SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Echvi_1691 FitnessBrowser__Cola:Echvi_1691 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 15 hits to proteins with known functional sites (download)

1zh8A Crystal structure of oxidoreductase (tm0312) from thermotoga maritima at 2.50 a resolution
30% identity, 45% coverage: 6:159/345 of query aligns to 9:156/325 of 1zh8A

query
sites
1zh8A
I
 
V
G
|
G
A
x
C
G
|
G
G
x
I
I
x
A
V
 
A
K
 
R
D
 
E
A
 
L
H
 
H
L
 
L
P
 
P
A
 
A
Y
 
L
K
 
K
I
 
N
A
 
L
G
 
S
-
 
H
-
 
L
F
 
F
E
 
E
V
 
I
E
 
T
G
 
A
V
 
V
Y
 
T
D
x
S
L
x
R
D
x
T
E
 
R
E
 
S
N
x
H
A
 
A
I
 
E
S
 
E
L
 
F
A
 
A
T
 
K
A
 
M
F
 
V
G
 
G
I
 
N
P
 
P
R
 
A
V
 
V
F
 
F
G
 
D
S
 
S
L
 
Y
D
 
E
E
 
E
L
 
L
T
 
L
A
 
E
H
 
S
A
 
G
T
 
L
E
 
V
D
 
D
T
 
A
V
 
V
F
 
-
D
 
D
V
 
L
A
x
T
V
x
L
P
|
P
G
 
V
S
 
E
A
x
L
V
 
N
L
 
L
E
 
P
V
 
F
L
 
I
E
 
E
K
 
K
-
 
A
L
 
L
P
 
R
D
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
H
V
 
V
L
 
I
I
 
C
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
M
 
I
G
 
S
E
 
T
D
 
D
L
 
V
E
 
E
A
 
T
A
 
G
K
 
K
A
 
K
I
 
V
L
 
V
A
 
E
L
 
L
C
 
S
R
 
E
K
 
K
K
 
S
K
 
E
L
 
K
K
 
T
A
 
V
G
 
Y
V
 
I
N
 
A
F
 
E
Q
x
N
M
 
F
R
 
R
Y
 
H
A
 
V
P
 
P
Y
 
A
I
 
F
Q
 
W
K
 
K
A
 
A
R
 
K
E
 
E
I
 
L
I
 
V
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
H
 
A
I
 
I
G
 
G
E
 
D
V
 
-
C
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
V
 
-
K
 
-
I
 
-
N
 
P
V
 
V
Y
 
F
T
 
M
P
 
N
W
 
W
H
 
Q
L
 
I
W
 
W

Sites not aligning to the query:

2glxA Crystal structure analysis of bacterial 1,5-af reductase (see paper)
26% identity, 75% coverage: 6:263/345 of query aligns to 6:262/332 of 2glxA

query
sites
2glxA
I
 
I
G
|
G
A
|
A
G
x
S
G
x
T
I
|
I
V
 
A
K
 
R
D
 
E
A
 
W
H
 
V
L
 
I
P
 
G
A
 
A
Y
 
I
K
 
R
I
 
A
A
 
T
G
 
G
F
 
G
E
 
E
V
 
V
E
 
V
G
 
S
V
 
M
Y
 
M
D
x
S
L
x
T
D
 
S
E
 
A
E
 
E
N
x
R
A
 
G
I
 
A
S
 
A
L
 
Y
A
 
A
T
 
T
A
 
E
F
 
N
G
 
G
I
 
I
P
 
G
R
 
K
V
 
S
F
 
V
G
 
T
S
 
S
L
 
V
D
 
E
E
 
E
L
 
L
T
 
V
A
 
G
H
 
D
A
 
P
T
 
D
E
 
V
D
 
D
T
 
A
V
 
V
F
 
Y
D
 
V
V
x
S
A
x
T
V
 
T
P
x
N
G
 
E
S
 
L
A
x
H
V
 
R
L
 
E
E
 
Q
V
 
T
L
 
L
E
 
A
K
 
A
L
 
I
P
 
R
D
 
A
G
 
G
A
 
K
V
 
H
V
 
V
L
 
L
I
 
C
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
M
 
L
G
 
A
E
 
M
D
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
D
A
 
A
K
 
R
A
 
E
I
 
M
L
 
V
A
 
V
L
 
A
C
 
A
R
 
R
K
 
E
K
 
A
K
 
G
L
 
V
K
 
V
A
 
L
G
 
G
V
 
T
N
 
N
F
 
H
Q
x
H
M
 
L
R
 
R
Y
 
N
A
 
A
P
 
A
Y
 
A
I
 
H
Q
 
R
K
 
A
A
 
M
R
 
R
E
 
D
I
 
A
I
 
I
Q
 
A
A
 
E
G
 
G
H
 
R
I
 
I
G
 
G
E
 
R
V
 
P
C
 
I
D
 
A
I
 
A
E
 
R
V
 
V
K
 
F
I
 
H
N
 
A
V
 
V
Y
 
Y
T
 
L
P
 
P
W
 
P
H
 
H
L
 
L
W
 
Q
D
 
G
F
x
W
L
x
R
F
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
P
T
 
E
A
 
A
S
 
G
R
 
G
V
 
G
E
 
V
I
 
I
L
 
L
Y
 
D
H
 
I
S
 
T
I
 
V
H
|
H
Y
 
D
V
 
A
D
 
D
L
 
T
V
 
L
R
 
R
S
 
-
F
 
F
F
 
V
G
 
L
N
 
N
P
 
D
E
 
D
K
 
P
V
 
A
Y
 
E
A
 
A
K
 
V
T
 
A
I
 
I
K
 
S
H
 
H
P
 
S
K
 
A
M
 
G
T
 
M
Q
 
G
L
 
K
A
 
E
S
 
G
V
 
V
K
 
E
T
 
D
N
 
G
I
 
V
I
 
M
M
 
-
D
 
-
Y
 
-
G
 
G
A
 
V
L
 
L
K
 
R
-
 
F
G
 
Q
A
 
S
N
 
G
I
 
V
L
 
I
T
 
A
N
 
Q
H
 
F
A
 
H
H
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
T
L
 
T
K
 
K
H
 
F
Q
 
A
Q
 
E
S
 
T
Y
 
G
V
 
F
K
 
E
I
 
V
E
 
H
G
 
G
T
 
T
K
 
E
G
 
G
A
 
S
I
 
-
M
 
L
I
 
I
E
 
G
M
 
R
G
 
N
L
 
V
L
 
M
K
 
T
N
 
Q
Y
 
K
P
 
P
Q
 
V
G
 
G
T
 
T

Sites not aligning to the query:

Q2I8V6 1,5-anhydro-D-fructose reductase; Anhydrofructose reductase; 1,5-anhydro-D-fructose reductase (1,5-anhydro-D-mannitol-forming); EC 1.1.1.292 from Ensifer adhaerens (Sinorhizobium morelense) (see paper)
25% identity, 75% coverage: 6:263/345 of query aligns to 7:263/333 of Q2I8V6

query
sites
Q2I8V6
I
 
I
G
 
G
A
|
A
G
x
S
G
x
T
I
|
I
V
x
A
K
 
R
D
 
E
A
 
W
H
 
V
L
 
I
P
 
G
A
 
A
Y
 
I
K
 
R
I
 
A
A
 
T
G
 
G
F
 
G
E
 
E
V
 
V
E
 
V
G
 
S
V
 
M
Y
 
M
D
x
S
L
x
T
D
 
S
E
 
A
E
 
E
N
x
R
A
 
G
I
 
A
S
 
A
L
 
Y
A
 
A
T
 
T
A
 
E
F
 
N
G
 
G
I
 
I
P
 
G
R
 
K
V
 
S
F
 
V
G
 
T
S
 
S
L
 
V
D
 
E
E
 
E
L
 
L
T
 
V
A
 
G
H
 
D
A
 
P
T
 
D
E
 
V
D
 
D
T
 
A
V
 
V
F
 
Y
D
 
V
V
 
S
A
x
T
V
x
T
P
x
N
G
x
E
S
x
L
A
x
H
V
 
R
L
 
E
E
 
Q
V
 
T
L
 
L
E
 
A
K
 
A
L
 
I
P
 
R
D
 
A
G
 
G
A
 
K
V
 
H
V
 
V
L
 
L
I
 
C
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
M
 
L
G
 
A
E
 
M
D
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
D
A
 
A
K
 
R
A
 
E
I
 
M
L
 
V
A
 
V
L
 
A
C
 
A
R
 
R
K
 
E
K
 
A
K
 
G
L
 
V
K
 
V
A
 
L
G
 
G
V
 
T
N
|
N
F
 
H
Q
 
H
M
 
L
R
 
R
Y
 
N
A
 
A
P
 
A
Y
 
A
I
 
H
Q
 
R
K
 
A
A
 
M
R
 
R
E
 
D
I
 
A
I
 
I
Q
 
A
A
 
E
G
 
G
H
 
R
I
 
I
G
 
G
E
 
R
V
 
P
C
 
I
D
 
A
I
 
A
E
 
R
V
 
V
K
 
F
I
 
H
N
 
A
V
 
V
Y
 
Y
T
 
L
P
 
P
W
 
P
H
 
H
L
 
L
W
 
Q
D
 
G
F
x
W
L
x
R
F
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
P
T
 
E
A
 
A
S
 
G
R
 
G
V
 
G
E
 
V
I
 
I
L
 
L
Y
x
D
H
 
I
S
 
T
I
 
V
H
|
H
Y
 
D
V
 
A
D
 
D
L
 
T
V
 
L
R
 
R
S
 
-
F
 
F
F
 
V
G
 
L
N
 
N
P
 
D
E
 
D
K
 
P
V
 
A
Y
 
E
A
 
A
K
 
V
T
 
A
I
 
I
K
 
S
H
 
H
P
 
S
K
 
A
M
 
G
T
 
M
Q
x
G
L
 
K
A
 
E
S
 
G
V
 
V
K
 
E
T
 
D
N
 
G
I
 
V
I
 
M
M
 
-
D
 
-
Y
 
G
G
 
G
A
 
V
L
 
R
K
 
F
G
 
Q
A
 
S
N
 
G
I
 
V
L
 
I
T
 
A
N
 
Q
H
 
F
A
 
H
H
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
T
L
 
T
K
 
K
H
 
F
Q
 
A
Q
 
E
S
 
T
Y
 
G
V
 
F
K
 
E
I
 
V
E
 
H
G
 
G
T
 
T
K
 
E
G
 
G
A
 
S
I
 
-
M
 
L
I
 
I
E
 
G
M
 
R
G
 
N
L
 
V
L
 
M
K
 
T
N
 
Q
Y
 
K
P
 
P
Q
 
V
G
 
G
T
 
T

Sites not aligning to the query:

4koaA Crystal structure analysis of 1,5-anhydro-d-fructose reductase from sinorhizobium meliloti (see paper)
26% identity, 75% coverage: 6:263/345 of query aligns to 7:263/333 of 4koaA

query
sites
4koaA
I
 
I
G
|
G
A
|
A
G
x
S
G
x
T
I
|
I
V
 
A
K
 
R
D
 
E
A
 
W
H
 
V
L
 
I
P
 
G
A
 
A
Y
 
I
K
 
R
I
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
G
E
 
E
V
 
V
E
 
V
G
 
S
V
 
V
Y
 
M
D
x
S
L
x
S
D
 
S
E
 
A
E
 
E
N
x
R
A
 
G
I
 
E
S
 
A
L
 
Y
A
 
A
T
 
A
A
 
E
F
 
N
G
 
G
I
 
I
P
 
A
R
 
K
V
 
A
F
 
V
G
 
T
S
 
S
L
 
V
D
 
D
E
 
D
L
 
L
T
 
V
A
 
G
H
 
D
A
 
P
T
 
D
E
 
V
D
 
D
T
 
A
V
 
V
F
 
Y
D
 
I
V
 
S
A
x
T
V
 
T
P
x
N
G
 
E
S
 
L
A
x
H
V
 
H
L
 
G
E
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
A
K
 
A
L
 
I
P
 
R
D
 
A
G
 
G
A
 
K
V
 
H
V
 
V
L
 
L
I
 
C
Q
 
E
K
|
K
P
 
P
M
 
L
G
 
A
E
 
M
D
 
N
L
 
L
-
 
N
E
 
D
A
 
G
A
 
C
K
 
E
A
 
M
I
 
V
L
 
L
A
 
K
L
 
A
C
 
C
R
 
-
K
 
E
K
 
A
K
 
G
L
 
V
K
 
V
A
 
L
G
 
G
V
 
T
N
 
N
F
 
H
Q
 
H
M
 
L
R
 
R
Y
 
N
A
 
A
P
 
A
Y
 
T
I
 
H
Q
 
R
K
 
A
A
 
M
R
 
R
E
 
E
I
 
A
I
 
I
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
H
 
R
I
 
I
G
 
G
E
 
R
V
 
P
C
 
I
D
 
A
I
 
A
E
 
R
V
 
V
K
 
F
I
 
H
N
 
A
V
 
V
Y
 
Y
T
 
L
P
 
P
W
 
P
H
 
H
L
 
L
W
x
Q
D
 
G
F
 
W
L
 
R
F
 
L
T
 
D
-
 
K
-
 
P
-
 
E
A
 
A
S
 
G
R
 
G
V
 
G
E
 
V
I
 
I
L
 
L
Y
 
D
H
 
I
S
 
T
I
 
V
H
|
H
Y
 
D
V
 
A
D
 
D
L
 
T
V
 
L
R
 
R
S
 
-
F
 
F
F
 
V
G
 
L
N
 
N
P
 
D
E
 
D
K
 
P
V
 
I
Y
 
E
A
 
A
K
 
V
T
 
A
I
 
I
K
 
S
H
 
H
P
 
S
K
 
A
M
 
G
T
 
M
Q
 
G
L
 
K
A
 
E
S
 
G
V
 
L
K
 
E
T
 
D
N
 
G
I
 
V
I
 
M
M
 
-
D
 
-
Y
 
-
G
 
G
A
 
V
L
 
L
K
 
R
-
 
F
G
 
R
A
 
S
N
 
G
I
 
V
L
 
I
T
 
A
N
 
Q
H
 
F
A
 
H
H
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
T
L
 
T
K
 
K
H
 
F
Q
 
A
Q
 
E
S
 
T
Y
 
G
V
 
L
K
 
E
I
 
V
E
 
H
G
 
G
T
 
T
K
 
A
G
 
G
A
 
S
I
 
-
M
 
L
I
 
I
E
 
G
M
 
R
G
 
N
L
 
V
L
 
M
K
 
T
N
 
Q
Y
 
R
P
 
P
Q
 
V
G
 
G
T
 
T

4n54A Crystal structure of scyllo-inositol dehydrogenase from lactobacillus casei with bound cofactor NAD(h) and scyllo-inositol
25% identity, 65% coverage: 45:267/345 of query aligns to 48:292/340 of 4n54A

query
sites
4n54A
F
 
L
G
 
G
I
 
V
P
 
E
R
 
E
V
 
V
F
 
F
G
 
E
S
 
D
L
 
F
D
 
D
E
 
D
L
 
M
T
 
V
A
 
Q
H
 
H
A
 
A
T
 
D
E
 
I
D
 
D
T
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
I
V
 
V
A
x
S
V
x
P
P
 
S
G
 
G
S
x
F
A
x
H
V
 
L
L
 
Q
E
 
Q
V
 
I
L
 
E
E
 
S
K
 
A
L
 
L
P
 
N
D
 
A
G
 
G
A
 
K
V
 
H
V
 
V
L
 
F
I
 
S
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
M
 
I
G
 
G
E
 
L
D
 
D
L
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
I
K
 
E
A
 
H
I
 
T
-
 
Q
L
 
Q
A
 
V
L
 
I
C
 
A
R
 
Q
K
 
H
K
 
A
K
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
F
G
 
Q
V
 
L
N
 
G
F
 
F
Q
x
M
M
 
R
R
 
R
Y
 
F
A
 
D
P
 
D
Y
 
S
I
 
Y
Q
 
R
K
 
Y
A
 
A
R
 
K
E
 
Q
I
 
L
I
 
V
Q
 
D
A
 
Q
G
 
G
H
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
D
V
 
I
C
 
T
D
 
L
I
 
I
E
 
R
V
 
-
K
 
S
I
 
Y
N
 
S
V
 
I
Y
x
D
T
 
P
P
 
A
W
 
A
H
 
G
L
 
M
W
 
A
D
 
S
F
 
F
L
 
V
F
 
K
T
x
F
A
 
A
S
 
T
R
 
S
V
 
A
E
 
N
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
L
I
 
F
L
 
L
Y
x
D
H
x
M
S
 
S
I
 
I
H
|
H
Y
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
V
V
 
I
R
 
R
S
 
W
F
 
F
F
 
T
G
 
G
N
 
K
P
 
E
-
 
I
E
 
D
K
 
K
V
 
V
Y
 
W
A
 
A
K
 
I
T
 
G
I
 
L
K
 
N
-
 
R
-
 
A
H
 
Y
P
 
P
K
 
V
M
 
L
T
 
D
Q
 
K
L
 
A
A
 
G
S
 
E
V
 
L
K
 
E
T
 
T
N
 
G
I
 
A
I
 
A
M
 
L
D
 
M
Y
 
Q
G
 
L
A
 
E
L
 
D
K
 
K
G
 
T
A
 
M
N
 
A
I
 
I
L
 
L
T
 
V
-
 
A
-
 
G
-
x
R
N
 
N
H
 
A
A
 
A
H
 
H
A
 
G
F
x
Y
G
 
H
L
 
V
K
 
E
H
 
-
Q
 
-
Q
 
-
S
 
-
Y
 
-
V
 
T
K
 
E
I
 
I
E
 
I
G
 
G
T
 
T
K
 
K
G
 
G
-
 
M
-
 
L
-
 
R
-
 
I
-
 
A
-
 
Q
-
 
V
-
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
N
-
 
L
-
 
V
A
 
T
I
 
V
M
 
M
I
 
N
E
 
E
M
 
E
G
 
G
L
 
I
L
 
I
K
 
R
-
 
P
-
 
T
-
 
S
-
 
Q
N
 
N
Y
x
F
P
 
P
Q
 
E
G
 
R
T
 
F
A
 
A
D
 
Q
K
 
A
F
 
F

Sites not aligning to the query:

5uiaA Crystal structure of an oxidoreductase from agrobacterium radiobacter in complex with NAD+, r-2,3-dihydroxyisovalerate and magnesium
23% identity, 94% coverage: 16:339/345 of query aligns to 17:336/342 of 5uiaA

query
sites
5uiaA
H
 
Q
L
 
M
P
 
H
A
 
A
Y
x
W
K
|
K
-
 
D
I
x
V
A
 
K
G
 
G
F
x
A
E
 
G
V
 
I
E
 
A
G
 
A
V
 
I
Y
 
C
D
|
D
L
x
R
D
 
D
E
 
P
E
 
K
N
 
R
A
 
L
I
 
K
S
 
L
L
 
V
A
 
G
T
 
D
A
 
Q
F
 
F
G
 
G
I
 
I
P
 
E
R
 
R
V
 
R
F
 
Y
G
 
G
S
 
D
L
 
A
D
 
A
E
 
A
L
 
L
T
 
F
A
 
A
H
 
D
A
 
G
T
 
G
E
 
F
D
 
D
T
 
F
V
 
V
F
 
-
D
 
D
V
 
I
A
 
A
V
x
T
P
 
T
G
 
V
S
 
Q
A
 
S
V
 
H
L
 
R
E
 
A
V
 
L
L
 
V
E
 
E
-
 
M
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
H
K
 
K
L
 
V
P
 
P
D
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
A
L
 
I
I
 
C
Q
|
Q
K
|
K
P
 
P
M
 
F
G
 
A
E
 
K
D
 
S
L
 
L
E
 
S
A
 
D
A
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
M
L
 
V
A
 
R
L
 
T
C
 
C
R
 
E
K
 
N
K
 
A
K
 
D
L
 
I
K
 
P
A
 
L
G
 
M
V
 
V
N
 
H
F
 
E
Q
x
N
M
 
F
R
 
R
Y
 
W
A
 
Q
P
 
T
Y
 
P
I
 
I
Q
 
Q
K
 
A
A
 
V
R
 
K
E
 
A
I
 
V
I
 
L
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
H
 
A
I
 
I
G
 
G
E
 
E
-
 
P
-
 
F
-
 
W
-
 
G
V
 
R
C
 
F
D
 
S
I
 
F
E
 
R
V
 
S
K
 
G
I
 
F
N
 
D
V
 
V
Y
 
F
T
 
S
P
 
G
W
 
-
H
 
-
L
 
-
W
x
Q
D
 
P
F
x
Y
L
 
L
F
 
A
T
 
E
A
 
G
S
 
E
R
 
R
V
 
F
E
 
I
I
 
I
L
 
E
Y
x
D
H
 
L
S
 
G
I
 
I
H
|
H
Y
 
T
V
 
L
D
 
D
L
 
I
V
 
A
R
 
R
S
 
F
F
 
I
F
 
L
G
 
G
N
 
D
P
 
V
E
 
A
K
 
T
V
 
L
Y
 
T
A
 
A
K
 
R
T
 
T
I
 
K
K
 
R
H
 
V
P
 
N
K
 
P
M
 
K
T
 
I
Q
 
K
L
 
G
A
 
E
S
 
D
V
 
V
K
 
A
T
 
T
N
 
-
I
 
I
I
 
L
M
 
L
D
 
D
Y
 
H
G
 
-
A
 
-
L
 
Q
K
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
T
I
 
S
L
 
I
T
 
V
N
 
D
H
 
V
A
 
S
H
x
Y
A
 
A
F
 
T
G
 
K
L
 
L
K
 
G
H
 
T
Q
 
E
-
 
P
-
 
F
-
 
P
Q
 
E
S
 
T
Y
 
L
V
 
I
K
 
D
I
 
I
E
 
D
G
 
G
T
 
T
K
 
Q
G
 
G
A
 
T
I
 
I
M
 
R
I
 
L
E
 
S
M
 
Q
G
 
G
-
 
Y
-
 
R
L
 
L
L
 
E
K
 
V
N
 
T
Y
 
G
P
 
P
Q
 
N
G
 
G
T
 
M
-
 
T
-
 
I
A
 
S
D
 
D
K
 
A
F
 
S
E
 
P
Y
 
Q
I
 
L
I
 
L
A
 
S
A
 
W
E
 
A
G
 
S
K
 
R
E
 
-
A
 
-
E
 
P
W
 
W
K
 
H
E
 
N
V
 
I
E
 
Q
-
 
E
-
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
A
I
 
I
A
 
Q
G
 
Q
T
 
H
W
 
W
F
 
T
P
 
D
H
 
R
A
 
L
F
 
S
I
 
S
G
 
G
S
 
G
M
 
E
T
 
T
E
 
S
M
 
T
K
 
S
K
 
G
A
 
A
L
 
-
E
 
-
N
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
N
 
-
S
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
D
C
 
N
I
 
L
Y
 
K
T
 
T
M
 
F
A
 
A
C
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
H
 
Y
Q
 
E
S
 
S
S
 
A
E
 
A
Q
 
N
G
 
G
G
 
R
V
 
T
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5ui9A Crystal structure of an oxidoreductase from agrobacterium radiobacter in complex with NAD+, 2 -hydroxy-2-hydroxymethyl propanoic acid and magnesium
23% identity, 94% coverage: 16:339/345 of query aligns to 17:336/342 of 5ui9A

query
sites
5ui9A
H
 
Q
L
 
M
P
 
H
A
 
A
Y
x
W
K
|
K
-
 
D
I
x
V
A
 
K
G
 
G
F
x
A
E
 
G
V
 
I
E
 
A
G
 
A
V
 
I
Y
 
C
D
|
D
L
x
R
D
 
D
E
 
P
E
 
K
N
 
R
A
 
L
I
 
K
S
 
L
L
 
V
A
 
G
T
 
D
A
 
Q
F
 
F
G
 
G
I
 
I
P
 
E
R
 
R
V
 
R
F
 
Y
G
 
G
S
 
D
L
 
A
D
 
A
E
 
A
L
 
L
T
 
F
A
 
A
H
 
D
A
 
G
T
 
G
E
 
F
D
 
D
T
 
F
V
 
V
F
 
-
D
 
D
V
 
I
A
 
A
V
x
T
P
 
T
G
 
V
S
 
Q
A
x
S
V
 
H
L
 
R
E
 
A
V
 
L
L
 
V
E
 
E
-
 
M
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
H
K
 
K
L
 
V
P
 
P
D
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
A
L
 
I
I
 
C
Q
|
Q
K
|
K
P
|
P
M
 
F
G
 
A
E
 
K
D
 
S
L
 
L
E
 
S
A
 
D
A
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
M
L
 
V
A
 
R
L
 
T
C
 
C
R
 
E
K
 
N
K
 
A
K
 
D
L
 
I
K
 
P
A
 
L
G
 
M
V
 
V
N
 
H
F
 
E
Q
x
N
M
 
F
R
 
R
Y
 
W
A
 
Q
P
 
T
Y
 
P
I
 
I
Q
 
Q
K
 
A
A
 
V
R
 
K
E
 
A
I
 
V
I
 
L
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
H
 
A
I
 
I
G
 
G
E
 
E
-
 
P
-
 
F
-
 
W
-
 
G
V
 
R
C
 
F
D
 
S
I
 
F
E
 
R
V
 
S
K
 
G
I
 
F
N
 
D
V
 
V
Y
 
F
T
 
S
P
 
G
W
 
-
H
 
-
L
 
-
W
x
Q
D
 
P
F
x
Y
L
 
L
F
 
A
T
 
E
A
 
G
S
 
E
R
 
R
V
 
F
E
 
I
I
 
I
L
 
E
Y
x
D
H
 
L
S
 
G
I
 
I
H
|
H
Y
 
T
V
 
L
D
 
D
L
 
I
V
 
A
R
 
R
S
 
F
F
 
I
F
 
L
G
 
G
N
 
D
P
 
V
E
 
A
K
 
T
V
 
L
Y
 
T
A
 
A
K
 
R
T
 
T
I
 
K
K
 
R
H
 
V
P
 
N
K
 
P
M
 
K
T
 
I
Q
 
K
L
 
G
A
 
E
S
 
D
V
 
V
K
 
A
T
 
T
N
 
-
I
 
I
I
 
L
M
 
L
D
 
D
Y
 
H
G
 
-
A
 
-
L
 
Q
K
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
T
I
 
S
L
 
I
T
 
V
N
 
D
H
 
V
A
 
S
H
x
Y
A
 
A
F
 
T
G
 
K
L
 
L
K
 
G
H
 
T
Q
 
E
-
 
P
-
 
F
-
 
P
Q
 
E
S
 
T
Y
 
L
V
 
I
K
 
D
I
 
I
E
 
D
G
 
G
T
 
T
K
 
Q
G
 
G
A
 
T
I
 
I
M
 
R
I
 
L
E
 
S
M
 
Q
G
 
G
-
 
Y
-
 
R
L
 
L
L
 
E
K
 
V
N
 
T
Y
 
G
P
 
P
Q
 
N
G
 
G
T
 
M
-
 
T
-
 
I
A
 
S
D
 
D
K
 
A
F
 
S
E
 
P
Y
 
Q
I
 
L
I
 
L
A
 
S
A
 
W
E
 
A
G
 
S
K
 
R
E
 
-
A
 
-
E
 
P
W
|
W
K
 
H
E
 
N
V
 
I
E
 
Q
-
 
E
-
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
A
I
 
I
A
 
Q
G
 
Q
T
 
H
W
 
W
F
 
T
P
 
D
H
 
R
A
 
L
F
 
S
I
 
S
G
 
G
S
 
G
M
 
E
T
 
T
E
 
S
M
 
T
K
 
S
K
 
G
A
 
A
L
 
-
E
 
-
N
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
N
 
-
S
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
D
C
 
N
I
 
L
Y
 
K
T
 
T
M
 
F
A
 
A
C
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
H
 
Y
Q
 
E
S
 
S
S
 
A
E
 
A
Q
 
N
G
 
G
G
 
R
V
 
T
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5uhzA Crystal structure of an oxidoreductase from agrobacterium radiobacter in complex with NAD+, d-apionate and magnesium
23% identity, 94% coverage: 16:339/345 of query aligns to 17:336/342 of 5uhzA

query
sites
5uhzA
H
 
Q
L
 
M
P
 
H
A
 
A
Y
x
W
K
|
K
-
 
D
I
x
V
A
 
K
G
 
G
F
x
A
E
 
G
V
 
I
E
 
A
G
 
A
V
 
I
Y
 
C
D
|
D
L
x
R
D
 
D
E
 
P
E
 
K
N
 
R
A
 
L
I
 
K
S
 
L
L
 
V
A
 
G
T
 
D
A
 
Q
F
 
F
G
 
G
I
 
I
P
 
E
R
 
R
V
 
R
F
 
Y
G
 
G
S
 
D
L
 
A
D
 
A
E
 
A
L
 
L
T
 
F
A
 
A
H
 
D
A
 
G
T
 
G
E
 
F
D
 
D
T
 
F
V
 
V
F
 
-
D
 
D
V
 
I
A
 
A
V
x
T
P
 
T
G
 
V
S
 
Q
A
x
S
V
 
H
L
 
R
E
 
A
V
 
L
L
 
V
E
 
E
-
 
M
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
H
K
 
K
L
 
V
P
 
P
D
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
A
L
 
I
I
 
C
Q
|
Q
K
|
K
P
|
P
M
 
F
G
 
A
E
 
K
D
 
S
L
 
L
E
 
S
A
 
D
A
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
M
L
 
V
A
 
R
L
 
T
C
 
C
R
 
E
K
 
N
K
 
A
K
 
D
L
 
I
K
 
P
A
 
L
G
 
M
V
 
V
N
 
H
F
 
E
Q
x
N
M
 
F
R
 
R
Y
 
W
A
 
Q
P
 
T
Y
 
P
I
 
I
Q
 
Q
K
 
A
A
 
V
R
 
K
E
 
A
I
 
V
I
 
L
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
H
 
A
I
 
I
G
 
G
E
 
E
-
 
P
-
 
F
-
 
W
-
 
G
V
 
R
C
 
F
D
 
S
I
 
F
E
 
R
V
 
S
K
 
G
I
 
F
N
 
D
V
 
V
Y
 
F
T
 
S
P
 
G
W
 
-
H
 
-
L
 
-
W
x
Q
D
 
P
F
x
Y
L
 
L
F
 
A
T
 
E
A
 
G
S
 
E
R
 
R
V
 
F
E
 
I
I
 
I
L
 
E
Y
x
D
H
 
L
S
 
G
I
 
I
H
|
H
Y
 
T
V
 
L
D
 
D
L
 
I
V
 
A
R
 
R
S
 
F
F
 
I
F
 
L
G
 
G
N
 
D
P
 
V
E
 
A
K
 
T
V
 
L
Y
 
T
A
 
A
K
 
R
T
 
T
I
 
K
K
 
R
H
 
V
P
 
N
K
 
P
M
 
K
T
 
I
Q
 
K
L
 
G
A
 
E
S
 
D
V
 
V
K
 
A
T
 
T
N
 
-
I
 
I
I
 
L
M
 
L
D
 
D
Y
 
H
G
 
-
A
 
-
L
 
Q
K
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
T
I
 
S
L
 
I
T
 
V
N
 
D
H
 
V
A
 
S
H
x
Y
A
 
A
F
 
T
G
 
K
L
 
L
K
 
G
H
 
T
Q
 
E
-
 
P
-
 
F
-
 
P
Q
 
E
S
 
T
Y
 
L
V
 
I
K
 
D
I
 
I
E
 
D
G
 
G
T
 
T
K
 
Q
G
 
G
A
 
T
I
 
I
M
 
R
I
 
L
E
 
S
M
 
Q
G
 
G
-
 
Y
-
 
R
L
 
L
L
 
E
K
 
V
N
 
T
Y
 
G
P
 
P
Q
 
N
G
 
G
T
 
M
-
 
T
-
 
I
A
 
S
D
 
D
K
 
A
F
 
S
E
 
P
Y
 
Q
I
 
L
I
 
L
A
 
S
A
 
W
E
 
A
G
 
S
K
 
R
E
 
-
A
 
-
E
 
P
W
 
W
K
 
H
E
 
N
V
 
I
E
 
Q
-
 
E
-
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
A
I
 
I
A
 
Q
G
 
Q
T
 
H
W
 
W
F
 
T
P
 
D
H
 
R
A
 
L
F
 
S
I
 
S
G
 
G
S
 
G
M
 
E
T
 
T
E
 
S
M
 
T
K
 
S
K
 
G
A
 
A
L
 
-
E
 
-
N
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
N
 
-
S
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
D
C
 
N
I
 
L
Y
 
K
T
 
T
M
 
F
A
 
A
C
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
H
 
Y
Q
 
E
S
 
S
S
 
A
E
 
A
Q
 
N
G
 
G
G
 
R
V
 
T
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5uhwA Crystal structure of an oxidoreductase from agrobacterium radiobacter in complex with NAD+ and magnesium
23% identity, 94% coverage: 16:339/345 of query aligns to 17:336/342 of 5uhwA

query
sites
5uhwA
H
 
Q
L
 
M
P
 
H
A
 
A
Y
x
W
K
|
K
-
 
D
I
x
V
A
 
K
G
 
G
F
x
A
E
 
G
V
 
I
E
 
A
G
 
A
V
 
I
Y
 
C
D
|
D
L
x
R
D
 
D
E
 
P
E
 
K
N
 
R
A
 
L
I
 
K
S
 
L
L
 
V
A
 
G
T
 
D
A
 
Q
F
 
F
G
 
G
I
 
I
P
 
E
R
 
R
V
 
R
F
 
Y
G
 
G
S
 
D
L
 
A
D
 
A
E
 
A
L
 
L
T
 
F
A
 
A
H
 
D
A
 
G
T
 
G
E
 
F
D
 
D
T
 
F
V
 
V
F
 
-
D
 
D
V
 
I
A
 
A
V
x
T
P
 
T
G
 
V
S
 
Q
A
 
S
V
 
H
L
 
R
E
 
A
V
 
L
L
 
V
E
 
E
-
 
M
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
H
K
 
K
L
 
V
P
 
P
D
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
A
L
 
I
I
 
C
Q
|
Q
K
|
K
P
 
P
M
 
F
G
 
A
E
 
K
D
 
S
L
 
L
E
 
S
A
 
D
A
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
M
L
 
V
A
 
R
L
 
T
C
 
C
R
 
E
K
 
N
K
 
A
K
 
D
L
 
I
K
 
P
A
 
L
G
 
M
V
 
V
N
 
H
F
 
E
Q
x
N
M
 
F
R
 
R
Y
 
W
A
 
Q
P
 
T
Y
 
P
I
 
I
Q
 
Q
K
 
A
A
 
V
R
 
K
E
 
A
I
 
V
I
 
L
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
H
 
A
I
 
I
G
 
G
E
 
E
-
 
P
-
 
F
-
 
W
-
 
G
V
 
R
C
 
F
D
 
S
I
 
F
E
 
R
V
 
S
K
 
G
I
 
F
N
 
D
V
 
V
Y
 
F
T
 
S
P
 
G
W
 
-
H
 
-
L
 
-
W
x
Q
D
 
P
F
 
Y
L
 
L
F
 
A
T
 
E
A
 
G
S
 
E
R
 
R
V
 
F
E
 
I
I
 
I
L
 
E
Y
 
D
H
 
L
S
 
G
I
 
I
H
 
H
Y
 
T
V
 
L
D
 
D
L
 
I
V
 
A
R
 
R
S
 
F
F
 
I
F
 
L
G
 
G
N
 
D
P
 
V
E
 
A
K
 
T
V
 
L
Y
 
T
A
 
A
K
 
R
T
 
T
I
 
K
K
 
R
H
 
V
P
 
N
K
 
P
M
 
K
T
 
I
Q
 
K
L
 
G
A
 
E
S
 
D
V
 
V
K
 
A
T
 
T
N
 
-
I
 
I
I
 
L
M
 
L
D
 
D
Y
 
H
G
 
-
A
 
-
L
 
Q
K
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
T
I
 
S
L
 
I
T
 
V
N
 
D
H
 
V
A
 
S
H
 
Y
A
 
A
F
 
T
G
 
K
L
 
L
K
 
G
H
 
T
Q
 
E
-
 
P
-
 
F
-
 
P
Q
 
E
S
 
T
Y
 
L
V
 
I
K
 
D
I
 
I
E
 
D
G
 
G
T
 
T
K
 
Q
G
 
G
A
 
T
I
 
I
M
 
R
I
 
L
E
 
S
M
 
Q
G
 
G
-
 
Y
-
 
R
L
 
L
L
 
E
K
 
V
N
 
T
Y
 
G
P
 
P
Q
 
N
G
 
G
T
 
M
-
 
T
-
 
I
A
 
S
D
 
D
K
 
A
F
 
S
E
 
P
Y
 
Q
I
 
L
I
 
L
A
 
S
A
 
W
E
 
A
G
 
S
K
 
R
E
 
-
A
 
-
E
 
P
W
 
W
K
 
H
E
 
N
V
 
I
E
 
Q
-
 
E
-
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
A
I
 
I
A
 
Q
G
 
Q
T
 
H
W
 
W
F
 
T
P
 
D
H
 
R
A
 
L
F
 
S
I
 
S
G
 
G
S
 
G
M
 
E
T
 
T
E
 
S
M
 
T
K
 
S
K
 
G
A
 
A
L
 
-
E
 
-
N
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
N
 
-
S
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
D
C
 
N
I
 
L
Y
 
K
T
 
T
M
 
F
A
 
A
C
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
H
 
Y
Q
 
E
S
 
S
S
 
A
E
 
A
Q
 
N
G
 
G
G
 
R
V
 
T
V
 
V

Sites not aligning to the query:

B9JK80 D-apiose dehydrogenase; EC 1.1.1.420 from Rhizobium rhizogenes (strain K84 / ATCC BAA-868) (Agrobacterium radiobacter)
23% identity, 94% coverage: 16:339/345 of query aligns to 20:339/345 of B9JK80

query
sites
B9JK80
H
 
Q
L
 
M
P
 
H
A
 
A
Y
x
W
K
|
K
-
 
D
I
x
V
A
 
K
G
 
G
F
x
A
E
 
G
V
 
I
E
 
A
G
 
A
V
 
I
Y
 
C
D
|
D
L
 
R
D
 
D
E
 
P
E
 
K
N
 
R
A
 
L
I
 
K
S
 
L
L
 
V
A
 
G
T
 
D
A
 
Q
F
 
F
G
 
G
I
 
I
P
 
E
R
 
R
V
 
R
F
 
Y
G
 
G
S
 
D
L
 
A
D
 
A
E
 
A
L
 
L
T
 
F
A
 
A
H
 
D
A
 
G
T
 
G
E
 
F
D
 
D
T
 
F
V
 
V
F
 
-
D
 
D
V
 
I
A
 
A
V
 
T
P
 
T
G
 
V
S
 
Q
A
x
S
V
 
H
L
 
R
E
 
A
V
 
L
L
 
V
E
 
E
-
 
M
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
H
K
 
K
L
 
V
P
 
P
D
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
A
L
 
I
I
 
C
Q
|
Q
K
|
K
P
 
P
M
 
F
G
 
A
E
 
K
D
 
S
L
 
L
E
 
S
A
 
D
A
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
M
L
 
V
A
 
R
L
 
T
C
 
C
R
 
E
K
 
N
K
 
A
K
 
D
L
 
I
K
 
P
A
 
L
G
 
M
V
 
V
N
 
H
F
 
E
Q
x
N
M
 
F
R
 
R
Y
 
W
A
 
Q
P
 
T
Y
 
P
I
 
I
Q
 
Q
K
 
A
A
 
V
R
 
K
E
 
A
I
 
V
I
 
L
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
H
 
A
I
 
I
G
 
G
E
 
E
-
 
P
-
 
F
-
 
W
-
 
G
V
 
R
C
 
F
D
 
S
I
 
F
E
 
R
V
 
S
K
 
G
I
 
F
N
 
D
V
 
V
Y
 
F
T
 
S
P
 
G
W
 
-
H
 
-
L
 
-
W
x
Q
D
x
P
F
x
Y
L
 
L
F
 
A
T
 
E
A
 
G
S
 
E
R
 
R
V
 
F
E
 
I
I
 
I
L
 
E
Y
 
D
H
 
L
S
 
G
I
 
I
H
 
H
Y
 
T
V
 
L
D
 
D
L
 
I
V
 
A
R
 
R
S
 
F
F
 
I
F
 
L
G
 
G
N
 
D
P
 
V
E
 
A
K
 
T
V
 
L
Y
 
T
A
 
A
K
 
R
T
 
T
I
 
K
K
 
R
H
 
V
P
 
N
K
 
P
M
 
K
T
 
I
Q
 
K
L
 
G
A
 
E
S
 
D
V
 
V
K
 
A
T
 
T
N
 
-
I
 
I
I
 
L
M
 
L
D
 
D
Y
 
H
G
 
-
A
 
-
L
 
Q
K
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
T
I
 
S
L
 
I
T
 
V
N
 
D
H
 
V
A
 
S
H
 
Y
A
 
A
F
 
T
G
 
K
L
 
L
K
 
G
H
 
T
Q
 
E
-
 
P
-
 
F
-
 
P
Q
 
E
S
 
T
Y
 
L
V
 
I
K
 
D
I
 
I
E
 
D
G
 
G
T
 
T
K
 
Q
G
 
G
A
 
T
I
 
I
M
 
R
I
 
L
E
 
S
M
 
Q
G
 
G
-
 
Y
-
 
R
L
 
L
L
 
E
K
 
V
N
 
T
Y
 
G
P
 
P
Q
 
N
G
 
G
T
 
M
-
 
T
-
 
I
A
 
S
D
 
D
K
 
A
F
 
S
E
 
P
Y
 
Q
I
 
L
I
 
L
A
 
S
A
 
W
E
 
A
G
 
S
K
 
R
E
 
-
A
 
-
E
 
P
W
 
W
K
 
H
E
 
N
V
 
I
E
 
Q
-
 
E
-
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
A
I
 
I
A
 
Q
G
 
Q
T
 
H
W
 
W
F
 
T
P
 
D
H
 
R
A
 
L
F
 
S
I
 
S
G
 
G
S
 
G
M
 
E
T
 
T
E
 
S
M
 
T
K
 
S
K
 
G
A
 
A
L
 
-
E
 
-
N
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
N
 
-
S
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
D
C
 
N
I
 
L
Y
 
K
T
 
T
M
 
F
A
 
A
C
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
H
 
Y
Q
 
E
S
 
S
S
 
A
E
 
A
Q
 
N
G
 
G
G
 
R
V
 
T
V
 
V

Sites not aligning to the query:

3q2kK Crystal structure of the wlba dehydrogenase from bordetella pertussis in complex with nadh and udp-glcnaca (see paper)
26% identity, 55% coverage: 6:195/345 of query aligns to 8:202/322 of 3q2kK

query
sites
3q2kK
I
 
V
G
|
G
A
 
C
G
|
G
G
x
R
I
|
I
V
 
S
K
 
K
D
 
N
A
 
-
H
 
H
L
 
I
P
 
G
A
 
A
Y
 
I
K
 
A
I
 
Q
A
 
H
G
 
G
F
 
D
E
 
R
V
 
A
E
 
E
G
 
L
V
 
V
Y
 
E
D
 
I
L
 
C
D
|
D
E
x
T
E
 
N
-
 
P
N
 
E
A
 
A
I
 
L
S
 
Q
L
 
A
A
 
A
T
 
E
A
 
A
F
 
A
G
 
T
I
 
G
P
 
A
R
 
R
V
 
P
F
 
F
G
 
S
S
 
S
L
 
L
D
 
S
E
 
D
L
 
M
T
 
L
A
 
A
H
 
Q
A
 
G
T
 
N
E
 
A
D
 
D
T
 
A
V
 
L
F
 
V
D
 
L
V
 
A
A
x
T
V
x
P
P
x
S
G
 
G
S
x
L
A
x
H
V
 
P
L
 
W
E
 
Q
V
 
A
L
 
I
E
 
E
K
 
V
L
 
A
P
 
Q
D
 
A
G
 
G
A
 
R
V
 
H
V
 
V
L
 
V
I
 
S
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
M
 
M
G
 
A
E
 
T
D
 
R
L
 
W
E
 
E
A
 
D
A
 
G
K
 
K
A
 
R
I
 
M
L
 
V
A
 
K
L
 
A
C
 
C
R
 
D
K
 
E
K
 
A
K
 
G
L
 
V
K
 
R
A
 
L
G
 
F
V
 
V
N
 
V
F
 
K
Q
|
Q
M
 
N
R
 
R
Y
 
R
A
 
N
P
 
A
Y
 
T
I
 
L
Q
 
Q
K
 
L
A
 
V
R
 
K
E
 
K
I
 
A
I
 
I
Q
 
E
A
 
Q
G
 
G
H
 
R
I
 
F
G
 
G
E
 
R
V
 
I
C
 
Y
D
 
M
I
 
V
E
 
T
V
 
V
K
 
N
I
 
V
N
 
F
V
 
W
Y
x
T
T
x
R
P
 
P
W
 
Q
H
 
E
L
x
Y
W
 
Y
D
 
D
F
 
A
L
 
A
F
 
R
T
x
W
A
x
R
S
 
G
R
 
K
V
 
W
E
 
E
-
 
W
-
 
D
-
 
G
-
 
G
-
 
A
I
 
F
L
 
M
Y
x
N
H
x
Q
S
 
A
I
 
S
H
|
H
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
L
R
 
D
S
 
W
F
 
L
F
 
V
G
 
G
N
 
P
P
 
V
E
 
E
K
 
S
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
K
 
Y
T
 
T

Sites not aligning to the query:

3q2kC Crystal structure of the wlba dehydrogenase from bordetella pertussis in complex with nadh and udp-glcnaca (see paper)
26% identity, 55% coverage: 6:195/345 of query aligns to 13:207/347 of 3q2kC

query
sites
3q2kC
I
 
V
G
 
G
A
 
C
G
|
G
G
x
R
I
|
I
V
 
S
K
 
K
D
 
N
A
 
-
H
 
H
L
 
I
P
 
G
A
 
A
Y
 
I
K
 
A
I
 
Q
A
 
H
G
 
G
F
 
D
E
 
R
V
 
A
E
 
E
G
 
L
V
 
V
Y
 
E
D
 
I
L
 
C
D
|
D
E
x
T
E
 
N
-
 
P
N
 
E
A
 
A
I
 
L
S
 
Q
L
 
A
A
 
A
T
 
E
A
 
A
F
 
A
G
 
T
I
 
G
P
 
A
R
 
R
V
 
P
F
 
F
G
 
S
S
 
S
L
 
L
D
 
S
E
 
D
L
 
M
T
 
L
A
 
A
H
 
Q
A
 
G
T
 
N
E
 
A
D
 
D
T
 
A
V
 
L
F
 
V
D
 
L
V
x
A
A
x
T
V
 
P
P
x
S
G
 
G
S
 
L
A
x
H
V
 
P
L
 
W
E
x
Q
V
 
A
L
 
I
E
 
E
K
 
V
L
 
A
P
 
Q
D
 
A
G
 
G
A
 
R
V
 
H
V
 
V
L
 
V
I
 
S
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
M
 
M
G
 
A
E
 
T
D
 
R
L
 
W
E
 
E
A
 
D
A
 
G
K
 
K
A
 
R
I
 
M
L
 
V
A
 
K
L
 
A
C
 
C
R
 
D
K
 
E
K
 
A
K
 
G
L
 
V
K
 
R
A
 
L
G
 
F
V
 
V
N
 
V
F
 
K
Q
|
Q
M
 
N
R
 
R
Y
 
R
A
 
N
P
 
A
Y
 
T
I
 
L
Q
 
Q
K
 
L
A
 
V
R
 
K
E
 
K
I
 
A
I
 
I
Q
 
E
A
 
Q
G
 
G
H
 
R
I
 
F
G
 
G
E
 
R
V
 
I
C
 
Y
D
 
M
I
 
V
E
 
T
V
 
V
K
 
N
I
 
V
N
 
F
V
x
W
Y
x
T
T
x
R
P
 
P
W
 
Q
H
 
E
L
x
Y
W
 
Y
D
 
D
F
 
A
L
 
A
F
 
R
T
x
W
A
x
R
S
 
G
R
 
K
V
 
W
E
 
E
-
 
W
-
 
D
-
 
G
-
 
G
-
 
A
I
 
F
L
 
M
Y
x
N
H
x
Q
S
 
A
I
 
S
H
|
H
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
L
R
 
D
S
 
W
F
 
L
F
 
V
G
 
G
N
 
P
P
 
V
E
 
E
K
 
S
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
K
 
Y
T
 
T

Sites not aligning to the query:

P04387 Galactose/lactose metabolism regulatory protein GAL80 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
22% identity, 47% coverage: 25:186/345 of query aligns to 47:212/435 of P04387

query
sites
P04387
F
 
F
E
 
Q
V
 
I
E
 
T
G
 
A
V
 
L
Y
 
Y
D
 
S
L
 
P
D
 
K
E
 
I
E
 
E
N
 
T
A
 
S
I
 
I
S
 
A
L
 
T
A
 
I
T
 
Q
A
 
R
F
 
L
G
 
K
I
 
L
P
 
S
R
 
N
V
 
A
-
 
T
-
 
A
F
 
F
G
 
P
S
 
T
L
 
L
D
 
E
E
 
S
L
 
F
T
 
A
A
 
S
H
 
S
A
 
S
T
 
T
E
 
I
D
 
D
T
 
M
V
 
I
-
 
V
-
 
I
-
 
A
-
 
I
-
 
Q
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
H
F
 
Y
D
 
E
V
 
V
A
 
V
V
 
M
P
 
P
G
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
F
L
 
S
E
 
K
K
 
N
L
 
N
P
 
P
D
 
N
G
 
L
A
 
K
V
 
Y
V
 
L
L
 
F
I
 
V
Q
 
E
K
 
W
P
 
A
M
 
L
G
 
A
E
 
C
D
 
S
L
 
L
E
 
D
A
 
Q
A
 
A
K
 
E
A
 
S
I
 
I
L
 
Y
A
 
K
L
 
A
C
 
A
R
 
A
K
 
E
K
 
R
K
 
G
L
 
V
K
 
Q
A
 
T
G
 
I
V
 
I
N
 
S
F
 
L
Q
 
Q
M
 
G
R
 
R
Y
 
K
A
 
S
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
Q
 
L
K
 
R
A
 
A
R
 
K
E
 
E
I
 
L
I
 
I
Q
 
S
A
 
Q
G
 
G
H
 
Y
I
 
I
G
 
G
E
 
D
V
 
I
C
 
N
D
 
S
I
 
I
E
 
E
V
 
I
K
 
A
I
 
G
N
 
N
V
 
-
Y
 
-
T
 
G
P
 
G
W
 
W
H
 
Y
L
 
G
W
 
Y
D
 
E
F
 
R
L
 
P
F
 
V
T
 
K
A
 
S
S
 
P
R
 
K
V
 
Y
E
 
-
I
 
-
L
 
I
Y
 
Y
H
 
E
S
 
I
I
 
G
H
 
N
Y
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
V
R
 
T
S
 
T
F
 
T
F
 
F
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3btsB Crystal structure of a ternary complex of the transcriptional repressor gal80p (gal80s0 [g301r]) and the acidic activation domain of gal4p (aa 854-874) from saccharomyces cerevisiae with NAD (see paper)
22% identity, 47% coverage: 25:186/345 of query aligns to 33:198/390 of 3btsB

query
sites
3btsB
F
 
F
E
 
Q
V
 
I
E
 
T
G
 
A
V
 
L
Y
 
Y
D
 
S
L
x
P
D
 
K
E
 
I
E
 
E
N
 
T
A
 
S
I
 
I
S
 
A
L
 
T
A
 
I
T
 
Q
A
 
R
F
 
L
G
 
K
I
 
L
P
 
S
R
 
N
V
 
A
-
 
T
-
 
A
F
 
F
G
 
P
S
 
T
L
 
L
D
 
E
E
 
S
L
 
F
T
 
A
A
 
S
H
 
S
A
 
S
T
 
T
E
 
I
D
 
D
T
 
M
V
 
I
-
 
V
-
 
I
-
x
A
-
x
I
-
x
Q
-
x
V
-
 
A
-
 
S
-
x
H
F
 
Y
D
 
E
V
 
V
A
 
V
V
 
M
P
 
P
G
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
F
L
 
S
E
 
K
K
 
N
L
 
N
P
 
P
D
 
N
G
 
L
A
 
K
V
 
Y
V
 
L
L
 
F
I
 
V
Q
x
E
K
x
W
P
 
A
M
 
L
G
 
A
E
 
C
D
 
S
L
 
L
E
 
D
A
 
Q
A
 
A
K
 
E
A
 
S
I
 
I
L
 
Y
A
 
K
L
 
A
C
 
A
R
 
A
K
 
E
K
 
R
K
 
G
L
 
V
K
 
Q
A
 
T
G
 
I
V
 
I
N
 
S
F
 
L
Q
|
Q
M
 
G
R
 
R
Y
 
K
A
 
S
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
Q
 
L
K
 
R
A
 
A
R
 
K
E
 
E
I
 
L
I
 
I
Q
 
S
A
 
Q
G
 
G
H
 
Y
I
 
I
G
 
G
E
 
D
V
 
I
C
 
N
D
 
S
I
 
I
E
 
E
V
 
I
K
 
A
I
 
G
N
 
N
V
 
-
Y
 
-
T
 
G
P
 
G
W
 
W
H
 
Y
L
 
G
W
 
Y
D
 
E
F
 
R
L
 
P
F
 
V
T
 
K
A
 
S
S
 
P
R
 
K
V
 
Y
E
 
-
I
 
-
L
 
I
Y
 
Y
H
 
E
S
 
I
I
 
G
H
 
N
Y
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
V
R
 
T
S
 
T
F
 
T
F
 
F
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3m2tA The crystal structure of dehydrogenase from chromobacterium violaceum
22% identity, 57% coverage: 1:198/345 of query aligns to 4:203/342 of 3m2tA

query
sites
3m2tA
M
 
I
K
 
K
I
 
V
L
 
G
Q
 
L
I
 
V
G
|
G
A
 
I
G
|
G
G
x
A
I
x
Q
V
 
M
K
 
Q
D
 
E
A
 
N
H
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
S
Y
 
L
-
 
L
K
 
Q
I
 
M
A
 
Q
G
 
D
F
 
I
E
 
R
V
 
I
E
 
V
G
 
A
V
 
A
Y
 
C
D
|
D
L
x
S
D
 
D
E
 
L
E
 
E
N
x
R
A
 
A
I
 
R
S
 
R
L
 
V
A
 
H
T
 
R
A
 
F
F
 
I
G
 
S
I
 
D
P
 
I
R
 
P
V
 
V
F
 
L
G
 
D
S
 
N
L
 
V
D
 
P
E
 
A
L
 
M
T
 
L
A
 
N
H
 
Q
A
 
V
T
 
P
E
 
L
D
 
D
T
 
A
V
 
V
F
 
V
D
 
M
V
x
A
A
x
G
V
 
P
P
 
P
G
 
Q
S
x
L
A
 
H
V
 
F
L
 
E
E
 
M
V
 
G
L
 
L
E
 
L
K
 
A
L
 
M
P
 
S
D
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
N
V
 
V
L
 
F
I
 
V
Q
x
E
K
|
K
P
 
P
M
 
P
G
 
C
E
 
A
D
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
E
A
 
L
K
 
E
A
 
T
I
 
L
L
 
I
A
 
D
L
 
A
C
 
A
R
 
R
K
 
R
K
 
S
K
 
D
L
 
V
K
 
V
A
 
S
G
 
G
V
 
V
N
 
G
F
 
M
Q
x
N
M
 
F
R
 
K
Y
 
F
A
 
A
P
 
R
Y
 
P
I
 
V
Q
 
R
K
 
Q
A
 
L
R
 
R
E
 
E
I
 
M
I
 
T
Q
 
Q
A
 
V
G
 
D
H
 
E
I
 
F
G
 
G
E
 
E
V
 
T
C
 
L
D
 
H
I
 
I
E
 
Q
V
 
L
K
 
N
I
 
H
N
 
Y
V
 
A
Y
 
N
T
 
K
P
 
P
W
 
R
H
 
A
-
 
P
L
 
L
W
 
W
D
 
G
F
 
-
L
 
L
F
 
D
T
 
S
A
 
T
S
 
L
R
 
R
V
 
S
E
 
F
I
 
L
L
 
L
Y
 
A
H
 
Q
S
 
A
I
 
I
H
 
H
Y
 
T
V
 
I
D
 
D
L
 
L
V
 
A
R
 
I
S
 
T
F
 
F
F
 
G
-
 
D
G
 
G
N
 
E
P
 
L
E
 
R
K
 
R
V
 
V
Y
 
Q
A
 
S
K
 
S
T
 
V
I
 
Q
K
 
R
H
 
H

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Echvi_1691 FitnessBrowser__Cola:Echvi_1691
MKILQIGAGGIVKDAHLPAYKIAGFEVEGVYDLDEENAISLATAFGIPRVFGSLDELTAH
ATEDTVFDVAVPGSAVLEVLEKLPDGAVVLIQKPMGEDLEAAKAILALCRKKKLKAGVNF
QMRYAPYIQKAREIIQAGHIGEVCDIEVKINVYTPWHLWDFLFTASRVEILYHSIHYVDL
VRSFFGNPEKVYAKTIKHPKMTQLASVKTNIIMDYGALKGANILTNHAHAFGLKHQQSYV
KIEGTKGAIMIEMGLLKNYPQGTADKFEYIIAAEGKEAEWKEVEIAGTWFPHAFIGSMTE
MKKALENPAYLPDNSVEDCIYTMACVEAAHQSSEQGGVVLPTIDQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory