SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Dsui_0929 FitnessBrowser__PS:Dsui_0929 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4ysbA Crystal structure of ethe1 from myxococcus xanthus (see paper)
45% identity, 94% coverage: 2:224/238 of query aligns to 1:224/225 of 4ysbA

query
sites
4ysbA
F
 
M
I
 
I
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
R
 
F
D
 
D
S
 
S
S
 
E
S
 
S
A
 
S
T
 
T
Y
 
Y
T
 
T
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
T
R
 
R
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
L
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
L
E
 
E
Q
 
Q
S
 
V
P
 
D
L
 
R
Y
 
D
L
 
L
G
 
Q
L
 
M
L
 
V
G
 
A
E
 
E
L
 
L
E
 
D
L
 
L
N
 
T
L
 
L
A
 
T
C
 
H
V
 
V
V
 
F
D
 
D
T
 
T
H
|
H
L
 
V
H
|
H
S
 
A
D
|
D
H
|
H
L
 
I
S
 
T
A
 
A
A
 
S
P
 
G
T
 
A
L
 
L
I
 
R
R
 
E
H
 
R
T
 
T
G
 
Q
C
 
A
L
 
T
Y
 
-
A
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
S
C
 
V
S
 
N
G
 
G
I
 
A
G
 
S
G
 
C
T
 
A
D
 
N
R
 
V
Q
 
Q
L
 
V
A
 
R
D
 
H
G
 
G
D
 
D
S
 
E
L
 
V
D
 
R
L
 
V
A
 
G
D
 
Q
L
 
L
H
 
V
L
 
F
E
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
D
G
 
D
C
 
S
I
 
I
T
 
S
L
 
Y
L
 
L
W
 
L
E
 
G
D
 
D
R
 
R
L
 
V
L
 
F
T
 
T
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
V
G
 
R
S
 
G
C
 
N
G
 
G
A
 
R
T
 
T
G
 
D
E
 
F
P
 
Q
G
 
N
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
S
T
 
Q
H
 
L
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
V
 
L
T
 
T
R
 
R
K
 
V
L
 
L
L
 
F
P
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
D
E
 
E
L
 
T
L
 
L
V
 
V
F
 
Y
P
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
D
R
 
Y
D
 
K
G
 
G
R
 
R
R
 
T
V
 
V
S
 
T
C
 
S
I
 
I
G
 
A
D
 
E
E
 
E
R
 
K
Q
 
R
G
 
H
N
 
N
P
 
P
L
 
R
F
 
V
C
 
A
G
 
G
I
 
K
S
 
S
R
 
R
D
 
E
E
 
E
F
 
F
-
 
I
-
 
H
M
 
I
A
 
M
Q
 
E
D
 
N
R
 
L
S
 
N
Q
 
L
P
 
P
M
 
R
G
 
P
E
 
K
R
 
L
A
 
I
E
 
D
A
 
A
M
 
A
L
 
V
A
 
P
A
 
A
N
 
N
R
 
R
Q
 
A
G
 
C
G
 
G

5ve5A Crystal structure of persulfide dioxygenase rhodanese fusion protein with rhodanese domain inactivating mutation (c314s) from burkholderia phytofirmans in complex with glutathione (see paper)
43% identity, 82% coverage: 1:194/238 of query aligns to 3:198/350 of 5ve5A

query
sites
5ve5A
M
 
M
F
 
L
I
 
I
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
R
 
F
D
 
D
S
 
Q
S
 
Q
S
 
S
A
 
S
T
 
T
Y
 
Y
T
 
T
Y
 
Y
L
 
L
I
 
L
G
 
A
S
 
D
R
 
S
A
 
T
S
 
T
R
|
R
A
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
F
E
 
E
Q
 
Q
S
 
V
P
 
R
L
 
R
Y
 
D
L
 
A
G
 
A
L
 
L
L
 
I
G
 
E
E
 
E
L
 
L
E
 
G
L
 
L
N
 
H
L
 
L
A
 
L
C
 
Y
V
 
T
V
 
I
D
 
D
T
 
T
H
|
H
L
 
V
H
|
H
S
 
A
D
|
D
H
|
H
L
 
V
S
 
T
A
 
G
A
 
A
P
 
W
T
 
M
L
 
L
I
 
N
R
 
R
H
 
R
T
 
I
G
 
G
C
 
S
L
 
R
Y
 
I
A
 
A
A
 
I
G
 
S
L
 
A
C
 
A
S
 
S
G
 
G
I
 
A
G
 
E
G
 
G
T
 
A
D
 
D
R
 
R
Q
 
Y
L
 
L
A
 
S
D
 
H
G
 
G
D
 
D
S
 
K
L
 
V
D
 
E
L
 
F
A
 
G
D
 
T
L
 
R
H
 
Y
L
 
L
E
 
T
V
 
V
L
 
R
A
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
D
G
 
G
C
 
C
I
 
I
T
 
T
L
 
L
L
 
V
W
 
L
E
 
D
D
 
N
R
 
E
L
 
T
L
 
M
-
 
A
-
 
F
T
 
T
G
 
G
D
|
D
A
 
C
L
 
L
L
 
L
I
 
I
G
 
R
S
 
G
C
 
T
G
|
G
A
x
R
T
 
T
G
 
D
E
 
F
P
 
Q
G
 
R
G
 
G
N
 
D
A
 
A
G
 
H
T
 
T
H
 
M
Y
 
F
D
 
R
S
 
A
V
 
V
T
 
H
R
 
G
K
 
Q
L
 
I
L
 
F
P
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
T
E
 
A
L
 
C
L
 
L
V
 
L
F
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
|
H
D
 
D
R
x
Y
D
 
R
G
 
G
R
 
L
R
 
T
V
 
V
S
 
T
C
 
S
I
 
V
G
 
G
D
 
E
E
 
E
R
 
R
Q
 
R
G
 
F
N
 
N
P
 
P
L
 
R
F
 
L
C
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4chlB Human ethylmalonic encephalopathy protein 1 (hethe1) (see paper)
39% identity, 94% coverage: 2:224/238 of query aligns to 7:232/237 of 4chlB

query
sites
4chlB
F
 
I
I
 
L
F
 
L
R
 
R
Q
 
Q
L
 
M
R
 
F
D
 
E
S
 
P
S
 
V
S
 
S
A
 
C
T
 
T
Y
 
F
T
 
T
Y
 
Y
L
 
L
I
 
L
G
 
G
S
 
D
R
 
R
A
 
E
S
 
S
R
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
L
E
 
E
Q
 
T
S
 
A
P
 
P
L
 
R
Y
 
D
L
 
A
G
 
Q
L
 
L
L
 
I
G
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
G
L
 
L
N
 
R
L
 
L
A
 
L
C
 
Y
V
 
A
V
 
V
D
 
N
T
 
T
H
|
H
L
 
C
H
|
H
S
 
A
D
|
D
H
|
H
L
 
I
S
 
T
A
 
G
A
 
S
P
 
-
T
 
G
L
 
L
I
 
L
R
 
R
H
 
S
-
 
L
-
 
L
T
 
P
G
 
G
C
 
C
L
 
Q
Y
 
S
A
 
V
A
 
I
G
 
S
L
 
R
C
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
-
G
 
A
G
 
Q
T
 
A
D
 
D
R
 
L
Q
 
H
L
 
I
A
 
E
D
 
D
G
 
G
D
 
D
S
 
S
L
 
I
D
 
R
L
 
F
A
 
G
D
 
R
L
 
F
H
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
T
L
 
R
A
 
A
T
 
S
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
C
 
C
I
 
V
T
 
T
L
 
F
L
 
V
W
 
L
E
 
N
D
 
D
R
 
H
-
 
S
-
 
M
L
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
I
G
 
R
S
 
G
C
 
C
G
 
G
A
 
R
T
 
T
G
 
D
E
 
F
P
 
Q
G
 
Q
G
 
G
N
 
C
A
 
A
G
 
K
T
 
T
H
 
L
Y
 
Y
D
 
H
S
 
S
V
 
V
T
 
H
R
 
E
K
 
K
L
 
I
L
 
F
P
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
G
E
 
D
L
 
C
L
 
L
V
 
I
F
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
|
H
D
 
D
R
 
Y
D
 
H
G
 
G
R
 
F
R
 
T
V
 
V
S
 
S
C
 
T
I
 
V
G
 
E
D
 
E
E
 
E
R
 
R
Q
 
T
G
 
L
N
 
N
P
 
P
L
 
R
F
 
L
C
 
-
G
 
T
I
 
L
S
 
S
R
 
C
D
 
E
E
 
E
F
 
F
M
 
V
A
 
K
Q
 
I
-
 
M
-
 
G
D
 
N
R
 
L
S
 
N
Q
 
L
P
 
P
M
 
K
G
 
P
E
 
Q
R
 
Q
A
 
I
E
 
D
A
 
F
M
 
A
L
 
V
A
 
P
A
 
A
N
 
N
R
 
M
Q
 
R
G
 
C
G
 
G

O95571 Persulfide dioxygenase ETHE1, mitochondrial; Ethylmalonic encephalopathy protein 1; Hepatoma subtracted clone one protein; Sulfur dioxygenase ETHE1; EC 1.13.11.18 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
39% identity, 94% coverage: 2:224/238 of query aligns to 23:248/254 of O95571

query
sites
O95571
F
 
I
I
 
L
F
 
L
R
 
R
Q
 
Q
L
 
M
R
 
F
D
 
E
S
 
P
S
 
V
S
 
S
A
 
C
T
 
T
Y
 
F
T
 
T
Y
 
Y
L
 
L
I
 
L
G
 
G
S
 
D
R
 
R
A
 
E
S
 
S
R
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
x
L
E
 
E
Q
 
T
S
 
A
P
 
P
L
 
R
Y
 
D
L
 
A
G
 
Q
L
 
L
L
 
I
G
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
G
L
 
L
N
 
R
L
 
L
A
 
L
C
 
Y
V
 
A
V
 
V
D
 
N
T
 
T
H
|
H
L
 
C
H
 
H
S
 
A
D
 
D
H
 
H
L
 
I
S
 
T
A
 
G
A
 
S
P
 
-
T
 
G
L
 
L
I
 
L
R
 
R
H
 
S
T
 
L
-
 
L
-
 
P
G
 
G
C
 
C
L
 
Q
Y
 
S
A
 
V
A
 
I
G
 
S
L
 
R
C
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
-
G
 
A
G
 
Q
T
 
A
D
 
D
R
 
L
Q
 
H
L
 
I
A
 
E
D
 
D
G
 
G
D
 
D
S
 
S
L
 
I
D
 
R
L
 
F
A
 
G
D
 
R
L
 
F
H
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
T
L
 
R
A
 
A
T
 
S
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
C
 
C
I
 
V
T
 
T
L
 
F
L
 
V
W
 
L
E
 
N
D
 
D
R
 
H
-
 
S
-
 
M
L
 
A
L
 
F
T
|
T
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
I
G
 
R
S
 
G
C
 
C
G
 
G
A
 
R
T
|
T
G
 
D
E
 
F
P
 
Q
G
 
Q
G
 
G
N
 
C
A
 
A
G
 
K
T
 
T
H
 
L
Y
 
Y
D
 
H
S
 
S
V
 
V
T
 
H
R
 
E
K
 
K
L
 
I
L
 
F
P
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
G
E
 
D
L
 
C
L
 
L
V
 
I
F
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
 
H
D
|
D
R
 
Y
D
 
H
G
 
G
R
 
F
R
 
T
V
 
V
S
 
S
C
 
T
I
 
V
G
 
E
D
 
E
E
 
E
R
 
R
Q
 
T
G
 
L
N
 
N
P
 
P
L
 
R
F
 
L
C
 
T
G
 
-
I
 
L
S
 
S
R
 
C
D
 
E
E
 
E
F
 
F
M
 
V
A
 
K
Q
 
I
-
 
M
-
 
G
D
 
N
R
 
L
S
 
N
Q
 
L
P
 
P
M
 
K
G
 
P
E
 
Q
R
 
Q
A
 
I
E
 
D
A
 
F
M
 
A
L
 
V
A
 
P
A
 
A
N
 
N
R
 
M
Q
 
R
G
 
C
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q9C8L4 Persulfide dioxygenase ETHE1 homolog, mitochondrial; Glyoxalase II; Glx II; Sulfur dioxygenase ETHE1; EC 1.13.11.18 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
38% identity, 79% coverage: 2:190/238 of query aligns to 52:250/294 of Q9C8L4

query
sites
Q9C8L4
F
 
L
I
 
L
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
R
 
F
D
 
E
S
 
N
S
 
E
S
 
S
A
 
S
T
 
T
Y
 
F
T
 
T
Y
 
Y
L
 
L
I
 
L
G
 
A
-
 
D
-
 
V
S
 
S
R
 
H
A
 
P
S
 
D
R
 
K
A
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
D
E
 
K
Q
 
T
S
 
V
P
 
D
L
 
R
Y
 
D
L
 
L
G
 
K
L
 
L
L
 
I
G
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
G
L
 
L
N
 
K
L
 
L
A
 
I
C
 
Y
V
 
A
V
 
M
D
 
N
T
 
T
H
|
H
L
 
V
H
 
H
S
 
A
D
 
D
H
 
H
L
 
V
S
 
T
A
 
G
A
 
T
P
 
G
T
 
L
L
 
L
-
 
K
I
 
T
R
 
K
H
 
L
T
 
P
G
 
G
C
 
V
L
 
K
Y
 
S
A
 
V
A
 
I
G
 
S
L
 
K
C
 
A
S
 
S
G
 
G
I
 
-
G
 
S
G
 
K
T
 
A
D
 
D
R
 
L
Q
 
F
L
 
L
A
 
E
D
 
P
G
 
G
D
 
D
S
 
K
L
 
V
D
 
S
L
 
I
A
 
G
D
 
D
L
 
I
H
 
Y
L
 
L
E
 
E
V
 
V
L
 
R
A
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
A
G
 
G
C
 
C
I
 
V
T
 
T
L
 
Y
L
 
V
W
 
T
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
D
-
 
Q
-
 
P
E
 
Q
D
 
P
R
 
R
L
 
M
-
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
V
L
 
L
I
 
I
G
 
R
S
 
G
C
 
C
G
 
G
A
 
R
T
 
T
G
 
D
E
 
F
P
 
Q
G
 
E
G
 
G
N
 
S
A
 
S
G
 
D
T
 
Q
H
 
L
Y
 
Y
D
 
E
S
 
S
V
 
V
T
 
H
R
 
S
K
 
Q
L
 
I
L
 
F
P
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
K
E
 
D
L
 
T
L
 
L
V
 
I
F
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
 
H
D
 
D
R
 
Y
D
 
K
G
 
G
R
 
F
R
 
E
V
 
V
S
 
S
C
 
T
I
 
V
G
 
G
D
 
E
E
 
E
R
 
M
Q
 
Q
G
 
H
N
 
N
P
 
P

2gcuA X-ray structure of gene product from arabidopsis thaliana at1g53580 (see paper)
38% identity, 79% coverage: 2:190/238 of query aligns to 3:201/244 of 2gcuA

query
sites
2gcuA
F
 
L
I
 
L
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
R
 
F
D
 
E
S
 
N
S
 
E
S
 
S
A
 
S
T
 
T
Y
 
F
T
 
T
Y
 
Y
L
 
L
I
 
L
G
 
A
-
 
D
-
 
V
S
 
S
R
 
H
A
 
P
S
 
D
R
 
K
A
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
D
E
 
K
Q
 
T
S
 
V
P
 
D
L
 
R
Y
 
D
L
 
L
G
 
K
L
 
L
L
 
I
G
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
G
L
 
L
N
 
K
L
 
L
A
 
I
C
 
Y
V
 
A
V
 
M
D
 
N
T
 
T
H
|
H
L
 
V
H
|
H
S
 
A
D
|
D
H
|
H
L
 
V
S
 
T
A
 
G
A
 
T
P
 
G
T
 
L
L
 
L
-
 
K
I
 
T
R
 
K
H
 
L
T
 
P
G
 
G
C
 
V
L
 
K
Y
 
S
A
 
V
A
 
I
G
 
S
L
 
K
C
 
A
S
 
S
G
 
G
I
 
-
G
 
S
G
 
K
T
 
A
D
 
D
R
 
L
Q
 
F
L
 
L
A
 
E
D
 
P
G
 
G
D
 
D
S
 
K
L
 
V
D
 
S
L
 
I
A
 
G
D
 
D
L
 
I
H
 
Y
L
 
L
E
 
E
V
 
V
L
 
R
A
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
A
G
 
G
C
 
C
I
 
V
T
 
T
L
 
Y
L
 
V
W
 
T
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
D
-
 
Q
-
 
P
E
 
Q
D
 
P
R
 
R
L
 
M
-
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
V
L
 
L
I
 
I
G
 
R
S
 
G
C
 
C
G
 
G
A
 
R
T
 
T
G
 
D
E
 
F
P
 
Q
G
 
E
G
 
G
N
 
S
A
 
S
G
 
D
T
 
Q
H
 
L
Y
 
Y
D
 
E
S
 
S
V
 
V
T
 
H
R
 
S
K
 
Q
L
 
I
L
 
F
P
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
K
E
 
D
L
 
T
L
 
L
V
 
I
F
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
|
H
D
 
D
R
 
Y
D
 
K
G
 
G
R
 
F
R
 
E
V
 
V
S
 
S
C
 
T
I
 
V
G
 
G
D
 
E
E
 
E
R
 
M
Q
 
Q
G
 
H
N
 
N
P
 
P

4yslA Crystal structure of sdoa from pseudomonas putida in complex with glutathione (see paper)
30% identity, 82% coverage: 7:202/238 of query aligns to 12:248/294 of 4yslA

query
sites
4yslA
L
 
F
R
 
Y
D
 
D
S
 
E
S
 
A
S
 
T
A
 
S
T
 
T
Y
 
I
T
 
S
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
G
 
M
S
 
D
R
 
R
A
 
E
S
 
T
R
 
R
A
 
Q
A
 
C
L
 
A
L
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
S
V
 
V
A
 
L
E
 
D
Q
 
Y
S
 
D
P
 
P
L
 
K
-
 
S
-
 
G
-
 
R
-
 
T
-
 
C
-
 
S
-
 
A
-
 
S
-
 
A
-
 
D
-
 
R
Y
 
L
L
 
V
G
 
E
L
 
R
L
 
V
G
 
N
E
 
E
L
 
L
E
 
N
L
 
A
N
 
S
L
 
V
A
 
R
C
 
W
V
 
V
V
 
L
D
 
E
T
 
T
H
|
H
L
 
V
H
 
H
S
 
A
D
 
D
H
 
H
L
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
A
P
 
A
T
 
Y
L
 
L
I
 
K
R
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
G
-
 
G
H
 
H
T
 
T
-
 
A
-
 
I
-
 
G
-
 
A
-
 
H
-
 
I
-
 
T
-
 
Q
-
 
V
-
 
Q
-
 
K
-
 
V
-
 
F
G
 
G
C
 
A
L
 
L
Y
 
F
A
 
N
A
 
A
-
 
E
-
 
P
G
 
G
L
 
F
C
 
A
S
 
R
G
 
D
I
 
G
G
 
S
G
 
Q
T
 
F
D
 
D
R
 
V
Q
 
L
L
 
L
A
 
E
D
 
D
G
 
E
D
 
E
S
 
G
L
 
F
D
 
R
L
 
I
A
 
G
D
 
N
L
 
L
H
 
Q
L
 
A
E
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
A
C
 
C
I
 
M
T
 
S
L
 
F
L
 
M
W
 
I
E
 
E
D
 
D
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
I
R
 
A
L
 
V
L
 
F
T
 
V
G
 
G
D
|
D
A
 
T
L
 
L
L
 
F
I
 
M
G
 
P
S
 
D
C
 
Y
G
 
G
A
 
T
T
x
A
-
x
R
-
 
C
G
 
D
E
 
F
P
 
P
G
 
G
G
 
A
N
 
D
A
 
A
G
 
R
T
 
T
H
 
L
Y
 
Y
D
 
R
S
 
S
V
 
I
T
 
-
R
 
R
K
 
R
L
 
L
L
 
L
P
 
A
L
 
F
P
 
P
D
 
D
E
 
Q
L
 
T
L
 
R
V
 
L
F
 
F
P
 
M
G
 
C
H
 
H
D
 
D
-
x
Y
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
G
R
 
R
D
 
D
G
 
M
R
 
Q
R
 
Y
V
 
V
S
 
T
C
 
T
I
 
V
G
 
A
D
 
E
E
 
Q
R
 
R
Q
 
A
G
 
S
N
 
N
-
 
I
P
 
H
L
 
I
F
 
H
C
 
Q
G
 
G
I
 
I
S
 
D
R
 
E
D
 
D
E
 
S
F
 
F
M
 
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

4yskA Crystal structure of apo-form sdoa from pseudomonas putida (see paper)
30% identity, 82% coverage: 7:202/238 of query aligns to 12:248/294 of 4yskA

query
sites
4yskA
L
 
F
R
 
Y
D
 
D
S
 
E
S
 
A
S
 
T
A
 
S
T
 
T
Y
 
I
T
 
S
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
G
 
M
S
 
D
R
 
R
A
 
E
S
 
T
R
 
R
A
 
Q
A
 
C
L
 
A
L
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
S
V
 
V
A
 
L
E
 
D
Q
 
Y
S
 
D
P
 
P
L
 
K
-
 
S
-
 
G
-
 
R
-
 
T
-
 
C
-
 
S
-
 
A
-
 
S
-
 
A
-
 
D
-
 
R
Y
 
L
L
 
V
G
 
E
L
 
R
L
 
V
G
 
N
E
 
E
L
 
L
E
 
N
L
 
A
N
 
S
L
 
V
A
 
R
C
 
W
V
 
V
V
 
L
D
 
E
T
 
T
H
|
H
L
 
V
H
 
H
S
 
A
D
 
D
H
 
H
L
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
A
P
 
A
T
 
Y
L
 
L
I
 
K
R
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
G
-
 
G
H
 
H
T
 
T
-
 
A
-
 
I
-
 
G
-
 
A
-
 
H
-
 
I
-
 
T
-
 
Q
-
 
V
-
 
Q
-
 
K
-
 
V
-
 
F
G
 
G
C
 
A
L
 
L
Y
 
F
A
 
N
A
 
A
-
 
E
-
 
P
G
 
G
L
 
F
C
 
A
S
 
R
G
 
D
I
 
G
G
 
S
G
 
Q
T
 
F
D
 
D
R
 
V
Q
 
L
L
 
L
A
 
E
D
 
D
G
 
E
D
 
E
S
 
G
L
 
F
D
 
R
L
 
I
A
 
G
D
 
N
L
 
L
H
 
Q
L
 
A
E
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
A
C
 
C
I
 
M
T
 
S
L
 
F
L
 
M
W
 
I
E
 
E
D
 
D
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
I
R
 
A
L
 
V
L
 
F
T
 
V
G
 
G
D
|
D
A
 
T
L
 
L
L
 
F
I
 
M
G
 
P
S
 
D
C
 
Y
G
 
G
A
 
T
T
 
A
-
 
R
-
 
C
G
 
D
E
 
F
P
 
P
G
 
G
G
 
A
N
 
D
A
 
A
G
 
R
T
 
T
H
 
L
Y
 
Y
D
 
R
S
 
S
V
 
I
T
 
-
R
 
R
K
 
R
L
 
L
L
 
L
P
 
A
L
 
F
P
 
P
D
 
D
E
 
Q
L
 
T
L
 
R
V
 
L
F
 
F
P
 
M
G
 
C
H
 
H
D
 
D
-
 
Y
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
G
R
 
R
D
 
D
G
 
M
R
 
Q
R
 
Y
V
 
V
S
 
T
C
 
T
I
 
V
G
 
A
D
 
E
E
 
Q
R
 
R
Q
 
A
G
 
S
N
 
N
-
 
I
P
 
H
L
 
I
F
 
H
C
 
Q
G
 
G
I
 
I
S
 
D
R
 
E
D
 
D
E
 
S
F
 
F
M
 
V
A
 
A

2xf4A Crystal structure of salmonella enterica serovar typhimurium ycbl (see paper)
30% identity, 79% coverage: 4:192/238 of query aligns to 3:208/210 of 2xf4A

query
sites
2xf4A
F
 
Y
R
 
R
Q
 
I
L
 
I
R
 
P
D
 
V
S
 
T
S
 
A
S
 
F
A
 
S
T
 
Q
Y
 
N
T
 
C
Y
 
S
L
 
L
I
 
I
G
 
W
S
 
C
R
 
E
A
 
Q
S
 
T
R
 
R
A
 
L
A
 
A
L
 
A
L
 
L
V
 
V
D
 
D
P
 
P
V
 
G
A
 
G
E
 
D
Q
 
A
S
 
E
P
 
K
L
 
I
Y
 
K
L
 
Q
G
 
E
L
 
V
L
 
D
G
 
A
E
 
S
L
 
-
E
 
G
L
 
V
N
 
T
L
 
L
A
 
M
C
 
Q
V
 
I
V
 
L
D
 
L
T
 
T
H
 
H
L
 
G
H
 
H
S
 
L
D
|
D
H
|
H
L
 
V
S
 
G
A
 
A
A
 
A
P
 
S
T
 
E
L
 
L
I
 
A
R
 
Q
H
 
H
T
 
Y
G
 
G
C
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
E
-
 
D
-
 
E
L
 
F
Y
 
W
A
 
L
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
Q
-
 
S
-
 
R
-
 
M
-
 
F
-
 
G
-
 
L
-
 
D
-
 
E
C
 
C
S
 
Q
G
 
P
I
 
L
G
 
-
G
 
T
T
 
P
D
 
D
R
 
R
Q
 
W
L
 
L
A
 
N
D
 
D
G
 
G
D
 
D
S
 
R
L
 
V
D
 
S
L
 
V
A
 
G
D
 
N
L
 
V
H
 
T
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
H
T
 
C
P
 
P
G
 
G
H
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
C
 
H
I
 
V
T
 
V
L
 
F
L
 
F
W
 
D
E
 
E
D
 
Q
R
 
S
-
 
Q
-
 
L
L
 
L
L
 
I
T
 
S
G
 
G
D
|
D
A
 
V
L
 
I
L
 
F
I
 
K
G
 
G
S
 
G
C
 
V
G
 
G
A
 
R
T
 
S
G
 
D
E
 
F
P
 
P
G
 
R
G
 
G
N
 
D
A
 
H
G
 
T
T
 
Q
H
 
L
Y
 
I
D
 
D
S
 
A
V
 
I
T
 
K
R
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
L
P
 
P
L
 
L
P
 
G
D
 
D
E
 
D
L
 
V
L
 
T
V
 
F
F
 
I
P
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
G
R
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
P
V
 
L
S
 
S
C
 
T
I
 
L
G
 
G
D
 
Y
E
 
E
R
 
R
Q
 
L
G
 
H
N
 
N
P
 
P
L
 
F
F
 
L

4efzA Crystal structure of a hypothetical metallo-beta-lactamase from burkholderia pseudomallei
29% identity, 82% coverage: 9:202/238 of query aligns to 12:249/295 of 4efzA

query
sites
4efzA
D
 
D
S
 
P
S
 
A
S
 
T
A
 
C
T
 
T
Y
 
I
T
 
S
Y
 
Y
L
 
L
I
 
L
G
 
F
S
 
D
R
 
S
A
 
G
S
 
S
R
 
G
A
 
E
A
 
C
L
 
A
L
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
S
V
 
V
A
 
L
E
 
D
Q
 
Y
S
 
D
P
 
P
L
 
K
-
 
S
-
 
G
-
 
R
-
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
A
-
 
S
-
 
A
-
 
D
-
 
Q
Y
 
L
L
 
I
G
 
A
L
 
R
L
 
V
G
 
A
E
 
A
L
 
L
E
 
G
L
 
A
N
 
R
L
 
V
A
 
R
C
 
W
V
 
L
V
 
L
D
 
E
T
 
T
H
|
H
L
 
V
H
|
H
S
 
A
D
|
D
H
|
H
L
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
A
P
 
P
T
 
Y
L
 
L
I
 
K
-
 
T
-
 
R
-
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
I
-
 
G
R
 
R
H
 
H
T
 
V
-
 
T
-
 
R
-
 
V
-
 
Q
-
 
D
-
 
V
-
 
F
G
 
G
C
 
K
L
 
L
Y
 
F
A
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
P
C
 
A
S
 
F
G
 
A
I
 
H
G
 
D
G
 
G
T
 
S
-
 
Q
-
 
F
D
 
D
R
 
R
Q
 
L
L
 
L
A
 
D
D
 
D
G
 
G
D
 
D
S
 
T
L
 
L
D
 
A
L
 
L
A
 
G
D
 
A
L
 
L
H
 
S
L
 
I
E
 
R
V
 
A
L
 
M
A
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
A
C
 
C
I
 
M
T
 
T
L
 
Y
L
 
V
W
 
V
E
 
T
D
 
E
-
 
A
-
 
H
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
D
-
 
A
-
 
R
-
 
D
-
 
A
R
 
A
L
 
A
L
 
F
T
 
V
G
 
G
D
|
D
A
 
T
L
 
L
L
 
F
I
 
M
G
 
P
S
 
D
C
 
Y
G
 
G
A
 
T
T
 
A
-
 
R
-
 
C
G
 
D
E
 
F
P
 
P
G
 
G
G
 
G
N
 
D
A
 
A
G
 
R
T
 
S
H
 
L
Y
 
Y
D
 
R
S
 
S
V
 
I
T
 
-
R
 
R
K
 
K
L
 
V
L
 
L
P
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
P
E
 
A
L
 
T
L
 
R
V
 
L
F
 
Y
P
 
M
G
 
C
H
 
H
D
 
D
R
 
Y
D
 
Q
G
 
P
-
 
A
-
 
I
R
 
Q
R
 
Y
V
 
A
S
 
S
C
 
T
I
 
V
G
 
A
D
 
D
E
 
E
-
 
L
R
 
R
Q
 
E
G
 
N
N
 
V
P
 
H
L
 
I
F
 
R
C
 
E
G
 
G
I
 
V
S
 
T
R
 
E
D
 
D
E
 
D
F
 
F
M
 
V
A
 
A

3r2uB 2.1 angstrom resolution crystal structure of metallo-beta-lactamase from staphylococcus aureus subsp. Aureus col
26% identity, 96% coverage: 1:229/238 of query aligns to 5:251/336 of 3r2uB

query
sites
3r2uB
M
 
M
F
 
F
I
 
-
F
 
F
R
 
K
Q
 
Q
L
 
F
R
 
Y
D
 
D
S
 
K
S
 
H
S
 
L
A
 
S
T
 
Q
Y
 
A
T
 
S
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
C
R
 
Q
A
 
K
S
 
T
R
 
G
A
 
E
A
 
A
L
 
M
L
 
I
V
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
I
A
 
R
E
 
D
Q
 
L
S
 
S
P
 
S
L
 
-
Y
 
Y
L
 
I
G
 
R
L
 
V
L
 
A
G
 
D
E
 
E
L
 
E
E
 
G
L
 
L
N
 
T
L
 
I
A
 
T
C
 
H
V
 
A
V
 
A
D
 
E
T
 
T
H
|
H
L
 
I
H
|
H
S
 
A
D
|
D
H
x
F
L
 
A
S
 
S
A
 
G
A
 
I
P
 
R
T
 
D
L
 
V
-
 
A
I
 
I
R
 
K
H
 
L
T
 
N
G
 
A
C
 
N
L
 
I
Y
 
Y
A
 
V
A
 
S
G
 
G
L
 
E
C
 
S
S
 
D
G
 
D
I
 
T
G
 
L
G
 
G
T
 
Y
D
 
K
R
 
N
Q
 
M
-
 
P
-
 
N
-
 
H
-
 
T
-
 
H
-
 
F
L
 
V
A
 
Q
D
 
H
G
 
N
D
 
D
S
 
D
L
 
I
D
 
Y
L
 
V
A
 
G
D
 
N
L
 
I
H
 
K
L
 
L
E
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
E
C
 
S
I
 
I
T
 
S
L
 
F
L
 
L
W
 
L
E
 
T
D
 
D
R
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
Q
-
 
V
-
 
P
-
 
M
-
 
G
L
 
L
L
 
F
T
 
S
G
 
G
D
|
D
A
 
F
L
 
I
L
 
F
I
 
V
G
 
G
S
 
D
C
 
I
G
 
G
A
 
R
T
 
P
G
 
D
E
 
L
P
 
S
G
 
E
G
 
I
N
 
G
A
 
A
G
 
K
T
 
Q
H
 
M
Y
 
F
D
 
K
S
 
S
V
 
I
T
 
-
R
 
E
K
 
S
L
 
I
L
 
K
P
 
D
L
 
L
P
 
P
D
 
D
E
 
Y
L
 
I
L
 
Q
V
 
I
F
 
W
P
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
G
R
 
A
D
 
G
G
 
S
R
 
S
R
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
P
V
 
T
S
 
S
C
 
T
I
 
L
G
 
G
D
 
Y
E
 
E
R
 
K
Q
 
Q
G
 
T
N
 
N
P
 
W
L
 
A
F
 
F
C
 
S
G
 
E
I
 
N
S
 
N
R
 
E
D
 
A
E
 
T
F
 
F
M
 
I
A
 
D
Q
 
K
D
 
L
R
 
I
S
 
S
-
 
D
Q
 
Q
P
 
P
M
 
A
G
 
P
E
 
P
R
 
H
A
 
H
E
 
F
A
 
A
M
 
Q
L
 
M
A
 
K
A
 
K
N
 
I
R
 
N
Q
 
Q
G
 
F
G
 
G
G
 
M
S
 
N
V
 
L
L
 
Y
R
 
Q

Sites not aligning to the query:

3r2uA 2.1 angstrom resolution crystal structure of metallo-beta-lactamase from staphylococcus aureus subsp. Aureus col
25% identity, 96% coverage: 1:229/238 of query aligns to 3:263/348 of 3r2uA

query
sites
3r2uA
M
 
M
F
 
F
I
 
-
F
 
F
R
 
K
Q
 
Q
L
 
F
R
 
Y
D
 
D
S
 
K
S
 
H
S
 
L
A
 
S
T
 
Q
Y
 
A
T
 
S
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
C
R
 
Q
A
 
K
S
 
T
R
 
G
A
 
E
A
 
A
L
 
M
L
 
I
V
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
I
A
 
R
E
 
D
Q
 
L
S
 
S
P
 
S
L
 
-
Y
 
Y
L
 
I
G
 
R
L
 
V
L
 
A
G
 
D
E
 
E
L
 
E
E
 
G
L
 
L
N
 
T
L
 
I
A
 
T
C
 
H
V
 
A
V
 
A
D
 
E
T
 
T
H
|
H
L
 
I
H
|
H
S
 
A
D
|
D
H
x
F
L
 
A
S
 
S
A
 
G
A
 
I
P
 
R
T
 
D
L
 
V
-
 
A
I
 
I
R
 
K
H
 
L
T
 
N
G
 
A
C
 
N
L
 
I
Y
 
Y
A
 
V
A
 
S
G
 
G
L
 
E
C
 
S
S
 
D
G
 
D
I
 
T
G
 
L
G
 
G
T
 
Y
D
 
K
R
 
N
Q
 
M
-
 
P
-
 
N
-
 
H
-
 
T
-
 
H
-
 
F
L
 
V
A
 
Q
D
 
H
G
 
N
D
 
D
S
 
D
L
 
I
D
 
Y
L
 
V
A
 
G
D
 
N
L
 
I
H
 
K
L
 
L
E
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
E
C
 
S
I
 
I
T
 
S
L
 
F
L
 
L
W
 
L
E
 
T
D
 
D
R
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
Q
-
 
V
-
 
P
-
 
M
-
 
G
L
 
L
L
 
F
T
 
S
G
 
G
D
|
D
A
 
F
L
 
I
L
 
F
I
 
V
G
 
G
S
 
D
C
 
I
G
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
K
A
 
V
T
 
E
G
 
G
E
 
S
P
 
S
G
 
E
G
 
I
N
 
G
A
 
A
G
 
K
T
 
Q
H
 
M
Y
 
F
D
 
K
S
 
S
V
 
I
T
 
-
R
 
E
K
 
S
L
 
I
L
 
K
P
 
D
L
 
L
P
 
P
D
 
D
E
 
Y
L
 
I
L
 
Q
V
 
I
F
 
W
P
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
G
R
 
A
D
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
C
G
 
G
R
 
K
R
 
S
V
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
P
-
 
T
S
 
S
C
 
T
I
 
L
G
 
G
D
 
Y
E
 
E
R
 
K
Q
 
Q
G
 
T
N
 
N
P
 
W
L
 
A
F
 
F
C
 
S
G
 
E
I
 
N
S
 
N
R
 
E
D
 
A
E
 
T
F
 
F
M
 
I
A
 
D
Q
 
K
D
 
L
R
 
I
S
 
S
-
 
D
Q
 
Q
P
 
P
M
 
A
G
 
P
E
 
P
R
 
H
A
 
H
E
 
F
A
 
A
M
 
Q
L
 
M
A
 
K
A
 
K
N
 
I
R
 
N
Q
 
Q
G
 
F
G
 
G
G
 
M
S
 
N
V
 
L
L
 
Y
R
 
Q

7l0bA Crystal structure of hydroxyacyl glutathione hydrolase (glob) from staphylococcus aureus, apoenzyme (see paper)
28% identity, 76% coverage: 14:194/238 of query aligns to 14:202/202 of 7l0bA

query
sites
7l0bA
T
 
T
Y
 
N
T
 
T
Y
 
Y
L
 
F
I
 
I
G
 
-
S
 
-
R
 
E
A
 
N
S
 
D
R
 
K
A
 
A
A
 
V
L
 
I
L
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
S
A
 
G
E
 
E
Q
 
S
S
 
E
P
 
K
L
 
I
Y
 
-
L
 
I
G
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
N
E
 
Q
L
 
I
E
 
N
L
 
K
N
 
P
L
 
L
A
 
K
C
 
A
V
 
I
V
 
L
D
 
L
T
 
T
H
|
H
L
 
A
H
|
H
S
 
F
D
|
D
H
|
H
L
 
I
S
 
G
A
 
A
A
 
V
P
 
D
T
 
D
L
 
I
I
 
V
-
 
D
R
 
R
H
 
F
T
 
D
G
 
V
C
 
P
L
 
V
Y
 
Y
-
 
M
-
 
H
-
 
E
-
 
A
-
 
E
-
 
F
-
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
P
-
 
V
-
 
K
-
 
N
-
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
K
L
 
L
C
 
P
S
 
I
G
 
T
I
 
S
G
 
K
G
 
V
T
 
T
D
 
P
R
 
E
Q
 
K
L
 
L
A
 
N
D
 
E
G
 
G
D
 
-
S
 
S
L
 
T
D
 
E
L
 
I
A
 
E
D
 
G
L
 
F
H
 
K
L
 
F
E
 
N
V
 
V
L
 
L
A
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
C
 
S
I
 
L
T
 
T
L
 
Y
L
 
V
W
 
F
E
 
D
D
 
E
R
 
F
L
 
A
L
 
V
T
 
V
G
 
G
D
|
D
A
 
T
L
 
L
L
 
F
I
 
N
G
 
N
S
 
G
C
 
I
G
 
G
A
 
R
T
 
T
G
 
D
E
 
L
P
 
Y
G
 
K
G
 
G
N
 
D
A
 
Y
G
 
E
T
 
T
H
 
L
Y
 
V
D
 
D
S
 
S
V
 
I
T
 
Q
R
 
D
K
 
K
L
 
I
L
 
F
P
 
E
L
 
L
P
 
E
D
 
G
E
 
D
L
 
L
L
 
P
V
 
L
F
 
F
P
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
G
R
 
P
R
 
Y
V
 
T
S
 
T
C
 
V
I
 
-
G
 
-
D
 
D
E
 
D
R
 
E
Q
 
Q
G
 
L
N
 
N
P
 
P
L
 
F
F
 
L
C
 
H
G
 
G

3tp9A Crystal structure of alicyclobacillus acidocaldarius protein with beta-lactamase and rhodanese domains
28% identity, 71% coverage: 4:172/238 of query aligns to 5:198/473 of 3tp9A

query
sites
3tp9A
F
 
L
R
 
R
Q
 
R
L
 
F
R
 
Y
D
 
D
S
 
E
S
 
G
S
 
L
A
 
A
T
 
H
Y
 
A
T
 
S
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
G
 
G
S
 
C
R
 
Q
A
 
E
S
 
T
R
 
G
A
 
E
A
 
A
L
 
C
L
 
V
V
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
A
A
 
R
E
 
D
Q
 
V
S
 
E
P
 
P
L
 
-
Y
 
Y
L
 
L
G
 
L
L
 
T
L
 
A
G
 
K
E
 
R
L
 
E
E
 
G
L
 
L
N
 
R
L
 
I
A
 
V
C
 
A
V
 
A
V
 
L
D
 
E
T
 
T
H
|
H
L
 
I
H
|
H
S
 
A
D
|
D
H
x
F
L
 
V
S
 
S
A
 
G
A
 
A
P
 
R
T
 
E
L
 
M
I
 
A
R
 
D
H
 
R
T
 
A
G
 
G
C
 
-
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
A
G
 
A
L
 
I
C
 
C
S
 
V
G
 
S
I
 
D
G
 
E
G
 
G
T
 
P
-
 
P
-
 
E
-
 
W
-
 
K
-
 
S
-
 
E
-
 
Y
-
 
V
-
 
K
-
 
A
-
 
Y
-
 
P
D
 
H
R
 
R
Q
 
L
L
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
D
 
D
S
 
E
L
 
L
D
 
H
L
 
F
A
 
G
D
 
N
L
 
V
H
 
R
L
 
I
E
 
V
V
 
V
L
 
M
A
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
E
C
 
H
I
 
V
T
 
S
L
 
Y
L
 
L
W
 
L
E
 
Y
D
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
T
-
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
M
R
 
A
L
 
L
L
 
F
T
 
S
G
 
G
D
|
D
A
 
F
L
 
V
L
 
F
I
 
V
G
 
G
S
 
D
C
 
V
G
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
R
A
 
V
T
 
A
G
 
G
E
 
E
P
 
S
G
 
G
G
 
S
N
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
L
A
 
A
G
 
R
T
 
Q
H
 
M
Y
 
F
D
 
R
S
 
S
V
 
L
T
 
-
R
 
R
K
 
K
L
 
F
L
 
E
P
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
D
E
 
H
L
 
V
L
 
Q
V
 
V
F
 
L
P
 
P
G
 
A
H
 
H

7ev5A Crystal structure of bleg-1 b3 metallo-beta-lactamase (see paper)
27% identity, 81% coverage: 3:194/238 of query aligns to 1:209/209 of 7ev5A

query
sites
7ev5A
I
 
M
F
 
F
R
 
K
Q
 
Q
L
 
I
R
 
P
D
 
L
S
 
G
S
 
P
S
 
I
A
 
Q
T
 
T
Y
 
N
T
 
A
Y
 
Y
L
 
V
I
 
L
G
 
-
S
 
Y
R
 
N
A
 
D
S
 
D
R
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
I
V
 
F
D
 
D
P
 
P
V
 
G
A
 
G
E
 
D
Q
 
A
S
 
E
P
 
A
L
 
L
Y
 
I
L
 
T
G
 
W
L
 
L
L
 
K
G
 
R
E
 
E
L
 
-
E
 
Q
L
 
L
N
 
T
L
 
P
A
 
L
C
 
A
V
 
I
V
 
L
D
 
L
T
 
T
H
|
H
L
 
A
H
|
H
S
 
F
D
|
D
H
|
H
L
 
I
S
 
G
A
 
A
A
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
T
-
 
F
-
 
S
-
 
I
P
 
P
T
 
V
L
 
Y
I
 
L
-
 
H
-
 
T
-
 
K
-
 
E
R
 
R
H
 
H
T
 
W
G
 
L
C
 
E
L
 
D
Y
 
P
A
 
A
A
 
L
G
 
N
L
 
G
C
 
S
S
 
S
G
 
R
I
 
L
G
 
T
G
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
I
-
 
T
-
 
T
-
 
A
-
 
K
-
 
P
T
 
A
D
 
D
R
 
H
Q
 
L
L
 
L
A
 
T
D
 
N
G
 
E
D
 
K
S
 
S
L
 
L
D
 
T
L
 
I
A
 
G
D
 
T
L
 
F
H
 
T
L
 
F
E
 
S
V
 
V
L
 
F
A
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
C
 
S
I
 
V
T
 
S
L
 
Y
L
 
Y
W
 
Y
E
 
Q
D
 
K
R
 
E
-
 
A
-
 
V
L
 
L
L
 
F
T
 
S
G
 
G
D
|
D
A
 
V
L
 
L
L
 
F
I
 
Q
G
 
Q
S
 
S
C
 
I
G
 
G
A
 
R
T
 
T
G
 
D
E
 
L
P
 
R
G
 
G
G
 
G
N
 
D
A
 
H
G
 
T
T
 
L
H
 
L
Y
 
L
D
 
A
S
 
S
V
 
I
T
 
H
R
 
N
K
 
K
L
 
I
L
 
L
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
E
E
 
R
L
 
T
L
 
I
V
 
V
F
 
A
P
 
S
G
 
G
H
|
H
D
 
G
R
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
P
V
 
L
S
 
T
C
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
Q
E
 
E
R
 
M
Q
 
D
G
 
H
N
 
N
P
 
P
L
 
F
F
 
L
C
 
T
G
 
G

Q9SID3 Hydroxyacylglutathione hydrolase 2, mitochondrial; Glyoxalase II; Glx II; EC 3.1.2.6 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
31% identity, 67% coverage: 15:173/238 of query aligns to 83:240/324 of Q9SID3

query
sites
Q9SID3
Y
 
Y
T
 
A
Y
 
Y
L
 
I
I
 
L
G
 
H
S
 
D
R
 
E
A
 
D
S
 
T
R
 
G
A
 
T
A
 
V
L
 
G
L
 
V
V
 
V
D
 
D
P
 
P
V
 
-
A
 
S
E
 
E
Q
 
A
S
 
E
P
 
P
L
 
I
Y
 
-
L
 
I
G
 
D
L
 
S
L
 
L
G
 
K
E
 
R
L
 
S
E
 
G
L
 
R
N
 
N
L
 
L
A
 
T
C
 
Y
V
 
I
V
 
L
D
 
N
T
 
T
H
|
H
L
 
H
H
|
H
S
 
Y
D
|
D
H
|
H
L
 
T
S
 
G
A
 
G
A
 
N
P
 
L
T
 
E
L
 
L
I
 
K
R
 
D
H
 
R
T
 
Y
G
 
G
-
 
A
-
 
K
C
 
V
L
 
I
Y
 
G
A
 
S
A
 
A
G
 
M
L
 
D
C
 
K
S
 
D
G
 
R
I
 
I
G
 
P
G
 
G
T
 
I
D
 
D
R
 
M
Q
 
A
L
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
D
 
D
S
 
K
L
 
W
D
 
M
L
 
F
A
 
A
D
 
G
L
 
H
H
 
E
L
 
V
E
 
H
V
 
V
L
 
M
A
 
D
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
K
G
 
G
C
 
H
I
 
I
T
 
S
L
 
L
L
 
Y
W
 
F
-
 
P
-
 
G
E
 
S
D
 
R
R
 
A
L
 
I
L
 
F
T
 
T
G
 
G
D
|
D
A
 
T
L
 
M
L
 
F
I
 
S
G
 
L
S
 
S
C
 
C
G
 
G
A
 
K
T
 
L
G
 
F
E
 
E
P
 
-
G
 
-
G
 
G
N
 
T
A
 
P
G
 
K
T
 
Q
H
 
M
Y
 
L
D
 
A
S
 
S
V
 
L
T
 
-
R
 
Q
K
 
K
L
 
I
L
 
T
P
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
D
E
 
D
L
 
T
L
 
S
V
 
I
F
 
Y
P
 
C
G
 
G
H
|
H
D
 
E

2q42A Ensemble refinement of the protein crystal structure of glyoxalase ii from arabidopsis thaliana gene at2g31350 (see paper)
30% identity, 67% coverage: 14:173/238 of query aligns to 12:170/254 of 2q42A

query
sites
2q42A
T
 
N
Y
 
Y
T
 
A
Y
 
Y
L
 
I
I
 
L
G
 
H
S
 
D
R
 
E
A
 
D
S
 
T
R
 
G
A
 
T
A
 
V
L
 
G
L
 
V
V
 
V
D
 
D
P
 
P
V
 
-
A
 
S
E
 
E
Q
 
A
S
 
E
P
 
P
L
 
I
Y
 
-
L
 
I
G
 
D
L
 
S
L
 
L
G
 
K
E
 
R
L
 
S
E
 
G
L
 
R
N
 
N
L
 
L
A
 
T
C
 
Y
V
 
I
V
 
L
D
 
N
T
 
T
H
|
H
L
 
H
H
|
H
S
 
Y
D
|
D
H
|
H
L
 
T
S
 
G
A
 
G
A
 
N
P
 
L
T
 
E
L
 
L
I
 
K
R
 
D
H
 
R
T
 
Y
G
 
G
-
 
A
-
 
K
C
 
V
L
 
I
Y
 
G
A
 
S
A
 
A
G
 
M
L
 
D
C
 
K
S
 
D
G
 
R
I
 
I
G
 
P
G
 
G
T
 
I
D
 
D
R
 
M
Q
 
A
L
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
D
 
D
S
 
K
L
 
W
D
 
M
L
 
F
A
 
A
D
 
G
L
 
H
H
 
E
L
 
V
E
 
H
V
 
V
L
 
M
A
 
D
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
K
G
 
G
C
 
H
I
 
I
T
 
S
L
 
L
L
 
Y
W
 
F
-
 
P
-
 
G
E
 
S
D
 
R
R
 
A
L
 
I
L
 
F
T
 
T
G
 
G
D
|
D
A
 
T
L
 
M
L
 
F
I
 
S
G
 
L
S
 
S
C
 
C
G
 
G
A
 
K
T
 
L
G
 
F
E
 
E
P
 
-
G
 
-
G
 
G
N
 
T
A
 
P
G
 
K
T
 
Q
H
 
M
Y
 
L
D
 
A
S
 
S
V
 
L
T
 
-
R
 
Q
K
 
K
L
 
I
L
 
T
P
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
D
E
 
D
L
 
T
L
 
S
V
 
I
F
 
Y
P
 
C
G
 
G
H
|
H
D
 
E

1qh5B Human glyoxalase ii with s-(n-hydroxy-n-bromophenylcarbamoyl) glutathione (see paper)
28% identity, 67% coverage: 15:173/238 of query aligns to 13:174/260 of 1qh5B

query
sites
1qh5B
Y
 
Y
T
 
M
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
G
 
I
S
 
D
R
 
D
A
 
E
S
 
T
R
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
A
L
 
I
V
 
V
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
Q
E
 
P
Q
 
Q
S
 
K
P
 
-
L
 
-
Y
 
V
L
 
V
G
 
D
L
 
A
L
 
A
G
 
R
E
 
K
L
 
H
E
 
G
L
 
V
N
 
K
L
 
L
A
 
T
C
 
T
V
 
V
V
 
L
D
 
T
T
 
T
H
|
H
L
 
H
H
|
H
S
 
W
D
|
D
H
|
H
L
 
A
S
 
G
A
 
G
A
 
N
P
 
E
T
 
K
L
 
L
I
 
V
R
 
K
H
 
L
T
 
E
G
 
S
C
 
G
L
 
L
Y
 
K
A
 
V
A
 
Y
G
 
G
L
 
G
C
 
D
S
 
D
G
 
R
I
 
I
G
 
G
G
 
A
T
 
L
D
 
T
R
 
H
Q
 
K
L
 
I
A
 
T
D
 
H
G
 
L
D
 
S
S
 
T
L
 
L
D
 
Q
L
 
V
A
 
G
D
 
S
L
 
L
H
 
N
L
 
V
E
 
K
V
 
C
L
 
L
A
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
C
H
|
H
T
 
T
P
 
S
G
 
G
C
 
H
I
 
I
T
 
C
L
 
Y
L
 
F
W
 
V
E
 
S
D
 
K
-
 
P
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
E
-
 
P
-
 
P
R
 
A
L
 
V
L
 
F
T
 
T
G
 
G
D
|
D
A
 
T
L
 
L
L
 
F
I
 
V
G
 
A
S
 
G
C
|
C
G
 
G
A
x
K
T
 
F
G
x
Y
E
 
E
P
 
-
G
 
-
G
 
G
N
 
T
A
 
A
G
 
D
T
 
E
H
 
M
Y
 
C
D
 
K
S
 
A
V
 
L
T
 
L
R
 
E
K
 
V
L
 
L
L
 
G
P
 
R
L
 
L
P
 
P
D
 
P
E
 
D
L
 
T
L
 
R
V
 
V
F
 
Y
P
 
C
G
 
G
H
|
H
D
 
E

Sites not aligning to the query:

1qh5A Human glyoxalase ii with s-(n-hydroxy-n-bromophenylcarbamoyl) glutathione (see paper)
28% identity, 67% coverage: 15:173/238 of query aligns to 13:174/260 of 1qh5A

query
sites
1qh5A
Y
 
Y
T
 
M
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
G
 
I
S
 
D
R
 
D
A
 
E
S
 
T
R
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
A
L
 
I
V
 
V
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
Q
E
 
P
Q
 
Q
S
 
K
P
 
-
L
 
-
Y
 
V
L
 
V
G
 
D
L
 
A
L
 
A
G
 
R
E
 
K
L
 
H
E
 
G
L
 
V
N
 
K
L
 
L
A
 
T
C
 
T
V
 
V
V
 
L
D
 
T
T
 
T
H
|
H
L
 
H
H
|
H
S
 
W
D
|
D
H
|
H
L
 
A
S
 
G
A
 
G
A
 
N
P
 
E
T
 
K
L
 
L
I
 
V
R
 
K
H
 
L
T
 
E
G
 
S
C
 
G
L
 
L
Y
 
K
A
 
V
A
 
Y
G
 
G
L
 
G
C
 
D
S
 
D
G
 
R
I
 
I
G
 
G
G
 
A
T
 
L
D
 
T
R
 
H
Q
 
K
L
 
I
A
 
T
D
 
H
G
 
L
D
 
S
S
 
T
L
 
L
D
 
Q
L
 
V
A
 
G
D
 
S
L
 
L
H
 
N
L
 
V
E
 
K
V
 
C
L
 
L
A
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
C
H
|
H
T
 
T
P
 
S
G
 
G
C
 
H
I
 
I
T
 
C
L
 
Y
L
 
F
W
 
V
E
 
S
D
 
K
-
 
P
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
E
-
 
P
-
 
P
R
 
A
L
 
V
L
 
F
T
 
T
G
 
G
D
|
D
A
 
T
L
 
L
L
 
F
I
 
V
G
 
A
S
 
G
C
|
C
G
 
G
A
x
K
T
 
F
G
 
Y
E
 
E
P
 
-
G
 
-
G
 
G
N
 
T
A
 
A
G
 
D
T
 
E
H
 
M
Y
 
C
D
 
K
S
 
A
V
 
L
T
 
L
R
 
E
K
 
V
L
 
L
L
 
G
P
 
R
L
 
L
P
 
P
D
 
P
E
 
D
L
 
T
L
 
R
V
 
V
F
 
Y
P
 
C
G
 
G
H
|
H
D
 
E

Sites not aligning to the query:

1qh3A Human glyoxalase ii with cacodylate and acetate ions present in the active site (see paper)
28% identity, 67% coverage: 15:173/238 of query aligns to 13:174/260 of 1qh3A

query
sites
1qh3A
Y
 
Y
T
 
M
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
G
 
I
S
 
D
R
 
D
A
 
E
S
 
T
R
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
A
L
 
I
V
 
V
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
Q
E
 
P
Q
 
Q
S
 
K
P
 
-
L
 
-
Y
 
V
L
 
V
G
 
D
L
 
A
L
 
A
G
 
R
E
 
K
L
 
H
E
 
G
L
 
V
N
 
K
L
 
L
A
 
T
C
 
T
V
 
V
V
 
L
D
 
T
T
 
T
H
|
H
L
 
H
H
|
H
S
 
W
D
|
D
H
|
H
L
 
A
S
 
G
A
 
G
A
 
N
P
 
E
T
 
K
L
 
L
I
 
V
R
 
K
H
 
L
T
 
E
G
 
S
C
 
G
L
 
L
Y
 
K
A
 
V
A
 
Y
G
 
G
L
 
G
C
 
D
S
 
D
G
 
R
I
 
I
G
 
G
G
 
A
T
 
L
D
 
T
R
 
H
Q
 
K
L
 
I
A
 
T
D
 
H
G
 
L
D
 
S
S
 
T
L
 
L
D
 
Q
L
 
V
A
 
G
D
 
S
L
 
L
H
 
N
L
 
V
E
 
K
V
 
C
L
 
L
A
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
C
H
|
H
T
 
T
P
 
S
G
 
G
C
 
H
I
 
I
T
 
C
L
 
Y
L
 
F
W
 
V
E
 
S
D
 
K
-
 
P
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
E
-
 
P
-
 
P
R
 
A
L
 
V
L
 
F
T
 
T
G
 
G
D
|
D
A
 
T
L
 
L
L
 
F
I
 
V
G
 
A
S
 
G
C
|
C
G
 
G
A
 
K
T
 
F
G
x
Y
E
 
E
P
 
-
G
 
-
G
 
G
N
 
T
A
 
A
G
 
D
T
 
E
H
 
M
Y
 
C
D
 
K
S
 
A
V
 
L
T
 
L
R
 
E
K
 
V
L
 
L
L
 
G
P
 
R
L
 
L
P
 
P
D
 
P
E
 
D
L
 
T
L
 
R
V
 
V
F
 
Y
P
 
C
G
 
G
H
|
H
D
 
E

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Dsui_0929 FitnessBrowser__PS:Dsui_0929
MFIFRQLRDSSSATYTYLIGSRASRAALLVDPVAEQSPLYLGLLGELELNLACVVDTHLH
SDHLSAAPTLIRHTGCLYAAGLCSGIGGTDRQLADGDSLDLADLHLEVLATPGHTPGCIT
LLWEDRLLTGDALLIGSCGATGEPGGNAGTHYDSVTRKLLPLPDELLVFPGHDRDGRRVS
CIGDERQGNPLFCGISRDEFMAQDRSQPMGERAEAMLAANRQGGGSVLRERSPVSPNN

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory