SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CCNA_01885 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_01885 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1gegE Cryatal structure analysis of meso-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
40% identity, 93% coverage: 14:253/258 of query aligns to 3:253/256 of 1gegE

query
sites
1gegE
R
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
G
R
x
Q
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
L
L
 
R
L
 
L
A
 
V
A
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
F
M
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
I
L
 
A
D
|
D
L
x
Y
K
 
N
A
 
D
H
 
A
W
 
T
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
A
 
A
D
 
S
E
 
E
I
 
I
I
 
N
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
H
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
V
G
 
K
C
x
V
D
|
D
V
|
V
S
 
S
D
 
D
R
|
R
E
x
D
A
 
Q
L
 
V
T
x
F
A
 
A
T
 
A
L
 
V
G
 
E
A
 
Q
V
 
A
N
 
R
D
 
K
A
 
T
H
 
L
G
 
G
R
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
I
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
M
 
G
W
 
V
N
 
A
V
 
P
Y
 
S
E
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
E
A
 
S
I
 
I
R
 
T
P
 
P
E
 
E
S
 
I
L
 
V
D
 
D
R
 
K
M
 
V
V
 
Y
S
 
N
V
x
I
G
 
N
F
 
V
S
 
K
G
 
G
V
 
V
I
 
I
W
 
W
G
 
G
M
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
V
P
x
E
L
 
A
M
 
F
A
 
K
A
 
K
S
 
E
G
 
G
-
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
A
A
 
C
S
|
S
V
 
Q
S
 
A
A
 
G
Q
 
H
L
 
V
G
 
G
I
 
N
P
 
P
N
 
E
G
 
L
I
 
A
A
 
V
Y
|
Y
C
 
S
G
 
S
V
 
S
K
|
K
A
 
F
G
 
A
V
 
V
A
 
R
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
Q
A
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
R
E
 
D
L
 
L
G
 
A
A
 
P
M
 
L
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
Y
A
 
C
P
|
P
S
 
G
T
 
I
V
|
V
D
 
K
T
|
T
E
 
P
-
x
M
-
 
W
-
 
A
G
 
E
V
 
I
R
 
D
R
 
R
V
 
Q
V
|
V
S
 
S
E
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
-
 
G
-
 
T
E
 
A
R
 
E
I
 
F
A
 
A
M
 
K
R
 
R
I
 
I
G
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
S
T
 
E
T
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
V
A
 
A
K
 
A
A
 
C
V
 
V
R
 
S
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
C
 
S
D
 
P
D
 
D
S
 
S
D
 
D
F
 
Y
V
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
M
 
S
L
 
L
T
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

Q48436 Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; Acetoin(diacetyl) reductase; AR; Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; EC 1.1.1.304 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
40% identity, 93% coverage: 14:253/258 of query aligns to 3:253/256 of Q48436

query
sites
Q48436
R
 
K
V
 
V
A
 
A
A
x
L
V
|
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
S
x
G
R
x
Q
G
|
G
L
x
I
G
|
G
R
x
K
A
|
A
T
x
I
A
|
A
A
x
L
L
x
R
L
|
L
A
x
V
A
x
K
E
x
D
G
|
G
A
x
F
M
x
A
V
|
V
A
|
A
L
x
I
L
x
A
D
|
D
L
 
Y
K
 
N
A
 
D
H
 
A
W
 
T
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
A
 
A
D
 
S
E
 
E
I
 
I
I
 
N
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
R
A
 
A
V
 
M
G
 
A
L
 
V
G
 
K
C
 
V
D
|
D
V
 
V
S
 
S
D
 
D
R
 
R
E
 
D
A
 
Q
L
 
V
T
 
F
A
 
A
T
 
A
L
 
V
G
 
E
A
 
Q
V
 
A
N
 
R
D
 
K
A
 
T
H
 
L
G
 
G
R
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
I
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
M
 
G
W
 
V
N
 
A
V
 
P
Y
 
S
E
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
E
A
 
S
I
 
I
R
 
T
P
 
P
E
 
E
S
 
I
L
 
V
D
 
D
R
 
K
M
 
V
V
 
Y
S
 
N
V
 
I
G
 
N
F
 
V
S
 
K
G
 
G
V
 
V
I
 
I
W
 
W
G
 
G
M
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
V
P
 
E
L
 
A
M
 
F
A
 
K
A
 
K
S
 
E
G
 
G
-
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
A
A
 
C
S
 
S
V
 
Q
S
 
A
A
 
G
Q
 
H
L
 
V
G
 
G
I
 
N
P
 
P
N
 
E
G
 
L
I
 
A
A
 
V
Y
 
Y
C
 
S
G
 
S
V
 
S
K
|
K
A
 
F
G
 
A
V
 
V
A
 
R
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
Q
A
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
R
E
 
D
L
 
L
G
 
A
A
 
P
M
 
L
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
Y
A
 
C
P
 
P
S
 
G
T
 
I
V
 
V
D
 
K
T
 
T
E
 
P
-
 
M
-
 
W
-
 
A
G
 
E
V
 
I
R
 
D
R
 
R
V
 
Q
V
 
V
S
 
S
E
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
-
 
G
-
 
T
E
 
A
R
 
E
I
 
F
A
 
A
M
 
K
R
 
R
I
 
I
G
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
S
T
 
E
T
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
V
A
 
A
K
 
A
A
 
C
V
 
V
R
 
S
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
C
 
S
D
 
P
D
 
D
S
 
S
D
 
D
F
 
Y
V
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
M
 
S
L
 
L
T
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
39% identity, 95% coverage: 10:253/258 of query aligns to 4:242/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
R
 
R
L
 
L
E
 
Q
G
 
D
R
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
A
R
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
T
 
A
A
 
A
A
 
R
L
 
V
L
 
F
A
 
M
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
M
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
I
L
 
A
D
|
D
L
 
-
K
 
-
A
 
-
H
 
-
W
x
F
A
 
N
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
G
D
 
K
E
 
E
I
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
A
G
 
N
G
 
P
K
 
G
A
 
V
V
 
V
G
 
F
L
 
I
G
 
R
C
x
V
D
|
D
V
|
V
S
 
S
D
 
D
R
 
R
E
 
E
A
 
S
L
 
V
T
 
H
A
 
R
T
 
L
L
 
V
G
 
E
A
 
N
V
 
V
N
 
A
D
 
E
A
 
R
H
 
F
G
 
G
R
 
K
F
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
M
x
G
W
x
I
N
 
T
V
 
R
Y
x
D
E
 
S
P
 
M
L
 
L
A
 
S
A
x
K
I
 
M
R
 
T
P
 
V
E
 
D
S
 
Q
L
 
F
D
 
Q
R
 
Q
M
 
V
V
 
I
S
 
N
V
 
V
G
x
N
F
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
V
I
 
F
W
 
H
G
 
C
M
 
T
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
A
 
L
P
 
P
L
 
Y
M
 
M
A
 
A
A
 
E
S
 
Q
G
 
G
G
 
K
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
S
S
|
S
V
 
V
S
 
T
A
 
G
Q
 
T
L
 
Y
G
 
G
I
x
N
P
x
V
N
 
G
G
x
Q
I
 
T
A
 
N
Y
|
Y
C
 
A
G
 
A
V
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
G
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
K
A
 
T
A
 
W
A
 
A
A
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
A
A
 
R
M
 
K
N
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
S
 
G
T
x
F
V
x
T
D
 
E
T
|
T
E
 
A
G
x
M
V
 
V
R
 
A
R
 
E
V
 
-
V
 
V
S
 
P
E
 
E
E
 
K
R
 
V
I
 
I
A
 
E
M
x
K
R
 
M
I
 
K
G
 
A
Q
 
Q
T
 
V
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
K
T
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
N
A
 
A
V
 
Y
R
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
C
 
S
D
 
H
D
 
E
S
 
S
D
 
D
F
 
Y
V
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
H
M
 
V
L
 
L
T
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
I

4urfB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
38% identity, 94% coverage: 11:253/258 of query aligns to 3:245/248 of 4urfB

query
sites
4urfB
L
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
T
A
 
A
A
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
x
G
R
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
T
 
I
A
 
A
A
 
L
L
 
T
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
M
 
N
V
 
V
A
 
V
L
 
V
L
 
S
D
|
D
L
x
I
K
 
S
A
 
D
H
 
E
W
 
W
A
 
G
Q
 
R
A
 
E
A
 
T
A
 
L
D
 
A
E
 
L
I
 
I
I
 
E
A
 
G
A
 
K
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
F
L
 
Q
G
 
H
C
 
A
D
|
D
V
x
T
S
 
A
D
 
H
R
 
P
E
 
E
A
 
D
L
 
H
T
 
D
A
 
E
T
 
L
L
 
I
G
 
A
A
 
A
V
 
A
N
 
K
D
 
R
A
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
R
F
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
-
x
G
M
x
I
W
 
S
N
x
G
V
 
E
Y
 
F
E
 
T
P
 
P
L
 
T
A
 
A
A
 
E
I
 
T
R
 
T
P
 
D
E
 
A
S
 
Q
L
 
W
D
 
Q
R
|
R
M
 
V
V
 
I
S
 
G
V
 
I
G
 
N
F
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
F
W
 
Y
G
 
G
M
 
V
Q
 
R
A
 
A
A
 
Q
A
 
I
P
 
R
L
 
A
M
 
M
A
 
L
A
 
E
S
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
V
 
I
S
 
A
A
 
G
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
I
P
 
E
N
 
G
G
x
I
I
 
T
A
 
P
Y
|
Y
C
 
T
G
 
A
V
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
V
 
V
A
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
T
A
 
V
A
 
A
A
 
W
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
A
 
S
M
 
K
N
 
G
I
 
I
R
|
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
G
P
|
P
S
x
A
T
 
F
V
x
I
D
 
N
T
|
T
E
 
T
G
 
L
V
 
V
R
 
Q
R
 
N
V
 
V
V
 
P
S
 
L
E
 
E
E
 
T
R
 
R
I
 
R
A
 
Q
M
 
L
R
 
E
I
 
-
G
 
Q
Q
 
M
T
 
H
P
 
A
L
|
L
G
x
R
R
|
R
L
 
L
G
 
G
T
 
E
T
 
T
E
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
N
A
 
L
V
 
V
R
 
A
Y
 
W
L
 
L
A
 
S
C
x
S
D
 
D
D
 
K
S
 
A
D
 
S
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
M
 
Y
L
 
Y
T
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y

4urfA Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
38% identity, 94% coverage: 11:253/258 of query aligns to 3:245/248 of 4urfA

query
sites
4urfA
L
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
T
A
 
A
A
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
x
G
R
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
T
 
I
A
 
A
A
 
L
L
 
T
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
M
 
N
V
 
V
A
 
V
L
 
V
L
 
S
D
|
D
L
x
I
K
 
S
A
 
D
H
 
E
W
|
W
A
 
G
Q
 
R
A
 
E
A
 
T
A
 
L
D
 
A
E
 
L
I
 
I
I
 
E
A
 
G
A
 
K
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
F
L
 
Q
G
 
H
C
 
A
D
|
D
V
x
T
S
 
A
D
 
H
R
 
P
E
 
E
A
 
D
L
 
H
T
 
D
A
 
E
T
 
L
L
 
I
G
 
A
A
 
A
V
 
A
N
 
K
D
 
R
A
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
R
F
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
-
x
G
M
x
I
W
x
S
N
x
G
V
x
E
Y
 
F
E
x
T
P
 
P
L
 
T
A
 
A
A
x
E
I
 
T
R
x
T
P
 
D
E
 
A
S
x
Q
L
 
W
D
 
Q
R
|
R
M
 
V
V
 
I
S
 
G
V
 
I
G
 
N
F
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
F
W
 
Y
G
 
G
M
 
V
Q
 
R
A
 
A
A
 
Q
A
 
I
P
 
R
L
 
A
M
 
M
A
 
L
A
 
E
S
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
V
 
I
S
 
A
A
 
G
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
I
P
 
E
N
 
G
G
x
I
I
 
T
A
 
P
Y
|
Y
C
 
T
G
 
A
V
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
V
 
V
A
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
T
A
 
V
A
 
A
A
 
W
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
A
x
S
M
 
K
N
x
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
G
P
|
P
S
 
A
T
 
F
V
x
I
D
 
N
T
|
T
E
 
T
G
 
L
V
 
V
R
 
Q
R
 
N
V
 
V
V
 
P
S
 
L
E
 
E
E
 
T
R
 
R
I
 
R
A
 
Q
M
 
L
R
 
E
I
 
-
G
 
Q
Q
 
M
T
 
H
P
 
A
L
 
L
G
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
E
T
 
T
E
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
N
A
 
L
V
 
V
R
 
A
Y
 
W
L
 
L
A
 
S
C
 
S
D
 
D
D
 
K
S
 
A
D
 
S
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
x
S
M
x
Y
L
 
Y
T
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y

4ureB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
38% identity, 94% coverage: 11:253/258 of query aligns to 3:245/248 of 4ureB

query
sites
4ureB
L
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
T
A
 
A
A
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
G
R
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
T
 
I
A
 
A
A
 
L
L
 
T
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
M
 
N
V
 
V
A
 
V
L
 
V
L
 
S
D
 
D
L
 
I
K
 
S
A
 
D
H
 
E
W
 
W
A
 
G
Q
 
R
A
 
E
A
 
T
A
 
L
D
 
A
E
 
L
I
 
I
I
 
E
A
 
G
A
 
K
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
F
L
 
Q
G
 
H
C
 
A
D
 
D
V
 
T
S
 
A
D
 
H
R
 
P
E
 
E
A
 
D
L
 
H
T
 
D
A
 
E
T
 
L
L
 
I
G
 
A
A
 
A
V
 
A
N
 
K
D
 
R
A
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
R
F
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
 
A
-
x
G
M
 
I
W
 
S
N
 
G
V
 
E
Y
 
F
E
 
T
P
 
P
L
 
T
A
 
A
A
 
E
I
 
T
R
 
T
P
 
D
E
 
A
S
 
Q
L
 
W
D
 
Q
R
 
R
M
 
V
V
 
I
S
 
G
V
 
I
G
 
N
F
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
F
W
 
Y
G
 
G
M
 
V
Q
 
R
A
 
A
A
 
Q
A
 
I
P
 
R
L
 
A
M
 
M
A
 
L
A
 
E
S
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
|
S
V
 
I
S
 
A
A
 
G
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
I
P
 
E
N
 
G
G
x
I
I
 
T
A
 
P
Y
|
Y
C
 
T
G
 
A
V
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
V
 
V
A
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
T
A
 
V
A
 
A
A
 
W
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
A
 
S
M
 
K
N
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
G
P
|
P
S
x
A
T
 
F
V
 
I
D
 
N
T
 
T
E
 
T
G
 
L
V
 
V
R
 
Q
R
 
N
V
 
V
V
 
P
S
 
L
E
 
E
E
 
T
R
 
R
I
 
R
A
 
Q
M
 
L
R
 
E
I
 
-
G
 
Q
Q
 
M
T
 
H
P
 
A
L
 
L
G
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
E
T
 
T
E
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
N
A
 
L
V
 
V
R
 
A
Y
 
W
L
 
L
A
 
S
C
 
S
D
 
D
D
 
K
S
 
A
D
 
S
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
M
 
Y
L
 
Y
T
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y

7krmC Putative fabg bound to nadh from acinetobacter baumannii
39% identity, 94% coverage: 11:253/258 of query aligns to 3:241/244 of 7krmC

query
sites
7krmC
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
A
-
x
S
-
 
E
R
 
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
E
L
 
I
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
M
 
K
V
 
V
A
 
I
L
 
I
L
 
V
D
|
D
L
|
L
K
 
D
A
 
L
H
 
A
W
 
Q
A
 
S
Q
 
Q
A
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
K
E
 
-
I
 
-
I
 
-
A
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
E
K
 
G
A
 
H
V
 
M
G
 
G
L
 
L
G
 
A
C
x
A
D
x
N
V
|
V
S
 
A
D
 
N
R
 
E
E
 
E
A
 
Q
L
 
V
T
 
K
A
 
A
T
 
A
L
 
V
G
 
E
A
 
Q
V
 
A
N
 
L
D
 
Q
A
 
H
H
 
Y
G
 
G
R
 
K
F
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
M
 
-
W
 
-
N
 
G
V
 
I
Y
 
T
E
 
Q
P
 
P
L
 
I
A
 
K
A
 
T
-
 
L
-
 
D
I
 
I
R
 
Q
P
 
R
E
 
S
S
 
D
L
 
Y
D
 
D
R
 
R
M
 
V
V
 
L
S
 
D
V
|
V
G
 
S
F
 
L
S
 
R
G
 
G
V
 
T
I
 
L
W
 
I
G
 
M
M
 
S
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
A
 
I
P
 
P
L
 
S
M
 
M
A
 
K
A
 
A
S
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
C
I
 
L
A
 
S
S
|
S
V
 
V
S
 
S
A
 
A
Q
 
Q
L
 
R
-
 
G
-
 
G
G
 
G
I
 
I
P
 
F
N
 
G
G
 
G
I
 
P
A
 
H
Y
|
Y
C
 
S
G
 
A
V
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
M
A
 
A
A
 
R
E
 
E
L
 
F
G
 
G
A
 
G
M
 
D
N
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
L
A
 
T
P
 
P
S
 
G
T
 
L
V
x
I
D
 
Q
T
|
T
E
 
D
G
 
-
V
 
-
R
 
-
R
 
-
V
 
-
V
 
M
S
 
N
E
 
D
E
 
D
R
 
R
I
 
R
A
 
H
M
 
D
R
 
I
I
 
L
G
 
A
Q
 
G
T
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
K
T
 
A
E
 
Q
D
 
D
I
 
V
A
 
A
K
 
N
A
 
A
V
 
A
R
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
C
 
S
D
 
D
D
 
L
S
 
S
D
 
A
F
 
Y
V
 
L
T
 
T
G
 
G
Q
 
V
M
 
T
L
 
L
T
 
D
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M

7v0hG Crystal structure of putative glucose 1-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia in complex with NADP and a potential reaction product
40% identity, 95% coverage: 10:253/258 of query aligns to 8:252/253 of 7v0hG

query
sites
7v0hG
R
 
K
L
 
L
E
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
R
x
K
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
A
A
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
M
 
A
V
 
V
A
 
V
L
 
V
L
 
-
D
 
-
L
 
-
K
 
N
A
 
Y
H
x
A
W
x
S
A
x
S
Q
 
K
A
 
A
A
 
G
A
 
A
D
 
D
E
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
S
A
 
A
-
 
I
-
 
T
-
 
E
-
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
R
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
V
G
 
G
C
x
G
D
|
D
V
|
V
S
 
S
D
 
K
R
 
A
E
 
A
A
 
D
L
 
A
T
 
Q
A
 
R
T
 
I
L
 
V
G
 
D
A
 
T
V
 
A
N
 
I
D
 
E
A
 
T
H
 
Y
G
 
G
R
 
R
F
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
S
M
x
G
W
 
V
N
x
Y
V
 
E
Y
 
F
E
 
A
P
 
P
L
 
I
A
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
T
P
 
E
E
 
E
S
 
H
L
 
Y
D
 
R
R
 
R
M
 
Q
V
 
F
S
 
D
V
 
T
G
 
N
F
 
V
S
 
F
G
 
G
V
 
V
I
 
L
W
 
L
G
 
T
M
 
T
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
V
P
 
K
L
 
H
M
 
L
A
 
G
A
 
E
S
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
A
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
V
 
V
S
 
V
A
 
T
Q
 
S
L
 
I
G
 
T
I
 
P
P
 
P
N
 
A
G
 
S
I
 
A
A
 
V
Y
|
Y
C
 
S
G
 
G
V
 
T
K
|
K
A
 
G
G
 
A
V
 
V
A
 
D
G
 
A
M
 
I
T
 
T
R
 
G
A
 
V
A
 
L
A
 
A
A
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
P
M
 
R
N
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
N
P
|
P
S
x
G
T
x
M
V
x
I
D
 
V
T
|
T
E
 
E
G
|
G
V
x
T
R
 
H
R
 
S
-
 
A
-
 
G
V
x
I
V
 
I
S
 
G
E
 
S
E
 
D
R
 
L
I
 
E
A
 
A
M
 
Q
R
 
V
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
E
T
 
P
E
 
N
D
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
S
A
 
V
V
 
A
R
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
C
 
S
D
 
D
D
 
D
S
 
A
D
 
R
F
 
W
V
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
M
 
H
L
 
L
T
 
V
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L

5epoA The three-dimensional structure of clostridium absonum 7alpha- hydroxysteroid dehydrogenase (see paper)
38% identity, 95% coverage: 10:254/258 of query aligns to 2:249/261 of 5epoA

query
sites
5epoA
R
 
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
I
V
 
V
T
 
T
G
x
S
A
 
S
S
x
T
R
|
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
S
A
 
A
A
 
E
L
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
M
 
L
V
 
V
A
 
Y
L
 
L
L
 
A
D
 
A
L
x
R
K
 
S
A
 
E
H
 
E
W
 
L
A
 
A
Q
 
N
A
 
E
A
 
V
A
 
I
D
 
A
E
 
D
I
 
I
I
 
K
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
K
 
V
A
 
A
V
 
K
G
 
F
L
 
V
G
 
Y
C
x
F
D
x
N
V
 
A
S
 
R
D
 
E
R
 
E
E
 
E
A
 
T
L
 
Y
T
 
T
A
 
S
T
 
M
L
 
V
G
 
E
A
 
K
V
 
V
N
 
A
D
 
E
A
 
A
H
 
E
G
 
G
R
 
R
F
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
-
x
Y
-
x
G
-
 
G
A
x
T
M
 
N
W
 
V
N
 
N
V
 
L
Y
 
D
E
 
K
P
 
N
L
 
L
A
 
T
A
 
A
I
 
G
R
 
D
P
 
T
E
 
D
S
 
E
L
 
F
D
 
F
R
 
R
M
 
I
V
 
L
S
 
K
V
 
D
G
 
N
F
 
V
S
 
Q
G
 
S
V
 
V
I
 
Y
W
 
L
G
 
P
M
 
A
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
I
P
 
P
L
 
H
M
 
M
A
 
E
A
 
K
S
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
x
T
V
 
I
S
x
G
A
 
S
Q
 
V
L
 
V
G
 
P
I
 
D
P
x
I
N
 
S
G
x
R
I
 
I
A
 
A
Y
|
Y
C
 
C
G
 
V
V
 
S
K
|
K
A
 
S
G
 
A
V
 
I
A
 
N
G
 
S
M
 
L
T
 
T
R
 
Q
A
 
N
A
 
I
A
 
A
A
 
L
E
 
Q
L
 
Y
G
 
A
A
 
R
M
 
K
N
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
L
P
|
P
S
x
G
T
 
L
V
x
I
D
 
G
T
|
T
E
x
R
G
x
A
V
x
A
R
 
L
R
 
E
V
x
N
V
x
M
S
 
T
E
 
D
E
 
E
R
x
F
I
 
R
A
 
D
M
 
S
R
 
F
I
 
L
G
 
G
Q
 
H
T
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
N
R
 
R
L
 
V
G
 
G
T
 
R
T
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
L
Y
 
Y
L
 
Y
A
 
A
C
 
S
D
 
D
D
 
D
S
 
S
D
 
G
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
M
M
 
I
L
 
H
T
 
E
V
 
V
D
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
F
A
 
A

G9FRD7 7alpha-hydroxysteroid dehydrogenase; 7alpha-HSDH; NADP-dependent 7alpha-hydroxysteroid dehydrogenase; EC 1.1.1.- from Clostridium sardiniense (Clostridium absonum) (see 2 papers)
38% identity, 95% coverage: 10:254/258 of query aligns to 3:250/262 of G9FRD7

query
sites
G9FRD7
R
 
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
I
V
 
V
T
 
T
G
x
S
A
x
S
S
x
T
R
|
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
S
A
 
A
A
 
E
L
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
M
 
L
V
 
V
A
 
Y
L
 
L
L
 
A
D
 
A
L
x
R
K
 
S
A
 
E
H
 
E
W
 
L
A
 
A
Q
 
N
A
 
E
A
 
V
A
 
I
D
 
A
E
 
D
I
 
I
I
 
K
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
K
 
V
A
 
A
V
 
K
G
 
F
L
 
V
G
 
Y
C
 
F
D
x
N
V
x
A
S
 
R
D
 
E
R
 
E
E
 
E
A
 
T
L
 
Y
T
 
T
A
 
S
T
 
M
L
 
V
G
 
E
A
 
K
V
 
V
N
 
A
D
 
E
A
 
A
H
 
E
G
 
G
R
 
R
F
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
-
 
Y
-
 
G
-
 
G
A
 
T
M
 
N
W
 
V
N
 
N
V
 
L
Y
 
D
E
 
K
P
 
N
L
 
L
A
 
T
A
 
A
I
 
G
R
 
D
P
 
T
E
 
D
S
 
E
L
 
F
D
 
F
R
 
R
M
 
I
V
 
L
S
 
K
V
 
D
G
 
N
F
 
V
S
 
Q
G
 
S
V
 
V
I
 
Y
W
 
L
G
 
P
M
 
A
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
I
P
 
P
L
 
H
M
 
M
A
 
E
A
 
K
S
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
x
T
V
 
I
S
 
G
A
 
S
Q
 
V
L
 
V
G
 
P
I
 
D
P
 
I
N
 
S
G
 
R
I
 
I
A
 
A
Y
|
Y
C
 
C
G
 
V
V
 
S
K
|
K
A
 
S
G
 
A
V
 
I
A
 
N
G
 
S
M
 
L
T
 
T
R
 
Q
A
 
N
A
 
I
A
 
A
A
 
L
E
 
Q
L
 
Y
G
 
A
A
 
R
M
 
K
N
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
L
P
 
P
S
 
G
T
 
L
V
x
I
D
x
G
T
|
T
E
x
R
G
x
A
V
 
A
R
 
L
R
 
E
V
 
N
V
 
M
S
 
T
E
 
D
E
 
E
R
 
F
I
 
R
A
 
D
M
 
S
R
 
F
I
 
L
G
 
G
Q
 
H
T
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
N
R
 
R
L
 
V
G
 
G
T
 
R
T
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
L
Y
 
Y
L
 
Y
A
 
A
C
 
S
D
 
D
D
 
D
S
 
S
D
 
G
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
M
M
 
I
L
 
H
T
 
E
V
 
V
D
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
F
A
 
A

Sites not aligning to the query:

8cxaA Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from mycobacterium smegmatis with bound NAD
36% identity, 95% coverage: 10:253/258 of query aligns to 2:248/251 of 8cxaA

query
sites
8cxaA
R
 
R
L
 
L
E
 
A
G
 
N
R
 
R
V
 
V
A
 
A
A
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
A
R
x
Q
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
I
T
 
Y
A
 
A
A
 
E
L
 
R
L
 
F
A
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
M
 
A
V
 
V
A
 
V
L
 
V
L
 
A
D
|
D
L
 
I
K
 
N
A
 
E
H
 
P
W
 
K
A
 
A
Q
 
T
A
 
E
A
 
V
A
 
A
D
 
S
E
 
S
I
 
I
I
 
T
A
 
S
A
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
R
A
 
A
V
 
I
G
 
A
L
 
A
G
 
A
C
 
V
D
 
D
V
|
V
S
 
S
D
 
D
R
 
V
E
 
E
A
 
S
L
 
V
T
 
N
A
 
R
T
 
M
L
 
V
G
 
D
A
 
S
V
 
A
N
 
V
D
 
E
A
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
T
F
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
-
x
A
M
 
I
W
 
F
N
x
S
V
 
T
Y
 
L
E
 
K
-
 
M
-
 
K
P
 
P
L
 
F
A
 
E
A
 
E
I
 
I
R
 
S
P
 
G
E
 
D
S
 
E
L
 
W
D
 
D
R
 
K
M
 
L
V
 
F
S
 
A
V
 
V
G
 
N
F
 
A
S
 
K
G
 
G
V
 
T
I
 
F
W
 
L
G
 
C
M
 
C
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
A
 
S
P
 
P
L
 
V
M
 
M
A
 
R
A
 
K
S
 
N
G
 
Q
G
 
Y
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
x
S
S
|
S
V
 
S
S
 
V
A
 
V
Q
 
V
L
 
T
G
 
G
I
 
R
P
 
P
N
 
N
G
 
Y
I
 
A
A
 
H
Y
|
Y
C
 
I
G
 
A
V
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
A
V
 
V
A
 
W
G
 
A
M
 
L
T
 
T
R
 
H
A
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
T
E
 
E
L
 
M
G
 
G
A
 
T
M
 
D
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
S
P
|
P
S
x
H
T
 
G
V
x
I
D
 
I
T
 
T
E
 
E
G
x
I
V
 
P
R
 
R
R
 
E
V
 
T
V
 
I
S
 
S
E
 
E
E
 
E
R
 
G
I
 
W
A
 
R
M
 
R
R
 
N
I
 
L
G
 
E
Q
 
E
T
 
Q
P
 
A
L
 
L
G
 
K
R
 
R
L
 
K
G
 
G
T
 
D
T
 
A
E
 
S
D
 
D
I
 
L
A
 
V
K
 
G
A
 
I
V
 
L
R
 
L
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
C
 
S
D
 
D
D
 
E
S
 
S
D
 
K
F
 
F
V
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
M
 
T
L
 
V
T
 
A
V
 
L
D
 
D
G
 
A
G
 
G
L
 
L

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
36% identity, 95% coverage: 9:253/258 of query aligns to 1:245/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
G
 
G
R
 
I
L
 
L
E
 
D
G
 
N
R
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
G
R
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
H
L
 
S
L
 
Y
A
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
M
 
K
V
 
V
A
 
I
L
 
V
L
 
S
D
|
D
L
x
I
K
 
N
A
 
E
H
 
D
W
 
H
A
 
G
Q
 
N
A
 
K
A
 
A
A
 
V
D
 
E
E
 
D
I
 
I
I
 
K
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
K
 
E
A
 
A
V
 
S
G
 
F
L
 
V
G
 
K
C
x
A
D
|
D
V
x
T
S
 
S
D
 
N
R
 
P
E
 
E
A
 
E
L
 
V
T
 
E
A
 
A
T
 
L
L
 
V
G
 
K
A
 
R
V
 
T
N
 
V
D
 
E
A
 
I
H
 
Y
G
 
G
R
 
R
F
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
M
 
G
W
 
I
N
 
G
V
 
G
Y
 
E
E
 
Q
P
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
G
-
 
D
I
 
Y
R
 
G
P
 
L
E
 
D
S
 
S
L
 
W
D
 
R
R
 
K
M
 
V
V
 
L
S
 
S
V
 
I
G
 
N
F
 
L
S
 
D
G
 
G
V
 
V
I
 
F
W
 
Y
G
 
G
M
 
C
Q
 
K
A
 
Y
A
 
E
A
 
L
P
 
E
L
 
Q
M
 
M
A
 
E
A
 
K
S
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
M
A
 
A
S
|
S
V
 
I
S
 
H
A
 
G
Q
 
I
L
 
V
G
 
A
I
 
A
P
 
P
N
 
L
G
 
S
I
 
S
A
 
A
Y
|
Y
C
 
T
G
 
S
V
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
A
V
 
V
A
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
N
A
 
I
A
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
A
 
Q
M
 
K
N
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
G
P
|
P
S
x
A
T
x
Y
V
x
I
D
 
E
T
 
T
E
 
P
G
x
L
V
 
L
R
 
E
R
 
S
V
 
L
V
 
T
S
 
K
E
 
E
E
 
M
R
 
K
I
 
E
A
 
A
M
 
L
R
 
-
I
 
I
G
 
S
Q
 
K
T
 
H
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
K
T
 
P
E
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
E
A
 
L
V
 
V
R
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
S
C
 
S
D
 
E
D
 
K
S
 
S
D
 
S
F
 
F
V
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
G
M
 
Y
L
 
Y
T
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
38% identity, 94% coverage: 11:252/258 of query aligns to 2:241/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
E
 
Q
G
 
N
R
 
R
V
 
V
A
 
A
A
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
S
 
A
R
 
S
G
 
G
L
x
M
G
 
G
R
 
K
A
 
Q
T
 
T
A
 
A
A
 
L
L
 
R
L
 
F
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
M
 
A
V
 
V
A
 
V
L
 
I
L
 
N
D
|
D
L
x
I
K
 
D
A
 
A
H
 
E
W
 
K
A
 
V
Q
 
R
A
 
A
A
 
T
A
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
F
I
 
S
A
 
A
A
 
R
G
 
G
G
 
H
K
 
R
A
 
V
V
 
L
G
 
G
L
 
A
G
 
V
C
 
A
D
 
D
V
x
I
S
 
G
D
 
N
R
 
K
E
 
A
A
 
A
L
 
V
T
 
D
A
 
G
T
 
M
L
 
V
G
 
K
A
 
Q
V
 
T
N
 
I
D
 
D
A
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
R
F
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
M
x
G
W
 
M
N
 
E
V
 
R
Y
 
A
E
 
G
P
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
K
I
 
L
R
 
S
P
 
E
E
 
A
S
 
D
L
 
W
D
 
D
R
 
V
M
 
T
V
 
I
S
 
N
V
 
V
G
 
N
F
 
L
S
 
K
G
 
G
V
 
T
I
 
F
W
 
L
G
 
C
M
 
T
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
A
 
H
P
 
G
L
 
H
M
 
M
A
 
V
A
 
E
S
 
N
G
 
K
G
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
V
 
-
S
 
R
A
 
A
Q
 
W
L
 
L
G
 
G
I
 
G
P
 
A
N
 
G
G
 
Q
I
 
T
A
 
P
Y
|
Y
C
 
S
G
 
S
V
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
V
G
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
R
A
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
R
M
 
A
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
G
T
 
L
V
x
I
D
 
H
T
 
T
E
 
P
G
 
-
V
 
M
R
 
W
R
 
D
V
 
E
V
 
L
S
 
P
E
 
E
E
 
K
R
 
D
I
 
Q
A
 
Q
M
 
F
R
 
L
I
 
L
G
 
S
Q
 
R
T
 
Q
P
 
P
L
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
E
T
 
P
E
 
D
D
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
N
A
 
T
V
 
L
R
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
C
 
D
D
 
D
D
 
D
S
 
S
D
 
G
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
M
 
V
L
 
L
T
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
38% identity, 94% coverage: 11:252/258 of query aligns to 3:242/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
L
 
I
E
 
Q
G
 
N
R
 
R
V
 
V
A
 
A
A
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
S
 
A
R
x
S
G
 
G
L
 
M
G
 
G
R
 
K
A
 
Q
T
 
T
A
 
A
A
 
L
L
 
R
L
 
F
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
M
 
A
V
 
V
A
 
V
L
 
I
L
 
N
D
|
D
L
 
I
K
 
D
A
 
A
H
 
E
W
 
K
A
 
V
Q
 
R
A
 
A
A
 
T
A
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
F
I
 
S
A
 
A
A
 
R
G
 
G
G
 
H
K
 
R
A
 
V
V
 
L
G
 
G
L
 
A
G
 
V
C
 
A
D
|
D
V
x
I
S
 
G
D
 
N
R
 
K
E
 
A
A
 
A
L
 
V
T
 
D
A
 
G
T
 
M
L
 
V
G
 
K
A
 
Q
V
 
T
N
 
I
D
 
D
A
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
R
F
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
M
 
G
W
 
M
N
 
E
V
 
R
Y
 
A
E
 
G
P
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
K
I
 
L
R
 
S
P
 
E
E
 
A
S
 
D
L
 
W
D
 
D
R
 
V
M
 
T
V
 
I
S
 
N
V
 
V
G
 
N
F
 
L
S
 
K
G
 
G
V
 
T
I
 
F
W
 
L
G
 
C
M
 
T
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
A
 
H
P
 
G
L
 
H
M
 
M
A
 
V
A
 
E
S
 
N
G
 
K
G
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
S
V
 
-
S
 
R
A
 
A
Q
 
W
L
 
L
G
 
G
I
 
G
P
 
A
N
 
G
G
 
Q
I
 
T
A
 
P
Y
|
Y
C
 
S
G
 
S
V
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
V
G
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
R
A
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
R
M
 
A
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
G
T
 
L
V
 
I
D
 
H
T
 
T
E
 
P
G
 
-
V
 
M
R
 
W
R
 
D
V
 
E
V
 
L
S
 
P
E
 
E
E
 
K
R
 
D
I
 
Q
A
 
Q
M
 
F
R
 
L
I
 
L
G
 
S
Q
 
R
T
 
Q
P
 
P
L
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
E
T
 
P
E
 
D
D
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
N
A
 
T
V
 
L
R
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
C
 
D
D
 
D
D
 
D
S
 
S
D
 
G
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
M
 
V
L
 
L
T
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6pejA Structure of sorbitol dehydrogenase from sinorhizobium meliloti 1021 bound to sorbitol
37% identity, 94% coverage: 10:252/258 of query aligns to 3:253/257 of 6pejA

query
sites
6pejA
R
 
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
S
A
 
A
A
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
S
 
A
R
 
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
F
A
 
A
A
 
E
L
 
A
L
 
Y
A
 
V
A
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
M
 
T
V
 
V
A
 
A
L
 
I
L
 
A
D
 
D
L
 
I
K
 
D
A
 
I
H
 
E
W
 
R
A
 
A
Q
 
R
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
D
 
A
E
 
E
I
 
I
I
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
P
K
 
A
A
 
A
V
 
Y
G
 
A
L
 
V
G
 
Q
C
 
M
D
 
D
V
 
V
S
 
T
D
 
R
R
 
Q
E
 
D
A
 
S
L
 
I
T
 
D
A
 
A
T
 
A
L
 
I
G
 
A
A
 
A
V
 
T
N
 
V
D
 
E
A
 
H
H
 
A
G
 
G
R
 
G
F
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
M
 
A
W
 
L
N
 
F
V
 
D
Y
 
L
E
 
A
P
 
P
L
 
I
A
 
V
A
 
E
I
 
I
R
 
T
P
 
R
E
 
E
S
 
S
L
 
Y
D
 
E
R
 
K
M
 
L
V
 
F
S
 
A
V
 
I
G
 
N
F
 
V
S
 
A
G
 
G
V
 
T
I
 
L
W
 
F
G
 
T
M
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
R
L
 
Q
M
 
M
A
 
I
A
 
A
S
 
Q
G
 
G
-
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
A
S
|
S
V
x
Q
S
 
A
A
 
G
Q
 
R
L
 
R
G
 
G
I
x
E
P
 
A
N
 
L
G
 
V
I
 
A
A
 
I
Y
|
Y
C
 
C
G
 
A
V
 
T
K
 
K
A
 
A
G
 
A
V
 
V
A
 
I
G
 
S
M
 
L
T
 
T
R
 
Q
A
 
S
A
 
A
A
 
G
A
 
L
E
 
D
L
 
L
G
 
I
A
 
K
M
 
H
N
 
R
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
A
P
 
P
S
 
G
T
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
G
E
 
E
-
x
H
-
x
W
-
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
D
R
 
A
V
 
L
V
x
F
S
 
A
E
 
R
E
 
Y
R
 
E
I
 
N
A
 
R
M
 
P
R
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
K
-
 
R
-
 
L
I
 
V
G
 
G
Q
 
E
-
 
A
T
 
V
P
 
P
L
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
M
G
 
G
T
 
T
T
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
T
K
 
G
A
 
M
V
 
A
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
C
 
S
D
 
A
D
 
E
S
 
S
D
 
D
F
 
Y
V
 
I
T
 
V
G
 
S
Q
 
Q
M
 
T
L
 
Y
T
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
36% identity, 94% coverage: 11:253/258 of query aligns to 3:245/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
|
S
R
|
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
D
T
 
I
A
 
A
A
 
I
L
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
M
 
N
V
 
I
A
 
F
L
 
F
-
x
N
L
x
Y
D
x
N
L
x
G
K
x
S
A
 
P
H
 
E
W
 
A
A
 
A
Q
 
E
A
 
E
A
 
T
A
 
A
D
 
K
E
 
L
I
 
V
I
 
A
A
 
E
A
 
H
G
 
G
G
 
V
K
 
E
A
 
V
V
 
E
G
 
A
L
 
M
G
 
K
C
 
A
D
x
N
V
|
V
S
 
A
D
 
I
R
 
A
E
 
E
A
 
D
L
 
V
T
 
D
A
 
A
T
 
F
L
 
F
G
 
K
A
 
Q
V
 
A
N
 
I
D
 
E
A
 
R
H
 
F
G
 
G
R
 
R
F
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
M
 
G
W
x
I
N
 
T
V
 
R
Y
 
D
E
 
N
P
 
L
L
 
L
A
 
M
A
 
R
I
 
M
R
 
K
P
 
E
E
 
D
S
 
E
L
 
W
D
 
D
R
 
D
M
 
V
V
 
I
S
 
N
V
x
I
G
 
N
F
 
L
S
 
K
G
 
G
V
 
T
I
 
F
W
 
L
G
 
C
M
 
T
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
A
 
S
P
 
R
L
 
T
M
 
M
A
 
M
A
 
K
S
 
Q
G
 
R
G
 
A
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
A
S
|
S
V
 
V
S
 
V
A
 
G
Q
 
L
L
 
I
G
 
G
I
 
N
P
 
A
N
 
G
G
x
Q
I
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
V
G
 
A
V
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
T
A
 
T
A
 
A
A
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
A
 
P
M
 
R
N
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
S
 
G
T
 
F
V
x
I
D
 
T
T
|
T
E
 
D
G
 
M
V
 
T
R
 
D
R
 
K
V
 
L
V
 
D
S
 
E
E
 
K
E
 
T
R
 
K
I
 
E
A
 
A
M
 
M
R
 
-
I
 
L
G
 
A
Q
 
Q
T
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
A
L
 
Y
G
 
G
T
 
T
T
 
T
E
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
C
 
S
D
 
D
D
 
A
S
 
S
D
 
K
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
M
 
T
L
 
L
T
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
35% identity, 95% coverage: 10:253/258 of query aligns to 5:245/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
R
 
K
L
 
L
E
 
A
G
 
S
R
 
K
V
 
T
A
 
A
A
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
A
R
|
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
F
A
 
G
T
 
I
A
 
A
A
 
Q
L
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
M
 
R
V
 
V
A
 
I
L
 
I
L
 
A
D
|
D
L
x
R
K
 
D
A
 
A
H
 
H
W
 
-
A
 
G
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
A
E
 
S
I
 
L
I
 
R
A
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
A
K
 
Q
A
 
A
V
 
L
G
 
F
L
 
I
G
 
S
C
|
C
D
 
N
V
x
I
S
 
A
D
 
E
R
 
K
E
 
T
A
 
Q
L
 
V
T
 
E
A
 
A
T
 
L
L
 
F
G
 
S
A
 
Q
V
 
A
N
 
E
D
 
E
A
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
P
F
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
M
x
G
W
x
I
N
 
N
V
 
R
Y
 
D
E
 
A
P
 
M
L
 
L
A
 
H
A
 
K
I
 
L
R
 
T
P
 
E
E
 
A
S
 
D
L
 
W
D
 
D
R
 
T
M
 
V
V
 
I
S
 
D
V
|
V
G
 
N
F
 
L
S
 
K
G
 
G
V
 
T
I
 
F
W
 
L
G
 
C
M
 
M
Q
 
Q
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
P
 
I
L
 
R
M
 
M
A
 
R
A
 
E
S
 
R
G
 
G
G
 
A
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
S
V
 
A
S
 
S
A
 
-
Q
 
W
L
 
L
G
 
G
I
 
N
P
 
V
N
 
G
G
 
Q
I
 
T
A
 
N
Y
|
Y
C
 
S
G
 
A
V
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
V
G
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
K
A
 
T
A
 
A
A
 
C
A
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
A
 
K
M
 
K
N
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
C
P
 
P
S
 
G
T
 
F
V
x
I
D
 
D
T
|
T
E
 
D
G
 
-
V
 
M
R
x
T
R
 
R
V
 
G
V
 
V
S
 
P
E
 
E
E
 
N
R
 
V
I
 
W
A
 
Q
M
 
I
R
 
M
I
 
V
G
 
S
Q
 
K
T
 
I
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
Y
L
 
A
G
 
G
T
 
E
T
 
A
E
 
K
D
 
D
I
 
V
A
 
G
K
 
E
A
 
C
V
 
V
R
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
C
 
S
D
 
D
D
 
G
S
 
A
D
 
R
F
 
Y
V
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
E
M
 
V
L
 
I
T
 
N
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
M

7djsD Crystal structure of isopiperitenol dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa complexed with NAD
40% identity, 96% coverage: 11:257/258 of query aligns to 3:251/251 of 7djsD

query
sites
7djsD
L
 
L
E
 
S
G
 
G
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
A
R
 
A
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
Q
L
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
V
M
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
V
L
 
A
D
|
D
L
|
L
K
 
D
A
 
S
H
 
A
W
 
G
A
 
G
Q
 
E
A
 
G
A
 
T
A
 
V
D
 
E
E
 
A
I
 
I
I
 
R
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
F
L
 
I
G
 
R
C
|
C
D
|
D
V
|
V
S
 
T
D
 
R
R
 
D
E
 
A
A
 
E
L
 
V
T
 
K
A
 
A
T
 
L
L
 
V
G
 
E
A
 
G
V
 
C
N
 
A
D
 
A
A
 
A
H
 
Y
G
 
G
R
 
R
F
 
L
D
 
D
V
 
Y
L
 
A
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
|
A
M
 
G
W
 
I
N
 
E
V
 
I
Y
 
E
E
 
Q
-
 
G
P
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
D
I
 
G
R
 
N
P
 
E
E
 
A
S
 
E
L
 
F
D
 
D
R
 
A
M
 
I
V
 
M
S
 
A
V
 
V
G
 
N
F
 
V
S
 
K
G
 
G
V
 
V
I
 
W
W
 
L
G
 
C
M
 
M
Q
 
K
A
 
H
A
 
Q
A
 
I
P
 
P
L
 
L
M
 
M
A
 
L
A
 
A
S
 
Q
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
V
 
V
S
 
A
A
 
G
Q
 
L
L
 
G
G
 
A
I
 
A
P
 
P
N
 
K
G
 
M
I
 
S
A
 
I
Y
|
Y
C
 
A
G
 
A
V
 
S
K
|
K
A
 
H
G
 
A
V
 
V
A
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
I
E
 
E
L
 
Y
G
 
A
A
 
K
M
 
K
N
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
C
P
 
P
S
x
A
T
x
V
V
 
I
D
 
D
T
 
T
E
 
D
G
 
M
V
 
F
R
 
R
R
 
R
V
 
A
V
 
Y
S
 
E
E
 
A
E
 
D
-
 
P
-
 
R
R
 
K
I
 
A
A
 
E
M
 
F
R
 
A
I
 
A
G
 
A
Q
 
M
T
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
V
G
 
G
T
 
R
T
 
V
E
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
L
Y
 
Y
L
 
L
A
 
C
C
 
S
D
 
D
D
 
N
S
 
A
D
 
G
F
 
F
V
 
T
T
 
T
G
 
G
Q
 
I
M
 
A
L
 
L
T
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
-
A
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
I

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
35% identity, 94% coverage: 11:253/258 of query aligns to 6:244/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
R
|
R
G
 
G
L
x
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
M
 
K
V
 
V
A
 
I
L
 
G
L
 
T
D
 
A
L
x
T
K
 
S
A
 
E
H
 
S
W
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
I
A
 
S
D
 
D
E
 
Y
I
 
L
I
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
D
K
 
N
A
 
G
V
 
K
G
 
G
L
 
M
G
 
A
C
 
L
D
x
N
V
|
V
S
 
T
D
 
N
R
 
P
E
 
E
A
 
S
L
 
I
T
 
E
A
 
A
T
 
V
L
 
L
G
 
K
A
 
A
V
 
I
N
 
T
D
 
D
A
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
G
F
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
M
 
G
W
x
I
N
 
T
V
 
R
Y
 
D
E
 
N
P
 
L
L
 
L
A
 
M
A
 
R
I
 
M
R
 
K
P
 
E
E
 
E
S
 
E
L
 
W
D
 
S
R
 
D
M
 
I
V
 
M
S
 
E
V
 
T
G
 
N
F
 
L
S
 
T
G
 
S
V
 
I
I
 
F
W
 
R
G
 
L
M
 
S
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
A
 
L
P
 
R
L
 
G
M
 
M
A
 
M
A
 
K
S
 
K
G
 
R
G
 
Q
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
V
A
 
G
S
|
S
V
 
V
S
 
V
A
 
G
Q
 
T
L
 
M
G
 
G
I
 
N
P
 
A
N
 
G
G
 
Q
I
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
A
G
 
A
V
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
G
 
G
M
 
F
T
 
T
R
 
K
A
 
S
A
 
M
A
 
A
A
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
A
 
S
M
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
A
P
|
P
S
x
G
T
 
F
V
x
I
D
 
E
T
|
T
E
 
D
G
x
M
V
 
T
R
 
K
R
 
A
V
 
L
V
 
N
S
 
D
E
 
E
E
 
Q
R
 
R
I
 
T
A
 
A
M
 
T
R
 
-
I
 
L
G
 
A
Q
 
Q
T
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
D
T
 
P
E
 
R
D
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
S
A
 
A
V
 
V
R
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
C
 
S
D
 
P
D
 
E
S
 
A
D
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
M
 
T
L
 
L
T
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M

4bo9A Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with 5-(2-(furan-2-ylmethoxy) phenyl)-2-phenyltetrazole at 2.9a resolution (see paper)
39% identity, 94% coverage: 11:253/258 of query aligns to 5:232/235 of 4bo9A

query
sites
4bo9A
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
R
 
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
L
L
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
R
E
 
L
G
 
G
A
 
A
M
 
V
V
 
V
A
 
I
L
 
G
L
 
T
D
 
A
L
 
T
K
 
S
A
 
A
H
 
S
W
 
G
A
 
A
Q
 
E
A
 
K
A
 
I
A
 
A
D
 
E
E
 
T
I
 
L
I
 
K
A
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
V
K
 
E
A
 
G
V
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
V
C
 
L
D
 
D
V
 
V
S
 
S
D
 
S
R
 
D
E
 
E
A
 
S
L
 
V
T
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
G
 
E
A
 
H
V
 
I
N
 
Q
D
 
Q
A
 
H
H
 
L
G
 
G
R
 
Q
F
 
P
D
 
L
V
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
M
 
E
W
 
W
N
 
F
-
 
D
-
 
V
V
|
V
Y
x
N
E
 
T
P
 
N
L
|
L
A
 
N
A
 
S
I
 
L
R
 
Y
P
 
-
E
 
-
S
 
R
L
 
L
D
 
S
R
 
K
M
 
A
V
 
V
S
 
L
V
 
R
G
 
G
F
 
M
S
 
T
G
 
K
V
 
A
I
 
R
W
 
W
G
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
L
 
-
M
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
G
S
|
S
V
 
V
S
 
V
A
 
G
Q
 
A
L
 
M
G
 
G
I
 
N
P
 
A
N
 
G
G
 
Q
I
 
T
A
 
N
Y
|
Y
C
 
A
G
 
A
V
 
A
K
|
K
A
 
A
G
|
G
V
 
L
A
 
E
G
|
G
M
x
F
T
 
T
R
 
R
A
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
G
A
 
S
M
 
R
N
 
A
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
G
T
 
F
V
 
I
D
 
D
T
 
T
E
 
D
G
 
M
V
 
T
R
 
R
R
 
E
V
 
L
V
 
P
S
 
E
E
 
A
E
 
Q
R
 
R
I
 
E
A
 
A
M
 
L
R
 
-
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
Q
T
 
A
E
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
V
V
 
V
R
 
G
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
C
 
S
D
 
D
D
 
G
S
 
A
D
 
A
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
M
 
T
L
 
V
T
 
P
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M

Query Sequence

>CCNA_01885 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_01885
MREEGTMAGRLEGRVAAVTGASRGLGRATAALLAAEGAMVALLDLKAHWAQAAADEIIAA
GGKAVGLGCDVSDREALTATLGAVNDAHGRFDVLVNNAMWNVYEPLAAIRPESLDRMVSV
GFSGVIWGMQAAAPLMAASGGGSIVNIASVSAQLGIPNGIAYCGVKAGVAGMTRAAAAEL
GAMNIRVNAVAPSTVDTEGVRRVVSEERIAMRIGQTPLGRLGTTEDIAKAVRYLACDDSD
FVTGQMLTVDGGLATALS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory