SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CCNA_03279 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_03279 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
37% identity, 69% coverage: 6:198/278 of query aligns to 3:196/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
F
 
L
Q
 
D
D
 
N
K
 
K
V
 
V
C
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
S
|
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
L
 
V
S
 
A
A
 
H
Q
 
S
L
 
Y
A
 
A
E
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
K
L
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
S
D
|
D
I
|
I
N
 
N
F
 
E
P
 
D
A
 
H
A
 
G
E
 
N
E
 
K
L
 
A
A
 
V
H
 
E
R
 
D
M
 
I
N
 
K
Q
 
A
L
 
Q
G
 
G
V
 
G
T
 
E
A
 
A
K
 
S
P
 
F
V
 
V
R
 
K
T
x
A
D
|
D
V
x
T
T
 
S
L
 
N
S
 
P
E
 
E
S
 
E
V
 
V
R
 
E
Q
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
K
G
 
R
T
 
T
A
 
V
A
 
E
E
 
I
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
Y
 
I
L
 
A
F
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
 
G
V
 
-
F
 
-
G
 
G
E
 
E
-
 
Q
-
 
A
-
 
L
I
 
A
R
 
G
D
 
D
L
 
Y
S
 
G
L
 
L
D
 
D
H
 
S
W
 
W
R
 
R
R
 
K
V
 
V
I
 
L
D
 
S
I
 
I
N
 
N
L
 
L
M
 
D
G
 
G
E
 
V
I
 
F
Y
 
Y
G
 
G
I
 
C
H
 
K
Y
 
Y
A
 
E
Y
 
L
P
 
E
Q
 
Q
M
 
M
I
 
E
K
 
K
Q
 
N
G
 
G
F
 
G
G
 
G
H
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
M
A
 
A
S
|
S
G
 
I
F
 
H
G
 
G
M
 
I
A
 
V
P
 
A
G
 
A
P
 
P
V
 
L
N
 
S
S
 
S
P
 
A
Y
|
Y
V
 
T
A
 
S
S
 
A
K
|
K
F
 
H
A
 
A
V
 
V
F
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
T
H
 
K
A
 
N
L
 
I
A
 
G
T
 
A
E
 
E
A
 
Y
R
 
G
A
 
Q
F
 
K
G
 
N
V
 
I
H
 
R
V
 
C
T
 
N
V
 
A
A
 
V
C
 
G
P
|
P
G
x
A
F
x
Y
I
|
I
K
 
E
T
 
T
P
 
P
L
|
L
V
 
L
D
 
E
N
 
S
I
 
L

5b4tA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from alcaligenes faecalis complexed with NAD+ and a substrate d-3- hydroxybutyrate (see paper)
35% identity, 69% coverage: 6:197/278 of query aligns to 2:195/260 of 5b4tA

query
sites
5b4tA
F
 
L
Q
 
K
D
 
G
K
 
K
V
 
K
C
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
x
T
S
 
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
L
 
M
S
 
A
A
 
T
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
D
L
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
N
D
 
G
I
x
F
N
 
G
F
 
Q
P
 
P
A
 
E
-
 
D
-
 
I
A
 
E
E
 
R
E
 
E
L
 
R
A
 
S
H
 
T
R
 
L
M
 
E
N
 
S
Q
 
K
L
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
K
A
 
A
K
 
Y
P
 
Y
V
 
L
R
 
N
T
 
A
D
|
D
V
x
L
T
 
S
L
 
D
S
 
A
E
 
Q
S
 
A
V
 
T
R
 
R
Q
 
D
L
 
F
I
 
I
E
 
A
G
 
K
T
 
A
A
 
A
A
 
E
E
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
Y
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
A
x
Q
V
 
H
F
 
T
G
 
A
E
 
P
I
 
I
R
 
E
D
 
E
L
 
F
S
 
P
L
 
V
D
 
D
H
 
K
W
 
W
R
 
N
R
 
A
V
 
I
I
 
I
D
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
M
 
S
G
 
A
E
 
V
I
 
F
Y
 
H
G
 
G
I
 
T
H
 
A
Y
 
A
A
 
A
Y
 
L
P
 
P
Q
 
I
M
 
M
I
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
F
 
W
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
A
S
|
S
G
 
A
F
x
H
G
 
G
M
 
L
A
 
V
P
 
A
G
 
S
P
 
V
V
 
N
N
x
K
S
 
S
P
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
H
A
 
G
V
 
V
F
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
T
H
 
K
A
 
V
L
 
T
A
 
A
T
 
L
E
 
E
A
 
N
R
 
A
A
 
G
F
 
K
G
 
G
V
 
I
H
 
T
V
 
C
T
 
N
V
 
A
A
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
F
x
W
I
x
V
K
 
R
T
|
T
P
 
P
L
|
L
V
|
V
D
 
E
N
 
K

Sites not aligning to the query:

3w8dA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from alcaligenes faecalis complexed with NAD+ and an inhibitor methylmalonate
35% identity, 69% coverage: 6:197/278 of query aligns to 2:195/260 of 3w8dA

query
sites
3w8dA
F
 
L
Q
 
K
D
 
G
K
 
K
V
 
K
C
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
x
T
S
|
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
L
 
M
S
 
A
A
 
T
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
D
L
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
N
D
 
G
I
x
F
N
 
G
F
 
Q
P
 
P
A
 
E
-
 
D
-
 
I
A
 
E
E
 
R
E
 
E
L
 
R
A
 
S
H
 
T
R
 
L
M
 
E
N
 
S
Q
 
K
L
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
K
A
 
A
K
 
Y
P
 
Y
V
 
L
R
 
N
T
x
A
D
|
D
V
x
L
T
 
S
L
 
D
S
 
A
E
 
Q
S
 
A
V
 
T
R
 
R
Q
 
D
L
 
F
I
 
I
E
 
A
G
 
K
T
 
A
A
 
A
A
 
E
E
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
Y
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
A
x
Q
V
 
H
F
 
T
G
 
A
E
 
P
I
 
I
R
 
E
D
 
E
L
 
F
S
 
P
L
 
V
D
 
D
H
 
K
W
 
W
R
 
N
R
 
A
V
 
I
I
 
I
D
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
M
 
S
G
 
A
E
 
V
I
 
F
Y
 
H
G
 
G
I
 
T
H
 
A
Y
 
A
A
 
A
Y
 
L
P
 
P
Q
 
I
M
 
M
I
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
F
 
W
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
G
 
A
F
x
H
G
 
G
M
 
L
A
 
V
P
 
A
G
 
S
P
 
V
V
 
N
N
x
K
S
 
S
P
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
H
A
 
G
V
 
V
F
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
T
H
 
K
A
 
V
L
 
T
A
 
A
T
 
L
E
 
E
A
 
N
R
 
A
A
 
G
F
 
K
G
 
G
V
 
I
H
 
T
V
 
C
T
 
N
V
 
A
A
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
F
x
W
I
x
V
K
 
R
T
|
T
P
 
P
L
|
L
V
|
V
D
 
E
N
 
K

Sites not aligning to the query:

3vdrA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase, prepared in the presence of the substrate d-3-hydroxybutyrate and NAD(+) (see paper)
35% identity, 69% coverage: 6:197/278 of query aligns to 2:195/260 of 3vdrA

query
sites
3vdrA
F
 
L
Q
 
K
D
 
G
K
 
K
V
 
K
C
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
x
T
S
 
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
L
 
M
S
 
A
A
 
T
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
D
L
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
N
D
 
G
I
x
F
N
 
G
F
 
Q
P
 
P
A
 
E
-
 
D
-
 
I
A
 
E
E
 
R
E
 
E
L
 
R
A
 
S
H
 
T
R
 
L
M
 
E
N
 
S
Q
 
K
L
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
K
A
 
A
K
 
Y
P
 
Y
V
 
L
R
 
N
T
 
A
D
|
D
V
x
L
T
 
S
L
 
D
S
 
A
E
 
Q
S
 
A
V
 
T
R
 
R
Q
 
D
L
 
F
I
 
I
E
 
A
G
 
K
T
 
A
A
 
A
A
 
E
E
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
Y
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
A
x
Q
V
 
H
F
 
T
G
 
A
E
 
P
I
 
I
R
 
E
D
 
E
L
 
F
S
 
P
L
 
V
D
 
D
H
 
K
W
 
W
R
 
N
R
 
A
V
 
I
I
 
I
D
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
M
 
S
G
 
A
E
 
V
I
 
F
Y
 
H
G
 
G
I
 
T
H
 
A
Y
 
A
A
 
A
Y
 
L
P
 
P
Q
 
I
M
 
M
I
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
F
 
W
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
G
 
A
F
x
H
G
 
G
M
 
L
A
 
V
P
 
A
G
 
S
P
 
V
V
 
N
N
x
K
S
 
S
P
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
H
A
 
G
V
 
V
F
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
T
H
 
K
A
 
V
L
 
T
A
 
A
T
 
L
E
 
E
A
 
N
R
 
A
A
 
G
F
 
K
G
 
G
V
 
I
H
 
T
V
 
C
T
 
N
V
 
A
A
 
I
C
 
C
P
 
P
G
|
G
F
x
W
I
x
V
K
 
R
T
|
T
P
 
P
L
|
L
V
|
V
D
 
E
N
 
K

Sites not aligning to the query:

3vdqA Crystal structure of alcaligenes faecalis d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase in complex with NAD(+) and acetate (see paper)
35% identity, 69% coverage: 6:197/278 of query aligns to 2:195/260 of 3vdqA

query
sites
3vdqA
F
 
L
Q
 
K
D
 
G
K
 
K
V
 
K
C
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
T
S
|
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
L
 
M
S
 
A
A
 
T
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
D
L
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
N
D
 
G
I
x
F
N
 
G
F
 
Q
P
 
P
A
 
E
-
 
D
-
 
I
A
 
E
E
 
R
E
 
E
L
 
R
A
 
S
H
 
T
R
 
L
M
 
E
N
 
S
Q
 
K
L
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
K
A
 
A
K
 
Y
P
 
Y
V
 
L
R
 
N
T
 
A
D
|
D
V
x
L
T
 
S
L
 
D
S
 
A
E
 
Q
S
 
A
V
 
T
R
 
R
Q
 
D
L
 
F
I
 
I
E
 
A
G
 
K
T
 
A
A
 
A
A
 
E
E
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
Y
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
A
x
Q
V
 
H
F
 
T
G
 
A
E
 
P
I
 
I
R
 
E
D
 
E
L
 
F
S
 
P
L
 
V
D
 
D
H
 
K
W
 
W
R
 
N
R
 
A
V
 
I
I
 
I
D
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
M
 
S
G
 
A
E
 
V
I
 
F
Y
 
H
G
 
G
I
 
T
H
 
A
Y
 
A
A
 
A
Y
 
L
P
 
P
Q
 
I
M
 
M
I
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
F
 
W
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
A
S
|
S
G
 
A
F
x
H
G
 
G
M
 
L
A
 
V
P
 
A
G
 
S
P
 
V
V
 
N
N
x
K
S
 
S
P
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
H
A
 
G
V
 
V
F
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
T
H
 
K
A
 
V
L
 
T
A
 
A
T
 
L
E
 
E
A
 
N
R
 
A
A
 
G
F
 
K
G
 
G
V
 
I
H
 
T
V
 
C
T
 
N
V
 
A
A
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
F
x
W
I
x
V
K
 
R
T
|
T
P
 
P
L
|
L
V
|
V
D
 
E
N
 
K

Sites not aligning to the query:

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
35% identity, 78% coverage: 6:221/278 of query aligns to 5:209/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
F
 
L
Q
 
Q
D
 
D
K
 
K
V
 
V
C
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
S
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
L
 
A
S
 
A
A
 
R
Q
 
V
L
 
F
A
 
M
E
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
K
L
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
F
N
 
N
F
 
E
P
 
A
A
 
A
A
 
G
E
 
K
E
 
E
L
 
-
A
 
-
H
 
-
R
 
-
M
 
-
N
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
A
V
 
V
T
 
E
A
 
A
K
 
N
P
 
P
-
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
F
V
 
I
R
 
R
T
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
L
 
D
S
 
R
E
 
E
S
 
S
V
 
V
R
 
H
Q
 
R
L
 
L
I
 
V
E
 
E
G
 
N
T
 
V
A
 
A
A
 
E
E
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
Y
 
I
L
 
L
F
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
A
 
T
V
 
R
F
x
D
G
 
S
E
 
M
I
 
L
R
 
S
D
x
K
L
 
M
S
 
T
L
 
V
D
 
D
H
 
Q
W
 
F
R
 
Q
R
 
Q
V
 
V
I
 
I
D
 
N
I
 
V
N
|
N
L
 
L
M
 
T
G
 
G
E
 
V
I
 
F
Y
 
H
G
 
C
I
 
T
H
 
Q
Y
 
A
A
 
V
Y
 
L
P
 
P
Q
 
Y
M
 
M
I
 
A
K
 
E
Q
 
Q
G
 
G
F
 
K
G
 
G
H
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
T
A
 
S
S
|
S
G
 
V
F
 
T
G
 
G
M
 
T
A
 
Y
P
 
G
G
x
N
P
x
V
V
 
G
N
x
Q
S
 
T
P
 
N
Y
|
Y
V
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
A
A
 
G
V
 
V
F
 
I
G
 
G
L
 
M
S
 
T
H
 
K
A
 
T
L
 
W
A
 
A
T
 
K
E
 
E
A
 
L
R
 
A
A
 
R
F
 
K
G
 
G
V
 
I
H
 
N
V
 
V
T
 
N
V
 
A
A
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
F
|
F
I
x
T
K
 
E
T
|
T
P
 
A
L
x
M
V
 
V
D
 
A
N
 
E
I
 
V
H
 
-
C
 
-
V
 
-
N
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
P
A
 
E
D
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
E
N
x
K
I
 
M
P
 
K
V
 
-
A
 
A
M
 
Q
V
 
V
P
 
P
V
 
M
D
 
G
R
 
R

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
33% identity, 77% coverage: 9:221/278 of query aligns to 7:224/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
K
 
K
V
 
V
C
 
A
I
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
S
|
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
L
 
I
S
 
A
A
 
K
Q
 
K
L
 
F
A
 
A
E
 
Q
A
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
K
L
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
S
D
|
D
I
x
M
N
 
N
F
 
A
P
 
E
A
 
K
A
 
C
E
 
Q
E
 
E
L
 
T
A
 
A
H
 
N
R
 
S
M
 
L
N
 
K
Q
 
E
L
 
Q
G
 
G
V
 
F
T
 
D
A
 
A
K
 
L
P
 
S
V
 
A
R
 
P
T
 
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
L
 
D
S
 
E
E
 
D
S
 
A
V
 
Y
R
 
K
Q
 
Q
L
 
A
I
 
I
E
 
E
G
 
L
T
 
T
A
 
Q
A
 
K
E
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
V
D
 
D
Y
 
I
L
 
L
F
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
F
A
x
Q
V
 
H
F
 
V
G
 
A
E
 
P
I
 
I
R
 
E
D
 
E
L
 
F
S
 
P
L
 
T
D
 
A
H
 
V
W
 
F
R
 
Q
R
 
K
V
 
L
I
 
V
D
 
Q
I
 
V
N
 
M
L
 
L
M
 
T
G
 
G
E
 
A
I
 
F
Y
 
I
G
 
G
I
 
I
H
 
K
Y
 
H
A
 
V
Y
 
L
P
 
P
Q
 
I
M
 
M
I
 
K
K
 
A
Q
 
Q
G
 
K
F
 
Y
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
M
A
|
A
S
|
S
G
 
I
F
 
N
G
 
G
M
 
L
A
 
I
P
 
G
G
 
F
P
 
A
V
 
G
N
x
K
S
 
A
P
 
G
Y
|
Y
V
 
N
A
 
S
S
 
A
K
|
K
F
 
H
A
 
G
V
 
V
F
 
I
G
 
G
L
 
L
S
 
T
H
 
K
A
 
V
L
 
A
A
 
A
T
 
L
E
 
E
A
 
C
R
 
A
A
 
R
F
 
D
G
 
G
V
 
I
H
 
T
V
 
V
T
 
N
V
 
A
A
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
G
F
x
Y
I
x
V
K
 
D
T
|
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
-
 
R
-
 
G
-
x
Q
-
 
I
-
 
A
D
 
D
N
 
L
I
 
A
H
 
K
C
 
T
V
 
R
N
 
N
A
 
V
A
 
S
P
 
L
A
 
D
D
 
S
V
 
A
L
 
L
A
 
E
N
 
D
I
 
V
P
 
I
V
 
L
A
 
A
M
 
M
V
 
V
P
 
P
V
 
Q
D
 
K
R
 
R

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
33% identity, 77% coverage: 9:221/278 of query aligns to 8:225/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
K
 
K
V
 
V
C
 
A
I
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
S
|
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
L
 
I
S
 
A
A
 
K
Q
 
K
L
 
F
A
 
A
E
 
Q
A
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
K
L
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
S
D
|
D
I
x
M
N
 
N
F
 
A
P
 
E
A
 
K
A
 
C
E
 
Q
E
 
E
L
 
T
A
 
A
H
 
N
R
 
S
M
 
L
N
 
K
Q
 
E
L
 
Q
G
 
G
V
 
F
T
 
D
A
 
A
K
 
L
P
 
S
V
 
A
R
 
P
T
 
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
L
 
D
S
 
E
E
 
D
S
 
A
V
 
Y
R
 
K
Q
 
Q
L
 
A
I
 
I
E
 
E
G
 
L
T
 
T
A
 
Q
A
 
K
E
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
V
D
 
D
Y
 
I
L
 
L
F
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
F
A
x
Q
V
 
H
F
 
V
G
 
A
E
 
P
I
 
I
R
 
E
D
 
E
L
 
F
S
 
P
L
 
T
D
 
A
H
 
V
W
 
F
R
 
Q
R
 
K
V
 
L
I
 
V
D
 
Q
I
 
V
N
 
M
L
 
L
M
 
T
G
 
G
E
 
A
I
 
F
Y
 
I
G
 
G
I
 
I
H
 
K
Y
 
H
A
 
V
Y
 
L
P
 
P
Q
 
I
M
 
M
I
 
K
K
 
A
Q
 
Q
G
 
K
F
 
Y
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
M
A
|
A
S
|
S
G
 
I
F
x
N
G
 
G
M
 
L
A
 
I
P
 
G
G
 
F
P
 
A
V
 
G
N
x
K
S
 
A
P
 
G
Y
|
Y
V
 
N
A
 
S
S
 
A
K
|
K
F
 
H
A
 
G
V
 
V
F
 
I
G
 
G
L
 
L
S
 
T
H
 
K
A
 
V
L
 
A
A
 
A
T
 
L
E
 
E
A
 
C
R
 
A
A
 
R
F
 
D
G
 
G
V
 
I
H
 
T
V
 
V
T
 
N
V
 
A
A
 
L
C
 
C
P
|
P
G
|
G
F
 
Y
I
x
V
K
 
D
T
|
T
P
 
P
L
|
L
V
 
V
-
 
R
-
 
G
-
x
Q
-
 
I
-
 
A
D
 
D
N
 
L
I
 
A
H
 
K
C
 
T
V
 
R
N
 
N
A
 
V
A
 
S
P
 
L
A
 
D
D
 
S
V
 
A
L
 
L
A
 
E
N
 
D
I
 
V
P
 
I
V
 
L
A
 
A
M
 
M
V
 
V
P
 
P
V
 
Q
D
 
K
R
 
R

2ztlA Closed conformation of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase complexed with NAD+ and l-3-hydroxybutyrate (see paper)
36% identity, 69% coverage: 6:197/278 of query aligns to 2:195/260 of 2ztlA

query
sites
2ztlA
F
 
L
Q
 
K
D
 
G
K
 
K
V
 
V
C
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
T
S
 
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
L
A
 
G
L
 
I
S
 
A
A
 
T
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
A
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
D
L
 
I
I
 
V
I
 
L
A
 
N
D
 
-
I
 
-
N
 
G
F
|
F
P
 
G
A
 
D
A
 
A
E
 
A
E
 
E
L
 
I
-
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
R
A
 
A
H
 
G
R
 
L
M
 
A
N
 
A
Q
 
Q
L
 
H
G
 
G
V
 
V
T
 
K
A
 
V
K
 
L
P
 
Y
V
 
D
R
 
G
T
 
A
D
 
D
V
x
L
T
 
S
L
 
K
S
 
G
E
 
E
S
 
A
V
 
V
R
 
R
Q
 
G
L
 
L
I
 
V
E
 
D
G
 
N
T
 
A
A
 
V
A
 
R
E
 
Q
F
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
Y
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
A
x
Q
V
 
H
F
 
T
G
 
A
E
 
L
I
 
I
R
 
E
D
 
D
L
 
F
S
 
P
L
 
T
D
 
E
H
 
K
W
 
W
R
 
D
R
 
A
V
 
I
I
 
L
D
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
M
 
S
G
 
A
E
 
V
I
 
F
Y
 
H
G
 
G
I
 
T
H
 
A
Y
 
A
A
 
A
Y
 
L
P
 
P
Q
 
H
M
 
M
I
 
K
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
G
 
A
F
x
H
G
 
G
M
 
L
A
 
V
P
 
A
G
 
S
P
 
A
V
 
N
N
x
K
S
 
S
P
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
H
A
 
G
V
 
V
F
 
V
G
 
G
L
 
F
S
 
T
H
 
K
A
 
V
L
 
T
A
 
A
T
 
L
E
 
E
A
 
T
R
 
A
A
 
G
F
 
Q
G
 
G
V
 
I
H
 
T
V
 
A
T
 
N
V
 
A
A
 
I
C
 
C
P
|
P
G
 
G
F
x
W
I
x
V
K
 
R
T
|
T
P
 
P
L
 
L
V
|
V
D
 
E
N
 
K

Sites not aligning to the query:

1wmbA Crystal structure of NAD dependent d-3-hydroxybutylate dehydrogenase (see paper)
36% identity, 69% coverage: 6:197/278 of query aligns to 2:195/260 of 1wmbA

query
sites
1wmbA
F
 
L
Q
 
K
D
 
G
K
 
K
V
 
V
C
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
T
S
 
S
G
|
G
L
 
I
G
 
G
R
 
L
A
 
G
L
 
I
S
 
A
A
 
T
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
A
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
D
L
 
I
I
 
V
I
 
L
A
 
N
D
 
-
I
 
-
N
 
G
F
 
F
P
 
G
A
 
D
A
 
A
E
 
A
E
 
E
L
 
I
-
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
R
A
 
A
H
 
G
R
 
L
M
 
A
N
 
A
Q
 
Q
L
 
H
G
 
G
V
 
V
T
 
K
A
 
V
K
 
L
P
 
Y
V
 
D
R
 
G
T
 
A
D
 
D
V
 
L
T
 
S
L
 
K
S
 
G
E
 
E
S
 
A
V
 
V
R
 
R
Q
 
G
L
 
L
I
 
V
E
 
D
G
 
N
T
 
A
A
 
V
A
 
R
E
 
Q
F
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
Y
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
Q
V
 
H
F
 
T
G
 
A
E
 
L
I
 
I
R
 
E
D
 
D
L
 
F
S
 
P
L
 
T
D
 
E
H
 
K
W
 
W
R
 
D
R
 
A
V
 
I
I
 
L
D
 
A
I
 
L
N
|
N
L
 
L
M
 
S
G
 
A
E
 
V
I
 
F
Y
 
H
G
 
G
I
 
T
H
 
A
Y
 
A
A
 
A
Y
 
L
P
 
P
Q
 
H
M
 
M
I
 
K
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
G
 
A
F
 
H
G
 
G
M
 
L
A
 
V
P
 
A
G
 
S
P
 
A
V
 
N
N
 
K
S
 
S
P
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
H
A
 
G
V
 
V
F
 
V
G
 
G
L
 
F
S
 
T
H
 
K
A
 
V
L
 
T
A
 
A
T
 
L
E
 
E
A
 
T
R
 
A
A
 
G
F
 
Q
G
 
G
V
 
I
H
 
T
V
 
A
T
 
N
V
 
A
A
 
I
C
 
C
P
 
P
G
 
G
F
 
W
I
 
V
K
 
R
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
D
 
E
N
 
K

Sites not aligning to the query:

8cxaA Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from mycobacterium smegmatis with bound NAD
36% identity, 67% coverage: 8:194/278 of query aligns to 5:194/251 of 8cxaA

query
sites
8cxaA
D
 
N
K
 
R
V
 
V
C
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
S
x
Q
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
I
L
 
Y
S
 
A
A
 
E
Q
 
R
L
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
A
L
 
V
I
 
V
I
 
V
A
 
A
D
|
D
I
 
I
N
 
N
F
 
E
P
 
P
A
 
K
A
 
A
E
 
T
E
 
E
L
 
V
A
 
A
H
 
S
R
 
S
M
 
I
N
 
T
Q
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
G
T
 
R
A
 
A
K
 
I
P
 
A
V
 
A
R
 
A
T
 
V
D
 
D
V
|
V
T
 
S
L
 
D
S
 
V
E
 
E
S
 
S
V
 
V
R
 
N
Q
 
R
L
 
M
I
 
V
E
 
D
G
 
S
T
 
A
A
 
V
A
 
E
E
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
V
D
 
D
Y
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
-
I
 
-
A
|
A
V
 
I
F
 
F
G
x
S
E
 
T
I
 
L
R
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
P
-
 
F
-
 
E
D
 
E
L
 
I
S
 
S
L
 
G
D
 
D
H
 
E
W
 
W
R
 
D
R
 
K
V
 
L
I
 
F
D
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
A
M
 
K
G
 
G
E
 
T
I
 
F
Y
 
L
G
 
C
I
 
C
H
 
Q
Y
 
A
A
 
V
Y
 
S
P
 
P
Q
 
V
M
 
M
I
 
R
K
 
K
Q
 
N
G
 
Q
F
 
Y
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
x
S
S
|
S
G
 
S
F
 
V
G
 
V
M
 
V
A
 
T
P
 
G
G
 
R
P
 
P
V
 
N
N
 
Y
S
 
A
P
 
H
Y
|
Y
V
 
I
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
G
A
 
A
V
 
V
F
 
W
G
 
A
L
 
L
S
 
T
H
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
T
E
 
E
A
 
M
R
 
G
A
 
T
F
 
D
G
 
G
V
 
I
H
 
T
V
 
V
T
 
N
V
 
T
A
 
V
C
 
S
P
|
P
G
x
H
F
 
G
I
|
I
K
 
I
T
 
T
P
 
E
L
x
I

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
35% identity, 76% coverage: 5:214/278 of query aligns to 2:210/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
P
 
T
F
 
L
Q
 
Q
D
 
G
K
 
K
V
 
V
C
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
S
S
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
D
L
 
I
S
 
A
A
 
I
Q
 
N
L
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
N
L
 
I
I
 
F
I
 
F
A
x
N
D
x
Y
I
x
N
N
x
G
F
x
S
P
 
P
-
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
T
A
 
A
H
 
K
R
 
L
M
 
V
N
 
A
Q
 
E
L
 
H
G
 
G
V
 
V
T
 
E
A
 
V
K
 
E
P
 
A
V
 
M
R
 
K
T
 
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
L
 
I
S
 
A
E
 
E
S
 
D
V
 
V
R
 
D
Q
 
A
L
 
F
I
 
F
E
 
K
G
 
Q
T
 
A
A
 
I
A
 
E
E
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
Y
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
A
 
T
V
 
R
F
 
D
G
 
N
E
 
L
I
 
L
R
 
M
D
 
R
L
 
M
S
 
K
L
 
E
D
 
D
H
 
E
W
 
W
R
 
D
R
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
N
I
|
I
N
 
N
L
 
L
M
 
K
G
 
G
E
 
T
I
 
F
Y
 
L
G
 
C
I
 
T
H
 
K
Y
 
A
A
 
V
Y
 
S
P
 
R
Q
 
T
M
 
M
I
 
M
K
 
K
Q
 
Q
G
 
R
F
 
A
G
 
G
H
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
M
A
 
A
S
|
S
G
 
V
F
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
I
P
 
G
G
 
N
P
 
A
V
 
G
N
x
Q
S
 
A
P
 
N
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
A
A
 
G
V
 
V
F
 
I
G
 
G
L
 
L
S
 
T
H
 
K
A
 
T
L
 
T
A
 
A
T
 
R
E
 
E
A
 
L
R
 
A
A
 
P
F
 
R
G
 
G
V
 
I
H
 
N
V
 
V
T
 
N
V
 
A
A
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
K
 
T
T
|
T
P
 
D
L
 
M
V
 
T
D
 
D
N
 
K
I
 
L
H
 
D
C
 
-
V
 
-
N
 
E
A
 
K
A
 
T
P
 
K
A
 
E
D
 
A
V
 
M
L
 
L
A
 
A
N
 
Q
I
 
I
P
 
P
V
 
L

2dtxA Structure of thermoplasma acidophilum aldohexose dehydrogenase (aldt) in complex with d-mannose (see paper)
36% identity, 68% coverage: 6:195/278 of query aligns to 5:182/255 of 2dtxA

query
sites
2dtxA
F
 
L
Q
 
R
D
 
D
K
 
K
V
 
V
C
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
S
 
M
G
|
G
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
S
 
A
A
 
E
Q
 
R
L
 
F
A
 
V
E
 
D
A
 
E
G
 
G
A
 
S
T
 
K
L
 
V
I
 
I
I
 
D
A
 
L
D
 
S
I
 
I
N
 
H
F
 
D
P
 
P
A
 
G
A
 
E
E
 
A
E
 
K
L
 
Y
A
 
D
H
 
H
R
 
-
M
 
-
N
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
-
K
 
-
P
 
-
V
 
I
R
 
E
T
 
C
D
 
D
V
 
V
T
 
T
L
 
N
S
 
P
E
 
D
S
 
Q
V
 
V
R
 
K
Q
 
A
L
 
S
I
 
I
E
 
D
G
 
H
T
 
I
A
 
F
A
 
K
E
 
E
F
 
Y
G
 
G
R
 
S
I
 
I
D
 
S
Y
 
V
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
E
V
 
S
F
 
Y
G
 
G
E
 
K
I
 
I
R
 
E
D
 
S
L
 
M
S
 
S
L
 
M
D
 
G
H
 
E
W
 
W
R
 
R
R
 
R
V
 
I
I
 
I
D
 
D
I
 
V
N
 
N
L
 
L
M
 
F
G
 
G
E
 
Y
I
 
Y
Y
 
Y
G
 
A
I
 
S
H
 
K
Y
 
F
A
 
A
Y
 
I
P
 
P
Q
 
Y
M
 
M
I
 
I
K
 
R
Q
 
S
G
 
R
F
 
D
G
 
P
H
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
I
A
 
S
S
|
S
G
x
V
F
x
Q
G
 
A
M
 
S
A
 
I
P
 
I
G
 
T
P
 
K
V
 
N
N
 
A
S
 
S
P
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
T
S
|
S
K
|
K
F
 
H
A
 
A
V
 
V
F
 
I
G
 
G
L
 
L
S
 
T
H
 
K
A
 
S
L
 
I
A
 
A
T
 
L
E
 
D
A
 
Y
R
 
A
A
 
P
F
 
L
G
 
-
V
 
L
H
 
R
V
 
C
T
 
N
V
 
A
A
 
V
C
 
C
P
 
P
G
x
A
F
x
T
I
 
I
K
 
D
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V

2dteA Structure of thermoplasma acidophilum aldohexose dehydrogenase (aldt) in complex with nadh (see paper)
36% identity, 68% coverage: 6:195/278 of query aligns to 5:182/255 of 2dteA

query
sites
2dteA
F
 
L
Q
 
R
D
 
D
K
 
K
V
 
V
C
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
x
M
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
S
 
A
A
 
E
Q
 
R
L
 
F
A
 
V
E
 
D
A
 
E
G
 
G
A
 
S
T
 
K
L
 
V
I
 
I
I
 
D
A
 
L
D
x
S
I
|
I
N
 
H
F
 
D
P
 
P
A
 
G
A
 
E
E
 
A
E
 
K
L
 
Y
A
 
D
H
 
H
R
 
-
M
 
-
N
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
-
K
 
-
P
 
-
V
 
I
R
 
E
T
x
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
L
 
N
S
 
P
E
 
D
S
 
Q
V
 
V
R
 
K
Q
 
A
L
 
S
I
 
I
E
 
D
G
 
H
T
 
I
A
 
F
A
 
K
E
 
E
F
 
Y
G
 
G
R
 
S
I
 
I
D
 
S
Y
 
V
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
 
E
V
 
S
F
 
Y
G
 
G
E
 
K
I
 
I
R
 
E
D
 
S
L
 
M
S
 
S
L
 
M
D
 
G
H
 
E
W
 
W
R
 
R
R
 
R
V
 
I
I
 
I
D
 
D
I
 
V
N
 
N
L
 
L
M
 
F
G
 
G
E
 
Y
I
 
Y
Y
 
Y
G
 
A
I
 
S
H
 
K
Y
 
F
A
 
A
Y
 
I
P
 
P
Q
 
Y
M
 
M
I
 
I
K
 
R
Q
 
S
G
 
R
F
 
D
G
 
P
H
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
I
A
 
S
S
|
S
G
 
V
F
 
Q
G
 
A
M
 
S
A
 
I
P
 
I
G
 
T
P
 
K
V
 
N
N
 
A
S
 
S
P
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
T
S
|
S
K
|
K
F
 
H
A
 
A
V
 
V
F
 
I
G
 
G
L
 
L
S
 
T
H
 
K
A
 
S
L
 
I
A
 
A
T
 
L
E
 
D
A
 
Y
R
 
A
A
 
P
F
 
L
G
 
-
V
 
L
H
 
R
V
 
C
T
 
N
V
 
A
A
 
V
C
 
C
P
|
P
G
x
A
F
x
T
I
|
I
K
 
D
T
|
T
P
|
P
L
|
L
V
|
V

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
33% identity, 74% coverage: 9:215/278 of query aligns to 5:210/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
K
 
K
V
 
S
C
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
S
 
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
L
 
I
S
 
A
A
 
L
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
T
 
N
L
 
V
I
 
A
I
 
V
A
 
-
D
 
-
I
 
-
N
 
N
F
 
Y
P
 
A
A
 
G
A
 
S
E
 
K
E
 
E
L
 
K
A
 
A
H
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
E
R
 
E
M
 
I
N
 
K
Q
 
A
L
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
D
A
 
S
K
 
F
P
 
A
V
 
I
R
 
Q
T
 
A
D
 
N
V
 
V
T
 
A
L
 
D
S
 
A
E
 
D
S
 
E
V
 
V
R
 
K
Q
 
A
L
 
M
I
 
I
E
 
K
G
 
E
T
 
V
A
 
V
A
 
S
E
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
Y
 
V
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
T
V
 
R
F
 
D
G
 
N
E
 
L
I
 
L
R
 
M
D
 
R
L
 
M
S
 
K
L
 
E
D
 
Q
H
 
E
W
 
W
R
 
D
R
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
I
 
T
N
 
N
L
 
L
M
 
K
G
 
G
E
 
V
I
 
F
Y
 
N
G
 
C
I
 
I
H
 
Q
Y
 
K
A
 
A
Y
 
T
P
 
P
Q
 
Q
M
 
M
I
 
L
K
 
R
Q
 
Q
G
 
R
F
 
S
G
 
G
H
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
L
A
 
S
S
|
S
G
 
V
F
 
V
G
 
G
M
 
A
A
 
V
P
 
G
G
 
N
P
 
P
V
 
G
N
x
Q
S
 
A
P
 
N
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
F
 
A
A
 
G
V
 
V
F
 
I
G
 
G
L
 
L
S
 
T
H
 
K
A
 
S
L
 
A
A
 
A
T
 
R
E
 
E
A
 
L
R
 
A
A
 
S
F
 
R
G
 
G
V
 
I
H
 
T
V
 
V
T
 
N
V
 
A
A
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
K
 
V
T
 
S
P
 
D
L
 
M
V
 
T
D
 
D
N
 
A
I
 
L
H
 
S
C
 
-
V
 
-
N
 
D
A
 
E
A
 
L
P
 
K
A
 
E
D
 
Q
V
 
M
L
 
L
A
 
T
N
 
Q
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
A

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
33% identity, 74% coverage: 9:215/278 of query aligns to 2:203/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
K
 
K
V
 
S
C
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
L
 
I
S
 
A
A
 
L
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
T
 
N
L
 
V
I
 
A
I
 
V
A
 
-
D
 
-
I
 
-
N
|
N
F
x
Y
P
x
A
A
x
G
A
x
S
E
 
K
E
 
E
L
 
K
A
 
A
H
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
E
R
 
E
M
 
I
N
 
K
Q
 
A
L
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
D
A
 
S
K
 
F
P
 
A
V
 
I
R
 
Q
T
x
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
L
 
D
S
 
A
E
 
D
S
 
E
V
 
V
R
 
K
Q
 
A
L
 
M
I
 
I
E
 
K
G
 
E
T
 
V
A
 
V
A
 
S
E
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
Y
 
V
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
 
T
V
 
R
F
 
D
G
 
N
E
 
L
I
 
L
R
 
M
D
 
R
L
 
M
S
 
K
L
 
E
D
 
Q
H
 
E
W
 
W
R
 
D
R
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
I
x
T
N
 
N
L
 
L
M
 
K
G
 
G
E
 
V
I
 
F
Y
 
N
G
 
C
I
 
I
H
 
Q
Y
 
K
A
 
A
Y
 
T
P
 
P
Q
 
Q
M
 
M
I
 
L
K
 
R
Q
 
Q
G
 
R
F
 
S
G
 
G
H
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
L
A
 
S
S
|
S
G
 
V
F
 
V
G
 
G
M
 
A
A
 
V
P
 
G
G
 
N
P
 
P
V
 
G
N
x
Q
S
 
A
P
 
N
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
F
 
A
A
 
G
V
 
V
F
 
I
G
 
G
L
 
L
S
 
T
H
 
K
A
 
S
L
 
A
A
 
A
T
 
R
E
 
E
A
 
L
R
 
A
A
 
S
F
 
R
G
 
G
V
 
I
H
 
T
V
 
V
T
 
N
V
 
A
A
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
 
I
K
 
V
T
 
S
P
 
D
L
 
M
V
 
T
D
 
D
N
 
E
I
 
L
H
 
K
C
 
-
V
 
-
N
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
E
D
 
Q
V
 
M
L
 
L
A
 
T
N
 
Q
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
A

8g9vE Crystal structures of 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 13 (see paper)
28% identity, 88% coverage: 9:254/278 of query aligns to 37:274/293 of 8g9vE

query
sites
8g9vE
K
 
E
V
 
I
C
 
V
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
S
x
H
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
Q
L
 
T
S
 
T
A
 
Y
Q
 
E
L
 
F
A
 
A
E
 
K
A
 
R
G
 
K
A
 
S
T
 
R
L
 
L
I
 
V
I
 
L
A
 
W
D
|
D
I
|
I
N
 
N
F
 
K
P
 
H
A
 
G
A
 
V
E
 
E
E
 
E
L
 
T
A
 
A
H
 
A
R
 
E
M
 
C
N
 
R
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
T
A
 
A
K
 
H
P
 
A
V
 
Y
R
 
V
T
 
V
D
|
D
V
x
C
T
 
S
L
 
N
S
 
R
E
 
E
S
 
E
V
 
I
R
 
Y
Q
 
R
L
 
S
I
 
L
E
 
N
G
 
Q
T
 
V
A
 
K
A
 
K
E
 
E
F
 
V
G
 
G
R
 
D
I
 
V
D
 
T
Y
 
I
L
 
V
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
T
A
 
V
V
 
Y
F
 
P
G
 
A
E
 
D
I
 
L
R
 
L
D
 
S
L
 
T
S
 
K
L
 
D
D
 
E
H
 
E
W
 
I
R
 
T
R
 
K
V
 
T
I
 
F
D
 
E
I
 
V
N
 
N
L
 
I
M
 
L
G
 
G
E
 
H
I
 
F
Y
 
W
G
 
I
I
 
T
H
 
K
Y
 
A
A
 
L
Y
 
L
P
 
P
Q
 
S
M
 
M
I
 
M
K
 
K
Q
 
R
G
 
N
F
 
H
G
 
G
H
 
H
I
 
I
V
 
V
N
 
T
V
|
V
A
 
A
S
|
S
G
x
V
F
x
C
G
 
G
M
 
H
A
 
E
P
 
G
G
x
I
P
 
P
V
 
Y
N
 
L
S
 
I
P
 
P
Y
|
Y
V
 
C
A
 
S
S
 
S
K
|
K
F
 
F
A
 
A
V
 
A
F
 
V
G
 
G
L
 
F
S
 
H
H
 
R
A
 
G
L
 
L
A
 
T
T
 
S
E
 
E
A
 
L
R
 
Q
A
 
A
F
 
L
-
 
G
-
 
K
-
 
T
G
 
G
V
 
I
H
 
K
V
 
T
T
 
S
V
 
C
A
 
L
C
 
C
P
|
P
G
x
V
F
|
F
I
x
V
K
 
N
T
|
T
P
 
G
L
x
F
V
 
T
D
 
K
N
 
N
I
 
-
H
 
-
C
 
-
V
 
-
N
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
P
A
 
S
D
 
T
V
 
R
L
 
L
A
x
W
N
 
-
I
 
-
P
 
P
V
 
V
A
 
-
M
 
-
V
 
L
P
 
E
V
 
T
D
 
D
R
 
E
A
 
V
A
 
V
N
 
R
I
 
S
I
 
L
L
 
I
T
 
D
G
 
G
V
 
I
A
 
L
K
 
T
R
 
N
K
 
K
M
 
K
V
 
M
I
 
I
A
 
F
F
 
V
P
 
P
G
 
S
Y
 
Y
V
 
I
G
 
N
V
 
I
L
x
F
A
 
L
F
 
R
I
 
L
H
 
Q
R
 
K
F
 
F
L
 
L
P
 
P

1x1tA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from pseudomonas fragi complexed with NAD+ (see paper)
33% identity, 81% coverage: 6:231/278 of query aligns to 2:228/236 of 1x1tA

query
sites
1x1tA
F
 
L
Q
 
K
D
 
G
K
 
K
V
 
V
C
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
x
T
S
|
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
L
A
 
G
L
 
I
S
 
A
A
 
T
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
A
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
D
L
 
I
I
 
V
I
 
L
A
 
N
D
 
-
I
 
-
N
x
G
F
|
F
P
 
G
A
 
D
A
 
A
E
 
A
E
 
E
L
 
I
-
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
R
A
 
A
H
 
G
R
 
L
M
 
A
N
 
A
Q
 
Q
L
 
H
G
 
G
V
 
V
T
 
K
A
 
V
K
 
L
P
 
Y
V
 
D
R
 
G
T
 
A
D
|
D
V
x
L
T
 
S
L
 
K
S
 
G
E
 
E
S
 
A
V
 
V
R
 
R
Q
 
G
L
 
L
I
 
V
E
 
D
G
 
N
T
 
A
A
 
V
A
 
R
E
 
Q
F
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
Y
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
A
 
Q
V
 
H
F
 
T
G
 
A
E
 
L
I
 
I
R
 
E
D
 
D
L
 
F
S
 
P
L
 
T
D
 
E
H
 
K
W
 
W
R
 
D
R
 
A
V
 
I
I
 
L
D
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
M
 
S
G
 
A
E
 
V
I
 
F
Y
 
H
G
 
G
I
 
T
H
 
A
Y
 
A
A
 
A
Y
 
L
P
 
P
Q
 
H
M
 
M
I
 
K
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
G
 
A
F
x
H
G
 
G
M
 
L
A
 
V
P
 
A
G
 
S
P
 
A
V
 
N
N
 
K
S
 
S
P
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
H
A
 
G
V
 
V
F
 
V
G
 
G
L
 
F
S
 
T
H
 
K
A
 
V
L
 
T
A
 
A
T
 
L
E
 
E
A
 
T
R
 
A
A
 
G
F
 
Q
G
 
G
V
 
I
H
 
T
V
 
A
T
 
N
V
 
A
A
 
I
C
 
C
P
|
P
G
 
G
F
x
W
I
x
V
K
 
R
T
|
T
P
 
L
L
 
L
V
 
S
D
 
E
N
 
K
I
 
Q
H
 
P
C
 
S
V
 
L
N
 
Q
A
 
F
A
 
V
P
 
T
A
 
P
D
 
E
V
 
Q
L
 
L
A
 
G
N
 
G
I
 
T
P
 
A
V
 
V
A
 
-
M
 
F
V
 
L
P
 
A
V
 
S
D
 
D
R
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
Q
I
 
I
I
 
T
L
 
G
T
 
T
G
 
T
V
 
V
A
 
S

Sites not aligning to the query:

1zemA Crystal structure of NAD+-bound xylitol dehydrogenase (see paper)
35% identity, 67% coverage: 6:190/278 of query aligns to 3:188/260 of 1zemA

query
sites
1zemA
F
 
F
Q
 
N
D
 
G
K
 
K
V
 
V
C
 
C
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
S
x
G
G
x
N
L
x
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
L
 
T
S
 
A
A
 
L
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
T
T
 
A
L
 
I
I
 
A
I
 
L
A
 
L
D
|
D
I
x
M
N
 
N
F
 
R
P
 
E
A
 
A
A
 
L
E
 
E
E
 
K
L
 
A
A
 
E
H
 
A
R
 
S
M
 
V
N
 
R
Q
 
E
L
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
E
A
 
A
K
 
R
P
 
S
V
 
Y
R
 
V
T
 
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
L
 
S
S
 
E
E
 
E
S
 
A
V
 
V
R
 
I
Q
 
G
L
 
T
I
 
V
E
 
D
G
 
S
T
 
V
A
 
V
A
 
R
E
 
D
F
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
Y
 
F
L
 
L
F
 
F
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
Y
-
 
Q
A
 
G
V
 
A
F
 
F
G
 
A
E
 
P
I
 
V
R
 
Q
D
 
D
L
 
Y
S
 
P
L
 
S
D
 
D
H
 
D
W
 
F
R
 
A
R
 
R
V
 
V
I
 
L
D
 
T
I
 
I
N
 
N
L
 
V
M
 
T
G
 
G
E
 
A
I
 
F
Y
 
H
G
 
V
I
 
L
H
 
K
Y
 
A
A
 
V
Y
 
S
P
 
R
Q
 
Q
M
 
M
I
 
I
K
 
T
Q
 
Q
G
 
N
F
 
Y
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
T
A
 
A
S
|
S
G
 
M
F
 
A
G
 
G
M
 
V
A
 
K
P
 
G
G
 
P
P
 
P
V
 
N
N
 
M
S
 
A
P
 
A
Y
|
Y
V
 
G
A
 
T
S
 
S
K
|
K
F
 
G
A
 
A
V
 
I
F
 
I
G
 
A
L
 
L
S
 
T
H
 
E
A
 
T
L
 
A
A
 
A
T
 
L
E
 
D
A
 
L
R
 
A
A
 
P
F
 
Y
G
 
N
V
 
I
H
 
R
V
 
V
T
 
N
V
 
A
A
 
I
C
 
S
P
|
P
G
 
G
F
 
Y
I
x
M

Sites not aligning to the query:

Q7Z5P4 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 13; 17-beta-HSD 13; Hepatic retinol/retinal dehydrogenase; Short chain dehydrogenase/reductase family 16C member 3; Short-chain dehydrogenase/reductase 9; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.62; EC 1.1.1.105 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
28% identity, 88% coverage: 9:254/278 of query aligns to 37:274/300 of Q7Z5P4

query
sites
Q7Z5P4
K
 
E
V
 
I
C
 
V
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
G
S
 
H
G
|
G
L
x
I
G
|
G
R
 
R
A
 
Q
L
 
T
S
 
T
A
 
Y
Q
 
E
L
 
F
A
 
A
E
 
K
A
 
R
G
 
Q
A
 
S
T
 
I
L
 
L
I
 
V
I
 
L
A
 
W
D
 
D
I
 
I
N
|
N
F
x
K
P
x
R
A
x
G
A
x
V
E
|
E
E
|
E
L
x
T
A
|
A
H
x
A
R
x
E
M
x
C
N
x
R
Q
x
K
L
|
L
G
|
G
V
|
V
T
|
T
A
|
A
K
x
H
P
x
A
V
x
Y
R
x
V
T
x
V
D
|
D
V
x
C
T
x
S
L
x
N
S
x
R
E
|
E
S
x
E
V
x
I
R
x
Y
Q
x
R
L
x
S
I
x
L
E
x
N
G
x
Q
T
 
V
A
 
K
A
 
K
E
 
E
F
 
V
G
 
G
R
 
D
I
 
V
D
 
T
Y
 
I
L
 
V
F
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
T
A
 
V
V
 
Y
F
 
P
G
 
A
E
 
D
I
 
L
R
 
L
D
 
S
L
 
T
S
 
K
L
 
D
D
 
E
H
 
E
W
 
I
R
 
T
R
 
K
V
 
T
I
 
F
D
 
E
I
 
V
N
|
N
L
 
I
M
 
L
G
 
G
E
 
H
I
 
F
Y
 
W
G
 
I
I
 
T
H
x
K
Y
 
A
A
 
L
Y
x
L
P
 
P
Q
 
S
M
 
M
I
 
M
K
 
E
Q
 
R
G
 
N
F
 
H
G
 
G
H
 
H
I
 
I
V
 
V
N
 
T
V
 
V
A
 
A
S
|
S
G
 
V
F
 
C
G
 
G
M
 
H
A
 
E
P
 
G
G
 
I
P
 
P
V
 
Y
N
 
L
S
 
I
P
 
P
Y
|
Y
V
 
C
A
 
S
S
 
S
K
|
K
F
 
F
A
 
A
V
 
A
F
 
V
G
 
G
L
 
F
S
 
H
H
 
R
A
 
G
L
|
L
A
 
T
T
 
S
E
|
E
A
 
L
R
 
Q
A
 
A
F
 
L
-
 
G
-
x
K
-
 
T
G
 
G
V
 
I
H
 
K
V
 
T
T
 
S
V
 
C
A
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
V
F
 
F
I
 
V
K
 
N
T
 
T
P
 
G
L
 
F
V
 
T
D
 
K
N
 
N
I
 
-
H
 
-
C
 
-
V
 
-
N
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
P
A
 
S
D
 
T
V
 
R
L
 
L
A
 
W
N
 
-
I
 
-
P
 
P
V
 
V
A
 
-
M
 
-
V
 
L
P
 
E
V
 
T
D
 
D
R
 
E
A
 
V
A
 
V
N
 
R
I
 
S
I
 
L
L
 
I
T
 
D
G
 
G
V
 
I
A
 
L
K
 
T
R
 
N
K
 
K
M
 
K
V
 
M
I
 
I
A
 
F
F
 
V
P
|
P
G
 
S
Y
 
Y
V
 
I
G
 
N
V
 
I
L
 
F
A
 
L
F
 
R
I
 
L
H
 
Q
R
 
K
F
 
F
L
 
L
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>CCNA_03279 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_03279
MAKNPFQDKVCIVTGAASGLGRALSAQLAEAGATLIIADINFPAAEELAHRMNQLGVTAK
PVRTDVTLSESVRQLIEGTAAEFGRIDYLFNNAGIAVFGEIRDLSLDHWRRVIDINLMGE
IYGIHYAYPQMIKQGFGHIVNVASGFGMAPGPVNSPYVASKFAVFGLSHALATEARAFGV
HVTVACPGFIKTPLVDNIHCVNAAPADVLANIPVAMVPVDRAANIILTGVAKRKMVIAFP
GYVGVLAFIHRFLPAVWDSMGKGEIARFRKIRKDPAVS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory