SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Dsui_2068 Dsui_2068 ABC-type metal ion transport system, ATPase component to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
52% identity, 85% coverage: 11:247/278 of query aligns to 2:238/343 of P30750

query
sites
P30750
L
 
I
A
 
K
L
 
L
R
 
S
G
 
N
V
 
I
S
 
T
K
 
K
S
 
V
F
 
F
R
 
H
T
 
Q
P
 
G
D
 
T
G
 
R
Q
 
T
Q
 
I
V
 
Q
G
 
A
V
 
L
H
 
N
P
 
N
T
 
V
D
 
S
L
 
L
D
 
H
V
 
V
A
 
P
P
 
A
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
H
 
Y
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
A
S
|
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
L
 
C
A
 
V
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
T
A
 
E
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
V
 
L
V
 
V
H
 
D
G
 
G
Q
 
Q
D
 
E
L
 
L
M
 
T
T
 
T
L
 
L
S
 
S
P
 
E
A
 
S
D
 
E
L
 
L
R
 
T
T
 
K
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
L
H
 
S
N
 
S
R
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
F
D
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
L
P
 
P
L
 
L
R
 
E
I
 
L
A
 
D
G
 
N
A
 
T
D
 
P
E
 
K
A
 
D
R
 
E
I
 
V
N
 
K
E
 
R
R
 
R
V
 
V
K
 
T
T
 
E
C
 
L
L
 
L
E
 
S
F
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
G
E
 
D
K
 
K
A
 
H
G
 
D
V
 
S
Y
 
Y
P
 
P
A
 
S
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
S
E
 
N
P
 
P
H
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
R
 
A
T
 
T
T
 
T
Q
 
R
S
 
S
L
 
I
L
 
L
E
 
E
V
 
L
L
 
L
A
 
K
D
 
D
V
 
I
N
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
L
T
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
S
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
D
V
 
V
I
 
V
R
 
K
R
 
R
L
 
I
C
 
C
H
 
D
R
 
C
V
 
V
S
 
A
V
 
V
M
 
I
E
 
S
A
 
N
G
 
G
Q
 
E
I
 
L
V
 
I
E
 
E
R
 
Q
L
 
D
T
 
T
I
 
V
A
 
S
N
 
E
G
 
V
R
 
F
I
 
S
P
 
H
P
 
P
D
 
K
S
 
T
Q
 
P
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
52% identity, 85% coverage: 11:247/278 of query aligns to 3:239/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
L
 
I
A
 
K
L
 
L
R
 
S
G
 
N
V
 
I
S
 
T
K
 
K
S
 
V
F
|
F
R
 
H
T
x
Q
P
 
G
D
 
T
G
 
R
Q
 
T
Q
 
I
V
 
Q
G
 
A
V
 
L
H
 
N
P
 
N
T
 
V
D
 
S
L
 
L
D
 
H
V
 
V
A
 
P
P
 
A
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
H
 
Y
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
A
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
L
 
C
A
 
V
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
T
A
 
E
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
V
 
L
V
 
V
H
 
D
G
 
G
Q
 
Q
D
 
E
L
 
L
M
 
T
T
 
T
L
 
L
S
 
S
P
 
E
A
 
S
D
 
E
L
 
L
R
 
T
T
 
K
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
L
H
 
S
N
 
S
R
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
F
D
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
L
P
 
P
L
 
L
R
 
E
I
 
L
A
 
D
G
 
N
A
 
T
D
 
P
E
 
K
A
 
D
R
 
E
I
 
V
N
 
K
E
 
R
R
 
R
V
 
V
K
 
T
T
 
E
C
 
L
L
 
L
E
 
S
F
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
G
E
 
D
K
 
K
A
 
H
G
 
D
V
 
S
Y
 
Y
P
 
P
A
 
S
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
S
E
 
N
P
 
P
H
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
R
 
A
T
 
T
T
 
T
Q
 
R
S
 
S
L
 
I
L
 
L
E
 
E
V
 
L
L
 
L
A
 
K
D
 
D
V
 
I
N
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
L
T
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
S
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
D
V
 
V
I
 
V
R
 
K
R
 
R
L
 
I
C
 
C
H
 
D
R
 
C
V
 
V
S
 
A
V
 
V
M
 
I
E
 
S
A
 
N
G
 
G
Q
 
E
I
 
L
V
 
I
E
 
E
R
 
Q
L
 
D
T
 
T
I
 
V
A
 
S
N
 
E
G
 
V
R
 
F
I
 
S
P
 
H
P
 
P
D
 
K
S
 
T
Q
 
P
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
52% identity, 85% coverage: 11:247/278 of query aligns to 3:239/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
L
 
I
A
 
K
L
 
L
R
 
S
G
 
N
V
 
I
S
 
T
K
 
K
S
 
V
F
|
F
R
 
H
T
 
Q
P
 
G
D
 
T
G
 
R
Q
 
T
Q
 
I
V
 
Q
G
 
A
V
 
L
H
 
N
P
 
N
T
 
V
D
 
S
L
 
L
D
 
H
V
 
V
A
 
P
P
 
A
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
H
 
Y
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
A
S
 
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
L
 
C
A
 
V
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
T
A
 
E
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
V
 
L
V
 
V
H
 
D
G
 
G
Q
 
Q
D
 
E
L
 
L
M
 
T
T
 
T
L
 
L
S
 
S
P
 
E
A
 
S
D
 
E
L
 
L
R
 
T
T
 
K
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
L
H
 
S
N
 
S
R
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
F
D
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
L
P
 
P
L
 
L
R
 
E
I
 
L
A
 
D
G
 
N
A
 
T
D
 
P
E
 
K
A
 
D
R
 
E
I
 
V
N
 
K
E
 
R
R
 
R
V
 
V
K
 
T
T
 
E
C
 
L
L
 
L
E
 
S
F
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
G
E
 
D
K
 
K
A
 
H
G
 
D
V
 
S
Y
 
Y
P
 
P
A
 
S
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
S
E
 
N
P
 
P
H
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
R
 
A
T
 
T
T
 
T
Q
 
R
S
 
S
L
 
I
L
 
L
E
 
E
V
 
L
L
 
L
A
 
K
D
 
D
V
 
I
N
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
L
T
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
S
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
D
V
 
V
I
 
V
R
 
K
R
 
R
L
 
I
C
 
C
H
 
D
R
 
C
V
 
V
S
 
A
V
 
V
M
 
I
E
 
S
A
 
N
G
 
G
Q
 
E
I
 
L
V
 
I
E
 
E
R
 
Q
L
 
D
T
 
T
I
 
V
A
 
S
N
 
E
G
 
V
R
 
F
I
 
S
P
 
H
P
 
P
D
 
K
S
 
T
Q
 
P
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
52% identity, 85% coverage: 11:247/278 of query aligns to 3:239/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
L
 
I
A
 
K
L
 
L
R
 
S
G
 
N
V
 
I
S
 
T
K
 
K
S
 
V
F
|
F
R
 
H
T
x
Q
P
 
G
D
 
T
G
 
R
Q
 
T
Q
x
I
V
 
Q
G
 
A
V
 
L
H
 
N
P
 
N
T
 
V
D
 
S
L
 
L
D
 
H
V
 
V
A
 
P
P
 
A
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
H
 
Y
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
A
S
|
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
L
 
C
A
 
V
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
T
A
 
E
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
V
 
L
V
 
V
H
 
D
G
 
G
Q
 
Q
D
 
E
L
 
L
M
 
T
T
 
T
L
 
L
S
 
S
P
 
E
A
 
S
D
 
E
L
 
L
R
 
T
T
 
K
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
L
H
 
S
N
 
S
R
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
F
D
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
L
P
 
P
L
 
L
R
 
E
I
 
L
A
 
D
G
 
N
A
 
T
D
 
P
E
 
K
A
 
D
R
 
E
I
 
V
N
 
K
E
 
R
R
 
R
V
 
V
K
 
T
T
 
E
C
 
L
L
 
L
E
 
S
F
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
G
E
 
D
K
 
K
A
 
H
G
 
D
V
 
S
Y
 
Y
P
 
P
A
 
S
Q
x
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
|
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
S
E
 
N
P
 
P
H
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
R
 
A
T
 
T
T
 
T
Q
 
R
S
 
S
L
 
I
L
 
L
E
 
E
V
 
L
L
 
L
A
 
K
D
 
D
V
 
I
N
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
L
T
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
S
 
T
H
|
H
E
 
E
M
 
M
G
 
D
V
 
V
I
 
V
R
 
K
R
 
R
L
 
I
C
 
C
H
 
D
R
 
C
V
 
V
S
 
A
V
 
V
M
 
I
E
 
S
A
 
N
G
 
G
Q
 
E
I
 
L
V
 
I
E
 
E
R
 
Q
L
 
D
T
 
T
I
 
V
A
 
S
N
 
E
G
 
V
R
 
F
I
 
S
P
 
H
P
 
P
D
 
K
S
 
T
Q
 
P
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q

8i6rB Cryo-em structure of pseudomonas aeruginosa ftse(e163q)x/envc complex with atp in peptidisc (see paper)
46% identity, 75% coverage: 21:229/278 of query aligns to 10:216/222 of 8i6rB

query
sites
8i6rB
R
 
R
T
x
Y
P
 
P
D
 
N
G
 
G
Q
x
H
Q
 
-
V
 
V
G
 
G
V
 
L
H
 
H
P
 
E
T
 
V
D
 
S
L
 
F
D
 
R
V
 
V
A
 
H
P
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
H
 
L
G
 
F
I
 
V
I
 
T
G
 
G
F
 
H
S
|
S
G
 
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
I
N
 
L
L
 
A
L
 
M
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
T
A
 
S
G
 
G
Q
 
K
V
 
L
V
 
L
V
 
L
H
 
G
G
 
G
Q
 
Q
D
 
D
L
 
L
M
 
G
T
 
R
L
 
I
S
 
T
P
 
T
A
 
A
D
 
Q
L
 
I
R
 
P
T
 
F
A
 
L
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
V
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
N
F
 
H
N
 
Q
L
 
L
L
 
L
H
 
T
N
 
D
R
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
A
D
 
D
N
 
N
V
 
I
A
 
A
F
 
L
P
 
P
L
 
L
R
 
Q
I
 
I
A
 
L
G
 
G
A
 
M
D
 
P
E
 
K
A
 
P
R
 
E
I
 
I
N
 
A
E
 
K
R
 
R
V
 
V
K
 
A
T
 
S
C
 
A
L
 
L
E
 
E
F
 
R
V
 
V
G
 
N
L
 
L
S
 
K
E
 
E
K
 
K
A
 
G
G
 
E
V
 
A
Y
 
L
P
 
P
A
 
S
Q
x
D
L
 
L
S
|
S
G
x
T
G
|
G
Q
|
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
P
 
H
E
 
Q
P
 
P
H
 
A
V
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
R
 
R
T
 
L
T
 
A
Q
 
S
S
 
E
L
 
I
L
 
M
E
 
G
V
 
V
L
 
F
A
 
E
D
 
D
V
 
I
N
 
N
R
 
-
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
T
T
 
T
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
A
S
 
S
H
 
H
E
 
D
M
 
L
G
 
A
V
 
L
I
 
I
R
 
A
R
 
R
L
 
M
C
 
R
H
 
H
R
 
R
V
 
M
S
 
L
V
 
T
M
 
L
E
 
Q
A
 
R
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
V
 
I

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
47% identity, 80% coverage: 9:230/278 of query aligns to 1:216/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
P
 
P
A
 
I
L
 
I
A
 
R
L
 
I
R
 
R
G
 
N
V
 
L
S
 
H
K
 
K
S
 
W
F
|
F
R
 
-
T
 
G
P
 
P
D
 
L
G
 
H
Q
x
V
Q
 
L
V
 
K
G
 
G
V
 
I
H
 
H
P
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
L
D
 
E
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
K
H
 
L
G
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
F
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
L
 
T
A
 
I
N
 
N
L
 
R
L
 
L
E
 
E
R
 
D
P
 
F
D
 
Q
A
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
V
H
 
D
G
 
G
Q
 
-
D
 
-
L
 
-
M
 
-
T
 
-
L
 
L
S
 
S
P
 
V
A
 
K
D
 
D
-
 
D
-
 
R
-
 
A
L
 
L
R
 
R
T
 
E
A
 
I
R
 
R
Q
 
R
R
 
E
I
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
Q
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
F
H
 
P
N
 
H
R
 
M
T
 
T
V
 
V
A
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
T
F
 
L
-
 
A
P
 
P
L
 
M
R
 
R
I
 
V
A
 
R
G
 
R
A
 
W
D
 
P
E
 
R
A
 
E
R
 
K
I
 
A
N
 
E
E
 
K
R
 
K
V
 
A
K
 
L
T
 
E
C
 
L
L
 
L
E
 
E
F
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
I
S
 
L
E
 
D
K
 
Q
A
 
A
G
 
R
V
 
K
Y
 
Y
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
M
E
 
E
P
 
P
H
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
A
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
R
 
E
T
 
M
T
 
V
Q
 
G
S
 
E
L
 
V
L
 
L
E
 
D
V
 
V
L
 
M
A
 
R
D
 
D
V
 
L
N
 
A
R
 
Q
R
 
G
L
 
-
G
 
G
V
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
V
 
V
S
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
F
I
 
A
R
 
R
R
 
E
L
 
V
C
 
A
H
 
D
R
 
R
V
 
V
S
 
V
V
 
F
M
 
M
E
 
D
A
 
G
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
V
 
V
E
 
E

P0A9R7 Cell division ATP-binding protein FtsE from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
44% identity, 77% coverage: 16:228/278 of query aligns to 7:215/222 of P0A9R7

query
sites
P0A9R7
V
 
V
S
 
S
K
 
K
S
 
A
F
 
Y
R
 
L
T
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
G
Q
 
G
Q
 
R
V
 
Q
G
 
A
V
 
L
H
 
Q
P
 
G
T
 
V
D
 
T
L
 
F
D
 
H
V
 
M
A
 
Q
P
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
M
H
 
A
G
 
F
I
 
L
I
 
T
G
 
G
F
 
H
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
K
L
 
L
A
 
I
N
x
C
L
 
G
L
 
I
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
V
 
I
V
 
W
V
 
F
H
 
S
G
 
G
Q
 
H
D
 
D
L
 
I
M
 
T
T
 
R
L
 
L
S
 
K
P
 
N
A
 
R
D
 
E
L
 
V
R
 
P
T
 
F
A
 
L
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
D
F
 
H
N
 
H
L
 
L
L
 
L
H
 
M
N
 
D
R
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
Y
D
 
D
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
S
E
 
G
A
 
D
R
 
D
I
 
I
N
 
R
E
 
R
R
 
R
V
 
V
K
 
S
T
 
A
C
 
A
L
 
L
E
 
D
F
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
L
E
 
D
K
 
K
A
 
A
G
 
K
V
 
N
Y
 
F
P
 
P
A
 
I
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
P
 
N
E
 
K
P
 
P
H
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
D
R
 
A
T
 
L
T
 
S
Q
 
E
S
 
G
L
 
I
L
 
L
E
 
R
V
 
L
L
 
F
A
 
E
D
 
E
V
 
F
N
 
N
R
 
-
R
 
R
L
 
V
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
V
L
 
L
L
 
M
V
 
A
S
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
I
G
 
N
V
 
L
I
 
I
R
 
S
R
 
R
L
 
R
C
 
S
H
 
Y
R
 
R
V
 
M
S
 
L
V
 
T
M
 
L
E
 
S
A
 
D
G
 
G
Q
 
H
I
 
L

8w6iD Cryo-em structure of escherichia coli str k12 ftsex complex with atp- gamma-s in peptidisc
44% identity, 77% coverage: 16:228/278 of query aligns to 7:215/219 of 8w6iD

query
sites
8w6iD
V
 
V
S
 
S
K
 
K
S
 
A
F
x
Y
R
 
L
T
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
G
Q
 
G
Q
 
R
V
 
Q
G
 
A
V
 
L
H
 
Q
P
 
G
T
 
V
D
 
T
L
 
F
D
 
H
V
 
M
A
 
Q
P
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
M
H
 
A
G
 
F
I
 
L
I
 
T
G
 
G
F
 
H
S
|
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
R
 
K
L
 
L
A
 
I
N
 
C
L
 
G
L
 
I
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
V
 
I
V
 
W
V
 
F
H
 
S
G
 
G
Q
 
H
D
 
D
L
 
I
M
 
T
T
 
R
L
 
L
S
 
K
P
 
N
A
 
R
D
 
E
L
 
V
R
 
P
T
 
F
A
 
L
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
|
Q
H
 
D
F
 
H
N
 
H
L
 
L
L
 
L
H
 
M
N
 
D
R
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
Y
D
 
D
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
S
E
 
G
A
 
D
R
 
D
I
 
I
N
 
R
E
 
R
R
 
R
V
 
V
K
 
S
T
 
A
C
 
A
L
 
L
E
 
D
F
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
L
E
 
D
K
|
K
A
 
A
G
 
K
V
 
N
Y
 
F
P
 
P
A
 
I
Q
|
Q
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
Q
x
E
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
P
 
N
E
 
K
P
 
P
H
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
D
R
 
A
T
 
L
T
 
S
Q
 
E
S
 
G
L
 
I
L
 
L
E
 
R
V
 
L
L
 
F
A
 
E
D
 
E
V
 
F
N
 
N
R
 
-
R
 
R
L
 
V
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
V
L
 
L
L
 
M
V
 
A
S
 
T
H
|
H
E
 
D
M
 
I
G
 
N
V
 
L
I
 
I
R
 
S
R
 
R
L
 
R
C
 
S
H
 
Y
R
 
R
V
 
M
S
 
L
V
 
T
M
 
L
E
 
S
A
 
D
G
 
G
Q
 
H
I
 
L

8hd0A Cell divisome spg hydrolysis machinery ftsex-envc
43% identity, 77% coverage: 16:228/278 of query aligns to 7:215/218 of 8hd0A

query
sites
8hd0A
V
 
V
S
 
S
K
 
K
S
 
A
F
x
Y
R
 
L
T
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
G
Q
 
G
Q
x
R
V
 
Q
G
x
A
V
 
L
H
 
Q
P
 
G
T
 
V
D
 
T
L
 
F
D
 
H
V
 
M
A
 
Q
P
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
M
H
 
A
G
 
F
I
 
L
I
 
T
G
 
G
F
 
H
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
R
 
K
L
 
L
A
 
I
N
 
C
L
 
G
L
 
I
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
V
 
I
V
 
W
V
 
F
H
 
S
G
 
G
Q
 
H
D
 
D
L
 
I
M
 
T
T
 
R
L
 
L
S
 
K
P
 
N
A
 
R
D
 
E
L
 
V
R
 
P
T
 
F
A
 
L
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
D
F
 
H
N
 
H
L
 
L
L
 
L
H
 
M
N
 
D
R
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
Y
D
 
D
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
S
E
 
G
A
 
D
R
 
D
I
 
I
N
 
R
E
 
R
R
 
R
V
 
V
K
 
S
T
 
A
C
 
A
L
 
L
E
 
D
F
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
L
E
 
D
K
 
K
A
 
A
G
 
K
V
 
N
Y
 
F
P
 
P
A
 
I
Q
 
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
 
E
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
P
 
N
E
 
K
P
 
P
H
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
D
R
 
A
T
 
L
T
 
S
Q
 
E
S
 
G
L
 
I
L
 
L
E
 
R
V
 
L
L
 
F
A
 
E
D
 
E
V
 
F
N
 
N
R
 
-
R
 
R
L
 
V
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
V
L
 
L
L
 
M
V
 
A
S
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
I
G
 
N
V
 
L
I
 
I
R
 
S
R
 
R
L
 
R
C
 
S
H
 
Y
R
 
R
V
 
M
S
 
L
V
 
T
M
 
L
E
 
S
A
 
D
G
 
G
Q
 
H
I
 
L

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
45% identity, 72% coverage: 35:233/278 of query aligns to 22:219/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
L
 
L
D
 
K
V
 
V
A
 
N
P
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
V
H
 
V
G
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
F
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
C
A
 
I
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
E
P
 
P
D
 
T
A
 
K
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
V
 
F
V
 
I
H
 
D
G
 
G
Q
 
V
D
 
K
L
 
I
M
 
N
T
 
N
L
 
-
S
 
G
P
 
K
A
 
V
D
 
N
L
 
I
R
 
N
T
 
K
A
 
V
R
 
R
Q
 
Q
R
 
K
I
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
F
H
 
P
N
 
H
R
 
L
T
 
T
V
 
A
A
 
I
D
 
E
N
 
N
V
 
I
A
 
T
F
 
L
-
 
A
P
 
P
L
 
V
R
 
K
I
 
V
A
 
K
G
 
K
A
 
M
D
 
N
E
 
K
A
 
K
R
 
E
I
 
A
N
 
E
E
 
E
R
 
L
V
 
A
K
 
V
T
 
D
C
 
L
L
 
L
E
 
A
F
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
L
E
 
D
K
 
K
A
 
K
G
 
D
V
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
A
 
I
Q
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
M
E
 
Q
P
 
P
H
 
E
V
 
V
L
 
M
L
 
L
A
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
R
 
E
T
 
M
T
 
V
Q
 
K
S
 
E
L
 
V
L
 
L
E
 
N
V
 
V
L
 
M
A
 
K
D
 
Q
V
 
L
N
 
A
R
 
N
R
 
E
L
 
-
G
 
G
V
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
V
 
V
S
 
T
H
|
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
F
I
 
A
R
 
R
R
 
E
L
 
V
C
 
G
H
 
D
R
 
R
V
 
V
S
 
I
V
 
F
M
 
M
E
 
D
A
 
D
G
 
G
Q
 
V
I
 
I
V
 
V
E
 
E
R
 
E
L
 
G
T
 
T

Sites not aligning to the query:

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
42% identity, 71% coverage: 34:230/278 of query aligns to 23:218/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
D
 
N
L
 
V
D
 
H
V
 
I
A
 
R
P
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
H
 
V
G
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
L
 
C
A
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
D
P
 
F
D
 
D
A
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
I
V
 
I
V
 
I
H
 
D
G
 
G
Q
 
I
D
 
N
L
 
L
M
 
K
T
 
A
L
 
-
S
 
K
P
 
D
A
 
T
D
 
N
L
 
L
R
 
N
T
 
K
A
 
V
R
 
R
Q
 
E
R
 
E
I
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
F
H
 
P
N
 
H
R
 
M
T
 
T
V
 
V
A
 
L
D
 
N
N
 
N
V
 
I
A
 
T
F
 
L
-
 
A
P
 
P
L
 
M
R
 
K
I
 
V
A
 
R
G
 
K
A
 
W
D
 
P
E
 
R
A
 
E
R
 
K
I
 
A
N
 
E
E
 
A
R
 
K
V
 
A
K
 
M
T
 
E
C
 
L
L
 
L
E
 
D
F
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
E
 
D
K
 
K
A
 
A
G
 
H
V
 
A
Y
 
Y
P
 
P
A
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
M
E
 
E
P
 
P
H
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
A
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
R
 
E
T
 
M
T
 
V
Q
 
G
S
 
E
L
 
V
L
 
L
E
 
S
V
 
V
L
 
M
A
 
K
D
 
Q
V
 
L
N
 
A
R
 
N
R
 
E
L
 
-
G
 
G
V
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
V
 
V
S
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
F
I
 
A
R
 
R
R
 
E
L
 
V
C
 
G
H
 
D
R
 
R
V
 
V
S
 
L
V
 
F
M
 
M
E
 
D
A
 
G
G
 
G
Q
 
Y
I
 
I
V
 
I
E
 
E

Sites not aligning to the query:

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
42% identity, 71% coverage: 34:230/278 of query aligns to 23:218/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
D
 
N
L
 
V
D
 
H
V
 
I
A
 
R
P
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
H
 
V
G
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
P
S
|
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
L
 
C
A
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
D
P
 
F
D
 
D
A
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
I
V
 
I
V
 
I
H
 
D
G
 
G
Q
 
I
D
 
N
L
 
L
M
 
K
T
 
A
L
 
-
S
 
K
P
 
D
A
 
T
D
 
N
L
 
L
R
 
N
T
 
K
A
 
V
R
 
R
Q
 
E
R
 
E
I
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
F
H
 
P
N
 
H
R
 
M
T
 
T
V
 
V
A
 
L
D
 
N
N
 
N
V
 
I
A
 
T
F
 
L
-
 
A
P
 
P
L
 
M
R
 
K
I
 
V
A
 
R
G
 
K
A
 
W
D
 
P
E
 
R
A
 
E
R
 
K
I
 
A
N
 
E
E
 
A
R
 
K
V
 
A
K
 
M
T
 
E
C
 
L
L
 
L
E
 
D
F
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
E
 
D
K
 
K
A
 
A
G
 
H
V
 
A
Y
 
Y
P
 
P
A
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
M
E
 
E
P
 
P
H
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
A
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
R
 
E
T
 
M
T
 
V
Q
 
G
S
 
E
L
 
V
L
 
L
E
 
S
V
 
V
L
 
M
A
 
K
D
 
Q
V
 
L
N
 
A
R
 
N
R
 
E
L
 
-
G
 
G
V
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
V
 
V
S
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
F
I
 
A
R
 
R
R
 
E
L
 
V
C
 
G
H
 
D
R
 
R
V
 
V
S
 
L
V
 
F
M
 
M
E
 
D
A
 
G
G
 
G
Q
 
Y
I
 
I
V
 
I
E
 
E

Sites not aligning to the query:

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
42% identity, 71% coverage: 34:230/278 of query aligns to 23:218/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
D
 
N
L
 
V
D
 
H
V
 
I
A
 
R
P
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
H
 
V
G
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
L
 
C
A
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
D
P
 
F
D
 
D
A
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
I
V
 
I
V
 
I
H
 
D
G
 
G
Q
 
I
D
 
N
L
 
L
M
 
K
T
 
A
L
 
-
S
 
K
P
 
D
A
 
T
D
 
N
L
 
L
R
 
N
T
 
K
A
 
V
R
 
R
Q
 
E
R
 
E
I
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
F
H
 
P
N
 
H
R
 
M
T
 
T
V
 
V
A
 
L
D
 
N
N
 
N
V
 
I
A
 
T
F
 
L
-
 
A
P
 
P
L
 
M
R
 
K
I
 
V
A
 
R
G
 
K
A
 
W
D
 
P
E
 
R
A
 
E
R
 
K
I
 
A
N
 
E
E
 
A
R
 
K
V
 
A
K
 
M
T
 
E
C
 
L
L
 
L
E
 
D
F
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
E
 
D
K
 
K
A
 
A
G
 
H
V
 
A
Y
 
Y
P
 
P
A
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
M
E
 
E
P
 
P
H
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
A
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
R
 
E
T
 
M
T
 
V
Q
 
G
S
 
E
L
 
V
L
 
L
E
 
S
V
 
V
L
 
M
A
 
K
D
 
Q
V
 
L
N
 
A
R
 
N
R
 
E
L
 
-
G
 
G
V
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
V
 
V
S
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
F
I
 
A
R
 
R
R
 
E
L
 
V
C
 
G
H
 
D
R
 
R
V
 
V
S
 
L
V
 
F
M
 
M
E
 
D
A
 
G
G
 
G
Q
 
Y
I
 
I
V
 
I
E
 
E

Sites not aligning to the query:

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
42% identity, 71% coverage: 34:230/278 of query aligns to 23:218/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
D
 
N
L
 
V
D
 
H
V
 
I
A
 
R
P
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
H
 
V
G
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
L
 
C
A
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
D
P
 
F
D
 
D
A
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
I
V
 
I
V
 
I
H
 
D
G
 
G
Q
 
I
D
 
N
L
 
L
M
 
K
T
 
A
L
 
-
S
 
K
P
 
D
A
 
T
D
 
N
L
 
L
R
 
N
T
 
K
A
 
V
R
 
R
Q
 
E
R
 
E
I
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
F
H
 
P
N
 
H
R
 
M
T
 
T
V
 
V
A
 
L
D
 
N
N
 
N
V
 
I
A
 
T
F
 
L
-
 
A
P
 
P
L
 
M
R
 
K
I
 
V
A
 
R
G
 
K
A
 
W
D
 
P
E
 
R
A
 
E
R
 
K
I
 
A
N
 
E
E
 
A
R
 
K
V
 
A
K
 
M
T
 
E
C
 
L
L
 
L
E
 
D
F
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
E
 
D
K
 
K
A
 
A
G
 
H
V
 
A
Y
 
Y
P
 
P
A
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
M
E
 
E
P
 
P
H
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
A
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
R
 
E
T
 
M
T
 
V
Q
 
G
S
 
E
L
 
V
L
 
L
E
 
S
V
 
V
L
 
M
A
 
K
D
 
Q
V
 
L
N
 
A
R
 
N
R
 
E
L
 
-
G
 
G
V
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
V
 
V
S
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
F
I
 
A
R
 
R
R
 
E
L
 
V
C
 
G
H
 
D
R
 
R
V
 
V
S
 
L
V
 
F
M
 
M
E
 
D
A
 
G
G
 
G
Q
 
Y
I
 
I
V
 
I
E
 
E

Sites not aligning to the query:

7ahhC Opua inhibited inward-facing, sbd docked (see paper)
38% identity, 74% coverage: 25:230/278 of query aligns to 37:243/382 of 7ahhC

query
sites
7ahhC
G
 
G
Q
 
A
Q
x
T
V
|
V
G
|
G
V
 
V
H
 
Y
P
 
D
T
 
T
D
 
N
L
 
F
D
 
E
V
 
I
A
 
N
P
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
H
 
F
G
 
V
I
 
I
I
 
M
G
 
G
F
 
L
S
 
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
L
N
 
N
L
 
R
L
 
L
E
 
I
R
 
E
P
 
P
D
 
T
A
 
S
G
 
G
Q
 
K
V
 
I
V
 
F
V
 
I
H
 
D
G
 
N
Q
 
Q
D
 
D
L
 
V
M
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
N
P
 
K
A
 
E
D
 
D
L
 
L
R
 
L
T
 
Q
A
 
V
R
 
R
Q
 
R
R
 
K
-
 
T
I
 
M
G
 
S
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
N
F
 
F
N
 
G
L
 
L
L
 
F
H
 
P
N
 
H
R
 
R
T
 
T
V
 
I
A
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
T
A
 
E
F
 
Y
P
 
G
L
 
L
R
 
E
I
 
V
A
 
Q
G
 
N
A
 
V
D
 
P
E
 
K
A
 
E
R
 
E
I
 
R
N
 
R
E
 
K
R
 
R
V
 
A
K
 
E
T
 
K
C
 
A
L
 
L
E
 
D
F
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
S
 
L
E
 
D
K
 
F
A
 
K
G
 
D
V
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
A
 
K
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
N
E
 
D
P
 
P
H
 
E
V
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
M
D
|
D
E
|
E
P
 
A
T
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
R
 
L
T
 
I
T
 
R
Q
 
R
S
 
E
L
 
M
L
 
Q
E
 
D
V
 
E
L
 
L
A
 
L
D
 
E
V
 
L
N
 
Q
R
 
A
R
 
K
L
 
F
G
 
Q
V
 
K
T
 
T
I
 
I
L
 
I
L
 
F
V
 
V
S
 
S
H
 
H
E
 
D
M
 
L
G
 
N
V
 
E
I
 
A
R
 
L
R
 
R
L
 
I
C
 
G
H
 
D
R
 
R
V
 
I
S
 
A
V
 
I
M
 
M
E
 
K
A
 
D
G
 
G
Q
 
K
I
 
I
V
 
M
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

7aheC Opua inhibited inward facing (see paper)
38% identity, 74% coverage: 25:230/278 of query aligns to 37:243/382 of 7aheC

query
sites
7aheC
G
 
G
Q
 
A
Q
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
V
H
 
Y
P
 
D
T
 
T
D
 
N
L
 
F
D
 
E
V
 
I
A
 
N
P
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
H
 
F
G
 
V
I
 
I
I
 
M
G
 
G
F
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
L
N
 
N
L
 
R
L
 
L
E
 
I
R
 
E
P
 
P
D
 
T
A
 
S
G
 
G
Q
 
K
V
 
I
V
 
F
V
 
I
H
 
D
G
 
N
Q
 
Q
D
 
D
L
 
V
M
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
N
P
 
K
A
 
E
D
 
D
L
 
L
R
 
L
T
 
Q
A
 
V
R
 
R
Q
 
R
R
 
K
-
 
T
I
 
M
G
 
S
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
N
F
 
F
N
 
G
L
 
L
L
 
F
H
 
P
N
 
H
R
 
R
T
 
T
V
 
I
A
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
T
A
 
E
F
 
Y
P
 
G
L
 
L
R
 
E
I
 
V
A
 
Q
G
 
N
A
 
V
D
 
P
E
 
K
A
 
E
R
 
E
I
 
R
N
 
R
E
 
K
R
 
R
V
 
A
K
 
E
T
 
K
C
 
A
L
 
L
E
 
D
F
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
S
 
L
E
 
D
K
 
F
A
 
K
G
 
D
V
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
A
 
K
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
N
E
 
D
P
 
P
H
 
E
V
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
R
 
L
T
 
I
T
 
R
Q
 
R
S
 
E
L
 
M
L
 
Q
E
 
D
V
 
E
L
 
L
A
 
L
D
 
E
V
 
L
N
 
Q
R
 
A
R
 
K
L
 
F
G
 
Q
V
 
K
T
 
T
I
 
I
L
 
I
L
 
F
V
 
V
S
 
S
H
 
H
E
 
D
M
 
L
G
 
N
V
 
E
I
 
A
R
 
L
R
 
R
L
 
I
C
 
G
H
 
D
R
 
R
V
 
I
S
 
A
V
 
I
M
 
M
E
 
K
A
 
D
G
 
G
Q
 
K
I
 
I
V
 
M
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

7ahdC Opua (e190q) occluded (see paper)
38% identity, 74% coverage: 25:230/278 of query aligns to 37:243/260 of 7ahdC

query
sites
7ahdC
G
 
G
Q
 
A
Q
x
T
V
 
V
G
 
G
V
 
V
H
 
Y
P
 
D
T
 
T
D
 
N
L
 
F
D
 
E
V
 
I
A
 
N
P
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
H
 
F
G
 
V
I
 
I
I
 
M
G
 
G
F
 
L
S
|
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
L
N
 
N
L
 
R
L
 
L
E
 
I
R
 
E
P
 
P
D
 
T
A
 
S
G
 
G
Q
 
K
V
 
I
V
 
F
V
 
I
H
 
D
G
 
N
Q
 
Q
D
 
D
L
 
V
M
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
N
P
 
K
A
 
E
D
 
D
L
 
L
R
 
L
T
 
Q
A
 
V
R
 
R
Q
 
R
R
 
K
-
 
T
I
 
M
G
 
S
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
|
Q
H
 
N
F
 
F
N
 
G
L
 
L
L
 
F
H
 
P
N
 
H
R
 
R
T
 
T
V
 
I
A
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
T
A
 
E
F
 
Y
P
 
G
L
 
L
R
 
E
I
 
V
A
 
Q
G
 
N
A
 
V
D
 
P
E
 
K
A
 
E
R
 
E
I
 
R
N
 
R
E
 
K
R
 
R
V
 
A
K
 
E
T
 
K
C
 
A
L
 
L
E
 
D
F
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
S
 
L
E
 
D
K
 
F
A
 
K
G
 
D
V
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
A
x
K
Q
|
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
x
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
N
E
 
D
P
 
P
H
 
E
V
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
M
D
 
D
E
x
Q
P
 
A
T
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
R
 
L
T
 
I
T
 
R
Q
 
R
S
 
E
L
 
M
L
 
Q
E
 
D
V
 
E
L
 
L
A
 
L
D
 
E
V
 
L
N
 
Q
R
 
A
R
 
K
L
 
F
G
 
Q
V
 
K
T
 
T
I
 
I
L
 
I
L
 
F
V
 
V
S
 
S
H
|
H
E
 
D
M
 
L
G
 
N
V
 
E
I
 
A
R
 
L
R
 
R
L
 
I
C
 
G
H
 
D
R
 
R
V
 
I
S
 
A
V
 
I
M
 
M
E
 
K
A
 
D
G
 
G
Q
 
K
I
 
I
V
 
M
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

8tzjA Cryo-em structure of vibrio cholerae ftse/ftsx complex (see paper)
42% identity, 71% coverage: 16:213/278 of query aligns to 8:201/220 of 8tzjA

query
sites
8tzjA
V
 
V
S
 
S
K
 
K
S
 
A
F
x
Y
R
 
R
T
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
G
Q
 
G
Q
x
R
V
 
Q
G
x
A
V
 
L
H
 
Q
P
 
K
T
 
V
D
 
D
L
 
F
D
 
H
V
 
L
A
 
R
P
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
M
H
 
A
G
 
F
I
 
L
I
 
G
G
 
G
F
 
H
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
K
L
 
L
A
 
I
N
 
C
L
 
A
L
 
I
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
T
A
 
D
G
 
G
Q
 
K
V
 
I
V
 
S
V
 
F
H
 
N
G
 
G
Q
 
H
D
 
D
L
 
I
M
 
T
T
 
R
L
 
I
S
 
P
P
 
N
A
 
K
D
 
D
L
 
I
R
 
P
T
 
F
A
 
L
R
 
R
Q
 
R
R
 
N
I
 
I
G
 
G
M
 
I
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
D
F
 
H
N
 
R
L
 
L
L
 
L
H
 
M
N
 
D
R
 
R
T
 
S
V
 
I
A
 
Y
D
 
D
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
L
P
 
P
L
 
M
R
 
R
I
 
I
A
 
E
G
 
S
A
 
I
D
 
S
E
 
E
A
 
N
R
 
E
I
 
I
N
 
K
E
 
R
R
 
R
V
 
V
K
 
S
T
 
A
C
 
A
L
 
L
E
 
D
F
 
K
V
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
L
E
 
D
K
 
K
A
 
A
G
 
R
V
 
C
Y
 
L
P
 
P
A
 
S
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
P
 
N
E
 
R
P
 
P
H
 
T
V
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
R
 
E
T
 
L
T
 
S
Q
 
S
S
 
R
L
 
V
L
 
L
E
 
R
V
 
L
L
 
F
A
 
E
D
 
E
V
 
F
N
 
N
R
 
-
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
A
S
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
I
G
 
H
V
 
L
I
 
V

6z4wA Ftse structure from streptococcus pneumoniae in complex with adp (space group p 1) (see paper)
37% identity, 82% coverage: 2:229/278 of query aligns to 9:218/230 of 6z4wA

query
sites
6z4wA
T
 
V
T
 
V
Q
 
K
N
 
K
T
x
Y
D
 
D
S
 
N
P
 
G
A
x
T
L
 
T
A
|
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
S
K
 
V
S
 
S
F
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
Q
 
-
Q
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
H
 
-
P
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
V
A
 
Q
P
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
F
H
 
A
G
 
Y
I
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
P
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
I
R
 
R
L
 
S
A
 
L
N
 
Y
L
 
R
L
 
E
E
 
V
R
 
K
P
 
I
D
 
D
A
 
K
G
 
G
Q
 
S
V
 
L
V
 
S
V
 
V
H
 
A
G
 
G
Q
 
F
D
 
N
L
 
L
M
 
V
T
 
K
L
 
I
S
 
K
P
 
K
A
 
K
D
 
D
L
 
V
R
 
P
T
 
L
A
 
L
R
 
R
Q
 
R
R
 
S
I
 
V
G
 
G
M
 
V
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
D
F
 
Y
N
 
K
L
 
L
L
 
L
H
 
P
N
 
K
R
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
Y
D
 
E
N
 
N
V
 
I
A
 
A
F
 
Y
P
 
A
L
 
M
R
 
E
I
 
V
A
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
N
E
 
R
A
 
R
R
 
N
I
 
I
N
 
K
E
 
R
R
 
R
V
 
V
K
 
M
T
 
E
C
 
V
L
 
L
E
 
D
F
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
E
 
H
K
 
K
A
 
V
G
 
R
V
 
S
Y
 
F
P
 
P
A
 
N
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
P
 
N
E
 
N
P
 
P
H
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
R
 
D
T
 
N
T
 
S
Q
 
W
S
 
E
L
 
I
L
 
M
E
 
N
V
 
L
L
 
L
A
 
E
D
 
R
V
 
I
N
 
N
R
 
L
R
 
Q
L
 
-
G
 
G
V
 
T
T
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
M
V
 
A
S
 
T
H
 
H
E
 
N
M
 
S
G
 
Q
V
 
I
I
 
V
R
 
N
R
 
T
L
 
L
C
 
R
H
 
H
R
 
R
V
 
V
S
 
I
V
 
A
M
 
I
E
 
E
A
 
N
G
 
G
Q
 
R
I
 
V
V
 
V

6z67B Ftse structure of streptococcus pneumoniae in complex with amppnp at 2.4 a resolution (see paper)
37% identity, 82% coverage: 2:229/278 of query aligns to 9:218/229 of 6z67B

query
sites
6z67B
T
 
V
T
 
V
Q
 
K
N
 
K
T
x
Y
D
 
D
S
 
N
P
x
G
A
 
T
L
 
T
A
|
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
S
K
 
V
S
 
S
F
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
Q
 
-
Q
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
H
 
-
P
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
V
A
 
Q
P
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
F
H
 
A
G
 
Y
I
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
P
S
|
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
I
R
 
R
L
 
S
A
 
L
N
 
Y
L
 
R
L
 
E
E
 
V
R
 
K
P
 
I
D
 
D
A
 
K
G
 
G
Q
 
S
V
 
L
V
 
S
V
 
V
H
 
A
G
 
G
Q
 
F
D
 
N
L
 
L
M
 
V
T
 
K
L
 
I
S
 
K
P
 
K
A
 
K
D
 
D
L
 
V
R
 
P
T
 
L
A
 
L
R
 
R
Q
 
R
R
 
S
I
 
V
G
 
G
M
 
V
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
D
F
 
Y
N
 
K
L
 
L
L
 
L
H
 
P
N
 
K
R
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
Y
D
 
E
N
 
N
V
 
I
A
 
A
F
 
Y
P
 
A
L
 
M
R
 
E
I
 
V
A
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
N
E
 
R
A
 
R
R
 
N
I
 
I
N
 
K
E
 
R
R
 
R
V
 
V
K
 
M
T
 
E
C
 
V
L
 
L
E
 
D
F
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
E
 
H
K
 
K
A
 
V
G
 
R
V
 
S
Y
 
F
P
 
P
A
 
N
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
P
 
N
E
 
N
P
 
P
H
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
R
 
D
T
 
N
T
 
S
Q
 
W
S
 
E
L
 
I
L
 
M
E
 
N
V
 
L
L
 
L
A
 
E
D
 
R
V
 
I
N
 
N
R
 
L
R
 
Q
L
 
-
G
 
G
V
 
T
T
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
M
V
 
A
S
 
T
H
 
H
E
 
N
M
 
S
G
 
Q
V
 
I
I
 
V
R
 
N
R
 
T
L
 
L
C
 
R
H
 
H
R
 
R
V
 
V
S
 
I
V
 
A
M
 
I
E
 
E
A
 
N
G
 
G
Q
 
R
I
 
V
V
 
V

Query Sequence

>Dsui_2068 Dsui_2068 ABC-type metal ion transport system, ATPase component
MTTQNTDSPALALRGVSKSFRTPDGQQVGVHPTDLDVAPGEIHGIIGFSGAGKSTLLRLA
NLLERPDAGQVVVHGQDLMTLSPADLRTARQRIGMIFQHFNLLHNRTVADNVAFPLRIAG
ADEARINERVKTCLEFVGLSEKAGVYPAQLSGGQKQRVAIARALAPEPHVLLADEPTSAL
DPRTTQSLLEVLADVNRRLGVTILLVSHEMGVIRRLCHRVSVMEAGQIVERLTIANGRIP
PDSQLAQWLREYGDAEGDAEEAAADPAPQHLLSEAAHG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory