SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Dsui_1516 FitnessBrowser__PS:Dsui_1516 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 5 hits to proteins with known functional sites (download)

1l7nA Transition state analogue of phosphoserine phosphatase (aluminum fluoride complex) (see paper)
24% identity, 95% coverage: 3:210/220 of query aligns to 5:193/209 of 1l7nA

query
sites
1l7nA
L
 
L
A
 
I
L
 
L
F
 
F
D
|
D
L
x
F
D
|
D
N
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
V
A
 
N
G
 
N
D
 
E
S
 
T
D
 
I
F
 
D
E
 
E
W
 
I
A
 
A
Q
 
R
F
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
E
G
 
A
A
 
G
L
 
V
D
 
E
G
 
E
E
 
E
I
 
V
H
 
K
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
N
 
-
E
 
-
K
 
K
F
 
I
Y
 
T
E
 
K
Q
 
E
Y
 
A
K
 
M
A
 
E
G
 
G
T
 
K
L
 
L
D
 
N
I
 
F
Y
 
E
E
 
Q
F
 
S
L
 
L
D
 
-
F
 
-
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
R
H
 
K
S
 
R
R
 
V
A
 
S
Q
 
L
L
 
L
D
 
K
A
 
D
W
 
L
H
 
P
Q
 
I
E
 
E
F
 
K
M
 
V
A
 
E
R
 
K
N
 
A
I
 
I
R
 
K
P
 
R
I
 
I
M
 
T
-
 
P
T
 
T
D
 
E
Q
 
G
A
 
A
R
 
E
A
 
E
K
 
T
V
 
I
Q
 
K
E
 
E
H
 
L
L
 
K
Q
 
N
R
 
R
G
 
G
D
 
Y
L
 
V
V
 
V
L
 
A
L
 
V
V
 
V
T
x
S
A
x
G
T
 
G
N
 
F
A
 
D
F
 
I
V
 
A
T
 
V
G
 
N
P
 
K
I
 
I
A
 
K
R
 
E
E
 
K
F
 
L
G
 
G
I
 
L
H
 
D
H
 
Y
L
 
A
I
 
F
A
 
A
T
 
N
I
 
R
P
 
L
E
 
I
Q
 
V
R
 
K
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
F
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
D
V
 
V
R
 
E
G
 
G
T
 
E
P
 
V
S
 
L
F
 
K
Q
 
E
D
 
N
G
 
A
K
|
K
I
 
G
T
 
E
R
 
I
V
 
L
E
 
E
D
 
K
W
 
I
L
 
A
E
 
K
A
 
I
Q
 
E
G
 
G
L
 
I
N
 
N
W
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
L
A
 
E
D
 
D
S
 
T
W
 
V
F
 
A
Y
 
V
S
 
G
D
|
D
S
 
G
R
 
A
N
|
N
D
|
D
L
 
I
P
 
S
L
 
M
L
 
F
E
 
K
K
 
K
V
 
A
S
 
G
C
 
L
P
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
F
D
 
C
P
 
A
D
 
K
P
 
P
I
 
I
L
 
L
K
 
K
A
 
E
E
 
K
A
 
A
E
 
D

1f5sA Crystal structure of phosphoserine phosphatase from methanococcus jannaschii (see paper)
24% identity, 95% coverage: 3:210/220 of query aligns to 6:194/210 of 1f5sA

query
sites
1f5sA
L
 
L
A
 
I
L
 
L
F
 
F
D
|
D
L
x
F
D
|
D
N
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
V
A
 
N
G
 
N
D
 
E
S
 
T
D
 
I
F
 
D
E
 
E
W
 
I
A
 
A
Q
 
R
F
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
E
G
 
A
A
 
G
L
 
V
D
 
E
G
 
E
E
 
E
I
 
V
H
 
K
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
N
 
-
E
 
-
K
 
K
F
 
I
Y
 
T
E
 
K
Q
 
E
Y
 
A
K
 
M
A
 
E
G
 
G
T
 
K
L
 
L
D
 
N
I
 
F
Y
 
E
E
 
Q
F
 
S
L
 
L
D
 
-
F
 
-
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
R
H
 
K
S
 
R
R
 
V
A
 
S
Q
 
L
L
 
L
D
 
K
A
 
D
W
 
L
H
 
P
Q
 
I
E
 
E
F
 
K
M
 
V
A
 
E
R
 
K
N
 
A
I
 
I
R
 
K
P
 
R
I
 
I
M
 
T
-
 
P
T
 
T
D
 
E
Q
 
G
A
 
A
R
 
E
A
 
E
K
 
T
V
 
I
Q
 
K
E
 
E
H
 
L
L
 
K
Q
 
N
R
 
R
G
 
G
D
 
Y
L
 
V
V
 
V
L
 
A
L
 
V
V
 
V
T
x
S
A
x
G
T
 
G
N
 
F
A
 
D
F
 
I
V
 
A
T
 
V
G
 
N
P
 
K
I
 
I
A
 
K
R
 
E
E
 
K
F
 
L
G
 
G
I
 
L
H
 
D
H
 
Y
L
 
A
I
 
F
A
 
A
T
 
N
I
 
R
P
 
L
E
 
I
Q
 
V
R
 
K
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
F
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
D
V
 
V
R
 
E
G
 
G
T
 
E
P
 
V
S
 
L
F
 
K
Q
 
E
D
 
N
G
 
A
K
|
K
I
 
G
T
 
E
R
 
I
V
 
L
E
 
E
D
 
K
W
 
I
L
 
A
E
 
K
A
 
I
Q
 
E
G
 
G
L
 
I
N
 
N
W
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
L
A
 
E
D
 
D
S
 
T
W
 
V
F
 
A
Y
 
V
S
 
G
D
|
D
S
 
G
R
 
A
N
 
N
D
|
D
L
 
I
P
 
S
L
 
M
L
 
F
E
 
K
K
 
K
V
 
A
S
 
G
C
 
L
P
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
F
D
 
C
P
 
A
D
 
K
P
 
P
I
 
I
L
 
L
K
 
K
A
 
E
E
 
K
A
 
A
E
 
D

Q58989 Phosphoserine phosphatase; PSP; PSPase; O-phosphoserine phosphohydrolase; EC 3.1.3.3 from Methanocaldococcus jannaschii (strain ATCC 43067 / DSM 2661 / JAL-1 / JCM 10045 / NBRC 100440) (Methanococcus jannaschii) (see 3 papers)
24% identity, 95% coverage: 3:210/220 of query aligns to 7:195/211 of Q58989

query
sites
Q58989
L
 
L
A
 
I
L
 
L
F
 
F
D
|
D
L
 
F
D
|
D
N
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
V
A
 
N
G
 
N
D
x
E
S
 
T
D
 
I
F
 
D
E
 
E
W
 
I
A
 
A
Q
 
R
F
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
E
G
 
A
A
 
G
L
 
V
D
 
E
G
 
E
E
 
E
I
 
V
H
 
K
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
N
 
-
E
 
-
K
 
K
F
 
I
Y
 
T
E
 
K
Q
 
E
Y
 
A
K
 
M
A
 
E
G
 
G
T
 
K
L
 
L
D
 
N
I
 
F
Y
 
E
E
 
Q
F
 
S
L
 
L
D
 
-
F
 
-
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
R
H
 
K
S
x
R
R
 
V
A
 
S
Q
 
L
L
 
L
D
 
K
A
 
D
W
 
L
H
 
P
Q
 
I
E
 
E
F
 
K
M
 
V
A
 
E
R
 
K
N
 
A
I
 
I
R
 
K
P
 
R
I
 
I
M
 
T
-
 
P
T
 
T
D
 
E
Q
 
G
A
 
A
R
 
E
A
 
E
K
 
T
V
 
I
Q
 
K
E
 
E
H
 
L
L
 
K
Q
 
N
R
 
R
G
 
G
D
 
Y
L
 
V
V
 
V
L
 
A
L
 
V
V
 
V
T
x
S
A
x
G
T
 
G
N
 
F
A
 
D
F
 
I
V
 
A
T
 
V
G
 
N
P
 
K
I
 
I
A
 
K
R
 
E
E
 
K
F
 
L
G
 
G
I
 
L
H
 
D
H
 
Y
L
 
A
I
 
F
A
 
A
T
 
N
I
 
R
P
 
L
E
 
I
Q
 
V
R
 
K
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
F
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
D
V
 
V
R
 
E
G
 
G
T
 
E
P
 
V
S
 
L
F
 
K
Q
 
E
D
 
N
G
 
A
K
|
K
I
 
G
T
 
E
R
 
I
V
 
L
E
 
E
D
 
K
W
 
I
L
 
A
E
 
K
A
 
I
Q
 
E
G
 
G
L
 
I
N
 
N
W
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
L
A
 
E
D
 
D
S
 
T
W
 
V
F
 
A
Y
 
V
S
 
G
D
|
D
S
 
G
R
 
A
N
|
N
D
 
D
L
 
I
P
 
S
L
 
M
L
 
F
E
 
K
K
 
K
V
 
A
S
 
G
C
 
L
P
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
F
D
 
C
P
 
A
D
 
K
P
 
P
I
 
I
L
 
L
K
 
K
A
 
E
E
 
K
A
 
A
E
 
D

1l7pA Substrate bound phosphoserine phosphatase complex structure (see paper)
23% identity, 95% coverage: 3:210/220 of query aligns to 4:192/208 of 1l7pA

query
sites
1l7pA
L
 
L
A
 
I
L
 
L
F
 
F
D
x
N
L
x
F
D
|
D
N
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
V
A
 
N
G
 
N
D
x
E
S
 
T
D
 
I
F
 
D
E
 
E
W
 
I
A
 
A
Q
 
R
F
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
E
G
 
A
A
 
G
L
 
V
D
 
E
G
 
E
E
 
E
I
 
V
H
 
K
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
N
 
-
E
 
-
K
 
K
F
 
I
Y
 
T
E
 
K
Q
 
E
Y
 
A
K
x
M
A
 
E
G
 
G
T
 
K
L
 
L
D
 
N
I
x
F
Y
 
E
E
 
Q
F
 
S
L
 
L
D
 
-
F
 
-
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
R
H
 
K
S
x
R
R
 
V
A
 
S
Q
 
L
L
 
L
D
 
K
A
 
D
W
 
L
H
 
P
Q
 
I
E
 
E
F
 
K
M
 
V
A
 
E
R
 
K
N
 
A
I
 
I
R
 
K
P
 
R
I
 
I
M
 
T
-
 
P
T
 
T
D
 
E
Q
 
G
A
 
A
R
 
E
A
 
E
K
 
T
V
 
I
Q
 
K
E
 
E
H
 
L
L
 
K
Q
 
N
R
 
R
G
 
G
D
 
Y
L
 
V
V
 
V
L
 
A
L
 
V
V
 
V
T
x
S
A
x
G
T
 
G
N
 
F
A
 
D
F
 
I
V
 
A
T
 
V
G
 
N
P
 
K
I
 
I
A
 
K
R
 
E
E
 
K
F
 
L
G
 
G
I
 
L
H
 
D
H
 
Y
L
 
A
I
 
F
A
 
A
T
 
N
I
 
R
P
 
L
E
 
I
Q
 
V
R
 
K
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
F
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
D
V
 
V
R
 
E
G
 
G
T
 
E
P
 
V
S
 
L
F
 
K
Q
 
E
D
 
N
G
 
A
K
|
K
I
 
G
T
 
E
R
 
I
V
 
L
E
 
E
D
 
K
W
 
I
L
 
A
E
 
K
A
 
I
Q
 
E
G
 
G
L
 
I
N
 
N
W
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
L
A
 
E
D
 
D
S
 
T
W
 
V
F
 
A
Y
 
V
S
 
G
D
 
D
S
 
G
R
 
A
N
 
N
D
|
D
L
 
I
P
 
S
L
 
M
L
 
F
E
 
K
K
 
K
V
 
A
S
 
G
C
 
L
P
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
F
D
 
C
P
 
A
D
 
K
P
 
P
I
 
I
L
 
L
K
 
K
A
 
E
E
 
K
A
 
A
E
 
D

1l7oA Crystal structure of phosphoserine phosphatase in apo form (see paper)
23% identity, 95% coverage: 3:210/220 of query aligns to 4:184/200 of 1l7oA

query
sites
1l7oA
L
 
L
A
 
I
L
 
L
F
 
F
D
 
N
L
 
F
D
 
D
N
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
V
A
 
N
G
 
N
D
 
E
S
 
T
D
 
I
F
 
D
E
 
E
W
 
I
A
 
A
Q
 
R
F
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
E
G
 
A
A
 
G
L
 
V
D
 
E
G
 
E
E
 
E
I
 
V
H
 
K
A
 
K
A
 
I
Q
 
T
N
 
N
E
 
-
K
 
-
F
 
-
Y
 
F
E
 
E
Q
 
Q
Y
 
S
K
 
L
A
 
R
G
 
K
T
 
R
L
 
V
D
 
S
I
 
L
Y
 
L
E
 
K
F
 
D
L
 
L
D
 
-
F
 
-
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
P
L
 
I
A
 
E
R
 
K
H
 
V
S
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
W
 
-
H
 
-
Q
 
-
E
 
-
F
 
-
M
 
-
A
 
I
R
 
K
N
 
R
I
 
I
R
 
T
P
 
P
I
 
-
M
 
-
T
 
T
D
 
E
Q
 
G
A
 
A
R
 
E
A
 
E
K
 
T
V
 
I
Q
 
K
E
 
E
H
 
L
L
 
K
Q
 
N
R
 
R
G
 
G
D
 
Y
L
 
V
V
 
V
L
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
S
A
 
G
T
 
G
N
 
F
A
 
D
F
 
I
V
 
A
T
 
V
G
 
N
P
 
K
I
 
I
A
 
K
R
 
E
E
 
K
F
 
L
G
 
G
I
 
L
H
 
D
H
 
Y
L
 
A
I
 
F
A
 
A
T
 
N
I
 
R
P
 
L
E
 
I
Q
 
V
R
 
K
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
F
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
D
V
 
V
R
 
E
G
 
G
T
 
E
P
 
V
S
 
L
F
 
K
Q
 
E
D
 
N
G
 
A
K
 
K
I
 
G
T
 
E
R
 
I
V
 
L
E
 
E
D
 
K
W
 
I
L
 
A
E
 
K
A
 
I
Q
 
E
G
 
G
L
 
I
N
 
N
W
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
L
A
 
E
D
 
D
S
 
T
W
 
V
F
 
A
Y
 
V
S
 
G
D
 
D
S
 
G
R
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
I
P
 
S
L
 
M
L
 
F
E
 
K
K
 
K
V
 
A
S
 
G
C
 
L
P
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
F
D
 
C
P
 
A
D
 
K
P
 
P
I
 
I
L
 
L
K
 
K
A
 
E
E
 
K
A
 
A
E
 
D

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Dsui_1516 FitnessBrowser__PS:Dsui_1516
MNLALFDLDNTLLAGDSDFEWAQFLIGQGALDGEIHAAQNEKFYEQYKAGTLDIYEFLDF
QLKPLARHSRAQLDAWHQEFMARNIRPIMTDQARAKVQEHLQRGDLVLLVTATNAFVTGP
IAREFGIHHLIATIPEQRDGQFTGGVRGTPSFQDGKITRVEDWLEAQGLNWGSFADSWFY
SDSRNDLPLLEKVSCPVAVDPDPILKAEAERRGWPVISLR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory