SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Echvi_0157 FitnessBrowser__Cola:Echvi_0157 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 18 hits to proteins with known functional sites (download)

2f02A Crystal structure of lacc from enterococcus faecalis in complex with atp
27% identity, 99% coverage: 1:304/307 of query aligns to 2:312/319 of 2f02A

query
sites
2f02A
M
 
L
V
 
I
L
 
V
S
 
T
V
 
V
C
 
T
P
 
M
N
 
N
P
 
P
S
 
S
I
 
I
D
 
D
T
 
I
Y
 
S
A
 
Y
W
 
L
L
 
L
E
 
D
D
 
H
F
 
L
Q
 
K
L
 
L
G
 
D
K
 
T
A
 
V
N
 
N
R
 
R
I
 
T
S
 
S
K
 
Q
Q
 
V
E
 
T
E
 
K
F
 
T
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
L
H
 
N
V
 
V
A
 
T
M
 
R
A
 
V
L
 
I
Q
 
H
E
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
G
P
 
D
T
 
V
V
 
I
L
 
A
M
 
T
A
 
G
A
 
V
W
 
L
A
 
G
G
 
G
H
 
F
P
 
H
G
 
G
E
 
A
W
 
F
I
 
I
K
 
A
A
 
N
A
 
E
C
 
L
K
 
K
E
 
K
R
 
A
G
 
N
M
 
I
A
 
P
T
 
Q
V
 
A
G
 
F
V
 
T
D
 
S
L
 
I
K
 
K
G
 
E
M
 
E
N
 
T
R
 
R
K
 
D
C
 
S
Y
 
I
T
 
A
F
 
I
L
 
L
A
 
H
E
 
E
A
 
G
T
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
N
N
 
Q
T
 
T
E
 
E
L
 
I
M
 
L
E
 
E
P
 
A
G
 
G
P
 
P
E
 
T
M
 
V
N
 
S
G
 
P
E
 
E
D
 
E
F
 
I
D
 
S
R
 
N
F
 
F
V
 
L
G
 
E
V
 
N
F
 
F
K
 
D
D
 
Q
N
 
L
L
 
I
R
 
K
Q
 
Q
S
 
A
A
 
E
L
 
I
T
 
V
V
 
T
M
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
S
W
 
L
P
 
A
K
 
K
G
 
G
A
 
L
P
 
P
K
 
S
T
 
D
A
 
F
Y
 
Y
R
 
Q
E
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
Q
A
 
K
A
 
A
N
 
H
G
 
A
S
 
Q
G
 
E
K
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
L
L
 
L
D
 
D
C
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
D
Q
 
S
L
 
L
T
 
R
H
 
Q
A
 
V
L
 
L
E
 
Q
E
 
G
-
 
P
-
 
W
K
 
K
I
 
P
F
 
Y
G
 
L
I
 
I
H
 
K
L
 
P
N
|
N
E
 
L
H
 
E
E
 
E
A
 
L
K
 
E
Q
 
G
Y
 
L
C
 
L
G
 
G
T
 
Q
-
 
D
-
 
F
-
 
S
-
 
E
-
 
N
-
 
P
-
 
L
S
 
A
S
 
A
V
 
V
H
 
Q
E
 
T
A
 
A
F
 
L
D
 
T
K
 
K
-
 
P
L
 
M
H
 
F
E
 
A
K
 
G
V
 
I
E
 
E
L
 
W
I
 
I
A
 
V
L
 
I
T
x
S
K
 
L
G
|
G
K
 
K
E
 
D
G
 
G
L
 
A
F
 
I
L
 
A
S
 
K
Y
 
H
Q
 
H
G
 
D
T
 
Q
R
 
F
L
 
Y
H
 
R
A
 
V
N
 
K
V
x
I
T
 
P
L
 
T
E
x
I
K
 
Q
V
 
A
I
 
K
S
 
N
T
 
P
V
 
V
G
|
G
C
x
S
G
|
G
D
 
D
C
 
A
L
x
T
T
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
L
A
 
A
L
 
Y
G
 
G
V
 
L
S
 
A
R
 
K
G
 
D
Y
 
A
G
 
P
V
 
A
E
 
A
E
 
E
I
 
L
A
 
L
R
 
K
Y
 
W
G
 
G
A
x
M
A
 
A
F
 
A
G
|
G
A
x
M
A
 
A
N
 
N
C
 
A
L
 
Q
R
 
E
P
 
R
D
 
M
L
 
T
G
 
G
M
 
H
I
 
V
Y
 
D
K
 
V
A
 
E
D
 
N
V
 
V
E
 
K
R
 
K
L
 
H
L
 
L
P
 
M
Q
 
N
V
 
I
N
 
Q
I
 
V
N
 
V
E
 
E
L
 
I

2jgvB Structure of staphylococcus aureus d-tagatose-6-phosphate kinase in complex with adp (see paper)
27% identity, 99% coverage: 1:304/307 of query aligns to 5:314/314 of 2jgvB

query
sites
2jgvB
M
 
M
V
 
I
L
 
L
S
 
T
V
 
L
C
 
T
P
 
L
N
 
N
P
 
P
S
 
S
I
 
V
D
 
D
T
 
I
Y
 
S
A
 
Y
W
 
P
L
 
L
E
 
T
D
 
A
F
 
L
Q
 
K
L
 
L
G
 
D
K
 
D
A
 
V
N
 
N
R
 
R
I
 
V
S
 
Q
K
 
E
Q
 
V
E
 
S
E
 
K
F
 
T
P
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
L
H
 
N
V
 
V
A
 
T
M
 
R
A
 
V
L
 
L
Q
 
A
E
 
Q
A
 
V
G
 
G
A
 
E
P
 
P
T
 
V
V
 
L
L
 
A
M
 
S
A
 
G
A
 
F
W
 
I
A
 
G
G
 
G
H
 
E
P
 
L
G
 
G
E
 
Q
W
 
F
I
 
I
K
 
A
A
 
K
A
 
K
C
 
L
K
 
D
E
 
H
R
 
A
G
 
D
M
 
I
A
 
K
T
 
H
V
 
A
G
 
F
V
 
Y
D
 
N
L
 
I
K
 
K
G
 
G
M
 
E
N
 
T
R
 
R
K
 
N
C
 
C
Y
 
I
T
 
A
F
 
I
L
 
L
A
 
H
E
 
E
A
 
G
T
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
Q
N
 
Q
T
 
T
E
 
E
L
 
I
M
 
L
E
 
E
P
 
Q
G
 
G
P
 
P
E
 
E
M
 
I
N
 
D
G
 
N
E
 
Q
D
 
E
F
 
A
D
 
A
R
 
G
F
 
F
V
 
I
G
 
K
V
 
H
F
 
F
K
 
E
D
 
Q
N
 
L
L
 
L
R
 
E
Q
 
K
S
 
V
A
 
E
L
 
A
T
 
V
V
 
A
M
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
S
W
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
G
A
 
L
P
 
N
K
 
Q
T
 
D
A
 
Y
Y
 
Y
R
 
A
E
 
Q
L
 
I
I
 
I
A
 
E
A
 
R
A
 
C
N
 
Q
G
 
N
S
 
K
G
 
G
K
 
V
K
 
P
V
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
D
C
 
C
S
 
S
G
 
G
E
 
A
Q
 
T
L
 
L
T
 
Q
H
 
T
A
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
N
-
 
P
-
 
Y
K
 
K
I
 
P
F
 
T
G
 
V
I
 
I
H
 
K
L
 
P
N
 
N
E
 
I
H
 
S
E
 
E
A
 
L
K
 
Y
Q
 
Q
Y
 
L
C
 
L
G
 
N
T
 
Q
-
 
P
-
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
L
S
 
E
S
 
S
V
 
L
H
 
K
E
 
Q
A
 
A
F
 
V
D
 
S
K
 
Q
-
 
P
L
 
L
H
 
F
E
 
E
K
 
G
V
 
I
E
 
E
L
 
W
I
 
I
A
 
I
L
 
V
T
x
S
K
 
L
G
 
G
K
x
A
E
 
Q
G
 
G
L
 
A
F
 
F
L
 
A
S
 
K
Y
 
H
Q
 
N
G
 
H
T
 
T
R
 
F
L
 
Y
H
 
R
A
 
V
N
 
N
V
 
I
T
 
P
L
 
T
E
x
I
K
 
S
V
 
V
I
 
L
S
 
N
T
x
P
V
 
V
G
|
G
C
x
S
G
|
G
D
|
D
C
 
S
L
 
T
T
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
T
L
 
S
G
 
A
V
 
I
S
 
L
R
 
N
G
 
H
Y
 
E
G
 
N
V
 
D
E
 
H
E
 
D
I
 
L
A
 
L
R
 
K
Y
 
K
G
 
A
A
x
N
A
 
T
F
 
L
G
|
G
A
x
M
A
 
L
N
 
N
C
 
A
L
 
Q
R
 
E
P
 
A
D
 
Q
L
 
T
G
 
G
M
 
Y
I
 
V
Y
 
N
K
 
L
A
 
N
D
 
N
V
 
Y
E
 
D
R
 
D
L
 
L
L
 
F
P
 
N
Q
 
Q
V
 
I
N
 
E
I
 
V
N
 
L
E
 
E
L
 
V

2jg1A Structure of staphylococcus aureus d-tagatose-6-phosphate kinase with cofactor and substrate (see paper)
27% identity, 99% coverage: 1:304/307 of query aligns to 9:318/318 of 2jg1A

query
sites
2jg1A
M
 
M
V
 
I
L
 
L
S
 
T
V
 
L
C
 
T
P
 
L
N
 
N
P
 
P
S
 
S
I
 
V
D
 
D
T
 
I
Y
 
S
A
 
Y
W
 
P
L
 
L
E
 
T
D
 
A
F
 
L
Q
 
K
L
 
L
G
 
D
K
 
D
A
 
V
N
 
N
R
 
R
I
 
V
S
 
Q
K
 
E
Q
 
V
E
 
S
E
 
K
F
 
T
P
 
A
G
 
G
G
 
G
K
|
K
G
 
G
V
 
L
H
 
N
V
 
V
A
 
T
M
 
R
A
 
V
L
 
L
Q
 
A
E
 
Q
A
 
V
G
 
G
A
 
E
P
 
P
T
 
V
V
 
L
L
 
A
M
 
S
A
 
G
A
 
F
W
 
I
A
 
G
G
 
G
H
 
E
P
 
L
G
 
G
E
 
Q
W
 
F
I
 
I
K
 
A
A
 
K
A
 
K
C
 
L
K
 
D
E
 
H
R
 
A
G
 
D
M
 
I
A
 
K
T
 
H
V
 
A
G
 
F
V
 
Y
D
 
N
L
 
I
K
 
K
G
 
G
M
 
E
N
 
T
R
 
R
K
 
N
C
 
C
Y
 
I
T
 
A
F
 
I
L
 
L
A
 
H
E
 
E
A
 
G
T
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
Q
N
 
Q
T
 
T
E
 
E
L
 
I
M
 
L
E
 
E
P
 
Q
G
 
G
P
 
P
E
 
E
M
 
I
N
 
D
G
 
N
E
 
Q
D
 
E
F
 
A
D
 
A
R
 
G
F
 
F
V
 
I
G
 
K
V
 
H
F
 
F
K
 
E
D
 
Q
N
 
M
L
 
M
R
 
E
Q
 
K
S
 
V
A
 
E
L
 
A
T
 
V
V
 
A
M
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
S
W
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
G
A
 
L
P
 
N
K
 
Q
T
 
D
A
 
Y
Y
 
Y
R
 
A
E
 
Q
L
 
I
I
 
I
A
 
E
A
 
R
A
 
C
N
 
Q
G
 
N
S
 
K
G
 
G
K
 
V
K
 
P
V
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
D
C
 
C
S
 
S
G
 
G
E
 
A
Q
 
T
L
 
L
T
 
Q
H
 
T
A
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
N
-
 
P
-
 
Y
K
 
K
I
 
P
F
 
T
G
 
V
I
 
I
H
 
K
L
 
P
N
|
N
E
 
I
H
 
S
E
 
E
A
 
L
K
 
Y
Q
 
Q
Y
 
L
C
 
L
G
 
N
T
 
Q
-
 
P
-
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
L
S
 
E
S
 
S
V
 
L
H
 
K
E
 
Q
A
 
A
F
 
V
D
 
S
K
 
Q
-
 
P
L
 
L
H
 
F
E
 
E
K
 
G
V
 
I
E
 
E
L
 
W
I
 
I
A
 
I
L
 
V
T
x
S
K
 
L
G
|
G
K
 
A
E
 
Q
G
|
G
L
 
A
F
 
F
L
 
A
S
 
K
Y
 
H
Q
 
N
G
 
H
T
 
T
R
 
F
L
 
Y
H
 
R
A
 
V
N
 
N
V
 
I
T
 
P
L
 
T
E
x
I
K
 
S
V
|
V
I
 
L
S
 
N
T
 
P
V
 
V
G
|
G
C
x
S
G
|
G
D
|
D
C
 
S
L
x
T
T
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
T
L
 
S
G
 
A
V
 
I
S
 
L
R
 
N
G
 
H
Y
 
E
G
 
N
V
 
D
E
 
H
E
 
D
I
 
L
A
 
L
R
 
K
Y
 
K
G
 
A
A
x
N
A
 
T
F
 
L
G
|
G
A
x
M
A
 
L
N
 
N
C
 
A
L
 
Q
R
 
E
P
 
A
D
 
Q
L
 
T
G
 
G
M
 
Y
I
 
V
Y
 
N
K
 
L
A
 
N
D
 
N
V
 
Y
E
 
D
R
 
D
L
 
L
L
 
F
P
 
N
Q
 
Q
V
 
I
N
 
E
I
 
V
N
 
L
E
 
E
L
 
V

2jg1C Structure of staphylococcus aureus d-tagatose-6-phosphate kinase with cofactor and substrate (see paper)
27% identity, 99% coverage: 1:304/307 of query aligns to 6:315/315 of 2jg1C

query
sites
2jg1C
M
 
M
V
 
I
L
 
L
S
 
T
V
 
L
C
 
T
P
 
L
N
 
N
P
 
P
S
 
S
I
 
V
D
|
D
T
 
I
Y
 
S
A
 
Y
W
 
P
L
 
L
E
 
T
D
 
A
F
 
L
Q
 
K
L
 
L
G
 
D
K
 
D
A
 
V
N
 
N
R
 
R
I
 
V
S
 
Q
K
 
E
Q
 
V
E
 
S
E
 
K
F
 
T
P
 
A
G
 
G
G
|
G
K
|
K
G
 
G
V
 
L
H
 
N
V
 
V
A
 
T
M
 
R
A
 
V
L
 
L
Q
 
A
E
 
Q
A
 
V
G
 
G
A
 
E
P
 
P
T
 
V
V
 
L
L
 
A
M
 
S
A
 
G
A
 
F
W
 
I
A
 
G
G
 
G
H
 
E
P
 
L
G
 
G
E
 
Q
W
 
F
I
 
I
K
 
A
A
 
K
A
 
K
C
 
L
K
 
D
E
 
H
R
 
A
G
 
D
M
 
I
A
 
K
T
 
H
V
 
A
G
 
F
V
 
Y
D
 
N
L
 
I
K
 
K
G
 
G
M
 
E
N
 
T
R
|
R
K
 
N
C
|
C
Y
 
I
T
 
A
F
 
I
L
 
L
A
 
H
E
 
E
A
 
G
T
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
Q
N
 
Q
T
 
T
E
 
E
L
 
I
M
x
L
E
 
E
P
 
Q
G
 
G
P
 
P
E
 
E
M
 
I
N
 
D
G
 
N
E
 
Q
D
 
E
F
 
A
D
 
A
R
 
G
F
 
F
V
 
I
G
 
K
V
 
H
F
 
F
K
 
E
D
 
Q
N
 
M
L
 
M
R
 
E
Q
 
K
S
 
V
A
 
E
L
 
A
T
 
V
V
 
A
M
 
I
S
 
S
G
|
G
S
|
S
W
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
G
A
 
L
P
 
N
K
 
Q
T
 
D
A
 
Y
Y
 
Y
R
 
A
E
 
Q
L
 
I
I
 
I
A
 
E
A
 
R
A
 
C
N
 
Q
G
 
N
S
 
K
G
 
G
K
 
V
K
 
P
V
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
D
C
 
C
S
 
S
G
 
G
E
 
A
Q
 
T
L
 
L
T
 
Q
H
 
T
A
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
N
-
 
P
-
 
Y
K
 
K
I
 
P
F
 
T
G
 
V
I
 
I
H
 
K
L
 
P
N
 
N
E
 
I
H
 
S
E
 
E
A
 
L
K
 
Y
Q
 
Q
Y
 
L
C
 
L
G
 
N
T
 
Q
-
 
P
-
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
L
S
 
E
S
 
S
V
 
L
H
 
K
E
 
Q
A
 
A
F
 
V
D
 
S
K
 
Q
-
 
P
L
 
L
H
 
F
E
 
E
K
 
G
V
 
I
E
 
E
L
 
W
I
 
I
A
 
I
L
 
V
T
x
S
K
 
L
G
|
G
K
x
A
E
 
Q
G
|
G
L
 
A
F
 
F
L
 
A
S
 
K
Y
 
H
Q
 
N
G
 
H
T
 
T
R
 
F
L
 
Y
H
 
R
A
 
V
N
 
N
V
x
I
T
 
P
L
 
T
E
x
I
K
 
S
V
|
V
I
 
L
S
 
N
T
 
P
V
|
V
G
|
G
C
x
S
G
|
G
D
|
D
C
 
S
L
x
T
T
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
T
L
 
S
G
 
A
V
 
I
S
 
L
R
 
N
G
 
H
Y
 
E
G
 
N
V
 
D
E
 
H
E
 
D
I
 
L
A
 
L
R
 
K
Y
 
K
G
 
A
A
x
N
A
 
T
F
 
L
G
|
G
A
x
M
A
 
L
N
 
N
C
 
A
L
 
Q
R
 
E
P
 
A
D
 
Q
L
 
T
G
 
G
M
 
Y
I
 
V
Y
 
N
K
 
L
A
 
N
D
 
N
V
 
Y
E
 
D
R
 
D
L
 
L
L
 
F
P
 
N
Q
 
Q
V
 
I
N
 
E
I
 
V
N
 
L
E
 
E
L
 
V

P9WID3 ATP-dependent 6-phosphofructokinase isozyme 2; ATP-PFK 2; Phosphofructokinase 2; Phosphofructokinase B; Phosphohexokinase 2; Tagatose-6-phosphate kinase; EC 2.7.1.11; EC 2.7.1.144 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
23% identity, 96% coverage: 2:296/307 of query aligns to 14:313/339 of P9WID3

query
sites
P9WID3
V
 
I
L
 
I
S
 
T
V
 
L
C
 
T
P
 
M
N
 
N
P
 
P
S
 
A
I
 
L
D
 
D
T
 
I
Y
 
T
A
 
T
W
 
S
L
 
V
E
 
D
D
 
V
F
 
V
Q
 
R
L
 
P
G
 
T
K
 
E
A
 
K
N
 
M
R
 
R
I
 
C
S
 
G
K
 
A
Q
 
P
E
 
R
E
 
Y
F
 
D
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
G
G
 
G
V
 
I
H
 
N
V
 
V
A
 
A
M
 
R
A
 
I
L
 
V
Q
 
H
E
 
V
A
 
L
G
 
G
A
 
G
P
 
C
T
 
S
V
 
T
L
 
A
M
 
L
A
 
F
A
 
P
W
 
A
A
 
G
G
 
G
H
 
S
P
 
T
G
 
G
E
 
S
W
 
L
I
 
L
K
 
M
A
 
A
A
 
L
C
 
L
K
 
G
E
 
D
R
 
A
G
 
G
M
 
V
A
 
P
T
 
F
V
 
R
G
 
V
V
 
I
D
 
P
L
 
I
K
 
A
G
 
A
M
 
S
N
 
T
R
 
R
K
 
E
C
 
S
Y
 
F
T
 
T
F
 
-
L
 
V
A
 
N
E
 
E
A
 
S
T
 
R
A
 
T
I
 
A
R
 
K
N
 
Q
T
 
Y
E
 
R
L
 
F
M
 
V
E
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
E
 
S
M
 
L
N
 
T
G
 
V
E
 
A
D
 
E
F
 
Q
D
 
E
R
 
Q
F
 
C
V
 
L
G
 
D
V
 
E
F
 
L
K
 
R
D
 
G
N
 
A
L
 
A
R
 
A
Q
 
S
S
 
A
A
 
A
L
 
F
T
 
V
V
 
V
M
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
S
W
 
L
P
 
P
K
 
P
G
 
G
A
 
V
P
 
A
K
 
A
T
 
D
A
 
Y
Y
 
Y
R
 
Q
E
 
R
L
 
V
I
 
A
A
 
D
A
 
I
A
 
C
N
 
R
G
 
R
S
 
S
G
 
S
K
 
T
K
 
P
V
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
C
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
G
Q
 
G
L
 
L
T
 
Q
H
 
H
A
 
-
L
 
I
E
 
S
E
 
S
K
 
G
I
 
V
F
 
F
G
 
L
I
 
L
H
 
K
L
 
A
N
 
S
E
 
V
H
 
R
E
 
E
A
 
L
K
 
R
Q
 
E
Y
 
C
C
 
V
G
 
G
T
 
S
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
T
-
 
E
-
 
P
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
S
 
A
S
 
A
V
 
A
H
 
H
E
 
E
A
 
L
F
 
I
D
 
D
K
 
R
L
 
-
H
 
-
E
 
G
K
 
R
V
 
A
E
 
E
L
 
V
I
 
V
A
 
V
L
 
V
T
 
S
K
 
L
G
 
G
K
 
S
E
 
Q
G
 
G
L
 
A
F
 
L
L
 
L
S
 
A
Y
 
T
Q
 
R
G
 
H
T
 
A
R
 
S
L
 
H
H
 
R
A
 
F
N
 
S
V
 
S
T
 
I
L
 
P
E
 
M
K
 
T
V
 
A
I
 
V
S
 
S
T
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
A
G
 
G
D
 
D
C
 
A
L
 
M
T
 
V
A
 
A
G
 
A
V
 
I
A
 
T
L
 
V
G
 
G
V
 
L
S
 
S
R
 
R
G
 
G
Y
 
W
G
 
S
V
 
L
E
 
I
E
x
K
I
 
S
A
 
V
R
 
R
Y
 
L
G
 
G
A
 
N
A
 
A
F
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
N
 
M
C
 
L
L
 
L
R
 
T
P
 
P
D
 
G
L
 
T
G
 
A
M
 
A
I
 
C
Y
 
N
K
 
R
A
 
D
D
 
D
V
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
F
L
 
F

2ajrA Crystal structure of possible 1-phosphofructokinase (ec 2.7.1.56) (tm0828) from thermotoga maritima at 2.46 a resolution
26% identity, 94% coverage: 1:289/307 of query aligns to 2:309/320 of 2ajrA

query
sites
2ajrA
M
 
M
V
 
V
L
 
L
S
 
T
V
 
V
C
 
T
P
 
L
N
 
N
P
 
P
S
 
A
I
 
L
D
 
D
T
 
R
Y
 
E
A
 
I
W
 
F
L
 
I
E
 
E
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
L
 
V
G
 
N
K
 
R
A
 
L
N
 
Y
R
 
R
I
 
I
-
 
N
-
 
D
-
 
L
S
 
S
K
 
K
Q
 
T
E
 
Q
E
 
M
F
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
I
H
 
N
V
 
V
A
 
S
M
 
I
A
 
A
L
 
L
Q
 
S
E
 
K
A
 
L
G
 
G
A
 
V
P
 
P
T
 
S
V
 
V
L
 
A
M
 
T
A
 
G
A
 
F
W
 
V
A
 
G
G
 
G
H
 
Y
P
 
M
G
 
G
E
 
K
W
 
I
I
 
L
K
 
V
A
 
E
A
 
E
C
 
L
K
 
R
E
 
K
-
 
I
-
 
S
R
 
K
G
 
L
M
 
I
A
 
T
T
 
T
V
 
N
G
 
F
V
 
V
D
 
Y
L
 
V
K
 
E
G
 
G
M
 
E
N
 
T
R
 
R
K
 
E
C
 
N
Y
 
I
T
 
E
F
 
I
L
 
I
A
 
D
E
 
E
A
 
K
T
 
N
A
 
K
I
 
T
R
 
I
N
 
-
T
 
T
E
 
A
L
 
I
M
 
N
E
 
F
P
 
P
G
 
G
P
 
P
E
 
D
M
 
V
N
 
T
G
 
D
E
 
M
D
 
D
F
 
V
D
 
N
R
 
H
F
 
F
V
 
L
G
 
R
V
 
R
F
 
Y
K
 
K
D
 
M
N
 
T
L
 
L
R
 
S
Q
 
K
S
 
V
A
 
D
L
 
C
T
 
V
V
 
V
M
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
S
W
 
I
P
 
P
K
 
P
G
 
G
A
 
V
P
 
N
K
 
E
T
 
G
A
 
I
Y
 
C
R
 
N
E
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
R
A
 
L
A
 
A
N
 
R
G
 
E
S
 
R
G
 
G
K
 
V
K
 
F
V
 
V
I
 
F
L
 
V
D
 
E
C
 
Q
S
 
T
-
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
Y
-
 
E
G
 
G
E
 
P
Q
 
E
L
 
F
T
 
P
H
 
N
A
 
V
L
 
V
E
 
K
E
 
P
K
 
D
I
 
L
F
 
R
G
 
G
I
 
N
H
 
H
L
 
A
N
 
S
E
 
F
H
 
L
E
 
G
A
 
V
K
 
D
Q
 
L
Y
 
K
C
 
T
G
 
F
T
 
D
S
 
D
S
 
Y
V
 
V
H
 
K
E
 
L
A
 
A
F
 
-
D
 
E
K
 
K
L
 
L
H
 
A
E
 
E
K
 
K
V
 
S
E
 
Q
L
 
V
I
 
S
A
 
V
L
 
V
T
 
S
-
 
Y
K
 
E
G
 
V
K
 
K
E
 
N
G
 
D
L
 
I
F
 
V
L
 
A
S
 
T
Y
 
R
Q
 
E
G
 
G
T
 
V
R
 
W
L
 
L
H
 
I
A
 
R
N
 
S
V
 
K
T
 
E
L
 
E
E
 
I
K
 
D
V
 
T
I
 
S
S
x
H
T
 
L
V
 
L
G
 
G
C
 
A
G
 
G
D
 
D
C
 
A
L
 
Y
T
 
V
A
 
A
G
 
G
-
 
M
V
 
V
A
 
Y
L
 
Y
G
 
F
V
 
I
S
 
K
R
 
H
G
 
G
Y
 
A
G
 
N
V
 
F
E
 
L
E
 
E
I
 
M
A
 
A
R
 
K
Y
 
F
G
 
G
A
 
F
A
 
A
F
 
S
G
 
A
A
 
L
A
 
A
N
 
A
C
 
T
L
 
R
R
|
R
-
 
K
-
x
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
M
P
 
P
D
 
D
L
 
L
G
 
E
M
 
A
I
 
I
Y
 
K
K
 
K

3julA Crystal structure of listeria innocua d-tagatose-6-phosphate kinase bound with substrate
23% identity, 92% coverage: 1:281/307 of query aligns to 2:278/298 of 3julA

query
sites
3julA
M
 
L
V
 
I
L
 
Y
S
 
T
V
 
I
C
 
T
P
 
L
N
 
N
P
 
P
S
 
A
I
 
I
D
|
D
T
 
R
Y
 
L
A
 
L
W
 
F
L
 
I
E
 
R
-
 
G
D
 
E
F
 
L
Q
 
E
L
 
K
G
 
R
K
 
K
A
 
T
N
 
N
R
 
R
I
 
V
S
 
I
K
 
K
Q
 
T
E
 
E
E
 
F
F
 
D
P
 
C
G
 
G
G
 
G
K
|
K
G
 
G
V
 
L
H
|
H
V
 
V
A
 
S
M
 
G
A
 
V
L
 
L
Q
 
S
E
 
K
A
 
F
G
 
G
A
 
I
P
 
K
T
 
N
V
 
E
L
 
A
M
 
L
A
 
G
A
 
I
W
 
A
A
 
G
G
 
S
H
 
D
P
 
N
G
 
L
E
 
D
W
 
K
I
 
L
K
 
Y
A
 
A
A
 
I
C
 
L
K
 
K
E
 
E
R
 
K
G
 
H
M
 
I
A
 
N
-
 
H
T
 
D
V
 
F
G
 
L
V
 
V
D
 
E
L
 
A
K
 
G
G
 
T
M
 
S
N
 
T
R
|
R
K
 
E
C
 
C
Y
 
F
T
 
V
F
 
V
L
 
L
A
 
S
E
 
D
A
 
D
T
 
T
A
 
N
I
 
-
R
 
G
N
 
S
T
 
T
E
x
M
L
 
I
M
 
P
E
 
E
P
 
A
G
 
G
P
 
F
E
 
T
M
 
V
N
 
S
G
 
Q
E
 
T
D
 
N
F
 
K
D
 
D
R
 
N
F
 
L
V
 
L
G
 
K
V
 
Q
F
 
I
K
 
A
D
 
K
N
 
K
L
 
V
R
 
K
Q
 
K
S
 
E
A
 
D
L
 
M
T
 
V
V
 
V
M
 
I
S
 
A
G
|
G
S
 
S
W
 
P
P
 
P
K
 
P
G
 
H
A
 
Y
P
 
T
K
 
L
T
 
S
A
 
D
Y
 
F
R
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
T
A
 
V
N
 
K
G
 
A
S
 
T
G
 
G
K
 
A
K
 
F
V
 
L
I
 
G
L
 
C
D
 
D
C
 
N
S
 
S
G
 
G
E
 
E
Q
 
Y
L
 
L
T
 
N
H
 
L
A
 
A
L
 
V
E
 
E
E
 
M
K
 
G
I
 
V
F
 
D
G
 
F
I
 
I
H
 
K
L
 
P
N
 
N
E
 
E
H
 
D
E
 
E
A
 
V
K
 
I
Q
 
A
Y
 
I
C
 
L
G
 
D
-
 
E
-
 
K
T
 
T
S
 
N
S
 
S
V
 
L
H
 
E
E
 
E
A
 
N
F
 
I
D
 
R
K
 
T
L
 
L
H
 
A
E
 
E
K
 
K
V
 
I
E
 
P
L
 
Y
I
 
L
A
 
V
L
 
V
T
 
S
K
 
L
G
 
G
K
 
A
E
 
K
G
 
G
L
 
S
F
 
I
L
 
C
S
 
A
Y
 
H
Q
 
N
G
 
G
T
 
-
R
 
-
L
 
-
H
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
T
 
K
L
 
L
E
 
Y
K
 
Q
V
 
V
I
 
I
S
 
P
T
 
P
V
 
T
G
 
G
C
 
A
G
 
G
D
|
D
C
 
V
L
 
F
T
 
V
A
 
G
G
 
A
V
 
F
A
 
I
L
 
A
G
 
G
V
 
L
S
 
A
R
 
M
G
 
N
Y
 
M
G
 
P
V
 
I
E
 
T
E
 
E
I
 
T
A
 
L
R
 
K
Y
 
V
G
 
A
A
 
T
A
 
G
F
 
C
G
 
S
A
 
A
A
 
S
N
 
K
C
 
V
L
 
M
R
 
Q

3ie7A The crystal structure of phosphofructokinase (lin2199) from listeria innocua in complex with atp at 1.6a
22% identity, 99% coverage: 1:304/307 of query aligns to 2:308/309 of 3ie7A

query
sites
3ie7A
M
 
L
V
 
I
L
 
Y
S
 
T
V
 
I
C
 
T
P
 
L
N
 
N
P
 
P
S
 
A
I
 
I
D
 
D
T
 
R
Y
 
L
A
 
L
W
 
F
L
 
I
E
 
R
-
 
G
D
 
E
F
 
L
Q
 
E
L
 
K
G
 
R
K
 
K
A
 
T
N
 
N
R
 
R
I
 
V
S
 
I
K
 
K
Q
 
T
E
 
E
E
 
F
F
 
D
P
 
C
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
L
H
 
H
V
 
V
A
 
S
M
 
G
A
 
V
L
 
L
Q
 
S
E
 
K
A
 
F
G
 
G
A
 
I
P
 
K
T
 
N
V
 
E
L
 
A
M
 
L
A
 
G
A
 
I
W
 
A
A
 
G
G
 
S
H
 
D
P
 
N
G
 
L
E
 
D
W
 
K
I
 
L
K
 
Y
A
 
A
A
 
I
C
 
L
K
 
K
E
 
E
R
 
K
G
 
H
M
 
I
A
 
N
-
 
H
T
 
D
V
 
F
G
 
L
V
 
V
D
 
E
L
 
A
K
 
G
G
 
T
M
 
S
N
 
T
R
 
R
K
 
E
C
 
C
Y
 
F
T
 
V
F
 
V
L
 
L
A
 
S
E
 
D
A
 
D
T
 
T
A
 
N
I
 
-
R
 
G
N
 
S
T
 
T
E
 
M
L
 
I
M
 
P
E
 
E
P
 
A
G
 
G
P
 
F
E
 
T
M
 
V
N
 
S
G
 
Q
E
 
T
D
 
N
F
 
K
D
 
D
R
 
N
F
 
L
V
 
L
G
 
K
V
 
Q
F
 
I
K
 
A
D
 
K
N
 
K
L
 
V
R
 
K
Q
 
K
S
 
E
A
 
D
L
 
M
T
 
V
V
 
V
M
 
I
S
 
A
G
 
G
S
 
S
W
 
P
P
 
P
K
 
P
G
 
H
A
 
Y
P
 
T
K
 
L
T
 
S
A
 
D
Y
 
F
R
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
T
A
 
V
N
 
K
G
 
A
S
 
T
G
 
G
K
 
A
K
 
F
V
 
L
I
 
G
L
 
C
D
 
D
C
 
N
S
 
S
G
 
G
E
 
E
Q
 
Y
L
 
L
T
 
N
H
 
L
A
 
A
L
 
V
E
 
E
E
 
M
K
 
G
I
 
V
F
 
D
G
 
F
I
 
I
H
 
K
L
 
P
N
|
N
E
 
E
H
 
D
E
 
E
A
 
V
K
 
I
Q
 
A
Y
 
I
C
 
L
G
 
D
-
 
E
-
 
K
T
 
T
S
 
N
S
 
S
V
 
L
H
 
E
E
 
E
A
 
N
F
 
I
D
 
R
K
 
T
L
 
L
H
 
A
E
 
E
K
 
K
V
 
I
E
 
P
L
 
Y
I
 
L
A
 
V
L
 
V
T
x
S
K
 
L
G
|
G
K
x
A
E
 
K
G
|
G
L
 
S
F
 
I
L
 
C
S
 
A
Y
 
H
Q
 
N
G
 
G
T
 
K
R
 
L
L
 
Y
H
 
Q
A
 
V
N
 
I
V
 
P
T
 
P
L
 
K
E
x
V
K
 
Q
V
 
E
I
 
R
S
 
N
T
 
D
V
 
T
G
|
G
C
x
A
G
|
G
D
|
D
C
 
V
L
 
F
T
 
V
A
 
G
G
 
A
V
 
F
A
 
I
L
 
A
G
 
G
V
 
L
S
 
A
R
 
M
G
 
N
Y
 
M
G
 
P
V
 
I
E
 
T
E
 
E
I
 
T
A
 
L
R
 
K
Y
 
V
G
 
A
A
 
T
A
 
G
F
 
C
G
x
S
A
 
A
A
 
S
N
 
K
C
x
V
L
 
M
R
 
Q
P
 
Q
D
 
D
L
 
S
G
 
S
M
 
S
I
 
F
Y
 
D
K
 
L
A
 
E
D
 
A
V
 
A
E
 
G
R
 
K
L
 
L
L
 
K
P
 
N
Q
 
Q
V
 
V
N
 
S
I
 
I
N
 
I
E
 
Q
L
 
L

3uqdB Crystal structure of the phosphofructokinase-2 from escherichia coli in complex with substrates and products (see paper)
25% identity, 85% coverage: 35:295/307 of query aligns to 37:303/309 of 3uqdB

query
sites
3uqdB
P
 
P
G
 
G
G
|
G
K
 
G
G
 
G
V
 
I
H
x
N
V
 
V
A
 
A
M
 
R
A
 
A
L
 
I
Q
 
A
E
 
H
A
 
L
G
 
G
A
 
G
P
 
S
T
 
A
V
 
T
L
 
A
M
 
I
A
 
F
A
 
P
W
 
A
A
 
G
G
 
G
H
 
A
P
 
T
G
 
G
E
 
E
W
 
H
I
 
L
K
 
V
A
 
S
A
 
L
C
 
L
K
 
A
E
 
D
R
 
E
G
 
N
M
 
V
A
 
P
T
 
V
V
 
A
G
 
T
V
 
V
D
 
E
L
 
A
K
 
K
G
 
D
M
 
W
N
 
T
R
|
R
K
 
Q
C
 
N
Y
 
L
T
 
H
F
 
V
L
 
H
A
 
V
E
 
E
A
 
A
T
 
S
A
 
G
I
 
E
R
 
Q
N
 
Y
T
x
R
E
 
F
L
 
V
M
 
M
E
 
-
P
 
P
G
 
G
P
 
A
E
 
A
M
 
L
N
 
N
G
 
E
E
 
D
D
 
E
F
 
F
D
 
R
R
 
Q
F
 
L
V
 
E
G
 
E
V
 
Q
F
 
V
K
 
L
D
 
E
N
 
-
L
 
I
R
 
E
Q
 
S
S
 
G
A
 
A
L
 
I
T
 
L
V
 
V
M
 
I
S
 
S
G
 
G
S
|
S
W
 
L
P
 
P
K
 
P
G
 
G
A
 
V
P
 
K
K
 
L
T
 
E
A
 
K
Y
 
L
R
 
T
E
 
Q
L
 
L
I
 
I
A
 
S
A
 
A
A
 
A
N
 
Q
G
 
K
S
 
Q
G
 
G
K
 
I
K
 
R
V
 
C
I
 
I
L
 
V
D
 
D
C
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
T
 
S
H
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
-
E
 
-
K
 
A
I
 
I
F
 
G
G
 
N
I
 
I
H
 
E
L
 
L
-
 
V
-
x
K
-
 
P
N
|
N
E
 
Q
H
 
K
E
 
E
A
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
N
K
 
R
Q
 
E
Y
 
L
C
 
T
G
 
Q
T
 
P
S
 
D
S
 
D
V
 
V
H
 
R
E
 
K
A
 
A
F
 
A
D
 
Q
K
 
E
L
 
I
H
 
V
E
 
N
-
 
S
-
 
G
K
 
K
V
 
A
E
 
K
L
 
R
I
 
V
A
 
V
L
 
V
T
x
S
K
 
L
G
|
G
K
x
P
E
 
Q
G
|
G
L
 
A
F
 
L
L
 
G
S
 
V
Y
 
D
Q
 
S
G
 
E
T
 
N
R
 
C
L
 
I
H
 
Q
A
 
V
N
 
V
V
 
P
T
 
P
L
 
P
E
 
V
K
 
K
V
x
S
I
 
Q
S
 
S
T
 
T
V
 
V
G
|
G
C
x
A
G
|
G
D
|
D
C
 
S
L
x
M
T
 
V
A
 
G
G
 
A
V
 
M
A
 
T
L
 
L
G
 
K
V
 
L
S
 
A
R
 
E
G
 
N
Y
 
A
G
 
S
V
 
L
E
 
E
E
 
E
I
 
M
A
 
V
R
 
R
Y
 
F
G
 
G
A
x
V
A
 
A
F
 
A
G
|
G
A
x
S
A
 
A
N
 
A
C
 
T
L
 
L
R
 
N
P
 
Q
D
 
G
L
 
T
G
 
R
M
 
L
I
 
C
Y
 
S
K
 
H
A
 
D
D
 
D
V
 
T
E
 
Q
R
 
K
L
 
I

Sites not aligning to the query:

3uqdA Crystal structure of the phosphofructokinase-2 from escherichia coli in complex with substrates and products (see paper)
25% identity, 85% coverage: 35:295/307 of query aligns to 37:303/309 of 3uqdA

query
sites
3uqdA
P
 
P
G
|
G
G
|
G
K
 
G
G
 
G
V
 
I
H
x
N
V
 
V
A
 
A
M
 
R
A
 
A
L
 
I
Q
 
A
E
 
H
A
 
L
G
 
G
A
 
G
P
 
S
T
 
A
V
 
T
L
 
A
M
 
I
A
 
F
A
 
P
W
 
A
A
 
G
G
 
G
H
 
A
P
 
T
G
 
G
E
 
E
W
 
H
I
 
L
K
 
V
A
 
S
A
 
L
C
 
L
K
 
A
E
 
D
R
 
E
G
 
N
M
 
V
A
 
P
T
 
V
V
 
A
G
 
T
V
 
V
D
 
E
L
 
A
K
 
K
G
 
D
M
 
W
N
 
T
R
|
R
K
 
Q
C
 
N
Y
 
L
T
 
H
F
 
V
L
 
H
A
 
V
E
 
E
A
 
A
T
 
S
A
 
G
I
 
E
R
 
Q
N
 
Y
T
 
R
E
 
F
L
 
V
M
 
M
E
 
-
P
 
P
G
 
G
P
 
A
E
 
A
M
 
L
N
 
N
G
 
E
E
 
D
D
 
E
F
 
F
D
 
R
R
 
Q
F
 
L
V
 
E
G
 
E
V
 
Q
F
 
V
K
 
L
D
 
E
N
 
-
L
 
I
R
 
E
Q
 
S
S
 
G
A
 
A
L
 
I
T
 
L
V
 
V
M
 
I
S
 
S
G
 
G
S
|
S
W
 
L
P
 
P
K
 
P
G
 
G
A
 
V
P
 
K
K
 
L
T
 
E
A
 
K
Y
 
L
R
 
T
E
 
Q
L
 
L
I
 
I
A
 
S
A
 
A
A
 
A
N
 
Q
G
 
K
S
 
Q
G
 
G
K
 
I
K
 
R
V
 
C
I
 
I
L
 
V
D
 
D
C
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
T
 
S
H
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
-
E
 
-
K
 
A
I
 
I
F
 
G
G
 
N
I
 
I
H
 
E
L
 
L
-
 
V
-
x
K
-
 
P
N
 
N
E
 
Q
H
 
K
E
 
E
A
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
N
K
 
R
Q
 
E
Y
 
L
C
 
T
G
 
Q
T
 
P
S
 
D
S
 
D
V
 
V
H
 
R
E
 
K
A
 
A
F
 
A
D
 
Q
K
 
E
L
 
I
H
 
V
E
 
N
-
 
S
-
 
G
K
 
K
V
 
A
E
 
K
L
 
R
I
 
V
A
 
V
L
 
V
T
x
S
K
 
L
G
|
G
K
x
P
E
 
Q
G
|
G
L
 
A
F
 
L
L
 
G
S
 
V
Y
 
D
Q
 
S
G
 
E
T
 
N
R
 
C
L
 
I
H
 
Q
A
 
V
N
 
V
V
 
P
T
 
P
L
 
P
E
 
V
K
 
K
V
 
S
I
 
Q
S
 
S
T
|
T
V
 
V
G
|
G
C
x
A
G
|
G
D
|
D
C
 
S
L
x
M
T
 
V
A
 
G
G
 
A
V
 
M
A
 
T
L
 
L
G
 
K
V
 
L
S
 
A
R
 
E
G
 
N
Y
 
A
G
 
S
V
 
L
E
 
E
E
 
E
I
 
M
A
 
V
R
 
R
Y
 
F
G
 
G
A
x
V
A
 
A
F
 
A
G
|
G
A
x
S
A
 
A
N
 
A
C
x
T
L
 
L
R
 
N
P
 
Q
D
 
G
L
 
T
G
 
R
M
 
L
I
 
C
Y
 
S
K
 
H
A
 
D
D
 
D
V
 
T
E
 
Q
R
 
K
L
 
I

Sites not aligning to the query:

3n1cA Crystal structure of the phosphofructokinase-2 from escherichia coli in complex with fructose-6-phosphate (see paper)
25% identity, 85% coverage: 35:295/307 of query aligns to 37:303/309 of 3n1cA

query
sites
3n1cA
P
 
P
G
 
G
G
|
G
K
 
G
G
 
G
V
 
I
H
x
N
V
 
V
A
 
A
M
 
R
A
 
A
L
 
I
Q
 
A
E
 
H
A
 
L
G
 
G
A
 
G
P
 
S
T
 
A
V
 
T
L
 
A
M
 
I
A
 
F
A
 
P
W
 
A
A
 
G
G
 
G
H
 
A
P
 
T
G
 
G
E
 
E
W
 
H
I
 
L
K
 
V
A
 
S
A
 
L
C
 
L
K
 
A
E
 
D
R
 
E
G
 
N
M
 
V
A
 
P
T
 
V
V
 
A
G
 
T
V
 
V
D
 
E
L
 
A
K
 
K
G
 
D
M
 
W
N
 
T
R
|
R
K
 
Q
C
 
N
Y
 
L
T
 
H
F
 
V
L
 
H
A
 
V
E
 
E
A
 
A
T
 
S
A
 
G
I
 
E
R
 
Q
N
 
Y
T
 
R
E
 
F
L
 
V
M
 
M
E
 
-
P
 
P
G
 
G
P
 
A
E
 
A
M
 
L
N
 
N
G
 
E
E
 
D
D
 
E
F
 
F
D
 
R
R
 
Q
F
 
L
V
 
E
G
 
E
V
 
Q
F
 
V
K
 
L
D
 
E
N
 
-
L
 
I
R
 
E
Q
 
S
S
 
G
A
 
A
L
 
I
T
 
L
V
 
V
M
 
I
S
 
S
G
|
G
S
|
S
W
 
L
P
 
P
K
 
P
G
 
G
A
 
V
P
 
K
K
 
L
T
 
E
A
 
K
Y
 
L
R
 
T
E
 
Q
L
 
L
I
 
I
A
 
S
A
 
A
A
 
A
N
 
Q
G
 
K
S
 
Q
G
 
G
K
 
I
K
 
R
V
 
C
I
 
I
L
 
V
D
 
D
C
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
T
 
S
H
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
-
E
 
-
K
 
A
I
 
I
F
 
G
G
 
N
I
 
I
H
 
E
L
 
L
-
 
V
-
 
K
-
 
P
N
 
N
E
 
Q
H
 
K
E
 
E
A
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
N
K
 
R
Q
 
E
Y
 
L
C
 
T
G
 
Q
T
 
P
S
 
D
S
 
D
V
 
V
H
 
R
E
 
K
A
 
A
F
 
A
D
 
Q
K
 
E
L
 
I
H
 
V
E
 
N
-
 
S
-
 
G
K
 
K
V
 
A
E
 
K
L
 
R
I
 
V
A
 
V
L
 
V
T
 
S
K
 
L
G
 
G
K
 
P
E
 
Q
G
 
G
L
 
A
F
 
L
L
 
G
S
 
V
Y
 
D
Q
 
S
G
 
E
T
 
N
R
 
C
L
 
I
H
 
Q
A
 
V
N
 
V
V
 
P
T
 
P
L
 
P
E
 
V
K
 
K
V
 
S
I
 
Q
S
 
S
T
 
T
V
 
V
G
|
G
C
x
A
G
|
G
D
|
D
C
 
S
L
 
M
T
 
V
A
 
G
G
 
A
V
 
M
A
 
T
L
 
L
G
 
K
V
 
L
S
 
A
R
 
E
G
 
N
Y
 
A
G
 
S
V
 
L
E
 
E
E
 
E
I
 
M
A
 
V
R
 
R
Y
 
F
G
 
G
A
 
V
A
 
A
F
 
A
G
 
G
A
 
S
A
 
A
N
 
A
C
 
T
L
 
L
R
 
N
P
 
Q
D
 
G
L
 
T
G
 
R
M
 
L
I
 
C
Y
 
S
K
 
H
A
 
D
D
 
D
V
 
T
E
 
Q
R
 
K
L
 
I

Sites not aligning to the query:

P06999 ATP-dependent 6-phosphofructokinase isozyme 2; ATP-PFK 2; Phosphofructokinase 2; 6-phosphofructokinase isozyme II; Phosphohexokinase 2; EC 2.7.1.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
25% identity, 85% coverage: 35:295/307 of query aligns to 37:303/309 of P06999

query
sites
P06999
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
G
G
 
G
V
 
I
H
 
N
V
 
V
A
 
A
M
 
R
A
 
A
L
 
I
Q
 
A
E
 
H
A
 
L
G
 
G
A
 
G
P
 
S
T
 
A
V
 
T
L
 
A
M
 
I
A
 
F
A
 
P
W
 
A
A
 
G
G
 
G
H
 
A
P
 
T
G
 
G
E
 
E
W
 
H
I
 
L
K
 
V
A
 
S
A
 
L
C
 
L
K
 
A
E
 
D
R
 
E
G
 
N
M
 
V
A
 
P
T
 
V
V
 
A
G
 
T
V
 
V
D
 
E
L
 
A
K
 
K
G
 
D
M
 
W
N
 
T
R
 
R
K
 
Q
C
 
N
Y
 
L
T
 
H
F
 
V
L
 
H
A
 
V
E
 
E
A
 
A
T
 
S
A
 
G
I
 
E
R
 
Q
N
 
Y
T
 
R
E
 
F
L
 
V
M
 
M
E
 
-
P
 
P
G
 
G
P
 
A
E
 
A
M
 
L
N
 
N
G
 
E
E
 
D
D
 
E
F
 
F
D
 
R
R
 
Q
F
 
L
V
 
E
G
 
E
V
 
Q
F
 
V
K
 
L
D
 
E
N
 
-
L
 
I
R
 
E
Q
 
S
S
 
G
A
 
A
L
 
I
T
 
L
V
 
V
M
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
S
W
 
L
P
 
P
K
 
P
G
 
G
A
 
V
P
 
K
K
 
L
T
 
E
A
 
K
Y
 
L
R
 
T
E
 
Q
L
 
L
I
 
I
A
 
S
A
 
A
A
 
A
N
 
Q
G
 
K
S
 
Q
G
 
G
K
 
I
K
 
R
V
 
C
I
 
I
L
 
V
D
 
D
C
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
T
 
S
H
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
-
E
 
-
K
 
A
I
 
I
F
 
G
G
 
N
I
 
I
H
 
E
L
 
L
-
 
V
-
x
K
-
x
P
N
|
N
E
x
Q
H
x
K
E
|
E
A
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
N
K
 
R
Q
 
E
Y
 
L
C
 
T
G
 
Q
T
 
P
S
 
D
S
 
D
V
 
V
H
 
R
E
 
K
A
 
A
F
 
A
D
 
Q
K
 
E
L
 
I
H
 
V
E
 
N
-
 
S
-
 
G
K
 
K
V
 
A
E
 
K
L
 
R
I
 
V
A
 
V
L
 
V
T
x
S
K
x
L
G
|
G
K
x
P
E
x
Q
G
|
G
L
 
A
F
 
L
L
 
G
S
 
V
Y
 
D
Q
 
S
G
 
E
T
 
N
R
 
C
L
 
I
H
 
Q
A
 
V
N
 
V
V
 
P
T
 
P
L
 
P
E
 
V
K
 
K
V
x
S
I
 
Q
S
|
S
T
 
T
V
|
V
G
 
G
C
 
A
G
 
G
D
 
D
C
 
S
L
 
M
T
 
V
A
 
G
G
 
A
V
 
M
A
 
T
L
 
L
G
 
K
V
 
L
S
 
A
R
 
E
G
 
N
Y
 
A
G
 
S
V
 
L
E
 
E
E
 
E
I
 
M
A
 
V
R
 
R
Y
 
F
G
 
G
A
x
V
A
 
A
F
 
A
G
 
G
A
x
S
A
 
A
N
x
A
C
 
T
L
 
L
R
x
N
P
 
Q
D
x
G
L
 
T
G
x
R
M
 
L
I
 
C
Y
 
S
K
 
H
A
 
D
D
 
D
V
 
T
E
 
Q
R
 
K
L
 
I

Sites not aligning to the query:

3cqdA Structure of the tetrameric inhibited form of phosphofructokinase-2 from escherichia coli (see paper)
26% identity, 83% coverage: 35:288/307 of query aligns to 37:299/304 of 3cqdA

query
sites
3cqdA
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
G
G
 
G
V
 
I
H
 
N
V
 
V
A
 
A
M
 
R
A
 
A
L
 
I
Q
 
A
E
 
H
A
 
L
G
 
G
A
 
G
P
 
S
T
 
A
V
 
T
L
 
A
M
 
I
A
 
F
A
 
P
W
 
A
A
 
G
G
 
G
H
 
A
P
 
T
G
 
G
E
 
E
W
 
H
I
 
L
K
 
V
A
 
S
A
 
L
C
 
L
K
 
A
E
 
D
R
 
E
G
 
N
M
 
V
A
 
P
T
 
V
V
 
A
G
 
T
V
 
V
D
 
E
L
 
A
K
 
K
G
 
D
M
 
W
N
 
T
R
 
R
K
 
Q
C
 
N
Y
 
L
T
 
H
F
 
V
L
 
H
A
 
V
E
 
E
A
 
A
T
 
S
A
 
G
I
 
E
R
 
Q
N
 
Y
T
 
R
E
 
F
L
 
V
M
 
M
E
 
-
P
 
P
G
 
G
P
 
A
E
 
A
M
 
L
N
 
N
G
 
E
E
 
D
D
 
E
F
 
F
D
 
R
R
 
Q
F
 
L
V
 
E
G
 
E
V
 
Q
F
 
V
K
 
L
D
 
E
N
 
-
L
 
I
R
 
E
Q
 
S
S
 
G
A
 
A
L
 
I
T
 
L
V
 
V
M
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
S
W
 
L
P
 
P
K
 
P
G
 
G
A
 
V
P
 
K
K
 
L
T
 
E
A
 
K
Y
 
L
R
 
T
E
 
Q
L
 
L
I
 
I
A
 
S
A
 
A
A
 
A
N
 
Q
G
 
K
S
 
Q
G
 
G
K
 
I
K
 
R
V
 
C
I
 
I
L
 
V
D
 
D
C
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
T
 
S
H
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
-
E
 
-
K
 
A
I
 
I
F
 
G
G
 
N
I
 
I
H
 
E
L
 
L
-
 
V
-
x
K
-
 
P
N
|
N
E
 
Q
H
x
K
E
 
E
A
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
N
K
 
R
Q
 
E
Y
 
L
C
 
T
G
 
Q
T
 
P
S
 
D
S
 
D
V
 
V
H
 
R
E
 
K
A
 
A
F
 
A
D
 
Q
K
 
E
L
 
I
H
 
V
E
 
N
-
 
S
-
 
G
K
 
K
V
 
A
E
 
K
L
 
R
I
 
V
A
 
V
L
 
V
T
x
S
K
 
L
G
|
G
K
x
P
E
 
Q
G
|
G
L
 
A
F
 
L
L
 
G
S
 
V
Y
 
D
Q
 
S
G
 
E
T
 
N
R
 
C
L
 
I
H
 
Q
A
 
V
N
 
V
V
 
P
T
 
P
L
 
P
E
 
V
K
 
K
V
x
S
I
 
Q
S
 
S
T
|
T
V
 
V
G
|
G
C
x
A
G
|
G
D
|
D
C
 
S
L
x
M
T
 
V
A
 
G
G
 
A
V
 
M
A
 
T
L
 
L
G
 
K
V
 
L
S
 
A
R
 
E
G
 
N
Y
 
A
G
 
S
V
 
L
E
 
E
E
 
E
I
 
M
A
 
V
R
 
R
Y
 
F
G
 
G
A
x
V
A
 
A
F
 
A
G
|
G
A
x
S
A
 
A
N
 
A
-
x
T
-
 
L
-
 
L
C
 
C
L
 
S
R
 
H
P
 
D
D
 
D
L
 
T
G
 
Q
M
 
K
I
 
I
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

3uqeA Crystal structure of the phosphofructokinase-2 mutant y23d from escherichia coli
26% identity, 81% coverage: 35:284/307 of query aligns to 37:292/307 of 3uqeA

query
sites
3uqeA
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
G
G
 
G
V
 
I
H
 
N
V
 
V
A
 
A
M
 
R
A
 
A
L
 
I
Q
 
A
E
 
H
A
 
L
G
 
G
A
 
G
P
 
S
T
 
A
V
 
T
L
 
A
M
 
I
A
 
F
A
 
P
W
 
A
A
 
G
G
 
G
H
 
A
P
 
T
G
 
G
E
 
E
W
 
H
I
 
L
K
 
V
A
 
S
A
 
L
C
 
L
K
 
A
E
 
D
R
 
E
G
 
N
M
 
V
A
 
P
T
 
V
V
 
A
G
 
T
V
 
V
D
 
E
L
 
A
K
 
K
G
 
D
M
 
W
N
 
T
R
 
R
K
 
Q
C
 
N
Y
 
L
T
 
H
F
 
V
L
 
H
A
 
V
E
 
E
A
 
A
T
 
S
A
 
G
I
 
E
R
 
Q
N
 
Y
T
 
R
E
 
F
L
 
V
M
 
M
E
 
-
P
 
P
G
 
G
P
 
A
E
 
A
M
 
L
N
 
N
G
 
E
E
 
D
D
 
E
F
 
F
D
 
R
R
 
Q
F
 
L
V
 
E
G
 
E
V
 
Q
F
 
V
K
 
L
D
 
E
N
 
-
L
 
I
R
 
E
Q
 
S
S
 
G
A
 
A
L
 
I
T
 
L
V
 
V
M
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
S
W
 
L
P
 
P
K
 
P
G
 
G
A
 
V
P
 
K
K
 
L
T
 
E
A
 
K
Y
 
L
R
 
T
E
 
Q
L
 
L
I
 
I
A
 
S
A
 
A
A
 
A
N
 
Q
G
 
K
S
 
Q
G
 
G
K
 
I
K
 
R
V
 
C
I
 
I
L
 
V
D
 
D
C
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
T
 
S
H
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
-
E
 
-
K
 
A
I
 
I
F
 
G
G
 
N
I
 
I
H
 
E
L
 
L
-
 
V
-
x
K
-
 
P
N
|
N
E
 
Q
H
x
K
E
 
E
A
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
N
K
 
R
Q
 
E
Y
 
L
C
 
T
G
 
Q
T
 
P
S
 
D
S
 
D
V
 
V
H
 
R
E
 
K
A
 
A
F
 
A
D
 
Q
K
 
E
L
 
I
H
 
V
E
 
N
-
 
S
-
 
G
K
 
K
V
 
A
E
 
K
L
 
R
I
 
V
A
 
V
L
 
V
T
x
S
K
 
L
G
|
G
K
x
P
E
 
Q
G
|
G
L
 
A
F
 
L
L
 
G
S
 
V
Y
 
D
Q
 
S
G
 
E
T
 
N
R
 
C
L
 
I
H
 
Q
A
 
V
N
 
V
V
 
P
T
 
P
L
 
P
E
 
V
K
 
K
V
x
S
I
 
Q
S
 
S
T
 
T
V
 
V
G
|
G
C
x
A
G
|
G
D
|
D
C
 
S
L
x
M
T
 
V
A
 
G
G
 
A
V
 
M
A
 
T
L
 
L
G
 
K
V
 
L
S
 
A
R
 
E
G
 
N
Y
 
A
G
 
S
V
 
L
E
 
E
E
 
E
I
 
M
A
 
V
R
 
R
Y
 
F
G
 
G
A
x
V
A
 
A
F
 
A
G
|
G
A
x
S
A
 
A
N
 
A
C
x
T
L
 
L
R
 
N
P
 
Q
D
 
R
L
 
L

3b1rA Structure of burkholderia thailandensis nucleoside kinase (bthnk) in complex with amp-mg-amp (see paper)
28% identity, 36% coverage: 168:276/307 of query aligns to 174:280/310 of 3b1rA

query
sites
3b1rA
S
 
D
G
 
G
E
 
A
Q
 
T
L
 
L
T
 
R
H
 
R
A
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
L
K
 
A
I
 
T
F
 
Y
G
 
-
I
 
I
H
 
A
L
 
V
N
 
N
E
 
D
H
 
Y
E
 
E
A
 
A
K
 
K
Q
 
L
Y
 
V
C
 
C
G
 
D
T
 
K
S
 
T
S
 
G
V
 
W
H
 
S
E
 
E
A
 
-
F
 
-
D
 
D
K
 
E
L
 
I
H
 
A
E
 
S
K
 
R
V
 
V
E
 
Q
L
 
A
I
 
L
A
 
I
L
 
I
T
|
T
K
 
R
G
|
G
K
x
E
E
 
H
G
|
G
L
 
A
F
 
T
L
 
I
S
 
R
Y
 
H
Q
 
R
-
 
D
G
 
G
T
 
T
R
 
E
L
 
Q
H
 
I
A
 
P
N
 
A
V
 
V
T
 
R
L
 
A
E
 
E
K
 
R
V
 
V
I
 
I
S
x
D
T
x
P
V
 
T
G
|
G
C
|
C
G
 
G
D
|
D
C
 
A
L
x
F
T
 
R
A
 
G
G
 
G
V
 
L
A
 
L
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
S
 
E
R
 
H
G
 
G
Y
 
F
G
 
D
V
 
W
E
 
A
E
 
T
I
 
A
A
 
G
R
 
R
Y
 
L
G
 
A
A
x
S
A
 
L
F
 
M
G
|
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3b1pA Structure of burkholderia thailandensis nucleoside kinase (bthnk) in complex with adp-inosine (see paper)
28% identity, 36% coverage: 168:276/307 of query aligns to 174:280/319 of 3b1pA

query
sites
3b1pA
S
 
D
G
 
G
E
 
A
Q
 
T
L
 
L
T
 
R
H
 
R
A
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
L
K
 
A
I
 
T
F
 
Y
G
 
-
I
 
I
H
 
A
L
 
V
N
 
N
E
 
D
H
 
Y
E
 
E
A
 
A
K
 
K
Q
 
L
Y
 
V
C
 
C
G
 
D
T
 
K
S
 
T
S
 
G
V
 
W
H
 
S
E
 
E
A
 
-
F
 
-
D
 
D
K
 
E
L
 
I
H
 
A
E
 
S
K
 
R
V
 
V
E
 
Q
L
 
A
I
 
L
A
 
I
L
 
I
T
|
T
K
 
R
G
|
G
K
x
E
E
 
H
G
|
G
L
 
A
F
 
T
L
 
I
S
 
R
Y
 
H
Q
 
R
-
 
D
G
 
G
T
 
T
R
 
E
L
 
Q
H
 
I
A
 
P
N
 
A
V
 
V
T
 
R
L
 
A
E
 
E
K
 
R
V
 
V
I
 
I
S
 
D
T
 
P
V
 
T
G
|
G
C
|
C
G
|
G
D
|
D
C
 
A
L
 
F
T
 
R
A
 
G
G
 
G
V
 
L
A
 
L
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
S
 
E
R
 
H
G
 
G
Y
 
F
G
 
D
V
 
W
E
 
A
E
 
T
I
 
A
A
 
G
R
 
R
Y
 
L
G
 
A
A
x
S
A
 
L
F
 
M
G
|
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3b1nB Structure of burkholderia thailandensis nucleoside kinase (bthnk) in complex with adp-mizoribine (see paper)
28% identity, 36% coverage: 168:276/307 of query aligns to 174:280/320 of 3b1nB

query
sites
3b1nB
S
 
D
G
 
G
E
 
A
Q
 
T
L
 
L
T
 
R
H
 
R
A
 
S
L
 
I
E
 
E
E
 
L
K
 
A
I
 
T
F
 
Y
G
 
-
I
 
I
H
 
A
L
 
V
N
 
N
E
 
D
H
 
Y
E
 
E
A
 
A
K
 
K
Q
 
L
Y
 
V
C
 
C
G
 
D
T
 
K
S
 
T
S
 
G
V
 
W
H
 
S
E
 
E
A
 
-
F
 
-
D
 
D
K
 
E
L
 
I
H
 
A
E
 
S
K
 
R
V
 
V
E
 
Q
L
 
A
I
 
L
A
 
I
L
 
I
T
|
T
K
 
R
G
|
G
K
x
E
E
 
H
G
|
G
L
 
A
F
 
T
L
 
I
S
 
R
Y
 
H
Q
 
R
-
 
D
G
 
G
T
 
T
R
 
E
L
 
Q
H
 
I
A
 
P
N
 
A
V
 
V
T
 
R
L
 
A
E
 
E
K
 
R
V
 
V
I
 
I
S
 
D
T
 
P
V
 
T
G
|
G
C
|
C
G
|
G
D
|
D
C
 
A
L
 
F
T
 
R
A
 
G
G
 
G
V
 
L
A
 
L
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
S
 
E
R
 
H
G
 
G
Y
 
F
G
 
D
V
 
W
E
 
A
E
 
T
I
 
A
A
 
G
R
 
R
Y
 
L
G
 
A
A
x
S
A
 
L
F
 
M
G
|
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3uboA The crystal structure of adenosine kinase from sinorhizobium meliloti
26% identity, 49% coverage: 123:271/307 of query aligns to 141:300/338 of 3uboA

query
sites
3uboA
V
 
V
F
 
E
K
 
D
D
 
D
N
 
V
L
 
V
R
 
A
Q
 
Q
S
 
S
A
 
K
L
 
V
T
 
T
V
 
Y
M
 
F
S
x
E
G
 
G
S
x
Y
-
 
L
W
 
W
P
 
D
K
 
P
G
 
P
A
 
R
P
 
A
K
 
K
T
 
D
A
 
A
Y
 
I
R
 
R
E
 
E
L
 
A
I
 
A
A
 
R
A
 
I
A
 
A
N
 
H
G
 
A
S
 
H
G
 
G
K
 
R
K
 
E
V
 
T
I
 
A
L
 
M
D
 
T
C
 
L
S
 
S
G
 
D
E
 
S
Q
 
F
L
 
C
T
 
V
H
 
H
A
 
R
L
 
Y
E
 
R
E
 
S
K
 
E
I
 
F
F
 
L
G
 
E
-
 
L
-
 
M
-
 
R
-
 
S
-
 
G
-
 
T
-
 
V
-
 
D
-
 
I
I
 
V
H
 
F
L
 
A
N
|
N
E
 
R
H
 
Q
E
 
E
A
 
A
K
 
L
Q
 
A
Y
 
L
C
 
Y
G
 
E
T
 
T
S
 
E
S
 
D
V
 
F
H
 
D
E
 
R
A
 
A
F
 
L
D
 
E
K
 
L
L
 
L
H
 
A
E
 
R
K
 
D
V
 
C
E
 
K
L
 
L
I
 
A
A
 
A
L
 
V
T
|
T
K
 
L
G
x
S
K
x
E
E
 
E
G
|
G
L
 
S
F
 
V
L
 
V
S
 
V
Y
 
R
Q
 
G
G
 
A
T
 
E
R
 
R
L
 
V
H
 
R
A
 
V
N
 
G
V
 
A
T
 
S
-
 
V
L
|
L
E
 
E
K
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
C
x
A
G
|
G
D
|
D
C
 
L
L
 
Y
T
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
F
A
 
L
L
 
F
G
 
G
V
 
Y
S
 
T
R
 
S
G
 
G
Y
 
R
G
 
S
V
 
L
E
 
E
E
 
E
I
 
C
A
 
S
R
 
K
Y
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Echvi_0157 FitnessBrowser__Cola:Echvi_0157
MVLSVCPNPSIDTYAWLEDFQLGKANRISKQEEFPGGKGVHVAMALQEAGAPTVLMAAWA
GHPGEWIKAACKERGMATVGVDLKGMNRKCYTFLAEATAIRNTELMEPGPEMNGEDFDRF
VGVFKDNLRQSALTVMSGSWPKGAPKTAYRELIAAANGSGKKVILDCSGEQLTHALEEKI
FGIHLNEHEAKQYCGTSSVHEAFDKLHEKVELIALTKGKEGLFLSYQGTRLHANVTLEKV
ISTVGCGDCLTAGVALGVSRGYGVEEIARYGAAFGAANCLRPDLGMIYKADVERLLPQVN
INELTYG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory