SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CCNA_00864 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_00864 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7wwxA Crystal structure of herbaspirillum huttiense l-arabinose 1- dehydrogenase (NAD bound form) (see paper)
53% identity, 98% coverage: 4:247/248 of query aligns to 4:253/254 of 7wwxA

query
sites
7wwxA
A
 
A
I
 
N
Y
 
F
P
 
P
S
 
S
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
V
V
 
F
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
I
T
 
V
A
 
E
G
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
H
V
 
V
I
 
A
F
 
F
L
 
V
D
|
D
I
|
I
A
 
A
D
 
T
E
 
E
D
 
A
S
 
S
R
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
C
A
 
N
E
 
D
L
 
I
A
 
A
G
 
A
S
 
A
P
 
G
I
 
H
P
 
P
-
 
K
P
 
P
V
 
L
Y
 
F
K
 
R
R
 
H
C
|
C
D
|
D
L
|
L
M
 
R
N
 
D
L
 
I
E
 
P
A
 
A
I
 
F
K
 
Q
A
 
A
V
 
T
F
 
I
A
 
A
E
 
E
I
 
L
-
 
Q
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
G
 
G
D
 
D
V
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
x
A
N
 
N
D
 
D
D
 
Q
R
 
R
H
 
H
K
 
K
L
 
L
A
 
E
D
 
E
V
 
V
T
 
T
G
 
L
A
 
E
Y
 
Y
W
 
W
D
 
N
E
 
D
R
 
R
I
 
I
N
 
A
V
 
I
N
 
N
L
 
Q
R
 
R
H
 
P
M
 
S
L
 
F
F
 
F
C
 
A
T
 
V
Q
 
Q
A
 
S
V
 
V
A
 
V
P
 
E
G
 
G
M
 
M
K
 
K
K
 
R
R
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
S
V
 
I
I
 
I
N
 
N
F
|
F
G
x
S
S
|
S
I
 
I
S
 
S
W
 
W
H
 
H
L
 
Q
G
 
S
L
 
G
E
 
G
D
 
G
L
 
F
V
 
P
L
 
V
Y
|
Y
E
 
T
T
 
T
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
S
I
 
T
E
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
H
D
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
T
 
N
C
 
T
V
 
V
V
 
T
P
|
P
G
|
G
N
x
W
V
|
V
K
 
M
T
 
T
K
 
E
R
|
R
Q
 
Q
E
 
I
K
 
K
-
 
L
W
 
W
Y
 
L
T
 
D
P
 
E
E
 
E
G
 
G
E
 
K
A
 
K
Q
 
A
I
 
I
V
 
A
A
 
R
A
 
N
Q
 
Q
C
 
C
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
R
 
D
I
 
L
V
 
L
P
 
P
E
 
W
N
 
H
V
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
M
V
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
A
D
 
D
D
 
D
A
 
S
S
 
A
L
 
M
C
 
C
T
 
T
G
 
A
H
 
Q
E
 
E
Y
 
F
W
 
I
I
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G
W
 
W

5wjsA Crystal structure of oxidoreductase (short chain dehydrogenase/reductase family) from burkholderia thailandensis complexed with nadh
48% identity, 98% coverage: 4:247/248 of query aligns to 9:257/258 of 5wjsA

query
sites
5wjsA
A
 
A
I
 
R
Y
 
Y
P
 
P
S
 
S
L
 
L
K
 
A
G
 
G
K
 
R
R
 
A
V
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
S
x
T
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
G
 
S
L
 
F
T
 
V
A
 
E
G
 
H
F
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
R
V
 
V
I
 
A
F
 
F
L
 
V
D
|
D
I
x
L
A
 
D
D
 
E
E
 
Q
D
 
A
S
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
A
A
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
D
S
 
A
P
 
A
I
 
H
P
 
E
P
 
P
V
 
V
Y
 
F
K
 
V
R
 
A
C
 
C
D
|
D
L
|
L
M
 
T
N
 
D
L
 
I
E
 
A
A
 
A
-
 
L
-
 
R
-
 
G
-
 
A
I
 
I
K
 
E
A
 
A
V
 
I
F
 
R
A
 
A
E
 
R
I
 
I
G
 
G
D
 
P
V
 
I
D
 
A
V
 
A
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
x
A
N
 
N
D
 
D
D
 
V
R
 
R
H
 
H
K
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
D
V
 
V
T
 
T
G
 
P
A
 
D
Y
 
S
W
 
F
D
 
D
E
 
A
R
 
C
I
 
I
N
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
R
H
 
H
M
 
Q
L
 
F
F
 
F
C
 
A
T
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
D
G
 
D
M
 
M
K
 
K
K
 
R
R
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
S
V
 
I
I
 
V
N
 
N
F
x
L
G
|
G
S
|
S
I
 
I
S
 
S
W
 
W
H
 
M
L
 
L
G
 
K
L
 
N
E
 
A
D
 
G
L
x
Y
V
 
P
L
 
V
Y
|
Y
E
 
A
T
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
A
I
 
V
E
 
Q
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
F
D
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
T
 
N
C
 
T
V
 
L
V
 
V
P
|
P
G
|
G
N
x
W
V
|
V
K
 
M
T
 
T
K
 
D
R
x
K
Q
 
Q
E
 
R
K
 
R
-
 
L
W
 
W
Y
 
L
T
 
D
P
 
D
E
 
A
G
 
G
E
 
R
A
 
A
Q
 
A
I
 
I
V
 
K
A
 
A
A
 
G
Q
 
Q
C
 
C
L
 
I
K
 
D
G
 
A
R
 
E
I
 
L
V
 
L
P
 
P
E
 
G
N
 
D
V
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
M
V
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
A
D
 
D
D
 
D
A
 
S
S
 
R
L
 
M
C
 
I
T
 
T
G
 
A
H
 
Q
E
 
D
Y
 
V
W
 
V
I
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G
W
 
W

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
36% identity, 96% coverage: 9:246/248 of query aligns to 2:241/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
K
 
Q
G
 
N
K
 
R
R
 
V
V
 
A
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
A
S
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
A
 
K
G
 
Q
L
 
T
T
 
A
A
 
L
G
 
R
F
 
F
A
 
A
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
A
V
 
V
I
 
V
F
 
I
L
 
N
D
|
D
I
|
I
A
 
D
D
 
A
E
 
E
D
 
K
S
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
T
E
 
V
A
 
D
E
 
E
L
 
F
A
 
S
G
 
A
S
 
R
P
 
G
I
 
H
P
 
R
P
 
V
V
 
L
Y
 
G
K
 
A
R
 
V
C
 
A
D
 
D
L
x
I
M
 
G
N
 
N
L
 
K
E
 
A
A
 
A
I
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
M
-
 
V
K
 
K
A
 
Q
V
 
T
F
 
I
A
 
D
E
 
A
I
 
F
G
 
G
D
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
N
 
M
D
 
E
D
 
R
R
 
A
H
 
G
K
 
A
L
 
L
A
 
R
D
 
K
V
 
L
T
 
S
G
 
E
A
 
A
Y
 
D
W
 
W
D
 
D
E
 
V
R
 
T
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
K
H
 
G
M
 
T
L
 
F
F
 
L
C
 
C
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
H
P
 
G
G
 
H
M
 
M
K
 
V
K
 
E
R
 
N
G
 
K
G
 
H
G
 
G
A
 
R
V
 
I
I
 
V
N
 
N
F
x
I
G
 
A
S
|
S
I
 
R
S
 
A
W
 
W
H
 
-
L
 
L
G
 
G
L
 
G
E
 
A
D
 
G
L
 
Q
V
 
T
L
 
P
Y
|
Y
E
 
S
T
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
V
G
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
R
D
 
A
D
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
T
 
N
C
 
C
V
 
V
V
 
A
P
 
P
G
 
G
N
 
L
V
x
I
K
 
H
T
 
T
K
 
P
R
 
M
Q
 
W
E
 
D
K
 
E
W
 
L
Y
 
-
T
 
-
P
 
P
E
 
E
G
 
K
E
 
D
A
 
Q
Q
 
Q
I
 
F
V
 
L
A
 
L
A
 
S
Q
 
R
C
 
Q
L
 
P
K
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
L
-
 
G
V
 
E
P
 
P
E
 
D
N
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
N
L
 
T
V
 
L
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
D
 
D
A
 
S
S
 
G
L
 
F
C
 
V
T
 
T
G
 
G
H
 
Q
E
 
V
Y
 
L
W
 
Y
I
 
V
D
 
C
A
 
G
G
 
G

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
36% identity, 96% coverage: 9:246/248 of query aligns to 3:242/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
L
 
I
K
 
Q
G
 
N
K
 
R
R
 
V
V
 
A
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
G
 
A
S
|
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
A
 
K
G
 
Q
L
 
T
T
 
A
A
 
L
G
 
R
F
 
F
A
 
A
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
A
V
 
V
I
 
V
F
 
I
L
 
N
D
|
D
I
 
I
A
 
D
D
 
A
E
 
E
D
 
K
S
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
T
E
 
V
A
 
D
E
 
E
L
 
F
A
 
S
G
 
A
S
 
R
P
 
G
I
 
H
P
 
R
P
 
V
V
 
L
Y
 
G
K
 
A
R
 
V
C
 
A
D
|
D
L
x
I
M
 
G
N
 
N
L
 
K
E
 
A
A
 
A
I
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
M
-
 
V
K
 
K
A
 
Q
V
 
T
F
 
I
A
 
D
E
 
A
I
 
F
G
 
G
D
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
N
 
M
D
 
E
D
 
R
R
 
A
H
 
G
K
 
A
L
 
L
A
 
R
D
 
K
V
 
L
T
 
S
G
 
E
A
 
A
Y
 
D
W
 
W
D
 
D
E
 
V
R
 
T
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
K
H
 
G
M
 
T
L
 
F
F
 
L
C
 
C
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
H
P
 
G
G
 
H
M
 
M
K
 
V
K
 
E
R
 
N
G
 
K
G
 
H
G
 
G
A
 
R
V
 
I
I
 
V
N
 
N
F
 
I
G
 
A
S
 
S
I
 
R
S
 
A
W
 
W
H
 
-
L
 
L
G
 
G
L
 
G
E
 
A
D
 
G
L
 
Q
V
 
T
L
 
P
Y
|
Y
E
 
S
T
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
V
G
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
R
D
 
A
D
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
T
 
N
C
 
C
V
 
V
V
 
A
P
 
P
G
 
G
N
 
L
V
 
I
K
 
H
T
 
T
K
 
P
R
 
M
Q
 
W
E
 
D
K
 
E
W
 
L
Y
 
-
T
 
-
P
 
P
E
 
E
G
 
K
E
 
D
A
 
Q
Q
 
Q
I
 
F
V
 
L
A
 
L
A
 
S
Q
 
R
C
 
Q
L
 
P
K
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
L
-
 
G
V
 
E
P
 
P
E
 
D
N
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
N
L
 
T
V
 
L
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
D
 
D
A
 
S
S
 
G
L
 
F
C
 
V
T
 
T
G
 
G
H
 
Q
E
 
V
Y
 
L
W
 
Y
I
 
V
D
 
C
A
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4urfB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
33% identity, 96% coverage: 9:247/248 of query aligns to 3:245/248 of 4urfB

query
sites
4urfB
L
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
T
V
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
|
G
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
G
 
T
L
 
I
T
 
A
A
 
L
G
 
T
F
 
Y
A
 
A
R
 
A
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
N
V
 
V
I
 
V
F
 
V
L
 
S
D
|
D
I
|
I
A
 
S
D
 
D
E
 
E
D
 
W
S
 
G
R
 
R
A
 
E
L
 
T
E
 
L
A
 
A
E
 
L
L
 
I
A
 
E
G
 
G
S
 
K
P
 
G
I
 
G
P
 
K
P
 
A
V
 
V
Y
 
F
K
 
Q
R
 
H
C
 
A
D
|
D
L
x
T
M
 
A
N
 
H
L
 
P
E
 
E
-
 
D
-
 
H
-
 
D
-
 
E
A
 
L
I
 
I
K
 
A
A
 
A
V
 
A
F
 
K
A
 
R
E
 
A
I
 
F
G
 
G
D
 
R
V
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
-
x
I
N
 
S
D
x
G
D
 
E
R
 
F
H
 
T
K
 
P
L
 
T
A
 
A
D
 
E
V
 
T
T
 
T
G
 
D
A
 
A
Y
 
Q
W
 
W
D
 
Q
E
x
R
R
 
V
I
 
I
N
 
G
V
 
I
N
 
N
L
 
L
R
 
S
H
 
G
M
 
V
L
 
F
F
 
Y
C
 
G
T
 
V
Q
 
R
A
 
A
V
 
Q
A
 
I
P
 
R
G
 
A
M
 
M
K
 
L
K
 
E
R
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
V
N
 
N
F
x
I
G
 
S
S
|
S
I
 
I
S
 
A
W
 
G
H
 
Q
L
 
I
G
 
G
L
 
I
E
 
E
D
 
G
L
x
I
V
 
T
L
 
P
Y
|
Y
E
 
T
T
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
I
 
V
E
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
T
L
 
V
A
 
A
R
 
W
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
P
 
S
D
 
K
D
 
G
I
 
I
R
|
R
V
 
I
T
 
N
C
 
S
V
 
V
V
 
G
P
|
P
G
x
A
N
 
F
V
x
I
K
 
N
T
|
T
K
 
T
R
 
L
Q
 
V
E
 
Q
K
 
N
W
 
-
Y
 
-
T
 
V
P
 
P
-
 
L
E
 
E
G
 
T
E
 
R
A
 
R
Q
 
Q
I
 
L
V
 
E
A
 
Q
A
 
M
Q
 
H
C
 
A
L
|
L
K
x
R
G
x
R
R
 
L
I
 
G
V
 
E
P
 
T
E
 
E
N
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
S
S
|
S
D
 
D
D
 
K
A
 
A
S
 
S
L
 
F
C
 
V
T
 
T
G
 
G
H
 
S
E
 
Y
Y
 
Y
W
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G
W
 
Y

4urfA Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
33% identity, 96% coverage: 9:247/248 of query aligns to 3:245/248 of 4urfA

query
sites
4urfA
L
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
T
V
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
|
G
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
G
 
T
L
 
I
T
 
A
A
 
L
G
 
T
F
 
Y
A
 
A
R
 
A
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
N
V
 
V
I
 
V
F
 
V
L
 
S
D
|
D
I
|
I
A
 
S
D
 
D
E
 
E
D
x
W
S
 
G
R
 
R
A
 
E
L
 
T
E
 
L
A
 
A
E
 
L
L
 
I
A
 
E
G
 
G
S
 
K
P
 
G
I
 
G
P
 
K
P
 
A
V
 
V
Y
 
F
K
 
Q
R
 
H
C
 
A
D
|
D
L
x
T
M
 
A
N
 
H
L
 
P
E
 
E
-
 
D
-
 
H
-
 
D
-
 
E
A
 
L
I
 
I
K
 
A
A
 
A
V
 
A
F
 
K
A
 
R
E
 
A
I
 
F
G
 
G
D
 
R
V
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
-
x
I
N
x
S
D
x
G
D
x
E
R
 
F
H
x
T
K
 
P
L
 
T
A
 
A
D
x
E
V
 
T
T
|
T
G
 
D
A
 
A
Y
x
Q
W
 
W
D
 
Q
E
x
R
R
 
V
I
 
I
N
 
G
V
 
I
N
 
N
L
 
L
R
 
S
H
 
G
M
 
V
L
 
F
F
 
Y
C
 
G
T
 
V
Q
 
R
A
 
A
V
 
Q
A
 
I
P
 
R
G
 
A
M
 
M
K
 
L
K
 
E
R
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
V
N
 
N
F
x
I
G
 
S
S
|
S
I
 
I
S
 
A
W
 
G
H
 
Q
L
 
I
G
 
G
L
 
I
E
 
E
D
 
G
L
x
I
V
 
T
L
 
P
Y
|
Y
E
 
T
T
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
I
 
V
E
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
T
L
 
V
A
 
A
R
 
W
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
P
x
S
D
 
K
D
x
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
T
 
N
C
 
S
V
 
V
V
 
G
P
|
P
G
 
A
N
 
F
V
x
I
K
 
N
T
|
T
K
 
T
R
 
L
Q
 
V
E
 
Q
K
 
N
W
 
-
Y
 
-
T
 
V
P
 
P
-
 
L
E
 
E
G
 
T
E
 
R
A
 
R
Q
 
Q
I
 
L
V
 
E
A
 
Q
A
 
M
Q
 
H
C
 
A
L
 
L
K
 
R
G
 
R
R
 
L
I
 
G
V
 
E
P
 
T
E
 
E
N
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
D
D
 
K
A
 
A
S
 
S
L
 
F
C
 
V
T
 
T
G
 
G
H
x
S
E
x
Y
Y
 
Y
W
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G
W
 
Y

4ureB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
33% identity, 96% coverage: 9:247/248 of query aligns to 3:245/248 of 4ureB

query
sites
4ureB
L
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
T
V
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
G
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
G
 
T
L
 
I
T
 
A
A
 
L
G
 
T
F
 
Y
A
 
A
R
 
A
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
N
V
 
V
I
 
V
F
 
V
L
 
S
D
 
D
I
 
I
A
 
S
D
 
D
E
 
E
D
 
W
S
 
G
R
 
R
A
 
E
L
 
T
E
 
L
A
 
A
E
 
L
L
 
I
A
 
E
G
 
G
S
 
K
P
 
G
I
 
G
P
 
K
P
 
A
V
 
V
Y
 
F
K
 
Q
R
 
H
C
 
A
D
 
D
L
 
T
M
 
A
N
 
H
L
 
P
E
 
E
-
 
D
-
 
H
-
 
D
-
 
E
A
 
L
I
 
I
K
 
A
A
 
A
V
 
A
F
 
K
A
 
R
E
 
A
I
 
F
G
 
G
D
 
R
V
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
-
 
I
N
 
S
D
 
G
D
 
E
R
 
F
H
 
T
K
 
P
L
 
T
A
 
A
D
 
E
V
 
T
T
 
T
G
 
D
A
 
A
Y
 
Q
W
 
W
D
 
Q
E
 
R
R
 
V
I
 
I
N
 
G
V
 
I
N
 
N
L
 
L
R
 
S
H
 
G
M
 
V
L
 
F
F
 
Y
C
 
G
T
 
V
Q
 
R
A
 
A
V
 
Q
A
 
I
P
 
R
G
 
A
M
 
M
K
 
L
K
 
E
R
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
V
N
 
N
F
 
I
G
 
S
S
|
S
I
 
I
S
 
A
W
 
G
H
 
Q
L
 
I
G
 
G
L
 
I
E
 
E
D
 
G
L
x
I
V
 
T
L
 
P
Y
|
Y
E
 
T
T
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
I
 
V
E
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
T
L
 
V
A
 
A
R
 
W
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
P
 
S
D
 
K
D
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
T
 
N
C
 
S
V
 
V
V
 
G
P
|
P
G
x
A
N
 
F
V
 
I
K
 
N
T
 
T
K
 
T
R
 
L
Q
 
V
E
 
Q
K
 
N
W
 
-
Y
 
-
T
 
V
P
 
P
-
 
L
E
 
E
G
 
T
E
 
R
A
 
R
Q
 
Q
I
 
L
V
 
E
A
 
Q
A
 
M
Q
 
H
C
 
A
L
 
L
K
 
R
G
 
R
R
 
L
I
 
G
V
 
E
P
 
T
E
 
E
N
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
D
D
 
K
A
 
A
S
 
S
L
 
F
C
 
V
T
 
T
G
 
G
H
 
S
E
 
Y
Y
 
Y
W
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G
W
 
Y

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
34% identity, 96% coverage: 9:246/248 of query aligns to 5:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
L
 
L
K
 
Q
G
 
D
K
 
K
R
 
V
V
 
A
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
G
 
E
L
 
A
T
 
A
A
 
R
G
 
V
F
 
F
A
 
M
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
I
 
V
F
 
-
L
 
-
D
 
-
I
 
I
A
 
A
D
|
D
E
x
F
D
 
N
S
 
E
R
 
A
A
 
A
L
 
G
E
 
K
A
 
E
E
 
A
L
 
V
A
 
E
G
 
A
S
 
N
P
 
P
I
 
-
P
 
G
P
 
V
V
 
V
Y
 
F
K
 
I
R
 
R
C
x
V
D
|
D
L
x
V
M
 
S
N
 
D
L
 
R
E
 
E
A
 
S
I
 
V
K
 
H
A
 
R
V
 
L
F
 
V
A
 
E
E
 
N
I
 
V
-
 
A
-
 
E
-
 
R
-
 
F
G
 
G
D
 
K
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
N
x
I
D
 
T
D
 
R
R
x
D
H
 
S
K
 
M
L
 
L
A
 
S
D
x
K
V
 
M
T
 
T
G
 
V
A
 
D
Y
 
Q
W
 
F
D
 
Q
E
 
Q
R
 
V
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
|
N
L
 
L
R
 
T
H
 
G
M
 
V
L
 
F
F
 
H
C
 
C
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
Y
M
 
M
K
 
A
K
 
E
R
 
Q
G
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
K
V
 
I
I
 
I
N
 
N
F
x
T
G
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
T
W
 
G
H
 
T
L
 
Y
G
 
G
L
x
N
E
x
V
D
 
G
L
x
Q
V
 
T
L
 
N
Y
|
Y
E
 
A
T
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
I
G
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
K
A
 
T
L
 
W
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
R
D
 
K
D
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
T
 
N
C
 
A
V
 
V
V
 
A
P
|
P
G
 
G
N
x
F
V
x
T
K
 
E
T
|
T
K
 
A
R
x
M
Q
 
V
E
 
A
K
 
E
W
 
-
Y
 
-
T
 
V
P
 
P
E
 
E
G
 
K
E
 
V
A
 
I
Q
 
E
I
x
K
V
 
M
A
 
K
A
 
A
Q
 
Q
C
 
V
L
 
P
K
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
L
-
 
G
V
 
K
P
 
P
E
 
E
N
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
N
L
 
A
V
 
Y
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
D
 
E
A
 
S
S
 
D
L
 
Y
C
 
V
T
 
N
G
 
G
H
 
H
E
 
V
Y
 
L
W
 
H
I
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
34% identity, 97% coverage: 8:247/248 of query aligns to 2:245/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
S
 
T
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
G
 
D
L
 
I
T
 
A
A
 
I
G
 
N
F
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
N
V
 
I
I
 
F
F
 
F
-
x
N
-
x
Y
-
x
N
-
x
G
L
x
S
D
 
P
I
 
E
A
 
A
D
 
A
E
 
E
D
 
E
S
 
T
R
 
A
A
 
K
L
 
L
E
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
-
A
 
H
G
 
G
S
 
V
P
 
E
I
 
V
P
 
E
P
 
A
V
 
M
Y
 
-
K
 
-
R
 
K
C
 
A
D
x
N
L
x
V
M
 
A
N
 
I
L
 
A
E
 
E
A
 
D
I
 
V
K
 
D
A
 
A
V
 
F
F
 
F
A
 
K
E
 
Q
-
 
A
-
 
I
-
 
E
-
 
R
I
 
F
G
 
G
D
 
R
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
N
x
I
D
 
T
D
 
R
R
 
D
H
 
N
K
 
L
L
 
L
A
 
M
D
 
R
V
 
M
T
 
K
G
 
E
A
 
D
Y
 
E
W
 
W
D
 
D
E
 
D
R
 
V
I
 
I
N
 
N
V
x
I
N
 
N
L
 
L
R
 
K
H
 
G
M
 
T
L
 
F
F
 
L
C
 
C
T
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
S
P
 
R
G
 
T
M
 
M
K
 
M
K
 
K
R
 
Q
G
 
R
G
 
A
G
 
G
A
 
K
V
 
I
I
 
I
N
 
N
F
 
M
G
 
A
S
|
S
I
 
V
S
 
V
W
 
G
H
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
N
E
 
A
D
 
G
L
x
Q
V
 
A
L
 
N
Y
|
Y
E
 
V
T
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
T
L
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
D
 
R
D
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
T
 
N
C
 
A
V
 
V
V
 
A
P
|
P
G
 
G
N
 
F
V
x
I
K
 
T
T
|
T
K
 
D
R
 
M
Q
 
T
E
 
D
K
 
K
W
 
L
Y
 
D
T
 
E
P
 
K
E
 
T
G
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
-
I
 
M
V
 
L
A
 
A
A
 
Q
Q
 
I
C
 
P
L
 
L
K
 
G
G
 
A
R
 
Y
I
 
G
V
 
T
P
 
T
E
 
E
N
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
N
L
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
A
A
 
S
S
 
K
L
 
Y
C
 
I
T
 
T
G
 
G
H
 
Q
E
 
T
Y
 
L
W
 
S
I
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G
W
 
M

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
35% identity, 93% coverage: 9:239/248 of query aligns to 6:237/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
L
 
L
K
 
A
G
 
S
K
 
K
R
 
T
V
 
A
V
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
F
G
 
G
L
 
I
T
 
A
A
 
Q
G
 
V
F
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
R
V
 
V
I
 
I
F
 
I
L
 
A
D
|
D
I
 
-
A
x
R
D
 
D
E
 
A
D
 
H
S
 
G
R
 
E
A
 
A
L
 
A
E
 
A
A
 
A
E
 
S
L
 
L
A
 
R
G
 
E
S
 
S
P
 
G
I
 
A
P
 
Q
P
 
A
V
 
L
Y
 
F
K
 
I
R
 
S
C
|
C
D
 
N
L
x
I
M
 
A
N
 
E
L
 
K
E
 
T
A
 
Q
I
 
V
K
 
E
A
 
A
V
 
L
F
 
F
A
 
S
E
 
Q
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
A
I
 
F
G
 
G
D
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
N
x
I
D
 
N
D
 
R
R
 
D
H
 
A
K
 
M
L
 
L
A
 
H
D
 
K
V
 
L
T
 
T
G
 
E
A
 
A
Y
 
D
W
 
W
D
 
D
E
 
T
R
 
V
I
 
I
N
 
D
V
|
V
N
 
N
L
 
L
R
 
K
H
 
G
M
 
T
L
 
F
F
 
L
C
 
C
T
 
M
Q
 
Q
A
 
Q
V
 
A
A
 
A
P
 
I
G
 
R
M
 
M
K
 
R
K
 
E
R
 
R
G
 
G
G
 
A
G
 
G
A
 
R
V
 
I
I
 
I
N
 
N
F
 
I
G
 
A
S
 
S
I
 
A
S
 
S
W
 
W
H
 
-
L
 
L
G
 
G
L
 
N
E
 
V
D
 
G
L
 
Q
V
 
T
L
 
N
Y
|
Y
E
 
S
T
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
V
G
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
K
A
 
T
L
 
A
A
 
C
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
K
D
 
K
D
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
T
 
N
C
 
A
V
 
I
V
 
C
P
 
P
G
 
G
N
 
F
V
x
I
K
 
D
T
|
T
K
 
D
R
 
M
Q
x
T
E
 
R
K
 
G
W
 
-
Y
 
-
T
 
V
P
 
P
E
 
E
G
 
N
E
 
V
A
 
W
Q
 
Q
I
 
I
V
 
M
A
 
V
A
 
S
Q
 
K
C
 
I
L
 
P
K
 
A
G
 
G
R
 
Y
I
 
A
-
 
G
V
 
E
P
 
A
E
 
K
N
 
D
V
 
V
A
 
G
A
 
E
L
 
C
V
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
A
S
 
R
L
 
Y
C
 
I
T
 
N
G
 
G
H
 
E

4fn4A Short-chain NAD(h)-dependent dehydrogenase/reductase from sulfolobus acidocaldarius (see paper)
32% identity, 98% coverage: 6:247/248 of query aligns to 2:251/254 of 4fn4A

query
sites
4fn4A
Y
 
Y
P
 
Q
S
 
S
L
 
L
K
 
K
G
 
N
K
 
K
R
 
V
V
 
V
V
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
G
 
A
L
 
I
T
 
A
A
 
K
G
 
K
F
 
F
A
 
A
R
 
L
Q
 
N
G
 
D
A
 
S
E
 
I
V
 
V
I
 
V
F
 
A
L
 
V
D
x
E
I
x
L
A
 
L
D
 
E
E
 
D
D
x
R
S
 
L
R
 
N
A
 
Q
L
 
I
E
 
V
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
R
G
 
G
S
 
M
P
 
G
I
 
K
P
 
E
P
 
V
V
 
L
Y
 
G
K
 
V
R
 
K
C
x
A
D
|
D
L
x
V
M
 
S
N
 
K
L
 
K
-
 
K
-
 
D
-
 
V
-
 
E
E
 
E
A
 
F
I
 
V
K
 
R
A
 
R
V
 
T
F
 
F
A
 
E
E
 
T
I
 
Y
G
 
S
D
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
-
x
I
N
 
M
D
 
D
D
 
G
R
 
V
H
 
T
K
 
P
L
 
V
A
 
A
D
 
E
V
 
V
T
 
S
G
 
D
A
 
E
Y
 
L
W
 
W
D
 
E
E
 
R
R
 
V
I
 
L
N
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
Y
H
 
S
M
 
A
L
 
F
F
 
Y
C
 
S
T
 
S
Q
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
G
 
I
M
 
M
K
 
L
K
 
K
R
 
Q
G
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
I
I
 
V
N
 
N
F
x
T
G
 
A
S
|
S
I
 
I
S
 
A
W
 
G
H
 
I
L
 
R
G
 
G
L
 
G
E
 
F
D
 
A
L
 
G
V
 
A
L
 
P
Y
|
Y
E
 
T
T
 
V
A
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
I
 
L
E
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
S
L
 
I
A
 
A
R
 
A
E
 
H
L
 
Y
G
 
G
P
 
D
D
 
Q
D
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
A
T
 
V
C
 
A
V
 
V
V
 
L
P
|
P
G
 
G
N
 
T
V
|
V
K
 
K
T
|
T
K
x
N
R
x
I
Q
 
G
E
 
L
K
 
G
W
 
S
Y
 
S
T
 
K
P
 
P
E
x
S
-
 
E
-
 
L
G
 
G
E
 
M
A
 
R
Q
 
T
I
 
L
V
 
T
A
 
K
A
 
L
Q
 
M
C
 
S
L
 
L
K
 
S
G
 
S
R
 
R
I
 
L
V
 
A
-
 
E
P
 
P
E
 
E
N
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
N
L
 
V
V
 
I
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
S
 
S
L
 
F
C
 
V
T
 
N
G
 
G
H
 
D
E
 
A
Y
 
V
W
 
V
I
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G
W
 
L

3ak4A Crystal structure of nadh-dependent quinuclidinone reductase from agrobacterium tumefaciens
35% identity, 97% coverage: 9:248/248 of query aligns to 5:256/258 of 3ak4A

query
sites
3ak4A
L
 
L
K
 
S
G
 
G
K
 
R
R
 
K
V
 
A
V
 
I
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
S
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
I
T
 
A
A
 
R
G
 
A
F
 
L
A
 
D
R
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
T
V
 
V
I
 
A
F
 
-
L
 
-
D
 
-
I
 
I
A
 
A
D
|
D
E
x
L
D
 
D
S
 
V
R
 
M
A
 
A
L
 
A
E
 
Q
A
 
A
E
 
V
L
 
V
A
 
A
G
 
G
S
 
L
P
 
E
I
 
N
P
 
G
P
 
G
V
 
F
Y
 
A
K
 
V
R
 
E
C
x
V
D
|
D
L
x
V
M
 
T
N
 
K
L
 
R
E
 
A
A
 
S
I
 
V
K
 
D
A
 
A
V
 
A
F
 
M
A
 
Q
E
 
K
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
A
I
 
L
G
 
G
D
 
G
V
 
F
D
 
D
V
 
L
L
 
L
V
 
C
N
 
A
N
|
N
A
|
A
G
|
G
N
 
V
D
 
S
D
 
T
R
 
M
H
 
R
K
 
P
L
 
A
A
 
V
D
 
D
V
 
I
T
 
T
G
 
D
A
 
E
Y
 
E
W
 
W
D
 
D
E
 
F
R
 
N
I
 
F
N
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
A
R
 
R
H
 
G
M
 
V
L
 
F
F
 
L
C
 
A
T
 
N
Q
 
Q
-
 
I
A
 
A
V
 
C
A
 
R
P
 
H
G
 
F
M
 
L
K
 
A
K
 
S
R
 
N
G
 
T
G
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
I
I
 
V
N
 
N
F
x
T
G
 
A
S
|
S
I
 
L
S
 
A
W
 
A
H
 
K
L
 
V
G
 
G
L
 
A
E
 
P
D
 
L
L
|
L
V
 
A
L
 
H
Y
|
Y
E
 
S
T
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
F
G
 
A
I
 
V
E
 
F
G
 
G
M
 
W
T
 
T
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
M
G
 
A
P
 
P
D
 
K
D
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
T
 
N
C
 
C
V
 
V
V
 
C
P
 
P
G
|
G
N
 
F
V
|
V
K
 
K
T
|
T
K
 
A
R
x
M
Q
 
Q
E
 
E
K
 
R
-
 
E
-
 
I
-
 
I
W
 
W
-
x
E
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
R
-
 
G
Y
 
M
T
 
T
P
 
P
E
 
E
G
 
A
-
 
V
E
 
R
A
 
A
Q
 
E
I
 
Y
V
 
V
A
 
S
A
 
L
Q
 
T
C
 
P
L
 
L
K
 
-
G
 
G
R
 
R
I
 
I
-
 
E
V
 
E
P
 
P
E
 
E
N
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
D
L
 
V
V
 
V
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
A
A
 
A
S
 
R
L
 
F
C
 
M
T
 
T
G
 
G
H
 
Q
E
 
G
Y
 
I
W
 
N
I
 
V
D
 
T
A
 
G
G
 
G
W
 
V
R
 
R

4nbwA Crystal structure of fabg from plesiocystis pacifica (see paper)
36% identity, 95% coverage: 12:246/248 of query aligns to 1:248/253 of 4nbwA

query
sites
4nbwA
K
 
K
R
 
R
V
 
V
-
 
A
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
G
 
A
L
 
T
T
 
A
A
 
L
G
 
E
F
 
F
A
 
A
R
 
Q
Q
 
A
G
 
G
A
 
Y
E
 
H
V
 
V
I
 
V
F
 
A
L
 
W
D
|
D
I
x
L
A
 
A
D
 
E
E
 
E
D
 
A
S
 
G
R
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
I
A
 
A
G
 
D
S
 
A
P
 
G
I
 
G
P
 
S
P
 
A
V
 
D
Y
 
F
K
 
A
R
 
R
C
x
V
D
|
D
L
x
V
M
 
S
N
 
A
L
 
A
E
 
E
A
 
S
I
 
V
K
 
E
A
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
E
V
 
I
F
 
I
A
 
A
E
 
E
I
 
H
G
 
G
D
 
R
V
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
N
 
I
D
 
L
D
 
H
R
 
D
H
 
G
K
 
Q
L
 
L
A
 
V
D
 
K
V
 
V
T
 
K
G
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
V
-
 
K
-
 
K
-
 
M
-
 
A
-
 
E
A
 
A
Y
 
Q
W
 
F
D
 
D
E
 
A
R
 
V
I
 
I
N
 
S
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
K
H
 
G
M
 
V
L
 
F
F
 
L
C
 
C
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
H
M
 
M
K
 
I
K
 
A
R
 
A
G
 
K
G
 
Y
G
 
G
A
 
R
V
 
I
I
 
L
N
 
N
F
 
A
G
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
V
W
 
G
H
 
L
L
 
Y
G
 
G
L
 
N
E
 
F
D
 
G
L
 
Q
V
 
T
L
 
N
Y
|
Y
E
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
S
G
 
G
I
 
V
E
 
I
G
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
K
A
 
V
L
 
W
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
R
D
 
Y
D
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
T
 
N
C
 
A
V
 
I
V
 
A
P
 
P
G
 
G
N
 
F
V
x
I
K
 
A
T
|
T
K
 
E
R
 
M
Q
 
V
E
 
Q
K
 
Q
W
 
M
Y
 
-
T
 
-
P
 
P
E
 
E
G
 
R
E
 
V
A
 
L
Q
 
E
I
 
A
V
 
M
A
 
V
A
 
A
Q
 
R
C
 
T
L
 
P
K
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
G
-
 
D
P
 
P
E
 
V
N
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
R
L
 
A
V
 
Y
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
D
 
E
A
 
S
S
 
G
L
 
F
C
 
I
T
 
S
G
 
G
H
 
T
E
 
T
Y
 
L
W
 
S
I
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G

7wbcA Hydroxysteroid dehydrogenase wild-type complexed with NAD+ and (4s)-2- 2-methyl-2,4-pentanediol
34% identity, 96% coverage: 9:246/248 of query aligns to 3:245/250 of 7wbcA

query
sites
7wbcA
L
 
L
K
 
R
G
 
G
K
 
K
R
 
T
V
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
S
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
G
 
A
L
 
V
T
 
T
A
 
R
G
 
V
F
 
F
A
 
V
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
R
V
 
V
I
 
L
F
 
F
L
 
V
D
|
D
I
x
V
A
 
D
D
 
D
E
 
D
D
 
R
S
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
S
E
 
E
L
 
L
A
 
T
G
 
G
S
 
A
P
 
G
I
 
G
P
 
E
P
 
A
V
 
K
Y
 
F
K
 
L
R
 
Q
C
x
A
D
|
D
L
x
I
M
 
S
N
 
R
L
 
R
E
 
E
A
 
S
I
 
A
-
 
D
-
 
Q
-
 
I
-
 
R
K
 
D
A
 
A
V
 
A
F
 
V
A
 
A
E
 
A
I
 
F
G
 
G
D
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
H
N
 
A
D
 
S
D
 
R
R
 
Q
H
 
A
K
 
L
L
 
L
A
 
V
D
 
E
V
 
H
T
 
T
G
 
P
A
 
E
Y
 
M
W
 
F
D
 
E
E
 
L
R
 
S
I
 
F
N
 
G
V
 
T
N
 
G
L
 
F
R
x
Y
H
x
P
M
 
T
L
 
V
F
x
H
C
 
L
T
 
M
Q
 
Q
A
 
A
V
 
C
A
 
Y
P
 
P
G
 
Q
M
 
L
K
 
K
K
 
Q
R
 
-
G
 
A
G
 
R
G
 
G
A
 
S
V
 
V
I
 
V
N
 
N
F
|
F
G
 
G
S
|
S
I
 
G
S
 
S
W
 
A
H
 
L
L
 
D
G
 
G
L
 
M
E
 
P
D
 
T
L
 
Q
V
 
T
L
 
S
Y
|
Y
E
 
A
T
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
E
G
 
A
I
 
I
E
 
R
G
 
A
M
 
V
T
 
S
R
 
R
A
 
V
L
 
A
A
 
A
R
 
N
E
 
E
L
 
W
G
 
A
P
 
A
D
 
D
D
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
T
 
N
C
 
V
V
 
V
V
 
C
P
|
P
G
 
-
N
x
F
V
x
A
K
 
A
T
|
T
K
 
E
R
x
G
Q
x
V
E
 
Q
K
 
A
W
 
W
Y
 
Q
T
 
Q
-
 
A
-
 
F
P
 
P
E
 
D
G
 
R
E
 
A
A
 
A
Q
 
A
I
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
K
Q
 
V
C
 
P
L
 
L
K
 
Q
G
 
R
R
 
I
I
 
G
V
 
D
P
 
P
E
 
E
-
 
T
N
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
P
L
 
V
V
 
V
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
S
S
 
K
L
 
Y
C
 
M
T
 
T
G
 
G
H
 
Q
E
 
T
Y
 
L
W
 
M
I
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G

3rwbA Crystal structure of complex of 4pal (4-pyridoxolactone) and pldh (tetrameric pyridoxal 4-dehydrogenase) from mesorhizobium loti
36% identity, 96% coverage: 9:246/248 of query aligns to 4:243/247 of 3rwbA

query
sites
3rwbA
L
 
L
K
 
A
G
 
G
K
 
K
R
 
T
V
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
S
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
K
G
 
A
L
 
I
T
 
A
A
 
A
G
 
R
F
 
L
A
 
A
R
 
A
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
T
V
 
V
I
 
I
F
 
V
L
 
S
D
|
D
I
|
I
A
 
N
D
 
A
E
 
E
D
 
G
S
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
A
E
 
A
A
 
A
E
 
S
L
 
I
A
 
-
G
 
G
S
 
K
P
 
K
I
 
A
P
 
R
P
 
A
V
 
I
Y
 
A
K
 
-
R
 
-
C
 
A
D
|
D
L
x
I
M
 
S
N
 
D
L
 
P
E
 
G
A
 
S
I
 
V
K
 
K
A
 
A
V
 
L
F
 
F
A
 
A
E
 
E
I
 
I
-
 
Q
-
 
A
-
 
L
-
 
T
G
 
G
D
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
S
N
 
I
D
 
V
D
 
P
R
 
F
H
 
V
K
 
A
L
 
W
A
 
D
D
 
D
V
 
V
T
 
D
G
 
L
A
 
D
Y
 
H
W
 
W
D
 
R
E
 
K
R
 
I
I
 
I
N
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
T
H
 
G
M
 
T
L
 
F
F
 
I
C
 
V
T
 
T
Q
 
R
A
 
A
V
 
G
A
 
T
P
 
D
G
 
Q
M
 
M
K
 
R
K
 
A
R
 
A
G
 
G
-
 
K
G
 
A
G
 
G
A
 
R
V
 
V
I
 
I
N
 
S
F
x
I
G
 
A
S
|
S
I
x
N
S
x
T
W
 
F
H
 
F
L
 
A
G
 
G
L
 
T
E
 
P
D
 
N
L
x
M
V
 
A
L
 
A
Y
|
Y
E
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
G
I
 
V
E
 
I
G
 
G
M
 
F
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
T
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
K
D
 
Y
D
 
N
I
 
I
R
 
T
V
 
A
T
 
N
C
 
A
V
 
V
V
 
T
P
|
P
G
 
G
N
x
L
V
x
I
K
 
E
T
x
S
K
 
D
R
x
G
Q
x
V
E
 
K
K
 
A
W
 
S
Y
 
P
T
x
H
P
 
N
E
 
E
G
 
A
E
 
F
A
 
G
Q
 
F
I
 
V
V
 
E
A
 
M
A
 
L
Q
 
Q
C
 
A
L
 
M
K
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
G
V
 
Q
P
 
P
E
 
E
N
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
D
L
 
V
V
 
V
L
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
S
 
R
L
 
W
C
 
I
T
 
T
G
 
G
H
 
Q
E
 
T
Y
 
L
W
 
N
I
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G

3ndrA Crystal structure of tetrameric pyridoxal 4-dehydrogenase from mesorhizobium loti
36% identity, 96% coverage: 9:246/248 of query aligns to 4:243/247 of 3ndrA

query
sites
3ndrA
L
 
L
K
 
A
G
 
G
K
 
K
R
 
T
V
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
S
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
K
G
 
A
L
 
I
T
 
A
A
 
A
G
 
R
F
 
L
A
 
A
R
 
A
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
T
V
 
V
I
 
I
F
 
V
L
 
S
D
|
D
I
|
I
A
 
N
D
 
A
E
 
E
D
 
G
S
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
A
E
 
A
A
 
A
E
 
S
L
 
I
A
 
-
G
 
G
S
 
K
P
 
K
I
 
A
P
 
R
P
 
A
V
 
I
Y
 
A
K
 
-
R
 
-
C
 
A
D
|
D
L
x
I
M
 
S
N
 
D
L
 
P
E
 
G
A
 
S
I
 
V
K
 
K
A
 
A
V
 
L
F
 
F
A
 
A
E
 
E
I
 
I
-
 
Q
-
 
A
-
 
L
-
 
T
G
 
G
D
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
S
N
 
I
D
 
V
D
 
P
R
 
F
H
 
V
K
 
A
L
 
W
A
 
D
D
 
D
V
 
V
T
 
D
G
 
L
A
 
D
Y
 
H
W
 
W
D
 
R
E
 
K
R
 
I
I
 
I
N
 
D
V
|
V
N
 
N
L
 
L
R
 
T
H
 
G
M
 
T
L
 
F
F
 
I
C
 
V
T
 
T
Q
 
R
A
 
A
V
 
G
A
 
T
P
 
D
G
 
Q
M
 
M
K
 
R
K
 
A
R
 
A
G
 
G
-
 
K
G
 
A
G
 
G
A
 
R
V
 
V
I
 
I
N
 
S
F
x
I
G
 
A
S
|
S
I
 
N
S
 
T
W
 
F
H
 
F
L
 
A
G
 
G
L
 
T
E
 
P
D
 
N
L
 
M
V
 
A
L
 
A
Y
|
Y
E
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
G
I
 
V
E
 
I
G
 
G
M
 
F
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
T
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
K
D
 
Y
D
 
N
I
 
I
R
 
T
V
 
A
T
 
N
C
 
A
V
 
V
V
 
T
P
|
P
G
 
G
N
x
L
V
x
I
K
 
E
T
x
S
K
 
D
R
x
G
Q
x
V
E
 
K
K
 
A
W
 
S
Y
 
P
T
 
H
P
 
N
E
 
E
G
 
A
E
 
F
A
 
G
Q
 
F
I
 
V
V
 
E
A
 
M
A
 
L
Q
 
Q
C
 
A
L
 
M
K
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
G
V
 
Q
P
 
P
E
 
E
N
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
D
L
 
V
V
 
V
L
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
S
 
R
L
 
W
C
 
I
T
 
T
G
 
G
H
 
Q
E
 
T
Y
 
L
W
 
N
I
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G

P9WGT1 3-alpha-(or 20-beta)-hydroxysteroid dehydrogenase; NADH-dependent 3alpha, 20beta-hydroxysteroid dehydrogenase; EC 1.1.1.53 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
34% identity, 96% coverage: 9:246/248 of query aligns to 5:237/260 of P9WGT1

query
sites
P9WGT1
L
 
L
K
x
I
G
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
A
S
x
R
G
|
G
I
x
M
G
 
G
A
 
A
G
 
S
L
 
H
T
 
V
A
 
R
G
 
A
F
 
M
A
 
V
R
 
A
Q
 
E
G
 
G
A
 
A