SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CCNA_00618 CCNA_00618 succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5u0mA Fatty aldehyde dehydrogenase from marinobacter aquaeolei vt8 and cofactor complex (see paper)
52% identity, 99% coverage: 8:472/472 of query aligns to 22:484/488 of 5u0mA

query
sites
5u0mA
S
 
S
R
 
V
D
 
Q
P
 
P
Y
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
T
I
 
V
A
 
W
D
 
D
F
 
G
A
 
N
V
 
A
N
 
A
D
 
S
A
 
L
R
 
E
S
 
D
I
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
C
 
V
H
 
R
S
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
L
E
 
A
W
 
W
A
 
R
M
 
R
T
 
K
P
 
S
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
R
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
I
L
 
E
R
 
A
F
 
F
A
 
G
E
 
E
T
 
L
V
 
L
R
 
E
A
 
A
R
 
N
R
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
A
T
 
H
L
 
Q
I
 
I
A
 
G
R
 
L
E
 
E
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
M
 
L
W
 
W
E
 
E
A
 
S
L
 
R
T
 
T
E
 
E
A
 
V
D
 
A
S
 
A
V
 
M
A
 
M
A
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
P
I
 
I
S
 
S
I
 
V
R
 
K
A
 
A
Q
 
Y
D
 
N
E
 
E
R
 
R
A
 
T
G
 
G
E
 
H
R
 
T
S
 
E
E
 
S
P
 
D
M
 
V
A
 
A
D
 
G
A
 
G
T
 
H
A
 
A
R
 
V
L
 
L
A
 
R
H
 
H
R
 
R
P
 
P
H
 
H
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
V
I
x
F
G
 
G
P
 
P
F
x
Y
N
|
N
F
 
F
P
 
P
M
 
G
H
 
H
L
 
L
A
 
P
N
 
N
G
 
G
H
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
V
 
V
F
 
F
K
|
K
P
 
P
S
|
S
E
|
E
K
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
G
C
 
V
G
 
A
Q
 
E
L
 
L
M
 
T
G
 
V
E
 
R
L
 
L
W
 
W
R
 
E
A
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
D
 
D
H
 
G
V
 
V
L
 
I
T
 
N
I
 
L
V
 
V
I
 
Q
G
 
G
G
 
G
G
 
S
E
 
D
A
 
T
G
|
G
E
 
K
A
 
C
L
 
L
V
 
A
R
 
R
H
 
H
E
 
S
A
 
L
L
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
L
L
 
F
F
 
F
T
|
T
G
|
G
G
x
S
V
 
S
Q
 
T
A
x
V
G
 
G
R
 
H
A
 
L
I
 
L
H
 
H
R
 
E
A
 
Q
L
 
F
A
 
G
D
 
G
A
 
Q
P
 
P
H
 
E
K
 
K
I
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
|
E
L
x
M
G
|
G
G
 
G
N
 
N
A
 
N
P
 
P
L
 
L
V
 
I
V
 
V
W
 
Q
D
 
N
V
 
V
A
 
S
D
 
D
I
 
L
E
 
D
A
 
G
A
 
A
A
 
V
H
 
H
L
 
H
I
 
A
V
 
L
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
T
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
C
|
C
T
 
T
C
 
C
A
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
L
L
 
V
P
 
P
E
 
K
G
 
G
A
 
K
R
 
K
G
 
G
D
 
D
A
 
E
L
 
F
L
 
L
E
 
A
A
 
R
L
 
L
T
 
V
M
 
E
L
 
V
M
 
A
D
 
A
R
 
R
L
 
I
V
 
T
I
 
V
G
 
A
G
 
E
P
 
F
F
 
D
Q
 
A
S
 
D
P
 
P
A
 
Q
P
 
P
F
 
F
M
 
M
G
 
G
P
 
S
V
 
V
I
 
I
D
 
S
A
 
A
H
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
N
Q
 
Q
V
 
L
L
 
L
A
 
K
A
 
A
Q
 
Q
D
 
A
R
 
A
M
 
M
T
 
L
A
 
E
D
 
K
G
 
G
G
 
A
R
 
T
P
 
S
L
 
L
R
 
L
L
 
E
A
 
M
A
 
K
V
 
Q
R
 
L
E
 
K
A
 
P
R
 
D
S
 
T
A
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
S
P
 
P
G
 
G
L
 
I
I
 
V
E
 
D
L
 
A
T
 
T
D
 
G
A
 
I
P
 
E
L
 
L
R
 
E
D
 
D
E
 
Q
E
|
E
I
 
F
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
V
 
V
R
 
Y
R
 
R
A
 
Y
A
 
K
D
 
G
F
 
F
D
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
A
N
 
N
A
 
N
T
 
T
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
I
I
 
L
S
 
S
D
 
D
D
 
D
E
 
R
A
 
K
L
 
L
Y
 
Y
R
 
N
R
 
R
F
 
L
W
 
V
T
 
E
S
 
E
V
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
V
N
 
N
W
 
W
N
 
N
R
 
R
P
 
P
T
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
S
 
S
A
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
A
S
 
S
G
 
G
N
 
N
H
 
H
R
 
R
P
|
P
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
S
 
C
A
 
A
Y
 
W
P
 
P
V
 
M
A
 
A
G
 
S
L
 
L
E
 
E
S
 
A
P
 
G
S
 
K
P
 
S
V
 
-
Y
 
-
R
 
E
L
 
L
P
 
P
I
 
D
G
 
S
L
 
L
N
 
A
P
 
P

5u0lA X-ray crystal structure of fatty aldehyde dehydrogenase enzymes from marinobacter aquaeolei vt8 complexed with a substrate (see paper)
52% identity, 99% coverage: 8:472/472 of query aligns to 22:484/488 of 5u0lA

query
sites
5u0lA
S
 
S
R
 
V
D
 
Q
P
 
P
Y
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
T
I
 
V
A
 
W
D
 
D
F
 
G
A
 
N
V
 
A
N
 
A
D
 
S
A
 
L
R
 
E
S
 
D
I
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
C
 
V
H
 
R
S
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
L
E
 
A
W
 
W
A
 
R
M
 
R
T
 
K
P
 
S
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
R
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
I
L
 
E
R
 
A
F
 
F
A
 
G
E
 
E
T
 
L
V
 
L
R
 
E
A
 
A
R
 
N
R
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
A
T
 
H
L
 
Q
I
 
I
A
 
G
R
 
L
E
 
E
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
M
 
L
W
 
W
E
 
E
A
 
S
L
 
R
T
 
T
E
 
E
A
 
V
D
 
A
S
 
A
V
 
M
A
 
M
A
 
G
K
|
K
V
 
I
A
 
P
I
 
I
S
 
S
I
 
V
R
 
K
A
 
A
Q
 
Y
D
 
N
E
 
E
R
 
R
A
 
T
G
 
G
E
 
H
R
 
T
S
 
E
E
 
S
P
 
D
M
 
V
A
 
A
D
 
G
A
 
G
T
 
H
A
 
A
R
 
V
L
 
L
A
 
R
H
 
H
R
 
R
P
 
P
H
 
H
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
F
G
 
G
P
 
P
F
 
Y
N
|
N
F
 
F
P
 
P
M
 
G
H
|
H
L
|
L
A
 
P
N
 
N
G
|
G
H
|
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
V
 
V
F
 
F
K
|
K
P
 
P
S
 
S
E
 
E
K
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
G
C
 
V
G
 
A
Q
 
E
L
 
L
M
 
T
G
 
V
E
 
R
L
 
L
W
 
W
R
 
E
A
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
D
 
D
H
 
G
V
 
V
L
 
I
T
 
N
I
 
L
V
 
V
I
 
Q
G
 
G
G
 
G
G
 
S
E
 
D
A
 
T
G
 
G
E
 
K
A
 
C
L
 
L
V
 
A
R
 
R
H
 
H
E
 
S
A
 
L
L
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
L
L
 
F
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
 
S
V
 
S
Q
 
T
A
 
V
G
 
G
R
 
H
A
 
L
I
 
L
H
 
H
R
 
E
A
 
Q
L
 
F
A
 
G
D
 
G
A
 
Q
P
 
P
H
 
E
K
 
K
I
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
|
E
L
 
M
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
N
P
 
P
L
 
L
V
 
I
V
 
V
W
 
Q
D
 
N
V
 
V
A
 
S
D
 
D
I
 
L
E
 
D
A
 
G
A
 
A
A
 
V
H
 
H
L
 
H
I
 
A
V
 
L
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
T
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
C
|
C
T
 
T
C
 
C
A
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
L
L
 
V
P
 
P
E
 
K
G
 
G
A
 
K
R
 
K
G
 
G
D
 
D
A
 
E
L
 
F
L
 
L
E
 
A
A
 
R
L
 
L
T
 
V
M
 
E
L
 
V
M
 
A
D
 
A
R
 
R
L
 
I
V
 
T
I
 
V
G
 
A
G
 
E
P
 
F
F
 
D
Q
 
A
S
 
D
P
 
P
A
 
Q
P
 
P
F
 
F
M
 
M
G
 
G
P
 
S
V
 
V
I
 
I
D
 
S
A
 
A
H
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
N
Q
 
Q
V
 
L
L
 
L
A
 
K
A
 
A
Q
 
Q
D
 
A
R
 
A
M
 
M
T
 
L
A
 
E
D
 
K
G
 
G
G
 
A
R
 
T
P
 
S
L
 
L
R
 
L
L
 
E
A
 
M
A
 
K
V
 
Q
R
 
L
E
 
K
A
 
P
R
 
D
S
 
T
A
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
S
P
 
P
G
 
G
L
 
I
I
 
V
E
 
D
L
 
A
T
 
T
D
 
G
A
 
I
P
 
E
L
 
L
R
 
E
D
 
D
E
 
Q
E
|
E
I
 
F
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
V
 
V
R
 
Y
R
 
R
A
 
Y
A
 
K
D
 
G
F
 
F
D
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
A
N
 
N
A
 
N
T
 
T
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
I
I
 
L
S
 
S
D
 
D
D
 
D
E
 
R
A
 
K
L
 
L
Y
 
Y
R
 
N
R
 
R
F
 
L
W
 
V
T
 
E
S
 
E
V
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
V
N
 
N
W
 
W
N
 
N
R
 
R
P
 
P
T
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
S
 
S
A
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
A
S
 
S
G
 
G
N
 
N
H
 
H
R
 
R
P
|
P
S
|
S
A
|
A
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
S
 
C
A
 
A
Y
 
W
P
 
P
V
 
M
A
 
A
G
 
S
L
 
L
E
 
E
S
 
A
P
 
G
S
 
K
P
 
S
V
 
-
Y
 
-
R
 
E
L
 
L
P
 
P
I
 
D
G
 
S
L
 
L
N
 
A
P
 
P

3ju8A Crystal structure of succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa.
56% identity, 95% coverage: 24:472/472 of query aligns to 37:484/486 of 3ju8A

query
sites
3ju8A
D
 
D
A
 
A
R
 
T
S
 
Q
I
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
C
 
V
H
 
C
S
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
P
E
 
A
W
 
W
A
 
A
M
 
R
T
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
E
E
 
Q
R
 
R
R
 
I
A
 
E
I
 
L
A
 
L
L
 
E
R
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
A
T
 
T
V
 
L
R
 
K
A
 
S
R
 
R
R
 
A
E
 
D
E
 
E
I
 
L
A
 
A
T
 
R
L
 
V
I
 
I
A
 
G
R
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
M
 
L
W
 
W
E
 
E
A
 
S
L
 
A
T
 
T
E
 
E
A
 
V
D
 
T
S
 
S
V
 
M
A
 
V
A
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
V
R
 
Q
A
 
A
Q
 
F
D
 
R
E
 
E
R
 
R
A
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
K
S
 
S
E
 
G
P
 
P
M
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
V
L
 
L
A
 
R
H
 
H
R
 
K
P
 
P
H
 
H
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
F
G
|
G
P
 
P
F
x
Y
N
|
N
F
 
F
P
 
P
M
 
G
H
 
H
L
|
L
A
 
P
N
 
N
G
 
G
H
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
C
V
 
V
V
 
V
F
 
F
K
|
K
P
 
P
S
|
S
E
 
E
K
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
K
C
 
V
G
 
A
Q
 
E
L
 
L
M
 
T
G
 
L
E
 
K
L
 
A
W
 
W
R
 
I
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
D
 
A
H
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
N
I
 
L
V
 
V
I
 
Q
G
 
G
G
 
G
G
 
R
E
 
E
A
 
T
G
 
G
E
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
A
R
 
A
H
 
H
E
 
R
A
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
L
L
 
F
F
|
F
T
|
T
G
|
G
G
x
S
V
 
S
Q
 
R
A
x
T
G
 
G
R
 
N
A
 
L
I
 
L
H
 
H
R
 
S
A
 
Q
L
 
F
A
 
G
D
 
G
A
 
Q
P
 
P
H
 
Q
K
 
K
I
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
|
E
L
x
M
G
|
G
G
 
G
N
 
N
A
 
N
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
W
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
D
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
V
H
 
Y
L
 
T
I
 
I
V
 
I
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
Y
 
F
V
 
I
T
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
C
|
C
T
 
T
C
 
C
A
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
L
L
 
V
P
 
P
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
W
G
 
G
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
A
A
 
R
L
 
L
T
 
V
M
 
A
L
 
V
M
 
S
D
 
A
R
 
T
L
 
L
V
 
R
I
 
V
G
 
G
G
 
R
P
 
F
F
 
D
Q
 
E
S
 
Q
P
 
P
A
 
A
P
 
P
F
 
F
M
 
M
G
 
G
P
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
S
A
 
L
H
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
E
Q
 
H
V
 
L
L
 
L
A
 
K
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
R
 
H
M
 
L
T
 
I
A
 
G
D
 
K
G
 
G
G
 
A
R
 
Q
P
 
P
L
 
L
R
 
L
L
 
A
A
 
M
A
 
T
V
 
Q
R
 
P
E
 
I
A
 
D
R
 
G
S
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
S
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
I
I
 
L
E
 
D
L
 
V
T
 
S
D
 
A
A
 
V
P
 
A
L
 
E
R
 
R
-
 
P
D
 
D
E
 
E
E
|
E
I
 
F
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
R
 
I
R
 
R
A
 
Y
A
 
S
D
 
D
F
 
F
D
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
R
L
 
E
A
 
A
N
 
N
A
 
A
T
 
T
R
 
Q
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
L
S
 
S
D
 
D
D
 
S
E
 
R
A
 
E
L
 
R
Y
 
F
R
 
E
R
 
Q
F
 
F
W
 
L
T
 
V
S
 
E
V
 
S
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
V
N
 
N
W
 
W
N
 
N
R
 
K
P
 
Q
T
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
S
 
S
A
 
S
A
 
A
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
V
 
I
G
 
G
G
 
A
S
 
S
G
 
G
N
 
N
H
 
H
R
 
R
P
|
P
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
S
 
C
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
S
L
 
L
E
 
E
S
 
S
P
 
P
S
 
S
P
 
-
V
 
-
Y
 
V
R
 
S
L
 
L
P
 
P
I
 
A
G
 
T
L
 
L
N
 
T
P
 
P

4pz2B Structure of zm aldh2-6 (rf2f) in complex with NAD (see paper)
34% identity, 95% coverage: 1:448/472 of query aligns to 23:476/494 of 4pz2B

query
sites
4pz2B
M
 
V
S
 
S
A
 
G
S
 
R
R
 
T
L
 
F
I
 
D
S
 
T
R
 
R
D
 
D
P
 
P
Y
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
G
A
 
V
I
 
I
A
 
A
D
 
S
F
 
V
A
 
A
V
 
E
N
 
A
D
 
D
A
 
K
R
 
E
S
 
D
I
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
A
C
 
V
H
 
R
S
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
F
 
F
-
 
D
-
 
H
A
 
G
E
 
E
W
 
W
A
 
P
M
 
R
T
 
M
P
 
S
L
 
G
A
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
G
A
 
R
I
 
I
A
 
M
L
 
A
R
 
R
F
 
L
A
 
A
E
 
D
T
 
L
V
 
V
R
 
E
A
 
E
R
 
H
R
 
A
E
 
G
E
 
E
I
 
L
A
 
A
T
 
A
L
 
L
I
 
E
A
 
S
R
 
L
E
 
D
T
 
A
G
 
G
K
 
K
-
 
H
P
 
P
M
 
A
W
 
V
E
 
T
A
 
R
L
 
A
T
 
V
E
 
D
A
 
V
D
 
G
S
 
N
V
 
A
A
 
A
A
 
G
K
 
S
V
 
L
A
 
R
I
 
Y
S
 
F
I
 
A
R
 
G
A
 
A
Q
 
A
D
 
D
E
 
K
R
 
I
A
 
H
G
 
G
E
 
E
R
 
T
S
 
L
E
 
K
P
 
M
M
 
P
A
 
G
D
 
Q
A
 
F
T
 
Q
A
 
G
R
 
H
L
 
T
A
 
L
H
 
R
R
 
E
P
 
P
H
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
A
A
 
G
V
 
V
I
|
I
G
x
I
P
|
P
F
x
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
M
 
S
H
 
T
L
x
M
A
 
F
N
 
A
G
 
V
H
 
K
I
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
C
A
 
A
V
 
L
V
 
V
F
 
V
K
|
K
P
 
P
S
x
A
E
|
E
K
 
Q
T
 
T
P
 
P
A
 
L
C
 
S
G
 
A
Q
 
L
L
 
Y
M
 
L
G
 
A
E
 
Q
L
 
L
W
 
A
R
 
K
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
D
 
D
H
 
G
V
 
V
L
 
I
T
 
N
I
 
V
V
 
V
I
 
P
G
 
G
G
 
F
G
|
G
-
 
P
E
 
T
A
 
A
G
|
G
E
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
A
R
 
S
H
 
H
E
 
M
A
 
D
L
 
V
D
 
D
G
 
M
V
 
V
L
 
S
F
|
F
T
|
T
G
|
G
G
x
S
V
 
T
Q
 
E
A
x
V
G
 
G
R
 
R
A
 
L
I
 
I
H
 
M
R
 
K
A
 
A
L
 
S
A
 
A
D
 
E
A
 
S
P
 
N
H
 
L
K
 
K
I
 
P
L
 
V
A
 
Y
L
 
L
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
A
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
V
 
V
W
 
F
D
 
D
V
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
L
E
 
D
A
 
M
A
 
A
A
 
V
H
 
E
L
 
L
I
 
A
V
 
V
Q
 
G
S
 
A
A
 
S
Y
 
F
V
 
F
T
 
N
A
 
K
G
 
G
Q
 
E
R
 
A
C
|
C
T
 
V
C
 
A
A
 
A
R
 
S
R
 
R
L
 
V
I
 
Y
L
 
V
P
 
Q
E
 
E
G
 
R
A
 
V
R
 
Y
G
 
-
D
 
D
A
 
R
L
 
F
L
 
E
E
 
E
A
 
R
L
 
L
T
 
A
M
 
E
L
 
R
M
 
M
D
 
R
R
 
S
L
 
W
V
 
V
I
 
V
G
 
G
G
 
D
P
 
P
F
 
F
Q
 
S
S
 
D
P
 
P
A
 
R
P
 
A
F
 
D
M
 
Q
G
 
G
P
 
P
V
 
Q
I
 
V
D
 
D
A
 
K
H
 
A
A
 
Q
A
 
Y
A
 
E
Q
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
S
A
 
Y
Q
 
I
D
 
D
R
 
H
M
 
G
T
 
K
A
 
R
D
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
L
-
 
L
-
 
T
G
 
G
G
 
G
R
 
R
P
 
P
L
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
C
V
 
A
R
 
P
E
 
E
A
 
G
R
 
K
S
 
G
A
 
Y
L
 
Y
L
 
I
S
 
E
P
 
P
G
 
T
L
 
V
I
 
F
E
 
T
-
 
N
-
 
V
L
 
K
T
 
E
D
 
D
A
 
M
P
 
I
L
 
I
R
 
A
D
 
K
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
M
Q
 
C
V
 
L
R
 
M
R
 
K
A
 
F
A
 
K
D
 
T
F
 
V
D
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
R
A
 
A
N
 
N
A
 
D
T
 
T
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
V
S
 
T
D
 
R
D
 
D
E
 
L
A
 
D
L
 
V
Y
 
A
R
 
N
R
 
R
F
 
V
W
 
V
T
 
R
S
 
S
V
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
V
N
 
-
W
 
W
N
 
V
R
 
N
P
 
C
T
 
Y
T
 
F
G
 
A
A
 
M
S
 
G
S
 
S
A
 
D
A
 
C
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
R
G
 
K
G
 
M
S
 
S
G
 
G
N
 
F
H
 
G
R
 
K
P
x
D
S
 
E
A
 
G
Y
 
M
Y
 
H
A
 
A
A
 
L
D
 
D

Q56YU0 Aldehyde dehydrogenase family 2 member C4; ALDH1a; Protein REDUCED EPIDERMAL FLUORESCENCE 1; EC 1.2.1.3 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
32% identity, 95% coverage: 2:448/472 of query aligns to 33:483/501 of Q56YU0

query
sites
Q56YU0
S
 
S
A
 
G
S
 
K
R
 
T
L
 
F
I
 
E
S
 
T
R
 
I
D
 
D
P
 
P
Y
 
R
T
 
N
G
 
G
E
 
E
A
 
V
I
 
I
A
 
A
D
 
T
F
 
I
A
 
A
V
 
E
N
 
G
D
 
D
A
 
K
R
 
E
S
 
D
I
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
A
C
 
V
H
 
N
S
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
D
E
 
H
-
 
G
-
 
P
W
 
W
A
 
P
M
 
R
T
 
M
P
 
T
L
 
G
A
 
F
E
 
E
R
 
R
R
 
A
A
 
K
I
 
L
A
 
I
L
 
N
R
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
D
T
 
L
V
 
I
R
 
E
A
 
E
R
 
N
R
 
I
E
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
A
T
 
K
L
 
L
I
 
D
A
 
A
R
 
V
E
 
D
T
 
G
G
 
G
K
 
K
P
 
-
M
 
L
W
 
F
E
 
Q
A
 
L
L
 
G
T
 
K
E
 
Y
A
 
A
D
 
D
-
 
I
-
 
P
S
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
G
K
 
H
V
 
F
A
 
R
I
 
Y
S
 
N
I
 
A
R
 
G
A
 
A
Q
 
A
D
 
D
E
 
K
R
 
I
A
 
H
G
 
G
E
 
E
R
 
T
S
 
L
E
 
K
P
 
M
M
 
T
A
 
R
D
 
Q
A
 
S
T
 
L
-
 
F
A
x
G
R
 
Y
L
 
T
A
 
L
H
 
K
R
 
E
P
 
P
H
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
G
V
 
N
I
 
I
G
 
I
P
 
P
F
 
W
N
 
N
F
 
F
P
 
P
M
 
S
H
 
I
L
 
M
A
 
F
N
 
A
G
 
T
H
 
K
I
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
M
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
C
A
 
T
V
 
M
V
 
V
F
 
V
K
 
K
P
 
P
S
 
A
E
 
E
K
 
Q
T
 
T
P
 
S
A
 
L
C
 
S
G
 
A
Q
 
L
L
 
F
M
 
Y
G
 
A
E
 
H
L
 
L
W
 
S
R
 
K
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
I
P
 
P
D
 
D
H
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
N
I
 
I
V
 
V
I
 
T
G
 
G
-
 
F
G
 
G
G
 
S
E
 
T
A
 
A
G
 
G
E
 
A
A
 
A
L
 
I
V
 
A
R
 
S
H
 
H
E
 
M
A
 
D
L
 
V
D
 
D
G
 
K
V
 
V
L
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
 
S
V
 
T
Q
 
D
A
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
K
I
 
I
H
 
M
R
 
Q
A
 
A
L
 
A
A
 
A
D
 
A
A
 
S
P
 
N
H
 
L
K
 
K
I
 
K
L
 
V
A
 
S
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
A
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
L
V
 
I
W
 
F
D
 
N
V
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
I
E
 
D
A
 
K
A
 
A
A
 
A
H
 
D
L
 
L
I
 
A
V
 
L
Q
 
L
S
 
G
A
 
C
Y
 
F
V
 
Y
T
 
N
A
 
K
G
 
G
Q
 
E
R
 
I
C
 
C
T
 
V
C
 
A
A
 
S
R
 
S
R
 
R
L
 
V
I
 
F
L
 
V
P
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
I
R
 
Y
G
 
-
D
 
D
A
 
K
L
 
V
L
 
V
E
 
E
A
 
K
L
 
L
T
 
V
M
 
E
L
 
K
M
 
A
D
 
K
R
 
D
L
 
W
V
 
T
I
 
V
G
 
G
G
 
D
P
 
P
F
 
F
Q
 
D
S
 
S
P
 
T
A
 
A
P
 
R
F
 
-
M
 
Q
G
 
G
P
 
P
V
 
Q
I
 
V
D
 
D
A
 
K
H
 
R
A
 
Q
A
 
F
A
 
E
Q
 
K
V
 
I
L
 
L
A
 
S
A
 
Y
Q
 
I
D
 
E
R
 
H
M
 
G
T
 
K
A
 
N
D
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
T
P
 
L
L
 
L
R
 
T
L
 
G
A
 
G
A
 
K
V
 
A
R
 
I
E
 
G
A
 
D
R
 
K
S
 
G
A
 
Y
L
 
F
L
 
I
S
 
Q
P
 
P
G
 
T
L
 
I
I
 
F
-
 
A
E
 
D
L
 
V
T
 
T
-
 
E
D
 
D
A
 
M
P
 
K
L
 
I
R
 
Y
D
 
Q
E
 
D
E
 
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
M
Q
 
S
V
 
L
R
 
M
R
 
K
A
 
F
A
 
K
D
 
T
F
 
V
D
 
E
A
 
E
A
x
G
L
 
I
A
 
K
L
 
C
A
 
A
N
 
N
A
 
N
T
 
T
R
 
K
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
I
I
 
L
S
 
S
D
 
Q
D
 
D
E
 
I
A
 
D
L
 
L
Y
 
I
R
 
N
R
 
T
F
 
V
W
 
S
T
 
R
S
 
S
V
 
I
R
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
I
N
 
-
W
 
W
N
 
V
R
 
N
P
 
C
T
 
Y
T
 
F
G
 
G
A
 
F
S
 
D
S
 
L
A
 
D
A
 
C
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
G
 
K
G
 
M
S
 
S
G
 
G
N
 
N
H
 
C
R
 
R
P
 
E
S
 
S
A
 
G
Y
 
M
Y
 
D
A
 
A
A
 
L
D
 
D

4pxlA Structure of zm aldh2-3 (rf2c) in complex with NAD (see paper)
32% identity, 93% coverage: 1:437/472 of query aligns to 18:457/486 of 4pxlA

query
sites
4pxlA
M
 
V
S
 
S
A
 
G
S
 
K
R
 
T
L
 
F
I
 
E
S
 
T
R
 
R
D
 
D
P
 
P
Y
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
V
I
 
I
A
 
A
D
 
S
F
 
I
A
 
A
V
 
E
N
 
G
D
 
D
A
 
K
R
 
A
S
 
D
I
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
A
C
 
V
H
 
K
S
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
D
E
 
N
-
 
G
-
 
P
W
 
W
A
 
P
M
 
R
T
 
M
P
 
T
L
 
G
A
 
Y
E
 
E
R
 
R
R
 
G
A
 
R
I
 
I
A
 
L
L
 
H
R
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
D
T
 
L
V
 
I
R
 
D
A
 
E
R
 
H
R
 
V
E
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
A
T
 
A
L
 
L
I
 
D
A
 
T
R
 
V
E
 
D
T
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
L
M
 
F
W
 
-
E
 
-
A
 
A
L
 
V
T
 
G
E
 
K
A
 
A
D
 
R
S
 
D
V
 
I
-
 
P
-
 
G
-
 
A
A
 
A
A
 
H
K
 
L
V
 
L
A
 
R
I
 
Y
S
 
Y
I
 
A
R
 
G
A
 
A
Q
 
A
D
 
D
E
 
K
R
 
V
A
 
H
G
 
G
E
 
-
R
 
-
S
 
-
E
 
-
P
 
-
M
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
A
T
 
T
A
 
L
R
 
K
L
 
M
A
 
A
H
 
Q
R
 
R
P
 
M
H
 
H
G
 
G
-
 
Y
-
 
T
-
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
P
-
 
V
-
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
G
V
 
H
I
|
I
G
x
V
P
|
P
F
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
M
 
T
H
 
T
L
 
M
A
 
F
N
 
F
G
 
F
H
 
K
I
 
V
V
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
C
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
V
K
|
K
P
 
P
S
 
A
E
|
E
K
 
Q
T
 
T
P
 
P
A
 
L
C
 
S
G
 
A
Q
 
L
L
 
F
M
 
Y
G
 
A
E
 
H
L
 
L
W
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
D
 
A
H
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
N
I
 
V
V
 
V
I
 
P
G
 
G
G
 
F
G
|
G
-
 
P
E
 
T
A
 
A
G
|
G
E
x
A
A
 
A
L
 
V
V
 
A
R
 
A
H
 
H
E
 
M
A
 
D
L
 
V
D
 
D
G
 
K
V
 
V
L
 
S
F
|
F
T
 
T
G
|
G
G
x
S
V
 
T
Q
 
E
A
x
V
G
 
G
R
 
R
A
 
L
I
 
V
H
 
M
R
 
R
A
 
A
L
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
S
P
 
N
H
 
L
K
 
K
I
 
P
L
 
V
A
 
S
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
|
G
G
 
G
N
 
K
A
 
S
P
 
P
L
 
V
V
 
I
V
 
V
W
 
F
D
 
D
V
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
L
E
 
D
A
 
M
A
 
A
A
 
V
H
 
N
L
 
L
I
 
V
V
 
N
Q
 
F
S
 
A
A
 
T
Y
 
Y
V
 
T
T
 
N
A
 
K
G
 
G
Q
 
E
R
 
I
C
|
C
T
 
V
C
 
A
A
 
G
R
 
T
R
 
R
L
 
I
I
 
Y
L
 
V
P
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
I
R
 
Y
G
 
-
D
 
D
A
 
E
L
 
F
L
 
V
E
 
K
A
 
K
L
 
A
T
 
A
M
 
E
L
 
L
M
 
A
D
 
S
R
 
K
L
 
S
V
 
V
I
 
V
G
 
G
G
 
D
P
 
P
F
 
F
Q
 
-
S
 
N
P
 
P
A
 
S
P
 
V
F
 
S
M
 
Q
G
 
G
P
 
P
V
 
Q
I
 
V
D
 
D
A
 
K
H
 
D
A
x
Q
A
 
Y
A
 
E
Q
x
K
V
 
V
L
 
L
A
 
R
A
 
Y
Q
 
I
D
 
D
R
 
I
M
 
G
T
 
K
A
 
R
D
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
T
P
 
L
L
 
V
R
 
T
L
 
G
A
 
G
A
 
K
V
 
P
R
 
C
E
 
G
A
 
D
R
 
K
S
 
G
A
 
Y
L
 
Y
L
 
I
S
 
E
P
 
P
G
 
T
L
 
I
I
 
F
E
 
T
-
 
D
-
 
V
L
 
K
T
 
D
D
 
D
A
 
M
P
 
T
L
 
I
R
 
A
D
 
Q
E
 
D
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
M
Q
 
A
V
 
L
R
 
M
R
 
K
A
 
F
A
 
K
D
 
T
F
 
V
D
 
E
A
 
E
A
 
V
L
 
I
A
 
Q
L
 
K
A
 
A
N
 
N
A
 
N
T
 
T
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
I
I
 
V
S
 
T
D
 
K
D
 
N
E
 
I
A
 
D
L
 
V
Y
 
A
R
 
N
R
 
T
F
 
V
W
 
S
T
 
R
S
 
S
V
 
I
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
A
V
 
I
N
 
-
W
 
W
N
 
I
R
 
N
P
 
C
T
 
Y
T
 
F
G
 
A
A
 
F
S
 
D
S
 
P
A
 
D
A
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
G
 
K
G
 
M
S
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6wsbA Crystal structure of a betaine aldehyde dehydrogenase from burkholderia pseudomallei bound to cofactor NAD (see paper)
34% identity, 92% coverage: 10:442/472 of query aligns to 27:463/489 of 6wsbA

query
sites
6wsbA
D
 
D
P
 
P
Y
 
A
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
L
I
 
L
A
 
A
D
 
R
F
 
V
A
 
Q
V
 
Q
N
 
A
D
 
S
A
 
A
R
 
D
S
 
D
I
 
V
D
 
D
A
 
R
A
 
A
C
 
V
H
 
A
S
 
S
A
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
G
F
 
Q
A
 
R
E
 
E
W
 
W
A
 
A
M
 
A
T
 
M
P
 
T
L
 
A
A
 
M
E
 
Q
R
 
R
R
 
S
A
 
R
I
 
I
A
 
L
L
 
R
R
 
R
F
 
A
A
 
V
E
 
E
T
 
L
V
 
L
R
 
R
A
 
E
R
 
R
R
 
N
E
 
D
E
 
A
I
 
L
A
 
A
T
 
E
L
 
L
I
 
E
A
 
M
R
 
R
E
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
M
 
I
W
 
A
E
 
E
A
 
T
-
 
R
-
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
I
L
 
V
T
 
T
E
 
G
A
 
A
D
 
D
S
 
V
V
 
I
A
 
E
A
 
Y
K
 
Y
V
 
A
A
 
G
I
 
L
S
 
A
I
 
T
R
 
A
A
 
I
Q
 
E
D
 
G
E
 
L
R
 
Q
A
 
V
G
 
P
E
 
L
R
 
R
S
 
P
E
 
E
P
 
S
M
 
F
A
 
V
D
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
R
 
Y
L
 
T
A
 
R
H
 
R
R
 
E
P
 
P
H
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
C
A
 
A
V
 
G
I
|
I
G
|
G
P
x
A
F
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
M
 
I
H
 
Q
L
 
I
A
 
A
N
 
C
G
 
W
H
 
K
I
 
S
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
M
V
 
I
F
 
F
K
|
K
P
 
P
S
 
S
E
|
E
K
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
L
C
 
S
G
 
A
Q
 
L
L
 
K
M
 
L
G
 
A
E
 
E
L
 
I
W
 
Y
R
 
T
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
D
 
A
H
 
G
V
 
V
L
 
F
T
 
N
I
 
V
V
 
V
I
 
Q
G
 
G
G
 
D
G
|
G
E
 
S
A
 
V
G
|
G
E
x
A
A
 
L
L
 
L
V
 
S
R
 
A
H
 
H
E
 
P
A
 
G
L
 
I
D
 
A
G
 
K
V
 
V
L
 
S
F
|
F
T
|
T
G
|
G
G
|
G
V
 
V
Q
 
E
A
x
T
G
 
G
R
 
K
A
 
K
I
x
V
H
 
M
R
 
S
A
 
L
L
 
A
A
 
G
D
 
A
A
 
S
P
 
S
H
 
L
K
 
K
I
 
E
L
 
V
A
 
T
L
 
M
E
|
E
L
|
L
G
|
G
G
 
G
N
 
K
A
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
V
 
V
W
 
F
D
 
D
V
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
L
E
 
D
A
 
R
A
 
A
A
 
A
H
 
D
L
 
I
I
 
A
V
 
V
Q
 
T
S
 
A
A
 
N
Y
 
F
V
 
F
T
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
C
|
C
T
 
T
C
 
N
A
 
G
R
 
T
R
 
R
L
 
V
I
 
F
L
 
V
P
 
Q
E
 
Q
G
 
A
A
 
V
R
 
K
G
 
-
D
 
D
A
 
A
L
 
F
L
 
V
E
 
E
A
 
R
L
 
V
T
 
L
M
 
A
L
 
R
M
 
V
D
 
A
R
 
R
L
 
I
V
 
R
I
 
V
G
 
G
G
 
K
P
 
P
F
 
S
Q
 
D
S
 
S
P
 
D
A
 
T
P
 
N
F
 
F
M
 
-
G
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
A
D
 
S
A
 
A
H
 
A
A
 
Q
A
 
L
A
 
D
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
G
A
 
Y
Q
 
I
D
 
D
R
 
S
M
 
G
T
 
K
A
 
A
D
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
K
P
 
L
L
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
V
A
 
N
V
 
D
R
 
H
E
 
F
A
 
A
R
 
S
S
 
G
A
 
Q
L
 
Y
L
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
T
L
 
V
I
 
F
E
 
G
L
 
D
T
 
C
D
 
R
A
 
D
P
 
D
L
 
M
R
 
R
-
 
I
-
 
V
D
 
R
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
M
Q
 
S
V
 
I
R
 
L
R
 
S
A
 
F
A
 
E
D
 
T
F
 
E
D
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
R
A
 
A
N
 
N
A
 
A
T
 
T
R
 
D
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
V
S
 
T
D
 
E
D
 
N
E
 
L
A
 
S
L
 
R
Y
 
A
R
 
H
R
 
R
F
 
A
W
 
I
T
 
H
S
 
R
V
 
L
R
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
C
N
 
W
W
 
I
N
 
N
R
 
-
P
 
-
T
 
T
T
 
W
G
 
G
A
 
E
S
 
S
S
 
P
A
 
A
A
 
E
-
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
G
 
K
G
 
Q
S
 
S
G
 
G
N
 
V
H
 
G
R
 
R
P
x
E
S
 
N

4o6rA Crystal structure of a putative aldehyde dehydrogenase from burkholderia cenocepacia
33% identity, 93% coverage: 10:450/472 of query aligns to 25:470/489 of 4o6rA

query
sites
4o6rA
D
 
N
P
 
P
Y
 
H
T
 
D
G
 
G
E
 
S
A
 
V
I
 
I
A
 
T
D
 
K
F
 
I
A
 
A
V
 
A
N
 
A
D
 
T
A
 
A
R
 
A
S
 
D
I
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
A
C
 
V
H
 
D
S
 
A
A
 
A
R
 
T
A
 
R
A
 
A
F
 
F
A
 
P
E
 
A
W
 
W
A
 
S
M
 
A
T
 
M
P
 
P
L
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
R
R
 
G
A
 
R
I
 
L
A
 
L
L
 
L
R
 
R
F
 
L
A
 
A
E
 
D
T
 
A
V
 
I
R
 
E
A
 
A
R
 
N
R
 
T
E
 
E
E
 
A
I
 
L
A
 
A
T
 
Q
L
 
L
I
 
E
A
 
S
R
 
L
E
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
H
P
 
P
M
 
I
W
 
R
E
 
D
A
 
S
L
 
R
T
 
A
E
 
L
A
 
D
D
 
V
S
 
P
V
 
R
A
 
T
A
 
A
K
 
A
V
 
C
A
 
F
I
 
R
S
 
Y
I
 
F
R
 
G
A
 
G
Q
 
M
D
 
A
E
 
D
R
 
K
A
 
L
G
 
Q
E
 
G
R
 
S
S
 
V
E
 
I
P
 
P
M
 
V
A
 
D
D
 
T
A
 
G
T
 
F
A
 
L
R
 
N
L
 
Y
A
 
V
H
 
Q
R
 
R
-
 
A
P
 
P
H
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
G
V
 
Q
I
|
I
G
x
V
P
 
P
F
 
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
M
 
L
H
 
M
L
 
F
A
 
T
N
 
S
G
 
W
H
 
K
I
 
M
V
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
V
 
V
F
 
L
K
|
K
P
 
P
S
 
S
E
 
E
K
 
I
T
 
T
P
 
P
A
 
L
C
 
S
G
 
T
Q
 
L
L
 
R
M
 
I
G
 
V
E
 
E
L
 
L
W
 
M
R
 
A
A
 
E
A
 
V
G
 
G
L
 
F
P
 
P
D
 
A
H
 
G
V
 
V
L
 
V
T
 
N
I
 
I
V
 
V
I
 
P
G
 
G
G
 
Y
G
|
G
E
 
H
-
 
T
A
 
A
G
|
G
E
x
Q
A
 
R
L
 
L
V
 
A
R
 
E
H
 
H
E
 
P
A
 
G
L
 
V
D
 
G
G
 
K
V
 
I
L
 
A
F
|
F
T
 
T
G
|
G
G
x
S
V
 
T
Q
 
A
A
x
T
G
 
G
R
 
R
A
x
R
I
 
I
H
 
V
R
 
E
A
 
A
L
 
-
A
 
S
D
 
Q
A
 
G
P
 
N
H
 
L
K
 
K
I
 
R
L
 
V
A
 
Q
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
A
 
G
P
 
A
L
 
N
V
 
I
V
 
V
W
 
F
D
 
D
V
 
D
A
 
A
D
 
N
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
I
H
 
N
L
 
G
I
 
A
V
 
A
Q
 
W
S
 
A
A
 
I
Y
 
F
V
 
H
T
 
N
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
R
 
A
C
|
C
T
 
I
C
 
A
A
 
G
R
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
V
L
 
L
P
 
H
E
 
E
G
 
R
A
 
I
R
 
-
G
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
F
L
 
L
E
 
E
A
 
R
L
 
F
T
 
V
M
 
A
L
 
L
M
 
A
D
 
S
R
 
S
L
 
I
V
 
R
I
 
I
G
 
G
G
 
N
P
 
P
F
 
L
Q
 
-
S
 
D
P
 
P
A
 
N
P
 
T
F
 
E
M
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
T
D
 
S
A
 
K
H
 
Q
A
 
H
A
 
L
A
 
D
Q
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
S
A
 
Y
Q
 
V
D
 
D
R
 
V
M
 
A
T
 
R
A
 
E
D
 
Q
G
 
G
G
 
G
R
 
R
P
 
V
L
 
L
R
 
T
L
 
G
A
 
G
A
 
S
V
 
A
R
 
P
E
 
Q
-
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
L
A
 
A
R
 
N
S
 
G
A
 
Y
L
 
Y
L
 
V
S
 
R
P
 
P
G
 
T
L
 
I
I
 
V
E
 
E
L
 
A
T
 
K
D
 
H
A
 
A
P
 
T
L
 
D
R
 
R
-
 
V
-
 
A
D
 
Q
E
 
E
E
|
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
F
L
 
V
Q
 
T
V
 
V
R
 
L
R
 
R
A
 
F
A
 
G
D
 
S
F
 
D
D
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
T
 
T
R
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
G
A
 
S
G
 
G
L
 
L
I
 
W
S
 
T
D
 
N
D
 
D
E
 
L
A
 
S
L
 
R
Y
 
A
R
 
H
R
 
R
F
 
M
W
 
A
T
 
A
S
 
R
V
 
I
R
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
M
V
 
C
N
 
-
W
 
W
N
 
I
R
 
N
P
 
C
T
 
Y
T
 
K
G
 
R
A
 
V
S
 
N
S
 
P
A
 
G
A
 
S
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
K
S
 
S
G
 
G
N
 
Y
H
 
G
R
 
R
P
x
E
S
 
M
A
 
G
Y
 
F
Y
 
E
A
 
A
A
 
M
-
 
H
D
 
D
Y
 
Y
S
 
T

Q8NMB0 Vanillin dehydrogenase; Aromatic aldehyde dehydrogenase; EC 1.2.1.67; EC 1.2.1.64; EC 1.2.1.96 from Corynebacterium glutamicum (strain ATCC 13032 / DSM 20300 / BCRC 11384 / JCM 1318 / LMG 3730 / NCIMB 10025) (see paper)
34% identity, 93% coverage: 10:448/472 of query aligns to 32:471/484 of Q8NMB0

query
sites
Q8NMB0
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
T
 
D
G
 
D
E
 
S
A
 
V
I
 
I
A
 
A
D
 
E
F
 
S
A
 
K
V
 
Q
N
 
A
D
 
S
A
 
I
R
 
A
S
 
D
I
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
C
 
Y
H
 
E
S
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
K
A
 
A
F
 
Q
A
 
A
E
 
E
W
 
W
A
 
A
M
 
A
T
 
T
P
 
P
L
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
R
R
 
S
A
 
A
I
 
I
A
 
I
L
 
Y
R
 
R
F
 
A
A
 
A
E
 
E
T
 
L
V
 
L
R
 
E
A
 
E
R
 
H
R
 
R
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
V
T
 
E
L
 
W
I
 
L
A
 
I
R
 
K
E
 
E
T
 
S
G
 
G
K
 
S
P
 
T
M
 
R
W
 
S
E
 
K
A
 
A
L
 
N
T
 
L
E
 
E
A
 
I
D
 
-
S
 
T
V
 
L
A
 
A
A
 
G
K
 
N
V
 
I
A
 
T
I
 
K
S
 
E
I
 
S
R
 
A
A
 
S
Q
 
F
D
 
P
E
 
G
R
 
R
A
 
V
G
 
H
E
 
G
R
 
R
S
 
I
E
 
S
P
 
P
M
 
S
A
 
N
D
 
T
-
 
P
-
 
G
A
 
K
T
 
E
A
 
N
R
 
R
L
 
V
A
 
Y
H
 
R
R
 
V
P
 
A
H
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
S
P
 
P
F
 
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
M
 
L
H
 
N
L
 
L
A
 
S
N
 
I
G
 
R
H
 
S
I
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
I
K
|
K
P
 
P
S
 
A
E
 
S
K
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
V
C
 
T
G
 
G
Q
 
G
L
 
V
M
 
I
-
 
P
G
 
A
E
 
R
L
 
I
W
 
F
R
 
E
A
x
E
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
D
 
A
H
 
G
V
 
V
L
 
I
T
 
S
I
 
T
V
 
V
I
 
A
G
 
G
-
 
A
G
 
G
G
 
S
E
 
E
A
 
I
G
 
G
E
 
D
A
 
H
L
 
F
V
 
V
R
 
T
H
 
H
E
 
A
A
 
V
L
 
P
D
 
K
G
 
L
V
 
I
L
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
 
S
V
 
T
Q
 
P
A
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
R
I
 
V
-
 
G
H
 
E
R
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
N
D
 
G
A
 
G
P
 
P
H
 
M
K
 
K
I
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
P
 
P
L
 
F
V
 
V
V
 
V
W
 
L
D
 
A
V
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
I
E
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
H
 
Q
L
 
A
I
 
A
V
 
A
Q
 
V
S
 
G
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
T
 
H
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
R
 
I
C
|
C
T
 
M
C
 
S
A
 
I
R
 
N
R
 
R
L
 
V
I
 
I
L
 
V
P
 
-
E
 
D
G
 
A
A
 
A
R
 
V
G
 
H
D
 
D
A
 
E
L
 
F
L
 
L
E
 
E
A
 
K
L
 
F
T
 
V
M
 
E
L
 
A
M
 
V
D
 
K
R
 
N
L
 
I
V
 
P
I
 
T
G
 
G
G
 
D
P
 
P
F
 
-
Q
 
S
S
 
A
P
 
E
A
 
G
P
 
T
F
 
L
M
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
I
D
 
N
A
 
-
H
 
D
A
 
S
A
 
Q
A
 
L
Q
 
S
V
 
G
L
 
L
A
 
K
A
 
E
Q
 
K
D
 
I
R
 
E
M
 
L
T
 
A
A
 
K
D
 
K
G
 
E
G
 
G
R
 
A
P
 
T
L
 
V
R
 
Q
L
 
V
A
 
E
A
 
G
V
 
P
R
 
I
E
 
E
A
 
G
R
 
R
S
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
V
S
 
H
P
 
P
G
 
H
L
 
V
I
 
F
E
 
S
-
 
D
-
 
V
L
 
T
T
 
S
D
 
D
A
 
M
P
 
E
L
 
I
R
 
A
D
 
R
E
 
E
E
 
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
I
Q
 
S
V
 
V
R
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
D
D
 
D
F
 
E
D
 
A
A
 
H
A
 
A
L
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
A
N
 
N
A
 
A
T
 
S
R
 
D
F
 
F
G
 
G
L
 
L
A
 
S
A
 
A
G
 
A
L
 
V
I
 
W
S
 
S
D
 
K
D
 
D
E
 
I
A
 
D
L
 
R
Y
 
A
R
 
A
R
 
Q
F
 
F
W
 
A
T
 
L
S
 
Q
V
 
I
R
 
D
A
 
S
G
 
G
I
 
M
V
 
V
N
 
H
W
 
I
N
 
N
R
 
D
P
 
L
T
 
T
T
 
V
G
 
N
A
 
D
S
 
E
S
 
P
A
 
H
A
 
V
P
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
S
G
 
K
G
 
N
S
 
S
G
 
G
N
 
L
H
 
G
R
 
R
P
 
F
S
 
N
A
 
G
Y
 
D
Y
 
W
A
 
A
A
 
I
D
 
E

4yweA Crystal structure of a putative aldehyde dehydrogenase from burkholderia cenocepacia
34% identity, 93% coverage: 10:446/472 of query aligns to 22:461/476 of 4yweA

query
sites
4yweA
D
 
D
P
 
P
Y
 
S
T
 
D
G
 
G
E
 
Q
A
 
P
I
 
F
A
 
A
D
 
T
F
 
I
A
 
A
V
 
R
N
 
G
D
 
T
A
 
A
R
 
P
S
 
D
I
 
I
D
 
E
-
 
R
A
 
A
A
 
V
C
 
A
H
 
A
S
 
A
A
 
R
R
 
D
A
 
A
A
 
F
F
 
A
A
 
G
E
 
P
W
 
W
A
 
G
M
 
A
T
 
A
P
 
S
L
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
R
R
 
G
A
 
R
I
 
V
A
 
L
L
 
M
R
 
R
F
 
L
A
 
S
E
 
A
T
 
R
V
 
V
R
 
T
A
 
D
R
 
S
R
 
I
E
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
A
T
 
A
L
 
I
I
 
E
A
 
A
R
 
R
E
x
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
M
 
L
W
 
K
E
 
Q
A
 
A
L
 
R
T
 
A
E
 
D
A
 
A
D
 
A
S
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
R
K
 
Y
V
 
F
A
 
E
I
 
F
S
 
Y
I
 
A
R
 
G
A
 
A
Q
 
A
D
 
D
E
 
K
R
 
L
A
 
H
G
 
G
E
 
E
R
 
T
S
 
L
E
 
P
P
 
Y
M
 
Q
A
 
A
D
 
G
A
 
Y
T
 
T
A
 
V
R
 
L
L
 
T
A
 
V
H
 
R
R
 
E
P
 
P
H
 
H
G
 
G
V
 
V
L
 
T
A
 
G
V
 
H
I
 
I
G
 
V
P
 
P
F
 
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
M
 
M
H
 
Q
L
 
I
A
 
F
N
 
G
G
 
R
H
 
S
I
 
V
V
 
G
P
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
C
V
 
V
F
 
V
K
|
K
P
 
P
S
 
A
E
 
E
K
x
D
T
 
A
P
 
C
A
 
L
C
 
S
G
 
V
Q
 
L
L
 
R
M
 
V
G
 
A
E
 
E
L
 
L
W
 
A
R
 
A
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
D
 
A
H
 
G
V
 
A
L
 
L
T
 
N
I
 
I
V
 
V
I
 
T
G
 
G
-
 
Y
G
 
G
G
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
A
R
 
R
H
 
H
E
 
P
A
 
G
L
 
I
D
 
D
G
 
H
V
 
I
L
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
 
S
V
 
P
Q
 
A
A
 
T
G
 
G
R
 
K
A
 
L
I
 
V
H
 
T
R
 
Q
A
 
M
L
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
N
P
 
-
H
 
H
K
 
V
I
 
P
L
 
V
A
 
T
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
A
 
S
P
 
P
L
 
Q
V
 
I
V
 
V
W
 
F
D
 
A
V
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
L
H
 
P
L
 
V
I
 
L
V
 
V
Q
 
S
S
 
A
A
 
I
Y
 
V
V
 
Q
T
 
N
A
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
T
C
|
C
T
 
S
C
 
A
A
 
G
R
 
S
R
 
R
L
 
V
I
 
L
L
 
I
P
 
-
E
 
E
G
 
R
A
 
A
R
 
V
G
 
Y
D
 
E
A
 
P
L
 
L
L
 
V
E
 
E
A
 
R
L
 
L
T
 
A
M
 
T
L
 
A
M
 
F
D
 
N
R
 
G
L
 
L
V
 
R
I
 
V
G
 
-
G
 
G
P
 
P
F
 
S
Q
 
R
S
 
A
P
 
D
A
 
L
P
 
D
F
 
-
M
 
C
G
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
I
D
 
N
A
 
A
H
 
K
A
 
Q
A
 
Q
A
 
Q
Q
 
R
V
 
V
L
 
W
A
 
D
A
 
F
Q
 
L
D
 
S
R
 
D
M
 
A
T
 
Q
A
 
H
D
 
D
G
 
G
G
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
I
R
 
P
L
 
M
A
 
A
A
 
A
V
 
H
R
 
G
E
 
Q
A
 
V
R
 
V
S
 
A
A
 
D
L
 
A
L
 
P
S
 
E
P
 
S
G
 
G
L
 
F
I
 
Y
E
 
Q
-
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
L
L
 
L
T
 
R
D
 
D
A
 
V
P
 
P
-
 
P
-
 
S
-
 
H
-
 
R
L
 
L
R
 
A
D
 
Q
E
 
E
E
|
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
L
Q
 
A
V
 
A
R
 
M
R
 
R
A
 
F
A
 
V
D
 
D
F
 
E
D
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
N
A
 
G
T
 
T
R
 
P
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
I
I
 
W
S
 
T
D
 
R
D
 
D
E
 
G
A
 
A
L
 
R
Y
 
Q
R
 
M
R
 
R
F
 
L
W
 
A
T
 
R
S
 
R
V
 
L
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
Q
V
 
V
N
 
F
W
 
I
N
 
N
R
 
N
P
 
Y
T
 
G
T
 
A
G
 
G
A
 
G
S
 
G
S
 
V
A
 
E
A
 
L
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
|
G
G
 
H
S
 
S
G
|
G
N
 
H
H
 
G
R
 
R
P
x
E
S
 
K
A
 
G
Y
 
F
Y
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

4cazA Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa in complex with nadh
31% identity, 92% coverage: 10:442/472 of query aligns to 27:464/489 of 4cazA

query
sites
4cazA
D
 
N
P
 
P
Y
 
A
T
 
N
G
 
G
E
 
E
A
 
V
I
 
L
A
 
A
D
 
K
F
 
V
A
 
Q
V
 
R
N
 
A
D
 
S
A
 
R
R
 
E
S
 
D
I
 
V
D
 
E
A
 
R
A
 
A
C
 
V
H
 
Q
S
 
S
A
 
A
R
 
V
A
 
E
A
 
G
F
 
Q
A
 
K
E
 
V
W
 
W
A
 
A
M
 
A
T
 
M
P
 
T
L
 
A
A
 
M
E
 
Q
R
 
R
R
 
S
A
 
R
I
 
I
A
 
L
L
 
R
R
 
R
F
 
A
A
 
V
E
 
D
T
 
I
V
 
L
R
 
R
A
 
E
R
 
R
R
 
N
E
 
D
E
 
E
I
 
L
A
 
A
T
 
A
L
 
L
I
 
E
A
 
T
R
 
L
E
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
M
 
L
W
 
A
E
 
E
A
 
T
-
 
R
-
 
S
-
 
V
-
 
D
-
 
I
L
 
V
T
 
T
E
 
G
A
 
A
D
 
D
S
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
Y
K
 
Y
V
 
A
A
 
G
I
 
L
S
 
V
I
 
P
R
 
A
A
 
I
Q
 
E
D
 
G
E
 
E
R
 
Q
A
 
I
G
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
E
 
-
P
 
P
M
 
L
A
 
R
D
 
E
A
 
T
T
 
S
A
 
F
R
 
V
L
 
Y
A
 
T
H
 
R
R
 
R
-
 
E
P
 
P
H
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
G
I
|
I
G
|
G
P
 
A
F
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
M
 
V
H
 
Q
L
 
I
A
 
A
N
 
L
G
 
W
H
 
K
I
 
S
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
M
V
 
I
F
 
F
K
|
K
P
 
P
S
 
S
E
|
E
K
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
L
C
 
T
G
 
A
Q
 
L
L
 
K
M
 
L
G
 
A
E
 
E
L
 
I
W
 
Y
R
 
T
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
D
 
D
H
 
G
V
 
V
L
 
F
T
 
N
I
 
V
V
 
L
I
 
T
G
 
G
G
 
S
G
|
G
-
 
R
E
 
E
A
 
V
G
|
G
E
 
Q
A
 
W
L
 
L
V
 
T
R
 
E
H
 
H
E
 
P
A
 
L
L
 
I
D
 
E
G
 
K
V
 
I
L
 
S
F
|
F
T
|
T
G
|
G
G
|
G
V
 
T
Q
 
S
A
x
T
G
 
G
R
 
K
A
 
K
I
x
V
H
 
M
R
 
A
A
 
S
L
 
A
A
 
S
D
 
S
A
 
S
P
 
S
H
 
L
K
 
K
I
 
E
L
 
V
A
 
T
L
 
M
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
A
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
V
 
I
W
 
F
D
 
P
V
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
L
E
 
D
A
 
R
A
 
A
A
 
A
H
 
D
L
 
I
I
 
A
V
 
V
Q
 
M
S
 
A
A
 
N
Y
 
F
V
 
F
T
 
S
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
C
|
C
T
 
T
C
 
N
A
 
G
R
 
T
R
 
R
L
 
V
I
 
F
L
 
I
P
 
H
E
 
R
G
 
S
A
 
Q
R
 
Q
G
 
-
D
 
-
A
 
A
L
 
R
L
 
F
E
 
E
A
 
A
L
 
K
T
 
V
M
 
L
-
 
E
L
 
R
M
 
V
D
 
Q
R
 
R
L
 
I
V
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
D
P
 
P
F
 
Q
Q
 
D
S
 
E
P
 
N
A
 
T
P
 
N
F
 
F
M
 
-
G
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
V
D
 
S
A
 
F
H
 
P
A
 
H
A
 
M
A
 
E
Q
 
S
V
 
V
L
 
L
A
 
G
A
 
Y
Q
 
I
D
 
E
R
 
S
M
 
G
T
 
K
A
 
A
D
 
Q
G
 
K
G
 
A
R
 
R
P
 
L
L
 
L
-
 
C
-
 
G
-
 
G
-
 
E
R
 
R
L
 
V
A
 
T
A
 
D
V
 
G
R
 
A
E
 
F
A
 
G
R
 
K
S
 
G
A
 
A
L
 
Y
L
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
T
L
 
V
I
 
F
E
 
T
-
 
D
-
 
C
L
 
R
T
 
D
D
 
D
A
 
M
P
 
T
L
 
I
R
 
V
D
 
R
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
M
Q
 
S
V
 
I
R
 
L
R
 
V
A
 
Y
A
 
D
D
 
D
F
 
E
D
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
R
L
 
R
A
 
A
N
 
N
A
 
D
T
 
T
R
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
V
S
 
T
D
 
Q
D
 
D
E
 
L
A
 
A
L
 
R
Y
 
A
R
 
H
R
 
R
F
 
A
W
 
I
T
 
H
S
 
R
V
 
L
R
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
C
N
 
W
W
 
I
N
 
N
R
 
-
P
 
-
T
 
T
T
 
W
G
 
G
A
 
E
S
 
S
S
 
P
A
 
A
A
 
E
-
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
G
 
K
G
 
Q
S
 
S
G
 
G
N
 
V
H
 
G
R
 
R
P
x
E
S
 
N

2woxA Betaine aldehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa with NAD(p) h-catalytic thiol adduct. (see paper)
31% identity, 92% coverage: 10:442/472 of query aligns to 27:464/489 of 2woxA

query
sites
2woxA
D
 
N
P
 
P
Y
 
A
T
 
N
G
 
G
E
 
E
A
 
V
I
 
L
A
 
A
D
 
K
F
 
V
A
 
Q
V
 
R
N
 
A
D
 
S
A
 
R
R
 
E
S
 
D
I
 
V
D
 
E
A
 
R
A
 
A
C
 
V
H
 
Q
S
 
S
A
 
A
R
 
V
A
 
E
A
 
G
F
 
Q
A
 
K
E
 
V
W
 
W
A
 
A
M
 
A
T
 
M
P
 
T
L
 
A
A
 
M
E
 
Q
R
 
R
R
 
S
A
 
R
I
 
I
A
 
L
L
 
R
R
 
R
F
 
A
A
 
V
E
 
D
T
 
I
V
 
L
R
 
R
A
 
E
R
 
R
R
 
N
E
 
D
E
 
E
I
 
L
A
 
A
T
 
A
L
 
L
I
 
E
A
 
T
R
 
L
E
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
M
 
L
W
 
A
E
 
E
A
 
T
-
 
R
-
 
S
-
 
V
-
 
D
-
 
I
L
 
V
T
 
T
E
 
G
A
 
A
D
 
D
S
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
Y
K
 
Y
V
 
A
A
 
G
I
 
L
S
 
V
I
 
P
R
 
A
A
 
I
Q
 
E
D
 
G
E
 
E
R
 
Q
A
 
I
G
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
E
 
-
P
 
P
M
 
L
A
 
R
D
 
E
A
 
T
T
 
S
A
 
F
R
 
V
L
 
Y
A
 
T
H
 
R
R
 
R
-
 
E
P
 
P
H
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
G
I
|
I
G
|
G
P
 
A
F
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
M
 
V
H
 
Q
L
 
I
A
 
A
N
 
L
G
 
W
H
 
K
I
 
S
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
M
V
 
I
F
 
F
K
|
K
P
 
P
S
|
S
E
|
E
K
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
L
C
 
T
G
 
A
Q
 
L
L
 
K
M
 
L
G
 
A
E
 
E
L
 
I
W
 
Y
R
 
T
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
D
 
D
H
 
G
V
 
V
L
 
F
T
 
N
I
 
V
V
 
L
I
 
T
G
 
G
G
 
S
G
|
G
-
 
R
E
 
E
A
 
V
G
|
G
E
 
Q
A
 
W
L
 
L
V
 
T
R
 
E
H
 
H
E
 
P
A
 
L
L
 
I
D
 
E
G
 
K
V
 
I
L
 
S
F
|
F
T
|
T
G
|
G
G
|
G
V
 
T
Q
 
S
A
x
T
G
 
G
R
 
K
A
 
K
I
x
V
H
 
M
R
 
A
A
 
S
L
 
A
A
 
S
D
 
S
A
 
S
P
 
S
H
 
L
K
 
K
I
 
E
L
 
V
A
 
T
L
 
M
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
A
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
V
 
I
W
 
F
D
 
P
V
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
L
E
 
D
A
 
R
A
 
A
A
 
A
H
 
D
L
 
I
I
 
A
V
 
V
Q
 
M
S
 
A
A
 
N
Y
 
F
V
 
F
T
 
S
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
C
|
C
T
 
T
C
 
N
A
 
G
R
 
T
R
 
R
L
 
V
I
 
F
L
 
I
P
 
H
E
 
R
G
 
S
A
 
Q
R
 
Q
G
 
-
D
 
-
A
 
A
L
 
R
L
 
F
E
 
E
A
 
A
L
 
K
T
 
V
M
 
L
-
 
E
L
 
R
M
 
V
D
 
Q
R
 
R
L
 
I
V
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
D
P
 
P
F
 
Q
Q
 
D
S
 
E
P
 
N
A
 
T
P
 
N
F
 
F
M
 
-
G
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
V
D
 
S
A
 
F
H
 
P
A
 
H
A
 
M
A
 
E
Q
 
S
V
 
V
L
 
L
A
 
G
A
 
Y
Q
 
I
D
 
E
R
 
S
M
 
G
T
 
K
A
 
A
D
 
Q
G
 
K
G
 
A
R
 
R
P
 
L
L
 
L
-
 
C
-
 
G
-
 
G
-
 
E
R
 
R
L
 
V
A
 
T
A
 
D
V
 
G
R
 
A
E
 
F
A
 
G
R
 
K
S
 
G
A
 
A
L
 
Y
L
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
T
L
 
V
I
 
F
E
 
T
-
 
D
-
 
C
L
 
R
T
 
D
D
 
D
A
 
M
P
 
T
L
 
I
R
 
V
D
 
R
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
M
Q
 
S
V
 
I
R
 
L
R
 
V
A
 
Y
A
 
D
D
 
D
F
 
E
D
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
R
L
 
R
A
 
A
N
 
N
A
 
D
T
 
T
R
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
V
S
 
T
D
 
Q
D
 
D
E
 
L
A
 
A
L
 
R
Y
 
A
R
 
H
R
 
R
F
 
A
W
 
I
T
 
H
S
 
R
V
 
L
R
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
C
N
 
W
W
 
I
N
 
N
R
 
-
P
 
-
T
 
T
T
 
W
G
 
G
A
 
E
S
 
S
S
 
P
A
 
A
A
 
E
-
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
G
 
K
G
 
Q
S
 
S
G
 
G
N
 
V
H
 
G
R
 
R
P
x
E
S
 
N

2wmeA Crystallographic structure of betaine aldehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa (see paper)
31% identity, 92% coverage: 10:442/472 of query aligns to 27:464/489 of 2wmeA

query
sites
2wmeA
D
 
N
P
 
P
Y
 
A
T
 
N
G
 
G
E
 
E
A
 
V
I
 
L
A
 
A
D
 
K
F
 
V
A
 
Q
V
 
R
N
 
A
D
 
S
A
 
R
R
 
E
S
 
D
I
 
V
D
 
E
A
 
R
A
 
A
C
 
V
H
 
Q
S
 
S
A
 
A
R
 
V
A
 
E
A
 
G
F
 
Q
A
 
K
E
 
V
W
 
W
A
 
A
M
 
A
T
 
M
P
 
T
L
 
A
A
 
M
E
 
Q
R
 
R
R
 
S
A
 
R
I
 
I
A
 
L
L
 
R
R
 
R
F
 
A
A
 
V
E
 
D
T
 
I
V
 
L
R
 
R
A
 
E
R
 
R
R
 
N
E
 
D
E
 
E
I
 
L
A
 
A
T
 
A
L
 
L
I
 
E
A
 
T
R
 
L
E
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
M
 
L
W
 
A
E
 
E
A
 
T
-
 
R
-
 
S
-
 
V
-
 
D
-
 
I
L
 
V
T
 
T
E
 
G
A
 
A
D
 
D
S
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
Y
K
 
Y
V
 
A
A
 
G
I
 
L
S
 
V
I
 
P
R
 
A
A
 
I
Q
 
E
D
 
G
E
 
E
R
 
Q
A
 
I
G
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
E
 
-
P
 
P
M
 
L
A
 
R
D
 
E
A
 
T
T
 
S
A
 
F
R
 
V
L
 
Y
A
 
T
H
 
R
R
 
R
-
 
E
P
 
P
H
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
G
I
 
I
G
|
G
P
 
A
F
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
M
 
V
H
 
Q
L
 
I
A
 
A
N
 
L
G
 
W
H
 
K
I
 
S
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
M
V
 
I
F
 
F
K
|
K
P
 
P
S
|
S
E
|
E
K
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
L
C
 
T
G
 
A
Q
 
L
L
 
K
M
 
L
G
 
A
E
 
E
L
 
I
W
 
Y
R
 
T
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
D
 
D
H
 
G
V
 
V
L
 
F
T
 
N
I
 
V
V
 
L
I
 
T
G
 
G
G
 
S
G
|
G
-
 
R
E
 
E
A
 
V
G
|
G
E
 
Q
A
 
W
L
 
L
V
 
T
R
 
E
H
 
H
E
 
P
A
 
L
L
 
I
D
 
E
G
 
K
V
 
I
L
 
S
F
|
F
T
 
T
G
|
G
G
|
G
V
 
T
Q
 
S
A
x
T
G
 
G
R
 
K
A
 
K
I
x
V
H
 
M
R
 
A
A
 
S
L
 
A
A
 
S
D
 
S
A
 
S
P
 
S
H
 
L
K
 
K
I
 
E
L
 
V
A
 
T
L
 
M
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
A
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
V
 
I
W
 
F
D
 
P
V
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
L
E
 
D
A
 
R
A
 
A
A
 
A
H
 
D
L
 
I
I
 
A
V
 
V
Q
 
M
S
 
A
A
 
N
Y
 
F
V
 
F
T
 
S
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
C
|
C
T
 
T
C
 
N
A
 
G
R
 
T
R
 
R
L
 
V
I
 
F
L
 
I
P
 
H
E
 
R
G
 
S
A
 
Q
R
 
Q
G
 
-
D
 
-
A
 
A
L
 
R
L
 
F
E
 
E
A
 
A
L
 
K
T
 
V
M
 
L
-
 
E
L
 
R
M
 
V
D
 
Q
R
 
R
L
 
I
V
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
D
P
 
P
F
 
Q
Q
 
D
S
 
E
P
 
N
A
 
T
P
 
N
F
 
F
M
 
-
G
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
V
D
 
S
A
 
F
H
 
P
A
 
H
A
 
M
A
 
E
Q
 
S
V
 
V
L
 
L
A
 
G
A
 
Y
Q
 
I
D
 
E
R
 
S
M
 
G
T
 
K
A
 
A
D
 
Q
G
 
K
G
 
A
R
 
R
P
 
L
L
 
L
-
 
C
-
 
G
-
 
G
-
 
E
R
 
R
L
 
V
A
 
T
A
 
D
V
 
G
R
 
A
E
 
F
A
 
G
R
 
K
S
 
G
A
 
A
L
 
Y
L
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
T
L
 
V
I
 
F
E
 
T
-
 
D
-
 
C
L
 
R
T
 
D
D
 
D
A
 
M
P
 
T
L
 
I
R
 
V
D
 
R
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
M
Q
 
S
V
 
I
R
 
L
R
 
V
A
 
Y
A
 
D
D
 
D
F
 
E
D
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
R
L
 
R
A
 
A
N
 
N
A
 
D
T
 
T
R
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
V
S
 
T
D
 
Q
D
 
D
E
 
L
A
 
A
L
 
R
Y
 
A
R
 
H
R
 
R
F
 
A
W
 
I
T
 
H
S
 
R
V
 
L
R
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
C
N
 
W
W
 
I
N
 
N
R
 
-
P
 
-
T
 
T
T
 
W
G
 
G
A
 
E
S
 
S
S
 
P
A
 
A
A
 
E
-
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
G
 
K
G
 
Q
S
 
S
G
 
G
N
 
V
H
 
G
R
 
R
P
x
E
S
 
N

Q9HTJ1 NAD/NADP-dependent betaine aldehyde dehydrogenase; BADH; EC 1.2.1.8 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see 2 papers)
31% identity, 92% coverage: 10:442/472 of query aligns to 28:465/490 of Q9HTJ1

query
sites
Q9HTJ1
D
 
N
P
 
P
Y
 
A
T
 
N
G
 
G
E
 
E
A
 
V
I
 
L
A
 
A
D
 
K
F
 
V
A
 
Q
V
 
R
N
 
A
D
 
S
A
 
R
R
 
E
S
 
D
I
 
V
D
 
E
A
 
R
A
 
A
C
 
V
H
 
Q
S
 
S
A
 
A
R
 
V
A
 
E
A
 
G
F
 
Q
A
 
K
E
 
V
W
 
W
A
 
A
M
 
A
T
 
M
P
 
T
L
 
A
A
 
M
E
 
Q
R
 
R
R
 
S
A
 
R
I
 
I
A
 
L
L
 
R
R
 
R
F
 
A
A
 
V
E
 
D
T
 
I
V
 
L
R
 
R
A
 
E
R
 
R
R
 
N
E
 
D
E
 
E
I
 
L
A
 
A
T
 
A
L
 
L
I
 
E
A
 
T
R
 
L
E
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
M
 
L
W
 
A
E
 
E
A
 
T
-
 
R
-
 
S
-
 
V
-
 
D
-
 
I
L
 
V
T
 
T
E
 
G
A
 
A
D
 
D
S
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
Y
K
 
Y
V
 
A
A
 
G
I
 
L
S
 
V
I
 
P
R
 
A
A
 
I
Q
 
E
D
 
G
E
 
E
R
 
Q
A
 
I
G
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
E
 
-
P
 
P
M
 
L
A
 
R
D
 
E
A
 
T
T
 
S
A
 
F
R
 
V
L
 
Y
A
 
T
H
 
R
R
 
R
-
 
E
P
 
P
H
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
G
I
 
I
G
|
G
P
x
A
F
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
M
 
V
H
 
Q
L
 
I
A
 
A
N
 
L
G
 
W
H
x
K
I
 
S
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
M
V
 
I
F
 
F
K
|
K
P
|
P
S
|
S
E
|
E
K
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
L
C
 
T
G
 
A
Q
 
L
L
 
K
M
 
L
G
 
A
E
 
E
L
 
I
W
 
Y
R
 
T
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
D
 
D
H
 
G
V
 
V
L
 
F
T
 
N
I
 
V
V
 
L
I
 
T
G
 
G
G
 
S
G
|
G
-
 
R
E
 
E
A
 
V
G
 
G
E
 
Q
A
 
W
L
 
L
V
 
T
R
 
E
H
 
H
E
 
P
A
 
L
L
 
I
D
 
E
G
 
K
V
 
I
L
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
V
x
T
Q
x
S
A
x
T
G
 
G
R
 
K
A
 
K
I
 
V
H
 
M
R
 
A
A
 
S
L
 
A
A
 
S
D
 
S
A
 
S
P
 
S
H
 
L
K
 
K
I
 
E
L
 
V
A
 
T
L
 
M
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
A
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
V
 
I
W
 
F
D
 
P
V
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
L
E
 
D
A
 
R
A
 
A
A
 
A
H
 
D
L
 
I
I
 
A
V
 
V
Q
 
M
S
 
A
A
 
N
Y
 
F
V
 
F
T
 
S
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
C
|
C
T
 
T
C
 
N
A
 
G
R
 
T
R
 
R
L
 
V
I
 
F
L
 
I
P
 
H
E
 
R
G
 
S
A
 
Q
R
 
Q
G
 
-
D
 
-
A
 
A
L
 
R
L
 
F
E
 
E
A
 
A
L
 
K
T
 
V
M
 
L
-
 
E
L
 
R
M
 
V
D
 
Q
R
 
R
L
 
I
V
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
D
P
 
P
F
 
Q
Q
 
D
S
 
E
P
 
N
A
 
T
P
 
N
F
 
F
M
 
-
G
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
V
D
 
S
A
 
F
H
 
P
A
 
H
A
 
M
A
 
E
Q
 
S
V
 
V
L
 
L
A
 
G
A
 
Y
Q
 
I
D
 
E
R
 
S
M
 
G
T
 
K
A
 
A
D
 
Q
G
 
K
G
 
A
R
 
R
P
 
L
L
 
L
-
 
C
-
 
G
-
 
G
-
 
E
R
 
R
L
 
V
A
 
T
A
 
D
V
 
G
R
 
A
E
 
F
A
 
G
R
 
K
S
 
G
A
 
A
L
 
Y
L
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
T
L
 
V
I
 
F
E
 
T
-
 
D
-
 
C
L
 
R
T
 
D
D
 
D
A
 
M
P
 
T
L
 
I
R
 
V
D
 
R
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
M
Q
 
S
V
 
I
R
 
L
R
 
V
A
 
Y
A
 
D
D
 
D
F
 
E
D
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
R
L
 
R
A
 
A
N
 
N
A
 
D
T
 
T
R
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
V
S
 
T
D
 
Q
D
 
D
E
 
L
A
 
A
L
 
R
Y
 
A
R
 
H
R
 
R
F
 
A
W
 
I
T
 
H
S
 
R
V
 
L
R
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
C
N
 
W
W
 
I
N
 
N
R
 
-
P
 
-
T
 
T
T
 
W
G
 
G
A
 
E
S
 
S
S
 
P
A
 
A
A
 
E
-
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
G
 
K
G
 
Q
S
 
S
G
 
G
N
 
V
H
 
G
R
 
R
P
x
E
S
 
N

8skfA Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (lattice translocation disorder)
30% identity, 98% coverage: 10:472/472 of query aligns to 35:492/497 of 8skfA

query
sites
8skfA
D
 
N
P
 
P
Y
 
A
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
V
I
 
L
A
 
A
D
 
T
F
 
V
A
 
Q
V
 
A
N
 
A
D
 
G
A
 
R
R
 
E
S
 
D
I
 
V
D
 
D
A
 
R
A
 
A
C
 
V
H
 
K
S
 
S
A
 
A
R
 
Q
A
 
Q
A
 
G
F
 
Q
A
 
K
E
 
V
W
 
W
A
 
A
M
 
A
T
 
M
P
 
S
L
 
A
A
 
M
E
 
A
R
 
R
R
 
S
A
 
R
I
 
I
A
 
L
L
 
R
R
 
K
F
 
A
A
 
V
E
 
D
T
 
I
V
 
L
R
 
R
A
 
E
R
 
R
R
 
N
E
 
D
E
 
E
I
 
L
A
 
A
T
 
R
L
 
L
I
 
E
A
 
T
R
 
L
E
x
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
M
 
L
W
 
S
E
 
E
A
 
T
L
 
-
T
 
A
E
 
A
A
 
V
D
 
D
S
 
I
V
 
V
A
 
T
A
 
G
K
 
A
V
 
D
A
 
V
I
 
L
S
 
E
I
 
Y
R
 
Y
A
 
A
Q
 
G
D
 
L
E
 
I
R
 
P
A
 
A
G
 
L
E
 
E
R
 
G
S
 
S
E
 
Q
-
 
I
P
 
P
M
 
L
A
 
R
D
 
D
A
 
S
T
 
S
A
 
F
R
 
V
L
 
Y
A
 
T
H
 
R
R
 
R
-
 
E
P
 
P
H
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
G
I
|
I
G
|
G
P
x
A
F
x
W
N
 
N
F
 
Y
P
 
P
M
 
I
H
 
Q
L
 
I
A
 
A
N
 
L
G
 
W
H
 
K
I
 
S
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
M
V
 
I
F
 
F
K
|
K
P
 
P
S
 
S
E
|
E
K
x
V
T
 
T
P
 
P
A
 
L
C
 
T
G
 
A
Q
 
L
L
 
K
M
 
L
G
 
A
E
 
E
L
 
I
W
 
Y
R
 
R
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
D
 
D
H
 
G
V
 
V
L
 
F
T
 
N
I
 
V
V
 
L
I
 
P
G
 
G
-
 
I
G
|
G
G
 
A
E
 
E
A
 
T
G
|
G
E
 
Q
A
 
Y
L
 
L
V
 
T
R
 
E
H
 
H
E
 
P
A
 
D
L
 
I
D
 
A
G
 
K
V
 
I
L
 
S
F
 
F
T
|
T
G
|
G
G
|
G
V
 
V
Q
 
A
A
x
S
G
 
G
R
 
K
A
x
K
I
 
V
H
 
M
R
 
A
A
 
N
L
 
S
A
 
A
D
 
A
A
 
S
P
 
S
H
 
L
K
 
K
I
 
E
L
 
V
A
 
T
L
 
M
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
A
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
V
 
I
W
 
A
D
 
E
V
 
D
A
 
A
D
 
N
I
 
L
E
 
D
A
 
L
A
 
A
A
 
A
H
 
D
L
 
I
I
 
A
V
 
M
Q
 
M
S
 
A
A
 
N
Y
 
F
V
 
Y
T
 
S
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
C
|
C
T
 
T
C
 
N
A
 
G
R
 
T
R
 
R
L
 
V
I
 
F
L
 
V
P
 
P
E
 
A
G
 
K
A
 
F
R
 
K
G
 
A
D
 
E
A
 
F
L
 
E
L
 
H
E
 
K
A
 
I
L
 
L
T
 
E
M
 
R
L
 
V
M
 
-
D
 
G
R
 
R
L
 
I
V
 
R
I
 
A
G
 
G
G
 
D
P
 
L
F
 
F
Q
 
A
S
 
D
P
 
D
A
 
T
P
 
N
F
 
F
M
 
-
G
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
V
D
 
S
A
 
F
H
 
P
A
 
H
A
 
R
A
 
Q
Q
 
N
V
 
V
L
 
L
A
 
R
A
 
Y
Q
 
I
D
 
E
R
 
S
M
 
G
T
 
K
A
 
S
D
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
R
P
 
L
L
 
L
R
 
C
L
 
G
A
 
G
A
 
D
V
 
V
R
 
L
E
 
K
A
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
F
-
 
D
R
 
N
S
 
G
A
 
A
L
 
W
L
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
T
L
 
V
I
 
F
E
 
T
-
 
D
-
 
C
L
 
T
T
 
D
D
 
D
A
 
M
P
 
T
L
 
I
R
 
V
D
 
R
E
 
E
E
 
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
M
Q
 
S
V
 
I
R
 
L
R
 
S
A
 
Y
A
 
D
D
 
D
F
 
E
D
 
A
A
 
E
A
 
V
L
 
I
A
 
R
L
 
R
A
 
A
N
 
N
A
 
A
T
 
T
R
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
V
S
 
T
D
 
P
D
 
D
E
 
L
A
 
N
L
 
R
Y
 
A
R
 
H
R
 
R
F
 
I
W
 
I
T
 
H
S
 
Q
V
 
L
R
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
C
N
 
-
W
 
W
N
 
I
R
 
N
P
 
S
T
 
W
T
 
G
G
 
E
A
 
S
S
 
P
S
 
A
A
 
E
A
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
G
 
K
G
 
H
S
 
S
G
 
G
N
 
I
H
 
G
R
 
R
P
 
E
S
 
N
A
 
G
Y
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
V
 
V
A
 
M
G
 
T
L
 
L
E
 
Q
S
 
S
P
 
Y
S
 
T
P
 
Q
V
 
V
Y
 
K
R
 
S
L
 
I
P
 
Q
I
 
V
G
 
E
L
 
M
N
 
G
P
 
P

Sites not aligning to the query:

8vr1A Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (ctp bound)
30% identity, 98% coverage: 10:472/472 of query aligns to 26:483/488 of 8vr1A

query
sites
8vr1A
D
 
N
P
 
P
Y
 
A
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
V
I
 
L
A
 
A
D
 
T
F
 
V
A
 
Q
V
 
A
N
 
A
D
 
G
A
 
R
R
 
E
S
 
D
I
 
V
D
 
D
A
 
R
A
 
A
C
 
V
H
 
K
S
 
S
A
 
A
R
 
Q
A
 
Q
A
 
G
F
 
Q
A
 
K
E
 
V
W
 
W
A
 
A
M
 
A
T
 
M
P
 
S
L
 
A
A
 
M
E
 
A
R
 
R
R
 
S
A
 
R
I
 
I
A
 
L
L
 
R
R
 
K
F
 
A
A
 
V
E
 
D
T
 
I
V
 
L
R
 
R
A
 
E
R
 
R
R
 
N
E
 
D
E
 
E
I
 
L
A
 
A
T
 
R
L
 
L
I
 
E
A
 
T
R
 
L
E
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
M
 
L
W
 
S
E
 
E
A
 
T
L
 
-
T
 
A
E
 
A
A
 
V
D
 
D
S
 
I
V
 
V
A
 
T
A
 
G
K
 
A
V
 
D
A
 
V
I
 
L
S
 
E
I
 
Y
R
 
Y
A
 
A
Q
 
G
D
 
L
E
 
I
R
 
P
A
 
A
G
 
L
E
 
E
R
 
G
S
 
S
E
 
Q
-
 
I
P
 
P
M
 
L
A
 
R
D
 
D
A
 
S
T
 
S
A
 
F
R
 
V
L
 
Y
A
 
T
H
 
R
R
 
R
-
 
E
P
 
P
H
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
A
F
x
W
N
 
N
F
 
Y
P
 
P
M
 
I
H
 
Q
L
 
I
A
 
A
N
 
L
G
 
W
H
 
K
I
 
S
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
M
V
 
I
F
 
F
K
 
K
P
 
P
S
 
S
E
 
E
K
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
L
C
 
T
G
 
A
Q
 
L
L
 
K
M
 
L
G
 
A
E
 
E
L
 
I
W
 
Y
R
 
R
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
D
 
D
H
 
G
V
 
V
L
 
F
T
 
N
I
 
V
V
 
L
I
 
P
G
 
G
-
 
I
G
 
G
G
 
A
E
 
E
A
 
T
G
 
G
E
 
Q
A
 
Y
L
 
L
V
 
T
R
 
E
H
 
H
E
 
P
A
 
D
L
 
I
D
 
A
G
 
K
V
 
I
L
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
G
|
G
V
 
V
Q
x
A
A
x
S
G
 
G
R
 
K
A
 
K
I
 
V
H
 
M
R
 
A
A
 
N
L
 
S
A
 
A
D
 
A
A
 
S
P
 
S
H
 
L
K
 
K
I
 
E
L
 
V
A
 
T
L
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
A
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
V
 
I
W
 
A
D
 
E
V
 
D
A
 
A
D
 
N
I
 
L
E
 
D
A
 
L
A
 
A
A
 
A
H
 
D
L
 
I
I
 
A
V
 
M
Q
 
M
S
 
A
A
 
N
Y
 
F
V
 
Y
T
 
S
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
C
 
C
T
 
T
C
 
N
A
 
G
R
 
T
R
 
R
L
 
V
I
 
F
L
 
V
P
 
P
E
 
-
G
 
-
A
 
A
R
 
K
G
 
F
D
 
K
A
 
A
L
 
E
L
 
F
E
 
E
-
 
H
A
 
K
L
 
I
T
 
L
M
 
E
L
 
R
M
 
V
D
 
G
R
 
R
L
 
I
V
 
R
I
 
A
G
 
G
G
 
D
P
 
L
F
 
F
Q
 
A
S
 
D
P
 
D
A
 
T
P
 
N
F
 
F
M
 
-
G
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
V
D
 
S
A
 
F
H
 
P
A
 
H
A
 
R
A
 
Q
Q
 
N
V
 
V
L
 
L
A
 
R
A
 
Y
Q
 
I
D
 
E
R
 
S
M
 
G
T
 
K
A
 
S
D
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
R
P
 
L
L
 
L
R
 
C
L
 
G
A
 
G
A
 
D
V
 
V
R
 
L
E
 
K
A
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
F
-
 
D
R
 
N
S
 
G
A
 
A
L
 
W
L
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
T
L
 
V
I
 
F
E
 
T
-
 
D
-
 
C
L
 
T
T
 
D
D
 
D
A
 
M
P
 
T
L
 
I
R
 
V
D
 
R
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
M
Q
 
S
V
 
I
R
 
L
R
 
S
A
 
Y
A
 
D
D
 
D
F
 
E
D
 
A
A
 
E
A
 
V
L
 
I
A
 
R
L
 
R
A
 
A
N
 
N
A
 
A
T
 
T
R
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
V
S
 
T
D
 
P
D
 
D
E
 
L
A
 
N
L
 
R
Y
 
A
R
 
H
R
 
R
F
 
I
W
 
I
T
 
H
S
 
Q
V
 
L
R
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
C
N
 
-
W
 
W
N
 
I
R
 
N
P
 
S
T
 
W
T
 
G
G
 
E
A
 
S
S
 
P
S
 
A
A
 
E
A
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
G
 
K
G
 
H
S
 
S
G
 
G
N
 
I
H
 
G
R
 
R
P
 
E
S
 
N
A
 
G
Y
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
V
 
V
A
 
M
G
 
T
L
 
L
E
 
Q
S
 
S
P
 
Y
S
 
T
P
 
Q
V
 
V
Y
 
K
R
 
S
L
 
I
P
 
Q
I
 
V
G
 
E
L
 
M
N
 
G
P
 
P

8vr0A Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (gmp bound)
30% identity, 98% coverage: 10:472/472 of query aligns to 26:483/488 of 8vr0A

query
sites
8vr0A
D
 
N
P
 
P
Y
 
A
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
V
I
 
L
A
 
A
D
 
T
F
 
V
A
 
Q
V
 
A
N
 
A
D
 
G
A
 
R
R
 
E
S
 
D
I
 
V
D
 
D
A
 
R
A
 
A
C
 
V
H
 
K
S
 
S
A
 
A
R
 
Q
A
 
Q
A
 
G
F
 
Q
A
 
K
E
 
V
W
 
W
A
 
A
M
 
A
T
 
M
P
 
S
L
 
A
A
 
M
E
 
A
R
 
R
R
 
S
A
 
R
I
 
I
A
 
L
L
 
R
R
 
K
F
 
A
A
 
V
E
 
D
T
 
I
V
 
L
R
 
R
A
 
E
R
 
R
R
 
N
E
 
D
E
 
E
I
 
L
A
 
A
T
 
R
L
 
L
I
 
E
A
 
T
R
 
L
E
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
M
 
L
W
 
S
E
 
E
A
 
T
L
 
-
T
 
A
E
 
A
A
 
V
D
 
D
S
 
I
V
 
V
A
 
T
A
 
G
K
 
A
V
 
D
A
 
V
I
 
L
S
 
E
I
 
Y
R
 
Y
A
 
A
Q
 
G
D
 
L
E
 
I
R
 
P
A
 
A
G
 
L
E
 
E
R
 
G
S
 
S
E
 
Q
-
 
I
P
 
P
M
 
L
A
 
R
D
 
D
A
 
S
T
 
S
A
 
F
R
 
V
L
 
Y
A
 
T
H
 
R
R
 
R
-
 
E
P
 
P
H
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
A
F
x
W
N
 
N
F
 
Y
P
 
P
M
 
I
H
 
Q
L
 
I
A
 
A
N
 
L
G
 
W
H
 
K
I
 
S
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
M
V
 
I
F
 
F
K
 
K
P
 
P
S
 
S
E
 
E
K
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
L
C
 
T
G
 
A
Q
 
L
L
 
K
M
 
L
G
 
A
E
 
E
L
 
I
W
 
Y
R
 
R
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
D
 
D
H
 
G
V
 
V
L
 
F
T
 
N
I
 
V
V
 
L
I
 
P
G
 
G
-
 
I
G
 
G
G
 
A
E
 
E
A
 
T
G
 
G
E
 
Q
A
 
Y
L
 
L
V
 
T
R
 
E
H
 
H
E
 
P
A
 
D
L
 
I
D
 
A
G
 
K
V
 
I
L
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
G
|
G
V
 
V
Q
 
A
A
 
S
G
 
G
R
 
K
A
 
K
I
 
V
H
 
M
R
 
A
A
 
N
L
 
S
A
 
A
D
 
A
A
 
S
P
 
S
H
 
L
K
 
K
I
 
E
L
 
V
A
 
T
L
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
A
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
V
 
I
W
 
A
D
 
E
V
 
D
A
 
A
D
 
N
I
 
L
E
 
D
A
 
L
A
 
A
A
 
A
H
 
D
L
 
I
I
 
A
V
 
M
Q
 
M
S
 
A
A
 
N
Y
 
F
V
 
Y
T
 
S
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
C
 
C
T
 
T
C
 
N
A
 
G
R
 
T
R
 
R
L
 
V
I
 
F
L
 
V
P
 
P
E
 
-
G
 
-
A
 
A
R
 
K
G
 
F
D
 
K
A
 
A
L
 
E
L
 
F
E
 
E
-
 
H
A
 
K
L
 
I
T
 
L
M
 
E
L
 
R
M
 
V
D
 
G
R
 
R
L
 
I
V
 
R
I
 
A
G
 
G
G
 
D
P
 
L
F
 
F
Q
 
A
S
 
D
P
 
D
A
 
T
P
 
N
F
 
F
M
 
-
G
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
V
D
 
S
A
 
F
H
 
P
A
x
H
A
 
R
A
 
Q
Q
 
N
V
 
V
L
 
L
A
 
R
A
 
Y
Q
 
I
D
 
E
R
 
S
M
 
G
T
 
K
A
 
S
D
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
R
P
 
L
L
 
L
R
 
C
L
 
G
A
 
G
A
 
D
V
 
V
R
 
L
E
 
K
A
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
F
-
 
D
R
 
N
S
 
G
A
 
A
L
 
W
L
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
T
L
 
V
I
 
F
E
 
T
-
 
D
-
 
C
L
 
T
T
 
D
D
 
D
A
 
M
P
 
T
L
 
I
R
 
V
D
 
R
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
M
Q
 
S
V
 
I
R
 
L
R
 
S
A
 
Y
A
 
D
D
 
D
F
 
E
D
 
A
A
 
E
A
 
V
L
 
I
A
 
R
L
 
R
A
 
A
N
 
N
A
 
A
T
 
T
R
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
V
S
 
T
D
 
P
D
 
D
E
 
L
A
 
N
L
 
R
Y
 
A
R
 
H
R
 
R
F
 
I
W
 
I
T
 
H
S
 
Q
V
 
L
R
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
C
N
 
-
W
 
W
N
 
I
R
 
N
P
 
S
T
 
W
T
 
G
G
 
E
A
 
S
S
 
P
S
 
A
A
 
E
A
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
G
 
K
G
 
H
S
 
S
G
 
G
N
 
I
H
 
G
R
 
R
P
 
E
S
 
N
A
 
G
Y
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
V
 
V
A
 
M
G
 
T
L
 
L
E
 
Q
S
 
S
P
 
Y
S
 
T
P
 
Q
V
 
V
Y
 
K
R
 
S
L
 
I
P
 
Q
I
 
V
G
 
E
L
 
M
N
 
G
P
 
P

8vqzA Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (cmp bound)
30% identity, 98% coverage: 10:472/472 of query aligns to 26:483/488 of 8vqzA

query
sites
8vqzA
D
 
N
P
 
P
Y
 
A
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
V
I
 
L
A
 
A
D
 
T
F
 
V
A
 
Q
V
 
A
N
 
A
D
 
G
A
 
R
R
 
E
S
 
D
I
 
V
D
 
D
A
 
R
A
 
A
C
 
V
H
 
K
S
 
S
A
 
A
R
 
Q
A
 
Q
A
 
G
F
 
Q
A
 
K
E
 
V
W
 
W
A
 
A
M
 
A
T
 
M
P
 
S
L
 
A
A
 
M
E
 
A
R
 
R
R
 
S
A
 
R
I
 
I
A
 
L
L
 
R
R
 
K
F
 
A
A
 
V
E
 
D
T
 
I
V
 
L
R
 
R
A
 
E
R
 
R
R
 
N
E
 
D
E
 
E
I
 
L
A
 
A
T
 
R
L
 
L
I
 
E
A
 
T
R
 
L
E
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
M
 
L
W
 
S
E
 
E
A
 
T
L
 
-
T
 
A
E
 
A
A
 
V
D
 
D
S
 
I
V
 
V
A
 
T
A
 
G
K
 
A
V
 
D
A
 
V
I
 
L
S
 
E
I
 
Y
R
 
Y
A
 
A
Q
 
G
D
 
L
E
 
I
R
 
P
A
 
A
G
 
L
E
 
E
R
 
G
S
 
S
E
 
Q
-
 
I
P
 
P
M
 
L
A
 
R
D
 
D
A
 
S
T
 
S
A
 
F
R
 
V
L
 
Y
A
 
T
H
 
R
R
 
R
-
 
E
P
 
P
H
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
A
F
x
W
N
 
N
F
 
Y
P
 
P
M
 
I
H
 
Q
L
 
I
A
 
A
N
 
L
G
 
W
H
 
K
I
 
S
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
M
V
 
I
F
 
F
K
 
K
P
 
P
S
 
S
E
 
E
K
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
L
C
 
T
G
 
A
Q
 
L
L
 
K
M
 
L
G
 
A
E
 
E
L
 
I
W
 
Y
R
 
R
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
D
 
D
H
 
G
V
 
V
L
 
F
T
 
N
I
 
V
V
 
L
I
 
P
G
 
G
-
 
I
G
 
G
G
 
A
E
 
E
A
 
T
G
 
G
E
 
Q
A
 
Y
L
 
L
V
 
T
R
 
E
H
 
H
E
 
P
A
 
D
L
 
I
D
 
A
G
 
K
V
 
I
L
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
G
|
G
V
 
V
Q
 
A
A
 
S
G
 
G
R
 
K
A
 
K
I
 
V
H
 
M
R
 
A
A
 
N
L
 
S
A
 
A
D
 
A
A
 
S
P
 
S
H
 
L
K
 
K
I
 
E
L
 
V
A
 
T
L
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
A
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
V
 
I
W
 
A
D
 
E
V
 
D
A
 
A
D
 
N
I
 
L
E
 
D
A
 
L
A
 
A
A
 
A
H
 
D
L
 
I
I
 
A
V
 
M
Q
 
M
S
 
A
A
 
N
Y
 
F
V
 
Y
T
 
S
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
C
 
C
T
 
T
C
 
N
A
 
G
R
 
T
R
 
R
L
 
V
I
 
F
L
 
V
P
 
P
E
 
-
G
 
-
A
 
A
R
 
K
G
 
F
D
 
K
A
 
A
L
 
E
L
 
F
E
 
E
-
 
H
A
 
K
L
 
I
T
 
L
M
 
E
L
 
R
M
 
V
D
 
G
R
 
R
L
 
I
V
 
R
I
 
A
G
 
G
G
 
D
P
 
L
F
 
F
Q
 
A
S
 
D
P
 
D
A
 
T
P
 
N
F
 
F
M
 
-
G
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
V
D
 
S
A
 
F
H
 
P
A
x
H
A
 
R
A
 
Q
Q
x
N
V
 
V
L
 
L
A
 
R
A
 
Y
Q
 
I
D
 
E
R
 
S
M
 
G
T
 
K
A
 
S
D
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
R
P
 
L
L
 
L
R
 
C
L
 
G
A
 
G
A
 
D
V
 
V
R
 
L
E
 
K
A
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
F
-
 
D
R
 
N
S
 
G
A
 
A
L
 
W
L
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
T
L
 
V
I
 
F
E
 
T
-
 
D
-
 
C
L
 
T
T
 
D
D
 
D
A
 
M
P
 
T
L
 
I
R
 
V
D
 
R
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
M
Q
 
S
V
 
I
R
 
L
R
 
S
A
 
Y
A
 
D
D
 
D
F
 
E
D
 
A
A
 
E
A
 
V
L
 
I
A
 
R
L
 
R
A
 
A
N
 
N
A
 
A
T
 
T
R
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
V
S
 
T
D
 
P
D
 
D
E
 
L
A
 
N
L
 
R
Y
 
A
R
 
H
R
 
R
F
 
I
W
 
I
T
 
H
S
 
Q
V
 
L
R
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
C
N
 
-
W
 
W
N
 
I
R
 
N
P
 
S
T
 
W
T
 
G
G
 
E
A
 
S
S
 
P
S
 
A
A
 
E
A
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
G
 
K
G
 
H
S
 
S
G
 
G
N
 
I
H
 
G
R
 
R
P
 
E
S
 
N
A
 
G
Y
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
V
 
V
A
 
M
G
 
T
L
 
L
E
 
Q
S
 
S
P
 
Y
S
 
T
P
 
Q
V
 
V
Y
 
K
R
 
S
L
 
I
P
 
Q
I
 
V
G
 
E
L
 
M
N
 
G
P
 
P

8vqwC Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (coa bound)
30% identity, 98% coverage: 10:472/472 of query aligns to 26:483/488 of 8vqwC

query
sites
8vqwC
D
 
N
P
 
P
Y
 
A
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
V
I
 
L
A
 
A
D
 
T
F
 
V
A
 
Q
V
 
A
N
 
A
D
 
G
A
 
R
R
 
E
S
 
D
I
 
V
D
 
D
A
 
R
A
 
A
C
 
V
H
 
K
S
 
S
A
 
A
R
 
Q
A
 
Q
A
 
G
F
 
Q
A
 
K
E
 
V
W
 
W
A
 
A
M
 
A
T
 
M
P
 
S
L
 
A
A
 
M
E
 
A
R
 
R
R
 
S
A
 
R
I
 
I
A
 
L
L
 
R
R
 
K
F
 
A
A
 
V
E
 
D
T
 
I
V
 
L
R
 
R
A
 
E
R
 
R
R
 
N
E
 
D
E
 
E
I
 
L
A
 
A
T
 
R
L
 
L
I
 
E
A
 
T
R
 
L
E
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
M
 
L
W
 
S
E
 
E
A
 
T
L
 
-
T
 
A
E
 
A
A
 
V
D
 
D
S
 
I
V
 
V
A
 
T
A
 
G
K
 
A
V
 
D
A
 
V
I
 
L
S
 
E
I
 
Y
R
 
Y
A
 
A
Q
 
G
D
 
L
E
 
I
R
 
P
A
 
A
G
 
L
E
 
E
R
 
G
S
 
S
E
 
Q
-
 
I
P
 
P
M
 
L
A
 
R
D
 
D
A
 
S
T
 
S
A
 
F
R
 
V
L
 
Y
A
 
T
H
 
R
R
 
R
-
 
E
P
 
P
H
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
G
I
|
I
G
 
G
P
 
A
F
x
W
N
 
N
F
 
Y
P
 
P
M
 
I
H
 
Q
L
 
I
A
 
A
N
 
L
G
 
W
H
 
K
I
 
S
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
M
V
 
I
F
 
F
K
|
K
P
 
P
S
|
S
E
|
E
K
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
L
C
 
T
G
 
A
Q
 
L
L
 
K
M
 
L
G
 
A
E
 
E
L
 
I
W
 
Y
R
 
R
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
D
 
D
H
 
G
V
 
V
L
 
F
T
 
N
I
 
V
V
 
L
I
 
P
G
 
G
-
 
I
G
|
G
G
 
A
E
 
E
A
 
T
G
|
G
E
 
Q
A
 
Y
L
 
L
V
 
T
R
 
E
H
 
H
E
 
P
A
 
D
L
 
I
D
 
A
G
 
K
V
 
I
L
 
S
F
|
F
T
 
T
G
|
G
G
|
G
V
 
V
Q
 
A
A
x
S
G
 
G
R
 
K
A
 
K
I
 
V
H
 
M
R
 
A
A
 
N
L
 
S
A
 
A
D
 
A
A
 
S
P
 
S
H
 
L
K
 
K
I
 
E
L
 
V
A
 
T
L
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
A
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
V
 
I
W
 
A
D
 
E
V
 
D
A
 
A
D
 
N
I
 
L
E
 
D
A
 
L
A
 
A
A
 
A
H
 
D
L
 
I
I
 
A
V
 
M
Q
 
M
S
 
A
A
 
N
Y
 
F
V
 
Y
T
 
S
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
C
 
C
T
 
T
C
 
N
A
 
G
R
 
T
R
 
R
L
 
V
I
 
F
L
 
V
P
 
P
E
 
-
G
 
-
A
 
A
R
 
K
G
 
F
D
 
K
A
 
A
L
 
E
L
 
F
E
 
E
-
 
H
A
 
K
L
 
I
T
 
L
M
 
E
L
 
R
M
 
V
D
 
G
R
 
R
L
 
I
V
 
R
I
 
A
G
 
G
G
 
D
P
 
L
F
 
F
Q
 
A
S
 
D
P
 
D
A
 
T
P
 
N
F
 
F
M
 
-
G
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
V
D
 
S
A
 
F
H
 
P
A
x
H
A
 
R
A
 
Q
Q
 
N
V
 
V
L
 
L
A
 
R
A
 
Y
Q
 
I
D
 
E
R
 
S
M
 
G
T
 
K
A
 
S
D
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
R
P
 
L
L
 
L
R
 
C
L
 
G
A
 
G
A
 
D
V
 
V
R
 
L
E
 
K
A
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
F
-
 
D
R
 
N
S
 
G
A
 
A
L
 
W
L
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
T
L
 
V
I
 
F
E
 
T
-
 
D
-
 
C
L
 
T
T
 
D
D
 
D
A
 
M
P
 
T
L
 
I
R
 
V
D
 
R
E
 
E
E
 
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
M
Q
 
S
V
 
I
R
 
L
R
 
S
A
 
Y
A
 
D
D
 
D
F
 
E
D
 
A
A
 
E
A
 
V
L
 
I
A
 
R
L
 
R
A
 
A
N
 
N
A
 
A
T
 
T
R
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
V
S
 
T
D
 
P
D
 
D
E
 
L
A
 
N
L
 
R
Y
 
A
R
 
H
R
 
R
F
 
I
W
 
I
T
 
H
S
 
Q
V
 
L
R
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
C
N
 
-
W
 
W
N
 
I
R
 
N
P
 
S
T
 
W
T
 
G
G
 
E
A
 
S
S
 
P
S
 
A
A
 
E
A
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
G
 
K
G
 
H
S
 
S
G
 
G
N
 
I
H
 
G
R
 
R
P
 
E
S
 
N
A
 
G
Y
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
V
 
V
A
 
M
G
 
T
L
 
L
E
 
Q
S
 
S
P
 
Y
S
 
T
P
 
Q
V
 
V
Y
 
K
R
 
S
L
 
I
P
 
Q
I
 
V
G
 
E
L
 
M
N
 
G
P
 
P

8vj3A Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (fad bound)
30% identity, 98% coverage: 10:472/472 of query aligns to 26:483/488 of 8vj3A

query
sites
8vj3A
D
 
N
P
 
P
Y
 
A
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
V
I
 
L
A
 
A
D
 
T
F
 
V
A
 
Q
V
 
A
N
 
A
D
 
G
A
 
R
R
 
E
S
 
D
I
 
V
D
 
D
A
 
R
A
 
A
C
 
V
H
 
K
S
 
S
A
 
A
R
 
Q
A
 
Q
A
 
G
F
 
Q
A
 
K
E
 
V
W
 
W
A
 
A
M
 
A
T
 
M
P
 
S
L
 
A
A
 
M
E
 
A
R
 
R
R
 
S
A
 
R
I
 
I
A
 
L
L
 
R
R
 
K
F
 
A
A
 
V
E
 
D
T
 
I
V
 
L
R
 
R
A
 
E
R
 
R
R
 
N
E
 
D
E
 
E
I
 
L
A
 
A
T
 
R
L
 
L
I
 
E
A
 
T
R
 
L
E
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
M
 
L
W
 
S
E
 
E
A
 
T
L
 
-
T
 
A
E
 
A
A
 
V
D
 
D
S
 
I
V
 
V
A
 
T
A
 
G
K
 
A
V
 
D
A
 
V
I
 
L
S
 
E
I
 
Y
R
 
Y
A
 
A
Q
 
G
D
 
L
E
 
I
R
 
P
A
 
A
G
 
L
E
 
E
R
 
G
S
 
S
E
 
Q
-
 
I
P
 
P
M
 
L
A
 
R
D
 
D
A
 
S
T
 
S
A
 
F
R
 
V
L
 
Y
A
 
T
H
 
R
R
 
R
-
 
E
P
 
P
H
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
G
I
|
I
G
|
G
P
 
A
F
x
W
N
 
N
F
 
Y
P
 
P
M
 
I
H
 
Q
L
 
I
A
 
A
N
 
L
G
 
W
H
 
K
I
 
S
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
M
V
 
I
F
 
F
K
|
K
P
 
P
S
|
S
E
|
E
K
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
L
C
 
T
G
 
A
Q
 
L
L
 
K
M
 
L
G
 
A
E
 
E
L
 
I
W
 
Y
R
 
R
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
D
 
D
H
 
G
V
 
V
L
 
F
T
 
N
I
 
V
V
 
L
I
 
P
G
 
G
-
 
I
G
|
G
G
 
A
E
 
E
A
 
T
G
|
G
E
 
Q
A
 
Y
L
 
L
V
 
T
R
 
E
H
 
H
E
 
P
A
 
D
L
 
I
D
 
A
G
 
K
V
 
I
L
 
S
F
|
F
T
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
Q
 
A
A
x
S
G
 
G
R
 
K
A
 
K
I
 
V
H
 
M
R
 
A
A
 
N
L
 
S
A
 
A
D
 
A
A
 
S
P
 
S
H
 
L
K
 
K
I
 
E
L
 
V
A
 
T
L
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
A
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
V
 
I
W
 
A
D
 
E
V
 
D
A
 
A
D
 
N
I
 
L
E
 
D
A
 
L
A
 
A
A
 
A
H
 
D
L
 
I
I
 
A
V
 
M
Q
 
M
S
 
A
A
 
N
Y
 
F
V
 
Y
T
 
S
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
C
 
C
T
 
T
C
 
N
A
 
G
R
 
T
R
 
R
L
 
V
I
 
F
L
 
V
P
 
P
E
 
-
G
 
-
A
 
A
R
 
K
G
 
F
D
 
K
A
 
A
L
 
E
L
 
F
E
 
E
-
 
H
A
 
K
L
 
I
T
 
L
M
 
E
L
 
R
M
 
V
D
 
G
R
 
R
L
 
I
V
 
R
I
 
A
G
 
G
G
 
D
P
 
L
F
 
F
Q
 
A
S
 
D
P
 
D
A
 
T
P
 
N
F
 
F
M
 
-
G
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
V
D
 
S
A
 
F
H
 
P
A
 
H
A
 
R
A
 
Q
Q
 
N
V
 
V
L
 
L
A
 
R
A
 
Y
Q
 
I
D
 
E
R
 
S
M
 
G
T
 
K
A
 
S
D
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
R
P
 
L
L
 
L
R
 
C
L
 
G
A
 
G
A
 
D
V
 
V
R
 
L
E
 
K
A
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
F
-
 
D
R
 
N
S
 
G
A
 
A
L
 
W
L
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
T
L
 
V
I
 
F
E
 
T
-
 
D
-
 
C
L
 
T
T
 
D
D
 
D
A
 
M
P
 
T
L
 
I
R
 
V
D
 
R
E
 
E
E
 
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
M
Q
 
S
V
 
I
R
 
L
R
 
S
A
 
Y
A
 
D
D
 
D
F
 
E
D
 
A
A
 
E
A
 
V
L
 
I
A
 
R
L
 
R
A
 
A
N
 
N
A
 
A
T
 
T
R
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
V
S
 
T
D
 
P
D
 
D
E
 
L
A
 
N
L
 
R
Y
 
A
R
 
H
R
 
R
F
 
I
W
 
I
T
 
H
S
 
Q
V
 
L
R
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
C
N
 
-
W
 
W
N
 
I
R
 
N
P
 
S
T
 
W
T
 
G
G
 
E
A
 
S
S
 
P
S
 
A
A
 
E
A
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
G
 
K
G
 
H
S
 
S
G
 
G
N
 
I
H
 
G
R
 
R
P
 
E
S
 
N
A
 
G
Y
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
V
 
V
A
 
M
G
 
T
L
 
L
E
 
Q
S
 
S
P
 
Y
S
 
T
P
 
Q
V
 
V
Y
 
K
R
 
S
L
 
I
P
 
Q
I
 
V
G
 
E
L
 
M
N
 
G
P
 
P

Query Sequence

>CCNA_00618 CCNA_00618 succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase
MSASRLISRDPYTGEAIADFAVNDARSIDAACHSARAAFAEWAMTPLAERRAIALRFAET
VRARREEIATLIARETGKPMWEALTEADSVAAKVAISIRAQDERAGERSEPMADATARLA
HRPHGVLAVIGPFNFPMHLANGHIVPALLAGNAVVFKPSEKTPACGQLMGELWRAAGLPD
HVLTIVIGGGEAGEALVRHEALDGVLFTGGVQAGRAIHRALADAPHKILALELGGNAPLV
VWDVADIEAAAHLIVQSAYVTAGQRCTCARRLILPEGARGDALLEALTMLMDRLVIGGPF
QSPAPFMGPVIDAHAAAQVLAAQDRMTADGGRPLRLAAVREARSALLSPGLIELTDAPLR
DEEIFGPLLQVRRAADFDAALALANATRFGLAAGLISDDEALYRRFWTSVRAGIVNWNRP
TTGASSAAPFGGVGGSGNHRPSAYYAADYSAYPVAGLESPSPVYRLPIGLNP

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory