SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CCNA_03061 CCNA_03061 SDR family dehydrogenase, group 9 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4yacA Crystal structure of ligo in complex with nadh from sphingobium sp. Strain syk-6 (see paper)
36% identity, 65% coverage: 16:192/273 of query aligns to 7:187/270 of 4yacA

query
sites
4yacA
K
 
K
S
 
V
I
 
A
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
G
S
|
S
G
|
G
I
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
G
C
 
Q
A
 
A
K
 
K
R
 
V
F
 
L
A
 
A
Q
 
E
E
 
E
G
 
A
W
 
Q
F
 
M
-
 
K
V
 
V
G
 
V
L
 
I
S
 
A
D
|
D
I
|
I
D
 
R
K
 
Q
V
 
D
G
x
H
L
 
L
K
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
M
L
 
G
A
 
Y
V
 
F
G
 
S
P
 
Q
E
 
K
N
 
N
G
 
V
S
 
A
I
 
V
H
 
H
P
 
P
-
 
V
-
 
R
L
|
L
D
|
D
V
x
L
R
 
T
D
 
D
R
 
R
E
 
A
A
 
A
W
 
Y
E
 
A
N
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
D
E
 
E
F
 
-
G
 
A
R
 
E
E
 
Q
T
 
V
G
 
F
G
 
G
K
 
P
A
 
V
N
 
D
A
 
L
L
 
L
L
 
C
N
 
N
N
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
S
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
M
 
P
L
 
I
N
 
E
E
 
K
M
 
A
S
 
T
D
 
F
A
 
D
D
 
D
C
 
W
D
 
D
I
 
W
Q
 
Q
I
 
M
D
 
D
I
 
V
N
 
N
L
 
V
K
 
N
G
 
G
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
G
A
 
V
R
 
M
A
 
T
G
 
V
L
 
M
P
 
P
L
 
R
L
 
M
-
 
I
-
 
E
K
 
R
A
 
G
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
R
 
H
L
 
I
I
 
L
N
 
I
V
 
T
A
 
A
S
|
S
C
 
M
A
 
S
G
 
A
L
 
F
Y
 
V
G
 
A
S
 
L
P
 
P
K
 
T
L
 
T
A
 
G
V
 
I
Y
|
Y
S
 
C
A
 
T
T
 
T
K
|
K
F
 
Y
A
 
A
V
 
V
R
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
A
E
 
E
A
 
S
L
 
L
D
 
R
V
 
V
E
 
E
Y
 
M
A
 
P
A
 
K
Y
 
Y
G
 
N
V
 
I
S
 
G
V
 
V
A
 
S
C
 
L
V
 
L
M
 
C
P
 
P

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
38% identity, 68% coverage: 16:200/273 of query aligns to 8:194/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
K
 
K
S
 
V
I
 
A
F
 
F
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
E
C
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
K
F
 
F
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
W
 
A
F
 
K
V
 
V
G
 
V
L
 
I
S
 
S
D
|
D
I
x
M
-
 
N
-
 
A
D
 
E
K
 
K
V
 
C
G
 
Q
L
 
E
K
 
T
A
 
A
A
 
N
L
 
S
L
 
L
A
 
K
V
 
E
G
 
Q
P
 
G
E
 
F
N
 
D
G
 
A
S
 
L
I
 
S
H
 
A
P
 
P
L
 
C
D
|
D
V
|
V
R
 
T
D
 
D
R
 
E
E
 
D
A
 
A
W
 
Y
E
 
K
N
 
Q
A
 
A
I
 
I
G
 
-
E
 
E
F
 
L
G
 
T
R
 
Q
E
 
K
T
 
T
G
 
F
G
 
G
K
 
T
A
 
V
N
 
D
A
 
I
L
 
L
L
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
F
A
x
Q
R
 
H
F
 
V
G
 
A
M
 
P
L
 
I
N
 
E
E
 
E
M
 
F
S
 
P
D
 
T
A
 
A
D
 
V
C
 
F
D
 
Q
I
 
K
Q
 
L
I
 
V
D
 
Q
I
 
V
N
 
M
L
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
A
I
 
F
N
 
I
G
 
G
A
 
I
R
 
K
A
 
H
G
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
I
L
 
M
K
 
K
A
 
A
A
 
Q
G
 
K
-
 
Y
G
 
G
R
 
R
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
M
A
|
A
S
|
S
C
 
I
A
x
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
I
G
 
G
S
 
F
P
 
A
K
 
G
L
x
K
A
 
A
V
 
G
Y
|
Y
S
 
N
A
 
S
T
 
A
K
|
K
F
 
H
A
 
G
V
 
V
R
 
I
G
 
G
L
 
L
S
 
T
E
 
K
A
 
V
L
 
A
D
 
A
V
 
L
E
 
E
Y
 
C
A
 
A
A
 
R
Y
 
D
G
 
G
V
 
I
S
 
T
V
 
V
A
 
N
C
 
A
V
 
L
M
 
C
P
|
P
W
x
G
F
 
Y
V
|
V
E
 
D
T
|
T
P
 
P
I
x
L
L
 
V

Sites not aligning to the query:

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
38% identity, 68% coverage: 16:200/273 of query aligns to 7:193/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
K
 
K
S
 
V
I
 
A
F
 
F
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
E
C
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
K
F
 
F
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
W
 
A
F
 
K
V
 
V
G
 
V
L
 
I
S
 
S
D
|
D
I
x
M
-
 
N
-
 
A
D
 
E
K
 
K
V
 
C
G
 
Q
L
 
E
K
 
T
A
 
A
A
 
N
L
 
S
L
 
L
A
 
K
V
 
E
G
 
Q
P
 
G
E
 
F
N
 
D
G
 
A
S
 
L
I
 
S
H
 
A
P
 
P
L
 
C
D
|
D
V
|
V
R
 
T
D
 
D
R
 
E
E
 
D
A
 
A
W
 
Y
E
 
K
N
 
Q
A
 
A
I
 
I
G
 
-
E
 
E
F
 
L
G
 
T
R
 
Q
E
 
K
T
 
T
G
 
F
G
 
G
K
 
T
A
 
V
N
 
D
A
 
I
L
 
L
L
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
F
A
x
Q
R
 
H
F
 
V
G
 
A
M
 
P
L
 
I
N
 
E
E
 
E
M
 
F
S
 
P
D
 
T
A
 
A
D
 
V
C
 
F
D
 
Q
I
 
K
Q
 
L
I
 
V
D
 
Q
I
 
V
N
 
M
L
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
A
I
 
F
N
 
I
G
 
G
A
 
I
R
 
K
A
 
H
G
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
I
L
 
M
K
 
K
A
 
A
A
 
Q
G
 
K
-
 
Y
G
 
G
R
 
R
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
M
A
|
A
S
|
S
C
 
I
A
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
I
G
 
G
S
 
F
P
 
A
K
 
G
L
x
K
A
 
A
V
 
G
Y
|
Y
S
 
N
A
 
S
T
 
A
K
|
K
F
 
H
A
 
G
V
 
V
R
 
I
G
 
G
L
 
L
S
 
T
E
 
K
A
 
V
L
 
A
D
 
A
V
 
L
E
 
E
Y
 
C
A
 
A
A
 
R
Y
 
D
G
 
G
V
 
I
S
 
T
V
 
V
A
 
N
C
 
A
V
 
L
M
 
C
P
 
P
W
 
G
F
x
Y
V
|
V
E
 
D
T
|
T
P
 
P
I
 
L
L
 
V

Sites not aligning to the query:

Q48436 Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; Acetoin(diacetyl) reductase; AR; Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; EC 1.1.1.304 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
37% identity, 68% coverage: 15:199/273 of query aligns to 2:189/256 of Q48436

query
sites
Q48436
R
 
K
K
 
K
S
 
V
I
 
A
F
x
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
A
x
G
S
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
|
G
L
x
K
A
|
A
C
x
I
A
|
A
K
x
L
R
|
R
F
x
L
A
x
V
Q
x
K
E
x
D
G
|
G
W
x
F
F
x
A
V
|
V
G
x
A
L
x
I
S
x
A
D
|
D
I
 
Y
D
 
N
K
 
D
V
 
A
G
 
T
L
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
V
L
 
A
L
 
S
A
 
E
V
 
I
G
 
N
P
 
Q
E
 
A
N
 
G
G
 
G
S
 
R
I
 
A
H
 
M
-
 
A
-
 
V
P
 
K
L
 
V
D
|
D
V
 
V
R
 
S
D
 
D
R
 
R
E
 
D
A
 
Q
W
 
V
E
 
F
N
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
-
E
 
E
F
 
Q
G
 
A
R
 
R
E
 
K
T
 
T
G
 
L
G
 
G
K
 
G
A
 
F
N
 
D
A
 
V
L
 
I
L
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
A
R
 
P
F
 
S
G
 
T
M
 
P
L
 
I
N
 
E
E
 
S
M
 
I
S
 
T
D
 
P
A
 
E
D
 
I
C
 
V
D
 
D
I
 
K
Q
 
V
I
 
Y
D
 
N
I
 
I
N
 
N
L
 
V
K
 
K
G
 
G
V
 
V
I
 
I
N
 
W
G
 
G
A
 
I
R
 
Q
A
 
A
G
 
A
L
 
V
P
 
E
L
 
A
L
 
F
K
 
K
A
 
K
A
 
E
G
 
G
-
 
H
-
 
G
G
 
G
R
 
K
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
A
A
 
C
S
 
S
C
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
H
Y
 
V
G
 
G
S
 
N
P
 
P
K
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
A
 
S
T
 
S
K
|
K
F
 
F
A
 
A
V
 
V
R
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
T
E
 
Q
A
 
T
L
 
A
D
 
A
V
 
R
E
 
D
Y
 
L
A
 
A
A
 
P
Y
 
L
G
 
G
V
 
I
S
 
T
V
 
V
A
 
N
C
 
G
V
 
Y
M
 
C
P
 
P
W
 
G
F
 
I
V
 
V
E
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
M

1gegE Cryatal structure analysis of meso-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
37% identity, 68% coverage: 15:199/273 of query aligns to 2:189/256 of 1gegE

query
sites
1gegE
R
 
K
K
 
K
S
 
V
I
 
A
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
S
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
C
 
I
A
 
A
K
 
L
R
 
R
F
 
L
A
 
V
Q
 
K
E
 
D
G
 
G
W
 
F
F
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
I
S
 
A
D
|
D
I
x
Y
D
 
N
K
 
D
V
 
A
G
 
T
L
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
V
L
 
A
L
 
S
A
 
E
V
 
I
G
 
N
P
 
Q
E
 
A
N
 
G
G
 
G
S
 
H
I
 
A
H
 
V
-
 
A
-
 
V
P
 
K
L
x
V
D
|
D
V
|
V
R
 
S
D
 
D
R
|
R
E
x
D
A
 
Q
W
 
V
E
x
F
N
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
-
E
 
E
F
 
Q
G
 
A
R
 
R
E
 
K
T
 
T
G
 
L
G
 
G
K
 
G
A
 
F
N
 
D
A
 
V
L
 
I
L
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
V
A
 
A
R
 
P
F
 
S
G
 
T
M
 
P
L
 
I
N
 
E
E
 
S
M
 
I
S
 
T
D
 
P
A
 
E
D
 
I
C
 
V
D
 
D
I
 
K
Q
 
V
I
 
Y
D
 
N
I
|
I
N
 
N
L
 
V
K
 
K
G
 
G
V
 
V
I
 
I
N
 
W
G
 
G
A
 
I
R
 
Q
A
 
A
G
 
A
L
 
V
P
x
E
L
 
A
L
 
F
K
 
K
A
 
K
A
 
E
G
 
G
-
 
H
-
 
G
G
 
G
R
 
K
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
A
A
 
C
S
|
S
C
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
H
Y
 
V
G
 
G
S
 
N
P
 
P
K
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
V
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
T
 
S
K
|
K
F
 
F
A
 
A
V
 
V
R
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
T
E
 
Q
A
 
T
L
 
A
D
 
A
V
 
R
E
 
D
Y
 
L
A
 
A
A
 
P
Y
 
L
G
 
G
V
 
I
S
 
T
V
 
V
A
 
N
C
 
G
V
 
Y
M
 
C
P
|
P
W
 
G
F
 
I
V
|
V
E
 
K
T
|
T
P
 
P
I
x
M

Sites not aligning to the query:

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
35% identity, 75% coverage: 16:220/273 of query aligns to 8:210/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
K
 
K
S
 
V
I
 
A
F
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
E
C
 
A
A
 
A
K
 
R
R
 
V
F
 
F
A
 
M
Q
 
K
E
 
E
G
 
G
W
 
A
F
 
K
V
 
V
G
 
V
L
 
I
S
 
A
D
|
D
I
x
F
D
 
N
K
 
E
V
 
A
G
 
A
L
 
G
K
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
E
A
 
A
V
 
-
G
 
N
P
 
P
E
 
G
N
 
V
G
 
V
S
 
F
I
 
I
H
 
R
P
 
-
L
x
V
D
|
D
V
|
V
R
 
S
D
 
D
R
 
R
E
 
E
A
 
S
W
 
V
E
 
H
N
 
R
A
 
L
I
 
V
G
 
-
E
 
E
F
 
N
G
 
V
R
 
A
E
 
E
T
 
R
G
 
F
G
 
G
K
 
K
A
 
I
N
 
D
A
 
I
L
 
L
L
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
A
 
T
R
 
R
F
x
D
G
 
S
M
 
M
L
 
L
N
 
S
E
x
K
M
 
M
S
 
T
D
 
V
A
 
D
D
 
Q
C
 
F
D
 
Q
I
 
Q
Q
 
V
I
 
I
D
 
N
I
 
V
N
|
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
V
I
 
F
N
 
H
G
 
C
A
 
T
R
 
Q
A
 
A
G
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
Y
L
 
M
K
 
A
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
-
 
K
G
 
G
R
 
K
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
T
A
 
S
S
|
S
C
 
V
A
 
T
G
 
G
L
 
T
Y
 
Y
G
 
G
S
x
N
P
x
V
K
 
G
L
x
Q
A
 
T
V
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
F
 
A
A
 
G
V
 
V
R
 
I
G
 
G
L
 
M
S
 
T
E
 
K
A
 
T
L
 
W
D
 
A
V
 
K
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
A
 
R
Y
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
N
V
 
V
A
 
N
C
 
A
V
 
V
M
 
A
P
|
P
W
 
G
F
|
F
V
x
T
E
 
E
T
|
T
P
 
A
I
x
M
L
 
V
N
 
A
A
 
E
A
 
V
S
 
P
D
 
E
G
 
K
S
 
V
N
 
I
K
 
E
S
x
K
M
 
M
S
 
K
E
 
A
S
 
Q
L
 
V
K
 
P
A
 
M
G
 
G
G
 
R
L
 
L

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
30% identity, 77% coverage: 16:225/273 of query aligns to 8:217/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
K
 
K
S
 
T
I
 
V
F
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
Y
A
 
A
C
 
A
A
 
V
K
 
Q
R
 
A
F
 
F
A
 
L
Q
 
G
E
 
Q
G
 
Q
W
 
A
F
 
N
V
 
V
G
 
V
L
 
V
S
 
A
D
|
D
I
|
I
D
 
D
K
 
E
V
 
A
G
 
Q
L
 
G
K
 
E
A
 
A
A
 
M
L
 
V
L
 
R
A
 
K
V
 
E
G
 
N
P
 
N
E
 
D
N
 
R
G
 
L
S
 
H
I
 
F
H
 
V
P
 
Q
L
x
T
D
 
D
V
x
I
R
 
T
D
 
D
R
 
E
E
 
A
A
 
A
W
 
C
E
 
Q
N
 
H
A
 
A
I
 
V
G
 
-
E
 
E
F
 
S
G
 
A
R
 
V
E
 
H
T
 
T
G
 
F
G
 
G
K
 
G
A
 
L
N
 
D
A
 
V
L
 
L
L
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
 
I
A
 
E
R
 
I
F
 
V
G
 
A
M
 
P
L
 
I
N
 
H
E
 
E
M
 
M
S
 
E
D
 
L
A
 
S
D
 
D
C
 
W
D
 
N
I
 
K
Q
 
V
I
 
L
D
 
Q
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
M
I
 
F
N
 
L
G
 
M
A
 
S
R
 
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
P
 
K
L
 
H
L
 
M
K
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
-
 
K
G
 
G
R
 
N
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
T
A
 
C
S
|
S
C
 
V
A
 
G
G
 
G
L
 
L
Y
 
V
G
 
A
S
 
W
P
 
P
K
 
D
L
 
I
A
 
P
V
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
F
 
G
A
 
G
V
 
V
R
 
L
G
 
Q
L
 
L
S
 
T
E
 
K
A
 
S
L
 
M
D
 
A
V
 
V
E
 
D
Y
 
Y
A
 
A
A
 
K
Y
 
H
G
 
Q
V
 
I
S
 
R
V
 
V
A
 
N
C
 
C
V
 
V
M
 
C
P
|
P
W
x
G
F
x
I
V
x
I
E
 
D
T
 
T
P
 
P
I
 
L
L
 
N
N
 
E
A
 
K
A
 
S
S
 
F
D
 
L
G
 
E
S
 
N
N
 
N
K
 
E
S
 
G
M
 
T
S
 
L
E
 
E
S
 
E
L
 
I
K
 
K
A
 
K
G
 
E
G
 
K
L
 
A
E
 
K
V
 
V
Y
 
N
P
 
P
V
 
L

6t62A Crystal structure of acinetobacter baumannii fabg in complex with NADPH at 1.8 a resolution (see paper)
32% identity, 75% coverage: 12:215/273 of query aligns to 2:204/244 of 6t62A

query
sites
6t62A
A
 
A
N
 
Q
G
 
E
R
 
R
K
 
K
S
 
V
I
 
A
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
A
A
 
A
C
 
I
A
 
A
K
 
Q
R
 
Q
F
 
L
A
 
I
Q
 
Q
E
 
D
G
 
G
W
 
Y
F
 
F
V
 
V
G
 
V
L
 
G
S
 
T
D
x
A
I
x
T
D
 
S
K
 
E
V
 
S
G
 
G
L
 
A
K
 
Q
A
 
K
A
 
L
L
 
T
L
 
D
A
 
S
V
 
F
G
 
G
P
 
-
E
 
E
N
 
Q
G
 
G
S
 
A
I
 
G
H
 
L
P
 
A
L
|
L
D
|
D
V
|
V
R
 
R
D
 
N
R
 
L
E
 
D
A
 
E
W
 
I
E
 
E
N
 
A
A
 
V
I
 
V
G
 
S
E
 
H
F
 
I
G
 
-
R
 
E
E
 
Q
T
 
N
G
 
Y
G
 
G
K
 
P
A
 
V
N
 
L
A
 
V
L
 
L
L
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
A
 
T
R
 
K
F
 
D
G
 
N
M
 
L
L
 
L
N
 
L
E
 
R
M
 
M
S
 
S
D
 
E
A
 
D
D
 
D
C
 
W
D
 
D
I
 
D
Q
 
I
I
 
L
D
 
N
I
 
I
N
 
H
L
 
L
K
 
K
G
 
A
V
 
V
I
 
Y
N
 
R
G
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
R
G
 
V
L
 
L
P
 
K
-
 
G
L
 
M
L
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
R
G
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
I
A
x
S
S
|
S
C
 
V
A
 
V
G
 
A
L
 
H
Y
 
F
G
 
A
S
 
N
P
 
P
K
 
G
L
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
T
 
A
K
|
K
F
 
A
A
 
G
V
 
I
R
 
E
G
 
A
L
 
F
S
 
S
E
 
R
A
 
S
L
 
L
D
 
A
V
 
K
E
 
E
Y
 
M
A
 
G
A
 
S
Y
 
R
G
 
Q
V
 
I
S
 
T
V
 
V
A
 
N
C
 
S
V
 
V
M
 
A
P
|
P
W
x
G
F
 
F
V
x
I
E
 
A
T
 
T
P
 
E
I
x
M
L
 
T
N
 
D
A
 
A
A
 
L
S
 
S
D
 
E
G
 
D
S
 
I
N
 
R
K
 
K
S
 
K
M
 
M
S
 
S
E
 
D
S
 
Q
L
 
V

1zk1A Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (mutant g37d) from lactobacillus brevis in complex with phenylethanol and NAD (see paper)
34% identity, 74% coverage: 16:217/273 of query aligns to 7:211/251 of 1zk1A

query
sites
1zk1A
K
 
K
S
 
V
I
 
A
F
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
T
S
x
L
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
I
A
 
A
K
 
T
R
 
K
F
 
F
A
 
V
Q
 
E
E
 
E
G
 
G
W
 
A
F
 
K
V
 
V
G
 
M
L
 
I
S
 
T
D
|
D
-
 
R
I
 
H
D
 
S
K
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
K
L
 
S
A
 
V
V
 
G
G
 
T
P
 
P
E
 
D
N
 
Q
G
 
I
S
 
Q
I
 
F
H
 
F
P
 
Q
L
x
H
D
|
D
V
x
S
R
 
S
D
 
D
R
 
E
E
 
D
A
 
G
W
 
W
E
 
-
N
 
T
A
 
K
I
 
L
G
 
F
E
 
D
F
 
A
G
 
T
R
 
E
E
 
K
T
 
A
G
 
F
G
 
G
K
 
P
A
 
V
N
 
S
A
 
T
L
 
L
L
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
x
I
A
|
A
R
 
V
F
x
N
G
 
K
M
 
S
L
 
V
N
 
E
E
 
E
M
 
T
S
 
T
D
 
T
A
 
A
D
 
E
C
 
W
D
 
R
I
 
K
Q
 
L
I
 
L
D
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
D
G
 
G
V
 
V
I
 
F
N
 
F
G
 
G
A
 
T
R
 
R
A
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
Q
L
 
R
L
 
M
K
 
K
-
 
N
-
 
K
A
 
G
A
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
S
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
M
A
 
S
S
|
S
C
 
I
A
 
E
G
 
G
L
 
F
Y
 
V
G
 
G
S
 
D
P
 
P
K
 
S
L
 
L
A
 
G
V
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
F
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
G
 
I
L
 
M
S
 
S
E
 
K
-
 
S
-
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
C
E
 
A
Y
 
L
A
 
K
A
 
D
Y
 
Y
G
 
D
V
 
V
S
 
R
V
 
V
A
 
N
C
 
T
V
 
V
M
 
H
P
 
P
W
x
G
F
x
Y
V
x
I
E
 
K
T
 
T
P
 
P
I
x
L
L
 
V
N
 
D
A
 
D
A
 
L
S
 
P
D
 
-
G
 
G
S
 
A
N
 
E
K
 
E
S
 
A
M
 
M
S
 
S
E
 
Q
S
 
R
L
 
T
K
 
K
A
 
T

1zjzA Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (mutant g37d) from lactobacillus brevis in complex with phenylethanol and NAD (see paper)
34% identity, 74% coverage: 16:217/273 of query aligns to 7:211/251 of 1zjzA

query
sites
1zjzA
K
 
K
S
 
V
I
 
A
F
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
T
S
x
L
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
I
A
 
A
K
 
T
R
 
K
F
 
F
A
 
V
Q
 
E
E
 
E
G
 
G
W
 
A
F
 
K
V
 
V
G
 
M
L
 
I
S
 
T
D
|
D
-
 
R
I
 
H
D
 
S
K
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
K
L
 
S
A
 
V
V
 
G
G
 
T
P
 
P
E
 
D
N
 
Q
G
 
I
S
 
Q
I
 
F
H
 
F
P
 
Q
L
 
H
D
|
D
V
 
S
R
 
S
D
 
D
R
 
E
E
 
D
A
 
G
W
 
W
E
 
-
N
 
T
A
 
K
I
 
L
G
 
F
E
 
D
F
 
A
G
 
T
R
 
E
E
 
K
T
 
A
G
 
F
G
 
G
K
 
P
A
 
V
N
 
S
A
 
T
L
 
L
L
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
A
|
A
R
 
V
F
x
N
G
 
K
M
 
S
L
 
V
N
 
E
E
 
E
M
 
T
S
 
T
D
 
T
A
 
A
D
 
E
C
 
W
D
 
R
I
 
K
Q
 
L
I
 
L
D
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
D
G
 
G
V
 
V
I
 
F
N
 
F
G
 
G
A
 
T
R
 
R
A
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
Q
L
 
R
L
 
M
K
 
K
-
 
N
-
 
K
A
 
G
A
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
S
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
M
A
 
S
S
|
S
C
 
I
A
 
E
G
 
G
L
 
F
Y
 
V
G
 
G
S
 
D
P
 
P
K
 
S
L
|
L
A
 
G
V
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
F
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
G
 
I
L
 
M
S
 
S
E
 
K
-
 
S
-
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
C
E
 
A
Y
 
L
A
 
K
A
 
D
Y
 
Y
G
 
D
V
 
V
S
 
R
V
 
V
A
 
N
C
 
T
V
 
V
M
 
H
P
 
P
W
x
G
F
 
Y
V
x
I
E
 
K
T
 
T
P
 
P
I
x
L
L
 
V
N
 
D
A
 
D
A
 
L
S
 
P
D
 
-
G
 
G
S
 
A
N
 
E
K
 
E
S
 
A
M
 
M
S
 
S
E
 
Q
S
 
R
L
 
T
K
 
K
A
 
T

1zjyA Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (mutant g37d) from lactobacillus brevis in complex with phenylethanol and nadh (see paper)
34% identity, 74% coverage: 16:217/273 of query aligns to 7:211/251 of 1zjyA

query
sites
1zjyA
K
 
K
S
 
V
I
 
A
F
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
T
S
x
L
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
I
A
 
A
K
 
T
R
 
K
F
 
F
A
 
V
Q
 
E
E
 
E
G
 
G
W
 
A
F
 
K
V
 
V
G
 
M
L
 
I
S
 
T
D
|
D
-
 
R
I
 
H
D
 
S
K
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
K
L
 
S
A
 
V
V
 
G
G
 
T
P
 
P
E
 
D
N
 
Q
G
 
I
S
 
Q
I
 
F
H
 
F
P
 
Q
L
 
H
D
|
D
V
 
S
R
 
S
D
 
D
R
 
E
E
 
D
A
 
G
W
 
W
E
 
-
N
 
T
A
 
K
I
 
L
G
 
F
E
 
D
F
 
A
G
 
T
R
 
E
E
 
K
T
 
A
G
 
F
G
 
G
K
 
P
A
 
V
N
 
S
A
 
T
L
 
L
L
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
A
|
A
R
 
V
F
x
N
G
 
K
M
 
S
L
 
V
N
 
E
E
 
E
M
 
T
S
 
T
D
 
T
A
 
A
D
 
E
C
 
W
D
 
R
I
 
K
Q
 
L
I
 
L
D
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
D
G
 
G
V
 
V
I
 
F
N
 
F
G
 
G
A
 
T
R
 
R
A
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
Q
L
 
R
L
 
M
K
 
K
-
 
N
-
 
K
A
 
G
A
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
S
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
M
A
 
S
S
|
S
C
 
I
A
 
E
G
 
G
L
 
F
Y
 
V
G
 
G
S
 
D
P
 
P
K
 
S
L
|
L
A
 
G
V
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
F
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
G
 
I
L
 
M
S
 
S
E
 
K
-
 
S
-
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
C
E
 
A
Y
 
L
A
 
K
A
 
D
Y
 
Y
G
 
D
V
 
V
S
 
R
V
 
V
A
 
N
C
 
T
V
 
V
M
 
H
P
 
P
W
x
G
F
x
Y
V
x
I
E
 
K
T
 
T
P
 
P
I
x
L
L
 
V
N
 
D
A
 
D
A
 
L
S
 
P
D
 
-
G
 
G
S
 
A
N
 
E
K
 
E
S
 
A
M
 
M
S
 
S
E
 
Q
S
 
R
L
 
T
K
 
K
A
 
T

6wprA Crystal structure of a putative 3-oxoacyl-acp reductase (fabg) with NADP(h) from acinetobacter baumannii (see paper)
32% identity, 74% coverage: 15:215/273 of query aligns to 5:204/244 of 6wprA

query
sites
6wprA
R
 
R
K
 
K
S
 
V
I
 
A
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
A
A
 
A
C
 
I
A
 
A
K
 
Q
R
 
Q
F
 
L
A
 
I
Q
 
Q
E
 
D
G
 
G
W
 
Y
F
 
F
V
 
V
G
 
V
L
 
G
S
 
T
D
 
A
I
x
T
D
 
S
K
 
E
V
 
S
G
 
G
L
 
A
K
 
Q
A
 
K
A
 
L
L
 
T
L
 
D
A
 
S
V
 
F
G
 
G
P
 
-
E
 
E
N
 
Q
G
 
G
S
 
A
I
 
G
H
 
L
P
 
A
L
|
L
D
|
D
V
|
V
R
 
R
D
 
N
R
 
L
E
 
D
A
 
E
W
 
I
E
 
E
N
 
A
A
 
V
I
 
V
G
 
S
E
 
H
F
 
I
G
 
-
R
 
E
E
 
Q
T
 
N
G
 
Y
G
 
G
K
 
P
A
 
V
N
 
L
A
 
V
L
 
L
L
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
A
 
T
R
 
K
F
 
D
G
 
N
M
 
L
L
 
L
N
 
L
E
 
R
M
 
M
S
 
S
D
 
E
A
 
D
D
 
D
C
 
W
D
 
D
I
 
D
Q
 
I
I
 
L
D
 
N
I
 
I
N
 
H
L
 
L
K
 
K
G
 
A
V
 
V
I
 
Y
N
 
R
G
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
R
G
 
V
L
 
L
P
 
K
-
 
G
L
 
M
L
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
R
G
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
S
S
|
S
C
 
V
A
 
V
G
 
A
L
 
H
Y
 
F
G
 
A
S
 
N
P
 
P
K
 
G
L
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
T
 
A
K
|
K
F
 
A
A
 
G
V
 
I
R
 
E
G
 
A
L
 
F
S
 
S
E
 
R
A
 
S
L
 
L
D
 
A
V
 
K
E
 
E
Y
 
M
A
 
G
A
 
S
Y
 
R
G
 
Q
V
 
I
S
 
T
V
 
V
A
 
N
C
 
S
V
 
V
M
 
A
P
|
P
W
 
G
F
 
F
V
 
I
E
 
A
T
 
T
P
 
E
I
 
M
L
 
T
N
 
D
A
 
A
A
 
L
S
 
S
D
 
E
G
 
D
S
 
I
N
 
R
K
 
K
S
 
K
M
 
M
S
 
S
E
 
D
S
 
Q
L
 
V

3p19A Improved NADPH-dependent blue fluorescent protein (see paper)
33% identity, 80% coverage: 15:232/273 of query aligns to 2:215/239 of 3p19A

query
sites
3p19A
R
 
K
K
 
K
S
 
L
I
 
V
F
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
E
A
 
A
C
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
S
Q
 
E
E
 
E
G
 
G
W
 
H
F
 
P
V
 
L
G
 
L
L
 
L
S
 
L
D
x
A
I
x
R
D
x
R
K
 
V
V
 
E
G
 
R
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
L
L
 
N
L
 
L
A
 
P
V
 
-
G
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
N
G
 
T
S
 
L
I
 
C
H
 
A
P
 
Q
L
 
V
D
|
D
V
|
V
R
 
T
D
 
D
R
 
K
E
 
Y
A
 
T
W
 
F
E
 
D
N
 
T
A
 
A
I
 
I
G
 
T
E
 
R
F
 
-
G
 
A
R
 
E
E
 
K
T
 
I
G
 
Y
G
 
G
K
 
P
A
 
A
N
 
D
A
 
A
L
 
I
L
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
M
A
 
M
R
 
L
F
 
L
G
 
G
M
 
Q
L
 
I
N
 
D
E
 
T
M
 
Q
S
 
E
D
 
A
A
 
N
D
 
E
C
 
W
D
 
Q
I
 
R
Q
 
M
I
 
F
D
 
D
I
 
V
N
 
N
L
 
V
K
 
L
G
 
G
V
 
L
I
 
L
N
 
N
G
 
G
A
 
M
R
 
Q
A
 
A
G
 
V
L
 
L
P
 
A
L
 
P
L
 
M
K
 
K
A
 
A
A
 
R
G
 
N
-
 
C
G
 
G
R
 
T
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
S
S
|
S
C
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
K
Y
 
K
G
 
T
S
 
F
P
 
P
K
 
D
L
 
H
A
 
A
V
 
A
Y
|
Y
S
 
C
A
 
G
T
 
T
K
|
K
F
 
F
A
 
A
V
 
V
R
 
H
G
 
A
L
 
I
S
 
S
E
 
E
A
 
N
L
 
V
D
 
R
V
 
E
E
 
E
Y
 
V
A
 
A
A
 
A
Y
 
S
G
 
N
V
 
V
S
 
R
V
 
V
A
 
M
C
 
T
V
 
I
M
 
A
P
|
P
W
 
S
F
x
A
V
|
V
E
 
K
T
|
T
P
x
E
I
x
L
L
 
L
N
 
S
A
 
H
A
 
T
S
 
T
D
 
S
G
 
Q
S
 
Q
N
 
I
K
 
K
S
 
D
M
 
G
S
 
Y
E
 
D
S
 
A
L
 
W
K
 
R
A
 
V
G
 
D
G
 
M
L
 
G
E
 
G
V
 
V
Y
 
L
P
 
A
V
 
A
E
 
D
D
 
D
A
 
V
A
 
A
Q
 
R
V
 
A
V
 
V

1zk4A Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (wildtype) from lactobacillus brevis in complex with acetophenone and NADP (see paper)
33% identity, 74% coverage: 16:217/273 of query aligns to 7:211/251 of 1zk4A

query
sites
1zk4A
K
 
K
S
 
V
I
 
A
F
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
T
S
x
L
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
I
A
 
A
K
 
T
R
 
K
F
 
F
A
 
V
Q
 
E
E
 
E
G
 
G
W
 
A
F
 
K
V
 
V
G
 
M
L
 
I
S
x
T
-
x
G
D
x
R
I
 
H
D
 
S
K
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
K
L
 
S
A
 
V
V
 
G
G
 
T
P
 
P
E
 
D
N
 
Q
G
 
I
S
 
Q
I
 
F
H
 
F
P
 
Q
L
x
H
D
|
D
V
 
S
R
 
S
D
 
D
R
 
E
E
 
D
A
 
G
W
 
W
E
 
-
N
 
T
A
 
K
I
 
L
G
 
F
E
 
D
F
 
A
G
 
T
R
 
E
E
 
K
T
 
A
G
 
F
G
 
G
K
 
P
A
 
V
N
 
S
A
 
T
L
 
L
L
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
A
|
A
R
 
V
F
 
N
G
 
K
M
 
S
L
 
V
N
 
E
E
 
E
M
 
T
S
 
T
D
 
T
A
 
A
D
 
E
C
 
W
D
 
R
I
 
K
Q
 
L
I
 
L
D
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
D
G
 
G
V
 
V
I
 
F
N
 
F
G
 
G
A
 
T
R
 
R
A
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
Q
L
 
R
L
 
M
K
 
K
-
 
N
-
 
K
A
 
G
A
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
S
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
M
A
 
S
S
|
S
C
 
I
A
 
E
G
 
G
L
 
F
Y
 
V
G
 
G
S
 
D
P
 
P
K
 
S
L
 
L
A
 
G
V
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
F
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
G
 
I
L
 
M
S
 
S
E
 
K
-
 
S
-
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
C
E
 
A
Y
 
L
A
 
K
A
 
D
Y
 
Y
G
 
D
V
 
V
S
 
R
V
 
V
A
 
N
C
 
T
V
 
V
M
 
H
P
 
P
W
x
G
F
x
Y
V
x
I
E
 
K
T
|
T
P
 
P
I
x
L
L
 
V
N
 
D
A
 
D
A
 
L
S
 
P
D
 
-
G
 
G
S
 
A
N
 
E
K
 
E
S
 
A
M
 
M
S
 
S
E
 
Q
S
 
R
L
 
T
K
 
K
A
 
T

6y0sAAA R-specific alcohol dehydrogenase (see paper)
33% identity, 74% coverage: 16:217/273 of query aligns to 7:211/251 of 6y0sAAA

query
sites
6y0sAAA
K
 
K
S
 
V
I
 
A
F
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
x
T
S
 
L
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
I
A
 
A
K
 
T
R
 
K
F
 
F
A
 
V
Q
 
E
E
 
E
G
 
G
W
 
A
F
 
K
V
 
V
G
 
M
L
 
I
S
 
T
-
x
G
D
 
R
I
x
H
D
 
S
K
 
D
V
|
V
G
 
G
L
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
K
L
 
S
A
 
V
V
 
G
G
 
T
P
 
P
E
 
D
N
 
Q
G
 
I
S
 
Q
I
 
F
H
 
F
P
 
Q
L
 
H
D
 
D
V
 
S
R
 
S
D
 
D
R
 
E
E
 
D
A
 
G
W
 
W
E
 
-
N
 
T
A
 
K
I
 
L
G
 
F
E
 
D
F
 
A
G
 
T
R
 
E
E
 
K
T
 
A
G
 
F
G
 
G
K
 
P
A
 
V
N
 
S
A
 
T
L
 
L
L
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
A
R
 
V
F
 
N
G
 
K
M
 
S
L
 
V
N
 
E
E
 
E
M
 
T
S
 
E
D
 
T
A
 
A
D
 
E
C
 
W
D
 
R
I
 
K
Q
 
L
I
 
L
D
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
D
G
 
G
V
 
V
I
 
F
N
 
F
G
 
G
A
 
T
R
 
R
A
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
Q
L
 
R
L
 
M
K
 
K
-
 
N
-
 
K
A
 
G
A
 
L
G
|
G
G
x
A
R
 
S
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
M
A
 
S
S
|
S
C
 
I
A
 
E
G
 
G
L
 
F
Y
 
V
G
 
G
S
 
D
P
 
P
K
 
S
L
 
L
A
 
G
V
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
T
 
S
K
 
K
F
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
G
 
I
L
 
M
S
 
S
E
 
K
-
 
S
-
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
C
E
 
A
Y
 
L
A
 
K
A
 
D
Y
 
Y
G
x
D
V
 
V
S
x
R
V
 
V
A
 
N
C
 
T
V
 
V
M
 
H
P
 
P
W
 
G
F
 
Y
V
 
I
E
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
L
L
 
V
N
 
D
A
 
D
A
 
L
S
 
P
D
 
-
G
 
G
S
 
A
N
 
E
K
 
E
S
 
A
M
 
M
S
 
S
E
 
Q
S
 
R
L
 
T
K
 
K
A
 
T

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
34% identity, 72% coverage: 16:211/273 of query aligns to 5:203/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
K
 
K
S
 
S
I
 
A
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
S
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
S
C
 
I
A
 
A
K
 
L
R
 
Q
F
 
L
A
 
A
Q
 
E
E
 
E
G
 
G
W
 
Y
F
 
N
V
 
V
G
 
A
L
 
-
S
 
-
D
 
-
I
 
V
D
 
N
K
 
Y
V
 
A
G
 
G
L
 
S
K
 
K
A
 
E
A
 
K
L
 
A
L
 
E
A
 
A
V
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
K
G
 
G
P
 
V
E
 
D
N
 
S
G
 
F
S
 
A
I
 
I
H
 
Q
P
 
A
L
 
-
D
 
N
V
 
V
R
 
A
D
 
D
R
 
A
E
 
D
A
 
E
W
 
V
E
 
K
N
 
A
A
 
M
I
 
I
G
 
K
E
 
E
F
 
V
G
 
V
R
 
S
E
 
Q
T
 
F
G
 
G
G
 
S
K
 
-
A
 
L
N
 
D
A
 
V
L
 
L
L
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
T
R
 
R
F
 
D
G
 
N
M
 
L
L
 
L
N
 
M
E
 
R
M
 
M
S
 
K
D
 
E
A
 
Q
D
 
E
C
 
W
D
 
D
I
 
D
Q
 
V
I
 
I
D
 
D
I
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
V
I
 
F
N
 
N
G
 
C
A
 
I
R
 
Q
A
 
K
G
 
A
L
 
T
P
 
P
-
 
Q
L
 
M
L
 
L
K
 
R
A
 
Q
A
 
R
G
 
S
G
 
G
R
 
A
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
L
A
 
S
S
|
S
C
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
A
Y
 
V
G
 
G
S
 
N
P
 
P
K
 
G
L
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
T
 
T
K
|
K
F
 
A
A
 
G
V
 
V
R
 
I
G
 
G
L
 
L
S
 
T
E
 
K
A
 
S
L
 
A
D
 
A
V
 
R
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
A
 
S
Y
 
R
G
 
G
V
 
I
S
 
T
V
 
V
A
 
N
C
 
A
V
 
V
M
 
A
P
 
P
W
 
G
F
 
F
V
 
I
E
 
V
T
 
S
P
 
D
I
 
M
L
 
T
N
 
D
A
 
A
A
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
E
S
 
L
N
 
K
K
 
E
S
 
Q
M
 
M

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
33% identity, 66% coverage: 19:199/273 of query aligns to 8:189/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
F
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
S
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
L
 
K
A
 
Q
C
 
T
A
 
A
K
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
Q
 
E
E
 
Q
G
 
G
W
 
A
F
 
A
V
 
V
G
 
V
L
 
I
S
 
N
D
|
D
I
|
I
D
 
D
K
 
A
V
 
E
G
 
K
L
 
V
K
 
R
A
 
A
A
 
T
L
 
V
L
 
D
A
 
E
V
 
F
G
 
S
P
 
A
E
 
R
N
 
G
G
 
H
S
 
R
I
 
V
-
 
L
-
 
G
H
 
A
P
 
V
L
 
A
D
 
D
V
x
I
R
 
G
D
 
N
R
 
K
E
 
A
A
 
A
W
 
V
E
 
D
N
 
G
A
 
M
I
 
V
G
 
K
E
 
Q
F
 
T
G
 
-
R
 
I
E
 
D
T
 
A
G
 
F
G
 
G
K
 
R
A
 
I
N
 
D
A
 
I
L
 
L
L
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
 
M
A
 
E
R
 
R
F
 
A
G
 
G
M
 
A
L
 
L
N
 
R
E
 
K
M
 
L
S
 
S
D
 
E
A
 
A
D
 
D
C
 
W
D
 
D
I
 
V
Q
 
T
I
 
I
D
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
I
 
F
N
 
L
G
 
C
A
 
T
R
 
Q
A
 
A
G
 
V
L
 
H
-
 
G
P
 
H
L
 
M
L
 
V
K
 
E
A
 
N
A
 
K
G
 
H
G
 
G
R
 
R
L
 
I
I
 
V
N
 
N
V
x
I
A
 
A
S
|
S
C
 
R
A
 
A
G
 
W
L
 
L
Y
 
G
G
 
G
S
 
A
P
 
G
K
 
Q
L
 
T
A
 
P
V
 
-
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
T
 
A
K
|
K
F
 
A
A
 
G
V
 
V
R
 
V
G
 
G
L
 
M
S
 
T
E
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
A
V
 
I
E
 
E
Y
 
L
A
 
G
A
 
R
Y
 
A
G
 
G
V
 
I
S
 
T
V
 
V
A
 
N
C
 
C
V
 
V
M
 
A
P
 
P
W
 
G
F
 
L
V
x
I
E
 
H
T
 
T
P
 
P
I
 
M

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
33% identity, 66% coverage: 19:199/273 of query aligns to 9:190/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
F
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
A
S
|
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
L
 
K
A
 
Q
C
 
T
A
 
A
K
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
Q
 
E
E
 
Q
G
 
G
W
 
A
F
 
A
V
 
V
G
 
V
L
 
I
S
 
N
D
|
D
I
 
I
D
 
D
K
 
A
V
 
E
G
 
K
L
 
V
K
 
R
A
 
A
A
 
T
L
 
V
L
 
D
A
 
E
V
 
F
G
 
S
P
 
A
E
 
R
N
 
G
G
 
H
S
 
R
I
 
V
-
 
L
-
 
G
H
 
A
P
 
V
L
 
A
D
|
D
V
x
I
R
 
G
D
 
N
R
 
K
E
 
A
A
 
A
W
 
V
E
 
D
N
 
G
A
 
M
I
 
V
G
 
K
E
 
Q
F
 
T
G
 
-
R
 
I
E
 
D
T
 
A
G
 
F
G
 
G
K
 
R
A
 
I
N
 
D
A
 
I
L
 
L
L
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
M
A
 
E
R
 
R
F
 
A
G
 
G
M
 
A
L
 
L
N
 
R
E
 
K
M
 
L
S
 
S
D
 
E
A
 
A
D
 
D
C
 
W
D
 
D
I
 
V
Q
 
T
I
 
I
D
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
I
 
F
N
 
L
G
 
C
A
 
T
R
 
Q
A
 
A
G
 
V
L
 
H
-
 
G
P
 
H
L
 
M
L
 
V
K
 
E
A
 
N
A
 
K
G
 
H
G
 
G
R
 
R
L
 
I
I
 
V
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
 
S
C
 
R
A
 
A
G
 
W
L
 
L
Y
 
G
G
 
G
S
 
A
P
 
G
K
 
Q
L
 
T
A
 
P
V
 
-
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
T
 
A
K
|
K
F
 
A
A
 
G
V
 
V
R
 
V
G
 
G
L
 
M
S
 
T
E
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
A
V
 
I
E
 
E
Y
 
L
A
 
G
A
 
R
Y
 
A
G
 
G
V
 
I
S
 
T
V
 
V
A
 
N
C
 
C
V
 
V
M
 
A
P
 
P
W
 
G
F
 
L
V
 
I
E
 
H
T
 
T
P
 
P
I
 
M

Sites not aligning to the query:

6qheA Alcohol dehydrogenase from arthrobacter sp. Ts-15 in complex with NAD+
32% identity, 72% coverage: 19:215/273 of query aligns to 11:209/261 of 6qheA

query
sites
6qheA
F
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
S
x
M
G
|
G
I
x
M
G
 
G
L
 
N
A
 
G
C
 
C
A
 
A
K
 
R
R
 
K
F
 
L
A
 
A
Q
 
E
E
 
A
G
 
G
W
 
A
F
 
K
V
 
V
G
 
Y
L
 
L
S
 
-
D
 
-
I
 
I
D
|
D
K
x
R
V
 
S
G
 
N
L
 
L
K
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
A
L
 
A
A
 
Q
V
 
D
G
 
M
P
 
R
E
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
L
N
 
N
G
 
A
S
 
N
I
 
H
H
 
V
P
 
Q
L
 
V
D
|
D
V
x
I
R
 
T
D
 
D
R
 
Q
E
 
E
A
 
S
W
 
L
E
 
T
N
 
S
A
 
A
I
 
Y
G
 
D
E
 
G
F
 
I
G
 
A
R
 
A
E
 
E
T
 
S
G
 
G
G
 
-
K
 
R
A
 
L
N
 
D
A
 
V
L
 
L
L
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
A
 
G
R
 
D
F
 
S
G
 
R
M
 
M
L
 
F
N
 
L
E
 
D
M
 
V
S
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
H
C
 
Y
D
 
K
I
 
K
Q
 
V
I
 
I
D
 
D
I
 
V
N
 
N
L
 
V
K
 
R
G
 
G
V
 
T
I
 
W
N
 
N
G
 
S
A
 
C
R
 
R
A
 
A
G
 
A
L
 
V
P
 
P
-
 
H
L
 
M
L
 
L
K
 
S
A
 
N
A
 
K
G
 
H
G
 
G
R
 
R
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
F
A
 
G
S
|
S
C
 
I
A
 
S
G
 
G
-
 
P
L
 
I
Y
 
V
G
 
A
S
 
D
P
 
P
K
 
G
L
 
W
A
 
T
V
 
V
Y
|
Y
S
 
A
A
 
L
T
 
S
K
|
K
F
 
G
A
 
A
V
 
I
R
 
F
G
 
G
L
 
F
S
 
T
E
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
A
V
 
S
E
 
E
Y
 
F
A
 
A
A
 
G
Y
 
Q
G
 
N
V
 
I
S
 
L
V
 
V
A
 
N
C
 
A
V
 
I
M
 
L
P
|
P
W
x
G
F
 
S
V
x
M
E
 
D
T
|
T
P
|
P
I
x
M
L
 
M
N
 
R
A
 
A
A
 
A
S
 
A
D
 
A
G
 
D
S
 
T
N
 
N
K
 
P
S
 
A
M
 
D
S
 
P
E
 
Q
S
 
S
L
 
V

5itvD Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
32% identity, 67% coverage: 16:197/273 of query aligns to 8:189/227 of 5itvD

query
sites
5itvD
K
 
K
S
 
T
I
 
V
F
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
Y
A
 
A
C
 
A
A
 
V
K
 
Q
R
 
A
F
 
F
A
 
L
Q
 
G
E
 
Q
G
 
Q
W
 
A
F
 
N
V
 
V
G
 
V
L
 
V
S
 
A
D
|
D
I
|
I
D
 
D
K
 
E
V
 
A
G
 
Q
L
 
G
K
 
E
A
 
A
A
 
M
L
 
V
L
 
R
A
 
K
V
 
E
G
 
N
P
 
N
E
 
D
N
 
R
G
 
L
S
 
H
I
 
F
H
 
V
P
 
Q
L
x
T
D
|
D
V
x
I
R
 
T
D
 
D
R
 
E
E
 
A
A
 
A
W
 
C
E
 
Q
N
 
H
A
 
A
I
 
V
G
 
-
E
 
E
F
 
S
G
 
A
R
 
V
E
 
H
T
 
T
G
 
F
G
 
G
K
 
G
A
 
L
N
 
D
A
 
V
L
 
L
L
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
E
R
 
I
F
 
V
G
 
A
M
 
P
L
 
I
N
 
H
E
 
E
M
 
M
S
 
E
D
 
L
A
 
S
D
 
D
C
 
W
D
 
N
I
 
K
Q
 
V
I
 
L
D
 
Q
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
M
I
 
F
N
 
L
G
 
M
A
 
S
R
 
K
A
 
H
G
 
A
L