SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Dsui_0501 FitnessBrowser__PS:Dsui_0501 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 17 hits to proteins with known functional sites (download)

7cyxA Crystal strcuture of glycine oxidase from bacillus cereus atcc 14579 (see paper)
25% identity, 96% coverage: 3:403/416 of query aligns to 4:348/363 of 7cyxA

query
sites
7cyxA
V
 
V
L
 
A
V
 
I
L
x
I
G
|
G
A
 
G
G
|
G
V
|
V
V
x
I
G
 
G
V
 
S
T
 
S
S
 
V
A
 
A
W
 
H
F
 
F
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
R
G
 
G
H
 
H
E
 
K
V
 
V
T
 
A
V
 
I
V
|
V
D
x
E
R
x
K
Q
 
Q
P
 
S
G
 
I
A
 
A
A
 
S
L
 
-
E
|
E
T
x
A
S
|
S
F
 
K
A
 
A
N
x
A
G
 
A
G
|
G
Q
x
L
I
 
L
S
 
G
V
 
V
C
 
A
H
 
Y
A
 
-
E
 
-
P
 
-
W
 
-
A
 
-
N
 
N
P
 
P
R
 
-
A
 
-
P
 
-
F
 
-
K
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
W
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
E
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
L
F
 
F
R
 
E
L
 
L
-
 
A
R
 
R
Y
 
E
D
 
S
P
 
R
A
 
A
L
 
I
F
 
F
A
 
P
W
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
C
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
R
 
-
R
 
-
N
 
-
I
 
-
R
 
-
D
 
-
I
 
-
I
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
Y
 
-
S
 
-
R
 
-
Q
 
Q
R
 
L
L
 
A
Q
 
A
A
 
V
L
 
L
R
 
R
Q
 
E
A
 
K
L
 
T
P
 
G
L
 
V
D
 
D
Y
 
I
D
 
G
Q
 
Y
R
 
E
C
 
E
Q
 
K
G
 
G
I
 
I
L
 
Y
H
 
R
I
 
I
F
 
A
T
 
Q
Q
 
N
A
 
E
A
 
D
E
 
E
F
 
K
E
 
E
A
 
R
A
 
I
C
 
L
H
 
H
A
 
I
A
 
M
A
 
D
L
 
W
M
 
Q
R
 
Q
E
 
K
F
 
T
G
 
G
V
 
E
D
 
D
R
 
S
E
 
Y
P
 
F
V
 
L
D
 
T
A
 
G
A
 
D
R
 
H
C
 
V
V
 
R
A
 
E
I
 
K
E
 
E
P
 
P
A
 
Y
L
 
L
A
 
S
A
 
E
V
 
-
Q
 
-
G
 
-
R
 
S
L
 
I
A
 
I
G
 
G
G
 
A
D
 
V
Y
 
Y
T
 
Y
P
 
P
S
 
K
D
 
D
E
 
G
S
 
H
G
 
V
D
 
I
A
 
A
H
 
P
R
 
E
F
 
L
T
 
T
Q
 
K
R
 
A
L
 
F
A
 
A
E
 
H
A
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
I
R
 
S
G
 
G
V
 
A
Q
 
D
F
 
I
R
 
Y
Y
 
E
N
 
Q
C
 
T
P
 
E
V
|
V
E
 
F
K
 
D
I
 
I
A
 
R
S
 
I
A
 
E
G
 
N
G
 
N
R
 
K
V
 
V
A
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
I
A
 
T
G
 
S
G
 
E
D
 
G
L
 
I
L
 
V
L
 
T
A
 
C
D
 
E
A
 
K
Y
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
L
x
G
G
|
G
S
 
S
Y
x
W
S
 
S
P
 
T
A
 
K
L
 
L
L
 
L
K
 
S
P
 
Y
A
 
F
G
 
H
V
 
R
K
 
D
A
 
W
C
 
G
V
 
T
Y
 
Y
P
 
P
G
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
E
S
 
V
A
 
V
T
 
A
I
 
V
A
 
R
L
 
S
S
 
R
P
 
K
D
 
Q
S
 
L
V
 
L
A
 
K
P
 
A
S
 
P
V
 
I
S
 
F
I
 
-
T
 
-
D
 
-
D
 
Q
E
 
E
R
 
R
K
 
F
I
 
Y
V
 
I
M
 
T
S
 
P
R
 
K
L
 
R
G
 
G
N
 
G
R
 
R
L
 
Y
R
 
V
V
 
I
A
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
M
E
 
K
F
 
P
N
 
H
G
 
T
H
 
F
N
 
N
L
 
K
D
 
T
L
 
V
T
 
Q
P
 
P
V
 
E
R
 
S
C
 
I
E
 
T
A
 
S
L
 
I
L
 
L
R
 
E
R
 
R
A
 
A
L
 
Y
E
 
T
L
 
I
F
 
L
P
 
P
Q
 
A
L
 
L
R
 
K
P
 
E
D
 
A
G
 
E
D
 
W
P
 
E
L
 
S
Y
 
T
W
 
W
C
 
A
G
|
G
L
 
L
R
|
R
P
|
P
V
 
Q
T
 
S
P
 
N
S
 
H
N
 
E
V
 
A
P
 
P
L
 
Y
I
 
M
G
 
G
-
 
E
R
 
H
T
 
E
R
 
E
L
 
I
S
 
K
N
 
G
L
 
L
W
 
Y
L
 
A
N
 
C
T
 
T
G
 
G
H
 
H
G
x
Y
T
x
R
L
x
N
G
|
G
W
x
I
T
 
L
L
 
L
S
 
S
C
 
P
G
 
I
S
 
S
A
 
G
A
 
Q
A
 
Y
L
 
M
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
S
 
E
G
 
G
R
 
K
R
 
Q

6j39A Crystal structure of cmis2 with inhibitor (see paper)
27% identity, 72% coverage: 107:405/416 of query aligns to 57:358/368 of 6j39A

query
sites
6j39A
D
 
D
I
 
L
I
 
L
A
 
R
L
 
L
A
 
C
L
 
L
Y
 
A
S
 
S
R
 
R
Q
 
E
R
 
R
L
 
Y
Q
 
P
A
 
S
L
 
F
R
 
V
Q
 
K
A
 
E
L
 
L
P
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
G
L
 
T
D
 
S
Y
 
A
D
 
G
Q
 
Y
R
 
R
C
 
R
Q
 
D
G
 
G
I
 
V
L
 
L
H
 
D
I
 
A
F
 
A
T
 
F
Q
 
D
A
 
D
A
 
E
E
 
S
F
 
L
E
 
A
A
 
A
A
 
L
C
 
D
H
 
G
A
 
L
A
 
R
A
 
N
L
 
F
M
 
L
R
 
A
E
 
P
F
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
A
R
 
V
E
 
A
P
 
P
V
 
L
D
 
N
A
 
A
A
 
R
R
 
R
C
 
C
V
 
R
A
 
E
I
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
M
L
 
L
A
 
A
-
 
E
A
 
S
V
 
V
Q
 
R
G
 
G
R
 
G
L
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
-
D
 
-
Y
 
-
T
 
-
P
 
P
S
 
D
D
 
D
E
 
G
S
 
A
G
 
V
D
 
N
A
 
P
H
 
R
R
 
E
F
 
L
T
 
T
Q
 
A
R
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
A
A
 
A
A
 
I
A
 
D
A
 
V
R
 
R
G
 
G
V
 
G
Q
 
T
F
 
L
R
 
I
Y
 
R
N
 
R
C
 
R
P
x
A
V
 
T
E
 
E
K
 
F
I
 
L
A
 
A
S
 
D
A
 
E
G
 
-
G
 
-
R
 
R
V
 
T
A
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
L
-
 
L
A
 
E
G
 
N
G
 
G
D
 
C
L
 
A
L
 
V
L
 
H
A
 
G
D
 
D
A
 
R
Y
 
V
V
 
V
V
 
L
A
 
S
L
x
A
G
 
G
S
 
C
Y
x
W
S
 
T
P
 
H
A
 
R
L
 
L
L
 
A
K
 
G
-
 
L
P
 
P
A
 
A
G
 
G
V
 
A
K
 
V
A
 
P
C
 
E
V
 
I
Y
 
A
P
 
P
G
 
A
K
 
K
G
 
G
Y
 
Q
S
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
A
x
I
L
 
L
S
 
R
P
 
L
D
 
R
S
 
S
V
 
A
A
 
A
P
 
P
-
 
F
-
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
A
S
 
T
V
x
R
S
 
A
I
 
V
T
 
T
D
 
R
D
 
G
E
 
S
R
 
G
K
 
V
I
x
Y
V
 
L
M
 
V
S
 
P
R
 
R
L
 
T
G
 
D
N
 
G
R
 
E
L
 
L
R
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
A
T
 
T
A
x
Y
E
 
E
F
 
E
N
 
R
G
 
D
H
 
Y
N
 
D
L
 
T
D
 
T
L
 
V
T
 
T
P
 
A
V
 
G
R
 
G
C
 
V
E
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
G
R
 
K
A
 
V
L
 
L
E
 
A
L
 
V
F
 
L
P
 
P
Q
 
G
L
 
A
R
 
A
P
 
E
D
 
L
G
 
E
D
 
L
P
 
A
L
 
E
Y
 
T
W
 
A
C
 
A
G
 
G
L
 
L
R
|
R
P
 
P
V
 
G
T
 
S
P
 
P
S
 
D
N
 
G
V
 
L
P
 
P
L
 
V
I
 
L
G
 
G
R
 
W
T
 
T
R
 
A
L
 
V
S
 
P
N
 
N
L
 
L
W
 
L
L
 
V
N
 
A
T
 
T
G
 
G
H
 
H
G
x
S
T
x
R
L
x
I
G
|
G
W
x
V
T
x
Q
L
 
L
S
 
A
C
 
P
G
 
I
S
 
T
A
 
A
A
 
D
A
 
V
L
 
M
A
 
G
D
 
E
-
 
M
L
 
L
I
 
V
S
 
T
G
 
G
R
 
R
R
 
T
P
 
P
E
 
E

Sites not aligning to the query:

6j38A Crystal structure of cmis2 (see paper)
27% identity, 72% coverage: 107:405/416 of query aligns to 57:358/368 of 6j38A

query
sites
6j38A
D
 
D
I
 
L
I
 
L
A
 
R
L
 
L
A
 
C
L
 
L
Y
 
A
S
 
S
R
 
R
Q
 
E
R
 
R
L
 
Y
Q
 
P
A
 
S
L
 
F
R
 
V
Q
 
K
A
 
E
L
 
L
P
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
G
L
 
T
D
 
S
Y
 
A
D
 
G
Q
 
Y
R
 
R
C
 
R
Q
 
D
G
 
G
I
 
V
L
 
L
H
 
D
I
 
A
F
 
A
T
 
F
Q
 
D
A
 
D
A
 
E
E
 
S
F
 
L
E
 
A
A
 
A
A
 
L
C
 
D
H
 
G
A
 
L
A
 
R
A
 
N
L
 
F
M
 
L
R
 
A
E
 
P
F
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
A
R
 
V
E
 
A
P
 
P
V
 
L
D
 
N
A
 
A
A
 
R
R
 
R
C
 
C
V
 
R
A
 
E
I
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
M
L
 
L
A
 
A
-
 
E
A
 
S
V
 
V
Q
 
R
G
 
G
R
 
G
L
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
-
D
 
-
Y
 
-
T
 
-
P
 
P
S
 
D
D
 
D
E
 
G
S
 
A
G
 
V
D
 
N
A
 
P
H
 
R
R
 
E
F
 
L
T
 
T
Q
 
A
R
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
A
A
 
A
A
 
I
A
 
D
A
 
V
R
 
R
G
 
G
V
 
G
Q
 
T
F
 
L
R
 
I
Y
 
R
N
 
R
C
 
R
P
x
A
V
 
T
E
 
E
K
 
F
I
 
L
A
 
A
S
 
D
A
 
E
G
 
-
G
 
-
R
 
R
V
 
T
A
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
L
-
 
L
A
 
E
G
 
N
G
 
G
D
 
C
L
 
A
L
 
V
L
 
H
A
 
G
D
 
D
A
 
R
Y
 
V
V
 
V
V
 
L
A
 
S
L
x
A
G
 
G
S
 
C
Y
x
W
S
 
T
P
 
H
A
 
R
L
 
L
L
 
A
K
 
G
-
 
L
P
 
P
A
 
A
G
 
G
V
 
A
K
 
V
A
 
P
C
 
E
V
 
I
Y
 
A
P
 
P
G
 
A
K
 
K
G
|
G
Y
 
Q
S
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
I
L
 
L
S
 
R
P
 
L
D
 
R
S
 
S
V
 
A
A
 
A
P
 
P
-
 
F
-
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
A
S
 
T
V
 
R
S
 
A
I
 
V
T
 
T
D
 
R
D
 
G
E
 
S
R
 
G
K
 
V
I
 
Y
V
 
L
M
 
V
S
 
P
R
 
R
L
 
T
G
 
D
N
 
G
R
 
E
L
 
L
R
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
Y
E
 
E
F
 
E
N
 
R
G
 
D
H
 
Y
N
 
D
L
 
T
D
 
T
L
 
V
T
 
T
P
 
A
V
 
G
R
 
G
C
 
V
E
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
G
R
 
K
A
 
V
L
 
L
E
 
A
L
 
V
F
 
L
P
 
P
Q
 
G
L
 
A
R
 
A
P
 
E
D
 
L
G
 
E
D
 
L
P
 
A
L
 
E
Y
 
T
W
 
A
C
 
A
G
|
G
L
 
L
R
|
R
P
 
P
V
 
G
T
 
S
P
 
P
S
 
D
N
 
G
V
 
L
P
 
P
L
 
V
I
 
L
G
 
G
R
 
W
T
 
T
R
 
A
L
 
V
S
 
P
N
 
N
L
 
L
W
 
L
L
 
V
N
 
A
T
 
T
G
 
G
H
 
H
G
x
S
T
x
R
L
x
I
G
|
G
W
x
V
T
x
Q
L
 
L
S
 
A
C
 
P
G
 
I
S
 
T
A
 
A
A
 
D
A
 
V
L
 
M
A
 
G
D
 
E
-
 
M
L
 
L
I
 
V
S
 
T
G
 
G
R
 
R
R
 
T
P
 
P
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Q50LF2 Sarcosine oxidase subunit beta; Sarcosine oxidase subunit B; Sarcosine oxidase (5,10-methylenetetrahydrofolate-forming) subunit beta; Tetrameric sarcosine oxidase subunit beta; TSOX subunit beta; EC 1.5.3.24 from Corynebacterium sp. (strain U-96) (see 4 papers)
24% identity, 60% coverage: 161:410/416 of query aligns to 131:384/405 of Q50LF2

query
sites
Q50LF2
G
 
G
V
 
V
D
 
D
R
 
A
E
 
E
P
 
W
V
 
L
D
 
T
A
 
P
A
 
E
R
 
Q
C
 
V
V
 
K
A
 
E
I
 
V
E
 
C
P
 
P
A
 
I
L
 
I
A
 
N
A
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
N
V
 
I
Q
 
R
G
 
Y
R
 
P
L
 
V
A
 
M
G
 
G
G
 
A
D
 
T
Y
 
Y
T
 
Q
P
 
P
S
 
R
D
 
A
E
 
G
S
 
I
G
 
A
D
x
K
A
x
H
H
 
D
R
 
H
F
 
V
T
 
A
Q
 
W
R
 
A
L
 
F
A
 
A
E
 
R
A
 
K
A
 
A
A
 
N
A
 
E
R
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
D
F
 
I
R
 
I
Y
 
Q
N
 
N
C
 
C
P
 
E
V
|
V
E
 
T
K
 
G
I
 
F
A
 
L
S
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
E
R
 
K
V
 
V
A
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
K
A
 
T
G
 
T
G
 
R
D
 
G
L
 
T
L
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
G
A
 
K
Y
 
V
V
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
G
G
 
A
S
 
G
Y
 
H
S
 
S
P
 
S
A
 
V
L
 
L
L
 
A
K
 
E
P
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
F
K
 
E
A
 
L
C
 
P
V
 
I
Y
 
-
P
 
Q
G
 
S
K
 
H
G
 
P
Y
 
L
S
 
Q
A
 
A
T
 
L
I
 
V
A
 
S
L
 
E
S
 
L
P
 
F
D
 
E
S
 
P
V
 
V
A
 
H
P
 
P
S
 
T
V
 
V
S
 
V
I
 
M
T
 
S
D
 
N
D
 
H
E
 
I
R
x
H
K
 
V
I
x
Y
V
 
V
-
 
S
M
 
Q
S
 
A
R
 
H
L
 
K
G
 
G
N
 
E
R
 
L
L
 
V
R
 
M
V
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
D
E
 
S
F
 
Y
N
 
N
G
 
G
H
 
Y
N
 
G
L
 
Q
D
 
R
L
 
G
T
 
A
P
 
F
V
 
H
R
 
V
C
 
I
E
 
E
A
 
E
L
 
Q
L
 
M
R
 
A
R
 
A
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
I
L
 
F
R
 
A
P
 
R
D
 
A
G
 
H
D
 
V
P
 
L
L
 
R
Y
 
T
W
 
W
C
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
V
P
 
D
V
 
T
T
 
T
P
 
M
S
 
D
N
 
A
V
 
S
P
 
P
L
 
I
I
 
I
G
 
S
R
 
K
T
 
T
R
 
P
L
 
I
S
 
Q
N
 
N
L
 
L
W
 
Y
L
 
V
N
 
N
T
 
C
G
 
G
H
 
W
G
|
G
T
 
T
L
 
G
G
|
G
W
 
F
T
x
K
L
 
G
S
 
T
C
 
P
G
 
G
S
 
A
A
 
G
A
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
H
L
 
T
I
 
I
S
 
A
G
 
H
R
 
D
R
 
E
P
 
P
E
 
H
P
 
K
-
 
L
D
 
N
F
 
A
P
 
P
F
 
F

Sites not aligning to the query:

2gagB Heteroteterameric sarcosine: structure of a diflavin metaloenzyme at 1.85 a resolution (see paper)
22% identity, 71% coverage: 115:410/416 of query aligns to 83:382/403 of 2gagB

query
sites
2gagB
S
 
S
R
 
L
Q
 
K
R
 
L
L
 
W
Q
 
E
A
 
Q
L
 
L
R
 
P
Q
 
E
A
 
D
L
 
L
P
 
E
L
 
Y
D
 
D
Y
 
F
D
 
L
Q
 
F
R
 
S
C
 
Q
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
L
 
L
H
 
N
I
 
L
F
 
A
T
 
H
Q
 
T
A
 
L
A
 
G
E
 
D
F
 
V
E
 
R
A
 
E
A
 
S
C
 
V
H
 
R
A
 
R
A
 
V
A
 
E
L
 
A
M
 
N
R
 
K
E
 
L
F
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
D
R
 
A
E
 
E
P
 
W
V
 
L
D
 
D
A
 
P
A
 
S
R
 
Q
C
 
V
V
 
K
A
 
E
I
 
A
E
 
C
P
 
P
A
 
I
L
 
I
A
 
N
A
 
T
-
 
S
-
 
D
-
 
D
V
 
I
Q
 
R
G
 
Y
R
 
P
L
 
V
A
 
M
G
 
G
G
 
A
D
 
T
Y
 
W
T
 
Q
P
 
P
S
 
R
D
 
A
E
 
G
S
 
I
G
 
A
D
x
K
A
x
H
H
 
D
R
 
H
F
 
V
T
 
A
Q
 
W
R
 
A
L
 
F
A
 
A
E
 
R
A
 
K
A
 
A
A
 
N
A
 
E
R
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
D
F
 
I
R
 
I
Y
 
Q
N
 
N
C
 
C
P
 
E
V
|
V
E
 
T
K
 
G
I
 
F
A
 
I
S
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
E
R
 
K
V
 
V
A
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
K
A
 
T
G
 
T
G
 
R
D
 
G
L
 
T
L
 
I
L
 
H
A
 
A
D
 
G
A
 
K
Y
 
V
V
 
A
V
 
L
A
 
A
L
x
G
G
x
A
S
 
G
Y
x
H
S
 
S
P
 
S
A
 
V
L
|
L
L
 
A
K
 
E
P
 
M
A
 
A
G
 
G
V
 
F
K
 
E
A
 
L
C
 
P
V
 
I
Y
 
-
P
 
Q
G
 
S
K
 
H
G
 
P
Y
x
L
S
 
Q
A
 
A
T
 
L
I
x
V
A
 
S
L
 
E
S
 
L
P
 
F
D
 
E
S
 
P
V
 
V
A
 
H
P
 
P
S
 
T
V
 
V
S
 
V
I
x
M
T
 
S
D
 
N
D
 
H
E
 
I
R
 
H
K
 
V
I
x
Y
V
 
V
-
 
S
M
 
Q
S
 
A
R
 
H
L
x
K
G
 
G
N
x
E
R
 
L
L
 
V
R
 
M
V
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
D
E
 
S
F
 
Y
N
 
N
G
 
G
H
 
Y
N
 
G
L
 
Q
D
 
R
L
 
G
T
 
A
P
 
F
V
 
H
R
 
V
C
 
I
E
 
Q
A
 
E
L
 
Q
L
 
M
R
 
A
R
 
A
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
I
L
 
F
R
 
A
P
 
R
D
 
A
G
 
H
D
 
V
P
 
L
L
x
R
Y
 
T
W
|
W
C
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
V
P
 
D
V
 
T
T
 
T
P
 
M
S
 
D
N
 
A
V
 
S
P
 
P
L
 
I
I
 
I
G
 
S
R
 
K
T
 
T
R
 
P
L
 
I
S
 
Q
N
 
N
L
 
L
W
 
Y
L
 
V
N
 
N
T
 
C
G
 
G
H
 
W
G
|
G
T
|
T
L
x
G
G
|
G
W
x
F
T
x
K
L
 
G
S
 
T
C
 
P
G
 
G
S
 
A
A
 
G
A
 
F
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
H
L
 
T
I
 
I
S
 
A
G
 
N
R
 
D
R
 
E
P
 
P
-
 
H
E
 
E
P
 
L
D
 
N
F
 
K
P
 
P
F
 
F

Sites not aligning to the query:

3ad8B Heterotetrameric sarcosine oxidase from corynebacterium sp. U-96 in complex with pyrrole 2-carboxylate (see paper)
24% identity, 60% coverage: 161:410/416 of query aligns to 130:383/404 of 3ad8B

query
sites
3ad8B
G
 
G
V
 
V
D
 
D
R
 
A
E
 
E
P
 
W
V
 
L
D
 
T
A
 
P
A
 
E
R
 
Q
C
 
V
V
 
K
A
 
E
I
 
V
E
 
C
P
 
P
A
 
I
L
 
I
A
 
N
A
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
N
V
 
I
Q
 
R
G
 
Y
R
 
P
L
 
V
A
 
M
G
 
G
G
 
A
D
 
T
Y
 
Y
T
 
Q
P
 
P
S
 
R
D
 
A
E
 
G
S
 
I
G
 
A
D
 
K
A
x
H
H
 
D
R
 
H
F
 
V
T
 
A
Q
 
W
R
 
A
L
 
F
A
 
A
E
 
R
A
 
K
A
 
A
A
 
N
A
 
E
R
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
D
F
 
I
R
 
I
Y
 
Q
N
 
N
C
 
C
P
 
E
V
|
V
E
 
T
K
 
G
I
 
F
A
 
L
S
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
E
R
 
K
V
 
V
A
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
K
A
 
T
G
 
T
G
 
R
D
 
G
L
 
T
L
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
G
A
 
K
Y
 
V
V
 
A
V
 
L
A
 
A
L
x
G
G
x
A
S
 
G
Y
x
H
S
 
S
P
 
S
A
 
V
L
 
L
L
 
A
K
 
E
P
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
F
K
 
E
A
 
L
C
 
P
V
 
I
Y
 
-
P
 
Q
G
 
S
K
 
H
G
 
P
Y
x
L
S
 
Q
A
 
A
T
 
L
I
x
V
A
 
S
L
 
E
S
 
L
P
 
F
D
 
E
S
 
P
V
 
V
A
 
H
P
 
P
S
 
T
V
 
V
S
 
V
I
x
M
T
 
S
D
 
N
D
 
H
E
 
I
R
 
H
K
 
V
I
x
Y
V
 
V
-
 
S
M
 
Q
S
 
A
R
 
H
L
 
K
G
 
G
N
x
E
R
 
L
L
 
V
R
 
M
V
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
D
E
 
S
F
 
Y
N
 
N
G
 
G
H
 
Y
N
 
G
L
 
Q
D
 
R
L
 
G
T
 
A
P
 
F
V
 
H
R
 
V
C
 
I
E
 
E
A
 
E
L
 
Q
L
 
M
R
 
A
R
 
A
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
I
L
 
F
R
 
A
P
 
R
D
 
A
G
 
H
D
 
V
P
 
L
L
x
R
Y
 
T
W
|
W
C
 
G
G
|
G
L
 
I
R
 
V
P
 
D
V
 
T
T
 
T
P
 
M
S
 
D
N
 
A
V
 
S
P
 
P
L
 
I
I
 
I
G
 
S
R
 
K
T
 
T
R
 
P
L
 
I
S
 
Q
N
 
N
L
 
L
W
 
Y
L
 
V
N
 
N
T
 
C
G
 
G
H
 
W
G
|
G
T
|
T
L
x
G
G
|
G
W
x
F
T
x
K
L
 
G
S
 
T
C
 
P
G
 
G
S
 
A
A
 
G
A
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
H
L
 
T
I
 
I
S
 
A
G
 
H
R
 
D
R
 
E
P
 
P
E
 
H
P
 
K
-
 
L
D
 
N
F
 
A
P
 
P
F
 
F

Sites not aligning to the query:

3ad7B Heterotetrameric sarcosine oxidase from corynebacterium sp. U-96 in complex with methylthio acetate (see paper)
24% identity, 60% coverage: 161:410/416 of query aligns to 130:383/404 of 3ad7B

query
sites
3ad7B
G
 
G
V
 
V
D
 
D
R
 
A
E
 
E
P
 
W
V
 
L
D
 
T
A
 
P
A
 
E
R
 
Q
C
 
V
V
 
K
A
 
E
I
 
V
E
 
C
P
 
P
A
 
I
L
 
I
A
 
N
A
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
N
V
 
I
Q
 
R
G
 
Y
R
 
P
L
 
V
A
 
M
G
 
G
G
 
A
D
 
T
Y
 
Y
T
 
Q
P
 
P
S
 
R
D
 
A
E
 
G
S
 
I
G
 
A
D
 
K
A
x
H
H
 
D
R
 
H
F
 
V
T
 
A
Q
 
W
R
 
A
L
 
F
A
 
A
E
 
R
A
 
K
A
 
A
A
 
N
A
 
E
R
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
D
F
 
I
R
 
I
Y
 
Q
N
 
N
C
 
C
P
 
E
V
|
V
E
 
T
K
 
G
I
 
F
A
 
L
S
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
E
R
 
K
V
 
V
A
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
K
A
 
T
G
 
T
G
 
R
D
 
G
L
 
T
L
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
G
A
 
K
Y
 
V
V
 
A
V
 
L
A
 
A
L
x
G
G
x
A
S
 
G
Y
x
H
S
 
S
P
 
S
A
 
V
L
 
L
L
 
A
K
 
E
P
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
F
K
 
E
A
 
L
C
 
P
V
 
I
Y
 
-
P
 
Q
G
 
S
K
 
H
G
 
P
Y
x
L
S
 
Q
A
 
A
T
 
L
I
x
V
A
 
S
L
 
E
S
 
L
P
 
F
D
 
E
S
 
P
V
 
V
A
 
H
P
 
P
S
 
T
V
 
V
S
 
V
I
x
M
T
 
S
D
 
N
D
 
H
E
 
I
R
 
H
K
 
V
I
x
Y
V
 
V
-
 
S
M
 
Q
S
 
A
R
 
H
L
x
K
G
 
G
N
x
E
R
 
L
L
 
V
R
 
M
V
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
D
E
 
S
F
 
Y
N
 
N
G
 
G
H
 
Y
N
 
G
L
 
Q
D
 
R
L
 
G
T
 
A
P
 
F
V
 
H
R
 
V
C
 
I
E
 
E
A
 
E
L
 
Q
L
 
M
R
 
A
R
 
A
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
I
L
 
F
R
 
A
P
 
R
D
 
A
G
 
H
D
 
V
P
 
L
L
x
R
Y
 
T
W
|
W
C
 
G
G
|
G
L
 
I
R
 
V
P
 
D
V
 
T
T
 
T
P
 
M
S
 
D
N
 
A
V
 
S
P
 
P
L
 
I
I
 
I
G
 
S
R
 
K
T
 
T
R
 
P
L
 
I
S
 
Q
N
 
N
L
 
L
W
 
Y
L
 
V
N
 
N
T
 
C
G
 
G
H
 
W
G
|
G
T
|
T
L
x
G
G
|
G
W
x
F
T
x
K
L
 
G
S
 
T
C
 
P
G
 
G
S
 
A
A
 
G
A
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
H
L
 
T
I
 
I
S
 
A
G
 
H
R
 
D
R
 
E
P
 
P
E
 
H
P
 
K
-
 
L
D
 
N
F
 
A
P
 
P
F
 
F

Sites not aligning to the query:

1vrqB Crystal structure of heterotetrameric sarcosine oxidase from corynebacterium sp. U-96 in complex with folinic acid (see paper)
24% identity, 60% coverage: 161:410/416 of query aligns to 130:383/402 of 1vrqB

query
sites
1vrqB
G
 
G
V
 
V
D
 
D
R
 
A
E
 
E
P
 
W
V
 
L
D
 
T
A
 
P
A
 
E
R
 
Q
C
 
V
V
 
K
A
 
E
I
 
V
E
 
C
P
 
P
A
 
I
L
 
I
A
 
N
A
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
N
V
 
I
Q
 
R
G
 
Y
R
 
P
L
 
V
A
 
M
G
 
G
G
 
A
D
 
T
Y
 
Y
T
 
Q
P
 
P
S
 
R
D
 
A
E
 
G
S
 
I
G
 
A
D
 
K
A
x
H
H
 
D
R
 
H
F
 
V
T
 
A
Q
 
W
R
 
A
L
 
F
A
 
A
E
 
R
A
 
K
A
 
A
A
 
N
A
 
E
R
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
D
F
 
I
R
 
I
Y
 
Q
N
 
N
C
 
C
P
 
E
V
|
V
E
 
T
K
 
G
I
 
F
A
 
L
S
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
E
R
 
K
V
 
V
A
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
K
A
 
T
G
 
T
G
 
R
D
 
G
L
 
T
L
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
G
A
 
K
Y
 
V
V
 
A
V
 
L
A
|
A
L
x
G
G
 
A
S
 
G
Y
x
H
S
 
S
P
 
S
A
 
V
L
 
L
L
 
A
K
 
E
P
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
F
K
 
E
A
 
L
C
 
P
V
 
I
Y
 
-
P
 
Q
G
 
S
K
 
H
G
 
P
Y
x
L
S
 
Q
A
 
A
T
 
L
I
x
V
A
 
S
L
 
E
S
 
L
P
 
F
D
 
E
S
 
P
V
 
V
A
 
H
P
 
P
S
 
T
V
 
V
S
 
V
I
 
M
T
 
S
D
 
N
D
 
H
E
 
I
R
 
H
K
 
V
I
 
Y
V
 
V
-
 
S
M
 
Q
S
 
A
R
 
H
L
 
K
G
 
G
N
x
E
R
 
L
L
 
V
R
 
M
V
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
D
E
 
S
F
 
Y
N
 
N
G
 
G
H
 
Y
N
 
G
L
 
Q
D
 
R
L
 
G
T
 
A
P
 
F
V
 
H
R
 
V
C
 
I
E
 
E
A
 
E
L
 
Q
L
 
M
R
 
A
R
 
A
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
I
L
 
F
R
 
A
P
 
R
D
 
A
G
 
H
D
 
V
P
 
L
L
x
R
Y
 
T
W
|
W
C
 
G
G
|
G
L
 
I
R
 
V
P
 
D
V
 
T
T
 
T
P
 
M
S
 
D
N
 
A
V
 
S
P
 
P
L
 
I
I
 
I
G
 
S
R
 
K
T
 
T
R
 
P
L
 
I
S
 
Q
N
 
N
L
 
L
W
 
Y
L
 
V
N
 
N
T
 
C
G
 
G
H
 
W
G
|
G
T
|
T
L
x
G
G
|
G
W
x
F
T
x
K
L
 
G
S
 
T
C
 
P
G
 
G
S
 
A
A
 
G
A
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
H
L
 
T
I
 
I
S
 
A
G
 
H
R
 
D
R
 
E
P
 
P
E
 
H
P
 
K
-
 
L
D
 
N
F
 
A
P
 
P
F
 
F

Sites not aligning to the query:

S5FMM4 Glycine oxidase; GO; BliGO; EC 1.4.3.19 from Bacillus licheniformis (see paper)
30% identity, 44% coverage: 218:401/416 of query aligns to 169:348/369 of S5FMM4

query
sites
S5FMM4
F
 
F
R
 
E
Y
 
Y
N
 
T
C
 
-
P
 
P
V
 
V
E
 
L
K
 
S
I
 
I
A
 
E
S
 
S
A
 
E
G
 
A
G
 
G
R
 
A
V
 
V
A
 
R
G
 
V
V
 
T
V
 
S
A
 
A
G
 
S
G
 
G
D
 
-
L
 
T
L
 
A
L
 
E
A
 
A
D
 
E
A
 
H
Y
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
L
x
S
G
 
G
S
 
V
Y
 
W
S
 
S
P
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
F
K
 
K
P
 
Q
A
 
I
G
 
G
V
 
L
K
 
D
A
 
K
C
 
R
V
 
F
Y
 
Y
P
 
P
G
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
-
S
 
-
A
 
E
T
 
C
I
 
L
A
 
S
L
 
V
S
 
W
P
 
N
D
 
D
S
 
G
V
 
I
A
 
S
P
 
L
S
 
T
V
 
R
S
 
T
I
 
L
T
 
Y
D
 
H
D
 
D
E
 
H
R
 
C
K
 
Y
I
 
I
V
 
V
M
 
-
S
 
P
R
 
R
L
 
H
G
 
S
N
 
G
R
 
R
L
 
L
R
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
M
E
 
K
F
 
P
N
 
G
G
 
D
H
 
W
N
 
N
L
 
E
D
 
Q
L
 
P
T
 
E
P
 
L
V
 
G
R
 
G
C
 
I
E
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
R
R
 
K
A
 
A
L
 
K
E
 
S
L
 
M
F
 
L
P
 
P
Q
 
G
L
 
I
R
 
E
P
 
S
D
 
M
G
 
K
D
 
I
P
 
D
L
 
Q
Y
 
C
W
 
W
C
 
A
G
 
G
L
 
L
R
 
R
P
 
P
V
 
E
T
 
T
P
 
G
S
 
D
N
 
G
V
 
N
P
 
P
L
 
Y
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
H
R
 
P
L
 
E
S
 
N
N
 
D
-
 
R
L
 
I
W
 
L
L
 
F
N
 
A
T
 
A
G
 
G
H
 
H
G
 
F
T
 
R
L
 
N
G
 
G
W
x
I
T
 
L
L
 
L
S
 
A
C
 
P
G
 
A
S
 
T
A
 
G
A
 
E
A
 
M
L
x
M
A
 
A
D
 
D
L
 
M
I
 
I
S
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q5L2C2 Glycine oxidase; GO; GOX; GOXK; EC 1.4.3.19 from Geobacillus kaustophilus (strain HTA426)
25% identity, 73% coverage: 108:410/416 of query aligns to 62:365/377 of Q5L2C2

query
sites
Q5L2C2
I
 
L
I
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
A
L
 
L
Y
 
Q
S
 
S
R
 
R
Q
 
A
R
 
L
L
 
M
-
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
A
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
R
 
R
Q
 
E
A
 
R
L
 
T
P
 
G
L
 
I
D
 
D
Y
 
I
D
 
G
Q
 
L
R
 
V
C
 
E
Q
 
K
G
 
G
I
 
L
L
 
I
H
 
K
I
 
L
F
 
A
T
 
T
Q
 
T
A
 
E
A
 
E
E
 
E
F
 
A
E
 
D
A
 
D
A
 
L
C
 
Y
H
 
R
A
 
H
A
 
Y
A
 
T
L
 
F
M
 
W
R
 
R
E
 
G
F
 
I
G
 
G
V
 
E
D
 
P
R
 
V
E
 
Q
P
 
W
V
 
L
D
 
T
A
 
K
A
 
G
R
 
E
C
 
A
V
 
L
A
 
E
I
 
M
E
 
E
P
 
P
A
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
E
Q
 
A
G
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
A
D
 
M
Y
 
Y
T
 
I
P
 
P
S
 
G
D
 
D
-
 
G
E
 
Q
S
 
V
G
 
S
D
 
A
A
 
P
H
 
D
R
 
L
F
 
A
T
 
A
Q
 
A
R
 
L
L
 
A
A
 
Y
E
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
S
A
 
A
R
 
G
G
 
A
V
 
C
Q
 
L
F
 
Y
R
 
E
Y
 
Y
N
 
T
C
 
E
P
x
V
V
 
F
E
 
D
K
 
I
I
 
R
A
 
S
S
 
D
A
 
S
G
 
S
G
 
G
R
 
H
V
 
V
A
 
L
G
 
D
V
 
T
V
 
T
A
 
G
G
 
G
G
 
-
D
 
-
L
 
T
L
 
F
L
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
A
Y
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
L
 
S
G
 
G
S
 
A
Y
 
W
S
 
A
P
 
A
A
 
R
L
 
L
L
 
G
K
 
A
P
 
R
A
 
V
G
 
G
V
 
L
K
 
S
A
 
L
C
 
S
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
G
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
-
S
 
E
A
 
C
T
 
V
I
 
M
A
 
V
L
 
R
S
 
A
P
 
P
D
 
V
S
 
P
V
 
L
A
 
L
P
 
Q
S
 
T
V
 
T
S
 
V
I
 
F
T
 
A
D
 
K
D
 
N
E
 
G
R
 
C
K
 
Y
I
 
I
V
 
V
M
 
-
S
 
P
R
 
K
L
 
S
G
 
G
N
 
N
R
 
R
L
 
L
R
 
L
V
 
I
A
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
S
E
 
T
F
 
P
N
 
G
G
 
T
H
 
F
N
 
D
L
 
R
D
 
R
L
 
V
T
 
S
P
 
A
V
 
G
R
 
G
C
 
V
E
 
M
A
 
N
L
 
L
L
 
L
R
 
H
R
 
R
A
 
A
L
 
A
E
 
H
L
 
L
F
 
V
P
 
P
Q
 
D
L
 
I
R
 
E
P
 
Q
D
 
A
G
 
E
D
 
W
P
 
V
L
 
A
Y
 
S
W
 
W
C
 
S
G
 
G
L
 
I
R
|
R
P
 
P
V
 
Q
T
 
T
P
 
E
S
 
D
N
 
G
V
 
L
P
 
P
L
 
Y
I
 
L
G
 
G
R
 
E
T
 
H
-
 
P
R
 
E
L
 
R
S
 
R
N
 
G
L
 
L
W
 
F
L
 
V
N
 
A
T
 
A
G
 
G
H
|
H
G
x
Y
T
x
R
L
x
N
G
|
G
W
x
I
T
x
L
L
 
L
S
 
S
C
 
P
G
 
L
S
 
T
A
 
G
A
 
L
A
 
L
L
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
V
S
 
E
G
 
R
R
 
K
R
 
E
P
 
T
E
 
A
P
 
F
D
 
D
F
 
L
-
 
A
P
 
P
F
 
F

Sites not aligning to the query:

4yshA Crystal structure of glycine oxidase from geobacillus kaustophilus
24% identity, 73% coverage: 108:410/416 of query aligns to 61:363/370 of 4yshA

query
sites
4yshA
I
 
L
I
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
A
L
 
L
Y
 
Q
S
 
S
R
 
R
Q
 
A
R
 
L
L
 
M
-
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
A
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
R
 
R
Q
 
E
A
 
R
L
 
T
P
 
G
L
 
I
D
 
D
Y
 
I
D
 
G
Q
 
L
R
 
V
C
 
E
Q
 
K
G
 
G
I
 
L
L
 
I
H
 
K
I
 
L
F
 
A
T
 
T
Q
 
T
A
 
E
A
 
E
E
 
E
F
 
A
E
 
D
A
 
D
A
 
L
C
 
Y
H
 
R
A
 
H
A
 
Y
A
 
T
L
 
F
M
 
W
R
 
R
E
 
G
F
 
I
G
 
G
V
 
E
D
 
P
R
 
V
E
 
Q
P
 
W
V
 
L
D
 
T
A
 
K
A
 
G
R
 
E
C
 
A
V
 
L
A
 
E
I
 
M
E
 
E
P
 
P
A
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
E
V
 
A
Q
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
A
D
 
M
Y
 
Y
T
 
I
P
 
P
S
 
G
D
 
D
-
 
G
E
 
Q
S
 
V
G
 
S
D
 
A
A
 
P
H
 
D
R
 
L
F
 
A
T
 
A
Q
 
A
R
 
L
L
 
A
A
 
Y
E
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
S
A
 
A
R
 
G
G
 
A
V
 
C
Q
 
L
F
 
Y
R
 
E
Y
 
Y
N
 
T
C
 
E
P
x
V
V
 
F
E
 
D
K
 
I
I
 
R
A
 
S
S
 
D
A
 
S
G
 
S
G
 
G
R
 
H
V
 
V
A
 
L
G
 
D
V
 
T
V
 
T
A
 
G
G
 
G
G
 
-
D
 
-
L
 
T
L
 
F
L
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
A
Y
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
L
x
S
G
|
G
S
 
A
Y
x
W
S
 
A
P
 
A
A
 
R
L
 
L
L
 
G
K
 
A
P
 
R
A
 
V
G
 
G
V
 
L
K
 
S
A
 
L
C
 
S
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
G
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
-
S
 
E
A
 
C
T
 
V
I
 
M
A
 
V
L
 
R
S
 
A
P
 
P
D
 
V
S
 
P
V
 
L
A
 
L
P
 
Q
S
 
T
V
 
T
S
 
V
I
 
F
T
 
A
D
 
K
D
 
N
E
 
G
R
 
C
K
 
Y
I
 
I
V
 
V
M
 
-
S
 
P
R
 
K
L
 
S
G
 
G
N
 
N
R
 
R
L
 
L
R
 
L
V
x
I
A
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
S
E
 
T
F
 
P
N
 
G
G
 
T
H
 
F
N
 
D
L
 
R
D
 
R
L
 
V
T
 
S
P
 
A
V
 
G
R
 
G
C
 
V
E
 
M
A
 
N
L
|
L
L
 
L
R
 
H
R
 
R
A
 
A
L
 
A
E
 
H
L
 
L
F
 
V
P
 
P
Q
 
D
L
 
I
R
 
E
P
 
Q
D
 
A
G
 
E
D
 
W
P
 
V
L
 
A
Y
 
S
W
 
W
C
 
S
G
|
G
L
 
I
R
|
R
P
 
P
V
 
Q
T
 
T
P
 
E
S
 
D
N
 
G
V
 
L
P
 
P
L
 
Y
I
 
L
G
 
G
R
 
E
T
 
H
-
 
P
R
 
E
L
 
R
S
 
R
N
 
G
L
 
L
W
 
F
L
 
V
N
 
A
T
 
A
G
 
G
H
|
H
G
 
Y
T
x
R
L
x
N
G
|
G
W
x
I
T
x
L
L
 
L
S
 
S
C
 
P
G
 
L
S
 
T
A
 
G
A
 
L
A
 
L
L
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
V
S
 
E
G
 
R
R
 
K
R
 
E
P
 
T
E
 
A
P
 
F
D
 
D
F
 
L
-
 
A
P
 
P
F
 
F

Sites not aligning to the query:

O31616 Glycine oxidase; GO; EC 1.4.3.19 from Bacillus subtilis (strain 168) (see 3 papers)
24% identity, 54% coverage: 184:408/416 of query aligns to 134:355/369 of O31616

query
sites
O31616
G
 
G
R
 
D
L
 
I
A
 
F
G
 
G
G
 
A
D
 
S
Y
 
F
T
 
I
P
 
Q
S
 
D
D
 
D
E
 
V
S
 
H
G
 
V
D
 
E
A
 
P
H
 
Y
R
 
F
F
 
V
T
 
C
Q
 
K
R
 
A
L
 
Y
A
 
V
E
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
M
R
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
E
F
 
I
R
 
F
Y
 
E
N
 
H
C
 
T
P
 
P
V
|
V
E
 
L
K
 
H
I
 
V
A
 
E
S
 
R
A
 
D
G
 
G
G
 
E
R
 
A
V
 
L
A
 
F
G
 
I
V
 
K
V
 
T
A
 
P
G
 
S
G
 
G
D
 
D
L
 
V
L
 
W
L
 
-
A
 
A
D
 
N
A
 
H
Y
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
S
G
 
G
S
 
V
Y
 
W
S
 
S
P
 
G
A
 
M
L
 
F
L
 
F
K
 
K
P
 
Q
A
 
L
G
 
G
V
 
L
K
 
N
A
 
N
C
 
A
V
 
F
Y
 
L
P
 
P
G
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
-
S
 
-
A
 
E
T
 
C
I
 
L
A
 
S
L
 
V
S
 
W
P
 
N
D
 
D
S
 
D
V
 
I
A
 
P
P
 
L
S
 
T
V
 
K
S
 
T
I
 
L
T
 
Y
D
 
H
D
 
D
E
x
H
R
 
C
K
 
Y
I
 
I
V
 
V
M
 
P
S
 
R
R
 
K
L
 
S
G
 
G
N
 
-
R
 
R
L
 
L
R
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
M
E
 
K
F
 
P
N
 
G
G
 
D
H
 
W
N
 
S
L
 
E
D
 
T
L
 
P
T
 
D
P
 
L
V
 
G
R
 
G
C
 
L
E
 
E
A
 
S
L
 
V
L
 
M
R
 
K
R
 
K
A
 
A
L
 
K
E
 
T
L
 
M
F
 
L
P
 
P
Q
 
A
L
 
I
R
 
Q
P
 
N
D
 
M
G
 
K
D
 
V
P
 
D
L
 
R
Y
 
F
W
 
W
C
 
A
G
 
G
L
 
L
R
|
R
P
 
P
V
 
G
T
 
T
P
 
K
S
 
D
N
 
G
V
 
K
P
 
P
L
 
Y
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
H
-
 
P
R
 
E
L
 
D
S
 
S
N
 
R
L
 
I
W
 
L
L
 
F
N
 
A
T
 
A
G
 
G
H
|
H
G
x
F
T
x
R
L
x
N
G
|
G
W
x
I
T
x
L
L
 
L
S
 
A
C
 
P
G
 
A
S
 
T
A
 
G
A
 
A
A
 
L
L
 
I
A
 
S
D
 
D
L
 
L
I
 
I
S
 
M
G
 
N
R
 
K
R
 
E
P
 
V
E
 
N
P
 
Q
D
 
D
F
 
W

Sites not aligning to the query:

P40875 Sarcosine oxidase subunit beta; Sarcosine oxidase subunit B; Sarcosine oxidase (5,10-methylenetetrahydrofolate-forming) subunit beta; Tetrameric sarcosine oxidase subunit beta; TSOX subunit beta; EC 1.5.3.24 from Corynebacterium sp. (strain P-1) (see 3 papers)
24% identity, 67% coverage: 122:400/416 of query aligns to 88:373/405 of P40875

query
sites
P40875
L
 
L
R
 
W
Q
 
E
A
 
Q
L
 
L
P
 
P
-
 
E
-
 
E
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
F
-
 
S
Q
 
Q
R
 
R
C
 
-
Q
 
-
G
 
G
I
 
V
L
 
L
H
 
N
I
 
L
F
 
A
T
 
H
Q
 
T
A
 
L
A
 
G
E
 
D
F
 
V
E
 
R
A
 
E
A
 
S
C
 
V
H
 
R
A
 
R
A
 
V
A
 
E
L
 
A
M
 
N
R
 
K
E
 
F
F
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
D
R
 
A
E
 
E
P
 
W
V
 
L
D
 
T
A
 
P
A
 
E
R
 
Q
C
 
V
V
 
K
A
 
E
I
 
V
E
x
C
P
 
P
A
 
I
L
 
I
A
 
N
A
 
I
-
 
G
-
 
D
-
 
D
V
 
I
Q
 
R
G
 
Y
R
 
P
L
 
V
A
 
M
G
 
G
G
 
A
D
 
T
Y
 
Y
T
 
Q
P
 
P
S
 
R
D
 
A
E
 
G
S
 
I
G
 
A
D
 
K
A
x
H
H
 
D
R
x
H
F
 
V
T
 
A
Q
 
W
R
 
A
L
 
F
A
 
A
E
 
R
A
 
K
A
 
A
A
 
N
A
 
E
R
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
D
F
 
I
R
 
I
Y
 
Q
N
 
N
C
|
C
P
 
E
V
 
V
E
 
T
K
 
G
I
 
F
A
 
L
S
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
E
R
 
K
V
 
V
A
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
K
A
 
T
G
 
T
G
 
R
D
 
G
L
 
T
L
 
I
L
 
H
A
 
A
D
 
G
A
 
K
Y
 
V
V
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
G
G
 
A
S
 
G
Y
 
H
S
 
S
P
 
S
A
 
V
L
 
L
L
 
A
K
 
E
P
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
F
K
 
E
A
 
L
C
 
P
V
 
I
Y
 
-
P
 
Q
G
 
S
K
 
H
G
 
P
Y
 
L
S
 
Q
A
 
A
T
 
L
I
 
V
A
 
S
L
 
E
S
 
L
P
 
F
D
 
E
S
 
P
V
 
V
A
 
H
P
 
P
S
 
T
V
 
V
S
 
V
I
 
M
T
 
S
D
 
N
D
 
H
E
 
I
R
 
H
K
 
V
I
 
Y
V
 
V
-
 
S
M
 
Q
S
 
A
R
 
H
L
 
K
G
 
G
N
 
E
R
 
L
L
 
V
R
 
M
V
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
D
E
 
S
F
 
Y
N
 
N
G
 
G
H
 
Y
N
 
G
L
 
Q
D
 
R
L
 
G
T
 
A
P
 
F
V
 
H
R
 
V
C
 
I
E
 
E
A
 
E
L
 
Q
L
 
M
R
 
A
R
 
A
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
I
L
 
F
R
 
A
P
 
R
D
 
A
G
 
H
D
 
V
P
 
L
L
 
R
Y
 
T
W
 
W
C
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
V
P
 
D
V
 
T
T
 
T
P
 
M
S
 
D
N
 
A
V
 
S
P
 
P
L
 
I
I
 
I
G
 
S
R
 
K
T
 
T
R
 
P
L
 
I
S
 
Q
N
 
N
L
 
L
W
 
Y
L
 
V
N
 
N
T
x
C
G
 
G
H
 
W
G
 
G
T
 
T
L
 
G
G
 
G
W
 
F
T
 
K
L
 
G
S
 
T
C
 
P
G
 
G
S
 
A
A
 
G
A
 
F
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
H
L
 
T
I
 
I
S
 
A

Sites not aligning to the query:

4yshB Crystal structure of glycine oxidase from geobacillus kaustophilus
24% identity, 73% coverage: 108:410/416 of query aligns to 61:363/368 of 4yshB

query
sites
4yshB
I
 
L
I
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
A
L
 
L
Y
 
Q
S
 
S
R
 
R
Q
 
A
R
 
L
L
 
M
-
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
A
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
R
 
R
Q
 
E
A
 
R
L
 
T
P
 
G
L
 
I
D
 
D
Y
 
I
D
 
G
Q
 
L
R
 
V
C
 
E
Q
 
K
G
 
G
I
 
L
L
 
I
H
 
K
I
 
L
F
 
A
T
 
T
Q
 
T
A
 
E
A
 
E
E
 
E
F
 
A
E
 
D
A
 
D
A
 
L
C
 
Y
H
 
R
A
 
H
A
 
Y
A
 
T
L
 
F
M
 
W
R
 
R
E
 
G
F
 
I
G
 
G
V
 
E
D
 
P
R
 
V
E
 
Q
P
 
W
V
 
L
D
 
T
A
 
K
A
 
G
R
 
E
C
 
A
V
 
L
A
 
E
I
 
M
E
 
E
P
 
P
A
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
E
V
 
A
Q
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
A
D
 
M
Y
 
Y
T
 
I
P
 
P
S
 
G
D
 
D
-
 
G
E
 
Q
S
 
V
G
 
S
D
 
A
A
 
P
H
 
D
R
 
L
F
 
A
T
 
A
Q
 
A
R
 
L
L
 
A
A
 
Y
E
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
S
A
 
A
R
 
G
G
 
A
V
 
C
Q
 
L
F
 
Y
R
 
E
Y
 
Y
N
 
T
C
 
E
P
x
V
V
 
F
E
 
D
K
 
I
I
 
R
A
 
S
S
 
D
A
 
S
G
 
S
G
 
G
R
 
H
V
 
V
A
 
L
G
 
D
V
 
T
V
 
T
A
 
G
G
 
G
G
 
-
D
 
-
L
 
T
L
 
F
L
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
A
Y
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
L
x
S
G
 
G
S
 
A
Y
x
W
S
 
A
P
 
A
A
 
R
L
 
L
L
 
G
K
 
A
P
 
R
A
 
V
G
 
G
V
 
L
K
 
S
A
 
L
C
 
S
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
G
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
-
S
 
E
A
 
C
T
 
V
I
 
M
A
 
V
L
 
R
S
 
A
P
 
P
D
 
V
S
 
P
V
 
L
A
 
L
P
 
Q
S
 
T
V
 
T
S
 
V
I
 
F
T
 
A
D
 
K
D
 
N
E
x
G
R
 
C
K
x
Y
I
 
I
V
 
V
M
 
-
S
 
P
R
 
K
L
 
S
G
 
G
N
 
N
R
 
R
L
 
L
R
 
L
V
x
I
A
 
G
G
x
A
T
 
T
A
 
S
E
 
T
F
 
P
N
 
G
G
 
T
H
 
F
N
 
D
L
 
R
D
 
R
L
 
V
T
 
S
P
 
A
V
 
G
R
 
G
C
 
V
E
 
M
A
 
N
L
|
L
L
 
L
R
 
H
R
 
R
A
 
A
L
 
A
E
 
H
L
 
L
F
 
V
P
 
P
Q
 
D
L
 
I
R
 
E
P
 
Q
D
 
A
G
 
E
D
 
W
P
 
V
L
 
A
Y
 
S
W
 
W
C
 
S
G
|
G
L
 
I
R
|
R
P
 
P
V
 
Q
T
 
T
P
 
E
S
 
D
N
 
G
V
 
L
P
 
P
L
 
Y
I
 
L
G
 
G
R
 
E
T
 
H
-
 
P
R
 
E
L
 
R
S
 
R
N
 
G
L
 
L
W
 
F
L
 
V
N
 
A
T
 
A
G
 
G
H
|
H
G
 
Y
T
x
R
L
x
N
G
|
G
W
x
I
T
x
L
L
 
L
S
 
S
C
 
P
G
 
L
S
 
T
A
 
G
A
 
L
A
 
L
L
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
V
S
 
E
G
 
R
R
 
K
R
 
E
P
 
T
E
 
A
P
 
F
D
 
D
F
 
L
-
 
A
P
 
P
F
 
F

Sites not aligning to the query:

1ng3A Complex of thio (glycine oxidase) with acetyl-glycine (see paper)
24% identity, 54% coverage: 184:408/416 of query aligns to 134:355/364 of 1ng3A

query
sites
1ng3A
G
 
G
R
 
D
L
 
I
A
 
F
G
 
G
G
 
A
D
 
S
Y
 
F
T
 
I
P
 
Q
S
 
D
D
 
D
E
 
V
S
 
H
G
 
V
D
 
E
A
 
P
H
 
Y
R
 
F
F
 
V
T
 
C
Q
 
K
R
 
A
L
 
Y
A
 
V
E
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
M
R
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
E
F
 
I
R
 
F
Y
 
E
N
 
H
C
 
T
P
 
P
V
|
V
E
 
L
K
 
H
I
 
V
A
 
E
S
 
R
A
 
D
G
 
G
G
 
E
R
 
A
V
 
L
A
 
F
G
 
I
V
 
K
V
 
T
A
 
P
G
 
S
G
 
G
D
 
D
L
 
V
L
 
W
L
 
-
A
 
A
D
 
N
A
 
H
Y
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
L
x
S
G
|
G
S
 
V
Y
x
W
S
 
S
P
 
G
A
 
M
L
x
F
L
 
F
K
 
K
P
 
Q
A
 
L
G
 
G
V
 
L
K
 
N
A
 
N
C
 
A
V
 
F
Y
 
L
P
 
P
G
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
-
S
 
-
A
 
E
T
 
C
I
 
L
A
 
S
L
 
V
S
 
W
P
 
N
D
 
D
S
 
D
V
 
I
A
 
P
P
 
L
S
 
T
V
 
K
S
 
T
I
 
L
T
 
Y
D
 
H
D
 
D
E
 
H
R
 
C
K
x
Y
I
 
I
V
 
V
M
 
P
S
 
R
R
 
K
L
 
S
G
 
G
N
 
-
R
|
R
L
 
L
R
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
M
E
 
K
F
 
P
N
 
G
G
 
D
H
 
W
N
 
S
L
 
E
D
 
T
L
 
P
T
 
D
P
 
L
V
 
G
R
 
G
C
 
L
E
 
E
A
 
S
L
 
V
L
 
M
R
 
K
R
 
K
A
 
A
L
 
K
E
 
T
L
 
M
F
 
L
P
 
P
Q
 
P
L
 
I
R
 
Q
P
 
N
D
 
M
G
 
K
D
 
V
P
 
D
L
 
R
Y
 
F
W
 
W
C
 
A
G
|
G
L
 
L
R
|
R
P
 
P
V
 
G
T
 
T
P
 
K
S
 
D
N
 
G
V
 
K
P
 
P
L
 
Y
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
H
-
 
P
R
 
E
L
 
D
S
 
S
N
 
R
L
 
I
W
 
L
L
 
F
N
 
A
T
 
A
G
 
G
H
|
H
G
 
F
T
x
R
L
x
N
G
|
G
W
x
I
T
 
L
L
 
L
S
 
A
C
 
P
G
 
A
S
 
T
A
 
G
A
 
A
A
 
L
L
 
I
A
 
S
D
 
D
L
 
L
I
 
I
S
 
M
G
 
N
R
 
K
R
 
E
P
 
V
E
 
N
P
 
Q
D
 
D
F
 
W

Sites not aligning to the query:

Q8GAI3 4-methylaminobutanoate oxidase (formaldehyde-forming); MABO; Demethylating gamma-N-methylaminobutyrate oxidase; Gamma-N-methylaminobutyrate oxidase 1; EC 1.5.3.19 from Paenarthrobacter nicotinovorans (Arthrobacter nicotinovorans) (see paper)
26% identity, 72% coverage: 103:401/416 of query aligns to 76:386/824 of Q8GAI3

query
sites
Q8GAI3
R
 
R
N
 
G
I
 
T
R
 
T
D
 
T
I
 
M
I
 
T
A
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
K
Y
 
Y
S
 
G
R
 
L
Q
 
D
R
 
F
L
 
Y
Q
 
S
A
 
R
L
 
L
R
 
E
Q
 
Q
A
 
M
L
 
S
P
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
V
D
 
S
-
 
F
Q
 
Q
R
 
R
C
 
C
Q
 
-
G
 
G
I
 
S
L
 
L
H
 
S
I
 
V
F
 
A
T
 
R
Q
 
T
A
 
A
A
 
G
E
 
R
F
 
V
E
 
D
A
 
E
A
 
L
C
 
L
H
 
Y
A
 
A
A
 
K
A
 
D
L
 
V
M
 
A
R
 
D
E
 
Q
F
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
R
R
 
T
E
 
E
P
 
W
V
 
L
D
 
T
A
 
E
A
 
D
R
 
R
C
 
Y
V
 
K
A
 
E
I
 
L
E
 
W
P
 
P
A
 
-
L
 
L
A
 
A
A
 
T
V
 
Y
Q
 
S
G
 
G
R
 
-
L
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
A
D
 
L
Y
 
L
T
 
L
P
 
P
S
 
D
D
 
D
E
 
G
S
 
H
G
 
I
D
 
N
A
 
P
H
 
G
R
 
H
F
 
A
T
 
T
Q
 
V
R
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
L
A
 
A
A
 
H
A
 
S
R
 
L
G
 
G
V
 
T
Q
 
Q
F
 
I
R
 
R
Y
 
E
N
 
N
C
 
V
P
 
A
V
 
V
E
 
H
K
 
K
I
 
V
A
 
L
S
 
R
A
 
Q
G
 
G
G
 
D
R
 
L
V
 
V
A
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
L
A
 
T
G
 
D
G
 
Q
D
 
G
L
 
I
L
 
V
L
 
H
A
 
C
D
 
D
A
 
R
Y
 
V
V
 
I
V
 
L
A
 
A
L
 
C
G
 
G
S
 
L
Y
 
W
S
 
T
P
 
R
A
 
D
L
 
L
L
 
A
K
 
A
P
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
V
C
 
P
V
 
L
Y
 
Y
P
 
A
G
 
A
K
 
E
G
 
H
Y
 
I
S
 
H
A
 
V
T
 
R
I
 
S
A
 
A
L
 
-
S
 
E
P
 
I
D
 
D
S
 
G
V
 
A
A
 
V
P
 
P
S
 
E
V
 
L
S
 
P
I
 
V
T
 
Y
D
 
R
D
 
D
-
 
L
E
 
D
R
 
N
K
 
S
I
 
Y
V
 
Y
M
 
I
S
 
R
R
 
H
L
 
E
G
 
A
N
 
G
R
 
R
L
 
L
R
 
L
V
 
V
A
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
E
-
 
P
-
 
D
-
 
G
-
 
L
-
 
P
-
 
R
-
 
P
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
P
-
 
S
-
 
N
G
 
G
T
 
F
A
 
A
E
 
E
F
 
F
N
 
G
G
 
P
H
 
E
N
 
W
L
 
E
D
 
H
L
 
F
T
 
A
P
 
P
V
 
I
R
 
R
C
 
A
E
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
K
A
 
A
L
 
E
E
 
G
L
 
V
F
 
V
P
 
P
Q
 
A
L
 
L
R
 
A
P
 
S
D
 
A
G
 
G
D
 
F
P
 
D
L
 
R
Y
 
F
W
 
L
C
 
N
G
 
A
L
 
P
R
 
E
P
 
S
V
 
F
T
 
T
P
 
P
S
 
D
N
 
A
V
 
N
P
 
F
L
 
A
I
 
V
G
 
G
R
 
E
T
 
T
-
 
S
R
 
E
L
 
L
S
 
S
N
 
N
L
 
L
W
 
F
L
 
V
N
 
A
T
 
A
G
 
G
H
 
F
G
 
N
T
 
S
L
 
Q
G
 
G
W
 
I
T
 
I
L
 
F
S
 
A
C
 
P
G
 
G
S
 
I
A
 
G
A
 
K
A
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
E
-
 
W
L
 
V
I
 
I
S
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3if9A Crystal structure of glycine oxidase g51s/a54r/h244a mutant in complex with inhibitor glycolate (see paper)
24% identity, 54% coverage: 184:408/416 of query aligns to 134:355/364 of 3if9A

query
sites
3if9A
G
 
G
R
 
D
L
 
I
A
 
F
G
 
G
G
 
A
D
 
S
Y
 
F
T
 
I
P
 
Q
S
 
D
D
 
D
E
 
V
S
 
H
G
 
V
D
 
E
A
 
P
H
 
Y
R
 
F
F
 
V
T
 
C
Q
 
K
R
 
A
L
 
Y
A
 
V
E
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
M
R
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
E
F
 
I
R
 
F
Y
 
E
N
 
H
C
 
T
P
|
P
V
|
V
E
 
L
K
 
H
I
 
V
A
 
E
S
 
R
A
 
D
G
 
G
G
 
E
R
 
A
V
 
L
A
 
F
G
 
I
V
 
K
V
 
T
A
 
P
G
 
S
G
 
G
D
 
D
L
 
V
L
 
W
L
 
-
A
 
A
D
 
N
A
 
H
Y
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
L
x
S
G
|
G
S
 
V
Y
x
W
S
 
S
P
 
G
A
 
M
L
x
F
L
 
F
K
 
K
P
 
Q
A
 
L
G
 
G
V
 
L
K
 
N
A
 
N
C
 
A
V
 
F
Y
 
L
P
 
P
G
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
-
S
 
-
A
 
E
T
 
C
I
 
L
A
 
S
L
 
V
S
 
W
P
 
N
D
 
D
S
 
D
V
 
I
A
 
P
P
 
L
S
 
T
V
 
K
S
 
T
I
 
L
T
 
Y
D
 
H
D
 
D
E
 
A
R
 
C
K
x
Y
I
 
I
V
 
V
M
 
P
S
 
R
R
 
K
L
 
S
G
 
G
N
 
-
R
 
R
L
 
L
R
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
M
E
 
K
F
 
P
N
 
G
G
 
D
H
 
W
N
 
S
L
 
E
D
 
T
L
 
P
T
 
D
P
 
L
V
 
G
R
 
G
C
 
L
E
 
E
A
 
S
L
 
V
L
 
M
R
 
K
R
 
K
A
 
A
L
 
K
E
 
T
L
 
M
F
 
L
P
 
P
Q
 
A
L
 
I
R
 
Q
P
 
N
D
 
M
G
 
K
D
 
V
P
 
D
L
 
R
Y
 
F
W
 
W
C
 
A
G
|
G
L
 
L
R
|
R
P
 
P
V
 
G
T
 
T
P
 
K
S
 
D
N
 
G
V
 
K
P
 
P
L
 
Y
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
H
-
 
P
R
 
E
L
 
D
S
 
S
N
 
R
L
 
I
W
 
L
L
 
F
N
 
A
T
 
A
G
 
G
H
|
H
G
x
F
T
x
R
L
x
N
G
|
G
W
x
I
T
 
L
L
 
L
S
 
A
C
 
P
G
 
A
S
 
T
A
 
G
A
 
A
A
 
L
L
 
I
A
 
S
D
 
D
L
 
L
I
 
I
S
 
M
G
 
N
R
 
K
R
 
E
P
 
V
E
 
N
P
 
Q
D
 
D
F
 
W

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Dsui_0501 FitnessBrowser__PS:Dsui_0501
MRVLVLGAGVVGVTSAWFLAEAGHEVTVVDRQPGAALETSFANGGQISVCHAEPWANPRA
PFKALEWLGKEDAPLLFRLRYDPALFAWSLRFLANCPPGATRRNIRDIIALALYSRQRLQ
ALRQALPLDYDQRCQGILHIFTQAAEFEAACHAAALMREFGVDREPVDAARCVAIEPALA
AVQGRLAGGDYTPSDESGDAHRFTQRLAEAAAARGVQFRYNCPVEKIASAGGRVAGVVAG
GDLLLADAYVVALGSYSPALLKPAGVKACVYPGKGYSATIALSPDSVAPSVSITDDERKI
VMSRLGNRLRVAGTAEFNGHNLDLTPVRCEALLRRALELFPQLRPDGDPLYWCGLRPVTP
SNVPLIGRTRLSNLWLNTGHGTLGWTLSCGSAAALADLISGRRPEPDFPFLGTTKQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory