SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Dsui_2134 FitnessBrowser__PS:Dsui_2134 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5yeiC Mechanistic insight into the regulation of pseudomonas aeruginosa aspartate kinase (see paper)
72% identity, 99% coverage: 2:405/407 of query aligns to 1:396/397 of 5yeiC

query
sites
5yeiC
A
 
A
L
 
L
I
 
I
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
T
 
T
S
 
S
V
 
V
G
 
G
S
 
T
T
 
V
E
 
E
R
 
R
I
 
I
K
 
E
N
 
Q
V
 
V
A
 
A
K
 
E
R
 
K
V
 
V
A
 
K
R
 
K
W
 
F
K
 
R
A
 
E
M
 
A
G
 
G
H
 
D
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
P
 
V
S
 
S
A
 
A
M
 
M
S
 
S
G
 
G
E
 
E
T
 
T
N
 
N
R
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
K
 
N
E
 
Q
I
 
I
S
 
M
A
 
E
T
 
Q
P
 
P
S
 
V
P
 
P
R
 
R
E
 
E
L
 
L
D
 
D
V
 
V
I
 
M
A
 
V
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
S
M
 
M
A
 
A
I
 
L
Q
 
I
E
 
K
E
 
R
G
 
G
L
 
V
K
 
P
A
 
A
K
 
V
S
 
S
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
S
 
N
Q
 
Q
V
 
V
R
 
R
V
 
I
L
 
L
T
 
T
D
 
D
S
 
S
T
 
A
F
 
H
T
 
T
K
 
K
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
L
Q
 
H
I
 
I
D
 
D
D
 
D
E
 
T
R
 
H
M
 
I
R
 
R
K
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
K
E
 
A
G
 
G
N
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
D
 
D
E
 
G
N
 
N
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
T
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
T
 
T
S
 
T
A
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
D
 
D
E
 
E
C
 
C
Q
 
Q
I
 
I
Y
 
Y
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
A
 
A
R
 
R
K
 
R
L
 
L
D
 
D
T
 
K
I
 
I
T
 
T
F
 
F
E
 
E
E
 
E
M
 
M
L
 
L
E
 
E
M
 
M
A
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
G
S
 
S
K
 
K
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
S
 
A
V
 
V
E
 
E
F
 
F
A
 
A
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
K
 
N
V
 
V
K
 
P
L
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
L
S
 
H
S
 
S
F
 
F
Q
 
Q
D
 
-
E
 
E
G
 
G
E
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
T
V
 
I
E
 
D
D
 
-
D
 
-
K
 
-
N
 
-
M
 
-
E
 
-
Q
 
-
P
 
P
I
 
I
I
 
I
S
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
A
F
 
F
N
 
N
R
 
R
D
 
D
E
 
E
A
 
A
K
 
K
L
 
L
T
 
T
V
 
I
L
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
P
D
 
D
R
x
T
P
|
P
G
 
G
I
 
V
A
|
A
Y
 
F
Q
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
I
A
 
S
D
 
A
A
 
A
N
 
N
I
 
V
D
 
E
V
 
V
D
 
D
M
 
M
I
 
I
I
 
V
Q
|
Q
N
 
N
V
 
V
G
 
A
V
 
H
D
 
D
G
 
N
T
 
T
T
 
T
D
 
D
F
 
F
S
 
T
F
 
F
T
 
T
V
 
V
N
 
H
R
 
R
S
 
N
E
 
D
Y
 
Y
T
 
L
K
 
N
A
 
A
M
 
L
A
 
E
V
 
I
L
 
L
E
 
K
Q
 
Q
V
 
T
K
 
A
Q
 
A
H
 
N
V
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
A
V
 
I
G
 
G
D
 
D
N
 
T
K
 
N
T
 
I
C
 
A
K
 
K
V
 
V
S
 
S
A
 
I
V
 
V
G
 
G
V
 
V
G
 
G
M
|
M
R
 
R
S
 
S
H
|
H
P
x
A
G
|
G
V
|
V
A
|
A
S
|
S
Q
 
R
M
 
M
F
 
F
R
 
E
T
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
K
E
 
E
G
 
S
I
 
I
N
|
N
I
|
I
Q
 
Q
M
 
M
I
 
I
S
 
S
T
 
T
S
 
S
E
 
E
I
 
I
K
 
K
I
 
V
S
 
S
V
 
V
V
 
V
I
 
I
D
 
E
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
V
R
 
R
I
 
A
L
 
L
H
 
H
K
 
T
T
 
A
F
 
F
G
 
E
L
 
L
D
 
D

P26512 Aspartokinase; Aspartate kinase; EC 2.7.2.4 from Corynebacterium glutamicum (strain ATCC 13032 / DSM 20300 / BCRC 11384 / JCM 1318 / LMG 3730 / NCIMB 10025) (see 2 papers)
50% identity, 99% coverage: 1:404/407 of query aligns to 1:407/421 of P26512

query
sites
P26512
M
 
M
A
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
S
S
 
S
V
 
L
G
 
E
S
 
S
T
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
K
 
R
N
 
N
V
 
V
A
 
A
K
 
E
R
 
R
V
 
I
A
 
V
R
 
A
W
 
T
K
 
K
A
 
K
M
 
A
G
 
G
H
 
N
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
P
 
C
S
 
S
A
 
A
M
 
M
S
 
G
G
 
D
E
 
T
T
 
T
N
 
D
R
 
E
L
 
L
I
 
L
G
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
A
E
 
A
I
 
V
S
 
N
A
 
P
T
 
V
P
 
P
S
 
P
P
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
M
D
 
D
V
 
M
I
 
L
A
 
L
S
 
T
T
 
A
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
V
 
I
T
 
S
I
 
N
G
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
A
M
 
M
A
 
A
I
 
I
Q
 
E
E
 
S
E
 
L
G
 
G
L
 
A
K
 
E
A
 
A
K
 
Q
S
 
S
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
V
 
A
R
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
T
D
 
T
S
 
E
T
 
R
F
 
H
T
 
G
K
 
N
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
V
Q
 
D
I
 
V
D
 
T
D
 
P
E
 
G
R
 
R
M
 
V
R
 
R
K
 
E
D
 
A
L
 
L
A
 
D
E
 
E
G
 
G
N
 
K
V
 
I
V
 
C
V
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
D
 
N
-
 
K
E
 
E
N
 
T
G
 
R
N
 
D
I
 
V
T
 
T
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
T
 
T
S
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
N
A
 
A
D
 
D
E
 
V
C
 
C
Q
 
E
I
 
I
Y
 
Y
T
 
S
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
T
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
I
V
 
V
P
 
P
E
 
N
A
 
A
R
 
Q
K
 
K
L
 
L
D
 
E
T
 
K
I
 
L
T
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
E
M
 
M
L
 
L
E
 
E
M
 
L
A
 
A
S
 
A
L
 
V
G
 
G
S
 
S
K
 
K
V
 
I
L
 
L
Q
 
V
I
 
L
R
 
R
S
 
S
V
 
V
E
 
E
F
 
Y
A
 
A
G
 
R
K
 
A
Y
 
F
K
 
N
V
 
V
K
 
P
L
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
R
S
 
S
S
 
S
F
 
Y
Q
 
S
D
 
N
E
 
D
G
 
-
E
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
A
V
 
G
E
 
S
-
 
M
D
 
E
D
 
D
K
 
I
N
 
P
M
 
V
E
 
E
Q
 
E
P
 
A
I
 
V
I
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
A
F
 
T
N
 
D
R
 
K
D
 
S
E
 
E
A
 
A
K
 
K
L
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
S
D
 
D
R
 
K
P
 
P
G
|
G
I
 
E
A
|
A
Y
 
A
Q
 
K
I
 
V
L
 
F
G
 
R
P
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
N
 
E
I
 
I
D
 
N
V
 
I
D
 
D
M
 
M
I
 
V
I
 
L
Q
|
Q
N
 
N
V
 
V
G
x
S
V
 
S
-
 
V
-
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
D
F
 
I
S
 
T
F
 
F
T
 
T
V
 
C
N
 
P
R
 
R
S
 
S
E
 
D
Y
 
G
T
 
R
K
 
R
A
 
A
M
 
M
A
 
E
V
 
I
L
 
L
E
 
K
Q
 
K
V
 
L
K
 
Q
Q
 
V
H
 
Q
V
 
G
G
 
N
A
 
W
R
 
T
E
 
N
I
 
V
V
 
L
G
 
Y
D
 
D
N
 
D
K
 
Q
T
 
V
C
 
G
K
 
K
V
 
V
S
 
S
A
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
M
 
M
R
 
K
S
 
S
H
 
H
P
 
P
G
 
G
V
|
V
A
x
T
S
 
A
Q
x
E
M
x
F
F
 
M
R
 
E
T
 
A
L
 
L
A
 
R
E
 
D
E
 
V
G
 
N
I
 
V
N
 
N
I
 
I
Q
 
E
M
 
L
I
 
I
S
 
S
T
 
T
S
 
S
E
 
E
I
 
I
K
 
R
I
 
I
S
 
S
V
 
V
V
 
L
I
 
I
D
 
R
E
 
E
K
 
D
Y
 
D
L
 
L
E
 
D
L
 
A
A
 
A
V
 
A
R
 
R
I
 
A
L
 
L
H
 
H
K
 
E
T
 
Q
F
 
F
G
 
Q
L
 
L

P41398 Aspartokinase; Aspartate kinase; EC 2.7.2.4 from Corynebacterium flavescens (see paper)
49% identity, 99% coverage: 1:404/407 of query aligns to 1:407/421 of P41398

query
sites
P41398
M
 
M
A
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
S
S
 
S
V
 
L
G
 
E
S
 
S
T
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
K
 
R
N
 
N
V
 
V
A
 
A
K
 
E
R
 
R
V
 
I
A
 
V
R
 
A
W
 
T
K
 
K
A
 
K
M
 
A
G
 
G
H
 
N
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
P
 
C
S
 
S
A
 
A
M
 
M
S
 
G
G
 
D
E
 
T
T
 
T
N
 
D
R
 
E
L
 
L
I
 
L
G
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
A
E
 
A
I
 
V
S
 
N
A
 
P
T
 
V
P
 
P
S
 
P
P
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
M
D
 
D
V
 
M
I
 
L
A
 
L
S
 
T
T
 
A
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
V
 
I
T
 
S
I
 
N
G
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
A
M
 
M
A
 
A
I
 
I
Q
 
E
E
 
S
E
 
L
G
 
G
L
 
A
K
 
E
A
 
A
K
 
Q
S
 
S
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
V
 
A
R
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
T
D
 
T
S
 
E
T
 
R
F
 
H
T
 
G
K
 
N
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
V
Q
 
D
I
 
V
D
 
T
D
 
P
E
 
G
R
 
R
M
 
V
R
 
R
K
 
E
D
 
A
L
 
L
A
 
D
E
 
E
G
 
G
N
 
K
V
 
I
V
 
C
V
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
D
 
N
-
 
K
E
 
E
N
 
T
G
 
R
N
 
D
I
 
V
T
 
T
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
T
 
T
S
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
N
A
 
A
D
 
D
E
 
V
C
 
C
Q
 
E
I
 
I
Y
 
Y
T
 
S
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
T
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
I
V
 
V
P
 
P
E
 
N
A
 
A
R
 
Q
K
 
K
L
 
L
D
 
E
T
 
K
I
 
L
T
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
E
M
 
M
L
 
L
E
 
E
M
 
L
A
 
A
S
 
A
L
 
V
G
 
G
S
 
S
K
 
K
V
 
I
L
 
L
Q
 
V
I
 
L
R
 
R
S
 
S
V
 
V
E
 
E
F
 
Y
A
 
A
G
 
R
K
 
A
Y
 
F
K
 
N
V
 
V
K
 
P
L
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
R
S
 
S
S
 
S
F
 
Y
Q
 
S
D
 
N
E
 
D
G
 
-
E
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
A
V
 
G
E
 
S
-
 
M
D
 
E
D
 
D
K
 
I
N
 
P
M
 
V
E
 
E
Q
 
E
P
 
A
I
 
V
I
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
A
F
 
T
N
 
D
R
 
K
D
 
S
E
 
E
A
 
A
K
 
K
L
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
S
D
 
D
R
 
K
P
 
P
G
 
G
I
 
E
A
 
A
Y
 
A
Q
 
K
I
 
V
L
 
F
G
 
R
P
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
N
 
E
I
 
I
D
 
N
V
 
I
D
 
D
M
 
M
I
 
V
I
 
L
Q
 
Q
N
 
N
V
 
V
G
 
S
V
 
S
-
 
V
-
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
D
F
 
I
S
 
T
F
 
F
T
 
T
V
 
C
N
 
P
R
 
R
S
 
A
E
 
D
Y
 
G
T
 
R
K
 
R
A
 
A
M
 
M
A
 
E
V
 
I
L
 
L
E
 
K
Q
 
K
V
 
L
K
 
Q
Q
 
V
H
 
Q
V
 
G
G
 
N
A
 
W
R
 
T
E
 
N
I
 
V
V
 
L
G
 
Y
D
 
D
N
 
D
K
 
Q
T
 
V
C
x
D
K
 
K
V
 
V
S
 
S
A
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
M
 
M
R
 
K
S
 
S
H
 
H
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
T
S
 
A
Q
 
E
M
 
F
F
 
M
R
 
E
T
 
A
L
 
L
A
 
R
E
 
D
E
 
V
G
 
N
I
 
V
N
 
N
I
 
I
Q
 
E
M
 
L
I
 
I
S
 
S
T
 
T
S
 
S
E
 
E
I
 
I
K
 
R
I
 
I
S
 
S
V
 
V
V
 
L
I
 
I
D
 
R
E
 
E
K
 
D
Y
 
D
L
 
L
E
 
D
L
 
A
A
 
A
V
 
A
R
 
R
I
 
A
L
 
L
H
 
H
K
 
E
T
 
Q
F
 
F
G
 
Q
L
 
L

P61489 Aspartokinase; Aspartate kinase; AK; ASK; Threonine-sensitive AK; ThrA; EC 2.7.2.4 from Thermus thermophilus (see paper)
48% identity, 100% coverage: 1:407/407 of query aligns to 1:405/405 of P61489

query
sites
P61489
M
 
M
A
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
V
Q
 
Q
K
|
K
Y
 
Y
G
|
G
G
|
G
T
 
T
S
 
S
V
 
V
G
 
G
S
 
D
T
 
L
E
 
E
R
 
R
I
 
I
K
 
H
N
 
K
V
 
V
A
 
A
K
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
R
 
H
W
 
Y
K
 
R
A
 
E
M
 
K
G
 
G
H
 
H
D
 
R
V
 
L
V
 
A
V
 
V
V
 
V
P
 
V
S
|
S
A
|
A
M
 
M
S
 
G
G
 
H
E
 
T
T
|
T
N
 
D
R
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
R
I
 
V
S
 
N
A
 
P
T
 
R
P
 
P
S
 
P
P
 
F
R
 
R
E
 
E
L
 
L
D
 
D
V
 
L
I
 
L
A
 
T
S
 
T
T
 
T
G
 
G
E
|
E
Q
 
Q
V
 
V
T
 
S
I
 
V
G
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
S
M
 
M
A
 
Q
I
 
L
Q
 
W
E
 
A
E
 
M
G
 
G
L
 
I
K
 
P
A
 
A
K
 
K
S
 
G
Y
 
F
T
 
V
G
 
Q
S
 
H
Q
 
Q
V
 
I
R
 
G
V
 
I
L
 
T
T
 
T
D
 
D
S
 
G
T
 
R
F
 
Y
T
 
G
K
 
D
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
L
Q
 
E
I
 
V
D
 
N
D
 
P
E
 
A
R
 
R
M
 
I
R
 
R
K
 
E
D
 
A
L
 
L
A
 
D
E
 
Q
G
 
G
N
 
F
V
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
|
G
F
 
F
Q
 
M
G
 
G
A
 
T
D
 
T
E
 
P
N
 
E
G
 
G
N
 
E
I
 
I
T
 
T
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
|
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
|
D
T
 
T
S
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
G
A
 
A
D
 
K
E
 
E
C
 
C
Q
 
E
I
 
I
Y
 
Y
T
 
T
D
|
D
V
 
T
D
 
E
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
T
 
T
D
|
D
P
 
P
R
 
H
V
 
L
V
 
I
P
 
P
E
 
E
A
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
L
D
 
S
T
 
V
I
 
I
T
 
G
F
 
Y
E
 
D
E
 
Q
M
 
M
L
 
L
E
 
E
M
 
M
A
 
A
S
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
A
K
 
R
V
 
V
L
 
L
Q
 
H
I
 
P
R
 
R
S
 
A
V
 
V
E
 
Y
F
 
Y
A
 
A
G
 
K
K
 
R
Y
 
Y
K
 
G
V
 
V
K
 
V
L
 
L
R
 
H
V
 
V
L
 
R
S
 
S
S
 
S
F
 
F
Q
 
-
D
 
S
E
 
Y
G
 
N
E
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
L
-
 
V
-
 
K
-
 
E
I
 
V
T
 
A
V
 
M
E
 
E
D
 
M
D
 
D
K
 
K
N
 
A
M
 
-
E
 
-
Q
 
-
P
 
-
I
 
-
I
 
V
S
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
A
F
 
L
N
 
D
R
 
L
D
 
D
E
 
H
A
 
A
K
 
Q
L
 
I
T
 
G
V
 
L
L
 
I
G
 
G
V
 
I
P
 
P
D
 
D
R
 
Q
P
 
P
G
 
G
I
 
I
A
 
A
Y
 
A
Q
 
K
I
 
V
L
 
F
G
 
Q
P
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
R
N
 
G
I
 
I
D
 
A
V
 
V
D
 
D
M
 
M
I
 
I
I
 
I
Q
 
Q
N
 
G
V
 
V
-
 
P
G
 
G
V
 
H
D
 
D
G
 
P
T
 
S
-
 
R
T
 
Q
D
 
Q
F
 
M
S
 
A
F
 
F
T
 
T
V
 
V
N
 
K
R
 
K
S
 
D
E
 
F
Y
 
A
T
 
Q
K
 
E
A
 
A
M
 
L
A
 
E
V
 
A
L
 
L
E
 
E
Q
 
P
V
 
V
K
 
L
Q
 
A
H
 
E
V
 
I
G
 
G
A
 
G
R
 
E
E
 
A
I
 
I
V
 
L
G
 
R
D
 
P
N
 
D
K
 
-
T
 
I
C
 
A
K
 
K
V
 
V
S
 
S
A
 
I
V
 
V
G
 
G
V
 
V
G
 
G
M
 
L
R
 
A
S
 
S
H
 
T
P
 
P
G
 
E
V
 
V
A
 
P
S
 
A
Q
 
K
M
 
M
F
 
F
R
 
Q
T
 
A
L
 
V
A
 
A
E
 
S
E
 
T
G
 
G
I
 
A
N
 
N
I
 
I
Q
 
E
M
 
M
I
 
I
S
 
A
T
 
T
S
 
S
E
 
E
I
 
V
K
 
R
I
 
I
S
 
S
V
 
V
V
 
I
I
 
I
D
 
P
E
 
A
K
 
E
Y
 
Y
L
 
A
E
 
E
L
 
A
A
 
A
V
 
L
R
 
R
I
 
A
L
 
V
H
 
H
K
 
Q
T
 
A
F
 
F
G
 
E
L
 
L
D
 
D
Q
 
K
A
 
A

3aawC Crystal structure of aspartate kinase from corynebacterium glutamicum in complex with lysine and threonine (see paper)
48% identity, 99% coverage: 1:404/407 of query aligns to 1:390/392 of 3aawC

query
sites
3aawC
M
 
M
A
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
V
Q
 
Q
K
|
K
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
S
S
 
S
V
 
L
G
 
E
S
 
S
T
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
K
 
R
N
 
N
V
 
V
A
 
A
K
 
E
R
 
R
V
 
I
A
 
V
R
 
A
W
 
T
K
 
K
A
 
K
M
 
A
G
 
G
H
 
N
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
P
 
C
S
|
S
A
 
A
M
 
M
S
 
G
G
 
D
E
 
T
T
 
T
N
 
D
R
 
E
L
 
L
I
 
L
G
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
A
E
 
A
I
 
V
S
 
N
A
 
P
T
 
V
P
 
P
S
 
P
P
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
M
D
 
D
V
 
M
I
 
L
A
 
L
S
 
T
T
 
A
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
V
 
I
T
 
S
I
 
N
G
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
A
M
 
M
A
 
A
I
 
I
Q
 
E
E
 
S
E
 
L
G
 
G
L
 
A
K
 
E
A
 
A
K
 
Q
S
 
S
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
V
 
-
R
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
D
 
-
S
 
-
T
 
-
F
 
-
T
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
-
Q
 
D
I
 
V
D
 
T
D
 
P
E
 
G
R
 
R
M
 
V
R
 
R
K
 
E
D
 
A
L
 
L
A
 
D
E
 
E
G
 
G
N
 
K
V
 
I
V
 
C
V
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
D
 
N
E
 
K
N
 
R
G
 
-
N
 
D
I
 
V
T
 
T
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
|
G
S
|
S
D
|
D
T
 
T
S
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
N
A
 
A
D
 
D
E
 
V
C
 
C
Q
 
E
I
 
I
Y
 
Y
T
 
S
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
T
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
I
V
 
V
P
 
P
E
 
N
A
 
A
R
 
Q
K
 
K
L
 
L
D
 
E
T
 
K
I
 
L
T
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
E
M
 
M
L
 
L
E
 
E
M
 
L
A
 
A
S
 
A
L
 
V
G
 
G
S
 
S
K
 
K
V
 
I
L
 
L
Q
 
V
I
 
L
R
 
R
S
 
S
V
 
V
E
 
E
F
 
Y
A
 
A
G
 
R
K
 
A
Y
 
F
K
 
N
V
 
V
K
 
P
L
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
R
S
 
S
S
 
S
F
 
Y
Q
 
S
D
 
N
E
 
D
G
 
-
E
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
A
V
 
G
E
 
S
-
 
M
D
 
E
D
 
D
K
 
I
N
 
P
M
 
V
E
 
E
Q
 
E
P
 
A
I
 
V
I
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
A
F
 
T
N
 
D
R
 
K
D
 
S
E
 
E
A
 
A
K
 
K
L
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
S
D
 
D
R
x
K
P
 
P
G
|
G
I
x
E
A
|
A
Y
 
A
Q
 
K
I
 
V
L
 
F
G
 
R
P
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
N
 
E
I
 
I
D
 
N
V
 
I
D
 
D
M
 
M
I
 
V
I
 
L
Q
|
Q
N
 
N
V
 
V
G
 
S
V
 
S
-
 
V
-
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
D
F
 
I
S
 
T
F
 
F
T
 
T
V
 
C
N
 
P
R
 
R
S
 
S
E
 
D
Y
 
G
T
 
R
K
 
R
A
 
A
M
 
M
A
 
E
V
 
I
L
 
L
E
 
K
Q
 
K
V
 
L
K
 
Q
Q
 
V
H
 
Q
V
 
G
G
 
N
A
 
W
R
 
T
E
 
N
I
 
V
V
 
L
G
 
Y
D
 
D
N
 
D
K
 
Q
T
 
V
C
 
G
K
 
K
V
 
V
S
 
S
A
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
M
|
M
R
 
K
S
 
S
H
|
H
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
x
T
S
 
A
Q
 
E
M
 
F
F
 
M
R
 
E
T
 
A
L
 
L
A
 
R
E
 
D
E
 
V
G
 
N
I
 
V
N
|
N
I
|
I
Q
 
E
M
 
L
I
 
I
S
 
S
T
 
T
S
|
S
E
 
E
I
 
I
K
 
R
I
 
I
S
 
S
V
 
V
V
 
L
I
 
I
D
 
R
E
 
E
K
 
D
Y
 
D
L
 
L
E
 
D
L
 
A
A
 
A
V
 
A
R
 
R
I
 
A
L
 
L
H
 
H
K
 
E
T
 
Q
F
 
F
G
 
Q
L
 
L

3l76A Crystal structure of aspartate kinase from synechocystis (see paper)
47% identity, 99% coverage: 2:404/407 of query aligns to 1:406/585 of 3l76A

query
sites
3l76A
A
 
A
L
 
L
I
 
I
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
T
 
T
S
 
S
V
 
V
G
 
G
S
 
T
T
 
V
E
 
E
R
 
R
I
 
I
K
 
Q
N
 
A
V
 
V
A
 
A
K
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
K
R
 
R
W
 
T
K
 
V
A
 
Q
M
 
G
G
 
G
H
 
N
D
 
S
V
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
V
P
 
V
S
 
S
A
 
A
M
 
M
S
 
G
G
 
K
E
 
S
T
 
T
N
 
D
R
 
V
L
 
L
I
 
V
G
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
E
 
Q
I
 
I
S
 
S
A
 
P
T
 
N
P
 
P
S
 
C
P
 
R
R
 
R
E
 
E
L
 
M
D
 
D
V
 
M
I
 
L
A
 
L
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
T
 
S
I
 
I
G
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
S
M
 
L
A
 
A
I
 
L
Q
 
Q
E
 
E
E
 
I
G
 
D
L
 
Q
K
 
P
A
 
A
K
 
I
S
 
S
Y
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
A
Q
 
Q
V
 
V
R
 
G
V
 
I
L
 
V
T
 
T
D
 
E
S
 
-
T
 
-
F
 
-
T
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
I
L
 
L
Q
 
E
I
 
I
D
 
R
D
 
P
E
 
D
R
 
R
M
 
L
R
 
E
K
 
H
D
 
H
L
 
L
A
 
R
E
 
E
G
 
G
N
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
A
 
I
D
 
-
E
 
-
N
 
H
G
 
L
N
 
E
I
 
I
T
 
T
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
T
 
T
S
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
D
 
D
E
 
F
C
 
C
Q
 
E
I
 
I
Y
 
Y
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
P
G
 
G
V
 
I
Y
 
L
T
 
T
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
L
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
A
R
 
Q
K
 
L
L
 
M
D
 
A
T
 
E
I
 
I
T
 
T
F
 
C
E
 
D
E
 
E
M
 
M
L
 
L
E
 
E
M
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
G
S
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
L
Q
 
H
I
 
P
R
 
R
S
 
A
V
 
V
E
 
E
F
 
I
A
 
A
G
 
R
K
 
N
Y
 
Y
K
 
G
V
 
I
K
 
P
L
 
L
R
 
V
V
 
V
L
 
R
S
 
S
S
 
S
F
 
W
Q
 
S
D
 
D
E
 
E
G
 
-
E
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
K
I
 
V
T
 
V
V
 
A
E
 
P
D
 
P
D
 
V
K
 
Q
N
 
N
M
 
R
E
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
I
Q
 
A
P
 
K
I
 
A
I
 
V
S
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
E
F
 
Y
N
 
D
R
 
A
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
K
 
K
L
 
V
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
R
V
 
V
P
 
P
D
 
D
R
|
R
P
 
P
G
 
G
I
x
V
A
|
A
Y
 
S
Q
 
K
I
 
L
L
 
F
G
 
R
P
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
Q
A
 
Q
N
 
Q
I
 
V
D
|
D
V
x
I
D
|
D
M
 
L
I
 
I
I
 
I
Q
|
Q
N
 
S
V
 
I
G
 
H
V
 
D
D
 
G
G
 
N
T
 
S
T
 
N
D
 
D
F
 
I
S
 
A
F
 
F
T
 
T
V
 
V
N
 
V
R
 
K
S
 
D
E
 
L
Y
 
L
T
 
N
K
 
T
A
 
A
M
 
E
A
 
A
V
 
V
L
 
T
E
 
S
Q
 
A
V
 
I
K
 
A
Q
 
P
H
 
A
V
 
L
G
 
R
A
 
S
R
 
Y
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
D
-
 
Q
-
 
E
-
 
A
E
 
E
I
 
I
V
 
I
G
 
V
D
 
E
N
 
K
K
 
G
T
 
I
C
 
A
K
 
K
V
 
I
S
 
A
A
 
I
V
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
M
|
M
R
 
I
S
 
G
H
x
R
P
 
P
G
 
G
V
x
I
A
 
A
S
 
A
Q
 
K
M
 
M
F
 
F
R
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
D
E
 
V
G
 
G
I
 
V
N
|
N
I
|
I
Q
 
E
M
 
M
I
 
I
S
 
S
T
 
T
S
|
S
E
|
E
I
 
V
K
 
K
I
 
V
S
 
S
V
 
C
V
 
V
I
 
I
D
 
D
E
 
Q
K
 
R
Y
 
D
L
 
A
E
 
D
L
 
R
A
 
A
V
 
I
R
 
A
I
 
A
L
 
L
H
 
S
K
 
N
T
 
A
F
 
F
G
 
G
L
 
V

Sites not aligning to the query:

3ab4A Crystal structure of feedback inhibition resistant mutant of aspartate kinase from corynebacterium glutamicum in complex with lysine and threonine (see paper)
45% identity, 99% coverage: 2:404/407 of query aligns to 1:369/370 of 3ab4A

query
sites
3ab4A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
S
S
 
S
V
 
L
G
 
E
S
 
S
T
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
K
 
R
N
 
N
V
 
V
A
 
A
K
 
E
R
 
R
V
 
I
A
 
V
R
 
A
W
 
T
K
 
K
A
 
K
M
 
A
G
 
G
H
 
N
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
P
 
C
S
 
S
A
 
A
M
 
M
S
 
G
G
 
D
E
 
T
T
 
T
N
 
D
R
 
E
L
 
L
I
 
L
G
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
A
E
 
A
I
 
V
S
 
N
A
 
P
T
 
V
P
 
P
S
 
P
P
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
M
D
 
D
V
 
M
I
 
L
A
 
L
S
 
T
T
 
A
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
V
 
I
T
 
S
I
 
N
G
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
A
M
 
M
A
 
A
I
 
I
Q
 
E
E
 
S
E
 
L
G
 
G
L
 
A
K
 
E
A
 
A
K
 
Q
S
 
S
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
Q
 
-
V
 
-
R
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
D
 
-
S
 
-
T
 
-
F
 
-
T
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
-
Q
 
-
I
 
V
D
 
T
D
 
P
E
 
G
R
 
R
M
 
V
R
 
R
K
 
E
D
 
A
L
 
L
A
 
D
E
 
E
G
 
G
N
 
K
V
 
I
V
 
C
V
 
I
V
 
V
A
 
-
G
 
-
F
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
N
 
-
G
 
-
N
 
-
I
 
-
T
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
T
 
T
S
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
N
A
 
A
D
 
D
E
 
V
C
 
C
Q
 
E
I
 
I
Y
 
Y
T
 
S
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
T
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
I
V
 
V
P
 
P
E
 
N
A
 
A
R
 
Q
K
 
K
L
 
L
D
 
E
T
 
K
I
 
L
T
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
E
M
 
M
L
 
L
E
 
E
M
 
L
A
 
A
S
 
A
L
 
V
G
 
G
S
 
S
K
 
K
V
 
I
L
 
L
Q
 
V
I
 
L
R
 
R
S
 
S
V
 
V
E
 
E
F
 
Y
A
 
A
G
 
R
K
 
A
Y
 
F
K
 
N
V
 
V
K
 
P
L
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
R
S
 
S
S
 
S
F
 
Y
Q
 
S
D
 
N
E
 
D
G
 
-
E
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
A
V
 
G
E
 
S
-
 
M
D
 
E
D
 
D
K
 
I
N
 
P
M
 
V
E
 
E
Q
 
E
P
 
A
I
 
V
I
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
A
F
 
T
N
 
D
R
 
K
D
 
S
E
 
E
A
 
A
K
 
K
L
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
S
D
 
D
R
x
K
P
 
P
G
|
G
I
x
E
A
|
A
Y
 
A
Q
 
K
I
 
V
L
 
F
G
 
R
P
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
N
 
E
I
 
I
D
 
N
V
 
I
D
 
D
M
 
M
I
 
V
I
 
L
Q
|
Q
N
 
N
V
 
V
G
 
F
V
 
S
D
 
D
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
D
F
 
I
S
 
T
F
 
F
T
 
T
V
 
C
N
 
P
R
 
R
S
 
S
E
 
D
Y
 
G
T
 
R
K
 
R
A
 
A
M
 
M
A
 
E
V
 
I
L
 
L
E
 
K
Q
 
K
V
 
L
K
 
Q
Q
 
V
H
 
Q
V
 
G
G
 
N
A
 
W
R
 
T
E
 
N
I
 
V
V
 
L
G
 
Y
D
 
D
N
 
D
K
 
Q
T
 
V
C
 
G
K
 
K
V
 
V
S
 
S
A
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
M
|
M
R
 
K
S
 
S
H
|
H
P
|
P
G
 
G
V
|
V
A
x
T
S
 
A
Q
 
E
M
 
F
F
 
M
R
 
E
T
 
A
L
 
L
A
 
R
E
 
D
E
 
V
G
 
N
I
 
V
N
|
N
I
|
I
Q
 
E
M
 
L
I
 
I
S
 
S
T
 
T
S
|
S
E
|
E
I
 
I
K
 
R
I
 
I
S
 
S
V
 
V
V
 
L
I
 
I
D
 
R
E
 
E
K
 
D
Y
 
D
L
 
L
E
 
D
L
 
A
A
 
A
V
 
A
R
 
R
I
 
A
L
 
L
H
 
H
K
 
E
T
 
Q
F
 
F
G
 
Q
L
 
L

2hmfA Structure of a threonine sensitive aspartokinase from methanococcus jannaschii complexed with mg-adp and aspartate (see paper)
38% identity, 87% coverage: 50:402/407 of query aligns to 107:461/464 of 2hmfA

query
sites
2hmfA
L
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
V
A
 
A
K
 
Y
E
 
L
I
 
G
S
 
E
A
 
L
T
 
T
P
 
P
S
 
K
P
 
S
R
 
R
E
 
-
L
 
-
D
 
D
V
 
Y
I
 
I
A
 
L
S
 
S
T
 
F
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
V
 
L
T
 
S
I
 
S
G
 
P
L
 
I
L
 
L
A
 
S
M
 
G
A
 
A
I
 
I
Q
 
R
E
 
D
E
 
L
G
 
G
L
 
E
K
 
K
A
 
S
K
 
I
S
 
A
Y
 
L
T
 
E
G
 
G
S
 
G
Q
 
E
V
 
A
R
 
G
V
 
I
L
 
I
T
 
T
D
 
D
S
 
N
T
 
N
F
 
F
T
 
G
K
 
S
A
 
A
R
 
R
I
 
V
L
 
K
Q
 
R
I
 
L
D
 
E
-
 
V
D
 
K
E
 
E
R
 
R
M
 
L
R
 
L
K
 
P
D
 
L
L
 
L
A
 
K
E
 
E
G
 
G
N
 
I
V
 
I
V
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
T
G
 
G
F
|
F
Q
 
I
G
 
G
A
 
T
D
 
T
E
 
E
N
 
E
G
 
G
N
 
Y
I
 
I
T
 
T
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
|
R
G
|
G
G
 
G
S
|
S
D
 
D
T
 
Y
S
 
S
A
 
A
V
 
A
A
 
L
L
 
I
A
 
G
A
 
Y
A
 
G
L
 
L
K
 
D
A
 
A
D
 
D
E
 
I
C
 
I
Q
 
E
I
 
I
Y
 
W
T
|
T
D
|
D
V
|
V
D
 
S
G
 
G
V
 
V
Y
|
Y
T
 
T
T
|
T
D
|
D
P
|
P
R
|
R
V
 
L
V
 
V
P
 
P
E
 
T
A
 
A
R
 
R
K
 
R
L
 
I
D
 
P
T
 
K
I
 
L
T
 
S
F
 
Y
E
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
E
 
E
M
 
L
A
 
A
S
 
Y
L
 
F
G
 
G
S
 
A
K
|
K
V
|
V
L
 
L
Q
 
H
I
 
P
R
 
R
S
 
T
V
 
I
E
 
E
F
 
P
A
 
A
G
 
M
K
 
E
Y
 
K
K
 
G
V
 
I
K
 
P
L
 
I
R
 
L
V
 
V
L
 
K
S
 
N
S
 
T
F
 
F
Q
 
E
D
 
P
E
 
E
G
 
S
E
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
T
V
 
-
E
 
-
D
 
N
D
 
D
K
 
M
N
 
E
M
 
M
E
 
S
Q
 
D
P
 
S
I
 
I
I
 
V
S
 
K
G
 
A
I
 
I
A
 
S
F
 
T
N
 
I
R
 
K
D
 
N
E
 
V
A
 
A
K
 
L
L
 
I
T
 
N
V
 
I
L
 
F
-
 
G
-
 
A
G
 
G
V
 
M
P
 
V
D
 
G
R
 
V
P
 
S
G
 
G
I
 
T
A
 
A
Y
 
A
Q
 
R
I
 
I
L
 
F
G
 
K
P
 
A
I
 
L
A
 
G
D
 
E
A
 
E
N
 
E
I
 
V
D
 
N
V
 
V
D
 
I
M
 
L
I
 
I
I
 
S
Q
 
Q
N
 
G
V
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
S
G
 
S
T
 
E
T
 
T
D
 
N
F
 
I
S
 
S
F
 
L
T
 
V
V
 
V
N
 
S
R
 
E
S
 
E
E
 
D
Y
 
V
T
 
D
K
 
K
A
 
A
M
 
L
A
 
K
V
 
A
L
 
L
E
 
-
Q
 
-
V
 
-
K
 
K
Q
 
R
H
 
E
V
 
F
G
 
G
-
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
N
-
 
N
-
 
N
-
 
L
A
 
I
R
 
R
E
 
D
I
 
V
V
 
S
G
 
V
D
 
D
N
 
K
K
 
D
T
 
V
C
 
C
K
 
V
V
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
M
 
M
R
 
R
S
 
G
H
 
A
P
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
A
S
 
G
Q
 
K
M
 
I
F
 
F
R
 
T
T
 
A
L
 
V
A
 
S
E
 
E
E
 
S
G
 
G
I
 
A
N
 
N
I
 
I
Q
 
K
M
 
M
I
 
I
S
 
A
-
 
Q
-
 
G
T
 
S
S
 
S
E
 
E
I
 
V
K
 
N
I
 
I
S
 
S
V
 
F
V
 
V
I
 
I
D
 
D
E
 
E
K
 
K
Y
 
D
L
 
L
E
 
L
L
 
N
A
 
C
V
 
V
R
 
R
I
 
K
L
 
L
H
 
H
K
 
E
T
 
K
F
 
F

Sites not aligning to the query:

2re1A Crystal structure of aspartokinase alpha and beta subunits
65% identity, 37% coverage: 254:404/407 of query aligns to 2:148/148 of 2re1A

query
sites
2re1A
I
 
V
S
 
T
G
 
G
I
 
I
A
 
A
F
 
F
N
 
D
R
 
K
D
 
N
E
 
Q
A
 
A
K
 
R
L
 
I
T
 
N
V
 
V
L
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
P
D
 
D
R
 
K
P
 
P
G
 
G
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
A
I
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
N
 
N
I
 
I
D
 
E
V
 
V
D
 
D
M
 
M
I
 
I
I
 
I
Q
 
Q
N
 
N
V
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
D
F
 
F
S
 
S
F
 
F
T
 
T
V
 
V
N
 
P
R
 
R
S
 
G
E
 
D
Y
 
Y
T
 
K
K
 
Q
A
 
T
M
 
L
A
 
E
V
 
I
L
 
L
E
 
S
Q
 
E
V
 
R
K
 
Q
Q
 
D
H
 
S
V
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
A
E
 
S
I
 
I
V
 
D
G
 
G
D
 
D
N
 
D
K
x
T
T
 
V
C
 
C
K
 
K
V
 
V
S
 
S
A
 
A
V
 
V
G
 
G
V
 
L
G
 
G
M
 
M
R
 
R
S
 
S
H
 
H
P
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
A
S
 
A
Q
 
K
M
 
I
F
 
F
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
N
 
N
I
 
I
Q
 
Q
M
 
M
I
 
I
S
 
S
T
 
T
S
 
S
E
 
E
I
 
I
K
 
K
I
 
V
S
 
S
V
 
V
V
 
L
I
 
I
D
|
D
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
L
 
M
E
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
T
R
 
R
I
 
V
L
 
L
H
 
H
K
 
K
T
 
A
F
 
F
G
 
N
L
 
L

3c1mC Cyrstal structure of threonine-sensitive aspartokinase from methanococcus jannaschii with mgamp-pnp and l-aspartate (see paper)
37% identity, 87% coverage: 50:402/407 of query aligns to 107:465/468 of 3c1mC

query
sites
3c1mC
L
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
V
A
 
A
K
 
Y
E
 
L
I
 
G
S
 
E
A
 
L
T
 
T
P
 
P
S
 
K
P
 
S
R
 
R
E
 
-
L
 
-
D
 
D
V
 
Y
I
 
I
A
 
L
S
 
S
T
 
F
G
 
G
E
|
E
Q
 
R
V
 
L
T
 
S
I
 
S
G
 
P
L
 
I
L
 
L
A
 
S
M
 
G
A
 
A
I
 
I
Q
 
R
E
 
D
E
 
L
G
 
G
L
 
E
K
 
K
A
 
S
K
 
I
S
 
A
Y
 
L
T
 
E
G
 
G
S
 
G
Q
 
E
V
 
A
R
 
G
V
 
I
L
 
I
T
 
T
D
 
D
S
 
N
T
 
N
F
 
F
T
 
G
K
 
S
A
 
A
R
 
R
I
 
V
L
 
K
Q
 
R
I
 
L
D
 
E
-
 
V
D
 
K
E
 
E
R
 
R
M
 
L
R
 
L
K
 
P
D
 
L
L
 
L
A
 
K
E
 
E
G
 
G
N
 
I
V
 
I
V
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
T
G
 
G
F
|
F
Q
 
I
G
 
G
A
 
T
D
 
T
E
 
E
N
 
E
G
 
G
N
 
Y
I
 
I
T
 
T
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
|
R
G
|
G
G
 
G
S
|
S
D
 
D
T
 
Y
S
 
S
A
 
A
V
 
A
A
 
L
L
 
I
A
 
G
A
 
Y
A
 
G
L
 
L
K
 
D
A
 
A
D
 
D
E
 
I
C
 
I
Q
 
E
I
 
I
Y
 
W
T
|
T
D
|
D
V
 
V
D
 
S
G
 
G
V
 
V
Y
|
Y
T
 
T
T
 
T
D
|
D
P
|
P
R
|
R
V
 
L
V
 
V
P
 
P
E
 
T
A
 
A
R
 
R
K
 
R
L
 
I
D
 
P
T
 
K
I
 
L
T
 
S
F
 
Y
E
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
E
 
E
M
 
L
A
 
A
S
 
Y
L
 
F
G
 
G
S
 
A
K
|
K
V
|
V
L
 
L
Q
 
H
I
 
P
R
 
R
S
 
T
V
 
I
E
 
E
F
 
P
A
 
A
G
 
M
K
 
E
Y
 
K
K
 
G
V
 
I
K
 
P
L
 
I
R
 
L
V
 
V
L
 
K
S
 
N
S
 
T
F
 
F
Q
 
E
D
 
P
E
 
E
G
 
S
E
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
T
V
 
-
E
 
-
D
 
N
D
 
D
K
 
M
N
 
E
M
 
M
E
 
S
Q
 
D
P
 
S
I
 
I
I
 
V
S
 
K
G
 
A
I
 
I
A
 
S
F
 
T
N
 
I
R
 
K
D
 
N
E
 
V
A
 
A
K
 
L
L
 
I
T
 
N
V
 
I
L
 
F
-
 
G
-
 
A
G
 
G
V
 
M
P
 
V
D
 
G
R
 
V
P
 
S
G
 
G
I
 
T
A
 
A
Y
 
A
Q
 
R
I
 
I
L
 
F
G
 
K
P
 
A
I
 
L
A
 
G
D
 
E
A
 
E
N
 
E
I
 
V
D
 
N
V
 
V
D
 
I
M
 
L
I
 
I
I
 
S
Q
 
Q
N
 
G
V
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
S
G
 
S
T
 
E
T
 
T
D
 
N
F
 
I
S
 
S
F
 
L
T
 
V
V
 
V
N
 
S
R
 
E
S
 
E
E
 
D
Y
 
V
T
 
D
K
 
K
A
 
A
M
 
L
A
 
K
V
 
A
L
 
L
E
 
-
Q
 
-
V
 
-
K
 
K
Q
 
R
H
 
E
V
 
F
G
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
K
-
 
S
-
 
F
-
 
L
-
 
N
-
 
N
-
 
N
-
 
L
A
 
I
R
 
R
E
 
D
I
 
V
V
 
S
G
 
V
D
 
D
N
 
K
K
 
D
T
 
V
C
 
C
K
 
V
V
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
M
 
M
R
 
R
S
 
G
H
 
A
P
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
A
S
 
G
Q
 
K
M
 
I
F
 
F
R
 
T
T
 
A
L
 
V
A
 
S
E
 
E
E
 
S
G
 
G
I
 
A
N
 
N
I
 
I
Q
 
K
M
 
M
I
 
I
S
 
A
-
 
Q
-
 
G
T
 
S
S
 
S
E
 
E
I
 
V
K
 
N
I
 
I
S
 
S
V
 
F
V
 
V
I
 
I
D
 
D
E
 
E
K
 
K
Y
 
D
L
 
L
E
 
L
L
 
N
A
 
C
V
 
V
R
 
R
I
 
K
L
 
L
H
 
H
K
 
E
T
 
K
F
 
F

Sites not aligning to the query:

3c1nA Crystal structure of allosteric inhibition threonine-sensitive aspartokinase from methanococcus jannaschii with l-threonine (see paper)
38% identity, 87% coverage: 50:402/407 of query aligns to 106:456/458 of 3c1nA

query
sites
3c1nA
L
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
V
A
 
A
K
 
Y
E
 
L
I
 
G
S
 
E
A
 
L
T
 
T
P
 
P
S
 
K
P
 
S
R
 
R
E
 
-
L
 
-
D
 
D
V
 
Y
I
 
I
A
 
L
S
 
S
T
 
F
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
V
 
L
T
 
S
I
 
S
G
 
P
L
 
I
L
 
L
A
 
S
M
 
G
A
 
A
I
 
I
Q
 
R
E
 
D
E
 
L
G
 
G
L
 
E
K
 
K
A
 
S
K
 
I
S
 
A
Y
 
L
T
 
E
G
 
G
S
 
G
Q
 
E
V
 
A
R
 
G
V
 
I
L
 
I
T
 
T
D
 
D
S
 
N
T
 
N
F
 
F
T
 
G
K
 
S
A
 
A
R
 
R
I
 
V
L
 
K
Q
 
R
I
 
L
D
 
E
-
 
V
D
 
K
E
 
E
R
 
R
M
 
L
R
 
L
K
 
P
D
 
L
L
 
L
A
 
K
E
 
E
G
 
G
N
 
I
V
 
I
V
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
T
G
 
G
F
 
F
Q
 
I
G
 
G
A
 
T
D
 
T
E
 
E
N
 
E
G
 
G
N
 
Y
I
 
I
T
 
T
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
T
 
Y
S
 
S
A
 
A
V
 
A
A
 
L
L
 
I
A
 
G
A
 
Y
A
 
G
L
 
L
K
 
D
A
 
A
D
 
D
E
 
I
C
 
I
Q
 
E
I
 
I
Y
x
W
T
|
T
D
|
D
V
 
V
D
 
S
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
L
V
 
V
P
 
P
E
 
T
A
 
A
R
 
R
K
 
R
L
 
I
D
 
P
T
 
K
I
 
L
T
 
S
F
 
Y
E
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
E
 
E
M
 
L
A
 
A
S
 
Y
L
 
F
G
 
G
S
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
L
Q
 
H
I
 
P
R
 
R
S
 
T
V
 
I
E
 
E
F
 
P
A
 
A
G
 
M
K
 
E
Y
 
K
K
 
G
V
 
I
K
 
P
L
 
I
R
 
L
V
 
V
L
 
K
S
 
N
S
 
T
F
 
F
Q
 
E
D
 
P
E
 
E
G
 
S
E
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
T
V
 
N
E
 
D
D
 
M
D
 
D
K
 
S
N
 
-
M
 
-
E
 
-
Q
 
-
P
 
-
I
 
I
I
 
V
S
 
K
G
 
A
I
 
I
A
 
S
F
 
T
N
 
I
R
 
K
D
 
N
E
 
V
A
 
A
K
 
L
L
 
I
T
 
N
V
 
I
L
 
F
-
 
G
-
 
A
G
 
G
V
 
M
P
 
V
D
 
G
R
 
V
P
 
S
G
 
G
I
 
T
A
 
A
Y
 
A
Q
 
R
I
 
I
L
 
F
G
 
K
P
 
A
I
 
L
A
 
G
D
 
E
A
 
E
N
 
E
I
 
V
D
 
N
V
 
V
D
 
I
M
 
L
I
 
I
I
 
S
Q
 
Q
N
 
G
V
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
S
G
 
S
T
 
E
T
 
T
D
 
N
F
 
I
S
 
S
F
 
L
T
 
V
V
 
V
N
 
S
R
 
E
S
 
E
E
 
D
Y
 
V
T
 
D
K
 
K
A
 
A
M
 
L
A
 
K
V
 
A
L
 
L
E
 
-
Q
 
-
V
 
-
K
 
K
Q
 
R
H
 
E
V
 
F
G
 
G
-
 
D
-
 
L
-
 
N
-
 
N
-
 
N
-
 
L
A
 
I
R
 
R
E
 
D
I
 
V
V
 
S
G
 
V
D
 
D
N
 
K
K
 
D
T
 
V
C
 
C
K
 
V
V
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
M
 
M
R
 
R
S
 
G
H
x
A
P
 
K
G
 
G
V
x
I
A
|
A
S
 
G
Q
 
K
M
 
I
F
 
F
R
 
T
T
 
A
L
 
V
A
 
S
E
 
E
E
 
S
G
 
G
I
 
A
N
|
N
I
|
I
Q
 
K
M
 
M
I
 
I
S
 
A
-
x
Q
-
 
G
T
 
S
S
 
S
E
|
E
I
 
V
K
 
N
I
 
I
S
 
S
V
 
F
V
 
V
I
 
I
D
 
D
E
 
E
K
 
K
Y
 
D
L
 
L
E
 
L
L
 
N
A
 
C
V
 
V
R
 
R
I
 
K
L
 
L
H
 
H
K
 
E
T
 
K
F
 
F

Sites not aligning to the query:

4go7X The regulatory subunit of aspartate kinase in complex with threonine from mycobacterium tuberculosis (see paper)
44% identity, 39% coverage: 248:405/407 of query aligns to 3:160/165 of 4go7X

query
sites
4go7X
N
 
H
M
 
M
E
 
E
Q
 
D
P
 
P
I
 
I
I
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
A
F
 
H
N
 
D
R
 
R
D
 
S
E
 
E
A
 
A
K
 
K
L
 
V
T
 
T
V
 
I
L
 
V
G
 
G
V
 
L
P
 
P
D
 
D
R
x
I
P
 
P
G
|
G
I
x
Y
A
|
A
Y
 
A
Q
 
K
I
 
V
L
 
F
G
 
R
P
 
A
I
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
N
 
D
I
 
V
D
 
N
V
 
I
D
 
D
M
 
M
I
 
V
I
 
L
Q
|
Q
N
 
N
V
 
V
G
 
S
V
 
K
D
 
D
G
 
G
T
 
K
T
 
T
D
 
D
F
 
I
S
 
T
F
 
F
T
 
T
V
 
C
N
 
S
R
 
R
S
 
D
E
 
V
Y
 
G
T
 
P
K
 
A
A
 
A
M
 
V
A
 
E
V
 
K
L
 
L
E
 
D
Q
 
S
V
 
L
K
 
R
Q
 
N
H
 
E
V
 
I
G
 
G
A
 
F
R
 
S
E
 
Q
I
 
L
V
 
L
G
 
Y
D
 
D
N
 
D
K
 
H
T
 
I
C
 
G
K
 
K
V
 
V
S
 
S
A
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
A
G
 
G
M
 
M
R
 
R
S
 
S
H
 
H
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
T
S
 
A
Q
 
T
M
 
F
F
 
C
R
 
E
T
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
A
E
 
V
G
 
G
I
 
V
N
 
N
I
 
I
Q
 
E
M
 
L
I
 
I
S
 
S
T
 
T
S
 
S
E
 
E
I
 
I
K
 
R
I
 
I
S
 
S
V
 
V
V
 
L
I
 
C
D
 
R
E
 
D
K
 
T
Y
 
E
L
 
L
E
 
D
L
 
K
A
 
A
V
 
V
R
 
V
I
 
A
L
 
L
H
 
H
K
 
E
T
 
A
F
 
F
G
 
G
L
 
L
D
 
E

2cdqA Crystal structure of arabidopsis thaliana aspartate kinase complexed with lysine and s-adenosylmethionine (see paper)
27% identity, 98% coverage: 5:402/407 of query aligns to 6:458/470 of 2cdqA

query
sites
2cdqA
V
 
V
Q
 
M
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
T
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
A
S
 
S
T
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
M
K
 
K
N
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
D
R
 
L
V
 
I
A
 
L
R
 
T
W
 
F
K
 
P
A
 
E
M
 
-
G
 
-
H
 
E
D
 
S
V
 
P
V
 
V
V
 
I
V
 
V
P
 
L
S
|
S
A
|
A
M
 
M
S
 
G
G
 
K
E
 
T
T
|
T
N
 
N
R
 
N
L
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
C
-
 
G
-
 
V
-
 
S
-
 
N
-
 
A
-
 
S
-
 
E
-
 
I
-
 
E
-
 
E
-
 
L
-
 
S
-
 
I
-
 
I
-
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
H
I
 
I
G
 
R
L
 
T
A
 
V
K
 
K
E
 
E
I
 
L
S
 
N
A
 
I
T
 
D
P
 
P
S
 
S
P
 
V
-
 
I
-
 
L
-
 
T
-
 
Y
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
M
-
 
M
-
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
L
R
 
R
E
 
T
L
 
R
D
 
D
V
 
Y
I
 
L
A
 
V
S
 
S
T
 
F
G
 
G
E
|
E
Q
 
C
V
 
L
T
 
S
I
 
T
G
 
R
L
 
I
L
 
F
A
 
A
M
 
A
A
 
Y
I
 
L
Q
 
N
E
 
T
E
 
I
G
 
G
L
 
V
K
 
K
A
 
A
K
 
R
S
 
Q
Y
 
Y
T
 
D
G
 
A
S
 
F
Q
 
E
V
 
I
R
 
G
V
 
F
L
 
I
T
 
T
D
 
T
S
 
D
T
 
D
F
 
F
T
 
T
K
 
N
A
 
G
R
 
D
I
 
I
L
 
L
Q
 
E
I
 
A
D
 
T
-
 
Y
-
 
P
-
 
A
-
 
V
D
 
A
E
 
K
R
 
R
M
 
L
R
 
Y
K
 
D
D
 
D
-
 
W
L
 
M
A
 
H
E
 
D
G
 
P
N
 
A
V
 
V
V
 
P
V
 
I
V
 
V
A
 
T
G
 
G
F
 
F
Q
 
L
G
 
G
A
 
K
D
 
G
-
 
W
E
 
K
N
 
T
G
 
G
N
 
A
I
 
V
T
 
T
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
T
 
L
S
 
T
A
 
A
V
 
T
A
 
T
L
 
I
A
 
G
A
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
G
A
 
L
D
 
K
E
 
E
C
 
I
Q
 
Q
I
 
V
Y
 
W
T
 
K
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
 
L
T
 
T
T
 
C
D
 
D
P
 
P
R
 
T
V
 
I
V
 
Y
P
 
K
E
 
R
A
 
A
R
 
T
K
 
P
L
 
V
D
 
P
T
 
Y
I
 
L
T
 
T
F
 
F
E
 
D
E
 
E
M
 
A
L
 
A
E
 
E
M
 
L
A
 
A
S
 
Y
L
 
F
G
 
G
S
 
A
K
 
Q
V
 
V
L
 
L
Q
 
H
I
 
P
R
 
Q
S
 
S
V
 
M
E
 
R
F
 
P
A
 
A
G
 
R
K
 
E
Y
 
G
K
 
E
V
 
I
K
 
P
L
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
K
S
 
N
S
 
S
F
 
Y
Q
 
N
D
 
P
E
 
K
G
 
A
E
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
I
I
 
I
T
 
T
V
 
-
E
 
-
D
 
K
D
 
T
K
 
R
N
 
D
M
 
M
E
 
T
Q
 
K
P
 
S
I
 
I
I
 
L
S
 
T
G
 
S
I
 
I
A
 
V
F
 
L
N
 
K
R
 
R
-
 
N
-
 
V
-
 
T
-
 
M
-
 
L
D
 
D
E
 
I
A
 
A
K
 
S
L
 
T
T
 
R
V
x
M
L
 
L
G
 
G
V
 
-
P
 
-
D
 
-
R
x
Q
P
 
V
G
 
G
I
x
F
A
x
L
Y
 
A
Q
 
K
I
 
V
L
 
F
G
 
S
P
 
I
I
 
F
A
 
E
D
 
E
A
 
L
N
x
G
I
|
I
D
x
S
V
|
V
D
|
D
M
 
V
I
 
V
I
 
-
Q
 
-
N
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
A
D
 
T
G
 
S
T
 
E
T
 
V
D
 
S
F
 
I
S
 
S
F
 
L
T
 
T
V
 
L
N
 
D
R
 
P
S
 
S
E
 
K
Y
 
L
T
x
W
K
x
S
A
x
R
M
 
E
A
x
L
V
 
I
L
 
Q
E
 
Q
Q
x
E
V
 
L
K
 
D
Q
 
H
H
 
V
V
 
V
G
 
E
A
 
E
R
 
L
E
 
E
I
 
K
V
 
I
G
 
A
D
 
V
N
 
V
K
 
N
T
 
L
C
 
L
K
 
K
V
 
G
S
 
R
A
 
A
V
 
I
-
 
I
-
 
S
G
 
L
V
 
I
G
 
G
M
 
N
R
 
V
S
 
Q
H
 
H
P
 
S
G
 
S
-
 
L
V
 
I
A
 
L
S
 
E
Q
 
R
M
 
A
F
 
F
R
 
H
T
 
V
L
 
L
A
 
Y
E
 
T
E
 
K
G
 
G
I
 
V
N
 
N
I
 
V
Q
 
Q
M
 
M
I
 
I
S
 
S
-
 
Q
-
 
G
T
 
A
S
 
S
E
 
K
I
 
V
K
 
N
I
 
I
S
 
S
V
 
F
V
 
I
I
 
V
D
 
N
E
 
E
K
 
A
Y
 
E
L
 
A
E
 
E
L
 
G
A
 
C
V
 
V
R
 
Q
I
 
A
L
 
L
H
 
H
K
 
K
T
 
S
F
 
F

O81852 Bifunctional aspartokinase/homoserine dehydrogenase 2, chloroplastic; AK-HD 2; AK-HSDH 2; Beta-aspartyl phosphate homoserine 2; EC 2.7.2.4; EC 1.1.1.3 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
30% identity, 84% coverage: 67:406/407 of query aligns to 205:555/916 of O81852

query
sites
O81852
D
 
D
V
 
F
I
 
V
A
 
A
S
 
G
T
 
H
G
 
G
E
 
E
Q
 
L
V
 
W
T
 
S
I
 
A
G
 
Q
L
 
M
L
 
L
A
 
S
M
 
Y
A
 
V
I
 
V
Q
 
R
E
 
K
E
 
T
G
 
G
L
 
L
K
 
E
A
 
C
K
 
K
S
 
W
Y
 
M
T
 
D
G
 
T
S
 
R
Q
 
D
V
 
V
R
 
L
V
 
I
L
 
V
T
 
N
D
 
P
S
 
T
T
 
S
F
 
S
T
 
N
K
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
-
Q
 
Q
I
 
V
D
 
D
-
 
P
-
 
D
-
 
F
-
 
G
-
 
E
-
 
S
D
 
E
E
 
K
R
 
R
M
 
L
R
 
D
K
 
K
-
 
W
-
 
F
D
 
S
L
 
L
A
 
N
E
 
P
G
 
S
N
 
K
V
 
I
V
 
I
V
 
I
V
 
A
A
 
T
G
 
G
F
 
F
Q
 
I
G
 
A
A
 
S
D
 
T
E
 
P
N
 
Q
G
 
N
N
 
I
I
 
P
T
 
T
T
 
T
L
 
L
G
 
K
R
 
R
G
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
D
T
 
F
S
 
S
A
 
A
V
 
A
A
 
I
L
 
M
A
 
G
A
 
A
A
 
L
L
 
L
K
 
R
A
 
A
D
 
R
E
 
Q
C
 
V
Q
 
T
I
 
I
Y
 
W
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
T
 
S
T
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
K
V
 
V
P
 
N
E
 
E
A
 
A
R
 
V
K
 
I
L
 
L
D
 
Q
T
 
T
I
 
L
T
 
S
F
 
Y
E
 
Q
E
 
E
M
 
A
L
 
W
E
 
E
M
 
M
A
 
S
S
 
Y
L
 
F
G
 
G
S
 
A
K
 
N
V
 
V
L
 
L
Q
 
H
I
 
P
R
 
R
S
 
T
V
 
I
E
 
I
F
 
P
A
 
V
G
 
M
K
 
R
Y
 
Y
K
 
N
V
 
I
K
 
P
L
 
I
R
 
V
V
 
I
L
 
R
S
 
N
S
 
I
F
 
F
Q
 
N
D
 
L
E
 
S
G
 
A
E
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
I
I
 
I
T
 
C
-
 
Q
-
 
P
V
 
P
E
 
E
D
 
D
D
 
D
K
 
Y
N
 
D
M
 
L
E
 
K
Q
 
L
P
 
T
I
 
T
-
 
P
I
 
V
S
 
K
G
 
G
I
 
F
A
 
A
F
 
T
N
 
I
R
 
D
D
 
N
E
 
L
A
 
A
K
 
L
L
 
I
T
 
N
V
 
V
-
 
E
-
 
G
L
 
T
G
 
G
V
 
M
P
 
A
D
 
G
R
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
T
A
 
A
Y
 
S
Q
 
D
I
 
I
L
 
F
G
 
G
P
 
C
I
 
V
A
 
K
D
 
D
A
 
V
N
 
G
I
 
A
D
 
N
V
 
V
D
 
I
M
 
M
I
|
I
I
 
S
Q
|
Q
N
 
-
V
 
A
G
 
S
V
 
S
D
 
E
G
 
H
T
 
S
T
 
V
D
 
C
F
 
F
S
 
A
F
 
V
T
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
E
V
 
V
N
 
N
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
L
R
 
R
S
 
S
E
 
R
Y
 
F
T
 
S
K
 
E
A
 
A
M
 
L
A
 
Q
V
 
A
-
 
G
-
 
R
L
 
L
E
 
S
Q
 
Q
V
 
I
K
 
-
Q
 
-
H
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
E
I
 
V
V
 
I
G
 
P
D
 
N
N
 
-
K
 
-
T
 
-
C
 
C
K
 
S
V
 
I
-
 
L
S
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
V
 
Q
G
 
K
M
 
M
R
 
A
S
 
S
H
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
S
S
 
C
Q
 
T
M
 
L
F
 
F
R
 
S
T
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
K
E
 
A
G
 
N
I
 
I
N
 
N
I
 
V
Q
 
R
M
 
A
I
|
I
S
 
S
-
x
Q
-
 
G
T
 
C
S
 
S
E
 
E
I
 
Y
K
 
N
I
 
V
S
 
T
V
 
V
V
 
V
I
 
I
D
 
K
E
 
R
K
 
E
Y
 
D
L
 
S
E
 
V
L
 
K
A
 
A
V
 
L
R
 
R
I
 
A
L
 
V
H
 
H
K
 
S
T
 
R
F
 
F
G
 
F
L
 
L
D
 
S
Q
 
R

O60163 Probable aspartokinase; Aspartate kinase; EC 2.7.2.4 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
31% identity, 83% coverage: 62:400/407 of query aligns to 134:492/519 of O60163

query
sites
O60163
S
 
S
P
 
P
R
 
R
E
 
T
L
 
R
D
 
D
V
 
L
I
 
V
A
 
I
S
 
G
T
 
M
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
V
 
L
T
 
S
I
 
C
G
 
R
L
 
F
L
 
M
A
 
A
M
 
A
A
 
V
I
 
L
Q
 
K
E
 
D
E
 
Q
G
 
G
L
 
I
K
 
D
A
 
S
K
 
E
S
 
F
Y
 
I
T
 
D
G
 
M
S
 
S
Q
 
H
V
 
I
-
 
I
-
 
D
-
 
E
-
 
Q
-
 
R
-
 
E
-
 
W
R
 
R
V
 
N
L
 
L
T
 
-
D
 
D
S
 
A
T
 
S
F
 
F
T
 
Y
K
 
A
A
 
Y
R
 
L
I
 
A
L
 
S
Q
 
Q
I
 
L
D
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
M
 
A
R
 
S
K
 
K
D
 
V
L
 
T
A
 
A
E
 
V
G
 
G
N
 
N
-
 
K
V
 
V
V
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
T
G
 
G
F
 
F
Q
 
F
G
 
G
A
 
M
D
 
V
E
 
P
N
 
G
G
 
G
N
 
L
I
 
L
T
 
S
T
 
Q
L
 
I
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
Y
S
 
T
D
 
D
T
 
F
S
 
C
A
 
A
V
 
A
A
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
V
A
 
G
L
 
L
K
 
N
A
 
A
D
 
D
E
 
E
C
 
L
Q
 
Q
I
 
I
Y
 
W
T
 
K
D
 
E
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
I
Y
 
F
T
 
T
T
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
K
V
 
V
P
 
P
E
 
T
A
 
A
R
 
R
K
 
L
L
 
L
D
 
P
T
 
L
I
 
I
T
 
T
F
 
P
E
 
E
E
 
E
M
 
A
L
 
A
E
 
E
M
 
L
A
 
T
S
 
Y
L
 
Y
G
 
G
S
 
S
K
 
E
V
 
V
L
 
I
Q
 
H
I
 
P
R
 
F
S
 
T
V
 
M
E
 
S
F
 
Q
A
 
V
G
 
V
K
 
H
Y
 
A
K
 
R
V
 
I
K
 
P
L
 
I
R
 
R
V
 
I
L
 
K
S
 
N
S
 
V
F
 
G
Q
 
N
D
 
P
E
 
R
G
 
G
E
 
K
G
 
G
T
 
T
L
 
V
I
 
I
-
 
F
-
 
P
-
 
D
T
 
T
V
 
I
E
 
S
D
 
R
D
 
H
K
 
G
N
x
S
M
 
A
E
x
T
Q
 
P
P
 
P
I
 
H
I
 
P
S
 
P
G
 
K
I
 
I
A
 
M
F
 
P
N
 
D
R
 
D
D
 
I
E
 
S
A
 
A
K
 
S
L
 
L
T
 
A
V
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
D
 
N
R
 
K
P
 
G
G
 
A
I
 
T
A
 
A
Y
 
V
Q
 
T
I
 
I
L
 
K
G
 
D
P
 
T
I
 
I
A
 
M
D
 
V
A
 
I
N
 
N
I
 
I
D
 
Q
V
 
S
D
 
N
M
 
R
I
 
K
I
 
I
Q
 
S
N
 
A
V
 
H
G
 
G
V
 
F
D
 
L
G
 
A
T
 
S
T
 
I
-
 
F
-
 
A
-
 
I
-
 
L
-
 
D
D
 
K
F
 
Y
S
 
K
F
 
L
T
 
A
V
 
V
N
 
D
-
 
L
-
 
I
-
 
T
R
 
T
S
 
S
E
 
E
Y
 
V
T
 
H
K
 
V
A
 
S
M
 
M
A
 
A
V
 
L
L
 
Y
E
 
E
Q
 
E
V
 
S
K
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
N
-
 
M
-
 
H
-
 
E
-
 
A
-
 
F
-
 
V
-
 
E
-
 
L
Q
 
R
H
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
T
R
 
L
E
 
D
I
 
I
V
 
L
G
 
-
D
 
-
N
 
H
K
 
G
T
 
L
C
 
A
K
 
I
V
 
L
S
 
S
A
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
K
G
 
H
M
 
M
R
 
R
S
 
N
H
 
T
P
 
T
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
S
 
G
Q
 
R
M
 
M
F
 
F
R
 
C
T
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
A
G
 
Q
I
 
I
N
 
N
I
 
I
Q
 
E
M
 
M
I
 
I
S
 
S
-
 
Q
-
 
G
T
 
A
S
 
S
E
 
E
I
 
I
K
 
N
I
 
I
S
 
S
V
 
C
V
 
V
I
 
I
D
 
D
E
 
E
K
 
K
Y
 
M
L
 
A
E
 
V
L
 
K
A
 
A
V
 
L
R
 
N
I
 
V
L
 
I
H
 
H
K
 
K

2dt9A Crystal structure of the regulatory subunit of aspartate kinase from thermus flavus (see paper)
41% identity, 37% coverage: 254:402/407 of query aligns to 3:152/153 of 2dt9A

query
sites
2dt9A
I
 
V
S
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
A
F
 
L
N
 
D
R
 
L
D
 
D
E
 
H
A
 
A
K
 
Q
L
 
I
T
 
G
V
 
L
L
 
I
G
 
G
V
 
I
P
 
P
D
 
D
R
x
Q
P
 
P
G
 
G
I
|
I
A
|
A
Y
 
A
Q
 
K
I
 
V
L
 
F
G
 
Q
P
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
R
N
 
G
I
 
I
D
 
A
V
 
V
D
 
D
M
 
M
I
 
I
I
 
I
Q
|
Q
N
 
G
V
 
V
-
 
P
G
 
G
V
 
H
D
 
D
G
 
P
T
 
S
-
 
R
T
 
Q
D
 
Q
F
 
M
S
 
A
F
 
F
T
 
T
V
 
V
N
 
K
R
 
K
S
 
D
E
 
F
Y
 
A
T
 
Q
K
 
E
A
 
A
M
 
L
A
 
E
V
 
A
L
 
L
E
 
E
Q
 
P
V
 
V
K
 
L
Q
 
A
H
 
E
V
 
I
G
 
G
A
 
G
R
 
E
E
 
A
I
 
I
V
 
L
G
 
R
D
 
P
N
 
D
K
 
-
T
 
I
C
 
A
K
 
K
V
 
V
S
 
S
A
 
I
V
 
V
G
 
G
V
 
V
G
 
G
M
 
L
R
 
A
S
 
S
H
 
T
P
 
P
G
 
E
V
 
V
A
 
P
S
 
A
Q
 
K
M
 
M
F
 
F
R
 
Q
T
 
A
L
 
V
A
 
A
E
 
S
E
 
T
G
 
G
I
 
A
N
|
N
I
|
I
Q
 
E
M
 
M
I
 
I
S
 
A
T
 
T
S
 
S
E
 
E
I
 
V
K
 
R
I
 
I
S
 
S
V
 
V
V
 
I
I
 
I
D
 
P
E
 
A
K
 
E
Y
 
Y
L
 
A
E
 
E
L
 
A
A
 
A
V
 
L
R
 
R
I
 
A
L
 
V
H
 
H
K
 
Q
T
 
A
F
 
F

3tviE Crystal structure of clostridium acetobutylicum aspartate kinase (caak): an important allosteric enzyme for industrial amino acids production (see paper)
25% identity, 70% coverage: 119:402/407 of query aligns to 153:436/439 of 3tviE

query
sites
3tviE
E
 
E
R
 
K
M
 
I
R
 
K
K
 
E
D
 
K
L
 
V
A
 
L
E
 
S
G
 
C
N
 
N
V
 
K
V
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
P
G
 
G
F
|
F
Q
 
Y
G
 
G
A
 
S
D
 
S
E
 
F
N
 
N
G
 
G
N
 
D
I
 
V
T
 
K
T
 
T
L
 
F
G
 
S
R
 
R
G
 
G
G
|
G
S
|
S
D
 
D
T
 
V
S
 
T
A
 
G
V
 
S
A
 
I
L
 
I
A
 
S
A
 
A
A
 
G
L
 
V
K
 
N
A
 
A
D
 
D
E
 
L
C
 
Y
Q
 
E
I
 
N
Y
 
W
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
S
G
 
G
V
 
F
Y
 
L
T
 
M
T
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
I
V
 
V
P
 
E
E
 
N
A
 
P
R
 
K
K
 
T
L
 
I
D
 
S
T
 
K
I
 
I
T
 
S
F
 
Y
E
 
K
E
 
E
M
 
L
L
 
R
E
 
E
M
 
L
A
 
S
S
 
Y
L
 
M
G
 
G
S
 
A
K
 
T
V
 
V
L
 
L
Q
 
H
I
 
E
R
 
E
S
 
A
V
 
I
E
 
F
F
 
P
A
 
V
G
 
K
K
 
D
Y
 
S
K
 
G
V
 
I
K
 
P
L
 
I
R
 
N
V
 
I
L
 
K
S
 
N
S
 
T
F
 
N
Q
 
K
D
 
P
E
 
S
G
 
D
E
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
L
V
 
S
E
 
D
D
 
T
D
 
H
K
 
K
N
 
E
M
 
I
E
 
N
Q
 
L
P
 
G
I
 
T
I
 
I
S
 
T
G
 
G
I
 
I
A
 
A
F
 
G
N
 
K
R
 
K
D
 
N
-
 
F
-
 
T
-
 
V
-
 
I
-
 
A
-
 
I
-
 
E
E
 
K
A
 
A
K
 
L
L
 
L
T
 
N
-
 
S
-
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
F
-
 
C
-
 
R
-
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
S
V
 
I
P
 
L
D
 
E
R
 
M
P
 
Y
G
 
G
I
 
V
A
 
S
Y
 
F
Q
 
E
I
 
H
L
 
M
G
 
P
P
 
S
I
 
G
A
 
V
D
 
D
A
 
S
N
 
-
I
 
-
D
 
-
V
 
V
D
 
S
M
 
L
I
 
V
I
 
I
Q
 
E
N
 
D
V
 
C
G
 
K
V
 
L
D
 
D
G
 
G
T
 
K
T
 
C
D
 
D
F
 
-
S
 
-
F
 
-
T
 
-
V
 
-
N
 
-
R
 
-
S
 
-
E
 
-
Y
 
-
T
 
-
K
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
K
V
 
I
L
 
I
E
 
E
Q
 
E
V
 
I
K
 
K
Q
 
K
H
 
Q
V
 
C
G
 
N
A
 
P
R
 
D
E
 
S
I
 
I
V
 
E
G
 
I
D
 
H
N
 
P
K
 
N
T
 
M
C
 
A
K
 
L
V
 
V
S
 
A
A
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
T
G
 
G
M
 
M
R
 
A
S
 
K
H
 
T
P
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
A
S
 
N
Q
 
K
M
 
I
F
 
F
R
 
T
T
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
K
E
 
E
G
 
N
I
 
V
N
 
N
I
 
I
Q
 
R
M
 
M
I
 
I
S
 
D
-
 
Q
-
 
G
T
 
S
S
 
S
E
 
E
I
 
I
K
 
N
I
 
V
S
 
I
V
 
V
V
 
G
I
 
V
D
 
E
E
 
T
K
 
V
Y
 
D
L
 
F
E
 
E
L
 
K
A
 
A
V
 
V
R
 
K
I
 
S
L
 
I
H
 
Y
K
 
N
T
 
A
F
 
F

Sites not aligning to the query:

P08660 Lysine-sensitive aspartokinase 3; Aspartate kinase III; AKIII; Lysine-sensitive aspartokinase III; EC 2.7.2.4 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
33% identity, 63% coverage: 40:295/407 of query aligns to 81:342/449 of P08660

query
sites
P08660
P
 
P
S
 
N
A
 
V
M
 
I
S
 
R
G
 
E
E
 
E
T
 
I
N
 
E
R
 
R
L
 
L
I
 
L
G
 
E
-
 
N
-
 
I
-
 
T
-
 
V
L
 
L
A
 
A
K
 
E
E
 
A
I
 
A
S
 
A
A
 
L
T
 
A
P
 
T
S
 
S
P
 
P
R
 
A
E
 
L
L
 
T
D
 
D
V
 
E
I
 
L
A
 
V
S
 
S
T
 
H
G
 
G
E
|
E
Q
 
L
V
 
M
T
 
S
I
 
T
G
 
L
L
 
L
L
 
F
A
 
V
M
 
E
A
 
I
I
 
L
Q
 
R
E
 
E
E
 
R
G
 
D
L
 
V
K
 
Q
A
 
A
K
 
Q
S
 
W
Y
 
F
T
 
D
G
 
V
S
 
R
Q
 
K
V
 
V
R
 
-
V
 
M
L
 
R
T
 
T
D
 
N
S
 
D
T
 
R
F
 
F
T
 
G
K
 
R
A
 
A
R
 
E
-
 
P
-
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
A
I
 
L
L
 
A
Q
 
E
I
 
L
D
 
A
D
 
A
E
 
L
R
 
Q
M
 
L
R
 
L
K
 
P
D
 
R
L
 
L
A
 
N
E
 
E
G
 
G
N
 
-
V
 
L
V
 
V
V
 
I
V
 
T
A
 
Q
G
 
G
F
 
F
Q
 
I
G
 
G
A
 
S
D
 
E
E
 
N
N
 
K
G
 
G
N
 
R
I
 
T
T
 
T
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
|
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
|
D
T
 
Y
S
 
T
A
 
A
V
 
A
A
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
H
A
 
A
D
 
S
E
 
R
C
 
V
Q
 
D
I
 
I
Y
 
W
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
P
G
 
G
V
 
I
Y
 
Y
T
 
T
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
S
E
 
A
A
 
A
R
 
K
K
 
R
L
 
I
D
 
D
T
 
E
I
 
I
T
 
A
F
 
F
E
 
A
E
 
E
M
 
A
L
 
A
E
 
E
M
 
M
A
 
A
S
 
T
L
 
F
G
 
G
S
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
L
Q
 
H
I
 
P
R
 
A
S
 
T
V
 
L
E
 
L
F
 
P
A
 
A
G
 
V
K
 
R
Y
 
S
K
 
D
V
 
I
K
 
P
L
 
V
R
 
F
V
 
V
L
 
G
S
 
S
S
 
S
F
 
K
Q
 
D
D
 
P
E
 
R
G
 
A
E
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
V
T
 
C
V
 
-
E
 
-
D
 
-
D
 
N
K
 
K
N
 
T
M
 
E
E
 
N
Q
 
P
P
 
P
I
 
L
I
 
F
S
 
R
G
 
A
I
 
L
A
 
A
F
 
L
N
 
R
R
 
R
D
 
N
E
 
Q
A
 
T
K
 
L
L
 
L
T
 
T
V
 
L
-
 
H
-
 
S
L
 
L
G
 
N
V
 
M
P
 
L
D
 
H
R
 
S
P
 
R
G
 
G
I
 
F
A
 
L
Y
 
A
Q
 
E
I
 
V
L
 
F
G
 
G
P
 
I
I
 
L
A
 
A
D
 
R
A
 
H
N
 
N
I
 
I
D
 
S
V
 
V
D
 
D
M
 
L
I
 
I

Sites not aligning to the query:

2j0xA Crystal structure of e. Coli aspartokinase iii in complex with lysine and aspartate (t-state) (see paper)
33% identity, 63% coverage: 40:295/407 of query aligns to 79:340/447 of 2j0xA

query
sites
2j0xA
P
 
P
S
 
N
A
 
V
M
 
I
S
 
R
G
 
E
E
 
E
T
 
I
N
 
E
R
 
R
L
 
L
I
 
L
G
 
E
-
 
N
-
 
I
-
 
T
-
 
V
L
 
L
A
 
A
K
 
E
E
 
A
I
 
A
S
 
A
A
 
L
T
 
A
P
 
T
S
 
S
P
 
P
R
 
A
E
 
L
L
 
T
D
 
D
V
 
E
I
 
L
A
 
V
S
 
S
T
 
H
G
 
G
E
 
E
Q
 
L
V
 
M
T
 
S
I
 
T
G
 
L
L
 
L
L
 
F
A
 
V
M
 
E
A
 
I
I
 
L
Q
 
R
E
 
E
E
 
R
G
 
D
L
 
V
K
 
Q
A
 
A
K
 
Q
S
 
W
Y
 
F
T
 
D
G
 
V
S
 
R
Q
 
K
V
 
V
R
 
-
V
 
M
L
 
R
T
 
T
D
 
N
S
 
D
T
 
R
F
 
F
T
 
G
K
 
R
A
 
A
R
 
E
-
 
P
-
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
A
I
 
L
L
 
A
Q
 
E
I
 
L
D
 
A
D
 
A
E
 
L
R
 
Q
M
 
L
R
 
L
K
 
P
D
 
R
L
 
L
A
 
N
E
 
E
G
 
G
N
 
-
V
 
L
V
 
V
V
 
I
V
 
T
A
 
Q
G
 
G
F
|
F
Q
 
I
G
 
G
A
 
S
D
 
E
E
 
N
N
 
K
G
 
G
N
 
R
I
 
T
T
 
T
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
|
G
G
|
G
S
|
S
D
|
D
T
 
Y
S
 
T
A
 
A
V
 
A
A
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
H
A
 
A
D
 
S
E
 
R
C
 
V
Q
 
D
I
 
I
Y
 
W
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
P
G
 
G
V
 
I
Y
 
Y
T
 
T
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
S
E
 
A
A
 
A
R
 
K
K
 
R
L
 
I
D
 
D
T
 
E
I
 
I
T
 
A
F
 
F
E
 
A
E
 
E
M
 
A
L
 
A
E
 
E
M
 
M
A
 
A
S
 
T
L
 
F
G
 
G
S
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
L
Q
 
H
I
 
P
R
 
A
S
 
T
V
 
L
E
 
L
F
 
P
A
 
A
G
 
V
K
 
R
Y
 
S
K
 
D
V
 
I
K
 
P
L
 
V
R
 
F
V
 
V
L
 
G
S
 
S
S
 
S
F
 
K
Q
 
D
D
 
P
E
 
R
G
 
A
E
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
V
T
 
C
V
 
-
E
 
-
D
 
-
D
 
N
K
 
K
N
 
T
M
 
E
E
 
N
Q
 
P
P
 
P
I
 
L
I
 
F
S
 
R
G
 
A
I
 
L
A
 
A
F
 
L
N
 
R
R
 
R
D
 
N
E
 
Q
A
 
T
K
 
L
L
 
L
T
 
T
V
 
L
-
 
H
-
 
S
L
 
L
G
 
N
V
x
M
P
 
L
D
 
H
R
x
S
P
 
R
G
 
G
I
x
F
A
x
L
Y
 
A
Q
 
E
I
 
V
L
 
F
G
 
G
P
 
I
I
 
L
A
 
A
D
 
R
A
 
H
N
 
N
I
 
I
D
x
S
V
|
V
D
|
D
M
 
L
I
 
I

Sites not aligning to the query:

2j0wA Crystal structure of e. Coli aspartokinase iii in complex with aspartate and adp (r-state) (see paper)
33% identity, 63% coverage: 40:295/407 of query aligns to 79:340/447 of 2j0wA

query
sites
2j0wA
P
 
P
S
 
N
A
 
V
M
 
I
S
 
R
G
 
E
E
 
E
T
 
I
N
 
E
R
 
R
L
 
L
I
 
L
G
 
E
-
 
N
-
 
I
-
 
T
-
 
V
L
 
L
A
 
A
K
 
E
E
 
A
I
 
A
S
 
A
A
 
L
T
 
A
P
 
T
S
 
S
P
 
P
R
 
A
E
 
L
L
 
T
D
 
D
V
 
E
I
 
L
A
 
V
S
 
S
T
 
H
G
 
G
E
|
E
Q
 
L
V
 
M
T
 
S
I
 
T
G
 
L
L
 
L
L
 
F
A
 
V
M
 
E
A
 
I
I
 
L
Q
 
R
E
 
E
E
 
R
G
 
D
L
 
V
K
 
Q
A
 
A
K
 
Q
S
 
W
Y
 
F
T
 
D
G
 
V
S
 
R
Q
 
K
V
 
V
R
 
-
V
 
M
L
 
R
T
 
T
D
 
N
S
 
D
T
 
R
F
 
F
T
 
G
K
 
R
A
 
A
R
 
E
-
 
P
-
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
A
I
 
L
L
 
A
Q
 
E
I
 
L
D
 
A
D
 
A
E
 
L
R
 
Q
M
 
L
R
 
L
K
 
P
D
 
R
L
 
L
A
 
N
E
 
E
G
 
G
N
 
-
V
 
L
V
 
V
V
 
I
V
 
T
A
 
Q
G
 
G
F
|
F
Q
 
I
G
 
G
A
 
S
D
 
E
E
 
N
N
 
K
G
 
G
N
 
R
I
 
T
T
 
T
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
|
R
G
|
G
G
 
G
S
|
S
D
 
D
T
 
Y
S
 
T
A
 
A
V
 
A
A
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
H
A
 
A
D
 
S
E
 
R
C
 
V
Q
 
D
I
 
I
Y
 
W
T
|
T
D
|
D
V
 
V
D
 
P
G
 
G
V
x
I
Y
|
Y
T
 
T
T
 
T
D
|
D
P
 
P
R
|
R
V
 
V
V
 
V
P
 
S
E
 
A
A
 
A
R
 
K
K
 
R
L
 
I
D
 
D
T
 
E
I
 
I
T
 
A
F
 
F
E
 
A
E
 
E
M
 
A
L
 
A
E
 
E
M
 
M
A
 
A
S
 
T
L
 
F
G
 
G
S
 
A
K
|
K
V
|
V
L
 
L
Q
 
H
I
 
P
R
 
A
S
 
T
V
 
L
E
 
L
F
 
P
A
 
A
G
 
V
K
 
R
Y
 
S
K
 
D
V
 
I
K
 
P
L
 
V
R
 
F
V
 
V
L
 
G
S
 
S
S
 
S
F
 
K
Q
 
D
D
 
P
E
 
R
G
 
A
E
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
V
T
 
C
V
 
-
E
 
-
D
 
-
D
 
N
K
 
K
N
 
T
M
 
E
E
 
N
Q
 
P
P
 
P
I
 
L
I
 
F
S
 
R
G
 
A
I
 
L
A
 
A
F
 
L
N
 
R
R
 
R
D
 
N
E
 
Q
A
 
T
K
 
L
L
 
L
T
 
T
V
 
L
-
 
H
-
 
S
L
 
L
G
 
N
V
 
M
P
 
L
D
 
H
R
 
S
P
 
R
G
 
G
I
 
F
A
 
L
Y
 
A
Q
 
E
I
 
V
L
 
F
G
 
G
P
 
I
I
 
L
A
 
A
D
 
R
A
 
H
N
 
N
I
 
I
D
 
S
V
 
V
D
 
D
M
 
L
I
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Dsui_2134 FitnessBrowser__PS:Dsui_2134
MALIVQKYGGTSVGSTERIKNVAKRVARWKAMGHDVVVVPSAMSGETNRLIGLAKEISAT
PSPRELDVIASTGEQVTIGLLAMAIQEEGLKAKSYTGSQVRVLTDSTFTKARILQIDDER
MRKDLAEGNVVVVAGFQGADENGNITTLGRGGSDTSAVALAAALKADECQIYTDVDGVYT
TDPRVVPEARKLDTITFEEMLEMASLGSKVLQIRSVEFAGKYKVKLRVLSSFQDEGEGTL
ITVEDDKNMEQPIISGIAFNRDEAKLTVLGVPDRPGIAYQILGPIADANIDVDMIIQNVG
VDGTTDFSFTVNRSEYTKAMAVLEQVKQHVGAREIVGDNKTCKVSAVGVGMRSHPGVASQ
MFRTLAEEGINIQMISTSEIKISVVIDEKYLELAVRILHKTFGLDQA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory