SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Echvi_0893 FitnessBrowser__Cola:Echvi_0893 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3of4C Crystal structure of a fmn/fad- and NAD(p)h-dependent nitroreductase (nfnb, il2077) from idiomarina loihiensis l2tr at 1.90 a resolution
34% identity, 95% coverage: 4:207/215 of query aligns to 3:206/208 of 3of4C

query
sites
3of4C
L
 
L
E
 
E
N
 
K
L
 
L
E
 
Q
-
 
Q
W
 
W
R
 
R
Y
 
Y
A
|
A
T
 
T
K
x
A
K
 
D
M
 
F
N
 
S
G
 
G
K
 
A
A
 
H
V
 
I
P
 
T
Q
 
D
E
 
D
K
 
V
V
 
L
D
 
D
Y
 
K
I
 
L
L
 
L
E
 
N
A
 
T
A
 
T
R
 
R
L
 
L
S
 
T
P
 
A
S
 
S
S
 
S
S
 
Y
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
Y
R
 
C
V
 
T
I
 
L
V
 
V
V
 
I
T
 
R
D
 
N
P
 
K
E
 
G
I
 
L
K
 
R
E
 
E
K
 
Q
M
 
L
K
 
V
P
 
N
I
 
H
A
 
S
W
 
F
D
 
G
Q
|
Q
S
 
Q
Q
x
K
I
 
V
T
 
A
D
 
D
A
 
S
S
 
S
H
 
A
I
 
L
L
 
V
V
 
I
F
 
F
A
 
A
A
 
A
W
 
K
E
 
T
N
 
G
Y
 
A
T
 
V
E
 
A
E
 
D
K
 
I
I
 
V
K
 
D
A
 
P
V
 
Y
F
 
I
K
 
S
E
 
E
T
 
L
L
 
S
T
 
Q
A
 
Q
R
 
R
G
 
Q
L
 
L
P
 
T
L
 
N
D
 
E
K
 
E
M
 
A
D
 
E
A
 
N
Y
 
T
R
 
R
-
 
N
-
 
Y
-
 
F
-
 
T
E
 
Q
R
 
K
L
 
L
W
 
Q
G
 
A
M
 
M
Y
 
S
S
 
A
Q
 
A
L
 
T
P
 
R
E
 
K
E
 
E
W
 
W
H
 
-
A
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
A
A
 
V
K
 
R
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
A
 
G
F
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
F
I
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
L
K
 
E
V
 
V
D
 
D
A
 
S
T
x
C
P
|
P
M
|
M
E
|
E
G
|
G
F
 
I
D
 
E
P
 
H
E
 
D
G
 
A
L
 
Y
D
 
D
A
 
N
L
 
I
L
 
L
G
 
S
L
 
L
K
 
K
E
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
S
S
 
T
A
 
V
V
 
F
V
 
A
L
 
C
P
 
P
L
 
V
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
D
 
S
E
 
E
E
 
A
N
 
-
D
 
D
W
 
T
L
 
T
A
 
Q
G
 
F
M
 
Q
K
 
K
K
 
K
F
 
V
R
 
R
T
 
Q
P
 
P
K
 
L
E
 
S
E
 
R
F
 
F
I
 
K
I
 
V

3of4A Crystal structure of a fmn/fad- and NAD(p)h-dependent nitroreductase (nfnb, il2077) from idiomarina loihiensis l2tr at 1.90 a resolution
34% identity, 95% coverage: 4:207/215 of query aligns to 3:206/208 of 3of4A

query
sites
3of4A
L
 
L
E
 
E
N
 
K
L
 
L
E
 
Q
-
 
Q
W
 
W
R
|
R
Y
|
Y
A
|
A
T
 
T
K
x
A
K
 
D
M
 
F
N
 
S
G
 
G
K
 
A
A
 
H
V
 
I
P
 
T
Q
 
D
E
 
D
K
 
V
V
 
L
D
 
D
Y
 
K
I
 
L
L
 
L
E
 
N
A
 
T
A
 
T
R
 
R
L
 
L
S
 
T
P
x
A
S
|
S
S
|
S
S
 
Y
G
|
G
L
 
L
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
Y
R
 
C
V
 
T
I
 
L
V
 
V
V
 
I
T
 
R
D
 
N
P
 
K
E
 
G
I
 
L
K
 
R
E
 
E
K
 
Q
M
 
L
K
 
V
P
 
N
I
 
H
A
 
S
W
 
F
D
 
G
Q
|
Q
S
 
Q
Q
x
K
I
 
V
T
 
A
D
 
D
A
 
S
S
 
S
H
 
A
I
 
L
L
 
V
V
 
I
F
 
F
A
 
A
A
 
A
W
 
K
E
 
T
N
 
G
Y
 
A
T
 
V
E
 
A
E
 
D
K
 
I
I
 
V
K
 
D
A
 
P
V
 
Y
F
 
I
K
 
S
E
 
E
T
 
L
L
 
S
T
 
Q
A
 
Q
R
 
R
G
 
Q
L
 
L
P
 
T
L
 
N
D
 
E
K
 
E
M
 
A
D
 
E
A
 
N
Y
 
T
R
 
R
-
 
N
-
 
Y
-
 
F
-
 
T
E
 
Q
R
 
K
L
 
L
W
 
Q
G
 
A
M
 
M
Y
 
S
S
 
A
Q
 
A
L
 
T
P
 
R
E
 
K
E
 
E
W
 
W
H
 
-
A
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
A
A
 
V
K
 
R
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
A
 
G
F
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
F
I
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
L
K
 
E
V
 
V
D
 
D
A
 
S
T
x
C
P
|
P
M
|
M
E
|
E
G
|
G
F
 
I
D
 
E
P
 
H
E
 
D
G
 
A
L
 
Y
D
 
D
A
 
N
L
 
I
L
 
L
G
 
S
L
 
L
K
 
K
E
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
S
S
 
T
A
 
V
V
 
F
V
 
A
L
 
C
P
 
P
L
 
V
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
D
 
S
E
 
E
E
 
A
N
 
-
D
 
D
W
 
T
L
 
T
A
 
Q
G
 
F
M
 
Q
K
 
K
K
 
K
F
 
V
R
|
R
T
 
Q
P
 
P
K
 
L
E
 
S
E
 
R
F
 
F
I
 
K
I
 
V

6czpA 2.2 angstrom resolution crystal structure oxygen-insensitive NAD(p)h- dependent nitroreductase nfsb from vibrio vulnificus in complex with fmn
33% identity, 93% coverage: 1:199/215 of query aligns to 3:209/219 of 6czpA

query
sites
6czpA
M
 
M
S
 
T
L
 
I
L
 
V
E
 
Q
N
 
A
L
 
A
E
 
Q
W
 
S
R
|
R
Y
|
Y
A
x
S
T
 
T
K
|
K
K
 
A
M
 
F
N
 
D
G
 
A
-
 
S
K
 
R
A
 
K
V
 
L
P
 
P
Q
 
E
E
 
E
K
 
K
V
 
V
D
 
A
Y
 
A
I
 
V
L
 
K
E
 
E
A
 
L
A
 
I
R
 
R
L
 
M
S
 
S
P
 
A
S
|
S
S
|
S
S
 
V
G
x
N
L
 
S
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
W
R
 
H
V
 
F
I
 
I
V
 
V
V
 
A
T
 
S
D
 
S
P
 
E
E
 
E
I
 
G
K
 
K
E
 
A
K
 
R
M
 
I
K
 
A
P
 
K
-
 
A
-
 
T
-
 
Q
-
 
G
-
 
G
I
 
F
A
 
A
W
 
F
D
x
N
Q
 
E
S
 
R
Q
x
K
I
 
I
T
 
L
D
 
D
A
 
A
S
 
S
H
 
H
I
 
V
L
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
C
A
 
A
W
 
K
-
 
T
-
 
A
-
 
I
-
 
D
E
 
E
N
 
A
Y
 
Y
T
 
L
E
 
L
E
 
D
K
 
L
I
 
L
K
 
E
A
 
S
V
 
E
F
 
D
K
 
K
E
 
D
T
 
G
L
 
R
T
 
F
A
 
A
R
 
D
G
 
V
L
 
E
P
 
A
L
 
K
D
 
N
K
 
G
M
 
M
D
 
H
A
 
A
Y
 
G
R
 
R
E
 
S
R
 
F
L
 
F
W
 
V
G
 
N
M
 
M
Y
 
H
S
 
R
Q
 
F
L
 
D
P
 
L
E
 
K
E
 
D
W
 
A
H
 
H
A
 
-
H
 
H
H
 
W
A
 
M
A
 
E
K
 
K
Q
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
I
 
L
A
 
N
F
 
V
G
 
G
T
 
T
A
 
L
I
 
L
A
 
L
A
 
G
A
 
A
A
 
S
E
 
A
Q
 
M
K
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
V
P
|
P
M
x
I
E
|
E
G
|
G
F
 
F
D
 
D
P
 
A
E
 
K
G
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
E
L
 
E
L
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
R
E
 
E
L
 
K
G
 
G
L
 
F
K
 
T
S
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
I
L
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
R
 
H
D
 
-
E
 
S
E
 
E
N
 
D
D
 
D
W
 
F
L
 
N
A
 
A
G
 
K
M
 
L
K
 
P
K
|
K
F
 
S
R
|
R

7uwtB Structure of oxygen-insensitive NAD(p)h-dependent nitroreductase nfsb_vv f70a/f108y (ntr 2.0) in complex with fmn at 1.85 angstroms resolution (see paper)
33% identity, 93% coverage: 1:199/215 of query aligns to 1:207/217 of 7uwtB

query
sites
7uwtB
M
|
M
S
 
T
L
 
I
L
 
V
E
 
Q
N
 
A
L
 
A
E
 
Q
W
 
S
R
|
R
Y
|
Y
A
x
S
T
 
T
K
|
K
K
 
A
M
 
F
N
 
D
G
 
A
-
 
S
K
 
R
A
 
K
V
 
L
P
 
P
Q
 
E
E
 
E
K
 
K
V
 
V
D
 
A
Y
 
A
I
 
V
L
 
K
E
 
E
A
 
L
A
 
I
R
 
R
L
 
M
S
 
S
P
 
A
S
 
S
S
 
S
S
 
V
G
 
N
L
 
S
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
W
R
 
H
V
 
F
I
 
I
V
 
V
V
 
A
T
 
S
D
 
S
P
x
E
E
 
E
I
 
G
K
 
K
E
 
A
K
 
R
M
 
I
K
 
A
P
 
K
-
 
A
-
 
T
-
 
Q
-
 
G
-
 
G
I
 
F
A
 
A
W
 
A
D
x
N
Q
 
E
S
 
R
Q
x
K
I
 
I
T
x
L
D
|
D
A
 
A
S
 
S
H
 
H
I
 
V
L
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
C
A
 
A
W
 
K
-
 
T
-
 
A
-
 
I
-
 
D
E
 
E
N
 
A
Y
 
Y
T
 
L
E
 
L
E
 
D
K
 
L
I
 
L
K
 
E
A
 
S
V
 
E
F
 
D
K
 
K
E
 
D
T
 
G
L
 
R
T
 
Y
A
 
A
R
 
D
G
 
V
L
 
E
P
 
A
L
 
K
D
 
N
K
 
G
M
 
M
D
 
H
A
 
A
Y
 
G
R
 
R
E
 
S
R
 
F
L
 
F
W
 
V
G
 
N
M
 
M
Y
 
H
S
 
R
Q
 
F
L
 
D
P
 
L
E
 
K
E
 
D
W
 
A
H
 
H
A
 
-
H
 
H
H
 
W
A
 
M
A
 
E
K
 
K
Q
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
I
 
L
A
 
N
F
 
V
G
 
G
T
 
T
A
 
L
I
 
L
A
 
L
A
 
G
A
 
A
A
 
S
E
 
A
Q
 
M
K
x
E
V
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
V
P
|
P
M
x
I
E
|
E
G
|
G
F
 
F
D
 
D
P
 
A
E
 
K
G
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
E
L
 
E
L
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
R
E
 
E
L
 
K
G
 
G
L
 
F
K
 
T
S
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
I
L
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
R
 
H
D
 
-
E
 
S
E
 
E
N
x
D
D
 
D
W
 
F
L
 
N
A
 
A
G
 
K
M
 
L
K
 
P
K
|
K
F
 
S
R
|
R

1v5zA Binding of coumarins to NAD(p)h:fmn oxidoreductase
30% identity, 95% coverage: 3:206/215 of query aligns to 4:214/217 of 1v5zA

query
sites
1v5zA
L
 
I
L
 
I
E
 
H
N
 
D
L
 
L
E
 
E
W
 
N
R
|
R
Y
|
Y
A
x
T
T
 
S
K
|
K
K
 
K
M
 
Y
N
 
D
-
 
P
G
 
S
K
 
K
A
 
K
V
 
V
P
 
S
Q
 
Q
E
 
E
K
 
D
V
 
L
D
 
A
Y
 
V
I
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
L
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
x
A
S
|
S
S
|
S
S
x
I
G
x
N
L
 
S
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
W
R
 
K
V
 
F
I
 
I
V
 
V
V
 
I
T
 
E
D
 
S
P
 
D
E
 
A
I
 
A
K
 
K
E
 
Q
K
 
R
M
 
M
K
 
H
P
 
D
I
 
S
-
 
F
-
 
A
-
 
N
-
 
M
-
 
H
A
 
Q
W
 
F
D
x
N
Q
 
Q
S
 
P
Q
x
H
I
 
I
T
 
K
D
 
A
A
 
C
S
 
S
H
 
H
I
 
V
L
 
I
V
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
N
W
 
K
E
 
L
N
 
S
Y
 
Y
T
 
T
E
 
R
E
 
D
K
 
D
I
 
Y
K
 
D
A
 
V
V
 
V
F
 
L
K
 
S
E
 
K
T
 
A
L
 
V
T
 
A
A
 
D
R
 
K
G
 
R
L
 
I
P
 
T
L
 
E
D
 
E
K
 
Q
M
 
K
D
 
E
A
 
A
Y
 
A
R
 
F
E
 
A
R
 
S
L
 
F
W
 
-
G
 
-
M
 
K
Y
x
F
S
 
V
Q
 
E
L
 
L
P
 
N
E
 
C
E
 
D
W
 
E
H
 
N
A
 
G
H
 
E
H
 
H
A
 
K
A
 
A
-
 
W
-
 
T
-
 
K
K
 
P
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
I
 
L
A
 
A
F
 
L
G
 
G
T
 
N
A
 
A
I
 
L
A
 
H
A
 
T
A
 
L
A
 
A
E
 
R
Q
 
L
K
 
N
V
 
I
D
 
D
A
 
S
T
 
T
P
x
T
M
|
M
E
|
E
G
|
G
F
 
I
D
 
D
P
 
P
E
 
E
G
 
L
L
 
L
D
 
S
A
 
E
L
 
I
L
 
F
G
 
A
L
 
D
K
 
E
E
 
L
L
 
K
G
 
G
L
 
Y
K
 
E
S
 
C
A
 
H
V
 
V
V
 
A
L
 
L
P
 
A
L
 
I
G
 
G
Y
 
Y
R
 
H
D
 
H
E
 
P
E
 
S
N
 
E
D
 
D
W
 
Y
L
 
N
A
 
A
G
 
S
M
 
L
K
 
P
K
|
K
F
 
S
R
|
R
T
 
K
P
 
A
K
 
F
E
 
E
E
 
D
F
 
V
I
 
I

1v5yA Binding of coumarins to NAD(p)h:fmn oxidoreductase
30% identity, 95% coverage: 3:206/215 of query aligns to 4:214/217 of 1v5yA

query
sites
1v5yA
L
 
I
L
 
I
E
 
H
N
 
D
L
 
L
E
 
E
W
 
N
R
|
R
Y
|
Y
A
x
T
T
 
S
K
|
K
K
 
K
M
 
Y
N
 
D
-
 
P
G
 
S
K
 
K
A
 
K
V
 
V
P
 
S
Q
 
Q
E
 
E
K
 
D
V
 
L
D
 
A
Y
 
V
I
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
L
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
x
A
S
|
S
S
|
S
S
x
I
G
 
N
L
 
S
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
W
R
 
K
V
 
F
I
 
I
V
 
V
V
 
I
T
 
E
D
 
S
P
 
D
E
 
A
I
 
A
K
 
K
E
 
Q
K
 
R
M
 
M
K
 
H
P
 
D
I
 
S
-
 
F
-
 
A
-
 
N
-
 
M
-
 
H
A
 
Q
W
 
F
D
x
N
Q
 
Q
S
 
P
Q
x
H
I
 
I
T
 
K
D
 
A
A
 
C
S
 
S
H
 
H
I
 
V
L
 
I
V
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
N
W
 
K
E
 
L
N
 
S
Y
 
Y
T
 
T
E
 
R
E
 
D
K
 
D
I
 
Y
K
 
D
A
 
V
V
 
V
F
 
L
K
 
S
E
 
K
T
 
A
L
 
V
T
 
A
A
 
D
R
 
K
G
 
R
L
 
I
P
 
T
L
 
E
D
 
E
K
 
Q
M
 
K
D
 
E
A
 
A
Y
 
A
R
 
F
E
 
A
R
 
S
L
 
F
W
 
-
G
 
-
M
 
K
Y
x
F
S
 
V
Q
 
E
L
 
L
P
 
N
E
 
C
E
 
D
W
 
E
H
 
N
A
 
G
H
 
E
H
 
H
A
 
K
A
 
A
-
 
W
-
 
T
-
 
K
K
 
P
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
I
 
L
A
 
A
F
 
L
G
 
G
T
 
N
A
 
A
I
 
L
A
 
H
A
 
T
A
 
L
A
 
A
E
 
R
Q
 
L
K
 
N
V
 
I
D
 
D
A
 
S
T
 
T
P
x
T
M
|
M
E
|
E
G
|
G
F
 
I
D
 
D
P
 
P
E
 
E
G
 
L
L
 
L
D
 
S
A
 
E
L
 
I
L
 
F
G
 
A
L
 
D
K
 
E
E
 
L
L
 
K
G
 
G
L
 
Y
K
 
E
S
 
C
A
 
H
V
 
V
V
 
A
L
 
L
P
 
A
L
 
I
G
 
G
Y
 
Y
R
 
H
D
 
H
E
 
P
E
 
S
N
 
E
D
 
D
W
 
Y
L
 
N
A
 
A
G
 
S
M
 
L
K
 
P
K
|
K
F
 
S
R
|
R
T
 
K
P
 
A
K
 
F
E
 
E
E
 
D
F
 
V
I
 
I

7jh4B Crystal structure of NAD(p)h-flavin oxidoreductase (nfor) from s. Aureus complexed with reduced fmn and NAD+ (see paper)
29% identity, 87% coverage: 2:188/215 of query aligns to 7:202/223 of 7jh4B

query
sites
7jh4B
S
 
T
L
 
I
L
 
M
E
 
D
N
 
A
L
 
F
E
 
H
W
 
F
R
|
R
Y
x
H
A
|
A
T
 
T
K
|
K
K
 
Q
M
 
F
N
 
D
-
 
P
G
 
Q
K
 
K
A
 
K
V
 
V
P
 
S
Q
 
K
E
 
E
K
 
D
V
 
F
D
 
E
Y
 
T
I
 
I
L
 
L
E
 
E
A
 
S
A
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
|
P
S
|
S
S
|
S
S
x
L
G
|
G
L
 
L
Q
 
E
P
 
P
Y
 
W
R
 
K
V
 
F
I
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
Q
D
 
D
P
 
Q
E
 
A
I
 
L
K
 
R
E
 
D
K
 
E
M
 
L
K
 
K
P
 
A
I
 
H
A
 
S
W
 
W
D
x
G
Q
 
A
S
 
A
-
 
K
Q
|
Q
I
 
L
T
 
D
D
 
T
A
 
A
S
 
S
H
 
H
I
 
F
L
 
V
V
 
L
F
 
I
A
 
F
A
 
A
W
 
R
E
 
K
N
 
N
Y
 
V
T
 
T
E
 
S
E
 
R
K
 
S
-
 
P
-
 
Y
I
 
V
K
 
Q
A
 
H
V
 
M
F
 
L
K
 
R
E
 
D
T
 
I
-
 
K
-
 
K
L
 
Y
T
 
E
A
 
A
R
 
Q
G
 
T
L
 
I
P
 
P
L
 
A
-
 
V
-
 
E
D
 
Q
K
 
K
M
 
F
D
 
D
A
 
A
Y
x
F
R
 
Q
E
 
A
R
 
D
L
 
F
W
 
H
-
 
I
G
 
S
M
 
D
Y
 
N
S
 
D
Q
 
Q
L
 
A
P
 
L
E
 
Y
E
 
D
W
 
W
H
 
-
A
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
S
A
 
S
K
 
K
Q
|
Q
A
 
T
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
F
 
L
G
 
G
T
 
N
A
 
M
I
 
M
A
 
T
A
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
L
Q
 
L
K
 
G
V
 
I
D
 
D
A
 
S
T
 
C
P
|
P
M
|
M
E
|
E
G
|
G
F
 
F
D
 
S
P
 
L
E
 
D
G
 
T
L
 
V
D
 
T
A
 
D
L
 
I
L
 
L
G
 
A
L
 
N
K
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
L
-
 
D
-
 
T
-
 
E
E
 
Q
L
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
-
S
 
-
A
 
S
V
 
V
V
 
M
L
 
V
P
 
A
L
 
F
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
D
 
Q
E
 
Q
E
 
D

Sites not aligning to the query:

7jh4A Crystal structure of NAD(p)h-flavin oxidoreductase (nfor) from s. Aureus complexed with reduced fmn and NAD+ (see paper)
29% identity, 87% coverage: 2:188/215 of query aligns to 7:202/223 of 7jh4A

query
sites
7jh4A
S
 
T
L
 
I
L
 
M
E
 
D
N
 
A
L
 
F
E
 
H
W
 
F
R
|
R
Y
x
H
A
|
A
T
 
T
K
|
K
K
 
Q
M
 
F
N
 
D
-
 
P
G
 
Q
K
 
K
A
 
K
V
 
V
P
 
S
Q
 
K
E
 
E
K
 
D
V
 
F
D
 
E
Y
 
T
I
 
I
L
 
L
E
 
E
A
 
S
A
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
|
P
S
|
S
S
|
S
S
 
L
G
|
G
L
 
L
Q
 
E
P
 
P
Y
 
W
R
 
K
V
 
F
I
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
Q
D
 
D
P
 
Q
E
 
A
I
 
L
K
 
R
E
 
D
K
 
E
M
 
L
K
 
K
P
 
A
I
 
H
A
 
S
W
 
W
D
x
G
Q
 
A
S
 
A
-
 
K
Q
|
Q
I
 
L
T
 
D
D
 
T
A
 
A
S
 
S
H
 
H
I
 
F
L
 
V
V
 
L
F
 
I
A
 
F
A
 
A
W
 
R
E
 
K
N
 
N
Y
 
V
T
 
T
E
 
S
E
 
R
K
 
S
-
 
P
-
 
Y
I
 
V
K
 
Q
A
 
H
V
 
M
F
 
L
K
 
R
E
 
D
T
 
I
-
 
K
-
 
K
L
 
Y
T
 
E
A
 
A
R
 
Q
G
 
T
L
 
I
P
 
P
L
 
A
-
 
V
-
 
E
D
 
Q
K
 
K
M
 
F
D
 
D
A
 
A
Y
 
F
R
 
Q
E
 
A
R
 
D
L
 
F
W
 
H
-
 
I
G
 
S
M
 
D
Y
 
N
S
 
D
Q
 
Q
L
 
A
P
 
L
E
 
Y
E
 
D
W
 
W
H
 
-
A
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
S
A
 
S
K
 
K
Q
|
Q
A
 
T
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
F
 
L
G
 
G
T
 
N
A
 
M
I
 
M
A
 
T
A
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
L
Q
 
L
K
 
G
V
 
I
D
 
D
A
 
S
T
 
C
P
|
P
M
|
M
E
|
E
G
|
G
F
 
F
D
 
S
P
 
L
E
 
D
G
 
T
L
 
V
D
 
T
A
 
D
L
 
I
L
 
L
G
 
A
L
 
N
K
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
L
-
 
D
-
 
T
-
 
E
E
 
Q
L
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
-
S
 
-
A
 
S
V
 
V
V
 
M
L
 
V
P
 
A
L
 
F
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
D
 
Q
E
 
Q
E
 
D

Sites not aligning to the query:

8q5gA Crystal structure of nitroreductase from bacillus tequilensis with covalent fmn (see paper)
34% identity, 78% coverage: 18:185/215 of query aligns to 9:187/206 of 8q5gA

query
sites
8q5gA
G
 
N
K
 
K
A
 
K
V
 
V
P
 
S
Q
 
D
E
 
S
K
 
D
V
 
F
D
 
E
Y
 
F
I
 
I
L
 
L
E
 
E
A
 
T
A
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
|
P
S
|
S
S
|
S
S
 
L
G
|
G
L
 
L
Q
 
E
P
 
P
Y
 
W
R
 
K
V
 
F
I
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
Q
D
 
N
P
 
P
E
 
E
I
 
F
K
 
R
E
 
E
K
 
K
M
 
L
K
 
R
P
 
E
I
 
Y
A
 
T
W
 
W
D
x
G
-
 
A
Q
 
Q
S
 
K
Q
 
Q
I
 
L
T
 
P
D
 
T
A
 
A
S
 
S
H
 
H
I
 
F
L
 
V
V
 
L
F
 
I
A
 
L
A
 
A
W
 
R
E
 
T
-
 
A
-
 
K
-
 
D
-
 
I
N
 
K
Y
 
Y
T
 
N
E
 
A
E
 
D
K
 
Y
I
 
I
K
 
K
A
 
R
V
 
H
F
 
L
K
 
K
E
 
E
T
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
V
R
 
K
G
 
Q
L
 
M
P
 
P
L
 
Q
D
 
D
K
 
V
M
 
S
D
 
E
A
 
G
Y
 
Y
-
 
I
-
 
S
-
 
K
R
 
T
E
 
E
R
 
E
L
 
F
W
 
Q
G
 
K
M
 
N
Y
 
D
S
 
L
Q
 
H
L
 
L
P
 
L
E
 
E
-
 
S
-
 
D
-
 
R
-
 
T
-
 
L
-
 
F
E
 
D
W
 
W
H
 
-
A
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
A
A
 
S
K
 
K
Q
|
Q
A
 
T
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
F
 
L
G
 
G
T
 
N
A
 
M
I
 
M
A
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
Q
 
I
K
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
S
T
 
C
P
|
P
M
x
I
E
|
E
G
|
G
F
 
F
D
 
Q
P
 
Y
E
 
D
G
 
H
L
 
I
D
 
H
A
 
R
L
 
I
L
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
L
E
 
E
L
 
N
G
 
G
-
 
S
L
 
F
K
 
D
S
 
I
A
 
S
V
 
V
V
 
M
L
 
A
P
 
A
L
 
F
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R

Sites not aligning to the query:

6wt2A Crystal structure of putative NAD(p)h-flavin oxidoreductase from neisseria meningitidis
31% identity, 88% coverage: 18:207/215 of query aligns to 25:219/221 of 6wt2A

query
sites
6wt2A
G
 
A
K
 
R
A
 
K
V
 
I
P
 
S
Q
 
A
E
 
E
K
 
D
V
 
F
D
 
Q
Y
 
F
I
 
I
L
 
L
E
 
E
A
 
L
A
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
|
P
S
|
S
S
|
S
S
x
V
G
 
G
L
 
S
Q
 
E
P
 
P
Y
 
W
R
 
Q
V
 
F
I
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
Q
D
 
N
P
 
P
E
 
E
I
 
I
K
 
R
E
 
Q
K
 
A
M
 
I
K
 
K
P
 
P
I
 
F
A
 
S
W
 
W
D
x
G
Q
 
M
S
 
A
Q
 
D
I
x
A
T
 
L
D
 
D
-
 
T
A
 
A
S
 
S
H
 
H
I
 
L
L
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
L
A
 
A
W
 
K
E
 
K
N
 
N
Y
 
-
T
 
-
E
 
-
E
 
A
K
 
R
I
 
F
K
 
D
A
 
S
V
 
P
F
 
F
K
 
M
-
 
L
E
 
E
T
 
S
L
 
L
T
 
K
A
 
R
R
|
R
G
 
G
L
 
V
P
 
T
-
 
E
L
 
P
D
 
D
K
 
A
M
 
M
D
 
A
A
 
K
Y
 
S
R
 
L
E
 
A
R
 
R
L
 
Y
W
 
Q
G
 
A
M
x
F
Y
 
Q
S
 
A
-
 
D
-
 
D
-
 
I
Q
 
K
L
 
I
P
 
L
E
 
D
E
 
D
W
 
S
H
 
R
A
 
A
H
 
L
H
 
F
-
 
D
-
 
W
A
 
C
A
 
C
K
 
R
Q
|
Q
A
 
T
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
F
 
L
G
 
G
T
 
N
A
 
M
I
 
M
A
 
T
A
 
G
A
 
A
A
 
A
E
 
M
Q
 
A
K
 
G
V
 
I
D
 
D
A
 
S
T
x
C
P
|
P
M
x
V
E
|
E
G
|
G
F
 
F
D
 
N
P
 
Y
E
 
A
G
 
D
L
 
M
D
 
E
A
 
R
L
 
V
L
 
L
G
 
S
L
 
-
K
 
G
E
 
Q
L
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
F
S
 
D
A
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
W
-
 
G
-
 
V
-
 
S
V
 
V
V
 
A
L
 
A
P
 
T
L
 
F
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
D
 
V
E
 
Q
E
 
E
N
 
I
D
 
-
W
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
M
 
A
K
 
T
K
|
K
F
 
A
R
|
R
T
 
R
P
 
P
K
 
L
E
 
E
E
 
E
F
 
T
I
 
V
I
 
I

Sites not aligning to the query:

2hayD The crystal structure of the putative NAD(p)h-flavin oxidoreductase from streptococcus pyogenes m1 gas
32% identity, 93% coverage: 7:206/215 of query aligns to 14:218/222 of 2hayD

query
sites
2hayD
L
 
L
E
 
H
W
 
F
R
|
R
Y
x
T
A
|
A
T
 
V
K
 
R
K
 
V
M
 
Y
N
 
K
G
 
E
K
 
E
A
 
K
V
 
I
P
 
S
Q
 
D
E
 
E
K
 
D
V
 
L
D
 
A
Y
 
L
I
 
I
L
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
W
L
 
L
S
 
S
P
|
P
S
|
S
S
|
S
S
 
I
G
 
G
L
 
L
Q
 
E
P
 
G
Y
 
W
R
 
R
V
 
F
I
 
V
V
 
V
V
 
L
T
 
D
D
 
N
P
 
K
E
 
P
I
 
I
K
 
K
E
 
E
K
 
E
M
 
I
K
 
K
P
 
P
I
 
F
A
 
A
W
 
W
D
x
G
-
 
A
Q
 
Q
S
 
Y
Q
|
Q
I
 
L
T
 
E
D
 
T
A
 
A
S
 
S
H
 
H
I
 
F
L
 
I
V
 
L
F
 
L
A
 
I
A
 
A
W
 
-
E
 
E
N
 
K
Y
 
H
T
 
A
E
 
R
E
 
Y
K
 
D
I
 
S
K
 
P
A
 
A
V
 
I
F
 
-
K
 
K
E
 
N
T
 
S
L
 
L
T
 
L
A
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
P
 
K
L
 
-
D
 
-
K
 
E
M
 
G
D
 
D
A
 
G
Y
 
L
R
 
N
E
 
S
R
 
R
L
 
L
W
 
-
G
 
K
M
 
L
Y
 
Y
S
 
E
Q
 
S
L
 
F
P
 
Q
E
 
K
E
 
E
-
 
D
-
 
M
-
 
D
-
 
M
-
 
A
-
 
D
-
 
N
-
 
P
-
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
F
-
 
D
W
 
W
H
 
-
A
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
T
A
 
A
K
 
K
Q
|
Q
A
 
T
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
F
 
L
G
 
G
T
 
N
A
 
M
I
 
M
A
 
M
A
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
L
Q
 
L
K
 
G
V
 
I
D
 
D
A
 
T
T
x
C
P
|
P
M
x
I
E
|
E
G
|
G
F
 
F
D
 
H
P
 
Y
E
 
D
G
 
K
L
 
V
D
 
N
A
 
H
L
 
I
L
 
L
G
 
A
-
 
K
-
 
H
-
 
N
-
 
V
-
 
I
-
 
D
L
 
L
K
 
E
E
 
K
L
 
E
G
 
G
L
 
I
K
 
A
S
 
S
A
 
-
V
 
-
V
 
M
L
 
L
P
 
S
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
D
 
L
E
 
R
E
 
D
N
 
-
D
 
-
W
 
-
L
 
-
A
 
P
G
 
K
M
 
H
K
 
A
K
 
Q
F
 
V
R
|
R
T
 
K
P
 
P
K
 
K
E
 
E
E
 
E
F
 
V
I
 
M

7s14B Crystal structure of putative NAD(p)h-flavin oxidoreductase from haemophilus influenzae 86-028np
28% identity, 87% coverage: 3:188/215 of query aligns to 12:206/223 of 7s14B

query
sites
7s14B
L
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
L
L
 
F
E
 
H
W
 
Q
R
|
R
Y
x
S
A
x
S
T
 
T
K
x
R
K
 
Y
M
 
Y
N
 
D
-
 
P
G
 
A
K
 
K
A
 
K
V
 
I
P
 
S
Q
 
D
E
 
E
K
 
D
V
 
F
D
 
E
Y
 
C
I
 
I
L
 
L
E
 
E
A
 
C
A
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
|
P
S
|
S
S
|
S
S
 
V
G
 
G
L
 
S
Q
 
E
P
 
P
Y
 
W
R
 
K
V
 
F
I
 
L
V
 
V
V
 
I
T
 
Q
D
 
N
P
 
K
E
 
T
I
 
L
K
 
R
E
 
E
K
 
K
M
 
M
K
 
K
P
 
P
I
 
F
A
 
S
W
 
W
D
x
G
Q
 
M
-
 
I
S
 
N
Q
 
Q
I
 
L
T
 
D
D
 
N
A
 
C
S
 
S
H
 
H
I
 
L
L
 
V
V
 
V
F
 
I
A
 
L
A
 
A
W
 
K
E
 
K
N
 
N
Y
 
A
T
 
R
E
 
Y
E
 
D
K
 
-
I
 
-
K
 
S
A
 
P
V
 
F
F
 
F
K
 
V
E
 
D
T
 
V
L
 
M
T
 
A
A
 
R
R
 
K
G
 
G
L
 
L
P
 
N
L
 
A
D
 
E
K
 
Q
M
 
Q
D
 
Q
A
 
A
Y
 
A
R
 
L
E
 
A
R
 
K
L
 
-
W
 
-
G
 
-
M
 
-
Y
 
Y
S
 
K
Q
 
A
L
 
L
P
 
Q
E
 
E
E
 
E
-
 
D
-
 
M
-
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
N
-
 
D
-
 
R
-
 
T
-
 
L
-
 
F
-
 
D
W
 
W
H
 
-
A
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
C
A
 
S
K
 
K
Q
 
Q
A
 
T
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
F
 
L
G
 
A
T
 
N
A
 
M
I
 
L
A
 
T
A
 
G
A
 
A
A
 
S
E
 
A
Q
 
L
K
 
G
V
 
I
D
 
D
A
 
S
T
x
C
P
|
P
M
x
I
E
|
E
G
|
G
F
 
F
D
 
H
P
 
Y
E
 
D
G
 
K
L
 
M
D
 
N
A
 
E
L
 
C
L
 
L
G
 
A
L
 
-
K
 
-
E
 
E
L
 
E
G
 
G
L
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
P
-
 
Q
-
 
E
-
 
Y
K
 
A
S
 
V
A
 
S
V
 
V
V
 
A
L
 
A
P
 
T
L
 
F
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
D
 
S
E
 
R
E
 
D

Sites not aligning to the query:

7s14A Crystal structure of putative NAD(p)h-flavin oxidoreductase from haemophilus influenzae 86-028np
28% identity, 87% coverage: 3:188/215 of query aligns to 8:202/219 of 7s14A

query
sites
7s14A
L
 
V
L
 
L
E
|
E
N
 
L
L
 
F
E
 
H
W
 
Q
R
|
R
Y
x
S
A
x
S
T
 
T
K
x
R
K
 
Y
M
 
Y
N
 
D
-
 
P
G
 
A
K
 
K
A
 
K
V
 
I
P
 
S
Q
 
D
E
 
E
K
 
D
V
 
F
D
 
E
Y
 
C
I
 
I
L
 
L
E
 
E
A
 
C
A
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
|
P
S
|
S
S
|
S
S
 
V
G
 
G
L
 
S
Q
 
E
P
 
P
Y
 
W
R
 
K
V
 
F
I
 
L
V
 
V
V
 
I
T
 
Q
D
 
N
P
 
K
E
 
T
I
 
L
K
 
R
E
 
E
K
 
K
M
 
M
K
 
K
P
 
P
I
 
F
A
 
S
W
 
W
D
x
G
Q
 
M
-
 
I
S
 
N
Q
 
Q
I
 
L
T
 
D
D
 
N
A
 
C
S
 
S
H
 
H
I
 
L
L
 
V
V
 
V
F
 
I
A
 
L
A
 
A
W
 
K
E
 
K
N
 
N
Y
 
A
T
 
R
E
 
Y
E
 
D
K
 
-
I
 
-
K
 
S
A
 
P
V
 
F
F
 
F
K
 
V
E
 
D
T
 
V
L
 
M
T
 
A
A
 
R
R
 
K
G
 
G
L
 
L
P
 
N
L
 
A
D
 
E
K
 
Q
M
 
Q
D
 
Q
A
 
A
Y
 
A
R
 
L
E
 
A
R
 
K
L
 
-
W
 
-
G
 
-
M
 
-
Y
 
Y
S
 
K
Q
 
A
L
 
L
P
 
Q
E
 
E
E
 
E
-
 
D
-
 
M
-
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
N
-
 
D
-
 
R
-
 
T
-
 
L
-
 
F
-
 
D
W
 
W
H
 
-
A
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
C
A
 
S
K
 
K
Q
 
Q
A
 
T
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
F
 
L
G
 
A
T
 
N
A
 
M
I
 
L
A
 
T
A
 
G
A
 
A
A
 
S
E
 
A
Q
 
L
K
 
G
V
 
I
D
 
D
A
 
S
T
x
C
P
|
P
M
x
I
E
|
E
G
|
G
F
 
F
D
 
H
P
 
Y
E
 
D
G
 
K
L
 
M
D
 
N
A
 
E
L
 
C
L
 
L
G
 
A
L
 
-
K
 
-
E
 
E
L
 
E
G
 
G
L
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
P
-
 
Q
-
 
E
-
 
Y
K
 
A
S
 
V
A
 
S
V
 
V
V
 
A
L
 
A
P
 
T
L
 
F
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
D
 
S
E
 
R
E
 
D

Sites not aligning to the query:

7t33A The structure of haemophilus influenzae rd kw20 nitroreductase complexed with nicotinic acid (see paper)
28% identity, 87% coverage: 3:188/215 of query aligns to 8:202/219 of 7t33A

query
sites
7t33A
L
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
L
L
 
F
E
 
H
W
 
Q
R
|
R
Y
 
S
A
x
S
T
 
T
K
x
R
K
 
Y
M
 
Y
N
 
D
-
 
P
G
 
T
K
 
K
A
 
K
V
 
I
P
 
S
Q
 
D
E
 
E
K
 
D
V
 
F
D
 
E
Y
 
C
I
 
I
L
 
L
E
 
E
A
 
C
A
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
|
P
S
|
S
S
|
S
S
 
V
G
 
G
L
 
S
Q
 
E
P
 
P
Y
 
W
R
 
K
V
 
F
I
 
L
V
 
V
V
 
I
T
 
Q
D
 
N
P
 
K
E
 
T
I
 
L
K
 
R
E
 
E
K
 
K
M
 
M
K
 
K
P
 
P
I
 
F
A
 
S
W
|
W
D
 
G
Q
 
M
-
 
I
S
 
N
Q
 
Q
I
 
L
T
 
D
D
 
N
A
 
C
S
 
S
H
 
H
I
 
L
L
 
V
V
 
V
F
 
I
A
 
L
A
 
A
W
 
K
E
 
K
N
 
N
Y
 
A
T
 
R
E
 
Y
E
 
D
K
 
-
I
 
-
K
 
S
A
 
P
V
 
F
F
 
F
K
 
V
E
 
D
T
 
V
L
 
M
T
 
A
A
 
R
R
 
K
G
 
G
L
 
L
P
 
N
L
 
A
D
 
E
K
 
Q
M
 
Q
D
 
Q
A
 
A
Y
 
A
R
 
L
E
 
T
R
 
K
L
 
-
W
 
-
G
 
-
M
 
-
Y
 
Y
S
 
K
Q
 
A
L
 
L
P
 
Q
E
 
E
E
 
E
-
 
D
-
 
M
-
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
N
-
 
D
-
 
R
-
 
T
-
 
L
-
 
F
-
 
D
W
 
W
H
 
-
A
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
C
A
 
S
K
 
K
Q
|
Q
A
 
T
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
F
 
L
G
 
A
T
 
N
A
 
M
I
 
L
A
 
T
A
 
G
A
 
A
A
 
S
E
 
A
Q
 
L
K
 
G
V
 
I
D
 
D
A
 
S
T
x
C
P
|
P
M
x
I
E
|
E
G
|
G
F
 
F
D
 
H
P
 
Y
E
 
D
G
 
K
L
 
M
D
 
N
A
 
E
L
 
C
L
 
L
G
 
A
L
 
-
K
 
-
E
 
E
L
 
E
G
 
G
L
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
P
-
 
Q
-
 
E
-
 
Y
K
 
A
S
 
V
A
 
S
V
 
V
V
 
A
L
 
A
P
 
T
L
 
F
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
D
 
S
E
 
R
E
 
D

Sites not aligning to the query:

7xwwA Crystal structure of ntr in complex with bn-xb
30% identity, 90% coverage: 10:203/215 of query aligns to 9:210/216 of 7xwwA

query
sites
7xwwA
R
|
R
Y
x
H
A
x
S
T
 
T
K
 
K
K
 
A
M
 
F
N
 
D
G
 
A
-
 
S
K
 
K
A
 
K
V
 
L
P
 
T
Q
 
P
E
 
E
K
 
Q
V
 
A
D
 
E
Y
 
Q
I
 
I
L
 
K
E
 
T
A
 
L
A
 
L
R
 
Q
L
 
Y
S
 
S
P
|
P
S
|
S
S
|
S
S
x
T
G
x
N
L
 
S
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
W
R
 
H
V
 
F
I
 
I
V
 
V
V
 
A
T
 
S
D
 
T
P
 
E
E
 
E
I
 
G
K
 
K
E
 
A
K
 
R
M
 
V
K
 
A
P
 
K
I
 
S
A
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
Y
-
 
V
W
 
F
D
x
N
Q
 
E
S
 
R
Q
 
K
I
 
M
T
 
L
D
 
D
A
 
A
S
 
S
H
 
H
I
 
V
L
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
C
A
 
A
W
 
K
E
 
T
N
 
A
Y
 
M
T
 
D
E
 
D
E
 
V
K
 
W
I
 
L
K
 
K
A
 
L
V
 
V
F
 
V
K
 
D
E
 
Q
T
x
E
L
 
D
T
 
A
A
 
D
R
 
G
G
x
R
L
x
F
P
 
A
L
 
T
D
 
P
K
 
E
M
 
A
D
 
K
A
 
A
Y
 
A
R
x
N
E
 
D
R
 
K
L
 
G
W
 
R
G
 
K
M
 
F
Y
 
F
S
 
A
Q
 
D
L
 
M
P
 
H
-
 
R
E
 
K
E
 
D
W
 
L
H
 
H
-
 
D
-
 
D
A
 
A
H
 
E
H
 
W
A
 
M
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
I
 
L
A
 
N
F
 
V
G
 
G
T
 
N
A
 
F
I
 
L
A
 
L
A
 
G
A
 
V
A
 
A
E
 
A
Q
 
L
K
 
G
V
 
L
D
 
D
A
 
A
T
 
V
P
|
P
M
x
I
E
|
E
G
 
G
F
 
F
D
 
D
P
 
A
E
 
A
G
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
E
L
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
K
G
 
G
L
 
Y
K
 
T
S
 
S
A
 
L
V
 
V
V
 
V
L
 
V
P
 
P
L
 
V
G
 
G
Y
 
H
R
 
H
D
 
S
E
 
V
E
 
E
N
 
-
D
 
D
W
 
F
L
 
N
A
 
A
G
 
T
M
 
L
K
 
P
K
|
K
F
 
S
R
|
R
T
 
L
P
 
P
K
 
Q
E
 
N

7x32A Crystal structure of e. Coli nfsb in complex with berberine (see paper)
30% identity, 90% coverage: 10:203/215 of query aligns to 9:210/216 of 7x32A

query
sites
7x32A
R
|
R
Y
x
H
A
x
S
T
 
T
K
|
K
K
 
A
M
 
F
N
 
D
G
 
A
-
 
S
K
 
K
A
 
K
V
 
L
P
 
T
Q
 
P
E
 
E
K
 
Q
V
 
A
D
 
E
Y
 
Q
I
 
I
L
 
K
E
 
T
A
 
L
A
 
L
R
 
Q
L
 
Y
S
 
S
P
|
P
S
|
S
S
|
S
S
 
T
G
x
N
L
 
S
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
W
R
 
H
V
 
F
I
 
I
V
 
V
V
 
A
T
 
S
D
 
T
P
 
E
E
 
E
I
 
G
K
 
K
E
 
A
K
 
R
M
 
V
K
 
A
P
 
K
I
 
S
A
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
Y
-
 
V
W
x
F
D
x
N
Q
 
E
S
 
R
Q
 
K
I
 
M
T
 
L
D
 
D
A
 
A
S
 
S
H
 
H
I
 
V
L
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
C
A
 
A
W
 
K
E
 
T
N
 
A
Y
 
M
T
 
D
E
 
D
E
 
V
K
 
W
I
 
L
K
 
K
A
 
L
V
 
V
F
 
V
K
 
D
E
 
Q
T
 
E
L
 
D
T
 
A
A
 
D
R
 
G
G
 
R
L
 
F
P
 
A
L
 
T
D
 
P
K
 
E
M
 
A
D
 
K
A
 
A
Y
 
A
R
 
N
E
 
D
R
 
K
L
 
G
W
 
R
G
 
K
M
 
F
Y
 
F
S
 
A
Q
 
D
L
 
M
P
 
H
-
 
R
E
 
K
E
 
D
W
 
L
H
 
H
-
 
D
-
 
D
A
 
A
H
 
E
H
 
W
A
 
M
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
I
 
L
A
 
N
F
 
V
G
 
G
T
 
N
A
 
F
I
 
L
A
 
L
A
 
G
A
 
V
A
 
A
E
 
A
Q
 
L
K
 
G
V
 
L
D
 
D
A
 
A
T
 
V
P
|
P
M
x
I
E
|
E
G
|
G
F
 
F
D
 
D
P
 
A
E
 
A
G
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
E
L
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
K
G
 
G
L
 
Y
K
 
T
S
 
S
A
 
L
V
 
V
V
 
V
L
 
V
P
 
P
L
 
V
G
 
G
Y
 
H
R
 
H
D
 
S
E
 
V
E
 
E
N
 
-
D
 
D
W
 
F
L
 
N
A
 
A
G
 
T
M
 
L
K
 
P
K
|
K
F
 
S
R
|
R
T
 
L
P
 
P
K
 
Q
E
 
N

1ylrA The structure of e.Coli nitroreductase with bound acetate, crystal form 1 (see paper)
30% identity, 90% coverage: 10:203/215 of query aligns to 9:210/216 of 1ylrA

query
sites
1ylrA
R
|
R
Y
x
H
A
x
S
T
 
T
K
|
K
K
 
A
M
 
F
N
 
D
G
 
A
-
 
S
K
 
K
A
 
K
V
 
L
P
 
T
Q
 
P
E
 
E
K
 
Q
V
 
A
D
 
E
Y
 
Q
I
 
I
L
 
K
E
 
T
A
 
L
A
 
L
R
 
Q
L
 
Y
S
 
S
P
|
P
S
|
S
S
|
S
S
x
T
G
x
N
L
 
S
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
W
R
 
H
V
 
F
I
 
I
V
 
V
V
 
A
T
 
S
D
 
T
P
 
E
E
 
E
I
 
G
K
 
K
E
 
A
K
 
R
M
 
V
K
 
A
P
 
K
I
 
S
A
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
Y
-
 
V
W
 
F
D
x
N
Q
 
E
S
 
R
Q
x
K
I
 
M
T
 
L
D
 
D
A
 
A
S
 
S
H
 
H
I
 
V
L
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
C
A
 
A
W
 
K
E
 
T
N
 
A
Y
 
M
T
 
D
E
 
D
E
 
V
K
 
W
I
 
L
K
 
K
A
 
L
V
 
V
F
 
V
K
 
D
E
 
Q
T
 
E
L
 
D
T
 
A
A
 
D
R
 
G
G
 
R
L
 
F
P
 
A
L
 
T
D
 
P
K
 
E
M
 
A
D
 
K
A
 
A
Y
 
A
R
 
N
E
 
D
R
 
K
L
 
G
W
 
R
G
 
K
M
 
F
Y
x
F
S
 
A
Q
 
D
L
 
M
P
 
H
-
 
R
E
 
K
E
 
D
W
 
L
H
 
H
-
 
D
-
 
D
A
 
A
H
 
E
H
 
W
A
 
M
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
I
 
L
A
 
N
F
 
V
G
 
G
T
 
N
A
 
F
I
 
L
A
 
L
A
 
G
A
 
V
A
 
A
E
 
A
Q
 
L
K
 
G
V
 
L
D
 
D
A
 
A
T
 
V
P
|
P
M
x
I
E
|
E
G
|
G
F
 
F
D
 
D
P
 
A
E
 
A
G
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
E
L
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
K
G
 
G
L
 
Y
K
 
T
S
 
S
A
 
L
V
 
V
V
 
V
L
 
V
P
 
P
L
 
V
G
 
G
Y
 
H
R
 
H
D
 
S
E
 
V
E
 
E
N
 
-
D
 
D
W
 
F
L
 
N
A
 
A
G
 
T
M
 
L
K
 
P
K
|
K
F
 
S
R
|
R
T
 
L
P
 
P
K
 
Q
E
 
N

1ykiA The structure of e. Coli nitroreductase bound with the antibiotic nitrofurazone (see paper)
30% identity, 90% coverage: 10:203/215 of query aligns to 9:210/216 of 1ykiA

query
sites
1ykiA
R
|
R
Y
x
H
A
x
S
T
 
T
K
|
K
K
 
A
M
 
F
N
 
D
G
 
A
-
 
S
K
 
K
A
 
K
V
 
L
P
 
T
Q
 
P
E
 
E
K
 
Q
V
 
A
D
 
E
Y
 
Q
I
 
I
L
 
K
E
 
T
A
 
L
A
 
L
R
 
Q
L
 
Y
S
 
S
P
|
P
S
|
S
S
|
S
S
x
T
G
x
N
L
 
S
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
W
R
 
H
V
 
F
I
 
I
V
 
V
V
 
A
T
 
S
D
 
T
P
 
E
E
 
E
I
 
G
K
 
K
E
 
A
K
 
R
M
 
V
K
 
A
P
 
K
I
 
S
A
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
N
-
x
Y
-
 
V
W
x
F
D
x
N
Q
 
E
S
 
R
Q
x
K
I
 
M
T
 
L
D
 
D
A
 
A
S
 
S
H
 
H
I
 
V
L
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
C
A
 
A
W
 
K
E
 
T
N
 
A
Y
 
M
T
 
D
E
 
D
E
 
V
K
 
W
I
 
L
K
 
K
A
 
L
V
 
V
F
 
V
K
 
D
E
 
Q
T
 
E
L
 
D
T
 
A
A
 
D
R
 
G
G
 
R
L
 
F
P
 
A
L
 
T
D
 
P
K
 
E
M
 
A
D
 
K
A
 
A
Y
 
A
R
 
N
E
 
D
R
 
K
L
 
G
W
 
R
G
 
K
M
 
F
Y
x
F
S
 
A
Q
 
D
L
 
M
P
 
H
-
 
R
E
 
K
E
 
D
W
 
L
H
 
H
-
 
D
-
 
D
A
 
A
H
 
E
H
 
W
A
 
M
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
I
 
L
A
 
N
F
 
V
G
 
G
T
 
N
A
 
F
I
 
L
A
 
L
A
 
G
A
 
V
A
 
A
E
 
A
Q
 
L
K
 
G
V
 
L
D
 
D
A
 
A
T
 
V
P
|
P
M
x
I
E
|
E
G
|
G
F
 
F
D
 
D
P
 
A
E
 
A
G
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
E
L
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
K
G
 
G
L
 
Y
K
 
T
S
 
S
A
 
L
V
 
V
V
 
V
L
 
V
P
 
P
L
 
V
G
 
G
Y
 
H
R
 
H
D
 
S
E
 
V
E
 
E
N
 
-
D
 
D
W
 
F
L
 
N
A
 
A
G
 
T
M
 
L
K
 
P
K
|
K
F
 
S
R
|
R
T
 
L
P
 
P
K
 
Q
E
 
N

1oonA Nitroreductase from e-coli in complex with the dinitrobenzamide prodrug sn27217 (see paper)
30% identity, 90% coverage: 10:203/215 of query aligns to 9:210/216 of 1oonA

query
sites
1oonA
R
|
R
Y
x
H
A
x
S
T
 
T
K
|
K
K
 
A
M
 
F
N
 
D
G
 
A
-
 
S
K
 
K
A
 
K
V
 
L
P
 
T
Q
 
P
E
 
E
K
 
Q
V
 
A
D
 
E
Y
 
Q
I
 
I
L
 
K
E
 
T
A
 
L
A
 
L
R
 
Q
L
 
Y
S
 
S
P
 
P
S
|
S
S
|
S
S
x
T
G
x
N
L
 
S
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
W
R
 
H
V
 
F
I
 
I
V
 
V
V
 
A
T
 
S
D
 
T
P
 
E
E
 
E
I
 
G
K
 
K
E
 
A
K
 
R
M
 
V
K
 
A
P
 
K
I
 
S
A
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
Y
-
 
V
W
 
F
D
x
N
Q
 
E
S
 
R
Q
x
K
I
 
M
T
 
L
D
 
D
A
 
A
S
 
S
H
 
H
I
 
V
L
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
C
A
 
A
W
 
K
E
 
T
N
 
A
Y
 
M
T
 
D
E
 
D
E
 
V
K
 
W
I
 
L
K
 
K
A
 
L
V
 
V
F
 
V
K
 
D
E
 
Q
T
x
E
L
 
D
T
 
A
A
 
D
R
 
G
G
 
R
L
 
F
P
 
A
L
 
T
D
 
P
K
 
E
M
 
A
D
 
K
A
 
A
Y
 
A
R
x
N
E
 
D
R
 
K
L
 
G
W
 
R
G
 
K
M
 
F
Y
x
F
S
 
A
Q
 
D
L
 
M
P
 
H
-
 
R
E
 
K
E
 
D
W
 
L
H
 
H
-
 
D
-
 
D
A
 
A
H
 
E
H
 
W
A
 
M
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
I
x
L
A
 
N
F
 
V
G
 
G
T
 
N
A
 
F
I
 
L
A
 
L
A
 
G
A
 
V
A
 
A
E
 
A
Q
 
L
K
 
G
V
 
L
D
 
D
A
 
A
T
 
V
P
|
P
M
x
I
E
|
E
G
|
G
F
 
F
D
 
D
P
 
A
E
 
A
G
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
E
L
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
K
G
 
G
L
 
Y
K
 
T
S
 
S
A
 
L
V
 
V
V
 
V
L
 
V
P
 
P
L
 
V
G
 
G
Y
 
H
R
 
H
D
 
S
E
 
V
E
 
E
N
 
-
D
 
D
W
 
F
L
 
N
A
 
A
G
 
T
M
 
L
K
 
P
K
|
K
F
 
S
R
|
R
T
 
L
P
 
P
K
 
Q
E
 
N

1icrA The structure of escherichia coli nitroreductase complexed with nicotinic acid (see paper)
30% identity, 90% coverage: 10:203/215 of query aligns to 9:210/216 of 1icrA

query
sites
1icrA
R
|
R
Y
x
H
A
x
S
T
 
T
K
|
K
K
 
A
M
 
F
N
 
D
G
 
A
-
 
S
K
 
K
A
 
K
V
 
L
P
 
T
Q
 
P
E
 
E
K
 
Q
V
 
A
D
 
E
Y
 
Q
I
 
I
L
 
K
E
 
T
A
 
L
A
 
L
R
 
Q
L
 
Y
S
 
S
P
|
P
S
|
S
S
|
S
S
x
T
G
x
N
L
 
S
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
W
R
 
H
V
 
F
I
 
I
V
 
V
V
 
A
T
 
S
D
 
T
P
 
E
E
 
E
I
 
G
K
 
K
E
 
A
K
 
R
M
 
V
K
 
A
P
 
K
I
 
S
A
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
Y
-
 
V
W
 
F
D
x
N
Q
 
E
S
 
R
Q
x
K
I
 
M
T
 
L
D
 
D
A
 
A
S
 
S
H
 
H
I
 
V
L
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
C
A
 
A
W
 
K
E
 
T
N
 
A
Y
 
M
T
 
D
E
 
D
E
 
V
K
 
W
I
 
L
K
 
K
A
 
L
V
 
V
F
 
V
K
 
D
E
 
Q
T
 
E
L
 
D
T
 
A
A
 
D
R
 
G
G
 
R
L
 
F
P
 
A
L
 
T
D
 
P
K
 
E
M
 
A
D
 
K
A
 
A
Y
 
A
R
 
N
E
 
D
R
 
K
L
 
G
W
 
R
G
 
K
M
 
F
Y
x
F
S
 
A
Q
 
D
L
 
M
P
 
H
-
 
R
E
 
K
E
 
D
W
 
L
H
 
H
-
 
D
-
 
D
A
 
A
H
 
E
H
 
W
A
 
M
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
I
 
L
A
 
N
F
 
V
G
 
G
T
 
N
A
 
F
I
 
L
A
 
L
A
 
G
A
 
V
A
 
A
E
 
A
Q
 
L
K
 
G
V
 
L
D
 
D
A
 
A
T
 
V
P
|
P
M
x
I
E
|
E
G
|
G
F
 
F
D
 
D
P
 
A
E
 
A
G
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
E
L
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
K
G
 
G
L
 
Y
K
 
T
S
 
S
A
 
L
V
 
V
V
 
V
L
 
V
P
 
P
L
 
V
G
 
G
Y
 
H
R
 
H
D
 
S
E
 
V
E
 
E
N
 
-
D
 
D
W
 
F
L
 
N
A
 
A
G
 
T
M
 
L
K
 
P
K
|
K
F
 
S
R
|
R
T
 
L
P
 
P
K
 
Q
E
 
N

Query Sequence

>Echvi_0893 FitnessBrowser__Cola:Echvi_0893
MSLLENLEWRYATKKMNGKAVPQEKVDYILEAARLSPSSSGLQPYRVIVVTDPEIKEKMK
PIAWDQSQITDASHILVFAAWENYTEEKIKAVFKETLTARGLPLDKMDAYRERLWGMYSQ
LPEEWHAHHAAKQAYIAFGTAIAAAAEQKVDATPMEGFDPEGLDALLGLKELGLKSAVVL
PLGYRDEENDWLAGMKKFRTPKEEFIITSDELVEQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory