SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing CCNA_03320 FitnessBrowser__Caulo:CCNA_03320 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

A0A0H3JRU9 Pyruvate carboxylase; EC 6.4.1.1 from Staphylococcus aureus (strain Mu50 / ATCC 700699) (see 2 papers)
44% identity, 42% coverage: 2:449/1078 of query aligns to 3:455/1150 of A0A0H3JRU9

query
sites
A0A0H3JRU9
S
 
Q
L
 
I
S
 
K
R
 
K
V
 
L
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
I
R
 
R
I
 
I
A
 
F
R
|
R
T
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
L
G
 
D
L
 
I
E
 
S
S
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
S
A
 
N
D
 
E
D
 
D
A
 
K
Q
 
S
S
 
S
P
 
L
H
 
H
V
 
R
S
 
Y
A
 
K
A
 
A
D
 
D
H
 
E
A
 
S
V
 
Y
A
 
-
L
 
L
P
 
V
G
 
G
A
 
S
G
 
D
-
 
L
-
 
G
-
 
P
A
 
A
R
 
E
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
D
 
N
I
 
I
A
 
E
A
 
R
V
 
I
V
 
I
A
 
D
A
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
Q
Q
 
A
G
 
N
C
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
N
P
 
E
H
 
Q
L
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
R
C
 
C
A
 
A
E
 
E
A
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
K
F
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
H
P
 
L
E
 
E
H
 
H
L
 
L
T
 
D
T
 
M
F
 
F
G
 
G
D
 
D
K
|
K
A
 
V
A
 
K
A
 
A
R
 
R
A
 
T
L
 
T
A
 
A
A
 
I
E
 
K
R
 
A
G
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
G
T
 
T
-
 
D
G
 
G
A
 
P
I
 
I
-
 
K
T
 
S
L
 
Y
E
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
E
F
 
F
Q
 
A
A
 
E
E
 
E
H
 
A
G
 
G
-
 
F
A
 
P
I
 
L
M
 
M
L
 
I
K
|
K
A
 
A
R
 
T
A
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
K
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
I
V
 
V
L
 
R
D
 
E
P
 
E
G
 
S
E
 
E
L
 
L
D
 
E
A
 
D
A
 
A
F
 
F
A
 
H
A
 
R
C
 
A
E
 
K
R
 
S
E
 
E
A
 
A
L
 
E
A
 
K
A
 
S
F
 
F
G
 
G
D
 
N
G
 
S
G
 
E
L
 
V
Y
 
Y
A
 
I
E
 
E
K
 
R
L
 
Y
I
 
I
E
 
D
R
 
N
A
 
P
R
 
K
H
|
H
I
 
I
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
I
 
V
V
 
I
G
 
G
D
 
D
G
 
E
D
 
H
-
 
G
Q
 
N
V
 
I
L
 
V
A
 
H
L
 
L
G
 
F
D
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
L
 
V
Q
 
Q
R
 
R
R
 
R
N
 
H
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
V
 
V
E
 
E
I
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
S
A
 
V
-
 
G
L
 
L
P
 
S
D
 
P
N
 
T
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
A
 
R
L
 
I
A
 
C
G
 
D
W
 
A
S
 
A
E
 
I
R
 
Q
L
 
L
C
 
M
A
 
E
G
 
N
-
 
I
-
 
K
Y
 
Y
R
 
V
G
 
N
L
 
A
A
 
G
T
 
T
V
 
V
E
|
E
F
 
F
L
 
L
V
 
V
D
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
H
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
S
G
 
G
G
 
D
E
 
E
A
 
F
F
 
F
F
 
F
I
 
I
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
P
R
 
R
L
 
V
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
I
T
 
T
E
 
E
E
 
M
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
I
D
 
D
L
 
I
V
 
V
R
 
K
L
 
T
Q
 
Q
F
 
I
D
 
L
L
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
A
R
 
D
L
 
L
G
 
F
E
 
G
L
 
E
E
 
E
L
 
I
T
 
-
N
 
N
T
 
M
P
 
P
P
 
Q
P
 
Q
-
 
K
-
 
D
-
 
I
-
 
T
-
 
T
F
 
L
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
A
 
C
R
 
R
I
 
I
N
 
T
A
 
T
E
 
E
T
 
-
L
 
-
T
 
D
P
 
P
E
 
L
G
 
N
Q
 
D
V
 
F
R
 
M
P
 
P
S
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
I
S
 
I
A
 
A
W
 
Y
T
 
R
P
 
S
P
 
S
G
 
G
G
 
G
P
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
D
A
 
G
-
 
F
A
 
Q
G
 
G
L
 
A
T
 
E
I
 
I
G
 
S
A
 
P
A
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
V
K
 
K
V
 
L
I
 
S
V
 
T
R
 
H
G
 
A
R
 
I
T
 
S
P
 
F
S
 
K
E
 
Q
A
 
A
A
 
E
S
 
E
R
x
K
L
 
M
D
 
V
R
 
R
A
 
S
L
 
L
T
 
R
E
 
E
L
 
M
K
 
R
V
 
I
A
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
K
T
 
T
T
 
N
A
 
I
P
 
P
L
 
F
V
 
L
R
 
I
A
 
N
I
 
V
L
 
M
A
 
K
H
 
N
P
 
K
T
 
K
A
 
F
V
 
T
T
 
S
G
 
G
E
 
D
A
 
Y
T
 
T
T
 
T
T
 
K
F
 
F
I
 
I
A
 
E
Q
 
E
H
 
T
A
 
P
E
 
E

Sites not aligning to the query:

7zz3A Cryo-em structure of "bc react" conformation of lactococcus lactis pyruvate carboxylase with acetyl-coa (see paper)
44% identity, 41% coverage: 3:444/1078 of query aligns to 2:446/1138 of 7zz3A

query
sites
7zz3A
L
 
M
S
 
K
R
 
K
V
 
L
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
V
R
 
R
I
 
V
A
 
F
R
 
R
T
 
A
A
 
C
A
x
N
E
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
S
S
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
A
 
R
D
 
E
D
 
D
A
 
E
Q
 
Y
S
 
S
P
 
V
H
 
H
V
 
R
S
x
F
A
x
K
A
|
A
D
|
D
H
 
E
A
x
S
V
 
Y
A
 
-
L
 
L
P
 
I
G
 
G
A
 
Q
G
 
G
A
 
K
R
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
D
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
D
A
 
D
V
 
I
V
 
I
A
 
R
A
 
V
A
 
A
K
 
L
A
 
E
Q
 
S
G
 
G
C
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
|
G
F
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
N
P
 
L
H
 
E
L
 
F
A
 
A
R
 
T
A
 
K
C
 
V
A
 
R
E
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
L
V
 
V
F
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
S
 
E
P
 
L
E
 
H
H
 
H
L
 
L
T
 
D
T
 
I
F
 
F
G
 
G
D
 
D
K
|
K
A
 
I
A
 
K
A
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
D
E
 
E
R
 
A
G
 
K
L
 
V
P
 
P
L
 
G
I
 
I
P
 
P
G
 
G
T
 
T
-
 
N
G
 
G
A
 
A
I
 
V
T
 
D
L
 
I
E
 
D
A
 
G
A
 
A
R
 
L
A
 
E
F
 
F
Q
 
A
A
 
K
E
 
T
H
 
Y
G
 
G
A
 
Y
-
 
P
I
 
V
M
|
M
L
 
I
K
|
K
A
 
A
R
 
A
A
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
G
|
G
R
 
R
G
 
G
M
|
M
R
 
R
M
 
V
V
 
A
L
 
R
D
 
N
P
 
D
G
 
A
E
 
E
L
 
M
D
 
H
A
 
D
A
 
G
F
 
Y
A
 
A
A
 
R
C
 
A
E
 
K
R
 
S
E
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
G
A
 
A
F
 
F
G
 
G
D
 
S
G
 
G
G
 
E
L
 
I
Y
 
Y
A
 
V
E
|
E
K
 
K
L
x
Y
I
|
I
E
 
E
R
 
N
A
 
P
R
 
K
H
|
H
I
 
I
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
V
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
R
D
 
H
-
 
G
Q
 
N
V
 
I
L
 
I
A
 
H
L
 
L
G
 
H
D
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
L
 
V
Q
|
Q
R
 
R
R
 
R
N
|
N
Q
 
Q
K
|
K
L
 
V
V
 
I
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
V
-
 
G
L
 
L
P
 
S
D
 
P
N
 
D
L
 
F
R
 
R
A
 
N
A
 
E
L
 
I
A
 
C
G
 
E
W
 
A
S
 
A
E
 
V
R
 
K
L
 
L
C
 
C
-
 
K
-
 
N
A
 
V
G
 
G
Y
 
Y
R
 
V
G
 
N
L
 
A
A
 
G
T
 
T
V
 
V
E
|
E
F
 
F
L
|
L
V
 
V
D
 
K
A
 
D
D
 
D
P
 
-
H
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
K
A
 
F
F
 
Y
F
 
F
I
 
I
E
|
E
V
 
V
N
|
N
P
 
P
R
|
R
L
 
V
Q
|
Q
V
|
V
E
|
E
H
 
H
T
 
T
V
 
I
T
 
T
E
 
E
E
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
L
 
I
V
 
V
R
 
Q
L
 
A
Q
 
Q
F
 
I
D
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
D
L
 
L
G
 
H
E
 
R
-
 
E
-
 
I
-
 
G
L
 
L
E
 
P
L
 
A
T
 
Q
N
 
S
T
 
E
P
 
I
P
 
P
P
 
L
F
 
L
G
 
G
V
 
S
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
A
 
C
R
|
R
I
 
I
N
 
T
A
 
T
E
 
E
T
 
-
L
 
-
T
 
D
P
 
P
E
 
Q
G
 
N
Q
 
G
V
 
F
R
 
L
P
 
P
S
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
K
L
 
I
S
 
D
A
 
T
W
 
Y
T
x
R
P
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
P
 
F
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
L
D
 
D
A
 
V
G
 
G
V
 
N
A
 
A
-
 
Y
A
 
A
G
 
G
L
 
Y
T
 
E
I
 
V
G
 
T
A
 
P
A
 
Y
Y
 
F
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
C
V
 
T
R
 
F
G
 
A
R
 
N
T
 
E
P
 
F
S
 
S
E
 
D
A
 
S
A
 
V
S
 
R
R
 
K
L
 
M
D
 
D
R
 
R
A
 
V
L
 
L
T
x
H
E
|
E
L
 
F
K
x
R
V
 
I
A
x
R
G
 
G
V
 
V
A
 
K
T
 
T
T
 
N
A
 
I
P
 
P
L
 
F
V
 
L
R
 
I
A
 
N
I
 
V
L
 
I
A
 
A
H
 
N
P
 
E
T
 
N
A
 
F
V
 
T
T
 
S
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
T
 
T
T
|
T
T
 
T
F
 
F
I
 
I

Sites not aligning to the query:

7zyyA Cryo-em structure of lactococcus lactis pyruvate carboxylase with acetyl-coa (see paper)
44% identity, 41% coverage: 3:444/1078 of query aligns to 2:446/1056 of 7zyyA

query
sites
7zyyA
L
 
M
S
 
K
R
 
K
V
 
L
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
V
R
 
R
I
 
V
A
 
F
R
|
R
T
 
A
A
 
C
A
x
N
E
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
S
S
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
A
 
R
D
 
E
D
 
D
A
 
E
Q
 
Y
S
 
S
P
 
V
H
 
H
V
 
R
S
x
F
A
x
K
A
|
A
D
 
D
H
 
E
A
 
S
V
 
Y
A
 
-
L
 
L
P
 
I
G
 
G
A
 
Q
G
 
G
A
 
K
R
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
D
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
D
A
 
D
V
 
I
V
 
I
A
 
R
A
 
V
A
 
A
K
 
L
A
 
E
Q
 
S
G
 
G
C
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
N
P
 
L
H
 
E
L
 
F
A
 
A
R
 
T
A
 
K
C
 
V
A
 
R
E
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
L
V
 
V
F
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
S
 
E
P
 
L
E
 
H
H
 
H
L
 
L
T
 
D
T
 
I
F
 
F
G
 
G
D
 
D
K
 
K
A
 
I
A
 
K
A
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
D
E
 
E
R
 
A
G
 
K
L
 
V
P
 
P
L
 
G
I
 
I
P
 
P
G
 
G
T
 
T
-
 
N
G
 
G
A
 
A
I
 
V
T
 
D
L
 
I
E
 
D
A
 
G
A
 
A
R
 
L
A
 
E
F
 
F
Q
 
A
A
 
K
E
 
T
H
 
Y
G
 
G
A
 
Y
-
 
P
I
 
V
M
 
M
L
 
I
K
|
K
A
 
A
R
 
A
A
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
M
|
M
R
 
R
M
 
V
V
 
A
L
 
R
D
 
N
P
 
D
G
 
A
E
 
E
L
 
M
D
 
H
A
 
D
A
 
G
F
 
Y
A
 
A
A
 
R
C
 
A
E
 
K
R
 
S
E
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
G
A
 
A
F
 
F
G
 
G
D
 
S
G
 
G
G
 
E
L
 
I
Y
 
Y
A
 
V
E
|
E
K
|
K
L
x
Y
I
|
I
E
 
E
R
 
N
A
 
P
R
 
K
H
|
H
I
 
I
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
V
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
R
D
 
H
-
 
G
Q
 
N
V
 
I
L
 
I
A
 
H
L
 
L
G
 
H
D
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
L
 
V
Q
|
Q
R
 
R
R
 
R
N
|
N
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
V
 
I
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
V
-
 
G
L
 
L
P
 
S
D
 
P
N
 
D
L
 
F
R
 
R
A
 
N
A
 
E
L
 
I
A
 
C
G
 
E
W
 
A
S
 
A
E
 
V
R
 
K
L
 
L
C
 
C
-
 
K
-
 
N
A
 
V
G
 
G
Y
 
Y
R
 
V
G
 
N
L
 
A
A
 
G
T
 
T
V
 
V
E
|
E
F
 
F
L
|
L
V
 
V
D
 
K
A
 
D
D
 
D
P
 
-
H
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
K
A
 
F
F
 
Y
F
 
F
I
 
I
E
|
E
V
 
V
N
 
N
P
 
P
R
|
R
L
 
V
Q
|
Q
V
|
V
E
|
E
H
 
H
T
 
T
V
 
I
T
 
T
E
 
E
E
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
L
 
I
V
 
V
R
 
Q
L
 
A
Q
 
Q
F
 
I
D
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
D
L
 
L
G
 
H
E
 
R
-
 
E
-
 
I
-
 
G
L
 
L
E
 
P
L
 
A
T
 
Q
N
 
S
T
 
E
P
 
I
P
 
P
P
 
L
F
 
L
G
 
G
V
 
S
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
A
 
C
R
 
R
I
 
I
N
 
T
A
 
T
E
 
E
T
 
-
L
 
-
T
 
D
P
 
P
E
 
Q
G
 
N
Q
 
G
V
 
F
R
 
L
P
 
P
S
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
K
L
 
I
S
 
D
A
 
T
W
 
Y
T
x
R
P
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
P
 
F
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
L
D
 
D
A
 
V
G
 
G
V
 
N
A
 
A
-
 
Y
A
 
A
G
 
G
L
 
Y
T
 
E
I
 
V
G
 
T
A
 
P
A
 
Y
Y
 
F
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
C
V
 
T
R
 
F
G
 
A
R
 
N
T
 
E
P
 
F
S
 
S
E
 
D
A
 
S
A
 
V
S
 
R
R
 
K
L
 
M
D
 
D
R
 
R
A
 
V
L
 
L
T
 
H
E
|
E
L
 
F
K
x
R
V
 
I
A
x
R
G
 
G
V
 
V
A
 
K
T
 
T
T
 
N
A
 
I
P
 
P
L
 
F
V
 
L
R
 
I
A
 
N
I
 
V
L
 
I
A
 
A
H
 
N
P
 
E
T
 
N
A
 
F
V
 
T
T
 
S
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
T
 
T
T
|
T
T
 
T
F
 
F
I
 
I

Sites not aligning to the query:

5vyzA Crystal structure of lactococcus lactis pyruvate carboxylase in complex with cyclic-di-amp (see paper)
44% identity, 41% coverage: 3:444/1078 of query aligns to 8:452/1144 of 5vyzA

query
sites
5vyzA
L
 
M
S
 
K
R
 
K
V
 
L
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
V
R
 
R
I
 
V
A
 
F
R
 
R
T
 
A
A
 
C
A
 
N
E
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
S
S
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
A
 
R
D
 
E
D
 
D
A
 
E
Q
 
Y
S
 
S
P
 
V
H
 
H
V
 
R
S
 
F
A
 
K
A
 
A
D
 
D
H
 
E
A
 
S
V
 
Y
A
 
-
L
 
L
P
 
I
G
 
G
A
 
Q
G
 
G
A
 
K
R
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
D
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
D
A
 
D
V
 
I
V
 
I
A
 
R
A
 
V
A
 
A
K
 
L
A
 
E
Q
 
S
G
 
G
C
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
N
P
 
L
H
 
E
L
 
F
A
 
A
R
 
T
A
 
K
C
 
V
A
 
R
E
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
L
V
 
V
F
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
S
 
E
P
 
L
E
 
H
H
 
H
L
 
L
T
 
D
T
 
I
F
 
F
G
 
G
D
 
D
K
|
K
A
 
I
A
 
K
A
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
D
E
 
E
R
 
A
G
 
K
L
 
V
P
 
P
L
 
G
I
 
I
P
 
P
G
 
G
T
 
T
-
 
N
G
 
G
A
 
A
I
 
V
T
 
D
L
 
I
E
 
D
A
 
G
A
 
A
R
 
L
A
 
E
F
 
F
Q
 
A
A
 
K
E
 
T
H
 
Y
G
 
G
A
 
Y
-
 
P
I
 
V
M
|
M
L
 
I
K
|
K
A
 
A
R
 
A
A
 
L
G
|
G
G
 
G
G
|
G
G
|
G
R
 
R
G
 
G
M
|
M
R
 
R
M
 
V
V
 
A
L
 
R
D
 
N
P
 
D
G
 
A
E
 
E
L
 
M
D
 
H
A
 
D
A
 
G
F
 
Y
A
 
A
A
 
R
C
 
A
E
 
K
R
 
S
E
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
G
A
 
A
F
 
F
G
 
G
D
 
S
G
 
G
G
 
E
L
 
I
Y
 
Y
A
 
V
E
 
E
K
 
K
L
x
Y
I
|
I
E
 
E
R
 
N
A
 
P
R
 
K
H
|
H
I
 
I
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
V
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
R
D
 
H
-
 
G
Q
 
N
V
 
I
L
 
I
A
 
H
L
 
L
G
 
H
D
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
L
 
V
Q
|
Q
R
 
R
R
 
R
N
|
N
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
V
 
I
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
V
-
 
G
L
 
L
P
 
S
D
 
P
N
 
D
L
 
F
R
 
R
A
 
N
A
 
E
L
 
I
A
 
C
G
 
E
W
 
A
S
 
A
E
 
V
R
 
K
L
 
L
C
 
C
-
 
K
-
 
N
A
 
V
G
 
G
Y
 
Y
R
 
V
G
 
N
L
 
A
A
 
G
T
 
T
V
 
V
E
|
E
F
 
F
L
|
L
V
 
V
D
 
K
A
 
D
D
 
D
P
 
-
H
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
K
A
 
F
F
 
Y
F
 
F
I
 
I
E
|
E
V
 
V
N
 
N
P
 
P
R
 
R
L
 
V
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
I
T
 
T
E
 
E
E
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
L
 
I
V
 
V
R
 
Q
L
 
A
Q
 
Q
F
 
I
D
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
D
L
 
L
G
 
H
E
 
R
-
 
E
-
 
I
-
 
G
L
 
L
E
 
P
L
 
A
T
 
Q
N
 
S
T
 
E
P
 
I
P
 
P
P
 
L
F
 
L
G
 
G
V
 
S
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
A
 
C
R
 
R
I
 
I
N
 
T
A
 
T
E
 
E
T
 
-
L
 
-
T
 
D
P
 
P
E
 
Q
G
 
N
Q
 
G
V
 
F
R
 
L
P
 
P
S
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
K
L
 
I
S
 
D
A
 
T
W
 
Y
T
 
R
P
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
P
 
F
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
L
D
 
D
A
 
V
G
 
G
V
 
N
A
 
A
-
 
Y
A
 
A
G
 
G
L
 
Y
T
 
E
I
 
V
G
 
T
A
 
P
A
 
Y
Y
 
F
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
C
V
 
T
R
 
F
G
 
A
R
 
N
T
 
E
P
 
F
S
 
S
E
 
D
A
 
S
A
 
V
S
 
R
R
 
K
L
 
M
D
 
D
R
 
R
A
 
V
L
 
L
T
 
H
E
 
E
L
 
F
K
 
R
V
 
I
A
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
K
T
 
T
T
 
N
A
 
I
P
 
P
L
 
F
V
 
L
R
 
I
A
 
N
I
 
V
L
 
I
A
 
A
H
 
N
P
 
E
T
 
N
A
 
F
V
 
T
T
 
S
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
T
 
T
T
|
T
T
 
T
F
 
F
I
 
I

Sites not aligning to the query:

Q05920 Pyruvate carboxylase, mitochondrial; Pyruvic carboxylase; PCB; EC 6.4.1.1 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
45% identity, 42% coverage: 3:451/1078 of query aligns to 37:488/1178 of Q05920

query
sites
Q05920
L
 
I
S
 
K
R
x
K
V
 
V
L
 
M
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
I
R
 
R
I
 
V
A
 
F
R
 
R
T
 
A
A
 
C
A
 
T
E
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
I
E
 
R
S
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
A
 
S
A
 
E
D
 
Q
D
 
D
A
 
T
Q
 
G
S
 
Q
P
 
M
H
 
H
V
 
R
S
 
Q
A
x
K
A
 
A
D
 
D
H
 
E
A
 
A
V
 
Y
A
 
-
L
 
L
P
 
I
G
 
G
A
 
R
G
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
P
A
 
V
R
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
D
 
H
I
 
I
A
 
P
A
 
D
V
 
I
V
 
I
A
 
K
A
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
E
Q
 
N
G
 
G
C
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
V
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
R
P
 
A
H
 
D
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
A
 
A
C
 
C
A
 
Q
E
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
R
F
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
S
P
 
P
E
 
E
H
 
V
L
 
V
T
 
R
T
x
K
F
 
M
G
 
G
D
 
D
K
|
K
A
 
V
A
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
I
E
 
A
R
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
L
 
V
I
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
D
A
 
S
-
 
P
-
 
I
I
 
S
T
 
S
L
 
L
E
 
H
A
 
E
A
 
A
R
 
H
A
 
E
F
 
F
Q
 
S
A
 
N
E
 
T
H
 
F
G
 
G
-
 
F
A
 
P
I
 
I
M
 
I
L
 
F
K
 
K
A
 
A
R
 
A
A
 
Y
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
V
V
 
V
L
 
H
D
 
S
P
 
Y
G
 
E
E
 
E
L
 
L
D
 
E
A
 
E
A
 
N
F
 
Y
A
 
T
A
 
R
C
 
A
E
 
Y
R
 
S
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
D
 
N
G
 
G
G
 
A
L
 
L
Y
 
F
A
 
V
E
 
E
K
 
K
L
 
F
I
 
I
E
 
E
R
x
K
A
 
P
R
 
R
H
 
H
I
 
I
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
V
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
Q
-
 
Y
D
 
G
Q
 
N
V
 
I
L
 
L
A
 
H
L
 
L
G
 
Y
D
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
L
 
I
Q
 
Q
R
 
R
R
 
R
N
 
H
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
V
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
T
L
 
H
P
 
L
D
 
D
-
 
P
N
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
S
A
 
R
L
 
L
A
 
T
G
 
S
W
 
D
S
 
S
E
 
V
R
 
K
L
 
L
C
 
A
-
 
K
-
 
Q
A
 
V
G
 
G
Y
 
Y
R
 
E
G
 
N
L
 
A
A
 
G
T
 
T
V
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
K
D
 
H
P
 
-
H
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
G
E
 
K
A
 
H
F
 
Y
F
 
F
I
 
I
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
S
R
 
R
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
E
V
 
I
T
 
T
G
 
D
L
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
V
R
 
H
L
 
A
Q
 
Q
F
 
I
D
 
H
L
 
V
A
 
S
A
 
E
G
 
G
K
 
R
R
 
S
L
 
L
G
 
P
E
 
D
L
 
L
E
 
G
L
 
L
T
 
R
N
 
Q
T
 
E
P
 
N
P
 
I
P
 
R
F
 
I
-
 
N
G
 
G
V
 
C
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
A
 
C
R
 
R
I
 
V
N
 
T
A
 
T
E
 
E
T
 
-
L
 
-
T
 
D
P
 
P
E
 
A
G
 
R
Q
 
S
V
 
F
R
 
Q
P
 
P
S
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
R
L
 
I
S
 
E
A
 
V
W
 
F
T
 
R
P
 
S
P
 
G
G
 
E
G
 
G
P
 
M
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
L
D
 
D
-
 
N
A
 
A
G
 
S
V
 
A
A
 
F
A
 
Q
G
 
G
L
 
A
T
 
V
I
 
I
G
 
S
A
 
P
A
 
H
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
V
 
A
R
 
H
G
 
G
R
x
K
T
 
D
P
 
H
S
 
P
E
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
T
R
 
K
L
 
M
D
 
S
R
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
A
E
 
E
L
 
F
K
 
R
V
 
V
A
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
K
T
 
T
T
 
N
A
 
I
P
 
P
L
 
F
V
 
L
R
 
Q
A
 
N
I
 
V
L
 
L
A
 
N
H
 
N
P
 
Q
T
 
Q
A
 
F
V
 
L
T
 
A
G
 
G
E
 
T
A
 
V
T
 
D
T
 
T
T
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
D
Q
 
E
H
 
N
A
 
P
E
 
E
T
 
L
L
 
F

Sites not aligning to the query:

3tw6B Structure of rhizobium etli pyruvate carboxylase t882a with the allosteric activator, acetyl coenzyme-a (see paper)
43% identity, 41% coverage: 3:444/1078 of query aligns to 3:453/1129 of 3tw6B

query
sites
3tw6B
L
 
I
S
 
S
R
 
K
V
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
S
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
I
R
 
R
I
 
V
A
 
F
R
 
R
T
 
A
A
 
A
A
 
N
E
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
I
E
 
K
S
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
I
Y
 
W
A
 
A
A
 
E
D
 
E
D
 
D
A
 
K
Q
 
L
S
 
A
P
 
L
H
 
H
V
 
R
S
 
F
A
 
K
A
 
A
D
 
D
H
 
E
A
 
S
V
 
Y
A
 
Q
L
 
V
P
 
-
G
 
G
A
 
R
G
 
G
A
 
P
R
 
H
-
 
L
-
 
A
-
 
R
-
 
D
-
 
L
-
 
G
-
 
P
-
 
I
-
 
E
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
D
 
S
I
 
I
A
 
D
A
 
E
V
 
V
V
 
I
A
 
R
A
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
L
Q
 
S
G
 
G
C
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
S
P
 
P
H
 
E
L
 
F
A
 
V
R
 
D
A
 
A
C
 
C
A
 
N
E
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
I
F
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
K
P
 
A
E
 
D
H
 
T
L
 
M
T
 
R
T
 
Q
F
 
L
G
 
G
D
 
N
K
|
K
A
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
S
R
 
V
G
 
G
L
 
V
P
 
P
L
 
V
I
 
V
P
 
P
G
 
A
T
 
T
G
 
E
A
 
P
I
 
L
T
 
A
L
 
-
E
 
E
A
 
V
A
 
A
R
 
K
A
 
M
F
 
A
Q
 
A
A
 
A
E
 
I
H
 
G
G
 
Y
A
 
P
I
 
V
M
 
M
L
 
L
K
|
K
A
 
A
R
 
S
A
 
W
G
 
G
G
|
G
G
 
G
G
|
G
R
 
R
G
 
G
M
|
M
R
 
R
M
 
V
V
 
I
L
 
R
D
 
S
P
 
E
G
 
A
E
 
D
L
 
L
D
 
A
A
 
K
A
 
E
F
 
V
A
 
T
A
 
E
C
 
A
E
 
K
R
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
M
A
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
D
 
K
G
 
D
G
 
E
L
 
V
Y
 
Y
A
 
L
E
|
E
K
 
K
L
|
L
I
x
V
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
R
H
|
H
I
 
V
E
 
E
V
 
S
Q
 
Q
I
 
I
V
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
T
D
 
H
-
 
G
Q
 
N
V
 
V
L
 
V
A
 
H
L
 
L
G
 
F
D
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
L
 
V
Q
|
Q
R
 
R
R
|
R
N
|
N
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
V
 
V
E
 
E
I
 
R
A
 
A
P
 
P
A
 
A
-
 
P
A
 
Y
L
 
L
P
 
S
D
 
E
N
 
A
L
 
Q
R
 
R
A
 
Q
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
A
W
 
Y
S
 
S
E
 
L
R
 
K
L
 
I
-
 
A
-
 
G
C
 
A
A
 
T
G
 
N
Y
 
Y
R
 
I
G
 
G
L
 
A
A
 
G
T
|
T
V
 
V
E
|
E
F
 
Y
L
|
L
V
 
M
D
 
D
A
 
A
D
 
D
P
 
T
H
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
G
E
 
K
A
 
F
F
 
Y
F
 
F
I
 
I
E
|
E
V
 
V
N
|
N
P
 
P
R
|
R
L
 
I
Q
 
Q
V
 
V
E
|
E
H
 
H
T
 
T
V
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
I
D
 
D
L
 
I
V
 
V
R
 
K
L
 
A
Q
 
Q
F
 
I
D
 
H
L
 
I
A
 
L
A
 
D
G
 
G
K
 
A
R
 
A
L
 
I
G
 
G
E
 
T
L
 
P
E
 
Q
L
 
-
T
 
S
N
 
G
T
 
V
P
 
P
P
 
N
P
 
Q
-
 
E
-
 
D
-
 
I
-
 
R
-
 
L
F
 
N
G
 
G
V
 
H
A
 
A
I
 
L
Q
 
Q
A
 
C
R
|
R
I
 
V
N
 
T
A
 
T
E
 
E
T
 
-
L
 
-
T
 
D
P
 
P
E
 
E
G
 
H
Q
 
N
V
 
F
R
 
I
P
 
P
S
 
D
T
 
Y
G
 
G
T
 
R
L
 
I
S
 
T
A
 
A
W
 
Y
T
 
R
P
 
S
P
 
A
G
 
S
G
 
G
P
 
F
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
L
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
T
A
 
S
-
 
Y
A
 
S
G
 
G
L
 
A
T
 
I
I
 
I
G
 
T
A
 
R
A
 
Y
Y
 
Y
D
|
D
S
 
P
L
 
L
L
 
L
A
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
T
V
 
A
R
 
W
G
 
A
R
 
P
T
 
N
P
 
P
S
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
I
S
 
S
R
 
R
L
 
M
D
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
R
E
 
E
L
 
F
K
 
R
V
 
I
A
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
T
 
N
A
 
L
P
 
T
L
 
F
V
 
L
R
 
E
A
 
A
I
 
I
L
 
I
A
 
G
H
 
H
P
 
P
T
 
K
A
 
F
V
 
R
T
 
D
G
 
N
E
 
S
A
 
Y
T
 
T
T
|
T
T
 
R
F
 
F
I
 
I

Sites not aligning to the query:

7wtbB Cryo-em structure of human pyruvate carboxylase with acetyl-coa (see paper)
45% identity, 42% coverage: 3:451/1078 of query aligns to 6:457/1147 of 7wtbB

query
sites
7wtbB
L
 
I
S
 
K
R
 
K
V
 
V
L
 
M
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
I
R
 
R
I
 
V
A
x
F
R
 
R
T
 
A
A
 
C
A
x
T
E
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
I
E
 
R
S
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
S
A
 
E
D
 
Q
D
 
D
A
 
T
Q
 
G
S
 
Q
P
 
M
H
 
H
V
x
R
S
x
Q
A
x
K
A
|
A
D
|
D
H
 
E
A
 
A
V
 
Y
A
 
-
L
 
L
P
 
I
G
 
G
A
 
R
G
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
P
A
 
V
R
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
D
 
H
I
 
I
A
 
P
A
 
D
V
 
I
V
 
I
A
 
K
A
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
E
Q
 
N
G
 
N
C
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
V
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
R
P
 
A
H
 
D
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
A
 
A
C
 
C
A
 
Q
E
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
R
F
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
S
P
 
P
E
 
E
H
 
V
L
 
V
T
 
R
T
 
K
F
 
M
G
 
G
D
 
D
K
 
K
A
 
V
A
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
I
E
 
A
R
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
L
 
V
I
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
D
A
 
A
-
 
P
-
 
I
I
 
T
T
 
S
L
 
L
E
 
H
A
 
E
A
 
A
R
 
H
A
 
E
F
 
F
Q
 
S
A
 
N
E
 
T
H
 
Y
G
 
G
-
 
F
A
 
P
I
 
I
M
 
I
L
 
F
K
|
K
A
 
A
R
 
A
A
 
Y
G
 
G
G
|
G
G
|
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
M
|
M
R
 
R
M
 
V
V
 
V
L
 
H
D
 
S
P
 
Y
G
 
E
E
 
E
L
 
L
D
 
E
A
 
E
A
 
N
F
 
Y
A
 
T
A
 
R
C
 
A
E
 
Y
R
 
S
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
D
 
N
G
 
G
G
 
A
L
 
L
Y
 
F
A
 
V
E
 
E
K
 
K
L
x
F
I
|
I
E
 
E
R
 
K
A
x
P
R
 
R
H
 
H
I
 
I
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
V
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
Q
-
 
Y
D
 
G
Q
 
N
V
 
I
L
 
L
A
 
H
L
 
L
G
 
Y
D
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
L
 
I
Q
 
Q
R
 
R
R
 
R
N
x
H
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
V
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
H
P
 
L
D
 
D
-
 
P
N
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
T
A
 
R
L
 
L
A
 
T
G
 
S
W
 
D
S
 
S
E
 
V
R
 
K
L
 
L
C
 
A
-
 
K
-
 
Q
A
 
V
G
 
G
Y
 
Y
R
 
E
G
 
N
L
 
A
A
 
G
T
 
T
V
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
-
D
 
-
P
 
-
H
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
R
G
 
H
G
 
G
E
 
K
A
 
H
F
 
Y
F
 
F
I
 
I
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
S
R
 
R
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
E
V
 
I
T
 
T
G
 
D
L
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
V
R
 
H
L
 
A
Q
 
Q
F
 
I
D
 
H
L
 
V
A
 
A
A
 
E
G
 
G
K
 
R
R
 
S
L
 
L
G
 
P
E
 
D
L
 
L
E
 
G
L
 
L
T
 
R
N
 
Q
T
 
E
P
 
N
P
 
I
P
 
R
F
 
I
-
 
N
G
 
G
V
 
C
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
A
 
C
R
 
R
I
 
V
N
 
T
A
 
T
E
 
E
T
 
-
L
 
-
T
 
D
P
 
P
E
 
A
G
 
R
Q
 
S
V
 
F
R
 
Q
P
 
P
S
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
R
L
 
I
S
 
E
A
 
V
W
 
F
T
x
R
P
 
S
P
 
G
G
 
E
G
 
G
P
 
M
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
L
D
 
D
-
 
N
A
 
A
G
 
S
V
 
A
A
 
F
A
 
Q
G
 
G
L
 
A
T
 
V
I
 
I
G
 
S
A
 
P
A
 
H
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
V
 
A
R
 
H
G
 
G
R
 
K
T
 
D
P
 
H
S
 
P
E
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
T
R
 
K
L
 
M
D
 
S
R
|
R
A
 
A
L
 
L
T
 
A
E
|
E
L
 
F
K
x
R
V
 
V
A
x
R
G
 
G
V
 
V
A
 
K
T
 
T
T
 
N
A
 
I
P
 
A
L
 
F
V
 
L
R
 
Q
A
 
N
I
 
V
L
 
L
A
 
N
H
 
N
P
 
Q
T
 
Q
A
 
F
V
 
L
T
 
A
G
 
G
E
 
T
A
 
V
T
 
D
T
 
T
T
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
D
Q
 
E
H
 
N
A
 
P
E
 
E
T
 
L
L
 
F

Sites not aligning to the query:

7wtdC Cryo-em structure of human pyruvate carboxylase with acetyl-coa in the intermediate state 1 (see paper)
45% identity, 42% coverage: 3:451/1078 of query aligns to 5:456/1146 of 7wtdC

query
sites
7wtdC
L
 
I
S
 
K
R
 
K
V
 
V
L
 
M
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
I
R
 
R
I
 
V
A
x
F
R
|
R
T
 
A
A
 
C
A
x
T
E
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
I
E
 
R
S
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
S
A
 
E
D
 
Q
D
 
D
A
 
T
Q
 
G
S
 
Q
P
 
M
H
 
H
V
x
R
S
x
Q
A
x
K
A
|
A
D
|
D
H
x
E
A
 
A
V
 
Y
A
 
-
L
 
L
P
 
I
G
 
G
A
 
R
G
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
P
A
 
V
R
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
D
 
H
I
 
I
A
 
P
A
 
D
V
 
I
V
 
I
A
 
K
A
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
E
Q
 
N
G
 
N
C
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
V
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
R
P
 
A
H
 
D
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
A
 
A
C
 
C
A
 
Q
E
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
R
F
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
S
P
 
P
E
 
E
H
 
V
L
 
V
T
 
R
T
 
K
F
 
M
G
 
G
D
 
D
K
 
K
A
 
V
A
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
I
E
 
A
R
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
L
 
V
I
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
D
A
 
A
-
 
P
-
 
I
I
 
T
T
 
S
L
 
L
E
 
H
A
 
E
A
 
A
R
 
H
A
 
E
F
 
F
Q
 
S
A
 
N
E
 
T
H
 
Y
G
 
G
-
 
F
A
 
P
I
 
I
M
 
I
L
 
F
K
|
K
A
 
A
R
 
A
A
 
Y
G
 
G
G
|
G
G
|
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
V
V
 
V
L
 
H
D
 
S
P
 
Y
G
 
E
E
 
E
L
 
L
D
 
E
A
 
E
A
 
N
F
 
Y
A
 
T
A
 
R
C
 
A
E
 
Y
R
 
S
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
D
 
N
G
 
G
G
 
A
L
 
L
Y
 
F
A
 
V
E
 
E
K
 
K
L
x
F
I
 
I
E
 
E
R
 
K
A
 
P
R
 
R
H
 
H
I
 
I
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
V
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
Q
-
 
Y
D
 
G
Q
 
N
V
 
I
L
 
L
A
 
H
L
 
L
G
 
Y
D
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
L
 
I
Q
|
Q
R
 
R
R
 
R
N
x
H
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
V
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
A
-
 
H
L
 
L
P
 
D
D
 
P
N
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
T
A
 
R
L
 
L
A
 
T
G
 
S
W
 
D
S
 
S
E
 
V
R
 
K
L
 
L
C
 
A
-
 
K
-
 
Q
A
 
V
G
 
G
Y
 
Y
R
 
E
G
 
N
L
 
A
A
 
G
T
 
T
V
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
-
D
 
-
P
 
-
H
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
R
G
 
H
G
 
G
E
 
K
A
 
H
F
 
Y
F
 
F
I
 
I
E
|
E
V
 
V
N
 
N
P
 
S
R
 
R
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
E
V
 
I
T
 
T
G
 
D
L
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
V
R
 
H
L
 
A
Q
 
Q
F
 
I
D
 
H
L
 
V
A
 
A
A
 
E
G
 
G
K
 
R
R
 
S
L
 
L
G
 
P
E
 
D
L
 
L
E
 
G
L
 
L
T
 
R
N
 
Q
T
 
E
P
 
N
P
 
I
P
 
R
F
 
I
-
 
N
G
 
G
V
 
C
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
A
 
C
R
 
R
I
 
V
N
 
T
A
 
T
E
 
E
T
 
-
L
 
-
T
 
D
P
 
P
E
 
A
G
 
R
Q
 
S
V
 
F
R
 
Q
P
 
P
S
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
R
L
 
I
S
 
E
A
 
V
W
 
F
T
x
R
P
 
S
P
 
G
G
 
E
G
 
G
P
 
M
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
L
D
 
D
-
 
N
A
 
A
G
 
S
V
 
A
A
 
F
A
 
Q
G
 
G
L
 
A
T
 
V
I
 
I
G
 
S
A
 
P
A
 
H
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
V
 
A
R
 
H
G
 
G
R
 
K
T
 
D
P
 
H
S
 
P
E
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
T
R
 
K
L
 
M
D
 
S
R
|
R
A
 
A
L
 
L
T
x
A
E
 
E
L
 
F
K
x
R
V
 
V
A
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
K
T
 
T
T
 
N
A
 
I
P
 
A
L
 
F
V
 
L
R
 
Q
A
 
N
I
 
V
L
 
L
A
 
N
H
 
N
P
 
Q
T
 
Q
A
 
F
V
 
L
T
 
A
G
 
G
E
 
T
A
 
V
T
 
D
T
 
T
T
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
D
Q
 
E
H
 
N
A
 
P
E
 
E
T
 
L
L
 
F

Sites not aligning to the query:

P11498 Pyruvate carboxylase, mitochondrial; Pyruvic carboxylase; PCB; EC 6.4.1.1 from Homo sapiens (Human) (see 6 papers)
45% identity, 42% coverage: 3:451/1078 of query aligns to 37:488/1178 of P11498

query
sites
P11498
L
 
I
S
 
K
R
 
K
V
 
V
L
 
M
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
I
R
 
R
I
 
V
A
 
F
R
 
R
T
 
A
A
 
C
A
 
T
E
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
I
E
 
R
S
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
S
A
 
E
D
 
Q
D
 
D
A
 
T
Q
 
G
S
 
Q
P
 
M
H
 
H
V
 
R
S
 
Q
A
 
K
A
 
A
D
 
D
H
 
E
A
 
A
V
 
Y
A
 
-
L
 
L
P
 
I
G
 
G
A
 
R
G
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
P
A
 
V
R
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
D
 
H
I
 
I
A
 
P
A
 
D
V
 
I
V
 
I
A
 
K
A
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
E
Q
 
N
G
 
N
C
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
V
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
R
P
 
A
H
 
D
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
A
 
A
C
 
C
A
 
Q
E
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
R
F
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
S
P
 
P
E
 
E
H
x
V
L
 
V
T
 
R
T
 
K
F
 
M
G
 
G
D
 
D
K
 
K
A
 
V
A
 
E
A
 
A
R
|
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
I
E
 
A
R
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
L
 
V
I
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
D
A
 
A
-
 
P
-
 
I
I
 
T
T
 
S
L
 
L
E
 
H
A
 
E
A
 
A
R
 
H
A
 
E
F
 
F
Q
 
S
A
 
N
E
 
T
H
 
Y
G
 
G
-
 
F
A
 
P
I
 
I
M
 
I
L
 
F
K
 
K
A
 
A
R
 
A
A
 
Y
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
V
V
 
V
L
 
H
D
 
S
P
 
Y
G
 
E
E
 
E
L
 
L
D
 
E
A
 
E
A
 
N
F
 
Y
A
 
T
A
 
R
C
 
A
E
 
Y
R
 
S
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
D
 
N
G
 
G
G
 
A
L
 
L
Y
 
F
A
 
V
E
 
E
K
 
K
L
 
F
I
 
I
E
 
E
R
 
K
A
 
P
R
 
R
H
 
H
I
 
I
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
V
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
Q
-
 
Y
D
 
G
Q
 
N
V
 
I
L
 
L
A
 
H
L
 
L
G
 
Y
D
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
L
 
I
Q
 
Q
R
 
R
R
|
R
N
 
H
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
V
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
H
P
 
L
D
 
D
-
 
P
N
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
T
A
 
R
L
 
L
A
 
T
G
 
S
W
 
D
S
 
S
E
 
V
R
 
K
L
 
L
C
 
A
-
 
K
-
 
Q
A
 
V
G
 
G
Y
|
Y
R
 
E
G
 
N
L
 
A
A
 
G
T
 
T
V
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
-
D
 
-
P
 
-
H
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
R
G
 
H
G
 
G
E
 
K
A
 
H
F
 
Y
F
 
F
I
 
I
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
S
R
 
R
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
E
V
 
I
T
 
T
G
 
D
L
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
V
R
 
H
L
 
A
Q
 
Q
F
 
I
D
 
H
L
 
V
A
 
A
A
 
E
G
 
G
K
 
R
R
 
S
L
 
L
G
 
P
E
 
D
L
 
L
E
 
G
L
 
L
T
 
R
N
 
Q
T
 
E
P
 
N
P
 
I
P
 
R
F
 
I
-
 
N
G
 
G
V
 
C
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
A
 
C
R
 
R
I
 
V
N
 
T
A
 
T
E
 
E
T
 
-
L
 
-
T
 
D
P
 
P
E
 
A
G
 
R
Q
 
S
V
 
F
R
 
Q
P
 
P
S
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
R
L
 
I
S
 
E
A
 
V
W
 
F
T
 
R
P
 
S
P
 
G
G
 
E
G
 
G
P
 
M
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
L
D
 
D
-
 
N
A
 
A
G
 
S
V
 
A
A
 
F
A
 
Q
G
 
G
L
 
A
T
 
V
I
 
I
G
 
S
A
 
P
A
 
H
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
V
 
A
R
 
H
G
 
G
R
 
K
T
 
D
P
 
H
S
 
P
E
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
T
R
 
K
L
 
M
D
 
S
R
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
A
E
 
E
L
 
F
K
x
R
V
 
V
A
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
K
T
 
T
T
 
N
A
 
I
P
 
A
L
 
F
V
 
L
R
 
Q
A
 
N
I
 
V
L
 
L
A
 
N
H
 
N
P
 
Q
T
 
Q
A
 
F
V
 
L
T
 
A
G
 
G
E
 
T
A
 
V
T
 
D
T
 
T
T
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
D
Q
 
E
H
 
N
A
 
P
E
 
E
T
 
L
L
 
F

Sites not aligning to the query:

3bg5A Crystal structure of staphylococcus aureus pyruvate carboxylase (see paper)
43% identity, 42% coverage: 2:449/1078 of query aligns to 1:446/1137 of 3bg5A

query
sites
3bg5A
S
 
Q
L
 
I
S
 
K
R
 
K
V
 
L
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
I
R
 
R
I
 
I
A
 
F
R
 
R
T
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
L
G
 
D
L
 
I
E
 
S
S
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
S
A
 
N
D
 
E
D
 
D
A
 
K
Q
 
S
S
 
S
P
 
L
H
 
H
V
 
R
S
 
Y
A
 
K
A
 
A
D
 
D
H
 
E
A
 
S
V
 
Y
A
 
-
L
 
L
P
 
V
G
 
G
A
 
S
G
 
D
-
 
L
-
 
G
-
 
P
A
 
A
R
 
E
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
D
 
N
I
 
I
A
 
E
A
 
R
V
 
I
V
 
I
A
 
D
A
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
Q
Q
 
A
G
 
N
C
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
N
P
 
E
H
 
Q
L
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
R
C
 
C
A
 
A
E
 
E
A
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
K
F
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
H
P
 
L
E
 
E
H
 
H
L
 
L
T
 
D
T
 
M
F
 
F
G
 
G
D
 
D
K
|
K
A
 
V
A
 
K
A
 
A
R
 
R
A
 
T
L
 
T
A
 
A
A
 
I
E
 
K
R
 
A
G
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
G
T
 
T
-
 
D
G
 
G
A
 
P
I
 
I
-
 
K
T
 
S
L
 
Y
E
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
E
F
 
F
Q
 
A
A
 
E
E
 
E
H
 
A
G
 
G
-
 
F
A
 
P
I
 
L
M
|
M
L
 
I
K
|
K
A
 
A
R
 
T
A
 
S
G
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
M
 
-
R
 
R
M
 
I
V
 
V
L
 
R
D
 
E
P
 
E
G
 
S
E
 
E
L
 
L
D
 
E
A
 
D
A
 
A
F
 
F
A
 
H
A
 
R
C
 
A
E
 
K
R
 
S
E
 
E
A
 
A
L
 
E
A
 
K
A
 
S
F
 
F
G
 
G
D
 
N
G
x
S
G
 
E
L
 
V
Y
 
Y
A
 
I
E
 
E
K
 
R
L
x
Y
I
|
I
E
 
D
R
 
N
A
 
P
R
 
K
H
|
H
I
 
I
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
I
 
V
V
 
I
G
 
G
D
 
D
G
 
E
D
 
H
-
 
G
Q
 
N
V
 
I
L
 
V
A
 
H
L
 
L
G
 
F
D
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
L
 
V
Q
|
Q
R
 
R
R
|
R
N
x
H
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
V
 
V
E
 
E
I
 
V
A
 
A
P
 
P