SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CCNA_01508 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_01508 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4zv2A An ancestral arginine-binding protein bound to glutamine (see paper)
42% identity, 84% coverage: 39:256/261 of query aligns to 4:224/225 of 4zv2A

query
sites
4zv2A
G
 
G
K
 
T
L
 
L
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
T
E
|
E
G
 
A
T
 
T
Y
x
F
P
 
P
P
 
P
F
 
F
N
 
G
F
 
F
Q
 
K
D
 
D
K
 
E
S
 
N
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
A
 
V
G
 
G
F
 
F
E
 
D
V
 
I
D
 
D
F
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
K
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
V
E
 
E
F
 
F
S
 
K
P
 
P
A
 
M
P
 
D
F
|
F
A
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
I
G
 
P
S
 
A
L
 
L
E
 
Q
S
 
S
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
I
N
 
A
Q
x
G
I
x
M
T
|
T
I
 
I
T
 
T
P
 
E
D
 
E
R
|
R
Q
 
K
A
 
K
K
 
Q
Y
 
V
D
 
D
F
 
F
S
 
S
E
 
D
P
 
P
Y
 
Y
T
 
F
V
 
E
S
 
A
G
 
G
I
 
Q
Q
 
A
I
 
I
I
 
V
A
 
V
L
 
K
K
 
K
G
 
G
K
 
N
P
 
D
A
 
S
P
 
I
T
 
K
G
 
S
P
 
L
E
 
E
G
 
D
L
 
L
T
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
V
G
 
G
V
 
V
G
 
Q
L
 
L
G
 
G
T
x
S
N
x
T
Y
 
S
E
 
E
Q
 
Q
W
 
H
L
 
V
R
 
K
A
 
K
N
 
V
V
 
A
P
 
A
T
 
G
A
 
V
D
 
K
V
 
V
R
 
K
T
 
K
Y
 
F
D
 
D
D
 
N
D
 
F
P
 
S
T
 
E
K
 
A
Y
 
F
Q
 
Q
D
 
E
L
 
L
R
 
K
A
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
V
N
 
T
D
|
D
R
 
N
L
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
L
D
 
A
F
 
Y
V
 
V
K
 
K
T
 
Q
S
 
N
P
 
P
E
 
N
-
 
A
-
 
G
F
 
V
V
 
K
A
 
I
S
 
V
G
 
G
Q
 
E
P
 
T
F
 
F
A
 
S
A
 
G
Q
 
E
G
 
P
S
 
Y
G
 
G
V
 
I
A
 
A
M
 
V
Q
 
R
K
 
K
-
 
G
D
 
N
P
 
S
A
 
E
L
 
L
K
 
L
V
 
E
V
 
K
I
 
I
N
 
N
Q
 
K
A
 
A
I
 
L
N
 
E
A
 
E
L
 
M
R
 
K
A
 
K
N
 
D
G
 
G
K
 
T
L
 
Y
A
 
D
A
 
K
I
 
I
S
 
Y
Q
 
E
Q
 
K
W
 
W
F
 
F
G
 
G

4zv1A An ancestral arginine-binding protein bound to arginine (see paper)
42% identity, 84% coverage: 39:256/261 of query aligns to 4:226/226 of 4zv1A

query
sites
4zv1A
G
 
G
K
 
T
L
 
L
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
T
E
|
E
G
 
A
T
 
T
Y
x
F
P
 
P
P
 
P
F
 
F
N
 
G
F
 
F
Q
 
K
D
 
D
K
 
E
S
 
N
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
A
 
V
G
 
G
F
 
F
E
 
D
V
 
I
D
 
D
F
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
K
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
V
E
 
E
F
 
F
S
 
K
P
 
P
A
 
M
P
 
D
F
|
F
A
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
I
G
 
P
S
 
A
L
 
L
E
 
Q
S
 
S
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
I
N
x
A
Q
x
G
I
x
M
T
|
T
I
 
I
T
 
T
P
 
E
D
 
E
R
|
R
Q
 
K
A
 
K
K
 
Q
Y
 
V
D
 
D
F
 
F
S
 
S
E
 
D
P
 
P
Y
 
Y
T
 
F
V
 
E
S
 
A
G
 
G
I
 
Q
Q
 
A
I
 
I
I
 
V
A
 
V
L
 
K
K
 
K
G
 
G
K
 
N
P
 
D
A
 
S
P
 
I
T
 
K
G
 
S
P
 
L
E
 
E
G
 
D
L
 
L
T
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
V
G
 
G
V
 
V
G
x
Q
L
 
L
G
 
G
T
x
S
N
x
T
Y
 
S
E
 
E
Q
 
Q
W
 
H
L
 
V
R
 
K
A
 
K
N
 
V
V
 
A
P
 
K
T
 
D
A
 
A
-
 
G
-
 
V
D
 
K
V
 
V
R
 
K
T
 
K
Y
 
F
D
 
D
D
 
N
D
 
F
P
 
S
T
 
E
K
 
A
Y
 
F
Q
 
Q
D
 
E
L
 
L
R
 
K
A
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
V
N
 
T
D
|
D
R
 
N
L
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
L
D
 
A
F
 
Y
V
 
V
K
 
K
T
 
Q
S
 
N
P
 
P
E
 
N
-
 
A
-
 
G
F
 
V
V
 
K
A
 
I
S
 
V
G
 
G
Q
 
E
P
 
T
F
 
F
A
 
S
A
 
G
Q
 
E
G
 
P
S
 
Y
G
 
G
V
 
I
A
 
A
M
 
V
Q
 
R
K
 
K
-
 
G
D
 
N
P
 
S
A
 
E
L
 
L
K
 
L
V
 
E
V
 
K
I
 
I
N
 
N
Q
 
K
A
 
A
I
 
L
N
 
E
A
 
E
L
 
M
R
 
K
A
 
K
N
 
D
G
 
G
K
 
T
L
 
Y
A
 
D
A
 
K
I
 
I
S
 
Y
Q
 
E
Q
 
K
W
 
W
F
 
F
G
 
G

5t0wA Crystal structure of the ancestral amino acid-binding protein anccdt- 1, a precursor of cyclohexadienyl dehydratase
37% identity, 87% coverage: 30:255/261 of query aligns to 1:228/229 of 5t0wA

query
sites
5t0wA
S
 
S
G
 
T
W
 
L
D
 
D
R
 
E
I
 
I
K
 
M
A
 
K
S
 
R
G
 
G
K
 
T
L
 
L
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
T
E
x
D
G
 
A
T
 
D
Y
|
Y
P
 
K
P
 
P
F
 
F
N
 
S
F
 
F
Q
 
K
D
 
D
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Q
 
Q
L
 
Y
A
 
T
G
 
G
F
 
F
E
 
D
V
 
I
D
 
D
F
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
K
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
V
E
 
E
F
 
F
S
 
V
P
 
P
A
 
T
P
 
T
F
x
W
A
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
I
G
 
P
S
 
A
L
 
L
E
 
Q
S
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
F
D
 
D
V
 
I
V
 
V
I
 
M
N
x
S
Q
x
G
I
x
M
T
|
T
I
 
I
T
 
T
P
 
P
D
 
E
R
|
R
Q
 
K
A
 
K
K
 
K
Y
 
V
D
 
D
F
 
F
S
 
S
E
 
D
P
 
P
Y
 
Y
T
 
M
V
 
T
S
 
A
G
 
G
I
 
Q
Q
 
T
I
 
I
I
 
L
A
 
V
L
 
K
K
 
K
G
 
D
K
 
N
P
 
A
A
 
D
P
 
K
T
 
I
G
 
K
P
 
S
E
 
F
G
 
E
L
 
D
T
 
L
G
 
N
K
 
K
-
 
P
-
 
D
-
 
V
K
 
K
V
 
V
G
 
A
V
 
V
G
x
Q
L
 
L
G
 
G
T
|
T
N
x
T
Y
 
S
E
 
E
Q
 
Q
W
 
A
L
 
A
R
 
K
A
 
E
N
 
F
V
 
L
P
 
P
T
 
K
A
 
A
D
 
K
V
 
I
R
 
R
T
 
T
Y
 
F
D
 
E
D
 
N
D
 
N
P
 
A
T
 
E
K
 
A
Y
 
F
Q
 
Q
D
 
E
L
 
V
R
 
V
A
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
M
L
 
V
N
 
T
D
|
D
R
 
S
L
 
P
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
Y
F
 
Y
V
 
A
K
 
K
T
 
L
S
 
A
P
 
-
E
 
-
F
 
V
V
 
V
A
 
V
S
 
V
G
 
D
Q
 
E
P
 
P
F
 
F
A
 
T
A
 
H
Q
 
E
G
 
P
S
 
L
G
 
G
V
 
F
A
 
A
M
 
I
Q
 
R
K
 
K
-
 
G
D
 
D
P
 
P
A
 
E
L
 
L
K
 
L
V
 
N
V
 
W
I
 
V
N
 
N
Q
 
N
A
 
W
I
 
L
N
 
K
A
 
Q
L
 
M
R
 
K
A
 
K
N
 
D
G
 
G
K
 
T
L
 
Y
A
 
D
A
 
K
I
 
L
S
 
Y
Q
 
E
Q
 
K
W
 
W
F
 
F

3vvfA Crystal structure of ttc0807 complexed with arginine (see paper)
39% identity, 87% coverage: 32:259/261 of query aligns to 10:238/241 of 3vvfA

query
sites
3vvfA
W
 
F
D
 
E
R
 
E
I
 
I
K
 
K
A
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
E
L
 
I
R
 
R
V
 
I
G
 
G
L
 
T
E
|
E
G
 
G
T
 
A
Y
x
F
P
 
P
P
 
P
F
 
F
N
 
N
F
 
Y
Q
 
F
D
 
D
K
 
E
S
 
R
G
 
N
Q
 
Q
L
 
L
A
 
T
G
 
G
F
 
F
E
 
E
V
 
V
D
 
D
F
 
L
A
 
G
K
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
E
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
L
K
 
K
A
 
P
E
 
R
F
 
W
S
 
I
P
 
A
A
 
Q
P
 
S
F
|
F
A
 
D
G
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
I
S
 
Q
L
 
L
E
 
N
S
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
F
D
 
D
V
 
F
V
 
V
I
 
I
N
x
A
Q
x
S
I
x
H
T
x
G
I
 
I
T
 
T
P
 
E
D
 
E
R
|
R
Q
 
A
A
 
R
K
 
A
Y
 
V
D
 
D
F
 
F
S
 
T
E
 
N
P
 
P
Y
 
H
T
 
Y
V
 
C
S
 
T
G
 
G
I
 
G
Q
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
S
L
 
R
K
 
K
G
 
G
K
 
-
P
 
-
A
 
G
P
 
P
T
 
R
G
 
T
P
 
A
E
 
K
G
 
D
L
 
L
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
K
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
G
x
Q
L
 
V
G
 
G
T
|
T
N
x
T
Y
|
Y
E
 
M
Q
 
E
W
 
A
L
 
A
R
 
Q
A
 
K
N
 
I
V
 
P
P
 
G
T
 
I
A
 
K
D
 
E
V
 
V
R
 
R
T
 
T
Y
 
Y
D
 
Q
D
 
R
D
 
D
P
 
P
T
 
D
K
 
A
Y
 
L
Q
 
Q
D
 
D
L
 
L
R
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
T
V
 
W
L
 
I
N
 
T
D
 
D
R
 
R
L
 
F
V
 
V
A
 
A
A
 
K
D
 
E
F
 
A
V
 
I
K
 
K
T
 
E
S
 
R
-
 
K
-
 
L
P
 
E
E
 
N
F
 
T
V
 
L
A
 
Q
S
 
V
G
 
G
Q
 
E
P
 
L
F
 
V
A
 
F
A
 
Q
Q
x
E
G
 
R
S
 
V
G
 
A
V
 
M
A
 
A
M
 
V
Q
 
A
K
 
K
-
 
G
D
 
N
P
 
K
A
 
S
L
 
L
K
 
L
V
 
D
V
 
A
I
 
L
N
 
N
Q
 
R
A
 
A
I
 
L
N
 
A
A
 
E
L
 
L
R
 
M
A
 
Q
N
 
D
G
 
G
K
 
T
L
 
Y
A
 
A
A
 
R
I
 
I
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
K
W
 
W
F
 
F
G
 
G
M
 
E
D
 
D
V
 
V

3vveA Crystal structure of ttc0807 complexed with lysine (see paper)
39% identity, 87% coverage: 32:259/261 of query aligns to 10:238/241 of 3vveA

query
sites
3vveA
W
 
F
D
 
E
R
 
E
I
 
I
K
 
K
A
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
E
L
 
I
R
 
R
V
 
I
G
 
G
L
 
T
E
|
E
G
 
G
T
 
A
Y
x
F
P
 
P
P
 
P
F
 
F
N
 
N
F
 
Y
Q
 
F
D
 
D
K
 
E
S
 
R
G
 
N
Q
 
Q
L
 
L
A
 
T
G
 
G
F
 
F
E
 
E
V
 
V
D
 
D
F
 
L
A
 
G
K
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
E
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
L
K
 
K
A
 
P
E
 
R
F
 
W
S
 
I
P
 
A
A
 
Q
P
 
S
F
|
F
A
 
D
G
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
I
S
 
Q
L
 
L
E
 
N
S
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
F
D
 
D
V
 
F
V
 
V
I
 
I
N
 
A
Q
x
S
I
x
H
T
 
G
I
 
I
T
 
T
P
 
E
D
 
E
R
|
R
Q
 
A
A
 
R
K
 
A
Y
 
V
D
 
D
F
 
F
S
 
T
E
 
N
P
 
P
Y
 
H
T
 
Y
V
 
C
S
 
T
G
 
G
I
 
G
Q
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
S
L
 
R
K
 
K
G
 
G
K
 
-
P
 
-
A
 
G
P
 
P
T
 
R
G
 
T
P
 
A
E
 
K
G
 
D
L
 
L
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
K
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
G
x
Q
L
 
V
G
 
G
T
|
T
N
x
T
Y
|
Y
E
 
M
Q
 
E
W
 
A
L
 
A
R
 
Q
A
 
K
N
 
I
V
 
P
P
 
G
T
 
I
A
 
K
D
 
E
V
 
V
R
 
R
T
 
T
Y
 
Y
D
 
Q
D
 
R
D
 
D
P
 
P
T
 
D
K
 
A
Y
 
L
Q
 
Q
D
 
D
L
 
L
R
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
T
V
 
W
L
 
I
N
 
T
D
 
D
R
 
R
L
 
F
V
 
V
A
 
A
A
 
K
D
 
E
F
 
A
V
 
I
K
 
K
T
 
E
S
 
R
-
 
K
-
 
L
P
 
E
E
 
N
F
 
T
V
 
L
A
 
Q
S
 
V
G
 
G
Q
 
E
P
 
L
F
 
V
A
 
F
A
 
Q
Q
x
E
G
 
R
S
 
V
G
 
A
V
 
M
A
 
A
M
 
V
Q
 
A
K
 
K
-
 
G
D
 
N
P
 
K
A
 
S
L
 
L
K
 
L
V
 
D
V
 
A
I
 
L
N
 
N
Q
 
R
A
 
A
I
 
L
N
 
A
A
 
E
L
 
L
R
 
M
A
 
Q
N
 
D
G
 
G
K
 
T
L
 
Y
A
 
A
A
 
R
I
 
I
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
K
W
 
W
F
 
F
G
 
G
M
 
E
D
 
D
V
 
V

3vvdA Crystal structure of ttc0807 complexed with ornithine (see paper)
39% identity, 87% coverage: 32:259/261 of query aligns to 10:238/241 of 3vvdA

query
sites
3vvdA
W
 
F
D
 
E
R
 
E
I
 
I
K
 
K
A
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
E
L
 
I
R
 
R
V
 
I
G
 
G
L
 
T
E
|
E
G
 
G
T
 
A
Y
 
F
P
 
P
P
 
P
F
 
F
N
 
N
F
 
Y
Q
 
F
D
 
D
K
 
E
S
 
R
G
 
N
Q
 
Q
L
 
L
A
 
T
G
 
G
F
 
F
E
 
E
V
 
V
D
 
D
F
 
L
A
 
G
K
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
E
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
L
K
 
K
A
 
P
E
 
R
F
 
W
S
 
I
P
 
A
A
 
Q
P
 
S
F
|
F
A
 
D
G
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
I
S
 
Q
L
 
L
E
 
N
S
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
F
D
 
D
V
 
F
V
 
V
I
 
I
N
 
A
Q
x
S
I
x
H
T
x
G
I
 
I
T
 
T
P
 
E
D
 
E
R
|
R
Q
 
A
A
 
R
K
 
A
Y
 
V
D
 
D
F
 
F
S
 
T
E
 
N
P
 
P
Y
 
H
T
 
Y
V
 
C
S
 
T
G
 
G
I
 
G
Q
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
S
L
 
R
K
 
K
G
 
G
K
 
-
P
 
-
A
 
G
P
 
P
T
 
R
G
 
T
P
 
A
E
 
K
G
 
D
L
 
L
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
K
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
G
x
Q
L
 
V
G
 
G
T
|
T
N
x
T
Y
|
Y
E
 
M
Q
 
E
W
 
A
L
 
A
R
 
Q
A
 
K
N
 
I
V
 
P
P
 
G
T
 
I
A
 
K
D
 
E
V
 
V
R
 
R
T
 
T
Y
 
Y
D
 
Q
D
 
R
D
 
D
P
 
P
T
 
D
K
 
A
Y
 
L
Q
 
Q
D
 
D
L
 
L
R
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
T
V
 
W
L
 
I
N
 
T
D
 
D
R
 
R
L
 
F
V
 
V
A
 
A
A
 
K
D
 
E
F
 
A
V
 
I
K
 
K
T
 
E
S
 
R
-
 
K
-
 
L
P
 
E
E
 
N
F
 
T
V
 
L
A
 
Q
S
 
V
G
 
G
Q
 
E
P
 
L
F
 
V
A
 
F
A
 
Q
Q
x
E
G
 
R
S
 
V
G
 
A
V
 
M
A
 
A
M
 
V
Q
 
A
K
 
K
-
 
G
D
 
N
P
 
K
A
 
S
L
 
L
K
 
L
V
 
D
V
 
A
I
 
L
N
 
N
Q
 
R
A
 
A
I
 
L
N
 
A
A
 
E
L
 
L
R
 
M
A
 
Q
N
 
D
G
 
G
K
 
T
L
 
Y
A
 
A
A
 
R
I
 
I
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
K
W
 
W
F
 
F
G
 
G
M
 
E
D
 
D
V
 
V

3vv5A Crystal structure of ttc0807 complexed with (s)-2-aminoethyl-l- cysteine (aec) (see paper)
39% identity, 87% coverage: 32:259/261 of query aligns to 6:234/237 of 3vv5A

query
sites
3vv5A
W
 
F
D
 
E
R
 
E
I
 
I
K
 
K
A
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
E
L
 
I
R
 
R
V
 
I
G
 
G
L
 
T
E
|
E
G
 
G
T
 
A
Y
x
F
P
 
P
P
 
P
F
 
F
N
|
N
F
 
Y
Q
 
F
D
 
D
K
 
E
S
 
R
G
 
N
Q
 
Q
L
 
L
A
 
T
G
 
G
F
 
F
E
 
E
V
 
V
D
 
D
F
 
L
A
 
G
K
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
E
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
L
K
 
K
A
 
P
E
 
R
F
 
W
S
 
I
P
 
A
A
 
Q
P
 
S
F
|
F
A
 
D
G
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
I
S
 
Q
L
 
L
E
 
N
S
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
F
D
 
D
V
 
F
V
 
V
I
 
I
N
x
A
Q
x
S
I
 
H
T
x
G
I
 
I
T
 
T
P
 
E
D
 
E
R
|
R
Q
 
A
A
 
R
K
 
A
Y
 
V
D
 
D
F
 
F
S
 
T
E
 
N
P
 
P
Y
 
H
T
 
Y
V
 
C
S
 
T
G
 
G
I
 
G
Q
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
S
L
 
R
K
 
K
G
 
G
K
 
-
P
 
-
A
 
G
P
 
P
T
 
R
G
 
T
P
 
A
E
 
K
G
 
D
L
 
L
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
K
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
G
 
Q
L
 
V
G
 
G
T
|
T
N
x
T
Y
|
Y
E
 
M
Q
 
E
W
 
A
L
 
A
R
 
Q
A
 
K
N
 
I
V
 
P
P
 
G
T
 
I
A
 
K
D
 
E
V
 
V
R
 
R
T
 
T
Y
 
Y
D
 
Q
D
 
R
D
 
D
P
 
P
T
 
D
K
 
A
Y
 
L
Q
 
Q
D
 
D
L
 
L
R
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
T
V
 
W
L
 
I
N
 
T
D
 
D
R
 
R
L
 
F
V
 
V
A
 
A
A
 
K
D
 
E
F
 
A
V
 
I
K
 
K
T
 
E
S
 
R
-
 
K
-
 
L
P
 
E
E
 
N
F
 
T
V
 
L
A
 
Q
S
 
V
G
 
G
Q
 
E
P
 
L
F
 
V
A
 
F
A
 
Q
Q
 
E
G
 
R
S
 
V
G
 
A
V
 
M
A
 
A
M
 
V
Q
 
A
K
 
K
-
 
G
D
 
N
P
 
K
A
 
S
L
 
L
K
 
L
V
 
D
V
 
A
I
 
L
N
 
N
Q
 
R
A
 
A
I
 
L
N
 
A
A
 
E
L
 
L
R
 
M
A
 
Q
N
 
D
G
 
G
K
 
T
L
 
Y
A
 
A
A
 
R
I
 
I
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
K
W
 
W
F
 
F
G
 
G
M
 
E
D
 
D
V
 
V

2ylnA Crystal structure of the l-cystine solute receptor of neisseria gonorrhoeae in the closed conformation (see paper)
36% identity, 87% coverage: 33:260/261 of query aligns to 8:238/240 of 2ylnA

query
sites
2ylnA
D
 
E
R
 
R
I
 
I
K
 
N
A
 
N
S
 
K
G
 
G
K
 
T
L
 
V
R
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
T
E
|
E
G
 
G
T
 
T
Y
|
Y
P
 
A
P
 
P
F
 
F
N
 
T
F
 
Y
Q
 
H
D
 
D
K
 
K
S
 
D
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
A
 
T
G
 
G
F
 
Y
E
 
D
V
 
V
D
 
E
F
 
V
A
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
A
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
V
E
 
E
F
 
F
S
 
K
P
 
E
A
 
T
P
 
Q
F
x
W
A
 
D
G
 
S
L
 
M
L
 
M
G
 
A
S
 
G
L
 
L
E
 
K
S
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
F
D
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
A
N
|
N
Q
 
Q
I
 
V
T
 
G
I
 
L
T
 
T
-
 
S
P
 
P
D
 
E
R
|
R
Q
 
Q
A
 
A
K
 
T
Y
 
F
D
 
D
F
 
K
S
 
S
E
 
E
P
 
P
Y
 
Y
T
 
S
V
 
W
S
 
S
G
 
G
I
 
A
Q
 
V
I
 
L
I
 
V
A
 
A
L
 
H
K
 
N
G
 
D
K
 
S
P
 
N
A
 
I
P
 
K
T
 
S
G
 
I
P
 
A
E
 
D
G
 
-
L
 
I
T
 
K
G
 
G
K
 
V
K
 
K
V
 
T
G
 
A
V
 
Q
G
x
S
L
 
L
G
 
T
T
x
S
N
|
N
Y
 
Y
E
 
G
Q
 
E
W
 
-
L
 
-
R
 
K
A
 
A
N
 
K
V
 
A
P
 
A
T
 
G
A
 
A
D
 
Q
V
 
L
R
 
V
T
 
P
Y
 
V
D
 
D
D
x
G
D
x
L
P
 
A
T
 
Q
K
 
S
Y
 
L
Q
 
T
D
 
L
L
 
I
R
 
E
A
 
Q
G
 
K
R
 
R
I
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
T
L
 
L
N
|
N
D
 
D
R
 
E
L
 
L
V
 
A
A
 
V
A
 
L
D
 
D
F
 
Y
V
 
L
K
 
K
T
 
K
S
 
N
P
 
P
-
 
N
-
 
A
-
 
G
-
 
V
E
 
K
F
 
I
V
 
V
A
 
W
S
 
S
G
 
A
Q
 
P
P
 
A
F
 
D
A
 
E
A
 
K
Q
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
G
V
 
L
A
 
I
M
 
V
Q
 
N
K
 
K
-
 
G
-
 
N
D
 
D
P
 
E
A
 
A
L
 
V
K
 
-
V
 
A
V
 
K
I
 
F
N
 
S
Q
 
T
A
 
A
I
 
I
N
 
N
A
 
E
L
 
L
R
 
K
A
 
A
N
 
D
G
 
G
K
 
T
L
 
L
A
 
K
A
 
K
I
 
L
S
 
G
Q
 
E
Q
 
Q
W
 
F
F
 
F
G
 
G
M
 
K
D
 
D
V
 
I
T
 
S

6svfA Crystal structure of the p235gk mutant of argbp from t. Maritima (see paper)
36% identity, 86% coverage: 33:256/261 of query aligns to 4:228/229 of 6svfA

query
sites
6svfA
D
 
D
R
 
E
I
 
I
K
 
K
A
 
S
S
 
R
G
 
G
K
 
Y
L
 
L
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
S
G
 
A
T
 
D
Y
x
F
P
 
P
P
 
P
F
 
F
N
 
E
F
 
F
Q
 
V
D
 
D
K
 
E
S
 
N
G
 
G
Q
 
N
L
 
I
A
 
V
G
 
G
F
 
F
E
 
D
V
 
V
D
 
D
F
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
R
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
K
 
E
A
 
L
E
 
K
F
 
I
S
 
V
P
 
D
A
 
M
P
 
T
F
|
F
A
 
D
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
P
S
 
S
L
 
L
E
 
L
S
 
T
G
 
K
R
 
K
I
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
I
I
 
I
N
x
S
Q
x
G
I
x
M
T
|
T
I
 
I
T
 
T
P
 
E
D
 
E
R
|
R
Q
 
K
A
 
K
K
 
V
Y
 
V
D
 
A
F
 
F
S
 
S
E
 
D
P
 
P
Y
 
Y
T
 
F
V
 
D
S
 
A
G
 
G
I
 
Q
Q
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
V
L
 
R
K
 
K
G
 
D
K
 
S
P
 
D
-
 
F
A
 
R
P
 
P
T
 
K
G
 
T
P
 
Y
E
 
E
G
 
D
L
 
L
T
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
T
V
 
V
G
 
A
V
 
V
G
x
Q
L
 
I
G
 
G
T
|
T
N
x
T
Y
 
G
E
 
D
Q
 
I
W
 
E
L
 
V
R
 
S
A
 
K
N
 
Y
V
 
D
P
 
G
T
 
I
A
 
K
D
 
V
V
 
V
R
 
R
T
 
-
Y
 
F
D
 
D
D
 
K
D
 
F
P
 
T
T
 
D
K
 
A
Y
 
F
Q
 
L
D
 
E
L
 
L
R
 
K
A
 
R
G
 
G
R
 
R
I
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
V
N
 
L
D
|
D
R
 
S
L
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
R
D
 
A
F
 
F
V
 
V
K
 
A
T
 
K
S
 
N
P
 
P
E
 
D
F
 
L
V
 
V
A
 
I
S
 
S
G
 
S
Q
 
G
P
 
V
F
 
L
A
 
S
A
 
S
Q
 
E
G
 
Q
S
 
Y
G
 
G
V
 
I
A
 
A
M
 
V
Q
 
R
K
 
K
-
 
E
D
 
D
P
 
T
A
 
D
L
 
L
K
 
L
V
 
E
V
 
F
I
 
I
N
 
N
Q
 
S
A
 
V
I
 
L
N
 
R
A
 
E
L
 
L
R
 
K
A
 
K
N
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
Y
A
 
D
A
 
V
I
 
L
S
 
I
Q
 
E
Q
 
K
W
 
W
F
 
F
G
 
S

5owfA Structure of a lao-binding protein mutant with glutamine (see paper)
32% identity, 84% coverage: 41:259/261 of query aligns to 3:232/235 of 5owfA

query
sites
5owfA
L
 
V
R
 
R
V
 
I
G
 
G
L
 
T
E
 
D
G
 
T
T
 
T
Y
|
Y
P
 
A
P
 
P
F
 
F
N
 
S
F
 
S
Q
 
K
D
 
D
K
 
A
S
 
K
G
 
G
Q
 
E
L
 
F
A
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
D
V
 
I
D
 
D
F
 
L
A
 
G
K
 
N
A
 
E
L
 
M
A
 
C
E
 
K
Q
 
R
L
 
M
G
 
Q
V
 
V
K
 
K
A
 
C
E
 
T
F
 
W
S
 
V
P
 
A
A
 
S
P
 
D
F
|
F
A
 
D
G
 
A
L
 
L
L
 
I
G
 
P
S
 
S
L
 
L
E
 
K
S
 
A
G
 
K
R
 
K
I
 
I
D
 
D
V
 
A
V
 
I
I
 
I
N
x
S
Q
x
S
I
 
L
T
x
S
I
 
I
T
 
T
P
 
D
D
 
K
R
|
R
Q
 
Q
A
 
Q
K
 
E
Y
 
I
D
 
A
F
 
F
S
 
S
E
 
D
P
 
K
Y
 
L
T
 
Y
V
 
A
S
 
A
G
 
D
I
 
S
Q
 
R
I
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
S
P
 
P
A
 
I
P
 
Q
T
 
P
G
 
T
P
 
L
E
 
E
G
 
S
L
 
L
T
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
H
V
 
V
G
 
G
V
 
V
G
x
K
L
 
Q
G
 
G
T
x
S
N
x
T
Y
 
Q
E
 
E
Q
 
A
W
 
Y
L
 
A
R
 
N
A
 
D
N
 
N
V
 
W
P
 
R
T
 
T
-
 
K
-
 
G
A
 
V
D
 
D
V
 
V
R
 
V
T
 
A
Y
 
Y
D
 
A
D
 
N
D
 
Q
P
 
D
T
 
L
K
 
I
Y
 
Y
Q
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
T
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
A
L
 
L
N
 
Q
D
|
D
R
 
E
L
 
V
V
 
A
A
 
A
A
 
S
D
 
E
-
 
G
F
 
F
V
 
L
K
 
K
-
 
Q
-
 
P
T
 
A
S
 
G
P
 
K
E
 
E
F
 
Y
V
 
A
A
 
F
S
 
A
G
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
V
-
 
K
-
 
D
Q
 
K
P
 
K
F
 
Y
A
 
F
A
 
G
Q
 
D
G
 
G
S
 
T
G
 
G
V
 
V
A
 
G
M
 
L
Q
 
R
K
 
K
D
 
D
P
 
D
A
 
T
-
 
E
L
 
L
K
 
K
V
 
A
V
 
A
I
 
F
N
 
D
Q
 
K
A
 
A
I
 
L
N
 
T
A
 
E
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
N
 
D
G
 
G
K
 
T
L
 
Y
A
 
D
A
 
K
I
 
M
S
 
A
Q
 
K
Q
 
K
W
 
Y
F
 
F
G
 
D
M
 
F
D
 
N
V
 
V

P02911 Lysine/arginine/ornithine-binding periplasmic protein; LAO-binding protein from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see 4 papers)
32% identity, 84% coverage: 41:259/261 of query aligns to 28:257/260 of P02911

query
sites
P02911
L
 
V
R
 
R
V
 
I
G
 
G
L
 
T
E
x
D
G
 
T
T
 
T
Y
|
Y
P
 
A
P
 
P
F
 
F
N
 
S
F
 
S
Q
 
K
D
 
D
K
 
A
S
 
K
G
 
G
Q
 
E
L
 
F
A
 
I
G
 
G
F
 
F
E
x
D
V
 
I
D
 
D
F
 
L
A
 
G
K
 
N
A
 
E
L
 
M
A
x
C
E
 
K
Q
 
R
L
 
M
G
 
Q
V
 
V
K
 
K
A
x
C
E
 
T
F
 
W
S
 
V
P
 
A
A
 
S
P
 
D
F
|
F
A
 
D
G
 
A
L
 
L
L
 
I
G
 
P
S
 
S
L
 
L
E
 
K
S
 
A
G
 
K
R
 
K
I
 
I
D
 
D
V
 
A
V
 
I
I
 
I
N
x
S
Q
x
S
I
 
L
T
x
S
I
 
I
T
 
T
P
 
D
D
 
K
R
|
R
Q
 
Q
A
 
Q
K
 
E
Y
 
I
D
 
A
F
 
F
S
 
S
E
 
D
P
 
K
Y
 
L
T
 
Y
V
 
A
S
 
A
G
 
D
I
 
S
Q
 
R
I
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
S
P
 
P
A
 
I
P
 
Q
T
 
P
G
 
T
P
 
L
E
 
E
G
 
S
L
 
L
T
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
H
V
 
V
G
 
G
V
 
V
G
x
L
L
 
Q
G
 
G
T
 
S
N
x
T
Y
 
Q
E
 
E
Q
 
A
W
 
Y
L
 
A
R
 
N
A
 
D
N
 
N
V
 
W
P
 
R
T
 
T
-
 
K
-
 
G
A
 
V
D
 
D
V
 
V
R
 
V
T
 
A
Y
 
Y
D
 
A
D
 
N
D
 
Q
P
 
D
T
 
L
K
 
I
Y
 
Y
Q
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
T
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
A
L
 
L
N
 
Q
D
|
D
R
 
E
L
 
V
V
 
A
A
 
A
A
 
S
D
 
E
-
 
G
F
 
F
V
 
L
K
 
K
-
 
Q
-
 
P
T
 
A
S
 
G
P
 
K
E
 
E
F
 
Y
V
 
A
A
 
F
S
 
A
G
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
V
-
 
K
-
 
D
Q
 
K
P
 
K
F
 
Y
A
 
F
A
 
G
Q
 
D
G
 
G
S
 
T
G
 
G
V
 
V
A
 
G
M
 
L
Q
 
R
K
 
K
D
 
D
P
 
D
A
 
T
-
 
E
L
 
L
K
 
K
V
 
A
V
 
A
I
 
F
N
 
D
Q
 
K
A
 
A
I
 
L
N
 
T
A
 
E
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
N
 
D
G
 
G
K
 
T
L
 
Y
A
 
D
A
 
K
I
 
M
S
 
A
Q
 
K
Q
 
K
W
 
Y
F
 
F
G
 
D
M
 
F
D
 
N
V
 
V

1lstA Three-dimensional structures of the periplasmic lysine-, arginine-, ornithine-binding protein with and without a ligand (see paper)
32% identity, 84% coverage: 41:259/261 of query aligns to 6:235/238 of 1lstA

query
sites
1lstA
L
 
V
R
 
R
V
 
I
G
 
G
L
 
T
E
 
D
G
 
T
T
 
T
Y
|
Y
P
 
A
P
 
P
F
 
F
N
 
S
F
 
S
Q
 
K
D
 
D
K
 
A
S
 
K
G
 
G
Q
 
E
L
 
F
A
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
D
V
 
I
D
 
D
F
 
L
A
 
G
K
 
N
A
 
E
L
 
M
A
 
C
E
 
K
Q
 
R
L
 
M
G
 
Q
V
 
V
K
 
K
A
 
C
E
 
T
F
 
W
S
 
V
P
 
A
A
 
S
P
 
D
F
|
F
A
 
D
G
 
A
L
 
L
L
 
I
G
 
P
S
 
S
L
 
L
E
 
K
S
 
A
G
 
K
R
 
K
I
 
I
D
 
D
V
 
A
V
 
I
I
 
I
N
 
S
Q
x
S
I
 
L
T
x
S
I
 
I
T
 
T
P
 
D
D
 
K
R
|
R
Q
 
Q
A
 
Q
K
 
E
Y
 
I
D
 
A
F
 
F
S
 
S
E
 
D
P
 
K
Y
 
L
T
 
Y
V
 
A
S
 
A
G
 
D
I
 
S
Q
 
R
I
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
S
P
 
P
A
 
I
P
 
Q
T
 
P
G
 
T
P
 
L
E
 
E
G
 
S
L
 
L
T
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
H
V
 
V
G
 
G
V
 
V
G
x
L
L
 
Q
G
 
G
T
x
S
N
x
T
Y
x
Q
E
 
E
Q
 
A
W
 
Y
L
 
A
R
 
N
A
 
D
N
 
N
V
 
W
P
 
R
T
 
T
-
 
K
-
 
G
A
 
V
D
 
D
V
 
V
R
 
V
T
 
A
Y
 
Y
D
 
A
D
 
N
D
 
Q
P
 
D
T
 
L
K
 
I
Y
 
Y
Q
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
T
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
A
L
 
L
N
 
Q
D
|
D
R
 
E
L
 
V
V
 
A
A
 
A
A
 
S
D
 
E
-
 
G
F
 
F
V
 
L
K
 
K
-
 
Q
-
 
P
T
 
A
S
 
G
P
 
K
E
 
E
F
 
Y
V
 
A
A
 
F
S
 
A
G
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
V
-
 
K
-
 
D
Q
 
K
P
 
K
F
 
Y
A
 
F
A
 
G
Q
 
D
G
 
G
S
 
T
G
 
G
V
 
V
A
 
G
M
 
L
Q
 
R
K
 
K
D
 
D
P
 
D
A
 
T
-
 
E
L
 
L
K
 
K
V
 
A
V
 
A
I
 
F
N
 
D
Q
 
K
A
 
A
I
 
L
N
 
T
A
 
E
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
N
 
D
G
 
G
K
 
T
L
 
Y
A
 
D
A
 
K
I
 
M
S
 
A
Q
 
K
Q
 
K
W
 
Y
F
 
F
G
 
D
M
 
F
D
 
N
V
 
V

1lahE Structural bases for multiple ligand specificity of the periplasmic lysine-, arginine-, ornithine-binding protein (see paper)
32% identity, 84% coverage: 41:259/261 of query aligns to 6:235/238 of 1lahE

query
sites
1lahE
L
 
V
R
 
R
V
 
I
G
 
G
L
 
T
E
 
D
G
 
T
T
 
T
Y
|
Y
P
 
A
P
 
P
F
 
F
N
 
S
F
 
S
Q
 
K
D
 
D
K
 
A
S
 
K
G
 
G
Q
 
E
L
 
F
A
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
D
V
 
I
D
 
D
F
 
L
A
 
G
K
 
N
A
 
E
L
 
M
A
 
C
E
 
K
Q
 
R
L
 
M
G
 
Q
V
 
V
K
 
K
A
 
C
E
 
T
F
 
W
S
 
V
P
 
A
A
 
S
P
 
D
F
|
F
A
 
D
G
 
A
L
 
L
L
 
I
G
 
P
S
 
S
L
 
L
E
 
K
S
 
A
G
 
K
R
 
K
I
 
I
D
 
D
V
 
A
V
 
I
I
 
I
N
 
S
Q
x
S
I
 
L
T
x
S
I
 
I
T
 
T
P
 
D
D
 
K
R
|
R
Q
 
Q
A
 
Q
K
 
E
Y
 
I
D
 
A
F
 
F
S
 
S
E
 
D
P
 
K
Y
 
L
T
 
Y
V
 
A
S
 
A
G
 
D
I
 
S
Q
 
R
I
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
S
P
 
P
A
 
I
P
 
Q
T
 
P
G
 
T
P
 
L
E
 
E
G
 
S
L
 
L
T
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
H
V
 
V
G
 
G
V
 
V
G
 
L
L
 
Q
G
 
G
T
x
S
N
 
T
Y
x
Q
E
 
E
Q
 
A
W
 
Y
L
 
A
R
 
N
A
 
D
N
 
N
V
 
W
P
 
R
T
 
T
-
 
K
-
 
G
A
 
V
D
 
D
V
 
V
R
 
V
T
 
A
Y
 
Y
D
 
A
D
 
N
D
 
Q
P
 
D
T
 
L
K
 
I
Y
 
Y
Q
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
T
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
A
L
 
L
N
 
Q
D
|
D
R
 
E
L
 
V
V
 
A
A
 
A
A
 
S
D
 
E
-
 
G
F
 
F
V
 
L
K
 
K
-
 
Q
-
 
P
T
 
A
S
 
G
P
 
K
E
 
E
F
 
Y
V
 
A
A
 
F
S
 
A
G
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
V
-
 
K
-
 
D
Q
 
K
P
 
K
F
 
Y
A
 
F
A
 
G
Q
 
D
G
 
G
S
 
T
G
 
G
V
 
V
A
 
G
M
 
L
Q
 
R
K
 
K
D
 
D
P
 
D
A
 
T
-
 
E
L
 
L
K
 
K
V
 
A
V
 
A
I
 
F
N
 
D
Q
 
K
A
 
A
I
 
L
N
 
T
A
 
E
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
N
 
D
G
 
G
K
 
T
L
 
Y
A
 
D
A
 
K
I
 
M
S
 
A
Q
 
K
Q
 
K
W
 
Y
F
 
F
G
 
D
M
 
F
D
 
N
V
 
V

1lagE Structural bases for multiple ligand specificity of the periplasmic lysine-, arginine-, ornithine-binding protein (see paper)
32% identity, 84% coverage: 41:259/261 of query aligns to 6:235/238 of 1lagE

query
sites
1lagE
L
 
V
R
 
R
V
 
I
G
 
G
L
 
T
E
 
D
G
 
T
T
 
T
Y
|
Y
P
 
A
P
 
P
F
 
F
N
 
S
F
 
S
Q
 
K
D
 
D
K
 
A
S
 
K
G
 
G
Q
 
E
L
 
F
A
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
D
V
 
I
D
 
D
F
 
L
A
 
G
K
 
N
A
 
E
L
 
M
A
 
C
E
 
K
Q
 
R
L
 
M
G
 
Q
V
 
V
K
 
K
A
 
C
E
 
T
F
 
W
S
 
V
P
 
A
A
 
S
P
 
D
F
|
F
A
 
D
G
 
A
L
 
L
L
 
I
G
 
P
S
 
S
L
 
L
E
 
K
S
 
A
G
 
K
R
 
K
I
 
I
D
 
D
V
 
A
V
 
I
I
 
I
N
x
S
Q
x
S
I
x
L
T
x
S
I
 
I
T
 
T
P
 
D
D
 
K
R
|
R
Q
 
Q
A
 
Q
K
 
E
Y
 
I
D
 
A
F
 
F
S
 
S
E
 
D
P
 
K
Y
 
L
T
 
Y
V
 
A
S
 
A
G
 
D
I
 
S
Q
 
R
I
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
S
P
 
P
A
 
I
P
 
Q
T
 
P
G
 
T
P
 
L
E
 
E
G
 
S
L
 
L
T
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
H
V
 
V
G
 
G
V
 
V
G
x
L
L
 
Q
G
 
G
T
x
S
N
 
T
Y
x
Q
E
 
E
Q
 
A
W
 
Y
L
 
A
R
 
N
A
 
D
N
 
N
V
 
W
P
 
R
T
 
T
-
 
K
-
 
G
A
 
V
D
 
D
V
 
V
R
 
V
T
 
A
Y
 
Y
D
 
A
D
 
N
D
 
Q
P
 
D
T
 
L
K
 
I
Y
 
Y
Q
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
T
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
A
L
 
L
N
 
Q
D
|
D
R
 
E
L
 
V
V
 
A
A
 
A
A
 
S
D
 
E
-
 
G
F
 
F
V
 
L
K
 
K
-
 
Q
-
 
P
T
 
A
S
 
G
P
 
K
E
 
E
F
 
Y
V
 
A
A
 
F
S
 
A
G
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
V
-
 
K
-
 
D
Q
 
K
P
 
K
F
 
Y
A
 
F
A
 
G
Q
 
D
G
 
G
S
 
T
G
 
G
V
 
V
A
 
G
M
 
L
Q
 
R
K
 
K
D
 
D
P
 
D
A
 
T
-
 
E
L
 
L
K
 
K
V
 
A
V
 
A
I
 
F
N
 
D
Q
 
K
A
 
A
I
 
L
N
 
T
A
 
E
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
N
 
D
G
 
G
K
 
T
L
 
Y
A
 
D
A
 
K
I
 
M
S
 
A
Q
 
K
Q
 
K
W
 
Y
F
 
F
G
 
D
M
 
F
D
 
N
V
 
V

1lafE Structural bases for multiple ligand specificity of the periplasmic lysine-, arginine-, ornithine-binding protein (see paper)
32% identity, 84% coverage: 41:259/261 of query aligns to 6:235/238 of 1lafE

query
sites
1lafE
L
 
V
R
 
R
V
 
I
G
 
G
L
 
T
E
x
D
G
 
T
T
 
T
Y
|
Y
P
 
A
P
 
P
F
 
F
N
 
S
F
 
S
Q
 
K
D
 
D
K
 
A
S
 
K
G
 
G
Q
 
E
L
 
F
A
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
D
V
 
I
D
 
D
F
 
L
A
 
G
K
 
N
A
 
E
L
 
M
A
 
C
E
 
K
Q
 
R
L
 
M
G
 
Q
V
 
V
K
 
K
A
 
C
E
 
T
F
 
W
S
 
V
P
 
A
A
 
S
P
 
D
F
|
F
A
 
D
G
 
A
L
 
L
L
 
I
G
 
P
S
 
S
L
 
L
E
 
K
S
 
A
G
 
K
R
 
K
I
 
I
D
 
D
V
 
A
V
 
I
I
 
I
N
x
S
Q
x
S
I
 
L
T
x
S
I
 
I
T
 
T
P
 
D
D
 
K
R
|
R
Q
 
Q
A
 
Q
K
 
E
Y
 
I
D
 
A
F
 
F
S
 
S
E
 
D
P
 
K
Y
 
L
T
 
Y
V
 
A
S
 
A
G
 
D
I
 
S
Q
 
R
I
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
S
P
 
P
A
 
I
P
 
Q
T
 
P
G
 
T
P
 
L
E
 
E
G
 
S
L
 
L
T
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
H
V
 
V
G
 
G
V
 
V
G
x
L
L
 
Q
G
 
G
T
x
S
N
x
T
Y
x
Q
E
 
E
Q
 
A
W
 
Y
L
 
A
R
 
N
A
 
D
N
 
N
V
 
W
P
 
R
T
 
T
-
 
K
-
 
G
A
 
V
D
 
D
V
 
V
R
 
V
T
 
A
Y
 
Y
D
 
A
D
 
N
D
 
Q
P
 
D
T
 
L
K
 
I
Y
 
Y
Q
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
T
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
A
L
 
L
N
 
Q
D
|
D
R
 
E
L
 
V
V
 
A
A
 
A
A
 
S
D
 
E
-
 
G
F
 
F
V
 
L
K
 
K
-
 
Q
-
 
P
T
 
A
S
 
G
P
 
K
E
 
E
F
 
Y
V
 
A
A
 
F
S
 
A
G
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
V
-
 
K
-
 
D
Q
 
K
P
 
K
F
 
Y
A
 
F
A
 
G
Q
 
D
G
 
G
S
 
T
G
 
G
V
 
V
A
 
G
M
 
L
Q
 
R
K
 
K
D
 
D
P
 
D
A
 
T
-
 
E
L
 
L
K
 
K
V
 
A
V
 
A
I
 
F
N
 
D
Q
 
K
A
 
A
I
 
L
N
 
T
A
 
E
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
N
 
D
G
 
G
K
 
T
L
 
Y
A
 
D
A
 
K
I
 
M
S
 
A
Q
 
K
Q
 
K
W
 
Y
F
 
F
G
 
D
M
 
F
D
 
N
V
 
V

8eyzA Engineered glutamine binding protein bound to gln and a cobaloxime ligand (see paper)
33% identity, 85% coverage: 37:258/261 of query aligns to 1:224/226 of 8eyzA

query
sites
8eyzA
A
 
A
S
 
D
G
 
K
K
 
K
L
 
L
R
 
V
V
 
V
G
 
A
L
 
T
E
x
D
G
 
T
T
 
A
Y
x
F
P
 
V
P
 
P
F
 
F
N
 
E
F
 
F
Q
 
-
D
 
-
K
 
K
S
 
Q
G
 
G
Q
 
D
L
 
I
-
 
Y
A
 
V
G
 
G
F
 
F
E
 
D
V
 
V
D
 
D
F
 
L
A
 
W
K
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
K
Q
 
E
L
 
L
G
 
K
V
 
L
K
 
D
A
 
Y
E
 
E
F
 
L
S
 
K
P
 
P
A
 
M
P
 
D
F
|
F
A
 
S
G
 
G
L
 
I
L
 
I
G
 
P
S
 
A
L
 
L
E
 
Q
S
 
T
G
 
K
R
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
V
 
A
I
 
L
N
x
A
Q
x
G
I
 
I
T
|
T
I
 
I
T
x
C
P
 
D
D
 
E
R
|
R
Q
 
K
A
 
K
K
 
A
Y
 
I
D
 
D
F
 
F
S
 
S
E
 
D
P
 
G
Y
 
Y
T
 
Y
V
 
K
S
 
S
G
 
G
I
 
L
Q
 
L
I
 
V
I
 
M
A
 
V
L
 
K
K
 
A
G
 
N
K
 
N
P
 
N
A
 
D
P
 
V
T
 
K
G
 
S
P
 
V
E
 
K
G
 
D
L
 
L
T
 
D
G
 
G
K
 
K
K
 
V
V
 
V
G
 
A
V
 
V
G
 
K
L
 
S
G
 
G
T
 
T
N
x
G
Y
 
S
E
 
V
Q
x
D
W
 
Y
L
 
A
R
 
K
A
 
A
N
 
N
V
 
I
P
 
K
T
 
T
A
 
K
D
 
D
V
 
L
R
 
R
T
 
Q
Y
 
F
D
 
P
D
 
N
D
 
I
P
 
D
T
 
N
K
 
A
Y
 
Y
Q
 
M
D
 
E
L
 
L
R
 
G
A
 
T
G
 
N
R
 
R
I
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
L
N
 
H
D
|
D
R
 
T
L
 
P
V
 
N
A
 
I
A
 
L
D
 
Y
F
 
F
V
 
I
K
 
K
T
 
T
-
 
A
-
 
G
S
 
N
P
 
G
E
 
Q
F
 
F
V
 
K
A
 
A
S
 
V
G
 
G
Q
 
D
P
 
S
F
 
L
A
 
E
A
 
A
Q
 
Q
G
 
Q
S
 
Y
G
 
G
V
 
I
A
 
A
M
 
F
Q
 
P
K
 
K
-
 
G
D
 
S
P
 
D
A
 
E
L
 
L
K
 
R
V
 
D
V
 
K
I
 
V
N
 
N
Q
 
G
A
 
A
I
 
L
N
 
K
A
 
T
L
 
L
R
 
R
A
 
E
N
 
N
G
 
G
K
 
T
L
 
Y
A
 
N
A
 
E
I
 
I
S
 
Y
Q
 
K
Q
 
K
W
 
W
F
 
F
G
 
G
M
 
T
D
 
E

5otaA Structure of the periplasmic binding protein (pbp) noct from agrobacterium tumefaciens c58 in complex with octopinic acid (see paper)
29% identity, 84% coverage: 41:260/261 of query aligns to 4:253/254 of 5otaA

query
sites
5otaA
L
 
I
R
 
T
V
 
I
G
 
A
L
 
T
E
|
E
G
 
G
T
 
S
Y
|
Y
P
 
A
P
 
P
F
 
Y
N
 
N
F
 
F
Q
 
K
D
 
D
K
 
A
S
 
G
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
A
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
D
V
 
I
D
 
D
F
 
L
A
 
G
K
 
N
A
 
D
L
 
L
A
 
C
E
 
K
Q
 
R
L
 
M
G
 
N
V
 
I
K
 
E
A
 
C
E
 
K
F
 
F
S
 
V
P
 
E
A
 
Q
P
 
A
F
x
W
A
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
I
G
 
P
S
 
S
L
 
L
E
 
T
S
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
Y
D
 
D
V
 
A
V
 
I
I
 
M
N
 
A
Q
x
A
I
 
M
T
x
G
I
 
I
T
 
Q
P
 
P
D
 
A
R
|
R
Q
 
E
A
 
K
K
 
V
Y
 
I
D
 
A
F
 
F
S
 
S
E
 
R
P
 
P
Y
 
Y
T
 
L
V
 
L
S
 
T
G
 
P
I
x
M
Q
 
T
I
 
F
I
 
L
A
 
T
L
 
T
K
 
A
G
 
D
K
 
S
P
 
P
A
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
T
-
 
Q
-
 
V
-
 
A
-
 
I
-
 
E
-
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
D
P
 
N
T
 
I
G
 
T
P
 
P
E
 
E
G
 
Q
-
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
D
-
 
K
-
 
F
-
 
T
-
 
K
-
 
I
L
 
F
T
 
E
G
 
G
K
 
V
K
 
K
V
 
F
G
 
G
V
 
V
G
x
Q
L
 
A
G
 
G
T
|
T
N
x
S
Y
x
H
E
 
E
Q
 
A
W
 
F
L
 
M
R
 
K
A
 
Q
N
 
M
V
 
M
P
 
P
T
 
S
A
 
V
D
 
Q
V
 
I
R
 
S
T
 
T
Y
 
Y
D
 
D
D
 
T
D
 
I
P
 
D
T
 
N
K
 
V
Y
 
V
Q
 
M
D
 
D
L
 
L
R
 
K
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
S
-
 
L
-
 
A
-
x
S
-
 
V
-
 
S
-
 
F
-
 
L
-
 
K
-
 
P
L
 
L
N
 
T
D
 
D
R
 
K
L
 
P
V
 
D
A
 
N
A
 
K
D
 
D
F
 
L
V
 
K
K
 
M
T
 
F
S
 
G
P
 
P
E
 
R
F
 
M
V
 
-
A
 
-
S
 
T
G
 
G
Q
 
G
P
 
L
F
 
F
A
 
-
A
 
G
Q
 
K
G
 
G
S
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
G
M
 
I
Q
 
R
K
 
K
D
 
E
P
 
D
A
 
A
-
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
A
V
 
L
I
 
F
N
 
D
Q
 
K
A
 
A
I
 
I
N
 
D
A
 
A
L
 
A
R
 
I
A
 
A
N
 
D
G
 
G
K
 
T
L
 
V
A
 
Q
A
 
K
I
 
L
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
W
 
W
F
 
F
G
 
G
M
 
Y
D
 
D
V
 
A
T
 
S

5ot9A Structure of the periplasmic binding protein (pbp) noct from a.Tumefaciens c58 in complex with histopine. (see paper)
29% identity, 84% coverage: 41:260/261 of query aligns to 4:253/254 of 5ot9A

query
sites
5ot9A
L
 
I
R
 
T
V
 
I
G
 
A
L
 
T
E
|
E
G
 
G
T
 
S
Y
|
Y
P
 
A
P
 
P
F
 
Y
N
 
N
F
 
F
Q
 
K
D
 
D
K
 
A
S
 
G
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
A
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
D
V
 
I
D
 
D
F
 
L
A
 
G
K
 
N
A
 
D
L
 
L
A
 
C
E
 
K
Q
 
R
L
 
M
G
 
N
V
 
I
K
 
E
A
 
C
E
 
K
F
 
F
S
 
V
P
 
E
A
 
Q
P
 
A
F
x
W
A
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
I
G
 
P
S
 
S
L
 
L
E
 
T
S
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
Y
D
 
D
V
 
A
V
 
I
I
 
M
N
x
A
Q
x
A
I
 
M
T
 
G
I
 
I
T
 
Q
P
 
P
D
 
A
R
|
R
Q
 
E
A
 
K
K
 
V
Y
 
I
D
 
A
F
 
F
S
 
S
E
 
R
P
 
P
Y
 
Y
T
 
L
V
 
L
S
 
T
G
 
P
I
x
M
Q
 
T
I
 
F
I
 
L
A
 
T
L
 
T
K
 
A
G
 
D
K
 
S
P
 
P
A
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
T
-
 
Q
-
 
V
-
 
A
-
 
I
-
 
E
-
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
D
P
 
N
T
 
I
G
 
T
P
 
P
E
 
E
G
 
Q
-
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
D
-
 
K
-
 
F
-
 
T
-
 
K
-
 
I
L
 
F
T
 
E
G
 
G
K
 
V
K
 
K
V
 
F
G
 
G
V
 
V
G
x
Q
L
 
A
G
 
G
T
|
T
N
x
S
Y
x
H
E
 
E
Q
 
A
W
 
F
L
 
M
R
 
K
A
 
Q
N
 
M
V
 
M
P
 
P
T
 
S
A
 
V
D
 
Q
V
 
I
R
 
S
T
 
T
Y
 
Y
D
 
D
D
 
T
D
 
I
P
 
D
T
 
N
K
 
V
Y
 
V
Q
 
M
D
 
D
L
 
L
R
 
K
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
S
-
 
L
-
 
A
-
x
S
-
 
V
-
 
S
-
 
F
-
 
L
-
 
K
-
 
P
L
 
L
N
 
T
D
 
D
R
 
K
L
 
P
V
 
D
A
 
N
A
 
K
D
 
D
F
 
L
V
 
K
K
 
M
T
 
F
S
 
G
P
 
P
E
 
R
F
 
M
V
 
-
A
 
-
S
 
T
G
 
G
Q
 
G
P
 
L
F
 
F
A
 
-
A
 
G
Q
 
K
G
 
G
S
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
G
M
 
I
Q
 
R
K
 
K
D
 
E
P
 
D
A
 
A
-
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
A
V
 
L
I
 
F
N
 
D
Q
 
K
A
 
A
I
 
I
N
 
D
A
 
A
L
 
A
R
 
I
A
 
A
N
 
D
G
 
G
K
 
T
L
 
V
A
 
Q
A
 
K
I
 
L
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
W
 
W
F
 
F
G
 
G
M
 
Y
D
 
D
V
 
A
T
 
S

4powA Structure of the pbp noct in complex with pyronopaline (see paper)
29% identity, 84% coverage: 41:260/261 of query aligns to 4:253/254 of 4powA

query
sites
4powA
L
 
I
R
 
T
V
 
I
G
 
A
L
 
T
E
|
E
G
 
G
T
 
S
Y
|
Y
P
 
A
P
 
P
F
 
Y
N
 
N
F
 
F
Q
 
K
D
 
D
K
 
A
S
 
G
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
A
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
D
V
 
I
D
 
D
F
 
L
A
 
G
K
 
N
A
 
D
L
 
L
A
 
C
E
 
K
Q
 
R
L
 
M
G
 
N
V
 
I
K
 
E
A
 
C
E
 
K
F
 
F
S
 
V
P
 
E
A
 
Q
P
 
A
F
x
W
A
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
I
G
 
P
S
 
S
L
 
L
E
 
T
S
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
Y
D
 
D
V
 
A
V
 
I
I
 
M
N
x
A
Q
x
A
I
 
M
T
x
G
I
 
I
T
 
Q
P
 
P
D
 
A
R
|
R
Q
 
E
A
 
K
K
 
V
Y
 
I
D
 
A
F
 
F
S
 
S
E
 
R
P
 
P
Y
 
Y
T
 
L
V
 
L
S
 
T
G
 
P
I
x
M
Q
 
T
I
 
F
I
 
L
A
 
T
L
 
T
K
 
A
G
 
D
K
 
S
P
 
P
A
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
T
-
 
Q
-
 
V
-
 
A
-
 
I
-
 
E
-
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
D
P
 
N
T
 
I
G
 
T
P
 
P
E
 
E
G
 
Q
-
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
D
-
 
K
-
 
F
-
 
T
-
 
K
-
 
I
L
 
F
T
 
E
G
 
G
K
 
V
K
 
K
V
 
F
G
 
G
V
 
V
G
x
Q
L
 
A
G
 
G
T
|
T
N
x
S
Y
x
H
E
 
E
Q
 
A
W
 
F
L
 
M
R
 
K
A
 
Q
N
 
M
V
 
M
P
 
P
T
 
S
A
 
V
D
 
Q
V
 
I
R
 
S
T
 
T
Y
 
Y
D
 
D
D
 
T
D
 
I
P
 
D
T
 
N
K
 
V
Y
 
V
Q
 
M
D
 
D
L
 
L
R
 
K
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
S
-
 
L
-
 
A
-
x
S
-
 
V
-
 
S
-
 
F
-
 
L
-
 
K
-
 
P
L
 
L
N
 
T
D
 
D
R
 
K
L
 
P
V
 
D
A
 
N
A
 
K
D
 
D
F
 
L
V
 
K
K
 
M
T
 
F
S
 
G
P
 
P
E
 
R
F
 
M
V
 
-
A
 
-
S
 
T
G
 
G
Q
 
G
P
 
L
F
 
F
A
 
-
A
 
G
Q
 
K
G
 
G
S
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
G
M
 
I
Q
 
R
K
 
K
D
 
E
P
 
D
A
 
A
-
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
A
V
 
L
I
 
F
N
 
D
Q
 
K
A
 
A
I
 
I
N
 
D
A
 
A
L
 
A
R
 
I
A
 
A
N
 
D
G
 
G
K
 
T
L
 
V
A
 
Q
A
 
K
I
 
L
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
W
 
W
F
 
F
G
 
G
M
 
Y
D
 
D
V
 
A
T
 
S

5ovzA High resolution structure of the pbp noct in complex with nopaline (see paper)
29% identity, 84% coverage: 41:260/261 of query aligns to 5:254/259 of 5ovzA

query
sites
5ovzA
L
 
I
R
 
T
V
 
I
G
 
A
L
 
T
E
|
E
G
 
G
T
 
S
Y
|
Y
P
 
A
P
 
P
F
 
Y
N
 
N
F
 
F
Q
 
K
D
 
D
K
 
A
S
 
G
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
A
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
D
V
 
I
D
 
D
F
 
L
A
 
G
K
 
N
A
 
D
L
 
L
A
 
C
E
 
K
Q
 
R
L
 
M
G
 
N
V
 
I
K
 
E
A
 
C
E
 
K
F
 
F
S
 
V
P
 
E
A
 
Q
P
 
A
F
x
W
A
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
I
G
 
P
S
 
S
L
 
L
E
 
T
S
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
Y
D
 
D
V
 
A
V
 
I
I
 
M
N
x
A
Q
x
A
I
 
M
T
x
G
I
 
I
T
 
Q
P
 
P
D
 
A
R
|
R
Q
 
E
A
 
K
K
 
V
Y
 
I
D
 
A
F
 
F
S
 
S
E
 
R
P
 
P
Y
 
Y
T
 
L
V
 
L
S
 
T
G
 
P
I
x
M
Q
 
T
I
 
F
I
 
L
A
 
T
L
 
T
K
 
A
G
 
D
K
 
S
P
 
P
A
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
T
-
 
Q
-
 
V
-
 
A
-
 
I
-
 
E
-
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
D
P
 
N
T
 
I
G
 
T
P
 
P
E
 
E
G
 
Q
-
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
D
-
 
K
-
 
F
-
 
T
-
 
K
-
 
I
L
 
F
T
 
E
G
 
G
K
 
V
K
 
K
V
 
F
G
 
G
V
 
V
G
x
Q
L
 
A
G
 
G
T
|
T
N
x
S
Y
x
H
E
 
E
Q
 
A
W
 
F
L
 
M
R
 
K
A
 
Q
N
 
M
V
 
M
P
 
P
T
 
S
A
 
V
D
 
Q
V
 
I
R
 
S
T
 
T
Y
 
Y
D
 
D
D
 
T
D
 
I
P
 
D
T
 
N
K
 
V
Y
 
V
Q
 
M
D
 
D
L
 
L
R
 
K
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
S
-
 
L
-
 
A
-
x
S
-
 
V
-
 
S
-
 
F
-
 
L
-
 
K
-
 
P
L
 
L
N
 
T
D
 
D
R
 
K
L
 
P
V
 
D
A
 
N
A
 
K
D
 
D
F
 
L
V
 
K
K
 
M
T
 
F
S
 
G
P
 
P
E
 
R
F
 
M
V
 
-
A
 
-
S
 
T
G
 
G
Q
 
G
P
 
L
F
 
F
A
 
-
A
 
G
Q
 
K
G
 
G
S
x
V
G
 
G
V
 
V
A
 
G
M
 
I
Q
 
R
K
 
K
D
 
E
P
 
D
A
 
A
-
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
A
V
 
L
I
 
F
N
 
D
Q
 
K
A
 
A
I
 
I
N
 
D
A
 
A
L
 
A
R
 
I
A
 
A
N
 
D
G
 
G
K
 
T
L
 
V
A
 
Q
A
 
K
I
 
L
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
W
 
W
F
 
F
G
 
G
M
 
Y
D
 
D
V
 
A
T
 
S

Query Sequence

>CCNA_01508 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_01508
MRFPARRAVLSGLGLALLAACGKKPDAGASGWDRIKASGKLRVGLEGTYPPFNFQDKSGQ
LAGFEVDFAKALAEQLGVKAEFSPAPFAGLLGSLESGRIDVVINQITITPDRQAKYDFSE
PYTVSGIQIIALKGKPAPTGPEGLTGKKVGVGLGTNYEQWLRANVPTADVRTYDDDPTKY
QDLRAGRIDAVLNDRLVAADFVKTSPEFVASGQPFAAQGSGVAMQKDPALKVVINQAINA
LRANGKLAAISQQWFGMDVTQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory