SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Echvi_1284 FitnessBrowser__Cola:Echvi_1284 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2fn8A Thermotoga maritima ribose binding protein ribose bound form (see paper)
58% identity, 90% coverage: 31:315/316 of query aligns to 1:292/292 of 2fn8A

query
sites
2fn8A
K
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
M
A
 
A
V
 
I
I
 
V
V
 
I
S
 
S
T
 
T
L
 
L
N
 
N
N
|
N
P
 
P
W
|
W
F
|
F
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
K
K
 
Q
E
 
R
A
 
A
E
 
E
S
 
Q
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
V
 
A
S
 
T
I
 
I
F
 
F
D
 
D
S
 
S
Q
 
Q
N
 
N
N
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
K
E
 
E
N
 
S
N
 
A
H
 
H
F
 
F
E
 
D
N
 
A
A
 
I
I
 
I
T
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
L
 
I
F
 
F
N
 
N
P
 
P
T
 
T
D
 
D
A
 
A
E
 
D
G
 
G
S
 
S
V
 
I
S
 
A
N
 
N
V
 
V
T
 
K
K
 
R
A
 
A
S
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
P
V
 
V
F
 
F
C
 
C
M
 
V
D
|
D
R
|
R
E
 
G
V
 
I
N
 
N
S
 
A
S
 
R
-
 
G
L
 
L
P
 
A
T
 
V
S
 
A
Q
 
Q
I
 
I
L
 
Y
S
 
S
D
 
D
N
 
N
Y
 
Y
A
 
Y
G
 
G
C
 
G
V
 
V
S
 
L
L
 
M
G
 
G
K
 
E
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
D
 
K
Q
 
F
L
 
L
D
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
P
-
 
D
-
 
A
K
 
K
S
 
E
G
 
I
N
 
P
Y
 
Y
V
 
A
E
 
E
I
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
 
S
D
 
A
N
 
Q
N
 
P
T
 
T
W
 
W
N
 
D
R
|
R
S
 
S
K
 
N
G
 
G
F
 
F
H
 
H
S
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
D
H
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
D
 
E
L
 
F
K
 
K
M
 
M
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
D
 
E
F
|
F
D
 
D
R
 
R
N
 
D
K
 
T
A
 
A
M
 
Y
E
 
K
V
 
V
M
 
T
E
 
E
S
 
Q
I
 
I
L
 
L
Q
 
Q
V
 
A
H
 
H
R
 
P
D
 
E
I
 
I
D
 
K
A
 
A
V
 
I
F
 
W
C
 
C
G
 
G
N
|
N
D
 
D
A
 
A
M
 
M
A
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
M
Q
 
K
A
 
A
L
 
C
K
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
-
E
 
R
N
 
T
Q
 
D
V
 
I
M
 
Y
V
 
I
F
 
F
G
 
G
F
 
F
D
|
D
G
 
G
A
 
A
A
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
I
K
 
K
D
 
E
G
 
G
R
 
K
-
 
Q
I
 
I
A
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
I
M
 
M
Q
|
Q
F
 
F
P
 
P
K
 
K
V
 
L
M
 
M
A
 
A
K
 
R
T
 
L
A
 
A
A
 
V
Q
 
E
L
 
W
A
 
A
D
 
D
K
 
Q
Y
 
Y
I
 
L
Q
 
R
G
 
G
E
 
E
R
 
R
D
 
S
F
 
F
V
 
P
K
 
E
K
 
I
L
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
T
V
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
V
T
 
T
L
 
R
A
 
E
N
 
N
V
 
I
E
 
D
H
 
K
Y
 
Y
A
 
T
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
K
 
R
K
 
K

2ioyA Crystal structure of thermoanaerobacter tengcongensis ribose binding protein (see paper)
39% identity, 87% coverage: 34:307/316 of query aligns to 3:274/274 of 2ioyA

query
sites
2ioyA
V
 
I
A
 
G
V
 
L
I
 
V
V
 
I
S
 
S
T
 
T
L
 
L
N
 
N
N
|
N
P
 
P
W
x
F
F
|
F
V
 
V
V
 
T
L
 
L
A
 
K
E
 
N
T
 
G
A
 
A
A
 
E
K
 
E
E
 
K
A
 
A
E
 
K
S
 
E
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
E
 
K
V
 
I
S
 
I
I
 
V
F
 
E
D
 
D
S
 
S
Q
 
Q
N
 
N
N
 
D
T
 
S
A
 
S
L
 
K
E
 
E
N
 
L
N
 
S
H
 
N
F
 
V
E
 
E
N
 
D
A
 
L
I
 
I
T
 
Q
A
 
Q
G
 
K
Y
 
V
Q
 
D
A
 
V
I
 
L
L
 
L
F
 
I
N
 
N
P
 
P
T
 
V
D
 
D
A
 
S
E
 
D
G
 
A
S
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
A
V
 
I
T
 
K
K
 
E
A
 
A
S
 
N
E
 
S
A
 
K
G
 
N
I
 
I
A
 
P
V
 
V
F
 
I
C
 
T
M
 
I
D
|
D
R
|
R
E
 
S
V
 
A
N
 
N
S
 
G
S
 
G
L
 
D
P
 
V
T
 
V
S
 
C
Q
 
H
I
 
I
L
 
A
S
 
S
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
A
 
K
G
 
G
C
 
G
V
 
E
S
 
M
L
 
A
G
 
A
K
 
E
Y
 
F
F
 
I
V
 
A
D
 
K
Q
 
A
L
 
L
D
 
K
K
 
G
S
 
K
G
 
G
N
 
N
Y
 
V
V
 
V
E
 
E
I
 
L
L
 
E
G
 
G
L
 
I
V
 
P
G
 
G
D
 
A
N
 
S
N
x
A
T
 
A
W
 
R
N
 
D
R
|
R
S
 
G
K
 
K
G
 
G
F
 
F
H
 
D
S
 
E
V
 
A
V
 
I
G
 
A
H
 
K
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
L
 
I
K
 
K
M
 
I
V
 
V
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
S
 
A
A
 
A
D
 
D
F
|
F
D
 
D
R
 
R
N
 
S
K
 
K
A
 
G
M
 
L
E
 
S
V
 
V
M
 
M
E
 
E
S
 
N
I
 
I
L
 
L
Q
 
Q
V
 
A
H
 
Q
R
 
P
D
 
K
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
F
 
F
C
 
A
G
 
Q
N
|
N
D
 
D
A
 
E
M
 
M
A
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
I
Q
 
K
A
 
A
L
 
I
K
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
N
L
 
R
E
 
Q
N
 
G
Q
 
-
V
 
I
M
 
I
V
 
V
F
 
V
G
 
G
F
 
F
D
|
D
G
 
G
A
 
T
A
 
E
D
 
D
V
 
A
V
 
L
D
 
K
A
 
A
V
 
I
K
 
K
D
 
E
G
 
G
R
 
K
I
 
M
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
I
M
 
A
Q
|
Q
F
 
Q
P
 
P
K
 
A
V
 
L
M
 
M
A
 
G
K
 
S
T
 
L
A
 
G
A
 
V
Q
 
E
L
 
M
A
 
A
D
 
D
K
 
K
Y
 
Y
I
 
L
Q
 
K
G
 
G
E
 
E
R
 
K
-
 
I
-
 
P
D
 
N
F
 
F
V
 
I
K
 
-
K
 
-
L
 
-
P
 
P
V
 
A
D
 
E
V
 
L
E
 
K
L
 
L
V
 
I
T
 
T
L
 
K
A
 
E
N
 
N
V
 
V
E
 
Q

1dbpA Identical mutations at corresponding positions in two homologous proteins with non-identical effects (see paper)
40% identity, 86% coverage: 31:301/316 of query aligns to 1:268/271 of 1dbpA

query
sites
1dbpA
K
 
K
G
 
D
K
 
T
V
 
I
A
 
A
V
 
L
I
 
V
V
 
V
S
 
S
T
 
T
L
 
L
N
 
N
N
|
N
P
 
P
W
x
F
F
 
F
V
 
V
V
 
S
L
 
L
A
 
K
E
 
D
T
 
G
A
 
A
A
 
Q
K
 
K
E
 
E
A
 
A
E
 
D
S
 
K
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
E
 
N
V
 
L
S
 
V
I
 
V
F
 
L
D
 
D
S
 
S
Q
 
Q
N
 
N
N
 
N
T
 
P
A
 
A
L
 
K
E
 
E
N
 
L
N
 
A
H
 
N
F
 
V
E
 
Q
N
 
D
A
 
L
I
 
T
T
 
V
A
 
R
G
 
G
Y
 
T
Q
 
K
A
 
I
I
 
L
L
 
L
F
 
I
N
 
N
P
 
P
T
 
T
D
 
D
A
 
S
E
 
D
G
 
A
S
 
V
V
 
D
S
 
N
N
 
A
V
 
V
T
 
K
K
 
M
A
 
A
S
 
N
E
 
Q
A
 
A
G
 
N
I
 
I
A
 
P
V
 
V
F
 
I
C
 
T
M
 
L
D
|
D
R
|
R
E
 
Q
V
 
A
N
 
T
S
 
K
S
 
G
L
 
E
P
 
V
T
 
V
S
 
S
Q
 
H
I
 
I
L
 
A
S
 
S
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
A
 
L
G
 
G
C
 
G
V
 
K
S
 
I
L
 
A
G
 
G
K
 
D
Y
 
Y
F
 
I
V
 
A
D
 
K
Q
 
K
L
 
A
D
 
G
K
 
E
S
 
G
G
 
A
N
 
K
Y
 
V
V
 
I
E
 
E
I
 
L
L
 
Q
G
 
G
L
 
I
V
 
A
G
 
G
D
 
T
N
 
S
N
 
A
T
 
A
W
 
R
N
 
E
R
|
R
S
 
G
K
 
E
G
 
G
F
 
F
H
 
Q
S
 
Q
V
 
A
V
 
V
G
 
A
H
 
A
Y
 
H
P
 
-
D
 
K
L
 
F
K
 
N
M
 
V
V
 
L
A
 
A
Q
 
S
Q
 
Q
S
 
P
A
 
A
D
 
D
F
|
F
D
 
D
R
 
R
N
 
I
K
 
K
A
 
G
M
 
L
E
 
N
V
 
V
M
 
M
E
 
Q
S
 
N
I
 
L
L
 
L
Q
 
T
V
 
A
H
 
H
R
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
F
 
F
C
 
A
G
 
Q
N
|
N
D
 
D
A
 
E
M
 
M
A
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
A
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
-
E
 
K
N
 
S
Q
 
D
V
 
V
M
 
M
V
 
V
F
 
V
G
 
G
F
 
F
D
|
D
G
 
G
A
 
T
A
 
P
D
 
D
V
 
G
V
 
E
D
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
N
D
 
D
G
 
G
R
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
I
M
 
A
Q
 
Q
F
 
L
P
 
P
K
 
D
V
 
Q
M
 
I
A
 
G
K
 
A
T
 
K
A
 
G
A
 
V
Q
 
E
L
 
T
A
 
A
D
 
D
K
 
K
Y
 
V
I
 
L
Q
 
K
G
 
G
E
 
E
R
 
K
D
 
-
F
 
V
V
 
Q
K
 
A
K
 
K
L
 
Y
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
L
E
 
K
L
 
L
V
 
V

5ibqA Crystal structure of an abc solute binding protein from rhizobium etli cfn 42 (rhe_pf00037,target efi-511357) in complex with alpha-d-apiose
41% identity, 80% coverage: 34:285/316 of query aligns to 5:256/287 of 5ibqA

query
sites
5ibqA
V
 
I
A
 
A
V
 
I
I
 
I
V
 
T
S
 
P
T
 
A
L
 
H
N
 
D
N
|
N
P
 
P
W
x
F
F
 
F
V
 
K
V
 
A
L
 
E
A
 
A
E
 
V
T
 
G
A
 
A
A
 
E
K
 
A
E
 
K
A
 
A
E
 
K
S
 
E
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
V
 
T
S
 
L
I
 
V
F
 
M
D
 
T
S
 
H
Q
 
D
N
 
D
N
 
D
T
 
A
A
 
N
L
 
K
E
 
Q
N
 
S
N
 
E
H
 
M
F
 
I
E
 
D
N
 
T
A
 
A
I
 
I
T
 
G
A
 
R
G
 
G
Y
 
A
Q
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
I
F
 
L
N
 
D
P
 
N
T
 
A
D
 
G
A
 
A
E
 
D
G
 
A
S
 
S
V
 
V
S
 
A
N
 
A
V
 
V
T
 
K
K
 
K
A
 
A
S
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
P
V
 
S
F
 
F
C
 
L
M
 
I
D
|
D
R
|
R
E
 
E
V
 
I
N
 
N
S
 
A
S
 
T
-
 
G
L
 
V
P
 
A
T
 
V
S
 
A
Q
 
Q
I
 
I
L
 
V
S
 
S
D
 
N
N
 
N
Y
 
Y
A
 
Q
G
 
G
C
 
A
V
 
Q
S
 
L
L
 
G
G
 
A
K
 
Q
Y
 
E
F
 
F
V
 
V
D
 
K
Q
 
L
L
 
M
D
 
G
K
 
E
S
 
K
G
 
G
N
 
N
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
I
 
L
L
 
V
G
 
G
L
 
K
V
 
E
G
 
S
D
|
D
N
 
T
N
|
N
T
 
A
W
 
G
N
 
I
R
|
R
S
 
S
K
 
Q
G
 
G
F
 
Y
H
 
H
S
x
D
V
 
V
V
 
I
G
x
D
H
x
D
Y
 
Y
P
 
P
D
 
E
L
 
M
K
 
K
M
 
S
V
 
V
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
D
 
N
F
x
W
D
 
S
R
 
Q
N
 
T
K
 
E
A
 
A
M
 
Y
E
 
S
V
 
K
M
 
M
E
 
E
S
 
T
I
 
I
L
 
L
Q
 
Q
V
 
A
H
 
N
R
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
K
A
 
G
V
 
V
F
 
I
C
 
S
G
 
G
N
|
N
D
 
D
A
 
T
M
 
M
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
Y
 
I
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
R
E
 
K
N
 
D
Q
 
-
V
 
V
M
 
I
V
 
V
F
 
V
G
 
G
F
 
F
D
|
D
G
 
G
A
 
S
A
 
N
D
 
D
V
 
V
V
 
R
D
 
D
A
 
S
V
 
I
K
 
K
D
 
S
G
 
G
R
 
G
I
 
I
A
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
V
M
 
L
Q
 
Q
F
 
P
P
 
A
K
 
Y
V
 
A
M
 
Q
A
 
A
K
 
Q
T
 
L
A
 
A
A
 
V
Q
 
E
L
 
Q
A
 
A
D
 
D
K
 
A
Y
 
Y
I
 
I
Q
 
K

4ry0A Crystal structure of ribose transporter solute binding protein rhe_pf00037 from rhizobium etli cfn 42, target efi-511357, in complex with d-ribose
41% identity, 80% coverage: 34:285/316 of query aligns to 5:256/287 of 4ry0A

query
sites
4ry0A
V
 
I
A
 
A
V
 
I
I
 
I
V
 
T
S
 
P
T
 
A
L
 
H
N
 
D
N
|
N
P
 
P
W
 
F
F
|
F
V
 
K
V
 
A
L
 
E
A
 
A
E
 
V
T
 
G
A
 
A
A
 
E
K
 
A
E
 
K
A
 
A
E
 
K
S
 
E
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
V
 
T
S
 
L
I
 
V
F
 
M
D
 
T
S
 
H
Q
 
D
N
 
D
N
 
D
T
 
A
A
 
N
L
 
K
E
 
Q
N
 
S
N
 
E
H
 
M
F
 
I
E
 
D
N
 
T
A
 
A
I
 
I
T
 
G
A
 
R
G
 
G
Y
 
A
Q
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
I
F
 
L
N
 
D
P
 
N
T
 
A
D
 
G
A
 
A
E
 
D
G
 
A
S
 
S
V
 
V
S
 
A
N
 
A
V
 
V
T
 
K
K
 
K
A
 
A
S
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
P
V
 
S
F
 
F
C
 
L
M
 
I
D
|
D
R
|
R
E
 
E
V
 
I
N
 
N
S
 
A
S
 
T
-
 
G
L
 
V
P
 
A
T
 
V
S
 
A
Q
 
Q
I
 
I
L
 
V
S
 
S
D
 
N
N
 
N
Y
 
Y
A
 
Q
G
 
G
C
 
A
V
 
Q
S
 
L
L
 
G
G
 
A
K
 
Q
Y
 
E
F
 
F
V
 
V
D
 
K
Q
 
L
L
 
M
D
 
G
K
 
E
S
 
K
G
 
G
N
 
N
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
I
 
L
L
 
V
G
 
G
L
 
K
V
 
E
G
 
S
D
|
D
N
 
T
N
 
N
T
 
A
W
 
G
N
 
I
R
|
R
S
 
S
K
 
Q
G
 
G
F
 
Y
H
 
H
S
x
D
V
 
V
V
 
I
G
x
D
H
x
D
Y
 
Y
P
 
P
D
 
E
L
 
M
K
 
K
M
 
S
V
 
V
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
D
 
N
F
x
W
D
 
S
R
 
Q
N
 
T
K
 
E
A
 
A
M
 
Y
E
 
S
V
 
K
M
 
M
E
 
E
S
 
T
I
 
I
L
 
L
Q
 
Q
V
 
A
H
 
N
R
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
K
A
 
G
V
 
V
F
 
I
C
 
S
G
 
G
N
|
N
D
 
D
A
 
T
M
 
M
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
Y
 
I
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
R
E
 
K
N
 
D
Q
 
-
V
 
V
M
 
I
V
 
V
F
 
V
G
 
G
F
 
F
D
|
D
G
 
G
A
 
S
A
 
N
D
 
D
V
 
V
V
 
R
D
 
D
A
 
S
V
 
I
K
 
K
D
 
S
G
 
G
R
 
G
I
 
I
A
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
V
M
 
L
Q
|
Q
F
 
P
P
 
A
K
 
Y
V
 
A
M
 
Q
A
 
A
K
 
Q
T
 
L
A
 
A
A
 
V
Q
 
E
L
 
Q
A
 
A
D
 
D
K
 
A
Y
 
Y
I
 
I
Q
 
K

7e7mC Crystal structure analysis of the streptococcus agalactiae ribose binding protein rbsb
38% identity, 88% coverage: 33:309/316 of query aligns to 10:282/284 of 7e7mC

query
sites
7e7mC
K
 
K
V
 
L
A
 
G
V
 
V
I
 
S
V
 
I
S
 
S
T
 
T
L
 
T
N
 
N
N
|
N
P
 
P
W
x
Y
F
|
F
V
 
V
V
 
A
L
 
M
A
 
K
E
 
D
T
 
G
A
 
I
A
 
D
K
 
K
E
 
Y
A
 
A
E
 
S
S
 
N
L
 
K
G
 
K
Y
 
I
E
 
S
V
 
I
S
 
K
I
 
V
F
 
A
D
 
D
S
 
A
Q
 
Q
N
 
D
N
 
D
T
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
Q
N
 
A
N
 
D
H
 
D
F
 
V
E
 
Q
N
 
N
A
 
F
I
 
I
T
 
S
A
 
Q
G
 
N
Y
 
V
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
L
 
L
F
 
I
N
 
N
P
 
P
T
 
V
D
 
D
A
 
S
E
 
K
G
 
A
S
 
I
V
 
V
S
 
T
N
 
A
V
 
I
T
 
K
K
 
S
A
 
A
S
 
N
E
 
N
A
 
A
G
 
N
I
 
I
A
 
P
V
 
V
F
 
I
C
 
L
M
 
M
D
|
D
R
|
R
E
 
G
V
 
S
N
 
E
S
 
G
S
 
G
L
 
K
P
 
V
T
 
L
S
 
T
Q
 
T
I
 
V
L
 
A
S
 
S
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
A
 
A
G
 
A
C
 
G
V
 
K
S
 
M
L
 
A
G
 
A
K
 
D
Y
 
Y
F
 
A
V
 
V
D
 
K
Q
 
K
L
 
L
D
 
G
K
 
K
S
 
K
G
 
A
N
 
K
Y
 
A
V
 
F
E
 
E
I
 
L
L
 
S
G
 
G
L
 
V
V
 
P
G
 
G
D
 
A
N
 
S
N
 
A
T
 
T
W
 
V
N
 
D
R
|
R
S
 
G
K
 
K
G
 
G
F
 
F
H
 
H
S
 
S
V
 
V
V
 
A
G
 
-
H
 
-
Y
 
K
P
 
S
D
 
K
L
 
L
K
 
D
M
 
M
V
 
L
A
 
S
Q
 
S
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
D
 
N
F
|
F
D
 
D
R
 
R
N
 
A
K
 
K
A
 
A
M
 
L
E
 
N
V
 
T
M
 
T
E
 
Q
S
 
N
I
 
M
L
 
I
Q
 
Q
V
 
G
H
 
H
R
 
K
D
 
D
I
 
V
D
 
Q
A
 
I
V
 
I
F
 
F
C
 
A
G
 
Q
N
|
N
D
 
D
A
 
E
M
 
M
A
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
V
K
 
K
A
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
Q
N
 
N
Q
 
-
V
 
V
M
 
L
V
 
I
F
 
V
G
 
G
F
 
I
D
|
D
G
 
G
A
 
Q
A
 
P
D
 
D
V
 
A
V
 
H
D
 
D
A
 
A
V
 
I
K
 
K
D
 
K
G
 
G
R
 
D
I
 
I
A
 
S
A
 
A
T
 
T
A
 
I
M
 
A
Q
|
Q
F
 
Q
P
 
P
K
 
A
V
 
K
M
 
M
A
 
G
K
 
E
T
 
I
A
 
A
A
 
I
Q
 
Q
L
 
A
A
 
A
D
 
I
K
 
D
Y
 
Y
I
 
Y
Q
 
K
G
 
G
E
 
K
R
 
K
D
 
-
F
 
V
V
 
E
K
 
K
K
 
E
L
 
T
P
 
I
V
 
S
D
 
P
V
 
I
E
 
Y
L
 
L
V
 
V
T
 
T
L
 
K
A
 
D
N
 
N
V
 
V
E
 
E
H
 
K
Y
 
Y

4zjpA Structure of an abc-transporter solute binding protein (sbp_ipr025997) from actinobacillus succinogenes (asuc_0197, target efi-511067) with bound beta-d-ribopyranose
37% identity, 85% coverage: 34:302/316 of query aligns to 5:269/270 of 4zjpA

query
sites
4zjpA
V
 
I
A
 
A
V
 
L
I
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
L
 
L
N
 
D
N
|
N
P
 
P
W
x
F
F
|
F
V
 
V
V
 
S
L
 
L
A
 
K
E
 
D
T
 
G
A
 
A
A
 
Q
K
 
K
E
 
K
A
 
A
E
 
T
S
 
E
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
E
 
K
V
 
L
S
 
V
I
 
V
F
 
L
D
 
D
S
 
S
Q
 
Q
N
 
N
N
 
D
T
 
P
A
 
S
L
 
K
E
 
E
N
 
L
N
 
S
H
 
N
F
 
V
E
 
E
N
 
D
A
 
L
I
 
T
T
 
V
A
 
R
G
 
G
Y
 
A
Q
 
K
A
 
V
I
 
L
L
 
L
F
 
I
N
 
N
P
 
P
T
 
T
D
 
D
A
 
S
E
 
A
G
 
A
S
 
V
V
 
S
S
 
N
N
 
A
V
 
V
T
 
A
K
 
I
A
 
A
S
 
N
E
 
R
A
 
N
G
 
K
I
 
I
A
 
P
V
 
V
F
 
I
C
 
T
M
 
L
D
|
D
R
|
R
E
 
G
V
 
A
N
 
A
S
 
K
S
 
G
L
 
E
P
 
V
T
 
V
S
 
S
Q
 
H
I
 
I
L
 
A
S
 
S
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
A
 
A
G
 
G
C
 
G
V
 
K
S
 
M
L
 
A
G
 
G
K
 
D
Y
 
F
F
 
I
V
 
A
D
 
Q
Q
 
K
L
 
L
D
 
G
K
 
D
S
 
G
G
 
A
N
 
K
Y
 
V
V
 
I
E
 
Q
I
 
L
L
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
A
G
 
G
D
 
T
N
 
S
N
 
A
T
 
A
W
 
R
N
 
E
R
|
R
S
 
G
K
 
E
G
 
G
F
 
F
H
 
K
S
 
Q
V
 
A
V
 
I
-
 
E
G
 
A
H
 
H
Y
 
K
P
 
F
D
 
D
L
 
-
K
 
-
M
 
V
V
 
L
A
 
A
Q
 
S
Q
 
Q
S
 
P
A
 
A
D
 
D
F
|
F
D
 
D
R
 
R
N
 
T
K
 
K
A
 
G
M
 
L
E
 
N
V
 
V
M
 
T
E
 
E
S
 
N
I
 
L
L
 
L
Q
 
A
V
 
S
H
 
K
R
 
G
D
 
S
I
 
V
D
 
Q
A
 
A
V
 
I
F
 
F
C
 
A
G
 
Q
N
|
N
D
 
D
A
 
E
M
 
M
A
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
I
K
 
S
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
-
E
 
-
N
 
K
Q
 
K
V
 
V
M
 
L
V
 
V
F
 
V
G
 
G
F
 
F
D
|
D
G
 
G
A
 
T
A
 
E
D
 
D
V
 
G
V
 
V
D
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
K
D
 
S
G
 
G
R
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
V
M
 
A
Q
|
Q
F
 
Q
P
 
P
K
 
E
V
 
L
M
 
I
A
 
G
K
 
S
T
 
L
A
 
G
A
 
V
Q
 
E
L
 
T
A
 
A
D
 
D
K
 
K
Y
 
I
I
 
L
Q
 
K
G
 
G
E
 
E
R
 
K
D
 
-
F
 
V
V
 
D
K
 
A
K
 
K
L
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
A
V
 
L
E
 
K
L
 
V
V
 
V
T
 
T

4irxA Crystal structure of caulobacter myo-inositol binding protein bound to myo-inositol (see paper)
30% identity, 89% coverage: 33:314/316 of query aligns to 10:295/296 of 4irxA

query
sites
4irxA
K
 
E
V
 
V
A
 
V
V
 
V
I
 
S
V
 
F
S
 
N
T
 
D
L
 
L
N
 
S
N
x
Q
P
 
P
W
x
F
F
 
F
V
 
V
V
 
A
L
 
M
A
 
R
E
 
R
T
 
E
A
 
L
A
 
E
K
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
A
S
 
K
L
 
L
G
 
G
Y
 
V
E
 
K
V
 
V
S
 
Q
I
 
V
F
 
L
D
 
D
S
 
A
Q
 
Q
N
 
N
N
 
N
T
 
S
A
 
S
L
 
K
E
 
Q
N
 
I
N
 
S
H
 
D
F
 
L
E
 
Q
N
 
A
A
 
A
I
 
A
T
 
V
A
 
Q
G
 
G
Y
 
A
Q
 
K
A
 
V
I
 
V
L
 
I
F
 
V
N
 
A
P
 
P
T
 
T
D
 
D
A
 
S
E
 
K
G
 
A
S
 
L
V
 
A
S
 
G
N
 
A
V
 
A
T
 
D
K
 
D
A
 
L
S
 
V
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
I
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
I
C
 
S
M
 
V
D
|
D
R
|
R
E
 
N
V
 
I
-
 
A
-
 
G
-
 
G
N
 
K
S
 
T
S
 
A
L
 
V
P
 
P
T
 
-
S
 
-
Q
 
H
I
 
V
L
 
G
S
 
A
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
A
 
A
G
 
G
C
 
G
V
 
R
S
 
A
L
 
M
G
 
A
K
 
D
Y
 
W
F
 
V
V
 
V
D
 
K
Q
 
T
L
 
Y
D
 
P
K
 
A
S
 
G
G
 
A
N
 
R
Y
 
V
V
 
V
E
 
V
I
 
I
L
 
T
G
x
N
L
x
D
V
 
P
G
 
G
D
 
S
N
 
S
N
x
S
T
 
S
W
 
I
N
 
E
R
|
R
S
 
V
K
 
K
G
 
G
F
 
V
H
 
H
-
 
D
S
 
G
V
 
L
V
 
A
G
 
A
H
 
G
Y
 
G
P
 
P
D
 
A
L
 
F
K
 
K
M
 
I
V
 
V
A
 
T
Q
 
E
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
D
 
N
F
x
S
D
 
K
R
 
R
N
 
D
K
 
Q
A
 
A
M
 
L
E
 
T
V
 
V
M
 
T
E
 
Q
S
 
N
I
 
I
L
 
L
Q
 
T
V
 
S
H
 
M
R
 
R
D
 
D
I
 
T
-
 
P
-
 
P
D
 
D
A
 
V
V
 
I
F
 
L
C
 
C
G
 
L
N
|
N
D
 
D
A
 
D
M
 
M
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
Y
 
L
Q
 
E
A
 
A
L
 
V
K
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
D
N
 
S
-
 
A
Q
 
K
V
 
V
M
 
K
V
 
V
F
 
I
G
 
G
F
 
F
D
|
D
G
 
A
A
 
I
A
 
P
D
 
E
V
 
A
V
 
L
D
 
A
A
 
R
V
 
I
K
 
K
D
 
A
G
 
G
R
 
E
I
 
M
A
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
V
M
 
E
Q
|
Q
F
 
N
P
 
P
K
 
G
V
 
L
M
 
Q
A
 
I
K
 
R
T
 
T
A
 
A
-
 
L
A
 
R
Q
 
Q
L
 
A
A
 
V
D
 
D
K
 
K
Y
 
I
I
 
K
Q
 
S
G
 
G
E
 
A
R
 
-
D
 
-
F
 
A
V
 
L
K
 
K
K
 
S
L
 
V
P
 
S
V
 
L
D
 
K
V
 
P
E
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
L
 
S
A
 
G
N
 
N
V
 
L
E
 
T
H
 
E
Y
 
A
A
 
S
A
 
R
Y
 
I
G
 
G
K
 
E

5dteB Crystal structure of an abc transporter periplasmic solute binding protein (ipr025997) from actinobacillus succinogenes 130z(asuc_0081, target efi-511065) with bound d-allose
30% identity, 80% coverage: 31:284/316 of query aligns to 2:263/287 of 5dteB

query
sites
5dteB
K
 
K
G
 
P
K
 
Q
V
 
I
A
 
A
V
 
L
I
 
L
V
 
M
S
x
K
T
 
T
L
 
L
N
 
S
N
|
N
P
 
E
W
x
Y
F
 
F
V
 
I
V
 
S
L
 
M
-
 
R
-
 
Q
-
 
G
A
 
A
E
 
E
T
 
E
A
 
T
A
 
A
K
 
K
E
 
Q
A
 
-
E
 
K
S
 
D
L
 
I
G
 
D
Y
 
L
E
 
I
V
 
V
S
 
Q
I
 
V
F
 
A
D
 
E
S
 
K
Q
 
E
N
 
D
N
 
S
T
 
T
A
 
E
L
 
Q
E
 
L
N
 
V
N
 
G
H
 
L
F
 
V
E
 
E
N
 
N
A
 
M
I
 
I
T
 
A
A
 
K
G
 
K
Y
 
V
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
L
 
I
F
 
V
N
 
T
P
 
P
T
 
N
D
 
D
A
 
S
E
 
I
G
 
A
S
 
F
V
 
I
S
 
P
N
 
A
V
 
F
T
 
Q
K
 
K
A
 
A
S
 
E
E
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
P
V
 
I
F
 
I
C
 
D
M
 
L
D
|
D
R
 
V
E
 
R
V
 
L
N
 
D
S
 
A
S
 
K
L
 
A
P
 
A
T
 
E
S
 
A
Q
 
A
I
 
G
L
 
L
S
 
K
D
 
F
N
 
N
Y
 
Y
A
 
V
G
 
G
C
 
V
V
 
D
S
 
N
L
 
F
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
 
L
-
 
E
G
 
A
K
 
K
Y
 
N
F
 
L
V
 
A
D
 
E
Q
 
A
L
 
I
D
 
G
K
 
K
S
 
K
G
 
G
N
 
N
Y
 
V
V
 
A
E
 
I
I
 
L
L
 
E
G
 
G
L
 
I
V
 
P
G
 
G
D
 
V
N
 
D
N
|
N
T
 
G
W
 
E
N
 
Q
R
|
R
S
 
K
K
 
G
G
 
G
F
 
A
H
 
L
S
 
K
V
 
A
V
 
F
G
 
A
H
 
E
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
L
 
I
K
 
K
M
 
I
V
 
V
A
 
A
Q
 
S
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
D
 
N
F
x
W
D
 
E
R
 
T
N
 
E
K
 
Q
A
 
A
M
 
L
E
 
N
V
 
V
M
 
T
E
 
T
S
 
N
I
 
I
L
 
L
Q
 
T
V
 
A
H
 
N
R
 
P
D
 
N
I
 
I
D
 
N
A
 
G
V
 
I
F
 
F
C
 
A
G
 
A
N
 
N
D
 
D
A
 
N
M
 
M
A
 
A
M
 
I
G
 
G
A
 
A
Y
 
V
Q
 
T
A
 
A
L
 
V
K
 
E
A
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
A
N
 
G
Q
 
K
V
 
V
M
 
L
V
 
V
F
 
S
G
 
G
F
 
Y
D
|
D
G
 
G
A
 
I
A
 
P
D
 
L
V
 
A
V
 
I
D
 
E
A
 
Y
V
 
V
K
 
K
D
 
Q
G
 
G
R
 
K
I
 
M
A
 
Q
A
 
N
T
 
T
A
 
I
M
 
D
Q
|
Q
F
 
L
P
 
P
K
 
K
V
 
K
M
 
Q
A
 
V
K
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
I
Q
 
E
L
 
H
A
 
A
D
 
L
K
 
K
Y
 
Q
I
 
I

1rpjA Crystal structure of d-allose binding protein from escherichia coli (see paper)
31% identity, 78% coverage: 35:279/316 of query aligns to 5:259/288 of 1rpjA

query
sites
1rpjA
A
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
L
S
x
K
T
 
T
L
 
L
N
 
S
N
|
N
P
 
P
W
x
F
F
 
W
V
 
V
V
 
D
L
 
M
A
 
K
E
 
K
T
 
G
A
 
I
A
 
E
K
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
K
S
 
T
L
 
L
G
 
G
Y
 
V
E
 
S
V
 
V
S
 
D
I
 
I
F
 
F
D
 
A
S
 
S
Q
 
P
N
 
S
N
x
E
T
 
G
A
 
D
L
 
F
E
 
Q
N
 
S
N
 
Q
H
 
L
-
 
Q
-
 
L
F
 
F
E
 
E
N
 
D
A
 
L
I
 
S
T
 
N
A
 
K
G
 
N
Y
 
Y
Q
 
K
A
 
G
I
 
I
L
 
A
F
 
F
N
 
A
P
 
P
T
 
L
D
 
S
A
 
S
E
 
V
G
 
N
S
 
L
V
 
V
S
 
M
N
 
P
V
 
V
T
 
A
K
 
R
A
 
A
S
 
W
E
 
K
A
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
Y
V
 
L
F
 
V
C
 
N
M
 
L
D
|
D
R
 
E
E
 
K
V
 
I
N
 
D
-
 
M
S
 
D
S
 
N
L
 
L
P
 
K
T
 
K
S
 
A
Q
 
G
-
 
G
-
 
N
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
F
I
 
V
L
 
T
S
 
T
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
A
 
A
G
 
V
C
 
G
V
 
A
S
 
K
L
 
G
G
 
A
K
 
S
Y
 
F
F
 
I
V
 
I
D
 
D
Q
 
K
L
 
L
D
 
G
K
 
A
S
 
E
G
 
G
N
 
G
Y
 
E
V
 
V
E
 
A
I
 
I
L
 
I
-
 
E
G
 
G
L
 
K
V
 
A
G
 
G
D
 
N
N
 
A
N
x
S
T
 
G
W
 
E
N
 
A
R
|
R
S
 
R
K
 
N
G
 
G
F
 
A
H
 
T
S
 
E
V
 
A
V
 
F
G
 
K
H
 
K
Y
 
A
P
 
S
D
 
Q
L
 
I
K
 
K
M
 
L
V
 
V
A
 
A
Q
 
S
Q
 
Q
S
 
P
A
 
A
D
 
D
F
x
W
D
 
D
R
 
R
N
 
I
K
 
K
A
 
A
M
 
L
E
 
D
V
 
V
M
 
A
E
 
T
S
 
N
I
 
V
L
 
L
Q
 
Q
V
 
R
H
 
N
R
 
P
D
 
N
I
 
I
D
 
K
A
 
A
V
 
I
F
 
Y
C
 
C
G
 
A
N
|
N
D
 
D
A
 
T
M
 
M
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
V
Y
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
V
K
 
A
A
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
K
E
 
T
N
 
G
Q
 
K
V
 
V
M
 
L
V
 
V
F
 
V
G
 
G
F
 
T
D
|
D
G
 
G
A
 
I
A
 
P
D
 
E
V
 
A
V
 
R
D
 
K
A
 
M
V
 
V
K
 
E
D
 
A
G
 
G
R
 
Q
I
 
M
A
 
T
A
 
A
T
 
T
A
 
V
M
 
A
Q
|
Q
F
 
N
P
 
P
K
 
A
V
 
D
M
 
I
A
 
G
K
 
A
T
 
T
A
 
G
A
 
L
Q
 
K
L
 
L

1gudA Hinge-bending motion of d-allose binding protein from escherichia coli: three open conformations (see paper)
31% identity, 78% coverage: 35:279/316 of query aligns to 5:259/288 of 1gudA

query
sites
1gudA
A
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
L
S
 
K
T
 
T
L
 
L
N
 
S
N
 
N
P
 
P
W
 
F
F
 
W
V
 
V
V
 
D
L
 
M
A
 
K
E
 
K
T
 
G
A
 
I
A
 
E
K
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
K
S
 
T
L
 
L
G
 
G
Y
 
V
E
 
S
V
 
V
S
x
D
I
 
I
F
 
F
D
 
A
S
 
S
Q
 
P
N
 
S
N
 
E
T
 
G
A
 
D
L
 
F
E
 
Q
N
 
S
N
 
Q
H
 
L
-
 
Q
-
 
L
F
 
F
E
 
E
N
 
D
A
 
L
I
 
S
T
 
N
A
 
K
G
 
N
Y
 
Y
Q
 
K
A
 
G
I
 
I
L
 
A
F
 
F
N
 
A
P
 
P
T
 
L
D
 
S
A
 
S
E
 
V
G
 
N
S
 
L
V
 
V
S
 
M
N
 
P
V
 
V
T
 
A
K
 
R
A
 
A
S
 
W
E
 
K
A
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
Y
V
 
L
F
 
V
C
 
N
M
 
L
D
 
D
R
 
E
E
 
K
V
 
I
N
 
D
-
 
M
S
 
D
S
 
N
L
 
L
P
 
K
T
 
K
S
 
A
Q
 
G
-
 
G
-
 
N
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
F
I
 
V
L
 
T
S
 
T
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
A
 
A
G
 
V
C
 
G
V
 
A
S
 
K
L
 
G
G
 
A
K
 
S
Y
 
F
F
 
I
V
 
I
D
 
D
Q
 
K
L
 
L
D
 
G
K
 
A
S
 
E
G
 
G
N
 
G
Y
 
E
V
 
V
E
 
A
I
 
I
L
 
I
-
 
E
G
 
G
L
 
K
V
 
A
G
 
G
D
 
N
N
 
A
N
 
S
T
 
G
W
 
E
N
 
A
R
 
R
S
 
R
K
 
N
G
 
G
F
 
A
H
 
T
S
 
E
V
 
A
V
 
F
G
 
K
H
 
K
Y
 
A
P
 
S
D
 
Q
L
 
I
K
 
K
M
 
L
V
 
V
A
 
A
Q
 
S
Q
 
Q
S
 
P
A
 
A
D
 
D
F
 
W
D
 
D
R
 
R
N
 
I
K
 
K
A
 
A
M
 
L
E
 
D
V
 
V
M
 
A
E
 
T
S
 
N
I
 
V
L
 
L
Q
 
Q
V
 
R
H
 
N
R
 
P
D
 
N
I
 
I
D
 
K
A
 
A
V
 
I
F
 
Y
C
 
C
G
 
A
N
 
N
D
 
D
A
 
T
M
 
M
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
V
Y
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
V
K
 
A
A
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
K
E
 
T
N
 
G
Q
 
K
V
 
V
M
 
L
V
 
V
F
 
V
G
 
G
F
 
T
D
 
D
G
 
G
A
 
I
A
 
P
D
 
E
V
 
A
V
 
R
D
 
K
A
 
M
V
 
V
K
 
E
D
 
A
G
 
G
R
 
Q
I
 
M
A
 
T
A
 
A
T
 
T
A
 
V
M
 
A
Q
 
Q
F
 
N
P
 
P
K
 
A
V
 
D
M
 
I
A
 
G
K
 
A
T
 
T
A
 
G
A
 
L
Q
 
K
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P39325 Galactofuranose-binding protein YtfQ from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
31% identity, 76% coverage: 45:283/316 of query aligns to 37:283/318 of P39325

query
sites
P39325
W
|
W
F
x
R
V
 
A
V
 
A
L
 
E
A
 
T
E
 
N
T
 
V
A
 
A
A
 
K
K
 
S
E
 
E
A
 
A
E
 
E
S
 
K
L
 
R
G
 
G
Y
 
I
E
 
T
V
 
L
S
 
K
I
 
I
F
 
A
D
 
D
S
 
G
Q
 
Q
N
 
Q
N
 
K
T
 
Q
A
 
E
L
 
N
E
 
Q
N
 
I
N
 
K
H
 
A
F
 
V
E
 
R
N
 
S
A
 
F
I
 
V
T
 
A
A
 
Q
G
 
G
Y
 
V
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
L
 
F
F
 
I
N
 
A
P
 
P
T
 
V
D
 
V
A
 
A
E
 
T
G
 
G
S
 
W
V
 
E
S
 
P
N
 
V
V
 
L
T
 
K
K
 
E
A
 
A
S
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
E
I
 
I
A
 
P
V
 
V
F
 
F
C
 
L
M
 
L
D
|
D
R
|
R
E
 
S
V
 
I
N
 
D
-
 
V
-
 
K
-
 
D
S
 
K
S
 
S
L
 
L
P
 
Y
T
 
M
S
 
T
Q
 
T
I
 
V
L
 
T
S
 
A
D
 
D
N
 
N
Y
 
I
A
 
L
G
 
E
C
 
G
V
 
K
S
 
L
L
 
I
G
 
G
K
 
D
Y
 
W
F
 
L
V
 
V
D
 
K
Q
 
E
L
 
V
D
 
N
-
 
G
K
 
K
S
 
P
G
x
C
N
 
N
Y
 
V
V
 
V
E
 
E
I
 
L
L
 
Q
G
 
G
L
 
T
V
 
V
G
 
G
D
 
A
N
 
S
N
 
V
T
 
A
W
 
I
N
 
D
R
|
R
S
 
K
K
 
K
G
 
G
F
 
F
H
 
A
S
 
E
V
 
A
V
 
I
G
 
K
H
 
N
Y
 
A
P
 
P
D
 
N
L
 
I
K
 
K
M
 
I
V
 
I
A
 
R
Q
 
S
Q
 
Q
S
 
S
A
 
G
D
 
D
F
 
F
D
 
T
R
 
R
N
 
S
K
 
K
A
 
G
M
 
K
E
 
E
V
 
V
M
 
M
E
 
E
S
 
S
I
 
F
L
 
I
Q
 
K
V
 
A
H
 
E
-
 
N
-
 
N
-
 
G
R
 
K
D
 
N
I
 
I
D
x
C
A
 
M
V
 
V
F
 
Y
C
 
A
G
 
H
N
|
N
D
 
D
A
 
D
M
 
M
A
 
V
M
 
I
G
 
G
A
 
A
Y
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
K
 
K
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
K
-
 
P
-
 
G
N
 
K
Q
 
D
V
 
I
M
 
L
V
 
T
F
 
G
G
 
S
F
 
I
D
|
D
G
 
G
A
 
V
A
 
P
D
 
D
V
 
I
V
 
Y
D
 
K
A
 
A
V
 
M
K
 
M
D
 
D
G
 
G
R
 
E
I
 
A
A
 
N
A
 
A
T
 
S
A
 
V
M
 
E
Q
 
L
F
 
T
P
 
P
K
 
N
V
 
-
M
 
M
A
 
A
K
 
G
T
 
P
A
 
A
A
 
F
Q
 
D
L
 
A
A
 
L
D
 
E
K
 
K
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

5ocpA The periplasmic binding protein component of the arabinose abc transporter from shewanella sp. Ana-3 bound to alpha and beta-l- arabinofuranose
29% identity, 78% coverage: 45:292/316 of query aligns to 14:267/302 of 5ocpA

query
sites
5ocpA
W
|
W
F
x
R
V
 
T
V
 
S
L
 
F
A
 
S
E
 
E
T
 
A
A
 
V
A
 
K
K
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
K
S
 
Q
L
 
R
G
 
G
Y
 
I
E
 
D
V
 
L
S
 
K
I
 
F
F
 
A
D
 
D
S
 
A
Q
 
Q
N
 
Q
N
 
K
T
 
Q
A
 
E
L
 
N
E
 
Q
N
 
I
N
 
K
H
 
A
F
 
V
E
 
R
N
 
S
A
 
F
I
 
I
T
 
A
A
 
Q
G
 
G
Y
 
V
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
L
 
I
F
 
I
N
 
A
P
 
P
T
 
V
D
 
V
A
 
E
E
 
T
G
 
G
S
 
W
V
 
K
S
 
P
N
 
V
V
 
L
T
 
K
K
 
E
A
 
A
S
 
K
E
 
R
A
 
A
G
 
K
I
 
I
A
 
P
V
 
V
F
 
V
C
 
I
M
 
V
D
|
D
R
|
R
E
 
N
V
 
I
-
 
K
-
 
V
-
 
D
N
 
D
S
 
D
S
 
S
L
 
L
P
 
F
T
 
L
S
 
T
Q
 
R
I
 
I
L
 
A
S
 
S
D
 
D
N
 
F
Y
 
S
A
 
E
G
 
E
C
 
G
V
 
R
S
 
K
L
 
I
G
 
G
K
 
Q
Y
 
W
F
 
L
V
 
M
D
 
D
Q
 
K
L
 
T
D
 
Q
K
 
G
S
 
N
G
 
C
N
 
D
Y
 
I
V
 
A
E
 
E
I
 
L
L
 
Q
G
 
G
L
 
T
V
 
V
G
 
G
D
 
A
N
 
T
N
 
A
T
 
A
W
 
I
N
 
D
R
|
R
S
 
A
K
 
A
G
 
G
F
 
F
H
 
N
S
 
Q
V
 
V
V
 
I
G
 
A
H
 
N
Y
 
Y
P
 
P
D
 
N
L
 
A
K
 
K
M
 
I
V
 
V
A
 
R
Q
 
S
Q
 
Q
S
 
T
A
 
G
D
 
E
F
|
F
D
 
T
R
 
R
N
 
A
K
 
K
A
 
G
M
 
K
E
 
E
V
 
V
M
 
M
E
 
E
S
 
G
I
 
F
L
 
L
Q
 
K
V
 
A
H
 
Q
-
 
N
-
 
G
R
 
Q
D
 
P
I
 
L
D
 
C
A
 
A
V
 
V
F
 
W
C
 
S
G
 
H
N
|
N
D
 
D
A
 
E
M
 
M
A
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
V
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
K
 
K
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
K
-
 
P
-
 
G
N
 
K
Q
 
D
V
 
I
M
 
L
V
 
I
F
 
V
G
 
S
F
 
V
D
|
D
G
 
G
A
 
V
A
 
P
D
 
D
V
 
Y
V
 
F
D
 
K
A
 
A
V
 
M
K
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
D
I
 
V
A
 
N
A
 
A
T
 
T
A
 
-
M
 
V
Q
 
E
F
 
L
P
 
S
K
 
P
V
 
Y
M
 
L
A
 
G
K
 
G
T
 
P
A
 
A
A
 
F
Q
 
D
L
 
A
A
 
I
D
 
D
K
 
A
Y
 
Y
I
 
L
Q
 
K
G
 
G
E
 
N
R
 
K
D
 
D
F
 
Q
V
 
A
K
 
K

Sites not aligning to the query:

2vk2A Crystal structure of a galactofuranose binding protein (see paper)
31% identity, 76% coverage: 45:283/316 of query aligns to 15:261/296 of 2vk2A

query
sites
2vk2A
W
 
W
F
x
R
V
 
A
V
 
A
L
 
E
A
 
T
E
 
N
T
 
V
A
 
A
A
 
K
K
 
S
E
 
E
A
 
A
E
 
E
S
 
K
L
 
R
G
 
G
Y
 
I
E
 
T
V
 
L
S
 
K
I
 
I
F
 
A
D
 
D
S
 
G
Q
 
Q
N
 
Q
N
 
K
T
 
Q
A
 
E
L
 
N
E
 
Q
N
 
I
N
 
K
H
 
A
F
 
V
E
 
R
N
 
S
A
 
F
I
 
V
T
 
A
A
 
Q
G
 
G
Y
 
V
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
L
 
F
F
 
I
N
 
A
P
 
P
T
 
V
D
 
V
A
 
A
E
 
T
G
 
G
S
 
W
V
 
E
S
 
P
N
 
V
V
 
L
T
 
K
K
 
E
A
 
A
S
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
E
I
 
I
A
 
P
V
 
V
F
 
F
C
 
L
M
 
L
D
|
D
R
|
R
E
 
S
V
 
I
N
 
D
-
 
V
-
 
K
-
 
D
S
 
K
S
 
S
L
 
L
P
 
Y
T
 
M
S
 
T
Q
 
T
I
 
V
L
 
T
S
 
A
D
 
D
N
 
N
Y
 
I
A
 
L
G
 
E
C
 
G
V
 
K
S
 
L
L
 
I
G
 
G
K
 
D
Y
 
W
F
 
L
V
 
V
D
 
K
Q
 
E
L
 
V
D
 
N
-
 
G
K
 
K
S
 
P
G
 
C
N
 
N
Y
 
V
V
 
V
E
 
E
I
 
L
L
 
Q
G
 
G
L
 
T
V
 
V
G
 
G
D
 
A
N
 
S
N
 
V
T
 
A
W
 
I
N
 
D
R
|
R
S
 
K
K
 
K
G
 
G
F
 
F
H
 
A
S
 
E
V
 
A
V
 
I
G
 
K
H
 
N
Y
 
A
P
 
P
D
 
N
L
 
I
K
 
K
M
 
I
V
 
I
A
 
R
Q
 
S
Q
 
Q
S
 
S
A
 
G
D
 
D
F
|
F
D
 
T
R
 
R
N
 
S
K
 
K
A
 
G
M
 
K
E
 
E
V
 
V
M
 
M
E
 
E
S
 
S
I
 
F
L
 
I
Q
 
K
V
 
A
H
 
E
-
 
N
-
 
N
-
 
G
R
 
K
D
 
N
I
 
I
D
 
C
A
 
M
V
 
V
F
 
Y
C
 
A
G
 
H
N
|
N
D
 
D
A
 
D
M
 
M
A
 
V
M
 
I
G
 
G
A
 
A
Y
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
K
 
K
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
K
-
 
P
-
 
G
N
 
K
Q
 
D
V
 
I
M
 
L
V
 
T
F
 
G
G
 
S
F
 
I
D
|
D
G
 
G
A
 
V
A
 
P
D
 
D
V
 
I
V
 
Y
D
 
K
A
 
A
V
 
M
K
 
M
D
 
D
G
 
G
R
 
E
I
 
A
A
 
N
A
 
A
T
 
S
A
 
V
M
 
E
Q
x
L
F
 
T
P
 
P
K
 
N
V
 
-
M
 
M
A
 
A
K
 
G
T
 
P
A
 
A
A
 
F
Q
 
D
L
 
A
A
 
L
D
 
E
K
 
K
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

4ry9B Crystal structure of carbohydrate transporter solute binding protein veis_2079 from verminephrobacter eiseniae ef01-2, target efi-511009, a complex with d-talitol
27% identity, 88% coverage: 33:309/316 of query aligns to 4:290/297 of 4ry9B

query
sites
4ry9B
K
 
K
V
 
I
A
 
G
V
 
V
I
 
S
V
 
M
S
x
K
T
 
T
L
 
L
N
 
S
N
 
A
P
 
P
W
x
Y
F
|
F
V
 
A
V
 
A
L
 
Q
A
 
M
E
 
E
T
 
A
A
 
A
A
 
K
K
 
A
E
 
R
A
 
G
E
 
K
S
 
E
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
S
 
L
I
 
A
F
 
T
D
 
D
S
 
A
Q
 
Q
N
 
G
N
 
K
T
 
L
A
 
Q
L
 
K
E
 
Q
N
 
I
N
 
S
H
 
D
F
 
V
E
 
E
N
 
D
A
 
L
I
 
V
T
 
T
A
 
R
G
 
G
Y
 
V
Q
 
K
A
 
L
I
 
L
L
 
I
F
 
I
N
 
N
P
 
P
T
 
A
D
|
D
A
x
S
E
 
E
G
 
G
S
 
L
V
 
V
S
 
N
N
 
A
V
 
V
T
 
N
K
 
N
A
 
A
S
 
S
E
 
A
A
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
K
V
 
V
F
 
V
C
 
V
M
 
I
D
|
D
R
x
S
E
x
T
V
 
L
N
 
N
S
 
P
S
 
R
L
 
A
P
 
N
-
 
F
T
 
V
S
 
T
Q
 
Q
I
 
V
L
 
Q
S
 
S
D
 
S
N
 
N
Y
 
S
A
 
I
G
 
N
C
 
G
V
 
A
S
 
L
L
 
V
G
 
G
K
 
H
Y
 
W
F
 
V
V
 
I
D
 
E
Q
 
E
L
 
V
-
 
G
D
 
N
K
 
K
S
 
S
G
 
L
N
 
K
Y
 
I
V
 
A
E
 
L
I
 
L
L
 
S
G
 
G
L
 
E
V
 
K
G
 
G
D
x
N
N
x
P
N
 
V
T
 
G
W
 
Q
N
 
E
R
|
R
S
 
R
K
 
L
G
 
G
F
 
V
H
 
L
S
 
S
V
 
G
V
 
I
G
 
I
H
 
E
-
 
A
-
 
Q
-
 
L
-
 
R
-
 
K
-
 
F
-
 
G
Y
 
K
P
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
T
M
 
V
V
 
V
A
 
G
Q
 
Q
Q
 
G
S
 
W
A
 
G
D
 
H
F
x
W
D
 
N
R
 
D
N
 
E
K
 
G
A
 
G
M
 
L
E
 
K
V
 
A
M
 
M
E
 
E
S
 
D
I
 
L
L
 
L
Q
 
V
V
 
A
H
 
N
R
 
K
D
 
D
I
 
I
D
 
N
A
 
M
V
 
V
F
 
L
C
 
G
G
 
E
N
|
N
D
 
D
A
 
S
M
 
M
A
 
V
M
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
R
Q
 
R
A
 
A
L
 
I
K
 
E
A
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
R
E
 
T
N
 
G
Q
 
I
V
 
L
M
 
L
V
 
V
F
 
A
G
 
A
F
 
A
D
|
D
G
 
A
A
 
Q
A
 
K
D
 
E
V
 
A
V
 
L
D
 
A
A
 
L
V
 
I
K
 
K
D
 
Q
G
 
G
R
 
K
I
 
Y
A
 
G
A
 
V
T
 
T
A
 
G
M
 
L
Q
 
N
F
 
D
P
 
P
K
 
A
V
 
L
M
 
V
A
 
A
K
 
R
T
 
T
A
 
A
A
 
I
Q
 
D
L
 
L
A
 
G
D
 
V
K
 
K
Y
 
V
I
 
V
Q
 
K
G
 
G
E
 
E
-
 
V
R
 
K
D
 
D
F
 
V
V
 
P
K
 
K
K
 
Q
L
 
T
P
 
L
V
 
T
D
 
T
V
 
P
E
 
A
L
 
A
V
 
I
T
 
T
L
 
K
A
 
G
N
 
N
V
 
V
E
 
D
H
 
K
Y
 
F

4ry9A Crystal structure of carbohydrate transporter solute binding protein veis_2079 from verminephrobacter eiseniae ef01-2, target efi-511009, a complex with d-talitol
27% identity, 88% coverage: 33:309/316 of query aligns to 4:290/297 of 4ry9A

query
sites
4ry9A
K
 
K
V
 
I
A
 
G
V
 
V
I
 
S
V
 
M
S
x
K
T
 
T
L
 
L
N
 
S
N
 
A
P
 
P
W
x
Y
F
|
F
V
 
A
V
 
A
L
 
Q
A
 
M
E
 
E
T
 
A
A
 
A
A
 
K
K
 
A
E
 
R
A
 
G
E
 
K
S
 
E
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
S
 
L
I
 
A
F
 
T
D
 
D
S
 
A
Q
 
Q
N
 
G
N
 
K
T
 
L
A
 
Q
L
 
K
E
 
Q
N
 
I
N
 
S
H
 
D
F
 
V
E
 
E
N
 
D
A
 
L
I
 
V
T
 
T
A
 
R
G
 
G
Y
 
V
Q
 
K
A
 
L
I
 
L
L
 
I
F
 
I
N
 
N
P
 
P
T
 
A
D
 
D
A
 
S
E
 
E
G
 
G
S
 
L
V
 
V
S
 
N
N
 
A
V
 
V
T
 
N
K
 
N
A
 
A
S
 
S
E
 
A
A
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
K
V
 
V
F
 
V
C
 
V
M
 
I
D
|
D
R
x
S
E
 
T
V
 
L
N
 
N
S
 
P
S
 
R
L
 
A
P
 
N
-
 
F
T
 
V
S
 
T
Q
 
Q
I
 
V
L
 
Q
S
 
S
D
 
S
N
 
N
Y
 
S
A
 
I
G
 
N
C
 
G
V
 
A
S
 
L
L
 
V
G
 
G
K
 
H
Y
 
W
F
 
V
V
 
I
D
 
E
Q
 
E
L
 
V
-
 
G
D
 
N
K
 
K
S
 
S
G
 
L
N
 
K
Y
 
I
V
 
A
E
 
L
I
 
L
L
 
S
G
 
G
L
 
E
V
 
K
G
 
G
D
x
N
N
 
P
N
 
V
T
 
G
W
 
Q
N
 
E
R
|
R
S
 
R
K
 
L
G
 
G
F
 
V
H
 
L
S
 
S
V
 
G
V
 
I
G
 
I
H
 
E
-
 
A
-
 
Q
-
 
L
-
 
R
-
 
K
-
 
F
-
 
G
Y
 
K
P
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
T
M
 
V
V
 
V
A
 
G
Q
 
Q
Q
 
G
S
 
W
A
 
G
D
 
H
F
x
W
D
 
N
R
 
D
N
 
E
K
 
G
A
 
G
M
 
L
E
 
K
V
 
A
M
 
M
E
 
E
S
 
D
I
 
L
L
 
L
Q
 
V
V
 
A
H
 
N
R
 
K
D
 
D
I
 
I
D
 
N
A
 
M
V
 
V
F
 
L
C
 
G
G
 
E
N
|
N
D
 
D
A
 
S
M
 
M
A
 
V
M
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
R
Q
 
R
A
 
A
L
 
I
K
 
E
A
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
R
E
 
T
N
 
G
Q
 
I
V
 
L
M
 
L
V
 
V
F
 
A
G
 
A
F
 
A
D
|
D
G
 
A
A
 
Q
A
 
K
D
 
E
V
 
A
V
 
L
D
 
A
A
 
L
V
 
I
K
 
K
D
 
Q
G
 
G
R
 
K
I
 
Y
A
 
G
A
 
V
T
 
T
A
 
G
M
 
L
Q
 
N
F
 
D
P
 
P
K
 
A
V
 
L
M
 
V
A
 
A
K
 
R
T
 
T
A
 
A
A
 
I
Q
 
D
L
 
L
A
 
G
D
 
V
K
 
K
Y
 
V
I
 
V
Q
 
K
G
 
G
E
 
E
-
 
V
R
 
K
D
 
D
F
 
V
V
 
P
K
 
K
K
 
Q
L
 
T
P
 
L
V
 
T
D
 
T
V
 
P
E
 
A
L
 
A
V
 
I
T
 
T
L
 
K
A
 
G
N
 
N
V
 
V
E
 
D
H
 
K
Y
 
F

4yo7A Crystal structure of an abc transporter solute binding protein (ipr025997) from bacillus halodurans c-125 (bh2323, target efi- 511484) with bound myo-inositol
30% identity, 90% coverage: 28:311/316 of query aligns to 1:285/287 of 4yo7A

query
sites
4yo7A
T
 
T
E
 
G
T
 
D
K
 
S
G
 
G
K
 
Q
V
 
K
A
 
V
V
 
I
I
 
G
V
 
V
S
 
S
T
 
I
L
 
S
N
 
N
N
 
L
P
x
D
W
 
E
F
 
F
V
 
L
V
 
T
L
 
Y
A
 
M
E
 
Q
T
 
D
A
 
A
A
 
M
K
 
K
E
 
E
-
 
E
-
 
A
A
 
A
E
 
N
S
 
Y
L
 
P
G
 
D
Y
 
F
E
 
E
V
 
F
S
 
I
I
 
F
F
 
S
D
 
D
S
 
A
Q
 
Q
N
 
N
N
 
D
T
 
S
A
 
T
L
 
Q
E
 
Q
N
 
M
N
 
A
H
 
Q
F
 
V
E
 
E
N
 
N
A
 
F
I
 
I
T
 
S
A
 
R
G
 
N
Y
 
V
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
L
 
I
F
 
V
N
 
N
P
 
P
T
 
V
D
 
D
A
 
T
E
 
T
G
 
S
S
 
A
V
 
V
S
 
D
N
 
I
V
 
V
T
 
N
K
 
M
A
 
V
S
 
N
E
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
P
V
 
I
F
 
I
C
 
I
M
 
A
D
x
N
R
|
R
E
 
T
V
 
F
N
 
D
S
 
G
-
 
V
S
 
D
L
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
A
Q
 
F
I
 
V
L
 
G
S
 
S
D
 
E
N
 
S
Y
 
I
A
 
Q
G
 
S
C
 
G
V
 
L
S
 
L
L
 
Q
G
 
M
K
 
E
Y
 
E
F
 
V
V
 
A
D
 
K
Q
 
L
L
 
L
D
 
N
K
 
N
S
 
E
G
 
G
N
 
N
Y
 
I
V
 
A
E
 
I
I
 
M
L
 
D
G
 
G
L
 
E
V
 
L
G
 
G
D
 
H
N
 
E
N
 
A
T
 
Q
W
 
I
N
 
M
R
|
R
S
 
T
K
 
E
G
 
G
F
 
N
H
 
K
S
 
Q
V
 
I
V
 
I
G
 
E
H
 
E
Y
 
H
P
 
D
D
 
G
L
 
L
K
 
E
M
 
V
V
 
V
A
 
L
Q
 
Q
Q
 
G
S
 
T
A
 
A
D
 
K
F
 
F
D
 
D
R
 
R
N
 
S
K