SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CCNA_02112 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_02112 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4d8uH Crystal structure of d-cysteine desulfhydrase from salmonella typhimurium at 3.3 a in monoclinic space group with 8 subunits in the asymmetric unit (see paper)
45% identity, 97% coverage: 2:325/333 of query aligns to 8:328/331 of 4d8uH

query
sites
4d8uH
H
 
H
L
 
L
A
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
P
R
 
R
A
 
L
R
 
E
F
 
F
A
 
I
H
 
G
L
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
Y
M
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
L
G
 
S
A
 
D
E
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
R
D
 
E
L
 
I
W
 
Y
V
 
I
K
 
K
R
 
R
D
 
D
D
 
D
C
 
V
T
 
T
G
 
P
L
 
I
A
 
A
G
 
M
G
 
G
G
 
G
N
 
N
K
|
K
T
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
V
G
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
L
V
 
I
T
 
T
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
S
|
S
N
 
N
H
|
H
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
T
 
T
I
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
A
A
 
A
R
 
K
F
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
H
T
 
C
E
 
V
V
 
A
I
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
P
T
 
I
G
 
G
S
 
T
K
 
T
A
 
A
S
 
E
D
 
N
Y
 
Y
M
 
L
G
 
T
N
 
N
G
 
G
N
 
N
V
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
L
K
 
D
L
 
L
M
 
F
G
 
N
A
 
T
S
 
Q
L
 
I
R
 
E
Y
 
M
V
 
C
P
 
D
G
 
A
G
 
L
T
 
T
D
 
D
M
 
P
V
 
D
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
D
 
Q
S
 
T
T
 
L
A
 
A
E
 
T
N
 
R
V
 
I
R
 
E
Q
 
A
R
 
Q
G
 
G
G
 
F
K
 
R
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
S
T
 
A
V
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
D
 
E
C
 
S
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
I
V
 
A
V
 
Q
Q
 
Q
A
 
C
D
 
E
Q
 
E
M
 
V
D
 
-
L
 
V
K
 
G
I
 
L
D
 
S
R
 
S
L
 
V
V
 
V
T
 
V
A
 
A
T
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
A
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
A
A
 
V
G
 
G
F
 
L
A
 
E
A
 
H
L
 
L
S
 
M
V
 
P
D
 
D
I
 
V
P
 
E
I
 
L
L
 
I
G
 
G
F
 
V
G
 
T
V
 
V
R
 
S
A
 
R
P
 
S
K
 
V
P
 
A
K
 
E
Q
 
Q
E
 
K
E
 
P
N
 
K
V
 
V
Y
 
I
N
 
A
L
 
L
A
 
Q
V
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
A
E
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
G
R
 
Q
V
 
L
R
 
A
R
 
L
E
 
T
A
 
A
V
 
-
V
 
T
A
 
A
D
 
D
C
 
I
-
 
H
-
 
L
-
 
W
-
 
D
D
 
D
Y
 
Y
V
 
F
G
 
A
E
 
P
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
L
 
V
V
 
P
D
 
N
Q
 
D
G
 
A
V
 
G
I
 
M
D
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
K
L
 
L
A
 
L
A
 
A
R
 
S
T
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
S
 
T
G
 
G
K
 
K
A
 
A
M
 
M
K
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Q
 
G
A
 
I
R
 
S
K
 
Q
G
 
K
A
 
R
F
 
F
K
 
N
G
 
D
E
 
D
-
 
G
R
 
P
V
 
I
V
 
L
F
 
F
L
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
P
G
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
A
Y
 
Y
Q
 
H

4d9fA D-cysteine desulfhydrase from salmonella typhimurium complexed with d- cycloserine (dcs) (see paper)
45% identity, 97% coverage: 2:325/333 of query aligns to 5:325/328 of 4d9fA

query
sites
4d9fA
H
 
H
L
 
L
A
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
P
R
 
R
A
 
L
R
 
E
F
 
F
A
 
I
H
 
G
L
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
Y
M
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
L
G
 
S
A
 
D
E
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
R
D
 
E
L
 
I
W
 
Y
V
 
I
K
 
K
R
 
R
D
 
D
D
 
D
C
 
V
T
 
T
G
 
P
L
 
I
A
 
A
G
 
M
G
 
G
G
 
G
N
|
N
K
|
K
T
 
L
R
 
R
K
|
K
L
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
V
G
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
L
V
 
I
T
 
T
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
S
 
S
N
|
N
H
 
H
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
T
 
T
I
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
A
A
 
A
R
 
K
F
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
H
T
 
C
E
 
V
V
 
A
I
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
P
T
 
I
G
 
G
S
 
T
K
 
T
A
 
A
S
 
E
D
 
N
Y
 
Y
M
 
L
G
 
T
N
 
N
G
 
G
N
 
N
V
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
L
K
 
D
L
 
L
M
 
F
G
 
N
A
 
T
S
 
Q
L
 
I
R
 
E
Y
 
M
V
 
C
P
 
D
G
 
A
G
 
L
T
 
T
D
 
D
M
 
P
V
 
D
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
D
 
Q
S
 
T
T
 
L
A
 
A
E
 
T
N
 
R
V
 
I
R
 
E
Q
 
A
R
 
Q
G
 
G
G
 
F
K
 
R
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
S
T
 
A
V
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
D
 
E
C
 
S
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
I
V
 
A
V
 
Q
Q
 
Q
A
 
C
D
 
E
Q
 
E
M
 
V
D
 
-
L
 
V
K
 
G
I
 
L
D
 
S
R
 
S
L
 
V
V
 
V
T
 
V
A
 
A
T
 
S
G
|
G
S
|
S
A
|
A
G
 
G
T
|
T
H
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
A
A
 
V
G
 
G
F
 
L
A
 
E
A
 
H
L
 
L
S
 
M
V
 
P
D
 
D
I
 
V
P
 
E
I
 
L
L
 
I
G
 
G
F
 
V
G
 
T
V
 
V
R
 
S
A
 
R
P
 
S
K
 
V
P
 
A
K
 
E
Q
 
Q
E
 
K
E
 
P
N
 
K
V
 
V
Y
 
I
N
 
A
L
 
L
A
 
Q
V
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
A
E
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
G
R
 
Q
V
 
L
R
 
A
R
 
L
E
 
T
A
 
A
V
 
-
V
 
T
A
 
A
D
 
D
C
 
I
-
 
H
-
 
L
-
 
W
-
 
D
D
 
D
Y
 
Y
V
 
F
G
 
A
E
 
P
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
L
 
V
V
 
P
D
 
N
Q
 
D
G
 
A
V
 
G
I
 
M
D
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
K
L
 
L
A
 
L
A
 
A
R
 
S
T
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
S
 
T
G
 
G
K
 
K
A
 
A
M
 
M
K
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Q
 
G
A
 
I
R
 
S
K
 
Q
G
 
K
A
 
R
F
 
F
K
 
N
G
 
D
E
 
D
-
 
G
R
 
P
V
 
I
V
 
L
F
 
F
L
 
I
H
 
H
T
|
T
G
|
G
G
|
G
A
 
A
Q
 
P
G
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
A
Y
 
Y
Q
 
H

4d9eA D-cysteine desulfhydrase from salmonella typhimurium complexed with l- cycloserine (lcs) (see paper)
45% identity, 97% coverage: 2:325/333 of query aligns to 5:325/328 of 4d9eA

query
sites
4d9eA
H
 
H
L
 
L
A
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
P
R
 
R
A
 
L
R
 
E
F
 
F
A
 
I
H
 
G
L
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
Y
M
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
L
G
 
S
A
 
D
E
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
R
D
 
E
L
 
I
W
 
Y
V
 
I
K
 
K
R
 
R
D
 
D
D
 
D
C
 
V
T
 
T
G
 
P
L
 
I
A
 
A
G
 
M
G
 
G
G
 
G
N
|
N
K
|
K
T
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
V
G
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
L
V
 
I
T
 
T
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
S
 
S
N
|
N
H
 
H
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
T
 
T
I
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
A
A
 
A
R
 
K
F
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
H
T
 
C
E
 
V
V
 
A
I
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
P
T
 
I
G
 
G
S
 
T
K
 
T
A
 
A
S
 
E
D
 
N
Y
 
Y
M
 
L
G
 
T
N
 
N
G
 
G
N
 
N
V
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
L
K
 
D
L
 
L
M
 
F
G
 
N
A
 
T
S
 
Q
L
 
I
R
 
E
Y
 
M
V
 
C
P
 
D
G
 
A
G
 
L
T
 
T
D
 
D
M
 
P
V
 
D
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
D
 
Q
S
 
T
T
 
L
A
 
A
E
 
T
N
 
R
V
 
I
R
 
E
Q
 
A
R
 
Q
G
 
G
G
 
F
K
 
R
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
S
T
 
A
V
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
D
 
E
C
 
S
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
I
V
 
A
V
 
Q
Q
 
Q
A
 
C
D
 
E
Q
 
E
M
 
V
D
 
-
L
 
V
K
 
G
I
 
L
D
 
S
R
 
S
L
 
V
V
 
V
T
 
V
A
 
A
T
 
S
G
|
G
S
|
S
A
|
A
G
 
G
T
|
T
H
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
A
A
 
V
G
 
G
F
 
L
A
 
E
A
 
H
L
 
L
S
 
M
V
 
P
D
 
D
I
 
V
P
 
E
I
 
L
L
 
I
G
 
G
F
 
V
G
 
T
V
 
V
R
 
S
A
 
R
P
 
S
K
 
V
P
 
A
K
 
E
Q
 
Q
E
 
K
E
 
P
N
 
K
V
 
V
Y
 
I
N
 
A
L
 
L
A
 
Q
V
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
A
E
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
G
R
 
Q
V
 
L
R
 
A
R
 
L
E
 
T
A
 
A
V
 
-
V
 
T
A
 
A
D
 
D
C
 
I
-
 
H
-
 
L
-
 
W
-
 
D
D
 
D
Y
 
Y
V
 
F
G
 
A
E
 
P
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
L
 
V
V
 
P
D
 
N
Q
 
D
G
 
A
V
 
G
I
 
M
D
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
K
L
 
L
A
 
L
A
 
A
R
 
S
T
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
S
 
T
G
 
G
K
 
K
A
 
A
M
 
M
K
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Q
 
G
A
 
I
R
 
S
K
 
Q
G
 
K
A
 
R
F
 
F
K
 
N
G
 
D
E
 
D
-
 
G
R
 
P
V
 
I
V
 
L
F
 
F
L
 
I
H
 
H
T
|
T
G
|
G
G
|
G
A
 
A
Q
 
P
G
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
A
Y
 
Y
Q
 
H

4d9bA Pyridoxamine 5' phosphate (pmp) bound form of salmonella typhimurium d-cysteine desulfhydrase obtained after co-crystallization with d- cycloserine (see paper)
45% identity, 97% coverage: 2:325/333 of query aligns to 5:325/328 of 4d9bA

query
sites
4d9bA
H
 
H
L
 
L
A
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
P
R
 
R
A
 
L
R
 
E
F
 
F
A
 
I
H
 
G
L
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
Y
M
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
L
G
 
S
A
 
D
E
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
R
D
 
E
L
 
I
W
 
Y
V
 
I
K
 
K
R
 
R
D
 
D
D
 
D
C
 
V
T
 
T
G
 
P
L
 
I
A
 
A
G
 
M
G
 
G
G
 
G
N
|
N
K
|
K
T
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
V
G
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
L
V
 
I
T
 
T
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
S
 
S
N
|
N
H
 
H
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
T
 
T
I
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
A
A
 
A
R
 
K
F
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
H
T
 
C
E
 
V
V
 
A
I
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
P
T
 
I
G
 
G
S
 
T
K
 
T
A
 
A
S
 
E
D
 
N
Y
 
Y
M
 
L
G
 
T
N
 
N
G
 
G
N
 
N
V
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
L
K
 
D
L
 
L
M
 
F
G
 
N
A
 
T
S
 
Q
L
 
I
R
 
E
Y
 
M
V
 
C
P
 
D
G
 
A
G
 
L
T
 
T
D
 
D
M
 
P
V
 
D
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
D
 
Q
S
 
T
T
 
L
A
 
A
E
 
T
N
 
R
V
 
I
R
 
E
Q
 
A
R
 
Q
G
 
G
G
 
F
K
 
R
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
S
T
 
A
V
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
D
 
E
C
 
S
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
I
V
 
A
V
 
Q
Q
 
Q
A
 
C
D
 
E
Q
 
E
M
 
V
D
 
-
L
 
V
K
 
G
I
 
L
D
 
S
R
 
S
L
 
V
V
 
V
T
 
V
A
 
A
T
 
S
G
|
G
S
|
S
A
|
A
G
 
G
T
|
T
H
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
A
A
 
V
G
 
G
F
 
L
A
 
E
A
 
H
L
 
L
S
 
M
V
 
P
D
 
D
I
 
V
P
 
E
I
 
L
L
 
I
G
 
G
F
 
V
G
 
T
V
 
V
R
 
S
A
 
R
P
 
S
K
 
V
P
 
A
K
 
E
Q
 
Q
E
 
K
E
 
P
N
 
K
V
 
V
Y
 
I
N
 
A
L
 
L
A
 
Q
V
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
A
E
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
G
R
 
Q
V
 
L
R
 
A
R
 
L
E
 
T
A
 
A
V
 
-
V
 
T
A
 
A
D
 
D
C
 
I
-
 
H
-
 
L
-
 
W
-
 
D
D
 
D
Y
 
Y
V
 
F
G
 
A
E
 
P
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
L
 
V
V
 
P
D
 
N
Q
 
D
G
 
A
V
 
G
I
 
M
D
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
K
L
 
L
A
 
L
A
 
A
R
 
S
T
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
S
 
T
G
 
G
K
 
K
A
 
A
M
 
M
K
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Q
 
G
A
 
I
R
 
S
K
 
Q
G
 
K
A
 
R
F
 
F
K
 
N
G
 
D
E
 
D
-
 
G
R
 
P
V
 
I
V
 
L
F
 
F
L
 
I
H
 
H
T
|
T
G
|
G
G
|
G
A
 
A
Q
 
P
G
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
A
Y
 
Y
Q
 
H

4d99A Salmonella typhimurium d-cysteine desulfhydrase with l-ser bound non- covalently at the active site (see paper)
45% identity, 97% coverage: 2:325/333 of query aligns to 5:325/328 of 4d99A

query
sites
4d99A
H
 
H
L
 
L
A
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
P
R
 
R
A
 
L
R
 
E
F
 
F
A
 
I
H
 
G
L
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
Y
M
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
L
G
 
S
A
 
D
E
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
R
D
 
E
L
 
I
W
 
Y
V
 
I
K
 
K
R
 
R
D
 
D
D
 
D
C
 
V
T
 
T
G
 
P
L
 
I
A
 
A
G
 
M
G
 
G
G
 
G
N
 
N
K
|
K
T
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
V
G
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
L
V
 
I
T
 
T
Q
 
A
G
 
G
A
|
A
V
 
I
Q
 
Q
S
|
S
N
 
N
H
|
H
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
T
 
T
I
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
A
A
 
A
R
 
K
F
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
H
T
 
C
E
 
V
V
 
A
I
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
P
T
 
I
G
 
G
S
 
T
K
 
T
A
 
A
S
 
E
D
 
N
Y
 
Y
M
 
L
G
 
T
N
 
N
G
 
G
N
 
N
V
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
L
K
 
D
L
 
L
M
 
F
G
 
N
A
 
T
S
 
Q
L
 
I
R
 
E
Y
 
M
V
 
C
P
 
D
G
 
A
G
 
L
T
 
T
D
 
D
M
 
P
V
 
D
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
D
 
Q
S
 
T
T
 
L
A
 
A
E
 
T
N
 
R
V
 
I
R
 
E
Q
 
A
R
 
Q
G
 
G
G
 
F
K
 
R
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
S
T
 
A
V
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
D
 
E
C
 
S
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
I
V
 
A
V
 
Q
Q
 
Q
A
 
C
D
 
E
Q
 
E
M
 
V
D
 
-
L
 
V
K
 
G
I
 
L
D
 
S
R
 
S
L
 
V
V
 
V
T
 
V
A
 
A
T
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
A
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
A
A
 
V
G
 
G
F
 
L
A
 
E
A
 
H
L
 
L
S
 
M
V
 
P
D
 
D
I
 
V
P
 
E
I
 
L
L
 
I
G
 
G
F
 
V
G
 
T
V
 
V
R
 
S
A
 
R
P
 
S
K
 
V
P
 
A
K
 
E
Q
 
Q
E
 
K
E
 
P
N
 
K
V
 
V
Y
 
I
N
 
A
L
 
L
A
 
Q
V
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
A
E
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
G
R
 
Q
V
 
L
R
 
A
R
 
L
E
 
T
A
 
A
V
 
-
V
 
T
A
 
A
D
 
D
C
 
I
-
 
H
-
 
L
-
 
W
-
 
D
D
 
D
Y
 
Y
V
 
F
G
 
A
E
 
P
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
L
 
V
V
 
P
D
 
N
Q
 
D
G
 
A
V
 
G
I
 
M
D
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
K
L
 
L
A
 
L
A
 
A
R
 
S
T
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
S
 
T
G
 
G
K
 
K
A
 
A
M
 
M
K
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Q
 
G
A
 
I
R
 
S
K
 
Q
G
 
K
A
 
R
F
 
F
K
 
N
G
 
D
E
 
D
-
 
G
R
 
P
V
 
I
V
 
L
F
 
F
L
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
P
G
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
A
Y
 
Y
Q
 
H

4d97A Salmonella typhimurium d-cysteine desulfhydrase with d-ser bound at active site (see paper)
45% identity, 97% coverage: 2:325/333 of query aligns to 5:325/328 of 4d97A

query
sites
4d97A
H
 
H
L
 
L
A
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
P
R
 
R
A
 
L
R
 
E
F
 
F
A
 
I
H
 
G
L
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
Y
M
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
L
G
 
S
A
 
D
E
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
R
D
 
E
L
 
I
W
 
Y
V
 
I
K
 
K
R
 
R
D
 
D
D
 
D
C
 
V
T
 
T
G
 
P
L
 
I
A
 
A
G
 
M
G
 
G
G
 
G
N
 
N
K
|
K
T
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
V
G
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
L
V
 
I
T
 
T
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
S
|
S
N
|
N
H
|
H
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
T
 
T
I
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
A
A
 
A
R
 
K
F
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
H
T
 
C
E
 
V
V
 
A
I
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
P
T
 
I
G
 
G
S
 
T
K
 
T
A
 
A
S
 
E
D
 
N
Y
 
Y
M
 
L
G
 
T
N
 
N
G
 
G
N
 
N
V
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
L
K
 
D
L
 
L
M
 
F
G
 
N
A
 
T
S
 
Q
L
 
I
R
 
E
Y
 
M
V
 
C
P
 
D
G
 
A
G
 
L
T
 
T
D
 
D
M
 
P
V
 
D
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
D
 
Q
S
 
T
T
 
L
A
 
A
E
 
T
N
 
R
V
 
I
R
 
E
Q
 
A
R
 
Q
G
 
G
G
 
F
K
 
R
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
V
G
|
G
G
 
G
S
 
S
N
 
S
T
 
A
V
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
D
 
E
C
 
S
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
I
V
 
A
V
 
Q
Q
 
Q
A
 
C
D
 
E
Q
 
E
M
 
V
D
 
-
L
 
V
K
 
G
I
 
L
D
 
S
R
 
S
L
 
V
V
 
V
T
 
V
A
 
A
T
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
A
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
A
A
 
V
G
 
G
F
 
L
A
 
E
A
 
H
L
 
L
S
 
M
V
 
P
D
 
D
I
 
V
P
 
E
I
 
L
L
 
I
G
 
G
F
 
V
G
 
T
V
 
V
R
 
S
A
 
R
P
 
S
K
 
V
P
 
A
K
 
E
Q
 
Q
E
 
K
E
 
P
N
 
K
V
 
V
Y
 
I
N
 
A
L
 
L
A
 
Q
V
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
A
E
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
G
R
 
Q
V
 
L
R
 
A
R
 
L
E
 
T
A
 
A
V
 
-
V
 
T
A
 
A
D
 
D
C
 
I
-
 
H
-
 
L
-
 
W
-
 
D
D
 
D
Y
 
Y
V
 
F
G
 
A
E
 
P
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
L
 
V
V
 
P
D
 
N
Q
 
D
G
 
A
V
 
G
I
 
M
D
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
K
L
 
L
A
 
L
A
 
A
R
 
S
T
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
S
 
T
G
 
G
K
 
K
A
 
A
M
 
M
K
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Q
 
G
A
 
I
R
 
S
K
 
Q
G
 
K
A
 
R
F
 
F
K
 
N
G
 
D
E
 
D
-
 
G
R
 
P
V
 
I
V
 
L
F
 
F
L
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
P
G
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
A
Y
 
Y
Q
 
H

4d96A D-cysteine desulfhydrase from salmonella typhimurium complexed with 1- amino-1-carboxycyclopropane (acc) (see paper)
45% identity, 97% coverage: 2:325/333 of query aligns to 5:325/328 of 4d96A

query
sites
4d96A
H
 
H
L
 
L
A
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
P
R
 
R
A
 
L
R
 
E
F
 
F
A
 
I
H
 
G
L
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
Y
M
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
L
G
 
S
A
 
D
E
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
R
D
 
E
L
 
I
W
 
Y
V
 
I
K
 
K
R
 
R
D
 
D
D
 
D
C
 
V
T
 
T
G
 
P
L
 
I
A
 
A
G
 
M
G
 
G
G
 
G
N
|
N
K
|
K
T
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
V
G
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
L
V
 
I
T
 
T
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
S
|
S
N
|
N
H
|
H
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
T
 
T
I
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
A
A
 
A
R
 
K
F
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
H
T
 
C
E
 
V
V
 
A
I
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
P
T
 
I
G
 
G
S
 
T
K
 
T
A
 
A
S
 
E
D
 
N
Y
 
Y
M
 
L
G
 
T
N
 
N
G
 
G
N
 
N
V
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
L
K
 
D
L
 
L
M
 
F
G
 
N
A
 
T
S
 
Q
L
 
I
R
 
E
Y
 
M
V
 
C
P
 
D
G
 
A
G
 
L
T
 
T
D
 
D
M
 
P
V
 
D
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
D
 
Q
S
 
T
T
 
L
A
 
A
E
 
T
N
 
R
V
 
I
R
 
E
Q
 
A
R
 
Q
G
 
G
G
 
F
K
 
R
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
S
T
 
A
V
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
D
 
E
C
 
S
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
I
V
 
A
V
 
Q
Q
 
Q
A
 
C
D
 
E
Q
 
E
M
 
V
D
 
-
L
 
V
K
 
G
I
 
L
D
 
S
R
 
S
L
 
V
V
 
V
T
 
V
A
 
A
T
 
S
G
|
G
S
|
S
A
|
A
G
 
G
T
|
T
H
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
A
A
 
V
G
 
G
F
 
L
A
 
E
A
 
H
L
 
L
S
 
M
V
 
P
D
 
D
I
 
V
P
 
E
I
 
L
L
 
I
G
 
G
F
 
V
G
 
T
V
 
V
R
 
S
A
 
R
P
 
S
K
 
V
P
 
A
K
 
E
Q
 
Q
E
 
K
E
 
P
N
 
K
V
 
V
Y
 
I
N
 
A
L
 
L
A
 
Q
V
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
A
E
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
G
R
 
Q
V
 
L
R
 
A
R
 
L
E
 
T
A
 
A
V
 
-
V
 
T
A
 
A
D
 
D
C
 
I
-
 
H
-
 
L
-
 
W
-
 
D
D
 
D
Y
 
Y
V
 
F
G
 
A
E
 
P
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
L
 
V
V
 
P
D
 
N
Q
 
D
G
 
A
V
 
G
I
 
M
D
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
K
L
 
L
A
 
L
A
 
A
R
 
S
T
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
S
 
T
G
 
G
K
 
K
A
 
A
M
 
M
K
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Q
 
G
A
 
I
R
 
S
K
 
Q
G
 
K
A
 
R
F
 
F
K
 
N
G
 
D
E
 
D
-
 
G
R
 
P
V
 
I
V
 
L
F
 
F
L
 
I
H
 
H
T
|
T
G
|
G
G
|
G
A
 
A
Q
 
P
G
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
A
Y
 
Y
Q
 
H

4d8wA Salmonella typhimurium d-cysteine desulfhydrase soaked with d-cys shows pyruvate bound 4 a away from active site (see paper)
45% identity, 97% coverage: 2:325/333 of query aligns to 5:325/328 of 4d8wA

query
sites
4d8wA
H
 
H
L
 
L
A
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
P
R
 
R
A
 
L
R
 
E
F
 
F
A
 
I
H
 
G
L
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
Y
M
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
L
G
 
S
A
 
D
E
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
R
D
 
E
L
 
I
W
 
Y
V
 
I
K
 
K
R
 
R
D
 
D
D
 
D
C
 
V
T
 
T
G
 
P
L
 
I
A
 
A
G
 
M
G
 
G
G
 
G
N
 
N
K
|
K
T
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
V
G
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
L
V
 
I
T
 
T
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
S
 
S
N
 
N
H
 
H
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
T
 
T
I
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
A
A
 
A
R
 
K
F
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
H
T
 
C
E
 
V
V
 
A
I
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
P
T
 
I
G
 
G
S
 
T
K
 
T
A
 
A
S
 
E
D
 
N
Y
 
Y
M
 
L
G
 
T
N
 
N
G
 
G
N
 
N
V
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
L
K
 
D
L
 
L
M
 
F
G
 
N
A
 
T
S
 
Q
L
 
I
R
 
E
Y
 
M
V
 
C
P
 
D
G
 
A
G
 
L
T
 
T
D
 
D
M
 
P
V
 
D
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
D
 
Q
S
 
T
T
 
L
A
 
A
E
 
T
N
 
R
V
 
I
R
 
E
Q
 
A
R
 
Q
G
 
G
G
 
F
K
 
R
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
S
T
 
A
V
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
D
 
E
C
 
S
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
I
V
 
A
V
 
Q
Q
 
Q
A
 
C
D
 
E
Q
 
E
M
 
V
D
 
-
L
 
V
K
 
G
I
 
L
D
 
S
R
 
S
L
 
V
V
 
V
T
 
V
A
 
A
T
 
S
G
 
G
S
|
S
A
 
A
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
A
A
 
V
G
 
G
F
 
L
A
 
E
A
 
H
L
 
L
S
 
M
V
 
P
D
 
D
I
 
V
P
 
E
I
 
L
L
 
I
G
 
G
F
 
V
G
 
T
V
 
V
R
x
S
A
x
R
P
 
S
K
 
V
P
 
A
K
 
E
Q
 
Q
E
 
K
E
 
P
N
 
K
V
 
V
Y
 
I
N
 
A
L
 
L
A
 
Q
V
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
A
E
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
G
R
 
Q
V
 
L
R
 
A
R
 
L
E
 
T
A
 
A
V
 
-
V
 
T
A
 
A
D
 
D
C
 
I
-
 
H
-
 
L
-
 
W
-
 
D
D
 
D
Y
 
Y
V
 
F
G
 
A
E
 
P
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
L
 
V
V
 
P
D
 
N
Q
 
D
G
 
A
V
 
G
I
 
M
D
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
K
L
 
L
A
 
L
A
 
A
R
 
S
T
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
S
 
T
G
 
G
K
 
K
A
 
A
M
 
M
K
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Q
 
G
A
 
I
R
 
S
K
 
Q
G
 
K
A
 
R
F
 
F
K
 
N
G
 
D
E
 
D
-
 
G
R
 
P
V
 
I
V
 
L
F
 
F
L
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
P
G
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
A
Y
 
Y
Q
 
H

1rqxC Crystal structure of acc deaminase complexed with inhibitor (see paper)
41% identity, 98% coverage: 1:328/333 of query aligns to 1:335/338 of 1rqxC

query
sites
1rqxC
M
 
M
H
 
N
L
 
L
A
 
Q
R
 
R
F
 
F
P
 
P
R
 
R
A
 
Y
R
 
P
F
 
L
A
 
T
H
 
F
L
 
G
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
I
E
 
Q
P
 
P
M
 
L
P
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
S
A
 
K
E
 
H
L
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
K
I
 
V
D
 
H
L
 
L
W
 
Y
V
 
A
K
 
K
R
 
R
D
 
E
D
 
D
C
 
C
-
 
N
T
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
F
G
 
G
G
 
G
N
|
N
K
|
K
T
 
T
R
 
R
K
|
K
L
 
L
E
 
E
F
 
Y
L
 
L
L
 
I
G
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
C
D
 
D
T
 
T
L
 
L
V
 
V
T
 
S
Q
 
I
G
 
G
A
 
G
V
 
I
Q
 
Q
S
|
S
N
|
N
H
x
Q
V
 
T
R
 
R
Q
 
Q
T
 
V
I
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
A
A
 
A
R
 
H
F
 
L
G
 
G
L
 
M
K
 
K
T
 
C
E
 
V
V
 
L
I
 
V
L
 
Q
E
 
E
E
 
N
R
 
W
T
 
V
G
 
N
S
 
Y
K
 
S
A
 
D
S
 
A
D
 
V
Y
 
Y
M
 
D
G
 
R
N
 
V
G
 
G
N
 
N
V
 
I
L
 
Q
L
 
M
D
 
S
K
 
R
L
 
I
M
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
L
 
V
R
 
R
Y
 
L
V
 
V
P
 
P
G
 
D
G
 
G
T
 
F
D
 
D
M
 
I
-
 
G
-
 
F
V
 
R
A
 
R
E
 
S
L
 
W
D
 
E
S
 
D
T
 
A
A
 
L
E
 
E
N
 
S
V
 
V
R
 
R
Q
 
A
R
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
P
 
P
Y
 
Y
V
 
A
I
 
I
P
 
P
G
 
A
G
 
G
G
 
C
S
 
S
N
 
D
-
 
H
T
 
P
V
 
L
G
 
G
A
 
G
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
D
 
G
C
 
F
A
 
A
R
 
E
E
 
E
L
 
V
V
 
R
V
 
A
Q
 
Q
A
 
E
D
 
A
Q
 
E
M
 
L
D
 
G
L
 
F
K
 
K
I
 
F
D
 
D
R
 
Y
L
 
V
V
 
V
T
 
V
A
 
C
T
x
S
G
x
V
S
x
T
A
x
G
G
 
S
T
|
T
H
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
M
V
 
V
A
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
A
 
A
L
 
D
S
 
G
V
 
R
D
 
A
I
 
D
P
 
R
I
 
V
L
 
I
G
 
G
F
 
V
G
 
D
V
 
A
R
 
S
A
 
A
P
 
K
K
 
P
P
 
A
K
 
Q
Q
 
T
E
 
R
E
 
E
N
 
Q
V
 
I
Y
 
T
N
 
R
L
 
I
A
 
A
V
 
R
A
 
Q
T
 
T
A
 
A
E
 
E
T
 
K
I
 
V
G
 
G
A
 
L
G
 
E
G
 
R
R
 
D
V
 
I
R
 
M
R
 
R
E
 
A
A
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
L
D
 
D
C
 
E
D
 
R
Y
 
F
V
 
A
G
 
G
E
 
P
G
 
E
Y
|
Y
G
 
G
L
 
L
V
 
P
D
 
N
Q
 
E
G
 
G
V
 
T
I
 
L
D
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
R
L
 
L
A
 
C
A
 
A
R
 
R
T
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
M
L
 
L
L
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
S
x
E
G
 
G
K
 
K
A
 
S
M
 
M
K
 
H
G
 
G
L
 
M
I
 
I
D
 
E
Q
 
M
A
 
V
R
 
R
K
 
N
G
 
G
A
 
E
F
 
F
-
 
P
K
 
E
G
 
G
E
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
L
F
 
Y
L
 
A
H
 
H
T
x
L
G
|
G
G
|
G
A
 
V
Q
 
P
G
 
A
L
 
L
F
 
N
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
S
T
 
F
V
 
I
L
 
F

1tzmA Crystal structure of acc deaminase complexed with substrate analog b- chloro-d-alanine (see paper)
41% identity, 98% coverage: 1:328/333 of query aligns to 1:328/331 of 1tzmA

query
sites
1tzmA
M
 
M
H
 
N
L
 
L
A
 
Q
R
 
R
F
 
F
P
 
P
R
 
R
A
 
Y
R
 
P
F
 
L
A
 
T
H
 
F
L
 
G
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
I
E
 
Q
P
 
P
M
 
L
P
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
S
A
 
K
E
 
H
L
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
K
I
 
V
D
 
H
L
 
L
W
 
Y
V
 
A
K
 
K
R
 
R
D
 
E
D
 
D
C
 
C
-
 
N
T
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
F
G
 
G
G
 
G
N
|
N
K
|
K
T
 
T
R
 
R
K
|
K
L
 
L
E
 
E
F
 
Y
L
 
L
L
 
I
G
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
C
D
 
D
T
 
T
L
 
L
V
 
V
T
 
S
Q
 
I
G
|
G
A
 
G
V
 
I
Q
 
Q
S
|
S
N
|
N
H
x
Q
V
 
T
R
 
R
Q
 
Q
T
 
V
I
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
A
A
 
A
R
 
H
F
 
L
G
 
G
L
 
M
K
 
K
T
 
C
E
 
V
V
 
L
I
 
V
L
 
Q
E
 
E
E
 
N
R
x
W
T
 
V
G
 
N
S
 
Y
K
 
S
A
 
D
S
 
A
D
 
V
Y
 
Y
M
 
D
G
 
R
N
 
V
G
 
G
N
 
N
V
 
I
L
 
Q
L
 
M
D
 
S
K
 
R
L
 
I
M
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
L
 
V
R
 
R
Y
 
L
V
 
V
P
 
P
G
 
D
G
 
R
T
 
S
D
 
-
M
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
W
D
 
E
S
 
D
T
 
A
A
 
L
E
 
E
N
 
S
V
 
V
R
 
R
Q
 
A
R
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
P
 
P
Y
 
Y
V
 
A
I
 
I
P
 
P
G
x
A
G
|
G
G
 
C
S
 
S
N
 
D
-
 
H
T
 
P
V
 
L
G
 
G
A
 
G
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
D
 
G
C
 
F
A
 
A
R
 
E
E
 
E
L
 
V
V
 
R
V
 
A
Q
 
Q
A
 
E
D
 
A
Q
 
E
M
 
L
D
 
G
L
 
F
K
 
K
I
 
F
D
 
D
R
 
Y
L
 
V
V
 
V
T
 
V
A
x
C
T
x
S
G
x
V
S
x
T
A
x
G
G
 
S
T
|
T
H
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
M
V
 
V
A
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
A
 
A
L
 
D
S
 
G
V
 
R
D
 
A
I
 
D
P
 
R
I
 
V
L
 
I
G
 
G
F
 
V
G
 
D
V
 
A
R
 
S
A
 
A
P
 
K
K
 
P
P
 
A
K
 
Q
Q
 
T
E
 
R
E
 
E
N
 
Q
V
 
I
Y
 
T
N
 
R
L
 
I
A
 
A
V
 
R
A
 
Q
T
 
T
A
 
A
E
 
E
T
 
K
I
 
V
G
 
G
A
 
L
G
 
E
G
 
R
R
 
D
V
 
I
R
 
M
R
 
R
E
 
A
A
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
L
D
 
D
C
 
E
D
 
R
Y
 
F
V
 
A
G
 
G
E
 
P
G
 
E
Y
|
Y
G
 
G
L
 
L
V
 
P
D
 
N
Q
 
E
G
 
G
V
 
T
I
 
L
D
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
R
L
 
L
A
 
C
A
 
A
R
 
R
T
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
M
L
 
L
L
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
S
x
E
G
 
G
K
 
K
A
 
S
M
 
M
K
 
H
G
 
G
L
 
M
I
 
I
D
 
E
Q
 
M
A
 
V
R
 
R
K
 
N
G
 
G
A
 
E
F
 
F
-
 
P
K
 
E
G
 
G
E
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
L
F
 
Y
L
 
A
H
 
H
T
x
L
G
|
G
G
|
G
A
 
V
Q
 
P
G
 
A
L
 
L
F
 
N
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
S
T
 
F
V
 
I
L
 
F

1tzkA Crystal structure of 1-aminocyclopropane-1-carboxylate-deaminase complexed with alpha-keto-butyrate (see paper)
41% identity, 98% coverage: 1:328/333 of query aligns to 1:328/331 of 1tzkA

query
sites
1tzkA
M
 
M
H
 
N
L
 
L
A
 
Q
R
 
R
F
 
F
P
 
P
R
 
R
A
 
Y
R
 
P
F
 
L
A
 
T
H
 
F
L
 
G
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
I
E
 
Q
P
 
P
M
 
L
P
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
S
A
 
K
E
 
H
L
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
K
I
 
V
D
 
H
L
 
L
W
 
Y
V
 
A
K
 
K
R
 
R
D
 
E
D
 
D
C
 
C
-
 
N
T
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
F
G
 
G
G
 
G
N
|
N
K
|
K
T
 
T
R
 
R
K
|
K
L
 
L
E
 
E
F
 
Y
L
 
L
L
 
I
G
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
C
D
 
D
T
 
T
L
 
L
V
 
V
T
 
S
Q
 
I
G
|
G
A
 
G
V
 
I
Q
 
Q
S
|
S
N
|
N
H
x
Q
V
 
T
R
 
R
Q
 
Q
T
 
V
I
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
A
A
 
A
R
 
H
F
 
L
G
 
G
L
 
M
K
 
K
T
 
C
E
 
V
V
 
L
I
 
V
L
 
Q
E
 
E
E
 
N
R
 
W
T
 
V
G
 
N
S
 
Y
K
 
S
A
 
D
S
 
A
D
 
V
Y
 
Y
M
 
D
G
 
R
N
 
V
G
 
G
N
 
N
V
 
I
L
 
Q
L
 
M
D
 
S
K
 
R
L
 
I
M
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
L
 
V
R
 
R
Y
 
L
V
 
V
P
 
P
G
 
D
G
 
R
T
 
S
D
 
-
M
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
W
D
 
E
S
 
D
T
 
A
A
 
L
E
 
E
N
 
S
V
 
V
R
 
R
Q
 
A
R
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
P
 
P
Y
 
Y
V
 
A
I
 
I
P
 
P
G
x
A
G
|
G
G
 
C
S
 
S
N
 
D
-
 
H
T
 
P
V
 
L
G
 
G
A
 
G
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
D
 
G
C
 
F
A
 
A
R
 
E
E
 
E
L
 
V
V
 
R
V
 
A
Q
 
Q
A
 
E
D
 
A
Q
 
E
M
 
L
D
 
G
L
 
F
K
 
K
I
 
F
D
 
D
R
 
Y
L
 
V
V
 
V
T
 
V
A
x
C
T
x
S
G
x
V
S
x
T
A
x
G
G
 
S
T
|
T
H
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
M
V
 
V
A
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
A
 
A
L
 
D
S
 
G
V
 
R
D
 
A
I
 
D
P
 
R
I
 
V
L
 
I
G
 
G
F
 
V
G
 
D
V
 
A
R
 
S
A
 
A
P
 
K
K
 
P
P
 
A
K
 
Q
Q
 
T
E
 
R
E
 
E
N
 
Q
V
 
I
Y
 
T
N
 
R
L
 
I
A
 
A
V
 
R
A
 
Q
T
 
T
A
 
A
E
 
E
T
 
K
I
 
V
G
 
G
A
 
L
G
 
E
G
 
R
R
 
D
V
 
I
R
 
M
R
 
R
E
 
A
A
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
L
D
 
D
C
 
E
D
 
R
Y
 
F
V
 
A
G
 
G
E
 
P
G
 
E
Y
|
Y
G
 
G
L
 
L
V
 
P
D
 
N
Q
 
E
G
 
G
V
 
T
I
 
L
D
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
R
L
 
L
A
 
C
A
 
A
R
 
R
T
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
M
L
 
L
L
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
S
x
E
G
 
G
K
 
K
A
 
S
M
 
M
K
 
H
G
 
G
L
 
M
I
 
I
D
 
E
Q
 
M
A
 
V
R
 
R
K
 
N
G
 
G
A
 
E
F
 
F
-
 
P
K
 
E
G
 
G
E
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
L
F
 
Y
L
 
A
H
 
H
T
x
L
G
|
G
G
|
G
A
 
V
Q
 
P
G
 
A
L
 
L
F
 
N
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
S
T
 
F
V
 
I
L
 
F

1tzjA Crystal structure of 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase complexed with d-vinyl glycine (see paper)
41% identity, 98% coverage: 1:328/333 of query aligns to 1:328/331 of 1tzjA

query
sites
1tzjA
M
 
M
H
 
N
L
 
L
A
 
Q
R
 
R
F
 
F
P
 
P
R
 
R
A
 
Y
R
 
P
F
 
L
A
 
T
H
 
F
L
 
G
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
I
E
 
Q
P
 
P
M
 
L
P
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
S
A
 
K
E
 
H
L
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
K
I
 
V
D
 
H
L
 
L
W
 
Y
V
 
A
K
 
K
R
 
R
D
 
E
D
 
D
C
 
C
-
 
N
T
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
F
G
 
G
G
 
G
N
|
N
K
|
K
T
 
T
R
 
R
K
|
K
L
 
L
E
 
E
F
 
Y
L
 
L
L
 
I
G
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
C
D
 
D
T
 
T
L
 
L
V
 
V
T
 
S
Q
 
I
G
|
G
A
 
G
V
 
I
Q
 
Q
S
|
S
N
|
N
H
x
Q
V
 
T
R
 
R
Q
 
Q
T
 
V
I
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
A
A
 
A
R
 
H
F
 
L
G
 
G
L
 
M
K
 
K
T
 
C
E
 
V
V
 
L
I
 
V
L
 
Q
E
 
E
E
 
N
R
 
W
T
 
V
G
 
N
S
 
Y
K
 
S
A
 
D
S
 
A
D
 
V
Y
 
Y
M
 
D
G
 
R
N
 
V
G
 
G
N
 
N
V
 
I
L
 
Q
L
 
M
D
 
S
K
 
R
L
 
I
M
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
L
 
V
R
 
R
Y
 
L
V
 
V
P
 
P
G
 
D
G
 
R
T
 
S
D
 
-
M
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
W
D
 
E
S
 
D
T
 
A
A
 
L
E
 
E
N
 
S
V
 
V
R
 
R
Q
 
A
R
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
P
 
P
Y
 
Y
V
 
A
I
 
I
P
 
P
G
x
A
G
|
G
G
 
C
S
 
S
N
 
D
-
 
H
T
 
P
V
 
L
G
 
G
A
 
G
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
D
 
G
C
 
F
A
 
A
R
 
E
E
 
E
L
 
V
V
 
R
V
 
A
Q
 
Q
A
 
E
D
 
A
Q
 
E
M
 
L
D
 
G
L
 
F
K
 
K
I
 
F
D
 
D
R
 
Y
L
 
V
V
 
V
T
 
V
A
x
C
T
x
S
G
x
V
S
x
T
A
x
G
G
 
S
T
|
T
H
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
M
V
 
V
A
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
A
 
A
L
 
D
S
 
G
V
 
R
D
 
A
I
 
D
P
 
R
I
 
V
L
 
I
G
 
G
F
 
V
G
 
D
V
 
A
R
 
S
A
 
A
P
 
K
K
 
P
P
 
A
K
 
Q
Q
 
T
E
 
R
E
 
E
N
 
Q
V
 
I
Y
 
T
N
 
R
L
 
I
A
 
A
V
 
R
A
 
Q
T
 
T
A
 
A
E
 
E
T
 
K
I
 
V
G
 
G
A
 
L
G
 
E
G
 
R
R
 
D
V
 
I
R
 
M
R
 
R
E
 
A
A
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
L
D
 
D
C
 
E
D
 
R
Y
 
F
V
 
A
G
 
G
E
 
P
G
 
E
Y
|
Y
G
 
G
L
 
L
V
 
P
D
 
N
Q
 
E
G
 
G
V
 
T
I
 
L
D
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
R
L
 
L
A
 
C
A
 
A
R
 
R
T
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
M
L
 
L
L
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
S
x
E
G
 
G
K
 
K
A
 
S
M
 
M
K
 
H
G
 
G
L
 
M
I
 
I
D
 
E
Q
 
M
A
 
V
R
 
R
K
 
N
G
 
G
A
 
E
F
 
F
-
 
P
K
 
E
G
 
G
E
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
L
F
 
Y
L
 
A
H
 
H
T
x
L
G
|
G
G
|
G
A
 
V
Q
 
P
G
 
A
L
 
L
F
 
N
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
S
T
 
F
V
 
I
L
 
F

1tz2A Crystal structure of 1-aminocyclopropane-1-carboyxlate deaminase complexed with acc (see paper)
41% identity, 98% coverage: 1:328/333 of query aligns to 1:328/331 of 1tz2A

query
sites
1tz2A
M
 
M
H
 
N
L
 
L
A
 
Q
R
 
R
F
 
F
P
 
P
R
 
R
A
 
Y
R
 
P
F
 
L
A
 
T
H
 
F
L
 
G
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
I
E
 
Q
P
 
P
M
 
L
P
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
S
A
 
K
E
 
H
L
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
K
I
 
V
D
 
H
L
 
L
W
 
Y
V
 
A
K
 
K
R
 
R
D
 
E
D
 
D
C
 
C
-
 
N
T
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
F
G
 
G
G
 
G
N
|
N
K
|
K
T
 
T
R
 
R
K
|
K
L
 
L
E
 
E
F
 
Y
L
 
L
L
 
I
G
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
C
D
 
D
T
 
T
L
 
L
V
 
V
T
 
S
Q
 
I
G
 
G
A
 
G
V
 
I
Q
 
Q
S
|
S
N
|
N
H
 
Q
V
 
T
R
 
R
Q
 
Q
T
 
V
I
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
A
A
 
A
R
 
H
F
 
L
G
 
G
L
 
M
K
 
K
T
 
C
E
 
V
V
 
L
I
 
V
L
 
Q
E
 
E
E
 
N
R
 
W
T
 
V
G
 
N
S
 
Y
K
 
S
A
 
D
S
 
A
D
 
V
Y
 
Y
M
 
D
G
 
R
N
 
V
G
 
G
N
 
N
V
 
I
L
 
Q
L
 
M
D
 
S
K
 
R
L
 
I
M
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
L
 
V
R
 
R
Y
 
L
V
 
V
P
 
P
G
 
D
G
 
R
T
 
S
D
 
-
M
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
W
D
 
E
S
 
D
T
 
A
A
 
L
E
 
E
N
 
S
V
 
V
R
 
R
Q
 
A
R
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
P
 
P
Y
 
Y
V
 
A
I
 
I
P
 
P
G
 
A
G
 
G
G
 
C
S
 
S
N
 
D
-
 
H
T
 
P
V
 
L
G
 
G
A
 
G
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
D
 
G
C
 
F
A
 
A
R
 
E
E
 
E
L
 
V
V
 
R
V
 
A
Q
 
Q
A
 
E
D
 
A
Q
 
E
M
 
L
D
 
G
L
 
F
K
 
K
I
 
F
D
 
D
R
 
Y
L
 
V
V
 
V
T
 
V
A
x
C
T
x
S
G
x
V
S
x
T
A
x
G
G
 
S
T
|
T
H
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
M
V
 
V
A
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
A
 
A
L
 
D
S
 
G
V
 
R
D
 
A
I
 
D
P
 
R
I
 
V
L
 
I
G
 
G
F
 
V
G
 
D
V
 
A
R
 
S
A
 
A
P
 
K
K
 
P
P
 
A
K
 
Q
Q
 
T
E
 
R
E
 
E
N
 
Q
V
 
I
Y
 
T
N
 
R
L
 
I
A
 
A
V
 
R
A
 
Q
T
 
T
A
 
A
E
 
E
T
 
K
I
 
V
G
 
G
A
 
L
G
 
E
G
 
R
R
 
D
V
 
I
R
 
M
R
 
R
E
 
A
A
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
L
D
 
D
C
 
E
D
 
R
Y
 
F
V
 
A
G
 
G
E
 
P
G
 
E
Y
|
Y
G
 
G
L
 
L
V
 
P
D
 
N
Q
 
E
G
 
G
V
 
T
I
 
L
D
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
R
L
 
L
A
 
C
A
 
A
R
 
R
T
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
M
L
 
L
L
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
S
x
E
G
 
G
K
 
K
A
 
S
M
 
M
K
 
H
G
 
G
L
 
M
I
 
I
D
 
E
Q
 
M
A
 
V
R
 
R
K
 
N
G
 
G
A
 
E
F
 
F
-
 
P
K
 
E
G
 
G
E
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
L
F
 
Y
L
 
A
H
 
H
T
x
L
G
|
G
G
|
G
A
 
V
Q
 
P
G
 
A
L
 
L
F
 
N
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
S
T
 
F
V
 
I
L
 
F

Q5PWZ8 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase; ACC deaminase; ACCD; EC 3.5.99.7 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see paper)
38% identity, 98% coverage: 1:328/333 of query aligns to 1:335/338 of Q5PWZ8

query
sites
Q5PWZ8
M
 
M
H
 
N
L
 
L
A
 
N
R
 
R
F
 
F
P
 
E
R
 
R
A
 
Y
R
 
P
F
 
L
A
 
T
H
 
F
L
 
G
P
 
P
T
 
S
P
 
P
L
 
I
E
 
T
P
 
P
M
 
L
P
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
S
A
 
E
E
 
H
L
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
K
I
 
V
D
 
E
L
 
L
W
 
Y
V
 
A
K
 
K
R
 
R
D
 
E
D
 
D
C
 
C
-
 
N
T
 
S
G
|
G
L
 
L
A
 
A
G
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
N
K
 
K
T
 
T
R
 
R
K
 
K
L
 
L
E
 
E
F
 
Y
L
 
L
L
 
I
G
 
P
E
 
E
A