SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CCNA_02178 CCNA_02178 short-chain alcohol dehydrogenase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1gz6A (3r)-hydroxyacyl-coa dehydrogenase fragment of rat peroxisomal multifunctional enzyme type 2 (see paper)
50% identity, 91% coverage: 4:276/301 of query aligns to 3:275/301 of 1gz6A

query
sites
1gz6A
I
 
L
R
 
R
F
 
F
D
 
D
G
 
G
K
 
R
V
 
V
A
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
|
L
G
 
G
R
 
R
Q
 
A
H
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
F
A
 
A
R
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
V
N
 
N
D
|
D
L
|
L
G
 
G
G
 
G
S
 
D
M
 
F
D
 
K
G
 
G
S
 
V
G
 
G
G
 
K
S
 
G
S
 
S
E
 
S
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
E
E
 
E
I
 
I
K
 
R
A
 
R
L
 
R
G
 
G
G
 
G
E
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
A
N
 
N
G
 
Y
S
 
D
S
|
S
V
|
V
T
 
-
D
 
-
D
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
E
A
 
K
L
 
L
M
 
-
I
 
V
K
 
K
Q
 
T
A
 
A
M
 
L
D
 
D
T
 
T
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
V
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
 
R
T
 
S
L
 
F
T
 
S
K
 
R
M
 
I
E
 
S
L
 
D
A
 
E
D
 
D
F
 
W
E
 
D
L
 
I
V
 
I
M
 
Q
Q
 
R
V
 
V
H
|
H
V
 
L
F
 
R
G
 
G
T
 
S
F
 
F
K
 
Q
P
 
V
I
 
T
K
 
R
A
 
A
V
 
A
W
 
W
D
 
D
I
 
H
M
 
M
K
 
K
A
 
K
Q
 
Q
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
M
T
|
T
T
 
A
S
|
S
S
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
I
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
M
 
L
A
 
G
V
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
A
N
 
N
T
 
T
L
 
L
K
 
V
L
 
I
E
 
E
G
 
G
A
 
R
K
 
K
N
 
N
D
 
N
V
 
I
K
 
H
I
 
C
N
 
N
A
 
T
I
 
I
S
 
A
P
|
P
V
 
N
A
|
A
A
 
G
T
x
S
R
|
R
M
|
M
T
 
T
E
 
E
G
 
T
L
 
V
M
 
M
P
 
P
P
 
E
E
 
D
V
 
L
L
 
V
A
 
E
K
 
A
L
 
L
A
 
K
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
T
 
A
P
 
P
G
 
L
V
 
V
V
 
L
Y
 
W
L
 
L
C
 
C
S
 
H
D
 
E
E
 
S
A
 
C
-
 
E
P
 
E
T
 
N
G
 
G
A
 
G
I
 
L
L
 
F
T
 
E
A
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
W
F
 
I
A
 
G
L
 
K
S
 
L
R
 
R
I
 
W
Y
 
E
E
 
R
T
 
T
E
 
L
G
 
G
V
 
A
Y
 
I
L
 
V
G
 
R
E
 
K
G
 
R
G
 
N
-
 
Q
-
 
P
L
 
M
S
 
T
A
 
P
E
 
E
E
 
A
V
 
V
R
 
R
D
 
D
S
 
N
W
 
W
G
 
V
Q
 
K
I
 
I
T
 
C

P97852 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2; MFE-2; 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 4; 17-beta-HSD 4; D-bifunctional protein; DBP; Multifunctional protein 2; MFP-2; EC 1.1.1.n12; EC 4.2.1.107; EC 4.2.1.119 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
49% identity, 91% coverage: 2:276/301 of query aligns to 3:277/735 of P97852

query
sites
P97852
A
 
S
D
 
P
I
 
L
R
 
R
F
 
F
D
 
D
G
 
G
K
 
R
V
 
V
A
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
G
|
G
G
|
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
Q
x
A
H
x
Y
A
|
A
L
|
L
E
x
A
L
x
F
A
|
A
R
x
E
R
|
R
G
|
G
A
|
A
K
x
L
V
|
V
V
|
V
V
|
V
N
|
N
D
|
D
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
D
M
 
F
D
 
K
G
 
G
S
 
V
G
 
G
G
 
K
S
 
G
S
 
S
E
 
S
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
E
E
 
E
I
 
I
K
 
R
A
 
R
L
 
R
G
 
G
G
 
G
E
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
A
N
 
N
G
 
Y
S
 
D
S
 
S
V
 
V
T
 
-
D
 
-
D
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
E
A
 
K
L
 
L
M
 
-
I
 
V
K
 
K
Q
 
T
A
 
A
M
 
L
D
 
D
T
 
T
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
V
I
 
V
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
 
R
T
 
S
L
 
F
T
 
S
K
 
R
M
 
I
E
 
S
L
 
D
A
 
E
D
 
D
F
 
W
E
 
D
L
 
I
V
 
I
M
 
Q
Q
 
R
V
 
V
H
 
H
V
 
L
F
 
R
G
 
G
T
 
S
F
 
F
K
 
Q
P
 
V
I
 
T
K
 
R
A
 
A
V
 
A
W
 
W
D
 
D
I
 
H
M
 
M
K
 
K
A
 
K
Q
 
Q
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
M
T
 
T
T
 
A
S
 
S
S
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
I
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
 
Y
G
 
S
A
 
A
A
 
A
K
 
K
M
 
L
A
 
G
V
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
A
N
 
N
T
 
T
L
 
L
K
 
V
L
 
I
E
 
E
G
 
G
A
 
R
K
 
K
N
 
N
D
 
N
V
 
I
K
 
H
I
 
C
N
 
N
A
 
T
I
 
I
S
 
A
P
 
P
V
 
N
A
 
A
A
 
G
T
 
S
R
 
R
M
 
M
T
 
T
E
 
E
G
 
T
L
 
V
M
 
M
P
 
P
P
 
E
E
 
D
V
 
L
L
 
V
A
 
E
K
 
A
L
 
L
A
 
K
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
T
 
A
P
 
P
G
 
L
V
 
V
V
 
L
Y
 
W
L
 
L
C
 
C
S
 
H
D
 
E
E
 
S
A
 
C
-
 
E
P
 
E
T
 
N
G
 
G
A
 
G
I
 
L
L
 
F
T
 
E
A
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
W
F
 
I
A
 
G
L
 
K
S
 
L
R
 
R
I
 
W
Y
 
E
E
 
R
T
 
T
E
 
L
G
 
G
V
 
A
Y
 
I
L
 
V
G
 
R
E
 
K
G
 
R
G
 
N
-
 
Q
-
 
P
L
 
M
S
 
T
A
 
P
E
 
E
E
 
A
V
 
V
R
 
R
D
 
D
S
 
N
W
 
W
G
 
V
Q
 
K
I
 
I
T
 
C

P96825 Putative short-chain type dehydrogenase/reductase Rv0148; EC 1.1.1.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
48% identity, 91% coverage: 9:282/301 of query aligns to 7:280/286 of P96825

query
sites
P96825
K
 
R
V
 
V
A
 
I
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
Q
 
E
H
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
G
R
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
S
V
 
V
V
 
V
V
 
V
N
 
N
D
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
A
M
 
R
D
 
D
G
 
G
S
 
T
G
 
G
G
 
A
S
 
G
S
 
S
E
 
A
A
 
M
A
 
A
Q
 
D
K
 
E
V
 
V
V
 
V
D
 
A
E
 
E
I
 
I
K
 
R
A
 
D
L
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
V
A
 
A
N
 
N
G
 
Y
S
 
D
S
 
S
V
 
V
T
 
A
D
 
T
D
 
E
A
 
D
G
 
G
V
 
A
A
 
A
L
 
N
M
 
I
I
 
I
K
 
K
Q
 
T
A
 
A
M
 
L
D
 
D
T
 
E
W
 
F
G
 
G
R
 
A
I
 
V
D
 
H
I
 
G
L
 
V
I
 
V
A
 
S
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
 
G
T
 
T
L
 
F
T
 
H
K
 
K
M
 
M
E
 
S
L
 
F
A
 
E
D
 
N
F
 
W
E
 
D
L
 
A
V
 
V
M
 
L
Q
 
K
V
 
V
H
 
H
V
 
L
F
 
Y
G
 
G
T
 
G
F
 
Y
K
 
H
P
 
V
I
 
L
K
 
R
A
 
A
V
 
A
W
 
W
D
 
P
I
 
H
M
 
F
K
 
R
A
 
E
Q
 
Q
N
 
S
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
A
T
 
T
S
 
S
S
 
T
S
 
S
G
 
G
M
 
L
Y
 
F
G
 
G
N
 
N
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
A
 
A
K
 
K
M
 
L
A
 
G
V
 
L
L
 
V
G
 
G
L
 
L
M
 
I
N
 
N
T
 
T
L
 
L
K
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
N
 
Y
D
 
N
V
 
I
K
 
H
I
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
L
S
 
A
P
 
P
V
 
I
A
 
A
A
 
A
T
 
T
R
 
R
M
 
M
T
 
T
E
 
Q
G
 
D
L
 
I
M
 
L
P
 
P
P
 
P
E
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
T
P
 
P
E
 
E
Y
 
F
V
 
V
T
 
A
P
 
P
G
 
V
V
 
V
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
C
 
C
S
 
T
D
 
E
E
 
E
-
 
C
A
 
A
P
 
D
T
 
N
G
 
A
A
 
S
I
 
V
L
 
Y
T
 
V
A
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
G
A
 
K
F
 
V
A
 
Q
L
 
R
S
 
V
R
 
A
I
 
L
Y
 
F
E
 
G
T
 
N
E
 
D
G
 
G
V
 
A
Y
 
N
L
 
F
G
 
-
E
 
D
G
 
K
G
 
P
L
 
P
S
 
S
A
 
V
E
 
Q
E
 
D
V
 
V
R
 
A
D
 
A
S
 
R
W
 
W
G
 
A
Q
 
E
I
 
I
T
 
T
A
 
D
E
 
L
D
 
S
G
 
G
Q
 
A
K
|
K

1zbqA Crystal structure of human 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase type 4 in complex with NAD
46% identity, 91% coverage: 4:276/301 of query aligns to 3:275/302 of 1zbqA

query
sites
1zbqA
I
 
L
R
 
R
F
 
F
D
 
D
G
 
G
K
 
R
V
 
V
A
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
A
G
|
G
L
|
L
G
 
G
R
 
R
Q
 
A
H
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
F
A
 
A
R
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
V
N
 
N
D
|
D
L
|
L
G
 
G
G
 
G
S
 
D
M
 
F
D
 
K
G
 
G
S
 
V
G
 
G
G
 
K
S
 
G
S
 
S
E
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
E
E
 
E
I
 
I
K
 
R
A
 
R
L
 
R
G
 
G
G
 
G
E
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
A
N
 
N
G
 
Y
S
 
D
S
|
S
V
|
V
T
 
E
D
 
E
D
 
G
A
 
E
G
 
K
V
 
V
A
 
-
L
 
-
M
 
-
I
 
V
K
 
K
Q
 
T
A
 
A
M
 
L
D
 
D
T
 
A
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
V
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
 
R
T
 
S
L
 
F
T
 
A
K
 
R
M
 
I
E
 
S
L
 
D
A
 
E
D
 
D
F
 
W
E
 
D
L
 
I
V
 
I
M
 
H
Q
 
R
V
 
V
H
 
H
V
 
L
F
 
R
G
 
G
T
 
S
F
 
F
K
 
Q
P
 
V
I
 
T
K
 
R
A
 
A
V
 
A
W
 
W
D
 
E
I
 
H
M
 
M
K
 
K
A
 
K
Q
 
Q
N
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
M
T
|
T
T
 
S
S
|
S
S
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
I
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
M
 
L
A
 
G
V
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
A
N
 
N
T
 
S
L
 
L
K
 
A
L
 
I
E
 
E
G
 
G
A
 
R
K
 
K
N
 
S
D
 
N
V
 
I
K
 
H
I
 
C
N
 
N
A
 
T
I
 
I
S
 
A
P
|
P
V
x
N
A
|
A
A
 
G
T
x
S
R
|
R
M
|
M
T
 
T
E
 
Q
G
 
T
L
 
V
M
 
M
P
 
P
P
 
E
E
 
D
V
 
L
L
 
V
A
 
E
K
 
A
L
 
L
A
 
K
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
T
 
A
P
 
P
G
 
L
V
 
V
V
 
L
Y
 
W
L
 
L
C
 
C
S
 
H
D
 
E
E
 
S
A
 
C
-
 
E
P
 
E
T
 
N
G
 
G
A
 
G
I
 
L
L
 
F
T
 
E
A
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
W
F
 
I
A
 
G
L
 
K
S
 
L
R
 
R
I
 
W
Y
 
E
E
 
R
T
 
T
E
 
L
G
 
G
V
 
A
Y
 
I
L
 
V
G
 
R
E
 
Q
G
 
K
G
 
N
-
 
H
-
 
P
L
 
M
S
 
T
A
 
P
E
 
E
E
 
A
V
 
V
R
 
K
D
 
A
S
 
N
W
 
W
G
 
K
Q
 
K
I
 
I
T
 
C

P51659 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2; MFE-2; 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 4; 17-beta-HSD 4; D-bifunctional protein; DBP; Multifunctional protein 2; MFP-2; Short chain dehydrogenase/reductase family 8C member 1; EC 1.1.1.n12; EC 4.2.1.107; EC 4.2.1.119 from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
45% identity, 91% coverage: 2:276/301 of query aligns to 3:277/736 of P51659

query
sites
P51659
A
 
S
D
 
P
I
 
L
R
 
R
F
 
F
D
 
D
G
 
G
K
 
R
V
 
V
A
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
Q
 
A
H
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
F
A
 
A
R
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
V
N
 
N
D
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
D
M
 
F
D
 
K
G
 
G
S
 
V
G
 
G
G
 
K
S
 
G
S
 
S
E
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
E
E
 
E
I
 
I
K
 
R
A
 
R
L
 
R
G
 
G
G
 
G
E
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
A
N
 
N
G
 
Y
S
 
D
S
 
S
V
 
V
T
 
E
D
 
E
D
 
G
A
 
E
G
 
K
V
 
V
A
 
-
L
 
-
M
 
-
I
 
V
K
 
K
Q
 
T
A
 
A
M
 
L
D
 
D
T
 
A
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
V
I
 
V
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
x
R
T
 
S
L
 
F
T
 
A
K
 
R
M
 
I
E
 
S
L
 
D
A
 
E
D
 
D
F
 
W
E
 
D
L
 
I
V
 
I
M
 
H
Q
 
R
V
 
V
H
 
H
V
 
L
F
 
R
G
 
G
T
 
S
F
 
F
K
 
Q
P
 
V
I
 
T
K
 
R
A
 
A
V
 
A
W
 
W
D
 
E
I
 
H
M
 
M
K
 
K
A
 
K
Q
 
Q
N
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
M
T
 
T
T
 
S
S
 
S
S
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
I
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
 
Y
G
 
S
A
 
A
A
 
A
K
 
K
M
 
L
A
 
G
V
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
A
N
 
N
T
 
S
L
 
L
K
 
A
L
 
I
E
 
E
G
 
G
A
 
R
K
 
K
N
 
S
D
 
N
V
 
I
K
 
H
I
 
C
N
 
N
A
 
T
I
 
I
S
 
A
P
 
P
V
 
N
A
 
A
A
 
G
T
 
S
R
 
R
M
 
M
T
 
T
E
 
Q
G
 
T
L
 
V
M
 
M
P
 
P
P
 
E
E
 
D
V
 
L
L
 
V
A
 
E
K
 
A
L
 
L
A
 
K
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
T
 
A
P
 
P
G
 
L
V
 
V
V
 
L
Y
 
W
L
 
L
C
 
C
S
 
H
D
 
E
E
 
S
A
 
C
-
 
E
P
 
E
T
 
N
G
 
G
A
 
G
I
 
L
L
 
F
T
 
E
A
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
W
F
 
I
A
 
G
L
 
K
S
 
L
R
 
R
I
 
W
Y
 
E
E
 
R
T
 
T
E
 
L
G
 
G
V
 
A
Y
 
I
L
 
V
G
 
R
E
 
Q
G
 
K
G
 
N
-
 
H
-
 
P
L
 
M
S
 
T
A
 
P
E
 
E
E
 
A
V
 
V
R
 
K
D
 
A
S
 
N
W
 
W
G
 
K
Q
 
K
I
 
I
T
 
C

Sites not aligning to the query:

P22414 Peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase; HDE; Multifunctional beta-oxidation protein; MFP; EC 4.2.1.119; EC 1.1.1.n12 from Candida tropicalis (Yeast) (see paper)
46% identity, 94% coverage: 1:282/301 of query aligns to 1:281/906 of P22414

query
sites
P22414
M
 
M
A
 
S
D
 
P
I
 
V
R
 
D
F
 
F
D
 
K
G
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
K
Q
 
Y
H
 
Y
A
 
S
L
 
L
E
 
E
L
 
F
A
 
A
R
 
K
R
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
V
N
 
N
D
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
A
M
 
L
D
 
N
G
 
G
S
 
Q
G
 
G
G
 
G
S
 
N
S
 
S
E
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
K
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
K
 
V
A
 
K
L
 
N
G
 
G
G
 
G
E
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
A
N
 
D
G
 
Y
S
 
N
S
 
N
V
 
V
T
 
L
D
 
D
D
 
G
A
 
D
G
 
K
V
 
I
A
 
-
L
 
-
M
 
-
I
 
V
K
 
E
Q
 
T
A
 
A
M
 
V
D
 
K
T
 
N
W
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
V
D
 
H
I
 
V
L
 
I
I
 
I
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
 
A
T
 
S
L
 
M
T
 
K
K
 
K
M
 
M
E
 
T
L
 
E
A
 
K
D
 
D
F
 
Y
E
 
K
L
 
L
V
 
V
M
 
I
Q
 
D
V
 
V
H
 
H
V
 
L
F
 
N
G
 
G
T
 
A
F
 
F
K
 
A
P
 
V
I
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
A
W
 
W
D
 
P
I
 
Y
M
 
F
K
 
Q
A
 
K
Q
 
Q
N
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
V
 
N
T
 
T
T
 
S
S
 
S
S
 
P
S
 
A
G
 
G
M
 
L
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
 
Y
G
 
A
A
 
S
A
 
A
K
 
K
M
 
S
A
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
F
M
 
A
N
 
E
T
 
T
L
 
L
K
 
A
L
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
N
 
Y
D
 
N
V
 
I
K
 
K
I
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
I
S
 
A
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
R
T
 
S
R
 
R
M
 
M
T
 
T
E
 
E
G
 
S
L
 
I
M
 
L
P
 
P
P
 
P
E
 
P
V
 
M
L
 
L
A
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
G
P
 
P
E
 
E
Y
 
K
V
 
V
T
 
A
P
 
P
G
 
L
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
L
 
L
C
 
S
S
 
S
D
 
A
E
 
E
A
 
N
P
 
E
-
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
I
 
F
L
 
F
T
 
E
A
 
V
G
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
F
F
 
Y
A
 
A
L
 
Q
S
 
I
R
 
R
I
 
W
Y
 
E
E
 
R
T
 
S
E
 
G
G
 
G
V
 
V
-
 
L
Y
 
F
L
 
K
G
 
P
E
 
D
G
 
Q
G
 
S
L
 
F
S
 
T
A
 
A
E
 
E
E
 
V
V
 
V
R
 
A
D
 
K
S
 
R
W
 
F
G
 
S
Q
 
E
I
 
I
T
 
L
A
 
D
E
 
Y
D
 
D
G
 
D
Q
 
S
K
 
R

Sites not aligning to the query:

1gz6B (3r)-hydroxyacyl-coa dehydrogenase fragment of rat peroxisomal multifunctional enzyme type 2 (see paper)
47% identity, 91% coverage: 4:276/301 of query aligns to 3:252/278 of 1gz6B

query
sites
1gz6B
I
 
L
R
 
R
F
 
F
D
 
D
G
 
G
K
 
R
V
 
V
A
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
|
L
G
 
G
R
 
R
Q
 
A
H
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
F
A
 
A
R
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
V
N
 
N
D
|
D
L
|
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
M
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
E
 
S
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
E
E
 
E
I
 
I
K
 
R
A
 
R
L
 
R
G
 
G
G
 
G
E
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
A
N
 
N
G
 
Y
S
 
D
S
|
S
V
|
V
T
 
-
D
 
-
D
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
E
A
 
K
L
 
L
M
 
-
I
 
V
K
 
K
Q
 
T
A
 
A
M
 
L
D
 
D
T
 
T
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
V
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
 
R
T
 
S
L
 
F
T
 
S
K
 
R
M
 
I
E
 
S
L
 
D
A
 
E
D
 
D
F
 
W
E
 
D
L
 
I
V
 
I
M
 
Q
Q
 
R
V
 
V
H
|
H
V
 
L
F
 
R
G
 
G
T
 
S
F
 
F
K
 
Q
P
 
V
I
 
T
K
 
R
A
 
A
V
 
A
W
 
W
D
 
D
I
 
H
M
 
M
K
 
K
A
 
K
Q
 
Q
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
M
T
|
T
T
 
A
S
|
S
S
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
I
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
M
 
L
A
 
G
V
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
A
N
 
N
T
 
T
L
 
L
K
 
V
L
 
I
E
 
E
G
 
G
A
 
R
K
 
K
N
 
N
D
 
N
V
 
I
K
 
H
I
 
C
N
 
N
A
 
T
I
 
I
S
 
A
P
|
P
V
 
N
A
 
E
A
 
A
T
 
-
R
 
-
M
 
-
T
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
M
 
-
P
 
-
P
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
L
A
 
K
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
T
 
A
P
 
P
G
 
L
V
 
V
V
 
L
Y
 
W
L
 
L
C
 
C
S
 
H
D
 
E
E
 
S
A
 
C
-
 
E
P
 
E
T
 
N
G
 
G
A
 
G
I
 
L
L
 
F
T
 
E
A
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
W
F
 
I
A
 
G
L
 
K
S
 
L
R
 
R
I
 
W
Y
 
E
E
 
R
T
 
T
E
 
L
G
 
G
V
 
A
Y
 
I
L
 
V
G
 
R
E
 
K
G
 
R
G
 
N
-
 
Q
-
 
P
L
 
M
S
 
T
A
 
P
E
 
E
E
 
A
V
 
V
R
 
R
D
 
D
S
 
N
W
 
W
G
 
V
Q
 
K
I
 
I
T
 
C

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
41% identity, 78% coverage: 6:239/301 of query aligns to 4:234/247 of P73574

query
sites
P73574
F
 
L
D
 
T
G
 
A
K
 
Q
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
 
S
G
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
R
 
K
Q
 
A
H
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
A
R
 
T
G
 
G
A
 
M
K
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
V
N
 
N
D
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
M
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
Y
G
 
A
G
 
Q
S
 
S
S
 
S
E
 
T
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
K
 
A
V
 
V
V
 
V
D
 
A
E
 
E
I
 
I
K
 
I
A
 
A
L
 
N
G
 
G
G
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
N
 
V
G
 
Q
S
 
A
S
 
N
V
 
V
T
 
A
D
 
N
D
 
A
A
 
D
G
 
E
V
 
V
A
 
D
L
 
Q
M
 
L
I
 
I
K
 
K
Q
 
T
A
 
T
M
 
L
D
 
D
T
 
K
W
 
F
G
 
S
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
T
T
 
L
L
 
L
T
 
L
K
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
A
 
E
D
 
D
F
 
W
E
 
Q
L
 
A
V
 
V
M
 
I
Q
 
D
V
 
L
H
 
N
V
 
L
F
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
K
 
L
P
 
C
I
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
V
W
 
S
D
 
K
I
 
L
M
 
M
K
 
L
A
 
K
Q
 
Q
N
 
K
Y
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
N
T
 
I
T
 
T
S
 
S
S
 
V
S
 
A
G
 
G
M
 
M
Y
 
M
G
 
G
N
 
N
F
x
P
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
 
Y
G
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
M
 
A
A
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
F
M
 
T
N
 
K
T
 
T
L
 
V
K
 
A
L
 
K
E
 
E
G
 
L
A
 
A
K
 
S
N
 
R
D
 
G
V
 
V
K
 
T
I
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
S
 
A
P
 
P
-
 
G
V
x
F
A
 
I
A
 
A
T
 
T
R
 
D
M
 
M
T
 
T
E
 
E
G
 
N
L
 
L
M
x
N
P
 
A
P
 
E
E
 
P
V
 
I
L
 
L
A
 
Q
K
 
F
L
 
I
A
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
R
-
 
Y
-
 
G
-
 
Q
P
 
P
E
 
E
Y
 
E
V
 
V
T
 
A
P
 
G
G
 
T
V
 
I
V
 
R
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
T
D
 
D
E
 
-
A
 
-
P
 
P
T
 
A
G
 
A
A
 
A
I
 
Y
L
 
I
T
 
T

1edoA The x-ray structure of beta-keto acyl carrier protein reductase from brassica napus complexed with NADP+ (see paper)
37% identity, 68% coverage: 10:215/301 of query aligns to 3:192/244 of 1edoA

query
sites
1edoA
V
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
K
Q
 
A
H
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
S
L
 
L
A
 
G
R
 
K
R
 
A
G
 
G
A
 
C
K
 
K
V
 
V
V
 
L
V
 
V
N
|
N
D
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
M
 
-
D
 
-
G
 
-
S
x
Y
G
x
A
G
x
R
S
|
S
S
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
K
 
E
V
 
V
V
 
S
D
 
K
E
 
Q
I
 
I
K
 
E
A
 
A
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
T
N
 
F
G
 
G
S
 
G
S
x
D
V
|
V
T
 
S
D
 
K
D
 
E
A
 
A
G
 
D
V
 
V
A
 
E
L
 
A
M
 
M
I
 
M
K
 
K
Q
 
T
A
 
A
M
 
I
D
 
D
T
 
A
W
 
W
G
 
G
R
 
T
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
V
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
T
T
 
L
L
 
L
T
 
I
K
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
K
A
 
S
D
 
Q
F
 
W
E
 
D
L
 
E
V
 
V
M
 
I
Q
 
D
V
 
L
H
 
N
V
 
L
F
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
K
 
L
P
 
C
I
 
T
K
 
Q
A
 
A
V
 
A
W
 
T
D
 
K
I
 
I
M
 
M
K
 
M
A
 
K
Q
 
K
N
 
R
Y
 
K
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
N
T
 
I
T
 
A
S
|
S
S
 
V
S
 
V
G
 
G
M
 
L
Y
 
I
G
 
G
N
 
N
F
 
I
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
M
 
A
A
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
F
M
 
S
N
 
K
T
 
T
L
 
A
K
 
A
L
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
S
N
 
R
D
 
N
V
 
I
K
 
N
I
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
S
 
C
P
|
P
V
 
-
A
 
-
A
 
-
T
 
-
R
 
-
M
 
-
T
 
-
E
 
-
G
|
G
L
 
F
M
x
I
P
 
A
P
x
S
E
 
D
V
x
M
L
 
T
A
 
A
K
 
K
L
 
L

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
33% identity, 76% coverage: 5:232/301 of query aligns to 4:228/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
R
 
R
F
 
L
D
 
Q
G
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
A
G
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
L
Q
 
E
H
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
V
L
 
F
A
 
M
R
 
K
R
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
I
N
 
A
D
|
D
L
x
F
G
 
N
G
 
-
S
 
-
M
 
-
D
 
E
G
 
A
S
 
A
G
 
G
G
 
K
S
 
E
S
 
A
E
 
V
A
 
E
A
 
A
Q
 
N
K
 
P
V
 
G
V
 
V
D
 
V
E
 
F
I
 
I
K
 
R
A
x
V
L
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
I
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
S
 
-
S
x
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
D
 
R
A
 
E
G
 
S
V
 
V
A
 
H
L
 
R
M
 
L
I
 
V
K
 
E
Q
 
N
A
 
V
M
 
A
D
 
E
T
 
R
W
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
|
D
K
 
S
T
 
M
L
 
L
T
 
S
K
|
K
M
 
M
E
 
T
L
 
V
A
 
D
D
 
Q
F
 
F
E
 
Q
L
 
Q
V
 
V
M
 
I
Q
 
N
V
 
V
H
x
N
V
 
L
F
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
K
 
H
P
 
C
I
 
T
K
 
Q
A
 
A
V
 
V
W
 
L
D
 
P
I
 
Y
M
 
M
K
 
A
A
 
E
Q
 
Q
N
 
G
Y
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
V
 
N
T
|
T
T
 
S
S
|
S
S
 
V
S
 
T
G
 
G
M
 
T
Y
 
Y
G
 
G
N
|
N
F
x
V
G
 
G
Q
|
Q
S
 
T
N
 
N
Y
|
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
M
 
A
A
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
M
M
 
T
N
 
K
T
 
T
L
 
W
K
 
A
L
 
K
E
 
E
G
 
L
A
 
A
K
 
R
N
 
K
D
 
G
V
 
I
K
 
N
I
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
S
 
A
P
|
P
V
 
G
A
x
F
A
x
T
T
 
E
R
x
T
M
 
A
T
x
M
E
 
V
G
 
A
L
 
E
M
 
V
P
 
P
P
 
E
E
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
E
K
|
K
L
 
M
-
 
K
-
 
A
-
 
Q
-
 
V
-
 
P
-
 
M
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
G
A
 
K
P
 
P
E
 
E
Y
 
D
V
 
I
T
 
A
P
 
N
G
 
A
V
 
Y
V
 
L
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
H
E
 
E
A
 
S

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
35% identity, 79% coverage: 6:243/301 of query aligns to 3:244/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
F
 
L
D
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
Q
 
D
H
 
I
A
 
A
L
 
I
E
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
K
R
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
N
V
 
I
V
 
F
V
 
F
N
|
N
D
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
M
 
-
D
 
-
G
 
-
S
x
Y
G
x
N
G
|
G
S
|
S
S
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
K
 
E
V
 
T
V
 
A
D
 
K
E
 
L
I
 
V
K
 
A
A
 
E
L
 
H
G
 
G
G
 
V
E
 
E
A
 
V
I
 
E
A
 
A
N
 
M
G
 
K
S
 
A
S
x
N
V
|
V
T
 
A
D
 
I
D
 
A
A
 
E
G
 
D
V
 
V
A
 
D
L
 
A
M
 
F
I
 
F
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
M
 
I
D
 
E
T
 
R
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
N
T
 
L
L
 
L
T
 
M
K
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
E
A
 
D
D
 
E
F
 
W
E
 
D
L
 
D
V
 
V
M
 
I
Q
 
N
V
x
I
H
 
N
V
 
L
F
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
K
 
L
P
 
C
I
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
V
W
 
S
D
 
R
I
 
T
M
 
M
K
 
M
A
 
K
Q
 
Q
N
 
R
Y
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
V
 
N
T
 
M
T
 
A
S
|
S
S
 
V
S
 
V
G
 
G
M
 
L
Y
 
I
G
 
G
N
 
N
F
 
A
G
 
G
Q
|
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
V
A
 
A
A
 
S
K
|
K
M
 
A
A
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
L
M
 
T
N
 
K
T
 
T
L
 
T
K
 
A
L
 
R
E
 
E
G
 
L
A
 
A
K
 
P
N
 
R
D
 
G
V
 
I
K
 
N
I
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
S
 
A
P
|
P
-
 
G
V
 
F
A
x
I
A
 
T
T
|
T
R
 
D
M
 
M
T
 
T
E
 
D
G
 
K
L
 
L
M
 
D
P
 
E
P
 
K
E
 
T
V
 
K
L
 
E
A
 
A
K
 
M
L
 
L
A
 
A
-
 
Q
-
 
I
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
G
-
 
T
P
 
T
E
 
E
Y
 
D
V
 
I
T
 
A
P
 
N
G
 
A
V
 
V
V
 
L
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
A
A
 
S
P
 
K
-
 
Y
-
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
I
 
T
L
 
L
T
 
S
A
 
V
G
 
D
A
 
G
G
 
G

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
36% identity, 63% coverage: 6:196/301 of query aligns to 4:185/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
F
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
G
 
A
G
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
L
Q
 
E
H
 
I
A
 
A
L
 
K
E
 
K
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
R
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
I
N
 
S
D
|
D
L
x
M
G
 
-
G
 
-
S
 
-
M
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
N
S
 
A
E
 
E
A
 
K
A
 
C
Q
 
Q
K
 
E
V
 
T
V
 
A
D
 
N
E
 
S
I
 
L
K
 
K
A
 
E
L
 
Q
G
 
G
G
 
F
E
 
D
A
 
A
I
 
L
A
 
S
N
 
A
G
 
P
S
 
C
S
x
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
D
 
E
A
 
D
G
 
A
V
 
Y
A
 
K
L
 
Q
M
 
A
I
 
I
K
 
E
Q
 
L
A
 
T
M
 
Q
D
 
K
T
 
T
W
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
F
L
x
Q
R
 
H
D
 
V
K
 
A
T
 
P
L
 
I
T
 
E
K
 
E
M
 
F
E
 
P
L
 
T
A
 
A
D
 
V
F
 
F
E
 
Q
L
 
K
V
 
L
M
 
V
Q
 
Q
V
 
V
H
 
M
V
 
L
F
 
T
G
 
G
T
 
A
F
 
F
K
 
I
P
 
G
I
 
I
K
 
K
A
 
H
V
 
V
W
 
L
D
 
P
I
 
I
M
 
M
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
N
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
N
T
x
M
T
x
A
S
|
S
S
 
I
S
 
N
G
 
G
M
 
L
Y
 
I
G
 
G
N
 
F
F
 
A
G
 
G
Q
x
K
S
 
A
N
 
G
Y
|
Y
G
 
N
A
 
S
A
 
A
K
|
K
M
 
H
A
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
L
M
 
T
N
 
K
T
 
V
L
 
A
K
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
C
A
 
A
K
 
R
N
 
D
D
 
G
V
 
I
K
 
T
I
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
S
 
C
P
 
P

Sites not aligning to the query:

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
36% identity, 63% coverage: 6:196/301 of query aligns to 5:186/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
F
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
G
 
A
G
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
L
Q
 
E
H
 
I
A
 
A
L
 
K
E
 
K
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
R
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
I
N
 
S
D
|
D
L
x
M
G
 
-
G
 
-
S
 
-
M
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
N
S
 
A
E
 
E
A
 
K
A
 
C
Q
 
Q
K
 
E
V
 
T
V
 
A
D
 
N
E
 
S
I
 
L
K
 
K
A
 
E
L
 
Q
G
 
G
G
 
F
E
 
D
A
 
A
I
 
L
A
 
S
N
 
A
G
 
P
S
 
C
S
x
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
D
 
E
A
 
D
G
 
A
V
 
Y
A
 
K
L
 
Q
M
 
A
I
 
I
K
 
E
Q
 
L
A
 
T
M
 
Q
D
 
K
T
 
T
W
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
F
L
x
Q
R
 
H
D
 
V
K
 
A
T
 
P
L
 
I
T
 
E
K
 
E
M
 
F
E
 
P
L
 
T
A
 
A
D
 
V
F
 
F
E
 
Q
L
 
K
V
 
L
M
 
V
Q
 
Q
V
 
V
H
 
M
V
 
L
F
 
T
G
 
G
T
 
A
F
 
F
K
 
I
P
 
G
I
 
I
K
 
K
A
 
H
V
 
V
W
 
L
D
 
P
I
 
I
M
 
M
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
N
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
N
T
x
M
T
x
A
S
|
S
S
 
I
S
x
N
G
 
G
M
 
L
Y
 
I
G
 
G
N
 
F
F
 
A
G
 
G
Q
x
K
S
 
A
N
 
G
Y
|
Y
G
 
N
A
 
S
A
 
A
K
|
K
M
 
H
A
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
L
M
 
T
N
 
K
T
 
V
L
 
A
K
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
C
A
 
A
K
 
R
N
 
D
D
 
G
V
 
I
K
 
T
I
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
S
 
C
P
|
P

Sites not aligning to the query:

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
33% identity, 80% coverage: 6:245/301 of query aligns to 3:242/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
F
 
F
D
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
R
 
R
Q
 
A
H
 
I
A
 
A
L
 
E
E
 
T
L
 
L
A
 
V
R
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
-
N
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
M
 
-
D
 
-
G
 
G
S
 
T
G
 
A
G
x
T
S
 
S
S
 
E
E
 
S
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
K
 
A
V
 
I
V
 
S
D
 
D
E
 
Y
I
 
L
K
 
G
A
 
A
L
 
N
G
 
G
G
 
K
E
 
G
A
 
L
I
 
M
A
x
L
N
|
N
G
 
-
S
 
-
S
 
-
V
|
V
T
 
T
D
 
D
D
 
P
A
 
A
G
 
S
V
 
I
A
 
E
L
 
S
M
 
V
I
 
L
K
 
E
Q
 
N
A
 
V
M
 
R
D
 
A
T
 
E
W
 
F
G
 
G
R
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
N
T
 
L
L
 
L
T
 
M
K
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
D
A
 
D
D
 
E
F
 
W
E
 
N
L
 
D
V
 
I
M
 
I
Q
 
E
V
 
T
H
 
N
V
 
L
F
 
S
G
 
S
T
 
V
F
 
F
K
 
R
P
 
L
I
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
W
 
M
D
 
R
I
 
A
M
 
M
K
 
M
A
 
K
Q
 
K
N
 
R
Y
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
T
T
 
I
T
 
G
S
|
S
S
 
V
S
 
V
G
 
G
M
 
T
Y
 
M
G
 
G
N
 
N
F
 
A
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
M
 
A
A
 
G
V
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
F
M
 
S
N
 
K
T
 
S
L
 
L
K
 
A
L
 
R
E
 
E
G
 
V
A
 
A
K
 
S
N
 
R
D
 
G
V
 
I
K
 
T
I
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
S
 
A
P
 
P
-
 
G
V
 
F
A
 
I
A
 
E
T
 
T
R
 
D
M
 
M
T
 
T
E
 
R
G
 
A
L
 
L
M
 
T
P
 
D
P
 
E
E
 
Q
V
 
R
L
 
A
A
 
G
K
 
T
L
 
L
A
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
G
-
 
T
P
 
P
E
 
N
Y
 
E
V
 
I
T
 
A
P
 
S
G
 
A
V
 
V
V
 
A
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
A
P
 
S
-
 
Y
-
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
I
 
T
L
 
L
T
 
H
A
 
V
G
 
N
A
 
G
G
 
G
A
 
M
F
 
Y

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
33% identity, 80% coverage: 4:245/301 of query aligns to 1:242/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
I
 
M
R
 
N
F
 
F
D
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
x
S
G
x
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
R
 
R
Q
 
A
H
 
I
A
 
A
L
 
E
E
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
-
N
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
M
 
-
D
 
-
G
 
G
S
 
T
G
 
A
G
x
T
S
 
S
S
 
E
E
 
N
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
K
 
A
V
 
I
V
 
S
D
 
D
E
 
Y
I
 
L
K
 
G
A
 
A
L
 
N
G
 
G
G
 
K
E
 
G
A
 
L
I
 
M
A
 
L
N
|
N
G
 
-
S
 
-
S
 
-
V
|
V
T
 
T
D
 
D
D
 
P
A
 
A
G
 
S
V
 
I
A
 
E
L
 
S
M
 
V
I
 
L
K
 
E
Q
 
K
A
 
I
M
 
R
D
 
A
T
 
E
W
 
F
G
 
G
R
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
N
T
 
L
L
 
L
T
 
M
K
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
D
A
 
E
D
 
E
F
 
W
E
 
N
L
 
D
V
 
I
M
 
I
Q
 
E
V
 
T
H
 
N
V
 
L
F
 
S
G
 
S
T
 
V
F
 
F
K
 
R
P
 
L
I
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
W
 
M
D
 
R
I
 
A
M
 
M
K
 
M
A
 
K
Q
 
K
N
 
R
Y
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
T
T
 
I
T
 
G
S
 
S
S
 
V
S
 
V
G
 
G
M
 
T
Y
 
M
G
 
G
N
 
N
F
 
G
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
x
A
A
|
A
A
|
A
K
|
K
M
 
A
A
 
G
V
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
F
M
 
S
N
 
K
T
 
S
L
 
L
K
 
A
L
 
R
E
 
E
G
 
V
A
 
A
K
 
S
N
 
R
D
 
G
V
 
I
K
 
T
I
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
S
 
A
P
 
P
-
 
G
V
 
F
A
x
I
A
 
E
T
 
T
R
 
D
M
 
M
T
 
T
E
 
R
G
 
A
L
 
L
M
 
S
P
 
D
P
 
D
E
 
Q
-
 
R
-
 
A
-
 
G
V
 
I
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
L
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
G
A
 
G
P
 
A
E
 
Q
Y
 
E
V
 
I
T
 
A
P
 
N
G
 
A
V
 
V
V
 
A
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
A
P
 
A
-
 
Y
-
 
I
T
 
T
G
 
G
A
x
E
I
 
T
L
 
L
T
 
H
A
 
V
G
 
N
A
 
G
G
 
G
A
 
M
F
 
Y

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
33% identity, 80% coverage: 6:245/301 of query aligns to 2:241/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
F
 
F
D
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
R
 
R
Q
 
A
H
 
I
A
 
A
L
 
E
E
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
-
N
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
M
 
-
D
 
-
G
 
G
S
 
T
G
 
A
G
x
T
S
 
S
S
 
E
E
 
N
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
K
 
A
V
 
I
V
 
S
D
 
D
E
 
Y
I
 
L
K
 
G
A
 
A
L
 
N
G
 
G
G
 
K
E
 
G
A
 
L
I
 
M
A
 
L
N
|
N
G
 
-
S
 
-
S
 
-
V
|
V
T
 
T
D
 
D
D
 
P
A
 
A
G
 
S
V
 
I
A
 
E
L
 
S
M
 
V
I
 
L
K
 
E
Q
 
K
A
 
I
M
 
R
D
 
A
T
 
E
W
 
F
G
 
G
R
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
N
T
 
L
L
 
L
T
 
M
K
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
D
A
 
E
D
x
E
F
 
W
E
 
N
L
 
D
V
 
I
M
 
I
Q
 
E
V
 
T
H
 
N
V
 
L
F
 
S
G
 
S
T
 
V
F
 
F
K
 
R
P
 
L
I
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
W
 
M
D
 
R
I
 
A
M
 
M
K
 
M
A
 
K
Q
 
K
N
 
R
Y
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
T
T
 
I
T
 
G
S
|
S
S
 
V
S
 
V
G
 
G
M
 
T
Y
 
M
G
 
G
N
 
N
F
 
G
G
 
G
Q
|
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
M
 
A
A
 
G
V
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
F
M
 
S
N
 
K
T
 
S
L
 
L
K
 
A
L
 
R
E
 
E
G
 
V
A
 
A
K
 
S
N
 
R
D
 
G
V
 
I
K
 
T
I
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
S
 
A
P
|
P
-
x
G
V
 
F
A
x
I
A
 
E
T
 
T
R
 
D
M
 
M
T
 
T
E
 
R
G
 
A
L
 
L
M
 
S
P
 
D
P
 
D
E
 
Q
-
 
R
-
 
A
-
 
G
V
 
I
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
L
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
G
A
 
G
P
 
A
E
 
Q
Y
 
E
V
 
I
T
 
A
P
 
N
G
 
A
V
 
V
V
 
A
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
A
P
 
A
-
 
Y
-
 
I
T
 
T
G
 
G
A
x
E
I
x
T
L
 
L
T
 
H
A
 
V
G
 
N
A
 
G
G
 
G
A
 
M
F
 
Y

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
35% identity, 79% coverage: 9:245/301 of query aligns to 2:238/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
K
 
K
V
 
S
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
Q
 
S
H
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
E
R
 
E
G
 
G
A
 
Y
K
 
N
V
 
V
V
 
A
V
 
V
N
|
N
D
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
M
 
-
D
 
-
G
 
-
S
x
Y
G
x
A
G
|
G
S
|
S
S
 
K
E
 
E
A
 
K
A
 
A
Q
 
E
K
 
A
V
 
V
V
 
V
D
 
E
E
 
E
I
 
I
K
 
K
A
 
A
L
 
K
G
 
G
G
 
V
E
 
D
A
 
S
I
 
F
A
 
A
N
 
I
G
 
Q
S
x
A
S
x
N
V
|
V
T
 
A
D
 
D
D
 
A
A
 
D
G
 
E
V
 
V
A
 
K
L
 
A
M
 
M
I
 
I
K
 
K
Q
 
E
A
 
V
M
 
V
D
 
S
T
 
Q
W
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
N
T
 
L
L
 
L
T
 
M
K
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
E
A
 
Q
D
 
E
F
 
W
E
 
D
L
 
D
V
 
V
M
 
I
Q
 
D
V
x
T
H
 
N
V
 
L
F
 
K
G
 
G
T
 
V
F
 
F
K
 
N
P
 
C
I
 
I
K
 
Q
A
 
K
V
 
A
W
 
T
D
 
P
I
 
Q
M
 
M
K
 
L
A
 
R
Q
 
Q
N
 
R
Y
 
S
G
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
I
V
 
N
T
 
L
T
 
S
S
|
S
S
 
V
S
 
V
G
 
G
M
 
A
Y
 
V
G
 
G
N
 
N
F
 
P
G
 
G
Q
|
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
V
A
 
A
A