SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CCNA_01345 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_01345 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1vl8B Crystal structure of gluconate 5-dehydrogenase (tm0441) from thermotoga maritima at 2.07 a resolution
40% identity, 97% coverage: 8:258/260 of query aligns to 1:250/252 of 1vl8B

query
sites
1vl8B
L
 
V
F
 
F
D
 
D
L
 
L
T
 
R
G
 
G
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
S
 
S
R
|
R
G
|
G
L
|
L
G
 
G
L
 
F
Q
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
Q
A
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Y
 
A
G
 
G
A
 
C
A
 
S
V
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
A
A
x
S
R
|
R
K
 
N
Q
 
L
G
 
E
E
 
E
L
 
A
D
 
S
A
 
E
A
 
A
V
 
A
A
 
Q
A
 
K
L
 
L
T
 
T
A
 
E
E
 
K
-
 
Y
G
 
G
R
 
V
T
 
E
A
 
T
V
 
M
G
 
A
L
 
F
V
 
R
A
x
C
D
|
D
L
x
V
G
 
S
Q
 
N
A
 
Y
G
 
E
S
 
E
A
 
V
Q
 
K
D
 
K
L
 
L
T
 
L
A
 
E
R
 
A
V
 
V
L
 
K
E
 
E
R
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
L
D
 
D
I
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
A
x
I
A
 
N
W
 
R
G
 
R
A
 
H
P
 
P
A
 
A
E
 
E
D
 
E
Y
 
F
P
 
P
L
 
L
E
 
D
G
 
E
W
 
F
N
 
R
K
 
Q
V
 
V
M
 
I
D
 
E
L
x
V
N
 
N
V
 
L
T
 
F
G
 
G
L
 
-
F
 
-
L
 
-
L
 
-
T
 
T
Q
 
Y
A
 
Y
V
 
V
A
 
C
R
 
R
E
 
E
A
 
A
F
 
F
-
 
S
-
 
L
L
 
L
K
 
R
Q
 
E
G
 
S
K
 
D
G
 
N
-
 
P
A
 
S
V
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
G
S
|
S
I
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
L
Q
 
T
G
 
V
H
 
E
H
 
E
H
 
V
S
 
T
Q
 
M
L
 
P
G
 
N
T
x
I
I
 
S
A
 
A
Y
|
Y
N
 
A
T
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
A
N
 
S
M
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
E
W
 
W
G
 
G
P
 
R
R
 
Y
N
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
W
F
x
Y
P
 
R
S
x
T
K
 
K
M
|
M
T
|
T
M
 
E
T
 
A
T
 
V
L
 
F
G
 
S
-
 
D
-
 
P
Q
 
E
H
 
K
G
 
L
D
 
D
D
 
Y
M
 
M
L
 
L
R
 
K
Q
 
R
T
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
K
 
R
L
 
T
G
 
G
G
 
V
D
 
P
T
 
E
D
 
D
L
 
L
M
 
K
G
 
G
P
 
V
A
 
A
L
 
V
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
A
 
E
G
 
A
G
 
K
H
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
I
 
I
V
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
W
T
 
T

4za2D Crystal structure of pectobacterium carotovorum 2-keto-3-deoxy-d- gluconate dehydrogenase complexed with NAD+ (see paper)
38% identity, 95% coverage: 9:256/260 of query aligns to 6:243/247 of 4za2D

query
sites
4za2D
F
 
F
D
 
D
L
 
L
T
 
Q
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
C
S
x
D
R
 
T
G
 
G
L
|
L
G
 
G
L
 
Q
Q
 
G
I
 
M
A
 
A
R
 
I
A
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
Y
 
A
G
 
G
A
 
C
A
 
D
V
 
I
A
 
-
L
 
-
V
 
V
A
 
G
R
 
V
K
 
N
Q
x
I
G
 
V
E
 
E
L
 
P
D
 
K
A
 
D
A
 
T
V
 
I
A
 
E
A
 
K
L
 
V
T
 
T
A
 
A
E
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
R
A
 
F
V
 
L
G
 
S
L
 
L
V
 
T
A
 
A
D
|
D
L
x
M
G
 
S
Q
 
N
A
 
V
G
 
S
S
 
G
A
 
H
Q
 
A
D
 
E
L
 
L
T
 
V
A
 
E
R
 
K
V
 
A
L
 
V
E
 
A
R
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
H
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
 
I
A
 
I
W
 
R
G
 
R
A
 
E
P
 
D
A
 
A
E
 
I
D
 
E
Y
 
F
P
 
S
L
 
E
E
 
K
G
 
N
W
 
W
N
 
D
K
 
D
V
 
V
M
 
M
D
 
N
L
|
L
N
 
N
V
 
I
T
 
K
G
 
S
L
 
V
F
 
F
L
 
F
L
 
M
T
 
S
Q
 
Q
A
 
T
V
 
V
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
A
 
-
F
 
F
L
 
I
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
-
 
G
G
 
G
A
 
K
V
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
A
S
|
S
I
 
M
E
 
L
G
 
S
L
 
F
Q
 
Q
G
 
G
H
 
G
H
 
-
H
 
-
S
 
-
Q
 
-
L
 
I
G
 
R
T
 
V
I
 
P
A
 
S
Y
|
Y
N
 
T
T
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
S
A
 
A
V
 
V
I
 
M
N
 
G
M
 
V
T
 
T
R
 
R
A
 
L
L
 
M
A
 
A
A
 
N
E
 
E
W
 
W
G
 
A
P
 
K
R
 
H
N
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
|
G
Y
 
Y
F
x
M
P
 
A
S
x
T
K
 
N
M
x
N
T
 
T
M
 
Q
T
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
E
H
 
R
G
 
S
D
 
K
D
 
E
M
 
I
L
 
L
R
 
D
Q
 
R
T
 
I
P
 
P
L
 
A
G
 
G
K
 
R
L
 
W
G
 
G
G
 
L
D
 
P
T
 
Q
D
 
D
L
 
L
M
 
M
G
 
G
P
 
P
A
 
S
L
 
V
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
A
 
A
G
 
S
G
 
D
H
 
Y
I
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
Y
I
 
T
I
 
I
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
40% identity, 96% coverage: 11:259/260 of query aligns to 3:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
T
 
Q
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
S
|
S
R
|
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
Q
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
I
A
 
N
L
 
L
A
 
A
E
 
K
Y
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
N
V
 
I
A
 
F
L
 
F
V
x
N
A
x
Y
R
x
N
K
x
G
Q
x
S
G
 
P
E
 
E
L
 
A
D
 
A
A
 
E
A
 
E
V
 
T
A
 
A
A
 
K
L
 
L
T
 
V
A
 
A
E
 
E
-
 
H
G
 
G
R
 
V
T
 
E
A
 
V
V
 
E
G
 
A
L
 
M
V
 
K
A
 
A
D
x
N
L
x
V
G
 
A
Q
 
I
A
 
A
G
 
E
S
 
D
A
 
V
Q
 
D
D
 
A
L
 
F
T
 
F
A
 
K
R
 
Q
V
 
A
L
 
I
E
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
A
x
I
A
 
T
W
 
R
G
 
D
A
 
N
P
 
L
A
 
L
E
 
M
D
 
R
Y
 
M
P
 
K
L
 
E
E
 
D
G
 
E
W
 
W
N
 
D
K
 
D
V
 
V
M
 
I
D
 
N
L
x
I
N
 
N
V
 
L
T
 
K
G
 
G
L
 
T
F
 
F
L
 
L
L
 
C
T
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
S
R
 
R
E
 
-
A
 
T
F
 
M
L
 
M
K
 
K
Q
 
Q
G
 
R
K
 
A
G
 
G
A
 
K
V
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
M
A
 
A
S
|
S
I
 
V
E
 
V
G
 
G
L
 
L
Q
 
I
G
 
G
H
 
N
H
 
A
H
 
-
S
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
G
T
x
Q
I
 
A
A
 
N
Y
|
Y
N
 
V
T
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
N
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
T
L
 
T
A
 
A
A
 
R
E
 
E
W
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
R
N
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
 
F
F
x
I
P
 
T
S
x
T
K
 
D
M
 
M
T
 
T
M
 
D
T
 
K
T
 
L
L
 
D
G
 
E
Q
 
K
H
 
T
G
 
K
D
 
E
D
 
A
M
 
M
L
 
L
R
 
A
Q
 
Q
T
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
K
 
A
L
 
Y
G
 
G
G
 
T
D
 
T
T
 
E
D
 
D
L
 
I
M
 
A
G
 
N
P
 
A
A
 
V
L
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
S
G
 
K
H
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
T
I
 
L
V
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
V
I
 
M

2b4qA Pseudomonas aeruginosa rhlg/NADP active-site complex (see paper)
38% identity, 98% coverage: 5:259/260 of query aligns to 1:256/256 of 2b4qA

query
sites
2b4qA
L
 
M
H
 
H
K
 
P
L
 
Y
F
 
F
D
 
S
L
 
L
T
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
S
|
S
R
|
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
Q
Q
 
M
I
 
I
A
 
A
R
 
Q
A
 
G
L
 
L
A
 
L
E
 
E
Y
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
R
V
 
V
A
 
F
L
 
I
V
 
C
A
|
A
R
|
R
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
D
|
D
A
 
A
A
 
E
V
 
A
A
 
C
A
 
A
L
 
D
T
 
T
A
 
A
E
 
T
G
 
R
R
 
L
T
 
S
A
 
A
V
 
Y
G
 
G
-
 
D
-
 
C
-
 
Q
-
 
A
L
 
I
V
 
P
A
 
A
D
|
D
L
|
L
G
x
S
Q
 
S
A
 
E
G
 
A
S
 
G
A
 
A
Q
 
R
D
 
R
L
 
L
T
 
A
A
 
Q
R
 
A
V
 
L
L
 
G
E
 
E
R
 
L
F
 
S
G
 
A
R
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
 
T
A
 
S
W
 
W
G
 
G
A
 
A
P
 
A
A
 
L
E
 
E
D
 
S
Y
 
Y
P
 
P
L
 
V
E
 
S
G
 
G
W
 
W
N
 
E
K
 
K
V
 
V
M
 
M
D
 
Q
L
 
L
N
 
N
V
 
V
T
 
T
G
 
S
L
 
V
F
 
F
L
 
S
L
 
C
T
 
I
Q
 
Q
-
 
Q
-
 
L
-
 
L
A
 
P
V
 
L
A
 
L
R
 
R
E
 
R
A
 
S
F
 
A
L
 
S
K
 
A
Q
 
E
G
 
N
K
 
P
G
 
A
A
 
R
V
 
V
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
x
G
S
|
S
I
x
V
E
 
A
G
 
G
L
 
I
Q
 
S
G
 
A
H
 
M
H
 
G
H
 
E
S
 
Q
Q
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
A
I
 
Y
A
 
A
Y
|
Y
N
 
G
T
 
P
A
 
S
K
|
K
G
 
A
A
 
A
V
 
L
I
 
H
N
 
Q
M
 
L
T
 
S
R
 
R
A
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
E
W
 
L
G
 
V
P
 
G
R
 
E
N
 
H
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
x
R
F
|
F
P
 
P
S
|
S
K
 
R
M
|
M
T
 
T
-
 
R
-
 
H
M
 
I
T
 
A
T
 
N
L
 
D
G
 
P
Q
 
Q
H
 
A
G
 
L
D
 
E
D
 
A
M
 
D
L
 
S
R
 
A
Q
 
S
T
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
G
K
 
R
L
 
W
G
 
G
G
 
R
D
 
P
T
 
E
D
 
E
L
 
M
M
 
A
G
 
A
P
 
L
A
 
A
L
 
I
L
 
S
L
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
A
H
 
Y
I
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
N
I
 
V
I
 
I
V
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
F
T
 
H
I
 
L

7v0hG Crystal structure of putative glucose 1-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia in complex with NADP and a potential reaction product
40% identity, 97% coverage: 6:257/260 of query aligns to 4:252/253 of 7v0hG

query
sites
7v0hG
H
 
H
K
 
H
L
 
M
F
 
S
D
 
K
L
 
L
T
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
R
x
K
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
A
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
Y
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
V
L
 
V
-
 
N
V
 
Y
A
|
A
R
x
S
K
x
S
Q
 
K
G
 
A
E
 
G
L
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
A
 
E
E
 
A
G
 
G
R
 
G
T
 
R
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
V
V
 
G
A
x
G
D
|
D
L
x
V
G
 
S
Q
 
K
A
 
A
G
 
A
S
 
D
A
 
A
Q
 
Q
D
 
R
L
 
I
T
 
V
A
 
D
R
 
T
V
 
A
L
 
I
E
 
E
R
 
T
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
S
G
|
G
A
 
V
A
x
Y
W
 
E
G
 
F
A
 
A
P
 
P
A
 
I
E
 
E
D
 
A
Y
 
I
P
 
T
L
 
E
E
 
E
G
 
H
W
 
Y
N
 
R
K
 
R
V
 
Q
M
 
F
D
 
D
L
 
T
N
 
N
V
 
V
T
 
F
G
 
G
L
 
V
F
 
L
L
 
L
L
 
T
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
V
R
 
K
E
 
H
A
 
-
F
 
-
L
 
-
K
 
-
Q
 
L
G
 
G
K
 
E
G
 
G
A
 
A
-
 
S
V
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
S
S
|
S
I
 
V
E
 
V
G
 
T
L
 
S
Q
 
I
G
 
-
H
 
-
H
 
-
H
 
-
S
 
T
Q
 
P
L
 
P
G
 
A
T
 
S
I
 
A
A
 
V
Y
|
Y
N
 
S
T
 
G
A
 
T
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
D
N
 
A
M
 
I
T
 
T
R
 
G
A
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
L
E
 
E
W
 
L
G
 
G
P
 
P
R
 
R
N
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
N
P
|
P
G
|
G
Y
x
M
F
x
I
P
 
V
S
x
T
K
 
E
M
x
G
T
|
T
M
 
H
T
 
S
T
 
A
L
 
-
G
 
G
Q
x
I
H
 
I
G
 
G
D
 
S
D
 
D
M
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
Q
-
 
V
L
 
L
R
 
G
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
G
K
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
E
D
 
P
T
 
N
D
 
D
L
 
I
M
 
A
G
 
S
P
 
V
A
 
A
L
 
V
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
D
G
 
A
G
 
R
H
 
W
I
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
I
 
H
I
 
L
V
 
V
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
L

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
39% identity, 96% coverage: 11:260/260 of query aligns to 4:247/247 of P73574

query
sites
P73574
L
 
L
T
 
T
G
 
A
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
x
A
S
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
K
Q
 
A
I
 
T
A
 
A
R
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Y
 
T
G
 
G
A
 
M
A
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
V
-
 
N
V
 
Y
A
 
A
R
 
Q
K
 
S
Q
 
S
G
 
T
E
 
A
L
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
E
L
 
I
T
 
I
A
 
A
E
 
N
G
 
G
R
 
G
T
 
E
A
 
A
V
 
I
G
 
A
L
 
V
V
 
Q
A
 
A
D
 
N
L
 
V
G
 
A
Q
 
N
A
 
A
G
 
D
S
 
E
A
 
V
Q
 
D
D
 
Q
L
 
L
T
 
I
A
 
K
R
 
T
V
 
T
L
 
L
E
 
D
R
 
K
F
 
F
G
 
S
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
I
A
 
T
W
 
R
G
 
D
A
 
T
P
 
L
A
 
L
E
 
L
D
 
R
Y
 
M
P
 
K
L
 
L
E
 
E
G
 
D
W
 
W
N
 
Q
K
 
A
V
 
V
M
 
I
D
 
D
L
 
L
N
 
N
V
 
L
T
 
T
G
 
G
L
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
C
T
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
S
R
 
K
E
 
-
A
 
L
F
 
M
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
G
 
K
K
 
S
G
 
G
A
 
R
V
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
T
S
 
S
I
 
V
E
 
A
G
 
G
L
 
M
Q
 
M
G
 
G
H
 
N
H
x
P
H
 
-
S
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
G
T
 
Q
I
 
A
A
 
N
Y
 
Y
N
 
S
T
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
N
 
G
M
 
F
T
 
T
R
 
K
A
 
T
L
 
V
A
 
A
A
 
K
E
 
E
W
 
L
G
 
A
P
 
S
R
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
x
F
F
 
I
P
 
A
S
 
T
K
 
D
M
 
M
T
 
T
M
 
E
T
 
N
T
 
L
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
H
x
N
G
 
A
D
 
E
D
 
P
M
 
I
L
 
L
R
 
Q
Q
 
F
T
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
A
K
 
R
L
 
Y
G
 
G
G
 
Q
D
 
P
T
 
E
D
 
E
L
 
V
M
 
A
G
 
G
P
 
T
A
 
I
L
 
R
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
T
D
 
D
-
 
P
A
 
A
G
 
A
G
 
A
H
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
T
I
 
F
V
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
V
I
 
M
I
 
F

5u9pB Crystal structure of a gluconate 5-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia j2315 in complex with NADP and tartrate
36% identity, 96% coverage: 9:258/260 of query aligns to 12:258/261 of 5u9pB

query
sites
5u9pB
F
 
F
D
 
R
L
 
L
T
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
R
A
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
S
 
G
R
|
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
L
Q
 
T
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Y
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
V
L
 
I
V
 
N
A
 
D
R
|
R
K
 
N
Q
 
E
G
 
E
E
 
K
L
 
A
D
 
A
A
 
T
A
 
L
V
 
A
A
 
R
A
 
R
L
 
F
T
 
R
A
 
D
E
 
E
G
 
G
R
 
F
T
 
A
A
 
A
V
 
D
G
 
H
L
 
A
V
 
V
A
 
F
D
|
D
L
x
V
G
 
A
Q
 
E
A
 
H
G
 
A
S
 
Q
A
 
V
Q
 
R
D
 
A
L
 
A
T
 
I
A
 
D
R
 
E
V
 
F
L
 
E
E
 
A
R
 
R
F
 
V
G
 
G
R
 
A
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
A
 
I
A
 
Q
W
 
R
G
 
R
A
 
A
P
 
P
A
 
L
E
 
D
D
 
A
Y
 
F
P
 
E
L
 
P
E
 
D
G
 
D
W
 
W
N
 
H
K
 
A
V
 
L
M
 
M
D
 
R
L
 
V
N
 
N
V
 
L
T
 
D
G
 
G
L
 
V
F
 
F
L
 
N
L
 
V
T
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
R
E
 
H
A
 
-
F
 
M
L
 
I
K
 
A
Q
 
R
G
 
G
K
 
H
G
 
G
A
 
K
V
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
C
S
|
S
I
 
V
E
 
Q
G
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
H
 
-
H
 
-
H
 
-
S
 
S
Q
 
E
L
 
L
G
 
A
-
 
R
-
 
P
T
 
T
I
 
I
A
 
A
-
 
P
Y
|
Y
N
 
A
T
 
A
A
 
T
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
R
N
 
M
M
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
G
L
 
M
A
 
C
A
 
A
E
 
D
W
 
W
G
 
A
P
 
R
R
 
Y
N
 
G
I
 
I
R
 
Q
V
 
A
N
 
N
A
 
G
V
 
L
A
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
 
Y
F
|
F
P
 
E
S
x
T
K
 
E
M
x
L
T
x
N
M
 
R
T
 
A
T
 
L
L
 
V
G
 
D
Q
 
D
-
 
A
-
 
A
H
 
F
G
 
S
D
 
D
D
 
W
M
 
L
L
 
C
R
 
K
Q
 
R
T
 
T
P
 
P
L
 
A
G
 
G
K
 
R
L
 
W
G
 
G
G
 
Q
D
 
V
T
 
D
D
 
E
L
 
L
M
 
C
G
 
G
P
 
A
A
 
A
L
 
I
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
A
A
 
A
G
 
S
G
 
D
H
 
F
I
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
Q
I
 
T
I
 
L
V
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
L
T
 
T

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
37% identity, 94% coverage: 14:257/260 of query aligns to 5:244/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
R
 
K
V
 
S
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
S
 
S
R
 
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
L
 
R
Q
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Y
 
E
G
 
G
A
 
Y
A
 
N
V
 
V
A
 
A
L
 
V
-
 
N
V
 
Y
A
 
A
R
 
G
K
 
S
Q
 
K
G
 
E
E
 
K
L
 
A
D
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
E
L
 
I
T
 
K
A
 
A
E
 
K
G
 
G
R
 
V
T
 
D
A
 
S
V
 
F
G
 
A
L
 
I
V
 
Q
A
 
A
D
 
N
L
 
V
G
 
A
Q
 
D
A
 
A
G
 
D
S
 
E
A
 
V
Q
 
K
D
 
A
L
 
M
T
 
I
A
 
K
R
 
E
V
 
V
L
 
V
E
 
S
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
A
 
I
A
 
T
W
 
R
G
 
D
A
 
N
P
 
L
A
 
L
E
 
M
D
 
R
Y
 
M
P
 
K
L
 
E
E
 
Q
G
 
E
W
 
W
N
 
D
K
 
D
V
 
V
M
 
I
D
 
D
L
 
T
N
 
N
V
 
L
T
 
K
G
 
G
L
 
V
F
 
F
L
 
N
L
 
C
T
 
I
Q
 
Q
A
 
K
V
 
-
A
 
A
R
 
T
E
 
P
A
 
Q
F
 
M
L
 
L
K
 
R
Q
 
Q
G
 
R
K
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
L
A
 
S
S
|
S
I
 
V
E
 
V
G
 
G
L
 
A
Q
 
V
G
 
G
H
 
N
H
 
P
H
 
-
S
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
G
T
x
Q
I
 
A
A
 
N
Y
|
Y
N
 
V
T
 
A
A
 
T
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
N
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
R
E
 
E
W
 
L
G
 
A
P
 
S
R
 
R
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
F
 
I
P
 
V
S
 
S
K
 
D
M
 
M
T
 
T
M
 
D
T
 
A
T
 
L
L
 
S
G
 
D
Q
 
E
H
 
L
G
 
K
D
 
E
D
 
Q
M
 
M
L
 
L
R
 
T
Q
 
Q
T
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
A
K
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
Q
D
 
D
T
 
T
D
 
D
L
 
I
M
 
A
G
 
N
P
 
T
A
 
V
L
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
K
G
 
A
G
 
K
H
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
T
I
 
I
V
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

Q9BTZ2 Dehydrogenase/reductase SDR family member 4; NADPH-dependent carbonyl reductase; CR; NADPH-dependent retinol dehydrogenase/reductase; NRDR; humNRDR; Peroxisomal short-chain alcohol dehydrogenase; PSCD; SCAD-SRL; Short chain dehydrogenase/reductase family 25C member 2; Protein SDR25C2; Short-chain dehydrogenase/reductase family member 4; EC 1.1.1.184 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
37% identity, 98% coverage: 2:256/260 of query aligns to 21:273/278 of Q9BTZ2

query
sites
Q9BTZ2
S
 
S
S
 
S
P
 
G
L
 
M
H
 
T
K
 
R
L
 
R
F
 
D
D
 
P
L
 
L
T
 
A
G
 
N
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
A
G
 
S
S
 
T
R
 
D
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
F
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
Y
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
H
V
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
S
A
 
S
R
 
R
K
 
K
Q
 
Q
G
 
Q
E
 
N
L
 
V
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
L
T
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
R
 
L
T
 
S
A
 
V
V
 
T
G
 
G
L
 
T
V
 
V
A
 
C
D
 
H
L
 
V
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
G
 
E
S
 
D
A
 
R
Q
 
E
D
 
R
L
 
L
T
 
V
A
 
A
R
 
T
V
 
A
L
 
V
E
 
K
R
 
L
F
 
H
G
 
G
R
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
N
 
N
A
 
A
G
 
A
A
 
V
-
 
N
A
 
P
W
 
F
G
 
F
A
 
G
P
 
S
A
 
I
E
 
M
D
 
D
Y
 
V
P
 
T
L
 
E
E
 
E
G
 
V
W
 
W
N
 
D
K
 
K
V
 
T
M
 
L
D
 
D
L
 
I
N
 
N
V
 
V
T
 
K
G
 
A
L
 
P
F
 
A
L
 
L
L
 
M
T
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
V
R
 
P
E
 
E
A
 
-
F
 
M
L
 
E
K
 
K
Q
 
R
G
 
G
K
 
G
G
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
N
 
I
V
 
V
A
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
A
G
 
A
L
 
F
Q
 
S
G
 
-
H
 
-
H
 
-
H
 
-
S
 
P
Q
x
S
L
 
P
G
 
G
T
x
F
I
 
S
A
 
P
Y
 
Y
N
 
N
T
 
V
A
 
S
K
 
K
G
 
T
A
 
A
V
 
L
I
 
L
N
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
A
x
T
L
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
W
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
R
N
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
L
F
 
I
P
 
K
S
 
T
K
 
S
M
 
F
T
 
S
-
 
R
M
 
M
T
 
L
T
 
W
L
 
M
G
 
D
Q
 
K
H
 
E
G
 
K
D
 
E
D
 
E
M
 
S
L
 
M
R
 
K
Q
 
E
T
 
T
-
 
L
P
 
R
L
 
I
G
 
R
K
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
E
D
 
P
T
 
E
D
 
D
L
 
C
M
 
A
G
 
G
P
 
I
A
 
V
L
 
S
L
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
E
A
 
D
G
 
A
G
 
S
H
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
I
 
T
I
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

3o03A Quaternary complex structure of gluconate 5-dehydrogenase from streptococcus suis type 2 (see paper)
35% identity, 96% coverage: 9:257/260 of query aligns to 7:246/254 of 3o03A

query
sites
3o03A
F
 
F
D
 
S
L
 
L
T
 
K
G
 
G
R
 
K
V
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
 
S
R
x
Y
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
F
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
S
A
 
A
L
 
Y
A
 
A
E
 
K
Y
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
T
V
 
I
A
 
V
L
 
F
V
 
N
A
x
D
R
x
I
K
 
N
Q
 
Q
G
 
E
E
x
L
L
 
V
D
 
D
A
 
R
A
 
G
V
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
Y
T
 
K
A
 
A
E
 
A
G
 
G
R
 
I
T
 
N
A
 
A
V
 
H
G
 
G
L
 
Y
V
 
V
A
 
C
D
|
D
L
x
V
G
 
T
Q
 
D
A
 
E
G
 
D
S
 
G
A
 
I
Q
 
Q
D
 
A
L
 
M
T
 
V
A
 
A
R
 
Q
V
 
I
L
 
E
E
 
S
R
 
E
F
 
V
G
 
G
R
 
I
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
 
I
A
x
I
W
 
R
G
x
R
A
 
V
P
 
P
A
 
M
E
 
I
D
 
E
Y
 
M
P
 
T
L
 
A
E
 
A
G
 
Q
W
 
F
N
 
R
K
 
Q
V
 
V
M
 
I
D
 
D
L
 
I
N
 
D
V
 
L
T
 
N
G
 
A
L
 
P
F
 
F
L
 
I
L
 
V
T
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
I
R
 
-
E
 
P
A
 
S
F
 
M
L
 
I
K
 
K
Q
 
K
G
 
G
K
 
H
G
 
G
A
 
K
V
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
C
S
|
S
I
x
M
E
 
-
G
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
H
 
-
H
 
-
H
x
M
S
 
S
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
-
x
R
-
 
E
-
 
T
T
x
V
I
 
S
A
 
A
Y
|
Y
N
 
A
T
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
L
I
 
K
N
 
M
M
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
N
L
 
I
A
 
A
A
 
S
E
 
E
W
 
Y
G
 
G
P
 
E
R
 
A
N
 
N
I
 
I
R
 
Q
V
 
C
N
 
N
A
 
G
V
 
I
A
 
G
P
|
P
G
 
G
Y
 
Y
F
 
I
P
 
A
S
 
T
K
 
P
M
 
Q
T
 
T
M
 
-
T
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
H
 
H
G
 
P
D
 
F
D
 
D
-
 
Q
-
 
F
M
 
I
L
 
I
R
 
A
Q
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
A
G
 
A
K
 
R
L
 
W
G
 
G
G
 
E
D
 
A
T
 
E
D
 
D
L
 
L
M
 
M
G
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
V
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
S
G
 
N
H
 
F
I
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
H
I
 
I
I
 
L
V
 
Y
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
I

3o4rA Crystal structure of human dehydrogenase/reductase (sdr family) member 4 (dhrs4)
37% identity, 95% coverage: 11:256/260 of query aligns to 6:249/254 of 3o4rA

query
sites
3o4rA
L
 
L
T
 
A
G
 
N
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
x
A
G
 
S
S
x
T
R
x
D
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
F
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
Y
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
H
V
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
S
A
x
S
R
|
R
K
|
K
Q
 
Q
G
 
Q
E
x
N
L
 
V
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
L
T
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
R
 
L
T
 
S
A
 
V
V
 
T
G
 
G
L
 
T
V
 
V
A
 
C
D
x
H
L
x
V
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
G
 
E
S
 
D
A
 
R
Q
 
E
D
 
R
L
 
L
T
 
V
A
 
A
R
 
T
V
 
A
L
 
V
E
 
K
R
 
L
F
 
H
G
 
G
R
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
N
|
N
A
 
A
G
x
A
A
 
V
-
 
N
A
 
P
W
 
F
G
 
F
A
 
G
P
 
S
A
 
I
E
 
M
D
 
D
Y
 
V
P
 
T
L
 
E
E
 
E
G
 
V
W
 
W
N
 
D
K
 
K
V
 
T
M
 
L
D
 
D
L
 
I
N
 
N
V
 
V
T
 
K
G
 
A
L
 
P
F
 
A
L
 
L
L
 
M
T
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
V
R
 
P
E
 
E
A
 
-
F
 
M
L
 
E
K
 
K
Q
 
R
G
 
G
K
 
G
G
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
N
 
I
V
 
V
A
 
S
S
|
S
I
 
I
E
 
A
G
 
A
L
 
F
Q
 
S
G
 
P
H
 
S
H
 
P
H
 
-
S
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
G
T
x
F
I
 
S
A
 
P
Y
|
Y
N
 
N
T
 
V
A
 
S
K
|
K
G
 
T
A
 
A
V
 
L
I
 
L
N
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
W
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
R
N
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
L
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
x
L
F
x
I
P
 
K
S
x
T
K
 
S
M
x
F
T
x
S
-
 
R
M
 
M
T
 
L
T
 
W
L
 
M
G
 
D
Q
x
K
H
 
E
G
 
K
D
 
E
D
 
E
M
 
S
L
 
M
R
 
K
Q
 
E
T
 
T
-
 
L
P
 
R
L
 
I
G
 
R
K
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
E
D
 
P
T
 
E
D
 
D
L
 
C
M
 
A
G
 
G
P
 
I
A
 
V
L
 
S
L
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
E
A
 
D
G
 
A
G
 
S
H
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
I
 
T
I
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

4dmmB 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from synechococcus elongatus pcc 7942 in complex with NADP
41% identity, 96% coverage: 11:259/260 of query aligns to 3:239/240 of 4dmmB

query
sites
4dmmB
L
 
L
T
 
T
G
 
D
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Y
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
-
 
N
V
 
Y
A
|
A
R
x
S
K
x
S
Q
 
A
G
 
G
E
 
A
L
 
A
D
 
D
A
 
E
A
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
I
T
 
A
A
 
A
E
 
A
G
 
G
R
 
G
T
 
E
A
 
A
V
 
F
G
 
A
L
 
V
V
 
K
A
|
A
D
|
D
L
x
V
G
 
S
Q
 
Q
A
 
E
G
 
S
S
 
E
A
 
V
Q
 
E
D
 
A
L
 
L
T
 
F
A
 
A
R
 
A
V
 
V
L
 
I
E
 
E
R
 
R
F
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
A
 
I
A
 
T
W
 
R
G
 
D
A
 
T
P
 
L
A
 
L
E
 
L
D
 
R
Y
 
M
P
 
K
L
 
R
E
 
D
G
 
D
W
 
W
N
 
Q
K
 
S
V
 
V
M
 
L
D
 
D
L
|
L
N
 
N
V
 
L
T
 
G
G
 
G
L
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
C
T
 
S
Q
 
R
A
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
K
E
 
-
A
 
I
F
 
M
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
G
 
R
K
 
S
G
 
G
A
 
R
V
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
A
S
|
S
I
 
V
E
 
V
G
 
G
L
 
E
Q
 
M
G
 
G
H
 
N
H
 
P
H
 
-
S
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
G
T
x
Q
I
 
A
A
 
N
Y
|
Y
N
 
S
T
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
N
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
T
L
 
V
A
 
A
A
 
K
E
 
E
W
 
L
G
 
A
P
 
S
R
 
R
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
F
x
I
P
 
A
S
x
T
K
 
D
M
|
M
T
 
T
M
 
-
T
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
H
 
-
G
 
-
D
 
-
D
 
S
M
 
L
L
 
L
R
 
E
Q
 
V
T
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
K
 
R
L
 
Y
G
 
G
G
 
E
D
 
A
T
 
A
D
 
E
L
 
V
M
 
A
G
 
G
P
 
V
A
 
V
L
 
R
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
A
D
 
D
-
 
P
A
 
A
G
 
A
G
 
A
H
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
I
 
I
V
 
N
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
L
T
 
V
I
 
M

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
37% identity, 94% coverage: 14:257/260 of query aligns to 2:237/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
R
 
K
V
 
S
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
Q
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Y
 
E
G
 
G
A
 
Y
A
 
N
V
 
V
A
 
A
L
 
V
-
x
N
V
x
Y
A
|
A
R
x
G
K
x
S
Q
 
K
G
 
E
E
 
K
L
 
A
D
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
E
L
 
I
T
 
K
A
 
A
E
 
K
G
 
G
R
 
V
T
 
D
A
 
S
V
 
F
G
 
A
L
 
I
V
 
Q
A
|
A
D
x
N
L
x
V
G
 
A
Q
 
D
A
 
A
G
 
D
S
 
E
A
 
V
Q
 
K
D
 
A
L
 
M
T
 
I
A
 
K
R
 
E
V
 
V
L
 
V
E
 
S
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
A
 
I
A
 
T
W
 
R
G
 
D
A
 
N
P
 
L
A
 
L
E
 
M
D
 
R
Y
 
M
P
 
K
L
 
E
E
 
Q
G
 
E
W
 
W
N
 
D
K
 
D
V
 
V
M
 
I
D
 
D
L
x
T
N
 
N
V
 
L
T
 
K
G
 
G
L
 
V
F
 
F
L
 
N
L
 
C
T
 
I
Q
 
Q
A
 
K
V
 
-
A
 
A
R
 
T
E
 
P
A
 
Q
F
 
M
L
 
L
K
 
R
Q
 
Q
G
 
R
K
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
L
A
 
S
S
|
S
I
 
V
E
 
V
G
 
G
L
 
A
Q
 
V
G
 
G
H
 
N
H
 
P
H
 
-
S
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
G
T
x
Q
I
 
A
A
 
N
Y
|
Y
N
 
V
T
 
A
A
 
T
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
N
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
R
E
 
E
W
 
L
G
 
A
P
 
S
R
 
R
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
F
 
I
P
 
V
S
 
S
K
 
D
M
 
M
T
 
T
M
 
-
T
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
D
Q
 
E
H
 
L
G
 
K
D
 
E
D
 
Q
M
 
M
L
 
L
R
 
T
Q
 
Q
T
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
A
K
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
Q
D
 
D
T
 
T
D
 
D
L
 
I
M
 
A
G
 
N
P
 
T
A
 
V
L
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
K
G
 
A
G
 
K
H
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
T
I
 
I
V
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
36% identity, 96% coverage: 11:260/260 of query aligns to 3:246/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
L
 
I
T
 
Q
G
 
N
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
S
 
A
R
x
S
G
 
G
L
 
M
G
 
G
L
 
K
Q
 
Q
I
 
T
A
 
A
R
 
L
A
 
R
L
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
V
L
 
I
V
 
N
A
x
D
R
 
I
K
 
D
Q
 
A
G
 
E
E
 
K
L
 
V
D
 
R
A
 
A
A
 
T
V
 
V
A
 
D
A
 
E
L
 
F
T
 
S
A
 
A
E
 
R
G
 
G
R
 
H
T
 
R
A
 
V
V
 
L
G
 
G
L
 
A
V
 
V
A
 
A
D
|
D
L
x
I
G
 
G
Q
 
N
A
 
K
G
 
A
S
 
A
A
 
V
Q
 
D
D
 
G
L
 
M
T
 
V
A
 
K
R
 
Q
V
 
T
L
 
I
E
 
D
R
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
A
 
M
A
 
E
W
 
R
G
 
A
A
 
G
P
 
A
A
 
L
E
 
R
D
 
K
Y
 
L
P
 
S
L
 
E
E
 
A
G
 
D
W
 
W
N
 
D
K
 
V
V
 
T
M
 
I
D
 
N
L
 
V
N
 
N
V
 
L
T
 
K
G
 
G
L
 
T
F
 
F
L
 
L
L
 
C
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
-
R
 
H
E
 
G
A
 
H
F
 
M
L
 
V
K
 
E
Q
 
N
G
 
K
K
 
H
G
 
G
A
 
R
V
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
 
S
I
 
R
E
 
A
G
 
W
L
 
L
Q
 
G
G
 
G
H
 
-
H
 
-
H
 
-
S
 
-
Q
 
-
L
 
A
G
 
G
T
 
Q
I
 
T
A
 
P
Y
|
Y
N
 
S
T
 
S
A
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
V
N
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
W
 
L
G
 
G
P
 
R
R
 
A
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
L
F
 
I
P
 
H
S
 
T
K
 
P
M
 
M
T
 
W
M
 
D
T
 
E
T
 
L
L
 
P
G
 
E
Q
 
K
H
 
D
G
 
Q
D
 
Q
D
 
F
M
 
L
L
 
L
R
 
S
Q
 
R
T
 
Q
P
 
P
L
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
E
D
 
P
T
 
D
D
 
D
L
 
I
M
 
A
G
 
N
P
 
T
A
 
L
L
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
A
 
D
G
 
S
G
 
G
H
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
I
 
L
V
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
M
 
R
T
 
S
I
 
L
I
 
F

Sites not aligning to the query:

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
36% identity, 96% coverage: 11:260/260 of query aligns to 2:245/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
T
 
Q
G
 
N
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
S
 
A
R
 
S
G
 
G
L
x
M
G
 
G
L
 
K
Q
 
Q
I
 
T
A
 
A
R
 
L
A
 
R
L
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
V
L
 
I
V
 
N
A
x
D
R
x
I
K
 
D
Q
 
A
G
 
E
E
 
K
L
 
V
D
 
R
A
 
A
A
 
T
V
 
V
A
 
D
A
 
E
L
 
F
T
 
S
A
 
A
E
 
R
G
 
G
R
 
H
T
 
R
A
 
V
V
 
L
G
 
G
L
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
D
L
x
I
G
 
G
Q
 
N
A
 
K
G
 
A
S
 
A
A
 
V
Q
 
D
D
 
G
L
 
M
T
 
V
A
 
K
R
 
Q
V
 
T
L
 
I
E
 
D
R
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
A
 
M
A
 
E
W
 
R
G
 
A
A
 
G
P
 
A
A
 
L
E
 
R
D
 
K
Y
 
L
P
 
S
L
 
E
E
 
A
G
 
D
W
 
W
N
 
D
K
 
V
V
 
T
M
 
I
D
 
N
L
 
V
N
 
N
V
 
L
T
 
K
G
 
G
L
 
T
F
 
F
L
 
L
L
 
C
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
-
R
 
H
E
 
G
A
 
H
F
 
M
L
 
V
K
 
E
Q
 
N
G
 
K
K
 
H
G
 
G
A
 
R
V
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
I
A
 
A
S
|
S
I
 
R
E
 
A
G
 
W
L
 
L
Q
 
G
G
 
G
H
 
-
H
 
-
H
 
-
S
 
-
Q
 
-
L
 
A
G
 
G
T
 
Q
I
 
T
A
 
P
Y
|
Y
N
 
S
T
 
S
A
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
V
N
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
W
 
L
G
 
G
P
 
R
R
 
A
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
L
F
x
I
P
 
H
S
 
T
K
 
P
M
 
M
T
 
W
M
 
D
T
 
E
T
 
L
L
 
P
G
 
E
Q
 
K
H
 
D
G
 
Q
D
 
Q
D
 
F
M
 
L
L
 
L
R
 
S
Q
 
R
T
 
Q
P
 
P
L
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
E
D
 
P
T
 
D
D
 
D
L
 
I
M
 
A
G
 
N
P
 
T
A
 
L
L
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
A
 
D
G
 
S
G
 
G
H
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
I
 
L
V
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
M
 
R
T
 
S
I
 
L
I
 
F

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
34% identity, 96% coverage: 11:260/260 of query aligns to 3:248/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
L
 
L
T
 
D
G
 
N
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
 
G
R
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
L
Q
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
H
A
 
S
L
 
Y
A
 
A
E
 
K
Y
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
A
 
I
L
 
V
V
 
S
A
x
D
R
x
I
K
 
N
Q
 
E
G
 
D
E
 
H
L
 
G
D
 
N
A
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
D
L
 
I
T
 
K
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
R
 
G
T
 
E
A
 
A
V
 
S
G
 
F
L
 
V
V
 
K
A
|
A
D
|
D
L
x
T
G
 
S
Q
 
N
A
 
P
G
 
E
S
 
E
A
 
V
Q
 
E
D
 
A
L
 
L
T
 
V
A
 
K
R
 
R
V
 
T
L
 
V
E
 
E
R
 
I
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
-
 
I
A
 
G
A
 
G
W
 
E
G
 
Q
A
 
A
P
 
L
A
 
A
E
 
G
D
 
D
Y
 
Y
P
 
G
L
 
L
E
 
D
G
 
S
W
 
W
N
 
R
K
 
K
V
 
V
M
 
L
D
 
S
L
 
I
N
 
N
V
 
L
T
 
D
G
 
G
L
 
V
F
 
F
L
 
Y
L
 
G
T
 
C
Q
 
K
A
 
-
V
 
Y
A
 
E
R
 
L
E
 
E
A
 
Q
F
 
M
L
 
E
K
 
K
Q
 
N
G
 
G
K
 
G
G
 
G
A
 
V
V
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
M
A
 
A
S
|
S
I
 
I
E
 
H
G
 
G
L
 
I
Q
 
V
G
 
A
H
 
A
H
 
P
H
 
L
S
 
S
Q
 
S
L
 
-
G
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
A
Y
|
Y
N
 
T
T
 
S
A
 
A
K
|
K
G
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
V
N
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
N
L
 
I
A
 
G
A
 
A
E
 
E
W
 
Y
G
 
G
P
 
Q
R
 
K
N
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
G
P
|
P
G
x
A
Y
|
Y
F
x
I
P
 
E
S
 
T
K
 
P
M
x
L
T
 
L
M
 
E
T
 
S
T
 
L
L
 
T
G
 
K
Q
 
E
H
 
M
G
 
K
D
 
E
D
 
A
M
 
L
L
 
I
R
 
S
Q
 
K
T
 
H
P
 
P
L
 
M
G
 
G
K
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
K
D
 
P
T
 
E
D
 
E
L
 
V
M
 
A
G
 
E
P
 
L
A
 
V
L
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
E
A
 
K
G
 
S
G
 
S
H
 
F
I
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
G
I
 
Y
I
 
Y
V
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T
I
 
A
I
 
V

3lqfA Crystal structure of the short-chain dehydrogenase galactitol- dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD and erythritol (see paper)
39% identity, 98% coverage: 6:259/260 of query aligns to 4:253/254 of 3lqfA

query
sites
3lqfA
H
 
R
K
 
T
L
 
V
F
 
F
D
 
R
L
 
L
T
 
D
G
 
G
R
 
A
V
 
C
A
 
A
I
 
A
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
 
G
R
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
L
Q
 
E
I
 
I
A
 
C
R
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
A
E
 
A
Y
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
R
V
 
L
A
 
I
L
 
L
V
 
I
A
x
D
R
|
R
K
 
E
Q
 
A
G
 
A
E
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
R
A
 
A
V
 
A
A
 
Q
A
 
E
L
 
L
T
 
G
A
 
A
E
 
A
G
 
-
R
 
-
T
 
V
A
 
A
V
 
A
G
 
R
L
 
I
V
 
V
A
 
A
D
|
D
L
x
V
G
 
T
Q
 
D
A
 
A
G
 
E
S
 
A
A
 
M
Q
 
T
D
 
A
L
 
A
T
 
A
A
 
A
R
 
E
V
 
A
L
 
E
E
 
A
R
 
V
F
 
-
G
 
A
R
 
P
I
 
V
D
 
S
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
S
A
 
A
G
 
G
A
 
I
A
 
A
W
 
R
G
 
L
A
 
H
P
 
D
A
 
A
E
 
L
D
 
E
Y
 
T
P
 
D
L
 
D
E
 
A
G
 
T
W
 
W
N
 
R
K
 
Q
V
 
V
M
 
M
D
 
A
L
 
V
N
 
N
V
 
V
T
 
D
G
 
G
L
 
M
F
 
F
L
 
W
L
 
A
T
 
S
Q
 
R
A
 
A
V
 
F
A
 
G
R
 
R
E
 
-
A
 
A
F
 
M
L
 
V
K
 
A
Q
 
R
G
 
G
K
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
L
A
 
G
S
|
S
I
 
M
E
 
S
G
 
G
L
 
T
Q
 
I
G
 
-
H
 
V
H
x
N
H
 
R
S
 
P
Q
 
Q
L
 
F
G
 
A
T
 
S
I
 
-
A
 
S
Y
|
Y
N
 
M
T
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
H
N
 
Q
M
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
W
 
W
G
 
A
P
 
G
R
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
A
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
|
Y
F
x
V
P
 
A
S
x
T
K
 
E
M
|
M
T
|
T
-
 
L
-
 
K
M
|
M
T
 
R
T
 
E
L
 
R
G
 
P
Q
 
E
H
 
L
G
 
F
D
 
E
D
 
T
M
 
W
L
 
L
R
 
D
Q
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
K
 
R
L
 
C
G
 
G
G
 
E
D
 
P
T
 
S
D
 
E
L
 
I
M
 
A
G
 
A
P
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
A
 
A
G
 
A
G
 
S
H
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
I
 
I
I
 
L
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T
I
 
V

2wsbA Crystal structure of the short-chain dehydrogenase galactitol-dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD (see paper)
39% identity, 98% coverage: 6:259/260 of query aligns to 4:253/254 of 2wsbA

query
sites
2wsbA
H
 
R
K
 
T
L
 
V
F
 
F
D
 
R
L
 
L
T
 
D
G
 
G
R
 
A
V
 
C
A
 
A
I
 
A
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
 
G
R
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
L
Q
 
E
I
 
I
A
 
C
R
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
A
E
 
A
Y
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
R
V
 
L
A
 
I
L
 
L
V
 
I
A
x
D
R
|
R
K
 
E
Q
 
A
G
 
A
E
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
R
A
 
A
V
 
A
A
 
Q
A
 
E
L
 
L
T
 
G
A
 
A
E
 
A
G
 
-
R
 
-
T
 
V
A
 
A
V
 
A
G
 
R
L
 
I
V
 
V
A
 
A
D
|
D
L
x
V
G
 
T
Q
 
D
A
 
A
G
 
E
S
 
A
A
 
M
Q
 
T
D
 
A
L
 
A
T
 
A
A
 
A
R
 
E
V
 
A
L
 
E
E
 
A
R
 
V
F
 
-
G
 
A
R
 
P
I
 
V
D
 
S
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
S
A
|
A
G
 
G
A
 
I
A
 
A
W
 
R
G
 
L
A
 
H
P
 
D
A
 
A
E
 
L
D
 
E
Y
 
T
P
 
D
L
 
D
E
 
A
G
 
T
W
 
W
N
 
R
K
 
Q
V
 
V
M
 
M
D
 
A
L
 
V
N
 
N
V
 
V
T
 
D
G
 
G
L
 
M
F
 
F
L
 
W
L
 
A
T
 
S
Q
 
R
A
 
A
V
 
F
A
 
G
R
 
R
E
 
-
A
 
A
F
 
M
L
 
V
K
 
A
Q
 
R
G
 
G
K
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
L
A
 
G
S
|
S
I
x
M
E
 
S
G
 
G
L
 
T
Q
 
I
G
 
-
H
 
V
H
x
N
H
 
R
S
 
P
Q
 
Q
L
 
F
G
 
A
T
 
S
I
 
-
A
 
S
Y
|
Y
N
 
M
T
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
H
N
 
Q
M
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
W
 
W
G
 
A
P
 
G
R
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
A
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
|
Y
F
x
V
P
 
A
S
x
T
K
 
E
M
|
M
T
|
T
-
 
L
-
 
K
M
 
M
T
 
R
T
 
E
L
 
R
G
 
P
Q
 
E
H
 
L
G
 
F
D
 
E
D
 
T
M
 
W
L
 
L
R
 
D
Q
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
K
 
R
L
 
C
G
 
G
G
 
E
D
 
P
T
 
S
D
 
E
L
 
I
M
 
A
G
 
A
P
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
A
 
A
G
 
A
G
 
S
H
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
I
 
I
I
 
L
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T
I
 
V

2wdzA Crystal structure of the short chain dehydrogenase galactitol-dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD+ and 1,2-pentandiol (see paper)
39% identity, 98% coverage: 6:259/260 of query aligns to 4:253/254 of 2wdzA

query
sites
2wdzA
H
 
R
K
 
T
L
 
V
F
 
F
D
 
R
L
 
L
T
 
D
G
 
G
R
 
A
V
 
C
A
 
A
I
 
A
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
 
G
R
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
L
Q
 
E
I
 
I
A
 
C
R
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
A
E
 
A
Y
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
R
V
 
L
A
 
I
L
 
L
V
 
I
A
x
D
R
|
R
K
 
E
Q
x
A
G
 
A
E
 
A
L
 
L
D
|
D
A
 
R
A
 
A
V
 
A
A
 
Q
A
 
E
L
 
L
T
 
G
A
 
A
E
 
A
G
 
-
R
 
-
T
 
V
A
 
A
V
 
A
G
x
R
L
 
I
V
 
V
A
|
A
D
|
D
L
x
V
G
 
T
Q
 
D
A
 
A
G
 
E
S
 
A
A
 
M
Q
 
T
D
 
A
L
 
A
T
 
A
A
 
A
R
 
E
V
 
A
L
 
E
E
 
A
R
 
V
F
 
-
G
 
A
R
 
P
I
 
V
D
 
S
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
S
A
|
A
G
 
G
A
 
I
A
 
A
W
 
R
G
 
L
A
 
H
P
 
D
A
 
A
E
 
L
D
 
E
Y
 
T
P
 
D
L
 
D
E
 
A
G
 
T
W
 
W
N
 
R
K
 
Q
V
 
V
M
 
M
D
 
A
L
 
V
N
 
N
V
 
V
T
 
D
G
 
G
L
 
M
F
 
F
L
 
W
L
 
A
T
 
S
Q
 
R
A
 
A
V
 
F
A
 
G
R
 
R
E
 
-
A
 
A
F
 
M
L
 
V
K
 
A
Q
 
R
G
 
G
K
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
L
A
 
G
S
|
S
I
 
M
E
x
S
G
 
G
L
 
T
Q
 
I
G
 
-
H
 
V
H
 
N
H
 
R
S
 
P
Q
 
Q
L
 
F
G
 
A
T
 
S
I
 
-
A
 
S
Y
|
Y
N
 
M
T
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
H
N
 
Q
M
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
W
 
W
G
 
A
P
 
G
R
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
A
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
 
Y
F
x
V
P
 
A
S
x
T
K
 
E
M
|
M
T
|
T
-
 
L
-
 
K
M
 
M
T
 
R
T
 
E
L
 
R
G
 
P
Q
 
E
H
 
L
G
 
F
D
 
E
D
 
T
M
 
W
L
 
L
R
 
D
Q
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
K
 
R
L
 
C
G
 
G
G
 
E
D
 
P
T
 
S
D
 
E
L
 
I
M
 
A
G
 
A
P
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
A
 
A
G
 
A
G
 
S
H
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
I
 
I
I
 
L
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T
I
 
V

C0KTJ6 Galactitol 2-dehydrogenase (L-tagatose-forming); Galactitol dehydrogenase; GDH; GatDH; Galactitol:NAD(+) 5-oxidoreductase; EC 1.1.1.406 from Cereibacter sphaeroides (Rhodobacter sphaeroides) (see paper)
39% identity, 98% coverage: 6:259/260 of query aligns to 4:253/254 of C0KTJ6

query
sites
C0KTJ6
H
 
R
K
 
T
L
 
V
F
 
F
D
 
R
L
 
L
T
 
D
G
 
G
R
 
A
V
 
C
A
 
A
I
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
S
 
G
R
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
L
Q
 
E
I
 
I
A
 
C
R
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
A
E
 
A
Y
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
R
V
 
L
A
 
I
L
 
L
V
 
I
A
x
D
R
 
R
K
 
E
Q
 
A
G
 
A
E
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
R
A
 
A
V
 
A
A
 
Q
A
 
E
L
 
L
T
 
G
A
 
A
E
 
A
G
 
-
R
 
-
T
 
V
A
 
A
V
 
A
G
 
R
L
 
I
V
 
V
A
 
A
D
|
D
L
x
V
G
 
T
Q
 
D
A
 
A
G
 
E
S
 
A
A
 
M
Q
 
T
D
 
A
L
 
A
T
 
A
A
 
A
R
 
E
V
 
A
L
 
E
E
 
A
R
 
V
F
 
-
G
 
A
R
 
P
I
 
V
D
 
S
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
I
A
 
A
W
 
R
G
 
L
A
 
H
P
 
D
A
 
A
E
 
L
D
 
E
Y
 
T
P
 
D
L
 
D
E
 
A
G
 
T
W
 
W
N
 
R
K
 
Q
V
 
V
M
 
M
D
 
A
L
 
V
N
 
N
V
 
V
T
 
D
G
 
G
L
 
M
F
 
F
L
 
W
L
 
A
T
 
S
Q
 
R
A
 
A
V
 
F
A
 
G
R
 
R
E
 
-
A
 
A
F
 
M
L
 
V
K
 
A
Q
 
R
G
 
G
K
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
L
A
 
G
S
 
S
I
 
M
E
 
S
G
 
G
L
 
T
Q
 
I
G
 
-
H
 
V
H
 
N
H
 
R
S
 
P
Q
 
Q
L
 
F
G
 
A
T
 
S
I
 
-
A
 
S
Y
|
Y
N
 
M
T
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
H
N
 
Q
M
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
W
 
W
G
 
A
P
 
G
R
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
F
x
V
P
x
A
S
x
T
K
 
E
M
 
M
T
 
T
-
 
L
-
 
K
M
 
M
T
 
R
T
 
E
L
 
R
G
 
P
Q
 
E
H
 
L
G
 
F
D
 
E
D
 
T
M
 
W
L
 
L
R
 
D
Q
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
K
 
R
L
 
C
G
 
G
G
 
E
D
 
P
T
 
S
D
 
E
L
 
I
M
 
A
G
 
A
P
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
A
 
A
G
 
A
G
 
S
H
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
I
 
I
I
 
L
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T
I
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>CCNA_01345 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_01345
MSSPLHKLFDLTGRVAIVTGGSRGLGLQIARALAEYGAAVALVARKQGELDAAVAALTAE
GRTAVGLVADLGQAGSAQDLTARVLERFGRIDILVNNAGAAWGAPAEDYPLEGWNKVMDL
NVTGLFLLTQAVAREAFLKQGKGAVVNVASIEGLQGHHHSQLGTIAYNTAKGAVINMTRA
LAAEWGPRNIRVNAVAPGYFPSKMTMTTLGQHGDDMLRQTPLGKLGGDTDLMGPALLLAS
DAGGHITGQIIVVDGGMTII

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory