SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CCNA_01356 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_01356 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5eynA Crystal structure of fructokinase from vibrio cholerae o395 in fructose, adp, beryllium trifluoride and calcium ion bound form
28% identity, 46% coverage: 35:332/642 of query aligns to 22:305/306 of 5eynA

query
sites
5eynA
F
 
Y
A
 
L
K
 
K
Y
 
C
L
 
P
G
 
G
G
|
G
S
x
A
P
 
P
T
 
A
N
|
N
T
 
V
A
 
A
A
 
V
G
 
A
G
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
S
L
 
G
K
 
R
T
 
S
G
 
A
L
 
F
L
 
F
T
 
G
R
 
R
V
 
V
G
 
G
A
 
N
D
 
D
H
 
P
M
 
F
G
 
G
R
 
R
F
 
F
I
 
M
R
 
Q
E
 
Q
Q
 
T
L
 
L
E
 
T
R
 
D
E
 
E
G
 
Q
V
 
V
D
 
D
V
 
C
A
 
Q
G
 
H
V
 
L
L
 
H
S
 
F
D
 
D
P
 
P
D
 
V
R
 
H
L
 
R
T
 
T
A
 
S
L
 
T
V
 
V
I
 
V
L
 
V
G
 
D
I
 
L
R
 
D
D
 
E
R
x
H
V
 
G
N
 
E
F
 
R
P
 
S
L
x
F
I
 
T
F
|
F
Y
 
M
R
 
V
E
 
K
N
 
P
C
 
S
A
 
A
D
 
D
M
 
Q
A
 
F
L
 
L
E
 
Q
P
 
L
S
 
S
D
 
D
V
 
I
D
 
P
E
 
S
A
 
-
W
 
-
F
 
F
A
 
Q
Q
 
K
A
 
G
G
 
E
A
 
W
V
 
L
L
 
H
I
 
V
N
 
C
G
 
S
T
 
I
H
 
A
L
 
L
S
 
A
Q
 
N
P
 
Q
N
 
P
V
 
S
Y
 
R
E
 
S
T
 
S
S
 
T
L
 
F
K
 
A
A
 
A
A
 
I
R
 
A
A
 
Q
V
 
M
K
 
K
A
 
E
A
 
V
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
V
 
V
A
 
S
F
 
F
D
 
D
I
 
P
D
 
N
Y
 
L
R
|
R
P
 
E
V
 
E
L
 
V
W
 
W
G
 
S
L
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
E
 
E
N
 
P
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
L
T
 
Q
A
 
A
K
 
T
L
 
V
Q
 
M
E
 
R
V
 
A
V
 
V
A
 
G
L
 
L
C
 
A
D
 
D
L
 
V
I
 
V
V
 
K
G
 
F
T
 
S
E
 
E
E
 
E
E
 
E
I
 
L
H
 
Q
I
 
F
L
 
L
G
 
T
G
 
G
S
 
T
T
 
Q
D
 
S
T
 
I
I
 
E
A
 
E
A
 
G
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
I
 
I
R
 
A
R
 
D
A
 
F
S
 
Q
D
 
I
A
 
P
L
 
L
L
 
V
V
 
V
C
 
V
K
x
T
R
 
L
G
|
G
P
x
A
E
 
K
G
 
G
C
 
A
V
 
L
A
 
V
F
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
A
I
 
T
P
 
P
D
 
N
A
 
S
L
 
-
D
 
Q
E
 
Q
G
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
G
R
 
K
G
x
A
F
 
-
K
 
-
V
|
V
E
 
K
V
 
P
F
 
I
N
 
D
V
x
T
L
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
F
|
F
M
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
L
L
 
L
-
 
Y
-
 
R
-
 
L
-
 
S
-
 
V
-
 
A
R
 
Q
G
 
D
W
 
W
L
 
H
R
 
N
H
 
Q
E
 
A
S
 
T
V
 
I
E
 
L
T
 
D
C
 
A
C
 
V
E
 
K
W
 
W
G
 
A
N
|
N
A
 
G
C
 
C
G
|
G
A
|
A
I
 
L
V
 
A
V
 
T
S
 
T
R
 
Q
H
 
K
G
 
G
C
 
A
T
 
M
P
 
T
A
 
A
M
 
L
P
 
P
T
 
N
W
 
Q
I
 
A
E
 
A
L
 
L
Q
 
Y
A
 
A
F
 
F
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5yggA Crystal structure of fructokinase double-mutant (t261c-h108c) from vibrio cholerae o395 in fructose, adp and potassium ion bound form (see paper)
28% identity, 46% coverage: 35:332/642 of query aligns to 26:309/310 of 5yggA

query
sites
5yggA
F
 
Y
A
 
L
K
 
K
Y
 
C
L
 
P
G
 
G
G
|
G
S
x
A
P
 
P
T
 
A
N
 
N
T
 
V
A
 
A
A
 
V
G
 
A
G
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
S
L
 
G
K
 
R
T
 
S
G
 
A
L
 
F
L
 
F
T
 
G
R
 
R
V
 
V
G
 
G
A
 
N
D
 
D
H
 
P
M
 
F
G
 
G
R
 
R
F
 
F
I
 
M
R
 
Q
E
 
Q
Q
 
T
L
 
L
E
 
T
R
 
D
E
 
E
G
 
Q
V
 
V
D
 
D
V
 
C
A
 
Q
G
 
H
V
 
L
L
 
H
S
 
F
D
 
D
P
 
P
D
 
V
R
 
H
L
 
R
T
 
T
A
 
S
L
 
T
V
 
V
I
 
V
L
 
V
G
 
D
I
 
L
R
 
D
D
 
E
R
 
C
V
 
G
N
 
E
F
 
R
P
 
S
L
x
F
I
 
T
F
|
F
Y
 
M
R
 
V
E
 
K
N
 
P
C
 
S
A
 
A
D
 
D
M
 
Q
A
 
F
L
 
L
E
 
Q
P
 
L
S
 
S
D
 
D
V
 
I
D
 
P
E
 
S
A
 
-
W
 
-
F
 
F
A
 
Q
Q
 
K
A
 
G
G
 
E
A
 
W
V
 
L
L
 
H
I
 
V
N
 
C
G
 
S
T
 
I
H
 
A
L
 
L
S
 
A
Q
 
N
P
 
Q
N
 
P
V
 
S
Y
 
R
E
 
S
T
 
S
S
 
T
L
 
F
K
 
A
A
 
A
A
 
I
R
 
A
A
 
Q
V
 
M
K
 
K
A
 
E
A
 
V
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
V
 
V
A
 
S
F
 
F
D
 
D
I
 
P
D
 
N
Y
 
L
R
|
R
P
 
E
V
 
E
L
 
V
W
 
W
G
 
S
L
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
E
 
E
N
 
P
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
L
T
 
Q
A
 
A
K
 
T
L
 
V
Q
 
M
E
 
R
V
 
A
V
 
V
A
 
G
L
 
L
C
 
A
D
 
D
L
 
V
I
 
V
V
x
K
G
 
F
T
 
S
E
 
E
E
 
E
E
 
E
I
 
L
H
 
Q
I
 
F
L
 
L
G
 
T
G
 
G
S
 
T
T
 
Q
D
 
S
T
 
I
I
 
E
A
 
E
A
 
G
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
I
 
I
R
 
A
R
 
D
A
 
F
S
 
Q
D
 
I
A
 
P
L
 
L
L
 
V
V
 
V
C
 
V
K
x
T
R
 
L
G
|
G
P
 
A
E
 
K
G
 
G
C
 
A
V
 
L
A
 
V
F
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
A
I
 
T
P
 
P
D
 
N
A
 
S
L
 
-
D
 
Q
E
 
Q
G
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
G
R
 
K
G
x
A
F
 
-
K
 
-
V
|
V
E
 
K
V
 
P
F
 
I
N
 
D
V
 
C
L
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
A
 
A
F
|
F
M
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
L
L
 
L
-
 
Y
-
 
R
-
 
L
-
 
S
-
 
V
-
 
A
R
 
Q
G
 
D
W
 
W
L
 
H
R
 
N
H
 
Q
E
 
A
S
 
T
V
 
I
E
 
L
T
 
D
C
 
A
C
 
V
E
 
K
W
 
W
G
 
A
N
|
N
A
 
G
C
 
C
G
|
G
A
|
A
I
 
L
V
 
A
V
 
T
S
 
T
R
 
Q
H
 
K
G
 
G
C
 
A
T
 
M
P
 
T
A
 
A
M
 
L
P
 
P
T
 
N
W
 
Q
I
 
A
E
 
A
L
 
L
Q
 
Y
A
 
A
F
 
F
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1v1aA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound 2- keto-3-deoxygluconate and adp (see paper)
30% identity, 51% coverage: 8:332/642 of query aligns to 2:301/301 of 1v1aA

query
sites
1v1aA
L
 
L
D
 
E
L
 
V
I
 
V
A
 
T
V
 
A
G
 
G
R
 
E
S
 
P
S
x
L
V
 
V
D
 
A
L
 
L
Y
 
V
G
 
P
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
P
G
 
G
G
 
-
R
 
H
L
 
L
E
 
R
D
 
G
M
 
K
G
 
R
S
 
L
F
 
L
A
 
E
K
 
V
Y
 
Y
L
 
V
G
 
G
G
|
G
S
x
A
P
 
E
T
 
V
N
|
N
T
 
V
A
 
A
A
 
V
G
 
A
G
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
V
K
 
K
T
 
V
G
 
G
L
 
F
L
 
V
T
 
G
R
 
R
V
 
V
G
 
G
A
 
E
D
 
D
H
 
E
M
 
L
G
 
G
R
 
A
F
 
M
I
 
V
R
 
E
E
 
E
Q
 
R
L
 
L
E
 
R
R
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
T
G
 
H
V
 
F
L
 
R
S
 
R
D
 
A
P
 
P
D
 
G
R
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
I
 
F
L
 
T
G
 
G
I
 
L
R
x
Y
D
 
L
R
 
R
V
 
E
N
 
Y
F
 
L
P
 
P
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
V
I
 
F
F
 
Y
Y
 
Y
R
|
R
E
 
K
N
 
G
C
 
S
A
 
A
D
 
G
M
 
S
A
 
A
L
 
L
E
 
A
P
 
P
S
 
G
D
 
A
V
 
F
D
 
D
E
 
P
A
 
D
W
 
Y
F
 
L
A
 
E
Q
 
G
A
 
V
G
 
R
A
 
F
V
 
L
L
 
H
I
 
L
N
 
S
G
 
G
-
 
I
T
 
T
H
 
P
L
 
A
S
 
L
Q
 
S
P
 
P
N
 
E
V
 
A
Y
 
R
E
 
A
T
 
F
S
 
S
L
 
L
K
 
W
A
 
A
A
 
M
R
 
E
A
 
E
V
 
A
K
 
K
A
 
R
A
 
R
G
 
G
G
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
S
F
 
L
D
 
D
I
 
V
D
 
N
Y
 
Y
R
|
R
P
 
Q
V
 
T
L
 
L
W
 
W
G
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
E
 
S
N
 
P
Q
 
E
Q
 
E
V
 
A
T
 
R
A
 
G
K
 
F
L
 
L
Q
 
E
E
 
R
V
 
A
V
 
L
A
 
P
L
 
G
C
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
L
V
 
F
G
 
L
T
 
S
E
 
E
E
 
E
E
 
E
I
 
A
H
 
E
I
 
L
L
 
L
G
 
F
G
 
G
S
 
R
T
 
V
D
 
E
T
 
E
I
 
-
A
 
-
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
I
 
L
R
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
S
D
 
A
A
 
P
L
 
E
L
 
V
V
 
V
C
 
L
K
|
K
R
 
R
G
|
G
P
x
A
E
 
K
G
 
G
C
 
A
V
 
W
A
 
A
F
 
F
P
 
V
G
 
D
A
 
G
I
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
R
G
 
R
V
 
V
S
 
E
A
 
G
R
 
S
G
 
A
F
 
F
K
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
A
F
 
V
N
 
D
V
 
P
L
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
F
 
F
M
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
R
 
A
G
 
G
W
 
A
L
 
V
R
 
W
H
 
G
E
 
L
S
 
P
V
 
V
E
 
E
T
 
E
C
 
R
C
 
L
E
 
R
W
 
L
G
 
A
N
|
N
A
 
L
C
 
L
G
 
G
A
|
A
I
 
S
V
 
V
V
 
A
S
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
C
x
D
T
 
H
P
 
E
A
 
G
M
 
A
P
 
P
T
 
Y
W
 
R
I
 
E
E
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
V
F
 
L
L
 
L

Q53W83 2-dehydro-3-deoxygluconokinase; 2-keto-3-deoxygluconokinase; 3-deoxy-2-oxo-D-gluconate kinase; KDG kinase; EC 2.7.1.45 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see paper)
30% identity, 51% coverage: 8:333/642 of query aligns to 2:302/309 of Q53W83

query
sites
Q53W83
L
 
L
D
 
E
L
 
V
I
 
V
A
 
T
V
 
A
G
 
G
R
 
E
S
 
P
S
 
L
V
 
V
D
 
A
L
 
L
Y
 
V
G
 
P
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
P
G
 
G
G
 
-
R
 
H
L
 
L
E
 
R
D
 
G
M
 
K
G
 
R
S
 
L
F
 
L
A
 
E
K
 
V
Y
 
Y
L
 
V
G
 
G
G
|
G
S
x
A
P
x
E
T
x
V
N
|
N
T
 
V
A
 
A
A
 
V
G
 
A
G
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
V
K
 
K
T
 
V
G
 
G
L
 
F
L
 
V
T
 
G
R
 
R
V
 
V
G
 
G
A
 
E
D
 
D
H
 
E
M
 
L
G
 
G
R
 
A
F
 
M
I
 
V
R
 
E
E
 
E
Q
 
R
L
 
L
E
 
R
R
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
T
G
 
H
V
 
F
L
 
R
S
 
R
D
 
A
P
 
P
D
 
G
R
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
I
 
F
L
 
T
G
 
G
I
 
L
R
 
Y
D
 
L
R
 
R
V
 
E
N
 
Y
F
 
L
P
 
P
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
V
I
 
F
F
x
Y
Y
|
Y
R
|
R
E
 
K
N
 
G
C
 
S
A
 
A
D
 
G
M
 
S
A
 
A
L
 
L
E
 
A
P
 
P
S
 
G
D
 
A
V
 
F
D
 
D
E
 
P
A
 
D
W
 
Y
F
 
L
A
 
E
Q
 
G
A
 
V
G
 
R
A
 
F
V
 
L
L
 
H
I
 
L
N
 
S
G
 
G
-
 
I
T
 
T
H
 
P
L
 
A
S
 
L
Q
 
S
P
 
P
N
 
E
V
 
A
Y
 
R
E
 
A
T
 
F
S
 
S
L
 
L
K
 
W
A
 
A
A
 
M
R
 
E
A
 
E
V
 
A
K
 
K
A
 
R
A
 
R
G
 
G
G
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
S
F
 
L
D
 
D
I
 
V
D
 
N
Y
 
Y
R
|
R
P
 
Q
V
 
T
L
 
L
W
 
W
G
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
E
 
S
N
 
P
Q
 
E
Q
 
E
V
 
A
T
 
R
A
 
G
K
 
F
L
 
L
Q
 
E
E
 
R
V
 
A
V
 
L
A
 
P
L
 
G
C
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
L
V
 
F
G
 
L
T
x
S
E
 
E
E
 
E
E
 
E
I
 
A
H
 
E
I
 
L
L
 
L
G
 
F
G
 
G
S
 
R
T
 
V
D
 
E
T
 
E
I
 
-
A
 
-
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
I
 
L
R
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
S
D
 
A
A
 
P
L
 
E
L
 
V
V
 
V
C
 
L
K
|
K
R
|
R
G
|
G
P
x
A
E
x
K
G
|
G
C
x
A
V
 
W
A
 
A
F
 
F
P
 
V
G
 
D
A
 
G
I
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
R
G
 
R
V
 
V
S
 
E
A
 
G
R
 
S
G
 
A
F
 
F
K
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
A
F
 
V
N
 
D
V
 
P
L
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
F
 
F
M
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
R
 
A
G
 
G
W
 
A
L
 
V
R
 
W
H
 
G
E
 
L
S
 
P
V
 
V
E
 
E
T
 
E
C
 
R
C
 
L
E
 
R
W
 
L
G
 
A
N
|
N
A
 
L
C
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
S
V
 
V
V
 
A
S
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
C
x
D
T
 
H
P
 
E
A
 
G
M
 
A
P
 
P
T
 
Y
W
 
R
I
 
E
E
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
V
F
 
L
L
 
L
S
 
K

1v1bA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound atp (see paper)
30% identity, 50% coverage: 8:329/642 of query aligns to 2:298/300 of 1v1bA

query
sites
1v1bA
L
 
L
D
 
E
L
 
V
I
 
V
A
 
T
V
 
A
G
 
G
R
 
E
S
 
P
S
 
L
V
 
V
D
 
A
L
 
L
Y
 
V
G
 
P
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
P
G
 
G
G
 
-
R
 
H
L
 
L
E
 
R
D
 
G
M
 
K
G
 
R
S
 
L
F
 
L
A
 
E
K
 
V
Y
 
Y
L
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
A
P
 
E
T
 
V
N
 
N
T
 
V
A
 
A
A
 
V
G
 
A
G
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
V
K
 
K
T
 
V
G
 
G
L
 
F
L
 
V
T
 
G
R
 
R
V
 
V
G
 
G
A
 
E
D
 
D
H
 
E
M
 
L
G
 
G
R
 
A
F
 
M
I
 
V
R
 
E
E
 
E
Q
 
R
L
 
L
E
 
R
R
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
T
G
 
H
V
 
F
L
 
R
S
 
R
D
 
A
P
 
P
D
 
G
R
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
I
 
F
L
 
T
G
 
G
I
 
L
R
 
Y
D
 
L
R
 
R
V
 
E
N
 
Y
F
 
L
P
 
P
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
V
I
 
F
F
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
E
 
K
N
 
G
C
 
S
A
 
A
D
 
G
M
 
S
A
 
A
L
 
L
E
 
A
P
 
P
S
 
G
D
 
A
V
 
F
D
 
D
E
 
P
A
 
D
W
 
Y
F
 
L
A
 
E
Q
 
G
A
 
V
G
 
R
A
 
F
V
 
L
L
 
H
I
 
L
N
 
S
G
 
G
-
 
I
T
 
T
H
 
P
L
 
A
S
 
L
Q
 
S
P
 
P
N
 
E
V
 
A
Y
 
R
E
 
A
T
 
F
S
 
S
L
 
L
K
 
W
A
 
A
A
 
M
R
 
E
A
 
E
V
 
A
K
 
K
A
 
R
A
 
R
G
 
G
G
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
S
F
 
L
D
 
D
I
 
V
D
 
N
Y
 
Y
R
 
R
P
 
Q
V
 
T
L
 
L
W
 
W
G
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
E
 
S
N
 
P
Q
 
E
Q
 
E
V
 
A
T
 
R
A
 
G
K
 
F
L
 
L
Q
 
E
E
 
R
V
 
A
V
 
L
A
 
P
L
 
G
C
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
L
V
 
F
G
 
L
T
 
S
E
 
E
E
 
E
E
 
E
I
 
A
H
 
E
I
 
L
L
 
L
G
 
F
G
 
G
S
 
R
T
 
V
D
 
E
T
 
E
I
 
-
A
 
-
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
I
 
L
R
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
S
D
 
A
A
 
P
L
 
E
L
 
V
V
 
V
C
 
L
K
|
K
R
 
R
G
|
G
P
 
A
E
 
K
G
 
G
C
 
A
V
 
W
A
 
A
F
 
F
P
 
V
G
 
D
A
 
G
I
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
R
G
 
R
V
 
V
S
 
E
A
 
G
R
 
S
G
x
A
F
|
F
K
 
A
V
|
V
E
 
E
V
 
A
F
 
V
N
 
D
V
 
P
L
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
F
 
F
M
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
R
 
A
G
 
G
W
 
A
L
 
V
R
 
W
H
 
G
E
 
L
S
 
P
V
 
V
E
 
E
T
 
E
C
 
R
C
 
L
E
 
R
W
 
L
G
 
A
N
|
N
A
 
L
C
 
L
G
 
G
A
|
A
I
 
S
V
 
V
V
 
A
S
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
C
 
D
T
 
H
P
 
E
A
 
G
M
 
A
P
 
P
T
 
Y
W
 
R
I
 
E
E
 
D
L
 
L
Q
 
E

3gbuA Crystal structure of an uncharacterized sugar kinase ph1459 from pyrococcus horikoshii in complex with atp
26% identity, 44% coverage: 12:291/642 of query aligns to 4:254/302 of 3gbuA

query
sites
3gbuA
A
 
S
V
 
I
G
 
G
R
 
E
S
 
L
S
 
L
V
 
I
D
 
D
L
 
L
Y
 
I
G
 
S
Q
 
V
Q
 
E
V
 
-
G
 
E
G
 
G
R
 
D
L
 
L
E
 
K
D
 
D
M
 
V
G
 
R
S
 
L
F
 
F
A
 
E
K
 
K
Y
 
H
L
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
A
P
 
P
T
 
A
N
 
N
T
 
V
A
 
A
A
 
V
G
 
G
G
 
V
A
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
V
K
 
K
T
 
S
G
 
S
L
 
L
L
 
I
T
 
S
R
 
K
V
 
V
G
 
G
A
 
N
D
 
D
H
 
P
M
 
F
G
 
G
R
 
E
F
 
Y
I
 
L
R
 
I
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
E
 
S
R
 
K
E
 
E
G
 
N
V
 
V
D
 
D
V
 
T
A
 
R
G
 
G
V
 
I
L
 
V
S
 
K
D
 
D
P
 
E
D
 
K
R
 
K
L
 
H
T
 
T
A
 
G
L
 
I
V
 
V
I
 
F
L
 
V
G
 
Q
I
 
L
R
 
K
D
 
G
R
 
A
V
 
S
N
 
-
F
 
-
P
 
P
L
 
S
I
 
F
F
 
L
Y
 
L
R
 
Y
E
 
D
N
 
D
C
 
V
A
 
A
D
 
Y
M
 
F
A
 
N
L
 
M
E
 
T
P
 
L
S
 
N
D
 
D
V
 
I
D
 
N
E
 
W
A
 
D
W
 
I
F
 
V
A
 
E
Q
 
E
A
 
A
G
 
K
A
 
I
V
 
V
L
 
N
I
 
F
N
 
G
G
 
S
T
 
V
H
 
I
L
 
L
S
 
A
Q
 
R
P
 
N
N
 
P
V
 
S
Y
 
R
E
 
E
T
 
T
S
 
V
L
 
M
K
 
K
A
 
V
A
 
I
R
 
K
A
 
K
V
 
I
K
 
K
A
 
G
A
 
S
G
 
-
G
 
S
R
 
L
V
 
I
A
 
A
F
 
F
D
 
D
I
 
V
D
 
N
Y
 
L
R
 
R
P
 
L
V
 
D
L
 
L
W
 
W
G
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
R
F
 
G
V
 
Q
E
 
E
N
 
E
Q
 
E
Q
 
M
V
 
I
T
 
K
A
 
V
K
 
-
L
 
L
Q
 
E
E
 
E
V
 
S
V
 
I
A
 
K
L
 
L
C
 
A
D
 
D
L
 
I
I
 
V
V
x
K
G
 
A
T
 
S
E
 
E
E
 
E
E
 
E
I
 
V
H
 
L
I
 
Y
L
 
L
G
 
E
G
 
N
S
 
-
T
 
-
D
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
Q
A
 
G
I
 
V
R
 
E
R
 
V
A
 
K
S
 
G
D
 
S
A
 
M
L
 
L
L
 
T
V
 
A
C
 
I
K
x
T
R
 
L
G
|
G
P
 
P
E
 
K
G
 
G
C
 
F
V
 
R
A
 
L
F
 
I
P
 
K
G
 
N
A
 
-
I
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
E
E
 
T
G
 
V
V
 
V
S
 
D
A
 
V
R
 
P
G
 
S
F
 
Y
K
 
N
V
|
V
E
 
N
V
x
P
F
 
L
N
 
D
V
 
T
L
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
F
 
F
M
 
M
A
 
A
G
 
A
F
 
L
L
 
L
R
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3ih0A Crystal structure of an uncharacterized sugar kinase ph1459 from pyrococcus horikoshii in complex with amp-pnp
26% identity, 44% coverage: 12:291/642 of query aligns to 5:255/304 of 3ih0A

query
sites
3ih0A
A
 
S
V
 
I
G
 
G
R
 
E
S
 
L
S
 
L
V
 
I
D
 
D
L
 
L
Y
 
I
G
 
S
Q
 
V
Q
 
E
V
 
-
G
 
E
G
 
G
R
 
D
L
 
L
E
 
K
D
 
D
M
 
V
G
 
R
S
 
L
F
 
F
A
 
E
K
 
K
Y
 
H
L
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
A
P
 
P
T
 
A
N
 
N
T
 
V
A
 
A
A
 
V
G
 
G
G
 
V
A
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
V
K
 
K
T
 
S
G
 
S
L
 
L
L
 
I
T
 
S
R
 
K
V
 
V
G
 
G
A
 
N
D
 
D
H
 
P
M
 
F
G
 
G
R
 
E
F
 
Y
I
 
L
R
 
I
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
E
 
S
R
 
K
E
 
E
G
 
N
V
 
V
D
 
D
V
 
T
A
 
R
G
 
G
V
 
I
L
 
V
S
 
K
D
 
D
P
 
E
D
 
K
R
 
K
L
 
H
T
 
T
A
 
G
L
 
I
V
 
V
I
 
F
L
 
V
G
 
Q
I
 
L
R
 
K
D
 
G
R
 
A
V
 
S
N
 
-
F
 
-
P
 
P
L
 
S
I
 
F
F
 
L
Y
 
L
R
 
Y
E
 
D
N
 
D
C
 
V
A
 
A
D
 
Y
M
 
F
A
 
N
L
 
M
E
 
T
P
 
L
S
 
N
D
 
D
V
 
I
D
 
N
E
 
W
A
 
D
W
 
I
F
 
V
A
 
E
Q
 
E
A
 
A
G
 
K
A
 
I
V
 
V
L
 
N
I
 
F
N
 
G
G
 
S
T
 
V
H
 
I
L
 
L
S
 
A
Q
 
R
P
 
N
N
 
P
V
 
S
Y
 
R
E
 
E
T
 
T
S
 
V
L
 
M
K
 
K
A
 
V
A
 
I
R
 
K
A
 
K
V
 
I
K
 
K
A
 
G
A
 
S
G
 
-
G
 
S
R
 
L
V
 
I
A
 
A
F
 
F
D
 
D
I
 
V
D
 
N
Y
 
L
R
 
R
P
 
L
V
 
D
L
 
L
W
 
W
G
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
R
F
 
G
V
 
Q
E
 
E
N
 
E
Q
 
E
Q
 
M
V
 
I
T
 
K
A
 
V
K
 
-
L
 
L
Q
 
E
E
 
E
V
 
S
V
 
I
A
 
K
L
 
L
C
 
A
D
 
D
L
 
I
I
 
V
V
 
K
G
 
A
T
 
S
E
 
E
E
 
E
E
 
E
I
 
V
H
 
L
I
 
Y
L
 
L
G
 
E
G
 
N
S
 
-
T
 
-
D
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
Q
A
 
G
I
 
V
R
 
E
R
 
V
A
 
K
S
 
G
D
 
S
A
 
M
L
 
L
L
 
T
V
 
A
C
 
I
K
x
T
R
 
L
G
|
G
P
 
P
E
 
K
G
 
G
C
 
F
V
 
R
A
 
L
F
 
I
P
 
K
G
 
N
A
 
-
I
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
E
E
 
T
G
 
V
V
 
V
S
 
D
A
 
V
R
 
P
G
 
S
F
 
Y
K
 
N
V
|
V
E
 
N
V
 
P
F
 
L
N
 
D
V
 
T
L
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
F
 
F
M
 
M
A
 
A
G
 
A
F
 
L
L
 
L
R
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q8ZKR2 Aminoimidazole riboside kinase; AIRs kinase; EC 2.7.1.223 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
27% identity, 50% coverage: 13:336/642 of query aligns to 10:311/319 of Q8ZKR2

query
sites
Q8ZKR2
V
 
I
G
 
G
R
 
D
S
 
A
S
 
S
V
 
V
D
|
D
L
 
L
Y
 
V
G
 
P
Q
 
-
Q
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
E
D
 
K
M
 
Q
G
 
N
S
 
S
F
 
Y
A
 
L
K
 
K
Y
 
C
L
 
P
G
 
G
G
|
G
S
 
A
P
 
S
T
 
A
N
 
N
T
 
V
A
 
G
A
 
V
G
 
C
G
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
G
K
 
E
T
 
C
G
 
G
L
 
F
L
 
I
T
 
G
R
 
C
V
 
L
G
 
G
A
 
D
D
 
D
H
 
D
M
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
F
I
 
L
R
 
R
E
 
Q
Q
 
V
L
 
F
E
 
Q
R
 
D
E
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
T
G
 
F
V
 
L
L
 
R
S
 
L
D
 
D
P
 
A
D
 
D
R
 
L
L
 
T
T
 
S
A
 
A
L
 
V
V
 
L
I
 
I
L
 
V
G
 
N
I
 
L
R
 
T
D
 
A
R
 
D
V
 
G
N
 
E
F
 
R
P
 
S
L
 
F
I
 
T
F
x
Y
Y
 
L
R
 
V
E
 
H
N
 
P
C
 
G
A
 
A
D
 
D
M
 
T
A
 
Y
L
 
V
E
 
S
P
 
P
S
 
Q
D
 
D
V
 
L
D
 
P
E
 
P
A
 
-
W
 
-
F
 
F
A
 
R
Q
 
Q
A
 
Y
G
 
E
A
 
W
V
 
F
L
 
Y
I
 
F
N
 
S
G
 
S
T
 
I
H
 
G
L
 
L
S
 
T
Q
 
D
P
 
R
N
 
P
V
 
A
Y
 
R
E
 
E
T
 
A
S
 
C
L
 
L
K
 
E
A
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
R
V
 
M
K
 
R
A
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
V
 
V
A
 
L
F
 
F
D
 
D
I
 
V
D
 
N
Y
 
L
R
|
R
P
 
S
V
 
K
L
 
M
W
 
W
G
 
G
L
 
N
T
 
T
G
 
D
K
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
E
 
E
N
 
I
Q
 
P
Q
 
E
V
 
L
T
 
I
A
 
A
K
 
R
L
 
S
Q
x
A
E
x
A
V
 
L
V
x
A
A
 
S
L
 
I
C
 
C
D
 
K
L
 
V
I
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
S
E
 
A
E
 
D
E
 
E
I
 
L
H
 
C
I
 
Q
L
 
L
G
 
S
G
 
G
S
 
A
T
 
S
D
 
H
T
 
W
I
 
Q
A
 
D
A
 
A
L
 
R
R
 
Y
A
 
Y
I
 
L
R
 
R
R
 
D
-
 
L
-
x
G
-
 
C
-
 
D
-
 
T
-
 
T
-
 
I
-
 
I
-
 
S
-
 
L
-
 
G
A
 
A
S
 
D
D
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
I
C
 
T
K
 
A
R
 
-
G
 
-
P
 
-
E
 
E
G
 
G
C
 
E
V
 
F
A
 
H
F
 
F
P
 
P
G
 
A
A
 
P
I
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
F
 
-
K
 
R
V
 
V
E
 
D
V
 
V
F
 
V
N
x
D
V
 
T
L
x
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
A
 
A
F
 
F
M
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
L
L
 
L
R
 
F
G
 
T
W
 
L
L
 
S
R
 
R
-
 
A
-
 
N
-
 
C
-
 
W
-
 
D
H
 
H
E
 
A
S
 
L
V
 
L
E
 
A
T
 
E
C
 
A
C
 
I
E
 
S
W
 
N
G
 
A
N
 
N
A
 
A
C
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
M
V
x
A
V
 
V
S
 
T
R
x
A
H
 
K
G
|
G
C
 
A
T
 
M
P
 
T
A
 
A
M
 
L
P
 
P
T
 
F
W
 
P
I
 
D
E
 
Q
L
 
L
Q
 
N
A
 
T
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
 
S
R
 
H
E
 
S

2dcnA Crystal structure of 2-keto-3-deoxygluconate kinase from sulfolobus tokodaii complexed with 2-keto-6-phosphogluconate (alpha-furanose form)
28% identity, 48% coverage: 27:334/642 of query aligns to 19:307/308 of 2dcnA

query
sites
2dcnA
G
 
G
R
 
P
L
 
L
E
 
R
D
 
H
M
 
V
G
 
S
S
 
Y
F
 
F
A
 
E
K
 
K
Y
 
H
L
 
V
G
 
A
G
|
G
S
 
S
P
 
E
T
 
A
N
 
N
T
 
Y
A
 
C
A
 
V
G
 
A
G
 
F
A
 
I
R
 
K
L
 
Q
G
 
G
L
 
N
K
 
E
T
 
C
G
 
G
L
 
I
L
 
I
T
 
A
R
 
K
V
 
V
G
 
G
A
 
D
D
 
D
H
 
E
M
 
F
G
 
G
R
 
Y
F
 
N
I
 
A
R
 
I
E
 
E
Q
 
W
L
 
L
E
 
R
R
 
G
E
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
S
G
 
H
V
 
M
L
 
K
S
 
I
D
 
D
P
 
P
D
 
S
R
 
A
L
 
P
T
 
T
A
 
G
L
 
-
V
 
-
I
 
I
L
x
F
G
 
F
I
 
I
R
 
Q
D
 
R
R
 
H
V
 
Y
N
 
P
F
 
V
P
 
P
L
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
E
-
 
S
I
 
I
F
x
Y
Y
 
Y
R
|
R
E
 
K
N
 
G
C
 
S
A
 
A
D
 
G
M
 
S
A
 
K
L
 
L
E
 
S
P
 
P
S
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
E
W
 
Y
F
 
V
A
 
K
Q
 
S
A
 
A
G
 
D
A
 
L
V
 
V
L
 
H
I
 
S
N
 
S
G
 
G
T
x
I
H
 
T
L
 
L
S
 
A
Q
 
I
P
 
S
N
 
S
V
 
T
Y
 
A
E
 
K
T
 
E
S
 
A
L
 
V
K
 
-
A
 
-
A
 
Y
R
 
K
A
 
A
V
 
F
K
 
E
A
 
I
A
 
A
G
 
S
G
 
N
R
 
R
V
 
-
A
 
S
F
 
F
D
 
D
I
 
T
D
 
N
Y
 
I
R
|
R
P
 
L
V
 
K
L
 
L
W
 
W
G
 
S
L
 
A
T
 
E
G
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
E
 
E
N
 
A
Q
 
K
Q
 
R
V
 
E
T
 
I
A
 
L
K
 
K
L
 
L
Q
 
L
E
 
S
V
 
K
V
 
F
A
 
H
L
 
L
C
 
K
D
 
F
L
 
L
I
 
I
V
 
T
G
x
D
T
 
T
E
 
D
E
 
D
E
 
S
I
 
K
H
 
I
I
 
I
L
 
L
G
 
G
G
 
E
S
 
S
T
 
-
D
 
D
T
 
P
I
 
D
A
 
K
A
 
A
L
 
A
R
 
K
A
 
A
I
 
F
R
 
S
R
 
D
A
 
Y
S
 
A
D
 
E
A
 
-
L
 
I
L
 
I
V
 
V
C
 
M
K
|
K
R
 
L
G
|
G
P
|
P
E
 
K
G
|
G
C
 
A
V
 
I
A
 
V
F
 
Y
P
 
Y
G
 
D
A
 
G
I
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
K
G
 
K
V
 
Y
S
 
Y
A
 
S
R
 
S
G
 
G
F
 
Y
K
 
Q
V
 
V
E
 
P
V
|
V
F
 
E
N
 
D
V
 
V
L
x
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
F
 
L
M
 
G
A
 
G
G
 
T
F
 
F
L
 
L
R
 
S
G
 
L
W
 
Y
L
 
Y
R
 
K
H
 
G
E
 
F
S
 
E
V
 
M
E
 
E
T
 
K
C
 
A
C
 
L
E
 
D
W
 
Y
G
 
A
N
x
I
A
 
V
C
 
A
G
x
S
A
 
T
I
 
L
V
 
N
V
|
V
S
 
M
R
 
I
H
 
R
G
 
G
C
x
D
T
 
Q
P
 
E
A
 
N
M
 
L
P
 
P
T
 
T
W
 
T
I
 
K
E
 
D
L
 
I
Q
 
E
A
 
T
F
 
F
L
 
L
S
 
R
E
 
E

2varA Crystal structure of sulfolobus solfataricus 2-keto-3-deoxygluconate kinase complexed with 2-keto-3-deoxygluconate (see paper)
25% identity, 51% coverage: 8:334/642 of query aligns to 1:309/311 of 2varA

query
sites
2varA
L
 
V
D
 
D
L
 
V
I
 
I
A
 
A
V
 
L
G
 
G
R
 
E
S
 
P
S
x
L
V
 
I
D
 
Q
L
 
-
Y
 
F
G
 
N
Q
 
S
Q
 
F
V
 
N
G
 
P
G
 
G
R
 
P
L
 
L
E
 
R
D
 
F
M
 
V
G
 
N
S
 
Y
F
 
F
A
 
E
K
 
K
Y
 
H
L
 
V
G
 
A
G
|
G
S
|
S
P
 
E
T
 
L
N
 
N
T
 
F
A
 
C
A
 
I
G
 
A
G
 
V
A
 
V
R
 
R
L
 
N
G
 
H
L
 
L
K
 
S
T
 
C
G
 
S
L
 
L
L
 
I
T
 
A
R
 
R
V
 
V
G
 
G
A
 
N
D
 
D
H
 
E
M
 
F
G
 
G
R
 
K
F
 
N
I
 
I
R
 
I
E
 
E
Q
 
Y
L
 
S
E
 
R
R
 
A
E
 
Q
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
T
A
 
S
G
 
H
V
 
I
L
 
K
S
 
V
D
 
D
P
 
N
D
 
E
R
 
S
L
 
F
T
 
T
A
 
G
L
 
I
V
x
Y
I
 
F
L
 
I
-
 
Q
-
 
R
G
 
G
I
 
Y
R
 
P
D
 
I
R
 
P
V
 
M
N
 
K
F
 
S
P
 
E
L
|
L
I
 
V
F
x
Y
Y
 
Y
R
|
R
E
 
K
N
 
G
C
 
S
A
 
A
D
 
G
M
 
S
A
 
R
L
 
L
E
 
S
P
 
P
S
 
E
D
 
D
V
 
I
D
 
N
E
 
E
A
 
N
W
 
Y
F
 
V
A
 
R
Q
 
N
A
 
S
G
 
R
A
 
L
V
 
V
L
 
H
I
 
S
N
 
T
G
 
G
T
x
I
H
 
T
L
 
L
S
 
A
-
 
I
Q
 
S
P
 
D
N
 
N
V
 
A
Y
 
K
E
 
E
T
 
A
S
 
V
L
 
I
K
 
K
A
 
A
A
 
F
R
 
E
A
 
L
V
 
A
K
 
K
A
 
S
A
 
R
G
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
S
F
 
L
D
 
D
I
 
T
D
 
N
Y
 
I
R
|
R
P
 
P
V
 
K
L
 
L
W
 
W
G
 
S
L
 
S
T
 
L
G
 
E
K
 
K
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
E
 
A
N
 
K
Q
 
E
Q
 
T
V
 
I
T
 
L
A
 
S
K
 
I
L
 
L
Q
 
K
E
 
K
V
 
Y
V
 
D
A
 
-
L
 
-
C
 
I
D
 
E
L
 
V
I
 
L
V
 
I
G
 
T
T
 
D
E
 
P
E
 
D
E
 
D
I
 
T
H
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
L
G
 
D
S
 
V
T
 
T
D
 
D
T
 
P
I
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
Y
R
 
R
A
 
K
I
 
Y
R
 
K
R
 
E
A
 
L
S
 
G
D
 
V
A
 
K
L
 
V
L
 
L
V
 
L
C
 
Y
K
|
K
R
 
L
G
|
G
P
x
S
E
 
K
G
|
G
C
 
A
V
 
I
A
 
A
F
 
Y
P
 
K
G
 
D
A
 
N
I
 
V
P
 
K
D
 
A
A
 
F
L
 
K
D
 
D
E
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
A
F
 
Y
K
 
K
V
 
V
E
 
P
V
 
V
F
 
E
N
 
D
V
 
P
L
x
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
F
x
M
M
 
A
A
 
G
G
 
T
F
 
F
L
 
V
R
 
S
G
 
L
W
 
Y
L
 
L
R
 
Q
H
 
G
E
 
K
S
 
D
V
 
I
E
 
E
T
 
Y
C
 
S
C
 
L
E
 
A
W
 
H
G
 
G
N
x
I
A
 
A
C
 
A
G
x
S
A
 
T
I
 
L
V
 
V
V
x
I
S
 
T
R
 
V
H
 
R
G
 
G
C
x
D
T
 
N
P
 
E
A
 
L
M
 
T
P
 
P
T
 
T
W
 
L
I
 
E
E
 
D
L
 
A
Q
 
E
A
 
R
F
 
F
L
 
L
S
 
N
E
 
E

Q97U29 2-dehydro-3-deoxygluconokinase/2-dehydro-3-deoxygalactonokinase; 2-dehydro-3-deoxyglucono/galactono-kinase; 2-keto-3-deoxy-galactonokinase; 2-keto-3-deoxygluconokinase; 3-deoxy-2-oxo-D-gluconate kinase; KDG kinase; KDGal kinase; EC 2.7.1.178 from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
25% identity, 51% coverage: 8:334/642 of query aligns to 2:310/313 of Q97U29

query
sites
Q97U29
L
 
V
D
 
D
L
 
V
I
 
I
A
 
A
V
 
L
G
 
G
R
 
E
S
 
P
S
 
L
V
 
I
D
 
Q
L
 
-
Y
 
F
G
 
N
Q
 
S
Q
 
F
V
 
N
G
 
P
G
 
G
R
 
P
L
 
L
E
 
R
D
 
F
M
 
V
G
 
N
S
 
Y
F
 
F
A
 
E
K
 
K
Y
 
H
L
 
V
G
 
A
G
|
G
S
|
S
P
x
E
T
x
L
N
|
N
T
 
F
A
 
C
A
 
I
G
 
A
G
 
V
A
 
V
R
 
R
L
 
N
G
 
H
L
 
L
K
 
S
T
 
C
G
 
S
L
 
L
L
 
I
T
 
A
R
 
R
V
 
V
G
 
G
A
 
N
D
 
D
H
 
E
M
 
F
G
 
G
R
 
K
F
 
N
I
 
I
R
 
I
E
 
E
Q
 
Y
L
 
S
E
 
R
R
 
A
E
 
Q
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
T
A
 
S
G
 
H
V
 
I
L
 
K
S
 
V
D
 
D
P
 
N
D
 
E
R
 
S
L
 
F
T
 
T
A
 
G
L
 
I
V
x
Y
I
 
F
L
 
I
-
 
Q
-
 
R
G
 
G
I
 
Y
R
 
P
D
 
I
R
 
P
V
 
M
N
 
K
F
 
S
P
 
E
L
 
L
I
 
V
F
x
Y
Y
|
Y
R
|
R
E
 
K
N
 
G
C
 
S
A
 
A
D
 
G
M
 
S
A
 
R
L
 
L
E
 
S
P
 
P
S
 
E
D
 
D
V
 
I
D
 
N
E
 
E
A
 
N
W
 
Y
F
 
V
A
 
R
Q
 
N
A
 
S
G
 
R
A
 
L
V
 
V
L
 
H
I
 
S
N
 
T
G
 
G
T
 
I
H
 
T
L
 
L
S
 
A
-
 
I
Q
 
S
P
 
D
N
 
N
V
 
A
Y
 
K
E
 
E
T
 
A
S
 
V
L
 
I
K
 
K
A
 
A
A
 
F
R
 
E
A
 
L
V
 
A
K
 
K
A
 
S
A
 
R
G
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
S
F
 
L
D
 
D
I
 
T
D
x
N
Y
x
I
R
|
R
P
 
P
V
 
K
L
 
L
W
 
W
G
 
S
L
 
S
T
 
L
G
 
E
K
 
K
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
E
 
A
N
 
K
Q
 
E
Q
 
T
V
 
I
T
 
L
A
 
S
K
 
I
L
 
L
Q
 
K
E
 
K
V
 
Y
V
 
D
A
 
-
L
 
-
C
 
I
D
 
E
L
 
V
I
 
L
V
 
I
G
 
T
T
 
D
E
 
P
E
 
D
E
 
D
I
 
T
H
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
L
G
 
D
S
 
V
T
 
T
D
 
D
T
 
P
I
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
Y
R
 
R
A
 
K
I
 
Y
R
 
K
R
 
E
A
 
L
S
 
G
D
 
V
A
 
K
L
 
V
L
 
L
V
 
L
C
 
Y
K
|
K
R
x
L
G
|
G
P
x
S
E
x
K
G
|
G
C
 
A
V
 
I
A
 
A
F
 
Y
P
 
K
G
 
D
A
 
N
I
 
V
P
 
K
D
 
A
A
 
F
L
 
K
D
 
D
E
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
A
F
 
Y
K
 
K
V
 
V
E
 
P
V
 
V
F
 
E
N
 
D
V
 
P
L
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
F
 
M
M
 
A
A
 
G
G
 
T
F
 
F
L
 
V
R
 
S
G
 
L
W
 
Y
L
 
L
R
 
Q
H
 
G
E
 
K
S
 
D
V
 
I
E
 
E
T
 
Y
C
 
S
C
 
L
E
 
A
W
 
H
G
 
G
N
 
I
A
 
A
C
 
A
G
 
S
A
 
T
I
 
L
V
 
V
V
 
I
S
 
T
R
 
V
H
 
R
G
 
G
C
x
D
T
 
N
P
 
E
A
 
L
M
 
T
P
 
P
T
 
T
W
 
L
I
 
E
E
 
D
L
 
A
Q
 
E
A
 
R
F
 
F
L
 
L
S
 
N
E
 
E

1tz3A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase complexed with aminoimidazole riboside (see paper)
27% identity, 50% coverage: 13:335/642 of query aligns to 6:299/299 of 1tz3A

query
sites
1tz3A
V
 
I
G
 
G
R
x
D
S
 
A
S
|
S
V
 
V
D
|
D
L
 
L
Y
 
V
G
 
P
Q
 
-
Q
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
E
D
 
K
M
 
Q
G
 
N
S
 
S
F
 
Y
A
 
L
K
 
K
Y
x
C
L
 
P
G
 
G
G
|
G
S
 
A
P
 
S
T
 
A
N
 
N
T
 
V
A
 
G
A
 
V
G
 
C
G
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
G
K
 
E
T
 
C
G
 
G
L
 
F
L
 
I
T
 
G
R
 
C
V
 
L
G
 
G
A
 
D
D
 
D
H
 
D
M
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
F
I
 
L
R
 
R
E
 
Q
Q
 
V
L
 
F
E
 
Q
R
 
D
E
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
T
G
 
F
V
 
L
L
 
R
S
 
L
D
 
D
P
 
A
D
 
D
R
 
L
L
 
T
T
 
S
A
 
A
L
 
V
V
x
L
I
 
I
L
 
V
G
 
N
I
 
-
R
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
-
N
 
-
F
 
-
P
 
S
L
x
F
I
 
T
F
x
Y
Y
 
L
R
 
V
E
 
H
N
 
P
C
 
G
A
 
A
D
 
D
M
 
T
A
 
Y
L
 
V
E
 
S
P
 
P
S
 
Q
D
 
D
V
 
L
D
 
P
E
 
P
A
 
-
W
 
-
F
 
F
A
 
R
Q
 
Q
A
 
Y
G
 
E
A
 
W
V
 
F
L
 
Y
I
 
F
N
 
S
G
 
S
T
 
I
H
 
G
L
 
L
S
 
T
Q
 
D
P
 
R
N
 
P
V
 
A
Y
 
R
E
 
E
T
 
A
S
 
C
L
 
L
K
 
E
A
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
R
V
 
M
K
 
R
A
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
V
 
V
A
 
L
F
 
F
D
 
D
I
 
V
D
 
N
Y
 
L
R
|
R
P
 
S
V
 
K
L
x
M
W
 
W
G
 
G
L
 
N
T
 
T
G
 
D
K
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
E
 
E
N
 
I
Q
 
P
Q
 
E
V
 
L
T
 
I
A
 
A
K
 
R
L
 
S
Q
 
A
E
 
A
V
 
L
V
 
A
A
 
S
L
 
I
C
 
C
D
 
K
L
 
V
I
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
S
E
 
A
E
 
D
E
 
E
I
 
L
H
 
C
I
 
Q
L
 
L
G
 
S
G
 
G
S
 
A
T
 
S
D
 
H
T
 
W
I
 
Q
A
 
D
A
 
A
L
 
R
R
 
Y
A
 
Y
I
 
L
R
 
R
R
 
D
-
 
L
-
 
G
-
 
C
-
 
D
-
 
T
-
 
T
-
 
I
-
 
I
-
 
S
-
 
L
-
 
G
A
 
A
S
 
D
D
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
I
C
 
T
K
 
A
R
 
-
G
 
-
P
 
-
E
 
E
G
 
G
C
 
E
V
 
F
A
 
H
F
 
F
P
 
P
G
 
A
A
 
P
I
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
F
 
-
K
 
R
V
 
V
E
 
D
V
 
V
F
 
V
N
 
D
V
 
T
L
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
F
 
F
M
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
L
L
 
L
R
 
F
G
 
T
W
 
L
L
 
S
R
 
R
-
 
A
-
 
N
-
 
C
-
 
W
-
 
D
H
 
H
E
 
A
S
 
L
V
 
L
E
 
A
T
 
E
C
 
A
C
 
I
E
 
S
W
 
N
G
 
A
N
 
N
A
 
A
C
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
M
V
 
A
V
 
V
S
 
T
R
 
A
H
 
K
G
 
G
C
 
A
T
 
M
P
 
T
A
 
A
M
 
L
P
 
P
T
 
F
W
 
P
I
 
D
E
 
Q
L
 
L
Q
 
N
A
 
T
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
 
S
R
 
H

1tz6A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase from salmonella enterica complexed with aminoimidazole riboside and atp analog (see paper)
27% identity, 50% coverage: 13:333/642 of query aligns to 6:297/297 of 1tz6A

query
sites
1tz6A
V
 
I
G
 
G
R
x
D
S
 
A
S
 
S
V
 
V
D
|
D
L
 
L
Y
 
V
G
 
P
Q
 
-
Q
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
E
D
 
K
M
 
Q
G
 
N
S
 
S
F
 
Y
A
 
L
K
 
K
Y
x
C
L
 
P
G
 
G
G
|
G
S
 
A
P
 
S
T
 
A
N
 
N
T
 
V
A
 
G
A
 
V
G
 
C
G
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
G
K
 
E
T
 
C
G
 
G
L
 
F
L
 
I
T
 
G
R
 
C
V
 
L
G
 
G
A
 
D
D
 
D
H
 
D
M
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
F
I
 
L
R
 
R
E
 
Q
Q
 
V
L
 
F
E
 
Q
R
 
D
E
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
T
G
 
F
V
 
L
L
 
R
S
 
L
D
 
D
P
 
A
D
 
D
R
 
L
L
 
T
T
 
S
A
 
A
L
 
V
V
 
L
I
 
I
L
 
V
G
 
N
I
 
-
R
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
-
N
 
-
F
 
-
P
 
S
L
x
F
I
 
T
F
x
Y
Y
 
L
R
 
V
E
 
H
N
 
P
C
 
G
A
 
A
D
 
D
M
 
T
A
 
Y
L
 
V
E
 
S
P
 
P
S
 
Q
D
 
D
V
 
L
D
 
P
E
 
P
A
 
-
W
 
-
F
 
F
A
 
R
Q
 
Q
A
 
Y
G
 
E
A
 
W
V
 
F
L
 
Y
I
 
F
N
 
S
G
 
S
T
 
I
H
 
G
L
 
L
S
 
T
Q
 
D
P
 
R
N
 
P
V
 
A
Y
 
R
E
 
E
T
 
A
S
 
C
L
 
L
K
 
E
A
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
R
V
 
M
K
 
R
A
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
V
 
V
A
 
L
F
 
F
D
 
D
I
 
V
D
x
N
Y
 
L
R
|
R
P
 
S
V
 
K
L
x
M
W
 
W
G
 
G
L
 
N
T
 
T
G
 
D
K
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
E
 
E
N
 
I
Q
 
P
Q
 
E
V
 
L
T
 
I
A
 
A
K
 
R
L
 
S
Q
 
A
E
 
A
V
 
L
V
 
A
A
 
S
L
 
I
C
 
C
D
x
K
L
 
V
I
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
S
E
 
A
E
 
D
E
|
E
I
 
L
H
 
C
I
 
Q
L
 
L
G
 
S
G
 
G
S
 
A
T
 
S
D
 
H
T
 
W
I
 
Q
A
 
D
A
 
A
L
 
R
R
 
Y
A
 
Y
I
 
L
R
 
R
R
 
D
-
 
L
-
 
G
-
 
C
-
 
D
-
 
T
-
 
T
-
 
I
-
 
I
-
x
S
-
 
L
-
x
G
A
|
A
S
 
D
D
x
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
I
C
 
T
K
 
A
R
 
-
G
 
-
P
 
-
E
 
E
G
 
G
C
 
E
V
 
F
A
 
H
F
 
F
P
 
P
G
 
A
A
 
P
I
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
F
 
-
K
 
R
V
 
V
E
 
D
V
 
V
F
 
V
N
 
D
V
 
T
L
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
F
|
F
M
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
L
L
 
L
R
 
F
G
 
T
W
 
L
L
 
S
R
 
R
-
 
A
-
 
N
-
 
C
-
 
W
-
 
D
H
 
H
E
 
A
S
 
L
V
 
L
E
 
A
T
 
E
C
 
A
C
 
I
E
 
S
W
 
N
G
 
A
N
|
N
A
 
A
C
 
C
G
|
G
A
|
A
I
 
M
V
 
A
V
 
V
S
 
T
R
 
A
H
 
K
G
 
G
C
 
A
T
 
M
P
 
T
A
 
A
M
 
L
P
 
P
T
 
F
W
 
P
I
 
D
E
 
Q
L
 
L
Q
 
N
A
 
T
F
 
F
L
 
L
S
 
S

3lkiB Crystal structure of fructokinase with bound atp from xylella fastidiosa
25% identity, 47% coverage: 34:336/642 of query aligns to 23:321/322 of 3lkiB

query
sites
3lkiB
S
 
A
F
 
F
A
 
L
K
 
Q
Y
 
C
L
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
A
P
 
P
T
 
A
N
 
N
T
 
V
A
 
A
A
 
V
G
 
A
G
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
G
K
 
A
T
 
V
G
 
Q
L
 
F
L
 
V
T
 
G
R
 
M
V
 
L
G
 
G
A
 
S
D
 
D
H
 
M
M
 
F
G
 
G
R
 
D
F
 
F
I
 
L
R
 
F
E
 
D
Q
 
S
L
 
F
E
 
A
R
 
E
E
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
V
V
 
T
A
 
D
G
 
G
V
 
I
L
 
V
S
 
R
D
 
T
P
 
S
D
 
T
R
 
A
L
 
K
T
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
A
I
 
F
L
 
V
G
 
A
I
 
L
R
 
D
D
 
G
R
 
E
V
 
R
N
 
S
F
 
F
P
 
S
L
 
-
I
 
-
F
 
F
Y
 
Y
R
 
R
E
 
P
N
 
P
C
 
A
A
 
A
D
 
D
M
 
L
A
 
L
L
 
F
E
 
R
P
 
V
S
 
E
D
 
H
V
 
F
D
 
Q
E
 
D
A
 
A
W
 
S
F
 
F
A
 
S
Q
 
D
A
 
A
G
 
L
A
 
I
V
 
F
L
 
H
I
 
A
N
 
C
G
 
S
T
 
N
H
 
S
L
 
M
S
 
T
Q
 
D
P
 
A
N
 
D
V
 
I
Y
 
A
E
 
E
T
 
V
S
 
T
L
 
F
K
 
E
A
 
G
A
 
M
R
 
R
A
 
R
V
 
A
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
A
R
 
I
V
 
V
A
 
S
F
 
F
D
 
D
I
 
L
D
 
N
Y
 
F
R
 
R
P
 
P
V
 
M
L
 
L
W
 
W
G
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
P
A
 
N
G
 
G
E
 
E
N
 
N
R
 
P
F
 
-
V
 
-
E
 
-
N
 
-
Q
 
-
Q
 
-
V
 
-
T
 
A
A
 
S
K
 
R
L
 
L
Q
 
W
E
 
K
V
 
G
V
 
L
A
 
S
L
 
L
C
 
A
D
 
D
L
 
V
I
 
V
V
 
K
G
 
L
T
 
S
E
 
S
E
 
E
E
 
E
I
 
L
H
 
D
I
 
Y
L
 
L
G
 
A
G
 
N
S
 
T
-
 
L
-
 
A
T
 
A
D
 
D
T
 
A
I
 
N
A
 
A
A
 
V
L
 
I
R
 
Q
A
 
Q
I
 
L
-
 
W
-
 
Q
R
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
Q
D
 
L
A
 
L
L
 
L
L
 
V
V
x
T
C
x
D
K
 
A
R
 
A
G
 
G
P
 
P
E
 
V
G
 
H
C
 
W
V
 
Y
A
 
T
F
 
R
P
 
T
-
 
A
-
 
G
G
 
G
A
 
E
I
 
V
P
 
P
D
x
T
A
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
F
 
F
K
 
R
V
 
V
E
 
Q
V
 
V
F
 
Q
N
 
D
V
 
S
L
 
N
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
F
|
F
M
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
M
L
 
L
R
 
Y
G
 
T
W
 
F
L
 
A
R
 
Q
H
 
Q
-
 
F
-
 
D
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
I
-
 
D
-
 
F
-
 
C
-
 
H
-
 
D
-
 
P
E
 
E
S
 
S
V
 
I
E
 
V
T
 
S
C
 
T
C
 
L
E
 
R
W
 
F
G
 
A
N
x
A
A
 
A
C
 
V
G
 
G
A
 
A
I
 
L
V
 
A
V
 
V
S
 
T
R
 
R
H
 
Q
G
 
G
C
 
A
T
 
F
P
 
T
A
 
A
M
 
M
P
 
P
T
 
M
W
 
L
I
 
S
E
 
E
L
 
V
Q
 
L
A
 
S
F
 
L
L
 
I
S
 
Q
E
 
E
R
 
Q
E
 
S

3iq0B Crystal structure of a putative ribokinase ii in complex with atp and mg+2 from e.Coli
24% identity, 50% coverage: 10:332/642 of query aligns to 4:305/308 of 3iq0B

query
sites
3iq0B
L
 
V
I
 
F
A
 
T
V
 
I
G
 
G
R
 
E
S
 
I
S
 
L
V
 
V
D
 
E
L
 
I
Y
 
M
G
 
A
Q
 
S
Q
 
K
V
 
I
G
 
G
G
 
Q
R
 
P
L
 
F
E
 
D
D
 
Q
M
 
P
G
 
G
S
 
I
F
 
W
-
 
N
A
 
G
K
 
P
Y
 
Y
L
 
P
G
 
S
G
 
G
S
 
A
P
 
P
T
 
A
N
 
I
T
 
F
A
 
I
A
 
D
G
 
Q
G
 
V
A
 
T
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
V
K
 
P
T
 
C
G
 
G
L
 
I
L
 
I
T
 
S
R
 
C
V
 
V
G
 
G
A
 
N
D
 
D
H
 
G
M
 
F
G
 
G
R
 
D
F
 
I
I
 
N
R
 
I
E
 
H
Q
 
R
L
 
L
E
 
A
R
 
A
E
 
D
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
I
A
 
R
G
 
G
V
 
I
L
 
S
S
 
V
D
 
L
P
 
P
D
 
L
R
 
E
L
 
A
T
 
T
-
 
G
-
 
S
A
 
A
L
 
F
V
 
V
I
 
T
L
 
Y
G
 
G
I
 
D
R
 
R
D
 
D
R
 
-
V
 
-
N
 
-
F
 
-
P
 
-
L
 
F
I
 
I
F
 
F
Y
 
N
R
 
I
E
 
K
N
 
N
C
 
A
A
 
A
D
 
C
M
 
G
A
 
K
L
 
L
E
 
S
P
 
A
S
 
Q
D
 
H
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
N
W
 
I
F
 
L
A
 
K
Q
 
D
A
 
C
G
 
T
A
 
H
V
 
F
L
 
H
I
 
I
N
 
M
G
 
G
T
 
S
H
 
S
L
 
L
S
 
F
Q
 
S
P
 
F
N
 
H
V
 
M
Y
 
V
E
 
D
T
 
A
S
 
V
L
 
K
K
 
K
A
 
A
A
 
V
R
 
T
A
 
I
V
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
V
V
 
I
A
 
S
F
 
F
D
 
D
I
 
P
D
 
N
Y
 
I
R
 
R
P
 
-
V
 
-
L
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
K
R
 
E
F
 
M
V
 
L
E
 
D
N
 
I
Q
 
P
Q
 
E
V
 
M
T
 
R
A
 
D
K
 
A
L
 
L
Q
 
H
E
 
F
V
 
V
V
 
L
A
 
E
L
 
L
C
 
T
D
 
D
L
 
I
I
 
Y
V
 
M
G
 
P
T
x
S
E
 
E
E
 
G
E
 
E
I
 
V
H
 
L
I
 
L
L
 
L
G
 
S
G
 
P
S
 
H
T
 
S
D
 
T
T
 
P
I
 
E
A
 
R
A
 
A
L
 
I
R
 
A
A
 
G
I
 
F
R
 
L
R
 
E
A
 
E
S
 
G
D
 
V
A
 
K
L
 
E
L
 
V
V
 
I
C
 
V
K
|
K
R
 
R
G
|
G
P
 
N
E
 
Q
G
 
G
C
 
A
V
 
S
A
 
Y
F
 
Y
P
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
S
L
 
A
D
 
N
E
 
E
G
 
Q
V
 
F
S
 
H
A
 
V
R
 
E
G
 
S
F
 
Y
K
 
P
V
 
V
E
 
E
V
x
E
F
 
V
N
 
D
V
 
P
L
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
C
F
|
F
M
 
G
A
 
G
G
 
A
F
 
W
L
 
I
R
 
A
-
 
C
-
 
R
-
 
Q
-
 
L
G
 
G
W
 
F
L
 
D
R
 
A
H
 
H
E
 
R
S
 
A
V
 
L
E
 
-
T
 
-
C
 
-
C
 
-
E
 
Q
W
 
Y
G
 
A
N
|
N
A
 
A
C
 
C
G
|
G
A
 
A
I
 
L
V
 
A
V
 
V
S
 
T
R
 
R
H
 
R
G
 
G
C
 
P
T
 
M
P
 
E
A
 
G
M
 
T
P
 
S
T
 
R
W
 
L
I
 
M
E
 
E
L
 
I
Q
 
E
A
 
T
F
 
F
L
 
I

4wjmA Crystal structure of fructokinase from brucella abortus 2308 with bound amppnp
26% identity, 48% coverage: 10:320/642 of query aligns to 8:306/312 of 4wjmA

query
sites
4wjmA
L
 
I
I
 
L
A
 
C
V
 
C
G
 
G
R
 
E
S
 
A
S
 
L
V
 
I
D
 
D
L
 
M
Y
 
L
G
 
P
Q
 
R
Q
 
E
V
 
T
G
 
T
G
 
G
R
 
-
L
 
-
E
 
-
D
 
G
M
 
E
G
 
T
S
 
A
F
 
F
A
 
Q
K
 
P
Y
 
F
L
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
P
 
V
T
 
F
N
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
I
G
 
A
G
 
L
A
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
V
K
 
P
T
 
T
G
 
G
L
 
F
L
 
F
T
 
S
R
 
G
V
 
I
G
 
S
A
 
S
D
 
D
H
 
F
M
 
F
G
 
G
R
 
D
F
 
V
I
 
L
R
 
R
E
 
D
Q
 
T
L
 
L
E
 
A
R
 
R
E
 
S
G
 
N
V
 
V
D
 
D
-
 
Y
-
 
S
V
 
F
A
 
A
G
 
A
V
 
I
L
 
S
S
 
N
D
 
R
P
 
P
D
 
T
R
 
T
L
 
L
T
 
A
A
 
F
L
 
V
V
 
R
I
 
L
L
 
V
G
 
D
I
 
G
R
 
Q
D
 
A
R
 
R
V
 
-
N
 
-
F
 
-
P
 
-
L
 
Y
I
 
A
F
 
F
Y
 
Y
R
 
D
E
 
E
N
 
N
C
 
T
A
 
A
D
 
G
M
 
R
A
 
M
L
 
L
E
 
S
P
 
R
S
 
N
D
 
D
-
 
M
-
 
P
-
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
T
W
 
I
F
 
S
A
 
A
Q
 
M
A
 
L
G
 
F
A
 
G
V
 
C
L
 
I
I
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
S
H
 
L
L
 
I
S
 
S
Q
 
E
P
 
P
-
 
C
-
 
G
N
 
S
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
T
 
T
S
 
L
L
 
L
K
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
A
K
 
R
A
 
E
A
 
A
G
 
P
G
 
N
R
 
R
V
 
V
A
 
M
F
 
F
-
 
L
D
 
D
I
 
P
D
 
N
Y
 
I
R
 
R
P
 
-
V
 
-
L
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
A
N
 
N
R
 
L
F
 
I
V
 
T
E
 
V
N
 
R
Q
 
K
Q
 
T
V
 
H
T
 
L
A
 
T
K
 
R
L
 
M
Q
 
K
E
 
R
V
 
M
V
 
I
A
 
A
L
 
L
C
 
A
D
 
D
L
 
I
I
 
V
V
 
K
G
 
L
T
 
S
E
 
D
E
 
E
E
 
D
I
 
L
H
 
D
I
 
W
L
 
F
G
 
G
-
 
E
-
 
K
G
 
G
S
 
S
T
 
H
D
 
D
T
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
-
R
 
-
A
 
E
I
 
W
R
 
L
R
 
K
A
 
L
S
 
G
D
 
P
A
 
K
L
 
L
L
 
V
V
 
V
C
 
I
K
x
T
R
 
K
G
|
G
P
x
A
E
 
H
G
|
G
C
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
Y
P
 
T
G
 
N
A
 
-
I
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
H
E
 
A
G
 
T
V
 
V
S
 
P
A
 
V
R
 
P
G
 
G
F
 
V
K
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
V
F
 
V
N
 
D
V
 
T
L
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
T
F
x
V
M
 
N
A
 
A
G
 
G
F
 
I
L
 
L
R
 
A
G
 
S
W
 
L
-
 
H
-
 
S
-
 
Q
-
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
T
-
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
N
L
 
L
R
 
S
H
 
E
E
 
D
S
 
Q
V
 
I
E
 
H
T
 
S
C
 
A
C
 
V
E
 
A
W
 
L
G
 
G
N
x
V
A
 
R
C
 
A
G
x
A
A
 
A
I
 
V
V
 
T
V
 
V
S
 
S
R
 
R
H
 
A
G
 
G
C
 
A
T
 
N
P
 
P

3in1A Crystal structure of a putative ribokinase in complex with adp from e.Coli
24% identity, 51% coverage: 7:336/642 of query aligns to 1:312/312 of 3in1A

query
sites
3in1A
T
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
V
I
 
I
A
 
C
V
 
I
G
 
G
R
 
A
S
 
A
S
 
I
V
 
V
D
 
D
L
 
I
Y
 
P
G
 
L
Q
 
Q
Q
 
P
V
 
V
G
 
S
G
 
K
R
 
N
L
 
I
E
 
F
D
 
D
M
 
V
G
 
D
S
 
S
F
 
Y
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
I
A
 
A
K
 
M
Y
 
T
L
 
T
G
 
G
G
 
G
S
 
D
P
 
A
T
 
I
N
 
N
T
 
E
A
 
A
A
 
T
G
 
I
G
 
I
A
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
H
K
 
R
T
 
T
G
 
A
L
 
L
L
 
M
T
 
S
R
 
R
V
 
I
G
 
G
A
 
K
D
 
D
H
 
A
M
 
A
G
 
G
R
 
Q
F
 
F
I
 
I
R
 
L
E
 
D
Q
 
H
L
 
C
E
 
R
R
 
K
E
 
E
G
 
N
V
 
I
D
 
D
V
 
I
A
 
Q
G
 
S
V
 
L
L
 
K
S
 
Q
D
 
D
P
 
V
D
 
S
R
 
I
L
 
D
T
 
T
A
 
S
L
 
I
V
 
N
I
 
V
L
 
G
G
 
L
I
 
V
R
 
T
D
 
E
R
 
D
V
 
G
N
 
E
F
x
R
P
 
T
L
 
F
I
 
V
F
 
T
Y
 
N
R
 
R
E
 
-
N
 
N
C
 
G
A
 
S
D
 
L
M
 
W
A
 
K
L
 
L
E
 
N
P
 
I
S
 
D
D
 
D
V
 
V
D
 
D
E
 
F
A
 
A
W
 
R
F
 
F
A
 
S
Q
 
Q
A
 
A
G
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
I
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
K
H
 
L
L
 
L
S
 
S
Q
 
L
P
 
A
N
 
S
V
 
I
Y
 
F
E
 
N
T
 
S
S
 
P
L
 
L
K
 
L
A
 
D
A
 
G
R
 
K
A
 
A
V
 
L
-
 
T
-
 
E
-
 
I
-
 
F
-
 
T
-
 
Q
-
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
R
G
 
Q
G
 
M
R
 
I
V
 
I
A
 
C
F
 
A
D
 
D
I
 
M
D
 
-
Y
 
I
R
 
K
P
 
P
V
 
R
L
 
L
W
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
E
 
-
N
 
-
Q
 
N
Q
 
E
V
 
T
T
 
L
A
 
D
K
 
D
L
 
I
Q
 
C
E
 
E
V
 
A
V
 
L
A
 
S
L
 
Y
C
 
V
D
 
D
L
 
Y
I
 
L
V
 
F
G
 
P
T
x
N
E
 
F
E
 
A
E
 
E
I
 
A
H
 
K
I
 
L
L
 
L
G
 
T
G
 
G
S
 
K
T
 
-
D
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
E
A
 
T
I
 
L
R
 
D
R
 
E
A
 
I
S
 
A
D
 
D
A
 
C
L
 
F
L
 
L
V
 
A
C
 
C
-
 
G
-
 
V
-
 
K
-
 
T
-
 
V
-
 
V
-
 
I
K
|
K
R
 
T
G
|
G
P
 
K
E
 
D
G
|
G
C
 
C
V
 
F
A
 
I
F
 
K
P
 
R
G
 
G
A
 
D
I
 
M
P
 
T
D
 
M
A
 
K
L
 
V
D
 
P
-
x
A
-
 
V
E
 
A
G
 
G
V
 
I
S
 
T
A
 
A
R
 
-
G
 
-
F
 
-
K
 
-
V
 
-
E
 
-
V
 
-
F
 
I
N
 
D
V
x
T
L
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
N
F
 
F
M
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
L
 
I
R
 
A
G
 
A
W
 
L
L
 
L
R
 
E
H
 
G
E
 
K
S
 
N
V
 
L
E
 
R
T
 
E
C
 
C
C
 
A
E
 
R
W
 
F
G
 
A
N
|
N
A
 
A
C
 
T
G
x
A
A
 
A
I
 
I
V
 
S
V
 
V
S
 
L
R
 
S
H
 
V
G
 
G
C
 
A
T
 
T
P
 
T
A
 
G
M
 
V
P
 
K
T
 
N
W
 
R
I
 
K
E
 
L
L
 
V
Q
 
E
A
 
Q
F
 
L
L
 
L
S
 
E
E
 
E
R
 
Y
E
 
E

8cqxA Ribokinase from t.Sp mutant a92g
27% identity, 46% coverage: 35:332/642 of query aligns to 31:298/300 of 8cqxA

query
sites
8cqxA
F
 
Y
A
 
Q
K
 
T
Y
 
H
L
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
K
P
 
G
T
 
A
N
 
N
T
 
Q
A
 
A
A
 
V
G
 
A
G
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
G
K
 
K
T
 
V
G
 
R
L
 
M
L
 
L
T
 
G
R
 
R
V
 
V
G
 
G
A
 
E
D
 
D
H
 
P
M
 
F
G
 
G
R
 
Q
F
 
A
I
 
L
R
 
K
E
 
S
Q
 
G
L
 
L
E
 
A
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
W
V
 
V
L
 
L
S
 
E
D
 
T
P
 
P
D
 
G
R
 
P
L
 
S
T
 
G
A
 
T
L
 
G
V
 
F
I
 
I
L
 
L
G
 
V
I
 
D
R
 
P
D
 
E
R
 
G
V
 
Q
N
 
N
F
 
Q
P
 
-
L
 
-
I
 
-
F
 
I
Y
 
A
R
 
V
E
 
A
N
 
P
C
 
G
A
 
A
D
 
N
M
 
A
A
 
R
L
 
L
E
 
V
P
 
P
S
 
E
D
 
D
V
 
L
D
 
P
E
 
A
A
 
T
W
 
A
F
 
F
A
 
Q
Q
 
G
A
 
V
G
 
G
A
 
V
V
 
V
L
 
L
I
 
L
N
 
-
G
 
-
T
 
-
H
 
Q
L
 
L
S
 
E
Q
 
I
P
 
P
N
 
-
V
 
-
Y
 
L
E
 
E
T
 
T
S
 
V
L
 
V
K
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
A
A
 
L
V
 
G
K
 
R
A
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
A
R
 
R
V
 
I
A
 
-
F
 
-
D
 
-
I
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
F
 
L
V
 
L
E
 
N
N
 
A
Q
 
A
Q
 
P
V
 
A
T
 
H
A
 
A
K
 
L
L
 
P
Q
 
S
E
 
E
V
 
I
V
 
L
A
 
Q
L
 
S
C
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
L
V
 
L
G
 
V
T
x
N
E
 
E
E
 
V
E
 
E
I
 
A
H
 
A
I
 
Q
L
 
L
G
 
T
G
 
E
S
 
A
T
 
S
-
 
P
-
 
P
-
 
R
-
 
T
-
 
P
-
 
E
D
 
E
T
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
L
L
 
A
R
 
R
A
 
Q
I
 
L
R
 
R
-
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
P
D
 
Q
A
 
A
L
 
Q
L
 
V
V
 
V
C
 
L
K
x
T
R
 
L
G
|
G
P
x
A
E
 
Q
G
|
G
C
 
A
V
 
V
-
 
W
-
 
S
-
 
G
-
 
T
-
 
E
-
 
E
-
 
S
A
 
H
F
 
F
P
 
P
G
 
A
A
 
-
I
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
F
 
F
K
 
P
V
 
V
E
 
R
V
 
A
F
 
V
N
x
D
V
 
T
L
x
T
G
 
A
A
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
F
|
F
M
 
A
A
 
G
G
 
A
F
 
L
L
 
A
R
 
L
G
 
G
W
 
L
L
 
A
R
 
E
H
 
G
E
 
Q
S
 
N
V
 
M
E
 
R
T
 
A
C
 
A
C
 
L
E
 
R
W
 
F
G
 
A
N
|
N
A
 
A
C
 
A
G
|
G
A
|
A
I
 
L
V
x
A
V
x
T
S
 
T
R
 
R
H
 
P
G
 
G
C
 
A
T
 
Q
P
 
P
A
x
S
M
 
L
P
 
P
T
 
F
W
 
R
I
 
D
E
 
E
L
 
V
Q
 
E
A
 
A
F
 
L
L
 
L

4xckA Vibrio cholerae o395 ribokinase complexed with adp, ribose and cesium ion. (see paper)
27% identity, 46% coverage: 40:335/642 of query aligns to 38:305/306 of 4xckA

query
sites
4xckA
G
 
G
G
|
G
S
x
K
P
 
G
T
 
A
N
|
N
T
 
Q
A
 
A
A
 
V
G
 
A
G
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
M
G
 
Q
L
 
A
K
 
D
T
 
V
G
 
G
L
 
F
L
 
I
T
 
A
R
 
C
V
 
V
G
 
G
A
 
D
D
 
D
H
 
S
M
 
F
G
 
G
R
 
I
F
 
N
I
 
I
R
 
R
E
 
E
Q
 
S
L
 
F
E
 
K
R
 
L
E
 
D
G
 
G
V
 
I
D
 
N
V
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
K
S
 
L
D
 
Q
P
 
P
D
 
N
R
 
C
L
 
P
T
 
T
A
 
G
L
 
I
V
x
A
I
 
M
L
 
I
G
 
Q
I
 
V
R
 
S
D
 
D
R
 
S
V
 
G
N
 
E
F
 
N
P
 
S
L
x
I
I
 
C
F
x
I
Y
 
S
R
 
A
E
 
E
N
 
A
C
 
N
A
 
A
D
 
K
M
 
L
A
 
T
L
 
A
E
 
A
P
 
A
S
 
I
D
 
E
V
 
P
D
 
D
E
 
L
A
 
A
W
 
A
F
 
I
A
 
R
Q
 
D
A
 
A
G
 
R
A
 
Y
V
 
L
L
 
L
I
 
M
N
 
-
G
 
-
T
 
-
H
 
Q
L
 
L
S
x
E
Q
 
T
P
 
P
N
 
-
V
 
-
Y
 
L
E
 
D
T
 
G
S
 
I
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
A
 
E
V
 
A
K
 
K
A
 
T
A
 
A
G
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
-
F
 
-
D
 
-
I
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
K
N
 
T
R
 
N
F
 
V
V
 
I
E
 
L
N
 
N
Q
 
P
Q
 
A
V
 
P
T
 
A
A
 
R
K
 
E
L
 
L
-
 
P
Q
 
D
E
 
E
V
 
L
V
 
L
A
 
K
L
 
C
C
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
I
V
 
T
G
 
P
T
 
N
E
 
E
E
 
T
E
 
E
I
 
A
H
 
E
I
 
V
L
 
L
G
 
T
G
 
G
S
 
I
T
 
T
D
 
-
T
 
-
I
 
V
A
 
Y
A
 
D
L
 
D
R
 
S
A
 
S
I
 
A
R
 
Q
R
 
Q
A
 
A
S
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
H
V
 
-
C
 
C
K
 
K
R
 
-
G
 
G
P
 
I
E
 
E
G
 
I
C
 
V
V
 
I
A
 
I
F
x
T
P
 
L
G
|
G
A
x
S
I
 
K
P
 
G
D
 
V
A
 
W
L
 
L
D
 
S
E
 
Q
-
 
N
-
 
G
-
 
R
G
 
G
V
 
Q
S
 
R
A
 
I
R
 
P
G
 
G
F
 
F
K
 
V
V
|
V
E
 
K
V
 
A
F
 
T
N
 
D
V
x
T
L
x
T
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
T
F
|
F
M
 
N
A
 
G
G
 
A
F
 
L
L
 
V
R
 
T
G
 
G
W
 
L
L
 
L
R
 
Q
H
 
E
E
 
M
S
 
P
V
 
L
E
 
E
T
 
S
C
 
A
C
 
I
E
 
K
W
 
F
G
 
A
N
x
H
A
 
A
C
 
A
G
x
A
A
 
A
I
 
I
V
 
S
V
|
V
S
 
T
R
 
R
H
 
F
G
 
G
C
 
A
T
 
Q
P
 
T
A
 
S
M
 
I
P
 
P
T
 
T
W
 
R
I
 
A
E
 
E
L
 
V
Q
 
E
A
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
A
E
 
E
R
 
H

Sites not aligning to the query:

7fcaD Pfkb(mycobacterium marinum) (see paper)
29% identity, 40% coverage: 36:289/642 of query aligns to 21:237/282 of 7fcaD

query
sites
7fcaD
A
 
A
K
 
E
Y
 
Y
L
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
S
P
 
P
T
 
L
N
 
N
T
 
V
A
 
A
A
 
V
G
 
G
G
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
R
K
 
D
T
 
V
G
 
D
L
 
L
L
 
L
T
 
T
R
 
H
V
 
I
G
 
G
A
x
R
D
 
D
H
 
A
M
 
R
G
 
G
R
 
R
F
 
R
I
 
I
R
 
A
E
 
E
Q
 
Y
L
 
I
E
 
E
R
 
S
E
 
S
G
 
G
V
 
V
D
 
Q
V
 
L
A
 
V
G
x
S
V
x
G
L
 
S
S
 
Q
D
 
T
P
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
I
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
-
N
 
-
F
 
T
P
 
P
L
 
T
I
 
A
F
 
T
Y
 
A
R
 
R
E
 
T
N
 
Y
C
 
A
A
 
F
D
 
D
M
 
L
A
 
E
L
 
W
E
 
Q
P
 
I
S
 
P
D
 
D
V
 
T
D
 
P
E
 
P
A
 
V
W
 
-
F
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
A
G
 
P
A
 
P
V
 
L
L
 
L
I
 
V
N
 
H
G
 
T
T
 
G
H
 
S
L
 
I
S
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
R
Q
 
E
P
 
P
N
 
G
V
 
C
Y
 
L
E
 
A
T
 
V
S
 
A
-
 
A
-
 
L
L
 
L
K
 
D
A
 
A
A
 
Y
R
 
R
A
 
A
V
 
A
K
 
A
A
 
T
A
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
V
A
 
S
F
 
F
D
 
D
I
 
P
D
 
N
Y
 
V
R
 
R
P
 
P
V
 
S
L
 
L
W
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
S
K
 
A
D
 
D
A
 
P
G
 
D
E
 
L
N
 
T
R
 
R
F
 
R
V
 
-
E
 
-
N
 
-
Q
 
-
Q
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
-
K
 
R
L
 
I
Q
 
Q
E
 
R
V
 
L
V
 
V
A
 
E
L
 
R
C
 
S
D
 
D
L
 
I
I
 
I
V
 
K
G
 
A
T
 
S
E
 
A
E
 
E
E
 
D
I
 
L
H
 
H
I
 
W
L
 
I
G
 
D
G
 
P
S
 
T
T
 
Q
D
 
P
T
 
P
I
 
E
A
 
Q
A
 
T
L
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
W
R
 
L
R
 
A
A
 
C
S
 
G
D
 
P
A
 
A
L
 
I
L
 
V
V
 
A
C
 
L
K
 
T
R
 
L
G
 
G
P
 
D
E
 
Q
G
 
G
C
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
P
 
C
G
 
A
A
 
A
I
 
G
P
 
P
D
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
A
G
 
S
V
 
V
S
 
P
A
 
A
R
 
Q
G
 
-
F
 
-
K
 
-
V
 
-
E
 
P
V
 
V
F
 
V
N
 
D
V
 
T
L
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
F
 
F
M
 
M
A
 
A
G
 
G
F
 
L
L
 
L

Query Sequence

>CCNA_01356 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_01356
MAQDAKTLDLIAVGRSSVDLYGQQVGGRLEDMGSFAKYLGGSPTNTAAGGARLGLKTGLL
TRVGADHMGRFIREQLEREGVDVAGVLSDPDRLTALVILGIRDRVNFPLIFYRENCADMA
LEPSDVDEAWFAQAGAVLINGTHLSQPNVYETSLKAARAVKAAGGRVAFDIDYRPVLWGL
TGKDAGENRFVENQQVTAKLQEVVALCDLIVGTEEEIHILGGSTDTIAALRAIRRASDAL
LVCKRGPEGCVAFPGAIPDALDEGVSARGFKVEVFNVLGAGDAFMAGFLRGWLRHESVET
CCEWGNACGAIVVSRHGCTPAMPTWIELQAFLSERERPFRLREDAELEHIHWATTRERVY
DELTVLAIDHRSQFEDLIAETGGDAERIPDFKRLALRAVQMVAGRDETRFGMLLDGRFGF
EALAEAADHDYWIARPIELPKSRPLEFECSADVATELLEWPLNQVVKCLAFYHPDDESDL
RERQERQLLRLADACRKTRHELLLELILPRGMSSDSRTVARAIRRLYALGIRPDWWKLEP
LTDPDAWREIEIAIAENDPLCRGVVLLGLSAPEAELVASFEVVAPFPIVKGFAVGRTIFY
DVARAWLSNQIDDDAAVTALAAKFKVLVDAWRRLRGSVEKAA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory