SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CCNA_01799 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_01799 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P35486 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial; PDHE1-A type I; EC 1.2.4.1 from Mus musculus (Mouse) (see 2 papers)
50% identity, 93% coverage: 19:338/343 of query aligns to 52:369/390 of P35486

query
sites
P35486
V
 
V
N
 
T
A
 
T
F
 
V
V
 
L
G
 
T
K
 
R
D
 
E
E
 
D
L
 
G
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
Y
 
Y
Q
 
R
D
 
M
M
 
M
L
 
Q
L
 
T
I
 
V
R
 
R
R
 
R
F
 
M
E
 
E
E
 
L
R
 
K
A
 
A
G
 
D
Q
 
Q
L
 
L
Y
 
Y
G
 
K
M
 
Q
G
 
K
L
 
I
I
 
I
G
 
R
G
 
G
F
 
F
C
 
C
H
 
H
L
 
L
Y
 
C
I
 
D
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
C
A
 
C
V
 
V
G
 
G
M
 
L
Q
 
E
S
 
A
I
 
G
S
 
I
Q
 
N
K
 
P
G
 
T
D
 
D
Q
 
H
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
A
Y
 
Y
R
 
R
D
 
A
H
 
H
G
 
G
H
 
F
M
 
T
L
 
F
A
 
T
A
 
R
G
 
G
M
 
L
D
 
P
P
 
V
R
 
R
E
 
A
V
 
I
M
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
A
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
C
S
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
M
 
M
H
 
H
M
 
M
F
 
Y
D
 
-
I
 
-
A
 
A
T
 
K
G
 
N
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
H
 
N
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
C
S
 
K
Y
 
Y
R
 
N
N
 
G
N
 
K
G
 
D
N
 
E
V
 
V
S
 
C
Y
 
L
A
 
T
Y
 
L
M
 
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
F
E
 
E
S
 
A
F
 
Y
N
 
N
M
 
M
A
 
A
Q
 
A
L
 
L
W
 
W
K
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
C
V
 
I
Y
 
F
V
 
I
I
 
C
E
 
E
N
 
N
N
 
N
Q
 
R
Y
 
Y
A
 
G
M
 
M
G
 
G
T
 
T
A
x
S
V
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
S
 
A
E
 
S
T
 
T
A
 
D
F
 
Y
H
 
Y
K
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
-
S
 
D
F
 
F
R
 
-
I
 
I
P
 
P
G
 
G
E
 
L
E
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
I
I
 
L
A
 
C
V
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
T
A
 
K
R
 
F
A
 
A
T
 
A
E
 
A
H
 
Y
A
 
C
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
P
 
P
Y
 
I
I
 
L
L
 
M
E
 
E
M
 
L
K
 
Q
T
 
T
Y
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
R
 
H
G
 
G
H
 
H
S
|
S
M
 
M
S
 
S
D
 
D
P
 
P
-
 
G
A
 
V
K
x
S
Y
 
Y
R
 
R
T
 
T
K
 
R
E
 
E
E
 
E
V
 
I
D
 
Q
E
 
E
V
 
V
K
 
R
T
 
S
T
 
K
R
 
S
D
 
D
P
 
P
I
 
I
D
 
M
H
 
L
I
 
L
K
 
K
E
 
D
R
 
R
L
 
M
A
 
V
K
 
N
A
 
S
G
 
N
V
 
L
T
 
A
E
 
S
-
 
V
D
 
E
D
 
E
L
 
L
K
|
K
G
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
V
E
 
E
V
 
V
K
 
R
R
 
K
I
 
E
V
 
I
A
 
E
E
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
A
 
A
R
 
T
T
 
A
S
 
D
P
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
P
P
 
L
S
 
E
E
 
E
L
 
L
Y
 
G
T
 
Y
D
 
H
V
 
I
Y
 
Y

P29803 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, testis-specific form, mitochondrial; PDHE1-A type II; EC 1.2.4.1 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
51% identity, 93% coverage: 19:338/343 of query aligns to 50:367/388 of P29803

query
sites
P29803
V
 
V
N
 
T
A
 
T
F
 
V
V
 
L
G
 
T
K
 
R
D
 
A
E
 
E
L
 
G
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
Y
 
Y
Q
 
R
D
 
M
M
 
M
L
 
L
L
 
T
I
 
V
R
 
R
R
 
R
F
 
M
E
 
E
E
 
L
R
 
K
A
 
A
G
 
D
Q
 
Q
L
 
L
Y
 
Y
G
 
K
M
 
Q
G
 
K
L
 
F
I
 
I
G
 
R
G
 
G
F
 
F
C
 
C
H
 
H
L
 
L
Y
 
C
I
 
D
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
C
A
 
C
V
 
V
G
 
G
M
 
L
Q
 
E
S
 
A
I
 
G
S
 
I
Q
 
N
K
 
P
G
 
S
D
 
D
Q
 
H
I
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
S
Y
 
Y
R
 
R
D
 
A
H
 
H
G
 
G
H
 
V
M
 
C
L
 
Y
A
 
T
A
 
R
G
 
G
M
 
L
D
 
S
P
 
V
R
 
R
E
 
S
V
 
I
M
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
A
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
C
S
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
M
 
M
H
 
H
M
 
M
F
 
Y
D
 
-
I
 
-
A
 
T
T
 
K
G
 
N
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
H
 
N
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
V
 
G
A
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
C
S
 
K
Y
 
Y
R
 
K
N
 
G
N
 
N
G
 
D
N
 
E
V
 
I
S
 
C
Y
 
L
A
 
T
Y
 
L
M
 
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
A
E
 
E
S
 
A
F
 
F
N
 
N
M
 
M
A
 
A
Q
 
A
L
 
L
W
 
W
K
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
C
V
 
V
Y
 
F
V
 
I
I
 
C
E
 
E
N
 
N
N
 
N
Q
 
L
Y
 
Y
A
 
G
M
|
M
G
 
G
T
 
T
A
x
S
V
 
T
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
S
 
A
E
 
S
T
 
P
A
 
D
F
 
Y
H
 
Y
K
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
-
S
 
N
F
 
F
R
 
-
I
 
I
P
 
P
G
 
G
E
 
L
E
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
V
I
 
L
A
 
C
V
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
T
A
 
K
R
 
F
A
 
A
T
 
A
E
 
N
H
 
Y
A
 
C
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
P
 
P
Y
 
I
I
 
L
L
 
M
E
 
E
M
 
L
K
 
Q
T
 
T
Y
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
R
 
H
G
 
G
H
 
H
S
|
S
M
 
M
S
|
S
D
 
D
P
 
P
-
 
G
A
 
V
K
x
S
Y
 
Y
R
 
R
T
 
T
K
 
R
E
 
E
E
 
E
V
 
I
D
 
Q
E
 
E
V
 
V
K
 
R
T
 
S
T
 
K
R
 
R
D
 
D
P
 
P
I
 
I
D
 
I
H
 
I
I
 
L
K
 
Q
E
 
D
R
 
R
L
 
M
A
 
V
K
 
N
A
 
S
G
 
K
V
 
L
-
 
A
T
 
T
E
 
V
D
 
E
D
 
E
L
 
L
K
 
K
G
 
E
V
 
I
D
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
K
 
R
R
 
K
I
 
E
V
 
I
A
 
D
E
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
A
 
A
R
 
T
T
 
T
S
 
D
P
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
H
P
 
L
S
 
E
E
 
E
L
 
L
Y
 
G
T
 
H
D
 
H
V
 
I
Y
 
Y

P26284 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial; PDHE1-A type I; EC 1.2.4.1 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
50% identity, 93% coverage: 19:338/343 of query aligns to 52:369/390 of P26284

query
sites
P26284
V
 
V
N
 
T
A
 
T
F
 
V
V
 
L
G
 
T
K
 
R
D
 
E
E
 
D
L
 
G
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
Y
 
Y
Q
 
R
D
 
M
M
 
M
L
 
Q
L
 
T
I
 
V
R
 
R
R
 
R
F
 
M
E
 
E
E
 
L
R
 
K
A
 
A
G
 
D
Q
 
Q
L
 
L
Y
 
Y
G
 
K
M
 
Q
G
 
K
L
 
I
I
 
I
G
 
R
G
 
G
F
 
F
C
 
C
H
 
H
L
 
L
Y
 
C
I
 
D
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
C
A
 
C
V
 
V
G
 
G
M
 
L
Q
 
E
S
 
A
I
 
G
S
 
I
Q
 
N
K
 
P
G
 
T
D
 
D
Q
 
H
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
A
Y
 
Y
R
 
R
D
 
A
H
 
H
G
 
G
H
 
F
M
 
T
L
 
F
A
 
N
A
 
R
G
 
G
M
 
H
D
 
A
P
 
V
R
 
R
E
 
A
V
 
I
M
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
A
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
C
S
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
M
 
M
H
 
H
M
 
M
F
 
Y
D
 
-
I
 
-
A
 
A
T
 
K
G
 
N
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
H
 
N
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
C
S
 
K
Y
 
Y
R
 
N
N
 
G
N
 
K
G
 
D
N
 
E
V
 
V
S
 
C
Y
 
L
A
 
T
Y
 
L
M
 
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
F
E
 
E
S
 
A
F
 
Y
N
 
N
M
 
M
A
 
A
Q
 
A
L
 
L
W
 
W
K
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
C
V
 
I
Y
 
F
V
 
I
I
 
C
E
 
E
N
 
N
N
 
N
Q
 
R
Y
 
Y
A
 
G
M
 
M
G
 
G
T
 
T
A
x
S
V
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
S
 
A
E
 
S
T
 
T
A
 
D
F
 
Y
H
 
Y
K
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
-
S
 
D
F
 
F
R
 
-
I
 
I
P
 
P
G
 
G
E
 
L
E
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
I
I
 
L
A
 
C
V
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
T
A
 
K
R
 
F
A
 
A
T
 
A
E
 
A
H
 
Y
A
 
C
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
P
 
P
Y
 
I
I
 
L
L
 
M
E
 
E
M
 
L
K
 
Q
T
 
T
Y
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
R
 
H
G
 
G
H
 
H
S
|
S
M
 
M
S
 
S
D
 
D
P
 
P
-
 
G
A
 
V
K
x
S
Y
 
Y
R
 
R
T
 
T
K
 
R
E
 
E
E
 
E
V
 
I
D
 
Q
E
 
E
V
 
V
K
 
R
T
 
S
T
 
K
R
 
S
D
 
D
P
 
P
I
 
I
D
 
M
H
 
L
I
 
L
K
 
K
E
 
D
R
 
R
L
 
M
A
 
V
K
 
N
A
 
S
G
 
N
V
 
L
T
 
A
E
 
S
-
 
V
D
 
E
D
 
E
L
 
L
K
 
K
G
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
V
E
 
E
V
 
V
K
 
R
R
 
K
I
 
E
V
 
I
A
 
E
E
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
A
 
A
R
 
T
T
 
A
S
 
D
P
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
P
P
 
L
S
 
E
E
 
E
L
 
L
Y
 
G
T
 
Y
D
 
H
V
 
I
Y
 
Y

P26267 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha type I, mitochondrial; PDHA1; PDHE1-A; EC 1.2.4.1 from Ascaris suum (Pig roundworm) (Ascaris lumbricoides) (see paper)
50% identity, 93% coverage: 19:338/343 of query aligns to 48:365/396 of P26267

query
sites
P26267
V
 
I
N
 
N
A
 
V
F
 
H
V
 
V
G
 
T
K
 
K
D
 
E
E
 
D
L
 
A
L
 
V
K
 
H
F
 
Y
Y
 
Y
Q
 
T
D
 
Q
M
 
M
L
 
L
L
 
T
I
 
I
R
 
R
R
 
R
F
 
M
E
 
E
E
 
S
R
 
A
A
 
A
G
 
G
Q
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
K
M
 
E
G
 
K
L
 
K
I
 
V
G
 
R
G
 
G
F
 
F
C
 
C
H
 
H
L
 
L
Y
 
Y
I
 
S
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
C
A
 
A
V
 
V
G
 
G
M
 
T
Q
 
K
S
 
A
I
 
A
S
 
M
Q
 
D
K
 
A
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
I
 
A
I
 
V
T
 
T
G
 
A
Y
 
Y
R
 
R
D
 
C
H
 
H
G
 
G
H
 
W
M
 
T
L
 
Y
A
 
L
A
 
S
G
 
G
M
 
S
D
 
S
P
 
V
R
 
A
E
 
K
V
 
V
M
 
L
A
 
C
E
 
E
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
A
 
I
G
 
T
G
 
G
S
 
N
S
 
V
K
 
Y
G
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
M
 
M
H
 
H
M
 
M
F
 
Y
D
 
-
I
 
-
A
 
G
T
 
E
G
 
N
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
H
 
N
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
V
 
Q
A
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
I
A
 
A
L
 
F
A
 
A
N
 
M
S
 
K
Y
 
Y
R
 
R
N
 
K
N
 
E
G
 
K
N
 
N
V
 
V
S
 
C
Y
 
I
A
 
T
Y
 
M
M
 
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
T
N
 
N
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
V
 
L
Y
 
F
E
 
E
S
 
S
F
 
M
N
 
N
M
 
M
A
 
A
Q
 
K
L
 
L
W
 
W
K
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
V
 
V
I
 
C
E
 
E
N
 
N
N
 
N
Q
 
G
Y
 
Y
A
 
G
M
 
M
G
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
A
E
 
A
R
 
R
A
 
S
A
 
S
S
 
A
E
 
S
T
 
T
A
 
D
F
 
Y
H
 
Y
K
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
D
S
 
-
F
 
-
R
 
Y
I
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
I
E
 
W
V
 
V
D
 
D
G
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
V
I
 
L
A
 
A
V
 
V
R
 
R
E
 
Q
A
 
A
G
 
V
A
 
R
R
 
W
A
 
A
T
 
K
E
 
E
H
 
W
A
 
C
R
 
N
S
 
A
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
P
 
P
Y
 
L
I
 
M
L
 
I
E
 
E
M
 
M
K
 
A
T
 
T
Y
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
R
 
S
G
 
G
H
 
H
S
|
S
M
 
M
S
 
S
D
 
D
P
 
P
-
 
G
A
 
T
K
x
S
Y
 
Y
R
 
R
T
 
T
K
 
R
E
 
E
E
 
E
V
 
V
D
 
Q
E
 
E
V
 
V
K
 
R
T
 
K
T
 
T
R
 
R
D
 
D
P
 
P
I
 
I
D
 
T
H
 
G
I
 
F
K
 
K
E
 
D
R
 
K
L
 
I
A
 
V
K
 
T
A
 
A
G
 
G
-
 
L
V
 
V
T
 
T
E
 
E
D
 
D
D
 
E
L
 
I
K
 
K
G
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
K
E
 
Q
V
 
V
K
 
R
R
 
K
I
 
E
V
 
I
A
 
D
E
 
A
A
 
A
A
 
V
E
 
K
F
 
Q
A
 
A
R
 
H
T
 
T
S
 
D
P
 
K
E
 
E
P
 
S
D
 
P
P
 
V
S
 
E
E
 
L
L
 
M
Y
 
L
T
 
T
D
 
D
V
 
I
Y
 
Y

Q8H1Y0 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha-2, mitochondrial; PDHE1-A; Protein IAA-CONJUGATE-RESISTANT 4; EC 1.2.4.1 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
50% identity, 92% coverage: 26:340/343 of query aligns to 61:374/393 of Q8H1Y0

query
sites
Q8H1Y0
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
L
K
 
A
F
 
F
Y
 
F
Q
 
R
D
 
D
M
 
M
L
 
A
L
 
R
I
 
M
R
 
R
R
 
R
F
 
M
E
 
E
E
 
I
R
 
A
A
 
A
G
 
D
Q
 
S
L
 
L
Y
 
Y
G
 
K
M
 
A
G
 
K
L
 
L
I
 
I
G
 
R
G
 
G
F
 
F
C
 
C
H
 
H
L
 
L
Y
 
Y
I
 
D
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
M
 
M
Q
 
E
S
 
A
I
 
A
S
 
I
Q
 
T
K
 
K
G
 
K
D
 
D
Q
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
S
Y
 
Y
R
|
R
D
 
D
H
 
H
G
 
C
H
 
T
M
 
F
L
 
I
A
 
G
A
 
R
G
 
G
M
 
G
D
 
K
P
 
L
R
 
V
E
 
D
V
 
A
M
 
F
A
 
S
E
 
E
L
 
L
T
 
M
G
 
G
R
 
R
A
 
K
G
 
T
G
 
G
S
 
C
S
 
S
K
 
H
G
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
M
 
M
H
 
H
M
 
F
F
 
Y
D
 
K
I
 
K
A
 
D
T
 
A
G
 
S
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
H
 
H
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
V
 
I
A
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
C
G
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
F
A
 
A
N
 
Q
S
 
K
Y
 
Y
R
 
N
N
 
K
N
 
D
G
 
E
N
 
A
V
 
V
S
 
T
Y
 
F
A
 
A
Y
 
L
M
 
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
V
 
L
Y
 
F
E
 
E
S
 
A
F
 
L
N
 
N
M
 
I
A
 
S
Q
 
A
L
 
L
W
 
W
K
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
A
V
 
I
Y
 
L
V
 
V
I
 
C
E
 
E
N
 
N
N
 
N
Q
 
H
Y
 
Y
A
 
G
M
 
M
G
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
T
E
 
W
R
 
R
A
 
S
A
 
A
S
 
K
E
 
S
T
 
P
A
 
A
F
 
Y
H
 
F
K
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
D
S
 
-
F
 
-
R
 
Y
I
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
L
E
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
A
I
 
L
A
 
A
V
 
V
R
 
K
E
 
Q
A
 
A
G
 
C
A
 
K
R
 
F
A
 
A
T
 
K
E
 
E
H
 
H
A
 
A
R
 
L
S
 
K
G
 
-
Q
 
N
G
 
G
P
 
P
Y
 
I
I
 
I
L
 
L
E
 
E
M
 
M
K
 
D
T
 
T
Y
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
R
 
H
G
 
G
H
 
H
S
 
S
M
 
M
S
 
S
D
 
D
P
 
P
-
 
G
A
 
S
K
 
T
Y
 
Y
R
 
R
T
 
T
K
 
R
E
 
D
E
 
E
V
 
I
D
 
S
E
 
G
V
 
V
K
 
R
T
 
Q
T
 
V
R
 
R
D
 
D
P
 
P
I
 
I
D
 
E
H
 
R
I
 
V
K
 
R
E
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
L
K
 
T
A
 
H
G
 
D
V
 
I
-
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
K
D
 
E
L
 
L
K
 
K
G
 
D
V
 
M
D
 
E
A
 
K
E
 
E
V
 
I
K
 
R
R
 
K
I
 
E
V
 
V
A
 
D
E
 
D
A
 
A
A
 
V
E
 
A
F
 
Q
A
 
A
R
 
K
T
 
E
S
 
S
P
 
P
E
 
I
P
 
P
D
 
D
P
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
L
Y
 
F
T
 
T
D
 
N
V
 
M
Y
 
Y
L
 
V
E
 
K

P16387 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, mitochondrial; Pyruvate dehydrogenase complex component E1 alpha; PDHE1-A; EC 1.2.4.1 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see 2 papers)
50% identity, 93% coverage: 25:343/343 of query aligns to 78:396/420 of P16387

query
sites
P16387
K
 
K
D
 
A
E
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
Q
F
 
M
Y
 
Y
Q
 
K
D
 
D
M
 
M
L
 
V
L
 
I
I
 
I
R
 
R
R
 
R
F
 
M
E
 
E
E
 
M
R
 
A
A
 
C
G
 
D
Q
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
K
M
 
A
G
 
K
L
 
K
I
 
I
G
 
R
G
 
G
F
 
F
C
 
C
H
 
H
L
 
L
Y
 
S
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
G
 
G
M
 
I
Q
 
E
S
 
N
I
 
A
S
 
I
Q
 
T
K
 
K
G
 
L
D
 
D
Q
 
S
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
S
Y
 
Y
R
 
R
D
 
C
H
 
H
G
 
G
H
 
F
M
 
T
L
 
F
A
 
M
A
 
R
G
 
G
M
 
A
D
 
S
P
 
V
R
 
K
E
 
A
V
 
V
M
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
M
G
 
G
R
 
R
A
 
R
G
 
A
G
 
G
S
 
V
S
 
S
K
 
Y
G
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
M
 
M
H
 
H
M
 
L
F
 
Y
D
 
-
I
 
-
A
 
A
T
 
P
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
H
 
N
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
F
A
 
A
N
 
H
S
 
Q
Y
 
Y
R
 
K
N
 
N
N
 
E
G
 
D
N
 
A
V
 
C
S
 
S
Y
 
F
A
 
T
Y
 
L
M
 
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
S
N
 
N
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
S
 
S
F
 
F
N
 
N
M
 
M
A
 
A
Q
 
K
L
 
L
W
 
W
K
 
N
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Y
 
F
V
 
C
I
 
C
E
 
E
N
 
N
N
 
N
Q
 
K
Y
 
Y
A
 
G
M
 
M
G
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
A
E
 
S
R
 
R
A
 
S
A
 
S
S
 
A
E
 
M
T
 
T
A
 
E
F
 
Y
H
 
F
K
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
Q
S
 
-
F
 
-
R
 
Y
I
 
I
P
 
P
G
 
G
E
 
L
E
 
K
V
 
V
D
 
N
G
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
I
I
 
L
A
 
A
V
 
V
R
 
Y
E
 
Q
A
 
A
G
 
S
A
 
K
R
 
F
A
 
A
T
 
K
E
 
D
H
 
W
A
 
C
R
 
L
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
P
 
P
Y
 
L
I
 
V
L
 
L
E
 
E
M
 
Y
K
 
E
T
 
T
Y
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
R
 
G
G
 
G
H
 
H
S
|
S
M
 
M
S
 
S
D
 
D
P
 
P
-
 
G
A
 
T
K
 
T
Y
 
Y
R
 
R
T
 
T
K
 
R
E
 
D
E
 
E
V
 
I
D
 
Q
E
 
H
V
 
M
K
 
R
T
 
S
T
 
K
R
 
N
D
 
D
P
 
P
I
 
I
D
 
A
H
 
G
I
 
L
K
 
K
E
 
M
R
 
H
L
 
L
A
 
I
K
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
I
-
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
A
D
 
E
L
 
V
K
 
K
G
 
A
V
 
Y
D
 
D
A
 
K
E
 
S
V
 
A
K
 
R
R
 
K
I
 
Y
V
 
V
A
 
D
E
 
E
A
 
Q
A
 
V
E
 
E
F
 
L
A
 
A
R
 
D
T
 
A
S
 
A
P
 
P
E
 
P
P
 
P
D
 
E
P
 
A
-
 
K
-
 
L
S
 
S
E
 
I
L
 
L
Y
 
F
T
 
E
D
 
D
V
 
V
Y
 
Y
L
 
V
E
 
K
A
 
G
A
 
T
E
 
E

Sites not aligning to the query:

P08559 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial; PDHE1-A type I; EC 1.2.4.1 from Homo sapiens (Human) (see 13 papers)
51% identity, 93% coverage: 19:338/343 of query aligns to 52:369/390 of P08559

query
sites
P08559
V
 
V
N
 
T
A
 
T
F
 
V
V
 
L
G
 
T
K
 
R
D
 
E
E
 
D
L
 
G
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
Y
 
Y
Q
 
R
D
 
M
M
 
M
L
 
Q
L
 
T
I
 
V
R
 
R
R
 
R
F
 
M
E
 
E
E
 
L
R
 
K
A
 
A
G
 
D
Q
 
Q
L
 
L
Y
 
Y
G
 
K
M
 
Q
G
 
K
L
 
I
I
 
I
G
 
R
G
 
G
F
 
F
C
 
C
H
 
H
L
 
L
Y
 
C
I
 
D
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
C
A
 
C
V
 
V
G
 
G
M
 
L
Q
 
E
S
 
A
I
 
G
S
 
I
Q
 
N
K
 
P
G
 
T
D
 
D
Q
 
H
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
A
Y
 
Y
R
 
R
D
 
A
H
 
H
G
 
G
H
 
F
M
 
T
L
 
F
A
 
T
A
 
R
G
 
G
M
 
L
D
 
S
P
 
V
R
 
R
E
 
E
V
 
I
M
 
L
A
|
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
A
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
C
S
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
M
 
M
H
 
H
M
 
M
F
 
Y
D
 
-
I
 
-
A
 
A
T
 
K
G
 
N
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
H
 
N
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
C
S
 
K
Y
 
Y
R
 
N
N
 
G
N
 
K
G
 
D
N
 
E
V
 
V
S
 
C
Y
 
L
A
 
T
Y
 
L
M
 
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
F
E
 
E
S
 
A
F
 
Y
N
 
N
M
 
M
A
 
A
Q
 
A
L
 
L
W
 
W
K
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
C
V
 
I
Y
 
F
V
 
I
I
 
C
E
 
E
N
 
N
N
 
N
Q
 
R
Y
 
Y
A
 
G
M
 
M
G
 
G
T
 
T
A
x
S
V
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
S
 
A
E
 
S
T
 
T
A
 
D
F
 
Y
H
 
Y
K
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
-
S
 
D
F
 
F
R
 
-
I
 
I
P
 
P
G
 
G
E
 
L
E
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
I
I
 
L
A
 
C
V
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
T
A
 
R
R
 
F
A
 
A
T
 
A
E
 
A
H
 
Y
A
 
C
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
P
 
P
Y
 
I
I
 
L
L
x
M
E
 
E
M
 
L
K
 
Q
T
 
T
Y
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
R
 
H
G
 
G
H
 
H
S
|
S
M
 
M
S
 
S
D
 
D
P
 
P
-
 
G
A
 
V
K
x
S
Y
 
Y
R
|
R
T
 
T
K
 
R
E
 
E
E
 
E
V
 
I
D
 
Q
E
 
E
V
 
V
K
 
R
T
 
S
T
 
K
R
 
S
D
 
D
P
 
P
I
 
I
D
 
M
H
 
L
I
 
L
K
 
K
E
 
D
R
 
R
L
 
M
A
 
V
K
 
N
A
 
S
G
 
N
V
 
L
T
 
A
E
 
S
-
 
V
D
 
E
D
 
E
L
 
L
K
 
K
G
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
V
E
 
E
V
 
V
K
 
R
R
 
K
I
 
E
V
 
I
A
 
E
E
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
A
 
A
R
 
T
T
 
A
S
 
D
P
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
P
P
 
L
S
 
E
E
 
E
L
 
L
Y
 
G
T
 
Y
D
 
H
V
 
I
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

6cfoA Human pyruvate dehydrogenase e1 component complex with covalent tdp adduct acetyl phosphinate (see paper)
51% identity, 93% coverage: 19:338/343 of query aligns to 24:341/362 of 6cfoA

query
sites
6cfoA
V
 
V
N
 
T
A
 
T
F
 
V
V
 
L
G
 
T
K
 
R
D
 
E
E
 
D
L
 
G
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
Y
 
Y
Q
 
R
D
 
M
M
 
M
L
 
Q
L
 
T
I
 
V
R
 
R
R
 
R
F
 
M
E
 
E
E
 
L
R
 
K
A
 
A
G
 
D
Q
|
Q
L
 
L
Y
 
Y
G
 
K
M
 
Q
G
 
K
L
 
I
I
 
I
G
 
R
G
 
G
F
|
F
C
 
C
H
 
H
L
 
L
Y
 
C
I
 
D
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
C
A
 
C
V
 
V
G
 
G
M
 
L
Q
 
E
S
 
A
I
 
G
S
 
I
Q
 
N
K
 
P
G
 
T
D
 
D
Q
 
H
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
A
Y
|
Y
R
|
R
D
 
A
H
 
H
G
 
G
H
 
F
M
 
T
L
 
F
A
 
T
A
 
R
G
 
G
M
 
L
D
 
S
P
 
V
R
 
R
E
 
E
V
 
I
M
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
A
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
C
S
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
M
 
M
H
 
H
M
 
M
F
 
Y
D
 
-
I
 
-
A
 
A
T
 
K
G
 
N
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
H
 
N
G
|
G
I
 
I
V
|
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
C
S
 
K
Y
 
Y
R
 
N
N
 
G
N
 
K
G
 
D
N
 
E
V
 
V
S
 
C
Y
 
L
A
 
T
Y
 
L
M
 
Y
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
 
A
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
F
E
 
E
S
 
A
F
 
Y
N
 
N
M
 
M
A
 
A
Q
 
A
L
 
L
W
 
W
K
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
C
V
 
I
Y
 
F
V
 
I
I
 
C
E
 
E
N
 
N
N
|
N
Q
 
R
Y
|
Y
A
x
G
M
 
M
G
 
G
T
 
T
A
 
S
V
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
S
 
A
E
 
S
T
 
T
A
 
D
F
 
Y
H
 
Y
K
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
-
S
 
D
F
 
F
R
 
-
I
 
I
P
 
P
G
 
G
E
 
L
E
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
I
I
 
L
A
 
C
V
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
T
A
 
R
R
 
F
A
 
A
T
 
A
E
 
A
H
 
Y
A
 
C
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
P
 
P
Y
 
I
I
 
L
L
 
M
E
 
E
M
 
L
K
 
Q
T
 
T
Y
 
Y
R
|
R
Y
 
Y
R
 
H
G
 
G
H
|
H
S
|
S
M
 
M
S
 
S
D
 
D
P
 
P
-
 
G
A
 
V
K
 
S
Y
|
Y
R
 
R
T
 
T
K
 
R
E
 
E
E
 
E
V
 
I
D
 
Q
E
 
E
V
 
V
K
 
R
T
 
S
T
 
K
R
 
S
D
 
D
P
 
P
I
 
I
D
 
M
H
 
L
I
 
L
K
 
K
E
 
D
R
 
R
L
 
M
A
 
V
K
 
N
A
 
S
G
 
N
V
 
L
T
 
A
E
 
S
-
 
V
D
 
E
D
 
E
L
 
L
K
 
K
G
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
V
E
 
E
V
 
V
K
 
R
R
 
K
I
 
E
V
 
I
A
 
E
E
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
A
 
A
R
 
T
T
 
A
S
 
D
P
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
P
P
 
L
S
 
E
E
 
E
L
 
L
Y
 
G
T
 
Y
D
 
H
V
 
I
Y
 
Y

1ni4A Human pyruvate dehydrogenase (see paper)
51% identity, 93% coverage: 19:338/343 of query aligns to 24:341/362 of 1ni4A

query
sites
1ni4A
V
 
V
N
 
T
A
 
T
F
 
V
V
 
L
G
 
T
K
 
R
D
 
E
E
 
D
L
 
G
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
Y
 
Y
Q
 
R
D
 
M
M
 
M
L
 
Q
L
 
T
I
 
V
R
 
R
R
 
R
F
 
M
E
 
E
E
 
L
R
 
K
A
 
A
G
 
D
Q
|
Q
L
 
L
Y
 
Y
G
 
K
M
 
Q
G
 
K
L
 
I
I
 
I
G
 
R
G
 
G
F
 
F
C
 
C
H
 
H
L
 
L
Y
 
C
I
 
D
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
C
A
 
C
V
 
V
G
 
G
M
 
L
Q
 
E
S
 
A
I
 
G
S
 
I
Q
 
N
K
 
P
G
 
T
D
 
D
Q
 
H
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
A
Y
|
Y
R
|
R
D
 
A
H
 
H
G
 
G
H
 
F
M
 
T
L
 
F
A
 
T
A
 
R
G
 
G
M
 
L
D
 
S
P
 
V
R
 
R
E
 
E
V
 
I
M
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
A
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
C
S
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
M
 
M
H
 
H
M
 
M
F
 
Y
D
 
-
I
 
-
A
 
A
T
 
K
G
 
N
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
H
 
N
G
|
G
I
 
I
V
|
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
C
S
 
K
Y
 
Y
R
 
N
N
 
G
N
 
K
G
 
D
N
 
E
V
 
V
S
 
C
Y
 
L
A
 
T
Y
 
L
M
 
Y
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
|
A
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
F
E
 
E
S
 
A
F
 
Y
N
 
N
M
 
M
A
 
A
Q
 
A
L
 
L
W
 
W
K
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
C
V
 
I
Y
 
F
V
 
I
I
 
C
E
 
E
N
 
N
N
|
N
Q
 
R
Y
|
Y
A
x
G
M
 
M
G
 
G
T
 
T
A
 
S
V
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
S
 
A
E
 
S
T
 
T
A
 
D
F
 
Y
H
 
Y
K
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
-
S
 
D
F
 
F
R
 
-
I
 
I
P
 
P
G
 
G
E
 
L
E
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
I
I
 
L
A
 
C
V
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
T
A
 
R
R
 
F
A
 
A
T
 
A
E
 
A
H
 
Y
A
 
C
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
P
 
P
Y
 
I
I
 
L
L
 
M
E
 
E
M
 
L
K
 
Q
T
 
T
Y
 
Y
R
|
R
Y
 
Y
R
 
H
G
 
G
H
|
H
S
|
S
M
 
M
S
 
S
D
 
D
P
 
P
-
 
G
A
 
V
K
 
S
Y
|
Y
R
 
R
T
 
T
K
 
R
E
 
E
E
 
E
V
 
I
D
 
Q
E
 
E
V
 
V
K
 
R
T
 
S
T
 
K
R
 
S
D
 
D
P
 
P
I
 
I
D
 
M
H
 
L
I
 
L
K
 
K
E
 
D
R
 
R
L
 
M
A
 
V
K
 
N
A
 
S
G
 
N
V
 
L
T
 
A
E
 
S
-
 
V
D
 
E
D
 
E
L
 
L
K
 
K
G
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
V
E
 
E
V
 
V
K
 
R
R
 
K
I
 
E
V
 
I
A
 
E
E
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
A
 
A
R
 
T
T
 
A
S
 
D
P
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
P
P
 
L
S
 
E
E
 
E
L
 
L
Y
 
G
T
 
Y
D
 
H
V
 
I
Y
 
Y

3exeA Crystal structure of the pyruvate dehydrogenase (e1p) component of human pyruvate dehydrogenase complex (see paper)
51% identity, 93% coverage: 19:338/343 of query aligns to 25:342/363 of 3exeA

query
sites
3exeA
V
 
V
N
 
T
A
 
T
F
 
V
V
 
L
G
 
T
K
 
R
D
 
E
E
 
D
L
 
G
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
Y
 
Y
Q
 
R
D
 
M
M
 
M
L
 
Q
L
 
T
I
 
V
R
 
R
R
 
R
F
 
M
E
 
E
E
 
L
R
 
K
A
 
A
G
 
D
Q
|
Q
L
 
L
Y
 
Y
G
 
K
M
 
Q
G
 
K
L
 
I
I
 
I
G
 
R
G
 
G
F
 
F
C
 
C
H
 
H
L
 
L
Y
 
C
I
 
D
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
C
A
 
C
V
 
V
G
 
G
M
 
L
Q
 
E
S
 
A
I
 
G
S
 
I
Q
 
N
K
 
P
G
 
T
D
 
D
Q
 
H
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
A
Y
|
Y
R
|
R
D
 
A
H
 
H
G
 
G
H
 
F
M
 
T
L
 
F
A
 
T
A
 
R
G
 
G
M
 
L
D
 
S
P
 
V
R
 
R
E
 
E
V
 
I
M
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
A
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
C
S
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
M
 
M
H
 
H
M
 
M
F
 
Y
D
 
-
I
 
-
A
 
A
T
 
K
G
 
N
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
H
 
N
G
|
G
I
 
I
V
|
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
C
S
 
K
Y
 
Y
R
 
N
N
 
G
N
 
K
G
 
D
N
 
E
V
 
V
S
 
C
Y
 
L
A
 
T
Y
 
L
M
 
Y
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
|
A
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
F
E
 
E
S
 
A
F
 
Y
N
 
N
M
 
M
A
 
A
Q
 
A
L
 
L
W
 
W
K
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
C
V
 
I
Y
 
F
V
 
I
I
 
C
E
 
E
N
 
N
N
|
N
Q
 
R
Y
|
Y
A
x
G
M
 
M
G
 
G
T
 
T
A
 
S
V
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
S
 
A
E
 
S
T
 
T
A
 
D
F
 
Y
H
 
Y
K
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
-
S
 
D
F
 
F
R
 
-
I
 
I
P
 
P
G
 
G
E
 
L
E
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
I
I
 
L
A
 
C
V
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
T
A
 
R
R
 
F
A
 
A
T
 
A
E
 
A
H
 
Y
A
 
C
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
P
 
P
Y
 
I
I
 
L
L
 
M
E
 
E
M
 
L
K
 
Q
T
 
T
Y
 
Y
R
|
R
Y
 
Y
R
 
H
G
 
G
H
|
H
S
|
S
M
 
M
S
 
S
D
 
D
P
 
P
-
 
G
A
 
V
K
 
S
Y
|
Y
R
 
R
T
 
T
K
 
R
E
 
E
E
 
E
V
 
I
D
 
Q
E
 
E
V
 
V
K
 
R
T
 
S
T
 
K
R
 
S
D
 
D
P
 
P
I
 
I
D
 
M
H
 
L
I
 
L
K
 
K
E
 
D
R
 
R
L
 
M
A
 
V
K
 
N
A
 
S
G
 
N
V
 
L
T
 
A
E
 
S
-
 
V
D
 
E
D
 
E
L
 
L
K
 
K
G
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
V
E
 
E
V
 
V
K
 
R
R
 
K
I
 
E
V
 
I
A
 
E
E
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
A
 
A
R
 
T
T
 
A
S
 
D
P
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
P
P
 
L
S
 
E
E
 
E
L
 
L
Y
 
G
T
 
Y
D
 
H
V
 
I
Y
 
Y

Q10489 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, mitochondrial; PDHE1-A; EC 1.2.4.1 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
47% identity, 94% coverage: 23:343/343 of query aligns to 73:393/409 of Q10489

query
sites
Q10489
V
 
V
G
 
T
K
 
K
D
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
G
F
 
L
Y
 
Y
Q
 
E
D
 
K
M
 
M
L
 
V
L
 
T
I
 
I
R
 
R
R
 
R
F
 
L
E
 
E
E
 
L
R
 
A
A
 
C
G
 
D
Q
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
K
M
 
A
G
 
K
L
 
K
I
 
I
G
 
R
G
 
G
F
 
F
C
 
C
H
 
H
L
 
L
Y
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
A
G
 
G
M
 
I
Q
 
E
S
 
G
I
 
A
S
 
I
Q
 
T
K
 
L
G
 
D
D
 
D
Q
 
S
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
S
Y
 
Y
R
 
R
D
 
C
H
 
H
G
 
G
H
 
F
M
 
A
L
 
Y
A
 
T
A
 
R
G
 
G
M
 
L
D
 
S
P
 
I
R
 
R
E
 
S
V
 
I
M
 
I
A
 
G
E
 
E
L
 
L
T
 
M
G
 
G
R
 
R
A
 
Q
G
 
C
G
 
G
S
 
A
S
 
S
K
 
K
G
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
M
 
M
H
 
H
M
 
I
F
 
F
D
 
-
I
 
-
A
 
A
T
 
K
G
 
N
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
H
 
N
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
V
 
I
A
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
G
L
 
F
A
 
A
N
 
Q
S
 
K
Y
 
Y
R
 
L
N
 
E
N
 
K
G
 
P
N
 
T
V
 
T
S
 
T
Y
 
F
A
 
A
Y
 
L
M
 
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
S
N
 
N
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
Y
 
F
E
 
E
S
 
A
F
 
F
N
 
N
M
 
M
A
 
A
Q
 
K
L
 
L
W
 
W
K
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
I
Y
 
F
V
 
A
I
 
C
E
 
E
N
 
N
N
 
N
Q
 
K
Y
 
Y
A
 
G
M
 
M
G
 
G
T
 
T
A
 
S
V
 
A
E
 
E
R
 
R
A
 
S
A
 
S
S
 
A
E
 
M
T
 
T
A
 
E
F
 
F
H
 
Y
K
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
Q
S
 
Y
F
 
-
R
 
-
I
 
I
P
 
P
G
 
G
E
 
L
E
 
L
V
 
V
D
 
N
G
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
V
I
 
L
A
 
A
V
 
V
R
 
L
E
 
Q
A
 
A
G
 
S
A
 
K
R
 
F
A
 
A
T
 
K
E
 
K
H
 
Y
A
 
T
R
 
V
S
 
E
G
 
N
Q
 
S
G
 
Q
P
 
P
Y
 
L
I
 
L
L
 
M
E
 
E
M
 
F
K
 
V
T
 
T
Y
 
Y
R
 
R
Y
|
Y
R
 
G
G
 
G
H
 
H
S
|
S
M
 
M
S
|
S
D
 
D
P
 
P
-
 
G
A
 
T
K
 
T
Y
 
Y
R
 
R
T
 
S
K
 
R
E
 
E
E
 
E
V
 
V
D
 
Q
E
 
K
V
 
V
K
 
R
T
 
A
T
 
A
R
 
R
D
 
D
P
 
P
I
 
I
D
 
E
H
 
G
I
 
L
K
 
K
E
 
K
R
 
H
L
 
I
A
 
M
K
 
E
A
 
W
G
 
G
V
 
V
T
 
A
E
 
N
-
 
A
D
 
N
D
 
E
L
 
L
K
 
K
G
 
N
V
 
I
D
 
E
A
 
K
E
 
R
V
 
I
K
 
R
R
 
G
I
 
M
V
 
V
A
 
D
E
 
E
A
 
E
A
 
V
E
 
R
F
 
I
A
 
A
R
 
E
T
 
E
S
 
S
P
 
P
E
 
F
P
 
P
D
 
D
P
 
P
S
 
I
E
 
E
-
 
E
-
 
S
L
 
L
Y
 
F
T
 
S
D
 
D
V
 
V
Y
 
Y
L
 
V
E
 
A
A
 
G
A
 
T
E
 
E

Sites not aligning to the query:

6cerA Human pyruvate dehydrogenase complex e1 component v138m mutation (see paper)
46% identity, 93% coverage: 19:338/343 of query aligns to 25:321/342 of 6cerA

query
sites
6cerA
V
 
V
N
 
T
A
 
T
F
 
V
V
 
L
G
 
T
K
 
R
D
 
E
E
 
D
L
 
G
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
Y
 
Y
Q
 
R
D
 
M
M
 
M
L
 
Q
L
 
T
I
 
V
R
 
R
R
 
R
F
 
M
E
 
E
E
 
L
R
 
K
A
 
A
G
 
D
Q
|
Q
L
 
L
Y
 
Y
G
 
K
M
 
Q
G
 
K
L
 
I
I
 
I
G
 
R
G
 
G
F
 
F
C
 
C
H
 
H
L
 
L
Y
 
C
I
 
D
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
C
A
 
C
V
 
V
G
 
G
M
 
L
Q
 
E
S
 
A
I
 
G
S
 
I
Q
 
N
K
 
P
G
 
T
D
 
D
Q
 
H
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
A
Y
|
Y
R
|
R
D
 
A
H
 
H
G
 
G
H
 
F
M
 
T
L
 
F
A
 
T
A
 
R
G
 
G
M
 
L
D
 
S
P
 
V
R
 
R
E
 
E
V
 
I
M
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
A
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
C
S
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
M
 
M
H
 
H
M
 
M
F
 
Y
D
 
-
I
 
-
A
 
A
T
 
K
G
 
N
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
H
 
N
G
|
G
I
 
I
V
x
M
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
C
S
 
K
Y
 
Y
R
 
N
N
 
G
N
 
K
G
 
D
N
 
E
V
 
V
S
 
C
Y
 
L
A
 
T
Y
 
L
M
 
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
F
E
 
E
S
 
A
F
 
Y
N
 
N
M
 
M
A
 
A
Q
 
A
L
 
L
W
 
W
K
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
C
V
 
I
Y
 
F
V
 
I
I
 
C
E
 
E
N
 
N
N
 
N
Q
 
-
Y
 
-
A
 
-
M
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
R
A
 
A
A
 
A
S
 
A
E
 
S
T
 
T
A
 
D
F
 
Y
H
 
Y
K
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
-
S
 
D
F
 
F
R
 
-
I
 
I
P
 
P
G
 
G
E
 
L
E
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
I
I
 
L
A
 
C
V
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
T
A
 
R
R
 
F
A
 
A
T
 
A
E
 
A
H
 
Y
A
 
C
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
P
 
P
Y
 
I
I
 
L
L
 
M
E
 
E
M
 
L
K
 
Q
T
 
T
Y
 
Y
R
|
R
Y
 
-
R
 
-
G
 
-
H
 
-
S
 
-
M
 
-
S
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
Y
R
 
H
T
 
T
K
 
R
E
 
E
E
 
E
V
 
I
D
 
Q
E
 
E
V
 
V
K
 
R
T
 
S
T
 
K
R
 
S
D
 
D
P
 
P
I
 
I
D
 
M
H
 
L
I
 
L
K
 
K
E
 
D
R
 
R
L
 
M
A
 
V
K
 
N
A
 
S
G
 
N
V
 
L
T
 
A
E
 
S
-
 
V
D
 
E
D
 
E
L
 
L
K
 
K
G
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
V
E
 
E
V
 
V
K
 
R
R
 
K
I
 
E
V
 
I
A
 
E
E
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
A
 
A
R
 
T
T
 
A
S
 
D
P
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
P
P
 
L
S
 
E
E
 
E
L
 
L
Y
 
G
T
 
Y
D
 
H
V
 
I
Y
 
Y

6cerE Human pyruvate dehydrogenase complex e1 component v138m mutation (see paper)
45% identity, 93% coverage: 19:338/343 of query aligns to 24:319/340 of 6cerE

query
sites
6cerE
V
 
V
N
 
T
A
 
T
F
 
V
V
 
L
G
 
T
K
 
R
D
 
E
E
 
D
L
 
G
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
Y
 
Y
Q
 
R
D
 
M
M
 
M
L
 
Q
L
 
T
I
 
V
R
 
R
R
 
R
F
 
M
E
 
E
E
 
L
R
 
K
A
 
A
G
 
D
Q
|
Q
L
 
L
Y
 
Y
G
 
K
M
 
Q
G
 
K
L
 
I
I
 
I
G
 
R
G
 
G
F
 
F
C
 
C
H
 
H
L
 
L
Y
 
C
I
 
D
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
C
A
 
C
V
 
V
G
 
G
M
 
L
Q
 
E
S
 
A
I
 
G
S
 
I
Q
 
N
K
 
P
G
 
T
D
 
D
Q
 
H
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
A
Y
|
Y
R
|
R
D
 
A
H
 
H
G
 
G
H
 
F
M
 
T
L
 
F
A
 
T
A
 
R
G
 
G
M
 
L
D
 
S
P
 
V
R
 
R
E
 
E
V
 
I
M
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
A
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
C
S
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
M
 
M
H
 
H
M
 
M
F
 
Y
D
 
-
I
 
-
A
 
A
T
 
K
G
 
N
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
H
 
N
G
|
G
I
 
I
V
x
M
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
C
S
 
K
Y
 
Y
R
 
N
N
 
G
N
 
K
G
 
D
N
 
E
V
 
V
S
 
C
Y
 
L
A
 
T
Y
 
L
M
 
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
F
E
 
E
S
 
A
F
 
Y
N
 
N
M
 
M
A
 
A
Q
 
A
L
 
L
W
 
W
K
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
C
V
 
I
Y
 
F
V
 
I
I
 
C
E
 
E
N
 
N
N
 
N
Q
 
R
Y
 
-
A
 
-
M
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
R
A
 
A
A
 
A
S
 
A
E
 
S
T
 
T
A
 
D
F
 
Y
H
 
Y
K
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
-
S
 
D
F
 
F
R
 
-
I
 
I
P
 
P
G
 
G
E
 
L
E
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
I
I
 
L
A
 
C
V
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
T
A
 
R
R
 
F
A
 
A
T
 
A
E
 
A
H
 
Y
A
 
C
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
P
 
P
Y
 
I
I
 
L
L
 
M
E
 
E
M
 
L
K
 
Q
T
 
T
Y
 
Y
R
|
R
Y
 
Y
R
x
H
G
 
-
H
 
-
S
 
-
M
 
-
S
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
-
E
 
E
E
 
E
V
 
I
D
 
Q
E
 
E
V
 
V
K
 
R
T
 
S
T
 
K
R
 
S
D
 
D
P
 
P
I
 
I
D
 
M
H
 
L
I
 
L
K
 
K
E
 
D
R
 
R
L
 
M
A
 
V
K
 
N
A
 
S
G
 
N
V
 
L
T
 
A
E
 
S
-
 
V
D
 
E
D
 
E
L
 
L
K
 
K
G
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
V
E
 
E
V
 
V
K
 
R
R
 
K
I
 
E
V
 
I
A
 
E
E
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
A
 
A
R
 
T
T
 
A
S
 
D
P
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
P
P
 
L
S
 
E
E
 
E
L
 
L
Y
 
G
T
 
Y
D
 
H
V
 
I
Y
 
Y

3exhE Crystal structure of the pyruvate dehydrogenase (e1p) component of human pyruvate dehydrogenase complex (see paper)
44% identity, 93% coverage: 19:338/343 of query aligns to 24:310/331 of 3exhE

query
sites
3exhE
V
 
V
N
 
T
A
 
T
F
 
V
V
 
L
G
 
T
K
 
R
D
 
E
E
 
D
L
 
G
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
Y
 
Y
Q
 
R
D
 
M
M
 
M
L
 
Q
L
 
T
I
 
V
R
 
R
R
 
R
F
 
M
E
 
E
E
 
L
R
 
K
A
 
A
G
 
D
Q
|
Q
L
 
L
Y
 
Y
G
 
K
M
 
Q
G
 
K
L
 
I
I
 
I
G
 
R
G
 
G
F
 
F
C
 
C
H
 
H
L
 
L
Y
 
C
I
 
D
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
C
A
 
C
V
 
V
G
 
G
M
 
L
Q
 
E
S
 
A
I
 
G
S
 
I
Q
 
N
K
 
P
G
 
T
D
 
D
Q
 
H
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
A
Y
|
Y
R
|
R
D
 
A
H
 
H
G
 
G
H
 
F
M
 
T
L
 
F
A
 
T
A
 
R
G
 
G
M
 
L
D
 
S
P
 
V
R
 
R
E
 
E
V
 
I
M
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
A
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
C
S
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
M
 
M
H
 
H
M
 
M
F
 
Y
D
 
-
I
 
-
A
 
A
T
 
K
G
 
N
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
H
 
N
G
|
G
I
 
I
V
|
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
C
S
 
K
Y
 
Y
R
 
N
N
 
G
N
 
K
G
 
D
N
 
E
V
 
V
S
 
C
Y
 
L
A
 
T
Y
 
L
M
 
Y
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
 
A
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
F
E
 
E
S
 
A
F
 
Y
N
 
N
M
 
M
A
 
A
Q
 
A
L
 
L
W
 
W
K
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
C
V
 
I
Y
 
F
V
 
I
I
 
C
E
 
E
N
 
N
N
|
N
Q
 
R
Y
 
-
A
 
-
M
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
-
V
 
-
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
S
 
A
E
 
S
T
 
T
A
 
D
F
 
Y
H
 
Y
K
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
-
S
 
D
F
 
F
R
 
-
I
 
I
P
 
P
G
 
G
E
 
L
E
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
I
I
 
L
A
 
C
V
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
T
A
 
R
R
 
F
A
 
A
T
 
A
E
 
A
H
 
Y
A
 
C
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
P
 
P
Y
 
I
I
 
L
L
 
M
E
 
E
M
 
L
K
 
Q
T
 
T
Y
 
Y
R
 
-
Y
 
-
R
 
-
G
 
-
H
 
-
S
 
-
M
 
-
S
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
-
E
 
-
E
 
-
V
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
K
 
-
T
 
S
T
 
K
R
 
S
D
 
D
P
 
P
I
 
I
D
 
M
H
 
L
I
 
L
K
 
K
E
 
D
R
 
R
L
 
M
A
 
V
K
 
N
A
 
S
G
 
N
V
 
L
T
 
A
E
 
S
-
 
V
D
 
E
D
 
E
L
 
L
K
 
K
G
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
V
E
 
E
V
 
V
K
 
R
R
 
K
I
 
E
V
 
I
A
 
E
E
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
A
 
A
R
 
T
T
 
A
S
 
D
P
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
P
P
 
L
S
 
E
E
 
E
L
 
L
Y
 
G
T
 
Y
D
 
H
V
 
I
Y
 
Y

3dufA Snapshots of catalysis in the e1 subunit of the pyruvate dehydrogenase multi-enzyme complex (see paper)
31% identity, 92% coverage: 26:340/343 of query aligns to 40:347/365 of 3dufA

query
sites
3dufA
D
 
D
E
 
E
L
 
Q
L
 
L
K
 
K
-
 
E
F
 
L
Y
 
M
Q
 
R
D
 
R
M
 
M
L
 
V
L
 
Y
I
 
T
R
 
R
R
 
I
F
 
L
E
 
D
E
 
Q
R
 
R
A
 
S
G
 
I
Q
x
S
L
 
L
Y
 
N
G
 
R
M
 
Q
G
 
G
L
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
-
F
 
F
C
 
Y
H
 
A
L
 
P