SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CCNA_01970 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_01970 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4y90A Crystal structure of triosephosphate isomerase from deinococcus radiodurans (see paper)
48% identity, 96% coverage: 11:253/253 of query aligns to 4:243/244 of 4y90A

query
sites
4y90A
L
 
L
I
 
L
A
 
A
G
 
L
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
K
L
 
T
S
 
P
V
 
T
A
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
S
V
 
W
A
 
A
A
 
E
A
 
E
L
 
L
E
 
T
A
 
T
K
 
K
P
 
Y
P
 
A
A
 
P
A
 
A
R
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
D
V
 
L
A
 
A
I
 
V
F
 
L
P
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
L
L
 
D
L
 
L
H
 
S
R
 
A
L
 
L
S
 
A
Q
 
A
A
 
N
V
 
L
E
 
P
G
 
-
A
 
A
H
 
G
L
 
I
L
 
A
T
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
D
 
D
C
 
V
H
 
S
G
 
A
K
 
H
S
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
Y
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
A
E
 
A
M
 
M
V
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
A
S
 
S
L
 
C
V
 
V
I
 
V
C
 
V
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
T
 
E
D
 
Y
H
 
H
G
 
D
E
 
E
T
 
S
S
 
D
A
 
A
Q
 
T
V
 
V
A
 
A
G
 
A
K
 
K
A
 
A
E
 
R
A
 
Q
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
A
 
N
G
 
G
L
 
L
E
 
L
P
 
P
I
 
I
V
 
V
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
N
L
 
L
E
 
D
T
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
A
 
H
V
 
V
S
 
P
F
 
Q
V
 
T
V
 
L
S
 
A
Q
 
Q
V
 
L
R
 
R
D
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
E
T
 
G
S
 
-
L
 
-
A
 
V
G
 
G
K
 
A
A
 
D
F
 
V
S
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
L
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
T
A
 
A
S
 
T
V
 
A
D
 
D
N
 
D
I
 
A
V
 
E
E
 
E
M
 
L
H
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
G
E
 
A
L
 
L
V
 
R
S
 
E
R
 
Q
F
 
Y
C
 
G
E
 
A
Q
 
R
G
 
A
R
 
E
T
 
G
V
 
I
L
 
R
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
E
N
 
N
A
 
I
R
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
C
A
 
G
A
 
K
P
 
P
E
 
N
V
 
V
G
 
N
G
 
G
A
 
A
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
V
K
 
P
D
 
D
F
 
V
L
 
L
A
 
G
I
 
M
I
 
L
Q
 
D
A
 
A
L
 
L

P27876 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
41% identity, 96% coverage: 9:251/253 of query aligns to 3:248/253 of P27876

query
sites
P27876
R
 
K
P
 
P
L
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
N
 
N
G
 
K
L
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
T
L
 
L
D
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
V
A
 
S
V
 
F
A
 
V
A
 
E
A
 
E
L
 
V
E
 
K
A
 
S
K
 
S
P
 
I
P
 
P
A
 
A
A
 
A
R
 
D
V
 
K
A
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
V
I
 
V
F
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
L
L
 
F
L
 
L
H
 
E
R
 
K
L
 
L
S
 
A
Q
 
S
A
 
A
V
 
V
E
 
K
G
 
G
A
 
T
H
 
D
L
 
L
L
 
K
T
 
V
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
M
H
 
H
G
 
F
K
 
E
S
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
A
V
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
L
G
 
G
G
 
V
S
 
D
L
 
Y
V
 
C
I
 
V
C
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
E
D
 
M
H
 
F
G
 
A
E
 
E
T
 
T
S
 
D
A
 
E
Q
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
K
K
 
K
A
 
A
E
 
H
A
 
A
A
 
A
A
 
F
A
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
I
E
 
V
P
 
P
I
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
E
T
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
A
 
T
V
 
N
S
 
D
F
 
L
V
 
V
V
 
A
S
 
D
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
D
 
K
S
 
G
L
 
L
P
 
A
-
 
G
-
 
L
T
 
S
S
 
E
L
 
E
A
 
Q
G
 
V
K
 
A
A
 
A
F
 
S
S
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
L
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
S
A
 
S
S
 
T
V
 
A
D
 
K
N
 
D
I
 
A
V
 
N
E
 
D
M
 
V
H
 
C
A
 
A
A
 
H
I
 
I
R
 
R
A
 
K
E
 
T
L
 
V
V
 
A
S
 
E
R
 
S
F
 
F
C
 
S
E
 
Q
Q
 
E
G
 
A
R
 
A
T
 
D
V
 
K
L
 
L
-
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
A
N
 
N
A
 
I
R
 
K
E
 
E
I
 
Y
L
 
M
A
 
A
A
 
E
P
 
S
E
 
D
V
 
I
G
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
A
 
P
K
 
Q
D
 
S
F
 
F
L
 
V
A
 
Q
I
 
L
I
 
L
Q
 
E

6neeB Crystal structure of a reconstructed ancestor of triosephosphate isomerase from eukaryotes (see paper)
41% identity, 96% coverage: 11:252/253 of query aligns to 7:250/252 of 6neeB

query
sites
6neeB
L
 
F
I
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
T
L
 
L
D
 
E
E
 
S
A
 
I
R
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
V
A
 
E
A
 
T
L
 
L
E
 
N
A
 
S
K
 
A
-
 
Q
-
 
L
P
 
D
P
 
P
A
 
N
A
 
T
R
 
E
V
 
V
A
 
V
I
 
V
F
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
A
T
 
I
L
 
Y
L
 
L
-
 
P
H
 
F
R
 
A
L
 
R
S
 
S
Q
 
K
A
 
L
V
 
K
E
 
K
G
 
P
A
 
K
H
 
E
L
 
I
L
 
Q
T
 
V
G
 
A
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
C
H
 
Y
G
 
T
K
 
K
S
 
P
S
 
N
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
A
E
 
E
M
 
M
V
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
L
G
 
G
G
 
V
S
 
P
L
 
W
V
 
V
I
 
I
C
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
D
 
I
H
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
S
S
 
D
A
 
E
Q
 
L
V
 
I
A
 
A
G
 
E
K
 
K
A
 
V
E
 
K
A
 
Y
A
 
A
A
 
L
A
 
D
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
E
 
K
P
 
V
I
 
I
V
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
E
T
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
A
 
T
V
 
M
S
 
E
F
 
V
V
 
V
V
 
A
S
 
R
Q
 
Q
V
 
I
R
 
L
D
 
K
S
 
A
L
 
I
P
 
A
T
 
D
S
 
K
L
 
I
A
 
-
G
 
-
K
 
K
A
 
D
F
 
W
S
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
L
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
V
A
 
A
S
 
T
V
 
P
D
 
E
N
 
Q
I
 
A
V
 
Q
E
 
E
M
 
V
H
 
H
A
 
A
A
 
A
I
 
L
R
 
R
A
 
K
E
 
W
L
 
L
V
 
K
S
 
E
R
 
N
F
 
V
C
 
S
-
 
P
E
 
E
Q
 
V
G
 
A
R
 
E
T
 
S
V
 
T
L
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
E
 
A
N
 
N
A
 
C
R
 
K
E
 
E
I
 
L
L
 
A
A
 
K
A
 
Q
P
 
P
E
 
D
V
 
I
G
 
D
G
 
G
A
 
F
L
|
L
V
|
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
A
K
 
P
D
 
E
F
 
F
L
 
V
A
 
D
I
 
I
I
 
I
Q
 
N
A
 
A

P00943 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see 2 papers)
43% identity, 96% coverage: 9:252/253 of query aligns to 3:249/253 of P00943

query
sites
P00943
R
 
K
P
 
P
L
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
N
x
H
G
x
K
L
 
T
S
 
L
V
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
A
 
A
R
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
Q
A
 
F
A
 
V
L
 
E
E
 
D
A
 
V
K
 
K
-
 
G
-
 
H
-
 
V
P
 
P
P
 
P
A
 
A
A
 
D
R
 
E
V
 
V
-
 
I
-
 
S
A
 
V
I
 
V
F
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
F
T
 
L
L
 
F
L
 
L
H
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
V
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
T
H
 
D
L
 
L
L
 
K
T
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
T
C
 
M
H
 
H
G
 
F
K
 
A
S
 
D
S
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
Y
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
M
V
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
L
G
 
G
G
 
V
S
 
T
L
 
Y
V
 
V
I
 
I
C
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
Q
D
 
M
H
 
F
G
 
A
E
 
E
T
 
T
S
 
D
A
 
E
Q
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
K
K
 
K
A
 
V
E
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
F
A
 
T
A
 
R
G
 
G
L
 
L
E
 
I
P
 
P
I
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
C
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
L
E
 
E
T
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
A
 
T
V
 
N
S
 
A
F
 
V
V
 
V
V
 
A
S
 
S
Q
 
Q
V
 
V
R
 
E
D
 
K
S
 
A
L
 
L
P
 
A
-
 
G
-
 
L
T
 
T
S
 
P
L
 
E
A
 
Q
G
 
V
K
 
K
A
 
Q
F
 
A
S
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
L
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
S
A
 
S
S
 
T
V
 
P
D
 
E
N
 
D
I
 
A
V
 
N
E
 
S
M
 
V
H
 
C
A
 
G
A
 
H
I
 
I
R
 
R
A
 
S
E
 
-
L
 
V
V
 
V
S
 
S
R
 
R
F
 
L
C
 
F
-
 
G
-
 
P
E
 
E
Q
 
A
G
 
A
R
 
E
T
 
A
V
 
I
L
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
D
N
 
N
A
 
I
R
 
R
E
 
D
I
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
P
 
Q
E
 
Q
V
 
I
G
 
D
G
 
G
A
 
P
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
A
 
P
K
 
A
D
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
Q
I
 
L
I
 
V
Q
 
E
A
 
A

1btmA Triosephosphate isomerase (tim) complexed with 2-phosphoglycolic acid (see paper)
43% identity, 96% coverage: 9:252/253 of query aligns to 2:248/251 of 1btmA

query
sites
1btmA
R
 
K
P
 
P
L
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
H
G
 
K
L
 
T
S
 
L
V
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
A
 
A
R
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
Q
A
 
F
A
 
V
L
 
E
E
 
D
A
 
V
K
 
K
-
 
G
-
 
H
-
 
V
P
 
P
P
 
P
A
 
A
A
 
D
R
 
E
V
 
V
-
 
I
-
 
S
A
 
V
I
 
V
F
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
F
T
 
L
L
 
F
L
 
L
H
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
V
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
T
H
 
D
L
 
L
L
 
K
T
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
T
C
 
M
H
 
H
G
 
F
K
 
A
S
 
D
S
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
Y
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
M
V
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
L
G
 
G
G
 
V
S
 
T
L
 
Y
V
 
V
I
 
I
C
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
T
 
Q
D
 
M
H
 
F
G
 
A
E
 
E
T
 
T
S
 
D
A
 
E
Q
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
K
K
 
K
A
 
V
E
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
F
A
 
T
A
 
R
G
 
G
L
 
L
E
 
I
P
 
P
I
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
C
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
L
E
 
E
T
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
A
 
T
V
 
N
S
 
A
F
 
V
V
 
V
V
 
A
S
 
S
Q
 
Q
V
 
V
R
 
E
D
 
K
S
 
A
L
 
L
P
 
A
-
 
G
-
 
L
T
 
T
S
 
P
L
 
E
A
 
Q
G
 
V
K
 
K
A
 
Q
F
 
A
S
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
L
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
S
A
 
S
S
 
T
V
 
P
D
 
E
N
 
D
I
 
A
V
 
N
E
 
S
M
 
V
H
 
C
A
 
G
A
 
H
I
 
I
R
 
R
A
 
S
E
 
-
L
 
V
V
 
V
S
 
S
R
 
R
F
 
L
C
 
F
-
 
G
-
 
P
E
 
E
Q
 
A
G
 
A
R
 
E
T
 
A
V
 
I
L
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
D
N
 
N
A
 
I
R
 
R
E
 
D
I
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
P
 
Q
E
 
Q
V
 
I
G
 
D
G
 
G
A
 
P
L
|
L
V
|
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
A
 
P
K
 
A
D
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
Q
I
 
L
I
 
V
Q
 
E
A
 
A

3taoA Structure of mycobacterium tuberculosis triosephosphate isomerase bound to phosphoglycolohydroxamate (see paper)
49% identity, 94% coverage: 9:246/253 of query aligns to 3:247/256 of 3taoA

query
sites
3taoA
R
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
-
 
L
G
 
N
L
 
H
S
 
Y
V
 
E
A
 
A
L
 
I
D
 
A
E
 
L
A
 
V
R
 
Q
A
 
K
V
 
I
A
 
A
A
 
F
A
 
S
L
 
L
E
 
P
A
 
D
K
 
K
P
 
Y
-
 
Y
P
 
D
A
 
R
A
 
V
R
 
D
V
 
V
A
 
A
I
 
V
F
 
I
P
 
P
P
 
P
A
 
F
T
 
T
L
 
D
L
 
L
H
x
R
R
x
S
L
 
V
S
 
Q
Q
x
T
A
 
L
V
 
V
E
 
D
G
 
G
A
 
D
H
 
K
L
 
L
-
 
R
L
 
L
T
 
T
-
 
Y
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
D
C
 
L
H
 
S
G
 
P
K
 
H
S
 
D
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
Y
T
 
T
G
 
G
D
 
D
V
 
V
S
 
S
A
 
G
E
 
A
M
 
F
V
 
L
A
 
A
D
 
K
A
 
L
G
 
G
G
 
C
S
 
S
L
 
Y
V
 
V
I
 
V
C
 
V
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
D
 
Y
H
 
H
G
 
N
E
 
E
T
 
D
S
 
D
A
 
A
Q
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
A
K
 
K
A
 
A
E
 
A
A
 
T
A
 
A
A
 
L
A
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
L
E
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
V
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
H
L
 
L
E
 
D
T
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
N
A
 
H
V
 
V
S
 
A
F
 
H
V
 
N
V
 
I
S
 
E
Q
 
Q
V
 
L
R
 
R
D
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
A
T
 
G
S
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
E
K
 
Q
A
 
I
F
 
G
S
 
S
V
 
V
-
 
V
-
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
L
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
R
 
R
T
 
V
A
 
A
S
 
S
V
 
A
D
 
A
N
 
D
I
 
A
V
 
Q
E
 
E
M
 
V
H
 
C
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
K
E
 
E
L
 
L
V
 
A
S
 
S
R
 
L
F
 
A
C
 
S
E
 
P
Q
 
R
-
 
I
G
 
A
R
 
D
T
 
T
V
 
V
L
 
R
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
E
 
K
N
 
N
A
 
V
R
 
G
E
 
D
I
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
Q
P
 
D
E
 
D
V
 
V
G
 
D
G
 
G
A
 
G
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
D
A
 
G
K
 
E
D
 
H
F
 
F

P9WG43 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
49% identity, 94% coverage: 9:246/253 of query aligns to 4:248/261 of P9WG43

query
sites
P9WG43
R
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
-
 
L
G
 
N
L
 
H
S
 
Y
V
 
E
A
 
A
L
 
I
D
 
A
E
 
L
A
 
V
R
 
Q
A
 
K
V
 
I
A
 
A
A
 
F
A
 
S
L
 
L
E
 
P
A
 
D
K
 
K
P
 
Y
-
 
Y
P
 
D
A
 
R
A
 
V
R
 
D
V
 
V
A
 
A
I
 
V
F
 
I
P
 
P
P
 
P
A
 
F
T
 
T
L
 
D
L
 
L
H
 
R
R
 
S
L
 
V
S
 
Q
Q
 
T
A
 
L
V
 
V
E
 
D
G
 
G
A
 
D
H
 
K
L
 
L
-
 
R
L
 
L
T
 
T
-
 
Y
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
D
C
 
L
H
 
S
G
 
P
K
 
H
S
 
D
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
Y
T
 
T
G
 
G
D
 
D
V
 
V
S
 
S
A
 
G
E
 
A
M
 
F
V
 
L
A
 
A
D
 
K
A
 
L
G
 
G
G
 
C
S
 
S
L
 
Y
V
 
V
I
 
V
C
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
D
 
Y
H
 
H
G
 
N
E
 
E
T
 
D
S
 
D
A
 
A
Q
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
A
K
 
K
A
 
A
E
 
A
A
 
T
A
 
A
A
 
L
A
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
L
E
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
V
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
H
L
 
L
E
 
D
T
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
N
A
 
H
V
 
V
S
 
A
F
 
H
V
 
N
V
 
I
S
 
E
Q
 
Q
V
 
L
R
 
R
D
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
A
T
 
G
S
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
E
K
 
Q
A
 
I
F
 
G
S
 
S
V
 
V
-
 
V
-
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
L
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
R
 
R
T
 
V
A
 
A
S
 
S
V
 
A
D
 
A
N
 
D
I
 
A
V
 
Q
E
 
E
M
 
V
H
 
C
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
K
E
 
E
L
 
L
V
 
A
S
 
S
R
 
L
F
 
A
C
 
S
E
 
P
Q
 
R
-
 
I
G
 
A
R
 
D
T
 
T
V
 
V
L
 
R
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
E
 
K
N
 
N
A
 
V
R
 
G
E
 
D
I
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
Q
P
 
D
E
 
D
V
 
V
G
 
D
G
 
G
A
 
G
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
D
A
 
G
K
 
E
D
 
H
F
 
F

3uwzA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-2-phosphate (see paper)
41% identity, 96% coverage: 10:251/253 of query aligns to 5:251/254 of 3uwzA

query
sites
3uwzA
P
 
P
L
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
K
L
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
T
L
 
V
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
D
V
 
F
A
 
V
A
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
P
A
 
T
K
 
L
P
 
P
P
 
D
A
 
S
A
 
K
R
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
S
A
 
V
I
 
I
F
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
I
L
 
Q
L
 
L
H
 
D
R
 
A
L
 
L
S
 
T
Q
 
T
A
 
A
V
 
V
E
 
K
G
 
E
A
 
G
H
 
K
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
L
 
L
L
 
E
T
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
T
H
 
Y
G
 
F
K
 
E
S
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
T
S
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
A
V
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
G
 
V
S
 
K
L
 
Y
V
 
V
I
 
V
C
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
T
 
E
D
 
L
H
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
S
 
D
A
 
E
Q
 
E
V
 
I
A
 
N
G
 
K
K
 
K
A
 
A
E
 
H
A
 
A
A
 
I
A
 
F
A
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
E
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
D
E
 
E
T
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
V
 
N
S
 
D
F
 
V
V
 
V
V
 
G
S
 
E
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
D
 
K
S
 
A
L
 
V
P
 
A
-
 
G
-
 
L
T
 
S
S
 
E
L
 
D
A
 
Q
G
 
L
K
 
K
A
 
S
F
 
V
S
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
L
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
S
A
 
S
S
 
T
V
 
S
D
 
E
N
 
D
I
 
A
V
 
N
E
 
E
M
 
M
H
 
C
A
 
A
A
 
F
I
 
V
R
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
A
 
A
E
 
D
L
 
L
V
 
S
S
 
S
R
 
K
F
 
-
C
 
-
E
 
E
Q
 
V
G
 
S
R
 
E
T
 
A
V
 
T
L
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
N
N
 
N
A
 
I
R
 
K
E
 
E
I
 
Y
L
 
M
A
 
A
A
 
Q
P
 
T
E
 
D
V
 
I
G
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
V
K
 
E
D
 
D
F
 
F
L
 
V
A
 
Q
I
 
L
I
 
L
Q
 
E

3uwwA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 3-phosphoglyceric acid (see paper)
41% identity, 96% coverage: 10:251/253 of query aligns to 5:251/254 of 3uwwA

query
sites
3uwwA
P
 
P
L
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
K
L
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
T
L
 
V
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
D
V
 
F
A
 
V
A
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
P
A
 
T
K
 
L
P
 
P
P
 
D
A
 
S
A
 
K
R
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
S
A
 
V
I
 
I
F
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
I
L
 
Q
L
 
L
H
 
D
R
 
A
L
 
L
S
 
T
Q
 
T
A
 
A
V
 
V
E
 
K
G
 
E
A
 
G
H
 
K
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
L
 
L
L
 
E
T
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
T
H
 
Y
G
 
F
K
 
E
S
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
T
S
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
A
V
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
G
 
V
S
 
K
L
 
Y
V
 
V
I
 
V
C
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
T
 
E
D
 
L
H
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
S
 
D
A
 
E
Q
 
E
V
 
I
A
 
N
G
 
K
K
 
K
A
 
A
E
 
H
A
 
A
A
 
I
A
 
F
A
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
E
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
D
E
 
E
T
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
V
 
N
S
 
D
F
 
V
V
 
V
V
 
G
S
 
E
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
D
 
K
S
 
A
L
 
V
P
 
A
-
 
G
-
 
L
T
 
S
S
 
E
L
 
D
A
 
Q
G
 
L
K
 
K
A
 
S
F
 
V
S
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
L
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
S
A
 
S
S
 
T
V
 
S
D
 
E
N
 
D
I
 
A
V
 
N
E
 
E
M
 
M
H
 
C
A
 
A
A
 
F
I
 
V
R
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
A
 
A
E
 
D
L
 
L
V
 
S
S
 
S
R
 
K
F
 
-
C
 
-
E
 
E
Q
 
V
G
 
S
R
 
E
T
 
A
V
 
T
L
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
|
V
K
 
K
P
 
P
E
 
N
N
 
N
A
 
I
R
 
K
E
 
E
I
 
Y
L
 
M
A
 
A
A
 
Q
P
 
T
E
 
D
V
 
I
G
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
V
K
 
E
D
 
D
F
 
F
L
 
V
A
 
Q
I
 
L
I
 
L
Q
 
E

3uwuA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-3-phosphate (see paper)
41% identity, 96% coverage: 10:251/253 of query aligns to 4:250/253 of 3uwuA

query
sites
3uwuA
P
 
P
L
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
K
L
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
T
L
 
V
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
D
V
 
F
A
 
V
A
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
P
A
 
T
K
 
L
P
 
P
P
 
D
A
 
S
A
 
K
R
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
S
A
 
V
I
 
I
F
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
I
L
 
Q
L
 
L
H
 
D
R
 
A
L
 
L
S
 
T
Q
 
T
A
 
A
V
 
V
E
 
K
G
 
E
A
 
G
H
 
K
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
L
 
L
L
 
E
T
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
T
H
 
Y
G
 
F
K
 
E
S
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
T
S
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
A
V
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
G
 
V
S
 
K
L
 
Y
V
 
V
I
 
V
C
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
T
 
E
D
 
L
H
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
S
 
D
A
 
E
Q
 
E
V
 
I
A
 
N
G
 
K
K
 
K
A
 
A
E
 
H
A
 
A
A
 
I
A
 
F
A
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
E
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
D
E
 
E
T
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
V
 
N
S
 
D
F
 
V
V
 
V
V
 
G
S
 
E
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
D
 
K
S
 
A
L
 
V
P
 
A
-
 
G
-
 
L
T
 
S
S
 
E
L
 
D
A
 
Q
G
 
L
K
 
K
A
 
S
F
 
V
S
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
L
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
S
A
 
S
S
 
T
V
 
S
D
 
E
N
 
D
I
 
A
V
 
N
E
 
E
M
 
M
H
 
C
A
 
A
A
 
F
I
 
V
R
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
A
 
A
E
 
D
L
 
L
V
 
S
S
 
S
R
 
K
F
 
-
C
 
-
E
 
E
Q
 
V
G
 
S
R
 
E
T
 
A
V
 
T
L
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
N
N
 
N
A
 
I
R
 
K
E
 
E
I
 
Y
L
 
M
A
 
A
A
 
Q
P
 
T
E
 
D
V
 
I
G
 
D
G
 
G
A
 
A
L
|
L
V
|
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
V
K
 
E
D
 
D
F
 
F
L
 
V
A
 
Q
I
 
L
I
 
L
Q
 
E

Q6GIL6 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Staphylococcus aureus (strain MRSA252) (see paper)
41% identity, 96% coverage: 10:251/253 of query aligns to 4:250/253 of Q6GIL6

query
sites
Q6GIL6
P
 
P
L
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
K
L
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
T
L
 
V
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
D
V
 
F
A
 
V
A
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
P
A
 
T
K
 
L
P
 
P
P
 
D
A
 
S
A
 
K
R
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
S
A
 
V
I
 
I
F
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
I
L
 
Q
L
 
L
H
 
D
R
 
A
L
 
L
S
 
T
Q
 
T
A
 
A
V
 
V
E
 
K
G
 
E
A
 
G
H
 
K
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
L
 
L
L
 
E
T
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
T
H
 
Y
G
 
F
K
 
E
S
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
T
S
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
A
V
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
G
 
V
S
 
K
L
 
Y
V
 
V
I
 
V
C
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
E
D
 
L
H
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
S
 
D
A
 
E
Q
 
E
V
 
I
A
 
N
G
 
K
K
 
K
A
 
A
E
 
H
A
 
A
A
 
I
A
 
F
A
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
E
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
D
E
 
E
T
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
V
 
N
S
 
D
F
 
V
V
 
V
V
 
G
S
 
E
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
D
 
K
S
 
A
L
 
V
P
 
A
-
 
G
-
 
L
T
 
S
S
 
E
L
 
D
A
 
Q
G
 
L
K
 
K
A
 
S
F
 
V
S
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
L
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
S
A
 
S
S
 
T
V
 
S
D
 
E
N
 
D
I
 
A
V
 
N
E
 
E
M
 
M
H
 
C
A
 
A
A
 
F
I
 
V
R
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
A
 
A
E
 
D
L
 
L
V
 
S
S
 
S
R
 
K
F
 
-
C
 
-
E
 
E
Q
 
V
G
 
S
R
 
E
T
 
A
V
 
T
L
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
N
N
 
N
A
 
I
R
 
K
E
 
E
I
 
Y
L
 
M
A
 
A
A
 
Q
P
 
T
E
 
D
V
 
I
G
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
V
K
 
E
D
 
D
F
 
F
L
 
V
A
 
Q
I
 
L
I
 
L
Q
 
E

3uwvA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 2-phosphoglyceric acid (see paper)
41% identity, 96% coverage: 10:251/253 of query aligns to 6:252/255 of 3uwvA

query
sites
3uwvA
P
 
P
L
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
K
L
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
T
L
 
V
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
D
V
 
F
A
 
V
A
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
P
A
 
T
K
 
L
P
 
P
P
 
D
A
 
S
A
 
K
R
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
S
A
 
V
I
 
I
F
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
I
L
 
Q
L
 
L
H
 
D
R
 
A
L
 
L
S
 
T
Q
 
T
A
 
A
V
 
V
E
 
K
G
 
E
A
 
G
H
 
K
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
L
 
L
L
 
E
T
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
T
H
 
Y
G
 
F
K
 
E
S
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
T
S
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
A
V
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
G
 
V
S
 
K
L
 
Y
V
 
V
I
 
V
C
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
T
 
E
D
 
L
H
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
S
 
D
A
 
E
Q
 
E
V
 
I
A
 
N
G
 
K
K
 
K
A
 
A
E
 
H
A
 
A
A
 
I
A
 
F
A
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
E
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
D
E
 
E
T
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
V
 
N
S
 
D
F
 
V
V
 
V
V
 
G
S
 
E
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
D
 
K
S
 
A
L
 
V
P
 
A
-
 
G
-
 
L
T
 
S
S
 
E
L
 
D
A
 
Q
G
 
L
K
 
K
A
 
S
F
 
V
S
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
L
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
S
A
 
S
S
 
T
V
 
S
D
 
E
N
 
D
I
 
A
V
 
N
E
 
E
M
 
M
H
 
C
A
 
A
A
 
F
I
 
V
R
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
A
 
A
E
 
D
L
 
L
V
 
S
S
 
S
R
 
K
F
 
-
C
 
-
E
 
E
Q
 
V
G
 
S
R
 
E
T
 
A
V
 
T
L
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
|
K
P
 
P
E
 
N
N
 
N
A
 
I
R
 
K
E
 
E
I
 
Y
L
 
M
A
 
A
A
 
Q
P
 
T
E
 
D
V
 
I
G
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
V
K
 
E
D
 
D
F
 
F
L
 
V
A
 
Q
I
 
L
I
 
L
Q
 
E

4mvaA 1.43 angstrom resolution crystal structure of triosephosphate isomerase (tpia) from escherichia coli in complex with acetyl phosphate. (see paper)
40% identity, 96% coverage: 9:252/253 of query aligns to 3:248/255 of 4mvaA

query
sites
4mvaA
R
 
H
P
 
P
L
 
L
I
 
V
A
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
L
N
 
N
G
 
G
L
 
S
S
 
R
V
 
H
A
 
M
L
 
V
D
 
H
E
 
E
A
 
L
R
 
V
A
 
S
V
 
N
A
 
L
A
 
R
A
 
K
L
 
E
E
 
L
A
 
A
K
 
G
P
 
V
P
 
A
A
 
G
A
 
C
R
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
I
F
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
E
T
 
M
L
 
Y
L
 
I
H
 
D
R
 
M
L
 
A
S
 
K
Q
 
R
A
 
E
V
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
S
H
 
H
L
 
I
L
 
M
T
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
V
H
 
D
G
 
L
K
 
N
S
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
T
S
 
S
A
 
A
E
 
A
M
 
M
V
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
I
G
 
G
G
 
A
S
 
Q
L
 
Y
V
 
I
I
 
I
C
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
D
 
Y
H
 
H
G
 
K
E
 
E
T
 
S
S
 
D
A
 
E
Q
 
L
V
 
I
A
 
A
G
 
K
K
 
K
A
 
F
E
 
A
A
 
V
A
 
L
A
 
K
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
E
 
T
P
 
P
I
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
E
E
 
A
T
 
E
R
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
A
 
T
V
 
E
S
 
E
F
 
V
V
 
C
V
 
A
S
 
R
Q
 
Q
V
 
I
R
 
D
D
 
A
S
 
V
L
 
L
P
 
K
T
 
T
S
 
Q
L
 
G
A
 
A
G
 
A
K
 
-
A
 
A
F
 
F
S
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
L
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
S
A
 
A
S
 
T
V
 
P
D
 
A
N
 
Q
I
 
A
V
 
Q
E
 
A
M
 
V
H
 
H
A
 
K
A
 
F
I
 
I
R
 
R
A
 
D
E
 
H
L
 
I
V
 
A
S
 
K
R
 
V
F
 
D
C
 
A
E
 
N
Q
 
I
G
 
A
R
 
E
T
 
Q
V
 
V
L
 
I
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
E
 
S
N
 
N
A
 
A
R
 
A
E
 
E
I
 
L
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
P
 
P
E
 
D
V
 
I
G
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
A
K
 
D
D
 
A
F
 
F
L
 
A
A
 
V
I
 
I
I
 
V
Q
 
K
A
 
A

B1XB85 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Escherichia coli (strain K12 / DH10B) (see paper)
40% identity, 96% coverage: 9:252/253 of query aligns to 3:248/255 of B1XB85

query
sites
B1XB85
R
 
H
P
 
P
L
 
L
I
 
V
A
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
L
N
 
N
G
 
G
L
 
S
S
 
R
V
 
H
A
 
M
L
 
V
D
 
H
E
 
E
A
 
L
R
 
V
A
 
S
V
 
N
A
 
L
A
 
R
A
 
K
L
 
E
E
 
L
A
 
A
K
 
G
P
 
V
P
 
A
A
 
G
A
 
C
R
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
I
F
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
E
T
 
M
L
 
Y
L
 
I
H
 
D
R
 
M
L
 
A
S
 
K
Q
 
R
A
 
E
V
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
S
H
 
H
L
 
I
L
 
M
T
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
V
H
 
D
G
 
L
K
 
N
S
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
T
S
 
S
A
 
A
E
 
A
M
 
M
V
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
I
G
 
G
G
 
A
S
 
Q
L
 
Y
V
 
I
I
 
I
C
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
D
 
Y
H
 
H
G
 
K
E
 
E
T
 
S
S
 
D
A
 
E
Q
 
L
V
 
I
A
 
A
G
 
K
K
 
K
A
 
F
E
 
A
A
 
V
A
 
L
A
 
K
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
E
 
T
P
 
P
I
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
E
E
 
A
T
 
E
R
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
A
 
T
V
 
E
S
 
E
F
 
V
V
 
C
V
 
A
S
 
R
Q
 
Q
V
 
I
R
 
D
D
 
A
S
 
V
L
 
L
P
 
K
T
 
T
S
 
Q
L
 
G
A
 
A
G
 
A
K
 
-
A
 
A
F
 
F
S
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
L
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
S
A
 
A
S
 
T
V
 
P
D
 
A
N
 
Q
I
 
A
V
 
Q
E
 
A
M
 
V
H
 
H
A
 
K
A
 
F
I
 
I
R
 
R
A
 
D
E
 
H
L
 
I
V
 
A
S
 
K
R
 
V
F
 
D
C
 
A
E
 
N
Q
 
I
G
 
A
R
 
E
T
 
Q
V
 
V
L
 
I
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
E
 
S
N
 
N
A
 
A
R
 
A
E
 
E
I
 
L
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
P
 
P
E
 
D
V
 
I
G
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
A
K
 
D
D
 
A
F
 
F
L
 
A
A
 
V
I
 
I
I
 
V
Q
 
K
A
 
A

4y96A Crystal structure of triosephosphate isomerase from gemmata obscuriglobus (see paper)
39% identity, 97% coverage: 7:252/253 of query aligns to 1:248/250 of 4y96A

query
sites
4y96A
T
 
T
P
 
R
R
 
K
P
 
K
L
 
F
I
 
V
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
-
L
 
-
S
 
-
V
 
T
A
 
T
L
 
L
D
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
V
E
 
A
A
 
K
K
 
G
P
 
V
P
 
T
A
 
D
A
 
D
R
 
R
V
 
V
-
 
T
-
 
V
A
 
A
I
 
V
F
 
F
P
 
P
P
 
P
A
 
Y
T
 
P
L
 
W
L
 
L
H
 
T
R
 
A
L
 
V
S
 
G
Q
 
E
A
 
V
V
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
S
H
 
P
L
 
V
L
 
A
T
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
D
C
 
V
H
 
S
G
 
S
K
 
E
S
 
K
S
 
K
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
P
E
 
A
M
 
M
V
 
L
A
 
L
D
 
E
A
 
T
G
 
G
G
 
C
S
 
K
L
 
Y
V
 
A
I
 
L
C
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
T
 
H
D
 
I
H
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
S
S
 
E
A
 
T
Q
 
F
V
 
I
A
 
N
G
 
H
K
 
K
A
 
V
E
 
H
A
 
T
A
 
A
A
 
L
A
 
E
A
 
E
G
 
G
L
 
L
E
 
S
P
 
V
I
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
M
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
A
T
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
R
G
 
G
Q
 
L
A
 
Q
V
 
E
S
 
R
F
 
V
V
 
F
V
 
Q
S
 
R
Q
 
Q
V
 
V
R
 
Y
D
 
A
S
 
A
L
 
C
P
 
-
T
 
A
S
 
G
L
 
L
A
 
T
G
 
D
K
 
E
A
 
Q
F
 
F
S
 
G
-
 
R
-
 
I
-
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
L
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
V
A
 
A
S
 
T
V
 
P
D
 
E
N
 
Q
I
 
A
V
 
Q
E
 
E
M
 
A
H
 
H
A
 
A
A
 
F
I
 
V
R
 
R
A
 
S
E
 
K
L
 
L
V
 
R
S
 
L
R
 
L
F
 
Y
C
x
G
E
 
D
Q
x
K
-
 
I
G
 
A
R
 
D
T
 
S
V
 
T
L
 
P
I
 
I
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
P
E
 
D
N
 
N
A
 
T
R
 
V
E
 
G
I
 
L
L
 
M
A
 
S
A
 
Q
P
 
P
E
 
D
V
 
V
G
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
A
K
 
D
D
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
I
I
 
V
Q
 
K
A
 
A

3uwzB Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-2-phosphate (see paper)
40% identity, 96% coverage: 10:251/253 of query aligns to 4:247/250 of 3uwzB

query
sites
3uwzB
P
 
P
L
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
K
L
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
T
L
 
V
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
D
V
 
F
A
 
V
A
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
P
A
 
T
K
 
L
P
 
P
P
 
D
A
 
S
A
 
K
R
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
S
A
 
V
I
 
I
F
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
I
L
 
Q
L
 
L
H
 
D
R
 
A
L
 
L
S
 
T
Q
 
T
A
 
A
V
 
V
E
 
K
G
 
E
A
 
G
H
 
K
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
L
 
L
L
 
E
T
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
T
H
 
Y
G
 
F
K
 
E
S
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
T
S
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
A
V
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
G
 
V
S
 
K
L
 
Y
V
 
V
I
 
V
C
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
T
 
E
D
 
L
H
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
S
 
D
A
 
E
Q
 
E
V
 
I
A
 
N
G
 
K
K
 
K
A
 
A
E
 
H
A
 
A
A
 
I
A
 
F
A
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
E
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
D
E
 
E
T
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
V
 
N
S
 
D
F
 
V
V
 
V
V
 
G
S
 
E
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
D
 
K
S
 
A
L
 
V
P
 
A
-
 
G
-
 
L
T
 
S
S
 
E
L
 
D
A
 
Q
G
 
L
K
 
K
A
 
S
F
 
V
S
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
L
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
K
T
 
S
A
 
S
S
 
T
V
 
S
D
 
E
N
 
D
I
 
A
V
 
N
E
 
E
M
 
M
H
 
C
A
 
A
A
 
F
I
 
V
R
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
A
 
A
E
 
D
L
 
L
V
 
S
S
 
S
R
 
K
F
 
-
C
 
-
E
 
E
Q
 
V
G
 
S
R
 
E
T
 
A
V
 
T
L
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
|
K
P
 
P
E
 
N
N
 
N
A
 
I
R
 
K
E
 
E
I
 
Y
L
x
M
A
|
A
A
x
Q
P
x
T
E
 
D
V
x
I
G
x
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
V
K
 
E
D
 
D
F
 
F
L
 
V
A
 
Q
I
 
L
I
 
L
Q
 
E

6bveA Triosephosphate isomerase of synechocystis in complex with 2- phosphoglycolic acid (see paper)
39% identity, 96% coverage: 9:250/253 of query aligns to 3:238/242 of 6bveA

query
sites
6bveA
R
 
K
P
 
I
L
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
H
G
 
K
L
 
T
S
 
Q
V
 
A
A
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
E
A
 
A
R
 
Q
A
 
A
V
 
F
A
 
L
A
 
Q
A
 
G
-
 
F
-
 
K
-
 
P
-
 
L
L
 
I
E
 
E
A
 
D
K
 
A
P
 
A
P
 
E
A
 
S
A
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
V
I
 
L
F
 
C
P
 
V
P
 
P
A
 
F
T
 
T
L
 
D
L
 
L
H
 
S
R
 
G
L
 
M
S
 
S
Q
 
Q
A
 
Q
V
 
L
E
 
H
G
 
G
A
 
G
H
 
R
L
 
V
L
 
R
T
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
V
H
 
H
G
 
W
K
 
E
S
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
Y
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
A
E
 
A
M
 
M
V
 
L
A
 
T
D
 
E
A
 
I
G
 
G
G
 
I
S
 
H
L
 
Y
V
 
V
I
 
V
C
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
T
 
Q
D
 
Y
H
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
T
S
 
D
A
 
E
Q
 
T
V
 
A
A
 
N
G
 
L
K
 
R
A
 
V
E
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
A
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
I
P
 
P
I
 
I
V
 
L
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
K
E
 
A
T
 
Q
R
 
R
E
 
D
A
 
A
G
 
G
Q
 
E
A
 
T
V
 
E
S
 
Q
F
 
V
V
 
I
V
 
V
S
 
D
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
D
 
K
S
 
G
L
 
L
P
 
-
T
 
V
S
 
N
L
 
V
A
 
D
G
 
Q
K
 
S
A
 
N
F
 
L
S
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
L
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
R
 
D
T
 
T
A
 
C
S
 
A
V
 
A
D
 
T
N
 
E
I
 
A
V
 
N
E
 
R
M
 
V
H
 
I
A
 
G
A
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
V
 
T
S
 
N
R
 
-
F
 
-
C
 
-
E
 
-
Q
 
-
G
 
-
R
 
S
T
 
Q
V
 
V
L
 
T
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
E
 
N
N
 
N
A
 
V
R
 
D
E
 
E
I
 
I
L
 
M
A
 
A
A
 
Q
P
 
P
E
 
E
V
 
I
G
 
D
G
 
G
A
 
A
L
|
L
V
|
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
A
 
P
K
 
Q
D
 
S
F
 
F
L
 
A
A
 
R
I
 
I
I
 
V

6oogA Crystal structure of triosephosphate isomerase from taenia solium in complex with 2pg (see paper)
37% identity, 97% coverage: 7:252/253 of query aligns to 4:250/252 of 6oogA

query
sites
6oogA
T
 
T
P
 
R
R
 
K
P
 
L
L
 
F
I
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
S
S
 
Y
V
 
S
A
 
H
L
 
I
D
 
N
E
 
T
A
 
F
R
 
F
A
 
D
V
 
T
A
 
L
A
 
Q
A
 
K
L
 
A
E
 
D
A
 
T
K
 
D
P
 
P
P
 
N
A
 
A
A
 
D
R
 
I
V
 
V
A
 
I
I
 
G
F
 
V
P
 
P
P
 
A
A
 
C
T
 
Y
L
 
L
L
 
K
H
 
Y
R
 
A
L
 
Q
S
 
D
Q
 
K
A
 
A
V
 
P
E
 
K
G
 
G
A
 
I
H
 
K
L
 
I
L
 
-
T
 
-
G
 
A
G
 
A
Q
 
E
D
 
N
C
 
C
H
 
Y
G
 
K
K
 
V
S
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
T
E
 
E
M
 
M
V
 
I
A
 
K
D
 
D
A
 
C
G
 
G
G
 
C
S
 
E
L
 
W
V
 
V
I
 
I
C
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
T
 
H
D
 
I
H
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
S
S
 
N
A
 
E
Q
 
L
V
 
I
A
 
G
G
 
E
K
 
K
A
 
V
E
 
K
A
 
H
A
 
A
A
 
L
A
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
N
P
 
V
I
 
I
V
 
P
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
L
L
 
L
E
 
S
T
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
A
 
T
V
 
N
S
 
D
F
 
V
V
 
C
V
 
F
S
 
A
Q
 
Q
-
 
M
-
 
D
-
 
A
V
 
I
R
 
A
D
 
K
S
 
N
L
 
V
P
 
P
T
 
S
S
 
K
L
 
E
A
 
A
G
 
W
K
 
D
A
 
K
F
 
V
S
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
L
 
V
W
 
W
A
 
A