SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CCNA_00545 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_00545 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3vzsB Crystal structure of phab from ralstonia eutropha in complex with acetoacetyl-coa and NADP (see paper)
55% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 7:248/249 of 3vzsB

query
sites
3vzsB
R
 
R
V
 
I
A
 
A
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
 
M
R
 
G
G
 
G
I
|
I
G
 
G
R
 
T
A
 
A
I
 
I
C
 
C
E
 
Q
R
 
R
L
 
L
I
 
A
A
 
K
D
 
D
G
 
G
H
 
F
K
 
R
V
 
V
A
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
C
S
x
G
G
 
P
N
 
N
E
 
S
A
 
P
A
x
R
A
 
R
E
 
E
A
 
K
C
 
W
-
 
L
-
 
E
-
 
Q
A
 
Q
K
 
K
E
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
F
M
 
D
V
 
F
V
 
I
-
 
A
-
 
S
K
 
E
G
|
G
N
|
N
V
|
V
G
 
A
V
 
D
F
 
W
E
 
D
D
 
S
C
 
T
Q
 
K
A
 
T
A
 
A
V
 
F
K
 
D
K
 
K
V
 
V
E
 
K
A
 
S
E
 
E
L
 
V
G
 
G
P
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
T
|
T
R
 
R
D
|
D
G
 
V
M
 
V
L
 
F
H
 
R
K
 
K
M
 
M
T
 
T
Y
 
R
E
 
A
Q
 
D
W
 
W
S
 
D
E
 
A
V
 
V
I
 
I
R
 
D
V
 
T
N
|
N
M
 
L
D
 
T
S
 
S
A
 
L
F
 
F
N
 
N
M
 
V
T
 
T
R
 
K
P
 
Q
V
 
V
I
 
I
E
 
D
G
 
G
M
 
M
R
 
A
D
 
D
R
 
R
S
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
I
S
 
S
S
|
S
I
 
V
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
Q
|
Q
M
x
F
G
 
G
Q
|
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
T
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
H
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
Q
E
 
E
N
 
V
A
 
A
K
 
T
K
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
T
I
 
V
C
 
S
P
|
P
G
|
G
Y
|
Y
I
|
I
D
 
A
T
 
T
E
 
D
M
|
M
V
|
V
A
 
K
A
 
A
V
 
I
P
x
R
E
 
Q
N
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
D
Q
 
K
I
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
V
G
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
L
G
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
S
M
 
I
V
 
C
S
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
S
G
 
S
E
 
E
R
 
E
A
 
S
G
 
G
F
 
F
V
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
D
L
 
F
T
 
S
L
 
L
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
L
Y
 
H
M
 
M

P14697 Acetoacetyl-CoA reductase; EC 1.1.1.36 from Cupriavidus necator (strain ATCC 17699 / DSM 428 / KCTC 22496 / NCIMB 10442 / H16 / Stanier 337) (Ralstonia eutropha) (see 2 papers)
55% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 4:245/246 of P14697

query
sites
P14697
R
 
R
V
 
I
A
 
A
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
M
R
x
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
T
A
 
A
I
 
I
C
 
C
E
 
Q
R
 
R
L
 
L
I
 
A
A
 
K
D
 
D
G
 
G
H
 
F
K
 
R
V
 
V
A
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
C
S
x
G
G
 
P
N
 
N
E
 
S
A
 
P
A
x
R
A
 
R
E
 
E
A
 
K
C
 
W
-
 
L
-
 
E
-
x
Q
A
 
Q
K
 
K
E
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
F
M
 
D
V
 
F
V
 
I
-
 
A
-
 
S
K
 
E
G
|
G
N
|
N
V
|
V
G
 
A
V
 
D
F
 
W
E
 
D
D
 
S
C
 
T
Q
 
K
A
 
T
A
 
A
V
 
F
K
 
D
K
 
K
V
 
V
E
 
K
A
 
S
E
 
E
L
 
V
G
 
G
P
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
|
T
R
 
R
D
|
D
G
 
V
M
 
V
L
 
F
H
 
R
K
|
K
M
 
M
T
 
T
Y
 
R
E
 
A
Q
 
D
W
 
W
S
 
D
E
 
A
V
 
V
I
 
I
R
 
D
V
 
T
N
 
N
M
 
L
D
 
T
S
 
S
A
 
L
F
 
F
N
 
N
M
 
V
T
 
T
R
 
K
P
 
Q
V
 
V
I
 
I
E
 
D
G
 
G
M
 
M
R
 
A
D
 
D
R
 
R
S
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
I
S
 
S
S
 
S
I
 
V
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
Q
|
Q
M
x
F
G
 
G
Q
|
Q
T
 
T
N
 
N
Y
 
Y
S
 
S
A
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
H
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
Q
E
 
E
N
 
V
A
 
A
K
x
T
K
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
T
I
 
V
C
 
S
P
|
P
G
|
G
Y
|
Y
I
|
I
D
 
A
T
 
T
E
 
D
M
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
A
V
 
I
P
x
R
E
 
Q
N
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
D
Q
 
K
I
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
V
G
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
L
G
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
S
M
 
I
V
 
C
S
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
S
G
 
S
E
 
E
R
 
E
A
 
S
G
 
G
F
 
F
V
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
D
L
 
F
T
 
S
L
 
L
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
L
Y
 
H
M
 
M

4k6fB X-ray crystal structure of a putative acetoacetyl-coa reductase from burkholderia cenocepacia bound to the co-factor NADP
52% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 2:244/245 of 4k6fB

query
sites
4k6fB
R
 
R
V
 
I
A
 
A
F
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
 
M
R
 
G
G
|
G
I
 
L
G
 
G
R
 
E
A
 
A
I
 
V
C
 
S
E
 
I
R
 
R
L
 
L
I
 
N
A
 
D
D
 
A
G
 
G
H
 
H
K
 
R
V
 
V
A
 
V
A
 
V
G
 
T
Y
|
Y
S
|
S
G
 
P
N
 
N
E
x
N
A
 
T
A
 
G
A
 
A
E
 
D
-
 
R
-
 
W
-
 
L
-
 
T
-
 
E
-
 
M
-
 
H
A
 
A
C
 
A
A
 
G
K
 
R
E
 
E
L
 
F
G
 
H
V
 
A
M
 
Y
V
 
P
V
|
V
K
 
-
G
 
-
N
x
D
V
|
V
G
 
A
V
 
D
F
 
H
E
 
D
D
 
S
C
 
C
Q
 
Q
A
 
Q
A
 
C
V
 
I
K
 
E
K
 
K
V
 
I
E
 
V
A
 
R
E
 
D
L
 
V
G
 
G
P
 
P
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
M
M
 
T
L
 
L
H
 
R
K
 
K
M
 
L
T
 
D
Y
 
K
E
 
V
Q
x
N
W
 
W
S
 
D
E
 
A
V
 
V
I
 
I
R
 
R
V
 
T
N
 
N
M
 
L
D
 
D
S
 
S
A
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
M
T
 
T
R
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
C
E
 
D
G
 
G
M
 
M
R
 
V
D
 
E
R
 
R
S
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
I
S
 
S
S
|
S
I
 
V
N
 
N
G
 
G
Q
 
S
K
 
K
G
 
G
Q
 
S
M
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
M
I
 
H
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
I
A
 
A
K
 
R
K
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
T
I
 
V
C
 
S
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
I
 
L
D
 
A
T
 
T
E
 
K
M
 
M
V
 
V
A
 
T
A
 
A
V
 
I
P
 
P
E
 
Q
N
 
D
V
 
I
L
 
L
-
 
D
A
 
T
Q
 
K
I
 
I
V
 
L
A
 
P
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
K
G
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
A
M
 
L
V
 
V
S
 
A
F
 
Y
L
 
L
A
 
C
G
 
S
E
 
E
R
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
T
 
N
L
 
I
T
 
A
L
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
H
M
 
M

5vmlA Crystal structure of acetoacetyl-coa reductase from burkholderia pseudomallei 1710b with bound NADP
55% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 3:244/245 of 5vmlA

query
sites
5vmlA
R
 
R
V
 
I
A
 
A
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
 
M
R
x
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
T
A
 
S
I
 
I
C
 
C
E
 
Q
R
 
R
L
 
L
I
 
H
A
 
K
D
 
D
G
 
G
H
 
F
K
 
R
V
 
V
A
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
x
C
S
x
G
G
 
P
N
 
N
E
 
S
A
 
P
-
x
R
-
 
R
-
 
V
-
 
K
-
 
W
A
 
L
A
 
E
E
 
D
A
 
Q
C
 
K
A
 
A
K
 
L
E
 
G
L
 
F
G
 
D
V
 
F
M
 
Y
V
 
A
V
 
S
K
 
E
G
|
G
N
|
N
V
|
V
G
 
G
V
 
D
F
 
W
E
 
D
D
 
S
C
 
T
Q
 
K
A
 
Q
A
 
A
V
 
F
K
 
D
K
 
K
V
 
V
E
 
K
A
 
A
E
 
E
L
 
V
G
 
G
P
 
E
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
V
M
 
V
L
 
F
H
 
R
K
 
K
M
 
M
T
 
T
Y
 
R
E
 
E
Q
 
D
W
 
W
S
 
Q
E
 
A
V
 
V
I
 
I
R
 
D
V
 
T
N
|
N
M
 
L
D
 
T
S
 
S
A
 
L
F
 
F
N
 
N
M
 
V
T
 
T
R
 
K
P
 
Q
V
 
V
I
 
I
E
 
D
G
 
G
M
 
M
R
 
V
D
 
E
R
 
R
S
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
S
S
|
S
I
 
V
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
M
 
F
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
T
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
I
I
 
H
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
M
A
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
Q
E
 
E
N
 
V
A
 
A
K
 
T
K
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
T
I
 
V
C
 
S
P
|
P
G
|
G
Y
 
Y
I
|
I
D
 
G
T
 
T
E
 
D
M
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
A
V
 
I
P
 
R
E
 
P
N
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
E
Q
 
K
I
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
V
G
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
S
G
 
P
E
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
D
 
S
M
 
I
V
 
V
S
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
A
G
 
S
E
 
E
R
 
E
A
 
S
G
 
G
F
 
F
V
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
D
L
 
F
T
 
S
L
 
L
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
L
Y
 
H
M
 
M

5vt6A Crystal structure of acetoacetyl-coa reductase from burkholderia pseudomallei 1710b complexed with NADP
48% identity, 99% coverage: 3:240/240 of query aligns to 2:245/245 of 5vt6A

query
sites
5vt6A
R
 
R
V
 
V
A
 
A
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
 
M
R
x
G
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
A
A
 
A
I
 
I
C
 
S
E
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
H
A
 
D
D
 
A
G
 
G
H
 
M
K
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
V
G
 
S
Y
x
H
S
|
S
G
 
E
N
 
R
E
x
N
A
 
D
A
 
H
A
 
V
E
 
S
A
 
T
-
 
W
-
 
L
-
 
M
-
 
H
-
 
E
-
 
R
-
 
D
C
 
A
A
 
G
K
 
R
E
 
D
L
 
F
G
 
K
V
 
A
M
 
Y
V
 
A
V
|
V
K
 
-
G
 
-
N
x
D
V
|
V
G
 
A
V
 
D
F
 
F
E
 
E
D
 
S
C
 
C
Q
 
E
A
 
R
A
 
C
V
 
A
K
 
E
K
 
K
V
 
V
E
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
F
G
 
G
P
 
K
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
A
M
 
T
L
 
F
H
 
M
K
 
K
M
 
M
T
 
T
Y
 
K
E
 
G
Q
x
D
W
 
W
S
 
D
E
 
A
V
 
V
I
 
M
R
 
R
V
 
T
N
 
D
M
 
L
D
 
D
S
 
A
A
 
M
F
 
F
N
 
N
M
 
V
T
 
T
R
 
K
P
 
Q
V
 
F
I
 
I
E
 
A
G
 
G
M
 
M
R
 
V
D
 
E
R
 
R
S
 
R
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
|
I
S
 
G
S
|
S
I
 
V
N
 
N
G
 
G
Q
 
S
K
 
R
G
 
G
Q
 
A
M
 
F
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
I
I
 
H
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
T
A
 
A
K
 
K
K
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
T
I
 
V
C
 
S
P
|
P
G
 
G
Y
|
Y
I
x
L
D
 
A
T
|
T
E
 
A
M
 
M
V
 
V
A
 
E
A
 
A
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
N
 
D
V
 
V
L
 
L
-
 
E
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
V
 
L
A
 
P
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
P
E
 
D
E
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
A
M
 
L
V
 
I
S
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
C
G
 
S
E
 
D
R
 
D
A
 
A
G
 
G
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
D
L
 
L
T
 
A
L
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
Y
 
H
M
 
M
A
 
S

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
47% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 6:243/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
R
 
K
V
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
x
A
T
x
S
R
|
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
C
 
A
E
 
E
R
 
T
L
 
L
I
 
A
A
 
A
D
 
R
G
 
G
H
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
A
 
-
G
 
G
Y
 
T
S
 
A
G
x
T
N
 
S
E
 
E
A
 
N
A
 
G
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
C
 
I
A
 
S
K
 
D
E
 
Y
L
 
L
G
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
G
V
 
L
M
 
M
V
 
L
V
 
-
K
 
-
G
 
-
N
|
N
V
|
V
G
 
T
V
 
D
F
 
P
E
 
A
D
 
S
C
 
I
Q
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
K
 
E
K
 
K
V
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
M
 
L
L
 
L
H
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
Y
 
D
E
 
E
Q
 
E
W
 
W
S
 
N
E
 
D
V
 
I
I
 
I
R
 
E
V
 
T
N
 
N
M
 
L
D
 
S
S
 
S
A
 
V
F
 
F
N
 
R
M
 
L
T
 
S
R
 
K
P
 
A
V
 
V
I
 
M
E
 
R
G
 
A
M
 
M
R
 
M
D
 
K
R
 
K
S
 
R
W
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
 
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
T
K
 
M
G
 
G
Q
 
N
M
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
x
A
A
|
A
A
|
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
N
 
V
A
 
A
K
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
I
|
I
D
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
R
A
 
A
V
 
L
P
 
S
E
 
D
N
 
D
V
 
Q
L
 
R
A
 
A
Q
 
G
I
 
I
V
 
L
A
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
G
G
 
A
E
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
N
M
 
A
V
 
V
S
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
E
 
D
R
 
E
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
x
E
T
 
T
L
 
L
T
 
H
L
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
Y
 
Y
M
 
M

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
47% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 5:242/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
R
 
K
V
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
C
 
A
E
 
E
R
 
T
L
 
L
I
 
A
A
 
A
D
 
R
G
 
G
H
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
A
 
-
G
 
G
Y
 
T
S
 
A
G
x
T
N
 
S
E
 
E
A
 
N
A
 
G
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
C
 
I
A
 
S
K
 
D
E
 
Y
L
 
L
G
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
G
V
 
L
M
 
M
V
 
L
V
 
-
K
 
-
G
 
-
N
|
N
V
|
V
G
 
T
V
 
D
F
 
P
E
 
A
D
 
S
C
 
I
Q
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
K
 
E
K
 
K
V
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
M
 
L
L
 
L
H
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
Y
 
D
E
 
E
Q
x
E
W
 
W
S
 
N
E
 
D
V
 
I
I
 
I
R
 
E
V
 
T
N
 
N
M
 
L
D
 
S
S
 
S
A
 
V
F
 
F
N
 
R
M
 
L
T
 
S
R
 
K
P
 
A
V
 
V
I
 
M
E
 
R
G
 
A
M
 
M
R
 
M
D
 
K
R
 
K
S
 
R
W
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
|
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
T
K
 
M
G
 
G
Q
 
N
M
 
G
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
N
 
V
A
 
A
K
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
I
|
I
D
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
R
A
 
A
V
 
L
P
 
S
E
 
D
N
 
D
V
 
Q
L
 
R
A
 
A
Q
 
G
I
 
I
V
 
L
A
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
G
G
 
A
E
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
N
M
 
A
V
 
V
S
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
E
 
D
R
 
E
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
x
E
T
|
T
L
 
L
T
 
H
L
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
Y
 
Y
M
 
M

1q7cA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase y151f mutant in complex with NADPH fragment (see paper)
47% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 5:242/243 of 1q7cA

query
sites
1q7cA
R
 
K
V
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
C
 
A
E
 
E
R
 
T
L
 
L
I
 
A
A
 
A
D
 
R
G
 
G
H
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
A
 
-
G
 
G
Y
 
T
S
x
A
G
x
T
N
 
S
E
 
E
A
 
N
A
 
G
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
C
 
I
A
 
S
K
 
D
E
 
Y
L
 
L
G
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
G
V
 
L
M
 
M
V
x
L
V
 
-
K
 
-
G
 
-
N
|
N
V
|
V
G
 
T
V
 
D
F
 
P
E
 
A
D
 
S
C
 
I
Q
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
K
 
E
K
 
K
V
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
M
 
L
L
 
L
H
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
Y
 
D
E
 
E
Q
 
E
W
 
W
S
 
N
E
 
D
V
 
I
I
 
I
R
 
E
V
 
T
N
 
N
M
 
L
D
 
S
S
 
S
A
 
V
F
 
F
N
 
R
M
 
L
T
 
S
R
 
K
P
 
A
V
 
V
I
 
M
E
 
R
G
 
A
M
 
M
R
 
M
D
 
K
R
 
K
S
 
R
W
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
|
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
T
K
 
M
G
 
G
Q
 
N
M
 
G
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
x
F
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
N
 
V
A
 
A
K
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
D
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
R
A
 
A
V
 
L
P
 
S
E
 
D
N
 
D
V
 
Q
L
 
R
A
 
A
Q
 
G
I
 
I
V
 
L
A
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
G
G
 
A
E
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
N
M
 
A
V
 
V
S
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
E
 
D
R
 
E
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
H
L
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
Y
 
Y
M
 
M

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
46% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 6:243/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
R
 
K
V
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
C
 
A
E
 
E
R
 
T
L
 
L
I
 
V
A
 
A
D
 
R
G
 
G
H
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
A
 
-
G
 
G
Y
 
T
S
 
A
G
x
T
N
 
S
E
 
E
A
 
S
A
 
G
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
C
 
I
A
 
S
K
 
D
E
 
Y
L
 
L
G
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
G
V
 
L
M
 
M
V
x
L
V
 
-
K
 
-
G
 
-
N
|
N
V
|
V
G
 
T
V
 
D
F
 
P
E
 
A
D
 
S
C
 
I
Q
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
K
 
E
K
 
N
V
 
V
E
 
R
A
 
A
E
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
M
 
L
L
 
L
H
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
Y
 
D
E
 
D
Q
 
E
W
 
W
S
 
N
E
 
D
V
 
I
I
 
I
R
 
E
V
 
T
N
 
N
M
 
L
D
 
S
S
 
S
A
 
V
F
 
F
N
 
R
M
 
L
T
 
S
R
 
K
P
 
A
V
 
V
I
 
M
E
 
R
G
 
A
M
 
M
R
 
M
D
 
K
R
 
K
S
 
R
W
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
|
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
T
K
 
M
G
 
G
Q
 
N
M
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
N
 
V
A
 
A
K
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
D
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
R
A
 
A
V
 
L
P
 
T
E
 
D
N
 
E
V
 
Q
L
 
R
A
 
A
Q
 
G
I
 
T
V
 
L
A
 
A
G
 
A
I
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
T
G
 
P
E
 
N
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
S
M
 
A
V
 
V
S
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
E
 
D
R
 
E
A
 
A
G
 
S
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
H
L
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
Y
 
Y
M
 
M

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
46% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 6:243/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
R
 
K
V
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
T
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
C
 
A
E
 
E
R
 
T
L
 
L
I
 
V
A
 
A
D
 
R
G
 
G
H
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
A
 
-
G
 
G
Y
 
T
S
 
A
G
 
T
N
 
S
E
 
E
A
 
N
A
 
G
A
 
A
E
 
K
A
 
N
C
 
I
A
 
S
K
 
D
E
 
Y
L
 
L
G
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
G
V
 
L
M
 
M
V
 
L
V
 
-
K
 
-
G
 
-
N
 
N
V
 
V
G
 
T
V
 
D
F
 
P
E
 
A
D
 
S
C
 
I
Q
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
K
 
E
K
 
N
V
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
M
 
L
L
 
L
H
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
Y
 
D
E
 
D
Q
 
E
W
 
W
S
 
N
E
 
D
V
 
I
I
 
I
R
 
E
V
 
T
N
 
N
M
 
L
D
 
S
S
 
S
A
 
V
F
 
F
N
 
R
M
 
L
T
 
S
R
 
K
P
 
A
V
 
V
I
 
M
E
 
R
G
 
A
M
|
M
R
 
M
D
 
K
R
 
K
S
 
R
W
 
C
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
 
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
T
K
 
M
G
 
G
Q
 
N
M
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
 
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
N
 
V
A
 
A
K
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
D
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
R
A
 
A
V
 
L
P
 
S
E
 
D
N
 
D
V
 
Q
L
 
R
A
 
A
Q
 
G
I
 
I
V
 
L
A
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
G
G
 
A
E
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
S
M
 
A
V
 
V
S
 
A
F
 
F
L
 
L
A
|
A
G
x
S
E
 
D
R
 
E
A
 
A
G
 
S
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
H
L
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
Y
 
Y
M
 
M

7emgB Carbonyl reductase variant 4 (r123c/l209p/f183y/v61k) from serratia marcescens complexed with NADP+ (see paper)
46% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 5:242/243 of 7emgB

query
sites
7emgB
R
 
K
V
 
I
A
 
V
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
R
|
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
C
 
A
E
 
E
R
 
T
L
 
F
I
 
V
A
 
A
D
 
R
G
 
G
H
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
A
 
-
G
 
G
Y
 
T
S
 
A
G
x
T
N
 
S
E
 
E
A
 
S
A
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
A
C
 
I
A
 
S
K
 
G
E
 
Y
L
 
L
G
 
G
V
 
A
M
 
N
V
 
G
V
 
-
K
 
K
G
 
G
-
 
F
-
 
M
-
 
L
N
|
N
V
|
V
G
 
K
V
 
D
F
 
A
E
 
Q
D
 
S
C
 
I
Q
 
D
A
 
S
A
 
V
V
 
L
K
 
A
K
 
S
V
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
M
 
L
L
 
L
H
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
Y
 
D
E
 
D
Q
 
E
W
 
W
S
 
E
E
 
D
V
 
I
I
 
L
R
 
D
V
 
T
N
 
N
M
 
L
D
 
T
S
 
S
A
 
V
F
 
F
N
 
R
M
 
L
T
 
S
R
 
K
P
 
A
V
 
V
I
 
M
E
 
C
G
 
A
M
 
M
R
 
M
D
 
K
R
 
K
S
 
R
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
 
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
T
K
 
M
G
 
G
Q
 
N
M
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
 
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
N
 
V
A
 
A
K
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
I
 
I
D
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
R
A
 
A
V
 
L
P
 
T
E
 
D
N
 
D
V
 
Q
L
 
R
A
 
A
Q
 
G
I
 
I
V
 
L
A
 
S
G
 
S
I
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
N
R
 
R
L
 
P
G
 
G
R
 
D
G
 
A
E
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
S
M
 
A
V
 
V
S
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
E
 
D
R
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
H
L
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
Y
 
Y
M
 
M

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
46% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 9:246/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
R
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
R
|
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
I
 
I
C
 
A
E
 
E
R
 
L
L
 
L
I
 
A
A
 
E
D
 
R
G
 
G
H
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
A
 
-
G
 
G
Y
 
T
S
 
A
G
x
T
N
 
S
E
 
E
A
 
S
A
 
G
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
C
 
I
A
 
S
K
 
D
E
 
Y
L
 
L
G
 
G
V
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
G
M
 
M
V
 
A
V
 
L
K
 
-
G
 
-
N
|
N
V
|
V
G
 
T
V
 
N
F
 
P
E
 
E
D
 
S
C
 
I
Q
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
L
K
 
K
K
 
A
V
 
I
E
 
T
A
 
D
E
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
M
 
L
L
 
L
H
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
Y
 
E
E
 
E
Q
 
E
W
 
W
S
 
S
E
 
D
V
 
I
I
 
M
R
 
E
V
 
T
N
 
N
M
 
L
D
 
T
S
 
S
A
 
I
F
 
F
N
 
R
M
 
L
T
 
S
R
 
K
P
 
A
V
 
V
I
 
L
E
 
R
G
 
G
M
 
M
R
 
M
D
 
K
R
 
K
S
 
R
W
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
V
S
 
G
S
|
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
T
K
 
M
G
 
G
Q
 
N
M
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
M
A
 
A
L
 
R
E
 
E
N
 
V
A
 
A
K
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
T
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
I
|
I
D
 
E
T
|
T
E
 
D
M
|
M
V
 
T
A
 
K
A
 
A
V
 
L
P
 
N
E
 
D
N
 
E
V
 
Q
L
 
R
A
 
T
Q
 
A
I
 
T
V
 
L
A
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
D
G
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
S
M
 
A
V
 
V
S
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
E
 
P
R
 
E
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
H
L
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
Y
 
Y
M
 
M

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
47% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 9:242/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
R
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
I
 
I
C
 
A
E
 
E
R
 
L
L
 
L
I
 
A
A
 
E
D
 
R
G
 
G
H
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
A
 
-
G
 
G
Y
 
T
S
 
A
G
x
T
N
 
S
E
 
E
A
 
S
A
 
G
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
C
 
I
A
 
S
K
 
D
E
 
Y
L
 
L
G
 
G
V
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
G
M
 
M
V
 
A
V
 
L
K
 
-
G
 
-
N
|
N
V
|
V
G
 
T
V
 
N
F
 
P
E
 
E
D
 
S
C
 
I
Q
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
L
K
 
K
K
 
A
V
 
I
E
 
T
A
 
D
E
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
M
 
L
L
 
L
H
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
Y
 
E
E
 
E
Q
 
E
W
 
W
S
 
S
E
 
D
V
 
I
I
 
M
R
 
E
V
 
T
N
|
N
M
 
L
D
 
T
S
 
S
A
 
I
F
 
F
N
 
R
M
 
L
T
 
S
R
 
K
P
 
A
V
 
V
I
 
L
E
 
R
G
 
G
M
 
M
R
 
M
D
 
K
R
 
K
S
 
R
W
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
V
S
x
G
S
|
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
T
K
 
M
G
 
G
Q
 
N
M
 
A
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
M
A
 
A
L
 
R
E
 
E
N
 
V
A
 
A
K
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
T
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
I
 
I
D
 
E
T
|
T
E
 
D
M
 
M
V
 
N
A
 
D
A
 
E
V
 
Q
P
 
R
E
 
T
N
 
A
V
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
I
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
D
G
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
S
M
 
A
V
 
V
S
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
E
 
P
R
 
E
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
H
L
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
Y
 
Y
M
 
M

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
42% identity, 100% coverage: 1:239/240 of query aligns to 3:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
M
 
M
T
 
T
R
 
K
V
 
S
A
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
T
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
I
 
I
C
 
A
E
 
L
R
 
Q
L
 
L
I
 
A
A
 
E
D
 
E
G
 
G
H
 
Y
K
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
V
G
 
N
Y
 
Y
S
 
A
G
 
G
N
 
S
E
 
K
A
 
E
A
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
A
C
 
V
A
 
V
K
 
E
E
 
E
L
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
K
G
 
G
V
 
V
-
 
D
-
 
S
M
 
F
V
 
A
V
 
I
K
 
Q
G
 
A
N
 
N
V
 
V
G
 
A
V
 
D
F
 
A
E
 
D
D
 
E
C
 
V
Q
 
K
A
 
A
A
 
M
V
 
I
K
 
K
K
 
E
V
 
V
E
 
V
A
 
S
E
 
Q
L
 
F
G
 
G
P
 
S
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
M
 
L
L
 
L
H
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
Y
 
E
E
 
Q
Q
 
E
W
 
W
S
 
D
E
 
D
V
 
V
I
 
I
R
 
D
V
 
T
N
 
N
M
 
L
D
 
K
S
 
G
A
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
C
T
 
I
R
 
Q
P
 
K
V
 
A
I
 
T
E
 
P
G
 
Q
M
 
M
R
 
L
D
 
R
R
 
Q
S
 
R
W
 
S
G
 
G
R
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
A
K
 
V
G
 
G
Q
 
N
M
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
E
N
 
L
A
 
A
K
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
A
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
D
 
V
T
 
S
E
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
D
A
 
A
V
 
L
P
 
S
E
 
D
N
 
E
V
 
L
L
 
K
A
 
E
Q
 
Q
I
 
M
V
 
L
A
 
T
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
A
R
 
R
L
 
F
G
 
G
R
 
Q
G
 
D
E
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
N
M
 
T
V
 
V
S
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
E
 
D
R
 
K
A
 
A
G
 
K
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
T
 
T
L
 
I
T
 
H
L
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
Y
 
Y
M
 
M

4ag3A Crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with NADPH at 1.8a resolution (see paper)
45% identity, 99% coverage: 3:240/240 of query aligns to 13:254/254 of 4ag3A

query
sites
4ag3A
R
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
I
 
I
C
 
A
E
 
L
R
 
E
L
 
L
I
 
G
A
 
R
D
 
L
G
 
G
H
 
-
K
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
I
G
 
G
Y
 
T
S
 
A
G
x
T
N
 
S
E
 
A
A
 
S
A
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
K
C
 
I
A
 
A
K
 
E
E
 
T
L
 
L
G
 
K
V
 
A
M
 
N
V
 
G
V
 
V
K
 
E
G
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
V
-
x
L
N
x
D
V
|
V
G
 
S
V
 
S
F
 
D
E
 
E
D
 
S
C
 
V
Q
 
A
A
 
A
A
 
T
V
 
L
K
 
E
K
 
H
V
 
I
E
 
Q
A
 
Q
E
 
H
L
 
L
G
 
G
P
 
Q
I
 
P
D
 
L
I
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
M
 
L
L
 
L
H
 
V
K
 
R
M
 
M
T
 
K
Y
 
D
E
 
D
Q
 
E
W
 
W
S
 
F
E
 
D
V
 
V
I
 
V
R
 
N
V
 
T
N
 
N
M
 
L
D
 
N
S
 
S
A
 
L
F
 
Y
N
 
R
M
 
L
T
 
S
R
 
K
P
 
A
V
 
V
I
 
L
E
 
R
G
 
G
M
 
M
R
 
T
D
 
K
R
 
A
S
 
R
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
G
S
|
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
A
K
 
M
G
 
G
Q
 
N
M
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
E
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
N
 
V
A
 
G
K
 
S
K
 
R
G
 
A
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
A
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
x
F
I
|
I
D
 
D
T
|
T
E
 
D
M
|
M
V
x
T
A
 
R
A
 
E
V
 
L
P
 
P
E
 
E
N
 
A
V
 
Q
L
 
R
A
 
E
Q
 
A
I
 
L
V
 
L
A
 
G
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
Q
G
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
K
M
 
V
V
 
V
S
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
E
 
D
R
 
G
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
V
T
 
P
L
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
Y
 
Y
M
 
M
A
 
S

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
42% identity, 99% coverage: 2:239/240 of query aligns to 1:239/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
T
 
T
R
 
K
V
 
S
A
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
I
 
I
C
 
A
E
 
L
R
 
Q
L
 
L
I
 
A
A
 
E
D
 
E
G
 
G
H
 
Y
K
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
V
G
x
N
Y
|
Y
S
x
A
G
|
G
N
x
S
E
 
K
A
 
E
A
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
A
C
 
V
A
 
V
K
 
E
E
 
E
L
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
K
G
 
G
V
 
V
-
 
D
-
 
S
M
 
F
V
 
A
V
 
I
K
 
Q
G
x
A
N
|
N
V
|
V
G
 
A
V
 
D
F
 
A
E
 
D
D
 
E
C
 
V
Q
 
K
A
 
A
A
 
M
V
 
I
K
 
K
K
 
E
V
 
V
E
 
V
A
 
S
E
 
Q
L
 
F
G
 
G
P
 
S
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
M
 
L
L
 
L
H
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
Y
 
E
E
 
Q
Q
 
E
W
 
W
S
 
D
E
 
D
V
 
V
I
 
I
R
 
D
V
x
T
N
 
N
M
 
L
D
 
K
S
 
G
A
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
C
T
 
I
R
 
Q
P
 
K
V
 
A
I
 
T
E
 
P
G
 
Q
M
 
M
R
 
L
D
 
R
R
 
Q
S
 
R
W
 
S
G
 
G
R
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
A
K
 
V
G
 
G
Q
 
N
M
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
E
N
 
L
A
 
A
K
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
A
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
I
 
I
D
 
V
T
 
S
E
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
D
A
 
E
V
 
L
P
 
K
E
 
E
N
 
Q
V
 
M
L
 
L
A
 
T
Q
 
Q
I
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
A
R
 
R
L
 
F
G
 
G
R
 
Q
G
 
D
E
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
N
M
 
T
V
 
V
S
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
E
 
D
R
 
K
A
 
A
G
 
K
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
T
 
T
L
 
I
T
 
H
L
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
Y
 
Y
M
 
M

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
43% identity, 99% coverage: 3:239/240 of query aligns to 8:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
R
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
 
A
R
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
I
 
A
C
 
A
E
 
R
R
 
V
L
 
F
I
 
M
A
 
K
D
 
E
G
 
G
H
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
V
A
 
I
G
 
A
Y
x
D
S
x
F
G
 
N
N
 
E
E
 
A
A
 
A
A
 
G
A
 
K
E
 
E
A
 
A
C
 
V
A
 
E
K
 
A
E
 
N
L
 
P
G
 
G
V
 
V
M
 
V
V
 
F
V
 
I
K
 
R
G
x
V
N
x
D
V
|
V
G
 
S
V
 
D
F
 
R
E
 
E
D
 
S
C
 
V
Q
 
H
A
 
R
A
 
L
V
 
V
K
 
E
K
 
N
V
 
V
E
 
A
A
 
E
E
 
R
L
 
F
G
 
G
P
 
K
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
|
D
G
 
S
M
 
M
L
 
L
H
 
S
K
|
K
M
 
M
T
 
T
Y
 
V
E
 
D
Q
 
Q
W
 
F
S
 
Q
E
 
Q
V
 
V
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
|
N
M
 
L
D
 
T
S
 
G
A
 
V
F
 
F
N
 
H
M
 
C
T
 
T
R
 
Q
P
 
A
V
 
V
I
 
L
E
 
P
G
 
Y
M
 
M
R
 
A
D
 
E
R
 
Q
S
 
G
W
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
T
S
 
S
S
|
S
I
 
V
N
 
T
G
 
G
Q
 
T
K
 
Y
G
 
G
Q
x
N
M
x
V
G
 
G
Q
|
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
M
T
 
T
K
 
K
A
 
T
L
 
W
A
 
A
L
 
K
E
 
E
N
 
L
A
 
A
K
 
R
K
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
V
 
A
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
x
F
I
x
T
D
 
E
T
|
T
E
 
A
M
|
M
V
 
V
A
 
A
A
 
E
V
 
V
P
 
P
E
 
E
N
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
E
Q
x
K
I
 
M
V
 
K
A
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
V
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
K
G
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
N
M
 
A
V
 
Y
S
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
E
 
H
R
 
E
A
 
S
G
 
D
F
 
Y
V
 
V
T
 
N
G
 
G
A
 
H
T
 
V
L
 
L
T
 
H
L
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
I
Y
 
M
M
 
M

6wprA Crystal structure of a putative 3-oxoacyl-acp reductase (fabg) with NADP(h) from acinetobacter baumannii (see paper)
40% identity, 99% coverage: 3:240/240 of query aligns to 6:244/244 of 6wprA

query
sites
6wprA
R
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
A
A
 
A
I
 
I
C
 
A
E
 
Q
R
 
Q
L
 
L
I
 
I
A
 
Q
D
 
D
G
 
G
H
 
Y
K
 
F
V
 
V
A
 
V
A
 
-
G
 
G
Y
 
T
S
 
A
G
x
T
N
 
S
E
 
E
A
 
S
A
 
G
A
 
A
E
 
Q
A
 
K
C
 
L
A
 
T
K
 
D
E
 
S
L
 
F
G
 
G
V
 
E
M
 
Q
V
 
G
-
 
A
-
 
G
V
 
L
K
 
A
G
x
L
N
x
D
V
|
V
G
 
R
V
 
N
F
 
L
E
 
D
D
 
E
C
 
I
Q
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
V
K
 
S
K
 
H
V
 
I
E
 
E
A
 
Q
E
 
N
L
 
Y
G
 
G
P
 
P
I
 
V
D
 
L
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
K
D
 
D
G
 
N
M
 
L
L
 
L
H
 
L
K
 
R
M
 
M
T
 
S
Y
 
E
E
 
D
Q
 
D
W
 
W
S
 
D
E
 
D
V
 
I
I
 
L
R
 
N
V
 
I
N
 
H
M
 
L
D
 
K
S
 
A
A
 
V
F
 
Y
N
 
R
M
 
L
T
 
S
R
 
K
P
 
R
V
 
V
I
 
L
E
 
K
G
 
G
M
 
M
R
 
T
D
 
K
R
 
A
S
 
R
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
I
 
V
N
 
V
G
 
A
Q
 
H
K
 
F
G
 
A
Q
 
N
M
 
P
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
I
I
 
E
G
 
A
F
 
F
T
 
S
K
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
E
N
 
M
A
 
G
K
 
S
K
 
R
G
 
Q
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
S
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
D
 
A
T
 
T
E
 
E
M
 
M
V
 
T
A
 
D
A
 
A
V
 
L
P
 
S
E
 
E
N
 
D
V
 
I
L
 
R
A
 
K
Q
 
K
I
 
M
V
 
S
A
 
D
G
 
Q
I
 
V
P
 
A
V
 
L
G
 
N
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
E
G
 
P
E
 
Q
E
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
N
M
 
A
V
 
V
S
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
E
 
D
R
 
K
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
T
T
 
V
L
 
L
T
 
H
L
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
L
Y
 
Y
M
 
M
A
 
A

6t62A Crystal structure of acinetobacter baumannii fabg in complex with NADPH at 1.8 a resolution (see paper)
40% identity, 99% coverage: 3:240/240 of query aligns to 6:244/244 of 6t62A

query
sites
6t62A
R
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
A
A
 
A
I
 
I
C
 
A
E
 
Q
R
 
Q
L
 
L
I
 
I
A
 
Q
D
 
D
G
 
G
H
 
Y
K
 
F
V
 
V
A
 
V
A
 
-
G
 
G
Y
 
T
S
x
A
G
x
T
N
 
S
E
 
E
A
 
S
A
 
G
A
 
A
E
 
Q
A
 
K
C
 
L
A
 
T
K
 
D
E
 
S
L
 
F
G
 
G
V
 
E
M
 
Q
V
 
G
-
 
A
-
 
G
V
 
L
K
 
A
G
x
L
N
x
D
V
|
V
G
 
R
V
 
N
F
 
L
E
 
D
D
 
E
C
 
I
Q
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
V
K
 
S
K
 
H
V
 
I
E
 
E
A
 
Q
E
 
N
L
 
Y
G
 
G
P
 
P
I
 
V
D
 
L
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
K
D
 
D
G
 
N
M
 
L
L
 
L
H
 
L
K
 
R
M
 
M
T
 
S
Y
 
E
E
 
D
Q
 
D
W
 
W
S
 
D
E
 
D
V
 
I
I
 
L
R
 
N
V
 
I
N
 
H
M
 
L
D
 
K
S
 
A
A
 
V
F
 
Y
N
 
R
M
 
L
T
 
S
R
 
K
P
 
R
V
 
V
I
 
L
E
 
K
G
 
G
M
 
M
R
 
T
D
 
K
R
 
A
S
 
R
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
|
S
S
|
S
I
 
V
N
 
V
G
 
A
Q
 
H
K
 
F
G
 
A
Q
 
N
M
 
P
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
I
I
 
E
G
 
A
F
 
F
T
 
S
K
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
E
N
 
M
A
 
G
K
 
S
K
 
R
G
 
Q
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
S
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
I
|
I
D
 
A
T
 
T
E
 
E
M
|
M
V
 
T
A
 
D
A
 
A
V
 
L
P
 
S
E
 
E
N
 
D
V
 
I
L
 
R
A
 
K
Q
 
K
I
 
M
V
 
S
A
 
D
G
 
Q
I
 
V
P
 
A
V
 
L
G
 
N
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
E
G
 
P
E
 
Q
E
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
N
M
 
A
V
 
V
S
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
E
 
D
R
 
K
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
T
T
 
V
L
 
L
T
 
H
L
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
L
Y
 
Y
M
 
M
A
 
A

4bo4C Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with n-(2-methoxyphenyl)-3,4- dihydro-2h-quinoline-1-carboxamide at 2.7a resolution (see paper)
45% identity, 99% coverage: 3:240/240 of query aligns to 19:255/255 of 4bo4C

query
sites
4bo4C
R
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
T
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
I
 
I
C
 
A
E
 
L
R
 
E
L
 
L
I
 
G
A
 
R
D
 
L
G
 
G
H
 
-
K
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
I
G
 
G
Y
 
T
S
 
A
G
 
T
N
 
S
E
 
A
A
 
S
A
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
K
C
 
I
A
 
A
K
 
E
E
 
T
L
 
L
G
 
K
V
 
A
M
 
N
V
 
G
V
 
V
K
 
E
G
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
V
-
 
L
N
 
D
V
 
V
G
 
S
V
 
S
F
 
D
E
 
E
D
 
S
C
 
V
Q
 
A
A
 
A
A
 
T
V
 
L
K
 
E
K
 
H
V
 
I
E
 
Q
A
 
Q
E
 
H
L
 
L
G
 
G
P
 
Q
I
 
P
D
 
L
I
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
M
 
L
L
 
L
H
 
V
K
 
R
M
 
M
T
 
K
Y
 
D
E
 
D
Q
 
E
W
 
W
S
 
F
E
 
D
V
 
V
I
x
V
R
 
N
V
 
T
N
 
N
M
x
L
D
 
N
S
 
S
A
 
L
F
 
Y
N
 
R
M
 
L
T
 
S
R
 
K
P
 
A
V
 
V
I
 
L
E
 
R
G
 
G
M
 
M
R
 
T
D
 
K
R
 
A
S
 
R
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
G
S
|
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
-
K
 
-
G
 
G
Q
 
N
M
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
|
G
L
 
L
I
 
E
G
|
G
F
|
F
T
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
N
 
V
A
 
G
K
 
S
K
 
R
G
 
A
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
A
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
D
 
D
T
 
T
E
 
D
M
 
M
V
 
T
-
 
R
A
 
E
A
 
A
V
 
Q
P
 
R
E
 
E
N
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
G
Q
 
Q
I
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
Q
G
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
K
M
 
V
V
 
V
S
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
E
 
D
R
 
G
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
V
T
 
P
L
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
Y
 
Y
M
 
M
A
 
S

Query Sequence

>CCNA_00545 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_00545
MTRVAFVTGGTRGIGRAICERLIADGHKVAAGYSGNEAAAEACAKELGVMVVKGNVGVFE
DCQAAVKKVEAELGPIDILVNNAGITRDGMLHKMTYEQWSEVIRVNMDSAFNMTRPVIEG
MRDRSWGRIINISSINGQKGQMGQTNYSAAKAGLIGFTKALALENAKKGVTVNVICPGYI
DTEMVAAVPENVLAQIVAGIPVGRLGRGEEIADMVSFLAGERAGFVTGATLTLNGGQYMA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory