SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Echvi_1106 FitnessBrowser__Cola:Echvi_1106 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 3 hits to proteins with known functional sites (download)

Q3UDW8 Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase; Transmembrane protein 76; EC 2.3.1.78 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
31% identity, 83% coverage: 4:309/369 of query aligns to 259:614/656 of Q3UDW8

query
sites
Q3UDW8
Q
 
N
R
 
R
I
 
L
L
 
R
A
 
C
L
 
V
D
 
D
V
 
T
F
 
F
R
 
R
G
 
G
I
 
L
T
 
A
I
 
L
F
 
V
A
 
L
M
 
M
I
 
V
L
 
F
V
 
V
N
 
N
N
 
Y
P
 
G
G
 
G
S
 
G
W
 
-
S
 
-
H
 
-
V
 
K
Y
 
Y
A
 
W
P
 
Y
L
 
F
L
 
K
H
 
H
A
 
S
K
 
S
W
 
W
H
 
N
G
 
G
C
 
L
T
 
T
P
 
V
T
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
V
F
 
F
P
 
P
F
 
W
F
 
F
L
 
V
F
 
F
I
 
I
V
 
M
G
 
G
V
 
T
A
 
S
I
 
I
E
 
F
L
 
L
S
 
S
L
 
M
G
 
T
G
 
S
Q
 
I
L
 
L
K
 
Q
K
 
R
G
 
G
T
 
C
P
 
S
K
 
K
G
 
L
F
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
G
K
 
K
S
 
I
L
 
V
I
 
W
R
 
R
A
 
S
L
 
F
K
 
L
L
 
L
I
 
I
G
 
C
L
 
I
G
 
G
L
 
V
L
 
I
L
 
I
T
 
V
A
 
N
I
 
P
P
 
N
Y
 
Y
-
 
C
-
 
L
-
 
G
-
 
P
F
 
L
D
 
S
L
 
W
A
 
D
H
 
K
L
 
V
R
 
R
F
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
I
 
L
G
 
G
L
 
V
V
 
T
Y
 
Y
F
 
F
I
 
V
S
 
V
T
 
A
V
 
V
M
 
L
-
 
E
Y
 
F
L
 
F
Y
 
F
W
 
W
S
 
K
P
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
D
-
 
S
-
 
C
-
 
T
-
 
L
K
 
E
A
 
S
L
 
S
V
 
C
F
 
F
S
 
S
-
 
L
-
 
R
-
 
D
-
 
I
-
 
T
-
 
S
-
 
S
-
 
W
-
 
P
-
 
Q
-
 
W
-
 
L
S
 
T
G
 
I
I
 
L
L
 
T
L
 
L
I
 
E
G
 
S
Y
 
I
W
 
W
L
 
L
C
 
A
M
 
L
T
 
T
-
 
F
F
 
F
I
 
L
P
 
P
V
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
C
G
 
P
P
 
T
A
 
G
N
 
Y
L
 
L
E
 
G
P
 
P
G
 
G
-
 
G
-
 
I
-
 
G
-
 
D
-
 
L
-
 
G
-
 
K
-
 
Y
-
 
P
-
 
H
-
 
C
-
 
T
T
 
G
N
 
G
L
 
A
A
 
A
A
 
G
W
 
Y
I
 
I
D
 
D
Q
 
R
Q
 
L
V
 
L
L
 
L
-
 
G
T
 
D
G
 
N
H
 
H
M
 
L
W
 
Y
S
 
Q
Q
 
H
T
 
P
K
 
S
T
 
S
-
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
Y
-
 
H
-
 
T
-
 
E
-
 
V
-
 
A
W
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
E
G
 
G
L
 
V
F
 
L
S
 
G
T
 
T
L
 
I
P
 
N
A
 
S
I
 
I
V
 
V
T
 
M
C
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
Q
C
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
I
L
 
L
T
 
V
-
 
Y
G
 
Y
N
 
K
S
 
D
S
 
Q
H
 
T
K
 
K
A
 
A
R
 
I
L
 
L
T
 
T
K
 
R
W
 
F
G
 
A
-
 
A
-
 
W
-
 
C
-
 
C
-
 
I
I
 
L
A
 
G
G
 
L
V
 
I
T
 
S
L
 
I
V
 
V
F
 
L
G
 
T
G
 
K
L
 
V
A
 
S
W
 
A
S
 
N
L
 
E
-
 
G
F
 
F
F
 
I
P
 
P
L
 
I
N
 
N
K
 
K
A
 
N
L
 
L
W
 
W
T
 
S
S
 
I
S
 
S
F
 
Y
V
 
V
L
 
T
Y
 
T
T
 
L
A
 
S
G
 
C
W
 
F
A
 
A
F
 
F
L
 
F
G
 
I
L
 
L
A
 
L
A
 
I
C
 
L
Y
 
Y
W
 
P
I
 
V
L
 
V
D
 
D
V
 
V
K
 
K
G
 
G
W
 
L
K
 
-
K
 
-
W
 
W
S
 
T
-
 
G
L
 
T
P
 
P
F
 
F
V
 
F
I
 
Y
Y
 
P
G
 
G
M
 
M
N
 
N
A
 
S
I
 
I
T
 
L
V
 
V
F
 
Y
F
 
V
L
 
G
S
 
H
G
 
E
V
 
V
I
 
L
A
 
E
K
 
N
L
 
Y
F
 
F

Sites not aligning to the query:

8tu9A Cryo-em structure of hgsnat-acetyl-coa complex at ph 7.5
32% identity, 83% coverage: 5:309/369 of query aligns to 137:491/533 of 8tu9A

query
sites
8tu9A
R
|
R
I
 
L
L
 
R
A
 
S
L
 
V
D
 
D
V
 
T
F
 
F
R
|
R
G
 
G
I
 
I
T
 
A
I
 
L
F
 
I
A
 
L
M
|
M
I
 
V
L
 
F
V
 
V
N
 
N
N
 
Y
P
 
G
G
 
G
S
 
G
W
 
-
S
 
-
H
 
-
V
 
K
Y
 
Y
A
 
W
P
 
Y
L
 
F
L
 
K
H
 
H
A
 
A
K
 
S
W
 
W
H
 
N
G
 
G
C
 
L
T
 
T
P
 
V
T
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
V
F
|
F
P
 
P
F
 
W
F
 
F
L
 
V
F
 
F
I
 
I
V
 
M
G
 
G
V
 
S
A
x
S
I
 
I
E
 
F
L
|
L
S
|
S
L
 
M
G
 
T
G
 
S
Q
 
I
L
 
L
K
 
Q
K
 
R
G
 
G
T
 
C
P
 
S
K
 
K
G
 
F
F
 
R
L
 
L
L
 
L
R
 
G
K
 
K
S
 
I
L
 
A
I
 
W
R
 
R
A
 
S
L
 
F
K
 
L
L
 
L
I
 
I
G
 
C
L
 
I
G
 
G
L
 
I
L
 
I
L
 
I
T
 
V
A
 
N
I
 
P
P
 
N
Y
 
Y
-
 
C
-
 
L
-
 
G
-
 
P
F
 
L
D
 
S
L
 
W
A
 
D
H
 
K
L
 
V
R
 
R
F
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
I
x
L
G
 
G
L
 
V
V
 
T
Y
 
Y
F
 
F
I
 
V
S
 
V
T
 
A
V
 
V
M
 
L
Y
 
E
L
 
L
Y
 
L
W
 
F
S
 
A
-
 
K
-
 
P
-
 
V
P
 
P
K
 
E
A
 
H
L
 
C
V
 
A
F
 
S
S
 
E
S
 
R
G
 
S
I
 
C
L
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
R
-
 
D
-
 
I
-
 
T
-
 
S
-
 
S
-
 
W
-
 
P
-
 
Q
-
 
W
-
 
L
-
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
V
L
 
L
I
 
E
G
 
G
Y
 
L
W
 
W
L
 
L
C
 
G
M
 
L
T
 
T
F
 
F
-
 
L
I
 
L
P
 
P
V
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
C
G
 
P
P
 
T
A
 
G
N
 
Y
L
 
L
E
 
G
P
 
P
G
 
G
-
 
G
-
 
I
-
 
G
-
 
D
-
 
F
-
 
G
-
 
K
-
 
Y
-
 
P
-
 
N
-
 
C
-
 
T
T
 
G
N
 
G
L
 
A
A
 
A
A
 
G
W
 
Y
I
 
I
D
 
D
Q
 
R
Q
 
L
V
 
L
L
 
L
-
 
G
T
 
D
G
 
D
H
 
H
M
 
L
W
 
Y
S
 
Q
Q
 
H
T
 
P
K
 
S
T
 
S
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
Y
-
 
H
-
 
T
-
 
E
-
 
V
-
 
A
W
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
E
G
 
G
L
 
I
F
 
L
S
 
G
T
 
T
L
 
I
P
 
N
A
 
S
I
 
I
V
 
V
T
 
M
C
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
Q
C
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
I
L
 
L
T
 
L
G
 
Y
N
 
Y
S
 
K
S
 
A
H
 
R
K
 
T
A
 
K
-
 
D
-
 
I
-
 
L
-
 
I
R
 
R
L
 
F
T
 
T
K
 
A
W
 
W
-
 
C
-
 
C
-
 
I
-
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
I
G
 
S
V
 
V
T
 
A
L
 
L
V
 
T
F
 
K
G
 
V
G
 
S
L
 
E
A
 
N
W
 
E
S
 
G
L
 
-
F
 
F
F
 
I
P
 
P
L
 
V
N
 
N
K
 
K
A
 
N
L
 
L
W
 
W
T
 
S
S
 
L
S
 
S
F
 
Y
V
 
V
L
 
T
Y
 
T
T
 
L
A
 
S
G
 
S
W
 
F
A
 
A
F
 
F
L
 
F
G
 
I
L
 
L
A
 
L
A
 
V
C
 
L
Y
 
Y
W
 
P
I
 
V
L
 
V
D
 
D
V
 
V
K
 
K
G
 
G
W
 
L
K
 
-
K
 
-
W
 
W
S
 
T
-
 
G
L
 
T
P
 
P
F
 
F
V
 
F
I
 
Y
Y
 
P
G
 
G
M
 
M
N
 
N
A
 
S
I
 
I
T
 
L
V
 
V
F
x
Y
F
 
V
L
 
G
S
 
H
G
 
E
V
 
V
I
 
F
A
 
E
K
 
N
L
 
Y
F
 
F

Sites not aligning to the query:

Q68CP4 Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase; Transmembrane protein 76; EC 2.3.1.78 from Homo sapiens (Human) (see 10 papers)
32% identity, 83% coverage: 5:309/369 of query aligns to 267:621/663 of Q68CP4

query
sites
Q68CP4
R
 
R
I
 
L
L
 
R
A
 
S
L
 
V
D
 
D
V
 
T
F
 
F
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
A
I
 
L
F
 
I
A
 
L
M
 
M
I
 
V
L
 
F
V
 
V
N
 
N
N
 
Y
P
 
G
G
 
G
S
x
G
W
 
-
S
 
-
H
 
-
V
 
K
Y
 
Y
A
 
W
P
 
Y
L
 
F
L
 
K
H
|
H
A
 
A
K
 
S
W
 
W
H
x
N
G
 
G
C
 
L
T
 
T
P
 
V
T
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
V
F
 
F
P
|
P
F
 
W
F
 
F
L
 
V
F
 
F
I
 
I
V
 
M
G
 
G
V
 
S
A
 
S
I
 
I
E
 
F
L
 
L
S
 
S
L
 
M
G
 
T
G
 
S
Q
 
I
L
 
L
K
 
Q
K
 
R
G
 
G
T
x
C
P
 
S
K
 
K
G
 
F
F
 
R
L
 
L
L
 
L
R
 
G
K
 
K
S
 
I
L
 
A
I
 
W
R
 
R
A
 
S
L
 
F
K
 
L
L
 
L
I
 
I
G
 
C
L
 
I
G
 
G
L
 
I
L
 
I
L
 
I
T
 
V
A
 
N
I
 
P
P
 
N
Y
 
Y
-
 
C
-
 
L
-
 
G
-
 
P
F
 
L
D
 
S
L
 
W
A
 
D
H
 
K
L
 
V
R
|
R
F
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
I
 
L
G
 
G
L
 
V
V
 
T
Y
 
Y
F
 
F
I
 
V
S
 
V
T
 
A
V
 
V
M
 
L
Y
 
E
L
 
L
Y
 
L
W
 
F
S
 
A
-
 
K
-
 
P
-
 
V
P
 
P
K
 
E
A
 
H
L
x
C
V
 
A
F
 
S
S
 
E
S
 
R
G
 
S
I
 
C
L
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
R
-
 
D
-
 
I
-
 
T
-
 
S
-
 
S
-
 
W
-
 
P
-
 
Q
-
 
W
-
 
L
-
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
V
L
 
L
I
 
E
G
 
G
Y
 
L
W
|
W
L
 
L
C
 
G
M
 
L
T
 
T
F
 
F
-
 
L
I
 
L
P
 
P
V
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
C
G
 
P
P
 
T
A
 
G
N
 
Y
L
 
L
E
 
G
P
 
P
G
 
G
-
x
G
-
 
I
-
 
G
-
 
D
-
 
F
-
 
G
-
 
K
-
 
Y
-
 
P
-
 
N
-
x
C
-
 
T
T
 
G
N
 
G
L
 
A
A
 
A
A
 
G
W
 
Y
I
 
I
D
 
D
Q
 
R
Q
x
L
V
 
L
L
 
L
-
 
G
T
 
D
G
 
D
H
|
H
M
 
L
W
 
Y
S
 
Q
Q
 
H
T
 
P
K
 
S
T
 
S
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
Y
-
 
H
-
 
T
-
 
E
-
 
V
-
 
A
W
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
|
E
G
 
G
L
 
I
F
 
L
S
 
G
T
 
T
L
 
I
P
 
N
A
 
S
I
 
I
V
|
V
T
x
M
C
 
A
L
 
F
L
 
L
G
|
G
V
 
V
A
 
Q
C
x
A
G
 
G
K
 
K
I
 
I
L
 
L
T
 
L
G
 
Y
N
 
Y
S
 
K
S
 
A
H
 
R
K
 
T
A
 
K
-
 
D
-
 
I
-
 
L
-
 
I
R
 
R
L
 
F
T
 
T
K
 
A
W
 
W
-
 
C
-
 
C
-
 
I
-
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
I
G
x
S
V
 
V
T
 
A
L
 
L
V
 
T
F
x
K
G
 
V
G
 
S
L
 
E
A
 
N
W
 
E
S
 
G
L
 
-
F
 
F
F
 
I
P
 
P
L
 
V
N
 
N
K
 
K
A
 
N
L
 
L
W
 
W
T
x
S
S
 
L
S
|
S
F
 
Y
V
 
V
L
 
T
Y
 
T
T
 
L
A
 
S
G
 
S
W
 
F
A
 
A
F
 
F
L
 
F
G
 
I
L
 
L
A
 
L
A
 
V
C
 
L
Y
 
Y
W
 
P
I
 
V
L
 
V
D
|
D
V
 
V
K
 
K
G
 
G
W
 
L
K
 
-
K
 
-
W
 
W
S
 
T
-
 
G
L
 
T
P
|
P
F
 
F
V
 
F
I
 
Y
Y
 
P
G
 
G
M
 
M
N
 
N
A
 
S
I
 
I
T
 
L
V
 
V
F
 
Y
F
 
V
L
 
G
S
 
H
G
 
E
V
 
V
I
 
F
A
 
E
K
 
N
L
 
Y
F
 
F

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Echvi_1106 FitnessBrowser__Cola:Echvi_1106
MPKQRILALDVFRGITIFAMILVNNPGSWSHVYAPLLHAKWHGCTPTDLIFPFFLFIVGV
AIELSLGGQLKKGTPKGFLLRKSLIRALKLIGLGLLLTAIPYFDLAHLRFPGVLQRIGLV
YFISTVMYLYWSPKALVFSSGILLIGYWLCMTFIPVPGIGPANLEPGTNLAAWIDQQVLT
GHMWSQTKTWDPEGLFSTLPAIVTCLLGVACGKILTGNSSHKARLTKWGIAGVTLVFGGL
AWSLFFPLNKALWTSSFVLYTAGWAFLGLAACYWILDVKGWKKWSLPFVIYGMNAITVFF
LSGVIAKLFGLIKVNWEGTRVSLKLFLQEALFNGWLAPKDASLCGAILMMIILFIPAYFM
WKRNIIIKV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory