A
F
 
L
R
 
K
G
 
K
T
 
V
F
 
F
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8gjuJ Crystal structure of human methylmalonyl-coa mutase (mmut) in complex with methylmalonic acidemia type a protein (mmaa), coenzyme a, and gdp (see paper)
49% identity, 98% coverage: 8:513/515 of query aligns to 28:539/689 of 8gjuJ

query
sites
8gjuJ
T
 
T
T
 
P
S
 
E
G
 
G
I
 
I
E
 
S
I
 
I
K
 
K
A
 
P
L
 
L
Y
 
Y
T
 
S
K
 
K
A
 
R
K
 
D
P
 
T
M
 
M
-
 
D
-
 
L
-
 
P
E
 
E
E
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
G
E
 
V
F
 
K
P
 
P
F
 
F
T
 
T
R
 
R
G
 
G
I
 
P
Q
x
Y
K
 
P
D
x
T
M
 
M
Y
 
Y
R
 
T
G
 
F
R
|
R
L
 
P
W
 
W
T
|
T
M
 
I
R
|
R
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
F
 
F
S
 
S
T
 
T
A
 
V
E
 
E
E
 
E
S
 
S
N
 
N
K
 
K
R
 
F
Y
 
Y
H
 
K
Y
 
D
L
 
N
L
 
I
A
 
K
Q
 
A
G
 
G
T
 
Q
T
 
Q
G
 
G
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
F
 
F
D
 
D
L
 
L
P
 
A
T
 
T
Q
 
H
I
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
N
E
 
P
M
 
R
A
 
V
D
 
R
G
 
G
E
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
M
V
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
S
 
T
L
 
V
K
 
E
D
 
D
I
 
T
E
 
K
I
 
I
L
 
L
F
 
F
D
 
D
G
 
G
I
 
I
Q
 
P
L
 
L
K
 
E
D
 
K
I
 
M
T
 
S
T
 
V
S
|
S
M
 
M
T
|
T
I
 
M
N
 
N
A
 
G
T
 
A
A
 
V
S
 
I
I
 
P
L
 
V
L
 
L
A
 
A
M
 
N
Y
 
F
I
 
I
A
 
V
L
 
T
A
 
G
K
 
E
K
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
D
 
P
L
 
K
K
 
E
Q
 
K
I
 
L
S
 
T
G
 
G
T
|
T
I
 
I
Q
|
Q
N
 
N
D
 
D
I
 
I
L
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
A
 
M
A
 
V
R
 
R
G
 
N
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
Y
 
F
P
 
P
P
 
P
K
 
E
Q
 
P
S
 
S
M
 
M
R
 
K
L
 
I
I
 
I
T
 
A
D
 
D
I
 
I
F
 
F
E
 
E
F
 
Y
C
 
T
S
 
A
K
 
K
E
 
H
V
 
M
P
 
P
K
 
K
W
 
F
N
|
N
T
 
S
I
 
I
S
 
S
I
 
I
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
H
 
H
I
 
M
R
 
Q
E
 
E
A
 
A
G
 
G
S
 
A
T
 
D
A
 
A
V
 
I
Q
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
L
 
L
A
 
A
N
 
D
G
 
G
K
 
L
T
 
E
Y
 
Y
L
 
S
K
 
R
A
 
T
A
 
G
L
 
L
D
 
Q
K
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
T
I
 
I
N
 
D
V
 
E
F
 
F
A
 
A
K
 
P
R
|
R
L
 
L
S
|
S
F
 
F
F
 
F
F
 
W
N
 
G
C
 
I
H
 
G
N
 
M
N
 
N
F
 
F
F
 
Y
E
 
M
E
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
F
 
M
R
 
R
A
 
A
A
 
G
R
 
R
R
 
R
M
 
L
W
 
W
A
 
A
K
 
H
-
 
L
I
 
I
T
 
E
K
 
K
D
 
M
L
 
F
G
 
Q
A
 
P
T
 
K
D
 
N
E
 
S
K
 
K
A
 
S
Q
 
L
M
 
L
L
 
L
R
|
R
F
x
A
H
|
H
T
 
C
Q
 
Q
T
 
T
G
 
S
G
 
G
S
 
W
T
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
E
Q
 
Q
Q
 
D
P
 
P
L
 
Y
N
 
N
N
 
N
V
 
I
I
 
V
R
 
R
V
 
T
S
 
A
N
 
I
Q
 
E
A
 
A
M
 
M
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
F
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
|
Q
S
 
S
L
 
L
H
 
H
T
 
T
N
 
N
G
 
S
Y
 
F
D
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
G
L
 
L
P
 
P
T
 
T
E
 
V
S
 
K
A
 
S
A
 
A
K
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
R
R
 
N
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
I
I
 
I
I
 
I
A
 
Q
F
 
E
E
 
E
S
 
S
G
 
G
V
 
I
T
 
P
D
 
K
T
 
V
V
 
A
D
 
D
P
 
P
L
 
W
A
 
G
G
 
G
S
 
S
F
 
Y
F
 
M
V
 
M
E
 
E
N
 
C
L
 
L
T
 
T
D
 
N
E
 
D
V
 
V
E
 
Y
T
 
D
A
 
A
A
 
A
W
 
L
A
 
K
Y
 
L
I
 
I
D
 
N
R
 
E
I
 
I
D
 
E
A
 
E
M
 
M
G
 
G
G
 
G
S
 
M
V
 
A
N
 
K
A
 
A
I
 
V
E
 
A
S
 
E
D
 
G
Y
 
I
M
 
P
Q
 
K
N
 
L
E
 
R
I
 
I
A
 
E
G
 
E
A
 
C
S
 
A
Y
 
A
Q
 
R
Y
 
R
Q
 
Q
K
 
A
E
 
R
I
 
I
E
 
D
S
 
S
G
 
G
E
 
S
R
 
E
I
 
V
S
 
I
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
K
F
 
Y
T
 
Q
Q
 
L
E
 
E
E
 
K
E
 
E
G
 
D
L
 
T
T
 
V
E
 
E
V
 
V
F
 
L
N
 
A
I
 
I
D
 
D
D
 
N
-
 
T
S
 
S
I
 
V
R
 
R
K
 
N
L
 
R
Q
 
Q
S
 
I
E
 
E
K
 
K
L
 
L
E
 
K
I
 
K
L
 
I
K
 
K
T
 
S
T
 
S
R
 
R
D
 
D
N
 
Q
D
 
A
A
 
L
V
 
A
E
 
E
K
 
R
A
 
C
L
 
L
Q
 
A
S
 
A
L
 
L
H
 
T
E
 
E
-
 
C
A
 
A
A
 
A
K
 
S
G
 
G
E
 
D
T
 
G
N
 
N
L
 
I
M
 
L
P
 
A
L
 
L
I
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
S
E
 
R
K
 
A
Y
 
R
A
 
C
T
 
T
L
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
T
D
 
D
V
 
A
F
 
L
R
 
K
G
 
K
T
 
V
F
 
F
G
 
G

P22033 Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial; MCM; Methylmalonyl-CoA isomerase; EC 5.4.99.2 from Homo sapiens (Human) (see 28 papers)
49% identity, 98% coverage: 8:513/515 of query aligns to 63:574/750 of P22033

query
sites
P22033
T
|
T
T
x
P
S
x
E
G
|
G
I
|
I
E
x
S
I
|
I
K
|
K
A
x
P
L
|
L
Y
|
Y
T
x
S
K
|
K
A
x
R
K
x
D
P
x
T
M
|
M
-
x
D
-
x
L
-
x
P
E
|
E
E
|
E
L
|
L
P
|
P
G
|
G
E
x
V
F
x
K
P
|
P
F
|
F
T
|
T
R
|
R
G
|
G
I
x
P
Q
x
Y
K
x
P
D
x
T
M
|
M
Y
|
Y
R
x
T
G
x
F
R
|
R
L
x
P
W
|
W
T
|
T
M
x
I
R
|
R
Q
|
Q
Y
|
Y
A
|
A
G
|
G
F
|
F
S
|
S
T
|
T
A
x
V
E
|
E
E
|
E
S
|
S
N
|
N
K
|
K
R
x
F
Y
|
Y
H
x
K
Y
x
D
L
x
N
L
x
I
A
x
K
Q
x
A
G
|
G
T
x
Q
T
x
Q
G
|
G
L
|
L
S
|
S
V
|
V
A
|
A
F
|
F
D
|
D
L
|
L
P
x
A
T
|
T
Q
x
H
I
x
R
G
|
G
Y
|
Y
D
|
D
S
|
S
D
|
D
H
x
N
E
x
P
M
x
R
A
x
V
D
x
R
G
|
G
E
x
D
V
|
V
G
|
G
K
x
M
V
x
A
G
|
G
V
|
V
A
|
A
I
|
I
D
|
D
S
x
T
L
x
V
K
x
E
D
|
D
I
x
T
E
x
K
I
|
I
L
|
L
F
|
F
D
|
D
G
|
G
I
|
I
Q
x
P
L
|
L
K
x
E
D
x
K
I
x
M
T
x
S
T
x
V
S
|
S
M
|
M
T
|
T
I
x
M
N
|
N
A
x
G
T
x
A
A
x
V
S
x
I
I
x
P
L
x
V
L
|
L
A
|
A
M
x
N
Y
x
F
I
|
I
A
x
V
L
x
T
A
x
G
K
x
E
K
x
E
Q
|
Q
G
|
G
A
x
V
D
x
P
L
x
K
K
x
E
Q
x
K
I
x
L
S
x
T
G
|
G
T
|
T
I
|
I
Q
|
Q
N
|
N
D
|
D
I
|
I
L
|
L
K
|
K
E
|
E
Y
x
F
A
x
M
A
x
V
R
|
R
G
x
N
T
|
T
Y
|
Y
I
|
I
Y
x
F
P
|
P
P
|
P
K
x
E
Q
x
P
S
|
S
M
|
M
R
x
K
L
x
I
I
|
I
T
x
A
D
|
D
I
|
I
F
|
F
E
|
E
F
x
Y
C
x
T
S
x
A
K
|
K
E
x
H
V
x
M
P
|
P
K
|
K
W
x
F
N
|
N
T
x
S
I
|
I
S
|
S
I
|
I
S
|
S
G
|
G
Y
|
Y
H
|
H
I
x
M
R
x
Q
E
|
E
A
|
A
G
|
G
S
x
A
T
x
D
A
|
A
V
x
I
Q
x
L
E
|
E
L
|
L
A
|
A
F
x
Y
T
|
T
L
|
L
A
|
A
N
x
D
G
|
G
K
x
L
T
x
E
Y
|
Y
L
x
S
K
x
R
A
x
T
A
x
G
L
|
L
D
x
Q
K
x
A
G
|
G
L
|
L
D
x
T
I
|
I
N
x
D
V
x
E
F
|
F
A
|
A
K
x
P
R
|
R
L
|
L
S
|
S
F
|
F
F
|
F
F
x
W
N
x
G
C
x
I
H
x
G
N
x
M
N
|
N
F
|
F
F
x
Y
E
x
M
E
|
E
I
|
I
A
|
A
K
|
K
F
x
M
R
|
R
A
|
A
A
x
G
R
|
R
R
|
R
M
x
L
W
|
W
A
|
A
K
x
H
-
x
L
I
|
I
T
x
E
K
|
K
D
x
M
L
x
F
G
x
Q
A
x
P
T
x
K
D
x
N
E
x
S
K
|
K
A
x
S
Q
x
L
M
x
L
L
|
L
R
|
R
F
x
A
H
|
H
T
x
C
Q
|
Q
T
|
T
G
x
S
G
|
G
S
x
W
T
x
S
L
|
L
T
|
T
A
x
E
Q
|
Q
Q
x
D
P
|
P
L
x
Y
N
|
N
N
|
N
V
x
I
I
x
V
R
|
R
V
x
T
S
x
A
N
x
I
Q
x
E
A
|
A
M
|
M
A
|
A
A
|
A
V
|
V
L
x
F
G
|
G
G
|
G
T
|
T
Q
|
Q
S
|
S
L
|
L
H
|
H
T
|
T
N
|
N
G
x
S
Y
x
F
D
|
D
E
|
E
A
|
A
L
|
L
S
x
G
L
|
L
P
|
P
T
|
T
E
x
V
S
x
K
A
x
S
A
|
A
K
x
R
I
|
I
A
|
A
L
x
R
R
x
N
T
|
T
Q
|
Q
Q
x
I
I
|
I
I
|
I
A
x
Q
F
x
E
E
|
E
S
|
S
G
|
G
V
x
I
T
x
P
D
x
K
T
x
V
V
x
A
D
|
D
P
|
P
L
x
W
A
x
G
G
|
G
S
|
S
F
x
Y
F
x
M
V
x
M
E
|
E
N
x
C
L
|
L
T
|
T
D
x
N
E
x
D
V
|
V
E
x
Y
T
x
D
A
|
A
A
|
A
W
x
L
A
x
K
Y
x
L
I
|
I
D
x
N
R
x
E
I
|
I
D
x
E
A
x
E
M
|
M
G
|
G
G
|
G
S
x
M
V
x
A
N
x
K
A
|
A
I
x
V
E
x
A
S
x
E
D
x
G
Y
x
I
M
x
P
Q
x
K
N
x
L
E
x
R
I
|
I
A
x
E
G
x
E
A
x
C
S
x
A
Y
x
A
Q
x
R
Y
x
R
Q
|
Q
K
x
A
E
x
R
I
|
I
E
x
D
S
|
S
G
|
G
E
x
S
R
x
E
I
x
V
S
x
I
V
|
V
G
|
G
V
|
V
N
|
N
K
|
K
F
x
Y
T
x
Q
Q
x
L
E
|
E
E
x
K
E
|
E
G
x
D
L
x
A
T
x
V
E
|
E
V
|
V
F
x
L
N
x
A
I
|
I
D
|
D
D
x
N
-
x
T
S
|
S
I
x
V
R
|
R
K
x
N
L
x
R
Q
|
Q
S
x
I
E
|
E
K
|
K
L
|
L
E
x
K
I
x
K
L
x
I
K
|
K
T
x
S
T
x
S
R
|
R
D
|
D
N
x
Q
D
x
A
A
x
L
V
x
A
E
|
E
K
x
R
A
x
C
L
|
L
Q
x
A
S
x
A
L
|
L
H
x
T
E
|
E
-
x
C
A
|
A
A
|
A
K
x
S
G
|
G
E
x
D
T
x
G
N
|
N
L
x
I
M
x
L
P
x
A
L
|
L
I
x
A
I
x
V
D
|
D
A
|
A
V
x
S
E
x
R
K
x
A
Y
x
R
A
x
C
T
|
T
L
x
V
G
|
G
E
|
E
I
|
I
A
x
T
D
|
D
V
x
A
F
x
L
R
x
K
G
x
K
T
x
V
F
|
F
G
|
G

Sites not aligning to the query:

8dyjB Crystal structure of human methylmalonyl-coa mutase in complex with adp and cob(ii)alamin (see paper)
49% identity, 98% coverage: 8:513/515 of query aligns to 27:538/708 of 8dyjB

query
sites
8dyjB
T
 
T
T
 
P
S
 
E
G
 
G
I
 
I
E
 
S
I
 
I
K
 
K
A
 
P
L
 
L
Y
 
Y
T
 
S
K
 
K
A
 
R
K
 
D
P
 
T
M
 
M
-
 
D
-
 
L
-
 
P
E
 
E
E
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
G
E
 
V
F
 
K
P
 
P
F
 
F
T
 
T
R
 
R
G
 
G
I
 
P
Q
 
Y
K
 
P
D
 
T
M
 
M
Y
 
Y
R
 
T
G
 
F
R
 
R
L
 
P
W
 
W
T
 
T
M
 
I
R
 
R
Q
 
Q
Y
|
Y
A
 
A
G
 
G
F
 
F
S
 
S
T
 
T
A
 
V
E
 
E
E
 
E
S
 
S
N
 
N
K
 
K
R
 
F
Y
 
Y
H
 
K
Y
 
D
L
 
N
L
 
I
A
 
K
Q
 
A
G
 
G
T
 
Q
T
 
Q
G
 
G
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
F
|
F
D
 
D
L
|
L
P
 
A
T
 
T
Q
x
H
I
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
N
E
 
P
M
 
R
A
 
V
D
 
R
G
 
G
E
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
M
V
x
A
G
 
G
V
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
S
 
T
L
 
V
K
 
E
D
 
D
I
 
T
E
 
K
I
 
I
L
 
L
F
 
F
D
 
D
G
 
G
I
 
I
Q
 
P
L
 
L
K
 
E
D
 
K
I
 
M
T
 
S
T
 
V
S
 
S
M
 
M
T
|
T
I
 
M
N
 
N
A
 
G
T
 
A
A
 
V
S
 
I
I
 
P
L
 
V
L
 
L
A
 
A
M
 
N
Y
 
F
I
 
I
A
 
V
L
 
T
A
 
G
K
 
E
K
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
D
 
P
L
 
K
K
 
E
Q
 
K
I
 
L
S
 
T
G
 
G
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
I
 
I
L
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
A
 
M
A
x
V
R
|
R
G
 
N
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
Y
 
F
P
 
P
P
 
P
K
 
E
Q
 
P
S
 
S
M
 
M
R
 
K
L
 
I
I
 
I
T
 
A
D
 
D
I
 
I
F
 
F
E
 
E
F
 
Y
C
 
T
S
 
A
K
 
K
E
 
H
V
 
M
P
 
P
K
 
K
W
 
F
N
 
N
T
 
S
I
 
I
S
 
S
I
 
I
S
 
S
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
I
 
M
R
 
Q
E
|
E
A
 
A
G
 
G
S
 
A
T
 
D
A
 
A
V
 
I
Q
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
L
 
L