SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Echvi_0069 Echvi_0069 Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6slbAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
38% identity, 93% coverage: 17:258/260 of query aligns to 16:254/257 of 6slbAAA

query
sites
6slbAAA
I
 
L
A
 
T
I
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
E
V
 
K
F
x
L
N
 
N
A
|
A
L
 
I
N
 
T
F
 
G
E
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
Y
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
K
Q
 
E
A
 
G
A
 
E
Q
 
E
A
 
D
E
 
R
T
 
E
V
 
V
R
 
R
C
 
A
V
 
L
V
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
G
G
x
R
A
 
A
F
 
F
C
 
S
S
x
A
G
|
G
Q
|
Q
D
|
D
L
|
L
K
 
T
A
 
E
V
x
F
G
 
G
T
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
D
G
 
R
I
 
K
P
 
P
F
 
D
K
x
Y
E
 
E
I
 
A
I
x
H
R
x
L
K
 
R
Y
 
R
Y
|
Y
N
|
N
P
 
R
L
 
V
I
 
V
I
 
E
Q
 
A
M
 
L
R
 
S
N
 
G
L
 
L
S
 
E
K
 
K
P
 
P
I
 
L
I
 
V
C
 
V
K
 
A
L
 
V
N
 
N
G
 
G
A
x
V
A
 
A
V
x
A
G
|
G
A
|
A
G
 
G
C
 
M
S
|
S
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
W
T
 
G
D
 
D
V
 
L
I
 
R
I
 
L
A
 
A
S
 
A
K
 
V
E
 
G
A
 
A
Y
 
S
L
 
F
A
 
T
E
 
T
M
x
A
F
|
F
A
 
V
H
 
R
I
|
I
G
 
G
L
|
L
V
 
V
M
x
P
D
|
D
A
 
S
G
 
G
S
 
L
N
 
S
Y
 
F
F
 
L
L
 
L
P
 
P
K
 
R
R
 
L
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
P
 
A
L
 
K
A
 
A
F
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
L
T
 
L
T
 
L
G
 
S
R
 
P
K
 
R
V
 
L
Y
 
S
A
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
L
R
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
H
K
 
R
A
 
V
I
 
V
E
 
P
H
 
A
S
 
E
A
 
K
L
 
L
D
 
M
E
 
E
T
 
E
V
 
A
A
 
L
Q
 
S
Y
 
L
V
 
A
E
 
K
V
 
E
Y
 
L
V
 
A
N
 
Q
A
 
G
S
 
P
G
 
T
S
 
R
A
 
A
I
 
Y
G
 
A
M
 
L
I
 
T
K
 
K
E
 
K
M
 
L
L
 
L
R
 
L
K
 
E
S
 
T
N
 
Y
G
 
R
M
 
L
S
 
S
L
 
L
E
 
T
E
 
E
V
 
A
L
 
L
E
x
A
M
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
Y
 
L
Q
 
Q
E
 
G
K
 
Q
A
 
A
G
|
G
S
 
Q
H
 
T
Q
 
Q
D
 
D
F
 
H
K
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
R
S
 
A
F
 
F
L
 
R
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
P
P
 
P
R
 
R
F
 
F

6slaAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
36% identity, 93% coverage: 17:258/260 of query aligns to 13:242/245 of 6slaAAA

query
sites
6slaAAA
I
 
L
A
 
T
I
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
E
V
x
K
F
x
L
N
 
N
A
|
A
L
 
I
N
 
T
F
 
G
E
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
Y
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
K
Q
 
E
A
 
G
A
 
E
Q
 
E
A
 
D
E
 
R
T
 
E
V
 
V
R
 
R
C
 
A
V
 
L
V
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
G
G
x
R
A
 
A
F
 
F
C
 
S
S
x
A
G
|
G
Q
|
Q
D
|
D
L
|
L
K
 
T
A
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
-
F
 
-
K
 
-
E
 
E
I
 
A
I
 
H
R
x
L
K
 
R
Y
 
R
Y
|
Y
N
|
N
P
 
R
L
 
V
I
 
V
I
 
E
Q
 
A
M
 
L
R
 
S
N
 
G
L
 
L
S
 
E
K
 
K
P
 
P
I
 
L
I
 
V
C
 
V
K
 
A
L
 
V
N
 
N
G
 
G
A
x
V
A
 
A
V
x
A
G
|
G
A
|
A
G
 
G
C
 
M
S
|
S
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
W
T
 
G
D
 
D
V
 
L
I
 
R
I
 
L
A
 
A
S
 
A
K
 
V
E
 
G
A
 
A
Y
 
S
L
 
F
A
 
T
E
 
T
M
x
A
F
|
F
A
 
V
H
 
R
I
|
I
G
 
G
L
|
L
V
 
V
M
x
P
D
x
N
A
 
S
G
 
G
S
 
L
N
 
S
Y
 
F
F
 
L
L
 
L
P
 
P
K
 
R
R
 
L
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
P
 
A
L
 
K
A
 
A
F
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
L
T
 
L
T
 
L
G
 
S
R
 
P
K
 
R
V
 
L
Y
 
S
A
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
L
R
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
H
K
 
R
A
 
V
I
 
V
E
 
P
H
 
A
S
 
E
A
 
K
L
 
L
D
 
M
E
 
E
T
 
E
V
 
A
A
 
L
Q
 
S
Y
 
L
V
 
A
E
 
K
V
 
E
Y
 
L
V
 
A
N
 
Q
A
 
G
S
 
P
G
 
T
S
 
R
A
 
A
I
 
Y
G
 
A
M
 
L
I
 
T
K
 
K
E
 
K
M
 
L
L
 
L
R
 
L
K
 
E
S
 
T
N
 
Y
G
 
R
M
 
L
S
 
S
L
 
L
E
 
T
E
 
E
V
 
A
L
 
L
E
x
A
M
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
Y
 
L
Q
 
Q
E
 
G
K
 
Q
A
 
A
G
|
G
S
 
Q
H
 
T
Q
 
Q
D
 
D
F
 
H
K
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
R
S
 
A
F
|
F
L
 
R
E
 
E
K
|
K
R
 
R
K
 
P
P
 
P
R
 
R
F
 
F

5zaiC Crystal structure of 3-hydroxypropionyl-coa dehydratase from metallosphaera sedula (see paper)
33% identity, 99% coverage: 1:258/260 of query aligns to 1:256/259 of 5zaiC

query
sites
5zaiC
M
 
M
D
 
E
Y
 
F
K
 
E
Y
 
T
I
 
I
R
 
E
S
 
T
S
 
K
V
 
K
N
 
E
N
 
G
H
 
N
C
 
L
Q
 
F
E
 
W
I
 
I
A
 
T
I
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
A
x
D
V
x
K
F
x
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
N
 
N
F
 
A
E
 
K
V
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
L
K
 
D
A
 
R
A
 
A
F
 
V
D
 
S
Q
 
Q
A
 
A
A
 
E
Q
 
S
A
 
D
E
 
P
T
 
E
V
 
I
R
 
R
C
 
V
V
 
I
V
 
I
L
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
K
G
 
G
G
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
S
x
A
G
|
G
Q
x
A
D
|
D
L
x
I
K
 
T
A
 
Q
V
x
F
G
 
N
-
 
Q
-
 
L
T
 
T
D
 
P
L
 
A
D
 
E
G
 
A
I
 
W
P
 
K
F
 
F
K
x
S
E
 
K
I
 
K
I
 
G
R
|
R
K
 
E
Y
 
I
Y
 
M
N
 
D
P
 
-
L
 
-
I
 
-
I
 
-
Q
 
K
M
 
I
R
 
E
N
 
A
L
 
L
S
 
S
K
 
K
P
 
P
I
 
T
I
 
I
C
 
A
K
 
M
L
 
I
N
 
N
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
V
x
L
G
|
G
A
x
G
G
 
G
C
 
L
S
x
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
C
D
 
D
V
 
I
I
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
A
K
 
E
E
 
E
A
 
A
Y
 
Q
L
 
L
A
 
G
E
 
L
M
x
P
F
x
E
A
 
I
H
 
N
I
 
L
G
 
G
L
x
I
V
 
Y
M
x
P
D
x
G
A
 
Y
G
 
G
S
 
G
N
 
T
Y
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
K
 
R
R
 
V
V
 
I
G
 
G
Y
 
K
P
 
G
L
 
R
A
 
A
F
 
L
E
 
E
L
 
M
A
 
M
T
 
M
T
 
T
G
 
G
R
 
D
K
x
R
V
 
I
Y
 
P
A
 
G
E
 
K
E
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
Y
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
K
 
R
A
 
V
I
 
V
E
 
P
H
 
L
S
 
A
A
 
N
L
 
L
D
 
E
E
 
Q
T
 
E
V
 
T
A
 
R
Q
 
K
Y
 
L
V
 
A
E
 
E
V
 
K
Y
 
I
V
 
A
N
 
K
A
 
K
S
 
S
G
 
P
S
 
I
A
 
S
I
 
L
G
 
A
M
 
L
I
 
I
K
 
K
E
 
E
M
 
V
L
 
V
R
 
N
K
 
R
S
 
G
N
 
L
G
 
D
M
 
S
S
 
P
L
 
L
E
 
L
E
 
S
V
 
G
L
 
L
E
x
A
M
 
L
E
 
E
A
 
S
V
 
V
Y
 
G
Q
 
W
E
 
G
K
 
V
A
 
V
G
x
F
S
 
S
H
 
T
Q
 
E
D
 
D
F
 
K
K
 
K
E
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
S
S
 
A
F
|
F
L
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
K
 
E
P
 
P
R
 
T
F
 
F

2hw5C The crystal structure of human enoyl-coenzyme a (coa) hydratase short chain 1, echs1
32% identity, 99% coverage: 2:258/260 of query aligns to 2:257/260 of 2hw5C

query
sites
2hw5C
D
 
N
Y
 
F
K
 
E
Y
 
Y
I
 
I
-
 
I
-
 
A
-
 
E
R
 
K
S
 
R
S
 
G
V
 
K
N
 
N
N
 
N
H
 
T
C
 
V
Q
 
G
E
 
L
I
 
I
A
 
Q
I
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
A
x
K
V
x
A
F
x
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
N
 
C
F
 
D
E
 
G
V
 
L
L
 
I
E
 
D
E
 
E
L
 
L
K
 
N
A
 
Q
A
 
A
F
 
L
D
 
K
Q
 
I
A
 
F
A
 
E
Q
 
E
A
 
D
E
 
P
T
 
A
V
 
V
R
 
G
C
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
D
G
x
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
S
x
A
G
 
G
Q
x
A
D
|
D
L
x
I
K
|
K
A
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
E
L
x
M
D
 
Q
G
 
N
I
 
L
P
 
S
F
 
F
K
 
Q
E
 
D
I
 
C
I
 
Y
R
x
S
K
 
S
Y
 
K
Y
 
F
N
x
L
P
 
K
L
 
H
I
 
W
I
 
D
Q
 
H
M
 
L
R
 
T
N
 
Q
L
 
V
S
 
K
K
 
K
P
 
P
I
 
V
I
 
I
C
 
A
K
 
A
L
 
V
N
 
N
G
 
G
A
x
Y
A
 
A
V
x
F
G
 
G
A
x
G
G
 
G
C
 
C
S
x
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
T
 
C
D
 
D
V
 
I
I
 
I
I
 
Y
A
 
A
S
 
G
K
 
E
E
 
K
A
 
A
Y
 
Q
L
 
F
A
 
A
E
 
Q
M
x
P
F
x
E
A
 
I
H
 
L
I
 
I
G
 
G
L
x
T
V
 
I
M
x
P
D
x
G
A
 
A
G
 
G
S
 
G
N
 
T
Y
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
K
 
R
R
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
K
P
 
S
L
 
L
A
 
A
F
 
M
E
 
E
L
 
M
A
 
V
T
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
D
K
 
R
V
 
I
Y
 
S
A
 
A
E
 
Q
E
 
D
A
 
A
E
 
K
R
 
Q
L
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
K
 
K
A
 
I
I
 
C
E
 
P
H
 
V
S
 
E
A
 
T
L
 
L
D
 
V
E
 
E
T
 
E
V
 
A
A
 
I
Q
 
Q
Y
 
C
V
 
A
E
 
E
V
 
K
Y
 
I
V
 
A
N
 
S
A
 
N
S
 
S
G
 
K
S
 
I
A
 
V
I
 
V
G
 
A
M
 
M
I
 
A
K
 
K
E
 
E
M
 
S
L
 
V
R
 
N
K
 
A
S
 
A
N
 
F
G
 
E
M
 
M
S
 
T
L
 
L
E
 
T
E
 
E
V
 
G
L
 
S
E
x
K
M
 
L
E
 
E
A
 
K
V
 
K
Y
 
L
Q
 
F
E
 
Y
K
 
S
A
 
T
G
x
F
S
 
A
H
 
T
Q
 
D
D
 
D
F
 
R
K
 
K
E
 
E
G
 
G
V
 
M
T
 
T
S
 
A
F
 
F
L
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
K
P
 
A
R
 
N
F
 
F

Q9P4U9 Enoyl-CoA hydratase AKT3-1; AF-toxin biosynthesis protein 3-1; EC 4.2.1.17 from Alternaria alternata (Alternaria rot fungus) (Torula alternata) (see paper)
33% identity, 93% coverage: 17:258/260 of query aligns to 28:268/296 of Q9P4U9

query
sites
Q9P4U9
I
 
I
A
 
V
I
 
L
D
 
A
R
 
R
P
 
S
A
 
Q
V
 
S
F
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
T
F
 
L
E
 
P
V
 
M
L
 
L
E
 
T
E
 
D
L
 
M
K
 
V
A
 
Q
A
 
L
F
 
L
D
 
S
Q
 
A
A
 
M
A
 
D
Q
 
A
A
 
D
E
 
D
T
 
S
V
 
V
R
 
K
C
 
C
V
 
I
V
 
V
L
 
F
T
 
T
G
 
G
G
 
E
G
 
G
G
 
P
A
 
F
F
 
F
C
 
C
S
 
S
G
 
G
Q
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
T
A
 
E
V
 
G
G
 
F
T
 
G
D
 
E
L
 
I
D
 
G
G
 
K
I
 
T
P
 
-
F
 
-
K
 
R
E
 
D
I
 
T
I
 
H
R
 
R
K
 
D
Y
 
A
Y
 
G
N
 
G
P
 
K
L
 
L
I
 
A
I
 
L
Q
 
A
M
 
I
R
 
H
N
 
N
L
 
C
S
 
R
K
 
K
P
 
P
I
 
T
I
 
I
C
 
A
K
 
A
L
 
I
N
 
N
G
 
G
A
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
V
G
 
G
C
 
I
S
 
T
L
 
M
A
 
T
L
 
L
A
 
P
T
 
M
D
 
S
V
 
I
I
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
A
K
 
K
E
 
T
A
 
A
Y
 
K
L
 
I
A
 
S
E
 
F
M
 
P
F
 
F
A
 
V
H
 
R
I
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
V
M
 
A
D
 
D
A
 
A
G
 
A
S
 
S
N
 
S
Y
 
F
F
 
Y
L
 
L
P
 
P
K
 
R
R
 
L
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
P
 
G
L
 
R
A
 
A
F
 
L
E
 
H
L
 
L
A
 
F
T
 
T
T
 
T
G
 
G
R
 
A
K
 
L
V
 
Y
Y
 
P
A
 
A
E
 
E
E
 
S
A
 
G
E
 
L
R
 
L
L
 
H
G
 
G
L
 
L
V
 
F
N
 
S
K
 
E
A
 
T
I
 
V
E
 
N
-
 
P
-
 
A
H
 
S
S
 
S
A
 
T
L
 
L
D
 
P
E
 
R
T
 
A
V
 
L
A
 
E
Q
 
V
Y
 
A
V
 
R
E
 
D
V
 
I
Y
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
S
G
 
Q
S
 
V
A
 
G
I
 
V
G
 
Y
M
 
L
I
 
T
K
 
R
E
 
D
M
 
L
L
 
V
-
 
Y
R
 
R
K
 
S
S
 
P
N
 
R
G
 
S
M
 
P
S
 
E
L
 
Q
E
 
A
E
 
H
V
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
S
E
 
A
A
 
A
V
 
L
Y
 
Y
Q
 
T
E
 
R
K
 
Y
A
 
-
G
 
-
S
 
Q
H
 
S
Q
 
R
D
 
D
F
 
F
K
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
K
S
 
S
F
 
F
L
 
L
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
K
P
 
P
R
 
R
F
 
F

Sites not aligning to the query:

P14604 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial; mECH; mECH1; Enoyl-CoA hydratase 1; ECHS1; Short-chain enoyl-CoA hydratase; SCEH; EC 4.2.1.17; EC 5.3.3.8 from Rattus norvegicus (Rat) (see 3 papers)
30% identity, 99% coverage: 2:258/260 of query aligns to 32:287/290 of P14604

query
sites
P14604
D
 
N
Y
 
F
K
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
-
 
I
-
 
T
-
 
E
R
 
K
S
 
K
S
 
G
V
 
K
N
 
N
N
 
S
H
 
S
C
 
V
Q
 
G
E
 
L
I
 
I
A
 
Q
I
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
K
V
 
A
F
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
C
F
 
N
E
 
G
V
 
L
L
 
I
E
 
E
E
 
E
L
 
L
K
 
N
A
 
Q
A
 
A
F
 
L
D
 
E
Q
 
T
A
 
F
A
 
E
Q
 
E
A
 
D
E
 
P
T
 
A
V
 
V
R
 
G
C
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
E
G
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
S
 
A
G
 
G
Q
 
A
D
 
D
L
 
I
K
 
K
A
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
E
L
 
M
D
 
Q
G
 
N
I
 
R
P
 
T
F
 
F
K
 
Q
E
 
D
I
 
C
I
 
Y
R
 
S
K
 
G
Y
 
K
Y
 
F
N
 
L
P
 
S
L
 
H
I
 
W
I
 
D
Q
 
H
M
 
I
R
 
T
N
 
R
L
 
I
S
 
K
K
 
K
P
 
P
I
 
V
I
 
I
C
 
A
K
 
A
L
 
V
N
 
N
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
V
 
L
G
 
G
A
 
G
G
 
G
C
 
C
S
x
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
T
 
C
D
 
D
V
 
I
I
 
I
I
 
Y
A
 
A
S
 
G
K
 
E
E
 
K
A
 
A
Y
 
Q
L
 
F
A
 
G
E
 
Q
M
 
P
F
x
E
A
 
I
H
 
L
I
 
L
G
 
G
L
 
T
V
 
I
M
 
P
D
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
G
N
 
T
Y
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
K
 
R
R
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
K
P
 
S
L
 
L
A
 
A
F
 
M
E
 
E
L
 
M
A
 
V
T
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
D
K
 
R
V
 
I
Y
 
S
A
 
A
E
 
Q
E
 
D
A
 
A
E
 
K
R
 
Q
L
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
K
 
K
A
 
I
I
 
F
E
 
P
H
 
V
S
 
E
A
 
T
L
 
L
D
 
V
E
 
E
T
 
E
V
 
A
A
 
I
Q
 
Q
Y
 
C
V
 
A
E
 
E
V
 
K
Y
 
I
V
 
A
N
 
N
A
 
N
S
 
S
G
 
K
S
 
I
A
 
I
I
 
V
G
 
A
M
 
M
I
 
A
K
 
K
E
 
E
M
 
S
L
 
V
R
 
N
K
 
A
S
 
A
N
 
F
G
 
E
M
 
M
S
 
T
L
 
L
E
 
T
E
 
E
V
 
G
L
 
N
E
 
K
M
 
L
E
 
E
A
 
K
V
 
K
Y
 
L
Q
 
F
E
 
Y
K
 
S
A
 
T
G
 
F
S
 
A
H
 
T
Q
 
D
D
 
D
F
 
R
K
 
R
E
 
E
G
 
G
V
 
M
T
 
S
S
 
A
F
 
F
L
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
K
P
 
A
R
 
N
F
 
F

Sites not aligning to the query:

1dubA 2-enoyl-coa hydratase, data collected at 100 k, ph 6.5 (see paper)
30% identity, 99% coverage: 2:258/260 of query aligns to 2:257/260 of 1dubA

query
sites
1dubA
D
 
N
Y
 
F
K
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
-
 
I
-
 
T
-
 
E
R
 
K
S
 
K
S
 
G
V
 
K
N
 
N
N
 
S
H
 
S
C
 
V
Q
 
G
E
 
L
I
 
I
A
 
Q
I
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
A
x
K
V
x
A
F
x
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
N
 
C
F
 
N
E
 
G
V
 
L
L
 
I
E
 
E
E
 
E
L
 
L
K
 
N
A
 
Q
A
 
A
F
 
L
D
 
E
Q
 
T
A
 
F
A
 
E
Q
 
E
A
 
D
E
 
P
T
 
A
V
 
V
R
 
G
C
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
E
G
x
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
S
x
A
G
|
G
Q
x
A
D
|
D
L
x
I
K
|
K
A
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
E
L
x
M
D
 
Q
G
 
N
I
 
R
P
 
T
F
 
F
K
 
Q
E
 
D
I
 
C
I
 
Y
R
x
S
K
 
G
Y
 
K
Y
 
F
N
x
L
P
 
S
L
 
H
I
 
W
I
 
D
Q
 
H
M
 
I
R
 
T
N
 
R
L
 
I
S
 
K
K
 
K
P
 
P
I
 
V
I
 
I
C
 
A
K
 
A
L
 
V
N
 
N
G
 
G
A
x
Y
A
 
A
V
x
L
G
|
G
A
x
G
G
 
G
C
 
C
S
x
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
T
 
C
D
 
D
V
 
I
I
 
I
I
 
Y
A
 
A
S
 
G
K
 
E
E
 
K
A
 
A
Y
 
Q
L
 
F
A
 
G
E
 
Q
M
x
P
F
x
E
A
 
I
H
 
L
I
x
L
G
 
G
L
x
T
V
 
I
M
x
P
D
x
G
A
 
A
G
 
G
S
 
G
N
 
T
Y
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
K
 
R
R
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
K
P
 
S
L
 
L
A
 
A
F
 
M
E
 
E
L
 
M
A
 
V
T
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
D
K
 
R
V
 
I
Y
 
S
A
 
A
E
 
Q
E
 
D
A
 
A
E
 
K
R
 
Q
L
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
K
 
K
A
 
I
I
 
F
E
 
P
H
 
V
S
 
E
A
 
T
L
 
L
D
 
V
E
 
E
T
 
E
V
 
A
A
 
I
Q
 
Q
Y
 
C
V
 
A
E
 
E
V
 
K
Y
 
I
V
 
A
N
 
N
A
 
N
S
 
S
G
 
K
S
 
I
A
 
I
I
 
V
G
 
A
M
 
M
I
 
A
K
 
K
E
 
E
M
 
S
L
 
V
R
 
N
K
 
A
S
 
A
N
 
F
G
 
E
M
 
M
S
 
T
L
 
L
E
 
T
E
 
E
V
 
G
L
 
N
E
x
K
M
 
L
E
 
E
A
 
K
V
 
K
Y
 
L
Q
x
F
E
 
Y
K
 
S
A
 
T
G
x
F
S
 
A
H
 
T
Q
 
D
D
 
D
F
 
R
K
 
R
E
 
E
G
 
G
V
 
M
T
 
S
S
 
A
F
|
F
L
 
V
E
 
E
K
|
K
R
 
R
K
 
K
P
 
A
R
 
N
F
 
F

1ey3A Structure of enoyl-coa hydratase complexed with the substrate dac-coa (see paper)
31% identity, 98% coverage: 3:258/260 of query aligns to 1:255/258 of 1ey3A

query
sites
1ey3A
Y
 
F
K
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
-
 
I
-
 
T
-
 
E
R
 
K
S
 
K
S
 
G
V
 
K
N
 
N
N
 
S
H
 
S
C
 
V
Q
 
G
E
 
L
I
 
I
A
 
Q
I
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
A
x
K
V
x
A
F
x
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
N
 
C
F
 
N
E
 
G
V
 
L
L
 
I
E
 
E
E
 
E
L
 
L
K
 
N
A
 
Q
A
 
A
F
 
L
D
 
E
Q
 
T
A
 
F
A
 
E
Q
 
E
A
 
D
E
 
P
T
 
A
V
 
V
R
 
G
C
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
E
G
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
S
x
A
G
|
G
Q
x
A
D
|
D
L
x
I
K
|
K
A
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
E
L
x
M
D
 
Q
G
 
N
I
 
R
P
 
T
F
 
F
K
 
Q
E
 
D
I
 
C
I
 
Y
R
x
S
K
 
G
Y
 
K
Y
 
F
N
x
L
P
 
S
L
 
H
I
x
W
I
 
D
Q
 
H
M
 
I
R
 
T
N
 
R
L
 
I
S
 
K
K
 
K
P
 
P
I
 
V
I
 
I
C
 
A
K
 
A
L
 
V
N
 
N
G
 
G
A
x
Y
A
 
A
V
x
L
G
|
G
A
x
G
G
 
G
C
 
C
S
x
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
T
 
C
D
 
D
V
 
I
I
 
I
I
 
Y
A
 
A
S
 
G
K
 
E
E
 
K
A
 
A
Y
 
Q
L
 
F
A
 
G
E
 
Q
M
x
P
F
x
E
A
 
I
H
 
L
I
x
L
G
 
G
L
x
T
V
 
I
M
x
P
D
x
G
A
|
A
G
 
G
S
 
G
N
 
T
Y
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
K
 
R
R
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
K
P
 
S
L
 
L
A
 
A
F
 
M
E
 
E
L
 
M
A
 
V
T
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
D
K
x
R
V
 
I
Y
 
S
A
 
A
E
 
Q
E
 
D
A
 
A
E
 
K
R
 
Q
L
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
K
 
K
A
 
I
I
 
F
E
 
P
H
 
V
S
 
E
A
 
T
L
 
L
D
 
V
E
 
E
T
 
E
V
 
A
A
 
I
Q
 
Q
Y
 
C
V
 
A
E
 
E
V
 
K
Y
 
I
V
 
A
N
 
N
A
 
N
S
 
S
G
 
K
S
 
I
A
 
I
I
 
V
G
 
A
M
 
M
I
 
A
K
 
K
E
 
E
M
 
S
L
 
V
R
 
N
K
 
A
S
 
A
N
 
F
G
 
E
M
 
M
S
 
T
L
 
L
E
 
T
E
 
E
V
 
G
L
 
N
E
x
K
M
 
L
E
 
E
A
 
K
V
 
K
Y
 
L
Q
x
F
E
 
Y
K
 
S
A
 
T
G
x
F
S
 
A
H
 
T
Q
 
D
D
 
D
F
 
R
K
 
R
E
 
E
G
 
G
V
 
M
T
 
S
S
 
A
F
|
F
L
 
V
E
 
E
K
|
K
R
 
R
K
 
K
P
 
A
R
 
N
F
 
F

2dubA Enoyl-coa hydratase complexed with octanoyl-coa (see paper)
30% identity, 99% coverage: 2:258/260 of query aligns to 1:251/254 of 2dubA

query
sites
2dubA
D
 
N
Y
 
F
K
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
-
 
I
-
 
T
-
 
E
R
 
K
S
 
K
S
 
G
V
 
K
N
 
N
N
 
S
H
 
S
C
 
V
Q
 
G
E
 
L
I
 
I
A
 
Q
I
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
A
x
K
V
x
A
F
x
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
N
 
C
F
 
N
E
 
G
V
 
L
L
 
I
E
 
E
E
 
E
L
 
L
K
 
N
A
 
Q
A
 
A
F
 
L
D
 
E
Q
 
T
A
 
F
A
 
E
Q
 
E
A
 
D
E
 
P
T
 
A
V
 
V
R
 
G
C
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
E
G
x
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
S
x
A
G
|
G
Q
x
A
D
|
D
L
x
I
K
|
K
A
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
E
L
x
M
D
 
Q
G
 
N
I
 
R
P
 
T
F
 
F
K
 
Q
E
 
D
I
 
C
I
 
Y
R
x
S
K
 
H
Y
 
W
Y
 
D
N
 
H
P
 
-
L
 
-
I
 
-
I
 
-
Q
 
-
M
 
I
R
 
T
N
 
R
L
 
I
S
 
K
K
 
K
P
 
P
I
 
V
I
 
I
C
 
A
K
 
A
L
 
V
N
 
N
G
 
G
A
x
Y
A
 
A
V
 
L
G
|
G
A
x
G
G
 
G
C
 
C
S
x
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
T
 
C
D
 
D
V
 
I
I
 
I
I
 
Y
A
 
A
S
 
G
K
 
E
E
 
K
A
 
A
Y
 
Q
L
 
F
A
 
G
E
 
Q
M
x
P
F
x
E
A
 
I
H
 
L
I
x
L
G
 
G
L
x
T
V
 
I
M
x
P
D
x
G
A
|
A
G
 
G
S
 
G
N
 
T
Y
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
K
 
R
R
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
K
P
 
S
L
 
L
A
 
A
F
 
M
E
 
E
L
 
M
A
 
V
T
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
D
K
 
R
V
 
I
Y
 
S
A
 
A
E
 
Q
E
 
D
A
 
A
E
 
K
R
 
Q
L
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
K
 
K
A
 
I
I
 
F
E
 
P
H
 
V
S
 
E
A
 
T
L
 
L
D
 
V
E
 
E
T
 
E
V
 
A
A
 
I
Q
 
Q
Y
 
C
V
 
A
E
 
E
V
 
K
Y
 
I
V
 
A
N
 
N
A
 
N
S
 
S
G
 
K
S
 
I
A
 
I
I
 
V
G
 
A
M
 
M
I
 
A
K
 
K
E
 
E
M
 
S
L
 
V
R
 
N
K
 
A
S
 
A
N
 
F
G
 
E
M
 
M
S
 
T
L
 
L
E
 
T
E
 
E
V
 
G
L
 
N
E
x
K
M
 
L
E
 
E
A
 
K
V
 
K
Y
 
L
Q
 
F
E
 
Y
K
 
S
A
 
T
G
x
F
S
 
A
H
 
T
Q
 
D
D
 
D
F
 
R
K
 
R
E
 
E
G
 
G
V
 
M
T
 
S
S
 
A
F
 
F
L
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
K
P
 
A
R
 
N
F
 
F

O53561 Enoyl-CoA hydratase EchA19; EC 4.2.1.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
32% identity, 95% coverage: 13:258/260 of query aligns to 17:263/266 of O53561

query
sites
O53561
H
 
H
C
 
T
Q
 
L
E
 
I
I
 
V
A
 
T
I
 
M
D
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
A
V
 
A
F
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
S
F
 
T
E
 
E
V
 
M
L
 
M
E
 
R
E
 
I
L
 
M
K
 
V
A
 
Q
A
 
A
F
 
W
D
 
D
Q
 
R
A
 
V
A
 
D
Q
 
N
A
 
D
E
 
P
T
 
D
V
 
I
R
 
R
C
 
C
V
 
C
V
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
Y
F
 
F
C
 
C
S
 
A
G
 
G
Q
 
M
D
 
D
L
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
A
G
 
T
T
 
Q
D
 
K
L
 
P
D
 
P
G
 
G
I
 
D
P
 
S
F
 
F
K
 
K
E
 
D
I
 
-
I
 
-
R
 
-
K
 
G
Y
 
S
Y
 
Y
N
 
G
P
 
P
-
 
S
-
 
R
-
 
I
-
 
D
L
 
A
I
 
L
I
 
L
Q
 
K
M
 
G
R
 
R
N
 
R
L
 
L
S
 
T
K
 
K
P
 
P
I
 
L
I
 
I
C
 
A
K
 
A
L
 
V
N
 
E
G
 
G
A
 
P
A
 
A
V
 
I
G
 
A
A
 
G
G
 
G
C
 
T
S
 
E
L
 
I
A
 
L
L
 
Q
A
 
G
T
 
T
D
 
D
V
 
I
I
 
R
I
 
V
A
 
A
S
 
G
K
 
E
E
 
S
A
 
A
Y
x
K
L
x
F
A
x
G
E
x
I
M
x
S
F
x
E
A
|
A
H
x
K
I
 
W
G
 
S
L
 
L
V
 
Y
M
 
P
D
 
M
A
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
A
Y
 
V
F
 
R
L
 
L
P
 
V
K
 
R
R
 
Q
V
 
I
G
 
P
Y
 
Y
P
 
T
L
 
L
A
 
A
F
 
C
E
 
D
L
 
L
A
 
L
T
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
K
 
H
V
 
I
Y
 
T
A
 
A
E
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
K
R
 
E
L
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
I
N
 
G
K
 
H
A
 
V
I
 
V
-
 
P
E
 
D
H
 
G
S
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
-
E
 
-
T
 
T
V
 
K
A
 
A
Q
 
L
Y
 
E
V
 
L
E
 
A
V
 
D
Y
 
A
V
 
I
N
 
S
A
 
A
S
 
N
G
 
G
S
 
P
-
 
L
A
 
A
I
 
V
G
 
Q
M
 
A
I
 
I
K
 
L
E
 
R
M
 
S
L
 
I
R
 
R
K
 
E
S
 
T
N
 
E
G
 
C
M
 
M
S
 
P
L
 
E
E
 
N
E
 
E
V
 
A
L
 
F
E
 
K
M
 
I
E
 
D
A
 
T
V
 
Q
Y
 
I
Q
 
G
E
 
I
K
 
K
A
 
V
G
 
F
S
 
L
H
 
S
Q
 
D
D
 
D
F
 
A
K
 
K
E
 
E
G
 
G
V
 
P
T
 
R
S
 
A
F
 
F
L
 
A
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
R
 
N
F
 
F

1mj3A Crystal structure analysis of rat enoyl-coa hydratase in complex with hexadienoyl-coa (see paper)
31% identity, 99% coverage: 2:258/260 of query aligns to 2:255/258 of 1mj3A

query
sites
1mj3A
D
 
N
Y
 
F
K
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
-
 
I
-
 
T
-
 
E
R
 
K
S
 
K
S
 
G
V
 
K
N
 
N
N
 
S
H
 
S
C
 
V
Q
 
G
E
 
L
I
 
I
A
 
Q
I
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
A
x
K
V
x
A
F
x
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
N
 
C
F
 
N
E
 
G
V
 
L
L
 
I
E
 
E
E
 
E
L
 
L
K
 
N
A
 
Q
A
 
A
F
 
L
D
 
E
Q
 
T
A
 
F
A
 
E
Q
 
E
A
 
D
E
 
P
T
 
A
V
 
V
R
 
G
C
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
E
G
x
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
S
x
A
G
|
G
Q
x
A
D
|
D
L
x
I
K
|
K
A
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
E
L
x
M
D
 
Q
G
 
N
I
 
R
P
 
T
F
 
F
K
 
Q
E
 
D
I
 
C
I
 
-
R
 
-
K
 
-
Y
 
-
Y
 
Y
N
x
S
P
 
G
L
|
L
-
 
S
-
 
H
I
x
W
I
 
D
Q
 
H
M
 
I
R
 
T
N
 
R
L
 
I
S
 
K
K
 
K
P
 
P
I
 
V
I
 
I
C
 
A
K
 
A
L
 
V
N
 
N
G
 
G
A
x
Y
A
 
A
V
x
L
G
|
G
A
x
G
G
 
G
C
 
C
S
x
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
T
 
C
D
 
D
V
 
I
I
 
I
I
 
Y
A
 
A
S
 
G
K
 
E
E
 
K
A
 
A
Y
 
Q
L
 
F
A
 
G
E
 
Q
M
x
P
F
x
E
A
 
I
H
 
L
I
x
L
G
 
G
L
x
T
V
 
I
M
x
P
D
x
G
A
|
A
G
 
G
S
 
G
N
 
T
Y
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
K
 
R
R
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
K
P
 
S
L
 
L
A
 
A
F
 
M
E
 
E
L
 
M
A
 
V
T
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
D
K
 
R
V
 
I
Y
 
S
A
 
A
E
 
Q
E
 
D
A
 
A
E
 
K
R
 
Q
L
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
K
 
K
A
 
I
I
 
F
E
 
P
H
 
V
S
 
E
A
 
T
L
 
L
D
 
V
E
 
E
T
 
E
V
 
A
A
 
I
Q
 
Q
Y
 
C
V
 
A
E
 
E
V
 
K
Y
 
I
V
 
A
N
 
N
A
 
N
S
 
S
G
 
K
S
 
I
A
 
I
I
 
V
G
 
A
M
 
M
I
 
A
K
 
K
E
 
E
M
 
S
L
 
V
R
 
N
K
 
A
S
 
A
N
 
F
G
 
E
M
 
M
S
 
T
L
 
L
E
 
T
E
 
E
V
 
G
L
 
N
E
x
K
M
 
L
E
 
E
A
 
K
V
 
K
Y
 
L
Q
x
F
E
 
Y
K
 
S
A
 
T
G
x
F
S
 
A
H
 
T
Q
 
D
D
 
D
F
 
R
K
 
R
E
 
E
G
 
G
V
 
M
T
 
S
S
 
A
F
|
F
L
 
V
E
 
E
K
|
K
R
 
R
K
 
K
P
 
A
R
 
N
F
 
F

3q0jA Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase in complex with the inhibitor acetoacetylcoa
29% identity, 99% coverage: 1:258/260 of query aligns to 1:254/255 of 3q0jA

query
sites
3q0jA
M
 
M
D
 
T
Y
 
Y
K
 
E
Y
 
T
I
 
I
R
 
L
S
 
V
S
 
E
V
 
R
N
 
D
N
 
Q
H
 
R
C
 
V
Q
 
G
E
 
I
I
 
I
A
 
T
I
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
Q
V
 
A
F
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
N
F
 
S
E
 
Q
V
 
V
L
 
M
E
 
N
E
 
E
L
 
V
K
 
T
A
 
S
A
 
A
F
 
A
D
 
T
Q
 
E
A
 
L
A
 
D
Q
 
D
A
 
D
E
 
P
T
 
D
V
 
I
R
 
G
C
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
G
 
A
G
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
S
 
A
G
 
G
Q
x
A
D
 
D
L
 
I
K
 
K
A
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
E
L
x
M
D
 
A
G
 
D
I
 
L
P
 
T
F
 
F
K
 
A
E
 
D
I
 
A
I
 
F
R
x
T
K
 
A
Y
 
D
Y
 
F
N
x
F
P
 
A
L
 
T
I
 
W
I
 
G
Q
 
K
M
 
L
R
 
A
N
 
A
L
 
V
S
 
R
K
 
T
P
 
P
I
 
T
I
 
I
C
 
A
K
 
A
L
 
V
N
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
V
 
L
G
 
G
A
x
G
G
 
G
C
 
C
S
x
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
T
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
A
K
 
D
E
 
T
A
 
A
Y
 
K
L
 
F
A
 
G
E
 
Q
M
x
P
F
x
E
A
 
I
H
 
K
I
 
L
G
 
G
L
x
V
V
 
L
M
x
P
D
x
G
A
 
M
G
 
G
S
 
G
N
 
S
Y
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
K
 
R
R
 
A
V
 
I
G
 
G
Y
 
K
P
 
A
L
 
K
A
 
A
F
 
M
E
 
D
L
 
L
A
 
I
T
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
K
 
T
V
 
M
Y
 
D
A
 
A
E
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
K
 
R
A
 
V
I
 
V
E
 
P
H
 
A
S
 
D
A
 
D
L
 
L
D
 
L
E
 
T
T
 
E
V
 
A
A
 
R
Q
 
A
Y
 
T
V
 
A
E
 
T
V
 
T
Y
 
I
V
 
S
N
 
Q
A
 
M
S
 
S
G
 
A
S
 
S
A
 
A
I
 
A
G
 
R
M
 
M
I
 
A
K
 
K
E
 
E
M
 
A
L
 
V
R
 
N
K
 
R
S
 
A
N
 
F
G
 
E
M
 
S
S
 
S
L
 
L
E
 
S
E
 
E
V
 
G
L
 
L
E
x
L
M
 
Y
E
 
E
A
 
R
V
 
R
Y
 
L
Q
 
F
E
 
H
K
 
S
A
 
A
G
x
F
S
 
A
H
 
T
Q
 
E
D
 
D
F
 
Q
K
 
S
E
 
E
G
 
G
V
 
M
T
 
A
S
 
A
F
|
F
L
 
I
E
 
E
K
|
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
R
 
Q
F
 
F

3q0gC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
29% identity, 99% coverage: 1:258/260 of query aligns to 1:254/255 of 3q0gC

query
sites
3q0gC
M
 
M
D
 
T
Y
 
Y
K
 
E
Y
 
T
I
 
I
R
 
L
S
 
V
S
 
E
V
 
R
N
 
D
N
 
Q
H
 
R
C
 
V
Q
 
G
E
 
I
I
 
I
A
 
T
I
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
Q
V
x
A
F
x
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
N
 
N
F
 
S
E
 
Q
V
 
V
L
 
M
E
 
N
E
 
E
L
 
V
K
 
T
A
 
S
A
 
A
F
 
A
D
 
T
Q
 
E
A
 
L
A
 
D
Q
 
D
A
 
D
E
 
P
T
 
D
V
 
I
R
 
G
C
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
G
 
A
G
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
S
x
A
G
 
G
Q
x
A
D
|
D
L
x
I
K
|
K
A
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
E
L
x
M
D
 
A
G
 
D
I
 
L
P
 
T
F
 
F
K
 
A
E
 
D
I
 
A
I
 
F
R
x
T
K
 
A
Y
 
D
Y
 
F
N
x
F
P
 
A
L
 
T
I
 
W
I
 
G
Q
 
K
M
 
L
R
 
A
N
 
A
L
 
V
S
 
R
K
 
T
P
 
P
I
 
T
I
 
I
C
 
A
K
 
A
L
 
V
N
 
A
G
 
G
A
x
Y
A
 
A
V
 
L
G
 
G
A
x
G
G
 
G
C
 
C
S
x
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
T
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
A
K
 
D
E
 
T
A
 
A
Y
 
K
L
 
F
A
 
G
E
 
Q
M
x
P
F
x
E
A
 
I
H
 
K
I
x
L
G
 
G
L
x
V
V
 
L
M
x
P
D
x
G
A
 
M
G
 
G
S
 
G
N
 
S
Y
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
K
 
R
R
 
A
V
 
I
G
 
G
Y
 
K
P
 
A
L
 
K
A
 
A
F
 
M
E
 
D
L
 
L
A
 
I
T
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
K
 
T
V
 
M
Y
 
D
A
 
A
E
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
K
 
R
A
 
V
I
 
V
E
 
P
H
 
A
S
 
D
A
 
D
L
 
L
D
 
L
E
 
T
T
 
E
V
 
A
A
 
R
Q
 
A
Y
 
T
V
 
A
E
 
T
V
 
T
Y
 
I
V
 
S
N
 
Q
A
 
M
S
 
S
G
 
A
S
 
S
A
 
A
I
 
A
G
 
R
M
 
M
I
 
A
K
 
K
E
 
E
M
 
A
L
 
V
R
 
N
K
 
R
S
 
A
N
 
F
G
 
E
M
 
S
S
 
S
L
 
L
E
 
S
E
 
E
V
 
G
L
 
L
E
x
L
M
 
Y
E
 
E
A
 
R
V
 
R
Y
 
L
Q
 
F
E
 
H
K
 
S
A
 
A
G
x
F
S
 
A
H
 
T
Q
 
E
D
 
D
F
 
Q
K
 
S
E
 
E
G
 
G
V
 
M
T
 
A
S
 
A
F
 
F
L
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
R
 
Q
F
 
F

3h81A Crystal structure of enoyl-coa hydratase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
29% identity, 98% coverage: 3:258/260 of query aligns to 2:253/256 of 3h81A

query
sites
3h81A
Y
 
Y
K
 
E
Y
 
T
I
 
I
R
 
L
S
 
V
S
 
E
V
 
R
N
 
D
N
 
Q
H
 
R
C
 
V
Q
 
G
E
 
I
I
 
I
A
 
T
I
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
Q
V
 
A
F
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
N
F
 
S
E
 
Q
V
 
V
L
 
M
E
 
N
E
 
E
L
 
V
K
 
T
A
 
S
A
 
A
F
 
A
D
 
T
Q
 
E
A
 
L
A
 
D
Q
 
D
A
 
D
E
 
P
T
 
D
V
 
I
R
 
G
C
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
G
 
A
G
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
S
 
A
G
 
G
Q
x
A
D
 
D
L
 
I
K
 
K
A
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
E
L
x
M
D
 
A
G
 
D
I
 
L
P
 
T
F
 
F
K
 
A
E
 
D
I
 
A
I
 
F
R
x
T
K
 
A
Y
 
D
Y
 
F
N
x
F
P
 
A
L
 
T
I
 
W
I
 
G
Q
 
K
M
 
L
R
 
A
N
 
A
L
 
V
S
 
R
K
 
T
P
 
P
I
 
T
I
 
I
C
 
A
K
 
A
L
 
V
N
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
V
 
L
G
 
G
A
x
G
G
 
G
C
 
C
S
x
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
T
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
A
K
 
D
E
 
T
A
 
A
Y
 
K
L
 
F
A
 
G
E
 
Q
M
x
P
F
x
E
A
 
I
H
 
K
I
 
L
G
 
G
L
x
V
V
 
L
M
x
P
D
x
G
A
 
M
G
 
G
S
 
G
N
 
S
Y
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
K
 
R
R
 
A
V
 
I
G
 
G
Y
 
K
P
 
A
L
 
K
A
 
A
F
 
M
E
 
D
L
 
L
A
 
I
T
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
K
 
T
V
 
M
Y
 
D
A
 
A
E
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
E
R
|
R
L
x
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
K
 
R
A
 
V
I
 
V
E
 
P
H
 
A
S
 
D
A
 
D
L
 
L
D
 
L
E
 
T
T
 
E
V
 
A
A
 
R
Q
 
A
Y
 
T
V
 
A
E
 
T
V
 
T
Y
 
I
V
 
S
N
 
Q
A
 
M
S
 
S
G
 
A
S
 
S
A
 
A
I
 
A
G
 
R
M
 
M
I
 
A
K
 
K
E
 
E
M
 
A
L
 
V
R
 
N
K
 
R
S
 
A
N
 
F
G
 
E
M
 
S
S
 
S
L
 
L
E
 
S
E
 
E
V
 
G
L
 
L
E
x
L
M
 
Y
E
 
E
A
 
R
V
 
R
Y
 
L
Q
 
F
E
 
H
K
 
S
A
 
A
G
x
F
S
 
A
H
 
T
Q
 
E
D
 
D
F
x
Q
K
 
S
E
 
E
G
 
G
V
 
M
T
 
A
S
 
A
F
 
F
L
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
R
 
Q
F
 
F

3q0gD Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
29% identity, 98% coverage: 3:258/260 of query aligns to 2:249/250 of 3q0gD

query
sites
3q0gD
Y
 
Y
K
 
E
Y
 
T
I
 
I
R
 
L
S
 
V
S
 
E
V
 
R
N
 
D
N
 
Q
H
 
R
C
 
V
Q
 
G
E
 
I
I
 
I
A
 
T
I
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
Q
V
 
A
F
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
N
F
 
S
E
 
Q
V
 
V
L
 
M
E
 
N
E
 
E
L
 
V
K
 
T
A
 
S
A
 
A
F
 
A
D
 
T
Q
 
E
A
 
L
A
 
D
Q
 
D
A
 
D
E
 
P
T
 
D
V
 
I
R
 
G
C
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
G
 
A
G
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
S
 
A
G
 
G
Q
x
A
D
 
D
L
 
I
K
 
K
A
 
E
V
x
M
G
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
-
F
 
F
K
 
A
E
 
D
I
 
A
I
 
F
R
x
T
K
 
A
Y
 
D
Y
 
F
N
x
F
P
 
A
L
 
T
I
 
W
I
 
G
Q
 
K
M
 
L
R
 
A
N
 
A
L
 
V
S
 
R
K
 
T
P
 
P
I
 
T
I
 
I
C
 
A
K
 
A
L
 
V
N
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
V
 
L
G
 
G
A
x
G
G
 
G
C
 
C
S
x
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
T
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
A
K
 
D
E
 
T
A
 
A
Y
 
K
L
 
F
A
 
G
E
 
Q
M
x
P
F
x
E
A
 
I
H
 
K
I
 
L
G
 
G
L
x
V
V
 
L
M
x
P
D
x
G
A
 
M
G
 
G
S
 
G
N
 
S
Y
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
K
 
R
R
 
A
V
 
I
G
 
G
Y
 
K
P
 
A
L
 
K
A
 
A
F
 
M
E
 
D
L
 
L
A
 
I
T
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
K
 
T
V
 
M
Y
 
D
A
 
A
E
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
K
 
R
A
 
V
I
 
V
E
 
P
H
 
A
S
 
D
A
 
D
L
 
L
D
 
L
E
 
T
T
 
E
V
 
A
A
 
R
Q
 
A
Y
 
T
V
 
A
E
 
T
V
 
T
Y
 
I
V
 
S
N
 
Q
A
 
M
S
 
S
G
 
A
S
 
S
A
 
A
I
 
A
G
 
R
M
 
M
I
 
A
K
 
K
E
 
E
M
 
A
L
 
V
R
 
N
K
 
R
S
 
A
N
 
F
G
 
E
M
 
S
S
 
S
L
 
L
E
 
S
E
 
E
V
 
G
L
 
L
E
x
L
M
 
Y
E
 
E
A
 
R
V
 
R
Y
 
L
Q
x
F
E
 
H
K
 
S
A
 
A
G
x
F
S
 
A
H
 
T
Q
 
E
D
 
D
F
 
Q
K
 
S
E
 
E
G
 
G
V
 
M
T
 
A
S
 
A
F
|
F
L
 
I
E
 
E
K
|
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
R
 
Q
F
 
F

A5JTM5 4-chlorobenzoyl coenzyme A dehalogenase; 4-CBA-CoA dehalogenase; 4-CBCoA dehalogenase; 4-chlorobenzoyl-CoA dehalogenase; EC 3.8.1.7 from Pseudomonas sp. (strain CBS-3) (see 7 papers)
27% identity, 97% coverage: 3:255/260 of query aligns to 2:257/269 of A5JTM5

query
sites
A5JTM5
Y
 
Y
K
 
E
Y
 
A
I
 
I
R
 
G
S
 
H
S
 
R
V
 
V
N
 
E
N
 
D
H
 
G
C
 
V
Q
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
T
I
 
I
D
 
K
R
 
L
P
 
P
A
 
R
V
 
H
F
x
R
N
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
S
F
 
V
E
 
K
V
 
A
L
 
M
E
 
Q
E
|
E
L
 
V
K
 
T
A
 
D
A
 
A
F
 
L
D
 
N
Q
 
R
A
 
A
A
x
E
Q
 
E
A
x
D
E
x
D
T
 
S
V
 
V
R
 
G
C
 
A
V
 
V
V
 
M
L
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
E
G
 
D
A
 
A
F
 
F
C
 
C
S
 
A
G
|
G
Q
x
F
D
x
Y
L
 
L
K
x
R
A
x
E
V
 
I
G
 
P
T
 
L
D
 
D
L
 
K
D
 
G
G
 
V
I
 
A
P
 
G
F
 
V
K
 
R
E
 
D
I
x
H
I
x
F
R
 
R
-
 
I
-
 
G
-
 
A
K
 
L
Y
 
W
Y
x
W
N
x
H
P
 
Q
L
 
M
I
 
I
I
x
H
Q
 
K
M
 
I
R
 
I
N
 
R
L
 
V
S
 
K
K
 
R
P
 
P
I
 
V
I
 
L
C
 
A
K
 
A
L
 
I
N
 
N
G
 
G
A
 
V
A
 
A