SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CCNA_00651 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_00651 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3lxdA Crystal structure of ferredoxin reductase arr from novosphingobium aromaticivorans (see paper)
37% identity, 31% coverage: 36:287/822 of query aligns to 31:283/409 of 3lxdA

query
sites
3lxdA
V
 
V
T
 
L
I
 
V
F
 
I
G
 
G
A
x
R
E
|
E
P
 
P
R
 
E
V
 
I
N
 
P
Y
 
Y
N
 
E
R
|
R
I
x
P
M
 
P
L
 
L
S
|
S
P
x
K
-
 
E
V
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
R
E
 
E
K
 
K
A
 
T
F
 
F
E
 
E
D
 
R
I
 
I
V
 
C
I
 
I
N
 
R
D
 
P
E
 
A
A
 
Q
W
 
F
Y
 
W
R
 
E
D
 
D
N
 
K
G
 
A
I
 
V
T
 
E
L
 
M
H
 
K
A
 
L
G
 
G
R
 
A
A
x
E
V
|
V
T
 
V
A
 
S
I
 
L
D
 
D
L
 
P
A
 
A
A
 
A
R
 
H
K
 
T
V
 
V
F
 
K
A
 
L
E
 
G
G
 
D
G
 
G
L
 
S
E
 
A
I
 
I
G
 
E
Y
 
Y
D
 
G
K
 
K
L
 
L
I
 
I
L
 
W
A
 
A
T
|
T
G
 
G
S
 
G
D
 
D
P
 
P
F
 
R
R
 
R
L
 
L
P
 
S
L
 
C
P
 
V
G
 
G
G
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
H
T
 
A
F
 
V
R
 
R
D
 
T
L
 
K
D
 
E
D
 
D
V
 
A
N
 
D
A
 
R
M
 
L
L
 
M
A
 
A
A
 
E
S
 
L
A
 
D
E
 
A
P
 
G
D
 
A
A
 
K
R
 
N
A
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
L
x
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
A
G
 
V
L
 
L
A
 
T
R
 
K
R
 
F
G
 
G
M
 
V
A
 
N
A
 
V
T
 
T
V
 
L
V
 
L
H
 
E
L
 
A
M
 
L
D
 
P
V
 
R
L
 
V
M
 
L
E
 
A
R
 
R
Q
 
V
L
 
A
D
 
G
E
 
E
S
 
A
A
 
L
G
 
S
Y
 
E
L
 
F
L
 
Y
R
 
Q
E
 
A
A
 
E
L
 
H
A
 
R
D
 
A
R
 
H
G
 
G
V
 
V
E
 
D
T
 
L
V
 
R
L
 
T
G
 
G
A
 
A
H
 
A
S
 
M
E
 
D
E
 
C
I
 
I
V
 
E
G
 
G
A
 
D
D
 
G
G
 
T
Q
 
K
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
V
K
 
R
L
 
M
K
 
Q
D
 
D
G
 
G
R
 
S
V
 
V
L
 
I
P
 
P
C
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
V
V
 
I
M
 
V
A
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
I
R
 
V
P
 
P
N
 
C
T
 
V
T
 
G
L
 
A
A
 
L
K
 
I
A
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
A
T
 
S
V
 
G
N
 
G
R
 
N
G
 
G
V
 
V
A
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
E
A
 
F
M
 
C
R
 
R
T
 
T
S
 
S
D
 
L
P
 
T
D
 
D
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
V
 
I
G
|
G
E
x
D
C
 
C
V
 
A
E
 
A
H
 
H

Sites not aligning to the query:

6pfzA Structure of a NAD-dependent persulfide reductase from a. Fulgidus (see paper)
32% identity, 33% coverage: 67:336/822 of query aligns to 66:346/541 of 6pfzA

query
sites
6pfzA
I
 
V
N
 
R
D
 
D
E
 
E
A
 
A
W
 
Y
Y
 
F
R
 
K
D
 
K
-
 
L
N
x
K
G
 
N
I
 
I
T
 
D
L
 
V
H
 
L
A
 
T
G
 
E
R
 
T
A
 
V
V
x
A
T
 
T
A
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
R
A
 
S
A
 
R
R
 
K
-
 
T
-
 
V
K
 
K
V
 
I
F
 
V
A
 
R
E
 
N
G
 
G
G
 
S
L
 
E
-
 
D
E
 
E
I
 
L
G
 
N
Y
 
Y
D
 
D
K
 
Y
L
 
L
I
 
V
L
 
I
A
|
A
T
|
T
G
|
G
S
 
A
D
 
R
P
 
P
F
 
A
R
 
K
L
 
P
P
 
P
L
 
I
P
 
E
G
 
G
G
 
I
D
 
E
L
 
A
K
 
E
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
T
F
x
L
R
 
T
D
 
S
L
 
A
D
 
E
D
 
E
V
 
A
N
 
E
A
 
K
M
 
I
L
 
I
A
 
E
A
 
M
S
 
W
A
 
E
E
 
E
P
 
G
D
 
A
A
 
E
R
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
 
F
L
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
S
A
 
A
Y
 
E
G
 
A
L
 
L
A
 
K
R
 
N
R
 
L
G
 
D
M
 
M
A
 
E
A
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
I
H
 
E
L
 
M
M
 
M
D
 
D
V
 
R
L
 
V
M
 
A
E
 
P
R
 
A
Q
 
M
L
 
L
D
 
D
E
 
R
S
 
E
A
 
M
G
 
A
Y
 
V
L
 
L
L
 
V
R
 
E
E
 
N
A
 
H
L
 
L
A
 
R
D
 
E
R
 
K
G
 
G
V
 
V
E
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
T
G
 
S
A
 
T
H
 
R
S
 
V
E
 
E
E
 
K
I
 
I
V
 
V
G
 
S
A
 
Q
D
 
D
G
 
D
Q
 
K
V
 
V
T
 
R
G
 
A
L
 
V
K
 
-
L
 
I
K
 
A
D
 
N
G
 
G
R
 
K
V
 
E
L
 
Y
P
 
P
C
 
A
D
 
D
L
 
V
L
 
V
V
 
V
M
 
V
A
 
A
V
 
T
G
 
G
I
 
I
R
 
K
P
 
P
N
 
N
T
 
S
T
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
K
V
 
I
N
 
G
R
 
E
-
 
T
-
 
G
G
 
A
V
 
I
A
 
W
V
 
V
D
 
D
D
 
E
A
 
Y
M
 
M
R
 
R
T
 
T
S
 
S
D
 
D
P
 
E
D
 
S
V
 
I
F
 
Y
A
 
A
V
 
G
G
|
G
E
x
D
C
 
C
V
 
V
E
 
E
H
 
T
R
 
T
G
 
C
Q
 
L
C
 
V
Y
 
T
G
 
G
-
 
K
-
 
K
L
 
I
V
 
I
A
 
A
P
|
P
I
x
F
W
x
G
E
x
D
M
 
V
C
 
A
-
 
N
-
 
K
-
 
Q
-
 
G
R
|
R
A
 
V
L
 
I
A
 
G
Q
 
E
A
 
N
L
 
I
T
 
T
D
 
G
G
 
G
E
 
R
G
 
A
A
 
V
Y
 
F
Q
 
P
G
 
G
S
 
V
V
 
I
L
 
R
S
x
T
T
 
A
R
 
I
L
 
F
K
 
K
V
 
V
S
 
F
G
 
D
V
 
F
D
 
T
V
 
A
F
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q8U1K9 NAD(P)H:rubredoxin oxidoreductase; NROR; Rubredoxin--NAD(P)(+) reductase; EC 1.18.1.4 from Pyrococcus furiosus (strain ATCC 43587 / DSM 3638 / JCM 8422 / Vc1)
31% identity, 45% coverage: 8:375/822 of query aligns to 1:343/359 of Q8U1K9

query
sites
Q8U1K9
L
 
M
R
 
K
L
 
V
V
 
V
V
 
I
I
 
V
G
 
G
N
 
N
G
 
G
M
 
P
A
x
G
G
 
G
C
 
F
R
 
-
A
 
-
V
 
-
E
 
-
E
 
E
V
 
L
L
 
A
K
 
K
R
 
Q
D
 
L
P
 
S
D
 
Q
R
 
T
Y
 
Y
A
 
E
V
 
V
T
 
T
I
 
V
F
 
I
G
x
D
A
x
K
E
 
E
P
 
P
R
 
V
V
 
P
N
 
Y
Y
 
Y
N
 
S
R
x
K
I
x
P
M
 
M
L
 
L
S
 
S
P
 
H
V
 
Y
L
 
I
A
 
A
G
 
G
E
 
F
K
 
I
A
 
P
F
 
R
E
 
N
D
 
R
I
 
L
V
 
F
I
 
P
N
 
Y
D
 
S
E
 
L
A
 
D
W
 
W
Y
 
Y
R
 
R
D
 
K
N
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
E
L
 
I
H
 
R
A
 
L
G
 
A
R
 
E
A
 
E
V
x
A
T
 
K
A
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
R
A
 
G
A
 
R
R
 
K
K
 
V
V
 
V
F
 
I
A
 
T
E
 
E
G
 
K
G
 
G
L
 
-
E
 
E
I
 
V
G
 
P
Y
 
Y
D
 
D
K
 
T
L
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
x
A
D
 
R
P
 
A
F
 
R
R
 
E
L
 
P
P
 
Q
L
 
I
P
 
K
G
 
G
G
 
K
D
 
E
L
 
Y
K
 
-
G
 
-
V
 
L
V
 
L
T
 
T
F
 
L
R
|
R
D
 
T
L
 
I
D
 
F
D
 
D
V
 
A
N
 
D
A
 
R
M
 
-
L
 
I
A
 
K
A
 
E
S
 
S
A
 
I
E
 
E
P
 
N
D
 
S
A
 
G
R
 
E
A
 
A
V
 
I
V
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
F
L
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
L
A
 
A
Y
 
G
G
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
E
R
 
A
G
 
G
M
 
Y
A
 
H
A
 
V
T
 
K
V
 
L
V
 
I
H
 
H
L
 
R
M
 
G
D
 
A
V
 
M
L
 
F
M
 
L
E
 
-
R
 
-
Q
 
G
L
 
L
D
 
D
E
 
E
S
 
E
A
 
L
G
 
S
Y
 
N
L
 
M
L
 
I
R
 
K
E
 
D
A
 
M
L
 
L
A
 
E
D
 
E
R
 
T
G
 
G
V
 
V
E
 
K
T
 
F
V
 
F
L
 
L
G
 
N
A
 
S
H
 
E
S
 
L
E
 
L
E
 
E
I
 
-
V
 
A
G
 
N
A
 
E
D
 
E
G
 
G
Q
 
V
V
 
L
T
 
T
G
 
N
L
 
S
K
 
G
L
 
F
K
 
I
D
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
V
L
 
K
P
 
I
C
 
C
D
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
-
M
 
-
A
 
A
V
 
I
G
 
G
I
 
I
R
 
V
P
 
P
N
 
N
T
 
V
T
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
R
A
 
S
G
 
G
L
 
I
T
 
H
V
 
T
N
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
I
D
 
D
D
 
D
A
 
N
M
 
F
R
 
R
T
 
T
S
 
S
D
 
A
P
 
K
D
 
D
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
V
 
I
G
 
G
E
x
D
C
 
C
V
 
A
E
 
E
H
 
Y
R
 
S
G
 
G
Q
 
I
C
 
I
Y
 
A
G
 
G
L
 
T
V
 
A
A
 
K
P
 
A
I
 
A
W
 
M
E
 
E
M
 
Q
C
 
A
R
 
R
A
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
D
A
 
I
L
 
L
T
 
K
D
 
G
G
 
E
E
 
P
G
 
R
A
 
R
Y
 
Y
Q
 
N
G
 
F
S
 
K
V
 
F
L
 
R
S
 
S
T
 
T
R
 
V
L
 
F
K
 
K
V
 
F
S
 
G
G
 
K
V
 
L
D
 
Q
V
 
I
F
 
A
S
 
I
A
 
I
G
 
G
K
 
N
F
 
T
A
 
K
G
 
G
-
 
E
G
 
G
E
 
K
G
 
W
C
 
I
E
 
E
D
 
D
I
 
-
V
 
-
F
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
V
 
-
Y
 
N
K
 
T
R
 
K
V
 
V
V
 
F
I
 
Y
E
 
E
D
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
V
F
 
F
G
 
N
D
 
D

3kljA Crystal structure of nadh:rubredoxin oxidoreductase from clostridium acetobutylicum (see paper)
27% identity, 45% coverage: 9:379/822 of query aligns to 4:352/378 of 3kljA

query
sites
3kljA
R
 
K
L
 
I
V
 
L
V
 
I
I
x
L
G
|
G
N
 
A
G
|
G
M
x
P
A
|
A
G
 
G
C
 
F
R
 
S
A
 
A
V
 
A
E
 
K
E
 
A
V
 
A
L
 
L
K
 
G
R
 
K
D
 
C
P
 
D
D
 
D
R
 
-
Y
 
-
A
 
-
V
 
I
T
 
T
I
 
M
F
 
I
G
x
N
A
x
S
E
|
E
P
 
K
R
 
Y
V
 
L
N
 
P
Y
 
Y
N
 
Y
R
|
R
I
x
P
M
 
R
L
 
L
S
 
N
P
 
E
V
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
K
E
 
N
K
 
K
A
 
S
F
 
I
E
 
D
D
 
D
I
 
I
V
 
L
I
 
I
N
 
K
D
 
K
E
 
N
A
 
D
W
 
W
Y
 
Y
R
 
E
D
 
K
N
 
N
G
 
N
I
 
I
T
 
K
L
 
V
H
 
I
A
 
T
G
 
S
R
 
E
A
x
F
V
x
A
T
 
T
A
 
S
I
 
I
D
 
D
L
 
P
A
 
N
A
 
N
R
 
K
K
 
L
V
 
V
F
 
T
A
 
L
E
 
K
G
 
S
G
 
G
L
 
E
E
 
K
I
 
I
G
 
K
Y
 
Y
D
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
I
L
 
I
A
 
A
T
x
S
G
|
G
S
 
S
D
 
I
P
 
A
F
 
N
R
 
K
L
 
I
P
 
K
L
 
V
P
 
P
G
 
H
G
 
A
D
 
D
L
 
-
K
 
-
G
 
E
V
 
I
V
 
F
T
 
S
F
x
L
R
x
Y
D
 
S
L
 
Y
D
 
D
D
 
D
V
 
A
N
 
-
A
 
L
M
 
K
L
 
I
A
 
K
A
 
D
S
 
E
A
 
C
E
 
K
P
 
N
D
 
K
A
 
G
R
 
K
A
 
A
V
 
F
V
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
I
L
|
L
G
 
G
L
 
I
E
 
E
A
 
L
A
 
A
Y
 
Q
G
 
A
L
 
I
A
 
I
R
 
D
R
 
S
G
 
G
M
 
T
A
 
P
A
 
A
T
 
S
V
 
I
V
 
G
H
 
I
L
 
I
M
 
L
D
 
E
V
 
Y
L
 
P
M
 
L
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
E
 
R
S
 
D
A
 
G
G
 
G
Y
 
L
L
 
F
L
 
L
R
 
K
E
 
D
A
 
K
L
 
L
A
 
D
D
 
R
R
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
K
T
 
I
V
 
Y
L
 
T
G
 
N
A
 
S
H
 
N
S
 
F
E
 
E
E
 
E
I
 
M
V
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
Q
 
-
V
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
G
R
 
D
V
 
L
L
 
I
P
 
R
C
 
S
D
 
S
L
 
C
L
 
V
V
 
I
M
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
V
R
 
K
P
 
P
N
 
N
T
 
L
T
 
D
L
 
F
A
 
I
K
 
K
A
 
D
A
 
T
G
 
E
L
 
I
T
 
A
V
 
S
N
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
D
 
N
D
 
D
A
 
H
M
 
M
R
 
E
T
 
T
S
 
S
D
 
I
P
 
K
D
 
D
V
 
I
F
 
Y
A
 
A
V
 
C
G
|
G
E
x
D
C
 
V
V
 
A
E
 
E
H
 
F
R
 
Y
G
 
G
Q
 
K
C
 
N
Y
 
P
G
|
G
L
|
L
V
x
I
A
 
N
P
 
I
I
x
A
W
x
N
E
 
K
M
 
Q
C
 
G
R
 
E
A
 
V
L
 
A
A
 
G
Q
 
L
A
 
N
L
 
A
T
 
C
D
 
G
G
 
E
E
 
D
G
 
A
A
 
S
Y
 
Y
Q
 
S
G
 
E
S
 
I
V
 
I
L
 
P
S
 
S
T
 
P
R
 
I
L
 
L
K
|
K
V
 
V
S
 
S
G
 
G
V
 
I
D
 
S
V
 
I
F
 
I
S
 
S
A
 
C
G
 
G
K
 
D
F
 
I
A
 
E
G
 
N
G
 
N
E
 
K
G
 
P
C
 
S
E
 
K
D
 
-
I
 
-
V
 
V
F
 
F
R
 
R
D
 
S
A
 
T
A
 
Q
R
 
E
G
 
D
V
 
K
Y
 
Y
K
 
I
R
 
V
V
 
C
V
 
M
I
 
L
E
 
K
D
 
E
G
 
N
K
 
K
V
 
I
A
 
D
G
 
A
A
 
A
V
 
A
L
 
V
F
 
I
G
 
G
D
 
D
A
 
V
A
 
S
D
 
L
G
 
G

Q9AL95 NADH-rubredoxin oxidoreductase; NROR; NADH:rubredoxin oxidoreductase; EC 1.18.1.1 from Clostridium acetobutylicum (strain ATCC 824 / DSM 792 / JCM 1419 / LMG 5710 / VKM B-1787) (see paper)
27% identity, 45% coverage: 9:379/822 of query aligns to 5:353/379 of Q9AL95

query
sites
Q9AL95
R
 
K
L
 
I
V
 
L
V
 
I
I
 
L
G
 
G
N
 
A
G
 
G
M
 
P
A
 
A
G
 
G
C
 
F
R
 
S
A
 
A
V
 
A
E
 
K
E
 
A
V
 
A
L
 
L
K
 
G
R
 
K
D
x
C
P
 
D
D
 
D
R
 
-
Y
 
-
A
 
-
V
 
I
T
 
T
I
 
M
F
 
I
G
x
N
A
x
S
E
|
E
P
 
K
R
 
Y
V
 
L
N
 
P
Y
 
Y
N
 
Y
R
|
R
I
 
P
M
 
R
L
 
L
S
 
N
P
 
E
V
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
K
E
 
N
K
 
K
A
 
S
F
 
I
E
 
D
D
 
D
I
 
I
V
 
L
I
 
I
N
 
K
D
 
K
E
 
N
A
 
D
W
 
W
Y
 
Y
R
 
E
D
 
K
N
 
N
G
 
N
I
 
I
T
 
K
L
 
V
H
 
I
A
 
T
G
 
S
R
 
E
A
 
F
V
x
A
T
 
T
A
 
S
I
 
I
D
 
D
L
 
P
A
 
N
A
 
N
R
 
K
K
 
L
V
 
V
F
 
T
A
 
L
E
 
K
G
 
S
G
 
G
L
 
E
E
 
K
I
 
I
G
 
K
Y
 
Y
D
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
I
L
 
I
A
 
A
T
 
S
G
 
G
S
 
S
D
 
I
P
 
A
F
 
N
R
 
K
L
 
I
P
 
K
L
 
V
P
 
P
G
 
H
G
 
A
D
 
D
L
 
-
K
 
-
G
 
E
V
 
I
V
 
F
T
 
S
F
 
L
R
x
Y
D
 
S
L
 
Y
D
 
D
D
 
D
V
 
A
N
 
-
A
 
L
M
 
K
L
 
I
A
 
K
A
 
D
S
 
E
A
x
C
E
 
K
P
 
N
D
 
K
A
 
G
R
 
K
A
 
A
V
 
F
V
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
I
E
 
E
A
 
L
A
 
A
Y
 
Q
G
 
A
L
 
I
A
 
I
R
 
D
R
 
S
G
 
G
M
 
T
A
 
P
A
 
A
T
 
S
V
 
I
V
 
G
H
 
I
L
 
I
M
 
L
D
 
E
V
 
Y
L
 
P
M
 
L
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
E
 
R
S
 
D
A
 
G
G
 
G
Y
 
L
L
 
F
L
 
L
R
 
K
E
 
D
A
 
K
L
 
L
A
 
D
D
 
R
R
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
K
T
 
I
V
 
Y
L
 
T
G
 
N
A
 
S
H
 
N
S
 
F
E
 
E
E
 
E
I
 
M
V
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
Q
 
-
V
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
G
R
 
D
V
 
L
L
 
I
P
 
R
C
 
S
D
 
S
L
x
C
L
 
V
V
 
I
M
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
V
R
 
K
P
 
P
N
 
N
T
 
L
T
 
D
L
 
F
A
 
I
K
 
K
A
 
D
A
 
T
G
 
E
L
 
I
T
 
A
V
 
S
N
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
D
 
N
D
 
D
A
 
H
M
 
M
R
 
E
T
 
T
S
 
S
D
 
I
P
 
K
D
 
D
V
 
I
F
 
Y
A
 
A
V
 
C
G
 
G
E
x
D
C
 
V
V
 
A
E
 
E
H
 
F
R
 
Y
G
 
G
Q
 
K
C
 
N
Y
 
P
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
N
P
 
I
I
 
A
W
 
N
E
 
K
M
 
Q
C
 
G
R
 
E
A
 
V
L
 
A
A
 
G
Q
 
L
A
 
N
L
 
A
T
x
C
D
 
G
G
 
E
E
 
D
G
 
A
A
 
S
Y
 
Y
Q
 
S
G
 
E
S
 
I
V
 
I
L
 
P
S
 
S
T
 
P
R
 
I
L
 
L
K
 
K
V
 
V
S
 
S
G
 
G
V
 
I
D
 
S
V
 
I
F
 
I
S
 
S
A
 
C
G
 
G
K
 
D
F
 
I
A
 
E
G
 
N
G
 
N
E
 
K
G
 
P
C
 
S
E
 
K
D
 
-
I
 
-
V
 
V
F
 
F
R
 
R
D
 
S
A
 
T
A
 
Q
R
 
E
G
 
D
V
 
K
Y
 
Y
K
 
I
R
 
V
V
 
C
V
 
M
I
 
L
E
 
K
D
 
E
G
 
N
K
 
K
V
 
I
A
 
D
G
 
A
A
 
A
V
 
A
L
 
V
F
 
I
G
 
G
D
 
D
A
 
V
A
 
S
D
 
L
G
 
G

Q9HTK9 Rubredoxin-NAD(+) reductase; RdxR; EC 1.18.1.1 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
34% identity, 38% coverage: 1:309/822 of query aligns to 1:303/384 of Q9HTK9

query
sites
Q9HTK9
M
 
M
T
 
S
Q
 
E
A
 
R
T
 
A
P
 
P
K
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
L
V
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
N
x
T
G
|
G
M
x
L
A
|
A
G
 
G
C
 
Y
R
 
N
A
 
L
V
 
A
E
 
R
E
 
E
V
 
W
L
 
R
K
 
K
R
 
L
D
 
D
P
 
G
D
 
E
R
 
T
Y
 
P
A
 
L
V
 
L
T
 
M
I
 
I
F
x
T
G
x
A
A
 
D
E
 
D
P
 
G
R
 
R
V
 
-
N
 
S
Y
 
Y
N
 
S
R
x
K
I
 
P
M
 
M
L
 
L
S
 
S
P
 
T
V
 
G
L
 
F
A
 
S
G
 
K
E
 
N
K
 
K
A
 
D
F
 
A
E
 
D
D
 
G
I
 
L
V
 
A
I
 
M
N
 
A
D
 
E
E
 
P
A
 
G
W
 
A
Y
 
M
R
 
A
D
 
E
-
 
Q
-
 
L
N
 
N
G
 
A
I
 
R
T
 
I
L
 
L
H
 
T
A
 
H
G
 
T
R
 
R
A
 
-
V
|
V
T
 
T
A
 
G
I
 
I
D
 
D
L
 
P
A
 
G
A
 
H
R
 
Q
K
 
R
V
 
I
F
 
W
A
 
I
E
 
-
G
 
G
G
 
E
L
 
E
E
 
E
I
 
V
G
 
R
Y
 
Y
D
 
R
K
 
D
L
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
W
G
 
G
S
 
A
D
 
E
P
 
P
F
 
I
R
 
R
L
 
V
P
 
P
L
 
V
P
 
E
G
 
G
G
 
D
D
 
A
L
 
Q
K
 
D
G
 
A
V
 
L
V
 
Y
T
 
P
F
 
I
R
 
N
D
 
D
L
 
L
D
 
E
D
 
D
V
 
Y
N
 
-
A
 
A
M
 
R
L
 
F
A
 
R
A
 
Q
S
 
A
A
 
A
E
 
A
P
 
G
D
 
K
A
 
R
R
 
R
A
 
V
V
 
L
V
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
C
E
|
E
A
 
F
A
 
A
Y
 
N
G
 
D
L
 
L
A
 
S
R
 
S
R
 
G
G
 
G
M
 
Y
A
 
Q
A
 
L
T
 
D
V
 
V
V
 
V
H
 
A
L
 
P
M
 
C
D
 
E
V
 
Q
L
 
V
M
 
M
E
 
P
R
 
G
Q
 
L
L
 
L
D
 
H
E
 
P
S
 
A
A
 
A
G
 
A
Y
 
K
L
 
A
L
 
V
R
 
Q
E
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
E
D
 
G
R
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
R
T
 
F
V
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
P
H
 
V
S
 
L
E
 
A
E
 
S
I
 
L
V
 
K
G
 
K
A
 
A
D
 
-
G
 
G
Q
 
E
V
 
G
T
 
L
G
 
E
L
 
A
K
 
H
L
 
L
K
 
S
D
 
D
G
 
G
R
 
E
V
 
V
L
 
I
P
 
P
C
 
C
D
 
D
L
 
L
L
 
V
V
 
V
M
 
S
A
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
L
R
 
R
P
 
P
N
 
R
T
 
T
T
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
A
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
V
 
I
A
 
V
V
 
V
D
 
D
D
 
R
A
 
S
M
 
L
R
 
R
T
 
T
S
 
S
D
 
H
P
 
A
D
 
N
V
 
I
F
 
Y
A
 
A
V
 
L
G
 
G
E
x
D
C
 
C
V
 
A
E
 
E
H
 
V
R
 
D
G
 
G
Q
 
L
C
 
N
Y
 
L
G
 
L
L
 
Y
V
|
V
A
 
M
P
 
P
I
 
L
W
 
M
E
 
A
M
 
C
C
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
T
L
 
L

Sites not aligning to the query:

2v3aA Crystal structure of rubredoxin reductase from pseudomonas aeruginosa. (see paper)
34% identity, 36% coverage: 10:309/822 of query aligns to 4:300/381 of 2v3aA

query
sites
2v3aA
L
 
L
V
 
V
V
 
I
I
|
I
G
|
G
N
x
T
G
|
G
M
x
L
A
|
A
G
 
G
C
 
Y
R
 
N
A
 
L
V
 
A
E
 
R
E
 
E
V
 
W
L
 
R
K
 
K
R
 
L
D
 
D
P
 
G
D
 
E
R
 
T
Y
 
P
A
 
L
V
 
L
T
 
M
I
 
I
F
x
T
G
x
A
A
x
D
E
 
D
P
 
G
R
 
R
V
 
-
N
 
S
Y
 
Y
N
 
S
R
x
K
I
x
P
M
 
M
L
 
L
S
 
S
P
 
T
V
 
G
L
 
F
A
 
S
G
 
K
E
 
N
K
 
K
A
 
D
F
 
A
E
 
D
D
 
G
I
 
L
V
 
A
I
 
M
N
 
A
D
 
E
E
 
P
A
 
G
W
 
A
Y
 
M
R
 
A
D
 
E
-
 
Q
-
 
L
N
 
N
G
 
A
I
 
R
T
 
I
L
 
L
H
 
T
A
 
H
G
 
T
R
|
R
A
 
-
V
|
V
T
 
T
A
 
G
I
 
I
D
 
D
L
 
P
A
 
G
A
 
H
R
 
Q
K
 
R
V
 
I
F
 
W
A
 
I
E
 
-
G
 
G
G
 
E
L
 
E
E
 
E
I
 
V
G
 
R
Y
 
Y
D
 
R
K
 
D
L
 
L
I
 
V
L
 
L
A
|
A
T
x
W
G
|
G
S
 
A
D
 
E
P
 
P
F
 
I
R
 
R
L
 
V
P
 
P
L
 
V
P
 
E
G
 
G
G
 
D
D
 
A
L
 
Q
K
 
D
G
 
A
V
 
L
V
 
Y
T
 
P
F
 
I
R
 
N
D
 
D
L
 
L
D
 
E
D
 
D
V
 
Y
N
 
-
A
 
A
M
 
R
L
 
F
A
 
R
A
 
Q
S
 
A
A
 
A
E
 
A
P
 
G
D
 
K
A
 
R
R
 
R
A
 
V
V
 
L
V
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
 
L
L
x
I
G
 
G
L
 
C
E
 
E
A
x
F
A
 
A
Y
 
N
G
 
D
L
 
L
A
 
S
R
 
S
R
 
G
G
 
G
M
 
Y
A
 
Q
A
 
L
T
 
D
V
 
V
V
 
V
H
 
A
L
 
P
M
 
C
D
 
E
V
 
Q
L
 
V
M
 
M
E
 
P
R
 
G
Q
 
L
L
 
L
D
 
H
E
 
P
S
 
A
A
 
A
G
 
A
Y
 
K
L
 
A
L
 
V
R
 
Q
E
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
E
D
 
G
R
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
R
T
 
F
V
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
P
H
 
V
S
 
L
E
 
A
E
 
S
I
 
L
V
 
K
G
 
K
A
 
A
D
 
-
G
 
G
Q
 
E
V
 
G
T
 
L
G
 
E
L
 
A
K
 
H
L
 
L
K
 
S
D
 
D
G
 
G
R
 
E
V
 
V
L
 
I
P
 
P
C
 
C
D
 
D
L
 
L
L
 
V
V
 
V
M
 
S
A
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
L
R
 
R
P
 
P
N
 
R
T
 
T
T
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
A
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
V
 
I
A
 
V
V
 
V
D
 
D
D
 
R
A
 
S
M
 
L
R
 
R
T
 
T
S
 
S
D
 
H
P
 
A
D
 
N
V
 
I
F
 
Y
A
 
A
V
 
L
G
 
G
E
x
D
C
 
C
V
 
A
E
 
E
H
 
V
R
 
D
G
 
G
Q
 
L
C
 
N
Y
 
L
G
x
L
L
x
Y
V
|
V
A
 
M
P
 
P
I
 
L
W
x
M
E
 
A
M
 
C
C
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
T
L
 
L

Sites not aligning to the query:

8c0zE Cryoem structure of a tungsten-containing aldehyde oxidoreductase from aromatoleum aromaticum (see paper)
31% identity, 45% coverage: 8:374/822 of query aligns to 1:376/424 of 8c0zE

query
sites
8c0zE
L
 
M
R
 
K
L
 
H
V
 
V
V
 
I
I
 
L
G
|
G
N
 
N
G
 
G
M
x
P
A
 
A
G
 
G
C
 
V
R
 
I
A
 
A
V
 
A
E
 
E
E
 
-
V
 
T
L
 
L
K
 
R
R
 
R
D
 
A
P
 
A
D
 
P
R
 
T
Y
 
D
A
 
D
V
 
I
T
 
L
I
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
S
E
 
E
P
 
D
R
 
A
V
 
P
N
 
P
Y
 
Y
N
 
S
R
|
R
I
x
M
M
 
A
L
 
I
S
x
P
P
 
Y
V
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
G
E
 
N
K
 
I
A
 
D
F
 
E
E
 
S
D
 
G
I
 
T
V
 
W
I
 
L
N
 
R
D
 
K
E
 
S
A
 
P
W
 
G
Y
 
H
R
 
F
D
 
D
N
 
R
G
 
-
I
 
L
T
 
R
L
 
I
H
 
H
A
 
E
-
 
M
-
 
R
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
V
T
 
S
A
 
L
I
 
D
D
 
S
L
 
E
A
 
R
A
 
R
R
 
R
K
 
I
V
 
L
F
 
F
A
 
D
E
 
D
G
 
G
G
 
H
L
 
F
E
 
E
I
 
-
G
 
S
Y
 
W
D
 
D
K
 
R
L
 
L
I
 
L
L
 
I
A
 
A
T
|
T
G
 
G
S
 
S
D
 
H
P
 
P
F
 
V
R
 
R
L
 
P
P
 
P
L
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
I
D
 
D
L
 
L
K
 
P
G
 
E
V
 
V
V
 
Q
T
 
T
F
 
C
R
x
W
D
 
T
L
 
L
D
 
E
D
 
D
V
 
A
N
 
R
A
 
A
M
 
-
L
 
I
A
 
A
A
 
R
S
 
F
A
 
A
E
 
T
P
 
P
D
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
V
V
 
L
V
 
Q
I
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
x
F
L
 
I
G
 
G
L
 
C
E
 
I
A
 
I
A
 
M
Y
 
E
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
A
R
 
R
G
 
G
M
 
V
A
 
E
A
 
L
T
 
T
V
 
V
V
 
V
H
 
E
L
 
M
M
 
G
D
 
D
V
 
R
L
 
M
M
 
V
E
 
P
R
 
R
Q
 
M
L
 
M
D
 
T
E
 
P
S
 
T
A
 
A
G
 
G
Y
 
G
L
 
M
L
 
I
R
 
R
E
 
K
A
 
W
L
 
V
A
 
E
D
 
D
R
 
Q
G
 
G
V
 
V
E
 
R
T
 
V
V
 
V
L
 
T
G
 
N
A
 
A
H
 
G
S
 
V
E
 
S
E
 
R
I
 
I
-
 
D
-
 
C
V
 
R
G
 
A
A
 
S
D
 
N
G
 
D
Q
 
A
V
 
P
T
 
L
G
 
D
L
 
V
K
 
T
L
 
L
K
 
S
D
 
T
G
 
G
R
 
E
V
 
V
L
 
V
P
 
V
C
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
V
V
 
I
M
 
V
A
 
A
V
 
A
G
 
G
I
 
V
R
 
A
P
 
P
N
 
N
T
 
I
T
 
A
L
 
F
A
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
T
G
 
P
L
 
V
T
 
H
V
 
V
N
 
A
R
 
K
G
 
G
V
 
V
A
 
L
V
 
V
D
 
D
D
 
D
A
 
R
M
 
L
R
 
Q
T
 
T
S
 
S
D
 
V
P
 
P
D
 
G
V
 
I
F
 
F
A
 
A
V
 
A
G
 
G
E
x
D
C
 
V
V
 
A
E
 
E
H
 
A
R
 
P
G
 
D
Q
 
L
C
 
F
Y
 
T
G
 
G
-
 
A
-
 
H
L
 
L
V
 
V
A
 
A
P
 
A
I
 
I
W
 
Q
-
 
P
-
 
N
-
 
A
-
 
A
E
 
D
M
 
Q
C
 
A
R
 
R
A
 
V
L
 
A
A
 
A
Q
 
L
A
 
N
L
 
M
T
 
A
D
 
G
G
 
H
E
 
E
G
 
A
A
 
R
Y
 
L
Q
 
K
G
 
G
S
 
V
V
 
L
L
 
A
S
 
I
T
 
N
R
 
V
L
 
L
K
 
D
V
 
T
S
 
L
G
 
G
V
 
L
D
 
I
V
 
S
F
 
S
S
 
S
A
 
F
G
 
G
K
 
Q
F
 
W
-
 
W
-
 
G
-
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
E
A
 
R
G
 
G
G
 
G
E
 
A
G
 
G
C
 
V
E
 
E
D
 
H
I
 
V
V
 
-
F
 
-
R
 
-
D
 
D
A
 
E
A
 
A
R
 
A
G
 
Y
V
 
R
Y
 
Y
K
 
L
R
 
S
V
 
L
V
 
Q
I
 
F
E
 
K
D
 
D
G
 
D
K
 
V
V
 
L
A
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
T
L
 
S
F
 
I
G
 
G

8a56B Coenzyme a-persulfide reductase (coapr) from enterococcus faecalis (see paper)
29% identity, 40% coverage: 9:336/822 of query aligns to 2:338/539 of 8a56B

query
sites
8a56B
R
 
K
L
 
I
V
 
V
V
 
I
I
|
I
G
|
G
N
 
-
G
 
G
M
x
V
A
 
A
G
|
G
C
 
G
R
 
M
A
 
S
V
 
A
E
 
A
E
x
T
V
x
R
L
 
L
K
 
R
R
|
R
D
 
L
P
 
M
D
 
E
R
 
D
Y
 
A
A
 
E
V
 
I
T
 
V
I
 
V
F
 
M
G
x
E
A
x
K
E
 
G
P
 
P
R
 
F
V
 
V
N
 
S
Y
 
F
N
 
A
R
 
N
I
x
C
M
 
G
L
 
L
S
 
P
P
 
Y
V
 
Y
L
 
V
A
 
S
G
 
G
E
 
E
K
 
I
A
 
A
F
 
E
E
 
R
D
 
E
-
 
Q
-
 
L
I
 
L
V
 
V
I
 
Q
N
 
T
D
 
P
E
 
E
A
 
A
W
 
L
Y
 
K
R
 
A
D
 
R
N
x
F
G
 
N
I
 
L
T
 
D
L
 
V
H
 
R
A
 
P
G
 
H
R
 
H
A
 
E
V
|
V
T
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
L
 
P
A
 
I
A
 
E
R
 
K
K
 
V
V
 
I
F
 
T
A
 
V
E
 
K
G
 
H
G
 
E
L
 
T
E
 
E
I
 
I
-
 
L
-
 
T
-
 
E
G
 
H
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
L
 
L
I
 
I
L
 
L
A
x
S
T
x
P
G
|
G
S
 
A
D
 
K
P
 
P
F
 
F
R
 
V
L
 
P
P
 
P
L
 
I
P
 
T
G
 
G
-
 
L
G
 
A
D
 
E
L
 
A
K
 
K
G
 
N
V
 
V
V
 
F
T
 
S
F
 
L
R
 
R
D
 
N
L
 
V
D
 
P
D
 
D
V
 
L
N
 
D
A
 
Q
M
 
I
L
 
M
A
 
T
A
 
A
S
 
L
A
 
T
E
 
P
P
 
E
D
 
T
A
 
K
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
 
F
L
x
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
M
A
 
A
Y
 
E
G
 
N
L
 
L
A
 
Q
R
 
K
R
 
R
G
 
G
M
 
L
A
 
E
A
 
V
T
 
T
V
 
L
V
 
V
H
 
E
L
 
K
M
 
A
D
 
P
V
 
H
L
 
V
M
 
L
E
 
P
R
 
-
Q
 
P
L
 
L
D
 
D
E
 
E
S
 
E
A
 
M
G
 
A
Y
 
A
L
 
F
L
 
V
R
 
K
E
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
S
D
 
K
R
 
N
G
 
N
V
 
V
E
 
Q
T
 
V
V
 
I
L
 
T
G
 
G
A
 
-
H
 
Q
S
 
S
E
 
A
E
 
V
I
 
A
V
 
F
G
 
E
A
 
E
D
 
E
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
T
 
-
G
 
-
L
 
I
K
 
R
L
 
L
K
 
E
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
V
 
T
L
 
L
P
 
A
C
 
S
D
 
D
L
 
L
L
 
T
V
 
I
M
 
L
A
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
V
R
 
Q
P
 
P
N
 
E
T
 
N
T
 
T
L
 
L
A
 
A
K
 
V
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
V
T
 
A
-
 
T
-
 
G
V
 
L
N
 
R
R
 
G
G
 
G
V
 
I
A
 
V
V
 
V
D
 
D
D
 
E
A
 
H
M
 
Y
R
 
Q
T
 
T
S
 
N
D
 
Q
P
 
P
D
 
D
V
 
I
F
 
Y
A
 
A
V
 
V
G
|
G
E
x
D
C
 
A
V
 
I
E
 
V
H
 
V
R
 
K
G
 
Q
Q
 
Q
C
 
I
-
 
T
-
 
Q
-
 
E
-
 
D
-
 
A
-
 
L
Y
 
I
G
x
S
L
|
L
V
x
A
A
 
S
P
 
P
I
 
A
W
 
N
E
 
R
M
 
Q
C
 
G
R
|
R
A
 
Q
L
 
V
A
 
A
Q
 
D
A
 
V
L
 
I
T
 
A
D
 
G
G
 
L
E
 
E
G
 
R
A
 
K
Y
 
N
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
I
L
 
G
S
 
T
T
 
A
R
 
I
L
 
V
K
 
R
V
 
V
S
 
F
G
 
D
V
 
L
D
 
T
V
 
A
F
 
A
S
 
S
A
 
T
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6rvhA Nadh-dependent coenzyme a disulfide reductase soaked with menadione (see paper)
33% identity, 38% coverage: 29:339/822 of query aligns to 23:335/443 of 6rvhA

query
sites
6rvhA
R
|
R
D
 
E
P
 
N
D
 
P
R
 
E
Y
 
L
A
 
E
V
 
V
T
 
V
I
 
V
F
 
Y
G
x
E
A
x
K
E
 
S
P
 
G
R
 
W
V
|
V
N
x
S
Y
|
Y
N
 
G
R
x
A
I
x
C
M
 
G
L
 
L
S
 
P
P
 
Y
V
 
V
L
 
L
A
 
S
G
 
G
E
|
E
-
 
I
K
 
P
A
 
R
F
 
L
E
|
E
D
 
R
I
 
L
V
 
V
I
 
A
N
x
R
D
 
T
E
 
P
A
 
E
W
 
E
Y
 
F
R
 
R
D
 
K
N
 
Q
G
 
G
I
 
V
T
 
L
L
 
V
H
 
H
A
 
T
G
 
R
R
 
H
A
 
E
V
|
V
T
 
V
A
 
D
I
 
V
D
 
D
L
 
Y
A
 
E
A
 
L
R
 
R
K
 
T
V
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
H
-
 
D
F
 
H
A
 
A
E
 
E
G
 
G
-
 
R
G
 
T
L
 
F
E
 
Q
I
 
D
G
 
R
Y
 
F
D
 
D
K
 
H
L
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
A
D
 
R
P
 
P
F
 
S
R
 
L
L
 
P
P
 
P
L
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
Q
K
 
E
G
 
G
V
 
V
V
 
Y
T
 
T
F
 
L
R
|
R
D
 
T
L
 
M
D
 
E
D
 
D
V
 
G
N
 
E
A
 
R
M
 
L
L
 
L
A
 
K
A
 
A
S
 
L
A
 
-
E
 
-
P
 
P
D
 
Q
A
 
A
-
 
R
R
 
R
A
 
A
V
 
A
V
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
x
Y
L
 
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
E
G
 
A
L
 
F
A
 
R
R
 
K
R
 
R
G
 
G
M
 
L
A
 
Q
A
 
V
T
 
T
V
 
L
V
 
L
H
 
E
L
 
A
M
 
K
D
 
D
V
 
R
L
 
P
M
 
L
E
 
P
R
 
-
Q
 
H
L
 
W
D
 
D
E
 
P
S
 
E
A
 
V
G
 
G
Y
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
E
D
 
R
R
 
H
G
 
G
V
 
V
E
 
E
T
 
V
V
 
W
L
 
T
G
 
G
A
 
V
H
 
K
S
 
V
E
 
E
E
 
A
I
 
F
V
 
R
G
 
G
A
 
M
D
 
-
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
T
 
E
G
 
A
L
 
V
K
 
E
L
 
T
K
 
S
D
 
E
G
 
G
R
 
-
V
 
V
L
 
V
P
 
P
C
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
V
V
 
L
M
 
L
A
 
A
V
 
T
G
 
G
I
 
I
R
 
R
P
 
P
N
 
N
T
 
T
T
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
A
 
A
A
 
M
G
 
G
L
 
V
T
 
A
V
 
L
N
 
G
R
 
P
-
 
T
-
 
G
G
 
A
V
 
I
A
 
A
V
 
T
D
 
D
D
 
E
A
 
R
M
 
M
R
 
R
T
 
T
S
 
N
D
 
L
P
 
E
D
 
G
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
V
 
A
G
|
G
E
x
D
C
 
V
V
 
A
E
 
E
H
 
S
R
 
F
G
 
H
Q
 
R
C
 
V
Y
 
-
G
 
-
L
 
L
V
 
K
A
 
R
P
 
P
I
 
Y
W
 
W
E
 
L
M
x
P
C
x
L
R
x
G
A
 
D
L
 
V
A
 
A
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
T
 
-
D
x
N
G
 
K
E
 
H
G
 
G
A
x
R
Y
 
T
Q
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
I
S
 
A
T
 
G
R
 
R
-
 
E
-
 
A
-
 
R
-
 
F
L
 
L
K
 
G
V
 
V
S
 
V
G
 
G
V
 
T
D
 
A
V
 
I
F
 
F
S
 
K
A
 
A
G
 
F
K
 
D
F
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6rvbA Nadh-dependent coenzyme a disulfide reductase soaked with nadh (see paper)
33% identity, 38% coverage: 29:339/822 of query aligns to 23:335/443 of 6rvbA

query
sites
6rvbA
R
|
R
D
 
E
P
 
N
D
 
P
R
 
E
Y
 
L
A
 
E
V
 
V
T
 
V
I
 
V
F
x
Y
G
x
E
A
x
K
E
x
S
P
 
G
R
 
W
V
|
V
N
x
S
Y
|
Y
N
 
G
R
x
A
I
x
C
M
 
G
L
 
L
S
 
P
P
 
Y
V
 
V
L
 
L
A
 
S
G
 
G
E
|
E
-
 
I
K
 
P
A
 
R
F
 
L
E
|
E
D
 
R
I
 
L
V
 
V
I
 
A
N
x
R
D
 
T
E
 
P
A
 
E
W
 
E
Y
 
F
R
 
R
D
 
K
N
 
Q
G
 
G
I
 
V
T
 
L
L
 
V
H
 
H
A
 
T
G
 
R
R
 
H
A
x
E
V
|
V
T
 
V
A
 
D
I
 
V
D
 
D
L
 
Y
A
 
E
A
 
L
R
 
R
K
 
T
V
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
H
-
 
D
F
 
H
A
 
A
E
 
E
G
 
G
-
 
R
G
 
T
L
 
F
E
 
Q
I
 
D
G
 
R
Y
 
F
D
 
D
K
 
H
L
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
A
D
 
R
P
 
P
F
 
S
R
 
L
L
 
P
P
 
P
L
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
Q
K
 
E
G
 
G
V
 
V
V
 
Y
T
 
T
F
x
L
R
|
R
D
 
T
L
 
M
D
 
E
D
 
D
V
 
G
N
 
E
A
 
R
M
 
L
L
 
L
A
 
K
A
 
A
S
 
L
A
 
-
E
 
-
P
 
P
D
 
Q
A
 
A
-
 
R
R
 
R
A
 
A
V
 
A
V
 
I
I
 
L
G
|
G
G
 
A
G
|
G
L
x
Y
L
x
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
E
G
 
A
L
 
F
A
 
R
R
 
K
R
 
R
G
 
G
M
 
L
A
 
Q
A
 
V
T
 
T
V
 
L
V
 
L
H
x
E
L
x
A
M
 
K
D
 
D
V
 
R
L
 
P
M
 
L
E
 
P
R
 
-
Q
 
H
L
 
W
D
 
D
E
 
P
S
 
E
A
 
V
G
 
G
Y
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
E
D
 
R
R
 
H
G
 
G
V
 
V
E
 
E
T
 
V
V
 
W
L
 
T
G
 
G
A
 
V
H
 
K
S
 
V
E
 
E
E
 
A
I
 
F
V
 
R
G
 
G
A
 
M
D
 
-
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
T
 
E
G
 
A
L
 
V
K
 
E
L
 
T
K
 
S
D
 
E
G
 
G
R
 
-
V
 
V
L
 
V
P
 
P
C
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
V
V
 
L
M
 
L
A
|
A
V
x
T
G
|
G
I
 
I
R
 
R
P
 
P
N
 
N
T
 
T
T
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
A
 
A
A
 
M
G
 
G
L
 
V
T
 
A
V
 
L
N
 
G
R
 
P
-
 
T
-
 
G
G
 
A
V
 
I
A
 
A
V
 
T
D
 
D
D
 
E
A
 
R
M
 
M
R
 
R
T
 
T
S
 
N
D
 
L
P
 
E
D
 
G
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
V
 
A
G
|
G
E
x
D
C
 
V
V
 
A
E
 
E
H
 
S
R
 
F
G
 
H
Q
 
R
C
 
V
Y
 
-
G
 
-
L
 
L
V
 
K
A
 
R
P
 
P
I
 
Y
W
 
W
E
 
L
M
x
P
C
x
L
R
x
G
A
 
D
L
 
V
A
 
A
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
T
 
-
D
x
N
G
 
K
E
 
H
G
 
G
A
x
R
Y
 
T
Q
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
I
S
 
A
T
 
G
R
 
R
-
 
E
-
 
A
-
 
R
-
 
F
L
 
L
K
 
G
V
 
V
S
 
V
G
 
G
V
 
T
D
 
A
V
x
I
F
|
F
S
 
K
A
 
A
G
 
F
K
 
D
F
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6ruzA Nadh-dependent coenzyme a disulfide reductase (see paper)
33% identity, 38% coverage: 29:339/822 of query aligns to 23:335/443 of 6ruzA

query
sites
6ruzA
R
|
R
D
 
E
P
 
N
D
 
P
R
 
E
Y
 
L
A
 
E
V
 
V
T
 
V
I
 
V
F
x
Y
G
x
E
A
x
K
E
 
S
P
 
G
R
 
W
V
|
V
N
x
S
Y
|
Y
N
 
G
R
x
A
I
x
C
M
 
G
L
 
L
S
 
P
P
 
Y
V
 
V
L
 
L
A
 
S
G
 
G
E
|
E
-
 
I
K
 
P
A
 
R
F
 
L
E
|
E
D
 
R
I
 
L
V
 
V
I
 
A
N
x
R
D
 
T
E
 
P
A
 
E
W
 
E
Y
 
F
R
 
R
D
 
K
N
 
Q
G
 
G
I
 
V
T
 
L
L
 
V
H
 
H
A
 
T
G
 
R
R
 
H
A
x
E
V
|
V
T
 
V
A
 
D
I
 
V
D
 
D
L
 
Y
A
 
E
A
 
L
R
 
R
K
 
T
V
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
H
-
 
D
F
 
H
A
 
A
E
 
E
G
 
G
-
 
R
G
 
T
L
 
F
E
 
Q
I
 
D
G
 
R
Y
 
F
D
 
D
K
 
H
L
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
x
A
D
 
R
P
 
P
F
 
S
R
 
L
L
 
P
P
 
P
L
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
Q
K
 
E
G
 
G
V
 
V
V
 
Y
T
 
T
F
x
L
R
|
R
D
 
T
L
 
M
D
 
E
D
 
D
V
 
G
N
 
E
A
 
R
M
 
L
L
 
L
A
 
K
A
 
A
S
 
L
A
 
-
E
 
-
P
 
P
D
 
Q
A
 
A
-
 
R
R
 
R
A
 
A
V
 
A
V
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
x
Y
L
 
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
E
G
 
A
L
 
F
A
 
R
R
 
K
R
 
R
G
 
G
M
 
L
A
 
Q
A
 
V
T
 
T
V
 
L
V
 
L
H
 
E
L
 
A
M
 
K
D
 
D
V
 
R
L
 
P
M
 
L
E
 
P
R
 
-
Q
 
H
L
 
W
D
 
D
E
 
P
S
 
E
A
 
V
G
 
G
Y
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
E
D
 
R
R
 
H
G
 
G
V
 
V
E
 
E
T
 
V
V
 
W
L
 
T
G
 
G
A
 
V
H
 
K
S
 
V
E
 
E
E
 
A
I
 
F
V
 
R
G
 
G
A
 
M
D
 
-
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
T
 
E
G
 
A
L
 
V
K
 
E
L
 
T
K
 
S
D
 
E
G
 
G
R
 
-
V
 
V
L
 
V
P
 
P
C
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
V
V
 
L
M
 
L
A
 
A
V
 
T
G
 
G
I
 
I
R
 
R
P
 
P
N
 
N
T
 
T
T
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
A
 
A
A
 
M
G
 
G
L
 
V
T
 
A
V
 
L
N
 
G
R
 
P
-
 
T
-
 
G
G
 
A
V
 
I
A
 
A
V
 
T
D
 
D
D
 
E
A
 
R
M
 
M
R
 
R
T
 
T
S
 
N
D
 
L
P
 
E
D
 
G
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
V
 
A
G
|
G
E
x
D
C
 
V
V
 
A
E
 
E
H
 
S
R
 
F
G
 
H
Q
 
R
C
 
V
Y
 
-
G
 
-
L
 
L
V
 
K
A
 
R
P
 
P
I
 
Y
W
 
W
E
 
L
M
x
P
C
x
L
R
x
G
A
 
D
L
 
V
A
 
A
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
T
 
-
D
x
N
G
 
K
E
 
H
G
 
G
A
x
R
Y
 
T
Q
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
I
S
 
A
T
 
G
R
 
R
-
 
E
-
 
A
-
 
R
-
 
F
L
 
L
K
 
G
V
 
V
S
 
V
G
 
G
V
 
T
D
 
A
V
 
I
F
 
F
S
 
K
A
 
A
G
 
F
K
 
D
F
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

4emiA Toluene dioxygenase reductase in reduced state in complex with NAD+ (see paper)
32% identity, 33% coverage: 10:284/822 of query aligns to 4:275/402 of 4emiA

query
sites
4emiA
L
 
V
V
 
A
V
 
I
I
 
I
G
 
G
N
 
N
G
|
G
M
x
V
A
x
G
G
 
G
C
 
F
R
 
-
A
 
T
V
 
T
E
 
A
E
 
Q
V
 
A
L
 
L
K
 
R
R
 
A
D
 
E
P
 
G
D
 
F
R
 
E
Y
 
G
A
 
R
V
 
I
T
 
S
I
 
L
F
 
I
G
 
G
A
x
D
E
|
E
P
 
P
R
 
H
V
 
L
N
 
P
Y
 
Y
N
 
D
R
|
R
I
x
P
M
 
S
L
 
L
S
 
S
P
x
K
V
 
A
L
 
V
A
 
L
G
 
D
E
 
G
K
 
S
A
 
L
F
 
E
E
 
R
D
 
P
I
 
P
V
 
I
I
 
L
N
 
A
D
 
E
E
 
A
A
 
D
W
 
W
Y
 
Y
R
 
G
D
 
E
N
 
A
G
 
R
I
 
I
T
 
D
L
 
M
H
 
L
A
 
T
G
 
G
R
 
P
A
x
E
V
|
V
T
 
T
A
 
A
I
 
L
D
 
D
L
 
V
A
 
Q
A
 
T
R
 
R
K
 
T
V
 
I
F
 
S
A
 
L
E
 
D
G
 
D
G
 
G
L
 
T
E
 
T
I
 
L
G
 
S
Y
 
A
D
 
D
K
 
A
L
 
I
I
 
V
L
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
D
 
R
P
 
A
F
x
R
R
 
T
L
 
M
P
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
S
D
 
Q
L
 
L
K
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
T
F
 
L
R
 
R
D
 
T
L
 
Y
D
 
G
D
 
D
V
 
V
N
 
Q
A
 
-
M
 
V
L
 
L
A
 
R
A
 
D
S
 
S
A
 
W
E
 
T
P
 
S
D
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
L
V
 
L
V
 
I
I
 
V
G
|
G
G
 
G
G
 
G
L
|
L
L
x
I
G
 
G
L
 
C
E
|
E
A
 
V
A
 
A
Y
 
T
G
 
T
L
 
A
A
 
R
R
 
K
R
 
L
G
 
G
M
 
L
A
 
S
A
 
V
T
 
T
V
 
I
V
 
L
H
x
E
L
x
A
M
 
G
D
 
D
V
 
E
L
 
L
M
 
L
E
 
V
R
|
R
Q
 
V
L
 
L
D
 
G
E
 
R
S
 
R
A
 
I
G
 
G
Y
 
A
L
 
W
L
 
L
R
 
R
E
 
G
A
 
L
L
 
L
A
 
T
D
 
E
R
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
T
 
V
V
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
T
H
 
G
S
 
V
E
 
V
E
 
G
I
 
F
V
 
S
G
 
G
A
 
-
D
 
E
G
 
G
Q
 
Q
V
 
L
T
 
E
G
 
Q
L
 
V
K
 
M
L
 
A
K
 
S
D
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
S
L
 
F
P
 
V
C
 
A
D
 
D
L
 
S
L
 
A
V
 
L
M
 
I
A
 
C
V
|
V
G
|
G
I
x
A
R
 
E
P
 
P
N
 
A
T
 
D
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
A
V
 
C
N
 
D
R
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
I
V
 
V
D
 
D
D
 
H
A
 
C
M
 
G
R
 
A
T
 
T
S
 
L
D
 
A
P
 
K
D
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
A
V
 
V
G
|
G
E
x
D
C
 
V

Sites not aligning to the query:

4emjA Complex between the reductase and ferredoxin components of toluene dioxygenase (see paper)
32% identity, 33% coverage: 10:284/822 of query aligns to 5:276/406 of 4emjA

query
sites
4emjA
L
 
V
V
 
A
V
 
I
I
 
I
G
 
G
N
 
N
G
|
G
M
x
V
A
x
G
G
 
G
C
 
F
R
 
-
A
 
T
V
 
T
E
 
A
E
 
Q
V
 
A
L
 
L
K
 
R
R
 
A
D
 
E
P
 
G
D
 
F
R
 
E
Y
 
G
A
 
R
V
 
I
T
 
S
I
 
L
F
 
I
G
 
G
A
x
D
E
|
E
P
 
P
R
 
H
V
 
L
N
 
P
Y
 
Y
N
 
D
R
|
R
I
x
P
M
 
S
L
 
L
S
|
S
P
x
K
V
 
A
L
 
V
A
 
L
G
 
D
E
 
G
K
 
S
A
 
L
F
 
E
E
 
R
D
 
P
I
 
P
V
 
I
I
 
L
N
 
A
D
 
E
E
 
A
A
 
D
W
 
W
Y
 
Y
R
 
G
D
 
E
N
 
A
G
 
R
I
 
I
T
 
D
L
 
M
H
 
L
A
 
T
G
 
G
R
 
P
A
 
E
V
|
V
T
 
T
A
 
A
I
 
L
D
 
D
L
 
V
A
 
Q
A
 
T
R
 
R
K
 
T
V
 
I
F
 
S
A
 
L
E
 
D
G
 
D
G
 
G
L
 
T
E
 
T
I
 
L
G
 
S
Y
 
A
D
 
D
K
 
A
L
 
I
I
 
V
L
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
D
 
R
P
 
A
F
 
R
R
 
T
L
 
M
P
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
S
D
 
Q
L
 
L
K
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
T
F
 
L
R
|
R
D
 
T
L
 
Y
D
 
G
D
 
D
V
 
V
N
 
Q
A
 
-
M
 
V
L
 
L
A
 
R
A
 
D
S
 
S
A
 
W
E
 
T
P
 
S
D
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
L
V
 
L
V
 
I
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
C
E
 
E
A
 
V
A
 
A
Y
 
T
G
 
T
L
 
A
A
 
R
R
 
K
R
 
L
G
 
G
M
 
L
A
 
S
A
 
V
T
 
T
V
 
I
V
 
L
H
 
E
L
 
A
M
 
G
D
 
D
V
 
E
L
 
L
M
 
L
E
 
V
R
 
R
Q
 
V
L
 
L
D
 
G
E
 
R
S
 
R
A
 
I
G
 
G
Y
 
A
L
 
W
L
 
L
R
 
R
E
 
G
A
 
L
L
 
L
A
 
T
D
 
E
R
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
T
 
V
V
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
T
H
 
G
S
 
V
E
 
V
E
 
G
I
 
F
V
 
S
G
 
G
A
 
-
D
 
E
G
 
G
Q
 
Q
V
 
L
T
 
E
G
 
Q
L
 
V
K
 
M
L
 
A
K
 
S
D
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
S
L
 
F
P
 
V
C
 
A
D
 
D
L
 
S
L
 
A
V
 
L
M
 
I
A
 
C
V
 
V
G
 
G
I
 
A
R
 
E
P
 
P
N
 
A
T
 
D
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
A
V
 
C
N
 
D
R
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
I
V
 
V
D
 
D
D
 
H
A
 
C
M
 
G
R
 
A
T
 
T
S
 
L
D
 
A
P
 
K
D
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
A
V
 
V
G
|
G
E
x
D
C
 
V

Sites not aligning to the query:

1xhcA Nadh oxidase /nitrite reductase from pyrococcus furiosus pfu-1140779- 001
31% identity, 41% coverage: 9:346/822 of query aligns to 2:324/346 of 1xhcA

query
sites
1xhcA
R
 
K
L
 
V
V
 
V
V
 
I
I
x
V
G
|
G
N
 
N
G
|
G
M
x
P
A
x
G
G
 
G
C
 
F
R
 
-
A
 
-
V
 
-
E
 
-
E
 
E
V
 
L
L
 
A
K
 
K
R
 
Q
D
 
L
P
 
S
D
 
Q
R
 
T
Y
 
Y
A
 
E
V
 
V
T
 
T
I
 
V
F
 
I
G
x
D
A
x
K
E
 
E
P
 
P
R
 
V
V
 
P
N
 
Y
Y
 
Y
N
 
S
R
x
K
I
x
P
M
 
M
L
 
L
S
 
S
P
 
H
V
 
Y
L
 
I
A
 
A
G
 
G
E
 
F
K
 
I
A
 
P
F
 
R
E
 
N
D
 
R
I
 
L
V
 
F
I
 
P
N
 
Y
D
 
S
E
 
L
A
 
D
W
 
W
Y
 
Y
R
 
R
D
 
K
N
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
E
L
 
I
H
 
R
A
 
L
G
 
A
R
 
E
A
x
E
V
x
A
T
 
K
A
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
R
A
 
G
A
 
R
R
 
K
K
 
V
V
 
V
F
 
I
A
 
T
E
 
E
G
 
K
G
 
G
L
 
-
E
 
E
I
 
V
G
 
P
Y
 
Y
D
 
D
K
 
T
L
 
L
I
 
V
L
 
L
A
|
A
T
|
T
G
|
G
S
 
A
D
 
R
P
 
A
F
 
R
R
 
E
L
 
P
P
 
Q
L
 
I
P
 
K
G
 
G
G
 
K
D
 
E
L
 
Y
K
 
-
G
 
-
V
 
L
V
 
L
T
 
T
F
x
L
R
|
R
D
 
T
L
 
I
D
 
F
D
 
D
V
 
A
N
 
D
A
 
-
M
 
R
L
 
I
A
 
K
A
 
E
S
 
S
A
 
I
E
 
E
P
 
N
D
 
S
A
 
G
R
 
E
A
 
A
V
 
I
V
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
x
F
L
x
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
A
 
L
A
 
A
Y
 
G
G
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
E
R
 
A
G
 
G
M
 
Y
A
 
H
A
 
V
T
 
K
V
 
L
V
 
I
H
 
H
L
 
R
M
 
G
D
 
A
V
 
M
L
 
F
M
 
L
E
 
-
R
 
-
Q
 
G
L
 
L
D
 
D
E
 
E
S
 
E
A
 
L
G
 
S
Y
 
N
L
 
M
L
 
I
R
 
K
E
 
D
A
 
M
L
 
L
A
 
E
D
 
E
R
 
T
G
 
G
V
 
V
E
 
K
T
 
F
V
 
F
L
 
L
G
 
N
A
 
S
H
 
E
S
 
L
E
 
L
E
 
E
I
 
-
V
 
A
G
 
N
A
 
E
D
 
E
G
 
G
Q
 
V
V
 
L
T
 
T
G
 
N
L
 
S
K
 
G
L
 
F
K
 
I
D
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
V
L
 
K
P
 
I
C
 
C
D
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
-
M
 
-
A
 
A
V
 
I
G
 
G
I
 
I
R
 
V
P
 
P
N
 
N
T
 
V
T
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
R
A
 
S
G
 
G
L
 
I
T
 
H
V
 
T
N
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
I
D
 
D
D
 
D
A
 
N
M
 
F
R
 
R
T
 
T
S
 
S
D
 
A
P
 
K
D
 
D
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
V
 
I
G
|
G
E
x
D
C
 
C
V
 
A
E
 
E
H
 
Y
R
 
S
G
 
G
Q
 
I
C
 
I
Y
 
A
G
|
G
L
x
T
V
x
A
A
 
K
P
 
A
I
 
A
W
x
M
E
 
E
M
 
Q
C
 
A
R
 
R
A
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
D
A
 
I
L
 
L
T
 
K
D
 
G
G
 
E
E
 
P
G
 
R
A
 
R
Y
 
Y
Q
 
N
G
 
F
S
 
K
V
 
F
L
 
R
S
 
S
T
 
T
R
 
V
L
 
F
K
 
K
V
 
F
S
 
G
G
 
K
V
 
L
D
 
Q
V
 
I
F
 
A
S
 
I
A
 
I
G
 
G
K
 
N
F
 
T
A
 
K
G
 
G
-
 
E
G
 
G
E
 
K
G
 
W
C
 
I
E
 
E
D
 
D

1q1wA Crystal structure of putidaredoxin reductase from pseudomonas putida (see paper)
32% identity, 31% coverage: 56:308/822 of query aligns to 52:308/422 of 1q1wA

query
sites
1q1wA
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
K
K
 
A
A
 
T
F
 
A
E
 
E
D
 
S
I
 
L
V
 
Y
I
 
L
N
 
R
D
 
T
E
 
P
A
 
D
W
 
A
Y
 
Y
R
 
A
D
 
A
N
 
Q
G
 
N
I
 
I
T
 
Q
L
 
L
H
 
L
A
 
G
G
 
G
R
 
T
A
 
Q
V
|
V
T
 
T
A
 
A
I
 
I
D
 
N
L
 
R
A
 
D
A
 
R
R
 
Q
K
 
Q
V
 
V
F
 
I
A
 
L
E
 
S
G
 
D
G
 
G
L
 
R
E
 
A
I
 
L
G
 
D
Y
 
Y
D
 
D
K
 
R
L
 
L
I
 
V
L
 
L
A
|
A
T
|
T
G
|
G
S
 
G
D
 
R
P
 
P
F
 
R
R
 
P
L
 
L
P
 
P
L
 
V
P
 
A
G
 
S
G
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
N
D
 
N
L
 
F
K
 
R
G
 
Y
V
 
L
V
x
R
T
 
T
F
 
L
R
 
E
D
 
D
L
 
A
D
 
E
D
 
C
V
 
I
N
 
R
A
 
R
M
 
Q
L
 
L
A
 
I
A
 
A
S
 
-
A
 
-
E
 
-
P
 
-
D
 
D
A
 
N
R
 
R
A
 
L
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
L
x
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
V
A
 
A
Y
 
A
G
 
T
L
 
A
A
 
I
R
 
K
R
 
A
G
 
N
M
 
M
A
 
H
A
 
V
T
 
T
V
 
L
V
 
L
H
 
D
L
 
T
M
 
A
D
 
A
V
 
R
L
 
V
M
 
L
E
 
E
R
 
R
Q
 
V
L
 
T
D
 
A
E
 
P
S
 
P
A
 
V
G
 
S
Y
 
A
L
 
F
L
 
Y
R
 
E
E
 
H
A
 
L
L
 
H
A
 
R
D
 
E
R
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
D
T
 
I
V
 
R
L
 
T
G
 
G
A
 
T
H
 
Q
-
 
V
-
 
C
S
 
G
E
 
F
E
 
E
I
 
M
V
 
S
G
 
T
A
 
D
D
 
Q
G
 
Q
Q
 
K
V
 
V
T
 
T
G
 
A
L
 
V
K
 
L
L
 
C
K
 
E
D
 
D
G
 
G
R
 
T
V
 
R
L
 
L
P
 
P
C
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
V
V
 
I
M
 
A
A
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
L
R
 
I
P
 
P
N
 
N
T
 
C
T
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
S
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
Q
V
 
V
N
 
D
R
 
N
G
 
G
V
 
I
A
 
V
V
 
I
D
 
N
D
 
E
A
 
H
M
 
M
R
 
Q
T
 
T
S
 
S
D
 
D
P
 
P
D
 
L
V
 
I
F
 
M
A
 
A
V
 
V
G
 
G
E
x
D
C
 
C
V
 
A
E
 
R
H
 
F
R
 
H
G
 
S
Q
 
Q
C
 
L
Y
 
Y
G
 
D
L
 
R
V
 
W
A
 
V
P
 
R
I
 
I
W
 
E
E
x
S
M
x
V
C
 
P
R
 
N
A
 
A
L
|
L
A
 
E
Q
 
Q
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P16640 Putidaredoxin reductase CamA; Pdr; Putidaredoxin--NAD(+) reductase; EC 1.18.1.5 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see 2 papers)
32% identity, 31% coverage: 56:308/822 of query aligns to 53:309/422 of P16640

query
sites
P16640
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
K
K
 
A
A
 
T
F
 
A
E
 
E
D
 
S
I
 
L
V
 
Y
I
 
L
N
 
R
D
 
T
E
 
P
A
 
D
W
 
A
Y
 
Y
R
 
A
D
 
A
N
 
Q
G
 
N
I
 
I
T
 
Q
L
 
L
H
 
L
A
 
G
G
 
G
R
 
T
A
 
Q
V
|
V
T
 
T
A
 
A
I
 
I
D
 
N
L
 
R
A
 
D
A
 
R
R
 
Q
K
 
Q
V
 
V
F
 
I
A
 
L
E
 
S
G
 
D
G
 
G
L
 
R
E
 
A
I
 
L
G
 
D
Y
 
Y
D
 
D
K
 
R
L
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
G
D
 
R
P
 
P
F
 
R
R
 
P
L
 
L
P
 
P
L
 
V
P
 
A
G
 
S
G
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
N
D
 
N
L
 
F
K
 
R
G
 
Y
V
 
L
V
x
R
T
 
T
F
 
L
R
 
E
D
 
D
L
 
A
D
 
E
D
 
C
V
 
I
N
 
R
A
 
R
M
 
Q
L
 
L
A
 
I
A
 
A
S
 
-
A
 
-
E
 
-
P
 
-
D
 
D
A
 
N
R
 
R
A
 
L
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
L
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
V
A
 
A
Y
 
A
G
 
T
L
 
A
A
 
I
R
 
K
R
 
A
G
 
N
M
 
M
A
 
H
A
 
V
T
 
T
V
 
L
V
 
L
H
 
D
L
 
T
M
 
A
D
 
A
V
 
R
L
 
V
M
 
L
E
 
E
R
 
R
Q
 
V
L
 
T
D
 
A
E
 
P
S
 
P
A
 
V
G
 
S
Y
 
A
L
 
F
L
 
Y
R
 
E
E
 
H
A
 
L
L
 
H
A
 
R
D
 
E
R
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
D
T
 
I
V
 
R
L
 
T
G
 
G
A
 
T
H
 
Q
-
 
V
-
 
C
S
 
G
E
 
F
E
 
E
I
 
M
V
 
S
G
 
T
A
 
D
D
 
Q
G
 
Q
Q
 
K
V
 
V
T
 
T
G
 
A
L
 
V
K
 
L
L
 
C
K
 
E
D
 
D
G
 
G
R
 
T
V
 
R
L
 
L
P
 
P
C
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
V
V
 
I
M
 
A
A
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
L
R
 
I
P
 
P
N
 
N
T
 
C
T
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
S
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
Q
V
 
V
N
 
D
R
 
N
G
 
G
V
 
I
A
 
V
V
 
I
D
 
N
D
 
E
A
 
H
M
 
M
R
 
Q
T
 
T
S
 
S
D
 
D
P
 
P
D
 
L
V
 
I
F
 
M
A
 
A
V
 
V
G
 
G
E
x
D
C
 
C
V
 
A
E
 
R
H
 
F
R
 
H
G
 
S
Q
 
Q
C
 
L
Y
 
Y
G
 
D
L
 
R
V
 
W
A
 
V
P
 
R
I
 
I
W
 
E
E
 
S
M
x
V
C
 
P
R
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
E
Q
 
Q
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Q9LK94 Monodehydroascorbate reductase 4, peroxisomal; AtMDAR4; EC 1.6.5.4 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
32% identity, 31% coverage: 38:293/822 of query aligns to 35:306/488 of Q9LK94

query
sites
Q9LK94
I
 
I
F
 
I
G
 
S
A
 
E
E
 
E
P
 
P
R
 
V
V
 
A
N
 
P
Y
 
Y
N
 
E
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
K
-
 
G
I
 
F
M
 
L
L
 
L
S
 
P
P
 
E
V
 
A
L
 
P
A
 
A
G
 
R
E
 
L
K
 
P
A
 
S
F
 
F
E
 
H
D
 
T
I
 
C
V
 
V
-
 
G
I
 
A
N
 
N
D
 
D
E
 
E
A
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
K
W
 
W
Y
 
Y
R
 
K
D
 
D
N
 
H
G
 
G
I
 
I
T
 
E
L
 
L
H
 
V
A
 
L
G
 
G
R
 
T
A
 
R
V
 
V
T
 
K
A
 
S
I
 
V
D
 
D
L
 
V
A
 
R
A
 
R
R
 
K
K
 
T
V
 
L
F
 
L
A
 
S
E
 
S
G
 
T
G
 
G
L
 
E
E
 
T
I
 
I
G
 
S
Y
 
Y
D
 
K
K
 
F
L
 
L
I
 
I
L
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
A
D
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
K
L
 
L
P
 
E
-
 
E
-
 
F
-
 
G
L
 
V
P
 
E
G
 
G
G
 
S
D
 
D
L
 
A
K
 
E
G
 
N
V
 
V
V
 
C
T
 
Y
F
 
L
R
 
R
D
 
D
L
 
L
D
 
A
D
 
D
V
 
A
N
 
N
A
 
R
M
 
L
L
 
A
A
 
T
A
 
V
-
 
I
S
 
Q
A
 
S
E
 
S
P
 
S
D
 
N
A
 
G
R
 
N
A
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
L
 
I
G
 
G
L
 
M
E
 
E
A
 
C
A
 
A
Y
 
A
G
 
S
L
 
L
A
 
V
R
 
I
R
 
N
G
 
K
M
 
I
A
 
N
A
 
V
T
 
T
V
 
M
V
 
V
H
 
F
L
 
P
M
 
E
D
 
A
V
 
H
L
 
C
M
 
M
E
 
A
R
 
R
Q
 
L
L
 
F
D
 
T
E
 
P
S
 
K
A
 
I
G
 
A
Y
 
S
L
 
L
L
 
Y
R
 
E
E
 
D
A
 
Y
L
 
Y
A
 
R
D
 
A
R
 
K
G
 
G
V
 
V
E
 
K
T
 
F
V
 
I
L
 
K
G
 
G
A
 
T
H
 
V
S
 
L
E
 
T
E
 
S
I
 
F
-
 
E
V
 
F
G
 
D
A
 
S
D
 
N
G
 
K
Q
 
K
V
 
V
T
 
T
G
 
A
L
 
V
K
 
N
L
 
L
K
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
S
V
 
H
L
 
L
P
 
P
C
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
V
V
 
V
M
 
V
A
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
I
R
 
R
P
 
P
N
 
N
T
 
T
T
 
S
L
 
L
A
 
F
K
 
E
A
 
G
A
 
Q
G
 
-
L
 
L
T
 
T
V
 
I
N
 
E
R
 
K
-
 
G
G
 
G
V
 
I
A
 
K
V
 
V
D
 
N
D
 
S
A
 
R
M
 
M
R
 
Q
T
 
S
S
 
S
D
 
D
P
 
S
D
 
S
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
V
 
I
G
 
G
E
 
D
C
 
V
V
 
A
E
 
T
H
 
F
R
 
P
G
 
V
Q
 
K
C
 
L
Y
 
F
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3fg2P Crystal structure of ferredoxin reductase for the cyp199a2 system from rhodopseudomonas palustris (see paper)
32% identity, 36% coverage: 10:308/822 of query aligns to 4:300/404 of 3fg2P

query
sites
3fg2P
L
 
V
V
 
L
V
 
I
I
 
A
G
|
G
N
 
A
G
|
G
M
x
H
A
|
A
G
 
G
C
 
F
R
 
Q
-
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
S
E
 
L
V
 
R
L
 
Q
K
 
A
R
 
K
D
 
Y
P
 
P
D
 
G
R
 
R
Y
 
I
A
 
A
V
 
-
T
 
-
I
 
L
F
 
I
G
 
N
A
x
D
E
|
E
P
 
K
R
 
H
V
 
L
N
 
P
Y
 
Y
N
 
Q
R
|
R
I
x
P
M
 
P
L
 
L
S
|
S
P
x
K
V
 
A
-
 
Y
L
 
L
A
 
K
G
 
S
E
 
G
K
 
G
A
 
D
F
 
P
E
 
N
D
 
S
I
 
L
V
 
M
I
 
F
N
 
R
D
 
P
E
 
E
A
 
K
W
 
F
Y
 
F
R
 
Q
D
 
D
N
 
Q
G
 
A
I
 
I
T
 
E
L
 
L
H
 
I
A
 
S
G
 
D
R
|
R
A
x
M
V
 
V
T
 
S
A
 
-
I
 
I
D
 
D
L
 
R
A
 
E
A
 
G
R
 
R
K
 
K
V
 
L
F
 
L
A
 
L
E
 
A
G
 
S
G
 
G
L
 
T
E
 
A
I
 
I
G
 
E
Y
 
Y
D
 
G
K
 
H
L
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
A
T
|
T
G
 
G
S
 
A
D
 
R
P
 
N
F
 
R
R
 
M
L
 
L
P
 
D
L
 
V
P
 
P
G
 
N
G
 
A
D
 
S
L
 
L
K
 
P
G
 
D
V
 
V
V
 
L
T
 
Y
F
 
L
R
|
R
D
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
E
V
 
S
N
 
E
A
 
V
M
 
L
L
 
-
A
 
-
A
 
R
S
 
Q
A
 
R
E
 
M
P
 
P
D
 
D
A
 
K
R
 
K
-
 
H
A
 
V
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
 
F
L
x
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
F
A
 
A
Y
 
A
G
 
T
L
 
A
A
 
R
R
 
A
R
 
K
G
 
G
M
 
L
A
 
E
A
 
V
T
 
D
V
 
V
V
 
V
H
 
E
L
 
L
M
 
A
D
 
P
V
 
R
L
 
V
M
 
M
E
 
A
R
 
R
Q
 
V
L
 
V
D
 
T
E
 
P
S
 
E
A
 
I
G
 
S
Y
 
S
L
 
Y
L
 
F
R
 
H
E
 
D
A
 
R
L
 
H
A
 
S
D
 
G
R
 
A
G
 
G
V
 
I
E
 
R
T
 
M
V
 
H
L
 
Y
G
 
G
A
 
V
H
 
R
S
 
A
E
 
T
E
 
E
I
 
I
V
 
A
G
 
A
A
 
E
D
 
G
G
 
D
Q
 
R
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
V
K
 
V
L
 
L
K
 
S
D
 
D
G
 
G
R
 
N
V
 
T
L
 
L
P
 
P
C
 
C
D
 
D
L
 
L
L
 
V
V
 
V
M
 
V
A
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
V
R
 
I
P
 
P
N
 
N
T
 
V
T
 
E
L
 
I
A
 
A
K
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
P
V
 
T
N
 
A
R
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
I
V
 
V
D
 
D
D
 
Q
A
 
Q
M
 
L
R
 
L
T
 
T
S
 
S
D
 
D
P
 
P
D
 
H
V
 
I
F
 
S
A
 
A
V
 
I
G
 
G
E
x
D
C
 
C
V
 
A
E
 
L
H
 
F
R
 
E
G
 
S
Q
 
V
C
 
R
Y
 
F
G
 
G
L
 
E
V
 
T
A
 
M
P
 
R
I
 
V
W
 
E
E
x
S
M
x
V
C
 
Q
R
 
N
A
 
A
L
 
T
A
 
D
Q
 
Q
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3nt6A Structure of the shewanella loihica pv-4 nadh-dependent persulfide reductase c43s/c531s double mutant (see paper)
31% identity, 33% coverage: 70:337/822 of query aligns to 65:363/565 of 3nt6A

query
sites
3nt6A
E
 
E
A
 
S
W
 
F
Y
 
K
R
 
A
D
 
R
N
 
F
G
 
N
I
 
V
T
 
E
L
 
V
H
 
R
A
 
V
G
 
K
R
 
H
A
x
E
V
|
V
T
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
L
 
R
A
 
A
A
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
T
-
 
V
R
 
R
K
 
R
V
 
L
F
 
L
A
 
D
E
 
G
G
 
S
G
 
E
L
 
Y
E
 
Q
I
 
E
G
 
S
Y
 
Y
D
 
D
K
 
T
L
 
L
I
 
L
L
 
L
A
x
S
T
x
P
G
|
G
S
 
A
D
 
A
P
 
P
F
 
I
R
 
V
L
 
P
P
 
P
L
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
V
D
 
D
L
 
N
K
 
P
G
 
L
V
 
T
V
 
H
T
 
S
F
x
L
R
|
R
D
 
N
L
 
I
D
 
P
D
 
D
V
 
M
N
 
D
A
 
R
M
 
I
L
 
L
A
 
Q
A
 
T
S
 
I
A
 
Q
E
 
M
P
 
N
D
 
N
A
 
V
-
 
E
R
 
H
A
 
A
V
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
x
F
L
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
M
A
 
M
Y
 
E
G
 
S
L
 
L
A
 
H
R
 
H
R
 
L
G
 
G
M
 
I
A
 
K
A
 
T
T
 
T
V
 
L
V
 
L
H
 
E
L
 
L
M
 
A
D
 
D
V
 
Q
L
 
V
M
 
M
E
 
T
R
 
P
Q
 
V
L
 
D
D
 
R
E
 
E
S
 
M
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
L
 
A
L
 
-
R
 
H
E
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
R
D
 
D
R
 
Q
G
 
G
V
 
V
E
 
D
T
 
L
V
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
T
H
 
A
S
 
L
E
 
S
E
 
E
I
 
V
-
 
S
-
 
Y
-
 
Q
-
 
V
-
 
Q
-
 
T
-
 
H
V
 
V
G
 
A
A
 
S
D
 
D
G
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
D
-
 
T
-
 
A
-
 
H
-
 
Q
Q
 
H
V
 
I
T
 
K
G
 
G
-
 
H
-
 
L
-
 
S
L
 
L
K
 
T
L
 
L
K
 
S
D
 
N
G
 
G
R
 
E
V
 
L
L
 
L
P
 
E
C
 
T
D
 
D
L
 
L
L
 
L
V
 
I
M
 
M
A
 
A
V
 
I
G
 
G
I
 
V
R
 
R
P
 
P
N
 
E
T
 
T
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
D
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
A
V
 
I
N
 
G
R
 
E
-
 
L
-
 
G
G
 
G
V
 
I
A
 
K
V
 
V
D
 
N
D
 
A
A
 
M
M
 
M
R
 
Q
T
 
T
S
 
S
D
 
D
P
 
P
D
 
A
V
 
I
F
 
Y
A
 
A
V
 
V
G
|
G
E
x
D
C
 
A
V
 
V
E
 
E
H
 
E
R
 
Q
G
 
D
Q
 
F
C
 
V
Y
 
T
G
 
G
-
 
Q
-
 
A
-
 
C
-
 
L
-
 
V
-
x
P
L
|
L
V
x
A
A
 
G
P
 
P
I
 
A
W
x
N
E
 
R
M
 
Q
C
 
G
R
|
R
A
 
M
L
 
A
A
 
A
Q
 
D
A
 
N
L
 
M
T
 
F
D
 
G
G
 
R
E
 
E
G
 
E
A
 
R
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
S
 
T
V
 
Q
L
 
G
S
 
T
T
 
A
R
 
I
L
 
C
K
 
K
V
 
V
S
 
F
G
 
D
V
 
L
D
 
A
V
 
V
F
 
G
S
 
A
A
 
T
G
 
G
K
 
K

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>CCNA_00651 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_00651
MTQATPKLRLVVIGNGMAGCRAVEEVLKRDPDRYAVTIFGAEPRVNYNRIMLSPVLAGEK
AFEDIVINDEAWYRDNGITLHAGRAVTAIDLAARKVFAEGGLEIGYDKLILATGSDPFRL
PLPGGDLKGVVTFRDLDDVNAMLAASAEPDARAVVIGGGLLGLEAAYGLARRGMAATVVH
LMDVLMERQLDESAGYLLREALADRGVETVLGAHSEEIVGADGQVTGLKLKDGRVLPCDL
LVMAVGIRPNTTLAKAAGLTVNRGVAVDDAMRTSDPDVFAVGECVEHRGQCYGLVAPIWE
MCRALAQALTDGEGAYQGSVLSTRLKVSGVDVFSAGKFAGGEGCEDIVFRDAARGVYKRV
VIEDGKVAGAVLFGDAADGGWYFDLMKAGADVAGIRETLIFGQAITEGLSGLDPSAAVAA
MPDTQEICGCNGVCKGAITSAITAQGLTTLDDVRAVTKASASCGSCTPLVEQVLKLTLGD
GFQAQTGPKPICKCSPKTHGDVRRAIVDQGLKSMPAVMQALEWSTPDGCASCRPALNYYL
LCAWPGEYRDDKQSRYINERVHANIQKDGTYSVVPRMWGGMTSPAELRAIADVAEKFAIP
AVKVTGGQRIDLLGVKKDDLPAVWADLNAAGMVSGHAYAKGLRTVKTCVGSDWCRFGTQD
STGLGMRLEKFLWGSWAPAKVKLAVSGCPRNCAEATCKDFGVVCVDSGYEIHIGGAAGLH
IQGTQVLTRVATEDEAVWVIAAAMQLYREEGWYLERVYKWMDRVGLESIRAQVTDPDQRR
ALYDRFVYSQRFARIDPWAERVAGRHNEEFTPMSRRMEFVPA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory