SitesBLAST

SitesBLAST – Find functional sites

SitesBLAST

Comparing Echvi_0146 FitnessBrowser__Cola:Echvi_0146 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5z75A Artificial l-threonine 3-dehydrogenase designed by ancestral sequence reconstruction. (see paper)
65% identity, 94% coverage: 8:314/325 of query aligns to 2:305/306 of 5z75A

query
sites
5z75A

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binding nicotinamide-adenine-dinucleotide: G9 (= G15), C11 (≠ A17), G12 (= G18), Q13 (= Q19), I14 (≠ L20), D35 (= D41), I36 (= I42), L49 (= L58), D50 (= D59), V51 (= V60), L72 (= L81), A73 (= A82), A74 (= A83), L76 (= L85), L90 (= L99), P113 (= P122), S114 (= S123), S115 (= S124), Y140 (= Y149), K144 (= K153), Y167 (= Y176), P168 (= P177), G169 (= G178), L170 (= L179), P176 (≠ M185), P177 (= P186)

7eprB Partial consensus l-threonine 3-dehydrogenase (c-change) (see paper)
59% identity, 96% coverage: 9:319/325 of query aligns to 2:310/310 of 7eprB

query
sites
7eprB

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binding nicotinamide-adenine-dinucleotide: G8 (= G15), C10 (≠ A17), G11 (= G18), Q12 (= Q19), I13 (≠ L20), D34 (= D41), I35 (= I42), R36 (≠ N43), L49 (= L58), D50 (= D59), A51 (≠ V60), T52 (≠ M61), L72 (= L81), A73 (= A82), A74 (= A83), L76 (= L85), L90 (= L99), P113 (= P122), S114 (= S123), S115 (= S124), Y140 (= Y149), K144 (= K153), Y167 (= Y176), P168 (= P177), G169 (= G178), L170 (= L179), G178 (= G187)

7cgvA Full consensus l-threonine 3-dehydrogenase, fctdh-iiym (NAD+ bound form) (see paper)
62% identity, 94% coverage: 11:317/325 of query aligns to 3:307/310 of 7cgvA

query
sites
7cgvA

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binding nicotinamide-adenine-dinucleotide: G7 (= G15), N9 (≠ A17), G10 (= G18), Q11 (= Q19), I12 (≠ L20), D33 (= D41), I34 (= I42), R35 (≠ N43), L48 (= L58), D49 (= D59), V50 (= V60), L71 (= L81), A72 (= A82), A73 (= A83), L75 (= L85), L89 (= L99), P112 (= P122), S113 (= S123), S114 (= S124), Y139 (= Y149), K143 (= K153), Y166 (= Y176), P167 (= P177), G168 (= G178), I169 (≠ L179)

7epsA Partial consensus l-threonine 3-dehydrogenase (e-change) (see paper)
58% identity, 95% coverage: 11:319/325 of query aligns to 3:309/310 of 7epsA

query
sites
7epsA

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binding threonine: L75 (= L85), S76 (= S86), S114 (= S124), Y139 (= Y149), P167 (= P177), G168 (= G178), G179 (= G189), T180 (= T190), T181 (= T191), W275 (= W285)

2yy7A Crystal structure of thermolabile l-threonine dehydrogenase from flavobacterium frigidimaris kuc-1 (see paper)
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2yy7A

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3wmwB Gale-like l-threonine dehydrogenase from cupriavidus necator (apo form) (see paper)
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3wmwB

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5y1gA Monomeric l-threonine 3-dehydrogenase from metagenome database (akb and nadh bound form) (see paper)
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5y1gA

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binding nicotinamide-adenine-dinucleotide: G8 (= G15), L10 (≠ A17), G11 (= G18), Q12 (= Q19), I13 (≠ L20), D34 (= D41), L35 (≠ I42), C48 (≠ L58), D49 (= D59), I50 (≠ V60), R51 (≠ M61), L71 (= L81), A72 (= A82), A73 (= A83), I74 (= I84), L75 (= L85), V89 (≠ L99), P111 (= P122), S112 (= S123), S113 (= S124), Y138 (= Y149), K142 (= K153), Y165 (= Y176), P166 (= P177), G167 (= G178), L168 (= L179)

5y1fA Monomeric l-threonine 3-dehydrogenase from metagenome database (NAD+ bound form) (see paper)
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5y1fA

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5y1eA Monomeric l-threonine 3-dehydrogenase from metagenome database (l-ser and NAD+ bound form) (see paper)
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6jygD Crystal structure of l-threonine dehydrogenase from phytophthora infestans (see paper)
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3a4vA Crystal structure of pyruvate bound l-threonine dehydrogenase from hyperthermophilic archaeon thermoplasma volcanium (see paper)
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3a1nA Crystal structure of l-threonine dehydrogenase from hyperthermophilic archaeon thermoplasma volcanium (see paper)
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3ajrA Crystal structure of l-3-hydroxynorvaline bound l-threonine dehydrogenase (y137f) from hyperthermophilic archaeon thermoplasma volcanium (see paper)
44% identity, 96% coverage: 11:321/325 of query aligns to 2:309/314 of 3ajrA

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