SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Dsui_0680 FitnessBrowser__PS:Dsui_0680 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3o4rA Crystal structure of human dehydrogenase/reductase (sdr family) member 4 (dhrs4)
40% identity, 83% coverage: 2:203/243 of query aligns to 6:195/254 of 3o4rA

query
sites
3o4rA
L
 
L
A
 
A
Q
 
N
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
x
A
A
 
S
A
x
T
R
x
D
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
F
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
R
L
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
Q
 
D
G
 
G
C
 
A
R
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
V
V
 
S
G
x
S
R
|
R
R
x
K
E
 
Q
G
 
Q
P
x
N
L
 
V
Q
 
D
A
 
Q
A
 
A
C
 
V
A
 
A
E
 
T
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
R
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
S
V
 
V
A
 
T
A
 
G
L
 
T
V
 
V
A
 
C
D
x
H
V
|
V
T
 
G
R
 
K
G
 
A
E
 
E
D
 
D
V
 
R
A
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
V
A
 
A
F
 
T
L
 
A
E
 
V
R
 
K
E
 
L
Y
 
H
G
 
G
G
 
G
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
N
|
N
A
 
A
G
x
A
V
 
V
F
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
H
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
N
P
 
P
A
 
F
S
 
F
G
 
G
S
 
S
L
 
I
L
 
M
R
 
D
V
 
V
D
 
T
P
 
E
A
 
E
L
 
V
V
 
W
A
 
D
A
 
K
T
 
T
L
 
L
E
 
D
A
 
I
N
 
N
T
 
V
L
 
K
A
 
A
P
 
P
L
 
A
R
 
L
L
 
M
M
 
T
Q
 
K
A
 
A
L
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
E
M
 
M
R
 
E
R
 
K
R
 
R
G
 
G
W
 
G
G
 
G
R
 
S
I
 
V
V
 
V
N
 
I
V
 
V
S
 
S
S
|
S
G
 
-
M
 
I
G
 
A
Q
 
A
L
 
F
S
 
S
T
 
P
M
 
S
G
 
P
G
 
G
A
x
F
W
 
S
P
 
P
G
 
-
Y
|
Y
R
 
N
A
 
V
S
 
S
K
|
K
T
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
L
A
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
I
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
P
E
 
R
G
 
N
A
 
-
A
 
-
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
L
C
 
A
P
|
P
G
|
G
W
x
L
C
x
I
R
 
K
T
|
T
E
 
S
M
x
F

Sites not aligning to the query:

Q9BTZ2 Dehydrogenase/reductase SDR family member 4; NADPH-dependent carbonyl reductase; CR; NADPH-dependent retinol dehydrogenase/reductase; NRDR; humNRDR; Peroxisomal short-chain alcohol dehydrogenase; PSCD; SCAD-SRL; Short chain dehydrogenase/reductase family 25C member 2; Protein SDR25C2; Short-chain dehydrogenase/reductase family member 4; EC 1.1.1.184 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
40% identity, 83% coverage: 2:203/243 of query aligns to 30:219/278 of Q9BTZ2

query
sites
Q9BTZ2
L
 
L
A
 
A
Q
 
N
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
A
A
 
S
A
 
T
R
 
D
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
F
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
R
L
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
Q
 
D
G
 
G
C
 
A
R
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
V
V
 
S
G
 
S
R
 
R
R
 
K
E
 
Q
G
 
Q
P
 
N
L
 
V
Q
 
D
A
 
Q
A
 
A
C
 
V
A
 
A
E
 
T
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
R
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
S
V
 
V
A
 
T
A
 
G
L
 
T
V
 
V
A
 
C
D
 
H
V
 
V
T
 
G
R
 
K
G
 
A
E
 
E
D
 
D
V
 
R
A
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
V
A
 
A
F
 
T
L
 
A
E
 
V
R
 
K
E
 
L
Y
 
H
G
 
G
G
 
G
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
N
 
N
A
 
A
G
 
A
V
 
V
F
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
H
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
N
P
 
P
A
 
F
S
 
F
G
 
G
S
 
S
L
 
I
L
 
M
R
 
D
V
 
V
D
 
T
P
 
E
A
 
E
L
 
V
V
 
W
A
 
D
A
 
K
T
 
T
L
 
L
E
 
D
A
 
I
N
 
N
T
 
V
L
 
K
A
 
A
P
 
P
L
 
A
R
 
L
L
 
M
M
 
T
Q
 
K
A
 
A
L
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
E
M
 
M
R
 
E
R
 
K
R
 
R
G
 
G
W
 
G
G
 
G
R
 
S
I
 
V
V
 
V
N
 
I
V
 
V
S
 
S
S
 
S
G
 
-
M
 
I
G
 
A
Q
 
A
L
 
F
S
 
S
T
 
P
M
x
S
G
 
P
G
 
G
A
x
F
W
 
S
P
 
P
G
 
-
Y
 
Y
R
 
N
A
 
V
S
 
S
K
 
K
T
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
L
A
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
I
x
T
L
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
P
E
 
R
G
 
N
A
 
-
A
 
-
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
L
C
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
L
C
 
I
R
 
K
T
 
T
E
 
S
M
 
F

2zatA Crystal structure of a mammalian reductase (see paper)
37% identity, 83% coverage: 2:203/243 of query aligns to 3:192/251 of 2zatA

query
sites
2zatA
L
 
L
A
 
E
Q
 
N
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
x
A
A
 
S
A
x
T
R
x
D
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
R
L
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
Q
 
D
G
 
G
C
 
A
R
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
V
V
 
S
G
x
S
R
|
R
R
x
K
E
 
Q
G
 
E
P
x
N
L
 
V
Q
 
D
A
 
R
A
 
T
C
 
V
A
 
A
E
 
T
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
R
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
S
V
 
V
A
 
T
A
 
G
L
 
T
V
 
V
A
 
C
D
x
H
V
 
V
T
 
G
R
 
K
G
 
A
E
 
E
D
 
D
V
 
R
A
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
V
A
 
A
F
 
M
L
 
A
E
 
V
R
 
N
E
 
L
Y
 
H
G
 
G
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
N
|
N
A
 
A
G
x
A
V
 
V
F
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
H
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
N
P
 
P
A
 
F
S
 
F
G
 
G
S
 
N
L
 
I
L
 
I
R
 
D
V
 
A
D
 
T
P
 
E
A
 
E
L
 
V
V
 
W
A
 
D
A
 
K
T
 
I
L
 
L
E
 
H
A
 
V
N
 
N
T
 
V
L
 
K
A
 
A
P
 
T
L
 
V
R
 
L
L
 
M
M
 
T
Q
 
K
A
 
A
L
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
E
M
 
M
R
 
E
R
 
K
R
 
R
G
 
G
W
 
G
G
 
G
R
 
S
I
 
V
V
 
L
N
 
I
V
|
V
S
 
S
S
|
S
G
 
-
M
 
V
G
 
G
Q
 
A
L
 
Y
S
 
H
T
 
P
M
 
F
G
 
P
G
 
N
A
x
L
W
 
G
P
 
P
G
 
-
Y
|
Y
R
 
N
A
 
V
S
 
S
K
|
K
T
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
L
A
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
I
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
P
E
 
R
G
 
N
A
 
-
A
 
-
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
L
C
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
L
C
x
I
R
 
K
T
|
T
E
 
N
M
x
F

Sites not aligning to the query:

Q8WNV7 Dehydrogenase/reductase SDR family member 4; NADPH-dependent carbonyl reductase; CR; PHCR; NADPH-dependent retinol dehydrogenase/reductase; NDRD; Peroxisomal carbonyl reductase; PerCR; Peroxisomal short-chain alcohol dehydrogenase; PSCD; Short chain dehydrogenase/reductase family 25C member 2; Protein SDR25C2; EC 1.1.1.184; EC 1.1.1.300 from Sus scrofa (Pig) (see 2 papers)
37% identity, 83% coverage: 2:203/243 of query aligns to 31:220/279 of Q8WNV7

query
sites
Q8WNV7
L
 
L
A
 
E
Q
 
N
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
x
L
V
|
V
T
|
T
G
x
A
A
x
S
A
x
T
R
x
D
G
|
G
L
x
I
G
|
G
L
|
L
A
|
A
V
x
I
A
|
A
G
x
R
L
x
R
L
|
L
A
|
A
E
x
Q
Q
x
D
G
|
G
C
x
A
R
x
H
V
|
V
V
|
V
L
 
V
V
 
S
G
 
S
R
 
R
R
 
K
E
 
Q
G
 
E
P
 
N
L
 
V
Q
 
D
A
 
R
A
 
T
C
 
V
A
 
A
E
 
T
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
R
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
S
V
 
V
A
 
T
A
 
G
L
 
T
V
 
V
A
 
C
D
 
H
V
 
V
T
 
G
R
 
K
G
 
A
E
 
E
D
 
D
V
 
R
A
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
V
A
 
A
F
 
M
L
 
A
E
 
V
R
 
N
E
 
L
Y
 
H
G
 
G
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
N
 
N
A
 
A
G
 
A
V
 
V
F
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
H
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
N
P
 
P
A
 
F
S
 
F
G
 
G
S
 
N
L
 
I
L
 
I
R
 
D
V
 
A
D
 
T
P
 
E
A
 
E
L
 
V
V
 
W
A
 
D
A
 
K
T
 
I
L
 
L
E
 
H
A
 
V
N
 
N
T
 
V
L
 
K
A
 
A
P
 
T
L
 
V
R
 
L
L
 
M
M
 
T
Q
 
K
A
 
A
L
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
E
M
 
M
R
 
E
R
 
K
R
 
R
G
 
G
W
 
G
G
 
G
R
 
S
I
 
V
V
 
L
N
 
I
V
 
V
S
 
S
S
 
S
G
 
-
M
 
V
G
 
G
Q
 
A
L
 
Y
S
 
H
T
 
P
M
x
F
G
 
P
G
 
N
A
x
L
W
 
G
P
 
P
G
 
-
Y
|
Y
R
 
N
A
 
V
S
 
S
K
|
K
T
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
L
A
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
I
x
N
L
 
L
A
 
A
A
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
P
E
 
R
G
 
N
A
 
-
A
 
-
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
L
C
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
L
C
 
I
R
 
K
T
 
T
E
 
N
M
 
F

Sites not aligning to the query:

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
36% identity, 87% coverage: 2:212/243 of query aligns to 6:198/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
L
 
L
A
 
E
Q
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
C
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
G
V
 
T
G
 
A
R
x
T
R
 
S
E
 
E
G
 
S
P
 
G
L
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
I
C
 
S
A
 
D
E
 
Y
L
 
L
A
 
G
-
 
D
-
 
N
G
 
G
R
 
K
G
 
G
L
 
M
A
 
A
V
 
L
A
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
D
x
N
V
|
V
T
 
T
R
 
N
G
 
P
E
 
E
D
 
S
V
 
I
A
 
E
R
 
A
L
 
V
A
 
L
A
 
K
F
 
A
L
 
I
E
 
T
R
 
D
E
 
E
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
F
 
T
L
 
R
E
 
D
P
 
N
H
 
L
D
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
L
L
 
M
R
 
R
V
 
M
D
 
K
P
 
E
A
 
E
L
 
E
V
 
W
A
 
S
A
 
D
T
 
I
L
 
M
E
 
E
A
 
T
N
|
N
T
 
L
L
 
T
A
 
S
P
 
I
L
 
F
R
 
R
L
 
L
M
 
S
Q
 
K
A
 
A
L
 
V
V
 
L
P
 
R
L
 
G
M
 
M
R
 
M
R
 
K
R
 
K
G
 
R
W
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
V
S
x
G
S
|
S
G
 
V
M
 
V
G
 
G
Q
 
-
L
 
-
S
 
-
T
 
T
M
 
M
G
 
G
G
 
N
A
 
A
-
 
G
W
x
Q
P
 
A
G
 
N
Y
|
Y
R
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
T
 
A
A
 
G
L
 
V
N
 
I
A
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
I
 
S
L
 
M
A
 
A
A
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
S
E
 
R
G
 
G
A
 
-
A
 
-
I
 
V
K
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
F
C
 
I
R
 
E
T
|
T
E
 
D
M
 
M
G
 
-
G
 
-
S
 
N
D
 
D
A
 
E
Q
 
Q
R
 
R
S
 
T
A
 
A

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
35% identity, 87% coverage: 2:212/243 of query aligns to 6:202/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
L
 
L
A
 
E
Q
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
L
x
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
C
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
G
V
 
T
G
 
A
R
x
T
R
 
S
E
 
E
G
 
S
P
 
G
L
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
I
C
 
S
A
 
D
E
 
Y
L
 
L
A
 
G
-
 
D
-
 
N
G
 
G
R
 
K
G
 
G
L
 
M
A
 
A
V
 
L
A
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
D
x
N
V
|
V
T
 
T
R
 
N
G
 
P
E
 
E
D
 
S
V
 
I
A
 
E
R
 
A
L
 
V
A
 
L
A
 
K
F
 
A
L
 
I
E
 
T
R
 
D
E
 
E
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
x
I
F
 
T
L
 
R
E
 
D
P
 
N
H
 
L
D
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
L
L
 
M
R
 
R
V
 
M
D
 
K
P
 
E
A
 
E
L
 
E
V
 
W
A
 
S
A
 
D
T
 
I
L
 
M
E
 
E
A
 
T
N
 
N
T
 
L
L
 
T
A
 
S
P
 
I
L
 
F
R
 
R
L
 
L
M
 
S
Q
 
K
A
 
A
L
 
V
V
 
L
P
 
R
L
 
G
M
 
M
R
 
M
R
 
K
R
 
K
G
 
R
W
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
|
V
S
 
G
S
|
S
G
 
V
M
 
V
G
 
G
Q
 
T
L
 
M
S
 
G
T
 
N
M
 
A
G
 
G
G
 
Q
A
 
A
W
 
-
P
 
-
G
 
N
Y
|
Y
R
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
T
 
A
A
 
G
L
 
V
N
 
I
A
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
I
 
S
L
 
M
A
 
A
A
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
S
E
 
R
G
 
G
A
 
-
A
 
-
I
 
V
K
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
F
C
x
I
R
 
E
T
|
T
E
 
D
M
|
M
G
 
T
G
 
K
-
 
A
-
 
L
S
 
N
D
 
D
A
 
E
Q
 
Q
R
 
R
S
 
T
A
 
A

2q2qD Structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from pseudomonas putida (see paper)
37% identity, 83% coverage: 2:203/243 of query aligns to 2:188/255 of 2q2qD

query
sites
2q2qD
L
 
L
A
 
K
Q
 
G
K
 
K
I
 
T
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
x
T
R
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
L
A
 
G
V
 
I
A
 
A
G
 
Q
L
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
R
Q
 
A
G
 
G
C
 
A
R
 
N
V
 
I
V
 
V
L
 
L
V
 
N
G
 
G
R
x
F
R
 
-
E
 
-
G
 
G
P
 
D
L
 
P
Q
 
A
A
 
P
A
 
A
C
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
I
A
 
A
G
 
R
R
 
H
G
 
G
L
 
V
A
 
K
V
 
A
A
 
V
A
 
H
L
 
H
V
 
P
A
 
A
D
|
D
V
x
L
T
 
S
R
 
D
G
 
V
E
 
A
D
 
Q
V
 
I
A
 
E
R
 
A
L
 
L
A
 
F
A
 
A
F
 
L
L
 
A
E
 
E
R
 
R
E
 
E
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
 
I
F
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
H
 
-
D
 
Q
F
 
H
A
 
V
D
 
A
P
 
P
A
 
V
S
 
E
G
 
Q
S
 
F
L
 
P
L
 
L
R
 
E
V
 
S
D
 
W
P
 
D
A
 
K
L
 
I
V
 
I
A
 
A
A
x
L
T
 
N
L
 
L
E
 
S
A
 
A
N
 
-
T
 
V
L
 
F
A
 
H
P
 
G
L
 
T
R
 
R
L
 
L
M
 
A
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
L
P
 
P
L
 
G
M
 
M
R
 
R
R
 
A
R
 
R
G
 
N
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
S
 
A
S
|
S
G
 
V
M
 
H
G
 
G
Q
 
L
L
 
V
S
 
G
T
 
S
M
 
T
G
 
G
G
 
K
A
 
A
W
 
-
P
 
-
G
 
A
Y
|
Y
R
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
T
 
H
A
 
G
L
 
V
N
 
V
A
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
I
 
V
L
 
V
A
 
G
A
 
L
E
 
E
L
 
T
A
 
A
A
 
T
E
 
S
G
 
N
A
 
-
A
 
-
I
 
V
K
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
|
W
C
x
V
R
 
L
T
|
T
E
 
P
M
x
L

Sites not aligning to the query:

2ztlA Closed conformation of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase complexed with NAD+ and l-3-hydroxybutyrate (see paper)
34% identity, 88% coverage: 1:214/243 of query aligns to 1:214/260 of 2ztlA

query
sites
2ztlA
M
 
M
L
 
L
A
 
K
Q
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
T
R
 
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
L
A
 
G
V
 
I
A
 
A
G
 
T
L
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
G
 
G
C
 
A
R
 
D
V
 
I
V
 
V
L
 
L
V
 
N
G
 
G
R
x
F
R
 
G
E
 
D
-
 
A
G
 
A
P
 
E
L
 
I
Q
 
E
A
 
K
A
 
V
C
 
R
A
 
A
E
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
Q
-
 
H
G
 
G
L
 
V
A
 
K
V
 
V
A
 
L
A
 
Y
L
 
D
V
 
G
A
 
A
D
 
D
V
x
L
T
 
S
R
 
K
G
 
G
E
 
E
D
 
A
V
 
V
A
 
R
R
 
G
L
 
L
A
 
V
A
 
D
F
 
N
L
 
A
E
 
V
R
 
R
E
 
Q
Y
 
M
G
 
G
G
 
R
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
F
x
Q
L
 
H
E
 
T
P
 
A
-
 
L
-
 
I
H
 
E
D
 
D
F
 
F
A
 
P
D
 
T
P
 
E
A
 
K
S
 
W
G
 
D
S
 
A
L
 
I
L
 
L
R
 
A
V
x
L
D
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
-
N
|
N
T
 
L
L
 
S
A
 
A
P
 
V
L
 
F
R
 
H
L
 
G
M
 
T
Q
 
A
A
 
A
L
 
A
V
 
L
P
 
P
L
 
H
M
 
M
R
 
K
R
 
K
R
 
Q
G
 
G
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
S
 
A
S
|
S
G
 
A
M
x
H
G
 
G
Q
 
L
L
 
V
S
 
A
T
 
S
M
 
A
G
 
N
G
x
K
A
 
S
W
 
-
P
 
-
G
 
A
Y
|
Y
R
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
T
 
H
A
 
G
L
 
V
N
 
V
A
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
I
 
V
L
 
T
A
 
A
A
 
L
E
 
E
L
 
T
A
 
A
A
 
G
E
 
Q
G
 
G
A
 
-
A
 
-
I
 
I
K
 
T
V
 
A
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
C
P
|
P
G
 
G
W
|
W
C
x
V
R
 
R
T
|
T
-
 
P
-
 
L
-
x
V
-
 
E
-
 
K
-
x
Q
-
 
I
-
 
S
-
 
A
-
x
L
-
 
A
E
 
E
M
 
K
G
 
N
G
 
G
S
 
V
D
 
D
A
 
Q
Q
 
E
R
 
T
S
 
A
A
 
A
E
 
R
E
 
E

1wmbA Crystal structure of NAD dependent d-3-hydroxybutylate dehydrogenase (see paper)
34% identity, 88% coverage: 1:214/243 of query aligns to 1:214/260 of 1wmbA

query
sites
1wmbA
M
 
M
L
 
L
A
 
K
Q
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
T
R
 
S
G
|
G
L
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
G
V
 
I
A
 
A
G
 
T
L
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
G
 
G
C
 
A
R
 
D
V
 
I
V
 
V
L
 
L
V
 
N
G
 
G
R
 
F
R
 
G
E
 
D
-
 
A
G
 
A
P
 
E
L
 
I
Q
 
E
A
 
K
A
 
V
C
 
R
A
 
A
E
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
Q
-
 
H
G
 
G
L
 
V
A
 
K
V
 
V
A
 
L
A
 
Y
L
 
D
V
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
L
T
 
S
R
 
K
G
 
G
E
 
E
D
 
A
V
 
V
A
 
R
R
 
G
L
 
L
A
 
V
A
 
D
F
 
N
L
 
A
E
 
V
R
 
R
E
 
Q
Y
 
M
G
 
G
G
 
R
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
F
 
Q
L
 
H
E
 
T
P
 
A
-
 
L
-
 
I
H
 
E
D
 
D
F
 
F
A
 
P
D
 
T
P
 
E
A
 
K
S
 
W
G
 
D
S
 
A
L
 
I
L
 
L
R
 
A
V
 
L
D
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
-
N
|
N
T
 
L
L
 
S
A
 
A
P
 
V
L
 
F
R
 
H
L
 
G
M
 
T
Q
 
A
A
 
A
L
 
A
V
 
L
P
 
P
L
 
H
M
 
M
R
 
K
R
 
K
R
 
Q
G
 
G
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
S
 
A
S
|
S
G
 
A
M
 
H
G
 
G
Q
 
L
L
 
V
S
 
A
T
 
S
M
 
A
G
 
N
G
 
K
A
 
S
W
 
-
P
 
-
G
 
A
Y
|
Y
R
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
T
 
H
A
 
G
L
 
V
N
 
V
A
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
I
 
V
L
 
T
A
 
A
A
 
L
E
 
E
L
 
T
A
 
A
A
 
G
E
 
Q
G
 
G
A
 
-
A
 
-
I
 
I
K
 
T
V
 
A
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
C
P
 
P
G
 
G
W
 
W
C
 
V
R
 
R
T
 
T
-
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
I
-
 
S
-
 
A
-
x
L
-
 
A
E
 
E
M
 
K
G
 
N
G
 
G
S
 
V
D
 
D
A
 
Q
Q
 
E
R
 
T
S
 
A
A
 
A
E
 
R
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1x1tA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from pseudomonas fragi complexed with NAD+ (see paper)
35% identity, 83% coverage: 1:201/243 of query aligns to 1:190/236 of 1x1tA

query
sites
1x1tA
M
 
M
L
 
L
A
 
K
Q
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
x
T
R
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
L
A
 
G
V
 
I
A
 
A
G
 
T
L
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
G
 
G
C
 
A
R
 
D
V
 
I
V
 
V
L
 
L
V
 
N
G
|
G
R
x
F
R
 
G
E
 
D
-
 
A
G
 
A
P
 
E
L
 
I
Q
 
E
A
 
K
A
 
V
C
 
R
A
 
A
E
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
Q
-
 
H
G
 
G
L
 
V
A
 
K
V
 
V
A
 
L
A
 
Y
L
 
D
V
 
G
A
 
A
D
|
D
V
x
L
T
 
S
R
 
K
G
 
G
E
 
E
D
 
A
V
 
V
A
 
R
R
 
G
L
 
L
A
 
V
A
 
D
F
 
N
L
 
A
E
 
V
R
 
R
E
 
Q
Y
 
M
G
 
G
G
 
R
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
 
I
F
 
Q
L
 
H
E
 
T
P
 
A
-
 
L
-
 
I
H
 
E
D
 
D
F
 
F
A
 
P
D
 
T
P
 
E
A
 
K
S
 
W
G
 
D
S
 
A
L
 
I
L
 
L
R
 
A
V
x
L
D
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
-
N
|
N
T
 
L
L
 
S
A
 
A
P
 
V
L
 
F
R
 
H
L
 
G
M
 
T
Q
 
A
A
 
A
L
 
A
V
 
L
P
 
P
L
 
H
M
 
M
R
 
K
R
 
K
R
 
Q
G
 
G
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
S
 
A
S
|
S
G
 
A
M
x
H
G
 
G
Q
 
L
L
 
V
S
 
A
T
 
S
M
 
A
G
 
N
G
 
K
A
 
S
W
 
-
P
 
-
G
 
A
Y
|
Y
R
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
T
 
H
A
 
G
L
 
V
N
 
V
A
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
I
 
V
L
 
T
A
 
A
A
 
L
E
 
E
L
 
T
A
 
A
A
 
G
E
 
Q
G
 
G
A
 
-
A
 
-
I
 
I
K
 
T
V
 
A
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
C
P
|
P
G
 
G
W
|
W
C
x
V
R
 
R
T
|
T

Sites not aligning to the query:

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
35% identity, 83% coverage: 2:203/243 of query aligns to 6:192/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
L
 
L
A
 
A
Q
 
S
K
 
K
I
 
T
A
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
R
|
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
F
A
 
G
V
 
I
A
 
A
G
 
Q
L
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
R
Q
 
E
G
 
G
C
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
-
V
 
I
G
 
A
R
x
D
R
|
R
E
 
D
G
 
A
P
 
H
L
 
G
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
C
 
A
A
 
A
E
 
S
L
 
L
A
 
R
G
 
E
R
 
S
G
 
G
L
 
A
A
 
Q
V
 
A
A
 
L
A
 
F
L
 
I
V
 
S
A
x
C
D
 
N
V
x
I
T
 
A
R
 
E
G
 
K
E
 
T
D
 
Q
V
 
V
A
 
E
R
 
A
L
 
L
A
 
F
A
 
S
F
 
Q
L
 
A
E
 
E
R
 
E
E
 
A
Y
 
F
G
 
G
G
 
P
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
x
I
F
 
N
L
 
R
E
 
D
P
 
A
H
 
M
D
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
L
L
 
H
R
 
K
V
 
L
D
 
T
P
 
E
A
 
A
L
 
D
V
 
W
A
 
D
A
 
T
T
 
V
L
 
I
E
 
D
A
x
V
N
 
N
T
 
L
L
 
K
A
 
G
P
 
T
L
 
F
R
 
L
L
 
C
M
 
M
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
A
V
 
A
P
 
I
L
 
R
M
 
M
R
 
R
R
 
E
R
 
R
G
 
G
W
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
S
 
A
S
 
S
G
 
A
M
 
-
G
 
S
Q
 
W
L
 
L
S
 
G
T
 
N
M
 
V
G
 
G
G
 
-
A
 
-
W
 
Q
P
 
T
G
 
N
Y
|
Y
R
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
T
 
A
A
 
G
L
 
V
N
 
V
A
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
K
I
 
T
L
 
A
A
 
C
A
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
K
G
 
G
A
 
-
A
 
-
I
 
V
K
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
C
P
 
P
G
 
G
W
 
F
C
x
I
R
 
D
T
|
T
E
 
D
M
 
M

Sites not aligning to the query:

6ci9D Rmm microcompartment-associated aminopropanol dehydrogenase NADP + aminoacetone holo-structure (see paper)
35% identity, 83% coverage: 2:202/243 of query aligns to 7:195/259 of 6ci9D

query
sites
6ci9D
L
 
L
A
 
E
Q
 
G
K
 
R
I
 
S
A
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
S
R
 
K
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
A
 
G
V
 
I
A
 
A
G
 
E
L
 
T
L
 
F
A
 
A
E
 
N
Q
 
A
G
 
G
C
 
V
R
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
T
G
|
G
R
|
R
R
x
N
E
 
Q
G
 
D
P
 
D
L
 
L
Q
 
D
A
 
R
A
 
T
C
 
V
A
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
S
G
 
G
R
 
T
G
 
R
L
 
G
A
 
K
V
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
V
V
 
R
A
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
R
 
D
G
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
A
A
 
R
R
 
R
L
 
T
A
 
V
A
 
A
F
 
E
L
 
T
E
 
V
R
 
S
E
 
R
Y
 
H
G
 
G
G
 
G
V
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
V
V
 
C
N
 
A
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
 
I
F
|
F
L
 
-
E
 
-
P
 
-
H
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
P
S
 
S
G
 
G
S
 
R
L
 
L
L
 
E
R
 
D
V
 
L
D
 
T
P
 
P
A
 
D
L
 
D
V
 
I
A
 
E
A
 
Q
T
 
V
L
 
L
E
 
G
A
 
V
N
 
N
T
 
F
L
 
K
A
 
G
P
 
T
L
 
V
R
 
Y
L
 
I
M
 
V
Q
 
Q
A
 
A
L
 
A
V
 
L
P
 
Q
L
 
A
M
 
L
R
 
T
R
 
A
R
 
S
G
 
G
W
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
V
V
x
T
S
 
S
S
|
S
G
 
I
M
x
T
G
 
G
Q
 
P
L
 
I
S
 
T
T
 
G
M
 
Y
G
 
P
G
 
G
A
 
-
W
|
W
P
 
S
G
 
H
Y
|
Y
R
 
G
A
 
A
S
 
S
K
|
K
T
 
A
A
 
A
L
 
Q
N
 
L
A
 
G
L
 
F
T
 
L
R
 
R
I
 
T
L
 
A
A
 
A
A
 
M
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
P
E
 
K
G
 
-
A
 
-
A
 
K
I
 
I
K
 
T
V
 
I
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
L
P
|
P
G
|
G
W
x
N
C
x
I
R
 
M
T
|
T
E
 
E

Sites not aligning to the query:

5ha5D Crystal structure of an NAD-bound oxidoreductase from brucella ovis
36% identity, 84% coverage: 1:203/243 of query aligns to 3:192/244 of 5ha5D

query
sites
5ha5D
M
 
L
L
 
L
A
 
K
Q
 
E
K
 
K
I
 
L
A
 
V
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
R
|
R
G
|
G
L
|
L
G
 
G
L
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
S
G
 
S
L
 
G
L
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
C
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
L
V
 
V
G
x
D
R
x
I
R
 
D
E
 
G
G
 
T
P
 
A
L
 
A
Q
 
K
A
 
A
A
 
Q
C
 
A
A
 
D
E
 
A
L
 
L
A
 
T
G
 
A
R
 
K
G
 
G
L
 
F
A
 
V
V
 
A
A
 
E
A
 
G
L
 
H
V
 
A
A
x
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
R
 
D
G
 
R
E
 
D
D
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
D
F
 
D
L
 
I
E
 
L
R
 
S
E
 
R
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
A
F
 
F
L
 
D
E
 
Q
P
 
P
H
 
E
D
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
A
L
 
V
R
 
E
V
 
V
D
 
W
P
 
D
A
 
R
L
 
V
V
 
I
A
 
G
A
 
V
T
 
N
L
 
L
E
 
E
A
 
-
N
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
G
P
 
A
L
 
F
R
 
N
L
 
V
M
 
S
Q
 
H
A
 
A
L
 
L
V
 
V
P
 
P
L
 
A
M
 
L
R
 
-
R
 
K
R
 
A
G
 
A
W
 
K
G
 
G
R
 
N
I
 
V
V
 
V
N
 
H
V
 
L
S
 
C
S
|
S
G
 
V
M
 
A
G
 
G
Q
 
F
L
 
V
S
 
S
T
 
-
M
 
-
G
 
G
G
 
G
A
 
S
W
 
T
P
 
A
G
 
G
Y
|
Y
R
 
V
A
 
V
S
 
S
K
|
K
T
 
G
A
 
A
L
 
I
N
 
R
A
 
S
L
 
L
T
 
T
R
 
Q
I
 
V
L
 
M
A
 
A
A
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
P
E
 
H
G
 
G
A
 
-
A
 
-
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
|
G
W
 
I
C
x
M
R
 
M
T
x
S
E
 
E
M
 
M

7w61A Crystal structure of farnesol dehydrogenase from helicoverpa armigera (see paper)
31% identity, 91% coverage: 5:226/243 of query aligns to 9:231/249 of 7w61A

query
sites
7w61A
K
 
K
I
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
C
G
 
V
L
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
N
Q
 
A
G
 
G
C
 
I
R
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
G
V
 
V
G
x
A
R
|
R
R
|
R
E
 
T
G
 
G
P
 
P
L
 
I
Q
 
E
A
 
E
A
 
L
C
 
K
A
 
T
E
 
Q
L
 
V
A
 
K
G
 
G
R
 
K
G
 
G
L
 
-
A
 
S
V
 
I
A
 
T
A
 
A
L
 
R
V
 
Q
A
x
C
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
S
G
 
P
E
 
E
D
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
E
L
 
T
A
 
F
A
 
K
F
 
W
L
 
I
E
 
D
R
 
D
E
 
N
Y
 
L
G
 
G
G
 
C
V
 
V
D
 
H
I
 
I
L
 
M
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
F
 
F
L
 
T
E
 
Q
P
 
-
H
 
G
D
 
G
F
 
I
A
 
T
D
 
D
P
 
V
A
 
G
S
 
G
G
 
D
S
 
M
L
 
I
L
 
S
R
 
E
V
 
K
D
 
D
P
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
I
A
 
M
A
 
S
T
 
V
L
 
I
E
 
D
A
x
I
N
 
N
T
 
L
L
 
K
A
 
G
P
 
P
L
 
I
R
 
L
L
 
C
M
 
S
-
 
R
Q
 
H
A
 
A
L
 
I
V
 
A
P
 
S
L
 
M
M
 
T
R
 
R
R
 
N
R
 
K
G
 
F
W
 
D
G
 
G
R
 
H
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
I
S
 
N
S
 
S
G
 
I
M
 
A
G
 
G
Q
 
H
L
 
Y
S
 
V
T
 
P
M
 
W
G
 
S
G
 
S
A
 
K
W
 
F
P
 
N
G
 
V
Y
|
Y
R
 
A
A
 
S
S
 
S
K
|
K
T
 
Y
A
 
G
L
 
L
N
 
T
A
 
G
L
 
F
T
 
S
R
 
A
I
 
S
L
 
L
A
 
L
A
 
N
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
D
E
 
H
G
 
K
A
 
N
A
 
K
I
 
I
K
 
K
V
 
V
N
 
T
A
 
S
V
 
V
C
 
S
P
|
P
G
|
G
W
x
L
C
x
V
R
 
R
T
|
T
E
x
A
M
|
M
-
 
T
-
 
V
G
 
A
G
 
A
S
 
D
D
 
D
A
 
S
Q
 
E
R
 
M
S
 
P
A
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
P
E
 
K
E
 
D
G
 
V
A
 
A
R
 
D
S
 
A
I
 
V
L
 
L
W
 
Y
A
 
V
A
 
I
T
 
S
L
 
T
P
 
P

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
33% identity, 83% coverage: 2:203/243 of query aligns to 5:189/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
L
 
L
A
 
Q
Q
 
D
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
R
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
L
A
 
E
V
 
A
A
 
A
G
 
R
L
 
V
L
 
F
A
 
M
E
 
K
Q
 
E
G
 
G
C
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
A
G
x
D
R
x
F
R
 
N
E
 
E
G
 
-
P
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
A
A
 
A
C
 
G
A
 
K
E
 
E
L
 
A
A
 
V
G
 
E
R
 
A
G
 
N
L
 
P
A
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
F
L
 
I
V
 
R
A
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
D
G
 
R
E
 
E
D
 
S
V
 
V
A
 
H
R
 
R
L
 
L
A
 
V
A
 
E
F
 
N
L
 
V
E
 
A
R
 
E
E
 
R
Y
 
F
G
 
G
G
 
K
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
F
 
T
L
 
R
E
x
D
P
 
-
H
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
S
S
 
M
G
 
L
S
 
S
L
x
K
L
 
M
R
 
T
V
 
V
D
 
D
P
 
Q
A
 
-
L
 
-
V
 
F
A
 
Q
A
 
Q
T
 
V
L
 
I
E
 
N
A
 
V
N
|
N
T
 
L
L
 
T
A
 
G
P
 
V
L
 
F
R
 
H
L
 
C
M
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
V
V
 
L
P
 
P
L
 
Y
M
 
M
R
 
A
R
 
E
R
 
Q
G
 
G
W
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
T
S
 
S
S
|
S
G
 
V
M
 
T
G
 
G
Q
 
T
L
 
Y
S
 
G
T
x
N
M
x
V
G
 
G
G
 
-
A
 
-
W
x
Q
P
 
T
G
 
N
Y
|
Y
R
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
T
 
A
A
 
G
L
 
V
N
 
I
A
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
K
I
 
T
L
 
W
A
 
A
A
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
K
G
 
G
A
 
-
A
 
-
I
 
I
K
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
W
x
F
C
x
T
R
 
E
T
|
T
E
 
A
M
|
M

Sites not aligning to the query:

3tzcA Crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg)(y155f) from vibrio cholerae (see paper)
33% identity, 87% coverage: 2:212/243 of query aligns to 6:181/224 of 3tzcA

query
sites
3tzcA
L
 
L
A
 
E
Q
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
C
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
G
V
 
T
G
x
A
R
x
T
R
 
S
E
 
E
G
 
S
P
 
G
L
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
I
C
 
S
A
 
D
E
 
Y
L
 
L
A
 
G
-
 
D
-
 
N
G
 
G
R
 
K
G
 
G
L
 
M
A
 
A
V
 
L
A
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
D
x
N
V
|
V
T
 
T
R
 
N
G
 
P
E
 
E
D
 
S
V
 
I
A
 
E
R
 
A
L
 
V
A
 
L
A
 
K
F
 
A
L
 
I
E
 
T
R
 
D
E
 
E
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
V
x
I
F
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
H
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
T
L
 
R
L
 
M
R
 
R
V
 
M
D
 
K
P
 
E
A
 
E
L
 
E
V
 
W
A
 
S
A
 
D
T
 
I
L
 
M
E
 
E
A
x
T
N
 
N
T
 
L
L
 
T
A
 
S
P
 
I
L
 
F
R
 
R
L
 
L
M
 
S
Q
 
K
A
 
A
L
 
V
V
 
L
P
 
R
L
 
G
M
 
M
R
 
M
R
 
K
R
 
K
G
 
R
W
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
V
S
 
G
S
 
S
G
 
V
M
 
V
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
S
 
-
T
 
-
M
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
W
 
-
P
 
-
G
 
-
Y
 
-
R
 
-
A
 
A
S
 
A
K
 
K
T
 
A
A
 
G
L
 
V
N
 
I
A
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
I
 
S
L
 
M
A
 
A
A
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
S
E
 
R
G
 
G
A
 
-
A
 
-
I
 
V
K
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
F
C
 
I
R
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
G
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
D
A
 
E
Q
 
Q
R
 
R
S
 
T
A
 
A

5yssB Crystal structure of aminocaproic acid cyclase in complex with NAD (+) (see paper)
33% identity, 89% coverage: 2:217/243 of query aligns to 2:202/255 of 5yssB

query
sites
5yssB
L
 
L
A
 
T
Q
 
G
K
 
K
I
 
T
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
x
T
R
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
L
A
 
G
V
 
I
A
 
A
G
 
Q
L
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
Q
 
A
G
 
G
C
 
A
R
 
T
V
 
L
V
 
I
L
 
L
V
 
N
G
|
G
R
x
F
R
 
-
E
 
-
G
 
G
P
 
D
L
 
V
Q
 
D
A
 
A
A
 
A
C
 
K
A
 
D
E
 
A
L
 
V
A
 
A
G
 
Q
R
 
Y
G
 
G
L
 
K
A
 
T
V
 
P
A
 
G
A
 
Y
L
 
H
V
 
G
A
 
A
D
 
D
V
x
L
T
 
S
R
 
D
G
 
E
E
 
A
D
 
Q
V
 
I
A
 
A
R
 
D
L
 
M
A
 
M
A
 
R
F
 
Y
L
 
A
E
 
E
R
 
S
E
 
E
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
x
I
F
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
H
 
-
D
 
Q
F
 
H
A
 
V
D
 
S
P
 
P
A
 
I
S
 
E
G
 
T
S
 
F
L
 
P
L
 
V
R
 
D
V
 
K
D
 
W
P
 
N
A
 
A
L
 
I
V
 
I
A
 
A
A
 
I
T
 
N
L
 
L
E
 
-
A
 
S
N
 
S
T
 
V
L
 
F
A
 
H
P
 
T
L
 
T
R
 
R
L
 
L
M
 
A
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
L
P
 
P
L
 
G
M
 
M
R
 
R
R
 
A
R
 
R
G
 
N
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
S
x
A
S
 
S
G
 
V
M
 
H
G
 
G
Q
 
L
L
 
V
S
 
A
T
 
S
M
 
K
G
 
E
G
 
K
A
 
S
W
 
-
P
 
-
G
 
A
Y
|
Y
R
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
T
 
H
A
 
G
L
 
V
N
 
V
A
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
I
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
L
E
 
E
L
 
T
A
 
A
A
 
Q
E
 
-
G
 
-
A
 
T
A
 
E
I
 
I
K
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
L
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
 
W
C
x
V
R
 
L
T
|
T
E
 
P
M
 
L
G
 
V
G
 
Q
S
 
Q
D
 
Q
A
 
I
Q
 
D
R
 
K
S
 
R
A
 
I
E
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
E

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
36% identity, 85% coverage: 5:211/243 of query aligns to 6:198/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
K
 
K
I
 
I
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
|
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
E
L
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
R
G
 
G
C
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
G
V
 
T
G
 
A
R
x
T
R
 
S
E
 
E
G
 
N
P
 
G
L
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
I
C
 
S
A
 
D
E
 
Y
L
 
L
A
 
G
G
 
A
R
 
N
G
 
G
L
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
K
A
 
G
L
 
L
V
 
M
A
 
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
R
 
-
G
 
-
E
 
-
D
 
D
V
 
P
A
 
A
R
 
S
L
 
I
A
 
E
A
 
S
F
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
A
E
 
E
Y
 
F
G
 
G
G
 
E
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
F
 
T
L
 
R
E
 
D
P
 
N
H
 
L
D
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
L
L
 
M
R
 
R
V
 
M
D
 
K
P
 
D
A
 
E
L
 
E
V
 
W
A
 
N
A
 
D
T
 
I
L
 
I
E
 
E
A
 
T
N
 
N
T
 
L
L
 
S
A
 
S
P
 
V
L
 
F
R
 
R
L
 
L
M
 
S
Q
 
K
A
 
A
L
 
V
V
 
M
P
 
R
L
 
A
M
 
M
R
 
M
R
 
K
R
 
K
G
 
R
W
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
I
S
 
G
S
 
S
G
 
V
M
 
V
G
 
G
Q
 
-
L
 
-
S
 
-
T
 
T
M
 
M
G
 
G
-
 
N
G
 
G
A
 
G
W
 
Q
P
 
A
G
 
N
Y
|
Y
R
x
A
A
|
A
S
x
A
K
|
K
T
 
A
A
 
G
L
 
L
N
 
I
A
 
G
L
 
F
T
 
S
R
 
K
I
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
S
E
 
R
G
 
G
A
 
-
A
 
-
I
 
I
K
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
F
C
x
I
R
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
G
 
T
G
 
R
-
 
A
-
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
D
Q
 
Q
R
 
R
S
 
A

Sites not aligning to the query:

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
36% identity, 85% coverage: 5:211/243 of query aligns to 5:197/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
K
 
K
I
 
I
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
E
L
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
R
G
 
G
C
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
G
V
 
T
G
 
A
R
x
T
R
 
S
E
 
E
G
 
N
P
 
G
L
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
I
C
 
S
A
 
D
E
 
Y
L
 
L
A
 
G
G
 
A
R
 
N
G
 
G
L
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
K
A
 
G
L
 
L
V
 
M
A
 
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
R
 
-
G
 
-
E
 
-
D
 
D
V
 
P
A
 
A
R
 
S
L
 
I
A
 
E
A
 
S
F
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
A
E
 
E
Y
 
F
G
 
G
G
 
E
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
F
 
T
L
 
R
E
 
D
P
 
N
H
 
L
D
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
L
L
 
M
R
 
R
V
 
M
D
 
K
P
 
D
A
 
E
L
x
E
V
 
W
A
 
N
A
 
D
T
 
I
L
 
I
E
 
E
A
 
T
N
 
N
T
 
L
L
 
S
A
 
S
P
 
V
L
 
F
R
 
R
L
 
L
M
 
S
Q
 
K
A
 
A
L
 
V
V
 
M
P
 
R
L
 
A
M
 
M
R
 
M
R
 
K
R
 
K
G
 
R
W
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
I
S
 
G
S
|
S
G
 
V
M
 
V
G
 
G
Q
 
-
L
 
-
S
 
-
T
 
T
M
 
M
G
 
G
-
 
N
G
 
G
A
 
G
W
x
Q
P
 
A
G
 
N
Y
|
Y
R
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
T
 
A
A
 
G
L
 
L
N
 
I
A
 
G
L
 
F
T
 
S
R
 
K
I
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
S
E
 
R
G
 
G
A
 
-
A
 
-
I
 
I
K
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
F
C
x
I
R
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
G
 
T
G
 
R
-
 
A
-
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
D
Q
 
Q
R
 
R
S
 
A

Sites not aligning to the query:

4bmsF Short chain alcohol dehydrogenase from ralstonia sp. Dsm 6428 in complex with NADPH
33% identity, 93% coverage: 2:226/243 of query aligns to 4:210/249 of 4bmsF

query
sites
4bmsF
L
 
L
A
 
L
Q
 
N
K
 
K
I
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
N
R
x
S
G
 
G
L
x
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
T
A
 
A
G
 
K
L
 
R
L
 
F
A
 
V
E
 
A
Q
 
E
G
 
G
C
 
A
R
 
Y
V
 
V
V
 
F
L
 
I
V
 
V
G
 
G
R
|
R
R
|
R
E
 
R
G
 
K
P
 
E
L
 
L
Q
 
E
A
 
Q
A
 
A
C
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
I
A
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
G
L
 
R
A
 
N
V
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
V
V
 
K
A
|
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
R
 
K
G
 
L
E
 
E
D
 
D
V
 
L
A
 
D
R
 
R
L
 
L
A
 
Y
A
 
A
F
 
I
L
 
V
E
 
R
R
 
E
E
 
Q
Y
 
R
G
 
G
G
 
S
V
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
F
N
 
A
N
|
N
A
x
S
G
|
G
V
 
A
F
 
I
L
 
E
E
 
Q
P
 
K
H
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
T
L
 
L
L
 
E
R
 
E
V
 
I
D
 
T
P
 
P
A
 
E
L
 
H
V
 
Y
A
 
D
A
 
R
T
 
T
L
 
F
E
 
D
A
x
V
N
 
N
T
 
V
L
 
R
A
 
G
P
 
L
L
 
I
R
 
F
L
 
T
M
 
V
Q
 
Q
A
 
K
L
 
A
V
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
L
R
 
-
R
 
-
R
 
R
G
 
D
W
 
G
G
 
G
R
 
S
I
 
V
V
 
I
N
 
L
V
 
T
S
 
S
S
|
S
G
 
V
M
 
A
G
 
G
Q
 
V
L
 
L
S
 
G
T
 
L
M
 
Q
G
 
-
G
 
-
A
 
A
W
x
H
P
 
D
G
 
T
Y
|
Y
R
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
T
 
A
A
 
A
L
 
V
N
 
R
A
 
S
L
 
L
T
 
A
R
 
R
I
 
T
L
 
W
A
 
T
A
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
-
A
 
-
E
 
K
G
 
G
A
 
R
A
 
S
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
S
P
 
P
G
|
G
W
 
A
C
x
I
R
 
D
T
|
T
E
 
P
M
x
I
G
 
-
G
 
-
S
 
I
D
 
E
A
 
N
Q
 
Q
R
 
V
S
 
S
A
 
T
E
x
Q
E
 
E
G
 
E
A
 
A
R
 
D
S
 
E
I
 
L
-
 
R
-
 
A
L
 
K
W
 
F
A
 
A
A
 
A
T
 
A
L
 
T
P
 
P

Query Sequence

>Dsui_0680 FitnessBrowser__PS:Dsui_0680
MLAQKIAVVTGAARGLGLAVAGLLAEQGCRVVLVGRREGPLQAACAELAGRGLAVAALVA
DVTRGEDVARLAAFLEREYGGVDILVNNAGVFLEPHDFADPASGSLLRVDPALVAATLEA
NTLAPLRLMQALVPLMRRRGWGRIVNVSSGMGQLSTMGGAWPGYRASKTALNALTRILAA
ELAAEGAAIKVNAVCPGWCRTEMGGSDAQRSAEEGARSILWAATLPDDGPSGGFFRDGQP
LDW

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory