SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Dsui_3259 FitnessBrowser__PS:Dsui_3259 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8bcjB Crystal structure of short-chain dehydrogenase pa3128 from pseudomonas aeruginosa pao1 in complex with NADP+
62% identity, 100% coverage: 1:256/256 of query aligns to 3:250/250 of 8bcjB

query
sites
8bcjB
M
 
M
H
 
R
K
 
N
T
 
V
L
 
M
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
T
V
 
A
R
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
E
A
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
C
 
V
F
 
L
S
 
N
Y
 
Y
R
x
L
Q
x
R
D
x
N
A
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
Q
 
A
L
 
L
V
 
R
A
 
Q
E
 
R
V
 
I
T
 
E
R
 
R
E
 
Q
S
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
G
A
 
G
P
 
E
I
 
A
L
 
L
A
 
A
F
 
V
Q
 
A
A
|
A
D
|
D
I
x
V
S
 
A
R
 
E
E
 
E
E
 
G
E
 
D
I
 
V
R
 
E
A
 
R
L
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
S
A
 
I
E
 
D
Q
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
P
 
R
I
 
L
T
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
M
L
 
L
E
 
E
L
 
A
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
V
 
L
E
 
E
D
 
N
M
 
I
D
 
D
G
 
A
D
 
A
R
 
R
L
 
L
Q
 
H
R
 
R
I
 
V
F
 
F
A
 
A
T
|
T
N
 
N
V
 
V
I
 
T
G
 
G
T
 
S
F
 
F
L
 
L
C
 
C
C
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
V
R
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
S
T
 
T
R
 
R
H
 
H
G
 
G
G
 
G
H
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
L
x
V
S
 
S
S
|
S
R
 
M
A
 
A
A
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
S
A
 
P
G
 
N
E
 
E
Y
 
Y
V
 
I
D
 
D
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
D
T
 
S
L
 
M
T
 
T
L
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
R
P
|
P
G
|
G
L
 
L
I
|
I
D
 
D
T
|
T
D
 
E
I
|
I
H
|
H
A
 
A
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
R
 
R
V
 
I
E
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
K
T
 
G
G
 
G
I
 
I
P
 
P
M
 
L
Q
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
L
W
 
W
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
D
 
E
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
T
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
T
I
 
F
L
 
I
D
 
D
V
 
V
A
 
S
G
 
G
G
 
G
R
 
R

4iqgD Crystal structure of bpro0239 oxidoreductase from polaromonas sp. Js666 in NADP bound form
59% identity, 100% coverage: 1:256/256 of query aligns to 1:248/248 of 4iqgD

query
sites
4iqgD
M
 
L
H
 
S
K
 
K
T
 
V
L
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
S
V
 
A
R
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
C
 
A
F
 
V
S
x
N
Y
 
Y
R
x
A
Q
x
S
D
x
N
A
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
Q
 
E
L
 
V
V
 
V
A
 
R
E
 
Q
V
 
I
T
 
-
R
 
R
E
 
E
S
 
A
S
 
-
R
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
G
A
 
G
P
 
Q
I
 
A
L
 
L
A
 
A
F
 
V
Q
 
Q
A
|
A
D
|
D
I
x
V
S
 
A
R
 
K
E
 
E
E
 
R
E
 
E
I
 
V
R
 
L
A
 
A
L
 
M
F
 
F
A
 
E
A
 
T
A
 
V
E
 
D
Q
 
A
R
 
Q
F
 
L
G
 
G
P
 
R
I
 
L
T
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
V
L
 
V
E
 
D
L
 
Q
Q
 
T
T
 
T
R
 
R
V
 
V
E
 
D
D
 
G
M
 
I
D
 
T
G
 
L
D
 
E
R
 
R
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
I
 
M
F
 
F
A
 
E
T
 
I
N
|
N
V
 
V
I
 
F
G
 
G
T
 
S
F
 
F
L
 
L
C
 
C
C
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
V
R
 
K
R
 
R
L
 
M
S
 
S
T
 
T
R
 
R
H
 
Y
G
 
G
G
 
G
H
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
L
x
V
S
 
S
S
|
S
R
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
S
A
 
P
G
 
G
E
 
Q
Y
|
Y
V
 
V
D
 
D
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
D
T
 
T
L
 
F
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
R
P
|
P
G
|
G
L
 
I
I
|
I
D
 
E
T
|
T
D
 
D
I
|
I
H
|
H
A
 
A
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
L
P
 
P
G
 
N
R
 
R
V
 
A
E
 
R
R
 
D
L
 
V
R
 
A
T
 
P
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
G
 
A
G
 
G
T
 
T
P
 
A
E
 
R
E
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
E
A
 
A
I
 
I
L
 
V
W
 
W
L
 
L
L
 
L
S
 
G
E
 
D
D
 
Q
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
V
A
 
T
G
 
G
G
 
G
R
 
R

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
36% identity, 99% coverage: 3:255/256 of query aligns to 6:244/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
K
 
K
T
 
V
L
 
A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
D
T
 
I
V
 
A
R
 
I
L
 
N
A
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
E
G
 
G
Y
 
A
A
 
N
V
 
I
C
 
F
F
 
F
S
x
N
Y
|
Y
R
x
N
Q
x
G
D
x
S
A
 
P
A
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
Q
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
E
S
 
T
S
 
A
R
 
K
D
 
L
S
 
V
G
 
A
R
 
E
E
 
H
G
 
G
A
 
V
P
 
E
I
 
V
L
 
E
A
 
A
F
 
M
Q
 
K
A
 
A
D
x
N
I
x
V
S
 
A
R
 
I
E
 
A
E
 
E
E
 
D
I
 
V
R
 
D
A
 
A
L
 
F
F
 
F
A
 
K
A
 
Q
A
 
A
E
 
I
Q
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
P
 
R
I
 
V
T
 
D
A
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
L
 
T
-
 
R
-
 
D
E
 
N
L
 
L
Q
 
L
T
 
M
R
 
R
V
 
M
E
 
K
D
 
E
M
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
D
R
 
E
L
 
W
Q
 
D
R
 
D
I
 
V
F
 
I
A
 
N
T
x
I
N
 
N
V
 
L
I
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
C
 
T
R
 
K
E
 
A
A
 
V
V
 
S
R
 
R
R
 
T
L
 
M
S
 
M
T
 
K
R
 
Q
H
 
R
G
 
A
G
 
G
H
 
K
G
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
M
S
 
A
S
|
S
R
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
N
A
 
A
G
 
G
E
x
Q
Y
 
-
V
 
A
D
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
D
 
I
T
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
K
G
 
T
L
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
P
E
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
L
 
F
I
|
I
D
 
T
T
|
T
D
 
D
I
 
M
H
 
T
A
 
D
S
 
K
G
 
L
G
 
D
E
 
E
P
 
K
G
 
T
R
 
K
V
 
-
E
 
E
R
 
A
L
 
M
R
 
L
T
 
A
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
M
 
L
Q
 
G
R
 
A
G
 
Y
G
 
G
T
 
T
P
 
T
E
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
N
A
 
A
I
 
V
L
 
L
W
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
D
 
A
A
 
S
S
 
K
Y
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
I
 
T
L
 
L
D
 
S
V
 
V
A
 
D
G
 
G
G
 
G

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
34% identity, 100% coverage: 1:255/256 of query aligns to 3:243/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
M
 
M
H
 
T
K
 
K
T
 
S
L
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
S
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
A
 
S
T
 
I
V
 
A
R
 
L
L
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
E
A
 
E
G
 
G
Y
 
Y
A
 
N
V
 
V
C
 
A
F
 
V
S
 
N
Y
 
Y
R
 
A
Q
 
G
D
 
S
A
 
K
A
 
E
A
 
K
A
 
A
Q
 
E
Q
 
A
L
 
V
V
 
V
A
 
E
E
 
E
V
 
I
T
 
K
R
 
A
E
 
K
S
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
G
A
 
V
P
 
D
I
 
S
L
 
F
A
 
A
F
 
I
Q
 
Q
A
 
A
D
 
N
I
 
V
S
 
A
R
 
D
E
 
A
E
 
D
E
 
E
I
 
V
R
 
K
A
 
A
L
 
M
F
 
I
A
 
K
A
 
E
A
 
V
E
 
V
Q
 
S
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
P
 
S
I
 
L
T
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
-
 
R
-
 
D
E
 
N
L
 
L
Q
 
L
T
 
M
R
 
R
V
 
M
E
 
K
D
 
E
M
 
Q
D
 
E
G
 
W
D
 
D
R
 
D
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
I
 
V
F
 
I
A
 
D
T
 
T
N
 
N
V
 
L
I
 
K
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
C
C
 
I
R
 
Q
E
 
K
A
 
A
V
 
T
R
 
P
R
 
Q
L
 
M
S
 
L
T
 
R
R
 
Q
H
 
R
G
 
S
G
 
G
H
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
L
S
 
S
S
|
S
R
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
A
L
 
V
G
 
G
A
 
N
A
 
P
G
 
G
E
x
Q
Y
 
-
V
 
A
D
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
D
 
I
T
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
K
G
 
S
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
S
E
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
F
I
 
I
D
 
V
T
 
S
D
 
D
I
 
M
H
 
T
A
 
D
S
 
A
G
 
L
G
 
S
E
 
D
P
 
E
G
 
L
R
 
K
V
 
-
E
 
E
R
 
Q
L
 
M
R
 
L
T
 
T
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
M
 
L
Q
 
A
R
 
R
G
 
F
G
 
G
T
 
Q
P
 
D
E
 
T
E
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
N
A
 
T
I
 
V
L
 
A
W
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
D
 
K
A
 
A
S
 
K
Y
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
I
 
T
L
 
I
D
 
H
V
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

4cqmF Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD and NADP (see paper)
37% identity, 100% coverage: 1:255/256 of query aligns to 5:236/241 of 4cqmF

query
sites
4cqmF
M
 
M
H
 
D
K
 
K
T
 
V
L
 
C
L
 
A
I
 
V
T
 
F
G
|
G
G
 
G
S
 
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
T
 
V
V
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
M
A
 
A
R
 
R
A
 
K
G
 
G
Y
 
Y
-
 
R
-
 
L
A
 
A
V
 
V
C
 
I
F
x
A
S
x
R
Y
x
N
R
 
L
Q
 
E
D
 
G
A
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
-
S
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
-
S
 
A
G
 
G
R
 
D
E
 
L
G
 
G
A
 
G
P
 
D
I
 
H
L
 
L
A
 
A
F
 
F
Q
 
S
A
 
C
D
|
D
I
x
V
S
 
A
R
 
K
E
 
E
E
 
H
E
 
D
I
 
V
R
 
Q
A
 
N
L
 
T
F
 
F
A
 
E
A
 
E
A
 
L
E
 
E
Q
 
K
R
 
H
F
 
L
G
 
G
P
 
R
I
 
V
T
 
N
A
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
I
 
I
-
 
N
-
 
R
-
 
D
-
 
G
L
 
L
E
 
L
L
 
V
Q
 
R
T
 
T
R
 
K
V
 
T
E
 
E
D
 
D
M
 
M
D
 
V
G
 
S
D
 
Q
R
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
I
 
-
F
 
L
A
 
H
T
 
T
N
 
N
V
 
L
I
 
L
G
 
G
T
 
S
F
 
M
L
 
L
C
 
T
C
 
C
R
 
K
E
 
A
A
 
A
V
 
M
R
 
R
R
 
T
L
 
M
S
 
I
T
 
Q
R
 
Q
H
 
Q
G
 
G
G
 
G
H
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
L
x
V
S
 
G
S
|
S
R
 
I
A
 
V
A
 
G
R
 
L
L
 
K
G
 
G
A
 
N
A
 
S
G
 
G
E
x
Q
Y
 
S
V
 
V
D
 
-
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
I
 
L
D
 
V
T
 
G
L
 
F
T
 
S
L
 
R
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
R
E
 
K
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
F
I
x
V
D
 
H
T
|
T
D
 
D
I
x
M
H
 
T
A
 
K
S
 
D
G
 
L
G
 
K
E
 
E
P
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
E
R
 
H
L
 
L
R
 
K
T
 
K
G
 
N
I
 
I
P
 
P
M
 
L
Q
 
G
R
 
R
G
 
F
G
 
G
T
 
E
P
 
T
E
 
I
E
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
H
A
 
A
I
 
V
L
 
V
W
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
-
E
 
-
D
 
E
A
 
S
S
 
P
Y
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
H
I
 
V
L
 
L
D
 
V
V
 
V
A
 
D
G
 
G
G
 
G

Q8N4T8 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase beta subunit; KAR beta subunit; Carbonyl reductase family member 4; CBR4; Quinone reductase CBR4; Short chain dehydrogenase/reductase family 45C member 1; EC 1.1.1.100; EC 1.6.5.10 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
37% identity, 100% coverage: 1:255/256 of query aligns to 1:232/237 of Q8N4T8

query
sites
Q8N4T8
M
 
M
H
 
D
K
 
K
T
 
V
L
 
C
L
 
A
I
 
V
T
 
F
G
|
G
G
 
G
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
T
 
V
V
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
M
A
 
A
R
 
R
A
 
K
G
 
G
Y
 
Y
-
 
R
-
 
L
A
 
A
V
 
V
C
 
I
F
 
A
S
x
R
Y
x
N
R
 
L
Q
 
E
D
 
G
A
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
-
S
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
-
S
 
A
G
 
G
R
 
D
E
 
L
G
 
G
A
 
G
P
 
D
I
 
H
L
 
L
A
 
A
F
 
F
Q
 
S
A
 
C
D
|
D
I
 
V
S
 
A
R
 
K
E
 
E
E
 
H
E
 
D
I
 
V
R
 
Q
A
 
N
L
 
T
F
 
F
A
 
E
A
 
E
A
x
L
E
 
E
Q
 
K
R
 
H
F
 
L
G
 
G
P
 
R
I
 
V
T
 
N
A
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
I
 
I
-
 
N
-
 
R
-
 
D
-
 
G
L
 
L
E
 
L
L
 
V
Q
 
R
T
 
T
R
 
K
V
 
T
E
 
E
D
 
D
M
 
M
D
 
V
G
 
S
D
 
Q
R
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
I
 
-
F
 
L
A
 
H
T
 
T
N
 
N
V
 
L
I
 
L
G
 
G
T
 
S
F
 
M
L
 
L
C
 
T
C
 
C
R
 
K
E
 
A
A
 
A
V
 
M
R
 
R
R
 
T
L
 
M
S
 
I
T
 
Q
R
 
Q
H
 
Q
G
 
G
G
 
G
H
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
V
S
 
G
S
|
S
R
 
I
A
 
V
A
 
G
R
 
L
L
 
K
G
 
G
A
 
N
A
 
S
G
 
G
E
 
Q
Y
 
S
V
 
V
D
 
-
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
I
 
L
D
 
V
T
 
G
L
 
F
T
 
S
L
 
R
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
x
R
E
x
K
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
F
I
x
V
D
x
H
T
|
T
D
 
D
I
 
M
H
 
T
A
 
K
S
 
D
G
 
L
G
 
K
E
 
E
P
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
E
R
 
H
L
 
L
R
 
K
T
 
K
G
 
N
I
 
I
P
 
P
M
 
L
Q
 
G
R
 
R
G
 
F
G
 
G
T
 
E
P
 
T
E
 
I
E
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
H
A
 
A
I
 
V
L
 
V
W
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
-
E
 
-
D
 
E
A
 
S
S
 
P
Y
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
H
I
 
V
L
 
L
D
 
V
V
 
V
A
 
D
G
 
G
G
 
G

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
37% identity, 98% coverage: 6:255/256 of query aligns to 10:243/247 of P73574

query
sites
P73574
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
x
A
S
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
K
A
 
A
T
 
T
V
 
A
R
 
L
L
 
A
A
 
L
A
 
A
R
 
A
A
 
T
G
 
G
Y
 
M
A
 
K
V
 
V
C
 
V
F
 
V
S
 
N
Y
 
Y
R
 
A
Q
 
Q
D
 
S
A
 
S
A
 
T
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
Q
 
A
L
 
V
V
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
I
T
 
I
R
 
A
E
 
N
S
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
G
A
 
G
P
 
E
I
 
A
L
 
I
A
 
A
F
 
V
Q
 
Q
A
 
A
D
 
N
I
 
V
S
 
A
R
 
N
E
 
A
E
 
D
E
 
E
I
 
V
R
 
D
A
 
Q
L
 
L
F
 
I
A
 
K
A
 
T
A
 
T
E
 
L
Q
 
D
R
 
K
F
 
F
G
 
S
P
 
R
I
 
I
T
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
-
 
T
-
 
R
-
 
D
-
 
T
L
 
L
E
 
L
L
 
L
Q
 
R
T
 
M
R
 
K
V
 
L
E
 
E
D
 
D
M
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
W
Q
 
Q
R
 
A
I
 
V
F
 
I
A
 
D
T
 
L
N
 
N
V
 
L
I
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
C
 
T
R
 
K
E
 
-
A
 
A
V
 
V
R
 
S
R
 
K
L
 
L
S
 
M
T
 
L
R
 
K
H
 
Q
G
 
-
G
 
-
H
 
K
G
 
S
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
I
S
 
T
S
 
S
R
 
V
A
 
A
A
 
G
R
 
M
L
 
M
G
 
G
A
 
N
A
x
P
G
 
G
E
 
Q
Y
 
-
V
 
A
D
 
N
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
D
 
I
T
 
G
L
 
F
T
 
T
L
 
K
G
 
T
L
 
V
A
 
A
R
 
K
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
S
E
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
L
x
F
I
 
I
D
 
A
T
 
T
D
 
D
I
 
M
H
 
T
A
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
E
P
 
N
G
 
L
R
x
N
V
 
A
E
 
E
R
 
P
L
 
I
R
 
L
T
 
Q
G
 
F
I
 
I
P
 
P
M
 
L
Q
 
A
R
 
R
G
 
Y
G
 
G
T
 
Q
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
G
A
 
T
I
 
I
L
 
R
W
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
T
E
 
D
D
 
P
-
 
A
A
 
A
S
 
A
Y
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
I
 
T
L
 
F
D
 
N
V
 
V
A
 
D
G
 
G
G
 
G

1vl8B Crystal structure of gluconate 5-dehydrogenase (tm0441) from thermotoga maritima at 2.07 a resolution
33% identity, 98% coverage: 6:255/256 of query aligns to 10:248/252 of 1vl8B

query
sites
1vl8B
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
S
 
S
R
|
R
G
|
G
I
x
L
G
 
G
A
 
F
A
 
G
T
 
I
V
 
A
R
 
Q
L
 
G
A
 
L
A
 
A
R
 
E
A
 
A
G
 
G
Y
 
C
A
 
S
V
 
V
C
 
V
F
 
V
S
 
A
Y
x
S
R
|
R
-
 
N
-
 
L
Q
 
E
D
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
E
A
 
A
Q
 
A
Q
 
Q
L
 
K
V
 
L
A
 
T
E
 
E
V
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
-
S
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
K
E
 
Y
G
 
G
A
 
V
P
 
E
I
 
T
L
 
M
A
 
A
F
 
F
Q
 
R
A
x
C
D
|
D
I
x
V
S
 
S
R
 
N
E
 
Y
E
 
E
E
 
E
I
 
V
R
 
K
A
 
K
L
 
L
F
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
K
Q
 
E
R
 
K
F
 
F
G
 
G
P
 
K
I
 
L
T
 
D
A
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
-
E
 
N
L
 
R
Q
 
R
T
 
H
R
 
P
V
 
A
E
 
E
D
 
E
M
 
F
D
 
P
G
 
L
D
 
D
R
 
E
L
 
F
Q
 
R
R
 
Q
I
 
V
F
 
I
A
 
E
T
x
V
N
 
N
V
 
L
I
 
F
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
L
 
Y
C
 
V
C
 
C
R
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
F
S
 
S
T
 
L
R
 
L
H
 
R
G
 
E
G
 
S
H
 
D
G
 
N
G
 
P
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
I
S
 
G
S
|
S
R
 
L
A
 
T
A
 
V
R
 
E
L
 
E
G
 
V
A
 
T
A
 
M
G
 
P
E
 
N
Y
x
I
V
 
S
D
 
A
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
I
 
V
D
 
A
T
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
K
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
V
 
W
A
 
G
A
 
R
E
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
W
I
x
Y
D
 
R
T
|
T
D
 
K
I
x
M
-
x
T
H
 
E
A
 
A
S
 
V
G
 
F
G
 
S
E
 
D
P
 
P
G
 
E
R
 
K
V
 
L
E
 
D
R
 
Y
L
 
M
R
 
L
T
 
K
G
 
R
I
 
I
P
 
P
M
 
L
Q
 
G
R
 
R
G
 
T
G
 
G
T
 
V
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
L
A
 
K
K
 
G
A
 
V
I
 
A
L
 
V
W
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
E
D
 
E
A
 
A
S
 
K
Y
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
I
 
I
L
 
I
D
 
F
V
 
V
A
 
D
G
 
G
G
 
G

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
34% identity, 99% coverage: 3:255/256 of query aligns to 2:236/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
K
 
K
T
 
S
L
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
S
T
 
I
V
 
A
R
 
L
L
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
E
A
 
E
G
 
G
Y
 
Y
A
 
N
V
 
V
C
 
A
F
 
V
S
x
N
Y
|
Y
R
x
A
Q
x
G
D
x
S
A
 
K
A
 
E
A
 
K
A
 
A
Q
 
E
Q
 
A
L
 
V
V
 
V
A
 
E
E
 
E
V
 
I
T
 
K
R
 
A
E
 
K
S
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
G
A
 
V
P
 
D
I
 
S
L
 
F
A
 
A
F
 
I
Q
 
Q
A
|
A
D
x
N
I
x
V
S
 
A
R
 
D
E
 
A
E
 
D
E
 
E
I
 
V
R
 
K
A
 
A
L
 
M
F
 
I
A
 
K
A
 
E
A
 
V
E
 
V
Q
 
S
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
P
 
S
I
 
L
T
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
-
 
R
-
 
D
E
 
N
L
 
L
Q
 
L
T
 
M
R
 
R
V
 
M
E
 
K
D
 
E
M
 
Q
D
 
E
G
 
W
D
 
D
R
 
D
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
I
 
V
F
 
I
A
 
D
T
|
T
N
 
N
V
 
L
I
 
K
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
C
C
 
I
R
 
Q
E
 
K
A
 
A
V
 
T
R
 
P
R
 
Q
L
 
M
S
 
L
T
 
R
R
 
Q
H
 
R
G
 
S
G
 
G
H
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
L
S
 
S
S
|
S
R
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
A
L
 
V
G
 
G
A
 
N
A
 
P
G
 
G
E
x
Q
Y
 
-
V
 
A
D
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
D
 
I
T
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
K
G
 
S
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
S
E
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
F
I
 
I
D
 
V
T
 
S
D
 
D
I
 
M
H
 
T
A
 
D
S
 
E
G
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
L
V
 
K
E
 
E
R
 
Q
L
 
M
R
 
L
T
 
T
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
M
 
L
Q
 
A
R
 
R
G
 
F
G
 
G
T
 
Q
P
 
D
E
 
T
E
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
N
A
 
T
I
 
V
L
 
A
W
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
D
 
K
A
 
A
S
 
K
Y
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
I
 
T
L
 
I
D
 
H
V
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
36% identity, 99% coverage: 3:255/256 of query aligns to 9:244/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
K
 
K
T
 
T
L
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
 
A
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
F
A
 
G
T
 
I
V
 
A
R
 
Q
L
 
V
A
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
E
G
 
G
Y
 
A
A
 
R
V
 
V
C
 
I
F
 
I
S
 
A
Y
x
D
R
|
R
Q
 
D
-
 
A
-
 
H
-
 
G
D
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
S
Q
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
L
R
 
R
E
 
E
S
 
S
S
 
-
R
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
G
A
 
A
P
 
Q
I
 
A
L
 
L
A
 
F
F
 
I
Q
 
S
A
x
C
D
 
N
I
|
I
S
 
A
R
 
E
E
 
K
E
 
T
E
 
Q
I
 
V
R
 
E
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
S
A
 
Q
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
R
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
T
 
D
A
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
L
 
N
E
 
R
-
 
D
-
 
A
L
 
M
Q
 
L
T
 
H
R
 
K
V
 
L
E
 
T
D
 
E
M
 
A
D
 
D
G
 
W
D
 
D
R
 
T
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
I
 
V
F
 
I
A
 
D
T
x
V
N
 
N
V
 
L
I
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
C
 
M
R
 
Q
E
 
Q
A
 
A
V
 
A
R
 
I
R
 
R
L
 
M
S
 
R
T
 
E
R
 
R
H
 
G
G
 
A
G
 
G
H
 
R
G
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
I
S
 
A
S
 
S
R
 
-
A
 
A
A
 
S
R
 
W
L
 
L
G
 
G
A
 
N
A
 
V
G
 
G
E
 
Q
Y
 
-
V
 
T
D
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
D
 
V
T
 
G
L
 
M
T
 
T
L
 
K
G
 
T
L
 
A
A
 
C
R
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
C
P
 
P
G
 
G
L
 
F
I
|
I
D
 
D
T
|
T
D
 
D
I
 
M
H
 
-
A
 
-
S
x
T
G
 
R
G
 
G
E
 
V
P
 
P
G
 
E
R
 
N
V
 
V
E
 
W
R
 
Q
L
 
I
R
 
M
-
 
V
T
 
S
G
 
K
I
 
I
P
 
P
M
 
A
Q
 
G
R
 
Y
G
 
A
G
 
G
T
 
E
P
 
A
E
 
K
E
 
D
V
 
V
A
 
G
K
 
E
A
 
C
I
 
V
L
 
A
W
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
D
 
G
A
 
A
S
 
R
Y
 
Y
T
 
I
T
 
N
G
 
G
A
 
E
I
 
V
L
 
I
D
 
N
V
 
V
A
 
G
G
 
G
G
 
G

3ijrF 2.05 angstrom resolution crystal structure of a short chain dehydrogenase from bacillus anthracis str. 'Ames ancestor' in complex with NAD+
31% identity, 99% coverage: 3:255/256 of query aligns to 47:285/290 of 3ijrF

query
sites
3ijrF
K
 
K
T
 
N
L
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
S
x
D
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
T
 
V
V
 
S
R
 
I
L
 
A
A
 
F
A
 
A
R
 
K
A
 
E
G
 
G
Y
 
A
A
 
N
V
 
I
C
 
A
F
 
I
S
 
A
Y
|
Y
R
x
L
Q
 
D
D
x
E
A
 
E
A
 
G
A
 
D
A
 
A
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
N
E
 
E
S
 
T
S
 
K
R
 
Q
D
 
Y
S
 
V
G
 
E
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
V
P
 
K
I
 
C
L
 
V
A
 
L
F
 
L
Q
 
P
A
x
G
D
|
D
I
x
L
S
 
S
R
 
D
E
 
E
E
 
Q
E
 
H
I
 
C
R
 
K
A
 
D
L
 
I
F
 
V
A
 
Q
A
 
E
A
 
T
E
 
V
Q
 
R
R
 
Q
F
 
L
G
 
G
P
 
S
I
 
L
T
 
N
A
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
V
G
x
A
I
x
Q
L
 
Q
E
 
Y
L
 
P
Q
 
Q
T
 
Q
R
 
G
V
 
L
E
 
E
D
 
Y
M
 
I
D
 
T
G
 
A
D
 
E
R
 
Q
L
 
L
Q
 
E
R
 
K
I
 
T
F
 
F
A
 
R
T
x
I
N
 
N
V
 
I
I
 
F
G
 
S
T
 
Y
F
 
F
L
 
H
C
 
V
C
 
T
R
 
K
E
 
A
A
 
A
V
 
L
R
 
S
R
 
H
L
 
L
S
 
K
T
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
G
 
-
H
 
Q
G
 
G
G
 
D
A
 
V
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
T
S
 
A
S
|
S
R
 
I
A
 
V
A
 
A
R
 
Y
L
 
E
G
 
G
A
 
N
A
 
E
G
 
-
E
 
T
Y
x
L
V
 
I
D
 
D
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
V
T
 
A
L
 
F
T
 
T
L
 
R
G
 
S
L
 
L
A
 
S
R
 
Q
E
 
S
V
 
L
A
 
V
A
 
Q
E
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
L
x
P
I
|
I
D
 
W
T
|
T
D
 
P
I
x
L
H
 
I
A
 
P
S
 
S
G
 
S
G
 
F
E
 
D
P
 
E
G
x
K
R
 
K
V
 
V
E
 
S
R
 
Q
L
 
F
R
 
G
T
 
S
G
 
N
I
 
V
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
G
 
P
G
 
G
T
 
Q
P
 
P
E
 
Y
E
 
E
V
 
L
A
 
A
K
 
P
A
 
A
I
 
Y
L
 
V
W
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
S
D
 
D
A
 
S
S
 
S
Y
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
I
 
M
L
 
I
D
 
H
V
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3i3oA 2.06 angstrom resolution crystal structure of a short chain dehydrogenase from bacillus anthracis str. 'Ames ancestor' in complex with NAD-acetone
31% identity, 99% coverage: 3:255/256 of query aligns to 39:277/282 of 3i3oA

query
sites
3i3oA
K
 
K
T
 
N
L
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
S
x
D
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
T
 
V
V
 
S
R
 
I
L
 
A
A
 
F
A
 
A
R
 
K
A
 
E
G
 
G
Y
 
A
A
 
N
V
 
I
C
 
A
F
 
I
S
 
A
Y
|
Y
R
x
L
Q
 
D
D
x
E
A
 
E
A
 
G
A
 
D
A
 
A
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
N
E
 
E
S
 
T
S
 
K
R
 
Q
D
 
Y
S
 
V
G
 
E
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
V
P
 
K
I
 
C
L
 
V
A
 
L
F
 
L
Q
 
P
A
x
G
D
|
D
I
x
L
S
 
S
R
 
D
E
 
E
E
 
Q
E
 
H
I
 
C
R
 
K
A
 
D
L
 
I
F
 
V
A
 
Q
A
 
E
A
 
T
E
 
V
Q
 
R
R
 
Q
F
 
L
G
 
G
P
 
S
I
 
L
T
 
N
A
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
V
G
x
A
I
x
Q
L
x
Q
E
 
Y
L
 
P
Q
 
Q
T
 
Q
R
 
G
V
 
L
E
 
E
D
 
Y
M
 
I
D
 
T
G
 
A
D
 
E
R
 
Q
L
 
L
Q
 
E
R
 
K
I
 
T
F
 
F
A
 
R
T
x
I
N
 
N
V
 
I
I
 
F
G
 
S
T
 
Y
F
 
F
L
 
H
C
 
V
C
 
T
R
 
K
E
 
A
A
 
A
V
 
L
R
 
S
R
 
H
L
 
L
S
 
K
T
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
G
 
-
H
 
Q
G
 
G
G
 
D
A
 
V
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
T
S
 
A
S
|
S
R
 
I
A
 
V
A
 
A
R
 
Y
L
 
E
G
 
G
A
 
N
A
 
E
G
 
-
E
 
T
Y
x
L
V
 
I
D
 
D
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
V
T
 
A
L
 
F
T
 
T
L
 
R
G
 
S
L
 
L
A
 
S
R
 
Q
E
 
S
V
 
L
A
 
V
A
 
Q
E
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
P
I
|
I
D
 
W
T
|
T
D
 
P
I
x
L
H
 
I
A
 
P
S
 
S
G
 
S
G
 
F
E
 
D
P
 
E
G
x
K
R
 
K
V
 
V
E
 
S
R
 
Q
L
 
F
R
 
G
T
 
S
G
 
N
I
 
V
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
G
 
P
G
 
G
T
 
Q
P
 
P
E
 
Y
E
 
E
V
 
L
A
 
A
K
 
P
A
 
A
I
 
Y
L
 
V
W
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
S
D
 
D
A
 
S
S
 
S
Y
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
I
 
M
L
 
I
D
 
H
V
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
33% identity, 99% coverage: 3:255/256 of query aligns to 8:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
K
 
K
T
 
V
L
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
 
A
R
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
E
T
 
A
V
 
A
R
 
R
L
 
V
A
 
F
A
 
M
R
 
K
A
 
E
G
 
G
Y
 
A
A
 
K
V
 
V
C
 
V
F
 
I
S
 
A
Y
x
D
R
x
F
Q
 
N
D
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
G
A
 
K
Q
 
E
Q
 
A
L
 
V
V
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
-
S
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
E
G
 
A
A
 
N
P
 
P
I
 
G
L
 
V
A
 
V
F
 
F
-
 
I
Q
 
R
A
x
V
D
|
D
I
x
V
S
 
S
R
 
D
E
 
R
E
 
E
E
 
S
I
 
V
R
 
H
A
 
R
L
 
L
F
 
V
A
 
E
A
 
N
A
 
V
E
 
A
Q
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
P
 
K
I
 
I
T
 
D
A
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
E
 
R
L
 
-
Q
x
D
T
 
S
R
 
M
V
 
L
E
 
S
D
x
K
M
 
M
D
 
T
G
 
V
D
 
D
R
 
Q
L
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
I
 
V
F
 
I
A
 
N
T
 
V
N
|
N
V
 
L
I
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
H
C
 
C
C
 
T
R
 
-
E
 
Q
A
 
A
V
 
V
R
 
L
R
 
P
L
 
Y
S
 
M
T
 
A
R
 
E
H
 
Q
G
 
G
G
 
K
H
 
-
G
 
-
G
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
T
S
 
S
S
|
S
R
 
V
A
 
T
A
 
G
R
 
T
L
 
Y
G
 
G
A
x
N
A
x
V
G
 
G
E
x
Q
Y
 
-
V
 
T
D
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
D
 
I
T
 
G
L
 
M
T
 
T
L
 
K
G
 
T
L
 
W
A
 
A
R
 
K
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
L
x
F
I
x
T
D
 
E
T
|
T
D
 
A
I
x
M
H
 
V
A
 
A
S
 
E
G
 
V
G
 
P
E
 
E
P
 
K
G
 
-
R
 
V
V
 
I
E
 
E
R
x
K
L
 
M
R
 
K
T
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
M
Q
 
G
R
 
R
G
 
L
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
N
A
 
A
I
 
Y
L
 
L
W
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
H
D
 
E
A
 
S
S
 
D
Y
 
Y
T
 
V
T
 
N
G
 
G
A
 
H
I
 
V
L
 
L
D
 
H
V
 
V
A
 
D
G
 
G
G
 
G

6d9yB Crystal structure of a short chain dehydrogenase/reductase sdr from burkholderia phymatum with partially occupied NAD
35% identity, 99% coverage: 3:256/256 of query aligns to 10:248/251 of 6d9yB

query
sites
6d9yB
K
 
R
T
 
V
L
 
V
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
S
 
A
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
T
 
V
V
 
A
R
 
Q
L
 
R
A
 
A
A
 
L
R
 
R
A
 
S
G
 
G
Y
 
A
A
 
A
V
 
V
C
 
-
F
 
-
S
 
-
Y
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
A
A
 
L
Q
 
W
Q
x
D
L
|
L
V
 
D
A
 
A
E
 
E
V
 
R
T
 
L
R
 
A
E
 
R
S
 
S
S
 
E
R
 
R
D
 
E
S
 
L
G
 
A
R
 
E
E
 
L
G
 
G
A
 
-
P
 
K
I
 
V
L
 
C
A
 
A
F
 
V
Q
 
T
A
x
V
D
|
D
I
x
Q
S
 
T
R
 
K
E
 
E
E
 
A
E
 
Q
I
 
I
R
 
E
A
 
A
L
 
A
F
 
V
A
 
G
A
 
K
A
 
T
E
 
L
Q
 
A
R
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
A
I
 
I
T
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
 
C
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
E
 
G
L
 
G
Q
 
N
T
 
G
R
 
T
V
 
T
E
 
W
D
 
E
M
 
L
D
 
E
G
 
P
D
 
D
R
 
V
L
 
W
Q
 
R
R
 
Q
I
 
V
F
 
I
A
 
D
T
 
V
N
 
N
V
 
L
I
 
I
G
 
G
T
 
P
F
 
Y
L
 
L
C
 
V
C
 
C
R
 
R
E
 
A
A
 
V
V
 
V
R
 
P
R
 
Q
L
 
M
S
 
L
T
 
K
R
 
Q
H
 
-
G
 
-
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
G
 
-
A
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
I
S
 
A
S
|
S
R
 
V
A
 
A
A
 
G
R
 
K
L
 
E
G
 
G
A
 
N
A
 
P
G
 
N
E
 
A
Y
 
S
V
 
-
D
 
H
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
L
D
 
I
T
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
K
G
 
S
L
 
L
A
 
G
R
 
K
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
T
E
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
T
P
|
P
G
x
A
L
x
A
I
x
A
D
 
K
T
|
T
D
 
E
I
 
I
H
 
F
A
 
D
S
 
S
G
 
M
G
 
K
E
 
Q
P
 
E
G
 
-
R
 
H
V
 
I
E
 
D
R
 
Y
L
 
M
R
 
L
T
 
S
G
 
K
I
 
I
P
 
P
M
 
M
Q
 
N
R
 
R
G
 
F
G
 
L
T
 
L
P
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
A
A
 
A
K
 
S
A
 
L
I
 
I
L
 
L
W
 
W
L
 
L
L
 
G
S
 
S
E
 
E
D
 
D
A
 
C
S
 
A
Y
 
F
T
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
S
I
 
V
L
 
F
D
 
D
V
 
L
A
 
S
G
 
G
G
 
G
R
 
R

5wuwA Serratia marcescens short-chain dehydrogenase/reductase f98l/f202l mutant (see paper)
36% identity, 99% coverage: 3:255/256 of query aligns to 6:242/245 of 5wuwA

query
sites
5wuwA
K
 
K
T
 
V
L
 
A
L
 
F
I
 
V
T
 
Q
G
|
G
G
 
G
S
 
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
I
V
 
V
R
 
K
L
 
R
A
 
L
A
 
A
R
 
S
A
 
E
G
 
G
Y
 
A
A
 
A
V
 
V
C
 
A
F
 
F
S
 
T
Y
|
Y
R
x
A
Q
x
A
D
 
S
A
 
A
A
 
D
A
 
R
A
 
A
Q
 
E
Q
 
A
L
 
V
V
 
A
A
 
S
E
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
T
E
 
A
S
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
G
A
 
G
P
 
K
I
 
V
L
 
L
A
 
A
F
 
I
Q
 
K
A
 
A
D
|
D
I
x
S
S
 
A
R
 
D
E
 
A
E
 
A
E
 
A
I
 
L
R
 
Q
A
 
Q
L
 
A
F
 
V
A
 
R
A
 
Q
A
 
A
E
 
V
Q
 
S
R
 
H
F
 
F
G
 
G
P
 
N
I
 
L
T
 
D
A
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
V
L
 
L
E
 
T
L
 
L
Q
 
G
T
 
G
R
 
-
V
 
T
E
 
E
D
 
E
M
 
L
D
 
A
G
 
L
D
 
D
R
 
D
L
 
L
Q
 
D
R
 
R
I
 
M
F
 
L
A
 
A
T
 
V
N
 
N
V
 
V
I
 
R
G
 
S
T
 
V
F
 
F
L
 
V
C
 
A
C
 
S
R
 
Q
E
 
E
A
 
A
V
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
-
S
 
-
T
 
A
R
 
R
H
 
H
G
 
M
G
 
N
H
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
H
L
 
I
-
 
G
S
|
S
S
 
T
R
 
N
A
 
A
A
 
E
R
 
R
L
 
V
G
 
P
A
 
F
A
 
G
G
 
G
E
 
A
Y
 
A
V
 
V
D
 
-
Y
|
Y
A
 
A
A
 
M
S
 
S
K
|
K
A
 
S
A
 
A
I
x
L
D
 
V
T
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
K
G
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
D
V
 
L
A
 
G
A
 
P
E
 
R
G
 
S
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
N
V
 
V
A
 
Q
P
 
P
G
|
G
L
x
P
I
x
V
D
 
D
T
 
T
D
 
E
I
 
M
H
 
N
A
 
P
S
 
D
G
 
A
G
 
G
E
 
E
P
 
-
G
 
-
R
 
L
V
 
A
E
 
D
R
 
Q
L
 
L
R
 
K
T
 
Q
G
 
L
I
 
M
P
 
A
M
 
I
Q
 
G
R
 
R
G
 
Y
G
 
G
T
 
K
P
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
K
 
G
A
 
F
I
 
V
L
 
A
W
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
G
E
 
P
D
 
Q
A
 
A
S
 
G
Y
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
S
L
 
L
D
 
S
V
 
I
A
 
D
G
 
G
G
 
G

1edoA The x-ray structure of beta-keto acyl carrier protein reductase from brassica napus complexed with NADP+ (see paper)
34% identity, 98% coverage: 5:255/256 of query aligns to 4:241/244 of 1edoA

query
sites
1edoA
L
 
V
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
K
A
 
A
T
 
I
V
 
A
R
 
L
L
 
S
A
 
L
A
 
G
R
 
K
A
 
A
G
 
G
Y
 
C
A
 
K
V
 
V
C
 
L
F
 
V
S
x
N
Y
|
Y
R
x
A
Q
x
R
D
x
S
A
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
Q
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
E
S
 
V
S
 
S
R
 
K
D
 
Q
S
 
I
G
 
E
R
 
A
E
 
Y
G
 
G
A
 
G
P
 
Q
I
 
A
L
 
I
A
 
T
F
 
F
Q
 
G
A
 
G
D
|
D
I
x
V
S
 
S
R
 
K
E
 
E
E
 
A
E
 
D
I
 
V
R
 
E
A
 
A
L
 
M
F
 
M
A
 
K
A
 
T
A
 
A
E
 
I
Q
 
D
R
 
A
F
 
W
G
 
G
P
 
T
I
 
I
T
 
D
A
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
E
 
R
L
 
-
Q
 
D
T
 
T
R
 
L
V
 
L
E
 
I
D
 
R
M
 
M
D
 
K
G
 
K
D
 
S
R
 
Q
L
 
W
Q
 
D
R
 
E
I
 
V
F
 
I
A
 
D
T
 
L
N
 
N
V
 
L
I
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
C
 
T
R
 
Q
E
 
A
A
 
A
V
 
T
R
 
K
R
 
I
L
 
M
S
 
M
T
 
K
R
 
K
H
 
R
G
 
K
G
 
G
H
 
R
G
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
I
S
 
A
S
|
S
R
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
N
A
 
I
G
 
G
E
 
Q
Y
 
-
V
 
A
D
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
D
 
I
T
 
G
L
 
F
T
 
S
L
 
K
G
 
T
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
G
A
 
A
A
 
S
E
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
L
 
F
I
|
I
D
 
A
T
x
S
D
 
D
I
x
M
H
 
T
A
 
A
S
 
K
G
 
L
G
 
G
E
 
E
P
 
D
G
 
M
R
 
E
V
 
K
E
 
K
R
 
I
L
 
L
R
 
G
T
 
T
G
 
-
I
 
I
P
 
P
M
 
L
Q
 
G
R
 
R
G
 
T
G
 
G
T
 
Q
P
 
P
E
 
E
E
 
N
V
 
V
A
 
A
K
 
G
A
 
L
I
 
V
L
 
E
W
 
F
L
 
L
-
 
A
L
 
L
S
 
S
E
 
P
D
 
A
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
I
 
A
L
 
F
D
 
T
V
 
I
A
 
D
G
 
G
G
 
G

7v0hG Crystal structure of putative glucose 1-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia in complex with NADP and a potential reaction product
33% identity, 99% coverage: 3:255/256 of query aligns to 12:251/253 of 7v0hG

query
sites
7v0hG
K
 
K
T
 
V
L
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
R
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
I
V
 
A
R
 
K
L
 
A
A
 
L
A
 
A
R
 
D
A
 
E
G
 
G
Y
 
A
A
 
A
V
 
V
C
 
V
F
 
V
S
 
N
Y
 
Y
R
x
A
Q
x
S
D
x
S
A
 
K
A
 
A
A
 
G
A
 
A
Q
 
D
Q
 
A
L
 
V
V
 
V
A
 
S
E
 
A
V
 
I
T
 
T
R
 
E
E
 
A
S
 
G
S
 
G
R
 
R
D
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
A
L
 
V
A
 
A
F
 
V
Q
 
G
A
x
G
D
|
D
I
x
V
S
 
S
R
 
K
E
 
A
E
 
A
E
 
D
I
 
A
R
 
Q
A
 
R
L
 
I
F
 
V
A
 
D
A
 
T
A
 
A
E
 
I
Q
 
E
R
 
T
F
 
Y
G
 
G
P
 
R
I
 
L
T
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
S
G
|
G
I
 
V
L
x
Y
E
 
E
L
 
F
Q
 
-
T
 
A
R
 
P
V
 
I
E
 
E
D
 
A
M
 
I
D
 
T
G
 
E
D
 
E
R
 
H
L
 
Y
Q
 
R
R
 
R
I
 
Q
F
 
F
A
 
D
T
 
T
N
 
N
V
 
V
I
 
F
G
 
G
T
 
V
F
 
L
L
 
L
C
 
T
C
 
T
R
 
Q
E
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
K
R
 
H
L
 
L
S
 
-
T
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
G
 
G
H
 
E
G
 
G
G
 
A
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
I
S
 
S
S
|
S
R
 
V
A
 
V
A
 
T
R
 
S
L
 
I
G
 
T
A
 
P
A
 
P
G
 
A
E
 
S
Y
 
A
V
 
V
D
 
-
Y
|
Y
A
 
S
A
 
G
S
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
I
 
V
D
 
D
T
 
A
L
 
I
T
 
T
L
 
G
G
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
L
E
 
E
V
 
L
A
 
G
A
 
P
E
 
R
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
N
P
|
P
G
|
G
L
x
M
I
|
I
D
 
V
T
|
T
D
 
E
-
x
G
I
x
T
H
 
H
A
 
S
S
 
A
G
 
G
G
x
I
E
 
I
P
 
G
G
 
S
R
 
D
V
 
L
E
 
E
R
 
A
L
 
Q
R
 
V
T
 
L
G
 
G
-
 
Q
I
 
T
P
 
P
M
 
L
Q
 
G
R
 
R
G
 
L
G
 
G
T
 
E
P
 
P
E
 
N
E
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
S
A
 
V
I
 
A
L
 
V
W
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
D
 
D
A
 
A
S
 
R
Y
 
W
T
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
E
I
 
H
L
 
L
D
 
V
V
 
V
A
 
S
G
 
G
G
 
G

8jfgA Crystal structure of 3-oxoacyl-acp reductase fabg in complex with NADP+ and 3-keto-octanoyl-acp from helicobacter pylori (see paper)
33% identity, 99% coverage: 3:255/256 of query aligns to 7:245/248 of 8jfgA

query
sites
8jfgA
K
 
K
T
 
N
L
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
 
S
R
x
K
G
 
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
A
 
E
T
 
I
V
 
A
R
 
R
L
 
T
A
 
L
A
 
A
R
 
S
A
 
M
G
 
G
Y
 
L
A
 
K
V
 
V
C
 
W
F
 
I
S
 
N
Y
 
Y
R
|
R
Q
 
S
D
 
N
A
 
A
A
 
E
A
 
V
A
 
A
Q
 
D
Q
 
A
L
 
L
V
 
K
A
 
N
E
 
E
V
 
L
T
 
E
R
 
E
E
 
K
S
 
G
S
 
Y
R
 
K
D
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
A
P
 
A
I
 
V
L
 
I
A
 
K
F
 
F
Q
 
-
A
 
-
D
 
D
I
x
A
S
 
A
R
 
S
E
 
E
E
 
S
E
 
D
I
 
F
R
 
V
A
 
E
L
 
A
F
 
I
A
 
Q
A
 
A
A
 
I
E
 
V
Q
 
Q
R
 
S
F
 
D
G
 
G
P
 
G
I
 
L
T
 
S
A
 
Y
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
V
L
 
V
E
 
R
L
x
D
Q
 
K
T
 
L
R
 
A
V
 
I
E
 
K
D
 
-
M
 
M
D
 
K
G
 
T
D
 
E
R
 
D
L
 
F
Q
 
H
R
 
H
I
 
V
F
 
I
A
 
D
T
 
N
N
 
N
V
 
L
I
 
T
G
 
S
T
 
A
F
 
F
L
 
I
C
 
G
C
 
C
R
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
L
R
 
K
R
 
V
L
 
M
S
 
S
T
 
K
R
 
-
H
 
-
G
 
-
G
 
S
H
 
R
G
 
F
G
 
G
A
 
S
I
 
V
V
 
V
N
 
N
L
 
I
S
x
A
S
|
S
R
 
I
A
x
I
A
 
G
R
 
E
L
 
R
G
 
G
A
 
N
A
x
M
G
|
G
E
x
Q
Y
 
-
V
 
T
D
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
I
 
M
D
 
I
T
 
A
L
 
M
T
 
S
L
 
K
G
 
S
L
 
F
A
 
A
R
 
Y
E
 
E
V
 
G
A
 
A
A
 
L
E
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
F
N
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
T
P
|
P
G
|
G
L
x
F
I
|
I
D
 
E
T
|
T
D
 
D
I
x
M
H
x
N
A
 
A
S
 
N
G
 
L
G
 
K
E
 
D
P
 
E
G
 
L
R
 
K
V
 
A
E
 
D
R
x
Y
L
 
V
R
 
K
T
 
N
G
 
-
I
 
I
P
 
P
M
 
L
Q
 
N
R
 
R
G
 
L
G
 
G
T
 
A
P
 
A
E
 
K
E
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
E
A
 
A
I
 
V
L
 
A
W
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
D
D
 
H
A
 
S
S
 
S
Y
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
I
 
T
L
 
L
D
 
K
V
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

4dmmB 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from synechococcus elongatus pcc 7942 in complex with NADP
37% identity, 98% coverage: 6:255/256 of query aligns to 9:236/240 of 4dmmB

query
sites
4dmmB
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
T
 
I
V
 
A
R
 
L
L
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
A
A
 
K
V
 
V
C
 
A
F
 
V
S
 
N
Y
 
Y
R
x
A
Q
x
S
D
x
S
A
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
Q
 
E
L
 
V
V
 
V
A
 
A
E
 
A
V
 
I
T
 
A
R
 
A
E
 
A
S
 
G
S
 
G
R
 
E
D
 
A
S
 
F
G
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
A
F
 
V
Q
 
K
A
|
A
D
|
D
I
x
V
S
 
S
R
 
Q
E
 
E
E
 
S
E
 
E
I
 
V
R
 
E
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
A
A
 
V
E
 
I
Q
 
E
R
 
R
F
 
W
G
 
G
P
 
R
I
 
L
T
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
E
 
R
L
 
-
Q
 
D
T
 
T
R
 
L
V
 
L
E
 
L
D
 
R
M
 
M
D
 
K
G
 
R
D
 
D
R
 
D
L
 
W
Q
 
Q
R
 
S
I
 
V
F
 
L
A
 
D
T
x
L
N
 
N
V
 
L
I
 
G
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
C
 
S
R
 
R
E
 
A
A
 
A
V
 
A
R
 
K
R
 
I
L
 
M
S
 
L
T
 
K
R
 
Q
H
 
R
G
 
S
G
 
G
H
 
R
G
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
I
S
 
A
S
|
S
R
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
E
L
 
M
G
 
G
A
 
N
A
 
P
G
 
G
E
x
Q
Y
 
-
V
 
A
D
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
D
 
I
T
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
K
G
 
T
L
 
V
A
 
A
R
 
K
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
S
E
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
F
I
|
I
D
 
A
T
|
T
D
 
D
I
x
M
H
 
T
A
 
S
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
L
R
 
L
T
 
E
G
 
V
I
 
I
P
 
P
M
 
L
Q
 
G
R
 
R
G
 
Y
G
 
G
T
 
E
P
 
A
E
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
G
A
 
V
I
 
V
L
 
R
W
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
A
E
 
D
D
 
P
-
 
A
A
 
A
S
 
A
Y
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
I
 
V
L
 
I
D
 
N
V
 
I
A
 
D
G
 
G
G
 
G

4cqlI Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD (see paper)
37% identity, 98% coverage: 6:255/256 of query aligns to 12:248/251 of 4cqlI

query
sites
4cqlI
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
S
 
G
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
-
 
R
A
 
A
A
 
V
T
 
S
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
G
R
 
E
-
 
G
A
 
A
G
 
T
Y
 
V
A
 
A
V
 
A
C
 
C
F
 
-
S
 
-
Y
 
-
R
x
D
Q
x
L
D
 
D
A
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
E
S
 
T
S
 
V
R
 
R
D
 
L
S
 
L
G
 
G
R
 
G
E
 
P
G
 
G
A
 
S
P
 
N
I
 
H
L
 
A
A
 
A
F
 
F
Q
 
Q
A
|
A
D
|
D
I
x
V
S
 
S
R
 
E
E
 
A
E
 
R
E
 
A
I
 
A
R
 
R
A
 
C
L
 
L
F
 
L
A
 
E
A
 
Q
A
 
V
E
 
Q
Q
 
A
R
 
C
F
 
F
G
 
S
-
 
R
P
 
P
I
 
P
T
 
S
A
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
S
N
x
C
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
E
 
Q
L
 
D
Q
 
E
T
 
F
R
 
L
V
 
L
E
 
H
D
 
-
M
 
M
D
 
S
G
 
E
D
 
D
R
 
D
L
 
W
Q
 
D
R
 
K
I
 
V
F
 
I
A
 
A
T
x
V
N
 
N
V
 
L
I
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
V
C
 
T
R
 
Q
E
 
A
A
 
A
V
 
A
R
 
Q
R
 
A
L
 
L
S
 
V
T
 
S
R
 
N
H
 
-
G
 
-
G
 
G
H
 
C
G
 
R
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
I
S
 
S
S
|
S
R
 
I
A
 
V
A
 
G
R
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
N
A
 
V
G
 
G
E
 
Q
Y
 
-
V
 
T
D
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
D
 
I
T
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
G
 
T
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
G
A
 
R
E
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
L
 
F
I
|
I
D
 
A
T
|
T
D
 
P
I
x
M
H
 
-
A
 
-
S
 
T
G
 
Q
G
 
K
E
 
V
P
 
P
G
 
Q
R
 
K
V
 
V
-
 
V
E
 
D
R
 
K
L
 
I
R
 
T
T
 
E
G
 
M
I
 
I
P
 
P
M
 
M
Q
 
G
R
 
H
G
 
L
G
 
G
T
 
D
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
V
A
 
A
K
 
D
A
 
V
I
 
V
L
 
A
W
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
E
D
 
D
A
 
S
S
 
G
Y
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
T
I
 
S
L
 
V
D
 
E
V
 
V
A
 
T
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>Dsui_3259 FitnessBrowser__PS:Dsui_3259
MHKTLLITGGSRGIGAATVRLAARAGYAVCFSYRQDAAAAQQLVAEVTRESSRDSGREGA
PILAFQADISREEEIRALFAAAEQRFGPITALVNNAGILELQTRVEDMDGDRLQRIFATN
VIGTFLCCREAVRRLSTRHGGHGGAIVNLSSRAARLGAAGEYVDYAASKAAIDTLTLGLA
REVAAEGIRVNAVAPGLIDTDIHASGGEPGRVERLRTGIPMQRGGTPEEVAKAILWLLSE
DASYTTGAILDVAGGR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory