SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Dsui_3414 FitnessBrowser__PS:Dsui_3414 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7qh2C Cryo-em structure of ldh-etfab complex from acetobacterium woodii (see paper)
30% identity, 43% coverage: 15:171/366 of query aligns to 64:220/467 of 7qh2C

query
sites
7qh2C
A
 
A
A
 
Y
S
 
E
A
 
H
G
 
N
A
 
I
P
 
P
L
 
V
L
 
V
L
x
V
R
 
R
G
|
G
G
x
S
G
|
G
S
x
T
K
 
-
D
x
G
F
x
L
Y
 
V
G
 
G
R
x
A
P
x
C
V
 
V
Q
 
P
-
 
L
-
 
F
-
 
G
G
 
G
D
 
I
I
 
M
L
 
L
D
 
E
T
 
T
R
 
T
S
 
L
H
 
M
R
 
N
G
 
N
V
 
I
V
 
L
A
 
E
Y
 
L
E
 
D
P
 
T
T
 
E
E
 
N
L
 
L
V
 
T
V
 
V
T
 
T
V
 
V
K
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
V
S
 
L
L
 
L
A
 
M
E
 
E
L
 
L
E
 
S
A
 
K
V
 
F
L
 
V
A
 
E
E
 
E
K
 
N
G
 
D
Q
 
L
Y
 
F
L
 
Y
A
 
-
C
 
-
E
 
-
P
 
P
P
 
P
H
 
D
F
x
P
G
|
G
-
x
E
P
 
K
D
 
S
A
|
A
T
|
T
V
 
I
G
 
A
G
|
G
M
x
N
V
 
I
A
x
S
A
x
T
G
 
N
L
x
A
S
x
G
G
 
G
P
 
M
R
 
R
R
 
A
A
 
V
Q
 
K
A
 
Y
G
 
G
A
 
V
V
 
T
R
 
R
D
 
D
F
 
Y
V
 
V
L
 
R
G
 
G
V
 
L
R
 
T
L
 
V
M
 
V
D
 
L
G
 
A
Q
 
N
G
 
G
Q
 
E
A
 
I
L
 
I
N
 
E
F
 
L
G
 
G
G
 
G
Q
 
K
V
 
I
M
 
V
K
 
K
N
 
N
V
 
S
A
 
S
G
 
G
Y
 
Y
D
 
S
V
 
L
P
 
K
R
 
D
L
 
L
L
 
V
A
 
I
G
 
G
S
 
S
L
x
E
G
|
G
Q
 
T
L
 
L
G
 
C
L
 
V
L
x
I
L
 
T
E
 
K
V
 
A
S
 
I
L
 
L
K
 
K
V
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
L
P
 
P

Sites not aligning to the query:

P9WIT1 Uncharacterized FAD-linked oxidoreductase Rv2280; EC 1.-.-.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
32% identity, 43% coverage: 15:170/366 of query aligns to 59:214/459 of P9WIT1

query
sites
P9WIT1
A
 
A
A
 
S
S
 
E
A
 
N
G
 
G
A
 
V
P
 
P
L
 
V
L
 
T
L
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
S
G
 
G
S
 
C
K
 
G
-
 
L
D
 
S
F
 
G
Y
 
A
G
 
A
R
 
R
P
 
P
V
 
V
Q
 
E
G
 
G
D
 
G
I
 
L
L
 
L
D
 
I
T
 
S
R
 
F
S
 
D
H
 
R
R
 
M
G
 
N
-
 
K
V
 
V
V
 
L
A
 
E
Y
 
V
E
 
D
P
 
T
T
 
A
E
 
N
L
 
Q
V
 
V
V
 
A
T
 
V
V
 
V
K
 
Q
A
 
P
G
 
G
T
 
V
S
 
A
L
 
L
A
 
T
E
 
D
L
 
L
E
 
D
A
 
A
V
 
A
L
 
T
A
 
A
E
 
D
K
 
T
G
 
G
Q
 
L
Y
 
R
L
 
Y
A
 
T
C
 
V
E
 
Y
P
 
P
P
 
G
H
 
E
F
 
L
G
 
S
P
 
-
D
 
-
A
 
S
T
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
G
M
 
N
V
 
V
A
 
G
A
 
T
G
 
N
L
 
A
S
 
G
G
 
G
P
 
M
R
 
R
R
 
A
A
 
V
Q
 
K
A
 
Y
G
 
G
A
 
V
V
 
A
R
 
R
D
 
H
F
 
N
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
L
R
 
Q
L
 
A
M
 
V
D
 
L
G
 
P
Q
 
T
G
 
G
Q
 
E
A
 
I
L
 
I
N
 
R
F
 
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
V
 
M
M
 
A
K
 
K
N
 
V
V
 
S
A
 
T
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
V
 
L
P
 
T
R
 
Q
L
 
L
L
 
I
A
 
I
G
 
G
S
 
S
L
 
E
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
L
L
 
V
L
 
T
E
 
E
V
 
V
S
 
I
L
 
V
K
 
K
V
 
L
L
 
H
P
 
P
R
 
R

Sites not aligning to the query:

8jdrA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxy-3-methyl- valeric acid (see paper)
31% identity, 39% coverage: 37:177/366 of query aligns to 82:221/456 of 8jdrA

query
sites
8jdrA
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
D
 
G
I
 
V
L
 
C
D
 
I
T
 
N
R
x
L
S
 
T
H
 
H
R
 
M
G
 
D
V
 
Q
V
 
I
A
 
T
Y
 
E
E
 
L
P
 
N
T
 
T
E
 
E
-
 
D
L
 
F
V
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
V
K
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
V
S
 
T
L
 
R
A
 
K
E
 
A
L
 
L
E
 
N
A
 
T
V
 
H
L
 
L
A
 
R
E
 
D
K
 
S
G
 
G
Q
 
L
Y
 
W
L
 
F
A
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
H
 
-
F
 
-
G
|
G
P
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
V
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
A
 
V
Q
 
R
A
 
Y
G
 
G
A
 
T
V
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
V
 
L
R
 
E
L
 
V
M
 
V
D
 
L
G
 
P
Q
 
D
G
 
G
Q
 
R
A
 
L
L
 
L
N
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
Q
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
V
 
L
P
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
A
 
V
G
 
G
S
 
S
L
x
E
G
|
G
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
x
I
L
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
R
 
A
P
 
P
V
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
A
T
 
T
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdqA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyisocaproic acid (see paper)
31% identity, 39% coverage: 37:177/366 of query aligns to 82:221/456 of 8jdqA

query
sites
8jdqA
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
D
 
G
I
 
V
L
 
C
D
 
I
T
 
N
R
x
L
S
 
T
H
 
H
R
 
M
G
 
D
V
 
Q
V
 
I
A
 
T
Y
 
E
E
 
L
P
 
N
T
 
T
E
 
E
-
 
D
L
 
F
V
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
V
K
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
V
S
 
T
L
 
R
A
 
K
E
 
A
L
 
L
E
 
N
A
 
T
V
 
H
L
 
L
A
 
R
E
 
D
K
 
S
G
 
G
Q
 
L
Y
 
W
L
 
F
A
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
H
 
-
F
 
-
G
|
G
P
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
V
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
A
 
V
Q
 
R
A
 
Y
G
 
G
A
 
T
V
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
V
 
L
R
 
E
L
 
V
M
 
V
D
 
L
G
 
P
Q
 
D
G
 
G
Q
 
R
A
 
L
L
 
L
N
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
Q
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
V
 
L
P
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
A
 
V
G
 
G
S
 
S
L
x
E
G
|
G
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
x
I
L
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
R
 
A
P
 
P
V
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
A
T
 
T
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdoA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyhexanoic acid (see paper)
31% identity, 39% coverage: 37:177/366 of query aligns to 82:221/456 of 8jdoA

query
sites
8jdoA
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
D
 
G
I
 
V
L
 
C
D
 
I
T
 
N
R
x
L
S
 
T
H
 
H
R
 
M
G
 
D
V
 
Q
V
 
I
A
 
T
Y
 
E
E
 
L
P
 
N
T
 
T
E
 
E
-
 
D
L
 
F
V
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
V
K
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
V
S
 
T
L
 
R
A
 
K
E
 
A
L
 
L
E
 
N
A
 
T
V
 
H
L
 
L
A
 
R
E
 
D
K
 
S
G
 
G
Q
 
L
Y
 
W
L
 
F
A
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
H
 
-
F
 
-
G
|
G
P
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
V
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
A
 
V
Q
 
R
A
 
Y
G
 
G
A
 
T
V
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
V
 
L
R
 
E
L
 
V
M
 
V
D
 
L
G
 
P
Q
 
D
G
 
G
Q
 
R
A
 
L
L
 
L
N
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
Q
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
V
 
L
P
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
A
 
V
G
 
G
S
 
S
L
x
E
G
|
G
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
x
I
L
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
R
 
A
P
 
P
V
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
A
T
 
T
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdnA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyvaleric acid (see paper)
31% identity, 39% coverage: 37:177/366 of query aligns to 82:221/456 of 8jdnA

query
sites
8jdnA
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
D
 
G
I
 
V
L
 
C
D
 
I
T
 
N
R
x
L
S
 
T
H
 
H
R
 
M
G
 
D
V
 
Q
V
 
I
A
 
T
Y
 
E
E
 
L
P
 
N
T
 
T
E
 
E
-
 
D
L
 
F
V
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
V
K
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
V
S
 
T
L
 
R
A
 
K
E
 
A
L
 
L
E
 
N
A
 
T
V
 
H
L
 
L
A
 
R
E
 
D
K
 
S
G
 
G
Q
 
L
Y
 
W
L
 
F
A
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
H
 
-
F
 
-
G
|
G
P
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
V
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
A
 
V
Q
 
R
A
 
Y
G
 
G
A
 
T
V
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
V
 
L
R
 
E
L
 
V
M
 
V
D
 
L
G
 
P
Q
 
D
G
 
G
Q
 
R
A
 
L
L
 
L
N
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
Q
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
V
 
L
P
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
A
 
V
G
 
G
S
 
S
L
x
E
G
|
G
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
x
I
L
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
R
 
A
P
 
P
V
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
A
T
 
T
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdgA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxybutanoic acid (see paper)
31% identity, 39% coverage: 37:177/366 of query aligns to 82:221/456 of 8jdgA

query
sites
8jdgA
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
D
 
G
I
 
V
L
 
C
D
 
I
T
 
N
R
x
L
S
 
T
H
 
H
R
 
M
G
 
D
V
 
Q
V
 
I
A
 
T
Y
 
E
E
 
L
P
 
N
T
 
T
E
 
E
-
 
D
L
 
F
V
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
V
K
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
V
S
 
T
L
 
R
A
 
K
E
 
A
L
 
L
E
 
N
A
 
T
V
 
H
L
 
L
A
 
R
E
 
D
K
 
S
G
 
G
Q
 
L
Y
 
W
L
 
F
A
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
H
 
-
F
 
-
G
|
G
P
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
V
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
A
 
V
Q
 
R
A
 
Y
G
 
G
A
 
T
V
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
V
 
L
R
 
E
L
 
V
M
 
V
D
 
L
G
 
P
Q
 
D
G
 
G
Q
 
R
A
 
L
L
 
L
N
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
Q
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
V
 
L
P
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
A
 
V
G
 
G
S
 
S
L
x
E
G
|
G
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
x
I
L
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
R
 
A
P
 
P
V
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
A
T
 
T
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdbA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyoctanoic acid (see paper)
31% identity, 39% coverage: 37:177/366 of query aligns to 82:221/456 of 8jdbA

query
sites
8jdbA
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
D
 
G
I
 
V
L
 
C
D
 
I
T
 
N
R
x
L
S
 
T
H
 
H
R
 
M
G
 
D
V
 
Q
V
 
I
A
 
T
Y
 
E
E
 
L
P
 
N
T
 
T
E
 
E
-
 
D
L
 
F
V
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
V
K
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
V
S
 
T
L
 
R
A
 
K
E
 
A
L
 
L
E
 
N
A
 
T
V
 
H
L
 
L
A
 
R
E
 
D
K
 
S
G
 
G
Q
 
L
Y
 
W
L
 
F
A
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
H
 
-
F
 
-
G
|
G
P
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
V
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
A
 
V
Q
 
R
A
 
Y
G
 
G
A
 
T
V
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
V
 
L
R
 
E
L
 
V
M
 
V
D
 
L
G
 
P
Q
 
D
G
 
G
Q
 
R
A
 
L
L
 
L
N
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
Q
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
V
 
L
P
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
A
 
V
G
 
G
S
 
S
L
x
E
G
|
G
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
x
I
L
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
R
 
A
P
 
P
V
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
A
T
 
T
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdzA Crystal structure of mldhd in complex with 2-keto-3-methylvaleric acid (see paper)
31% identity, 39% coverage: 37:177/366 of query aligns to 82:221/454 of 8jdzA

query
sites
8jdzA
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
D
 
G
I
 
V
L
 
C
D
 
I
T
 
N
R
x
L
S
 
T
H
 
H
R
 
M
G
 
D
V
 
Q
V
 
I
A
 
T
Y
 
E
E
 
L
P
 
N
T
 
T
E
 
E
-
 
D
L
 
F
V
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
V
K
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
V
S
 
T
L
 
R
A
 
K
E
 
A
L
 
L
E
 
N
A
 
T
V
 
H
L
 
L
A
 
R
E
 
D
K
 
S
G
 
G
Q
 
L
Y
 
W
L
 
F
A
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
H
 
-
F
 
-
G
|
G
P
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
V
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
A
 
V
Q
 
R
A
 
Y
G
 
G
A
 
T
V
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
V
 
L
R
 
E
L
 
V
M
 
V
D
 
L
G
 
P
Q
 
D
G
 
G
Q
 
R
A
 
L
L
 
L
N
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
Q
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
V
 
L
P
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
A
 
V
G
 
G
S
 
S
L
x
E
G
|
G
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
x
I
L
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
R
 
A
P
 
P
V
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
A
T
 
T
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdyA Crystal structure of mldhd in complex with 2-ketoisocaproic acid (see paper)
31% identity, 39% coverage: 37:177/366 of query aligns to 82:221/454 of 8jdyA

query
sites
8jdyA
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
D
 
G
I
 
V
L
 
C
D
 
I
T
 
N
R
x
L
S
 
T
H
 
H
R
 
M
G
 
D
V
 
Q
V
 
I
A
 
T
Y
 
E
E
 
L
P
 
N
T
 
T
E
 
E
-
 
D
L
 
F
V
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
V
K
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
V
S
 
T
L
 
R
A
 
K
E
 
A
L
 
L
E
 
N
A
 
T
V
 
H
L
 
L
A
 
R
E
 
D
K
 
S
G
 
G
Q
 
L
Y
 
W
L
 
F
A
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
H
 
-
F
 
-
G
|
G
P
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
V
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
A
 
V
Q
 
R
A
 
Y
G
 
G
A
 
T
V
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
V
 
L
R
 
E
L
 
V
M
 
V
D
 
L
G
 
P
Q
 
D
G
 
G
Q
 
R
A
 
L
L
 
L
N
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
Q
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
V
 
L
P
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
A
 
V
G
 
G
S
 
S
L
x
E
G
|
G
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
x
I
L
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
R
 
A
P
 
P
V
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
A
T
 
T
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdxA Crystal structure of mldhd in complex with 2-ketoisovaleric acid (see paper)
31% identity, 39% coverage: 37:177/366 of query aligns to 82:221/455 of 8jdxA

query
sites
8jdxA
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
D
 
G
I
 
V
L
 
C
D
 
I
T
 
N
R
x
L
S
 
T
H
 
H
R
 
M
G
 
D
V
 
Q
V
 
I
A
 
T
Y
 
E
E
 
L
P
 
N
T
 
T
E
 
E
-
 
D
L
 
F
V
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
V
K
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
V
S
 
T
L
 
R
A
 
K
E
 
A
L
 
L
E
 
N
A
 
T
V
 
H
L
 
L
A
 
R
E
 
D
K
 
S
G
 
G
Q
 
L
Y
 
W
L
 
F
A
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
H
 
-
F
 
-
G
|
G
P
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
V
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
A
 
V
Q
 
R
A
 
Y
G
 
G
A
 
T
V
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
V
 
L
R
 
E
L
 
V
M
 
V
D
 
L
G
 
P
Q
 
D
G
 
G
Q
 
R
A
 
L
L
 
L
N
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
Q
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
V
 
L
P
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
A
 
V
G
 
G
S
 
S
L
x
E
G
|
G
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
x
I
L
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
R
 
A
P
 
P
V
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
A
T
 
T
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdsA Crystal structure of mldhd in complex with pyruvate (see paper)
31% identity, 39% coverage: 37:177/366 of query aligns to 82:221/456 of 8jdsA

query
sites
8jdsA
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
D
 
G
I
 
V
L
 
C
D
 
I
T
 
N
R
x
L
S
 
T
H
 
H
R
 
M
G
 
D
V
 
Q
V
 
I
A
 
T
Y
 
E
E
 
L
P
 
N
T
 
T
E
 
E
-
 
D
L
 
F
V
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
V
K
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
V
S
 
T
L
 
R
A
 
K
E
 
A
L
 
L
E
 
N
A
 
T
V
 
H
L
 
L
A
 
R
E
 
D
K
 
S
G
 
G
Q
 
L
Y
 
W
L
 
F
A
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
H
 
-
F
 
-
G
|
G
P
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
V
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
A
 
V
Q
 
R
A
 
Y
G
 
G
A
 
T
V
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
V
 
L
R
 
E
L
 
V
M
 
V
D
 
L
G
 
P
Q
 
D
G
 
G
Q
 
R
A
 
L
L
 
L
N
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
Q
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
V
 
L
P
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
A
 
V
G
 
G
S
 
S
L
x
E
G
|
G
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
x
I
L
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
R
 
A
P
 
P
V
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
A
T
 
T
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdeA Crystal structure of mldhd in complex with d-lactate (see paper)
31% identity, 39% coverage: 37:177/366 of query aligns to 82:221/455 of 8jdeA

query
sites
8jdeA
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
D
 
G
I
 
V
L
 
C
D
 
I
T
 
N
R
x
L
S
 
T
H
 
H
R
 
M
G
 
D
V
 
Q
V
 
I
A
 
T
Y
 
E
E
 
L
P
 
N
T
 
T
E
 
E
-
 
D
L
 
F
V
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
V
K
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
V
S
 
T
L
 
R
A
 
K
E
 
A
L
 
L
E
 
N
A
 
T
V
 
H
L
 
L
A
 
R
E
 
D
K
 
S
G
 
G
Q
 
L
Y
 
W
L
 
F
A
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
H
 
-
F
 
-
G
|
G
P
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
V
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
A
 
V
Q
 
R
A
 
Y
G
 
G
A
 
T
V
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
V
 
L
R
 
E
L
 
V
M
 
V
D
 
L
G
 
P
Q
 
D
G
 
G
Q
 
R
A
 
L
L
 
L
N
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
Q
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
V
 
L
P
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
A
 
V
G
 
G
S
 
S
L
x
E
G
|
G
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
x
I
L
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
R
 
A
P
 
P
V
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
A
T
 
T
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8jduA Crystal structure of mldhd in complex with 2-ketovaleric acid (see paper)
31% identity, 39% coverage: 37:177/366 of query aligns to 82:221/455 of 8jduA

query
sites
8jduA
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
D
 
G
I
 
V
L
 
C
D
 
I
T
 
N
R
x
L
S
 
T
H
 
H
R
 
M
G
 
D
V
 
Q
V
 
I
A
 
T
Y
 
E
E
 
L
P
 
N
T
 
T
E
 
E
-
 
D
L
 
F
V
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
V
K
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
V
S
 
T
L
 
R
A
 
K
E
 
A
L
 
L
E
 
N
A
 
T
V
 
H
L
 
L
A
 
R
E
 
D
K
 
S
G
 
G
Q
 
L
Y
 
W
L
 
F
A
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
H
 
-
F
 
-
G
|
G
P
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
V
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
A
 
V
Q
 
R
A
 
Y
G
 
G
A
 
T
V
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
V
 
L
R
 
E
L
 
V
M
 
V
D
 
L
G
 
P
Q
 
D
G
 
G
Q
 
R
A
 
L
L
 
L
N
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
Q
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
V
 
L
P
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
A
 
V
G
 
G
S
 
S
L
x
E
G
|
G
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
x
I
L
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
R
 
A
P
 
P
V
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
A
T
 
T
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdtA Crystal structure of mldhd in complex with 2-ketobutanoic acid (see paper)
31% identity, 39% coverage: 37:177/366 of query aligns to 82:221/455 of 8jdtA

query
sites
8jdtA
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
D
 
G
I
 
V
L
 
C
D
 
I
T
 
N
R
x
L
S
 
T
H
 
H
R
 
M
G
 
D
V
 
Q
V
 
I
A
 
T
Y
 
E
E
 
L
P
 
N
T
 
T
E
 
E
-
 
D
L
 
F
V
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
V
K
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
V
S
 
T
L
 
R
A
 
K
E
 
A
L
 
L
E
 
N
A
 
T
V
 
H
L
 
L
A
 
R
E
 
D
K
 
S
G
 
G
Q
 
L
Y
 
W
L
 
F
A
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
H
 
-
F
 
-
G
|
G
P
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
V
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
A
 
V
Q
 
R
A
 
Y
G
 
G
A
 
T
V
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
V
 
L
R
 
E
L
 
V
M
 
V
D
 
L
G
 
P
Q
 
D
G
 
G
Q
 
R
A
 
L
L
 
L
N
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
Q
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
V
 
L
P
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
A
 
V
G
 
G
S
 
S
L
x
E
G
|
G
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
x
I
L
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
R
 
A
P
 
P
V
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
A
T
 
T
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdpA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyisovaleric acid (see paper)
31% identity, 39% coverage: 37:177/366 of query aligns to 82:221/455 of 8jdpA

query
sites
8jdpA
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
D
 
G
I
 
V
L
 
C
D
 
I
T
 
N
R
x
L
S
 
T
H
 
H
R
 
M
G
 
D
V
 
Q
V
 
I
A
 
T
Y
 
E
E
 
L
P
 
N
T
 
T
E
 
E
-
 
D
L
 
F
V
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
V
K
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
V
S
 
T
L
 
R
A
 
K
E
 
A
L
 
L
E
 
N
A
 
T
V
 
H
L
 
L
A
 
R
E
 
D
K
 
S
G
 
G
Q
 
L
Y
 
W
L
 
F
A
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
H
 
-
F
 
-
G
|
G
P
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
V
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
A
 
V
Q
 
R
A
 
Y
G
 
G
A
 
T
V
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
V
 
L
R
 
E
L
 
V
M
 
V
D
 
L
G
 
P
Q
 
D
G
 
G
Q
 
R
A
 
L
L
 
L
N
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
Q
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
V
 
L
P
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
A
 
V
G
 
G
S
 
S
L
x
E
G
|
G
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
x
I
L
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
R
 
A
P
 
P
V
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
A
T
 
T
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdvA Crystal structure of mldhd in complex with 2-ketohexanoic acid (see paper)
31% identity, 39% coverage: 37:177/366 of query aligns to 82:221/454 of 8jdvA

query
sites
8jdvA
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
D
 
G
I
 
V
L
 
C
D
 
I
T
 
N
R
x
L
S
 
T
H
 
H
R
 
M
G
 
D
V
 
Q
V
 
I
A
 
T
Y
 
E
E
 
L
P
 
N
T
 
T
E
 
E
-
 
D
L
 
F
V
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
V
K
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
V
S
 
T
L
 
R
A
 
K
E
 
A
L
 
L
E
 
N
A
 
T
V
 
H
L
 
L
A
 
R
E
 
D
K
 
S
G
 
G
Q
 
L
Y
 
W
L
 
F
A
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
H
 
-
F
 
-
G
|
G
P
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
V
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
A
 
V
Q
 
R
A
 
Y
G
 
G
A
 
T
V
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
V
 
L
R
 
E
L
 
V
M
 
V
D
 
L
G
 
P
Q
 
D
G
 
G
Q
 
R
A
 
L
L
 
L
N
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
Q
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
V
 
L
P
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
A
 
V
G
 
G
S
 
S
L
x
E
G
|
G
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
x
I
L
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
R
 
A
P
 
P
V
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
A
T
 
T
I
 
V

Sites not aligning to the query:

O00116 Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal; Alkyl-DHAP synthase; Aging-associated gene 5 protein; Alkylglycerone-phosphate synthase; EC 2.5.1.26 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
28% identity, 43% coverage: 14:171/366 of query aligns to 224:385/658 of O00116

query
sites
O00116
L
 
L
A
 
A
A
 
C
S
 
K
A
 
Y
G
 
N
A
 
L
P
 
C
L
 
I
L
 
I
L
 
P
R
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
T
K
 
S
D
 
V
F
 
S
Y
 
Y
G
 
G
R
 
L
P
 
M
V
 
C
Q
 
P
G
 
A
D
 
D
-
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
I
I
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
T
R
 
S
S
 
Q
H
 
M
R
 
N
G
 
R
V
 
I
V
 
L
A
 
W
Y
 
V
E
 
D
P
 
E
T
 
N
E
 
N
L
 
L
V
 
T
V
 
A
T
 
H
V
 
V
K
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
S
 
T
L
 
G
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
R
V
 
Q
L
 
L
A
 
K
E
 
E
K
 
S
G
 
G
Q
 
Y
Y
 
C
L
 
T
A
 
G
C
 
H
E
 
E
P
 
P
P
 
D
H
 
S
F
 
L
G
 
-
P
 
E
D
 
F
A
 
S
T
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
G
M
 
W
V
 
V
A
 
S
A
 
T
G
 
R
L
 
A
S
 
S
G
 
G
P
 
M
R
 
K
R
 
K
A
 
N
Q
 
I
A
 
Y
G
 
G
A
 
N
V
 
I
R
 
E
D
 
D
F
 
L
V
 
V
L
 
V
G
 
H
V
 
I
R
 
K
L
 
M
M
 
V
D
 
T
G
 
P
Q
 
R
G
 
G
Q
 
-
A
 
I
L
 
I
N
 
E
F
 
K
G
 
S
G
 
C
Q
 
Q
V
 
G
M
 
P
K
 
R
N
 
M
V
 
S
A
 
T
G
 
G
Y
 
P
D
 
D
V
 
I
P
 
H
R
 
H
L
 
F
L
 
I
A
 
M
G
 
G
S
 
S
L
 
E
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
V
L
 
I
L
 
T
E
 
E
V
 
A
S
 
T
L
 
I
K
 
K
V
 
I
L
 
R
P
 
P
R
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

5adzC Ether lipid-generating enzyme agps in complex with inhibitor 1a (see paper)
27% identity, 43% coverage: 14:171/366 of query aligns to 144:305/557 of 5adzC

query
sites
5adzC
L
 
L
A
 
A
A
 
C
S
 
K
A
 
Y
G
 
N
A
 
L
P
 
C
L
 
I
L
 
I
L
x
P
R
x
I
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
x
T
K
x
S
D
 
V
F
 
S
Y
 
Y
G
 
G
R
 
L
P
 
M
V
 
C
Q
 
P
G
 
A
D
 
D
-
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
I
I
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
T
R
 
S
S
 
Q
H
 
M
R
 
N
G
 
R
V
 
I
V
 
L
A
 
W
Y
 
V
E
 
D
P
 
E
T
 
N
E
 
N
L
 
L
V
 
T
V
 
A
T
 
H
V
 
V
K
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
S
 
T
L
 
G
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
R
V
 
Q
L
 
L
A
 
K
E
 
E
K
 
S
G
 
G
Q
 
Y
Y
 
C
L
 
T
A
 
G
C
 
H
E
 
E
P
|
P
P
x
D
H
x
S
F
 
L
G
 
-
P
 
E
D
 
F
A
x
S
T
|
T
V
 
V
G
 
G
G
|
G
M
x
W
V
 
I
A
x
S
A
x
T
G
 
R
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
M
R
 
K
R
 
K
A
 
N
Q
 
I
A
 
Y
G
 
G
A
 
N
V
 
I
R
 
E
D
 
D
F
 
L
V
 
V
L
 
V
G
 
H
V
 
M
R
 
K
L
 
V
M
 
V
D
 
T
G
 
P
Q
 
R
G
 
G
Q
 
-
A
 
V
L
 
I
N
 
E
F
 
K
G
 
S
G
 
C
Q
 
Q
V
 
G
M
 
P
K
 
R
N
 
M
V
 
S
A
 
T
G
 
G
Y
 
P
D
 
D
V
 
I
P
 
H
R
 
H
L
 
F
L
 
I
A
 
M
G
 
G
S
 
S
L
x
E
G
|
G
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
V
L
x
I
L
 
T
E
 
E
V
 
A
S
 
T
L
 
I
K
 
K
V
 
I
L
 
R
P
 
P
R
 
T
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4bc9A Mammalian alkyldihydroxyacetonephosphate synthase: wild-type, adduct with cyanoethyl (see paper)
27% identity, 43% coverage: 14:171/366 of query aligns to 135:296/555 of 4bc9A

query
sites
4bc9A
L
 
L
A
 
A
A
 
C
S
 
K
A
 
Y
G
 
N
A
 
L
P
 
C
L
 
I
L
 
I
L
x
P
R
x
I
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
x
T
K
x
S
D
x
V
F
 
S
Y
 
Y
G
|
G
R
x
L
P
 
M
V
 
C
Q
 
P
G
 
A
D
 
D
-
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
I
I
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
T
R
 
S
S
 
Q
H
 
M
R
 
N
G
 
R
V
 
I
V
 
L
A
 
W
Y
 
V
E
 
D
P
 
E
T
 
N
E
 
N
L
 
L
V
 
T
V
 
A
T
 
H
V
 
V
K
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
S
 
T
L
 
G
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
R
V
 
Q
L
 
L
A
 
K
E
 
E
K
 
S
G
 
G
Q
 
Y
Y
 
C
L
 
T
A
 
G
C
 
H
E
 
E
P
|
P
P
x
D
H
x
S
F
 
L
G
 
-
P
 
E
D
 
F
A
x
S
T
|
T
V
 
V
G
 
G
G
|
G
M
x
W
V
 
I
A
x
S
A
x
T
G
 
R
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
M
R
 
K
R
 
K
A
 
N
Q
 
I
A
 
Y
G
 
G
A
 
N
V
 
I
R
 
E
D
 
D
F
 
L
V
 
V
L
 
V
G
 
H
V
 
M
R
 
K
L
 
V
M
 
V
D
 
T
G
 
P
Q
 
R
G
 
G
Q
 
-
A
 
V
L
 
I
N
 
E
F
 
K
G
 
S
G
 
C
Q
 
Q
V
 
G
M
 
P
K
 
R
N
 
M
V
 
S
A
 
T
G
 
G
Y
 
P
D
 
D
V
 
I
P
 
H
R
 
H
L
 
F
L
 
I
A
 
M
G
 
G
S
 
S
L
x
E
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
L
x
V
L
x
I
L
 
T
E
 
E
V
 
A
S
 
T
L
 
I
K
 
K
V
 
I
L
 
R
P
 
P
R
 
T
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Dsui_3414 FitnessBrowser__PS:Dsui_3414
MSQVFEQQCRERILAASAGAPLLLRGGGSKDFYGRPVQGDILDTRSHRGVVAYEPTELVV
TVKAGTSLAELEAVLAEKGQYLACEPPHFGPDATVGGMVAAGLSGPRRAQAGAVRDFVLG
VRLMDGQGQALNFGGQVMKNVAGYDVPRLLAGSLGQLGLLLEVSLKVLPRPVAEATIRLE
TSQAKALALMNQWGGKPLPISATVWSDAGHPDGEAITVRLSGARAAVAAAQAALGGALVE
AGPASAFWAGVREQTHPFFTGAGGANESALWRLAVPSTAPQLDLPGRTLVEWGGAQRWLV
SDAEPRRIREAVEKAGGHATLFRGPAAARDQAFHPLASPLLDIHRRLKATFDPRGVFAAG
RLYEGL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory