SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CCNA_01990 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_01990 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P0CD76 UDP-3-O-acylglucosamine N-acyltransferase; EC 2.3.1.191 from Chlamydia trachomatis (strain D/UW-3/Cx) (see paper)
32% identity, 86% coverage: 42:331/339 of query aligns to 33:330/354 of P0CD76

query
sites
P0CD76
L
 
I
D
 
E
A
 
E
S
 
A
D
 
K
A
 
T
Q
 
A
A
 
H
I
 
I
T
 
T
F
 
F
F
 
L
S
 
D
D
 
N
A
 
E
K
 
K
R
 
Y
K
 
A
D
 
K
A
 
H
A
 
L
A
 
K
S
 
S
T
 
S
R
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
C
 
I
F
 
I
V
 
I
-
 
S
R
 
R
P
 
T
E
 
Q
H
 
F
Q
 
Q
G
 
K
F
 
Y
L
 
R
P
 
D
P
 
L
T
 
N
C
 
K
A
 
N
A
 
F
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
S
R
 
E
-
 
S
P
 
P
Q
 
S
A
 
L
A
 
V
W
 
F
A
 
Q
A
 
K
A
 
C
A
 
L
N
 
E
R
 
L
L
 
F
H
 
I
A
 
T
P
 
P
R
 
V
R
 
-
H
 
-
E
 
D
A
 
S
G
 
G
A
 
F
P
 
P
S
 
G
L
 
I
H
 
H
P
 
P
D
 
T
A
 
A
A
 
V
L
 
I
-
 
H
-
 
P
-
 
T
-
 
A
-
 
I
-
 
I
E
 
E
D
 
D
G
 
H
V
 
V
A
 
C
L
 
I
A
 
E
P
 
P
N
 
Y
V
 
A
T
 
V
I
 
V
G
 
C
Q
 
Q
G
 
H
A
 
A
S
 
H
I
 
V
G
 
G
R
 
S
G
 
A
T
 
C
R
 
H
I
 
I
G
 
G
P
 
S
G
 
G
V
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
G
 
Y
V
 
S
V
 
T
I
 
V
G
 
G
R
 
E
Y
 
H
C
 
S
R
 
Y
I
 
I
G
 
H
A
 
P
N
 
R
A
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
R
F
 
E
A
 
R
M
 
V
-
 
S
L
 
I
G
 
G
D
 
K
N
 
R
V
 
V
A
 
I
I
 
I
S
 
Q
A
 
P
G
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
S
A
 
C
G
 
G
F
 
F
G
 
G
A
 
Y
A
 
V
L
 
T
G
 
S
P
 
A
R
 
F
G
 
G
M
 
Q
-
 
H
V
 
K
D
 
H
L
 
L
P
 
K
Q
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
K
V
 
V
V
 
I
I
 
I
Q
 
E
D
 
D
N
 
D
V
 
V
T
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
T
C
 
T
V
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
R
F
 
F
G
 
K
D
 
H
T
 
S
T
 
V
I
 
V
G
 
R
E
 
E
N
 
G
T
 
S
K
 
K
I
 
I
D
|
D
N
 
N
L
 
L
V
 
V
H
x
Q
V
 
I
A
 
A
H
 
H
N
x
Q
V
 
V
R
 
E
I
 
V
G
 
G
R
 
Q
N
 
H
C
 
S
V
 
M
L
 
I
A
 
V
A
 
A
Y
 
Q
T
 
A
G
 
G
V
 
I
S
 
A
G
 
G
S
|
S
T
 
T
V
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
N
G
 
H
V
 
V
A
 
I
F
 
I
G
 
G
G
 
G
K
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
T
D
 
G
H
|
H
L
 
I
N
 
C
I
 
I
G
 
A
S
 
D
G
 
H
A
 
V
S
 
I
I
 
M
G
 
M
A
 
A
A
 
Q
A
 
T
S
 
G
V
 
V
F
 
T
K
 
K
D
 
S
V
 
I
P
 
T
D
 
S
G
 
P
E
 
G
T
 
I
W
 
Y
T
 
G
G
 
G
F
 
A
P
 
P
A
 
A
R
 
R
P
 
P
L
 
Y
K
 
Q
R
 
E
W
 
I
L
 
H
R
 
R
E
 
Q
T
 
V
A
 
A
W
 
K
L
 
V
S
 
R
R
 
N
M
 
L

2iu8A Chlamydia trachomatis lpxd with 25mm udpglcnac (complex i) (see paper)
32% identity, 86% coverage: 42:331/339 of query aligns to 33:330/346 of 2iu8A

query
sites
2iu8A
L
 
I
D
 
E
A
 
E
S
 
A
D
 
K
A
 
T
Q
 
A
A
 
H
I
 
I
T
 
T
F
 
F
F
 
L
S
 
D
D
 
N
A
 
E
K
 
K
R
 
Y
K
 
A
D
 
K
A
 
H
A
 
L
A
 
K
S
 
S
T
 
S
R
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
C
 
I
F
 
I
V
 
I
-
 
S
R
 
R
P
 
T
E
 
Q
H
 
F
Q
 
Q
G
 
K
F
 
Y
L
 
R
P
 
D
P
 
L
T
 
N
C
 
K
A
 
N
A
 
F
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
S
R
 
E
-
 
S
P
 
P
Q
 
S
A
 
L
A
 
V
W
 
F
A
 
Q
A
 
K
A
 
C
A
 
L
N
 
E
R
 
L
L
 
F
H
 
I
A
 
T
P
 
P
R
 
V
R
 
-
H
 
-
E
 
D
A
 
S
G
 
G
A
 
F
P
 
P
S
 
G
L
 
I
H
 
H
P
 
P
D
 
T
A
 
A
A
 
V
L
 
I
-
 
H
-
 
P
-
 
T
-
 
A
-
 
I
-
 
I
E
 
E
D
 
D
G
 
H
V
 
V
A
 
C
L
 
I
A
 
E
P
 
P
N
 
Y
V
 
A
T
 
V
I
 
V
G
 
C
Q
 
Q
G
 
H
A
 
A
S
 
H
I
 
V
G
 
G
R
 
S
G
 
A
T
 
C
R
 
H
I
 
I
G
 
G
P
 
S
G
 
G
V
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
G
 
Y
V
 
S
V
 
T
I
 
V
G
 
G
R
 
E
Y
 
H
C
 
S
R
 
Y
I
 
I
G
 
H
A
 
P
N
 
R
A
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
R
F
 
E
A
 
R
M
 
V
-
 
S
L
 
I
G
 
G
D
 
K
N
 
R
V
 
V
A
 
I
I
 
I
S
 
Q
A
 
P
G
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
S
A
 
C
G
 
G
F
|
F
G
|
G
A
 
Y
A
 
V
L
 
T
G
 
S
P
 
A
R
 
F
G
 
G
M
 
Q
-
 
H
V
 
K
D
 
H
L
 
L
P
 
K
Q
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
K
V
 
V
V
 
I
I
 
I
Q
 
E
D
 
D
N
 
D
V
 
V
T
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
T
C
 
T
V
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
R
F
 
F
G
 
K
D
 
H
T
 
S
T
 
V
I
 
V
G
 
R
E
 
E
N
 
G
T
 
S
K
 
K
I
 
I
D
|
D
N
 
N
L
 
L
V
 
V
H
x
Q
V
 
I
A
|
A
H
|
H
N
x
Q
V
 
V
R
 
E
I
 
V
G
 
G
R
 
Q
N
 
H
C
 
S
V
 
M
L
 
I
A
 
V
A
 
A
Y
 
Q
T
 
A
G
 
G
V
 
I
S
x
A
G
|
G
S
 
S
T
 
T
V
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
N
G
 
H
V
 
V
A
 
I
F
 
I
G
 
G
G
 
G
K
 
Q
A
 
A
G
|
G
V
 
I
A
x
T
D
x
G
H
|
H
L
 
I
N
 
C
I
 
I
G
 
A
S
 
D
G
 
H
A
 
V
S
 
I
I
 
M
G
 
M
A
|
A
A
x
Q
A
 
T
S
 
G
V
 
V
F
x
T
K
 
K
D
 
S
V
 
I
P
 
T
D
 
S
G
 
P
E
 
G
T
 
I
W
 
Y
T
 
G
G
 
G
F
 
A
P
 
P
A
 
A
R
 
R
P
 
P
L
 
Y
K
 
Q
R
 
E
W
 
I
L
 
H
R
 
R
E
 
Q
T
 
V
A
 
A
W
 
K
L
 
V
S
 
R
R
 
N
M
 
L

4ihgE Chasing acyl carrier protein through a catalytic cycle of lipid a production (see paper)
33% identity, 93% coverage: 15:328/339 of query aligns to 5:318/337 of 4ihgE

query
sites
4ihgE
L
 
L
S
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
L
A
 
D
A
 
A
T
 
E
L
 
L
A
 
H
D
 
G
A
 
D
A
 
-
L
 
-
G
 
G
E
 
D
R
 
I
V
 
V
I
 
I
T
 
T
H
 
G
A
 
V
A
 
A
P
 
S
L
 
M
D
 
Q
A
 
S
S
 
A
D
 
Q
A
 
T
Q
 
G
A
 
H
I
 
I
T
 
T
F
 
F
F
 
M
S
 
V
D
 
N
A
 
P
K
 
K
R
 
Y
K
 
R
D
 
E
A
 
H
A
 
L
A
 
G
S
 
L
T
 
C
R
 
Q
A
 
A
G
 
S
A
 
A
C
 
V
F
 
V
V
 
M
R
 
T
P
 
Q
E
 
D
H
 
D
Q
 
L
G
 
P
F
 
F
L
 
-
P
 
-
P
 
A
T
 
K
C
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
Q
 
Y
A
 
L
A
 
T
W
 
Y
A
 
A
A
 
R
A
 
M
A
 
A
N
 
Q
R
 
I
L
 
L
H
 
D
A
 
T
P
 
T
R
 
P
R
 
Q
H
 
P
E
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
A
P
 
Q
S
 
N
L
 
I
H
 
A
P
 
P
D
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
I
E
 
D
D
 
A
G
 
T
V
 
A
A
 
K
L
 
L
A
 
G
P
 
N
N
 
N
V
 
V
T
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
A
G
 
N
A
 
A
S
 
V
I
 
I
G
 
E
R
 
S
G
 
G
T
 
V
R
 
E
I
 
L
G
 
G
P
 
D
G
 
N
V
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
F
I
 
V
G
 
G
R
 
K
Y
 
N
C
 
S
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
W
-
 
A
N
 
N
A
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
Y
F
 
H
A
 
E
M
 
I
-
 
Q
L
 
I
G
 
G
D
 
Q
N
 
N
V
 
C
A
 
L
I
 
I
S
 
Q
A
 
S
G
 
G
A
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
A
A
 
D
G
 
G
F
 
F
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
L
 
N
G
 
D
P
 
R
R
 
G
G
 
N
M
 
W
V
 
V
D
 
K
L
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
I
I
 
I
Q
 
G
D
 
D
N
 
R
V
 
V
T
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
S
 
T
C
 
T
V
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
A
F
 
L
G
 
D
D
 
D
T
 
T
T
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
N
N
 
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
Q
V
 
C
H
 
Q
V
 
I
A
 
A
H
|
H
N
|
N
V
 
V
R
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
D
N
 
N
C
 
T
V
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
G
Y
 
G
T
 
V
G
 
I
V
 
M
S
 
A
G
|
G
S
 
S
T
 
L
V
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
A
 
M
F
 
I
G
 
G
G
 
G
K
 
A
A
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
N
D
 
G
H
 
H
L
 
M
N
 
E
I
 
I
G
 
C
S
 
D
G
 
K
A
 
V
S
 
T
I
 
V
G
 
T
A
 
G
A
 
M
A
 
G
S
 
M
V
 
V
F
 
M
K
 
R
D
 
P
V
 
I
P
 
T
D
 
E
-
 
P
G
 
G
E
 
V
T
 
Y
W
 
S
T
 
S
G
 
G
F
 
I
P
 
P
A
 
L
R
 
Q
P
 
P
L
 
N
K
 
K
R
 
V
W
 
W
L
 
-
R
|
R
E
 
K
T
 
T
A
|
A
W
 
A
L
 
L

6p8aA E.Coli lpxd in complex with compound 8.1 (see paper)
33% identity, 93% coverage: 15:328/339 of query aligns to 4:317/335 of 6p8aA

query
sites
6p8aA
L
 
L
S
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
L
A
 
D
A
 
A
T
 
E
L
 
L
A
 
H
D
 
G
A
 
D
A
 
-
L
 
-
G
 
G
E
 
D
R
 
I
V
 
V
I
 
I
T
 
T
H
 
G
A
 
V
A
 
A
P
 
S
L
 
M
D
 
Q
A
 
S
S
 
A
D
 
Q
A
 
T
Q
 
G
A
 
H
I
 
I
T
 
T
F
 
F
F
 
M
S
 
V
D
 
N
A
 
P
K
 
K
R
 
Y
K
 
R
D
 
E
A
 
H
A
 
L
A
 
G
S
 
L
T
 
C
R
 
Q
A
 
A
G
 
S
A
 
A
C
 
V
F
 
V
V
 
M
R
 
T
P
 
Q
E
 
D
H
 
D
Q
 
L
G
 
P
F
 
F
L
 
-
P
 
-
P
 
A
T
 
K
C
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
Q
 
Y
A
 
L
A
 
T
W
 
Y
A
 
A
A
 
R
A
 
M
A
 
A
N
 
Q
R
 
I
L
 
L
H
 
D
A
 
T
P
 
T
R
 
P
R
 
Q
H
 
P
E
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
A
P
 
Q
S
 
N
L
 
I
H
 
A
P
 
P
D
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
I
E
 
D
D
 
A
G
 
T
V
 
A
A
 
K
L
 
L
A
 
G
P
 
N
N
 
N
V
 
V
T
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
A
G
 
N
A
 
A
S
 
V
I
 
I
G
 
E
R
 
S
G
 
G
T
 
V
R
 
E
I
 
L
G
 
G
P
 
D
G
 
N
V
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
F
I
 
V
G
 
G
R
 
K
Y
 
N
C
 
S
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
W
-
 
A
N
 
N
A
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
Y
F
 
H
A
 
E
M
 
I
-
 
Q
L
 
I
G
 
G
D
 
Q
N
 
N
V
 
C
A
 
L
I
 
I
S
 
Q
A
 
S
G
 
G
A
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
A
A
 
D
G
 
G
F
|
F
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
L
 
N
G
 
D
P
 
R
R
 
G
G
 
N
M
 
W
V
 
V
D
 
K
L
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
I
I
 
I
Q
 
G
D
 
D
N
 
R
V
 
V
T
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
S
 
T
C
 
T
V
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
A
F
 
L
G
 
D
D
 
D
T
 
T
T
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
N
N
 
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
Q
V
 
C
H
 
Q
V
 
I
A
 
A
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
D
N
 
N
C
 
T
V
x
A
L
 
V
A
|
A
A
 
G
Y
 
G
T
 
V
G
x
I
V
 
M
S
x
A
G
 
G
S
 
S
T
 
L
V
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
A
x
M
F
x
I
G
|
G
G
 
G
K
 
A
A
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
N
D
 
G
H
 
H
L
 
M
N
 
E
I
 
I
G
 
C
S
 
D
G
 
K
A
 
V
S
 
T
I
 
V
G
x
T
A
x
G
A
 
M
A
 
G
S
 
M
V
 
V
F
 
M
K
 
R
D
 
P
V
 
I
P
 
T
D
 
E
-
 
P
G
 
G
E
 
V
T
 
Y
W
 
S
T
 
S
G
 
G
F
 
I
P
 
P
A
 
L
R
 
Q
P
 
P
L
 
N
K
 
K
R
 
V
W
 
W
L
 
-
R
 
R
E
 
K
T
 
T
A
 
A
W
 
A
L
 
L

6p89A E.Coli lpxd in complex with compound 7 (see paper)
33% identity, 93% coverage: 15:328/339 of query aligns to 4:317/335 of 6p89A

query
sites
6p89A
L
 
L
S
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
L
A
 
D
A
 
A
T
 
E
L
 
L
A
 
H
D
 
G
A
 
D
A
 
-
L
 
-
G
 
G
E
 
D
R
 
I
V
 
V
I
 
I
T
 
T
H
 
G
A
 
V
A
 
A
P
 
S
L
 
M
D
 
Q
A
 
S
S
 
A
D
 
Q
A
 
T
Q
 
G
A
 
H
I
 
I
T
 
T
F
 
F
F
 
M
S
 
V
D
 
N
A
 
P
K
 
K
R
 
Y
K
 
R
D
 
E
A
 
H
A
 
L
A
 
G
S
 
L
T
 
C
R
 
Q
A
 
A
G
 
S
A
 
A
C
 
V
F
 
V
V
 
M
R
 
T
P
 
Q
E
 
D
H
 
D
Q
 
L
G
 
P
F
 
F
L
 
-
P
 
-
P
 
A
T
 
K
C
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
Q
 
Y
A
 
L
A
 
T
W
 
Y
A
 
A
A
 
R
A
 
M
A
 
A
N
 
Q
R
 
I
L
 
L
H
 
D
A
 
T
P
 
T
R
 
P
R
 
Q
H
 
P
E
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
A
P
 
Q
S
 
N
L
 
I
H
 
A
P
 
P
D
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
I
E
 
D
D
 
A
G
 
T
V
 
A
A
 
K
L
 
L
A
 
G
P
 
N
N
 
N
V
 
V
T
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
A
G
 
N
A
 
A
S
 
V
I
 
I
G
 
E
R
 
S
G
 
G
T
 
V
R
 
E
I
 
L
G
 
G
P
 
D
G
 
N
V
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
F
I
 
V
G
 
G
R
 
K
Y
 
N
C
 
S
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
W
-
 
A
N
 
N
A
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
Y
F
 
H
A
 
E
M
 
I
-
 
Q
L
 
I
G
 
G
D
 
Q
N
 
N
V
 
C
A
 
L
I
 
I
S
 
Q
A
 
S
G
 
G
A
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
A
A
 
D
G
 
G
F
|
F
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
L
 
N
G
 
D
P
 
R
R
 
G
G
 
N
M
 
W
V
 
V
D
 
K
L
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
I
I
 
I
Q
 
G
D
 
D
N
 
R
V
 
V
T
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
S
 
T
C
 
T
V
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
A
F
 
L
G
 
D
D
 
D
T
 
T
T
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
N
N
 
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
Q
V
 
C
H
 
Q
V
 
I
A
 
A
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
D
N
 
N
C
 
T
V
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
G
Y
 
G
T
 
V
G
x
I
V
 
M
S
x
A
G
 
G
S
 
S
T
 
L
V
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
A
x
M
F
x
I
G
|
G
G
 
G
K
 
A
A
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
N
D
 
G
H
 
H
L
 
M
N
 
E
I
 
I
G
 
C
S
 
D
G
 
K
A
 
V
S
 
T
I
 
V
G
x
T
A
x
G
A
 
M
A
 
G
S
 
M
V
 
V
F
 
M
K
 
R
D
 
P
V
 
I
P
 
T
D
 
E
-
 
P
G
 
G
E
 
V
T
 
Y
W
 
S
T
 
S
G
 
G
F
 
I
P
 
P
A
 
L
R
 
Q
P
 
P
L
 
N
K
 
K
R
 
V
W
 
W
L
 
-
R
 
R
E
 
K
T
 
T
A
 
A
W
 
A
L
 
L

6p88A E.Coli lpxd in complex with compound 6 (see paper)
33% identity, 93% coverage: 15:328/339 of query aligns to 4:317/335 of 6p88A

query
sites
6p88A
L
 
L
S
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
L
A
 
D
A
 
A
T
 
E
L
 
L
A
 
H
D
 
G
A
 
D
A
 
-
L
 
-
G
 
G
E
 
D
R
 
I
V
 
V
I
 
I
T
 
T
H
 
G
A
 
V
A
 
A
P
 
S
L
 
M
D
 
Q
A
 
S
S
 
A
D
 
Q
A
 
T
Q
 
G
A
 
H
I
 
I
T
 
T
F
 
F
F
 
M
S
 
V
D
 
N
A
 
P
K
 
K
R
 
Y
K
 
R
D
 
E
A
 
H
A
 
L
A
 
G
S
 
L
T
 
C
R
 
Q
A
 
A
G
 
S
A
 
A
C
 
V
F
 
V
V
 
M
R
 
T
P
 
Q
E
 
D
H
 
D
Q
 
L
G
 
P
F
 
F
L
 
-
P
 
-
P
 
A
T
 
K
C
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
Q
 
Y
A
 
L
A
 
T
W
 
Y
A
 
A
A
 
R
A
 
M
A
 
A
N
 
Q
R
 
I
L
 
L
H
 
D
A
 
T
P
 
T
R
 
P
R
 
Q
H
 
P
E
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
A
P
 
Q
S
 
N
L
 
I
H
 
A
P
 
P
D
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
I
E
 
D
D
 
A
G
 
T
V
 
A
A
 
K
L
 
L
A
 
G
P
 
N
N
 
N
V
 
V
T
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
A
G
 
N
A
 
A
S
 
V
I
 
I
G
 
E
R
 
S
G
 
G
T
 
V
R
 
E
I
 
L
G
 
G
P
 
D
G
 
N
V
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
F
I
 
V
G
 
G
R
 
K
Y
 
N
C
 
S
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
W
-
 
A
N
 
N
A
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
Y
F
 
H
A
 
E
M
 
I
-
 
Q
L
 
I
G
 
G
D
 
Q
N
 
N
V
 
C
A
 
L
I
 
I
S
 
Q
A
 
S
G
 
G
A
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
A
A
 
D
G
 
G
F
|
F
G
 
G
A
x
Y
A
 
A
L
 
N
G
 
D
P
 
R
R
 
G
G
 
N
M
 
W
V
 
V
D
 
K
L
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
I
I
 
I
Q
 
G
D
 
D
N
 
R
V
 
V
T
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
S
 
T
C
 
T
V
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
A
F
 
L
G
 
D
D
 
D
T
 
T
T
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
N
N
 
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
Q
V
 
C
H
 
Q
V
 
I
A
 
A
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
D
N
 
N
C
 
T
V
 
A
L
 
V
A
|
A
A
 
G
Y
 
G
T
 
V
G
x
I
V
 
M
S
x
A
G
 
G
S
 
S
T
 
L
V
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
A
x
M
F
 
I
G
 
G
G
 
G
K
 
A
A
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
N
D
 
G
H
 
H
L
 
M
N
 
E
I
 
I
G
 
C
S
 
D
G
 
K
A
 
V
S
 
T
I
 
V
G
 
T
A
x
G
A
 
M
A
 
G
S
 
M
V
 
V
F
 
M
K
 
R
D
 
P
V
 
I
P
 
T
D
 
E
-
 
P
G
 
G
E
 
V
T
 
Y
W
 
S
T
 
S
G
 
G
F
 
I
P
 
P
A
 
L
R
 
Q
P
 
P
L
 
N
K
 
K
R
 
V
W
 
W
L
 
-
R
 
R
E
 
K
T
 
T
A
 
A
W
 
A
L
 
L

6p87A E.Coli lpxd in complex with compound 5 (see paper)
33% identity, 93% coverage: 15:328/339 of query aligns to 4:317/335 of 6p87A

query
sites
6p87A
L
 
L
S
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
L
A
 
D
A
 
A
T
 
E
L
 
L
A
 
H
D
 
G
A
 
D
A
 
-
L
 
-
G
 
G
E
 
D
R
 
I
V
 
V
I
 
I
T
 
T
H
 
G
A
 
V
A
 
A
P
 
S
L
 
M
D
 
Q
A
 
S
S
 
A
D
 
Q
A
 
T
Q
 
G
A
 
H
I
 
I
T
 
T
F
 
F
F
 
M
S
 
V
D
 
N
A
 
P
K
 
K
R
 
Y
K
 
R
D
 
E
A
 
H
A
 
L
A
 
G
S
 
L
T
 
C
R
 
Q
A
 
A
G
 
S
A
 
A
C
 
V
F
 
V
V
 
M
R
 
T
P
 
Q
E
 
D
H
 
D
Q
 
L
G
 
P
F
 
F
L
 
-
P
 
-
P
 
A
T
 
K
C
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
Q
 
Y
A
 
L
A
 
T
W
 
Y
A
 
A
A
 
R
A
 
M
A
 
A
N
 
Q
R
 
I
L
 
L
H
 
D
A
 
T
P
 
T
R
 
P
R
 
Q
H
 
P
E
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
A
P
 
Q
S
 
N
L
 
I
H
 
A
P
 
P
D
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
I
E
 
D
D
 
A
G
 
T
V
 
A
A
 
K
L
 
L
A
 
G
P
 
N
N
 
N
V
 
V
T
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
A
G
 
N
A
 
A
S
 
V
I
 
I
G
 
E
R
 
S
G
 
G
T
 
V
R
 
E
I
 
L
G
 
G
P
 
D
G
 
N
V
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
F
I
 
V
G
 
G
R
 
K
Y
 
N
C
 
S
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
W
-
 
A
N
 
N
A
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
Y
F
 
H
A
 
E
M
 
I
-
 
Q
L
 
I
G
 
G
D
 
Q
N
 
N
V
 
C
A
 
L
I
 
I
S
 
Q
A
 
S
G
 
G
A
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
A
A
 
D
G
 
G
F
|
F
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
L
 
N
G
 
D
P
 
R
R
 
G
G
 
N
M
 
W
V
 
V
D
 
K
L
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
I
I
 
I
Q
 
G
D
 
D
N
 
R
V
 
V
T
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
S
 
T
C
 
T
V
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
A
F
 
L
G
 
D
D
 
D
T
 
T
T
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
N
N
 
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
Q
V
 
C
H
 
Q
V
 
I
A
 
A
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
D
N
 
N
C
 
T
V
 
A
L
 
V
A
|
A
A
 
G
Y
 
G
T
 
V
G
x
I
V
 
M
S
x
A
G
 
G
S
 
S
T
 
L
V
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
A
x
M
F
 
I
G
|
G
G
|
G
K
 
A
A
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
N
D
 
G
H
 
H
L
 
M
N
 
E
I
 
I
G
 
C
S
 
D
G
 
K
A
 
V
S
 
T
I
 
V
G
x
T
A
x
G
A
 
M
A
 
G
S
 
M
V
 
V
F
 
M
K
 
R
D
 
P
V
 
I
P
 
T
D
 
E
-
 
P
G
 
G
E
 
V
T
 
Y
W
 
S
T
 
S
G
 
G
F
 
I
P
 
P
A
 
L
R
 
Q
P
 
P
L
 
N
K
 
K
R
 
V
W
 
W
L
 
-
R
 
R
E
 
K
T
 
T
A
 
A
W
 
A
L
 
L

6p86A E.Coli lpxd in complex with compound 4.1 (see paper)
33% identity, 93% coverage: 15:328/339 of query aligns to 4:317/335 of 6p86A

query
sites
6p86A
L
 
L
S
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
L
A
 
D
A
 
A
T
 
E
L
 
L
A
 
H
D
 
G
A
 
D
A
 
-
L
 
-
G
 
G
E
 
D
R
 
I
V
 
V
I
 
I
T
 
T
H
 
G
A
 
V
A
 
A
P
 
S
L
 
M
D
 
Q
A
 
S
S
 
A
D
 
Q
A
 
T
Q
 
G
A
 
H
I
 
I
T
 
T
F
 
F
F
 
M
S
 
V
D
 
N
A
 
P
K
 
K
R
 
Y
K
 
R
D
 
E
A
 
H
A
 
L
A
 
G
S
 
L
T
 
C
R
 
Q
A
 
A
G
 
S
A
 
A
C
 
V
F
 
V
V
 
M
R
 
T
P
 
Q
E
 
D
H
 
D
Q
 
L
G
 
P
F
 
F
L
 
-
P
 
-
P
 
A
T
 
K
C
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
Q
 
Y
A
 
L
A
 
T
W
 
Y
A
 
A
A
 
R
A
 
M
A
 
A
N
 
Q
R
 
I
L
 
L
H
 
D
A
 
T
P
 
T
R
 
P
R
 
Q
H
 
P
E
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
A
P
 
Q
S
 
N
L
 
I
H
 
A
P
 
P
D
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
I
E
 
D
D
 
A
G
 
T
V
 
A
A
 
K
L
 
L
A
 
G
P
 
N
N
 
N
V
 
V
T
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
A
G
 
N
A
 
A
S
 
V
I
 
I
G
 
E
R
 
S
G
 
G
T
 
V
R
 
E
I
 
L
G
 
G
P
 
D
G
 
N
V
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
F
I
 
V
G
 
G
R
 
K
Y
 
N
C
 
S
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
W
-
 
A
N
 
N
A
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
Y
F
 
H
A
 
E
M
 
I
-
 
Q
L
 
I
G
 
G
D
 
Q
N
 
N
V
 
C
A
 
L
I
 
I
S
 
Q
A
 
S
G
 
G
A
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
A
A
 
D
G
 
G
F
|
F
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
L
 
N
G
 
D
P
 
R
R
 
G
G
 
N
M
 
W
V
 
V
D
 
K
L
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
I
I
 
I
Q
 
G
D
 
D
N
 
R
V
 
V
T
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
S
 
T
C
 
T
V
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
A
F
 
L
G
 
D
D
 
D
T
 
T
T
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
N
N
 
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
Q
V
 
C
H
 
Q
V
 
I
A
 
A
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
D
N
 
N
C
 
T
V
x
A
L
 
V
A
|
A
A
 
G
Y
 
G
T
 
V
G
x
I
V
 
M
S
x
A
G
 
G
S
 
S
T
 
L
V
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
A
 
M
F
 
I
G
|
G
G
|
G
K
 
A
A
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
N
D
 
G
H
 
H
L
 
M
N
 
E
I
 
I
G
 
C
S
 
D
G
 
K
A
 
V
S
 
T
I
 
V
G
x
T
A
x
G
A
 
M
A
 
G
S
 
M
V
 
V
F
 
M
K
 
R
D
 
P
V
 
I
P
 
T
D
 
E
-
 
P
G
 
G
E
 
V
T
 
Y
W
 
S
T
 
S
G
 
G
F
 
I
P
 
P
A
 
L
R
 
Q
P
 
P
L
 
N
K
 
K
R
 
V
W
 
W
L
 
-
R
 
R
E
 
K
T
 
T
A
 
A
W
 
A
L
 
L

6p85A E.Coli lpxd in complex with compound 3 (see paper)
33% identity, 93% coverage: 15:328/339 of query aligns to 4:317/335 of 6p85A

query
sites
6p85A
L
 
L
S
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
L
A
 
D
A
 
A
T
 
E
L
 
L
A
 
H
D
 
G
A
 
D
A
 
-
L
 
-
G
 
G
E
 
D
R
 
I
V
 
V
I
 
I
T
 
T
H
 
G
A
 
V
A
 
A
P
 
S
L
 
M
D
 
Q
A
 
S
S
 
A
D
 
Q
A
 
T
Q
 
G
A
 
H
I
 
I
T
 
T
F
 
F
F
 
M
S
 
V
D
 
N
A
 
P
K
 
K
R
 
Y
K
 
R
D
 
E
A
 
H
A
 
L
A
 
G
S
 
L
T
 
C
R
 
Q
A
 
A
G
 
S
A
 
A
C
 
V
F
 
V
V
 
M
R
 
T
P
 
Q
E
 
D
H
 
D
Q
 
L
G
 
P
F
 
F
L
 
-
P
 
-
P
 
A
T
 
K
C
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
Q
 
Y
A
 
L
A
 
T
W
 
Y
A
 
A
A
 
R
A
 
M
A
 
A
N
 
Q
R
 
I
L
 
L
H
 
D
A
 
T
P
 
T
R
 
P
R
 
Q
H
 
P
E
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
A
P
 
Q
S
 
N
L
 
I
H
 
A
P
 
P
D
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
I
E
 
D
D
 
A
G
 
T
V
 
A
A
 
K
L
 
L
A
 
G
P
 
N
N
 
N
V
 
V
T
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
A
G
 
N
A
 
A
S
 
V
I
 
I
G
 
E
R
 
S
G
 
G
T
 
V
R
 
E
I
 
L
G
 
G
P
 
D
G
 
N
V
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
F
I
 
V
G
 
G
R
 
K
Y
 
N
C
 
S
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
W
-
 
A
N
 
N
A
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
Y
F
 
H
A
 
E
M
 
I
-
 
Q
L
 
I
G
 
G
D
 
Q
N
 
N
V
 
C
A
 
L
I
 
I
S
 
Q
A
 
S
G
 
G
A
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
A
A
 
D
G
 
G
F
|
F
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
L
 
N
G
 
D
P
 
R
R
 
G
G
 
N
M
 
W
V
 
V
D
 
K
L
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
I
I
 
I
Q
 
G
D
 
D
N
 
R
V
 
V
T
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
S
 
T
C
 
T
V
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
A
F
 
L
G
 
D
D
 
D
T
 
T
T
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
N
N
 
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
Q
V
 
C
H
 
Q
V
 
I
A
 
A
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
D
N
 
N
C
 
T
V
 
A
L
 
V
A
|
A
A
 
G
Y
 
G
T
 
V
G
x
I
V
 
M
S
x
A
G
 
G
S
 
S
T
 
L
V
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
A
 
M
F
 
I
G
|
G
G
|
G
K
 
A
A
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
N
D
 
G
H
 
H
L
 
M
N
 
E
I
 
I
G
 
C
S
 
D
G
 
K
A
 
V
S
 
T
I
 
V
G
 
T
A
x
G
A
 
M
A
 
G
S
 
M
V
 
V
F
 
M
K
 
R
D
 
P
V
 
I
P
 
T
D
 
E
-
 
P
G
 
G
E
 
V
T
 
Y
W
 
S
T
 
S
G
 
G
F
 
I
P
 
P
A
 
L
R
 
Q
P
 
P
L
 
N
K
 
K
R
 
V
W
 
W
L
 
-
R
 
R
E
 
K
T
 
T
A
 
A
W
 
A
L
 
L

6p84A E.Coli lpxd in complex with compound 2o (see paper)
33% identity, 93% coverage: 15:328/339 of query aligns to 4:317/335 of 6p84A

query
sites
6p84A
L
 
L
S
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
L
A
 
D
A
 
A
T
 
E
L
 
L
A
 
H
D
 
G
A
 
D
A
 
-
L
 
-
G
 
G
E
 
D
R
 
I
V
 
V
I
 
I
T
 
T
H
 
G
A
 
V
A
 
A
P
 
S
L
 
M
D
 
Q
A
 
S
S
 
A
D
 
Q
A
 
T
Q
 
G
A
 
H
I
 
I
T
 
T
F
 
F
F
 
M
S
 
V
D
 
N
A
 
P
K
 
K
R
 
Y
K
 
R
D
 
E
A
 
H
A
 
L
A
 
G
S
 
L
T
 
C
R
 
Q
A
 
A
G
 
S
A
 
A
C
 
V
F
 
V
V
 
M
R
 
T
P
 
Q
E
 
D
H
 
D
Q
 
L
G
 
P
F
 
F
L
 
-
P
 
-
P
 
A
T
 
K
C
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
Q
 
Y
A
 
L
A
 
T
W
 
Y
A
 
A
A
 
R
A
 
M
A
 
A
N
 
Q
R
 
I
L
 
L
H
 
D
A
 
T
P
 
T
R
 
P
R
 
Q
H
 
P
E
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
A
P
 
Q
S
 
N
L
 
I
H
 
A
P
 
P
D
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
I
E
 
D
D
 
A
G
 
T
V
 
A
A
 
K
L
 
L
A
 
G
P
 
N
N
 
N
V
 
V
T
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
A
G
 
N
A
 
A
S
 
V
I
 
I
G
 
E
R
 
S
G
 
G
T
 
V
R
 
E
I
 
L
G
 
G
P
 
D
G
 
N
V
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
F
I
 
V
G
 
G
R
 
K
Y
 
N
C
 
S
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
W
-
 
A
N
 
N
A
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
Y
F
 
H
A
 
E
M
 
I
-
 
Q
L
 
I
G
 
G
D
 
Q
N
 
N
V
 
C
A
 
L
I
 
I
S
 
Q
A
 
S
G
 
G
A
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
A
A
 
D
G
 
G
F
|
F
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
L
 
N
G
 
D
P
 
R
R
 
G
G
 
N
M
 
W
V
 
V
D
 
K
L
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
I
I
 
I
Q
 
G
D
 
D
N
 
R
V
 
V
T
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
S
 
T
C
 
T
V
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
A
F
 
L
G
 
D
D
 
D
T
 
T
T
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
N
N
 
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
Q
V
 
C
H
 
Q
V
 
I
A
 
A
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
D
N
 
N
C
 
T
V
 
A
L
 
V
A
|
A
A
 
G
Y
 
G
T
 
V
G
x
I
V
 
M
S
x
A
G
 
G
S
 
S
T
 
L
V
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
A
x
M
F
x
I
G
|
G
G
|
G
K
 
A
A
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
N
D
 
G
H
 
H
L
 
M
N
 
E
I
 
I
G
 
C
S
 
D
G
 
K
A
 
V
S
 
T
I
 
V
G
 
T
A
 
G
A
 
M
A
 
G
S
 
M
V
 
V
F
 
M
K
 
R
D
 
P
V
 
I
P
 
T
D
 
E
-
 
P
G
 
G
E
 
V
T
 
Y
W
 
S
T
 
S
G
 
G
F
 
I
P
 
P
A
 
L
R
 
Q
P
 
P
L
 
N
K
 
K
R
 
V
W
 
W
L
 
-
R
 
R
E
 
K
T
 
T
A
 
A
W
 
A
L
 
L

6p83A E.Coli lpxd in complex with compound 1o (see paper)
33% identity, 93% coverage: 15:328/339 of query aligns to 4:317/335 of 6p83A

query
sites
6p83A
L
 
L
S
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
L
A
 
D
A
 
A
T
 
E
L
 
L
A
 
H
D
 
G
A
 
D
A
 
-
L
 
-
G
 
G
E
 
D
R
 
I
V
 
V
I
 
I
T
 
T
H
 
G
A
 
V
A
 
A
P
 
S
L
 
M
D
 
Q
A
 
S
S
 
A
D
 
Q
A
 
T
Q
 
G
A
 
H
I
 
I
T
 
T
F
 
F
F
 
M
S
 
V
D
 
N
A
 
P
K
 
K
R
 
Y
K
 
R
D
 
E
A
 
H
A
 
L
A
 
G
S
 
L
T
 
C
R
 
Q
A
 
A
G
 
S
A
 
A
C
 
V
F
 
V
V
 
M
R
 
T
P
 
Q
E
 
D
H
 
D
Q
 
L
G
 
P
F
 
F
L
 
-
P
 
-
P
 
A
T
 
K
C
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
Q
 
Y
A
 
L
A
 
T
W
 
Y
A
 
A
A
 
R
A
 
M
A
 
A
N
 
Q
R
 
I
L
 
L
H
 
D
A
 
T
P
 
T
R
 
P
R
 
Q
H
 
P
E
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
A
P
 
Q
S
 
N
L
 
I
H
 
A
P
 
P
D
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
I
E
 
D
D
 
A
G
 
T
V
 
A
A
 
K
L
 
L
A
 
G
P
 
N
N
 
N
V
 
V
T
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
A
G
 
N
A
 
A
S
 
V
I
 
I
G
 
E
R
 
S
G
 
G
T
 
V
R
 
E
I
 
L
G
 
G
P
 
D
G
 
N
V
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
F
I
 
V
G
 
G
R
 
K
Y
 
N
C
 
S
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
W
-
 
A
N
 
N
A
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
Y
F
 
H
A
 
E
M
 
I
-
 
Q
L
 
I
G
 
G
D
 
Q
N
 
N
V
 
C
A
 
L
I
 
I
S
 
Q
A
 
S
G
 
G
A
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
A
A
 
D
G
 
G
F
|
F
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
L
 
N
G
 
D
P
 
R
R
 
G
G
 
N
M
 
W
V
 
V
D
 
K
L
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
I
I
 
I
Q
 
G
D
 
D
N
 
R
V
 
V
T
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
S
 
T
C
 
T
V
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
A
F
 
L
G
 
D
D
 
D
T
 
T
T
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
N
N
 
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
Q
V
 
C
H
 
Q
V
 
I
A
 
A
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
D
N
 
N
C
 
T
V
 
A
L
 
V
A
|
A
A
 
G
Y
 
G
T
 
V
G
x
I
V
 
M
S
x
A
G
 
G
S
 
S
T
 
L
V
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
A
x
M
F
x
I
G
|
G
G
|
G
K
 
A
A
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
N
D
 
G
H
 
H
L
 
M
N
 
E
I
 
I
G
 
C
S
 
D
G
 
K
A
 
V
S
 
T
I
x
V
G
 
T
A
 
G
A
 
M
A
 
G
S
 
M
V
 
V
F
 
M
K
 
R
D
 
P
V
 
I
P
 
T
D
 
E
-
 
P
G
 
G
E
 
V
T
 
Y
W
 
S
T
 
S
G
 
G
F
 
I
P
 
P
A
 
L
R
 
Q
P
 
P
L
 
N
K
 
K
R
 
V
W
 
W
L
 
-
R
 
R
E
 
K
T
 
T
A
 
A
W
 
A
L
 
L

P21645 UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)glucosamine N-acyltransferase; UDP-3-O-(3-OHC14)-GlcN N-acyltransferase; Protein FirA; Rifampicin resistance protein; UDP-3-O-(3-hydroxytetradecanoyl)glucosamine N-acyltransferase; EC 2.3.1.191 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
33% identity, 93% coverage: 15:328/339 of query aligns to 6:319/341 of P21645

query
sites
P21645
L
 
L
S
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
L
A
 
D
A
 
A
T
 
E
L
 
L
A
 
H
D
 
G
A
 
D
A
 
-
L
 
-
G
 
G
E
 
D
R
 
I
V
 
V
I
 
I
T
 
T
H
 
G
A
 
V
A
 
A
P
 
S
L
 
M
D
 
Q
A
 
S
S
 
A
D
 
Q
A
 
T
Q
 
G
A
 
H
I
 
I
T
 
T
F
|
F
F
 
M
S
 
V
D
 
N
A
 
P
K
 
K
R
 
Y
K
 
R
D
 
E
A
 
H
A
 
L
A
 
G
S
 
L
T
 
C
R
 
Q
A
 
A
G
 
S
A
 
A
C
 
V
F
 
V
V
 
M
R
 
T
P
 
Q
E
 
D
H
 
D
Q
 
L
G
 
P
F
 
F
L
 
-
P
 
-
P
 
A
T
 
K
C
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
Q
 
Y
A
 
L
A
 
T
W
 
Y
A
 
A
A
 
R
A
 
M
A
 
A
N
 
Q
R
 
I
L
 
L
H
 
D
A
 
T
P
 
T
R
 
P
R
 
Q
H
 
P
E
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
A
P
 
Q
S
 
N
L
 
I
H
 
A
P
 
P
D
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
I
E
 
D
D
 
A
G
 
T
V
 
A
A
 
K
L
 
L
A
 
G
P
 
N
N
 
N
V
 
V
T
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
A
G
 
N
A
 
A
S
 
V
I
 
I
G
 
E
R
 
S
G
 
G
T
 
V
R
 
E
I
 
L
G
 
G
P
 
D
G
 
N
V
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
F
I
 
V
G
 
G
R
 
K
Y
 
N
C
 
S
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
W
-
 
A
N
 
N
A
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
Y
F
 
H
A
 
E
M
 
I
-
x
Q
L
 
I
G
 
G
D
 
Q
N
 
N
V
 
C
A
 
L
I
 
I
S
 
Q
A
 
S
G
 
G
A
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
A
A
 
D
G
 
G
F
 
F
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
L
 
N
G
 
D
P
 
R
R
 
G
G
 
N
M
 
W
V
 
V
D
 
K
L
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
I
I
 
I
Q
 
G
D
 
D
N
 
R
V
 
V
T
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
S
 
T
C
 
T
V
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
A
F
 
L
G
 
D
D
 
D
T
 
T
T
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
N
N
x
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
Q
V
 
C
H
 
Q
V
 
I
A
 
A
H
|
H
N
 
N
V
 
V
R
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
D
N
 
N
C
 
T
V
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
G
Y
x
G
T
 
V
G
 
I
V
 
M
S
 
A
G
 
G
S
 
S
T
 
L
V
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
A
 
M
F
 
I
G
 
G
G
 
G
K
 
A
A
x
S
G
 
V
V
 
I
A
 
N
D
 
G
H
|
H
L
 
M
N
 
E
I
 
I
G
 
C
S
 
D
G
 
K
A
 
V
S
 
T
I
 
V
G
 
T
A
 
G
A
 
M
A
 
G
S
x
M
V
 
V
F
x
M
K
 
R
D
 
P
V
 
I
P
 
T
D
 
E
-
 
P
G
 
G
E
 
V
T
 
Y
W
 
S
T
 
S
G
 
G
F
 
I
P
 
P
A
 
L
R
 
Q
P
 
P
L
 
N
K
 
K
R
 
V
W
 
W
L
 
-
R
 
R
E
 
K
T
 
T
A
 
A
W
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4ihhE Chasing acyl carrier protein through a catalytic cycle of lipid a production (see paper)
33% identity, 93% coverage: 15:328/339 of query aligns to 7:320/340 of 4ihhE

query
sites
4ihhE
L
 
L
S
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
L
A
 
D
A
 
A
T
 
E
L
 
L
A
 
H
D
 
G
A
 
D
A
 
-
L
 
-
G
 
G
E
 
D
R
 
I
V
 
V
I
 
I
T
 
T
H
 
G
A
 
V
A
 
A
P
 
S
L
 
M
D
 
Q
A
 
S
S
 
A
D
 
Q
A
 
T
Q
 
G
A
 
H
I
 
I
T
 
T
F
 
F
F
 
M
S
 
V
D
 
N
A
 
P
K
 
K
R
 
Y
K
 
R
D
 
E
A
 
H
A
 
L
A
 
G
S
 
L
T
 
C
R
 
Q
A
 
A
G
 
S
A
 
A
C
 
V
F
 
V
V
 
M
R
 
T
P
 
Q
E
 
D
H
 
D
Q
 
L
G
 
P
F
 
F
L
 
-
P
 
-
P
 
A
T
 
K
C
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
Q
 
Y
A
 
L
A
 
T
W
 
Y
A
 
A
A
 
R
A
 
M
A
 
A
N
 
Q
R
 
I
L
 
L
H
 
D
A
 
T
P
 
T
R
 
P
R
 
Q
H
 
P
E
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
A
P
 
Q
S
 
N
L
 
I
H
 
A
P
 
P
D
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
I
E
 
D
D
 
A
G
 
T
V
 
A
A
 
K
L
 
L
A
 
G
P
 
N
N
 
N
V
 
V
T
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
A
G
 
N
A
 
A
S
 
V
I
 
I
G
 
E
R
 
S
G
 
G
T
 
V
R
 
E
I
 
L
G
 
G
P
 
D
G
 
N
V
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
F
I
 
V
G
 
G
R
 
K
Y
 
N
C
 
S
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
W
-
 
A
N
 
N
A
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
Y
F
 
H
A
 
E
M
 
I
-
 
Q
L
 
I
G
 
G
D
 
Q
N
 
N
V
 
C
A
 
L
I
 
I
S
 
Q
A
 
S
G
 
G
A
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
A
A
 
D
G
 
G
F
 
F
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
L
 
N
G
 
D
P
 
R
R
 
G
G
 
N
M
 
W
V
 
V
D
 
K
L
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
I
I
 
I
Q
 
G
D
 
D
N
 
R
V
 
V
T
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
S
 
T
C
 
T
V
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
A
F
 
L
G
 
D
D
 
D
T
 
T
T
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
N
N
 
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
Q
V
 
C
H
 
Q
V
 
I
A
 
A
H
|
H
N
|
N
V
 
V
R
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
D
N
 
N
C
 
T
V
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
G
Y
 
G
T
 
V
G
 
I
V
 
M
S
 
A
G
|
G
S
 
S
T
 
L
V
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
A
 
M
F
 
I
G
 
G
G
 
G
K
 
A
A
 
S
G
 
V
V
 
I
A
x
N
D
 
G
H
 
H
L
 
M
N
 
E
I
 
I
G
 
C
S
 
D
G
 
K
A
 
V
S
 
T
I
 
V
G
x
T
A
x
G
A
 
M
A
 
G
S
x
M
V
|
V
F
x
M
K
 
R
D
 
P
V
 
I
P
 
T
D
 
E
-
 
P
G
 
G
E
 
V
T
 
Y
W
 
S
T
 
S
G
 
G
F
 
I
P
 
P
A
 
L
R
 
Q
P
 
P
L
x
N
K
 
K
R
 
V
W
 
W
L
 
-
R
|
R
E
 
K
T
 
T
A
 
A
W
 
A
L
 
L

P0A1X4 UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)glucosamine N-acyltransferase; UDP-3-O-(3-OHC14)-GlcN N-acyltransferase; UDP-3-O-(3-hydroxytetradecanoyl)glucosamine N-acyltransferase; EC 2.3.1.191 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
33% identity, 91% coverage: 21:328/339 of query aligns to 7:319/341 of P0A1X4

query
sites
P0A1X4
A
 
A
G
 
D
A
 
L
A
 
A
T
 
E
L
 
Q
A
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
E
L
 
L
-
 
H
-
 
G
-
 
D
G
 
G
E
 
D
R
 
I
V
 
V
I
 
I
T
 
T
H
 
G
A
 
V
A
 
A
P
 
S
L
 
M
D
 
Q
A
 
S
S
 
A
D
 
T
A
 
T
Q
 
G
A
 
H
I
 
I
T
 
T
F
 
F
F
 
M
S
 
V
D
 
N
A
 
P
K
 
K
R
 
Y
K
 
R
D
 
E
A
 
H
A
 
L
A
 
G
S
 
L
T
 
C
R
 
Q
A
 
A
G
 
S
A
 
A
C
 
V
F
 
V
V
 
M
R
 
T
P
 
Q
E
 
D
H
 
D
Q
 
L
G
 
P
F
 
F
L
 
-
P
 
-
P
 
A
T
 
K
C
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
Q
 
Y
A
 
L
A
 
T
W
 
Y
A
 
A
A
 
R
A
 
M
A
 
A
N
 
Q
R
 
I
L
 
L
H
 
D
A
 
T
P
 
T
R
 
P
R
 
Q
H
 
P
E
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
A
P
 
Q
S
 
N
L
 
I
H
 
A
P
 
P
D
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
I
E
 
D
D
 
A
G
 
T
V
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
G
P
 
S
N
 
N
V
 
V
T
 
S
I
 
V
G
 
G
Q
 
A
G
 
N
A
 
A
S
 
V
I
 
I
G
 
E
R
 
S
G
 
G
T
 
V
R
 
Q
I
 
L
G
 
G
P
 
D
G
 
N
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
F
I
 
V
G
 
G
R
 
K
Y
 
N
C
 
S
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
W
-
 
A
N
 
N
A
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
Y
F
 
H
A
 
D
M
 
I
-
 
Q
L
 
I
G
 
G
D
 
E
N
 
N
V
 
C
A
 
L
I
 
I
S
 
Q
A
 
S
G
 
S
A
 
T
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
A
A
 
D
G
 
G
F
 
F
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
L
 
N
G
 
D
P
 
R
R
 
G
G
 
N
M
 
W
V
 
V
D
 
K
L
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
I
I
 
I
Q
 
G
D
 
D
N
 
R
V
 
V
T
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
S
 
T
C
 
T
V
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
A
F
 
L
G
 
D
D
 
D
T
 
T
T
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
N
N
 
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
Q
V
 
C
H
 
Q
V
 
I
A
 
A
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
D
N
 
N
C
 
T
V
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
G
Y
 
G
T
 
V
G
 
I
V
 
M
S
 
A
G
 
G
S
 
S
T
 
L
V
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
A
 
M
F
 
I
G
 
G
G
 
G
K
 
A
A
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
N
D
 
G
H
 
H
L
 
M
N
 
E
I
 
I
G
 
C
S
 
D
G
 
K
A
 
V
S
 
T
I
 
V
G
 
T
A
 
G
A
 
M
A
 
G
S
 
M
V
|
V
F
 
M
K
 
R
D
 
P
V
 
I
P
 
T
D
 
E
-
 
P
G
 
G
E
 
V
T
 
Y
W
 
S
T
 
S
G
 
G
F
 
I
P
 
P
A
 
L
R
 
Q
P
 
P
L
 
N
K
 
K
R
 
V
W
 
W
L
 
-
R
 
R
E
 
K
T
 
T
A
 
A
W
 
A
L
 
L

4ihfA Chasing acyl carrier protein through a catalytic cycle of lipid a production (see paper)
33% identity, 93% coverage: 15:328/339 of query aligns to 4:317/336 of 4ihfA

query
sites
4ihfA
L
 
L
S
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
L
A
 
D
A
 
A
T
 
E
L
 
L
A
 
H
D
 
G
A
 
D
A
 
-
L
 
-
G
 
G
E
 
D
R
 
I
V
 
V
I
 
I
T
 
T
H
 
G
A
 
V
A
 
A
P
 
S
L
 
M
D
 
Q
A
 
S
S
 
A
D
 
Q
A
 
T
Q
 
G
A
 
H
I
 
I
T
 
T
F
 
F
F
 
M
S
 
V
D
 
N
A
 
P
K
 
K
R
 
Y
K
 
R
D
 
E
A
 
H
A
 
L
A
 
G
S
 
L
T
 
C
R
 
Q
A
 
A
G
 
S
A
 
A
C
 
V
F
 
V
V
 
M
R
 
T
P
 
Q
E
 
D
H
 
D
Q
 
L
G
 
P
F
 
F
L
 
-
P
 
-
P
 
A
T
 
K
C
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
V
G
 
K
R
 
N
P
 
P
Q
 
Y
A
 
L
A
 
T
W
 
Y
A
 
A
A
 
R
A
 
M
A
 
A
N
 
Q
R
 
I
L
 
L
H
 
D
A
 
T
P
 
T
R
 
P
R
 
Q
H
 
P
E
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
A
P
 
Q
S
 
N
L
 
I
H
 
A
P
 
P
D
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
I
E
 
D
D
 
A
G
 
T
V
 
A
A
 
K
L
 
L
A
 
G
P
 
N
N
 
N
V
 
V
T
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
A
G
 
N
A
 
A
S
 
V
I
 
I
G
 
E
R
 
S
G
 
G
T
 
V
R
 
E
I
 
L
G
 
G
P
 
D
G
 
N
V
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
F
I
 
V
G
 
G
R
 
K
Y
 
N
C
 
S
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
W
-
 
A
N
 
N
A
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
Y
F
 
H
A
 
E
M
 
I
-
 
Q
L
 
I
G
 
G
D
 
Q
N
 
N
V
 
C
A
 
L
I
 
I
S
 
Q
A
 
S
G
 
G
A
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
A
A
 
D
G
 
G
F
|
F
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
L
 
N
G
 
D
P
 
R
R
 
G
G
 
N
M
 
W
V
 
V
D
 
K
L
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
I
I
 
I
Q
 
G
D
 
D
N
 
R
V
 
V
T
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
C
S
 
T
C
 
T
V
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
A
F
 
L
G
 
D
D
 
D
T
 
T
T
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
N
N
 
G
T
 
V
K
 
I
I
 
I
D
|
D
N
 
N
L
 
Q
V
 
C
H
 
Q
V
 
I
A
|
A
H
x
A
N
|
N
V
 
V
R
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
D
N
 
N
C
 
T
V
 
A
L
 
V
A
 
A
A
x
G
Y
 
G
T
 
V
G
x
I
V
 
M
S
x
A
G
|
G
S
 
S
T
 
L
V
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
Y
V
 
C
A
 
M
F
 
I
G
 
G
G
|
G
K
 
A
A
 
S
G
x
V
V
 
I
A
x
N
D
 
G
H
 
H
L
 
M
N
 
E
I
 
I
G
 
C
S
 
D
G
 
K
A
 
V
S
 
T
I
 
V
G
x
T
A
x
G
A
 
M
A
 
G
S
 
M
V
|
V
F
 
M
K
 
R
D
 
P
V
 
I
P
 
T
D
 
E
-
 
P
G
 
G
E
 
V
T
 
Y
W
 
S
T
 
S
G
 
G
F
 
I
P
 
P
A
 
L
R
 
Q
P
 
P
L
x
N
K
 
K
R
 
V
W
 
W
L
 
-
R
|
R
E
 
K
T
 
T
A
 
A
W
 
A
L
 
L

3pmoA The structure of lpxd from pseudomonas aeruginosa at 1.3 a resolution (see paper)
30% identity, 98% coverage: 1:331/339 of query aligns to 13:343/357 of 3pmoA

query
sites
3pmoA
M
 
V
P
 
P
D
x
R
P
 
G
R
 
S
F
 
H
F
 
M
D
 
S
S
 
T
L
 
L
G
 
S
P
 
Y
A
 
T
L
 
L
L
 
G
S
 
Q
E
 
L
L
 
A
A
 
A
Q
 
H
A
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
E
T
 
V
L
 
R
A
 
G
D
 
D
A
 
A
A
 
D
L
 
L
G
 
P
E
 
-
R
 
-
V
 
-
I
 
I
T
 
Q
H
 
G
A
 
L
A
 
A
P
 
T
L
 
L
D
 
Q
A
 
E
S
 
A
D
 
G
A
 
P
Q
 
A
A
 
Q
I
 
L
T
 
S
F
 
F
F
 
L
S
x
A
D
 
N
A
 
P
K
 
Q
R
x
Y
K
 
R
D
 
K
A
 
Y
A
 
L
A
 
P
S
 
E
T
 
S
R
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
C
 
V
F
 
L
V
 
L
R
 
T
P
 
A
-
 
A
E
 
D
H
 
A
Q
 
D
G
 
G
F
 
F
L
 
-
P
 
-
P
 
-
T
 
A
C
 
G
A
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
V
G
 
A
R
 
N
P
 
P
Q
 
Y
A
 
L
A
 
A
W
 
Y
A
 
A
A
 
S
A
 
L
A
 
S
N
 
-
R
 
-
L
 
-
H
 
H
A
 
L
P
 
F
R
 
D
R
 
R
H
 
K
E
 
P
A
 
K
G
 
A
A
 
A
P
 
A
S
 
G
L
 
I
H
 
H
P
 
P
D
 
T
A
 
A
A
 
I
L
 
V
E
 
A
D
 
A
G
 
D
V
 
A
A
 
E
L
 
V
A
 
D
P
 
P
N
 
S
V
 
A
T
 
S
I
 
V
G
 
G
Q
 
A
G
 
Y
A
 
A
S
 
V
I
 
I
G
 
E
R
 
S
G
 
G
T
 
A
R
 
R
I
 
I
G
 
G
P
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
I
 
I
G
 
G
P
 
A
G
 
-
V
 
-
V
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
H
C
 
C
R
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
R
A
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
W
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
R
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
Y
-
 
H
-
 
D
A
 
V
M
 
T
L
 
I
G
 
G
D
 
A
N
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
S
 
Q
A
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
G
A
 
E
G
 
G
F
 
F
G
 
G
A
 
F
A
 
A
L
 
N
G
 
E
P
 
K
R
 
G
G
 
V
M
 
W
V
 
Q
D
 
K
L
 
I
P
 
A
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
R
 
G
V
 
V
V
 
T
I
 
I
Q
 
G
D
 
D
N
 
D
V
 
V
T
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
T
C
 
T
V
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
A
F
 
L
G
 
S
D
 
D
T
 
T
T
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
N
N
 
G
T
 
V
K
 
K
I
 
L
D
 
D
N
 
N
L
 
Q
V
 
I
H
 
M
V
 
I
A
 
A
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
Q
I
 
I
G
 
G
R
 
D
N
 
H
C
 
T
V
 
A
L
 
M
A
 
A
A
 
A
Y
 
C
T
 
V
G
 
G
V
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
S
T
 
A
V
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
H
V
 
C
A
 
M
F
 
L
G
 
A
G
 
G
K
 
G
A
 
V
G
 
G
V
 
L
A
 
V
D
 
G
H
 
H
L
 
I
N
 
E
I
 
I
G
 
C
S
 
D
G
 
N
A
 
V
S
 
F
I
 
V
G
 
T
A
 
G
A
 
M
A
 
T
S
 
M
V
 
V
F
 
T
K
 
R
D
 
S
V
 
I
P
 
T
D
 
E
-
 
P
G
 
G
E
 
S
T
 
Y
W
 
S
T
 
S
G
 
G
F
 
T
P
 
A
A
 
M
R
 
Q
P
 
P
L
 
A
K
 
A
R
 
E
W
 
W
L
 
K
R
 
K
E
 
S
T
 
A
A
 
A
W
 
R
L
 
I
S
 
R
R
 
Q
M
 
L

6uecA Pseudomonas aeruginosa lpxd complex structure with ligand (see paper)
31% identity, 92% coverage: 19:331/339 of query aligns to 11:323/337 of 6uecA

query
sites
6uecA
A
 
A
Q
 
H
A
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
E
T
 
V
L
 
R
A
 
G
D
 
D
A
 
A
A
 
D
L
 
L
G
 
P
E
 
-
R
 
-
V
 
-
I
 
I
T
 
Q
H
 
G
A
 
L
A
 
A
P
 
T
L
 
L
D
 
Q
A
 
E
S
 
A
D
 
G
A
 
P
Q
 
A
A
 
Q
I
 
L
T
 
S
F
 
F
F
 
L
S
 
A
D
 
N
A
 
P
K
 
Q
R
 
Y
K
 
R
D
 
K
A
 
Y
A
 
L
A
 
P
S
 
E
T
 
S
R
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
C
 
V
F
 
L
V
 
L
R
 
T
P
 
A
-
 
A
E
 
D
H
 
A
Q
 
D
G
 
G
F
 
F
L
 
-
P
 
-
P
 
-
T
 
A
C
 
G
A
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
V
G
 
A
R
 
N
P
 
P
Q
 
Y
A
 
L
A
 
A
W
 
Y
A
 
A
A
 
S
A
 
L
A
 
S
N
 
-
R
 
-
L
 
-
H
 
H
A
 
L
P
 
F
R
 
D
R
 
R
H
 
K
E
 
P
A
 
K
G
 
A
A
 
A
P
 
A
S
 
G
L
 
I
H
 
H
P
 
P
D
 
T
A
 
A
A
 
I
L
 
V
E
 
A
D
 
A
G
 
D
V
 
A
A
 
E
L
 
V
A
 
D
P
 
P
N
 
S
V
 
A
T
 
S
I
 
V
G
 
G
Q
 
A
G
 
Y
A
 
A
S
 
V
I
 
I
G
 
E
R
 
S
G
 
G
T
 
A
R
 
R
I
 
I
G
 
G
P
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
I
 
I
G
 
G
P
 
A
G
 
-
V
 
-
V
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
H
C
 
C
R
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
R
A
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
W
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
R
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
Y
-
 
H
-
 
D
A
 
V
M
 
T
L
 
I
G
 
G
D
 
A
N
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
S
 
Q
A
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
G
A
 
E
G
 
G
F
 
F
G
 
G
A
 
F
A
 
A
L
 
N
G
 
E
P
 
K
R
 
G
G
 
V
M
 
W
V
 
Q
D
 
K
L
 
I
P
 
A
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
R
 
G
V
 
V
V
 
T
I
 
I
Q
 
G
D
 
D
N
 
D
V
 
V
T
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
T
C
 
T
V
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
A
F
 
L
G
 
S
D
 
D
T
 
T
T
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
N
N
 
G
T
 
V
K
 
K
I
 
L
D
 
D
N
 
N
L
 
Q
V
 
I
H
 
M
V
 
I
A
 
A
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
Q
I
 
I
G
 
G
R
 
D
N
 
H
C
 
T
V
 
A
L
 
M
A
 
A
A
 
A
Y
 
C
T
 
V
G
 
G
V
 
I
S
|
S
G
 
G
S
 
S
T
 
A
V
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
R
G
 
H
V
 
C
A
 
M
F
 
L
G
 
A
G
 
G
K
 
G
A
 
V
G
 
G
V
 
L
A
x
V
D
 
G
H
 
H
L
 
I
N
 
E
I
 
I
G
 
C
S
 
D
G
 
N
A
 
V
S
 
F
I
 
V
G
 
T
A
 
G
A
 
M
A
 
T
S
x
M
V
 
V
F
 
T
K
 
R
D
 
S
V
 
I
P
 
T
D
 
E
-
 
P
G
 
G
E
 
S
T
 
Y
W
 
S
T
 
S
G
 
G
F
 
T
P
 
A
A
 
M
R
 
Q
P
 
P
L
 
A
K
 
A
R
 
E
W
 
W
L
 
K
R
 
K
E
 
S
T
 
A
A
 
A
W
 
R
L
 
I
S
 
R
R
 
Q
M
 
L

4eqyG Crystal structure of acyl-[acyl-carrier-protein]--udp-n- acetylglucosamine o-acyltransferase from burkholderia thailandensis (see paper)
28% identity, 56% coverage: 128:317/339 of query aligns to 2:188/260 of 4eqyG

query
sites
4eqyG
L
 
I
A
 
H
P
 
P
N
 
T
V
 
A
T
 
I
I
 
I
G
 
E
Q
 
P
G
 
G
A
 
A
S
 
Q
I
 
L
G
 
H
R
 
E
G
 
T
T
 
V
R
 
E
I
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
Y
V
 
A
V
 
I
I
 
V
G
 
G
P
 
S
G
 
N
V
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
G
R
 
A
Y
 
R
C
 
T
R
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
S
N
 
H
A
 
S
V
 
V
I
 
I
-
 
E
G
 
G
F
 
H
A
 
T
M
 
T
L
 
I
G
 
G
D
x
E
N
 
D
V
 
N
A
 
R
I
 
I
S
 
G
A
 
H
G
 
Y
A
 
A
V
 
S
I
 
V
G
 
G
E
 
G
A
 
R
G
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
P
R
 
Q
G
 
D
M
 
M
V
 
K
D
 
Y
L
 
K
P
 
D
Q
 
E
L
 
P
G
 
T
R
 
R
V
 
L
V
 
V
I
 
I
Q
 
G
D
|
D
N
 
R
V
 
N
T
 
T
L
 
I
G
 
R
A
 
E
N
 
F
S
 
T
C
 
T
V
 
I
D
 
H
R
 
T
G
 
G
A
 
T
F
 
V
G
 
Q
D
 
D
-
 
A
-
 
G
-
 
V
T
 
T
T
 
T
I
 
L
G
 
G
E
 
D
N
 
D
T
 
N
K
 
W
I
 
I
D
 
M
N
 
A
L
 
Y
V
 
V
H
 
H
V
 
I
A
 
G
H
 
H
N
 
D
V
 
C
R
 
R
I
 
V
G
 
G
R
 
S
N
 
H
C
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
S
A
 
S
Y
 
N
T
 
A
G
 
Q
V
 
M
S
 
A
G
 
G
S
 
H
T
 
V
V
 
E
V
 
I
G
 
G
D
 
D
G
 
W
V
 
A
A
 
I
F
 
V
G
 
G
G
 
G
K
 
M
A
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
H
D
 
Q
H
 
Y
L
 
V
N
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
A
G
 
H
A
 
S
S
 
M
I
 
L
G
 
G
A
 
G
A
 
A
A
 
S
S
 
A
V
 
L
F
 
V
K
 
Q
D
 
D
V
 
I
P
 
P
D
 
P
G
 
F
E
 
V
T
 
I
W
 
A
T
 
A
G
 
G
F
 
N
P
 
K
A
 
A
R
 
E
P
 
P

7ojqA Crystal structure of pseudomonas aeruginosa lpxa in complex with compound 7 (see paper)
29% identity, 59% coverage: 118:316/339 of query aligns to 6:186/255 of 7ojqA

query
sites
7ojqA
P
 
P
D
 
R
A
 
A
A
 
I
L
 
I
E
 
D
D
 
P
G
 
S
V
 
A
A
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
A
N
 
D
V
 
V
T
 
Q
I
 
V
G
 
G
Q
 
P
G
 
W
A
 
S
S
 
I
I
 
V
G
 
G
R
 
A
G
 
E
T
 
V
R
 
E
I
 
I
G
 
G
P
 
E
G
 
G
V
 
T
V
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
H
V
 
V
V
 
V
I
 
L
G
 
K
R
 
G
Y
 
P
C
 
T
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
K
-
 
H
N
 
N
A
 
R
V
 
I
I
 
Y
G
 
Q
F
 
F
A
 
S
M
 
S
L
 
V
G
 
G
D
 
E
N
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
-
R
 
-
G
 
-
M
 
-
V
 
-
D
 
D
L
 
T
P
 
P
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
-
 
E
-
 
P
-
 
T
R
 
R
V
 
L
V
 
V
I
 
I
Q
 
G
D
 
D
N
 
H
V
 
N
T
 
V
L
 
I
G
 
R
A
 
E
N
 
G
S
 
V
C
 
T
V
 
I
D
 
H
R
 
R
G
 
G
A
 
T
F
 
V
G
 
Q
D
 
D
-
 
R
-
 
A
-
 
E
T
 
T
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
D
N
 
H
T
 
N
K
 
L
I
 
I
D
 
M
N
 
A
L
 
Y
V
 
A
H
|
H
V
 
I
A
 
G
H
 
H
N
 
D
V
 
S
R
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
N
N
 
H
C
 
C
V
 
I
L
 
L
A
x
V
A
x
N
Y
 
N
T
 
T
G
 
A
V
 
L
S
x
A
G
 
G
S
 
H
T
 
V
V
 
H
V
 
V
G
 
D
D
 
D
G
 
W
V
 
A
A
 
I
F
 
L
G
x
S
G
|
G
K
 
Y
A
 
T
G
 
L
V
 
V
A
 
H
D
x
Q
H
 
Y
L
 
C
N
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
A
G
 
H
A
 
S
S
 
F
I
 
S
G
 
G
A
x
M
A
 
G
A
 
S
S
 
A
V
 
I
F
 
G
K
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
D
 
A
G
 
Y
E
 
V
T
 
T
W
 
V
T
 
F
G
 
G
F
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
E

7ojwA Crystal structure of pseudomonas aeruginosa lpxa in complex with compound 93 (see paper)
29% identity, 59% coverage: 118:316/339 of query aligns to 6:187/256 of 7ojwA

query
sites
7ojwA
P
 
P
D
 
R
A
 
A
A
 
I
L
 
I
E
 
D
D
 
P
G
 
S
V
 
A
A
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
A
N
 
D
V
 
V
T
 
Q
I
 
V
G
 
G
Q
 
P
G
 
W
A
 
S
S
 
I
I
 
V
G
 
G
R
 
A
G
 
E
T
 
V
R
 
E
I
 
I
G
 
G
P
 
E
G
 
G
V
 
T
V
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
H
V
 
V
V
 
V
I
 
L
G
 
K
R
 
G
Y
 
P
C
 
T
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
K
-
 
H
N
 
N
A
 
R
V
 
I
I
 
Y
G
 
Q
F
 
F
A
 
S
M
 
S
L
 
V
G
 
G
D
 
E
N
 
D
V
 
T
A
 
P
I
 
K
S
 
Y
A
 
K
G
 
G
A
 
E
-
 
P
-
 
T
-
 
R
-
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
D
A
 
H
G
 
N
F
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
-
R
 
-
G
 
-
M
 
-
V
 
-
D
 
-
L
 
-
P
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
V
 
V
I
 
I
Q
 
R
D
 
E
N
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
I
G
 
H
A
 
R
N
 
G
S
 
T
C
 
V
V
 
Q
D
 
D
R
 
R
G
 
A
A
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
E
T
 
T
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
D
N
 
H
T
 
N
K
x
L
I
 
I
D
 
M
N
 
A
L
 
Y
V
 
A
H
 
H
V
 
I
A
 
G
H
 
H
N
 
D
V
 
S
R
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
N
N
 
H
C
 
C
V
 
I
L
 
L
A
x
V
A
x
N
Y
 
N
T
 
T
G
x
A
V
 
L
S
x
A
G
 
G
S
 
H
T
 
V
V
 
H
V
 
V
G
 
D
D
 
D
G
 
W
V
 
A
A
 
I
F
 
L
G
x
S
G
|
G
K
 
Y
A
 
T
G
 
L
V
 
V
A
 
H
D
x
Q
H
 
Y
L
 
C
N
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
A
G
 
H
A
 
S
S
 
F
I
 
S
G
 
G
A
 
M
A
 
G
A
 
S
S
 
A
V
 
I
F
 
G
K
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
D
 
A
G
 
Y
E
 
V
T
 
T
W
 
V
T
 
F
G
 
G
F
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
E

Query Sequence

>CCNA_01990 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_01990
MPDPRFFDSLGPALLSELAQAGAATLADAALGERVITHAAPLDASDAQAITFFSDAKRKD
AAASTRAGACFVRPEHQGFLPPTCAALVTGRPQAAWAAAANRLHAPRRHEAGAPSLHPDA
ALEDGVALAPNVTIGQGASIGRGTRIGPGVVIGPGVVIGRYCRIGANAVIGFAMLGDNVA
ISAGAVIGEAGFGAALGPRGMVDLPQLGRVVIQDNVTLGANSCVDRGAFGDTTIGENTKI
DNLVHVAHNVRIGRNCVLAAYTGVSGSTVVGDGVAFGGKAGVADHLNIGSGASIGAAASV
FKDVPDGETWTGFPARPLKRWLRETAWLSRMAGGRGTRG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory