SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Echvi_0146 FitnessBrowser__Cola:Echvi_0146 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5z75A Artificial l-threonine 3-dehydrogenase designed by ancestral sequence reconstruction. (see paper)
65% identity, 94% coverage: 8:314/325 of query aligns to 2:305/306 of 5z75A

query
sites
5z75A
M
 
M
E
 
M
T
 
K
I
 
I
L
 
L
I
 
V
T
 
I
G
|
G
A
 
A
A
x
C
G
|
G
Q
|
Q
L
x
I
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
R
N
 
E
M
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
N
D
 
E
R
 
N
I
 
V
I
 
V
A
 
A
T
 
S
D
|
D
I
|
I
N
 
R
E
 
E
A
 
P
S
 
N
A
 
E
Y
 
-
K
 
-
F
 
-
D
 
E
Y
 
S
C
 
G
R
 
P
F
 
F
M
 
E
A
 
K
L
|
L
D
 
D
V
|
V
M
 
M
D
 
D
R
 
K
K
 
E
R
 
R
M
 
L
T
 
E
E
 
E
I
 
I
V
 
V
K
 
E
A
 
K
E
 
H
K
 
K
V
 
I
T
 
T
Q
 
Q
I
 
V
Y
 
Y
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
 
A
I
 
I
L
|
L
S
 
S
A
 
A
T
 
T
S
 
G
E
 
E
K
 
K
N
 
N
P
 
P
I
 
L
F
 
F
A
 
A
W
 
W
N
 
D
L
 
L
N
 
N
M
 
M
E
 
N
S
 
S
L
 
L
L
 
L
S
 
N
I
 
V
L
 
L
E
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
Q
 
G
K
 
K
L
 
I
N
 
D
K
 
K
I
 
I
Y
 
F
W
 
W
P
|
P
S
 
S
S
|
S
I
 
I
A
 
A
V
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
N
 
T
T
 
T
P
 
P
M
 
K
Q
 
E
H
 
N
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
H
C
 
T
I
 
V
M
 
M
D
 
D
P
 
P
N
 
S
T
 
T
V
 
V
Y
|
Y
G
 
G
I
 
I
S
 
S
K
|
K
Q
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
R
W
 
W
C
 
C
A
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
F
 
H
E
 
E
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
V
R
 
R
S
 
S
L
 
I
R
 
R
Y
|
Y
P
|
P
G
 
G
L
|
L
I
 
I
G
 
S
Y
 
W
K
 
K
S
 
T
M
x
P
P
|
P
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
I
F
 
F
H
 
H
K
 
K
A
 
A
I
 
L
E
 
E
G
 
D
E
 
G
D
 
K
F
 
Y
E
 
T
C
 
C
F
 
F
L
 
L
E
 
S
E
 
E
D
 
D
T
 
T
Y
 
A
L
 
L
P
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
D
 
D
D
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
I
D
 
E
L
 
L
M
 
M
H
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
E
Q
 
N
I
 
I
K
 
K
V
 
I
R
 
R
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
N
 
N
L
 
L
G
 
A
G
 
G
I
 
M
S
 
S
F
 
F
S
 
T
P
 
P
K
 
E
E
 
E
I
 
I
Y
 
A
E
 
E
C
 
E
I
 
I
K
 
K
Q
 
K
H
 
H
Y
 
I
P
 
P
N
 
D
F
 
F
N
 
E
I
 
I
T
 
S
Y
 
Y
K
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
T
 
S
W
 
W
P
 
P
D
 
A
S
 
S
I
 
I
D
 
D
D
 
D
S
 
S
A
 
V
A
 
A
Q
 
R
N
 
K
D
 
D
W
 
W
G
 
G
W
 
W
Q
 
K
H
 
P
S
 
E
Y
 
Y
G
 
D
L
 
L
E
 
D
E
 
K
M
 
M
T
 
T
K
 
E
D
 
D
I
 
M
L
 
L

7eprB Partial consensus l-threonine 3-dehydrogenase (c-change) (see paper)
59% identity, 96% coverage: 9:319/325 of query aligns to 2:310/310 of 7eprB

query
sites
7eprB
E
 
E
T
 
K
I
 
I
L
 
L
I
 
I
T
 
V
G
|
G
A
 
A
A
 
C
G
|
G
Q
|
Q
L
x
I
G
 
G
S
 
S
E
 
E
L
 
L
T
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
E
M
 
R
Y
 
Y
G
 
G
G
 
N
D
 
T
R
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
T
T
 
S
D
|
D
I
|
I
N
x
R
E
 
E
A
 
G
S
 
G
A
 
-
Y
 
-
K
 
R
F
 
H
D
 
N
Y
 
S
C
 
G
R
 
T
F
 
H
M
 
E
A
 
M
L
 
L
D
|
D
V
x
A
M
 
T
D
 
D
R
 
R
K
 
G
R
 
E
M
 
L
T
 
A
E
 
T
I
 
V
V
 
V
K
 
E
A
 
R
E
 
H
K
 
K
V
 
I
T
 
T
Q
 
Q
I
 
V
Y
 
Y
H
 
L
L
|
L
A
|
A
A
|
A
I
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
A
T
 
T
S
 
G
E
 
E
K
 
K
N
 
N
P
 
P
I
 
Q
F
 
W
A
 
A
W
 
W
N
 
N
L
|
L
N
 
N
M
 
M
E
 
T
S
 
S
L
 
L
L
 
L
S
 
N
I
 
V
L
 
L
E
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
Q
 
T
K
 
K
L
 
I
N
 
K
K
 
R
I
 
V
Y
 
F
W
 
W
P
|
P
S
 
S
S
 
S
I
 
I
A
 
A
V
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
N
 
T
T
 
T
P
 
P
M
 
K
Q
 
E
H
 
N
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
Y
C
 
T
I
 
V
M
 
M
D
 
E
P
 
P
N
 
S
T
 
T
V
 
V
Y
|
Y
G
 
G
I
 
I
S
 
S
K
|
K
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
G
W
 
W
C
 
C
A
 
R
Y
 
W
Y
 
Y
F
 
H
E
 
A
K
 
N
F
 
H
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
V
R
 
R
S
 
S
L
 
V
R
 
R
Y
|
Y
P
 
P
G
 
G
L
|
L
I
 
I
G
 
S
Y
 
W
K
 
K
S
 
T
M
 
P
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
I
F
 
F
H
 
H
K
 
A
A
 
A
I
 
V
E
 
T
G
 
G
E
 
G
D
 
K
F
 
Y
E
 
T
C
 
C
F
 
F
L
 
L
E
 
S
E
 
E
D
 
D
T
 
T
Y
 
A
L
 
L
P
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
D
 
P
D
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
I
D
 
E
L
 
L
M
 
M
H
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
D
Q
 
K
I
 
I
K
 
K
V
 
I
R
 
R
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
N
 
N
L
 
L
G
 
A
G
 
G
I
 
M
S
 
S
F
 
F
S
 
T
P
 
P
K
 
A
E
 
Q
I
 
I
Y
 
A
E
 
A
C
 
A
I
 
I
K
 
R
Q
 
E
H
 
Q
Y
 
I
P
 
P
N
 
D
F
 
F
N
 
K
I
 
I
T
 
S
Y
 
Y
K
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
Y
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
T
 
S
W
 
W
P
 
P
D
 
A
S
 
S
I
 
I
D
 
D
D
 
D
S
 
S
A
 
V
A
 
A
Q
 
R
N
 
A
D
 
D
W
 
W
G
 
G
W
 
W
Q
 
K
H
 
P
S
 
E
Y
 
F
G
 
D
L
 
L
E
 
K
E
 
E
M
 
M
T
 
V
K
 
A
D
 
D
I
 
M
L
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
L
P
 
K
A
 
A

7cgvA Full consensus l-threonine 3-dehydrogenase, fctdh-iiym (NAD+ bound form) (see paper)
62% identity, 94% coverage: 11:317/325 of query aligns to 3:307/310 of 7cgvA

query
sites
7cgvA
I
 
I
L
 
L
I
 
V
T
 
I
G
|
G
A
 
A
A
 
N
G
|
G
Q
|
Q
L
x
I
G
 
G
S
 
S
E
 
E
L
 
L
T
 
V
L
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
R
N
 
K
M
 
R
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
D
 
D
R
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
S
D
|
D
I
|
I
N
x
R
E
 
P
A
 
P
S
 
N
A
 
L
Y
 
Y
K
 
-
F
 
-
D
 
E
Y
 
A
C
 
G
R
 
P
F
 
F
M
 
E
A
 
Y
L
|
L
D
|
D
V
|
V
M
 
L
D
 
D
R
 
K
K
 
E
R
 
A
M
 
L
T
 
A
E
 
E
I
 
L
V
 
V
K
 
K
A
 
K
E
 
Y
K
 
K
V
 
I
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
Y
 
Y
H
 
H
L
 
L
A
|
A
A
|
A
I
 
L
L
|
L
S
 
S
A
 
A
T
 
T
S
 
G
E
 
E
K
 
K
N
 
N
P
 
P
I
 
Q
F
 
K
A
 
A
W
 
W
N
 
D
L
 
L
N
 
N
M
 
M
E
 
D
S
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
N
I
 
V
L
 
L
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
E
 
E
Q
 
R
K
 
G
L
 
P
N
 
L
K
 
K
I
 
V
Y
 
F
W
 
W
P
|
P
S
 
S
S
|
S
I
 
I
A
 
A
V
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
P
N
 
N
T
 
T
P
 
P
M
 
K
Q
 
D
H
 
N
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
C
 
T
I
 
I
M
 
M
D
 
R
P
 
P
N
 
T
T
 
T
V
 
I
Y
|
Y
G
 
G
I
 
I
S
 
S
K
|
K
Q
 
V
A
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
L
W
 
L
C
 
C
A
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
F
 
H
E
 
T
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
V
R
 
R
S
 
S
L
 
V
R
 
R
Y
|
Y
P
 
P
G
 
G
L
x
I
I
 
I
G
 
S
Y
 
Y
K
 
K
S
 
T
M
 
P
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
E
I
 
I
F
 
F
H
 
Y
K
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
K
G
 
G
E
 
G
D
 
K
F
 
Y
E
 
E
C
 
C
F
 
F
L
 
L
E
 
G
E
 
P
D
 
D
T
 
T
Y
 
T
L
 
L
P
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
D
 
P
D
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
I
D
 
E
L
 
L
M
 
M
H
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
E
Q
 
K
I
 
L
K
 
K
V
 
H
R
 
R
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
N
 
N
L
 
V
G
 
A
G
 
A
I
 
M
S
 
S
F
 
F
S
 
T
P
 
P
K
 
E
E
 
E
I
 
L
Y
 
A
E
 
A
C
 
E
I
 
I
K
 
K
Q
 
K
H
 
H
Y
 
I
P
 
P
N
 
D
F
 
F
N
 
E
I
 
I
T
 
T
Y
 
Y
K
 
K
P
 
P
D
 
D
F
 
V
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
T
 
S
W
 
W
P
 
P
D
 
K
S
 
S
I
 
L
D
 
D
D
 
D
S
 
S
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
N
 
A
D
 
D
W
 
W
G
 
G
W
 
W
Q
 
K
H
 
P
S
 
R
Y
 
Y
G
 
D
L
 
L
E
 
E
E
 
E
M
 
M
T
 
T
K
 
K
D
 
D
I
 
M
L
 
L
A
 
E
N
 
N
L
 
L

7epsA Partial consensus l-threonine 3-dehydrogenase (e-change) (see paper)
58% identity, 95% coverage: 11:319/325 of query aligns to 3:309/310 of 7epsA

query
sites
7epsA
I
 
I
L
 
L
I
 
I
T
 
I
G
 
G
A
 
A
A
x
N
G
|
G
Q
|
Q
L
x
I
G
 
G
S
 
S
E
 
E
L
 
L
T
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
E
M
 
R
Y
 
Y
G
 
G
G
 
R
D
 
E
R
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
S
D
|
D
I
x
V
N
 
V
E
 
P
A
 
T
S
 
G
A
 
-
Y
 
-
K
 
R
F
 
H
D
 
V
Y
 
H
C
 
L
R
 
P
F
 
F
M
 
E
A
 
V
L
|
L
D
 
N
V
x
A
M
 
T
D
 
D
R
 
R
K
 
G
R
 
E
M
 
L
T
 
A
E
 
T
I
 
V
V
 
V
K
 
E
A
 
R
E
 
H
K
 
G
V
 
I
T
 
T
Q
 
Q
I
 
V
Y
 
Y
H
 
L
L
|
L
A
|
A
A
|
A
I
 
A
L
 
L
S
|
S
A
 
A
T
 
T
S
 
G
E
 
E
K
 
K
N
 
A
P
 
P
I
 
Q
F
 
W
A
 
A
W
 
W
N
 
N
L
|
L
N
 
N
M
 
M
E
 
T
S
 
S
L
 
L
L
 
L
S
 
N
I
 
V
L
 
L
E
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
Q
 
T
K
 
G
L
 
L
N
 
E
K
 
K
I
 
I
Y
 
F
W
 
W
P
|
P
S
 
S
S
|
S
I
 
I
A
 
A
V
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
P
N
 
T
T
 
T
P
 
P
M
 
A
Q
 
G
H
 
Q
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
K
C
 
T
I
 
V
M
 
M
D
 
E
P
 
P
N
 
T
T
 
T
V
 
V
Y
|
Y
G
 
G
I
 
I
S
 
S
K
|
K
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
G
W
 
W
C
 
C
A
 
R
Y
 
W
Y
 
Y
F
 
H
E
 
A
K
 
N
F
 
H
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
V
R
 
R
S
 
S
L
 
I
R
 
R
Y
|
Y
P
 
P
G
 
G
L
|
L
I
 
I
G
 
S
Y
 
H
K
 
K
S
 
T
M
 
P
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
|
G
T
|
T
T
|
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
I
F
 
F
H
 
H
K
 
A
A
 
A
I
 
V
E
 
T
G
 
G
E
 
E
D
 
P
F
 
Y
E
 
T
C
 
C
F
 
F
L
 
L
E
 
K
E
 
E
D
 
D
T
 
E
Y
 
A
L
 
L
P
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
D
 
P
D
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
I
D
 
E
L
 
L
M
 
M
H
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
D
Q
 
K
I
 
L
K
 
S
V
 
E
R
 
R
S
 
G
S
 
S
Y
 
Y
N
 
N
L
 
I
G
 
A
G
 
G
I
 
M
S
 
S
F
 
F
S
 
T
P
 
P
K
 
A
E
 
Q
I
 
I
Y
 
A
E
 
A
C
 
A
I
 
I
K
 
R
Q
 
E
H
 
Q
Y
 
V
P
 
P
N
 
G
F
 
F
N
 
Q
I
 
I
T
 
R
Y
 
Y
K
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
Y
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
Q
T
 
G
W
 
W
P
 
P
D
 
D
S
 
S
I
 
I
D
 
D
D
 
D
S
 
S
A
 
V
A
 
A
Q
 
R
N
 
A
D
 
D
W
 
W
G
 
G
W
 
W
Q
 
K
H
 
A
S
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
E
 
K
E
 
E
M
 
M
T
 
V
K
 
A
D
 
D
I
 
M
L
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
L
P
 
K
A
 
A

2yy7A Crystal structure of thermolabile l-threonine dehydrogenase from flavobacterium frigidimaris kuc-1 (see paper)
57% identity, 94% coverage: 11:317/325 of query aligns to 5:311/312 of 2yy7A

query
sites
2yy7A
I
 
I
L
 
L
I
 
I
T
 
I
G
 
G
A
 
A
A
x
C
G
|
G
Q
|
Q
L
x
I
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
A
 
K
L
 
L
A
 
R
N
 
K
M
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
T
D
 
E
R
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
S
D
|
D
I
|
I
N
x
R
E
 
K
A
 
L
S
 
N
A
 
T
Y
 
D
K
 
V
F
 
V
D
 
N
Y
 
S
C
 
G
R
 
P
F
 
F
M
 
E
A
 
V
L
x
V
D
x
N
V
x
A
M
 
L
D
 
D
R
 
F
K
 
N
R
 
Q
M
 
I
T
 
E
E
 
H
I
 
L
V
 
V
K
 
E
A
 
V
E
 
H
K
 
K
V
 
I
T
 
T
Q
 
D
I
 
I
Y
 
Y
H
 
L
L
x
M
A
|
A
A
 
A
I
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
A
T
 
T
S
 
A
E
 
E
K
 
K
N
 
N
P
 
P
I
 
A
F
 
F
A
 
A
W
 
W
N
 
D
L
|
L
N
 
N
M
 
M
E
 
N
S
 
S
L
 
L
L
 
F
S
 
H
I
 
V
L
 
L
E
 
N
I
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
A
Q
 
K
K
 
K
L
 
I
N
 
K
K
 
K
I
 
I
Y
 
F
W
 
W
P
|
P
S
 
S
S
|
S
I
 
I
A
 
A
V
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
N
 
T
T
 
T
P
 
P
M
 
K
Q
 
E
H
 
N
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
Y
C
 
T
I
 
I
M
 
M
D
 
E
P
 
P
N
 
S
T
 
T
V
 
V
Y
|
Y
G
 
G
I
 
I
S
 
S
K
|
K
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
R
W
 
W
C
 
C
A
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
F
 
H
E
 
N
K
 
I
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
V
R
 
R
S
 
S
L
 
I
R
 
R
Y
|
Y
P
 
P
G
 
G
L
|
L
I
 
I
G
 
S
Y
 
W
K
 
S
S
 
T
M
 
P
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
|
G
T
|
T
T
|
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
I
F
 
F
H
 
Y
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
A
G
 
D
E
 
K
D
 
K
F
 
Y
E
 
E
C
 
C
F
 
F
L
 
L
E
 
S
E
 
S
D
 
E
T
 
T
Y
 
K
L
 
M
P
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
D
 
D
D
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
D
A
 
A
T
 
T
L
 
I
D
 
N
L
 
I
M
 
M
H
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
V
A
 
E
Q
 
K
I
 
I
K
 
K
V
 
I
R
 
H
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
N
 
N
L
 
L
G
 
A
G
 
A
I
 
M
S
 
S
F
 
F
S
 
T
P
 
P
K
 
T
E
 
E
I
 
I
Y
 
A
E
 
N
C
 
E
I
 
I
K
 
K
Q
 
K
H
 
H
Y
 
I
P
 
P
N
 
E
F
 
F
N
 
T
I
 
I
T
 
T
Y
 
Y
K
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
D
T
 
S
W
|
W
P
 
P
D
 
A
S
 
S
I
 
I
D
 
D
D
 
D
S
 
S
A
 
Q
A
 
A
Q
 
R
N
 
E
D
 
D
W
 
W
G
 
D
W
 
W
Q
 
K
H
 
H
S
 
T
Y
 
F
G
 
D
L
 
L
E
 
E
E
 
S
M
 
M
T
 
T
K
 
K
D
 
D
I
 
M
L
 
I
A
 
E
N
 
H
L
 
L

3wmwB Gale-like l-threonine dehydrogenase from cupriavidus necator (apo form) (see paper)
53% identity, 94% coverage: 11:317/325 of query aligns to 4:277/278 of 3wmwB

query
sites
3wmwB
I
 
I
L
 
L
I
 
I
T
 
V
G
 
G
A
 
-
A
 
-
G
 
G
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
S
 
S
E
 
E
L
 
L
T
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
E
M
 
R
Y
 
Y
G
 
G
G
 
R
D
 
T
R
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
T
T
 
S
D
 
D
I
 
-
N
 
-
E
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
K
 
-
F
 
-
D
 
-
Y
 
-
C
 
-
R
 
-
F
 
-
M
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
M
 
-
D
 
-
R
 
-
K
 
G
R
 
E
M
 
L
T
 
A
E
 
T
I
 
V
V
 
V
K
 
E
A
 
R
E
 
H
K
 
G
V
 
I
T
 
T
Q
 
Q
I
 
V
Y
 
Y
H
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
-
L
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
-
S
 
-
E
 
-
K
 
-
N
 
-
P
 
P
I
 
Q
F
 
W
A
 
A
W
 
W
N
 
N
L
 
L
N
 
N
M
 
M
E
 
T
S
 
S
L
 
L
L
 
L
S
 
N
I
 
V
L
 
L
E
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
Q
 
T
K
 
G
L
 
L
N
 
E
K
 
R
I
 
V
Y
 
F
W
 
W
P
 
P
S
 
S
S
 
S
I
 
I
A
 
A
V
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
P
N
 
T
T
 
T
P
 
P
M
 
A
Q
 
G
H
 
Q
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
K
C
 
T
I
 
V
M
 
M
D
 
E
P
 
P
N
 
T
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
I
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
G
W
 
W
C
 
C
A
x
R
Y
 
W
Y
 
Y
F
 
H
E
 
A
K
 
N
F
 
H
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
V
R
 
R
S
 
S
L
 
V
R
 
R
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
S
Y
 
H
K
 
K
S
 
T
M
 
P
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
I
F
 
F
H
 
H
K
 
A
A
 
A
I
 
V
E
 
T
G
 
G
E
 
E
D
 
P
F
 
Y
E
 
T
C
 
C
F
 
F
L
 
L
E
 
K
E
 
E
D
 
D
T
x
E
Y
x
A
L
 
L
P
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
D
 
P
D
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
I
D
 
E
L
 
L
M
 
M
H
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
D
Q
 
K
I
 
L
K
 
S
V
x
E
R
|
R
S
 
G
S
 
S
Y
 
Y
N
 
N
L
 
I
G
 
A
G
 
G
I
 
M
S
 
S
F
 
F
S
 
T
P
 
P
K
 
A
E
 
Q
I
 
I
Y
 
A
E
 
A
C
 
A
I
 
I
K
 
R
Q
 
E
H
 
Q
Y
 
V
P
 
P
N
 
G
F
 
F
N
 
Q
I
 
I
T
 
R
Y
 
Y
K
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
Y
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
Q
T
 
G
W
 
W
P
 
P
D
|
D
S
 
S
I
 
I
D
 
D
D
 
D
S
 
S
A
 
V
A
 
A
Q
 
R
N
 
A
D
 
D
W
 
W
G
 
G
W
 
W
Q
 
K
H
 
A
S
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
E
 
K
E
 
E
M
 
M
T
 
V
K
 
A
D
 
D
I
 
M
L
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
L

5y1gA Monomeric l-threonine 3-dehydrogenase from metagenome database (akb and nadh bound form) (see paper)
49% identity, 94% coverage: 11:317/325 of query aligns to 4:305/310 of 5y1gA

query
sites
5y1gA
I
 
I
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
L
G
|
G
Q
|
Q
L
x
I
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
V
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
N
 
E
M
 
K
Y
 
Y
G
 
G
G
 
N
D
 
D
R
 
K
I
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
S
D
|
D
I
x
L
N
 
K
E
 
E
A
 
P
S
 
E
A
 
N
Y
 
Y
K
 
-
F
 
-
D
 
-
Y
 
H
C
 
C
R
 
K
F
 
F
M
 
E
A
 
K
L
 
C
D
|
D
V
x
I
M
 
R
D
 
D
R
 
I
K
 
E
R
 
T
M
 
Y
T
 
E
E
 
R
I
 
I
V
 
N
K
 
N
A
 
E
E
 
N
K
 
K
V
 
I
T
 
E
Q
 
I
I
 
V
Y
 
Y
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
I
 
I
L
|
L
S
|
S
A
 
A
T
 
A
S
 
G
E
 
E
K
 
K
N
 
N
P
 
P
I
 
E
F
 
L
A
 
C
W
 
H
N
 
D
L
 
V
N
 
N
M
 
Y
E
 
N
S
 
G
L
 
L
L
 
E
S
 
N
I
 
V
L
 
L
E
 
K
I
 
T
A
 
A
R
 
K
E
 
K
Q
 
Y
K
 
N
L
 
-
N
 
Q
K
 
K
I
 
L
Y
 
F
W
 
C
P
 
P
S
 
S
S
 
S
I
 
I
A
 
A
V
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
N
 
D
T
 
V
P
 
P
M
 
K
Q
 
E
H
 
M
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
N
C
 
V
I
 
E
M
 
L
D
 
N
P
 
P
N
 
K
T
 
T
V
 
V
Y
|
Y
G
 
G
I
 
I
S
 
T
K
|
K
Q
 
V
A
 
K
G
 
G
E
 
E
R
 
E
W
 
L
C
 
C
A
 
D
Y
 
T
Y
 
Y
F
 
F
E
 
K
K
 
E
F
 
H
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
V
R
 
R
S
 
G
L
 
I
R
 
R
Y
|
Y
P
 
P
G
 
G
L
|
L
I
 
I
G
 
S
Y
 
W
K
 
K
S
 
H
M
 
K
P
 
P
G
 
S
G
 
G
G
|
G
T
|
T
T
|
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
E
I
 
M
F
 
Y
H
 
F
K
 
D
A
 
A
I
 
V
E
 
E
G
 
S
E
 
G
D
 
K
F
 
Y
E
 
E
C
 
C
F
 
F
L
 
V
E
 
N
E
 
R
D
 
N
T
 
T
Y
 
R
L
 
L
P
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
F
M
 
M
D
 
D
D
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
E
L
 
L
M
 
M
H
 
D
A
 
A
P
 
P
A
 
L
A
 
D
Q
 
S
I
 
L
K
 
N
V
 
Y
R
 
H
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
N
 
N
L
 
L
G
 
S
G
 
S
I
 
M
S
 
S
F
 
F
S
 
S
P
 
A
K
 
E
E
 
E
I
 
L
Y
 
E
E
 
K
C
 
E
I
 
I
K
 
S
Q
 
A
H
 
H
Y
 
V
P
 
-
N
 
D
F
 
F
N
 
N
I
 
C
T
 
L
Y
 
Y
K
 
K
P
 
P
D
 
D
F
 
Y
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
D
T
 
T
W
|
W
P
 
P
D
 
I
S
 
S
I
 
I
D
 
N
D
 
D
S
 
D
A
 
D
A
 
A
Q
 
R
N
 
K
D
 
D
W
 
W
G
 
G
W
 
W
Q
 
E
H
 
P
S
 
K
Y
 
F
G
 
D
L
 
I
E
 
S
E
 
K
M
 
M
T
 
T
K
 
E
D
 
E
I
 
M
L
 
I
A
 
T
N
 
N
L
 
L

5y1fA Monomeric l-threonine 3-dehydrogenase from metagenome database (NAD+ bound form) (see paper)
49% identity, 94% coverage: 11:317/325 of query aligns to 5:306/311 of 5y1fA

query
sites
5y1fA
I
 
I
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
L
G
|
G
Q
|
Q
L
x
I
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
V
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
N
 
E
M
 
K
Y
 
Y
G
 
G
G
 
N
D
 
D
R
 
K
I
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
S
D
|
D
I
x
L
N
 
K
E
 
E
A
 
P
S
 
E
A
 
N
Y
 
Y
K
 
-
F
 
-
D
 
-
Y
 
H
C
 
C
R
 
K
F
 
F
M
 
E
A
 
K
L
 
C
D
|
D
V
x
I
M
 
R
D
 
D
R
 
I
K
 
E
R
 
T
M
 
Y
T
 
E
E
 
R
I
 
I
V
 
N
K
 
N
A
 
E
E
 
N
K
 
K
V
 
I
T
 
E
Q
 
I
I
 
V
Y
 
Y
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
I
 
I
L
|
L
S
 
S
A
 
A
T
 
A
S
 
G
E
 
E
K
 
K
N
 
N
P
 
P
I
 
E
F
 
L
A
 
C
W
 
H
N
 
D
L
 
V
N
 
N
M
 
Y
E
 
N
S
 
G
L
 
L
L
 
E
S
 
N
I
 
V
L
 
L
E
 
K
I
 
T
A
 
A
R
 
K
E
 
K
Q
 
Y
K
 
N
L
 
-
N
 
Q
K
 
K
I
 
L
Y
 
F
W
 
C
P
 
P
S
 
S
S
|
S
I
 
I
A
 
A
V
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
N
 
D
T
 
V
P
 
P
M
 
K
Q
 
E
H
 
M
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
N
C
 
V
I
 
E
M
 
L
D
 
N
P
 
P
N
 
K
T
 
T
V
 
V
Y
|
Y
G
 
G
I
 
I
S
 
T
K
|
K
Q
 
V
A
 
K
G
 
G
E
 
E
R
 
E
W
 
L
C
 
C
A
 
D
Y
 
T
Y
 
Y
F
 
F
E
 
K
K
 
E
F
 
H
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
V
R
 
R
S
 
G
L
 
I
R
 
R
Y
|
Y
P
 
P
G
 
G
L
|
L
I
 
I
G
 
S
Y
 
W
K
 
K
S
 
H
M
 
K
P
 
P
G
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
E
I
 
M
F
 
Y
H
 
F
K
 
D
A
 
A
I
 
V
E
 
E
G
 
S
E
 
G
D
 
K
F
 
Y
E
 
E
C
 
C
F
 
F
L
 
V
E
 
N
E
 
R
D
 
N
T
 
T
Y
 
R
L
 
L
P
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
F
M
 
M
D
 
D
D
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
E
L
 
L
M
 
M
H
 
D
A
 
A
P
 
P
A
 
L
A
 
D
Q
 
S
I
 
L
K
 
N
V
 
Y
R
 
H
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
N
 
N
L
 
L
G
 
S
G
 
S
I
 
M
S
 
S
F
 
F
S
 
S
P
 
A
K
 
E
E
 
E
I
 
L
Y
 
E
E
 
K
C
 
E
I
 
I
K
 
S
Q
 
A
H
 
H
Y
 
V
P
 
-
N
 
D
F
 
F
N
 
N
I
 
C
T
 
L
Y
 
Y
K
 
K
P
 
P
D
 
D
F
 
Y
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
D
T
 
T
W
 
W
P
 
P
D
 
I
S
 
S
I
 
I
D
 
N
D
 
D
S
 
D
A
 
D
A
 
A
Q
 
R
N
 
K
D
 
D
W
 
W
G
 
G
W
 
W
Q
 
E
H
 
P
S
 
K
Y
 
F
G
 
D
L
 
I
E
 
S
E
 
K
M
 
M
T
 
T
K
 
E
D
 
E
I
 
M
L
 
I
A
 
T
N
 
N
L
 
L

5y1eA Monomeric l-threonine 3-dehydrogenase from metagenome database (l-ser and NAD+ bound form) (see paper)
49% identity, 94% coverage: 11:317/325 of query aligns to 2:303/308 of 5y1eA

query
sites
5y1eA
I
 
I
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
L
G
|
G
Q
|
Q
L
x
I
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
V
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
N
 
E
M
 
K
Y
 
Y
G
 
G
G
 
N
D
 
D
R
 
K
I
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
S
D
|
D
I
x
L
N
 
K
E
 
E
A
 
P
S
 
E
A
 
N
Y
 
Y
K
 
-
F
 
-
D
 
-
Y
 
H
C
 
C
R
 
K
F
 
F
M
 
E
A
 
K
L
 
C
D
|
D
V
x
I
M
 
R
D
 
D
R
 
I
K
 
E
R
 
T
M
 
Y
T
 
E
E
 
R
I
 
I
V
 
N
K
 
N
A
 
E
E
 
N
K
 
K
V
 
I
T
 
E
Q
 
I
I
 
V
Y
 
Y
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
I
 
I
L
|
L
S
|
S
A
 
A
T
 
A
S
 
G
E
 
E
K
 
K
N
 
N
P
 
P
I
 
E
F
 
L
A
 
C
W
 
H
N
 
D
L
 
V
N
 
N
M
 
Y
E
 
N
S
 
G
L
 
L
L
 
E
S
 
N
I
 
V
L
 
L
E
 
K
I
 
T
A
 
A
R
 
K
E
 
K
Q
 
Y
K
 
N
L
 
-
N
 
Q
K
 
K
I
 
L
Y
 
F
W
 
C
P
|
P
S
 
S
S
|
S
I
 
I
A
 
A
V
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
N
 
D
T
 
V
P
 
P
M
 
K
Q
 
E
H
 
M
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
N
C
 
V
I
 
E
M
 
L
D
 
N
P
 
P
N
 
K
T
 
T
V
 
V
Y
|
Y
G
 
G
I
 
I
S
 
T
K
|
K
Q
 
V
A
 
K
G
 
G
E
 
E
R
 
E
W
 
L
C
 
C
A
 
D
Y
 
T
Y
 
Y
F
 
F
E
 
K
K
 
E
F
 
H
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
V
R
 
R
S
 
G
L
 
I
R
 
R
Y
|
Y
P
 
P
G
 
G
L
|
L
I
 
I
G
 
S
Y
 
W
K
 
K
S
 
H
M
 
K
P
 
P
G
 
S
G
 
G
G
|
G
T
|
T
T
|
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
E
I
 
M
F
 
Y
H
 
F
K
 
D
A
 
A
I
 
V
E
 
E
G
 
S
E
 
G
D
 
K
F
 
Y
E
 
E
C
 
C
F
 
F
L
 
V
E
 
N
E
 
R
D
 
N
T
 
T
Y
 
R
L
 
L
P
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
F
M
 
M
D
 
D
D
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
E
L
 
L
M
 
M
H
 
D
A
 
A
P
 
P
A
 
L
A
 
D
Q
 
S
I
 
L
K
 
N
V
 
Y
R
 
H
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
N
 
N
L
 
L
G
 
S
G
 
S
I
 
M
S
 
S
F
 
F
S
 
S
P
 
A
K
 
E
E
 
E
I
 
L
Y
 
E
E
 
K
C
 
E
I
 
I
K
 
S
Q
 
A
H
 
H
Y
 
V
P
 
-
N
 
D
F
 
F
N
 
N
I
 
C
T
 
L
Y
 
Y
K
 
K
P
 
P
D
 
D
F
 
Y
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
D
T
 
T
W
 
W
P
 
P
D
 
I
S
 
S
I
 
I
D
 
N
D
 
D
S
 
D
A
 
D
A
 
A
Q
 
R
N
 
K
D
 
D
W
 
W
G
 
G
W
 
W
Q
 
E
H
 
P
S
 
K
Y
 
F
G
 
D
L
 
I
E
 
S
E
 
K
M
 
M
T
 
T
K
 
E
D
 
E
I
 
M
L
 
I
A
 
T
N
 
N
L
 
L

6jygD Crystal structure of l-threonine dehydrogenase from phytophthora infestans (see paper)
47% identity, 96% coverage: 11:321/325 of query aligns to 3:307/307 of 6jygD

query
sites
6jygD
I
 
I
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
T
G
|
G
Q
|
Q
L
x
I
G
 
G
S
 
M
E
 
E
L
 
L
T
 
V
L
 
P
A
 
Y
L
 
M
A
 
R
N
 
Q
M
 
L
Y
 
F
G
 
G
G
 
A
D
 
D
R
 
T
I
 
I
I
 
V
A
 
N
T
 
S
D
|
D
I
|
I
N
x
K
E
 
A
A
 
P
S
 
G
A
 
R
-
 
D
Y
 
G
K
 
N
F
 
F
D
 
V
Y
 
Y
C
 
C
R
 
-
F
 
-
M
 
-
A
 
-
L
 
-
D
|
D
V
|
V
M
 
Q
D
 
D
R
 
R
K
 
D
R
 
S
M
 
M
T
 
A
E
 
R
I
 
I
V
 
V
K
 
T
A
 
E
E
 
Q
K
 
G
V
 
V
T
 
D
Q
 
T
I
 
I
Y
 
V
H
 
H
L
x
M
A
|
A
A
x
S
I
 
L
L
|
L
S
|
S
A
 
A
T
 
V
S
 
G
E
 
E
K
 
A
N
 
N
P
 
P
I
 
S
F
 
L
A
 
A
W
 
L
N
 
S
L
x
V
N
 
N
M
 
T
E
 
R
S
 
G
L
 
I
L
 
Q
S
 
N
I
 
V
L
 
L
E
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
Q
Q
 
Y
K
 
Q
L
 
L
N
 
-
K
 
R
I
 
V
Y
 
F
W
 
A
P
|
P
S
|
S
S
x
T
I
 
I
A
 
A
V
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
N
 
S
T
 
T
P
 
P
M
 
Q
Q
 
D
H
 
E
T
 
T
P
 
P
Q
 
D
D
 
T
C
 
T
I
 
I
M
 
M
D
 
R
P
 
P
N
 
T
T
 
T
V
 
M
Y
|
Y
G
 
G
I
 
L
S
 
T
K
|
K
Q
 
V
A
 
H
G
 
V
E
 
E
R
 
L
W
 
L
C
 
G
A
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
F
 
Y
E
 
N
K
 
K
F
 
F
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
F
R
 
R
S
 
S
L
 
V
R
 
R
Y
|
Y
P
 
P
G
 
G
L
x
V
I
 
I
G
 
S
Y
 
S
K
 
E
S
 
A
M
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
|
G
T
 
T
T
|
T
D
|
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
E
I
 
I
F
 
F
H
 
Y
K
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
K
G
 
H
E
 
G
D
 
K
F
 
Y
E
 
T
C
 
C
F
 
F
L
 
L
E
 
N
E
 
R
D
 
D
T
 
A
Y
 
K
L
 
L
P
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
D
 
P
D
 
D
A
 
C
I
 
L
K
 
K
A
 
A
T
 
T
L
 
M
D
 
G
L
 
L
M
 
I
H
 
N
A
 
A
P
 
P
A
 
N
A
 
D
Q
 
C
I
 
L
K
 
S
V
 
Q
R
 
R
S
 
-
S
 
T
Y
 
Y
N
 
N
L
 
I
G
 
T
G
 
A
I
 
V
S
 
S
F
 
F
S
 
T
P
 
P
K
 
E
E
 
E
I
 
I
Y
 
V
E
 
A
C
 
S
I
 
I
K
 
Q
Q
 
K
H
 
V
Y
 
M
P
 
P
N
 
S
F
 
F
N
 
Q
I
 
C
T
 
D
Y
 
Y
K
 
K
P
 
P
D
 
D
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
D
 
E
T
 
T
W
 
W
P
 
P
D
 
R
S
 
S
I
 
I
D
 
D
D
 
D
S
 
S
A
 
I
A
 
A
Q
 
R
N
 
K
D
 
D
W
 
W
G
 
N
W
 
W
Q
 
Q
H
 
H
S
 
D
Y
 
F
G
 
D
L
 
L
E
 
D
E
 
S
M
 
M
T
 
V
K
 
E
D
 
D
I
 
M
L
 
L
A
 
V
N
 
K
L
 
L
P
 
D
A
 
A
Y
 
K
L
 
L

3a4vA Crystal structure of pyruvate bound l-threonine dehydrogenase from hyperthermophilic archaeon thermoplasma volcanium (see paper)
45% identity, 94% coverage: 11:317/325 of query aligns to 2:305/311 of 3a4vA

query
sites
3a4vA
I
 
I
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
x
S
G
|
G
Q
|
Q
L
x
I
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
V
L
 
P
A
 
Y
L
 
L
A
 
A
N
 
E
M
 
K
Y
 
Y
G
 
G
G
 
K
D
 
K
R
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
S
D
|
D
I
|
I
N
 
V
E
 
Q
A
 
R
S
 
D
A
 
T
Y
 
-
K
 
-
F
 
-
D
 
G
Y
 
G
C
 
I
R
 
K
F
 
F
M
 
I
A
 
T
L
|
L
D
|
D
V
|
V
M
 
S
D
 
N
R
 
R
K
 
D
R
 
E
M
 
I
T
 
D
E
 
R
I
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
K
E
 
Y
K
 
S
V
 
I
T
 
D
Q
 
A
I
 
I
Y
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
x
G
I
 
I
L
|
L
S
|
S
A
 
A
T
 
K
S
 
G
E
 
E
K
 
K
N
 
D
P
 
P
I
 
A
F
 
L
A
 
A
W
 
Y
N
 
K
L
 
V
N
 
N
M
 
M
E
 
N
S
 
G
L
 
T
L
 
Y
S
 
N
I
 
I
L
 
L
E
 
E
I
 
A
A
 
A
R
 
K
E
 
Q
Q
 
H
K
 
R
L
 
V
N
 
E
K
 
K
I
 
V
Y
 
V
W
 
I
P
|
P
S
|
S
S
x
T
I
 
I
A
 
G
V
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
N
 
E
T
 
T
P
 
P
M
 
K
Q
 
N
H
 
K
T
 
V
P
 
P
Q
 
S
D
 
I
C
 
T
I
 
I
M
 
T
D
 
R
P
 
P
N
 
R
T
 
T
V
 
M
Y
|
Y
G
 
G
I
 
V
S
 
T
K
|
K
Q
 
I
A
 
A
G
 
A
E
 
E
R
 
L
W
 
L
C
 
G
A
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
F
 
Y
E
 
E
K
 
K
F
 
F
G
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
V
R
 
R
S
 
S
L
 
L
R
 
R
Y
|
Y
P
 
P
G
 
G
L
x
I
I
 
I
G
 
S
Y
 
Y
K
 
K
S
 
A
M
 
E
P
 
P
G
 
T
G
 
A
G
 
G
T
|
T
T
|
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
E
I
 
I
F
 
F
H
 
Y
K
 
Y
A
 
A
I
 
V
E
 
K
G
 
R
E
 
E
D
 
K
F
 
Y
E
 
K
C
 
C
F
 
Y
L
 
L
E
 
A
E
 
P
D
 
N
T
 
R
Y
 
A
L
 
L
P
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
D
 
P
D
 
D
A
 
A
I
 
L
K
 
K
A
 
A
T
 
L
L
 
V
D
 
D
L
 
L
M
 
Y
H
 
E
A
 
A
P
 
D
A
 
R
A
 
D
Q
 
K
I
 
L
K
 
V
V
 
L
R
 
R
S
 
N
S
 
G
Y
 
Y
N
 
N
L
 
V
G
 
T
G
 
A
I
 
Y
S
 
T
F
 
F
S
 
T
P
 
P
K
 
S
E
 
E
I
 
L
Y
 
Y
E
 
S
C
 
K
I
 
I
K
 
K
Q
 
E
H
 
R
Y
 
I
P
 
P
N
 
E
F
 
F
N
 
E
I
 
I
T
 
E
Y
 
Y
K
 
K
P
 
E
D
 
D
F
 
F
R
 
R
Q
 
D
Q
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
A
T
 
T
W
|
W
P
 
P
D
 
E
S
 
S
I
 
L
D
 
D
D
 
S
S
 
S
A
 
E
A
 
A
Q
 
S
N
 
N
D
 
E
W
 
W
G
 
G
W
 
F
Q
 
S
H
 
I
S
 
E
Y
 
Y
G
 
D
L
 
L
E
 
D
E
 
R
M
 
T
T
 
I
K
 
D
D
 
D
I
 
M
L
 
I
A
 
D
N
 
H
L
 
I

3a1nA Crystal structure of l-threonine dehydrogenase from hyperthermophilic archaeon thermoplasma volcanium (see paper)
44% identity, 96% coverage: 11:321/325 of query aligns to 2:309/315 of 3a1nA

query
sites
3a1nA
I
 
I
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
x
S
G
|
G
Q
|
Q
L
x
I
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
V
L
 
P
A
 
Y
L
 
L
A
 
A
N
 
E
M
 
K
Y
 
Y
G
 
G
G
 
K
D
 
K
R
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
S
D
|
D
I
|
I
N
 
V
E
 
Q
A
 
R
S
 
D
A
 
T
Y
 
-
K
 
-
F
 
-
D
 
G
Y
 
G
C
 
I
R
 
K
F
 
F
M
 
I
A
 
T
L
|
L
D
|
D
V
 
V
M
 
S
D
 
N
R
 
R
K
 
D
R
 
E
M
 
I
T
 
D
E
 
R
I
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
K
E
 
Y
K
 
S
V
 
I
T
 
D
Q
 
A
I
 
I
Y
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
x
G
I
 
I
L
|
L
S
 
S
A
 
A
T
 
K
S
 
G
E
 
E
K
 
K
N
 
D
P
 
P
I
 
A
F
 
L
A
 
A
W
 
Y
N
 
K
L
 
V
N
 
N
M
 
M
E
 
N
S
 
G
L
 
T
L
 
Y
S
 
N
I
 
I
L
 
L
E
 
E
I
 
A
A
 
A
R
 
K
E
 
Q
Q
 
H
K
 
R
L
 
V
N
 
E
K
 
K
I
 
V
Y
 
V
W
 
I
P
 
P
S
|
S
S
x
T
I
 
I
A
 
G
V
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
N
 
E
T
 
T
P
 
P
M
 
K
Q
 
N
H
 
K
T
 
V
P
 
P
Q
 
S
D
 
I
C
 
T
I
 
I
M
 
T
D
 
R
P
 
P
N
 
R
T
 
T
V
 
M
Y
|
Y
G
 
G
I
 
V
S
 
T
K
|
K
Q
 
I
A
 
A
G
 
A
E
 
E
R
 
L
W
 
L
C
 
G
A
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
F
 
Y
E
 
E
K
 
K
F
 
F
G
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
V
R
 
R
S
 
S
L
 
L
R
 
R
Y
|
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
I
I
 
I
G
 
S
Y
 
Y
K
 
K
S
 
A
M
 
E
P
 
P
G
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
E
I
 
I
F
 
F
H
 
Y
K
 
Y
A
 
A
I
 
V
E
 
K
G
 
R
E
 
E
D
 
K
F
 
Y
E
 
K
C
 
C
F
 
Y
L
 
L
E
 
A
E
 
P
D
 
N
T
 
R
Y
 
A
L
 
L
P
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
D
 
P
D
 
D
A
 
A
I
 
L
K
 
K
A
 
A
T
 
L
L
 
V
D
 
D
L
 
L
M
 
Y
H
 
E
A
 
A
P
 
D
A
 
R
A
 
D
Q
 
K
I
 
L
K
 
V
V
 
L
R
 
R
S
 
N
S
 
G
Y
 
Y
N
 
N
L
 
V
G
 
T
G
 
A
I
 
Y
S
 
T
F
 
F
S
 
T
P
 
P
K
 
S
E
 
E
I
 
L
Y
 
Y
E
 
S
C
 
K
I
 
I
K
 
K
Q
 
E
H
 
R
Y
 
I
P
 
P
N
 
E
F
 
F
N
 
E
I
 
I
T
 
E
Y
 
Y
K
 
K
P
 
E
D
 
D
F
 
F
R
 
R
Q
 
D
Q
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
A
T
 
T
W
 
W
P
 
P
D
 
E
S
 
S
I
 
L
D
 
D
D
 
S
S
 
S
A
 
E
A
 
A
Q
 
S
N
 
N
D
 
E
W
 
W
G
 
G
W
 
F
Q
 
S
H
 
I
S
 
E
Y
 
Y
G
 
D
L
 
L
E
 
D
E
 
R
M
 
T
T
 
I
K
 
D
D
 
D
I
 
M
L
 
I
A
 
D
N
 
H
L
 
I
P
 
S
A
 
E
Y
 
K
L
 
L

3ajrA Crystal structure of l-3-hydroxynorvaline bound l-threonine dehydrogenase (y137f) from hyperthermophilic archaeon thermoplasma volcanium (see paper)
44% identity, 96% coverage: 11:321/325 of query aligns to 2:309/314 of 3ajrA

query
sites
3ajrA
I
 
I
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
x
S
G
|
G
Q
|
Q
L
x
I
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
V
L
 
P
A
 
Y
L
 
L
A
 
A
N
 
E
M
 
K
Y
 
Y
G
 
G
G
 
K
D
 
K
R
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
S
D
|
D
I
|
I
N
 
V
E
 
Q
A
 
R
S
 
D
A
 
T
Y
 
-
K
 
-
F
 
-
D
 
G
Y
 
G
C
 
I
R
 
K
F
 
F
M
 
I
A
 
T
L
|
L
D
|
D
V
|
V
M
 
S
D
 
N
R
 
R
K
 
D
R
 
E
M
 
I
T
 
D
E
 
R
I
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
K
E
 
Y
K
 
S
V
 
I
T
 
D
Q
 
A
I
 
I
Y
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
x
G
I
 
I
L
|
L
S
|
S
A
 
A
T
 
K
S
 
G
E
 
E
K
 
K
N
 
D
P
 
P
I
 
A
F
 
L
A
 
A
W
 
Y
N
 
K
L
 
V
N
 
N
M
 
M
E
 
N
S
 
G
L
 
T
L
 
Y
S
 
N
I
 
I
L
 
L
E
 
E
I
 
A
A
 
A
R
 
K
E
 
Q
Q
 
H
K
 
R
L
 
V
N
 
E
K
 
K
I
 
V
Y
 
V
W
 
I
P
|
P
S
|
S
S
x
T
I
|
I
A
 
G
V
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
N
 
E
T
 
T
P
 
P
M
 
K
Q
 
N
H
 
K
T
 
V
P
 
P
Q
 
S
D
 
I
C
 
T
I
 
I
M
 
T
D
 
R
P
 
P
N
 
R
T
 
T
V
 
M
Y
x
F
G
 
G
I
 
V
S
 
T
K
|
K
Q
 
I
A
 
A
G
 
A
E
 
E
R
 
L
W
 
L
C
 
G
A
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
F
 
Y
E
 
E
K
 
K
F
 
F
G
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
V
R
 
R
S
 
S
L
 
L
R
 
R
Y
|
Y
P
 
P
G
 
G
L
x
I
I
 
I
G
 
S
Y
 
Y
K
 
K
S
 
A
M
 
E
P
 
P
G
 
T
G
 
A
G
|
G
T
|
T
T
|
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
E
I
 
I
F
 
F
H
 
Y
K
 
Y
A
 
A
I
 
V
E
 
K
G
 
R
E
 
E
D
 
K
F
 
Y
E
 
K
C
 
C
F
 
Y
L
 
L
E
 
A
E
 
P
D
 
N
T
 
R
Y
 
A
L
 
L
P
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
D
 
P
D
 
D
A
 
A
I
 
L
K
 
K
A
 
A
T
 
L
L
 
V
D
 
D
L
 
L
M
 
Y
H
 
E
A
 
A
P
 
D
A
 
R
A
 
D
Q
 
K
I
 
L
K
 
V
V
 
L
R
 
R
S
 
N
S
 
G
Y
 
Y
N
 
N
L
 
V
G
 
T
G
 
A
I
 
Y
S
 
T
F
 
F
S
 
T
P
 
P
K
 
S
E
 
E
I
 
L
Y
 
Y
E
 
S
C
 
K
I
 
I
K
 
K
Q
 
E
H
 
R
Y
 
I
P
 
P
N
 
E
F
 
F
N
 
E
I
 
I
T
 
E
Y
 
Y
K
 
K
P
 
E
D
 
D
F
 
F
R
 
R
Q
 
D
Q
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
A
T
 
T
W
 
W
P
 
P
D
 
E
S
 
S
I
 
L
D
 
D
D
 
S
S
 
S
A
 
E
A
 
A
Q
 
S
N
 
N
D
 
E
W
 
W
G
 
G
W
 
F
Q
 
S
H
 
I
S
 
E
Y
 
Y
G
 
D
L
 
L
E
 
D
E
 
R
M
 
T
T
 
I
K
 
D
D
 
D
I
 
M
L
 
I
A
 
D
N
 
H
L
 
I
P
 
S
A
 
E
Y
 
K
L
 
L

3a9wA Crystal structure of l-threonine bound l-threonine dehydrogenase (y137f) from hyperthermophilic archaeon thermoplasma volcanium (see paper)
44% identity, 96% coverage: 11:321/325 of query aligns to 2:309/315 of 3a9wA

query
sites
3a9wA
I
 
I
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
x
S
G
|
G
Q
|
Q
L
x
I
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
V
L
 
P
A
 
Y
L
 
L
A
 
A
N
 
E
M
 
K
Y
 
Y
G
 
G
G
 
K
D
 
K
R
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
S
D
|
D
I
|
I
N
 
V
E
 
Q
A
 
R
S
 
D
A
 
T
Y
 
-
K
 
-
F
 
-
D
 
G
Y
 
G
C
 
I
R
 
K
F
 
F
M
 
I
A
 
T
L
|
L
D
|
D
V
|
V
M
 
S
D
 
N
R
 
R
K
 
D
R
 
E
M
 
I
T
 
D
E
 
R
I
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
K
E
 
Y
K
 
S
V
 
I
T
 
D
Q
 
A
I
 
I
Y
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
 
G
I
 
I
L
|
L
S
|
S
A
 
A
T
 
K
S
 
G
E
 
E
K
 
K
N
 
D
P
 
P
I
 
A
F
 
L
A
 
A
W
 
Y
N
 
K
L
x
V
N
 
N
M
 
M
E
 
N
S
 
G
L
 
T
L
 
Y
S
 
N
I
 
I
L
 
L
E
 
E
I
 
A
A
 
A
R
 
K
E
 
Q
Q
 
H
K
 
R
L
 
V
N
 
E
K
 
K
I
 
V
Y
 
V
W
 
I
P
|
P
S
|
S
S
x
T
I
 
I
A
 
G
V
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
N
 
E
T
 
T
P
 
P
M
 
K
Q
 
N
H
 
K
T
 
V
P
 
P
Q
 
S
D
 
I
C
 
T
I
 
I
M
 
T
D
 
R
P
 
P
N
 
R
T
 
T
V
 
M
Y
x
F
G
 
G
I
 
V
S
 
T
K
|
K
Q
 
I
A
 
A
G
 
A
E
 
E
R
 
L
W
 
L
C
 
G
A
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
F
 
Y
E
 
E
K
 
K
F
 
F
G
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
V
R
 
R
S
 
S
L
 
L
R
 
R
Y
|
Y
P
 
P
G
 
G
L
x
I
I
 
I
G
 
S
Y
 
Y
K
 
K
S
 
A
M
 
E
P
 
P
G
 
T
G
 
A
G
|
G
T
|
T
T
|
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
E
I
 
I
F
 
F
H
 
Y
K
 
Y
A
 
A
I
 
V
E
 
K
G
 
R
E
 
E
D
 
K
F
 
Y
E
 
K
C
 
C
F
 
Y
L
 
L
E
 
A
E
 
P
D
 
N
T
 
R
Y
 
A
L
 
L
P
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
D
 
P
D
 
D
A
 
A
I
 
L
K
 
K
A
 
A
T
 
L
L
 
V
D
 
D
L
 
L
M
 
Y
H
 
E
A
 
A
P
 
D
A
 
R
A
 
D
Q
 
K
I
 
L
K
 
V
V
 
L
R
 
R
S
 
N
S
 
G
Y
 
Y
N
 
N
L
 
V
G
 
T
G
 
A
I
 
Y
S
 
T
F
 
F
S
 
T
P
 
P
K
 
S
E
 
E
I
 
L
Y
 
Y
E
 
S
C
 
K
I
 
I
K
 
K
Q
 
E
H
 
R
Y
 
I
P
 
P
N
 
E
F
 
F
N
 
E
I
 
I
T
 
E
Y
 
Y
K
 
K
P
 
E
D
 
D
F
 
F
R
 
R
Q
 
D
Q
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
A
T
 
T
W
 
W
P
 
P
D
 
E
S
 
S
I
 
L
D
 
D
D
 
S
S
 
S
A
 
E
A
 
A
Q
 
S
N
 
N
D
 
E
W
 
W
G
 
G
W
 
F
Q
 
S
H
 
I
S
 
E
Y
 
Y
G
 
D
L
 
L
E
 
D
E
 
R
M
 
T
T
 
I
K
 
D
D
 
D
I
 
M
L
 
I
A
 
D
N
 
H
L
 
I
P
 
S
A
 
E
Y
 
K
L
 
L

Q8K3F7 L-threonine 3-dehydrogenase, mitochondrial; EC 1.1.1.103 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
43% identity, 94% coverage: 11:314/325 of query aligns to 58:360/373 of Q8K3F7

query
sites
Q8K3F7
I
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
x
G
A
x
L
G
|
G
Q
|
Q
L
|
L
G
 
G
S
 
V
E
 
G
L
 
L
T
 
A
L
 
N
A
 
L
L
 
L
A
 
R
N
 
K
M
 
R
Y
 
F
G
 
G
G
 
K
D
 
D
R
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
L
T
 
S
D
|
D
I
|
I
N
x
R
E
 
K
A
 
P
S
 
P
A
 
A
Y
 
H
K
 
V
F
 
F
D
 
H
Y
 
S
C
 
G
R
 
P
F
 
F
M
 
V
A
 
Y
L
 
A
D
x
N
V
x
I
M
 
L
D
 
D
R
 
Y
K
 
K
R
 
S
M
 
L
T
 
R
E
 
E
I
 
I
V
 
V
K
 
V
A
 
N
E
 
H
K
 
R
V
 
I
T
 
S
Q
 
W
I
 
L
Y
 
F
H
 
H
L
 
Y
A
 
S
A
 
A
I
 
L
L
 
L
S
|
S
A
 
A
T
 
V
S
 
G
E
 
E
K
 
A
N
 
N
P
 
V
I
 
S
F
 
L
A
 
A
W
 
R
N
 
D
L
 
V
N
 
N
M
 
I
E
 
T
S
 
G
L
 
L
L
 
H
S
 
N
I
 
V
L
 
L
E
 
D
I
 
V
A
 
A
R
 
A
E
 
E
Q
 
Y
K
 
N
L
 
V
N
 
-
K
 
R
I
 
L
Y
 
F
W
 
V
P
 
P
S
 
S
S
 
T
I
 
I
A
 
G
V
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
P
N
 
T
T
 
S
P
 
P
M
x
R
Q
 
N
H
 
P
T
 
A
P
 
P
Q
 
D
D
 
L
C
 
C
I
 
I
M
 
Q
D
 
R
P
 
P
N
 
R
T
 
T
V
 
I
Y
|
Y
G
 
G
I
 
V
S
 
S
K
|
K
Q
 
V
A
 
H
G
 
T
E
 
E
R
 
L
W
 
M
C
 
G
A
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
F
 
Y
E
 
Y
K
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
F
R
 
R
S
 
C
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
x
I
I
 
I
G
 
S
Y
 
A
K
 
D
S
 
S
M
 
Q
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
Q
I
 
I
F
 
F
H
 
H
K
 
A
A
 
A
I
 
A
E
 
K
G
 
N
E
 
G
D
 
T
F
 
F
E
 
E
C
 
C
F
 
N
L
 
L
E
 
E
E
 
A
D
 
G
T
 
T
Y
 
R
L
 
L
P
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
I
D
 
S
D
 
D
A
 
C
I
 
L
K
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
E
L
 
V
M
 
M
H
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
E
Q
 
R
I
 
L
K
 
S
V
 
M
R
 
R
S
 
-
S
 
T
Y
 
Y
N
 
N
L
 
I
G
 
S
G
 
A
I
 
M
S
 
S
F
 
F
S
 
T
P
 
P
K
 
E
E
 
E
I
 
L
Y
 
A
E
 
Q
C
 
A
I
 
L
K
 
R
Q
 
K
H
 
H
Y
 
A
P
 
P
N
 
D
F
 
F
N
 
Q
I
 
I
T
 
T
Y
 
Y
K
 
C
P
 
V
D
 
D
-
 
P
F
 
L
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
E
T
 
S
W
 
W
P
 
P
D
x
M
S
 
I
I
 
L
D
 
D
D
 
D
S
 
S
A
 
N
A
 
A
Q
 
R
N
 
K
D
 
D
W
 
W
G
 
G
W
 
W
Q
 
K
H
 
H
S
 
D
Y
 
F
G
 
D
L
 
L
E
 
P
E
 
E
M
 
L
T
 
V
K
 
A
D
 
T
I
 
M
L
 
L

4yr9A Mouse tdh with NAD+ bound (see paper)
43% identity, 94% coverage: 11:314/325 of query aligns to 4:305/308 of 4yr9A

query
sites
4yr9A
I
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
 
L
G
|
G
Q
|
Q
L
|
L
G
 
G
S
 
V
E
 
G
L
 
L
T
 
A
L
 
N
A
 
L
L
 
L
A
 
R
N
 
K
M
 
R
Y
 
F
G
 
G
G
 
K
D
 
D
R
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
L
T
 
S
D
|
D
I
|
I
N
x
R
E
 
K
A
 
P
S
 
P
A
 
A
Y
 
H
K
 
V
F
 
F
D
 
H
Y
 
S
C
 
G
R
 
P
F
 
F
M
 
V
A
 
Y
L
x
A
D
x
N
V
x
I
M
 
L
D
 
D
R
 
Y
K
 
K
R
 
S
M
 
L
T
 
R
E
 
E
I
 
I
V
 
V
K
 
V
A
 
N
E
 
H
K
 
R
V
 
I
T
 
S
Q
 
W
I
 
L
Y
 
F
H
 
H
L
x
Y
A
x
S
A
|
A
I
 
L
L
|
L
S
 
S
A
 
A
T
 
V
S
 
G
E
 
E
K
 
A
N
 
N
P
 
V
I
 
S
F
 
L
A
 
A
W
 
R
N
 
D
L
 
V
N
 
N
M
 
I
E
 
T
S
 
G
L
 
L
L
 
H
S
 
N
I
 
V
L
 
L
E
 
D
I
 
V
A
 
A
R
 
A
E
 
E
Q
 
Y
K
 
N
L
 
V
N
 
-
K
 
R
I
 
L
Y
 
F
W
 
V
P
|
P
S
 
S
S
x
T
I
 
I
A
 
G
V
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
P
N
 
T
T
 
S
P
 
P
M
 
R
Q
 
N
H
 
P
T
 
A
P
 
P
Q
 
D
D
 
L
C
 
C
I
 
I
M
 
Q
D
 
R
P
 
P
N
 
R
T
 
T
V
 
I
Y
|
Y
G
 
G
I
 
V
S
 
S
K
|
K
Q
 
V
A
 
H
G
 
T
E
 
E
R
 
L
W
 
M
C
 
G
A
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
F
 
Y
E
 
Y
K
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
F
R
 
R
S
 
C
L
 
L
R
 
R
Y
|
Y
P
 
P
G
 
G
L
x
I
I
 
I
G
 
S
Y
 
A
K
 
D
S
 
S
M
 
-
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
Q
I
 
I
F
 
F
H
 
H
K
 
A
A
 
A
I
 
A
E
 
K
G
 
N
E
 
G
D
 
T
F
 
F
E
 
E
C
 
C
F
 
N
L
 
L
E
 
E
E
 
A
D
 
G
T
 
T
Y
 
R
L
 
L
P
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
I
D
 
S
D
 
D
A
 
C
I
 
L
K
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
E
L
 
V
M
 
M
H
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
E
Q
 
R
I
 
L
K
 
S
V
 
M
R
 
R
S
 
-
S
 
T
Y
 
Y
N
 
N
L
 
I
G
 
S
G
 
A
I
 
M
S
 
S
F
 
F
S
 
T
P
 
P
K
 
E
E
 
E
I
 
L
Y
 
A
E
 
Q
C
 
A
I
 
L
K
 
R
Q
 
K
H
 
H
Y
 
A
P
 
P
N
 
D
F
 
F
N
 
Q
I
 
I
T
 
T
Y
 
Y
K
 
C
P
 
V
D
 
D
-
 
P
F
 
L
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
E
T
 
S
W
|
W
P
 
P
D
 
M
S
 
I
I
 
L
D
 
D
D
 
D
S
 
S
A
 
N
A
 
A
Q
 
R
N
 
K
D
 
D
W
 
W
G
 
G
W
 
W
Q
 
K
H
 
H
S
 
D
Y
 
F
G
 
D
L
 
L
E
 
P
E
 
E
M
 
L
T
 
V
K
 
A
D
 
T
I
 
M
L
 
L

5lc1A L-threonine dehydrogenase from trypanosoma brucei with NAD and the inhibitor pyruvate bound. (see paper)
38% identity, 96% coverage: 8:318/325 of query aligns to 1:312/320 of 5lc1A

query
sites
5lc1A
M
 
M
E
 
P
T
 
R
I
 
V
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
L
G
|
G
Q
|
Q
L
x
I
G
 
G
S
 
T
E
 
D
L
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
R
N
 
D
M
 
K
Y
 
F
G
 
G
G
 
A
D
 
D
R
 
S
I
 
V
I
 
L
A
 
V
T
 
S
D
|
D
I
x
V
N
 
V
E
 
E
A
 
P
S
 
G
A
 
A
Y
 
-
K
 
K
F
 
H
D
 
P
Y
 
L
C
 
A
R
 
G
F
 
L
M
 
K
A
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
K
L
 
L
D
|
D
V
x
C
M
 
L
D
 
D
R
 
S
K
 
N
R
 
G
M
 
F
T
 
E
E
 
K
I
 
L
V
 
V
K
 
K
A
 
E
E
 
F
K
 
K
V
 
P
T
 
T
Q
 
W
I
 
M
Y
 
Y
H
 
H
L
|
L
A
x
P
A
|
A
I
 
I
L
x
M
S
|
S
A
 
V
T
 
R
S
 
G
E
 
E
K
 
A
N
 
E
P
 
P
I
 
D
F
 
L
A
 
A
W
 
M
N
 
D
L
 
I
N
 
N
M
 
V
E
 
N
S
 
T
L
 
T
L
 
R
S
 
Y
I
 
A
L
 
L
E
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
K
Q
 
Y
K
 
N
L
 
I
N
 
-
K
 
R
I
 
I
Y
 
F
W
 
I
P
|
P
S
 
S
S
x
T
I
 
I
A
 
A
V
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
D
N
 
K
T
 
C
P
 
G
M
 
K
Q
 
T
H
 
M
T
 
T
P
 
K
Q
 
D
D
 
D
C
 
T
I
 
I
M
 
M
D
 
N
P
 
P
N
 
S
T
 
T
V
 
V
Y
|
Y
G
 
G
I
 
V
S
 
T
K
|
K
Q
 
V
A
 
Y
G
 
T
E
 
E
R
 
L
W
 
L
C
 
G
A
 
T
Y
 
W
Y
 
Y
F
 
R
E
 
Q
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
F
R
 
R
S
 
S
L
 
V
R
 
R
Y
x
L
P
 
P
G
 
G
L
x
I
I
 
I
G
 
S
Y
 
A
K
 
A
S
 
T
M
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
|
G
T
 
A
T
|
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
I
D
 
H
I
 
M
F
 
Y
H
 
H
K
 
S
A
 
A
I
 
L
E
 
L
G
 
Q
E
 
K
D
 
K
F
 
C
E
 
V
C
 
C
F
 
P
L
 
V
E
 
L
E
 
P
D
 
Y
T
 
E
Y
 
S
L
 
L
P
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
D
 
P
D
 
D
A
 
T
I
 
L
K
 
N
A
 
S
T
 
L
L
 
V
D
 
K
L
 
I
M
 
M
H
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
L
A
 
E
Q
 
K
I
 
L
K
 
-
V
 
T
R
 
R
S
 
T
S
 
V
Y
 
Y
N
 
N
L
 
I
G
 
T
G
 
G
I
 
F
S
 
S
F
 
F
S
 
S
P
 
P
K
 
S
E
 
E
I
 
L
Y
 
R
E
 
F
C
 
S
I
 
I
K
 
E
Q
 
R
H
 
C
Y
 
T
P
 
D
-
 
R
N
 
T
F
 
I
N
 
E
I
 
V
T
 
E
Y
 
Y
K
 
V
P
 
E
D
 
G
F
 
P
R
 
A
Q
 
Q
Q
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
N
T
 
S
W
|
W
P
 
P
D
 
D
S
 
S
I
 
L
D
 
D
D
 
D
S
 
S
A
 
N
A
 
A
Q
 
R
N
 
N
D
 
D
W
 
W
G
 
G
W
 
H
Q
 
Q
H
 
V
S
 
K
Y
 
Y
G
 
D
L
 
I
E
 
D
E
 
M
M
 
M
T
 
S
K
 
E
D
 
D
I
 
M
L
 
L
A
 
R
N
 
Q
L
 
I
P
 
P

5k4wC Three-dimensional structure of l-threonine 3-dehydrogenase from trypanosoma brucei bound to nadh and l-threonine refined to 1.72 angstroms (see paper)
38% identity, 96% coverage: 8:318/325 of query aligns to 2:313/321 of 5k4wC

query
sites
5k4wC
M
 
M
E
 
P
T
 
R
I
 
V
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
L
G
|
G
Q
|
Q
L
x
I
G
 
G
S
 
T
E
 
D
L
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
R
N
 
D
M
 
K
Y
 
F
G
 
G
G
 
A
D
 
D
R
 
S
I
 
V
I
 
L
A
 
V
T
 
S
D
|
D
I
x
V
N
 
V
E
 
E
A
 
P
S
 
G
A
 
A
Y
 
-
K
 
K
F
 
H
D
 
P
Y
 
L
C
 
A
R
 
G
F
 
L
M
 
K
A
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
K
L
 
L
D
|
D
V
x
C
M
 
L
D
 
D
R
 
S
K
 
N
R
 
G
M
 
F
T
 
E
E
 
K
I
 
L
V
 
V
K
 
K
A
 
E
E
 
F
K
 
K
V
 
P
T
 
T
Q
 
W
I
 
M
Y
 
Y
H
 
H
L
|
L
A
x
P
A
|
A
I
 
I
L
x
M
S
|
S
A
 
V
T
 
R
S
 
G
E
 
E
K
 
A
N
 
E
P
 
P
I
 
D
F
 
L
A
 
A
W
 
M
N
 
D
L
 
I
N
 
N
M
 
V
E
 
N
S
 
T
L
 
T
L
 
R
S
 
Y
I
 
A
L
 
L
E
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
K
Q
 
Y
K
 
N
L
 
I
N
 
-
K
 
R
I
 
I
Y
 
F
W
 
I
P
|
P
S
 
S
S
x
T
I
 
I
A
 
A
V
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
D
N
 
K
T
 
C
P
 
G
M
 
K
Q
 
T
H
 
M
T
 
T
P
 
K
Q
 
D
D
 
D
C
 
T
I
 
I
M
 
M
D
 
N
P
 
P
N
 
S
T
 
T
V
 
V
Y
|
Y
G
 
G
I
 
V
S
 
T
K
|
K
Q
 
V
A
 
Y
G
 
T
E
 
E
R
 
L
W
 
L
C
 
G
A
 
T
Y
 
W
Y
 
Y
F
 
R
E
 
Q
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
F
R
 
R
S
 
S
L
 
V
R
 
R
Y
x
L
P
 
P
G
 
G
L
x
I
I
 
I
G
 
S
Y
 
A
K
 
A
S
 
T
M
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
I
D
 
H
I
 
M
F
 
Y
H
 
H
K
 
S
A
 
A
I
 
L
E
 
L
G
 
Q
E
 
K
D
 
K
F
 
C
E
 
V
C
 
C
F
 
P
L
 
V
E
 
L
E
 
P
D
 
Y
T
 
E
Y
 
S
L
 
L
P
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
D
 
P
D
 
D
A
 
T
I
 
L
K
 
N
A
 
S
T
 
L
L
 
V
D
 
K
L
 
I
M
 
M
H
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
L
A
 
E
Q
 
K
I
 
L
K
 
-
V
 
T
R
 
R
S
 
T
S
 
V
Y
 
Y
N
 
N
L
 
I
G
 
T
G
 
G
I
 
F
S
 
S
F
 
F
S
 
S
P
 
P
K
 
S
E
 
E
I
 
L
Y
 
R
E
 
F
C
 
S
I
 
I
K
 
E
Q
 
R
H
 
C
Y
 
T
P
 
D
-
 
R
N
 
T
F
 
I
N
 
E
I
 
V
T
 
E
Y
 
Y
K
 
V
P
 
E
D
 
G
F
 
P
R
 
A
Q
 
Q
Q
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
N
T
 
S
W
|
W
P
 
P
D
 
D
S
 
S
I
 
L
D
 
D
D
 
D
S
 
S
A
 
N
A
 
A
Q
 
R
N
 
N
D
 
D
W
 
W
G
 
G
W
 
H
Q
 
Q
H
 
V
S
 
K
Y
 
Y
G
 
D
L
 
I
E
 
D
E
 
M
M
 
M
T
 
S
K
 
E
D
 
D
I
 
M
L
 
L
A
 
R
N
 
Q
L
 
I
P
 
P

5k4qA Three-dimensional structure of l-threonine 3-dehydrogenase from trypanosoma brucei bound to NAD+ refined to 2.3 angstroms (see paper)
38% identity, 96% coverage: 8:318/325 of query aligns to 1:312/320 of 5k4qA

query
sites
5k4qA
M
 
M
E
 
P
T
 
R
I
 
V
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
L
G
|
G
Q
|
Q
L
x
I
G
 
G
S
 
T
E
 
D
L
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
R
N
 
D
M
 
K
Y
 
F
G
 
G
G
 
A
D
 
D
R
 
S
I
 
V
I
 
L
A
 
V
T
 
S
D
|
D
I
x
V
N
 
V
E
 
E
A
 
P
S
 
G
A
 
A
Y
 
-
K
 
K
F
 
H
D
 
P
Y
 
L
C
 
A
R
 
G
F
 
L
M
 
K
A
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
K
L
 
L
D
 
D
V
x
C
M
 
L
D
 
D
R
 
S
K
 
N
R
 
G
M
 
F
T
 
E
E
 
K
I
 
L
V
 
V
K
 
K
A
 
E
E
 
F
K
 
K
V
 
P
T
 
T
Q
 
W
I
 
M
Y
 
Y
H
 
H
L
|
L
A
x
P
A
|
A
I
 
I
L
x
M
S
 
S
A
 
V
T
 
R
S
 
G
E
 
E
K
 
A
N
 
E
P
 
P
I
 
D
F
 
L
A
 
A
W
 
M
N
 
D
L
 
I
N
 
N
M
 
V
E
 
N
S
 
T
L
 
T
L
 
R
S
 
Y
I
 
A
L
 
L
E
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
K
Q
 
Y
K
 
N
L
 
I
N
 
-
K
 
R
I
 
I
Y
 
F
W
 
I
P
|
P
S
|
S
S
 
T
I
 
I
A
 
A
V
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
D
N
 
K
T
 
C
P
 
G
M
 
K
Q
 
T
H
 
M
T
 
T
P
 
K
Q
 
D
D
 
D
C
 
T
I
 
I
M
 
M
D
 
N
P
 
P
N
 
S
T
 
T
V
 
V
Y
|
Y
G
 
G
I
 
V
S
 
T
K
|
K
Q
 
V
A
 
Y
G
 
T
E
 
E
R
 
L
W
 
L
C
 
G
A
 
T
Y
 
W
Y
 
Y
F
 
R
E
 
Q
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
F
R
 
R
S
 
S
L
 
V
R
 
R
Y
x
L
P
 
P
G
 
G
L
x
I
I
 
I
G
 
S
Y
 
A
K
 
A
S
 
T
M
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
I
D
 
H
I
 
M
F
 
Y
H
 
H
K
 
S
A
 
A
I
 
L
E
 
L
G
 
Q
E
 
K
D
 
K
F
 
C
E
 
V
C
 
C
F
 
P
L
 
V
E
 
L
E
 
P
D
 
Y
T
 
E
Y
 
S
L
 
L
P
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
D
 
P
D
 
D
A
 
T
I
 
L
K
 
N
A
 
S
T
 
L
L
 
V
D
 
K
L
 
I
M
 
M
H
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
L
A
 
E
Q
 
K
I
 
L
K
 
-
V
 
T
R
 
R
S
 
T
S
 
V
Y
 
Y
N
 
N
L
 
I
G
 
T
G
 
G
I
 
F
S
 
S
F
 
F
S
 
S
P
 
P
K
 
S
E
 
E
I
 
L
Y
 
R
E
 
F
C
 
S
I
 
I
K
 
E
Q
 
R
H
 
C
Y
 
T
P
 
D
-
 
R
N
 
T
F
 
I
N
 
E
I
 
V
T
 
E
Y
 
Y
K
 
V
P
 
E
D
 
G
F
 
P
R
 
A
Q
 
Q
Q
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
N
T
 
S
W
 
W
P
 
P
D
 
D
S
 
S
I
 
L
D
 
D
D
 
D
S
 
S
A
 
N
A
 
A
Q
 
R
N
 
N
D
 
D
W
 
W
G
 
G
W
 
H
Q
 
Q
H
 
V
S
 
K
Y
 
Y
G
 
D
L
 
I
E
 
D
E
 
M
M
 
M
T
 
S
K
 
E
D
 
D
I
 
M
L
 
L
A
 
R
N
 
Q
L
 
I
P
 
P

5k50C Three-dimensional structure of l-threonine 3-dehydrogenase from trypanosoma brucei bound to NAD+ and l-allo-threonine refined to 2.23 angstroms (see paper)
38% identity, 95% coverage: 11:318/325 of query aligns to 3:311/319 of 5k50C

query
sites
5k50C
I
 
V
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
L
G
|
G
Q
|
Q
L
x
I
G
 
G
S
 
T
E
 
D
L
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
R
N
 
D
M
 
K
Y
 
F
G
 
G
G
 
A
D
 
D
R
 
S
I
 
V
I
 
L
A
 
V
T
 
S
D
|
D
I
x
V
N
 
V
E
 
E
A
 
P
S
 
G
A
 
A
Y
 
-
K
 
K
F
 
H
D
 
P
Y
 
L
C
 
A
R
 
G
F
 
L
M
 
K
A
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
K
L
 
L
D
|
D
V
x
C
M
 
L
D
 
D
R
 
S
K
 
N
R
 
G
M
 
F
T
 
E
E
 
K
I
 
L
V
 
V
K
 
K
A
 
E
E
 
F
K
 
K
V
 
P
T
 
T
Q
 
W
I
 
M
Y
 
Y
H
 
H
L
|
L
A
x
P
A
|
A
I
 
I
L
x
M
S
|
S
A
 
V
T
 
R
S
 
G
E
 
E
K
 
A
N
 
E
P
 
P
I
 
D
F
 
L
A
 
A
W
 
M
N
 
D
L
 
I
N
 
N
M
 
V
E
 
N
S
 
T
L
 
T
L
 
R
S
 
Y
I
 
A
L
 
L
E
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
K
Q
 
Y
K
 
N
L
 
I
N
 
-
K
 
R
I
 
I
Y
 
F
W
 
I
P
 
P
S
 
S
S
x
T
I
 
I
A
 
A
V
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
D
N
 
K
T
 
C
P
 
G
M
 
K
Q
 
T
H
 
M
T
 
T
P
 
K
Q
 
D
D
 
D
C
 
T
I
 
I
M
 
M
D
 
N
P
 
P
N
 
S
T
 
T
V
 
V
Y
|
Y
G
 
G
I
 
V
S
 
T
K
|
K
Q
 
V
A
 
Y
G
 
T
E
 
E
R
 
L
W
 
L
C
 
G
A
 
T
Y
 
W
Y
 
Y
F
 
R
E
 
Q
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
F
R
 
R
S
 
S
L
 
V
R
 
R
Y
x
L
P
|
P
G
 
G
L
x
I
I
 
I
G
 
S
Y
 
A
K
 
A
S
 
T
M
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
x
A
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
I
D
 
H
I
 
M
F
 
Y
H
 
H
K
 
S
A
 
A
I
 
L
E
 
L
G
 
Q
E
 
K
D
 
K
F
 
C
E
 
V
C
 
C
F
 
P
L
 
V
E
 
L
E
 
P
D
 
Y
T
 
E
Y
 
S
L
 
L
P
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
D
 
P
D
 
D
A
 
T
I
 
L
K
 
N
A
 
S
T
 
L
L
 
V
D
 
K
L
 
I
M
 
M
H
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
L
A
 
E
Q
 
K
I
 
L
K
 
-
V
 
T
R
 
R
S
 
T
S
 
V
Y
 
Y
N
 
N
L
 
I
G
 
T
G
 
G
I
 
F
S
 
S
F
 
F
S
 
S
P
 
P
K
 
S
E
 
E
I
 
L
Y
 
R
E
 
F
C
 
S
I
 
I
K
 
E
Q
 
R
H
 
C
Y
 
T
P
 
D
-
 
R
N
 
T
F
 
I
N
 
E
I
 
V
T
 
E
Y
 
Y
K
 
V
P
 
E
D
 
G
F
 
P
R
 
A
Q
 
Q
Q
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
N
T
 
S
W
|
W
P
 
P
D
 
D
S
 
S
I
 
L
D
 
D
D
 
D
S
 
S
A
 
N
A
 
A
Q
 
R
N
 
N
D
 
D
W
 
W
G
 
G
W
 
H
Q
 
Q
H
 
V
S
 
K
Y
 
Y
G
 
D
L
 
I
E
 
D
E
 
M
M
 
M
T
 
S
K
 
E
D
 
D
I
 
M
L
 
L
A
 
R
N
 
Q
L
 
I
P
 
P

Query Sequence

>Echvi_0146 FitnessBrowser__Cola:Echvi_0146
MARLIEIMETILITGAAGQLGSELTLALANMYGGDRIIATDINEASAYKFDYCRFMALDV
MDRKRMTEIVKAEKVTQIYHLAAILSATSEKNPIFAWNLNMESLLSILEIAREQKLNKIY
WPSSIAVFGPNTPMQHTPQDCIMDPNTVYGISKQAGERWCAYYFEKFGVDVRSLRYPGLI
GYKSMPGGGTTDYAVDIFHKAIEGEDFECFLEEDTYLPMMYMDDAIKATLDLMHAPAAQI
KVRSSYNLGGISFSPKEIYECIKQHYPNFNITYKPDFRQQIADTWPDSIDDSAAQNDWGW
QHSYGLEEMTKDILANLPAYLVNLK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory