SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Dsui_3033 FitnessBrowser__PS:Dsui_3033 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1tuuA Acetate kinase crystallized with atpgs (see paper)
40% identity, 98% coverage: 5:395/397 of query aligns to 3:396/399 of 1tuuA

query
sites
1tuuA
V
 
V
L
 
L
T
 
V
L
 
I
N
|
N
A
 
A
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
I
 
L
K
|
K
F
 
Y
S
 
Q
L
 
L
Y
 
I
E
 
D
L
 
M
E
 
T
N
 
N
G
 
E
G
 
S
G
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
V
E
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
G
Q
 
L
I
 
C
D
 
E
G
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
I
-
 
D
K
 
N
A
 
S
H
 
I
I
 
I
K
 
T
A
 
Q
K
 
K
D
 
K
D
 
F
K
 
D
G
 
G
K
 
K
K
 
K
L
 
L
D
 
E
D
 
K
V
 
L
-
 
T
D
 
D
I
 
L
P
 
P
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
S
 
-
Q
 
T
H
 
H
H
 
K
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
E
F
 
E
L
 
V
I
 
V
S
 
K
W
 
A
L
 
L
H
 
T
D
 
D
H
 
D
E
 
E
K
 
F
G
 
G
-
 
V
-
 
I
-
 
K
-
 
D
-
 
M
W
 
G
K
 
E
I
 
I
V
 
N
A
 
A
V
 
V
G
 
G
H
 
H
R
|
R
V
 
V
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
K
Y
 
F
S
 
T
R
 
T
P
 
S
M
 
A
K
 
L
L
 
Y
D
 
D
D
 
E
N
 
G
I
 
V
I
 
E
E
 
K
H
 
A
L
 
I
T
 
K
R
 
D
L
 
C
I
 
F
P
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
|
H
Q
 
N
P
 
P
H
 
P
N
 
N
L
 
M
D
 
M
G
 
G
V
 
I
D
 
S
A
 
A
L
 
C
R
 
A
T
 
E
M
 
I
M
 
M
P
 
P
E
 
G
V
 
T
P
 
P
Q
 
M
V
 
V
A
 
I
C
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
A
F
 
F
H
 
H
R
 
Q
T
 
T
Q
 
M
A
 
P
P
 
P
V
 
Y
A
 
A
Q
 
Y
A
 
M
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
P
 
P
R
 
Y
W
 
D
I
 
L
T
 
Y
G
 
E
E
 
K
-
 
H
G
 
G
V
 
V
K
 
R
R
 
K
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
L
 
T
S
 
S
Y
 
H
E
 
K
Y
 
Y
I
 
V
A
 
A
R
 
E
-
 
R
-
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
M
D
 
L
Y
 
G
S
 
K
P
 
P
R
 
A
A
 
E
N
 
E
G
 
T
R
 
K
V
 
I
V
 
I
V
 
T
A
 
C
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
|
G
A
 
S
S
 
S
M
 
I
C
 
T
G
 
A
M
 
V
V
 
E
D
 
G
R
 
G
K
 
K
S
 
S
Q
 
V
V
 
E
S
 
T
T
 
S
M
 
M
G
 
G
F
 
F
T
 
T
A
 
P
V
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
A
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
T
 
C
G
 
G
A
 
S
L
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
A
V
 
I
M
 
V
L
 
P
Y
 
F
L
 
L
M
 
M
E
 
E
N
 
K
K
 
E
G
 
G
M
 
L
D
 
T
V
 
T
K
 
R
A
 
E
L
 
I
T
 
D
K
 
T
L
 
L
L
 
M
Y
 
N
K
 
K
E
 
K
S
 
S
G
 
G
L
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
V
S
 
S
G
 
G
I
 
L
S
 
S
P
 
N
D
|
D
M
x
F
R
|
R
T
 
D
L
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
A
L
 
A
A
 
S
S
 
K
D
 
G
K
 
N
P
 
R
E
 
K
A
 
A
K
 
E
E
 
L
A
 
A
V
 
L
D
 
E
L
 
I
F
 
F
C
 
A
Y
 
Y
R
 
K
V
 
V
V
 
K
R
 
K
E
 
F
L
 
I
G
 
G
S
 
E
L
 
Y
A
 
S
A
 
A
A
 
V
I
 
L
G
 
N
G
 
G
I
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
V
V
 
V
F
 
F
T
 
T
G
x
A
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
H
x
N
A
x
S
A
 
A
E
 
S
V
 
I
R
 
R
R
 
K
R
 
R
V
 
I
C
 
L
L
 
T
Q
 
G
A
 
L
S
 
D
W
 
G
L
 
I
G
 
G
I
 
I
S
 
K
I
 
I
D
 
D
E
 
D
S
 
E
A
 
K
N
 
N
A
 
K
L
 
I
H
 
R
A
 
G
N
 
Q
R
 
E
-
 
I
-
 
D
I
 
I
S
 
S
E
 
T
P
 
P
R
 
D
S
 
A
T
 
K
V
 
V
D
 
R
V
 
V
L
 
F
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
L
M
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
H
 
E
T
 
T
A
 
K
T
 
E
L
 
I
L
 
V

1tuyB Acetate kinase complexed with adp, alf3 and acetate (see paper)
40% identity, 98% coverage: 5:395/397 of query aligns to 3:396/398 of 1tuyB

query
sites
1tuyB
V
 
V
L
 
L
T
 
V
L
 
I
N
|
N
A
 
A
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
I
 
L
K
 
K
F
 
Y
S
 
Q
L
 
L
Y
 
I
E
 
D
L
 
M
E
 
T
N
 
N
G
 
E
G
 
S
G
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
V
E
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
G
Q
 
L
I
 
C
D
 
E
G
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
I
-
 
D
K
 
N
A
 
S
H
 
I
I
 
I
K
 
T
A
 
Q
K
 
K
D
 
K
D
 
F
K
 
D
G
 
G
K
 
K
K
 
K
L
 
L
D
 
E
D
 
K
V
 
L
-
 
T
D
 
D
I
 
L
P
 
P
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
S
 
-
Q
 
T
H
 
H
H
 
K
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
E
F
 
E
L
 
V
I
 
V
S
 
K
W
 
A
L
 
L
H
 
T
D
 
D
H
 
D
E
 
E
K
 
F
G
 
G
-
 
V
-
 
I
-
 
K
-
 
D
-
 
M
W
 
G
K
 
E
I
 
I
V
 
N
A
 
A
V
 
V
G
 
G
H
 
H
R
|
R
V
 
V
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
K
Y
 
F
S
 
T
R
 
T
P
 
S
M
 
A
K
 
L
L
 
Y
D
 
D
D
 
E
N
 
G
I
 
V
I
 
E
E
 
K
H
 
A
L
 
I
T
 
K
R
 
D
L
 
C
I
 
F
P
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
Q
 
N
P
 
P
H
 
P
N
 
N
L
 
M
D
 
M
G
 
G
V
 
I
D
 
S
A
 
A
L
 
C
R
 
A
T
 
E
M
 
I
M
 
M
P
 
P
E
 
G
V
 
T
P
 
P
Q
 
M
V
 
V
A
 
I
C
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
A
F
 
F
H
 
H
R
 
Q
T
 
T
Q
 
M
A
 
P
P
 
P
V
 
Y
A
 
A
Q
 
Y
A
 
M
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
P
 
P
R
 
Y
W
 
D
I
 
L
T
 
Y
G
 
E
E
 
K
-
 
H
G
 
G
V
 
V
K
 
R
R
 
K
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
L
 
T
S
 
S
Y
 
H
E
 
K
Y
 
Y
I
 
V
A
 
A
R
 
E
-
 
R
-
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
M
D
 
L
Y
 
G
S
 
K
P
 
P
R
 
A
A
 
E
N
 
E
G
 
T
R
 
K
V
 
I
V
 
I
V
 
T
A
 
C
H
 
H
L
|
L
G
|
G
N
|
N
G
|
G
A
 
S
S
 
S
M
 
I
C
 
T
G
 
A
M
 
V
V
 
E
D
 
G
R
 
G
K
 
K
S
 
S
Q
 
V
V
 
E
S
 
T
T
 
S
M
 
M
G
 
G
F
 
F
T
 
T
A
 
P
V
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
A
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
T
 
C
G
 
G
A
 
S
L
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
A
V
 
I
M
 
V
L
 
P
Y
 
F
L
 
L
M
 
M
E
 
E
N
 
K
K
 
E
G
 
G
M
 
L
D
 
T
V
 
T
K
 
R
A
 
E
L
 
I
T
 
D
K
 
T
L
 
L
L
 
M
Y
 
N
K
 
K
E
 
K
S
 
S
G
 
G
L
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
V
S
 
S
G
 
G
I
 
L
S
 
S
P
 
N
D
|
D
M
x
F
R
|
R
T
 
D
L
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
A
L
 
A
A
 
S
S
 
K
D
 
G
K
 
N
P
 
R
E
 
K
A
 
A
K
 
E
E
 
L
A
 
A
V
 
L
D
 
E
L
 
I
F
 
F
C
 
A
Y
 
Y
R
 
K
V
 
V
V
 
K
R
 
K
E
 
F
L
 
I
G
 
G
S
 
E
L
 
Y
A
 
S
A
 
A
A
 
V
I
 
L
G
 
N
G
 
G
I
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
V
V
 
V
F
 
F
T
 
T
G
x
A
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
H
x
N
A
x
S
A
 
A
E
 
S
V
 
I
R
 
R
R
 
K
R
 
R
V
 
I
C
 
L
L
 
T
Q
 
G
A
 
L
S
 
D
W
 
G
L
 
I
G
 
G
I
 
I
S
 
K
I
 
I
D
 
D
E
 
D
S
 
E
A
 
K
N
 
N
A
 
K
L
 
I
H
x
R
A
 
G
N
 
Q
R
 
E
-
 
I
-
 
D
I
 
I
S
 
S
E
 
T
P
 
P
R
 
D
S
 
A
T
 
K
V
 
V
D
 
R
V
 
V
L
 
F
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
L
M
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
H
 
E
T
 
T
A
 
K
T
 
E
L
 
I
L
 
V

1tuuB Acetate kinase crystallized with atpgs (see paper)
40% identity, 98% coverage: 5:395/397 of query aligns to 3:396/398 of 1tuuB

query
sites
1tuuB
V
 
V
L
 
L
T
 
V
L
 
I
N
|
N
A
 
A
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
I
 
L
K
 
K
F
 
Y
S
 
Q
L
 
L
Y
 
I
E
 
D
L
 
M
E
 
T
N
 
N
G
 
E
G
 
S
G
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
V
E
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
G
Q
 
L
I
 
C
D
 
E
G
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
I
-
 
D
K
 
N
A
 
S
H
 
I
I
 
I
K
 
T
A
 
Q
K
 
K
D
 
K
D
 
F
K
 
D
G
 
G
K
 
K
K
 
K
L
 
L
D
 
E
D
 
K
V
 
L
-
 
T
D
 
D
I
 
L
P
 
P
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
S
 
-
Q
 
T
H
 
H
H
 
K
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
E
F
 
E
L
 
V
I
 
V
S
 
K
W
 
A
L
 
L
H
 
T
D
 
D
H
 
D
E
 
E
K
 
F
G
 
G
-
 
V
-
 
I
-
 
K
-
 
D
-
 
M
W
 
G
K
 
E
I
 
I
V
 
N
A
 
A
V
 
V
G
 
G
H
 
H
R
|
R
V
 
V
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
K
Y
 
F
S
 
T
R
 
T
P
 
S
M
 
A
K
 
L
L
 
Y
D
 
D
D
 
E
N
 
G
I
 
V
I
 
E
E
 
K
H
 
A
L
 
I
T
 
K
R
 
D
L
 
C
I
 
F
P
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
Q
 
N
P
 
P
H
 
P
N
 
N
L
 
M
D
 
M
G
 
G
V
 
I
D
 
S
A
 
A
L
 
C
R
 
A
T
 
E
M
 
I
M
 
M
P
 
P
E
 
G
V
 
T
P
 
P
Q
 
M
V
 
V
A
 
I
C
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
A
F
 
F
H
 
H
R
 
Q
T
 
T
Q
 
M
A
 
P
P
 
P
V
 
Y
A
 
A
Q
 
Y
A
 
M
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
P
 
P
R
 
Y
W
 
D
I
 
L
T
 
Y
G
 
E
E
 
K
-
 
H
G
 
G
V
 
V
K
 
R
R
 
K
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
L
 
T
S
 
S
Y
 
H
E
 
K
Y
 
Y
I
 
V
A
 
A
R
 
E
-
 
R
-
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
M
D
 
L
Y
 
G
S
 
K
P
 
P
R
 
A
A
 
E
N
 
E
G
 
T
R
 
K
V
 
I
V
 
I
V
 
T
A
 
C
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
|
G
A
 
S
S
 
S
M
 
I
C
 
T
G
 
A
M
 
V
V
 
E
D
 
G
R
 
G
K
 
K
S
 
S
Q
 
V
V
 
E
S
 
T
T
 
S
M
 
M
G
 
G
F
 
F
T
 
T
A
 
P
V
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
A
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
T
 
C
G
 
G
A
 
S
L
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
A
V
 
I
M
 
V
L
 
P
Y
 
F
L
 
L
M
 
M
E
 
E
N
 
K
K
 
E
G
 
G
M
 
L
D
 
T
V
 
T
K
 
R
A
 
E
L
 
I
T
 
D
K
 
T
L
 
L
L
 
M
Y
 
N
K
 
K
E
 
K
S
 
S
G
 
G
L
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
V
S
 
S
G
 
G
I
 
L
S
 
S
P
 
N
D
|
D
M
x
F
R
|
R
T
 
D
L
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
A
L
 
A
A
 
S
S
 
K
D
 
G
K
 
N
P
 
R
E
 
K
A
 
A
K
 
E
E
 
L
A
 
A
V
 
L
D
 
E
L
 
I
F
 
F
C
 
A
Y
 
Y
R
 
K
V
 
V
V
 
K
R
 
K
E
 
F
L
 
I
G
 
G
S
 
E
L
 
Y
A
 
S
A
 
A
A
 
V
I
 
L
G
 
N
G
 
G
I
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
V
V
 
V
F
 
F
T
 
T
G
 
A
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
H
x
N
A
x
S
A
 
A
E
 
S
V
 
I
R
 
R
R
 
K
R
 
R
V
 
I
C
 
L
L
 
T
Q
 
G
A
 
L
S
 
D
W
 
G
L
 
I
G
 
G
I
 
I
S
 
K
I
 
I
D
 
D
E
 
D
S
 
E
A
 
K
N
 
N
A
 
K
L
 
I
H
x
R
A
 
G
N
 
Q
R
 
E
-
 
I
-
 
D
I
 
I
S
 
S
E
 
T
P
 
P
R
 
D
S
 
A
T
 
K
V
 
V
D
 
R
V
 
V
L
 
F
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
L
M
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
H
 
E
T
 
T
A
 
K
T
 
E
L
 
I
L
 
V

P38502 Acetate kinase; Acetokinase; EC 2.7.2.1 from Methanosarcina thermophila (see 5 papers)
40% identity, 98% coverage: 5:395/397 of query aligns to 3:396/408 of P38502

query
sites
P38502
V
 
V
L
 
L
T
 
V
L
 
I
N
|
N
A
 
A
G
 
G
S
|
S
S
 
S
S
|
S
I
 
L
K
|
K
F
 
Y
S
 
Q
L
 
L
Y
 
I
E
 
D
L
 
M
E
 
T
N
 
N
G
 
E
G
 
S
G
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
V
E
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
G
Q
 
L
I
 
C
D
 
E
G
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
I
-
 
D
K
 
N
A
 
S
H
 
I
I
 
I
K
 
T
A
 
Q
K
 
K
D
 
K
D
 
F
K
 
D
G
 
G
K
 
K
K
 
K
L
 
L
D
 
E
D
 
K
V
 
L
-
 
T
D
 
D
I
 
L
P
 
P
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
S
 
-
Q
 
T
H
 
H
H
 
K
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
E
F
 
E
L
 
V
I
 
V
S
 
K
W
 
A
L
 
L
H
 
T
D
 
D
H
 
D
E
 
E
K
 
F
G
 
G
-
 
V
-
 
I
-
 
K
-
 
D
-
 
M
W
 
G
K
 
E
I
 
I
V
 
N
A
 
A
V
 
V
G
 
G
H
 
H
R
|
R
V
 
V
V
|
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
K
Y
 
F
S
 
T
R
 
T
P
 
S
M
 
A
K
 
L
L
 
Y
D
 
D
D
 
E
N
 
G
I
 
V
I
 
E
E
 
K
H
 
A
L
 
I
T
 
K
R
 
D
L
 
C
I
 
F
P
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
|
L
H
 
H
Q
 
N
P
 
P
H
 
P
N
 
N
L
 
M
D
 
M
G
 
G
V
 
I
D
 
S
A
 
A
L
 
C
R
 
A
T
 
E
M
 
I
M
 
M
P
 
P
E
 
G
V
 
T
P
 
P
Q
 
M
V
 
V
A
 
I
C
 
V
F
 
F
D
|
D
T
 
T
A
 
A
F
 
F
H
 
H
R
 
Q
T
 
T
Q
 
M
A
 
P
P
 
P
V
 
Y
A
 
A
Q
 
Y
A
 
M
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
P
 
P
R
 
Y
W
 
D
I
 
L
T
 
Y
G
 
E
E
 
K
-
 
H
G
 
G
V
 
V
K
 
R
R
 
K
Y
 
Y
G
 
G
F
|
F
H
 
H
G
 
G
L
 
T
S
 
S
Y
 
H
E
 
K
Y
 
Y
I
 
V
A
 
A
R
 
E
-
 
R
-
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
M
D
 
L
Y
 
G
S
 
K
P
 
P
R
 
A
A
 
E
N
 
E
G
 
T
R
 
K
V
 
I
V
 
I
V
 
T
A
 
C
H
 
H
L
 
L
G
 
G
N
|
N
G
 
G
A
 
S
S
 
S
M
 
I
C
 
T
G
 
A
M
 
V
V
 
E
D
 
G
R
 
G
K
 
K
S
 
S
Q
 
V
V
 
E
S
 
T
T
 
S
M
 
M
G
 
G
F
 
F
T
 
T
A
x
P
V
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
A
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
T
 
C
G
 
G
A
 
S
L
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
A
V
 
I
M
 
V
L
 
P
Y
 
F
L
 
L
M
 
M
E
 
E
N
 
K
K
 
E
G
 
G
M
 
L
D
 
T
V
 
T
K
 
R
A
 
E
L
 
I
T
 
D
K
 
T
L
 
L
L
 
M
Y
 
N
K
 
K
E
 
K
S
 
S
G
 
G
L
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
V
S
 
S
G
 
G
I
 
L
S
 
S
P
 
N
D
 
D
M
 
F
R
 
R
T
 
D
L
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
A
L
 
A
A
 
S
S
 
K
D
 
G
K
 
N
P
 
R
E
 
K
A
 
A
K
 
E
E
 
L
A
 
A
V
 
L
D
 
E
L
 
I
F
 
F
C
 
A
Y
 
Y
R
 
K
V
 
V
V
 
K
R
 
K
E
 
F
L
 
I
G
 
G
S
 
E
L
 
Y
A
 
S
A
 
A
A
 
V
I
 
L
G
 
N
G
 
G
I
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
V
V
 
V
F
 
F
T
 
T
G
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
E
H
 
N
A
 
S
A
 
A
E
 
S
V
 
I
R
 
R
R
 
K
R
 
R
V
 
I
C
 
L
L
 
T
Q
 
G
A
 
L
S
 
D
W
 
G
L
 
I
G
 
G
I
 
I
S
 
K
I
 
I
D
 
D
E
 
D
S
 
E
A
 
K
N
 
N
A
 
K
L
 
I
H
 
R
A
 
G
N
 
Q
R
 
E
-
 
I
-
 
D
I
 
I
S
 
S
E
 
T
P
 
P
R
 
D
S
 
A
T
 
K
V
 
V
D
 
R
V
 
V
L
 
F
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
L
M
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
H
 
E
T
 
T
A
 
K
T
 
E
L
 
I
L
 
V

7fj9A Kpacka (pduw) with amppnp complex structure
40% identity, 99% coverage: 2:394/397 of query aligns to 1:391/395 of 7fj9A

query
sites
7fj9A
T
 
T
R
 
Y
A
 
K
V
 
I
L
 
M
T
 
A
L
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
I
 
L
K
 
K
F
 
F
S
 
Q
L
 
L
Y
 
L
E
 
N
L
 
M
E
 
P
N
 
Q
G
 
G
G
 
A
G
 
L
I
 
L
A
 
C
A
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
Q
G
 
G
Q
 
L
I
 
I
D
 
E
G
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
L
-
 
P
K
 
E
A
 
A
H
 
R
I
 
F
K
 
T
A
 
L
K
 
K
D
 
T
D
 
S
K
 
A
G
 
Q
K
 
K
K
 
W
L
 
Q
D
 
E
D
 
T
V
 
L
D
 
P
I
 
I
P
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
S
 
A
Q
 
D
H
 
H
H
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
T
F
 
L
L
 
L
I
 
L
S
 
E
W
 
A
L
 
L
H
 
T
D
 
G
H
 
R
-
 
G
-
 
I
-
 
L
E
 
S
K
 
S
G
 
L
W
 
Q
K
 
E
I
 
I
V
 
D
A
 
G
V
 
V
G
 
G
H
 
H
R
 
R
V
 
V
V
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
Y
 
F
S
 
K
R
 
D
P
 
A
M
 
A
K
 
L
L
 
V
D
 
C
D
 
D
N
 
D
I
 
T
I
 
L
E
 
R
H
 
E
L
 
I
T
 
E
R
 
R
L
 
L
I
 
A
P
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
Q
 
N
P
 
P
H
 
V
N
 
N
L
 
A
D
 
L
G
 
G
V
 
I
D
 
R
A
 
L
L
 
F
R
 
R
T
 
Q
M
 
L
M
 
L
P
 
P
E
 
A
V
 
V
P
 
P
Q
 
A
V
 
V
A
 
A
C
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
A
F
 
F
H
 
H
R
 
Q
T
 
T
Q
 
L
A
 
A
P
 
P
V
 
E
A
 
A
Q
 
W
A
 
L
F
 
Y
A
 
P
L
 
L
P
 
P
-
 
W
R
 
R
W
 
Y
I
 
Y
T
 
A
G
 
E
E
 
L
G
 
G
V
 
I
K
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
L
 
T
S
 
S
Y
 
H
E
 
H
Y
 
Y
I
 
V
A
 
S
R
 
S
V
 
A
L
 
L
P
 
A
D
 
E
Y
 
K
-
 
L
-
 
G
S
 
V
P
 
P
R
 
L
A
 
S
N
 
A
G
 
L
R
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
S
A
 
C
H
|
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
|
G
A
 
C
S
 
S
M
 
V
C
 
C
G
 
A
M
 
I
V
 
K
D
 
G
R
 
G
K
 
Q
S
 
S
Q
 
V
V
 
N
S
 
T
T
 
S
M
 
M
G
 
G
F
 
F
T
 
T
A
 
P
V
 
Q
E
 
S
G
 
G
L
 
V
M
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
 
R
T
 
S
G
 
G
A
 
D
L
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
S
V
 
I
M
 
L
L
 
P
Y
 
W
L
 
L
M
 
V
E
 
E
N
 
K
K
 
E
G
 
G
M
 
K
D
 
S
V
 
A
K
 
Q
A
 
Q
L
 
L
T
 
S
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
Y
 
N
K
 
N
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
V
S
 
S
G
 
G
I
 
V
S
 
S
P
 
S
D
|
D
M
x
Y
R
|
R
T
 
D
L
 
V
-
 
E
L
 
Q
A
 
A
S
 
A
D
 
D
-
 
A
-
 
G
K
 
N
P
 
E
E
 
R
A
 
A
K
 
A
E
 
L
A
 
A
V
 
L
D
 
S
L
 
L
F
 
F
C
 
A
Y
 
E
R
 
R
V
 
I
V
 
R
R
 
A
E
 
T
L
 
I
G
 
G
S
 
S
L
 
Y
A
 
I
A
 
M
A
 
Q
I
 
M
G
 
G
G
 
G
I
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
I
F
 
F
T
 
T
G
|
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
H
x
N
A
x
S
A
 
A
E
 
R
V
 
A
R
 
R
R
 
A
R
 
A
V
 
I
C
 
C
L
 
R
Q
 
N
A
 
L
S
 
H
W
 
F
L
 
L
G
 
G
I
 
L
S
 
A
I
 
L
D
 
D
E
 
D
S
 
E
A
 
K
N
 
N
A
 
Q
L
 
R
H
 
S
A
 
A
N
 
T
R
 
F
I
 
I
S
 
Q
E
 
A
P
 
D
R
 
N
S
 
A
T
 
L
V
 
V
D
 
K
V
 
V
L
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
N
T
 
T
N
 
N
E
 
E
E
 
E
W
 
L
M
 
M
I
 
I
A
 
A
R
 
R
H
 
D
T
 
V
A
 
M
T
 
R
L
 
L

7fj8A Kpacka (pduw) with amp complex structure
40% identity, 99% coverage: 2:394/397 of query aligns to 1:391/395 of 7fj8A

query
sites
7fj8A
T
 
T
R
 
Y
A
 
K
V
 
I
L
 
M
T
 
A
L
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
I
 
L
K
 
K
F
 
F
S
 
Q
L
 
L
Y
 
L
E
 
N
L
 
M
E
 
P
N
 
Q
G
 
G
G
 
A
G
 
L
I
 
L
A
 
C
A
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
Q
G
 
G
Q
 
L
I
 
I
D
 
E
G
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
L
-
 
P
K
 
E
A
 
A
H
 
R
I
 
F
K
 
T
A
 
L
K
 
K
D
 
T
D
 
S
K
 
A
G
 
Q
K
 
K
K
 
W
L
 
Q
D
 
E
D
 
T
V
 
L
D
 
P
I
 
I
P
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
S
 
A
Q
 
D
H
 
H
H
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
T
F
 
L
L
 
L
I
 
L
S
 
E
W
 
A
L
 
L
H
 
T
D
 
G
H
 
R
-
 
G
-
 
I
-
 
L
E
 
S
K
 
S
G
 
L
W
 
Q
K
 
E
I
 
I
V
 
D
A
 
G
V
 
V
G
 
G
H
 
H
R
 
R
V
 
V
V
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
Y
 
F
S
 
K
R
 
D
P
 
A
M
 
A
K
 
L
L
 
V
D
 
C
D
 
D
N
 
D
I
 
T
I
 
L
E
 
R
H
 
E
L
 
I
T
 
E
R
 
R
L
 
L
I
 
A
P
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
Q
 
N
P
 
P
H
 
V
N
 
N
L
 
A
D
 
L
G
 
G
V
 
I
D
 
R
A
 
L
L
 
F
R
 
R
T
 
Q
M
 
L
M
 
L
P
 
P
E
 
A
V
 
V
P
 
P
Q
 
A
V
 
V
A
 
A
C
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
A
F
 
F
H
 
H
R
 
Q
T
 
T
Q
 
L
A
 
A
P
 
P
V
 
E
A
 
A
Q
 
W
A
 
L
F
 
Y
A
 
P
L
 
L
P
 
P
-
 
W
R
 
R
W
 
Y
I
 
Y
T
 
A
G
 
E
E
 
L
G
 
G
V
 
I
K
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
 
H
G
 
G
L
 
T
S
 
S
Y
 
H
E
 
H
Y
 
Y
I
 
V
A
 
S
R
 
S
V
 
A
L
 
L
P
 
A
D
 
E
Y
 
K
-
 
L
-
 
G
S
 
V
P
 
P
R
 
L
A
 
S
N
 
A
G
 
L
R
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
S
A
 
C
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
 
G
A
 
C
S
 
S
M
 
V
C
 
C
G
 
A
M
 
I
V
 
K
D
 
G
R
 
G
K
 
Q
S
 
S
Q
 
V
V
 
N
S
 
T
T
 
S
M
 
M
G
 
G
F
 
F
T
 
T
A
 
P
V
 
Q
E
 
S
G
 
G
L
 
V
M
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
 
R
T
 
S
G
 
G
A
 
D
L
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
S
V
 
I
M
 
L
L
 
P
Y
 
W
L
 
L
M
 
V
E
 
E
N
 
K
K
 
E
G
 
G
M
 
K
D
 
S
V
 
A
K
 
Q
A
 
Q
L
 
L
T
 
S
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
Y
 
N
K
 
N
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
V
S
 
S
G
 
G
I
 
V
S
 
S
P
 
S
D
|
D
M
x
Y
R
|
R
T
 
D
L
 
V
-
 
E
L
 
Q
A
 
A
S
 
A
D
 
D
-
 
A
-
 
G
K
 
N
P
 
E
E
 
R
A
 
A
K
 
A
E
 
L
A
 
A
V
 
L
D
 
S
L
 
L
F
 
F
C
 
A
Y
 
E
R
 
R
V
 
I
V
 
R
R
 
A
E
 
T
L
 
I
G
 
G
S
 
S
L
 
Y
A
 
I
A
 
M
A
 
Q
I
 
M
G
 
G
G
 
G
I
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
I
F
 
F
T
 
T
G
|
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
H
x
N
A
 
S
A
 
A
E
 
R
V
 
A
R
 
R
R
 
A
R
 
A
V
 
I
C
 
C
L
 
R
Q
 
N
A
 
L
S
 
H
W
 
F
L
 
L
G
 
G
I
 
L
S
 
A
I
 
L
D
 
D
E
 
D
S
 
E
A
 
K
N
 
N
A
 
Q
L
 
R
H
 
S
A
 
A
N
 
T
R
 
F
I
 
I
S
 
Q
E
 
A
P
 
D
R
 
N
S
 
A
T
 
L
V
 
V
D
 
K
V
 
V
L
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
N
T
 
T
N
 
N
E
 
E
E
 
E
W
 
L
M
 
M
I
 
I
A
 
A
R
 
R
H
 
D
T
 
V
A
 
M
T
 
R
L
 
L

4fwsA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with ctp (see paper)
39% identity, 97% coverage: 5:388/397 of query aligns to 4:383/394 of 4fwsA

query
sites
4fwsA
V
 
V
L
 
L
T
 
V
L
 
I
N
|
N
A
 
C
G
 
G
S
|
S
S
 
S
S
 
S
I
 
I
K
 
K
F
 
F
S
 
S
L
 
V
Y
 
L
E
 
D
L
 
V
E
 
A
N
 
T
G
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
C
E
 
D
P
 
V
V
 
L
L
 
M
S
 
A
G
 
G
Q
 
I
I
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
M
G
 
N
V
 
T
K
 
E
-
 
N
A
 
A
H
 
F
I
 
L
K
 
S
A
 
I
K
 
N
D
 
G
D
 
D
K
 
K
G
 
P
K
 
I
K
 
N
L
 
L
D
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
P
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
A
E
 
H
S
 
S
Q
 
N
H
 
Y
H
 
E
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
K
F
 
A
L
 
I
I
 
A
S
 
F
W
 
E
L
 
L
H
 
E
D
 
K
H
 
R
E
 
D
K
 
L
G
 
T
W
 
D
K
 
S
I
 
V
V
 
A
A
 
L
V
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
V
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
L
Y
 
F
S
 
T
R
 
Q
P
 
S
M
 
V
K
 
I
L
 
I
D
 
T
D
 
D
N
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
D
H
 
N
L
 
I
T
 
R
R
 
R
L
 
V
I
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
|
H
Q
 
N
P
 
Y
H
 
A
N
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
G
V
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
A
R
 
R
T
 
H
M
 
L
M
 
F
P
 
P
E
 
A
V
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
C
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
S
F
 
F
H
 
H
R
 
Q
T
 
T
Q
 
L
A
 
A
P
 
P
V
 
E
A
 
A
Q
 
Y
A
 
L
F
 
Y
A
 
G
L
 
L
P
 
P
-
 
W
R
x
E
W
 
Y
I
 
F
T
 
S
G
 
S
E
x
L
G
 
G
V
 
V
K
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
L
 
T
S
 
S
Y
 
H
E
 
R
Y
 
Y
I
 
V
A
 
S
R
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
Y
V
 
E
L
 
L
P
 
L
D
 
D
Y
 
L
S
 
D
P
 
E
R
 
K
A
 
D
N
 
S
G
 
G
R
 
-
V
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
H
|
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
|
G
A
 
A
S
 
S
M
 
I
C
 
C
G
 
A
M
 
V
V
 
R
D
 
N
R
 
G
K
 
Q
S
 
S
Q
 
V
V
 
D
S
 
T
T
 
S
M
 
M
G
 
G
F
 
M
T
 
T
A
 
P
V
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
M
M
 
M
G
 
G
T
|
T
R
|
R
T
 
S
G
 
G
A
 
D
L
 
V
D
 
D
P
 
F
G
 
G
V
 
A
M
 
M
L
 
A
Y
 
W
L
 
I
M
 
A
E
 
K
N
 
E
K
 
T
G
 
G
M
 
Q
D
 
T
V
 
L
K
 
S
A
 
D
L
 
L
T
 
E
K
 
R
L
 
V
L
 
V
Y
 
N
K
|
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
I
S
 
S
G
 
G
I
 
L
S
 
S
P
 
S
D
|
D
M
x
L
R
|
R
T
 
V
L
 
L
L
 
E
A
 
K
S
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
E
D
 
G
K
 
H
P
 
E
E
 
R
A
 
A
K
 
R
E
 
L
A
 
A
V
 
I
D
 
K
L
 
T
F
 
F
C
 
V
Y
 
H
R
 
R
V
 
I
V
 
A
R
 
R
E
 
H
L
 
I
G
 
A
S
 
G
L
 
H
A
 
A
A
 
A
A
 
S
I
 
L
G
 
H
G
 
R
I
 
L
D
 
D
A
 
G
L
 
I
V
 
I
F
 
F
T
 
T
G
|
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
H
x
N
A
 
S
A
 
V
E
 
L
V
 
I
R
 
R
R
 
Q
R
 
L
V
 
V
C
 
I
L
 
E
Q
 
H
A
 
L
S
 
G
W
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
L
S
 
T
I
 
L
D
 
D
E
 
V
S
 
E
A
 
M
N
 
N
A
 
K
L
 
Q
-
 
P
-
 
N
-
 
S
H
 
H
A
 
G
N
 
E
R
 
R
-
 
I
I
 
I
S
 
S
E
 
A
P
 
N
R
 
P
S
 
S
T
 
Q
V
 
V
D
 
I
V
 
C
L
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
K
M
 
M
I
 
I
A
 
A

4fwrA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with cmp (see paper)
39% identity, 97% coverage: 5:388/397 of query aligns to 4:383/394 of 4fwrA

query
sites
4fwrA
V
 
V
L
 
L
T
 
V
L
 
I
N
|
N
A
 
C
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
I
 
I
K
 
K
F
 
F
S
 
S
L
 
V
Y
 
L
E
 
D
L
 
V
E
 
A
N
 
T
G
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
C
E
 
D
P
 
V
V
 
L
L
 
M
S
 
A
G
 
G
Q
 
I
I
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
M
G
 
N
V
 
T
K
 
E
-
 
N
A
 
A
H
 
F
I
 
L
K
 
S
A
 
I
K
 
N
D
 
G
D
 
D
K
 
K
G
 
P
K
 
I
K
 
N
L
 
L
D
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
P
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
A
E
 
H
S
 
S
Q
 
N
H
 
Y
H
 
E
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
K
F
 
A
L
 
I
I
 
A
S
 
F
W
 
E
L
 
L
H
 
E
D
 
K
H
 
R
E
 
D
K
 
L
G
 
T
W
 
D
K
 
S
I
 
V
V
 
A
A
 
L
V
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
V
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
x
L
Y
 
F
S
 
T
R
 
Q
P
 
S
M
 
V
K
 
I
L
 
I
D
 
T
D
 
D
N
x
E
I
 
I
I
 
I
E
 
D
H
x
N
L
 
I
T
 
R
R
 
R
L
 
V
I
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
Q
 
N
P
 
Y
H
 
A
N
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
G
V
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
A
R
 
R
T
 
H
M
 
L
M
 
F
P
 
P
E
 
A
V
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
C
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
S
F
 
F
H
 
H
R
 
Q
T
 
T
Q
 
L
A
 
A
P
 
P
V
 
E
A
 
A
Q
 
Y
A
 
L
F
 
Y
A
 
G
L
 
L
P
 
P
-
 
W
R
 
E
W
 
Y
I
 
F
T
 
S
G
 
S
E
 
L
G
 
G
V
 
V
K
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
L
 
T
S
 
S
Y
 
H
E
 
R
Y
 
Y
I
 
V
A
 
S
R
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
Y
V
 
E
L
 
L
P
 
L
D
 
D
Y
 
L
S
 
D
P
 
E
R
 
K
A
 
D
N
 
S
G
 
G
R
 
-
V
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
 
G
A
 
A
S
 
S
M
 
I
C
 
C
G
 
A
M
 
V
V
 
R
D
 
N
R
 
G
K
 
Q
S
 
S
Q
 
V
V
 
D
S
 
T
T
 
S
M
 
M
G
 
G
F
 
M
T
 
T
A
 
P
V
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
T
 
S
G
 
G
A
 
D
L
 
V
D
 
D
P
 
F
G
 
G
V
 
A
M
 
M
L
 
A
Y
 
W
L
 
I
M
 
A
E
 
K
N
 
E
K
 
T
G
 
G
M
 
Q
D
 
T
V
 
L
K
 
S
A
 
D
L
 
L
T
 
E
K
 
R
L
 
V
L
 
V
Y
 
N
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
I
S
 
S
G
 
G
I
 
L
S
 
S
P
 
S
D
|
D
M
x
L
R
|
R
T
 
V
L
 
L
L
 
E
A
 
K
S
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
E
D
 
G
K
 
H
P
 
E
E
 
R
A
 
A
K
 
R
E
 
L
A
 
A
V
 
I
D
 
K
L
 
T
F
 
F
C
 
V
Y
 
H
R
 
R
V
 
I
V
 
A
R
 
R
E
 
H
L
 
I
G
 
A
S
 
G
L
 
H
A
 
A
A
 
A
A
 
S
I
 
L
G
 
H
G
 
R
I
 
L
D
 
D
A
 
G
L
 
I
V
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
H
x
N
A
 
S
A
 
V
E
 
L
V
 
I
R
 
R
R
 
Q
R
 
L
V
 
V
C
 
I
L
 
E
Q
 
H
A
 
L
S
 
G
W
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
L
S
 
T
I
 
L
D
 
D
E
 
V
S
 
E
A
 
M
N
 
N
A
 
K
L
 
Q
-
 
P
-
 
N
-
 
S
H
 
H
A
 
G
N
 
E
R
 
R
-
 
I
I
 
I
S
 
S
E
 
A
P
 
N
R
 
P
S
 
S
T
 
Q
V
 
V
D
 
I
V
 
C
L
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
K
M
 
M
I
 
I
A
 
A

4fwqA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with gtp (see paper)
39% identity, 97% coverage: 5:388/397 of query aligns to 4:383/394 of 4fwqA

query
sites
4fwqA
V
 
V
L
 
L
T
 
V
L
 
I
N
|
N
A
 
C
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
I
 
I
K
 
K
F
 
F
S
 
S
L
 
V
Y
 
L
E
 
D
L
 
V
E
 
A
N
 
T
G
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
C
E
 
D
P
 
V
V
 
L
L
 
M
S
 
A
G
 
G
Q
 
I
I
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
M
G
 
N
V
 
T
K
 
E
-
 
N
A
 
A
H
 
F
I
 
L
K
 
S
A
 
I
K
 
N
D
 
G
D
 
D
K
 
K
G
 
P
K
 
I
K
 
N
L
 
L
D
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
P
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
A
E
 
H
S
 
S
Q
 
N
H
 
Y
H
 
E
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
K
F
 
A
L
 
I
I
 
A
S
 
F
W
 
E
L
 
L
H
 
E
D
 
K
H
 
R
E
 
D
K
 
L
G
 
T
W
 
D
K
 
S
I
 
V
V
 
A
A
 
L
V
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
V
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
L
Y
 
F
S
 
T
R
 
Q
P
 
S
M
 
V
K
 
I
L
 
I
D
 
T
D
 
D
N
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
D
H
 
N
L
 
I
T
 
R
R
 
R
L
 
V
I
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
Q
 
N
P
 
Y
H
 
A
N
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
G
V
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
A
R
 
R
T
 
H
M
 
L
M
 
F
P
 
P
E
 
A
V
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
C
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
S
F
 
F
H
 
H
R
 
Q
T
 
T
Q
 
L
A
 
A
P
 
P
V
 
E
A
 
A
Q
 
Y
A
 
L
F
 
Y
A
 
G
L
 
L
P
 
P
-
 
W
R
 
E
W
 
Y
I
 
F
T
 
S
G
 
S
E
 
L
G
 
G
V
 
V
K
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
L
 
T
S
 
S
Y
 
H
E
 
R
Y
 
Y
I
 
V
A
 
S
R
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
Y
V
 
E
L
 
L
P
 
L
D
 
D
Y
 
L
S
 
D
P
 
E
R
 
K
A
 
D
N
 
S
G
 
G
R
 
-
V
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
H
|
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
|
G
A
 
A
S
 
S
M
 
I
C
 
C
G
 
A
M
 
V
V
 
R
D
 
N
R
 
G
K
 
Q
S
 
S
Q
 
V
V
 
D
S
 
T
T
 
S
M
|
M
G
 
G
F
 
M
T
 
T
A
x
P
V
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
T
 
S
G
 
G
A
 
D
L
 
V
D
 
D
P
 
F
G
 
G
V
 
A
M
 
M
L
 
A
Y
 
W
L
 
I
M
 
A
E
 
K
N
 
E
K
 
T
G
 
G
M
 
Q
D
 
T
V
 
L
K
 
S
A
 
D
L
 
L
T
 
E
K
 
R
L
 
V
L
 
V
Y
 
N
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
I
S
 
S
G
 
G
I
 
L
S
 
S
P
 
S
D
|
D
M
x
L
R
|
R
T
 
V
L
 
L
L
x
E
A
 
K
S
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
E
D
 
G
K
 
H
P
 
E
E
 
R
A
 
A
K
 
R
E
 
L
A
 
A
V
 
I
D
 
K
L
 
T
F
 
F
C
 
V
Y
 
H
R
 
R
V
 
I
V
 
A
R
 
R
E
 
H
L
 
I
G
 
A
S
 
G
L
 
H
A
 
A
A
 
A
A
 
S
I
 
L
G
 
H
G
 
R
I
 
L
D
 
D
A
 
G
L
 
I
V
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
H
x
N
A
x
S
A
 
V
E
 
L
V
 
I
R
 
R
R
 
Q
R
 
L
V
 
V
C
 
I
L
 
E
Q
 
H
A
 
L
S
 
G
W
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
L
S
 
T
I
 
L
D
 
D
E
 
V
S
 
E
A
 
M
N
 
N
A
 
K
L
 
Q
-
 
P
-
 
N
-
 
S
H
 
H
A
 
G
N
 
E
R
 
R
-
 
I
I
 
I
S
 
S
E
 
A
P
 
N
R
 
P
S
 
S
T
 
Q
V
 
V
D
 
I
V
 
C
L
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
K
M
 
M
I
 
I
A
 
A

4fwpA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with gdp (see paper)
39% identity, 97% coverage: 5:388/397 of query aligns to 4:383/394 of 4fwpA

query
sites
4fwpA
V
 
V
L
 
L
T
 
V
L
 
I
N
|
N
A
 
C
G
 
G
S
|
S
S
 
S
S
 
S
I
 
I
K
 
K
F
 
F
S
 
S
L
 
V
Y
 
L
E
 
D
L
 
V
E
 
A
N
 
T
G
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
C
E
 
D
P
 
V
V
 
L
L
 
M
S
 
A
G
 
G
Q
 
I
I
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
M
G
 
N
V
 
T
K
 
E
-
 
N
A
 
A
H
 
F
I
 
L
K
 
S
A
 
I
K
 
N
D
 
G
D
 
D
K
 
K
G
 
P
K
 
I
K
 
N
L
 
L
D
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
P
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
A
E
 
H
S
 
S
Q
 
N
H
 
Y
H
 
E
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
K
F
 
A
L
 
I
I
 
A
S
 
F
W
 
E
L
 
L
H
 
E
D
 
K
H
 
R
E
 
D
K
 
L
G
 
T
W
 
D
K
 
S
I
 
V
V
 
A
A
 
L
V
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
V
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
L
Y
 
F
S
 
T
R
 
Q
P
 
S
M
 
V
K
 
I
L
 
I
D
 
T
D
 
D
N
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
D
H
 
N
L
 
I
T
 
R
R
 
R
L
 
V
I
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
|
H
Q
 
N
P
 
Y
H
 
A
N
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
G
V
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
A
R
 
R
T
 
H
M
 
L
M
 
F
P
 
P
E
 
A
V
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
C
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
S
F
 
F
H
 
H
R
 
Q
T
 
T
Q
 
L
A
 
A
P
 
P
V
 
E
A
 
A
Q
 
Y
A
 
L
F
 
Y
A
 
G
L
 
L
P
 
P
-
 
W
R
 
E
W
x
Y
I
 
F
T
 
S
G
x
S
E
 
L
G
 
G
V
 
V
K
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
L
 
T
S
 
S
Y
 
H
E
 
R
Y
 
Y
I
 
V
A
 
S
R
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
Y
V
 
E
L
 
L
P
 
L
D
 
D
Y
 
L
S
 
D
P
 
E
R
 
K
A
 
D
N
 
S
G
 
G
R
 
-
V
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
 
G
A
 
A
S
 
S
M
 
I
C
 
C
G
 
A
M
 
V
V
 
R
D
 
N
R
 
G
K
 
Q
S
 
S
Q
 
V
V
 
D
S
 
T
T
 
S
M
 
M
G
 
G
F
 
M
T
 
T
A
 
P
V
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
T
 
S
G
 
G
A
 
D
L
 
V
D
 
D
P
 
F
G
 
G
V
 
A
M
 
M
L
 
A
Y
 
W
L
 
I
M
 
A
E
 
K
N
 
E
K
 
T
G
 
G
M
 
Q
D
 
T
V
 
L
K
 
S
A
 
D
L
 
L
T
 
E
K
 
R
L
 
V
L
 
V
Y
 
N
K
|
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
I
S
 
S
G
 
G
I
 
L
S
 
S
P
 
S
D
|
D
M
x
L
R
|
R
T
 
V
L
 
L
L
x
E
A
 
K
S
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
E
D
 
G
K
 
H
P
 
E
E
 
R
A
 
A
K
 
R
E
 
L
A
 
A
V
 
I
D
 
K
L
 
T
F
 
F
C
 
V
Y
 
H
R
 
R
V
 
I
V
 
A
R
 
R
E
 
H
L
 
I
G
 
A
S
 
G
L
 
H
A
 
A
A
 
A
A
 
S
I
 
L
G
 
H
G
 
R
I
 
L
D
 
D
A
 
G
L
 
I
V
 
I
F
 
F
T
 
T
G
|
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
H
x
N
A
x
S
A
 
V
E
 
L
V
 
I
R
 
R
R
 
Q
R
 
L
V
 
V
C
 
I
L
 
E
Q
 
H
A
 
L
S
 
G
W
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
L
S
 
T
I
 
L
D
 
D
E
 
V
S
 
E
A
 
M
N
 
N
A
 
K
L
 
Q
-
 
P
-
 
N
-
 
S
H
 
H
A
 
G
N
 
E
R
 
R
-
 
I
I
 
I
S
 
S
E
 
A
P
 
N
R
 
P
S
 
S
T
 
Q
V
 
V
D
 
I
V
 
C
L
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
K
M
 
M
I
 
I
A
 
A

4fwoA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with gmp (see paper)
39% identity, 97% coverage: 5:388/397 of query aligns to 4:383/394 of 4fwoA

query
sites
4fwoA
V
 
V
L
 
L
T
 
V
L
 
I
N
|
N
A
 
C
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
I
 
I
K
 
K
F
 
F
S
 
S
L
 
V
Y
 
L
E
 
D
L
 
V
E
 
A
N
 
T
G
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
C
E
 
D
P
 
V
V
 
L
L
 
M
S
 
A
G
 
G
Q
 
I
I
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
M
G
 
N
V
 
T
K
 
E
-
 
N
A
 
A
H
 
F
I
 
L
K
 
S
A
 
I
K
 
N
D
 
G
D
 
D
K
 
K
G
 
P
K
 
I
K
 
N
L
 
L
D
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
P
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
A
E
 
H
S
 
S
Q
 
N
H
 
Y
H
 
E
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
K
F
 
A
L
 
I
I
 
A
S
 
F
W
 
E
L
 
L
H
 
E
D
 
K
H
 
R
E
 
D
K
 
L
G
 
T
W
 
D
K
 
S
I
 
V
V
 
A
A
 
L
V
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
V
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
x
L
Y
x
F
S
 
T
R
 
Q
P
 
S
M
 
V
K
 
I
L
 
I
D
 
T
D
 
D
N
x
E
I
 
I
I
 
I
E
 
D
H
x
N
L
 
I
T
 
R
R
 
R
L
 
V
I
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
Q
 
N
P
 
Y
H
 
A
N
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
G
V
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
A
R
 
R
T
 
H
M
 
L
M
 
F
P
 
P
E
 
A
V
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
C
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
S
F
 
F
H
 
H
R
 
Q
T
 
T
Q
 
L
A
 
A
P
 
P
V
 
E
A
 
A
Q
 
Y
A
 
L
F
 
Y
A
 
G
L
 
L
P
 
P
-
 
W
R
 
E
W
 
Y
I
 
F
T
 
S
G
 
S
E
 
L
G
 
G
V
 
V
K
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
L
 
T
S
 
S
Y
 
H
E
 
R
Y
 
Y
I
 
V
A
 
S
R
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
Y
V
 
E
L
 
L
P
 
L
D
 
D
Y
 
L
S
 
D
P
 
E
R
 
K
A
 
D
N
 
S
G
 
G
R
 
-
V
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
 
G
A
 
A
S
 
S
M
 
I
C
 
C
G
 
A
M
 
V
V
 
R
D
 
N
R
 
G
K
 
Q
S
 
S
Q
 
V
V
 
D
S
 
T
T
 
S
M
 
M
G
 
G
F
 
M
T
 
T
A
 
P
V
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
T
 
S
G
 
G
A
 
D
L
 
V
D
 
D
P
 
F
G
 
G
V
 
A
M
 
M
L
 
A
Y
 
W
L
 
I
M
 
A
E
 
K
N
 
E
K
 
T
G
 
G
M
 
Q
D
 
T
V
 
L
K
 
S
A
 
D
L
 
L
T
 
E
K
 
R
L
 
V
L
 
V
Y
 
N
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
I
S
 
S
G
 
G
I
 
L
S
 
S
P
 
S
D
|
D
M
x
L
R
|
R
T
 
V
L
 
L
L
x
E
A
 
K
S
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
E
D
 
G
K
 
H
P
 
E
E
 
R
A
 
A
K
 
R
E
 
L
A
 
A
V
 
I
D
 
K
L
 
T
F
 
F
C
 
V
Y
 
H
R
 
R
V
 
I
V
 
A
R
 
R
E
 
H
L
 
I
G
 
A
S
 
G
L
 
H
A
 
A
A
 
A
A
 
S
I
 
L
G
 
H
G
 
R
I
 
L
D
 
D
A
 
G
L
 
I
V
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
H
x
N
A
x
S
A
 
V
E
 
L
V
 
I
R
 
R
R
 
Q
R
 
L
V
 
V
C
 
I
L
 
E
Q
 
H
A
 
L
S
x
G
W
 
V
L
 
L
G
|
G
I
 
L
S
 
T
I
 
L
D
 
D
E
 
V
S
 
E
A
 
M
N
 
N
A
 
K
L
 
Q
-
 
P
-
 
N
-
 
S
H
 
H
A
 
G
N
 
E
R
 
R
-
 
I
I
 
I
S
 
S
E
 
A
P
 
N
R
 
P
S
 
S
T
x
Q
V
 
V
D
 
I
V
 
C
L
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
K
M
 
M
I
 
I
A
 
A

4fwnA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with adenosine tetraphosphate (ap4) (see paper)
39% identity, 97% coverage: 5:388/397 of query aligns to 4:383/394 of 4fwnA

query
sites
4fwnA
V
 
V
L
 
L
T
 
V
L
 
I
N
|
N
A
 
C
G
 
G
S
 
S
S