SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CCNA_01491 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_01491 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P06721 Cystathionine beta-lyase MetC; CBL; CL; Beta-cystathionase MetC; Cysteine desulfhydrase MetC; CD; Cysteine lyase MetC; Cysteine-S-conjugate beta-lyase MetC; EC 4.4.1.13; EC 4.4.1.28 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
43% identity, 97% coverage: 4:378/386 of query aligns to 7:391/395 of P06721

query
sites
P06721
E
 
D
T
 
T
R
 
Q
L
 
L
I
 
V
H
 
N
T
 
A
G
 
G
S
 
R
E
 
S
P
 
K
A
 
K
R
 
Y
L
 
T
G
 
L
R
 
G
T
 
A
V
 
V
N
 
N
P
 
S
P
 
V
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
S
V
 
L
L
 
V
L
 
F
-
 
D
-
 
S
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
K
P
 
K
D
 
H
A
 
A
A
 
T
S
 
R
L
 
N
Y
 
R
D
 
A
D
 
N
D
 
G
Q
 
E
L
 
L
T
 
F
Y
 
Y
G
 
G
I
 
R
T
 
R
G
 
G
L
 
T
S
 
L
T
 
T
P
 
H
V
 
F
A
 
S
L
 
L
Q
 
Q
N
 
Q
A
 
A
L
 
M
A
 
C
E
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
T
 
A
N
 
G
V
 
C
T
 
V
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
S
 
C
G
 
G
L
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
A
G
 
N
A
 
S
M
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
F
L
 
I
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
E
 
H
V
 
V
L
 
L
V
 
M
V
 
T
D
 
N
S
 
T
A
 
A
Y
 
Y
K
 
E
P
 
P
T
 
S
R
 
Q
R
 
D
F
 
F
C
 
C
D
 
S
R
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
S
R
 
K
F
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
S
Y
 
W
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
K
 
L
L
 
I
S
 
G
P
 
A
E
 
D
A
 
I
L
 
V
M
 
K
G
 
H
L
 
L
V
 
-
T
 
Q
S
 
P
S
 
N
T
 
T
R
 
K
L
 
I
I
 
V
V
 
F
L
 
L
E
 
E
A
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
T
F
 
M
E
 
E
M
 
V
Q
 
H
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
N
 
R
A
 
S
R
 
V
-
 
V
-
 
P
G
 
D
V
 
A
L
 
I
T
 
I
L
 
M
I
 
I
D
 
D
N
 
N
T
 
T
W
 
W
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
F
 
F
K
 
K
P
 
A
L
 
L
A
 
D
H
 
F
G
 
G
V
 
I
T
 
D
M
 
V
S
 
S
V
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
A
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
V
 
L
G
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
C
 
A
F
 
M
M
 
I
G
 
G
S
 
T
V
 
-
A
 
A
T
 
V
C
 
C
D
 
N
D
 
A
A
 
R
V
 
C
A
 
W
K
 
E
L
 
Q
L
 
L
G
 
R
D
 
E
A
 
N
M
 
A
W
 
Y
D
 
L
I
 
M
G
 
G
W
 
Q
S
 
M
V
 
V
S
 
D
S
 
A
D
 
D
D
 
T
A
 
A
Y
 
Y
T
 
I
M
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
G
T
 
V
R
 
R
L
 
L
P
 
R
R
 
Q
H
 
H
A
 
H
E
 
E
N
 
S
G
 
S
L
 
L
A
 
K
I
 
V
A
 
A
R
 
E
W
 
W
L
 
L
Q
 
A
E
 
E
R
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
S
A
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
E
I
 
F
W
 
W
K
 
K
R
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
T
G
 
G
A
 
S
C
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
G
 
S
V
 
F
V
 
V
L
 
L
-
 
K
K
 
K
P
 
K
C
 
L
S
 
N
Q
 
N
K
 
E
A
 
E
V
 
L
H
 
A
A
 
N
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
S
 
N
L
 
F
K
 
S
L
 
L
F
 
F
G
 
S
L
 
M
G
 
A
F
 
Y
S
 
S
W
 
W
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
I
L
 
L
N
 
A
C
 
N
D
 
Q
P
 
P
Q
 
E
L
 
H
G
 
I
A
 
A
R
 
A
S
 
I
I
 
R
P
 
P
-
 
Q
-
 
G
-
 
E
V
 
I
D
 
D
L
 
F
E
 
S
G
 
G
P
 
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
F
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
D
I
 
V
E
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
I
A
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
D
R
 
A
G
 
G
F
 
F

2gqnA Cystathionine beta-lyase (cbl) from escherichia coli in complex with n-hydrazinocarbonylmethyl-2-nitro-benzamide (see paper)
43% identity, 97% coverage: 4:378/386 of query aligns to 3:387/391 of 2gqnA

query
sites
2gqnA
E
 
D
T
 
T
R
 
Q
L
 
L
I
 
V
H
 
N
T
 
A
G
 
G
S
 
R
E
 
S
P
 
K
A
 
K
R
 
Y
L
 
T
G
 
L
R
 
G
T
 
A
V
 
V
N
 
N
P
 
S
P
 
V
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
S
V
 
L
L
 
V
L
 
F
-
 
D
-
 
S
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
K
P
 
K
D
 
H
A
 
A
A
 
T
S
 
R
L
 
N
Y
 
R
D
 
A
D
 
N
D
 
G
Q
 
E
L
 
L
T
 
F
Y
 
Y
G
 
G
I
x
R
T
 
R
G
 
G
L
 
T
S
 
L
T
 
T
P
 
H
V
 
F
A
 
S
L
 
L
Q
 
Q
N
 
Q
A
 
A
L
 
M
A
 
C
E
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
T
 
A
N
 
G
V
 
C
T
 
V
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
S
x
C
G
|
G
L
x
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
A
G
 
N
A
 
S
M
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
F
L
 
I
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
E
 
H
V
 
V
L
 
L
V
 
M
V
 
T
D
 
N
S
 
T
A
 
A
Y
|
Y
K
x
E
P
 
P
T
 
S
R
 
Q
R
 
D
F
 
F
C
 
C
D
 
S
R
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
S
R
 
K
F
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
S
Y
 
W
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
K
 
L
L
 
I
S
 
G
P
 
A
E
 
D
A
 
I
L
 
V
M
 
K
G
 
H
L
 
L
V
 
-
T
 
Q
S
 
P
S
 
N
T
 
T
R
 
K
L
 
I
I
 
V
V
 
F
L
 
L
E
 
E
A
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
T
F
 
M
E
 
E
M
 
V
Q
 
H
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
N
 
R
A
 
S
R
 
V
-
 
V
-
 
P
G
 
D
V
 
A
L
 
I
T
 
I
L
 
M
I
 
I
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
W
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
F
 
F
K
 
K
P
 
A
L
 
L
A
 
D
H
 
F
G
 
G
V
 
I
T
 
D
M
 
V
S
 
S
V
 
I
Q
 
Q
A
|
A
L
 
A
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
V
 
L
G
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
C
 
A
F
x
M
M
 
I
G
 
G
S
 
T
V
 
-
A
 
A
T
 
V
C
 
C
D
 
N
D
 
A
A
 
R
V
 
C
A
 
W
K
 
E
L
 
Q
L
 
L
G
 
R
D
 
E
A
 
N
M
 
A
W
 
Y
D
 
L
I
 
M
G
 
G
W
 
Q
S
 
M
V
 
V
S
 
D
S
 
A
D
 
D
D
 
T
A
 
A
Y
 
Y
T
 
I
M
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
G
T
 
V
R
 
R
L
 
L
P
 
R
R
 
Q
H
 
H
A
 
H
E
 
E
N
 
S
G
 
S
L
 
L
A
 
K
I
 
V
A
 
A
R
 
E
W
 
W
L
 
L
Q
 
A
E
 
E
R
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
S
A
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
E
I
 
F
W
 
W
K
 
K
R
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
T
G
 
G
A
 
S
C
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
G
 
S
V
 
F
V
 
V
L
 
L
-
 
K
K
 
K
P
 
K
C
 
L
S
 
N
Q
 
N
K
 
E
A
 
E
V
 
L
H
 
A
A
 
N
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
S
 
N
L
 
F
K
 
S
L
 
L
F
 
F
G
 
S
L
 
M
G
 
A
F
x
Y
S
|
S
W
|
W
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
I
L
 
L
N
 
A
C
 
N
D
 
Q
P
 
P
Q
 
E
L
 
H
G
 
I
A
 
A
R
 
A
S
 
I
I
 
R
P
 
P
-
 
Q
-
 
G
-
 
E
V
 
I
D
 
D
L
 
F
E
 
S
G
 
G
P
 
T
L
 
L
L
 
I
R
|
R
F
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
D
I
 
V
E
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
I
A
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
D
R
 
A
G
 
G
F
 
F

2fq6A Cystathionine beta-lyase (cbl) from escherichia coli in complex with n-hydrazinocarbonylmethyl-2-trifluoromethyl-benzamide (see paper)
43% identity, 97% coverage: 4:378/386 of query aligns to 3:387/391 of 2fq6A

query
sites
2fq6A
E
 
D
T
 
T
R
 
Q
L
 
L
I
 
V
H
 
N
T
 
A
G
 
G
S
 
R
E
 
S
P
 
K
A
 
K
R
 
Y
L
 
T
G
 
L
R
 
G
T
 
A
V
 
V
N
 
N
P
 
S
P
 
V
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
S
V
 
L
L
 
V
L
 
F
-
 
D
-
 
S
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
K
P
 
K
D
 
H
A
 
A
A
 
T
S
 
R
L
 
N
Y
 
R
D
 
A
D
 
N
D
 
G
Q
 
E
L
 
L
T
 
F
Y
 
Y
G
 
G
I
x
R
T
 
R
G
 
G
L
 
T
S
 
L
T
 
T
P
 
H
V
 
F
A
 
S
L
 
L
Q
 
Q
N
 
Q
A
 
A
L
 
M
A
 
C
E
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
T
 
A
N
 
G
V
 
C
T
 
V
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
S
x
C
G
|
G
L
x
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
A
G
 
N
A
 
S
M
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
F
L
 
I
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
E
 
H
V
 
V
L
 
L
V
 
M
V
 
T
D
 
N
S
 
T
A
 
A
Y
|
Y
K
 
E
P
|
P
T
 
S
R
 
Q
R
 
D
F
 
F
C
 
C
D
 
S
R
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
S
R
 
K
F
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
S
Y
 
W
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
K
 
L
L
 
I
S
 
G
P
 
A
E
 
D
A
 
I
L
 
V
M
 
K
G
 
H
L
 
L
V
 
-
T
 
Q
S
 
P
S
 
N
T
 
T
R
 
K
L
 
I
I
 
V
V
 
F
L
 
L
E
 
E
A
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
T
F
 
M
E
 
E
M
 
V
Q
 
H
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
N
 
R
A
 
S
R
 
V
-
 
V
-
 
P
G
 
D
V
 
A
L
 
I
T
 
I
L
 
M
I
 
I
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
W
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
F
 
F
K
 
K
P
 
A
L
 
L
A
 
D
H
 
F
G
 
G
V
 
I
T
 
D
M
 
V
S
 
S
V
 
I
Q
 
Q
A
|
A
L
 
A
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
V
 
L
G
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
C
 
A
F
x
M
M
 
I
G
 
G
S
 
T
V
 
-
A
 
A
T
 
V
C
 
C
D
 
N
D
 
A
A
 
R
V
 
C
A
 
W
K
 
E
L
 
Q
L
 
L
G
 
R
D
 
E
A
 
N
M
 
A
W
 
Y
D
 
L
I
 
M
G
 
G
W
 
Q
S
 
M
V
 
V
S
 
D
S
 
A
D
 
D
D
 
T
A
 
A
Y
 
Y
T
 
I
M
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
G
T
 
V
R
 
R
L
 
L
P
 
R
R
 
Q
H
 
H
A
 
H
E
 
E
N
 
S
G
 
S
L
 
L
A
 
K
I
 
V
A
 
A
R
 
E
W
 
W
L
 
L
Q
 
A
E
 
E
R
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
S
A
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
E
I
 
F
W
 
W
K
 
K
R
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
T
G
 
G
A
 
S
C
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
G
 
S
V
 
F
V
 
V
L
 
L
-
 
K
K
 
K
P
 
K
C
 
L
S
 
N
Q
 
N
K
 
E
A
 
E
V
 
L
H
 
A
A
 
N
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
S
 
N
L
 
F
K
 
S
L
 
L
F
 
F
G
 
S
L
 
M
G
 
A
F
x
Y
S
|
S
W
|
W
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
I
L
 
L
N
 
A
C
 
N
D
 
Q
P
 
P
Q
 
E
L
 
H
G
 
I
A
 
A
R
 
A
S
 
I
I
 
R
P
 
P
-
 
Q
-
 
G
-
 
E
V
 
I
D
 
D
L
 
F
E
 
S
G
 
G
P
 
T
L
 
L
L
 
I
R
|
R
F
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
D
I
 
V
E
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
I
A
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
D
R
 
A
G
 
G
F
 
F

1cl2A Cystathionine beta-lyase (cbl) from escherichia coli in complex with aminoethoxyvinylglycine (see paper)
43% identity, 97% coverage: 4:378/386 of query aligns to 3:387/391 of 1cl2A

query
sites
1cl2A
E
 
D
T
 
T
R
 
Q
L
 
L
I
 
V
H
 
N
T
 
A
G
 
G
S
 
R
E
 
S
P
 
K
A
 
K
R
 
Y
L
 
T
G
 
L
R
 
G
T
 
A
V
 
V
N
 
N
P
 
S
P
 
V
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
S
V
 
L
L
 
V
L
 
F
-
 
D
-
 
S
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
K
P
 
K
D
 
H
A
 
A
A
 
T
S
 
R
L
 
N
Y
 
R
D
 
A
D
 
N
D
 
G
Q
 
E
L
 
L
T
 
F
Y
 
Y
G
 
G
I
x
R
T
 
R
G
 
G
L
 
T
S
 
L
T
 
T
P
 
H
V
 
F
A
 
S
L
 
L
Q
 
Q
N
 
Q
A
 
A
L
 
M
A
 
C
E
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
T
 
A
N
 
G
V
 
C
T
 
V
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
S
x
C
G
|
G
L
x
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
A
G
 
N
A
 
S
M
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
F
L
 
I
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
E
 
H
V
 
V
L
 
L
V
 
M
V
 
T
D
 
N
S
 
T
A
 
A
Y
|
Y
K
 
E
P
 
P
T
 
S
R
 
Q
R
 
D
F
 
F
C
 
C
D
 
S
R
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
S
R
 
K
F
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
S
Y
 
W
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
K
 
L
L
 
I
S
 
G
P
 
A
E
 
D
A
 
I
L
 
V
M
 
K
G
 
H
L
 
L
V
 
-
T
 
Q
S
 
P
S
 
N
T
 
T
R
 
K
L
 
I
I
 
V
V
 
F
L
 
L
E
 
E
A
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
T
F
 
M
E
 
E
M
 
V
Q
 
H
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
N
 
R
A
 
S
R
 
V
-
 
V
-
 
P
G
 
D
V
 
A
L
 
I
T
 
I
L
 
M
I
 
I
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
W
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
F
 
F
K
 
K
P
 
A
L
 
L
A
 
D
H
 
F
G
 
G
V
 
I
T
 
D
M
 
V
S
 
S
V
 
I
Q
 
Q
A
|
A
L
 
A
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
V
 
L
G
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
C
 
A
F
x
M
M
 
I
G
 
G
S
 
T
V
 
-
A
 
A
T
 
V
C
 
C
D
 
N
D
 
A
A
 
R
V
 
C
A
 
W
K
 
E
L
 
Q
L
 
L
G
 
R
D
 
E
A
 
N
M
 
A
W
 
Y
D
 
L
I
 
M
G
 
G
W
 
Q
S
 
M
V
 
V
S
 
D
S
 
A
D
 
D
D
 
T
A
 
A
Y
 
Y
T
 
I
M
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
G
T
 
V
R
 
R
L
 
L
P
 
R
R
 
Q
H
 
H
A
 
H
E
 
E
N
 
S
G
 
S
L
 
L
A
 
K
I
 
V
A
 
A
R
 
E
W
 
W
L
 
L
Q
 
A
E
 
E
R
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
S
A
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
E
I
 
F
W
 
W
K
 
K
R
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
T
G
 
G
A
 
S
C
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
G
 
S
V
 
F
V
 
V
L
 
L
-
 
K
K
 
K
P
 
K
C
 
L
S
 
N
Q
 
N
K
 
E
A
 
E
V
 
L
H
 
A
A
 
N
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
S
 
N
L
 
F
K
 
S
L
 
L
F
 
F
G
 
S
L
 
M
G
 
A
F
x
Y
S
|
S
W
|
W
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
I
L
 
L
N
 
A
C
 
N
D
 
Q
P
 
P
Q
 
E
L
 
H
G
 
I
A
 
A
R
 
A
S
 
I
I
 
R
P
 
P
-
 
Q
-
 
G
-
 
E
V
 
I
D
 
D
L
 
F
E
 
S
G
 
G
P
 
T
L
 
L
L
 
I
R
|
R
F
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
D
I
 
V
E
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
I
A
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
D
R
 
A
G
 
G
F
 
F

1cl1B Cystathionine beta-lyase (cbl) from escherichia coli (see paper)
43% identity, 97% coverage: 4:378/386 of query aligns to 4:388/392 of 1cl1B

query
sites
1cl1B
E
 
D
T
 
T
R
 
Q
L
 
L
I
 
V
H
 
N
T
 
A
G
 
G
S
 
R
E
 
S
P
 
K
A
 
K
R
 
Y
L
 
T
G
 
L
R
 
G
T
 
A
V
 
V
N
 
N
P
 
S
P
 
V
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
S
V
 
L
L
 
V
L
 
F
-
 
D
-
 
S
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
K
P
 
K
D
 
H
A
 
A
A
 
T
S
 
R
L
 
N
Y
 
R
D
 
A
D
 
N
D
 
G
Q
 
E
L
 
L
T
 
F
Y
 
Y
G
 
G
I
x
R
T
 
R
G
 
G
L
 
T
S
 
L
T
 
T
P
 
H
V
 
F
A
 
S
L
 
L
Q
 
Q
N
 
Q
A
 
A
L
 
M
A
 
C
E
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
T
 
A
N
 
G
V
 
C
T
 
V
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
S
 
C
G
 
G
L
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
A
G
 
N
A
 
S
M
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
F
L
 
I
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
E
 
H
V
 
V
L
 
L
V
 
M
V
 
T
D
 
N
S
 
T
A
 
A
Y
|
Y
K
 
E
P
 
P
T
 
S
R
 
Q
R
 
D
F
 
F
C
 
C
D
 
S
R
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
S
R
 
K
F
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
S
Y
 
W
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
K
 
L
L
 
I
S
 
G
P
 
A
E
 
D
A
 
I
L
 
V
M
 
K
G
 
H
L
 
L
V
 
-
T
 
Q
S
 
P
S
 
N
T
 
T
R
 
K
L
 
I
I
 
V
V
 
F
L
 
L
E
 
E
A
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
T
F
 
M
E
 
E
M
 
V
Q
 
H
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
N
 
R
A
 
S
R
 
V
-
 
V
-
 
P
G
 
D
V
 
A
L
 
I
T
 
I
L
 
M
I
 
I
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
W
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
F
 
F
K
 
K
P
 
A
L
 
L
A
 
D
H
 
F
G
 
G
V
 
I
T
 
D
M
 
V
S
 
S
V
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
A
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
V
 
L
G
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
C
 
A
F
 
M
M
 
I
G
 
G
S
 
T
V
 
-
A
 
A
T
 
V
C
 
C
D
 
N
D
 
A
A
 
R
V
 
C
A
 
W
K
 
E
L
 
Q
L
 
L
G
 
R
D
 
E
A
 
N
M
 
A
W
 
Y
D
 
L
I
 
M
G
 
G
W
 
Q
S
 
M
V
 
V
S
 
D
S
 
A
D
 
D
D
 
T
A
 
A
Y
 
Y
T
 
I
M
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
G
T
 
V
R
 
R
L
 
L
P
 
R
R
 
Q
H
 
H
A
 
H
E
 
E
N
 
S
G
 
S
L
 
L
A
 
K
I
 
V
A
 
A
R
 
E
W
 
W
L
 
L
Q
 
A
E
 
E
R
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
S
A
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
E
I
 
F
W
 
W
K
 
K
R
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
T
G
 
G
A
 
S
C
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
G
 
S
V
 
F
V
 
V
L
 
L
-
 
K
K
 
K
P
 
K
C
 
L
S
 
N
Q
 
N
K
 
E
A
 
E
V
 
L
H
 
A
A
 
N
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
S
 
N
L
 
F
K
 
S
L
 
L
F
 
F
G
 
S
L
 
M
G
 
A
F
 
Y
S
|
S
W
|
W
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
I
L
 
L
N
 
A
C
 
N
D
 
Q
P
 
P
Q
 
E
L
 
H
G
 
I
A
 
A
R
 
A
S
 
I
I
 
R
P
 
P
-
 
Q
-
 
G
-
 
E
V
 
I
D
 
D
L
 
F
E
 
S
G
 
G
P
 
T
L
 
L
L
 
I
R
|
R
F
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
D
I
 
V
E
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
I
A
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
D
R
 
A
G
 
G
F
 
F

4itxA P113s mutant of e. Coli cystathionine beta-lyase metc inhibited by reaction with l-ala-p (see paper)
42% identity, 97% coverage: 4:378/386 of query aligns to 3:387/391 of 4itxA

query
sites
4itxA
E
 
D
T
 
T
R
 
Q
L
 
L
I
 
V
H
 
N
T
 
A
G
 
G
S
 
R
E
 
S
P
 
K
A
 
K
R
 
Y
L
 
T
G
 
L
R
 
G
T
 
A
V
 
V
N
 
N
P
 
S
P
 
V
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
S
V
 
L
L
 
V
L
 
F
-
 
D
-
 
S
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
K
P
 
K
D
 
H
A
 
A
A
 
T
S
 
R
L
 
N
Y
 
R
D
 
A
D
 
N
D
 
G
Q
 
E
L
 
L
T
 
F
Y
 
Y
G
 
G
I
x
R
T
 
R
G
 
G
L
 
T
S
 
L
T
 
T
P
 
H
V
 
F
A
 
S
L
 
L
Q
 
Q
N
 
Q
A
 
A
L
 
M
A
 
C
E
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
T
 
A
N
 
G
V
 
C
T
 
V
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
S
x
C
G
|
G
L
x
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
A
G
 
N
A
 
S
M
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
F
L
 
I
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
E
 
H
V
 
V
L
 
L
V
 
M
V
 
T
D
 
N
S
 
T
A
 
A
Y
|
Y
K
 
E
P
 
S
T
 
S
R
 
Q
R
 
D
F
 
F
C
 
C
D
 
S
R
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
S
R
 
K
F
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
S
Y
 
W
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
K
 
L
L
 
I
S
 
G
P
 
A
E
 
D
A
 
I
L
 
V
M
 
K
G
 
H
L
 
L
V
 
-
T
 
Q
S
 
P
S
 
N
T
 
T
R
 
K
L
 
I
I
 
V
V
 
F
L
 
L
E
 
E
A
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
T
F
 
M
E
 
E
M
 
V
Q
 
H
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
N
 
R
A
 
S
R
 
V
-
 
V
-
 
P
G
 
D
V
 
A
L
 
I
T
 
I
L
 
M
I
 
I
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
W
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
F
 
F
K
 
K
P
 
A
L
 
L
A
 
D
H
 
F
G
 
G
V
 
I
T
 
D
M
 
V
S
 
S
V
 
I
Q
 
Q
A
|
A
L
 
A
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
V
 
L
G
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
C
 
A
F
x
M
M
 
I
G
 
G
S
 
T
V
 
-
A
 
A
T
 
V
C
 
C
D
 
N
D
 
A
A
 
R
V
 
C
A
 
W
K
 
E
L
 
Q
L
 
L
G
 
R
D
 
E
A
 
N
M
 
A
W
 
Y
D
 
L
I
 
M
G
 
G
W
 
Q
S
 
M
V
 
V
S
 
D
S
 
A
D
 
D
D
 
T
A
 
A
Y
 
Y
T
 
I
M
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
G
T
 
V
R
 
R
L
 
L
P
 
R
R
 
Q
H
 
H
A
 
H
E
 
E
N
 
S
G
 
S
L
 
L
A
 
K
I
 
V
A
 
A
R
 
E
W
 
W
L
 
L
Q
 
A
E
 
E
R
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
S
A
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
E
I
 
F
W
 
W
K
 
K
R
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
T
G
 
G
A
 
S
C
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
G
 
S
V
 
F
V
 
V
L
 
L
-
 
K
K
 
K
P
 
K
C
 
L
S
 
N
Q
 
N
K
 
E
A
 
E
V
 
L
H
 
A
A
 
N
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
S
 
N
L
 
F
K
 
S
L
 
L
F
 
F
G
 
S
L
 
M
G
 
A
F
x
Y
S
|
S
W
|
W
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
I
L
 
L
N
 
A
C
 
N
D
 
Q
P
 
P
Q
 
E
L
 
H
G
 
I
A
 
A
R
 
A
S
 
I
I
 
R
P
 
P
-
 
Q
-
 
G
-
 
E
V
 
I
D
 
D
L
 
F
E
 
S
G
 
G
P
 
T
L
 
L
L
 
I
R
|
R
F
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
D
I
 
V
E
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
I
A
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
D
R
 
A
G
 
G
F
 
F

8sadA Crystal structure of cystathionine beta lyase from klebsiella aerogenes, plp/malonate complex (c2 form)
42% identity, 97% coverage: 4:378/386 of query aligns to 10:394/398 of 8sadA

query
sites
8sadA
E
 
D
T
 
T
R
 
A
L
 
L
I
 
V
H
 
N
T
 
A
G
 
G
S
 
R
E
 
R
P
 
K
A
 
K
R
 
Y
L
 
T
G
 
Q
R
 
G
T
 
S
V
 
V
N
 
N
P
 
S
P
 
V
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
S
V
 
L
L
 
V
L
 
F
-
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
K
P
 
K
D
 
H
A
 
A
A
 
T
S
 
R
L
 
N
Y
 
R
D
 
A
D
 
K
D
 
G
Q
 
E
L
 
L
T
 
F
Y
 
Y
G
 
G
I
 
R
T
 
R
G
 
G
L
 
T
S
 
L
T
 
T
P
 
H
V
 
F
A
 
S
L
 
L
Q
 
Q
N
 
E
A
 
A
L
 
M
A
 
C
E
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
T
 
A
N
 
G
V
 
C
T
 
A
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
S
x
C
G
|
G
L
x
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
A
G
 
N
A
 
T
M
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
F
L
 
V
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
E
 
H
V
 
V
L
 
L
V
 
M
V
 
T
D
 
N
S
 
T
A
 
A
Y
|
Y
K
 
E
P
 
P
T
 
S
R
 
Q
R
 
D
F
 
F
C
 
C
D
 
T
R
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
A
R
 
K
F
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
G
Y
 
W
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
K
 
L
L
 
I
S
 
G
P
 
A
E
 
D
A
 
-
L
 
I
M
 
A
G
 
N
L
 
L
V
 
I
T
 
Q
S
 
P
S
 
N
T
 
T
R
 
K
L
 
V
I
 
V
V
 
F
L
 
L
E
 
E
A
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
T
F
 
M
E
 
E
M
 
V
Q
 
H
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
N
 
R
-
 
R
-
 
V
A
 
A
R
 
P
G
 
E
V
 
A
L
 
I
T
 
I
L
 
M
I
 
I
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
W
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
F
 
F
K
 
K
P
 
A
L
 
L
A
 
D
H
 
F
G
 
G
V
 
I
T
 
D
M
 
I
S
 
S
V
 
I
Q
 
Q
A
|
A
L
 
A
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
V
 
L
G
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
C
 
G
F
x
M
M
 
I
G
 
G
S
 
T
V
 
-
A
 
A
T
 
V
C
 
A
D
 
N
D
 
A
A
 
R
V
 
C
A
 
W
K
 
E
L
 
Q
L
 
L
G
 
C
D
 
E
A
 
N
M
 
A
W
 
Y
D
 
L
I
 
M
G
 
G
W
 
Q
S
 
M
V
 
I
S
 
D
S
 
A
D
 
D
D
 
T
A
 
A
Y
 
Y
T
 
M
M
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
G
T
 
V
R
 
R
L
 
L
P
 
R
R
 
Q
H
 
H
A
 
H
E
 
E
N
 
S
G
 
S
L
 
L
A
 
R
I
 
V
A
 
A
R
 
E
W
 
W
L
 
L
Q
 
A
E
 
Q
R
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
S
A
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
E
I
 
F
W
 
W
K
 
K
R
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
S
G
 
G
A
 
S
C
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
G
 
S
V
 
F
V
 
V
L
 
L
-
 
N
K
 
K
P
 
R
C
 
L
S
 
T
Q
 
D
K
 
A
A
 
E
V
 
L
H
 
A
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
S
 
N
L
 
F
K
 
S
L
 
L
F
 
F
G
 
S
L
 
M
G
 
A
F
 
Y
S
 
S
W
|
W
G
 
G
G
 
G
Y
 
F
E
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
I
L
 
L
N
 
A
C
 
N
D
 
Q
P
 
P
Q
 
E
L
 
H
G
 
I
A
|
A
R
 
A
S
 
I
I
x
R
P
 
P
-
 
E
-
x
A
-
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
F
E
 
S
G
 
G
P
 
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
F
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
N
I
 
V
E
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
A
R
 
A
G
 
G
F
 
F

8u99A Crystal structure of cystathionine beta lyase from klebsiella aerogenes (plp-serine adduct)
42% identity, 97% coverage: 4:378/386 of query aligns to 3:387/391 of 8u99A

query
sites
8u99A
E
 
D
T
 
T
R
 
A
L
 
L
I
 
V
H
 
N
T
 
A
G
 
G
S
 
R
E
 
R
P
 
K
A
 
K
R
 
Y
L
 
T
G
 
Q
R
 
G
T
 
S
V
 
V
N
 
N
P
 
S
P
 
V
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
S
V
 
L
L
 
V
L
 
F
-
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
K
P
 
K
D
 
H
A
 
A
A
 
T
S
 
R
L
 
N
Y
 
R
D
 
A
D
 
K
D
 
G
Q
 
E
L
 
L
T
 
F
Y
 
Y
G
 
G
I
 
R
T
 
R
G
 
G
L
 
T
S
 
L
T
 
T
P
 
H
V
 
F
A
 
S
L
 
L
Q
 
Q
N
 
E
A
 
A
L
 
M
A
 
C
E
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
T
 
A
N
 
G
V
 
C
T
 
A
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
S
x
C
G
|
G
L
x
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
A
G
 
N
A
 
T
M
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
F
L
 
V
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
E
 
H
V
 
V
L
 
L
V
 
M
V
 
T
D
 
N
S
 
T
A
 
A
Y
|
Y
K
 
E
P
 
P
T
 
S
R
 
Q
R
 
D
F
 
F
C
 
C
D
 
T
R
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
A
R
 
K
F
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
G
Y
 
W
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
K
 
L
L
 
I
S
 
G
P
 
A
E
 
D
A
 
-
L
 
I
M
 
A
G
 
N
L
 
L
V
 
I
T
 
Q
S
 
P
S
 
N
T
 
T
R
 
K
L
 
V
I
 
V
V
 
F
L
 
L
E
 
E
A
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
T
F
 
M
E
 
E
M
 
V
Q
 
H
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
N
 
R
-
 
R
-
 
V
A
 
A
R
 
P
G
 
E
V
 
A
L
 
I
T
 
I
L
 
M
I
 
I
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
W
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
F
 
F
K
 
K
P
 
A
L
 
L
A
 
D
H
 
F
G
 
G
V
 
I
T
 
D
M
 
I
S
 
S
V
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
A
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
V
 
L
G
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
C
 
G
F
x
M
M
 
I
G
 
G
S
 
T
V
 
-
A
 
A
T
 
V
C
 
A
D
 
N
D
 
A
A
 
R
V
 
C
A
 
W
K
 
E
L
 
Q
L
 
L
G
 
C
D
 
E
A
 
N
M
 
A
W
 
Y
D
 
L
I
 
M
G
 
G
W
 
Q
S
 
M
V
 
I
S
 
D
S
 
A
D
 
D
D
 
T
A
 
A
Y
 
Y
T
 
M
M
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
G
T
 
V
R
 
R
L
 
L
P
 
R
R
 
Q
H
 
H
A
 
H
E
 
E
N
 
S
G
 
S
L
 
L
A
 
R
I
 
V
A
 
A
R
 
E
W
 
W
L
 
L
Q
 
A
E
 
Q
R
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
S
A
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
E
I
 
F
W
 
W
K
 
K
R
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
S
G
 
G
A
 
S
C
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
G
 
S
V
 
F
V
 
V
L
 
L
-
 
N
K
 
K
P
 
R
C
 
L
S
 
T
Q
 
D
K
 
A
A
 
E
V
 
L
H
 
A
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
S
 
N
L
 
F
K
 
S
L
 
L
F
 
F
G
 
S
L
 
M
G
 
A
F
x
Y
S
|
S
W
|
W
G
 
G
G
 
G
Y
 
F
E
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
I
L
 
L
N
 
A
C
 
N
D
 
Q
P
 
P
Q
 
E
L
 
H
G
 
I
A
 
A
R
 
A
S
 
I
I
 
R
P
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
F
E
 
S
G
 
G
P
 
T
L
 
L
L
 
I
R
|
R
F
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
N
I
 
V
E
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
A
R
 
A
G
 
G
F
 
F

8u98A Crystal structure of cystathionine beta lyase from klebsiella aerogenes (plp-glycine adduct)
42% identity, 97% coverage: 4:378/386 of query aligns to 3:387/391 of 8u98A

query
sites
8u98A
E
 
D
T
 
T
R
 
A
L
 
L
I
 
V
H
 
N
T
 
A
G
 
G
S
 
R
E
 
R
P
 
K
A
 
K
R
 
Y
L
 
T
G
 
Q
R
 
G
T
 
S
V
 
V
N
 
N
P
 
S
P
 
V
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
S
V
 
L
L
 
V
L
 
F
-
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
K
P
 
K
D
 
H
A
 
A
A
 
T
S
 
R
L
 
N
Y
 
R
D
 
A
D
 
K
D
 
G
Q
 
E
L
 
L
T
 
F
Y
|
Y
G
 
G
I
x
R
T
 
R
G
 
G
L
 
T
S
 
L
T
 
T
P
 
H
V
 
F
A
 
S
L
 
L
Q
 
Q
N
 
E
A
 
A
L
 
M
A
 
C
E
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
T
 
A
N
 
G
V
 
C
T
 
A
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
S
x
C
G
|
G
L
x
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
A
G
 
N
A
 
T
M
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
F
L
 
V
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
E
 
H
V
 
V
L
 
L
V
 
M
V
 
T
D
 
N
S
 
T
A
 
A
Y
|
Y
K
 
E
P
 
P
T
 
S
R
 
Q
R
 
D
F
 
F
C
 
C
D
 
T
R
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
A
R
 
K
F
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
G
Y
 
W
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
K
 
L
L
 
I
S
 
G
P
 
A
E
 
D
A
 
-
L
 
I
M
 
A
G
 
N
L
 
L
V
 
I
T
 
Q
S
 
P
S
 
N
T
 
T
R
 
K
L
 
V
I
 
V
V
 
F
L
 
L
E
 
E
A
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
T
F
 
M
E
 
E
M
 
V
Q
 
H
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
N
 
R
-
 
R
-
 
V
A
 
A
R
 
P
G
 
E
V
 
A
L
 
I
T
 
I
L
 
M
I
 
I
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
W
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
F
 
F
K
 
K
P
 
A
L
 
L
A
 
D
H
 
F
G
 
G
V
 
I
T
 
D
M
 
I
S
 
S
V
 
I
Q
 
Q
A
|
A
L
 
A
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
V
 
L
G
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
C
 
G
F
x
M
M
 
I
G
 
G
S
 
T
V
 
-
A
 
A
T
 
V
C
 
A
D
 
N
D
 
A
A
 
R
V
 
C
A
 
W
K
 
E
L
 
Q
L
 
L
G
 
C
D
 
E
A
 
N
M
 
A
W
 
Y
D
 
L
I
 
M
G
 
G
W
 
Q
S
 
M
V
 
I
S
 
D
S
 
A
D
 
D
D
 
T
A
 
A
Y
 
Y
T
 
M
M
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
G
T
 
V
R
 
R
L
 
L
P
 
R
R
 
Q
H
 
H
A
 
H
E
 
E
N
 
S
G
 
S
L
 
L
A
 
R
I
 
V
A
 
A
R
 
E
W
 
W
L
 
L
Q
 
A
E
 
Q
R
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
S
A
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
E
I
 
F
W
 
W
K
 
K
R
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
S
G
 
G
A
 
S
C
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
G
 
S
V
 
F
V
 
V
L
 
L
-
 
N
K
 
K
P
 
R
C
 
L
S
 
T
Q
 
D
K
 
A
A
 
E
V
 
L
H
 
A
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
S
 
N
L
 
F
K
 
S
L
 
L
F
 
F
G
 
S
L
 
M
G
 
A
F
x
Y
S
|
S
W
|
W
G
 
G
G
 
G
Y
 
F
E
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
I
L
 
L
N
 
A
C
 
N
D
 
Q
P
 
P
Q
 
E
L
 
H
G
 
I
A
 
A
R
 
A
S
 
I
I
 
R
P
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
F
E
 
S
G
 
G
P
 
T
L
 
L
L
 
I
R
|
R
F
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
N
I
 
V
E
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
A
R
 
A
G
 
G
F
 
F

8sa9A Crystal structure of cystathionine beta lyase from klebsiella aerogenes, plp-oxamate adduct (c2 form)
42% identity, 97% coverage: 4:378/386 of query aligns to 3:387/391 of 8sa9A

query
sites
8sa9A
E
 
D
T
 
T
R
 
A
L
 
L
I
 
V
H
 
N
T
 
A
G
 
G
S
 
R
E
 
R
P
 
K
A
 
K
R
 
Y
L
 
T
G
 
Q
R
 
G
T
 
S
V
 
V
N
 
N
P
 
S
P
 
V
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
S
V
 
L
L
 
V
L
 
F
-
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
K
P
 
K
D
 
H
A
 
A
A
 
T
S
 
R
L
 
N
Y
 
R
D
 
A
D
 
K
D
 
G
Q
 
E
L
 
L
T
 
F
Y
 
Y
G
 
G
I
 
R
T
 
R
G
 
G
L
 
T
S
 
L
T
 
T
P
 
H
V
 
F
A
 
S
L
 
L
Q
 
Q
N
 
E
A
 
A
L
 
M
A
 
C
E
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
T
 
A
N
 
G
V
 
C
T
 
A
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
S
x
C
G
|
G
L
x
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
A
G
 
N
A
 
T
M
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
F
L
 
V
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
E
 
H
V
 
V
L
 
L
V
 
M
V
 
T
D
 
N
S
 
T
A
 
A
Y
|
Y
K
 
E
P
 
P
T
 
S
R
 
Q
R
 
D
F
 
F
C
 
C
D
 
T
R
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
A
R
 
K
F
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
G
Y
 
W
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
K
 
L
L
 
I
S
 
G
P
 
A
E
 
D
A
 
-
L
 
I
M
 
A
G
 
N
L
 
L
V
 
I
T
 
Q
S
 
P
S
 
N
T
 
T
R
 
K
L
 
V
I
 
V
V
 
F
L
 
L
E
 
E
A
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
T
F
 
M
E
 
E
M
 
V
Q
 
H
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
N
 
R
-
 
R
-
 
V
A
 
A
R
 
P
G
 
E
V
 
A
L
 
I
T
 
I
L
 
M
I
 
I
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
W
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
F
 
F
K
 
K
P
 
A
L
 
L
A
 
D
H
 
F
G
 
G
V
 
I
T
 
D
M
 
I
S
 
S
V
 
I
Q
 
Q
A
|
A
L
 
A
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
V
 
L
G
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
C
 
G
F
x
M
M
 
I
G
 
G
S
 
T
V
 
-
A
 
A
T
 
V
C
 
A
D
 
N
D
 
A
A
 
R
V
 
C
A
 
W
K
 
E
L
 
Q
L
 
L
G
 
C
D
 
E
A
 
N
M
 
A
W
 
Y
D
 
L
I
 
M
G
 
G
W
 
Q
S
 
M
V
 
I
S
 
D
S
 
A
D
 
D
D
 
T
A
 
A
Y
 
Y
T
 
M
M
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
G
T
 
V
R
 
R
L
 
L
P
 
R
R
 
Q
H
 
H
A
 
H
E
 
E
N
 
S
G
 
S
L
 
L
A
 
R
I
 
V
A
 
A
R
 
E
W
 
W
L
 
L
Q
 
A
E
 
Q
R
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
S
A
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
E
I
 
F
W
 
W
K
 
K
R
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
S
G
 
G
A
 
S
C
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
G
 
S
V
 
F
V
 
V
L
 
L
-
 
N
K
 
K
P
 
R
C
 
L
S
 
T
Q
 
D
K
 
A
A
 
E
V
 
L
H
 
A
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
S
 
N
L
 
F
K
 
S
L
 
L
F
 
F
G
 
S
L
 
M
G
 
A
F
 
Y
S
|
S
W
|
W
G
 
G
G
 
G
Y
 
F
E
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
I
L
 
L
N
 
A
C
 
N
D
 
Q
P
 
P
Q
 
E
L
 
H
G
 
I
A
 
A
R
 
A
S
 
I
I
 
R
P
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
F
E
 
S
G
 
G
P
 
T
L
 
L
L
 
I
R
|
R
F
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
N
I
 
V
E
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
A
R
 
A
G
 
G
F
 
F

8sabA Crystal structure of cystathionine beta lyase from klebsiella aerogenes, plp adduct with alanine (c2 form)
42% identity, 97% coverage: 4:378/386 of query aligns to 4:388/392 of 8sabA

query
sites
8sabA
E
 
D
T
 
T
R
 
A
L
 
L
I
 
V
H
x
N
T
 
A
G
 
G
S
x
R
E
x
R
P
x
K
A
 
K
R
 
Y
L
x
T
G
 
Q
R
 
G
T
 
S
V
 
V
N
 
N
P
 
S
P
 
V
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
S
V
 
L
L
 
V
L
 
F
-
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
K
P
 
K
D
 
H
A
 
A
A
 
T
S
 
R
L
 
N
Y
 
R
D
 
A
D
 
K
D
 
G
Q
 
E
L
 
L
T
 
F
Y
 
Y
G
 
G
I
 
R
T
 
R
G
 
G
L
 
T
S
 
L
T
 
T
P
 
H
V
 
F
A
 
S
L
 
L
Q
 
Q
N
 
E
A
 
A
L
 
M
A
 
C
E
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
T
 
A
N
 
G
V
 
C
T
 
A
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
S
x
C
G
|
G
L
x
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
A
G
 
N
A
 
T
M
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
F
L
 
V
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
E
 
H
V
 
V
L
 
L
V
 
M
V
 
T
D
 
N
S
 
T
A
 
A
Y
|
Y
K
 
E
P
 
P
T
 
S
R
 
Q
R
 
D
F
 
F
C
 
C
D
 
T
R
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
A
R
 
K
F
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
G
Y
 
W
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
K
 
L
L
 
I
S
 
G
P
 
A
E
 
D
A
 
-
L
 
I
M
 
A
G
 
N
L
 
L
V
 
I
T
 
Q
S
 
P
S
 
N
T
 
T
R
 
K
L
 
V
I
 
V
V
 
F
L
 
L
E
 
E
A
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
T
F
 
M
E
 
E
M
 
V
Q
 
H
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
N
 
R
-
 
R
-
 
V
A
 
A
R
 
P
G
 
E
V
 
A
L
 
I
T
 
I
L
 
M
I
 
I
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
W
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
F
 
F
K
 
K
P
 
A
L
 
L
A
 
D
H
 
F
G
 
G
V
 
I
T
 
D
M
 
I
S
 
S
V
 
I
Q
 
Q
A
|
A
L
 
A
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
V
 
L
G
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
C
 
G
F
x
M
M
 
I
G
 
G
S
 
T
V
 
-
A
 
A
T
 
V
C
 
A
D
 
N
D
 
A
A
 
R
V
 
C
A
 
W
K
 
E
L
 
Q
L
 
L
G
 
C
D
 
E
A
 
N
M
 
A
W
 
Y
D
 
L
I
 
M
G
 
G
W
 
Q
S
 
M
V
 
I
S
 
D
S
 
A
D
 
D
D
 
T
A
 
A
Y
 
Y
T
 
M
M
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
G
T
 
V
R
 
R
L
 
L
P
 
R
R
 
Q
H
 
H
A
 
H
E
 
E
N
 
S
G
 
S
L
 
L
A
 
R
I
 
V
A
 
A
R
 
E
W
 
W
L
 
L
Q
 
A
E
 
Q
R
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
S
A
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
E
I
 
F
W
 
W
K
 
K
R
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
S
G
 
G
A
 
S
C
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
G
 
S
V
 
F
V
 
V
L
 
L
-
 
N
K
 
K
P
 
R
C
 
L
S
 
T
Q
 
D
K
 
A
A
 
E
V
 
L
H
 
A
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
S
 
N
L
 
F
K
 
S
L
|
L
F
 
F
G
 
S
L
 
M
G
 
A
F
x
Y
S
|
S
W
|
W
G
 
G
G
 
G
Y
 
F
E
|
E
S
 
S
L
 
L
A
 
I
L
 
L
N
 
A
C
 
N
D
 
Q
P
 
P
Q
 
E
L
 
H
G
 
I
A
 
A
R
 
A
S
 
I
I
 
R
P
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
F
E
 
S
G
 
G
P
 
T
L
 
L
L
 
I
R
|
R
F
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
N
I
 
V
E
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
A
R
 
A
G
 
G
F
 
F

8j6nA Crystal structure of cystathionine gamma-lyase in complex with compound 1 (see paper)
34% identity, 97% coverage: 5:380/386 of query aligns to 11:387/390 of 8j6nA

query
sites
8j6nA
T
 
T
R
 
Q
L
 
A
I
 
I
H
 
H
T
 
V
G
 
G
S
 
Q
E
 
E
P
 
P
A
 
E
R
 
Q
L
 
W
G
 
S
-
 
S
R
 
R
T
 
A
V
 
V
N
 
V
P
 
L
P
 
P
I
 
I
Q
 
S
R
 
L
G
 
A
S
 
T
T
 
T
V
 
F
L
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
K
A
 
Q
A
 
D
S
 
S
L
 
P
Y
 
G
D
 
Q
D
 
S
D
 
S
Q
 
G
L
 
F
T
 
V
Y
|
Y
G
 
S
I
x
R
T
 
S
G
 
G
L
 
N
S
 
P
T
 
T
P
 
R
V
 
N
A
 
C
L
 
L
Q
 
E
N
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
A
E
 
A
L
 
L
E
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
K
N
 
H
V
 
C
T
 
L
L
 
T
Y
 
F
P
 
A
S
 
S
G
|
G
L
|
L
A
 
A
A
 
A
I
 
T
T
 
T
G
 
-
A
 
T
M
 
I
L
 
T
A
 
H
V
 
L
L
 
L
K
 
K
A
 
A
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
L
 
I
V
 
C
V
 
M
D
 
D
S
 
E
A
 
V
Y
|
Y
K
 
G
P
 
G
T
 
T
R
 
N
R
 
R
F
 
Y
C
 
F
D
 
R
R
 
R
V
 
V
L
 
A
G
 
S
R
 
E
F
 
F
G
 
G
V
 
L
T
 
K
T
 
I
R
 
S
Y
 
F
Y
 
V
D
 
D
P
 
C
K
 
S
L
 
K
S
 
T
P
 
-
E
 
K
A
 
L
L
 
L
M
 
E
G
 
A
L
 
A
V
 
I
T
 
T
S
 
P
S
 
Q
T
 
T
R
 
K
L
 
L
I
 
V
V
 
W
L
 
I
E
|
E
A
 
T
P
 
P
G
 
T
S
x
N
L
 
P
T
 
T
F
 
L
E
 
K
M
 
L
Q
 
A
D
 
D
I
 
I
P
 
K
A
 
A
I
 
C
A
 
A
A
 
Q
A
 
I
A
 
V
N
 
H
A
 
K
-
 
H
R
 
K
G
 
D
V
 
I
L
 
I
T
 
L
L
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
F
A
 
M
A
 
S
G
 
A
L
 
Y
L
 
F
F
 
Q
K
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
A
H
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
D
M
 
I
S
 
C
V
 
M
Q
 
C
A
x
S
L
 
A
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
V
 
M
G
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
C
 
V
F
 
V
M
 
M
G
 
G
S
 
L
V
 
V
A
 
S
T
 
V
C
 
N
D
 
S
D
 
D
A
 
D
V
 
L
A
 
N
K
 
E
L
 
R
L
 
L
G
 
R
D
 
F
A
 
L
M
 
Q
W
 
N
D
 
S
I
 
L
G
 
G
W
 
A
S
 
V
V
 
P
S
 
S
S
 
P
D
 
F
D
 
D
A
 
C
Y
 
Y
T
 
L
M
 
C
L
 
C
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
Q
T
 
I
R
 
R
L
 
M
P
 
E
R
 
K
H
 
H
A
 
F
E
 
R
N
 
N
G
 
G
L
 
M
A
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
R
W
 
F
L
 
L
Q
 
E
E
 
S
R
 
N
P
 
P
E
 
R
V
 
V
A
 
E
R
 
K
V
 
V
L
 
I
H
 
Y
P
 
P
A
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
S
D
 
H
A
 
P
G
 
Q
H
 
H
A
 
E
I
 
L
W
 
A
K
 
K
R
 
R
D
 
Q
F
 
C
T
 
T
G
 
G
A
 
C
C
 
P
G
 
G
L
 
M
F
 
V
G
 
S
V
 
F
V
 
Y
L
 
I
K
 
K
P
 
G
C
 
T
S
 
L
Q
 
Q
K
 
H
A
 
A
V
 
-
H
 
Q
A
 
V
F
 
F
L
 
L
D
 
K
S
 
N
L
 
I
K
 
K
L
 
L
F
 
F
G
 
A
L
 
L
G
 
A
F
x
E
S
|
S
W
 
L
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
-
N
 
E
C
 
L
D
 
P
P
 
A
Q
 
I
L
 
M
G
x
T
A
 
H
R
 
A
S
 
S
I
 
V
P
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
D
-
 
R
-
 
A
-
 
T
V
 
L
D
 
G
L
 
I
E
 
S
G
 
D
P
 
T
L
 
L
L
 
I
R
|
R
F
 
L
H
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
D
I
 
E
E
 
K
D
 
D
L
 
L
K
 
L
A
 
E
D
 
D
L
 
L
R
 
G
R
 
Q
G
 
A
F
 
L
E
 
K
A
 
A

4l0oH Structure determination of cystathionine gamma-synthase from helicobacter pylori
33% identity, 98% coverage: 1:378/386 of query aligns to 1:370/373 of 4l0oH

query
sites
4l0oH
M
 
M
D
 
R
E
 
M
E
 
Q
T
 
T
R
 
K
L
 
L
I
 
I
H
 
H
T
 
G
G
 
G
-
 
I
S
 
S
E
 
E
P
 
D
A
 
A
R
 
T
L
 
T
G
 
G
R
 
-
T
 
A
V
 
V
N
 
S
P
 
V
P
 
P
I
 
I
Q
 
Y
R
 
Q
G
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
Y
 
Y
D
 
R
D
 
Q
D
 
D
Q
 
G
L
 
Y
T
 
E
Y
|
Y
G
 
S
I
x
R
T
 
S
G
 
G
L
 
N
S
 
P
T
 
T
P
 
R
V
 
F
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
N
 
E
A
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
T
 
V
N
 
K
V
 
G
T
 
F
L
 
A
Y
 
F
P
 
A
S
|
S
G
|
G
L
|
L
A
 
A
A
 
G
I
 
I
T
 
H
G
 
-
A
 
A
M
 
V
L
 
F
A
 
S
V
 
L
L
 
L
K
 
Q
A
 
S
G
 
G
D
 
D
E
 
H
V
 
V
L
 
L
V
 
L
V
 
G
D
 
D
S
 
D
A
 
V
Y
|
Y
K
 
G
P
 
G
T
 
T
R
 
F
R
 
R
F
 
L
C
 
F
D
 
N
R
 
Q
V
 
V
L
 
L
G
 
V
R
 
K
F
 
N
G
 
G
V
 
L
T
 
S
T
 
C
R
 
T
Y
 
I
Y
 
I
D
 
D
P
 
T
K
 
S
L
 
-
S
 
D
P
 
I
E
 
S
A
 
Q
L
 
I
M
 
K
G
 
K
L
 
A
V
 
I
T
 
K
S
 
P
S
 
N
T
 
T
R
 
K
L
 
A
I
 
L
V
 
Y
L
 
L
E
 
E
A
 
T
P
 
P
G
 
S
S
 
N
L
 
P
T
 
L
F
 
L
E
 
K
M
 
I
Q
 
T
D
 
D
I
 
L
P
 
A
A
 
Q
I
 
C
A
 
A
A
 
S
A
 
V
A
 
A
N
 
K
A
 
D
R
 
H
G
 
G
V
 
L
L
 
L
T
 
T
L
 
I
I
 
V
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
F
A
 
A
A
 
T
G
 
P
L
 
Y
L
 
Y
F
 
Q
K
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
L
H
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
D
M
 
I
S
 
V
V
 
A
Q
 
H
A
x
S
L
 
G
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
V
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
C
 
V
F
 
V
M
 
A
G
 
G
S
 
L
V
 
V
A
 
T
T
 
T
C
 
N
D
 
N
D
 
E
A
 
A
V
 
L
A
 
A
K
 
Q
L
 
E
L
 
I
G
 
A
D
 
F
A
 
F
M
 
Q
W
 
N
D
 
A
I
 
I
G
 
G
W
 
G
S
 
V
V
 
L
S
 
G
S
 
P
D
 
Q
D
 
D
A
 
S
Y
 
W
T
 
L
M
 
L
L
 
Q
R
 
R
G
 
G
L
 
I
R
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
G
T
 
L
R
 
R
L
 
M
P
 
E
R
 
A
H
 
H
A
 
Q
E
 
K
N
 
N
G
 
A
L
 
L
A
 
C
I
 
V
A
 
A
R
 
E
W
 
F
L
 
L
Q
 
E
E
 
K
R
 
H
P
 
P
E
 
K
V
 
V
A
 
E
R
 
R
V
 
V
L
 
Y
H
 
Y
P
 
P
A
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
T
D
 
H
A
 
P
G
 
N
H
 
Y
A
 
E
I
 
L
W
 
A
K
 
K
R
 
K
D
 
Q
F
 
M
T
 
R
G
 
G
A
 
F
C
 
S
G
 
G
L
 
M
F
 
L
G
 
S
V
 
F
V
 
T
L
 
L
K
 
K
P
 
N
C
 
D
S
 
S
Q
 
E
K
 
A
A
 
V
V
 
-
H
 
-
A
 
A
F
 
F
L
 
V
D
 
E
S
 
S
L
 
L
K
 
K
L
 
L
F
 
F
G
 
I
L
 
L
G
 
G
F
 
E
S
 
S
W
 
L
G
 
G
G
 
G
Y
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
V
-
 
G
-
 
I
-
 
P
-
 
A
-
 
F
-
 
M
-
 
T
L
 
H
N
 
A
C
 
C
D
 
I
P
 
P
Q
 
K
L
 
-
G
 
-
A
 
T
R
 
Q
S
 
R
I
 
E
P
 
A
V
 
A
D
 
G
L
 
I
E
 
R
G
 
D
P
 
G
L
 
L
L
 
V
R
 
R
F
 
L
H
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
I
E
 
E
G
 
H
I
 
E
E
 
Q
D
 
D
L
 
L
K
 
L
A
 
E
D
 
D
L
 
L
R
 
E
R
 
Q
G
 
A
F
 
F

7ba4A Structure of cystathionine gamma-lyase from pseudomonas aeruginosa
33% identity, 98% coverage: 5:382/386 of query aligns to 9:375/377 of 7ba4A

query
sites
7ba4A
T
 
T
R
 
R
L
 
V
I
 
I
H
 
H
T
 
A
G
 
G
S
 
Q
E
 
A
P
 
P
A
 
D
R
 
P
L
 
S
G
 
T
R
 
G
T
 
A
V
 
I
N
 
M
P
 
P
P
 
P
I
 
I
Q
 
Y
R
 
A
G
 
N
S
 
S
T
 
T
V
 
Y
L
 
I
L
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
Y
 
-
D
 
-
D
 
-
D
 
-
Q
 
Q
L
 
R
T
 
S
Y
 
H
G
 
N
I
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
P
T
 
T
P
 
R
V
 
W
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
N
 
R
A
 
C
L
 
V
A
 
A
E
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
T
 
T
N
 
Q
V
 
A
T
 
F
L
 
A
Y
 
F
P
 
A
S
 
S
G
|
G
L
|
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
S
G
 
-
A
 
S
M
 
V
L
 
L
A
 
E
V
 
L
L
 
L
K
 
D
A
 
A
G
 
G
D
 
S
E
 
H
V
 
I
L
 
V
V
 
S
V
 
G
D
 
N
S
 
D
A
 
L
Y
|
Y
K
 
G
P
 
G
T
 
T
R
 
F
R
 
R
F
 
L
C
 
F
D
 
E
R
 
R
V
 
V
L
 
R
G
 
R
R
 
R
F
 
S
-
 
A
G
 
G
V
 
H
T
 
R
T
 
F
R
 
S
Y
 
F
Y
 
V
D
 
D
P
 
P
K
 
T
L
 
-
S
 
D
P
 
L
E
 
Q
A
 
A
L
 
F
M
 
E
G
 
A
L
 
A
V
 
L
T
 
T
S
 
P
S
 
E
T
 
T
R
 
R
L
 
M
I
 
V
V
 
W
L
 
V
E
 
E
A
 
T
P
 
P
G
 
S
S
 
N
L
 
P
T
 
L
F
 
L
E
 
R
M
 
L
Q
 
T
D
 
D
I
 
L
P
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
Q
A
 
L
A
 
C
N
 
R
A
 
A
R
 
R
G
 
G
V
 
I
L
 
I
T
 
S
L
 
V
I
 
A
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
x
F
A
 
A
A
 
S
G
 
P
L
 
Y
L
 
I
F
 
Q
K
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
E
H
 
L
G
 
G
V
 
F
T
 
D
M
 
V
S
 
V
V
 
V
Q
 
H
A
x
S
L
 
T
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
V
 
L
G
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
C
 
V
F
 
I
M
 
G
G
 
G
S
 
I
V
 
A
A
 
I
T
 
V
C
 
G
D
 
D
D
 
N
A
 
P
-
 
D
V
 
L
A
 
R
K
 
E
L
 
R
L
 
L
G
 
G
D
 
F
A
 
L
M
 
Q
W
 
N
D
 
S
I
 
V
G
 
G
W
 
A
S
 
I
V
 
S
S
 
G
S
 
P
D
 
F
D
 
D
A
 
A
Y
 
F
T
 
L
M
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
V
R
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
L
R
 
R
L
 
M
P
 
E
R
 
R
H
 
H
A
 
C
E
 
S
N
 
N
G
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
Q
W
 
W
L
 
L
Q
 
E
E
 
R
R
 
Q
P
 
P
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
Y
H
 
Y
P
 
P
A
 
G
L
 
L
P
 
A
G
 
S
D
 
H
A
 
P
G
 
Q
H
 
H
A
 
E
I
 
L
W
 
A
K
 
K
R
 
R
D
 
Q
F
 
M
T
 
R
G
 
G
A
 
F
C
 
G
G
 
G
L
 
M
F
 
I
G
 
S
V
 
L
V
 
D
L
 
L
K
 
R
P
 
-
C
 
C
S
 
D
Q
 
L
K
 
A
A
 
G
V
 
A
H
 
R
A
 
R
F
 
F
L
 
L
D
 
E
S
 
N
L
 
V
K
 
R
L
 
I
F
 
F
G
 
S
L
 
L
G
 
A
F
 
E
S
 
S
W
 
L
G
 
G
G
 
G
Y
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
-
L
 
I
N
 
E
C
 
H
D
 
P
P
 
A
Q
 
I
L
 
M
G
 
T
A
 
H
R
 
A
S
 
S
I
 
I
P
 
P
V
 
A
D
 
E
L
 
T
E
 
R
G
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
G
-
 
D
P
 
S
L
 
L
L
 
I
R
 
R
F
 
L
H
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
V
E
 
E
G
 
A
I
 
L
E
 
E
D
 
D
L
 
L
K
 
Q
A
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
A
R
 
Q
G
 
A
F
 
L
E
 
A
A
 
K
L
 
I
N
 
H

4iyoD Crystal structure of cystathionine gamma lyase from xanthomonas oryzae pv. Oryzae (xometc) in complex with e-site serine, a-site serine, a- site external aldimine structure with aminoacrylate and a-site iminopropionate intermediates (see paper)
33% identity, 98% coverage: 5:382/386 of query aligns to 6:384/384 of 4iyoD

query
sites
4iyoD
T
 
T
R
 
L
L
 
A
I
 
I
H
 
H
T
 
G
G
 
G
S
 
Q
E
 
S
P
 
P
A
 
D
R
 
P
L
 
S
G
 
T
R
 
G
T
 
A
V
 
V
N
 
M
P
 
P
P
 
P
I
 
I
Q
 
Y
R
 
A
G
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
Y
L
 
A
L
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
Q
A
 
S
S
 
S
L
 
P
Y
 
G
D
 
E
D
 
H
D
 
Q
Q
 
G
L
 
F
T
 
E
Y
|
Y
G
 
S
I
x
R
T
|
T
G
 
H
L
 
N
S
 
P
T
 
T
P
 
R
V
 
F
A
 
A
L
 
Y
Q
 
E
N
 
R
A
 
C
L
 
V
A
 
A
E
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
T
 
T
N
 
R
V
 
A
T
 
F
L
 
A
Y
 
F
P
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
A
I
 
-
T
 
T
G
 
S
A
 
T
M
 
V
L
 
M
A
 
E
V
 
L
L
 
L
K
 
D
A
 
A
G
 
G
D
 
S
E
 
H
V
 
V
L
 
V
V
 
A
V
 
M
D
 
D
S
 
D
A
 
L
Y
|
Y
K
 
G
P
 
G
T
 
T
R
 
F
R
|
R
F
 
L
C
 
F
D
 
E
R
 
R
V
 
V
L
 
R
G
 
R
R
 
R
F
 
T
G
 
A
V
 
G
T
 
L
T
 
D
R
 
F
Y
 
S
Y
 
F
D
 
V
P
 
D
K
 
L
L
 
T
S
 
D
P
 
P
E
 
A
A
 
A
L
 
F
M
 
K
G
 
A
L
 
A
V
 
I
T
 
R
S
 
A
S
 
D
T
 
T
R
 
K
L
 
M
I
 
V
V
 
W
L
 
I
E
 
E
A
 
T
P
 
P
G
 
T
S
 
N
L
 
P
T
 
M
F
 
L
E
 
K
M
 
L
Q
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
V
A
 
I
A
 
A
N
 
R
A
 
K
R
 
H
G
 
G
V
 
L
L
 
L
T
 
T
L
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
F
A
 
A
A
 
S
G
 
P
L
 
M
L
 
L
F
 
Q
K
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
S
H
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
D
M
 
L
S
 
V
V
 
V
Q
 
H
A
 
S
L
 
A
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
V
 
L
G
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
C
 
M
F
 
V
M
 
G
G
 
G
S
 
I
V
 
A
A
 
V
T
 
V
C
 
G
D
 
D
D
 
N
A
 
A
-
 
E
V
 
L
A
 
A
K
 
E
L
 
Q
L
 
M
G
 
A
D
 
F
A
 
L
M
 
Q
W
x
N
D
 
S
I
 
I
G
 
G
W
 
G
S
 
V
V
 
Q
S
 
G
S
 
P
D
 
F
D
 
D
A
 
S
Y
 
F
T
 
L
M
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
P
T
 
L
R
 
R
L
 
M
P
 
R
R
 
A
H
 
H
A
 
C
E
 
E
N
 
N
G
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
Q
W
 
W
L
 
L
Q
 
E
E
 
T
R
 
H
P
 
P
E
 
A
V
 
I
A
 
E
R
 
K
V
 
V
L
 
I
H
 
Y
P
 
P
A
 
G
L
 
L
P
 
A
G
 
S
D
 
H
A
 
P
G
 
Q
H
 
H
A
 
V
I
 
L
W
 
A
K
 
K
R
 
R
D
 
Q
F
 
M
T
 
S
G
 
G
A
 
F
C
 
G
G
 
G
L
 
I
F
 
V
G
 
S
V
 
I
V
 
V
L
 
L
K
 
K
P
 
-
C
 
G
S
 
G
Q
 
F
K
 
D
A
 
A
V
 
A
H
 
K
A
 
R
F
 
F
L
 
C
D
 
E
S
 
K
L
 
T
K
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
T
L
 
L
G
 
A
F
x
E
S
|
S
W
 
L
G
 
G
G
 
G
Y
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
-
L
 
V
N
 
N
C
 
H
D
 
P
P
 
A
Q
 
V
L
 
M
G
x
T
A
 
H
R
 
A
S
 
S
I
 
I
P
 
P
V
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
D
 
G
L
 
I
E
 
S
G
 
D
P
 
A
L
 
L
L
 
V
R
|
R
F
 
L
H
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
I
E
 
E
G
 
D
I
 
L
E
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
R
A
 
G
D
 
D
L
 
L
R
 
E
R
 
R
G
 
A
F
 
L
E
 
V
A
 
N
L
 
Q
N
 
N

4iyoB Crystal structure of cystathionine gamma lyase from xanthomonas oryzae pv. Oryzae (xometc) in complex with e-site serine, a-site serine, a- site external aldimine structure with aminoacrylate and a-site iminopropionate intermediates (see paper)
33% identity, 97% coverage: 5:378/386 of query aligns to 6:380/381 of 4iyoB

query
sites
4iyoB
T
 
T
R
 
L
L
 
A
I
 
I
H
 
H
T
 
G
G
 
G
S
 
Q
E
 
S
P
 
P
A
 
D
R
 
P
L
 
S
G
 
T
R
 
G
T
 
A
V
 
V
N
 
M
P
 
P
P
 
P
I
 
I
Q
 
Y
R
 
A
G
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
Y
L
 
A
L
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
Q
A
 
S
S
 
S
L
 
P
Y
 
G
D
 
E
D
 
H
D
 
Q
Q
 
G
L
 
F
T
 
E
Y
|
Y
G
 
S
I
x
R
T
|
T
G
 
H
L
 
N
S
 
P
T
 
T
P
 
R
V
 
F
A
 
A
L
 
Y
Q
 
E
N
 
R
A
 
C
L
 
V
A
 
A
E
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
T
 
T
N
 
R
V
 
A
T
 
F
L
 
A
Y
 
F
P
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
A
I
 
-
T
 
T
G
 
S
A
 
T
M
 
V
L
 
M
A
 
E
V
 
L
L
 
L
K
 
D
A
 
A
G
 
G
D
 
S
E
 
H
V
 
V
L
 
V
V
 
A
V
 
M
D
 
D
S
 
D
A
 
L
Y
|
Y
K
 
G
P
 
G
T
 
T
R
 
F
R
|
R
F
 
L
C
 
F
D
 
E
R
 
R
V
 
V
L
 
R
G
 
R
R
 
R
F
 
T
G
 
A
V
 
G
T
 
L
T
 
D
R
 
F
Y
 
S
Y
 
F
D
 
V
P
 
D
K
 
L
L
 
T
S
 
D
P
 
P
E
 
A
A
 
A
L
 
F
M
 
K
G
 
A
L
 
A
V
 
I
T
 
R
S
 
A
S
 
D
T
 
T
R
 
K
L
 
M
I
 
V
V
 
W
L
 
I
E
 
E
A
 
T
P
 
P
G
 
T
S
 
N
L
 
P
T
 
M
F
 
L
E
 
K
M
 
L
Q
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
V
A
 
I
A
 
A
N
 
R
A
 
K
R
 
H
G
 
G
V
 
L
L
 
L
T
 
T
L
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
F
A
 
A
A
 
S
G
 
P
L
 
M
L
 
L
F
 
Q
K
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
S
H
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
D
M
 
L
S
 
V
V
 
V
Q
 
H
A
 
S
L
 
A
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
V
 
L
G
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
C
 
M
F
 
V
M
 
G
G
 
G
S
 
I
V
 
A
A
 
V
T
 
V
C
 
G
D
 
D
D
 
N
A
 
A
-
 
E
V
 
L
A
 
A
K
 
E
L
x
Q
L
 
M
G
 
A
D
x
F
A
 
L
M
 
Q
W
x
N
D
 
S
I
 
I
G
 
G
W
 
G
S
 
V
V
 
Q
S
 
G
S
 
P
D
 
F
D
 
D
A
 
S
Y
 
F
T
 
L
M
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
P
T
 
L
R
 
R
L
 
M
P
 
R
R
 
A
H
 
H
A
 
C
E
 
E
N
 
N
G
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
Q
W
 
W
L
 
L
Q
 
E
E
 
T
R
 
H
P
 
P
E
 
A
V
 
I
A
 
E
R
 
K
V
 
V
L
 
I
H
 
Y
P
 
P
A
 
G
L
 
L
P
 
A
G
 
S
D
 
H
A
 
P
G
 
Q
H
 
H
A
 
V
I
 
L
W
 
A
K
 
K
R
 
R
D
 
Q
F
 
M
T
 
S
G
 
G
A
 
F
C
 
G
G
 
G
L
 
I
F
 
V
G
 
S
V
 
I
V
 
V
L
 
L
K
 
K
P
 
-
C
 
G
S
 
G
Q
 
F
K
 
D
A
 
A
V
 
A
H
 
K
A
 
R
F
 
F
L
 
C
D
 
E
S
 
K
L
 
T
K
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
T
L
 
L
G
 
A
F
x
E
S
|
S
W
 
L
G
 
G
G
 
G
Y
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
-
L
 
V
N
 
N
C
 
H
D
 
P
P
 
A
Q
 
V
L
 
M
G
x
T
A
 
H
R
 
A
S
 
S
I
 
I
P
 
P
V
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
D
 
G
L
 
I
E
 
S
G
 
D
P
 
A
L
 
L
L
 
V
R
|
R
F
 
L
H
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
I
E
 
E
G
 
D
I
 
L
E
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
R
A
 
G
D
 
D
L
 
L
R
 
E
R
 
R
G
 
A
F
 
L

4iy7B Crystal structure of cystathionine gamma lyase (xometc) from xanthomonas oryzae pv. Oryzae in complex with e-site serine, a-site external aldimine structure with serine and a-site external aldimine structure with aminoacrylate intermediates (see paper)
33% identity, 97% coverage: 5:378/386 of query aligns to 6:380/381 of 4iy7B

query
sites
4iy7B
T
 
T
R
 
L
L
 
A
I
 
I
H
 
H
T
 
G
G
 
G
S
 
Q
E
 
S
P
 
P
A
 
D
R
 
P
L
 
S
G
 
T
R
 
G
T
 
A
V
 
V
N
 
M
P
 
P
P
 
P
I
 
I
Q
 
Y
R
 
A
G
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
Y
L
 
A
L
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
Q
A
 
S
S
 
S
L
 
P
Y
 
G
D
 
E
D
 
H
D
 
Q
Q
 
G
L
 
F
T
 
E
Y
|
Y
G
 
S
I
x
R
T
|
T
G
 
H
L
 
N
S
 
P
T
 
T
P
 
R
V
 
F
A
 
A
L
 
Y
Q
 
E
N
 
R
A
 
C
L
 
V
A
 
A
E
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
T
 
T
N
 
R
V
 
A
T
 
F
L
 
A
Y
 
F
P
 
A
S
 
S
G
|
G
L
x
M
A
 
A
A
 
A
I
 
-
T
 
T
G
 
S
A
 
T
M
 
V
L
 
M
A
 
E
V
 
L
L
 
L
K
 
D
A
 
A
G
 
G
D
 
S
E
 
H
V
 
V
L
 
V
V
 
A
V
 
M
D
 
D
S
 
D
A
 
L
Y
|
Y
K
 
G
P
 
G
T
 
T
R
 
F
R
|
R
F
 
L
C
 
F
D
 
E
R
 
R
V
 
V
L
 
R
G
 
R
R
 
R
F
 
T
G
 
A
V
 
G
T
 
L
T
 
D
R
 
F
Y
 
S
Y
 
F
D
 
V
P
 
D
K
 
L
L
 
T
S
 
D
P
 
P
E
 
A
A
 
A
L
 
F
M
 
K
G
 
A
L
 
A
V
 
I
T
 
R
S
 
A
S
 
D
T
 
T
R
 
K
L
 
M
I
 
V
V
 
W
L
 
I
E
|
E
A
 
T
P
 
P
G
 
T
S
x
N
L
 
P
T
 
M
F
 
L
E
 
K
M
 
L
Q
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
V
A
 
I
A
 
A
N
 
R
A
 
K
R
 
H
G
 
G
V
 
L
L
 
L
T
 
T
L
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
F
A
 
A
A
 
S
G
 
P
L
 
M
L
 
L
F
 
Q
K
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
S
H
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
D
M
 
L
S
 
V
V
 
V
Q
 
H
A
x
S
L
 
A
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
V
 
L
G
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
C
 
M
F
 
V
M
 
G
G
 
G
S
 
I
V
 
A
A
 
V
T
 
V
C
 
G
D
 
D
D
 
N
A
 
A
-
 
E
V
 
L
A
 
A
K
 
E
L
x
Q
L
 
M
G
 
A
D
x
F
A
 
L
M
 
Q
W
x
N
D
 
S
I
 
I
G
 
G
W
 
G
S
 
V
V
 
Q
S
 
G
S
 
P
D
 
F
D
 
D
A
 
S
Y
 
F
T
 
L
M
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
P
T
 
L
R
 
R
L
 
M
P
 
R
R
 
A
H
 
H
A
 
C
E
 
E
N
 
N
G
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
Q
W
 
W
L
 
L
Q
 
E
E
 
T
R
 
H
P
 
P
E
 
A
V
 
I
A
 
E
R
 
K
V
 
V
L
 
I
H
 
Y
P
 
P
A
 
G
L
 
L
P
 
A
G
 
S
D
 
H
A
 
P
G
 
Q
H
 
H
A
 
V
I
 
L
W
 
A
K
 
K
R
 
R
D
 
Q
F
 
M
T
 
S
G
 
G
A
 
F
C
 
G
G
 
G
L
 
I
F
 
V
G
 
S
V
 
I
V
 
V
L
 
L
K
 
K
P
 
-
C
 
G
S
 
G
Q
 
F
K
 
D
A
 
A
V
 
A
H
 
K
A
 
R
F
 
F
L
 
C
D
 
E
S
 
K
L
 
T
K
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
T
L
 
L
G
 
A
F
x
E
S
|
S
W
x
L
G
 
G
G
 
G
Y
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
-
L
 
V
N
 
N
C
 
H
D
 
P
P
 
A
Q
 
V
L
 
M
G
x
T
A
 
H
R
 
A
S
 
S
I
 
I
P
 
P
V
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
D
 
G
L
 
I
E
 
S
G
 
D
P
 
A
L
 
L
L
 
V
R
|
R
F
 
L
H
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
I
E
 
E
G
 
D
I
 
L
E
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
R
A
 
G
D
 
D
L
 
L
R
 
E
R
 
R
G
 
A
F
 
L

4iy7A Crystal structure of cystathionine gamma lyase (xometc) from xanthomonas oryzae pv. Oryzae in complex with e-site serine, a-site external aldimine structure with serine and a-site external aldimine structure with aminoacrylate intermediates (see paper)
33% identity, 97% coverage: 5:378/386 of query aligns to 6:380/381 of 4iy7A

query
sites
4iy7A
T
 
T
R
 
L
L
 
A
I
 
I
H
 
H
T
 
G
G
 
G
S
 
Q
E
 
S
P
 
P
A
 
D
R
 
P
L
 
S
G
 
T
R
 
G
T
 
A
V
 
V
N
 
M
P
 
P
P
 
P
I
 
I
Q
 
Y
R
 
A
G
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
Y
L
 
A
L
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
Q
A
 
S
S
 
S
L
 
P
Y
 
G
D
 
E
D
 
H
D
 
Q
Q
 
G
L
 
F
T
 
E
Y
|
Y
G
 
S
I
x
R
T
|
T
G
 
H
L
 
N
S
 
P
T
 
T
P
 
R
V
 
F
A
 
A
L
 
Y
Q
 
E
N
 
R
A
 
C
L
 
V
A
 
A
E
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
T
 
T
N
 
R
V
 
A
T
 
F
L
 
A
Y
 
F
P
 
A
S
 
S
G
|
G
L
x
M
A
 
A
A
 
A
I
 
-
T
 
T
G
 
S
A
 
T
M
 
V
L
 
M
A
 
E
V
 
L
L
 
L
K
 
D
A
 
A
G
 
G
D
 
S
E
 
H
V
 
V
L
 
V
V
 
A
V
 
M
D
 
D
S
 
D
A
 
L
Y
|
Y
K
 
G
P
 
G
T
 
T
R
 
F
R
|
R
F
 
L
C
 
F
D
 
E
R
 
R
V
 
V
L
 
R
G
 
R
R
 
R
F
 
T
G
 
A
V
 
G
T
 
L
T
 
D
R
 
F
Y
 
S
Y
 
F
D
 
V
P
 
D
K
 
L
L
 
T
S
 
D
P
 
P
E
 
A
A
 
A
L
 
F
M
 
K
G
 
A
L
 
A
V
 
I
T
 
R
S
 
A
S
 
D
T
 
T
R
 
K
L
 
M
I
 
V
V
 
W
L
 
I
E
|
E
A
 
T
P
 
P
G
 
T
S
x
N
L
 
P
T
 
M
F
 
L
E
 
K
M
 
L
Q
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
V
A
 
I
A
 
A
N
 
R
A
 
K
R
 
H
G
 
G
V
 
L
L
 
L
T
 
T
L
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
F
A
 
A
A
 
S
G
 
P
L
 
M
L
 
L
F
 
Q
K
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
S
H
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
D
M
 
L
S
 
V
V
 
V
Q
 
H
A
x
S
L
 
A
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
V
 
L
G
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
C
 
M
F
 
V
M
 
G
G
 
G
S
 
I
V
 
A
A
 
V
T
 
V
C
 
G
D
 
D
D
 
N
A
 
A
-
 
E
V
 
L
A
 
A
K
 
E
L
 
Q
L
 
M
G
 
A
D
 
F
A
 
L
M
 
Q
W
x
N
D
 
S
I
 
I
G
 
G
W
 
G
S
 
V
V
 
Q
S
 
G
S
 
P
D
 
F
D
 
D
A
 
S
Y
 
F
T
 
L
M
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
P
T
 
L
R
 
R
L
 
M
P
 
R
R
 
A
H
 
H
A
 
C
E
 
E
N
 
N
G
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
Q
W
 
W
L
 
L
Q
 
E
E
 
T
R
 
H
P
 
P
E
 
A
V
 
I
A
 
E
R
 
K
V
 
V
L
 
I
H
 
Y
P
 
P
A
 
G
L
 
L
P
 
A
G
 
S
D
 
H
A
 
P
G
 
Q
H
 
H
A
 
V
I
 
L
W
 
A
K
 
K
R
 
R
D
 
Q
F
 
M
T
 
S
G
 
G
A
 
F
C
 
G
G
 
G
L
 
I
F
 
V
G
 
S
V
 
I
V
 
V
L
 
L
K
 
K
P
 
-
C
 
G
S
 
G
Q
 
F
K
 
D
A
 
A
V
 
A
H
 
K
A
 
R
F
 
F
L
 
C
D
 
E
S
 
K
L
 
T
K
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
T
L
 
L
G
 
A
F
x
E
S
|
S
W
x
L
G
 
G
G
 
G
Y
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
-
L
 
V
N
 
N
C
 
H
D
 
P
P
 
A
Q
 
V
L
 
M
G
x
T
A
 
H
R
 
A
S
 
S
I
 
I
P
 
P
V
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
D
 
G
L
 
I
E
 
S
G
 
D
P
 
A
L
 
L
L
 
V
R
|
R
F
 
L
H
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
I
E
 
E
G
 
D
I
 
L
E
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
R
A
 
G
D
 
D
L
 
L
R
 
E
R
 
R
G
 
A
F
 
L

4ixzA Native structure of cystathionine gamma lyase (xometc) from xanthomonas oryzae pv. Oryzae at ph 9.0 (see paper)
33% identity, 97% coverage: 5:378/386 of query aligns to 6:380/381 of 4ixzA

query
sites
4ixzA
T
 
T
R
 
L
L
 
A
I
 
I
H
 
H
T
 
G
G
 
G
S
 
Q
E
 
S
P
 
P
A
 
D
R
 
P
L
 
S
G
 
T
R
 
G
T
 
A
V
 
V
N
 
M
P
 
P
P
 
P
I
 
I
Q
 
Y
R
 
A
G
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
Y
L
 
A
L
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
Q
A
 
S
S
 
S
L
 
P
Y
 
G
D
 
E
D
 
H
D
 
Q
Q
 
G
L
 
F
T
 
E
Y
 
Y
G
 
S
I
x
R
T
 
T
G
 
H
L
 
N
S
 
P
T
 
T
P
 
R
V
 
F
A
 
A
L
 
Y
Q
 
E
N
 
R
A
 
C
L
 
V
A
 
A
E
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
T
 
T
N
 
R
V
 
A
T
 
F
L
 
A
Y
 
F
P
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
A
I
 
-
T
 
T
G
 
S
A
 
T
M
 
V
L
 
M
A
 
E
V
 
L
L
 
L
K
 
D
A
 
A
G
 
G
D
 
S
E
 
H
V
 
V
L
 
V
V
 
A
V
 
M
D
 
D
S
 
D
A
 
L
Y
|
Y
K
 
G
P
 
G
T
 
T
R
 
F
R
 
R
F
 
L
C
 
F
D
 
E
R
 
R
V
 
V
L
 
R
G
 
R
R
 
R
F
 
T
G
 
A
V
 
G
T
 
L
T
 
D
R
 
F
Y
 
S
Y
 
F
D
 
V
P
 
D
K
 
L
L
 
T
S
 
D
P
 
P
E
 
A
A
 
A
L
 
F
M
 
K
G
 
A
L
 
A
V
 
I
T
 
R
S
 
A
S
 
D
T
 
T
R
 
K
L
 
M
I
 
V
V
 
W
L
 
I
E
 
E
A
 
T
P
 
P
G
 
T
S
 
N
L
 
P
T
 
M
F
 
L
E
 
K
M
 
L
Q
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
V
A
 
I
A
 
A
N
 
R
A
 
K
R
 
H
G
 
G
V
 
L
L
 
L
T
 
T
L
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
F
A
 
A
A
 
S
G
 
P
L
 
M
L
 
L
F
 
Q
K
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
S
H
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
D
M
 
L
S
 
V
V
 
V
Q
 
H
A
 
S
L
 
A
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
V
 
L
G
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
C
 
M
F
 
V
M
 
G
G
 
G
S
 
I
V
 
A
A
 
V
T
 
V
C
 
G
D
 
D
D
 
N
A
 
A
-
 
E
V
 
L
A
 
A
K
 
E
L
 
Q
L
 
M
G
 
A
D
 
F
A
 
L
M
 
Q
W
 
N
D
 
S
I
 
I
G
 
G
W
 
G
S
 
V
V
 
Q
S
 
G
S
 
P
D
 
F
D
 
D
A
 
S
Y
 
F
T
 
L
M
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
P
T
 
L
R
 
R
L
 
M
P
 
R
R
 
A
H
 
H
A
 
C
E
 
E
N
 
N
G
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
Q
W
 
W
L
 
L
Q
 
E
E
 
T
R
 
H
P
 
P
E
 
A
V
 
I
A
 
E
R
 
K
V
 
V
L
 
I
H
 
Y
P
 
P
A
 
G
L
 
L
P
 
A
G
 
S
D
 
H
A
 
P
G
 
Q
H
 
H
A
 
V
I
 
L
W
 
A
K
 
K
R
 
R
D
 
Q
F
 
M
T
 
S
G
 
G
A
 
F
C
 
G
G
 
G
L
 
I
F
 
V
G
 
S
V
 
I
V
 
V
L
 
L
K
 
K
P
 
-
C
 
G
S
 
G
Q
 
F
K
 
D
A
 
A
V
 
A
H
 
K
A
 
R
F
 
F
L
 
C
D
 
E
S
 
K
L
 
T
K
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
T
L
 
L
G
 
A
F
 
E
S
|
S
W
x
L
G
 
G
G
 
G
Y
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
-
L
 
V
N
 
N
C
 
H
D
 
P
P
 
A
Q
 
V
L
 
M
G
x
T
A
 
H
R
 
A
S
 
S
I
 
I
P
 
P
V
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
D
 
G
L
 
I
E
 
S
G
 
D
P
 
A
L
 
L
L
 
V
R
|
R
F
 
L
H
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
I
E
 
E
G
 
D
I
 
L
E
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
R
A
 
G
D
 
D
L
 
L
R
 
E
R
 
R
G
 
A
F
 
L

5eigC Engineered human cystathionine gamma lyase (e59t, e339v) to deplet cysteine
35% identity, 86% coverage: 5:337/386 of query aligns to 11:337/388 of 5eigC

query
sites
5eigC
T
 
T
R
 
Q
L
 
A
I
 
I
H
 
H
T
 
V
G
 
G
S
 
Q
E
 
D
P
 
P
A
 
E
R
 
Q
-
 
W
L
 
T
G
 
S
R
 
R
T
 
A
V
 
V
N
 
V
P
 
P
P
 
P
I
 
I
Q
 
S
R
 
L
G
 
S
S
 
T
T
 
T
V
 
F
L
 
K
L
 
Q
P
 
G
D
 
A
A
 
P
A
 
G
S
 
S
L
 
G
Y
 
F
D
 
-
D
 
-
D
 
-
Q
 
-
L
 
-
T
 
T
Y
 
Y
G
 
S
I
x
R
T
 
S
G
 
G
L
 
N
S
 
P
T
 
T
P
 
R
V
 
N
A
 
C
L
 
L
Q
 
E
N
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
A
E
 
A
L
 
L
E
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
K
N
 
Y
V
 
C
T
 
L
L
 
A
Y
 
F
P
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
-
T
 
T
G
 
V
A
 
T
M
 
I
L
 
T
A
 
H
V
 
L
L
 
L
K
 
K
A
 
A
G
 
G
D
 
D
E
 
Q
V
 
I
L
 
I
V
 
C
V
 
M
D
 
D
S
 
D
A
 
V
Y
|
Y
K
 
G
P
 
G
T
 
T
R
 
N
R
|
R
F
 
Y
C
 
F
D
 
R
R
 
Q
V
 
V
L
 
A
G
 
S
R
 
E
F
 
F
G
 
G
V
 
L
T
 
K
T
 
I
R
 
S
Y
 
F
Y
 
V
D
 
D
P
 
C
K
 
S
L
 
-
S
 
K
P
 
I
E
 
K
A
 
L
L
 
L
M
 
E
G
 
A
L
 
A
V
 
I
T
 
T
S
 
P
S
 
E
T
 
T
R
 
K
L
 
L
I
 
V
V
 
W
L
 
I
E
 
E
A
 
T
P
 
P
G
 
T
S
 
N
L
 
P
T
 
T
F
 
Q
E
 
K
M
 
V
Q
 
I
D
 
D
I
 
I
P
 
E
A
 
G
I
 
C
A
 
A
A
 
H
A
 
I
A
 
V
N
 
H
A
 
K
R
 
H
G
 
G
-
 
D
V
 
I
L
 
I
T
 
L
L
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
F
A
 
M
A
 
S
G
 
P
L
 
Y
L
 
F
F
 
Q
K
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
A
H
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
D
M
 
I
S
 
S
V
 
M
Q
 
Y
A
 
S
L
 
A
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
V
 
M
G
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
C
 
V
F
 
V
M
 
M
G
 
G
S
 
L
V
 
V
A
 
S
T
 
V
C
 
N
D
 
C
D
 
E
A
 
S
V
 
L
A
 
H
K
 
N
L
 
R
L
 
L
G
 
R
D
 
F
A
 
L
M
 
Q
W
 
N
D
 
S
I
 
L
G
 
G
W
 
A
S
 
V
V
 
P
S
 
S
S
 
P
D
 
I
D
 
D
A
 
C
Y
 
Y
T
 
L
M
 
C
L
 
N
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
H
T
 
V
R
 
R
L
 
M
P
 
E
R
 
K
H
 
H
A
 
F
E
 
K
N
 
N
G
 
G
L
 
M
A
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
Q
W
 
F
L
 
L
Q
 
E
E
 
S
R
 
N
P
 
P
E
 
W
V
 
V
A
 
E
R
 
K
V
 
V
L
 
I
H
 
Y
P
 
P
A
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
S
D
 
H
A
 
P
G
 
Q
H
 
H
A
 
E
I
 
L
W
 
V
K
 
K
R
 
R
D
 
Q
F
 
C
T
 
T
G
 
G
A
 
C
C
 
T
G
 
G
L
 
M
F
 
V
G
 
T
V
 
F
V
 
Y
L
 
I
K
 
K
P
 
G
C
 
T
S
 
L
Q
 
Q
K
 
H
A
 
A
V
 
-
H
 
E
A
 
I
F
 
F
L
 
L
D
 
K
S
 
N
L
 
L
K
 
K
L
 
L
F
 
F
G
 
T
L
 
L
G
 
A
F
 
V
S
 
S
W
 
L
G
 
G
G
 
G
Y
 
F
E
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
A

Query Sequence

>CCNA_01491 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_01491
MDEETRLIHTGSEPARLGRTVNPPIQRGSTVLLPDAASLYDDDQLTYGITGLSTPVALQN
ALAELEGATNVTLYPSGLAAITGAMLAVLKAGDEVLVVDSAYKPTRRFCDRVLGRFGVTT
RYYDPKLSPEALMGLVTSSTRLIVLEAPGSLTFEMQDIPAIAAAANARGVLTLIDNTWAA
GLLFKPLAHGVTMSVQALTKYVGGHSDCFMGSVATCDDAVAKLLGDAMWDIGWSVSSDDA
YTMLRGLRTLATRLPRHAENGLAIARWLQERPEVARVLHPALPGDAGHAIWKRDFTGACG
LFGVVLKPCSQKAVHAFLDSLKLFGLGFSWGGYESLALNCDPQLGARSIPVDLEGPLLRF
HIGLEGIEDLKADLRRGFEALNAAKA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory