SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CCNA_01199 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_01199 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4b2xB Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
75% identity, 99% coverage: 2:286/289 of query aligns to 13:297/302 of 4b2xB

query
sites
4b2xB
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
R
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
Y
|
Y
F
 
Y
G
 
G
H
 
H
G
 
D
I
 
F
T
 
H
N
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
G
R
 
S
A
 
A
M
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
K
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
Q
 
G
M
 
G
T
 
K
A
 
A
L
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
V
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
E
 
Q
F
 
F
V
 
I
R
 
A
V
 
T
L
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
K
 
K
I
 
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
R
K
x
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
P
L
 
L
G
 
A
K
 
K
S
 
N
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
T
 
R
V
 
L
I
 
L

5fuhA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
75% identity, 99% coverage: 2:286/289 of query aligns to 9:293/298 of 5fuhA

query
sites
5fuhA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
|
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
R
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
Y
|
Y
F
 
Y
G
|
G
H
 
H
G
 
D
I
x
F
T
 
H
N
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
G
R
 
S
A
 
A
M
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
K
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
Q
 
G
M
 
G
T
 
K
A
 
A
L
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
V
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
E
 
Q
F
 
F
V
 
I
R
 
A
V
 
T
L
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
K
 
K
I
 
V
A
|
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
x
R
K
x
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
P
L
 
L
G
 
A
K
 
K
S
 
N
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
T
 
R
V
 
L
I
 
L

4b4bA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
75% identity, 99% coverage: 2:286/289 of query aligns to 9:293/298 of 4b4bA

query
sites
4b4bA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
R
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
Y
 
Y
F
 
Y
G
 
G
H
 
H
G
 
D
I
 
F
T
 
H
N
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
G
R
 
S
A
 
A
M
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
K
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
Q
 
G
M
 
G
T
 
K
A
 
A
L
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
V
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
E
 
Q
F
 
F
V
 
I
R
 
A
V
 
T
L
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
K
 
K
I
x
V
A
|
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
x
R
K
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
P
L
 
L
G
 
A
K
 
K
S
 
N
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
T
 
R
V
 
L
I
 
L

4asjA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
75% identity, 99% coverage: 2:286/289 of query aligns to 3:287/292 of 4asjA

query
sites
4asjA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
R
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
Y
|
Y
F
 
Y
G
|
G
H
 
H
G
 
D
I
x
F
T
 
H
N
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
G
R
 
S
A
 
A
M
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
K
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
Q
 
G
M
 
G
T
 
K
A
|
A
L
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
V
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
|
V
E
 
E
L
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
E
 
Q
F
 
F
V
 
I
R
 
A
V
 
T
L
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
K
 
K
I
x
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
R
K
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
P
L
 
L
G
 
A
K
 
K
S
 
N
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
T
 
R
V
 
L
I
 
L

1g3lA The structural basis of the catalytic mechanism and regulation of glucose-1-phosphate thymidylyltransferase (rmla). Tdp-l-rhamnose complex. (see paper)
75% identity, 99% coverage: 2:286/289 of query aligns to 3:287/292 of 1g3lA

query
sites
1g3lA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
|
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
R
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
|
Q
P
 
P
S
 
S
P
|
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
L
Y
 
Y
F
x
Y
G
|
G
H
|
H
G
x
D
I
x
F
T
x
H
N
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
G
R
 
S
A
 
A
M
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
K
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
Q
 
G
M
 
G
T
 
K
A
 
A
L
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
K
 
L
V
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
|
V
T
|
T
G
|
G
L
 
L
Y
|
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
|
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
M
 
M
G
|
G
R
|
R
G
|
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
E
 
Q
F
 
F
V
 
I
R
 
A
V
 
T
L
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
K
 
K
I
 
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
x
R
K
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
P
L
 
L
G
 
A
K
 
K
S
 
N
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
T
 
R
V
 
L
I
 
L

1g2vA The structural basis of the catalytic mechanism and regulation of glucose-1-phosphate thymidylyltransferase (rmla). Ttp complex. (see paper)
75% identity, 99% coverage: 2:286/289 of query aligns to 3:287/292 of 1g2vA

query
sites
1g2vA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
|
A
G
|
G
G
|
G
S
 
S
G
|
G
T
|
T
R
|
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
|
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
R
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
|
Q
P
 
P
S
 
S
P
|
P
D
 
D
G
 
G
L
|
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
L
Y
 
Y
F
x
Y
G
|
G
H
|
H
G
x
D
I
x
F
T
x
H
N
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
G
R
 
S
A
 
A
M
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
K
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
Q
 
G
M
 
G
T
 
K
A
 
A
L
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
V
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
M
 
M
G
|
G
R
|
R
G
|
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
E
 
Q
F
 
F
V
 
I
R
 
A
V
 
T
L
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
K
 
K
I
 
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
R
K
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
P
L
 
L
G
 
A
K
 
K
S
 
N
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
T
 
R
V
 
L
I
 
L

1g1lA The structural basis of the catalytic mechanism and regulation of glucose-1-phosphate thymidylyltransferase (rmla). Tdp-glucose complex. (see paper)
75% identity, 99% coverage: 2:286/289 of query aligns to 3:287/292 of 1g1lA

query
sites
1g1lA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
|
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
|
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
R
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
|
Q
P
 
P
S
 
S
P
|
P
D
 
D
G
|
G
L
|
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
|
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
L
Y
 
Y
F
x
Y
G
|
G
H
|
H
G
x
D
I
x
F
T
x
H
N
x
E
L
 
L
F
 
L
T
 
G
R
 
S
A
 
A
M
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
K
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
Q
 
G
M
 
G
T
 
K
A
 
A
L
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
K
 
L
V
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
|
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
M
 
M
G
|
G
R
|
R
G
|
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
E
 
Q
F
 
F
V
 
I
R
 
A
V
 
T
L
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
K
 
K
I
x
V
A
|
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
x
R
K
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
P
L
 
L
G
 
A
K
 
K
S
 
N
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
T
 
R
V
 
L
I
 
L

Sites not aligning to the query:

1g0rA The structural basis of the catalytic mechanism and regulation of glucose-1-phosphate thymidylyltransferase (rmla). Thymidine/glucose- 1-phosphate complex. (see paper)
75% identity, 99% coverage: 2:286/289 of query aligns to 3:287/292 of 1g0rA

query
sites
1g0rA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
R
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
|
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
Y
 
Y
F
 
Y
G
 
G
H
 
H
G
 
D
I
 
F
T
 
H
N
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
G
R
 
S
A
 
A
M
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
K
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
Q
 
G
M
 
G
T
 
K
A
 
A
L
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
K
 
L
V
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
|
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
E
 
Q
F
 
F
V
 
I
R
 
A
V
 
T
L
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
K
 
K
I
 
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
R
K
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
P
L
 
L
G
 
A
K
 
K
S
 
N
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
T
 
R
V
 
L
I
 
L

1fxoA The structural basis of the catalytic mechanism and regulation of glucose-1-phosphate thymidylyltransferase (rmla). Tmp complex. (see paper)
75% identity, 99% coverage: 2:286/289 of query aligns to 3:287/292 of 1fxoA

query
sites
1fxoA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
|
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
|
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
R
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
|
Q
P
 
P
S
 
S
P
|
P
D
 
D
G
|
G
L
|
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
L
Y
 
Y
F
x
Y
G
|
G
H
|
H
G
x
D
I
 
F
T
 
H
N
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
G
R
 
S
A
 
A
M
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
K
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
Q
 
G
M
 
G
T
 
K
A
 
A
L
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
V
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
M
 
M
G
|
G
R
|
R
G
|
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
E
 
Q
F
 
F
V
 
I
R
 
A
V
 
T
L
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
K
 
K
I
x
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
x
R
K
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
P
L
 
L
G
 
A
K
 
K
S
 
N
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
T
 
R
V
 
L
I
 
L

3zllA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
75% identity, 99% coverage: 2:286/289 of query aligns to 8:292/297 of 3zllA

query
sites
3zllA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
R
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
Y
 
Y
F
 
Y
G
 
G
H
 
H
G
 
D
I
 
F
T
 
H
N
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
G
R
 
S
A
 
A
M
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
K
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
Q
 
G
M
 
G
T
 
K
A
 
A
L
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
V
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
E
 
Q
F
 
F
V
 
I
R
 
A
V
 
T
L
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
K
 
K
I
 
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
x
R
K
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
P
L
 
L
G
 
A
K
 
K
S
 
N
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
T
 
R
V
 
L
I
 
L

3zlkA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
75% identity, 99% coverage: 2:286/289 of query aligns to 8:292/297 of 3zlkA

query
sites
3zlkA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
R
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
Y
|
Y
F
x
Y
G
|
G
H
 
H
G
 
D
I
 
F
T
 
H
N
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
G
R
 
S
A
 
A
M
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
K
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
Q
 
G
M
 
G
T
 
K
A
 
A
L
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
V
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
E
 
Q
F
 
F
V
 
I
R
 
A
V
 
T
L
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
K
 
K
I
x
V
A
|
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
R
K
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
P
L
 
L
G
 
A
K
 
K
S
 
N
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
T
 
R
V
 
L
I
 
L

4b4mA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
75% identity, 99% coverage: 2:286/289 of query aligns to 7:291/296 of 4b4mA

query
sites
4b4mA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
R
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
Y
|
Y
F
 
Y
G
|
G
H
 
H
G
 
D
I
 
F
T
 
H
N
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
G
R
 
S
A
 
A
M
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
K
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
Q
 
G
M
 
G
T
 
K
A
 
A
L
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
V
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
E
 
Q
F
 
F
V
 
I
R
 
A
V
 
T
L
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
K
 
K
I
x
V
A
|
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
x
R
K
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
P
L
 
L
G
 
A
K
 
K
S
 
N
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
T
 
R
V
 
L
I
 
L

4arwA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
75% identity, 99% coverage: 2:286/289 of query aligns to 5:289/294 of 4arwA

query
sites
4arwA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
R
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
Y
|
Y
F
x
Y
G
|
G
H
 
H
G
 
D
I
 
F
T
 
H
N
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
G
R
 
S
A
 
A
M
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
K
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
Q
 
G
M
 
G
T
 
K
A
 
A
L
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
V
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
E
 
Q
F
 
F
V
 
I
R
 
A
V
 
T
L
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
K
 
K
I
x
V
A
|
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
R
K
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
P
L
 
L
G
 
A
K
 
K
S
 
N
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
T
 
R
V
 
L
I
 
L

5fu8A Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
75% identity, 99% coverage: 2:286/289 of query aligns to 8:292/297 of 5fu8A

query
sites
5fu8A
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
R
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
Y
|
Y
F
x
Y
G
|
G
H
 
H
G
 
D
I
 
F
T
x
H
N
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
G
R
 
S
A
 
A
M
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
K
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
Q
 
G
M
 
G
T
 
K
A
 
A
L
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
V
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
E
 
Q
F
 
F
V
 
I
R
 
A
V
 
T
L
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
K
 
K
I
x
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
x
R
K
x
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
P
L
 
L
G
 
A
K
 
K
S
 
N
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
T
 
R
V
 
L
I
 
L

4b5bA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
75% identity, 99% coverage: 2:286/289 of query aligns to 4:288/293 of 4b5bA

query
sites
4b5bA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
R
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
Y
|
Y
F
 
Y
G
|
G
H
 
H
G
 
D
I
 
F
T
 
H
N
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
G
R
 
S
A
 
A
M
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
K
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
Q
 
G
M
 
G
T
 
K
A
 
A
L
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
V
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
E
 
Q
F
 
F
V
 
I
R
 
A
V
 
T
L
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
K
 
K
I
x
V
A
|
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
R
K
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
P
L
 
L
G
 
A
K
 
K
S
 
N
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
T
 
R
V
 
L
I
 
L

4b4gA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
75% identity, 99% coverage: 2:286/289 of query aligns to 4:288/293 of 4b4gA

query
sites
4b4gA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
R
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
Y
|
Y
F
 
Y
G
|
G
H
 
H
G
 
D
I
x
F
T
 
H
N
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
G
R
 
S
A
 
A
M
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
K
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
Q
 
G
M
 
G
T
 
K
A
 
A
L
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
V
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
E
 
Q
F
 
F
V
 
I
R
 
A
V
 
T
L
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
K
 
K
I
x
V
A
|
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
x
R
K
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
P
L
 
L
G
 
A
K
 
K
S
 
N
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
T
 
R
V
 
L
I
 
L

4b42A Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
75% identity, 99% coverage: 2:286/289 of query aligns to 4:288/293 of 4b42A

query
sites
4b42A
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
R
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
Y
|
Y
F
 
Y
G
 
G
H
 
H
G
 
D
I
x
F
T
 
H
N
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
G
R
 
S
A
 
A
M
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
K
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
Q
 
G
M
 
G
T
 
K
A
 
A
L
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
V
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
E
 
Q
F
 
F
V
 
I
R
 
A
V
 
T
L
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
K
 
K
I
x
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
R
K
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
P
L
 
L
G
 
A
K
 
K
S
 
N
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
T
 
R
V
 
L
I
 
L

4b3uA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
75% identity, 99% coverage: 2:286/289 of query aligns to 10:294/299 of 4b3uA

query
sites
4b3uA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
R
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
Y
 
Y
F
 
Y
G
 
G
H
 
H
G
 
D
I
 
F
T
 
H
N
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
G
R
 
S
A
 
A
M
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
K
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
Q
 
G
M
 
G
T
 
K
A
 
A
L
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
V
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
E
 
Q
F
 
F
V
 
I
R
 
A
V
 
T
L
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
K
 
K
I
 
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
x
R
K
x
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
P
L
 
L
G
 
A
K
 
K
S
 
N
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
T
 
R
V
 
L
I
 
L

4b2wA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
75% identity, 99% coverage: 2:286/289 of query aligns to 8:292/297 of 4b2wA

query
sites
4b2wA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
R
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
Y
 
Y
F
 
Y
G
 
G
H
 
H
G
 
D
I
 
F
T
 
H
N
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
G
R
 
S
A
 
A
M
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
K
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
Q
 
G
M
 
G
T
 
K
A
 
A
L
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
V
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
E
 
Q
F
 
F
V
 
I
R
 
A
V
 
T
L
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
K
 
K
I
 
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
x
R
K
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
P
L
 
L
G
 
A
K
 
K
S
 
N
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
T
 
R
V
 
L
I
 
L

4asyA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
75% identity, 99% coverage: 2:286/289 of query aligns to 4:288/293 of 4asyA

query
sites
4asyA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
R
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
N
 
R
F
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
Y
|
Y
F
 
Y
G
|
G
H
 
H
G
 
D
I
 
F
T
 
H
N
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
G
R
 
S
A
 
A
M
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
K
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
Q
 
G
M
 
G
T
 
K
A
 
A
L
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
V
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
E
 
Q
F
 
F
V
 
I
R
 
A
V
 
T
L
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
K
 
K
I
x
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
R
K
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
P
L
 
L
G
 
A
K
 
K
S
 
N
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
T
 
R
V
 
L
I
 
L

Query Sequence

>CCNA_01199 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_01199
MKGIILAGGSGTRLHPMTLVTSKQLMPVYDKPMIYYPLSTLMLAGIREILIISTPRDTPN
FQALLGDGSQWGLDIQYAVQPSPDGLAQAYVIGADFVGRDPSALILGDNIYFGHGITNLF
TRAMARPKGATVFAYHVNDPERYGVVEFDKQMTALSIEEKPKVPKSNWAVTGLYFYDGDV
VDIARDLKPSARGELEITDVNRAYLERGDLSVELMGRGYAWLDTGTPDSLLEAAEFVRVL
EKRQGFKIACPEEVAYQKGFIDAAQVERLADALGKSAYGSYLRTVIGVR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory