SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CCNA_02094 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_02094 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7bvjA Udp-n-acetylglucosamine 3-dehydrogenase gnna from acidithiobacillus ferrooxidans (p21) (see paper)
33% identity, 98% coverage: 5:304/305 of query aligns to 4:308/313 of 7bvjA

query
sites
7bvjA
L
 
M
K
 
R
A
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
V
G
|
G
V
x
H
F
x
L
G
 
G
G
 
R
Y
 
F
H
 
H
A
 
A
K
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
V
 
A
E
 
A
L
 
I
D
 
S
G
 
-
V
 
-
T
 
Q
L
 
L
V
 
A
G
 
G
V
 
V
F
|
F
D
|
D
I
x
E
D
 
N
L
 
A
A
 
E
R
|
R
A
 
A
K
 
A
A
 
E
L
 
V
A
 
A
E
 
A
P
 
E
L
 
L
G
 
R
A
 
C
Q
 
R
G
 
A
Y
 
F
D
 
P
D
 
S
M
 
V
D
 
D
A
 
A
F
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
A
V
 
V
T
 
S
V
 
I
A
 
V
A
x
T
P
|
P
A
 
T
V
 
S
H
 
T
H
 
H
A
 
F
A
 
A
P
 
V
A
 
A
L
 
E
A
 
V
A
 
A
L
 
M
K
 
Q
A
 
A
G
 
G
K
 
V
P
 
H
V
 
C
Y
 
L
S
 
I
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
F
A
 
T
V
 
L
S
 
D
P
 
T
D
 
E
D
 
E
A
 
A
D
 
D
K
 
A
M
 
L
V
 
I
A
 
G
A
 
M
A
 
A
A
 
Q
K
 
E
A
 
R
G
 
H
V
 
L
P
 
V
L
 
L
A
 
A
C
 
I
G
 
G
H
 
H
Q
 
I
E
 
K
R
 
R
V
 
V
-
 
H
-
 
P
-
 
A
-
 
I
-
 
Q
V
 
Y
F
 
L
Q
 
R
A
 
Q
M
 
A
G
 
G
L
 
F
L
 
-
D
 
-
I
 
-
P
 
-
E
 
G
Q
 
A
P
 
P
L
 
R
R
 
Y
L
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
E
R
 
R
R
 
L
G
 
A
T
 
P
P
 
F
S
 
K
D
 
P
R
 
R
N
 
S
L
 
L
D
 
D
V
 
I
S
 
D
V
 
V
V
 
I
L
 
M
D
 
D
L
 
L
M
 
M
I
 
I
H
 
H
D
 
D
I
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
T
L
 
L
A
 
L
L
 
L
C
 
T
D
 
G
G
 
A
Q
 
E
P
 
P
I
 
V
A
 
D
V
 
V
E
 
R
G
 
A
E
 
V
G
 
G
A
 
V
I
 
A
T
 
A
R
 
V
S
 
T
T
 
D
S
 
K
L
 
A
D
 
D
W
 
M
V
 
A
K
 
T
A
 
A
E
 
W
A
 
M
T
 
T
F
 
L
D
 
N
N
 
N
G
 
G
F
 
T
T
 
V
A
 
A
V
 
N
F
 
L
D
 
A
S
 
A
S
 
S
R
 
R
V
 
V
A
 
V
E
 
R
A
 
E
R
 
P
E
 
A
R
 
R
T
 
R
M
 
M
K
x
R
V
 
I
V
 
F
Y
 
W
P
 
Q
S
 
D
G
 
R
E
x
Y
V
 
A
E
x
S
I
 
V
D
 
D
F
 
F
L
 
L
Q
 
N
R
 
N
T
 
T
F
 
L
R
 
H
-
 
I
-
 
Y
-
 
H
-
 
R
-
 
G
-
 
A
N
 
G
T
 
T
T
 
V
P
 
P
-
 
G
Y
 
I
P
 
P
L
 
G
I
 
V
E
 
R
N
 
D
F
 
E
T
 
A
E
 
V
T
 
D
P
 
L
A
 
A
G
 
K
K
 
R
D
 
D
P
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
A
S
 
E
V
 
I
A
 
E
G
 
D
F
 
F
L
 
L
A
 
N
A
 
A
V
 
I
R
 
-
G
 
-
Q
 
A
A
 
A
S
 
H
R
 
R
P
 
P
V
 
V
V
 
F
T
 
C
-
 
D
G
 
G
E
 
V
E
 
A
A
 
G
A
 
R
R
 
R
A
 
V
L
 
L
D
 
A
L
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
V
 
V
E
 
R
Q
 
V
S
 
A
V
 
V
E
 
E

3ec7A Crystal structure of putative dehydrogenase from salmonella typhimurium lt2
28% identity, 91% coverage: 4:280/305 of query aligns to 2:314/336 of 3ec7A

query
sites
3ec7A
T
 
T
L
 
L
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
I
G
|
G
V
x
M
F
x
I
G
 
G
G
 
S
Y
 
D
H
 
H
A
 
L
K
 
R
K
 
R
Y
 
L
V
 
A
E
 
N
-
 
T
L
 
V
D
 
S
G
 
G
V
 
V
T
 
E
L
 
V
V
 
V
G
 
A
V
 
V
F
 
C
D
|
D
I
|
I
D
 
V
L
 
A
A
 
G
R
|
R
A
 
A
K
 
Q
A
 
A
L
 
A
A
 
L
E
 
D
P
 
K
-
 
Y
-
 
A
L
 
I
G
 
E
A
 
A
Q
 
K
G
 
D
Y
 
Y
D
 
N
D
 
D
M
 
Y
D
 
H
A
 
D
F
 
L
L
 
I
-
 
N
-
 
D
A
 
K
A
 
D
V
 
V
D
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
I
V
 
I
A
x
T
A
|
A
P
x
S
A
x
N
V
 
E
H
 
A
H
|
H
A
 
A
A
 
D
P
 
V
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
N
A
 
A
G
 
N
K
 
K
P
 
Y
V
 
V
Y
 
F
S
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
S
 
T
P
 
A
D
 
A
D
 
D
A
 
C
D
 
Q
K
 
R
M
 
V
V
 
I
A
 
E
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
K
 
K
A
 
N
G
 
G
V
 
K
P
 
R
L
 
M
A
 
V
-
 
Q
C
 
I
G
 
G
H
 
F
Q
x
M
E
 
R
R
 
R
V
 
Y
-
 
D
-
 
K
-
 
G
V
 
Y
F
 
V
Q
 
Q
A
 
L
M
 
K
G
 
N
L
 
I
L
 
I
D
 
D
I
 
S
P
 
G
E
 
E
-
 
I
-
 
G
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
R
 
M
L
 
V
E
 
H
A
 
G
V
 
R
R
 
H
R
 
Y
G
 
N
T
 
A
P
 
S
S
 
T
D
 
V
R
 
P
N
 
E
L
 
Y
D
 
K
V
 
T
-
 
P
S
 
Q
V
 
A
V
 
I
L
 
Y
D
 
E
L
 
T
M
 
L
I
 
I
H
|
H
D
 
E
I
 
I
D
 
D
-
 
V
-
 
M
-
 
H
-
 
W
-
 
L
-
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
D
-
 
Y
-
 
K
-
 
T
-
 
V
-
 
K
-
 
V
-
 
Y
-
 
F
-
 
P
-
 
R
-
 
Q
-
 
S
-
 
S
L
 
L
A
 
V
L
 
T
A
 
T
L
 
L
C
 
R
D
 
D
G
 
P
Q
 
Q
P
 
L
I
 
V
A
 
V
V
 
M
E
 
E
G
 
T
E
 
T
G
 
S
A
 
G
I
 
I
T
 
N
R
 
I
S
 
V
T
 
V
S
 
E
L
 
V
D
 
-
W
 
F
V
 
V
K
 
N
A
 
C
E
 
Q
A
 
Y
T
 
G
F
 
Y
D
 
D
-
 
I
-
 
H
-
 
C
-
 
D
-
 
V
N
 
T
G
 
G
F
 
E
T
 
K
A
 
G
V
 
M
F
 
A
D
 
E
S
 
L
S
 
P
R
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
S
A
 
A
R
 
A
E
 
V
R
 
R
T
 
-
M
 
-
K
 
K
V
 
A
V
 
A
Y
 
K
P
 
Y
S
 
S
G
 
T
E
 
D
V
 
I
E
 
L
I
 
V
D
 
D
F
x
W
L
 
K
Q
 
Q
R
 
R
T
 
-
F
 
F
R
 
I
N
 
D
T
 
A
T
x
Y
P
 
D
Y
 
I
P
 
E
L
 
F
I
 
Q
E
 
D
N
 
F
F
 
F
T
 
D
E
 
R
T
 
L
P
 
N
A
 
A
G
 
G
K
 
L
D
 
P
P
 
P
L
 
A
G
 
G
-
 
P
L
 
T
S
 
S
V
 
W
A
 
D
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
T
G
 
A
Q
 
D
A
 
A
S
 
C

6jw8A The crystal structure of kand2 in complex with nadh and 3"-deamino-3"- hydroxykanamycin b (see paper)
30% identity, 77% coverage: 5:238/305 of query aligns to 2:254/342 of 6jw8A

query
sites
6jw8A
L
 
V
K
 
R
A
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
|
G
V
x
F
F
x
M
G
 
G
G
 
G
Y
 
V
H
 
H
A
 
A
K
 
E
K
 
V
Y
 
V
V
 
A
E
 
A
L
 
H
D
 
P
G
 
G
V
 
A
T
 
R
L
 
L
V
 
E
G
 
A
V
 
V
F
 
H
D
|
D
I
x
L
D
 
D
L
 
P
A
 
A
R
 
A
A
 
A
K
 
R
A
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
E
P
 
R
L
 
F
G
 
R
A
 
A
Q
 
E
G
 
R
Y
 
A
D
 
E
D
 
P
M
 
S
D
 
W
A
 
A
F
 
D
L
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
D
A
 
P
A
 
A
V
 
I
D
 
D
V
 
L
V
 
L
T
 
I
V
 
I
A
x
T
A
x
T
P
|
P
A
x
N
V
 
G
H
x
L
H
|
H
A
 
H
A
 
R
P
x
Q
A
 
A
L
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
R
A
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
H
V
 
V
Y
 
L
S
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
G
V
 
V
S
 
T
P
 
P
D
 
E
D
 
Q
A
 
V
D
 
A
K
 
E
M
 
L
V
 
V
A
 
E
A
 
L
A
 
A
A
 
G
K
 
R
A
 
H
G
 
D
V
 
R
P
 
V
L
 
L
A
 
A
C
 
H
G
 
G
-
 
S
-
x
N
-
 
F
-
 
V
H
 
H
Q
 
S
E
 
P
R
 
K
V
 
F
V
 
V
F
 
R
Q
 
A
A
 
R
M
 
Q
G
 
L
L
 
V
L
 
A
D
 
D
I
 
T
P
 
E
E
 
A
-
 
F
-
 
G
Q
 
R
P
 
P
L
 
H
R
 
L
L
 
V
E
 
R
A
 
V
V
 
V
R
x
F
R
 
R
G
x
N
T
 
S
P
 
G
S
 
P
D
 
E
R
 
A
N
 
A
L
x
W
D
 
A
V
 
A
S
 
S
-
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
G
V
 
A
V
 
L
L
 
L
D
|
D
L
|
L
M
 
G
I
 
C
H
|
H
D
 
A
I
 
V
D
 
E
L
 
L
A
 
C
L
 
R
A
 
W
L
 
L
C
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
A
P
 
D
I
 
V
-
 
E
A
 
S
V
 
V
E
 
S
G
 
A
E
 
R
G
 
L
A
 
Q
I
 
R
T
 
V
R
 
R
S
 
P
T
 
P
S
 
A
L
 
L
-
 
E
D
 
D
W
 
Q
V
 
A
K
 
L
A
 
L
E
 
V
A
 
M
T
 
E
F
 
F
D
 
A
N
 
D
G
 
G
F
 
A
T
 
V
A
 
G
V
 
Q
F
 
C
D
 
D
S
 
V
S
 
S
R
 
W
V
 
V
A
 
T
E
 
Q
A
 
G
R
 
G
E
|
E
R
 
Q
-
 
V
T
 
T
M
 
A
K
 
E
V
 
I
V
 
I
Y
 
G
P
 
T
S
 
K
G
 
G
E
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
V
D
 
D
F
 
L
L
 
W

Sites not aligning to the query:

6jw7A The crystal structure of kand2 in complex with nadh and 3"-deamino-3"- hydroxykanamycin a (see paper)
30% identity, 77% coverage: 5:238/305 of query aligns to 2:254/342 of 6jw7A

query
sites
6jw7A
L
 
V
K
 
R
A
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
|
G
A
 
A
G
|
G
V
x
F
F
x
M
G
 
G
G
 
G
Y
 
V
H
 
H
A
 
A
K
 
E
K
 
V
Y
 
V
V
 
A
E
 
A
L
 
H
D
 
P
G
 
G
V
 
A
T
 
R
L
 
L
V
 
E
G
 
A
V
 
V
F
 
H
D
|
D
I
x
L
D
 
D
L
 
P
A
 
A
R
 
A
A
 
A
K
 
R
A
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
E
P
 
R
L
 
F
G
 
R
A
 
A
Q
 
E
G
 
R
Y
 
A
D
 
E
D
 
P
M
 
S
D
 
W
A
 
A
F
 
D
L
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
D
A
 
P
A
 
A
V
 
I
D
 
D
V
 
L
V
 
L
T
 
I
V
 
I
A
x
T
A
x
T
P
|
P
A
x
N
V
 
G
H
x
L
H
|
H
A
 
H
A
 
R
P
x
Q
A
 
A
L
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
R
A
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
H
V
 
V
Y
 
L
S
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
G
V
 
V
S
 
T
P
 
P
D
 
E
D
 
Q
A
 
V
D
 
A
K
 
E
M
 
L
V
 
V
A
 
E
A
 
L
A
 
A
A
 
G
K
 
R
A
 
H
G
 
D
V
 
R
P
 
V
L
 
L
A
 
A
C
 
H
G
 
G
-
 
S
-
x
N
-
 
F
-
 
V
H
 
H
Q
 
S
E
 
P
R
 
K
V
 
F
V
 
V
F
 
R
Q
 
A
A
 
R
M
 
Q
G
 
L
L
 
V
L
 
A
D
 
D
I
 
T
P
 
E
E
 
A
-
 
F
-
 
G
Q
 
R
P
 
P
L
 
H
R
 
L
L
 
V
E
 
R
A
 
V
V
 
V
R
 
F
R
 
R
G
x
N
T
 
S
P
 
G
S
 
P
D
 
E
R
 
A
N
 
A
L
x
W
D
 
A
V
 
A
S
 
S
-
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
G
V
 
A
V
 
L
L
 
L
D
|
D
L
 
L
M
 
G
I
 
C
H
|
H
D
 
A
I
 
V
D
 
E
L
 
L
A
 
C
L
 
R
A
 
W
L
 
L
C
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
A
P
 
D
I
 
V
-
 
E
A
 
S
V
 
V
E
 
S
G
 
A
E
 
R
G
 
L
A
 
Q
I
 
R
T
 
V
R
 
R
S
 
P
T
 
P
S
 
A
L
 
L
-
 
E
D
 
D
W
 
Q
V
 
A
K
 
L
A
 
L
E
 
V
A
 
M
T
 
E
F
 
F
D
 
A
N
 
D
G
 
G
F
 
A
T
 
V
A
 
G
V
 
Q
F
 
C
D
 
D
S
 
V
S
 
S
R
 
W
V
 
V
A
 
T
E
 
Q
A
 
G
R
 
G
E
|
E
R
 
Q
-
 
V
T
 
T
M
 
A
K
 
E
V
 
I
V
 
I
Y
 
G
P
 
T
S
 
K
G
 
G
E
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
V
D
 
D
F
 
L
L
 
W

Sites not aligning to the query:

6jw6A The crystal structure of kand2 in complex with NAD (see paper)
30% identity, 77% coverage: 5:238/305 of query aligns to 2:254/341 of 6jw6A

query
sites
6jw6A
L
 
V
K
 
R
A
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
|
G
V
x
F
F
x
M
G
 
G
G
 
G
Y
 
V
H
 
H
A
 
A
K
 
E
K
 
V
Y
 
V
V
 
A
E
 
A
L
 
H
D
 
P
G
 
G
V
 
A
T
 
R
L
 
L
V
 
E
G
 
A
V
 
V
F
 
H
D
|
D
I
x
L
D
 
D
L
 
P
A
 
A
R
 
A
A
 
A
K
 
R
A
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
E
P
 
R
L
 
F
G
 
R
A
 
A
Q
 
E
G
 
R
Y
 
A
D
 
E
D
 
P
M
 
S
D
 
W
A
 
A
F
 
D
L
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
D
A
 
P
A
 
A
V
 
I
D
 
D
V
 
L
V
 
L
T
 
I
V
 
I
A
x
T
A
x
T
P
|
P
A
x
N
V
 
G
H
x
L
H
|
H
A
 
H
A
 
R
P
x
Q
A
 
A
L
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
R
A
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
H
V
 
V
Y
 
L
S
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
G
V
 
V
S
 
T
P
 
P
D
 
E
D
 
Q
A
 
V
D
 
A
K
 
E
M
 
L
V
 
V
A
 
E
A
 
L
A
 
A
A
 
G
K
 
R
A
 
H
G
 
D
V
 
R
P
 
V
L
 
L
A
 
A
C
 
H
G
 
G
-
 
S
-
x
N
-
 
F
-
 
V
H
 
H
Q
 
S
E
 
P
R
 
K
V
 
F
V
 
V
F
 
R
Q
 
A
A
 
R
M
 
Q
G
 
L
L
 
V
L
 
A
D
 
D
I
 
T
P
 
E
E
 
A
-
 
F
-
 
G
Q
 
R
P
 
P
L
 
H
R
 
L
L
 
V
E
 
R
A
 
V
V
 
V
R
 
F
R
 
R
G
 
N
T
 
S
P
 
G
S
 
P
D
 
E
R
 
A
N
 
A
L
x
W
D
 
A
V
 
A
S
 
S
-
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
G
V
 
A
V
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
M
 
G
I
 
C
H
|
H
D
 
A
I
 
V
D
 
E
L
 
L
A
 
C
L
 
R
A
 
W
L
 
L
C
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
A
P
 
D
I
 
V
-
 
E
A
 
S
V
 
V
E
 
S
G
 
A
E
 
R
G
 
L
A
 
Q
I
 
R
T
 
V
R
 
R
S
 
P
T
 
P
S
 
A
L
 
L
-
 
E
D
 
D
W
 
Q
V
 
A
K
 
L
A
 
L
E
 
V
A
 
M
T
 
E
F
 
F
D
 
A
N
 
D
G
 
G
F
 
A
T
 
V
A
 
G
V
 
Q
F
 
C
D
 
D
S
 
V
S
 
S
R
 
W
V
 
V
A
 
T
E
 
Q
A
 
G
R
 
G
E
 
E
R
 
Q
-
 
V
T
 
T
M
 
A
K
 
E
V
 
I
V
 
I
Y
 
G
P
 
T
S
 
K
G
 
G
E
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
V
D
 
D
F
 
L
L
 
W

Sites not aligning to the query:

6o15A Crystal structure of a putative oxidoreductase yjhc from escherichia coli in complex with NAD(h) (see paper)
34% identity, 38% coverage: 5:121/305 of query aligns to 2:118/355 of 6o15A

query
sites
6o15A
L
 
I
K
 
N
A
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
V
G
|
G
V
x
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
A
Y
 
E
H
 
L
A
 
A
K
 
R
K
 
F
Y
 
M
V
 
N
E
 
M
L
 
H
D
 
D
G
 
N
V
 
A
T
 
K
L
 
I
V
 
T
G
 
C
V
 
V
F
x
Y
D
|
D
I
 
P
D
 
E
L
 
-
A
 
-
R
 
N
A
 
G
K
 
E
A
 
N
L
 
I
A
 
A
E
 
R
P
 
E
L
 
L
G
 
Q
A
 
C
Q
 
I
G
 
N
Y
 
M
D
 
S
D
 
S
M
 
L
D
 
D
A
 
A
F
 
L
L
 
V
A
 
S
A
 
S
-
 
K
-
 
L
V
 
V
D
 
D
V
 
C
V
 
V
T
 
I
V
 
V
A
|
A
A
x
T
P
|
P
A
x
N
V
 
Y
H
 
L
H
|
H
A
 
K
A
 
E
P
 
P
A
 
V
L
 
I
A
 
K
A
 
A
L
 
A
K
 
K
A
 
N
G
 
K
K
 
K
P
 
H
V
 
V
Y
 
F
S
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
I
A
 
A
V
 
L
S
 
S
P
 
Y
D
 
E
D
 
D
A
 
C
D
 
V
K
 
D
M
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
C
A
 
K
K
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
L
 
F
A
 
M
C
 
A
G
 
G
H
 
H

Sites not aligning to the query:

3e18A Crystal structure of NAD-binding protein from listeria innocua
30% identity, 66% coverage: 9:209/305 of query aligns to 8:222/348 of 3e18A

query
sites
3e18A
V
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
Y
G
|
G
V
x
G
F
x
M
G
 
G
G
 
S
Y
 
Y
H
 
H
A
 
V
K
 
T
K
 
L
Y
 
A
V
 
S
E
 
A
L
 
A
D
 
D
G
 
N
V
 
L
T
 
E
L
 
V
V
 
H
G
 
G
V
 
V
F
|
F
D
|
D
I
|
I
D
 
-
L
 
L
A
 
A
R
 
E
A
x
K
K
 
R
A
 
E
L
 
A
A
 
A
E
 
A
P
 
Q
L
 
K
G
 
G
A
 
L
Q
 
K
G
 
I
Y
 
Y
D
 
E
D
 
S
M
 
Y
D
 
E
A
 
A
F
 
V
L
 
L
A
 
A
-
 
D
-
 
E
A
 
K
V
 
V
D
 
D
V
 
A
V
 
V
T
 
L
V
 
I
A
|
A
A
x
T
P
|
P
A
x
N
V
 
D
H
 
S
H
|
H
A
 
K
A
 
E
P
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
L
K
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
H
V
 
V
Y
 
V
S
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
V
A
 
T
V
 
M
S
 
T
P
 
S
D
 
E
D
 
D
A
 
L
D
 
L
K
 
A
M
 
I
V
 
M
A
 
D
A
 
V
A
 
A
A
 
K
K
 
R
A
 
V
G
 
N
V
 
K
P
 
H
L
 
F
A
 
M
C
 
V
G
 
-
H
 
H
Q
 
Q
E
x
N
R
 
R
-
 
R
-
 
W
-
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
F
V
 
L
V
 
I
F
 
I
Q
 
K
A
 
E
M
 
M
G
 
F
L
 
E
L
 
Q
D
 
K
I
 
T
P
 
I
E
 
G
Q
 
E
P
 
M
L
 
F
R
 
H
L
 
L
E
 
E
A
 
S
V
 
R
-
 
V
-
 
H
-
 
G
R
 
A
R
 
N
G
 
G
T
 
I
P
 
P
S
 
G
D
 
D
-
x
W
R
|
R
N
 
H
L
 
L
D
 
K
V
 
A
S
 
H
-
 
G
-
 
G
-
 
G
V
 
M
V
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
W
M
 
G
I
 
V
H
|
H
D
 
L
I
 
L
D
 
D
L
 
Q
A
 
L
L
 
L
A
 
F
L
 
L
C
 
V
D
 
D
G
 
S
Q
 
N
P
 
V
I
 
K
A
 
S
V
 
V
E
 
S
G
 
A
E
 
N
G
 
L
A
 
S
I
 
F
T
 
A
R
 
L
S
 
G
T
 
D
S
 
E
L
 
V
-
 
D
D
 
D
W
 
G
V
 
F
K
 
V
A
 
T
E
 
F
A
 
I
T
 
T
F
 
F
D
 
E
N
 
N
G
 
G
F
 
I
T
 
T
A
 
A

7xr9A Crystal structure of dgpa with glucose (see paper)
42% identity, 27% coverage: 50:132/305 of query aligns to 45:129/344 of 7xr9A

query
sites
7xr9A
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
G
 
V
Y
 
T
D
 
A
D
|
D
M
x
Y
D
 
K
A
 
E
F
 
L
L
 
L
A
 
A
-
 
N
-
 
P
A
 
E
V
 
V
D
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
H
V
 
V
A
x
C
A
x
T
P
|
P
A
 
N
V
 
V
H
 
S
H
|
H
A
 
S
A
 
E
P
 
I
A
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
F
K
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
H
V
 
V
Y
 
Y
S
 
C
E
|
E
K
|
K
P
|
P
L
 
M
A
 
S
V
 
H
S
 
S
P
 
T
D
 
E
D
 
E
A
 
A
D
 
E
K
 
K
M
 
M
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
W
A
 
K
K
 
K
A
 
S
G
 
G
V
 
K
P
 
Q
L
 
F
A
 
T
C
 
I
G
 
G
H
 
Y
Q
|
Q
E
 
N
R
 
R
V
 
F
V
 
R
F
 
E
Q
 
E
A
 
V
M
 
M
G
 
N
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6z3cAAA Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase (see paper)
33% identity, 39% coverage: 3:121/305 of query aligns to 10:128/379 of 6z3cAAA

query
sites
6z3cAAA
Q
 
K
T
 
T
L
 
V
K
 
G
A
 
Y
G
 
A
V
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
T
G
|
G
V
x
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
A
Y
 
E
H
 
L
A
 
G
K
 
R
K
 
I
Y
 
M
V
 
K
E
 
E
L
 
Q
D
 
E
G
 
G
V
 
A
T
 
R
L
 
I
V
 
V
G
 
A
V
 
V
F
x
L
D
|
D
I
x
P
D
 
E
L
 
-
A
 
-
R
 
N
A
 
G
K
 
Q
A
 
T
L
 
I
A
 
A
E
 
E
P
 
E
L
 
L
G
 
D
A
 
C
Q
 
D
G
 
V
Y
 
E
D
 
T
D
 
D
M
 
L
D
 
D
A
 
T
F
 
L
L
 
Y
A
 
S
A
 
R
V
 
E
D
 
D
V
 
V
-
 
E
-
 
A
V
 
V
T
 
I
V
 
V
A
|
A
A
x
T
P
|
P
A
x
N
V
 
Y
H
 
L
H
|
H
A
 
K
A
 
E
P
 
P
A
 
V
L
 
I
A
 
K
A
 
A
L
 
A
K
 
E
A
 
H
G
 
G
K
 
V
P
 
N
V
 
V
Y
 
F
S
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
I
A
 
A
V
 
L
S
 
S
P
 
Y
D
 
Q
D
 
D
A
 
C
D
 
D
K
 
E
M
 
M
V
 
V
A
 
R
A
 
T
A
 
C
A
 
Q
K
 
E
A
 
H
G
 
G
V
 
V
P
 
I
L
 
F
A
 
M
C
 
A
G
 
G
H
 
H

Sites not aligning to the query:

7xreC Crystal structure of dgpa
43% identity, 23% coverage: 64:132/305 of query aligns to 71:139/363 of 7xreC

query
sites
7xreC
V
 
V
D
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
H
V
 
V
A
 
C
A
x
T
P
|
P
A
x
N
V
 
V
H
 
S
H
|
H
A
 
S
A
 
E
P
 
I
A
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
F
K
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
H
V
 
V
Y
 
Y
S
 
C
E
|
E
K
|
K
P
|
P
L
 
M
A
 
S
V
 
H
S
 
S
P
 
T
D
 
E
D
 
E
A
 
A
D
 
E
K
 
K
M
 
M
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
W
A
 
K
K
 
K
A
 
S
G
 
G
V
 
K
P
 
Q
L
 
F
A
 
T
C
 
I
G
 
G
H
 
Y
Q
 
Q
E
 
N
R
 
R
V
 
F
V
 
R
F
 
E
Q
 
E
A
 
V
M
 
M
G
 
N
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q2I8V6 1,5-anhydro-D-fructose reductase; Anhydrofructose reductase; 1,5-anhydro-D-fructose reductase (1,5-anhydro-D-mannitol-forming); EC 1.1.1.292 from Ensifer adhaerens (Sinorhizobium morelense) (see paper)
28% identity, 77% coverage: 64:299/305 of query aligns to 64:317/333 of Q2I8V6

query
sites
Q2I8V6
V
 
V
D
 
D
V
 
A
V
 
V
T
 
Y
V
 
V
A
 
S
A
x
T
P
x
T
A
x
N
V
x
E
H
x
L
H
|
H
A
 
R
A
 
E
P
 
Q
A
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
I
K
 
R
A
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
H
V
 
V
Y
 
L
S
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
M
S
 
T
P
 
L
D
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
R
K
 
E
M
 
M
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
R
K
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
V
L
 
L
A
 
G
C
 
T
G
x
N
H
 
H
Q
 
H
E
 
L
R
 
R
-
 
N
-
 
A
V
 
A
V
 
A
F
 
H
Q
 
R
A
 
A
M
 
M
-
 
R
-
 
D
-
 
A
-
 
I
-
 
A
-
 
E
G
 
G
L
 
R
L
 
I
D
 
G
I
 
R
P
 
P
-
 
I
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
V
-
 
F
-
 
H
-
 
A
-
 
V
E
 
Y
Q
 
L
P
 
P
L
 
P
R
 
H
L
 
L
E
 
Q
A
 
G
V
x
W
R
|
R
R
 
L
G
 
E
T
 
R
P
 
P
S
 
E
D
 
A
R
 
G
N
 
G
L
 
-
D
 
-
V
 
-
S
 
G
V
 
V
V
 
I
L
 
L
D
|
D
L
 
I
M
 
T
I
 
V
H
|
H
D
 
D
I
 
A
D
 
D
-
 
T
L
 
L
A
 
R
L
 
F
A
 
V
L
 
L
C
 
N
D
 
D
-
 
D
-
 
P
G
 
A
Q
 
E
P
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
I
E
 
S
G
 
H
E
 
S
G
 
A
A
 
G
I
 
M
T
x
G
R
 
K
S
 
E
T
 
G
S
 
V
L
 
E
D
 
D
W
 
G
V
 
V
K
 
M
A
 
G
E
 
G
A
 
V
T
 
R
F
 
F
D
 
Q
N
 
S
G
 
G
F
 
V
T
 
I
A
 
A
V
 
Q
F
 
F
D
 
H
S
 
D
S
 
A
R
 
F
V
 
T
A
 
T
E
 
K
A
 
F
R
 
A
E
 
E
R
 
T
T
 
G
M
 
F
K
 
E
V
 
V
V
 
H
Y
 
G
P
 
T
S
 
E
G
 
G
E
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
D
 
S
F
 
L
L
 
I
Q
 
G
R
 
R
T
 
N
F
 
V
R
 
M
N
 
T
T
 
Q
T
 
K
P
 
P
Y
 
V
P
 
G
L
 
T
I
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
R
-
 
N
-
 
A
E
 
E
N
 
G
F
 
E
T
 
S
E
 
Q
T
 
L
P
 
P
A
 
L
G
 
-
K
 
-
D
 
D
P
 
P
L
 
A
G
 
N
L
 
L
-
x
Y
-
 
E
-
 
T
S
 
A
V
 
L
A
 
A
G
 
A
F
 
F
L
 
H
A
 
S
A
 
A
V
 
I
R
 
E
G
 
G
Q
 
H
A
 
G
S
 
-
R
 
Q
P
 
P
V
 
S
V
 
A
T
 
T
G
 
G
E
 
E
E
 
D
A
 
G
A
 
V
R
 
W
A
 
S
L
 
L
D
 
A
L
 
T
A
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V

Sites not aligning to the query:

3nt5A Crystal structure of myo-inositol dehydrogenase from bacillus subtilis with bound cofactor and product inosose (see paper)
30% identity, 57% coverage: 4:176/305 of query aligns to 2:186/337 of 3nt5A

query
sites
3nt5A
T
 
S
L
 
L
K
 
R
A
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
|
G
A
 
T
G
|
G
V
x
A
F
x
I
G
 
G
G
 
K
Y
 
E
H
 
H
A
 
I
K
 
N
K
 
R
Y
 
I
V
 
T
-
 
N
E
 
K
L
 
L
D
 
S
G
 
G
V
 
A
T
 
E
L
 
I
V
 
V
G
 
A
V
 
V
F
 
T
D
|
D
I
x
V
D
 
N
L
 
Q
A
 
E
R
 
A
A
 
A
K
 
Q
A
 
K
L
 
V
A
 
V
E
 
E
P
 
Q
-
 
Y
-
 
Q
L
 
L
G
 
N
A
 
A
Q
 
T
G
 
V
Y
 
Y
D
 
P
D
 
N
M
 
D
D
 
D
A
 
S
F
 
L
L
 
L
A
 
A
-
 
D
-
 
E
A
 
N
V
 
V
D
 
D
V
 
A
V
 
V
T
 
L
V
 
V
A
 
T
A
x
S
P
x
W
A
x
G
V
 
P
H
 
A
H
 
H
A
 
E
A
 
S
P
 
S
A
 
V
L
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
I
K
 
K
A
 
A
G
 
Q
K
 
K
P
 
Y
V
 
V
Y
 
F
S
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
T
S
 
T
P
 
A
D
 
E
D
 
G
A
 
C
D
 
M
K
 
R
M
 
I
V
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
E
A
 
I
K
 
K
A
 
V
G
 
G
V
 
K
P
 
R
L
 
L
A
 
V
-
 
Q
C
 
V
G
 
G
H
 
F
Q
 
M
E
 
R
R
 
R
V
 
Y
-
 
D
-
 
S
-
 
G
V
 
Y
F
 
V
Q
 
Q
A
 
L
M
 
K
G
 
E
L
 
A
L
 
L
D
 
D
-
 
N
-
 
H
I
 
V
P
 
I
E
 
G
Q
 
E
P
 
P
L
 
L
R
 
M
L
 
I
E
 
H
A
 
C
V
 
A
R
x
H
R
 
R
G
 
N
-
 
P
T
 
T
P
 
V
S
 
G
D
 
D
R
 
N
N
 
Y
L
 
T
D
 
T
V
 
D
S
 
M
V
 
A
V
 
V
L
 
V
D
 
D
L
 
T
M
 
L
I
 
V
H
|
H
D
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
V
A
 
L
L
 
H
A
 
W
L
 
L
C
 
V
D
 
N

Sites not aligning to the query:

3nt4A Crystal structure of myo-inositol dehydrogenase from bacillus subtilis with bound cofactor nadh and inositol (see paper)
30% identity, 57% coverage: 4:176/305 of query aligns to 2:186/337 of 3nt4A

query
sites
3nt4A
T
 
S
L
 
L
K
 
R
A
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
T
G
|
G
V
x
A
F
x
I
G
 
G
G
 
K
Y
 
E
H
 
H
A
 
I
K
 
N
K
 
R
Y
 
I
V
 
T
-
 
N
E
 
K
L
 
L
D
 
S
G
 
G
V
 
A
T
 
E
L
 
I
V
 
V
G
 
A
V
 
V
F
 
T
D
|
D
I
x
V
D
 
N
L
 
Q
A
 
E
R
 
A
A
 
A
K
 
Q
A
 
K
L
 
V
A
 
V
E
 
E
P
 
Q
-
 
Y
-
 
Q
L
 
L
G
 
N
A
 
A
Q
 
T
G
 
V
Y
 
Y
D
 
P
D
 
N
M
 
D
D
 
D
A
 
S
F
 
L
L
 
L
A
 
A
-
 
D
-
 
E
A
 
N
V
 
V
D
 
D
V
 
A
V
 
V
T
 
L
V
 
V
A
 
T
A
x
S
P
x
W
A
x
G
V
 
P
H
 
A
H
 
H
A
 
E
A
 
S
P
 
S
A
 
V
L
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
I
K
 
K
A
 
A
G
 
Q
K
 
K
P
 
Y
V
 
V
Y
 
F
S
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
T
S
 
T
P
 
A
D
 
E
D
 
G
A
 
C
D
 
M
K
 
R
M
 
I
V
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
E
A
 
I
K
 
K
A
 
V
G
 
G
V
 
K
P
 
R
L
 
L
A
 
V
-
 
Q
C
 
V
G
 
G
H
 
F
Q
 
M
E
 
R
R
 
R
V
 
Y
-
 
D
-
 
S
-
 
G
V
 
Y
F
 
V
Q
 
Q
A
 
L
M
 
K
G
 
E
L
 
A
L
 
L
D
 
D
-
 
N
-
 
H
I
 
V
P
 
I
E
 
G
Q
 
E
P
 
P
L
 
L
R
 
M
L
 
I
E
 
H
A
 
C
V
 
A
R
x
H
R
 
R
G
 
N
-
 
P
T
 
T
P
 
V
S
 
G
D
 
D
R
 
N
N
 
Y
L
 
T
D
 
T
V
 
D
S
 
M
V
 
A
V
 
V
L
 
V
D
 
D
L
 
T
M
 
L
I
 
V
H
|
H
D
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
V
A
 
L
L
 
H
A
 
W
L
 
L
C
 
V
D
 
N

Sites not aligning to the query:

3nt2B Crystal structure of myo-inositol dehydrogenase from bacillus subtilis with bound cofactor (see paper)
30% identity, 57% coverage: 4:176/305 of query aligns to 2:186/337 of 3nt2B

query
sites
3nt2B
T
 
S
L
 
L
K
 
R
A
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
|
G
A
 
T
G
|
G
V
x
A
F
 
I
G
 
G
G
 
K
Y
 
E
H
 
H
A
 
I
K
 
N
K
 
R
Y
 
I
V
 
T
-
 
N
E
 
K
L
 
L
D
 
S
G
 
G
V
 
A
T
 
E
L
 
I
V
 
V
G
 
A
V
 
V
F
 
T
D
|
D
I
x
V
D
 
N
L
 
Q
A
 
E
R
 
A
A
 
A
K
 
Q
A
 
K
L
 
V
A
 
V
E
 
E
P
 
Q
-
 
Y
-
 
Q
L
 
L
G
 
N
A
 
A
Q
 
T
G
 
V
Y
 
Y
D
 
P
D
 
N
M
 
D
D
 
D
A
 
S
F
 
L
L
 
L
A
 
A
-
 
D
-
 
E
A
 
N
V
 
V
D
 
D
V
 
A
V
 
V
T
 
L
V
 
V
A
 
T
A
x
S
P
x
W
A
 
G
V
 
P
H
x
A
H
 
H
A
 
E
A
 
S
P
 
S
A
 
V
L
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
I
K
 
K
A
 
A
G
 
Q
K
 
K
P
 
Y
V
 
V
Y
 
F
S
 
C
E
 
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
T
S
 
T
P
 
A
D
 
E
D
 
G
A
 
C
D
 
M
K
 
R
M
 
I
V
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
E
A
 
I
K
 
K
A
 
V
G
 
G
V
 
K
P
 
R
L
 
L
A
 
V
-
 
Q
C
 
V
G
 
G
H
 
F
Q
 
M
E
 
R
R
 
R
V
 
Y
-
 
D
-
 
S
-
 
G
V
 
Y
F
 
V
Q
 
Q
A
 
L
M
 
K
G
 
E
L
 
A
L
 
L
D
 
D
-
 
N
-
 
H
I
 
V
P
 
I
E
 
G
Q
 
E
P
 
P
L
 
L
R
 
M
L
 
I
E
 
H
A
 
C
V
 
A
R
 
H
R
 
R
G
 
N
-
 
P
T
 
T
P
 
V
S
 
G
D
 
D
R
 
N
N
 
Y
L
 
T
D
 
T
V
 
D
S
 
M
V
 
A
V
 
V
L
 
V
D
 
D
L
 
T
M
 
L
I
 
V
H
|
H
D
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
V
A
 
L
L
 
H
A
 
W
L
 
L
C
 
V
D
 
N

Sites not aligning to the query:

3nt2A Crystal structure of myo-inositol dehydrogenase from bacillus subtilis with bound cofactor (see paper)
30% identity, 57% coverage: 4:176/305 of query aligns to 2:186/337 of 3nt2A

query
sites
3nt2A
T
 
S
L
 
L
K
 
R
A
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
|
G
A
 
T
G
|
G
V
x
A
F
x
I
G
 
G
G
 
K
Y
 
E
H
 
H
A
 
I
K
 
N
K
 
R
Y
 
I
V
 
T
-
 
N
E
 
K
L
 
L
D
 
S
G
 
G
V
 
A
T
 
E
L
 
I
V
 
V
G
 
A
V
 
V
F
 
T
D
|
D
I
x
V
D
 
N
L
 
Q
A
 
E
R
 
A
A
 
A
K
 
Q
A
 
K
L
 
V
A
 
V
E
 
E
P
 
Q
-
 
Y
-
 
Q
L
 
L
G
 
N
A
 
A
Q
 
T
G
 
V
Y
 
Y
D
 
P
D
 
N
M
 
D
D
 
D
A
 
S
F
 
L
L
 
L
A
 
A
-
 
D
-
 
E
A
 
N
V
 
V
D
 
D
V
 
A
V
 
V
T
 
L
V
 
V
A
 
T
A
x
S
P
x
W
A
x
G
V
 
P
H
x
A
H
|
H
A
 
E
A
 
S
P
 
S
A
 
V
L
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
I
K
 
K
A
 
A
G
 
Q
K
 
K
P
 
Y
V
 
V
Y
 
F
S
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
T
S
 
T
P
 
A
D
 
E
D
 
G
A
 
C
D
 
M
K
 
R
M
 
I
V
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
E
A
 
I
K
 
K
A
 
V
G
 
G
V
 
K
P
 
R
L
 
L
A
 
V
-
 
Q
C
 
V
G
 
G
H
 
F
Q
 
M
E
 
R
R
 
R
V
 
Y
-
 
D
-
 
S
-
 
G
V
 
Y
F
 
V
Q
 
Q
A
 
L
M
 
K
G
 
E
L
 
A
L
 
L
D
 
D
-
 
N
-
 
H
I
 
V
P
 
I
E
 
G
Q
 
E
P
 
P
L
 
L
R
 
M
L
 
I
E
 
H
A
 
C
V
 
A
R
 
H
R
 
R
G
 
N
-
 
P
T
 
T
P
 
V
S
 
G
D
 
D
R
 
N
N
 
Y
L
 
T
D
 
T
V
 
D
S
 
M
V
 
A
V
 
V
L
 
V
D
 
D
L
 
T
M
 
L
I
 
V
H
|
H
D
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
V
A
 
L
L
 
H
A
 
W
L
 
L
C
 
V
D
 
N

Sites not aligning to the query:

4koaA Crystal structure analysis of 1,5-anhydro-d-fructose reductase from sinorhizobium meliloti (see paper)
26% identity, 97% coverage: 5:299/305 of query aligns to 2:317/333 of 4koaA

query
sites
4koaA
L
 
I
K
 
R
A
 
W
G
 
G
V
 
L
V
 
I
G
|
G
A
|
A
G
x
S
V
x
T
F
x
I
G
 
A
G
 
R
Y
 
E
H
 
W
A
 
V
K
 
I
K
 
G
Y
 
A
V
 
I
E
 
R
L
 
A
D
 
A
G
 
G
V
 
G
T
 
E
L
 
V
V
 
V
G
 
S
V
 
V
F
 
M
D
x
S
I
x
S
D
 
S
L
 
A
A
 
E
R
|
R
A
 
G
K
 
E
A
 
A
L
 
Y
A
 
A
E
 
A
P
 
E
L
 
N
G
 
G
-
 
I
A
 
A
Q
 
K
G
 
A
Y
 
V
D
 
T
D
 
S
M
 
V
D
 
D
A
 
D
F
 
L
L
 
V
A
 
G
A
 
D
-
 
P
-
 
D
V
 
V
D
 
D
V
 
A
V
 
V
T
 
Y
V
 
I
A
 
S
A
x
T
P
 
T
A
x
N
V
 
E
H
 
L
H
|
H
A
 
H
A
 
G
P
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
I
K
 
R
A
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
H
V
 
V
Y
 
L
S
 
C
E
 
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
M
S
 
N
P
 
L
D
 
N
D
 
D
A
 
G
D
 
C
K
 
E
M
 
M
V
 
V
A
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
C
K
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
V
L
 
L
A
 
G
C
 
T
G
 
N
H
 
H
Q
 
H
E
 
L
R
 
R
-
 
N
-
 
A
V
 
A
V
 
T
F
 
H
Q
 
R
A
 
A
M
 
M
-
 
R
-
 
E
-
 
A
-
 
I
-
 
A
-
 
A
G
 
G
L
 
R
L
 
I
D
 
G
I
 
R
P
 
P
-
 
I
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
V
-
 
F
-
 
H
-
 
A
-
 
V
E
 
Y
Q
 
L
P
 
P
L
 
P
R
 
H
L
 
L
E
x
Q
A
 
G
V
 
W
R
 
R
R
 
L
G
 
D
T
 
K
P
 
P
S
 
E
D
 
A
R
 
G
N
 
G
L
 
-
D
 
-
V
 
-
S
 
G
V
 
V
V
 
I
L
 
L
D
 
D
L
 
I
M
 
T
I
 
V
H
|
H
D
 
D
I
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
L
L
 
R
A
 
F
L
 
V
C
 
L
D
 
N
G
 
D
Q
 
D
P
 
P
I
 
I
-
 
E
-
 
A
-
 
V
A
 
A
V
 
I
E
 
S
G
 
H
E
 
S
G
 
A
A
 
G
I
 
M
T
 
G
R
 
K
S
 
E
T
 
G
S
 
L
L
 
E
D
 
D
W
 
G
V
 
V
K
 
M
A
 
G
E
 
V
A
 
L
T
 
R
F
 
F
D
 
R
N
 
S
G
 
G
F
 
V
T
 
I
A
 
A
V
 
Q
F
 
F
D
 
H
S
 
D
S
 
A
R
 
F
V
 
T
A
 
T
E
 
K
A
 
F
R
 
A
E
 
E
R
 
T
T
 
G
M
 
L
K
 
E
V
 
V
V
 
H
Y
 
G
P
 
T
S
 
A
G
 
G
E
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
D
 
S
F
 
L
L
 
I
Q
 
G
R
 
R
T
 
N
F
 
V
R
 
M
N
 
T
T
 
Q
T
 
R
P
 
P
Y
 
V
P
 
G
L
 
T
I
 
V
-
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
N
-
 
E
E
 
E
N
 
G
F
 
E
T
 
S
E
 
E
T
 
L
P
 
P
A
 
L
G
 
D
K
 
H
D
 
R
P
 
N
L
 
L
-
 
Y
G
 
E
L
 
T
S
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
A
F
 
F
L
 
H
A
 
S
A
 
A
V
 
I
R
 
G
G
 
G
Q
 
N
A
 
G
S
 
-
R
 
R
P
 
P
V
 
S
V
 
A
T
 
S
G
 
G
E
 
E
E
 
D
A
 
G
A
 
V
R
 
W
A
 
S
L
 
L
D
 
A
L
 
T
A
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V

2glxA Crystal structure analysis of bacterial 1,5-af reductase (see paper)
28% identity, 77% coverage: 64:299/305 of query aligns to 63:316/332 of 2glxA

query
sites
2glxA
V
 
V
D
 
D
V
 
A
V
 
V
T
 
Y
V
 
V
A
x
S
A
x
T
P
 
T
A
x
N
V
 
E
H
 
L
H
|
H
A
 
R
A
 
E
P
 
Q
A
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
I
K
 
R
A
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
H
V
 
V
Y
 
L
S
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
M
S
 
T
P
 
L
D
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
R
K
 
E
M
 
M
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
R
K
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
V
L
 
L
A
 
G
C
 
T
G
 
N
H
 
H
Q
x
H
E
 
L
R
 
R
-
 
N
-
 
A
V
 
A
V
 
A
F
 
H
Q
 
R
A
 
A
M
 
M
-
 
R
-
 
D
-
 
A
-
 
I
-
 
A
-
 
E
G
 
G
L
 
R
L
 
I
D
 
G
I
 
R
P
 
P
-
 
I
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
V
-
 
F
-
 
H
-
 
A
-
 
V
E
 
Y
Q
 
L
P
 
P
L
 
P
R
 
H
L
 
L
E
 
Q
A
 
G
V
x
W
R
|
R
R
 
L
G
 
E
T
 
R
P
 
P
S
 
E
D
 
A
R
 
G
N
 
G
L
 
-
D
 
-
V
 
-
S
 
G
V
 
V
V
 
I
L
 
L
D
 
D
L
 
I
M
 
T
I
 
V
H
|
H
D
 
D
I
 
A
D
 
D
-
 
T
L
 
L
A
 
R
L
 
F
A
 
V
L
 
L
C
 
N
D
 
D
-
 
D
-
 
P
G
 
A
Q
 
E
P
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
I
E
 
S
G
 
H
E
 
S
G
 
A
A
 
G
I
 
M
T
 
G
R
 
K
S
 
E
T
 
G
S
 
V
L
 
E
D
 
D
W
 
G
V
 
V
K
 
M
A
 
G
E
 
V
A
 
L
T
 
R
F
 
F
D
 
Q
N
 
S
G
 
G
F
 
V
T
 
I
A
 
A
V
 
Q
F
 
F
D
 
H
S
 
D
S
 
A
R
 
F
V
 
T
A
 
T
E
 
K
A
 
F
R
 
A
E
 
E
R
 
T
T
 
G
M
 
F
K
 
E
V
 
V
V
 
H
Y
 
G
P
 
T
S
 
E
G
 
G
E
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
D
 
S
F
 
L
L
 
I
Q
 
G
R
 
R
T
 
N
F
 
V
R
 
M
N
 
T
T
 
Q
T
 
K
P
 
P
Y
 
V
P
 
G
L
 
T
I
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
R
-
 
N
-
 
A
E
 
E
N
 
G
F
 
E
T
 
S
E
 
Q
T
 
L
P
 
P
A
 
L
G
 
-
K
 
-
D
 
D
P
 
P
L
 
A
G
 
N
L
 
L
-
x
Y
-
 
E
-
 
T
S
 
A
V
 
L
A
 
A
G
 
A
F
 
F
L
 
H
A
 
S
A
 
A
V
 
I
R
 
E
G
 
G
Q
 
H
A
 
G
S
 
-
R
 
Q
P
 
P
V
 
S
V
 
A
T
 
T
G
 
G
E
 
E
E
 
D
A
 
G
A
 
V
R
 
W
A
 
S
L
 
L
D
 
A
L
 
T
A
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V

Sites not aligning to the query:

4l8vA Crystal structure of a12k/d35s mutant myo-inositol dehydrogenase from bacillus subtilis with bound cofactor NADP (see paper)
30% identity, 57% coverage: 4:176/305 of query aligns to 2:186/337 of 4l8vA

query
sites
4l8vA
T
 
S
L
 
L
K
 
R
A
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
T
G
 
G
V
x
K
F
x
I
G
 
G
G
 
K
Y
 
E
H
 
H
A
 
I
K
 
N
K
 
R
Y
 
I
V
 
T
-
 
N
E
 
K
L
 
L
D
 
S
G
 
G
V
 
A
T
 
E
L
 
I
V
 
V
G
 
A
V
 
V
F
 
T
D
 
S
I
 
V
D
 
N
L
 
Q
A
 
E
R
 
A
A
 
A
K
 
Q
A
 
K
L
 
V
A
 
V
E
 
E
P
 
Q
-
 
Y
-
 
Q
L
 
L
G
 
N
A
 
A
Q
 
T
G
 
V
Y
 
Y
D
 
P
D
 
N
M
 
D
D
 
D
A
 
S
F
 
L
L
 
L
A
 
A
-
 
D
-
 
E
A
 
N
V
 
V
D
 
D
V
 
A
V
 
V
T
 
L
V
 
V
A
 
T
A
x
S
P
x
W
A
 
G
V
 
P
H
 
A
H
|
H
A
 
E
A
 
S
P
 
S
A
 
V
L
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
I
K
 
K
A
 
A
G
 
Q
K
 
K
P
 
Y
V
 
V
Y
 
F
S
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
T
S
 
T
P
 
A
D
 
E
D
 
G
A
 
C
D
 
M
K
 
R
M
 
I
V
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
E
A
 
I
K
 
K
A
 
V
G
 
G
V
 
K
P
 
R
L
 
L
A
 
V
-
 
Q
C
 
V
G
 
G
H
 
F
Q
x
M
E
 
R
R
 
R
V
 
Y
-
 
D
-
 
S
-
 
G
V
 
Y
F
 
V
Q
 
Q
A
 
L
M
 
K
G
 
E
L
 
A
L
 
L
D
 
D
-
 
N
-
 
H
I
 
V
P
 
I
E
 
G
Q
 
E
P
 
P
L
 
L
R
 
M
L
 
I
E
 
H
A
 
C
V
 
A
R
 
H
R
 
R
G
 
N
-
 
P
T
 
T
P
 
V
S
 
G
D
 
D
R
 
N
N
 
Y
L
 
T
D
 
T
V
 
D
S
 
M
V
 
A
V
 
V
L
 
V
D
 
D
L
 
T
M
 
L
I
 
V
H
|
H
D
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
V
A
 
L
L
 
H
A
 
W
L
 
L
C
 
V
D
 
N

Sites not aligning to the query:

5a05A Crystal structure of aldose-aldose oxidoreductase from caulobacter crescentus complexed with maltotriose (see paper)
26% identity, 74% coverage: 10:236/305 of query aligns to 3:258/335 of 5a05A

query
sites
5a05A
V
 
L
G
 
G
A
 
Y
G
 
A
V
 
I
F
 
L
G
|
G
-
x
L
G
|
G
Y
|
Y
H
x
Y
A
 
A
K
 
T
K
 
R
-
 
I
-
 
I
-
 
M
-
 
P
-
 
R
Y
 
F
V
 
A
E
 
E
L
 
C
D
 
E
G
 
H
V
 
S
T
 
R
L
 
L
V
 
A
G
 
A
V
 
L
F
 
V
D
x
S
I
x
G
D
x
T
L
 
P
A
 
E
R
x
K
A
 
L
K
 
K
A
 
T
L
 
Y
A
 
G
E
 
E
P
 
Q
L
 
Y
G
 
G
-
 
I
-
 
P
-
 
E
-
 
T
-
 
H
A
 
R
Q
 
Y
G
 
S
Y
|
Y
D
 
E
D
 
T
M
 
F
D
 
D
A
 
R
F
 
I
L
 
I
A
 
D
A
 
N
-
 
P
-
 
D
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
T
 
Y
V
 
V
A
x
I
A
x
T
P
|
P
A
x
N
V
 
S
H
x
L
H
|
H
A
 
R
A
 
P
P
 
F
A
 
T
L
 
E
A
 
R
A
 
A
L
 
A
K
 
R
A
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
H
V
 
V
Y
 
M
S
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
M
A
 
A
V
 
N
S
 
T
P
 
V
D
 
A
D
 
D
A
 
C
D
 
E
K
 
A
M
 
M
V
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
C
A
 
K
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
R
P
 
K
L
 
L
A
 
M
C
 
I
G
 
G
H
 
Y
Q
x
R
E
 
S
R
 
R
V
 
-
V
 
-
F
 
F
Q
 
Q
A
 
A
M
 
H
G
 
N
L
 
I
-
 
E
-
 
A
-
 
I
-
 
K
-
 
L
-
 
V
L
 
R
D
 
D
I
 
G
P
 
A
E
 
L
Q
 
G
P
 
P
L
 
V
R
 
R
L
 
T
-
 
V
-
 
V
-
 
T
-
 
D
E
 
H
A
 
G
V
x
F
R
 
T
R
 
I
G
 
G
T
 
D
P
 
P
S
 
K
D
 
Q
R
x
W
N
x
R
L
 
L
D
 
N
V
 
R
S
 
A
V
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
S
V
 
L
L
 
M
D
|
D
L
 
I
M
 
G
I
 
I
H
x
Y
D
 
S
I
 
L
D
 
N
L
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
Y
L
 
L
C
 
T
D
 
G
G
 
E
Q
 
E
P
 
P
I
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
N
G
 
A
E
 
V
G
 
E
A
 
S
I
 
T
T
 
D
R
 
R
S
 
S
T
 
D
S
 
P
L
 
R
-
 
F
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
E
D
 
D
W
 
I
V
 
I
K
 
N
A
 
F
E
 
Q
A
 
L
T
 
L
F
 
F
D
 
P
N
 
S
G
 
G
F
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
N
F
 
C
D
 
V
S
 
S
S
 
A
R
 
Y
V
 
S
A
 
V
E
 
N
A
 
C
R
 
N
E
 
R
R
 
-
T
 
-
M
 
Y
K
 
R
V
 
V
V
 
S
Y
 
G
P
 
P
S
 
K
G
 
G
E
 
W
V
 
V
E
 
E
I
 
I
D
 
D

Sites not aligning to the query:

5a04A Crystal structure of aldose-aldose oxidoreductase from caulobacter crescentus complexed with glucose (see paper)
26% identity, 74% coverage: 10:236/305 of query aligns to 3:258/335 of 5a04A

query
sites
5a04A
V
 
L
G
 
G
A
 
Y
G
 
A
V
 
I
F
 
L
G
 
G
-
x
L
G
|
G
Y
|
Y
H
x
Y
A
 
A
K
 
T
K
 
R
-
 
I
-
 
I
-
 
M
-
 
P
-
 
R
Y
 
F
V
 
A
E
 
E
L
 
C
D
 
E
G
 
H
V
 
S
T
 
R
L
 
L
V
 
A
G
 
A
V
 
L
F
 
V
D
x
S
I
x
G
D
x
T
L
 
P
A
 
E
R
x
K
A
 
L
K
 
K
A
 
T
L
 
Y
A
 
G
E
 
E
P
 
Q
L
 
Y
G
 
G
-
 
I
-
 
P
-
 
E
-
 
T
-
 
H
A
 
R
Q
 
Y
G
 
S
Y
|
Y
D
 
E
D
 
T
M
 
F
D
 
D
A
 
R
F
 
I
L
 
I
A
 
D
A
 
N
-
 
P
-
 
D
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
T
 
Y
V
 
V
A
x
I
A
x
T
P
|
P
A
x
N
V
 
S
H
x
L
H
|
H
A
 
R
A
 
P
P
 
F
A
 
T
L
 
E
A
 
R
A
 
A
L
 
A
K
 
R
A
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
H
V
 
V
Y
 
M
S
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
M
A
 
A
V
 
N
S
 
T
P
 
V
D
 
A
D
 
D
A
 
C
D
 
E
K
 
A
M
 
M
V
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
C
A
 
K
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
R
P
 
K
L
 
L
A
 
M
C
 
I
G
 
G
H
 
Y
Q
x
R
E
 
S
R
 
R
V
 
-
V
 
-
F
 
F
Q
 
Q
A
 
A
M
 
H
G
 
N
L
 
I
-
 
E
-
 
A
-
 
I
-
 
K
-
 
L
-
 
V
L
 
R
D
 
D
I
 
G
P
 
A
E
 
L
Q
 
G
P
 
P
L
 
V
R
 
R
L
 
T
-
 
V
-
 
V
-
 
T
-
 
D
E
 
H
A
 
G
V
x
F
R
 
T
R
 
I
G
 
G
T
 
D
P
 
P
S
 
K
D
 
Q
R
x
W
N
x
R
L
 
L
D
 
N
V
 
R
S
 
A
V
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
S
V
 
L
L
 
M
D
|
D
L
 
I
M
 
G
I
 
I
H
x
Y
D
 
S
I
 
L
D
 
N
L
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
Y
L
 
L
C
 
T
D
 
G
G
 
E
Q
 
E
P
 
P
I
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
N
G
 
A
E
 
V
G
 
E
A
 
S
I
 
T
T
 
D
R
 
R
S
 
S
T
 
D
S
 
P
L
 
R
-
 
F
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
E
D
 
D
W
 
I
V
 
I
K
 
N
A
 
F
E
 
Q
A
 
L
T
 
L
F
 
F
D
 
P
N
 
S
G
 
G
F
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
N
F
 
C
D
 
V
S
 
S
S
 
A
R
 
Y
V
 
S
A
 
V
E
 
N
A
 
C
R
 
N
E
 
R
R
 
-
T
 
-
M
 
Y
K
 
R
V
 
V
V
 
S
Y
 
G
P
 
P
S
 
K
G
 
G
E
 
W
V
 
V
E
 
E
I
 
I
D
 
D

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>CCNA_02094 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_02094
MTQTLKAGVVGAGVFGGYHAKKYVELDGVTLVGVFDIDLARAKALAEPLGAQGYDDMDAF
LAAVDVVTVAAPAVHHAAPALAALKAGKPVYSEKPLAVSPDDADKMVAAAAKAGVPLACG
HQERVVFQAMGLLDIPEQPLRLEAVRRGTPSDRNLDVSVVLDLMIHDIDLALALCDGQPI
AVEGEGAITRSTSLDWVKAEATFDNGFTAVFDSSRVAEARERTMKVVYPSGEVEIDFLQR
TFRNTTPYPLIENFTETPAGKDPLGLSVAGFLAAVRGQASRPVVTGEEAARALDLALAVE
QSVEG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory