SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Dsui_0987 FitnessBrowser__PS:Dsui_0987 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 17 hits to proteins with known functional sites (download)

2xf4A Crystal structure of salmonella enterica serovar typhimurium ycbl (see paper)
28% identity, 63% coverage: 30:226/311 of query aligns to 18:205/210 of 2xf4A

query
sites
2xf4A
V
 
I
L
 
W
C
 
C
I
 
E
E
 
Q
D
 
T
E
 
R
E
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
D
 
D
S
 
P
G
 
G
Y
 
G
V
 
D
T
 
A
H
 
E
A
 
K
A
 
I
Q
 
K
T
 
Q
L
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
E
K
 
V
A
 
D
L
 
A
D
 
S
G
 
G
R
 
V
R
 
T
L
 
L
T
 
M
R
 
Q
L
 
I
I
 
L
N
 
L
T
 
T
H
 
H
S
 
G
H
 
H
S
 
L
D
|
D
H
|
H
I
 
V
G
 
G
G
 
A
N
 
A
A
 
S
A
 
E
L
 
L
K
 
A
H
 
Q
A
 
H
T
 
Y
G
 
G
C
 
V
R
 
P
V
 
V
L
 
I
V
 
G
P
 
P
A
 
E
G
 
-
M
 
-
A
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
-
E
 
-
W
 
-
D
 
K
E
 
E
E
 
D
A
 
E
L
 
F
L
 
W
L
 
L
S
 
Q
P
 
G
L
 
L
G
 
P
Q
 
A
Q
 
Q
A
 
S
A
 
R
R
 
M
F
 
F
Q
 
G
H
 
L
D
 
D
A
 
E
T
 
C
-
 
Q
-
 
P
-
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
D
-
 
R
-
 
W
L
 
L
A
 
N
A
 
D
G
 
G
D
 
D
R
 
R
L
 
V
T
 
S
L
 
V
G
 
G
G
 
N
L
 
V
E
 
T
W
 
L
Q
 
Q
A
 
V
L
 
L
A
 
H
V
 
C
P
 
P
G
 
G
H
 
H
D
 
T
M
 
P
D
 
G
A
 
H
L
 
V
A
 
V
Y
 
F
F
 
F
N
 
D
A
 
E
D
 
Q
Q
 
S
G
 
Q
I
 
L
L
 
L
I
 
I
S
 
S
G
 
G
D
|
D
A
 
V
L
 
I
W
 
F
Q
 
K
D
 
G
G
 
G
F
 
V
G
 
G
V
 
R
I
 
-
F
 
-
A
 
S
E
 
D
L
 
F
L
 
P
G
 
R
G
 
G
D
 
D
G
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
T
 
H
R
 
T
Q
 
Q
T
 
L
L
 
I
D
 
D
M
 
A
L
 
I
A
 
K
A
 
R
-
 
K
-
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
L
R
 
G
-
 
D
-
 
D
-
 
V
A
 
T
V
 
F
I
 
I
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
A
 
-
P
 
P
F
 
L
A
 
S
D
 
T
I
 
L
G
 
G
E
 
-
S
 
-
F
 
Y
E
 
E
R
 
R
A
 
L
Y
 
H
S
 
N

7ev5A Crystal structure of bleg-1 b3 metallo-beta-lactamase (see paper)
28% identity, 62% coverage: 30:223/311 of query aligns to 16:203/209 of 7ev5A

query
sites
7ev5A
V
 
V
L
 
L
C
 
Y
I
 
N
E
 
D
D
 
D
E
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
V
L
 
I
V
 
F
D
 
D
S
 
P
G
 
G
Y
 
G
V
 
D
T
 
A
H
 
E
A
 
A
A
 
L
Q
 
I
T
 
T
L
 
W
A
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
L
 
L
D
 
K
G
 
R
R
 
E
R
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
P
L
 
L
-
 
A
-
 
I
I
 
L
N
 
L
T
 
T
H
|
H
S
 
A
H
|
H
S
 
F
D
|
D
H
|
H
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
V
A
 
D
A
 
A
L
 
V
K
 
R
H
 
D
A
 
T
T
 
F
G
 
S
C
 
-
R
 
-
V
 
-
L
 
-
V
 
I
P
 
P
A
 
V
G
 
Y
M
 
L
A
 
H
A
 
T
T
 
K
I
 
E
A
 
R
E
 
H
W
 
W
D
 
L
E
 
E
E
 
D
A
 
P
L
 
A
L
 
L
-
 
N
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
R
L
 
L
S
 
T
P
 
G
L
 
R
G
 
P
Q
 
I
Q
 
T
A
 
T
A
 
A
R
 
K
F
 
-
Q
 
P
H
 
A
D
 
D
A
 
H
T
 
L
L
 
L
A
 
T
A
 
N
G
 
E
D
 
K
R
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
I
G
 
G
G
 
T
L
 
F
E
 
T
W
 
F
Q
 
S
A
 
V
L
 
F
A
 
H
V
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
S
M
 
P
D
 
G
A
 
S
L
 
V
A
 
S
Y
 
Y
F
 
Y
N
 
Y
A
 
Q
D
 
K
Q
 
E
G
 
A
I
 
V
L
 
L
I
 
F
S
 
S
G
 
G
D
|
D
A
 
V
L
 
L
W
 
F
Q
 
Q
D
 
Q
G
 
S
F
 
I
G
 
G
V
 
R
I
 
-
F
 
-
A
 
T
E
 
D
L
 
L
L
 
R
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
H
L
 
T
R
 
L
T
 
L
T
 
L
R
 
A
Q
 
S
T
 
I
L
 
H
D
 
N
M
 
K
L
 
I
A
 
L
A
 
P
L
 
L
P
 
P
I
 
E
R
 
R
A
 
T
V
 
I
I
 
V
-
 
A
P
 
S
G
 
G
H
|
H
G
 
G
A
 
-
P
 
P
F
 
L
A
 
T
D
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
Q
S
 
E
F
 
M
E
 
D
R
 
H

4ysbA Crystal structure of ethe1 from myxococcus xanthus (see paper)
28% identity, 53% coverage: 65:230/311 of query aligns to 50:192/225 of 4ysbA

query
sites
4ysbA
L
 
L
T
 
T
R
 
H
L
 
V
I
 
F
N
 
D
T
 
T
H
|
H
S
 
V
H
|
H
S
 
A
D
|
D
H
|
H
I
 
I
G
 
T
G
 
A
N
 
S
A
 
G
A
 
A
L
 
L
K
 
R
H
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
-
R
 
-
V
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
M
 
-
A
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
-
E
 
E
W
 
R
D
 
T
E
 
Q
E
 
A
A
 
T
L
 
V
L
 
V
L
 
G
S
 
S
P
 
V
L
 
N
G
 
G
Q
 
A
Q
 
S
A
 
C
A
 
A
R
 
N
F
 
V
Q
 
Q
H
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
V
A
 
R
A
 
H
G
 
G
D
 
D
R
 
E
L
 
V
T
 
R
L
 
V
G
 
G
G
 
Q
L
 
L
E
 
V
W
 
F
Q
 
Q
A
 
V
L
 
L
A
 
A
V
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
T
M
 
D
D
 
D
A
 
S
L
 
I
A
 
S
Y
 
Y
F
 
L
N
 
L
A
 
G
D
 
D
Q
 
R
G
 
-
I
 
-
L
 
V
I
 
F
S
 
T
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
W
 
L
Q
 
V
D
 
R
G
 
G
F
 
N
G
 
G
V
 
-
I
 
-
F
 
R
A
 
T
E
 
D
L
 
F
L
 
Q
G
 
N
G
 
G
D
 
N
G
 
A
L
 
S
R
 
Q
T
 
L
T
 
Y
R
 
D
Q
 
S
T
 
L
L
 
T
D
 
R
M
 
V
L
 
L
A
 
F
A
 
T
L
 
L
P
 
P
I
 
D
R
 
E
A
 
T
V
 
L
I
 
V
-
 
Y
P
 
P
G
 
G
H
|
H
-
 
D
-
 
Y
-
 
K
G
 
G
A
 
R
P
 
T
F
 
V
A
 
T
D
 
S
I
 
I
G
 
A
E
 
E
S
 
E
F
 
-
E
 
K
R
 
R
A
 
H
Y
 
N
S
 
P
R
 
R
L
 
V
A
 
A
G
 
G

2q42A Ensemble refinement of the protein crystal structure of glyoxalase ii from arabidopsis thaliana gene at2g31350 (see paper)
24% identity, 50% coverage: 24:179/311 of query aligns to 8:142/254 of 2q42A

query
sites
2q42A
W
 
C
L
 
L
S
 
K
S
 
D
N
 
N
N
 
Y
V
 
A
L
 
Y
C
 
I
I
 
L
E
 
H
D
 
D
E
 
E
E
 
D
A
 
T
A
 
G
L
 
T
V
 
V
D
 
G
S
 
V
G
 
V
Y
 
D
V
 
P
T
 
S
H
 
E
A
 
A
A
 
E
Q
 
P
T
 
I
L
 
I
A
 
D
L
 
S
V
 
L
E
 
K
K
 
R
A
 
S
L
 
-
D
 
-
G
 
G
R
 
R
R
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
Y
L
 
I
I
 
L
N
 
N
T
 
T
H
|
H
S
 
H
H
|
H
S
 
Y
D
|
D
H
|
H
I
 
T
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
L
A
 
E
L
 
L
K
 
K
H
 
D
A
 
R
T
 
Y
G
 
G
C
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
I
V
 
G
P
 
S
A
 
A
G
 
M
M
 
D
A
 
K
A
 
D
T
 
R
I
 
I
A
 
P
E
 
G
W
 
I
D
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
F
 
-
Q
 
-
H
 
-
D
 
D
A
 
M
T
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
D
G
 
G
D
 
D
R
 
K
L
 
W
T
 
M
L
 
F
G
 
A
G
 
G
L
 
H
E
 
E
W
 
V
Q
 
H
A
 
V
L
 
M
A
 
D
V
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
T
M
 
K
D
 
G
A
 
H
L
 
I
A
 
S
Y
 
L
F
 
Y
N
 
F
A
 
P
D
 
G
Q
 
S
G
 
R
I
 
A
L
 
I
I
 
F
S
 
T
G
 
G
D
|
D
A
 
T
L
 
M
W
 
F
Q
 
S
D
 
L
G
 
S
F
 
C
G
 
G
V
 
K
I
 
L
F
 
F

Sites not aligning to the query:

Q9SID3 Hydroxyacylglutathione hydrolase 2, mitochondrial; Glyoxalase II; Glx II; EC 3.1.2.6 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
27% identity, 48% coverage: 30:179/311 of query aligns to 76:212/324 of Q9SID3

query
sites
Q9SID3
V
 
V
L
 
P
C
 
C
I
 
L
E
 
K
D
 
D
E
 
N
E
 
Y
A
 
A
A
 
Y
L
 
I
V
 
L
-
 
H
-
 
D
-
 
E
D
 
D
S
 
T
G
 
G
Y
 
T
V
 
V
-
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
D
-
 
P
T
 
S
H
 
E
A
 
A
A
 
E
Q
 
P
T
 
I
L
 
I
A
 
D
L
 
S
V
 
L
E
 
K
K
 
R
A
 
S
L
 
-
D
 
-
G
 
G
R
 
R
R
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
Y
L
 
I
I
 
L
N
 
N
T
 
T
H
|
H
S
 
H
H
|
H
S
 
Y
D
|
D
H
|
H
I
 
T
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
L
A
 
E
L
 
L
K
 
K
H
 
D
A
 
R
T
 
Y
G
 
G
C
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
I
V
 
G
P
 
S
A
 
A
G
 
M
M
 
D
A
 
K
A
 
D
T
 
R
I
 
I
A
 
P
E
 
G
W
 
I
D
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
F
 
-
Q
 
-
H
 
-
D
 
D
A
 
M
T
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
D
G
 
G
D
 
D
R
 
K
L
 
W
T
 
M
L
 
F
G
 
A
G
 
G
L
 
H
E
 
E
W
 
V
Q
 
H
A
 
V
L
 
M
A
 
D
V
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
T
M
 
K
D
 
G
A
 
H
L
 
I
A
 
S
-
 
L
Y
 
Y
F
 
F
N
 
P
A
 
G
D
 
S
Q
 
R
G
 
A
I
 
I
L
 
F
I
 
-
S
 
T
G
 
G
D
|
D
A
 
T
L
 
M
W
 
F
Q
 
S
D
 
L
G
 
S
F
 
C
G
 
G
V
 
K
I
 
L
F
 
F

Sites not aligning to the query:

8ewoA Crystal structure of putative glyoxylase ii from pseudomonas aeruginosa
36% identity, 37% coverage: 64:179/311 of query aligns to 49:144/259 of 8ewoA

query
sites
8ewoA
R
 
R
L
 
L
T
 
S
R
 
D
L
 
I
I
 
L
N
 
V
T
 
T
H
|
H
S
 
H
H
|
H
S
 
H
D
|
D
H
|
H
I
 
V
G
 
G
G
 
G
N
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K
H
 
E
A
 
L
T
 
T
G
 
G
C
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
G
P
 
P
A
 
A
G
 
N
M
 
E
A
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
-
E
 
-
W
 
-
D
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
K
Q
 
I
A
 
P
A
 
A
R
 
R
F
 
-
Q
 
-
H
 
-
D
 
D
A
 
L
T
 
A
L
 
L
A
 
E
A
 
D
G
 
G
D
 
E
R
 
R
L
 
V
T
 
E
L
 
V
G
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
V
W
 
F
Q
 
E
A
 
I
L
 
F
A
 
H
V
 
V
P
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
T
M
 
L
D
 
G
A
 
H
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
F
 
Y
N
 
H
-
 
P
A
 
A
D
 
E
Q
 
T
G
 
P
I
 
L
L
 
L
I
 
F
S
 
C
G
 
G
D
|
D
A
 
T
L
 
L
W
 
F
Q
 
A
D
 
A
G
 
G
F
 
C
G
 
G
V
 
R
I
 
L
F
 
F

Sites not aligning to the query:

O95571 Persulfide dioxygenase ETHE1, mitochondrial; Ethylmalonic encephalopathy protein 1; Hepatoma subtracted clone one protein; Sulfur dioxygenase ETHE1; EC 1.13.11.18 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
31% identity, 46% coverage: 34:176/311 of query aligns to 44:162/254 of O95571

query
sites
O95571
E
 
E
D
 
S
E
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
V
L
 
L
V
 
I
D
 
D
S
 
P
G
 
-
Y
 
-
V
 
V
T
x
L
H
 
E
A
 
T
A
 
A
Q
 
P
T
 
R
L
 
D
A
 
A
L
 
Q
V
 
L
E
 
I
K
 
K
A
 
E
L
 
L
D
 
-
G
 
G
R
 
L
R
 
R
L
 
L
T
 
L
R
 
Y
L
 
A
I
 
V
N
 
N
T
 
T
H
|
H
S
 
C
H
 
H
S
 
A
D
 
D
H
 
H
I
 
I
G
 
T
G
 
G
N
 
S
A
 
G
A
 
L
L
 
L
K
 
-
H
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
-
R
 
R
V
 
S
L
 
L
V
 
L
P
 
P
A
 
-
G
 
G
M
 
C
A
 
Q
A
 
S
T
 
V
I
 
I
A
 
S
E
 
R
W
 
L
D
 
S
E
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
G
Q
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
-
R
 
-
F
 
-
Q
 
-
H
 
-
D
 
D
A
 
L
T
 
H
L
 
I
A
 
E
A
 
D
G
 
G
D
 
D
R
 
S
L
 
I
T
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
F
E
 
A
W
 
L
Q
 
E
A
 
T
L
 
R
A
 
A
V
 
S
P
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
T
M
 
P
D
 
G
A
 
C
L
 
V
A
 
T
Y
 
F
F
 
V
N
 
L
A
 
N
D
 
D
Q
 
H
G
 
S
I
 
M
L
 
A
I
 
F
S
x
T
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
W
 
L
Q
 
I
D
 
R
G
 
G
F
 
C
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4chlB Human ethylmalonic encephalopathy protein 1 (hethe1) (see paper)
31% identity, 46% coverage: 34:176/311 of query aligns to 28:146/237 of 4chlB

query
sites
4chlB
E
 
E
D
 
S
E
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
V
L
 
L
V
 
I
D
 
D
S
 
P
G
 
-
Y
 
-
V
 
V
T
 
L
H
 
E
A
 
T
A
 
A
Q
 
P
T
 
R
L
 
D
A
 
A
L
 
Q
V
 
L
E
 
I
K
 
K
A
 
E
L
 
L
D
 
-
G
 
G
R
 
L
R
 
R
L
 
L
T
 
L
R
 
Y
L
 
A
I
 
V
N
 
N
T
 
T
H
|
H
S
 
C
H
|
H
S
 
A
D
|
D
H
|
H
I
 
I
G
 
T
G
 
G
N
 
S
A
 
G
A
 
L
L
 
L
K
 
-
H
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
-
R
 
R
V
 
S
L
 
L
V
 
L
P
 
P
A
 
-
G
 
G
M
 
C
A
 
Q
A
 
S
T
 
V
I
 
I
A
 
S
E
 
R
W
 
L
D
 
S
E
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
G
Q
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
-
R
 
-
F
 
-
Q
 
-
H
 
-
D
 
D
A
 
L
T
 
H
L
 
I
A
 
E
A
 
D
G
 
G
D
 
D
R
 
S
L
 
I
T
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
F
E
 
A
W
 
L
Q
 
E
A
 
T
L
 
R
A
 
A
V
 
S
P
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
T
M
 
P
D
 
G
A
 
C
L
 
V
A
 
T
Y
 
F
F
 
V
N
 
L
A
 
N
D
 
D
Q
 
H
G
 
S
I
 
M
L
 
A
I
 
F
S
 
T
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
W
 
L
Q
 
I
D
 
R
G
 
G
F
 
C
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6n36A Beta-lactamase from chitinophaga pinensis
32% identity, 26% coverage: 68:149/311 of query aligns to 74:155/265 of 6n36A

query
sites
6n36A
L
 
L
I
 
L
N
 
T
T
 
T
H
|
H
S
 
A
H
|
H
S
 
Y
D
|
D
H
|
H
I
 
V
G
 
G
G
 
A
N
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
V
K
 
K
H
 
Q
A
 
Q
T
 
T
G
 
H
C
 
A
R
 
K
V
 
M
L
 
M
V
 
V
P
 
N
A
 
E
G
 
K
M
 
D
A
 
A
A
 
A
T
 
L
I
 
L
A
 
A
E
 
D
W
 
G
D
 
G
E
 
N
E
 
S
A
 
D
L
 
Y
L
 
V
L
 
M
S
 
G
P
 
G
L
 
K
G
 
G
Q
 
S
Q
 
M
A
 
F
A
 
L
R
 
P
F
 
V
Q
 
K
H
 
A
D
 
D
A
 
R
T
 
L
L
 
L
A
 
H
A
 
D
G
 
G
D
 
D
R
 
S
L
 
I
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
M
E
 
K
W
 
I
Q
 
V
A
 
M
L
 
R
A
 
Q
V
 
H
P
 
P
G
 
G
H
|
H

Sites not aligning to the query:

2zo4A Crystal structure of metallo-beta-lactamase family protein ttha1429 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
27% identity, 60% coverage: 37:222/311 of query aligns to 30:236/301 of 2zo4A

query
sites
2zo4A
E
 
E
A
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
D
 
D
S
 
T
G
 
A
Y
 
L
V
 
G
T
 
T
H
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
-
 
G
-
 
A
-
 
L
T
 
E
L
 
L
A
 
H
L
 
L
V
 
A
E
 
E
K
 
L
A
 
G
L
 
L
D
 
C
G
 
F
R
 
Q
R
 
D
L
 
V
T
 
K
R
 
T
L
 
I
I
 
L
N
 
L
T
 
T
H
|
H
S
 
H
H
|
H
S
 
P
D
|
D
H
|
H
I
 
Y
G
 
G
G
 
L
N
 
S
A
 
G
A
 
F
L
 
F
K
 
E
H
 
-
A
 
G
T
 
L
G
 
G
C
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
F
V
 
L
-
 
H
-
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
F
-
 
A
-
 
R
-
 
G
-
 
H
-
 
R
-
 
F
-
 
W
-
 
R
-
 
E
P
 
P
A
 
E
G
 
A
M
 
F
A
 
A
A
 
E
T
 
-
I
 
-
A
 
A
E
 
S
W
 
W
-
 
R
-
 
L
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
H
-
 
G
-
 
T
D
 
P
E
 
E
E
 
E
A
 
T
L
 
V
L
 
-
L
 
-
S
 
E
P
 
K
L
 
T
G
 
R
Q
 
E
Q
 
R
A
 
V
A
 
H
R
 
P
F
 
P
Q
 
Q
H
 
N
D
 
P
A
 
L
T
 
P
L
 
L
A
 
R
A
 
D
G
 
G
D
 
E
R
 
A
L
 
L
T
 
E
L
 
V
G
 
A
G
 
G
L
 
K
E
 
R
W
 
L
Q
 
R
A
 
V
L
 
L
A
 
W
V
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
A
M
 
D
D
 
G
A
 
H
L
 
A
A
 
A
Y
 
F
F
 
Y
N
 
L
A
 
E
D
 
E
Q
 
E
G
 
G
I
 
V
L
 
L
I
 
L
S
 
A
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
W
 
L
Q
 
E
D
 
K
-
 
V
G
 
S
F
 
P
G
 
N
V
 
V
I
 
G
F
 
L
A
 
W
E
 
A
L
 
Y
L
 
T
G
 
R
G
 
E
D
 
N
G
 
P
L
 
L
R
 
K
T
 
D
T
 
F
R
 
L
Q
 
R
T
 
S
L
 
L
D
 
D
M
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
D
L
 
L
P
 
G
I
 
A
R
 
R
A
 
V
V
 
A
I
 
Y
P
 
A
G
 
G
H
|
H
G
 
F
A
 
G
P
 
P
F
 
I
A
 
A
D
 
D
I
 
V
G
 
R
E
 
Q
S
 
R
F
 
A
E
 
E

Q68D91 Acyl-coenzyme A thioesterase MBLAC2; Acyl-CoA thioesterase MBLAC2; Beta-lactamase MBLAC2; Metallo-beta-lactamase domain-containing protein 2; Palmitoyl-coenzyme A thioesterase MBLAC2; EC 3.1.2.2; EC 3.5.2.6 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
24% identity, 49% coverage: 63:215/311 of query aligns to 74:236/279 of Q68D91

query
sites
Q68D91
R
 
R
R
 
R
L
 
P
T
 
L
R
 
L
L
 
A
I
 
V
N
 
A
T
 
T
H
 
H
S
 
V
H
 
H
S
 
F
D
|
D
H
|
H
I
x
S
G
 
G
G
 
G
-
 
L
-
x
Y
-
 
Q
-
 
F
-
 
D
N
 
R
A
 
V
A
 
A
L
 
V
K
 
H
H
 
H
A
 
A
T
 
E
G
 
A
C
 
E
R
 
A
V
 
L
L
 
A
V
 
R
P
 
G
A
 
D
G
 
N
M
 
F
A
 
E
A
 
T
T
 
V
I
 
T
A
 
W
E
 
L
W
 
S
D
 
D
E
 
S
E
 
E
A
 
V
L
 
V
L
 
R
L
x
T
S
 
P
P
 
S
L
 
P
G
 
G
Q
 
W
Q
 
R
A
 
A
A
 
R
R
 
Q
F
 
F
Q
 
R
H
 
V
D
 
Q
A
 
A
T
 
V
-
 
Q
-
 
P
-
 
T
-
 
L
-
 
I
L
 
L
A
 
Q
A
 
D
G
 
G
D
 
D
R
 
V
L
 
I
T
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
D
L
 
R
E
 
Q
W
 
L
Q
 
T
A
 
V
L
 
M
A
 
H
V
 
M
P
 
P
G
 
G
H
 
H
D
 
S
M
 
R
D
 
G
A
 
S
L
 
I
A
x
C
Y
 
L
F
 
H
N
 
D
A
 
K
D
 
D
Q
 
R
G
 
K
I
 
I
L
 
L
I
 
F
S
 
S
G
 
G
D
 
D
A
 
V
L
 
V
W
 
Y
Q
 
D
D
 
G
G
 
S
F
 
L
G
 
I
V
 
D
I
 
W
F
 
L
A
 
P
E
 
Y
L
 
S
L
 
R
G
 
I
G
 
S
D
 
D
G
 
Y
L
 
V
R
 
G
T
 
T
T
x
C
R
 
E
Q
 
R
T
 
L
L
 
I
D
 
E
M
 
L
L
 
V
A
 
D
A
 
R
L
 
G
P
 
L
I
 
V
R
 
E
A
 
K
V
 
V
I
 
L
P
 
P
G
 
G
H
 
H
G
 
F
A
 
N
P
 
T
F
 
F
A
 
G

Sites not aligning to the query:

4efzA Crystal structure of a hypothetical metallo-beta-lactamase from burkholderia pseudomallei
26% identity, 53% coverage: 37:200/311 of query aligns to 29:209/295 of 4efzA

query
sites
4efzA
E
 
E
A
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
I
D
 
D
S
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
D
-
 
Y
-
 
D
-
 
P
-
 
K
-
 
S
G
 
G
Y
 
R
V
 
T
T
 
R
H
 
T
A
 
A
A
 
S
Q
 
A
T
 
D
L
 
Q
A
 
L
L
 
I
V
 
A
E
 
R
K
 
V
A
 
A
L
 
A
D
 
L
G
 
G
R
 
A
R
 
R
L
 
V
T
 
R
R
 
W
L
 
L
I
 
L
N
 
E
T
 
T
H
|
H
S
 
V
H
|
H
S
 
A
D
|
D
H
|
H
I
 
L
G
 
S
G
 
A
N
 
A
A
 
P
A
 
Y
L
 
L
K
 
K
H
 
T
A
 
R
T
 
V
G
 
G
C
 
G
R
 
E
V
 
I
L
 
A
V
 
I
P
 
-
A
 
-
G
 
G
M
 
R
A
 
H
A
 
V
T
 
T
I
 
R
A
 
V
E
 
Q
W
 
D
D
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
V
L
 
F
S
 
G
P
 
K
L
 
L
G
 
F
Q
 
N
Q
 
A
A
 
G
A
 
P
R
 
A
F
 
F
Q
 
A
H
 
H
D
 
D
A
 
G
T
 
S
-
 
Q
-
 
F
-
 
D
-
 
R
-
 
L
L
 
L
A
 
D
A
 
D
G
 
G
D
 
D
R
 
T
L
 
L
T
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
A
L
 
L
E
 
S
W
 
I
Q
 
R
A
 
A
L
 
M
A
 
H
V
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
T
M
 
P
D
 
A
A
 
C
L
 
M
A
 
T
Y
 
Y
F
 
V
N
 
V
A
 
T
D
 
E
-
 
A
-
 
H
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
D
-
 
A
-
 
R
Q
 
D
G
 
A
I
 
A
L
 
A
I
 
F
S
 
V
G
 
G
D
|
D
A
 
T
L
 
L
W
 
F
Q
 
M
D
 
P
G
 
D
F
 
Y
G
 
G
V
 
T
I
 
A
F
 
R
A
 
C
E
 
D
L
 
F
L
 
P
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
A
-
 
R
-
 
S
-
 
L
L
 
Y
R
 
R
T
 
S
T
 
I
R
 
R
Q
 
K
T
 
V
L
 
L
D
 
S
M
 
L
L
 
P
A
 
P
A
 
A

1x8iA Crystal structure of the zinc carbapenemase cpha in complex with the antibiotic biapenem (see paper)
24% identity, 63% coverage: 18:214/311 of query aligns to 14:208/224 of 1x8iA

query
sites
1x8iA
L
 
V
V
 
V
L
 
E
E
 
D
R
 
N
G
 
Y
W
 
Y
L
x
V
S
 
Q
S
 
E
N
 
N
N
 
S
V
 
M
L
 
V
C
 
Y
I
 
F
E
 
G
D
 
A
E
 
K
E
 
G
A
 
V
A
 
T
L
 
V
V
 
V
D
 
G
S
 
A
G
 
T
Y
 
W
V
 
T
T
 
P
H
 
D
A
 
T
A
 
A
Q
 
R
T
 
E
L
 
L
A
 
H
L
 
K
V
 
L
E
 
I
K
 
K
A
 
R
L
 
V
D
 
S
G
 
R
R
 
K
R
 
P
L
 
V
T
 
L
R
 
E
L
 
V
I
 
I
N
 
N
T
 
T
H
x
N
S
 
Y
H
|
H
S
 
T
D
|
D
H
 
R
I
 
A
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
A
 
Y
L
 
W
K
 
K
H
 
-
A
 
S
T
 
I
G
 
G
C
 
A
R
 
K
V
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
T
-
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
R
-
 
D
L
 
L
V
 
M
P
 
K
A
 
S
G
 
D
M
 
W
A
 
A
A
 
E
T
 
I
I
 
V
A
 
A
-
x
F
-
x
T
-
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
P
E
 
E
W
 
Y
D
 
P
E
 
D
E
 
L
A
 
P
L
 
L
L
 
V
L
 
L
S
 
P
P
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
N
F
 
V
Q
 
V
H
 
H
D
 
D
A
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
D
 
D
R
 
F
L
 
T
T
 
L
L
 
Q
G
 
E
G
 
G
L
 
K
E
 
V
W
 
R
Q
 
A
A
 
F
L
 
Y
A
 
A
V
 
G
P
 
P
G
 
A
H
|
H
D
 
T
M
 
P
D
 
D
A
 
G
L
 
I
A
 
F
Y
 
V
F
 
Y
N
 
F
A
 
P
D
 
D
Q
 
E
G
 
Q
I
 
V
L
 
L
I
 
Y
S
 
G
G
 
G
D
x
C
A
 
I
L
 
L
W
x
K
Q
 
E
D
 
K
G
 
L
F
 
G
G
x
N
V
 
L
I
 
S
F
|
F
A
 
A
E
 
D
L
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
V
R
 
K
T
 
A
T
 
Y
R
 
P
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
D
 
E
M
 
R
L
 
L
A
 
K
A
 
A
-
 
M
-
 
K
L
 
L
P
 
P
I
 
I
R
 
K
A
 
T
V
 
V
I
 
I
P
 
G
G
 
G
H
|
H
G
 
D
A
 
S
P
 
P
F
 
L

Sites not aligning to the query:

3iogA Crystal structure of cpha n220g mutant with inhibitor 18 (see paper)
24% identity, 63% coverage: 18:214/311 of query aligns to 14:208/227 of 3iogA

query
sites
3iogA
L
 
V
V
 
V
L
 
E
E
 
D
R
 
N
G
 
Y
W
 
Y
L
x
V
S
 
Q
S
 
E
N
 
N
N
 
S
V
 
M
L
 
V
C
 
Y
I
 
F
E
 
G
D
 
A
E
 
K
E
 
G
A
 
V
A
 
T
L
 
V
V
 
V
D
 
G
S
 
A
G
 
T
Y
x
W
V
 
T
T
 
P
H
 
D
A
 
T
A
 
A
Q
 
R
T
 
E
L
 
L
A
 
H
L
 
K
V
 
L
E
 
I
K
 
K
A
 
R
L
 
V
D
 
S
G
 
R
R
 
K
R
 
P
L
 
V
T
 
L
R
 
E
L
 
V
I
 
I
N
 
N
T
 
T
H
x
N
S
 
Y
H
|
H
S
 
T
D
|
D
H
 
R
I
 
A
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
A
 
Y
L
 
W
K
 
K
H
 
-
A
 
S
T
 
I
G
 
G
C
 
A
R
 
K
V
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
T
-
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
R
-
 
D
L
 
L
V
 
M
P
 
K
A
 
S
G
 
D
M
 
W
A
 
A
A
 
E
T
 
I
I
 
V
A
 
A
-
 
F
-
 
T
-
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
P
E
 
E
W
 
Y
D
 
P
E
 
D
E
 
L
A
 
P
L
 
L
L
 
V
L
 
L
S
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
P
R
 
N
F
 
V
Q
 
V
H
 
H
D
 
D
A
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
D
 
D
R
 
F
L
 
T
T
 
L
L
 
Q
G
 
E
G
 
G
L
 
K
E
 
V
W
 
R
Q
 
A
A
 
F
L
 
Y
A
 
A
V
 
G
P
 
P
G
 
A
H
|
H
D
 
T
M
 
P
D
 
D
A
 
G
L
 
I
A
 
F
Y
 
V
F
 
Y
N
 
F
A
 
P
D
 
D
Q
 
E
G
 
Q
I
 
V
L
 
L
I
 
Y
S
 
G
G
 
G
D
x
C
A
 
I
L
 
L
W
x
K
Q
 
E
D
 
K
G
 
L
F
 
G
G
x
N
V
 
L
I
 
S
F
 
F
A
 
A
E
 
D
L
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
V
R
 
K
T
 
A
T
 
Y
R
 
P
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
D
 
E
M
 
R
L
 
L
A
 
K
A
 
A
-
 
M
-
 
K
L
 
L
P
 
P
I
 
I
R
 
K
A
 
T
V
 
V
I
 
I
P
 
G
G
 
G
H
|
H
G
 
D
A
 
S
P
 
P
F
 
L

3iofA Crystal structure of cpha n220g mutant with inhibitor 10a (see paper)
24% identity, 63% coverage: 18:214/311 of query aligns to 14:208/227 of 3iofA

query
sites
3iofA
L
 
V
V
 
V
L
 
E
E
 
D
R
 
N
G
 
Y
W
 
Y
L
x
V
S
 
Q
S
 
E
N
 
N
N
 
S
V
 
M
L
 
V
C
 
Y
I
 
F
E
 
G
D
 
A
E
 
K
E
 
G
A
 
V
A
 
T
L
 
V
V
 
V
D
 
G
S
 
A
G
 
T
Y
x
W
V
 
T
T
 
P
H
 
D
A
 
T
A
 
A
Q
 
R
T
 
E
L
 
L
A
 
H
L
 
K
V
 
L
E
 
I
K
 
K
A
 
R
L
 
V
D
 
S
G
 
R
R
 
K
R
 
P
L
 
V
T
 
L
R
 
E
L
 
V
I
 
I
N
 
N
T
 
T
H
x
N
S
 
Y
H
|
H
S
x
T
D
|
D
H
 
R
I
 
A
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
A
 
Y
L
 
W
K
 
K
H
 
-
A
 
S
T
 
I
G
 
G
C
 
A
R
 
K
V
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
T
-
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
R
-
 
D
L
 
L
V
 
M
P
 
K
A
 
S
G
 
D
M
 
W
A
 
A
A
 
E
T
x
I
I
 
V
A
 
A
-
x
F
-
x
T
-
 
R
-
 
K
-
 
G
-
x
L
-
 
P
E
 
E
W
 
Y
D
 
P
E
 
D
E
 
L
A
 
P
L
 
L
L
 
V
L
 
L
S
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
P
R
 
N
F
 
V
Q
 
V
H
 
H
D
 
D
A
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
D
 
D
R
 
F
L
 
T
T
 
L
L
 
Q
G
 
E
G
 
G
L
 
K
E
 
V
W
 
R
Q
 
A
A
 
F
L
 
Y
A
 
A
V
 
G
P
 
P
G
 
A
H
|
H
D
 
T
M
 
P
D
 
D
A
 
G
L
 
I
A
 
F
Y
 
V
F
 
Y
N
 
F
A
 
P
D
 
D
Q
 
E
G
 
Q
I
 
V
L
 
L
I
 
Y
S
 
G
G
 
G
D
x
C
A
 
I
L
 
L
W
x
K
Q
 
E
D
 
K
G
 
L
F
 
G
G
x
N
V
 
L
I
 
S
F
 
F
A
 
A
E
 
D
L
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
V
R
 
K
T
 
A
T
 
Y
R
 
P
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
D
 
E
M
 
R
L
 
L
A
 
K
A
 
A
-
 
M
-
 
K
L
 
L
P
 
P
I
 
I
R
 
K
A
 
T
V
 
V
I
 
I
P
 
G
G
 
G
H
|
H
G
 
D
A
 
S
P
 
P
F
 
L

3faiA The di zinc carbapenemase cpha n220g mutant (see paper)
24% identity, 63% coverage: 18:214/311 of query aligns to 14:208/227 of 3faiA

query
sites
3faiA
L
 
V
V
 
V
L
 
E
E
 
D
R
 
N
G
 
Y
W
 
Y
L
 
V
S
 
Q
S
 
E
N
 
N
N
 
S
V
 
M
L
 
V
C
 
Y
I
 
F
E
 
G
D
 
A
E
 
K
E
 
G
A
 
V
A
 
T
L
 
V
V
 
V
D
 
G
S
 
A
G
 
T
Y
 
W
V
 
T
T
 
P
H
 
D
A
 
T
A
 
A
Q
 
R
T
 
E
L
 
L
A
 
H
L
 
K
V
 
L
E
 
I
K
 
K
A
 
R
L
 
V
D
 
S
G
 
R
R
 
K
R
 
P
L
 
V
T
 
L
R
 
E
L
 
V
I
 
I
N
 
N
T
 
T
H
x
N
S
 
Y
H
|
H
S
 
T
D
|
D
H
 
R
I
 
A
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
A
 
Y
L
 
W
K
 
K
H
 
-
A
 
S
T
 
I
G
 
G
C
 
A
R
 
K
V
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
T
-
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
R
-
 
D
L
 
L
V
 
M
P
 
K
A
 
S
G
 
D
M
 
W
A
 
A
A
 
E
T
 
I
I
 
V
A
 
A
-
 
F
-
 
T
-
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
P
E
 
E
W
 
Y
D
 
P
E
 
D
E
 
L
A
 
P
L
 
L
L
 
V
L
 
L
S
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
P
R
 
N
F
 
V
Q
 
V
H
 
H
D
 
D
A
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
D
 
D
R
 
F
L
 
T
T
 
L
L
 
Q
G
 
E
G
 
G
L
 
K
E
 
V
W
 
R
Q
 
A
A
 
F
L
 
Y
A
 
A
V
 
G
P
 
P
G
 
A
H
|
H
D
 
T
M
 
P
D
 
D
A
 
G
L
 
I
A
 
F
Y
 
V
F
 
Y
N
 
F
A
 
P
D
 
D
Q
 
E
G
 
Q
I
 
V
L
 
L
I
 
Y
S
 
G
G
 
G
D
x
C
A
 
I
L
 
L
W
x
K
Q
 
E
D
 
K
G
 
L
F
 
G
G
x
N
V
 
L
I
 
S
F
 
F
A
 
A
E
 
D
L
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
V
R
 
K
T
 
A
T
 
Y
R
 
P
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
D
 
E
M
 
R
L
 
L
A
 
K
A
 
A
-
 
M
-
 
K
L
 
L
P
 
P
I
 
I
R
 
K
A
 
T
V
 
V
I
 
I
P
 
G
G
 
G
H
|
H
G
 
D
A
 
S
P
 
P
F
 
L

6dr8A Metallo-beta-lactamase from cronobacter sakazakii (enterobacter sakazakii) harldq motif mutant s60/r118h/q121h/k254h
30% identity, 49% coverage: 28:178/311 of query aligns to 20:172/252 of 6dr8A

query
sites
6dr8A
N
 
S
N
 
S
V
 
V
L
 
L
C
 
L
I
 
T
E
 
T
D
 
P
E
 
Q
E
 
G
A
 
H
A
 
I
L
 
L
V
 
I
D
 
D
S
 
A
G
 
G
Y
 
L
V
 
D
T
 
A
H
 
S
A
 
A
A
 
P
Q
 
Q
T
 
I
L
 
R
A
 
R
L
 
N
V
 
I
E
 
E
K
 
-
A
 
A
L
 
L
D
 
G
G
 
F
R
 
R
R
 
M
-
 
A
-
 
D
L
 
I
T
 
R
R
 
Y
L
 
I
I
 
A
N
 
N
T
 
S
H
|
H
S
 
A
H
|
H
S
 
L
D
|
D
H
|
H
I
 
A
G
 
G
G
 
G
N
 
I
A
 
A
A
 
R
L
 
L
K
 
K
H
 
A
A
 
W
T
 
S
G
 
G
C
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
I
V
 
A
P
 
S
A
 
H
G
 
A
M
 
N
A
 
A
A
 
E
T
 
Q
I
 
M
A
 
A
E
 
R
W
 
G
D
 
G
E
 
K
E
 
E
-
 
D
-
 
F
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
P
L
 
F
S
 
P
P
 
P
L
 
V
G
 
-
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
F
 
-
Q
 
T
H
 
V
D
 
D
A
 
M
T
 
E
L
x
A
A
x
Q
A
x
D
G
 
G
D
 
Q
R
 
Q
L
 
W
T
 
H
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
V
E
 
T
W
 
L
Q
 
A
A
 
A
L
 
I
A
x
F
V
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
L
M
 
P
D
 
G
A
 
A
L
x
T
A
 
S
Y
 
W
F
 
K
N
 
V
-
 
T
-
 
L
A
 
A
D
 
D
Q
 
G
G
 
K
I
 
T
L
 
L
I
 
I
S
 
Y
G
 
A
D
 
D
A
 
S
L
 
L
W
 
A
Q
 
T
D
 
P
G
 
G
F
 
Y
G
 
P
V
 
L
I
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Dsui_0987 FitnessBrowser__PS:Dsui_0987
MASSRSVAPPPRLPASLLVLERGWLSSNNVLCIEDEEAALVDSGYVTHAAQTLALVEKAL
DGRRLTRLINTHSHSDHIGGNAALKHATGCRVLVPAGMAATIAEWDEEALLLSPLGQQAA
RFQHDATLAAGDRLTLGGLEWQALAVPGHDMDALAYFNADQGILISGDALWQDGFGVIFA
ELLGGDGLRTTRQTLDMLAALPIRAVIPGHGAPFADIGESFERAYSRLAGFESSIERLAR
HALKVMLVFYLLEKRRVQRRELPGLIASLSFPRSVAARYLAMDEEETAEWLTADLLRAGV
LQEEEGWLVAR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory