SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Echvi_2498 FitnessBrowser__Cola:Echvi_2498 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6z67B Ftse structure of streptococcus pneumoniae in complex with amppnp at 2.4 a resolution (see paper)
42% identity, 89% coverage: 21:227/232 of query aligns to 17:222/229 of 6z67B

query
sites
6z67B
T
 
T
A
 
T
I
x
A
L
 
L
Q
 
R
D
 
G
V
 
V
T
 
S
F
 
V
D
 
S
I
 
V
E
 
Q
K
 
P
D
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
A
F
 
Y
L
 
I
I
 
V
G
 
G
R
 
P
T
x
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
F
L
 
I
K
 
R
T
 
S
L
 
L
Y
 
Y
A
 
R
D
 
E
L
 
V
P
 
K
L
 
I
K
 
D
M
 
K
G
 
G
Y
 
S
G
 
L
K
 
S
I
 
V
S
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
N
L
 
L
K
 
V
E
 
K
I
 
I
K
 
K
T
 
K
K
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
F
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
S
L
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
Y
Q
 
K
L
 
L
F
 
L
T
 
P
D
 
K
R
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
I
Y
 
A
F
 
Y
V
 
A
M
 
M
R
 
E
A
 
V
T
 
I
G
 
G
W
 
-
K
 
E
D
 
N
K
 
R
A
 
R
K
 
N
M
 
I
K
 
K
T
 
R
R
 
R
M
 
V
V
 
M
E
 
E
V
 
V
L
 
L
M
 
D
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
K
G
 
H
A
 
K
A
 
V
T
 
R
K
 
S
M
 
F
P
 
P
H
 
N
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
V
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
L
 
V
N
 
N
H
 
N
P
 
P
S
 
K
I
 
V
L
 
L
L
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
D
V
 
N
A
 
S
D
 
W
G
 
E
I
 
I
F
 
M
K
 
N
L
 
L
F
 
L
Q
 
E
E
 
R
I
 
I
N
 
N
K
 
L
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
A
 
T
V
 
I
L
 
L
M
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
N
 
N
H
 
S
D
 
Q
L
 
I
L
 
V
N
 
N
K
 
T
Y
 
L
P
 
R
Y
 
H
R
 
R
I
 
V
L
 
I
K
 
A
C
 
I
E
 
E
K
 
N
G
 
G
K
 
R
L
 
V
L
 
V
D
 
R
S
 
D
K
 
E
T
 
S

Sites not aligning to the query:

6z4wA Ftse structure from streptococcus pneumoniae in complex with adp (space group p 1) (see paper)
42% identity, 89% coverage: 21:227/232 of query aligns to 17:222/230 of 6z4wA

query
sites
6z4wA
T
|
T
A
 
T
I
x
A
L
 
L
Q
 
R
D
 
G
V
 
V
T
 
S
F
 
V
D
 
S
I
 
V
E
 
Q
K
 
P
D
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
A
F
 
Y
L
 
I
I
 
V
G
 
G
R
 
P
T
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
F
L
 
I
K
 
R
T
 
S
L
 
L
Y
 
Y
A
 
R
D
 
E
L
 
V
P
 
K
L
 
I
K
 
D
M
 
K
G
 
G
Y
 
S
G
 
L
K
 
S
I
 
V
S
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
N
L
 
L
K
 
V
E
 
K
I
 
I
K
 
K
T
 
K
K
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
F
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
S
L
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
Y
Q
 
K
L
 
L
F
 
L
T
 
P
D
 
K
R
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
I
Y
 
A
F
 
Y
V
 
A
M
 
M
R
 
E
A
 
V
T
 
I
G
 
G
W
 
-
K
 
E
D
 
N
K
 
R
A
 
R
K
 
N
M
 
I
K
 
K
T
 
R
R
 
R
M
 
V
V
 
M
E
 
E
V
 
V
L
 
L
M
 
D
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
K
G
 
H
A
 
K
A
 
V
T
 
R
K
 
S
M
 
F
P
 
P
H
 
N
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
V
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
L
 
V
N
 
N
H
 
N
P
 
P
S
 
K
I
 
V
L
 
L
L
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
D
V
 
N
A
 
S
D
 
W
G
 
E
I
 
I
F
 
M
K
 
N
L
 
L
F
 
L
Q
 
E
E
 
R
I
 
I
N
 
N
K
 
L
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
A
 
T
V
 
I
L
 
L
M
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
N
 
N
H
 
S
D
 
Q
L
 
I
L
 
V
N
 
N
K
 
T
Y
 
L
P
 
R
Y
 
H
R
 
R
I
 
V
L
 
I
K
 
A
C
 
I
E
 
E
K
 
N
G
 
G
K
 
R
L
 
V
L
 
V
D
 
R
S
 
D
K
 
E
T
 
S

Sites not aligning to the query:

A0A0H2ZM82 Cell division ATP-binding protein FtsE from Streptococcus pneumoniae serotype 2 (strain D39 / NCTC 7466) (see paper)
42% identity, 89% coverage: 21:227/232 of query aligns to 17:222/230 of A0A0H2ZM82

query
sites
A0A0H2ZM82
T
 
T
A
 
T
I
 
A
L
 
L
Q
 
R
D
 
G
V
 
V
T
 
S
F
 
V
D
 
S
I
 
V
E
 
Q
K
 
P
D
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
A
F
 
Y
L
 
I
I
 
V
G
 
G
R
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
S
 
T
L
 
F
L
 
I
K
 
R
T
 
S
L
 
L
Y
 
Y
A
 
R
D
 
E
L
 
V
P
 
K
L
 
I
K
 
D
M
 
K
G
 
G
Y
 
S
G
 
L
K
 
S
I
 
V
S
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
N
L
 
L
K
 
V
E
 
K
I
 
I
K
 
K
T
 
K
K
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
F
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
S
L
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
Y
Q
 
K
L
 
L
F
 
L
T
 
P
D
 
K
R
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
I
Y
 
A
F
 
Y
V
 
A
M
 
M
R
 
E
A
 
V
T
 
I
G
 
G
W
 
-
K
 
E
D
 
N
K
 
R
A
 
R
K
 
N
M
 
I
K
 
K
T
 
R
R
 
R
M
 
V
V
 
M
E
 
E
V
 
V
L
 
L
M
 
D
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
K
G
 
H
A
 
K
A
 
V
T
 
R
K
 
S
M
 
F
P
 
P
H
 
N
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
V
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
L
 
V
N
 
N
H
 
N
P
 
P
S
 
K
I
 
V
L
 
L
L
 
I
A
 
A
D
|
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
D
V
 
N
A
 
S
D
 
W
G
 
E
I
 
I
F
 
M
K
 
N
L
 
L
F
 
L
Q
 
E
E
 
R
I
 
I
N
 
N
K
 
L
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
A
 
T
V
 
I
L
 
L
M
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
N
 
N
H
 
S
D
 
Q
L
 
I
L
 
V
N
 
N
K
 
T
Y
 
L
P
 
R
Y
 
H
R
 
R
I
 
V
L
 
I
K
 
A
C
 
I
E
 
E
K
 
N
G
 
G
K
 
R
L
 
V
L
 
V
D
 
R
S
 
D
K
 
E
T
 
S

8iddA Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis atp bound ftsex/ripc complex in peptidisc (see paper)
45% identity, 86% coverage: 24:223/232 of query aligns to 20:218/225 of 8iddA

query
sites
8iddA
L
 
L
Q
 
D
D
 
D
V
 
I
T
 
N
F
 
V
D
 
K
I
 
I
E
 
D
K
 
K
D
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
V
F
 
F
L
 
L
I
 
I
G
 
G
R
 
P
T
x
S
G
 
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
 
T
L
 
F
L
 
M
K
 
R
T
 
L
L
 
L
Y
 
L
A
 
A
D
 
A
L
 
E
P
 
T
L
 
P
K
 
T
M
 
S
G
 
G
Y
 
D
G
 
V
K
 
R
I
 
V
S
 
S
G
 
K
Y
 
F
D
 
H
L
 
V
K
 
N
E
 
K
I
 
L
K
 
R
T
 
G
K
 
R
D
 
H
V
 
V
P
 
P
F
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
K
 
V
L
 
I
G
 
G
I
 
C
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
Q
 
R
L
 
L
F
 
L
T
 
Q
D
 
Q
R
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
V
Y
 
A
F
 
F
V
 
A
M
 
L
R
 
E
A
 
V
T
 
I
G
 
G
W
 
K
K
 
R
D
 
T
K
 
D
A
 
A
K
 
I
M
 
N
K
 
R
T
 
V
R
 
-
M
 
V
V
 
P
E
 
E
V
 
V
L
 
L
M
 
E
R
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
S
G
 
G
A
 
K
A
 
A
T
 
N
K
 
R
M
 
L
P
 
P
H
 
D
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
L
 
V
N
 
N
H
 
R
P
 
P
S
 
L
I
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
T
A
 
S
D
 
R
G
 
D
I
 
I
F
 
M
K
 
D
L
 
L
F
 
L
Q
 
E
E
 
R
I
 
I
N
 
N
K
 
R
Q
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
T
V
 
V
L
 
L
M
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
N
 
D
H
 
H
D
 
H
L
 
I
L
 
V
N
 
D
K
 
S
Y
 
M
P
 
R
Y
 
Q
R
 
R
I
 
V
L
 
V
K
 
E
C
 
L
E
 
S
K
 
L
G
 
G
K
 
R
L
 
L
L
 
V

Sites not aligning to the query:

8igqA Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis adp bound ftsex/ripc complex in peptidisc (see paper)
45% identity, 86% coverage: 24:223/232 of query aligns to 20:218/227 of 8igqA

query
sites
8igqA
L
 
L
Q
 
D
D
 
D
V
 
I
T
 
N
F
 
V
D
 
K
I
 
I
E
 
D
K
 
K
D
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
V
F
 
F
L
 
L
I
 
I
G
 
G
R
 
P
T
 
S
G
|
G
S
|
S
G
 
G
K
|
K
S
|
S
S
 
T
L
 
F
L
 
M
K
 
R
T
 
L
L
 
L
Y
 
L
A
 
A
D
 
A
L
 
E
P
 
T
L
 
P
K
 
T
M
 
S
G
 
G
Y
 
D
G
 
V
K
 
R
I
 
V
S
 
S
G
 
K
Y
 
F
D
 
H
L
 
V
K
 
N
E
 
K
I
 
L
K
 
R
T
 
G
K
 
R
D
 
H
V
 
V
P
 
P
F
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
K
 
V
L
 
I
G
 
G
I
 
C
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
Q
 
R
L
 
L
F
 
L
T
 
Q
D
 
Q
R
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
V
Y
 
A
F
 
F
V
 
A
M
 
L
R
 
E
A
 
V
T
 
I
G
 
G
W
 
K
K
 
R
D
 
T
K
 
D
A
 
A
K
 
I
M
 
N
K
 
R
T
 
V
R
 
-
M
 
V
V
 
P
E
 
E
V
 
V
L
 
L
M
 
E
R
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
S
G
 
G
A
 
K
A
 
A
T
 
N
K
 
R
M
 
L
P
 
P
H
 
D
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
L
 
V
N
 
N
H
 
R
P
 
P
S
 
L
I
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
T
A
 
S
D
 
R
G
 
D
I
 
I
F
 
M
K
 
D
L
 
L
F
 
L
Q
 
E
E
 
R
I
 
I
N
 
N
K
 
R
Q
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
T
V
 
V
L
 
L
M
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
N
 
D
H
 
H
D
 
H
L
 
I
L
 
V
N
 
D
K
 
S
Y
 
M
P
 
R
Y
 
Q
R
 
R
I
 
V
L
 
V
K
 
E
C
 
L
E
 
S
K
 
L
G
 
G
K
 
R
L
 
L
L
 
V

Sites not aligning to the query:

A5U7B7 Cell division ATP-binding protein FtsE from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25177 / H37Ra) (see 2 papers)
45% identity, 86% coverage: 24:223/232 of query aligns to 19:217/229 of A5U7B7

query
sites
A5U7B7
L
 
L
Q
 
D
D
 
D
V
 
I
T
 
N
F
 
V
D
 
K
I
 
I
E
 
D
K
 
K
D
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
V
F
 
F
L
 
L
I
 
I
G
 
G
R
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
S
 
T
L
 
F
L
 
M
K
 
R
T
 
L
L
 
L
Y
 
L
A
 
A
D
 
A
L
 
E
P
 
T
L
 
P
K
 
T
M
 
S
G
 
G
Y
 
D
G
 
V
K
 
R
I
 
V
S
 
S
G
 
K
Y
 
F
D
 
H
L
 
V
K
 
N
E
 
K
I
 
L
K
 
R
T
 
G
K
 
R
D
 
H
V
 
V
P
 
P
F
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
K
 
V
L
 
I
G
 
G
I
x
C
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
Q
 
R
L
 
L
F
 
L
T
 
Q
D
 
Q
R
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
V
Y
 
A
F
 
F
V
 
A
M
 
L
R
 
E
A
 
V
T
 
I
G
 
G
W
 
K
K
 
R
D
 
T
K
 
D
A
 
A
K
 
I
M
 
N
K
 
R
T
 
V
R
 
-
M
 
V
V
 
P
E
 
E
V
 
V
L
 
L
M
 
E
R
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
S
G
 
G
A
 
K
A
 
A
T
 
N
K
 
R
M
 
L
P
 
P
H
 
D
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
L
 
V
N
 
N
H
 
R
P
 
P
S
 
L
I
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
T
A
 
S
D
 
R
G
 
D
I
 
I
F
 
M
K
 
D
L
 
L
F
 
L
Q
 
E
E
 
R
I
 
I
N
 
N
K
 
R
Q
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
T
V
 
V
L
 
L
M
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
N
 
D
H
 
H
D
 
H
L
 
I
L
 
V
N
 
D
K
 
S
Y
 
M
P
 
R
Y
 
Q
R
 
R
I
 
V
L
 
V
K
 
E
C
 
L
E
 
S
K
 
L
G
 
G
K
 
R
L
 
L
L
 
V

8tzjA Cryo-em structure of vibrio cholerae ftse/ftsx complex (see paper)
46% identity, 89% coverage: 17:222/232 of query aligns to 12:217/220 of 8tzjA

query
sites
8tzjA
F
x
Y
Q
 
R
G
 
G
I
 
G
T
x
R
A
 
Q
I
x
A
L
 
L
Q
 
Q
D
 
K
V
 
V
T
 
D
F
 
F
D
 
H
I
 
L
E
 
R
K
 
R
D
 
G
E
 
E
F
 
M
V
 
A
F
 
F
L
 
L
I
 
G
G
 
G
R
 
H
T
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
K
T
 
L
L
 
I
Y
 
C
A
 
A
-
 
I
D
 
E
L
 
R
P
 
P
L
 
T
K
 
D
M
 
-
G
 
-
Y
 
-
G
 
G
K
 
K
I
 
I
S
 
S
-
 
F
-
 
N
G
 
G
Y
 
H
D
 
D
L
 
I
K
 
T
E
 
R
I
 
I
K
 
P
T
 
N
K
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
F
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
N
L
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
H
Q
 
R
L
 
L
F
 
L
T
 
M
D
 
D
R
 
R
T
 
S
V
 
I
A
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
V
Y
 
A
F
 
L
V
 
P
M
 
M
R
 
R
A
 
I
T
 
E
G
 
S
W
 
I
K
 
S
D
 
E
K
 
N
A
 
-
K
 
E
M
 
I
K
 
K
T
 
R
R
 
R
M
 
V
V
 
S
E
 
A
V
 
A
L
 
L
M
 
D
R
 
K
V
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
L
G
 
D
A
 
K
A
 
A
T
 
R
K
 
C
M
 
L
P
 
P
H
 
S
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
L
 
V
N
 
N
H
 
R
P
 
P
S
 
T
I
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
L
A
 
S
D
 
S
G
 
R
I
 
V
F
 
L
K
 
R
L
 
L
F
 
F
Q
 
E
E
 
E
I
 
F
N
 
N
K
 
R
Q
 
A
G
 
G
T
 
V
A
 
T
V
 
I
L
 
L
M
 
L
A
 
A
T
 
T
H
 
H
N
 
D
H
 
I
D
 
H
L
 
L
L
 
V
N
 
N
K
 
S
Y
 
R
P
 
P
-
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
I
 
H
L
 
L
K
 
E
C
 
L
E
 
N
K
 
Q
G
 
G
K
 
F
L
 
L

P0A9R7 Cell division ATP-binding protein FtsE from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
46% identity, 86% coverage: 24:222/232 of query aligns to 18:215/222 of P0A9R7

query
sites
P0A9R7
L
 
L
Q
 
Q
D
 
G
V
 
V
T
 
T
F
 
F
D
 
H
I
 
M
E
 
Q
K
 
P
D
 
G
E
 
E
F
 
M
V
 
A
F
 
F
L
 
L
I
 
T
G
 
G
R
 
H
T
 
S
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
S
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
K
T
 
L
L
 
I
Y
x
C
A
 
G
D
 
I
L
 
E
P
 
R
L
 
P
K
 
S
M
 
A
G
 
G
Y
 
K
G
 
I
K
 
W
I
 
F
S
 
S
G
 
G
Y
 
H
D
 
D
L
 
I
K
 
T
E
 
R
I
 
L
K
 
K
T
 
N
K
 
R
D
 
E
V
 
V
P
 
P
F
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
H
Q
 
H
L
 
L
F
 
L
T
 
M
D
 
D
R
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
V
Y
 
A
F
 
I
V
 
P
M
 
L
R
 
I
A
 
I
T
 
A
G
 
G
W
 
A
K
 
S
D
 
G
K
 
D
A
 
-
K
 
D
M
 
I
K
 
R
T
 
R
R
 
R
M
 
V
V
 
S
E
 
A
V
 
A
L
 
L
M
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
L
G
 
D
A
 
K
A
 
A
T
 
K
K
 
N
M
 
F
P
 
P
H
 
I
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
L
 
V
N
 
N
H
 
K
P
 
P
S
 
A
I
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
D
E
 
A
V
 
L
A
 
S
D
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
L
K
 
R
L
 
L
F
 
F
Q
 
E
E
 
E
I
 
F
N
 
N
K
 
R
Q
 
V
G
 
G
T
 
V
A
 
T
V
 
V
L
 
L
M
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
N
 
D
H
 
I
D
 
N
L
 
L
L
 
I
N
 
S
K
 
R
Y
 
R
P
 
S
Y
 
Y
R
 
R
I
 
M
L
 
L
K
 
T
C
 
L
E
 
S
K
 
D
G
 
G
K
 
H
L
 
L

8w6iD Cryo-em structure of escherichia coli str k12 ftsex complex with atp- gamma-s in peptidisc
46% identity, 86% coverage: 24:222/232 of query aligns to 18:215/219 of 8w6iD

query
sites
8w6iD
L
 
L
Q
 
Q
D
 
G
V
 
V
T
 
T
F
 
F
D
 
H
I
 
M
E
 
Q
K
 
P
D
 
G
E
 
E
F
 
M
V
 
A
F
 
F
L
 
L
I
 
T
G
 
G
R
 
H
T
x
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
K
 
K
T
 
L
L
 
I
Y
 
C
A
 
G
D
 
I
L
 
E
P
 
R
L
 
P
K
 
S
M
 
A
G
 
G
Y
 
K
G
 
I
K
 
W
I
 
F
S
 
S
G
 
G
Y
 
H
D
 
D
L
 
I
K
 
T
E
 
R
I
 
L
K
 
K
T
 
N
K
 
R
D
 
E
V
 
V
P
 
P
F
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
|
Q
D
 
D
F
 
H
Q
 
H
L
 
L
F
 
L
T
 
M
D
 
D
R
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
V
Y
 
A
F
 
I
V
 
P
M
 
L
R
 
I
A
 
I
T
 
A
G
 
G
W
 
A
K
 
S
D
 
G
K
 
D
A
 
-
K
 
D
M
 
I
K
 
R
T
 
R
R
 
R
M
 
V
V
 
S
E
 
A
V
 
A
L
 
L
M
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
L
G
 
D
A
x
K
A
 
A
T
 
K
K
 
N
M
 
F
P
 
P
H
 
I
Q
|
Q
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
|
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
L
 
V
N
 
N
H
 
K
P
 
P
S
 
A
I
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
D
E
 
A
V
 
L
A
 
S
D
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
L
K
 
R
L
 
L
F
 
F
Q
 
E
E
 
E
I
 
F
N
 
N
K
 
R
Q
 
V
G
 
G
T
 
V
A
 
T
V
 
V
L
 
L
M
 
M
A
 
A
T
 
T
H
|
H
N
 
D
H
 
I
D
 
N
L
 
L
L
 
I
N
 
S
K
 
R
Y
 
R
P
 
S
Y
 
Y
R
 
R
I
 
M
L
 
L
K
 
T
C
 
L
E
 
S
K
 
D
G
 
G
K
 
H
L
 
L

Sites not aligning to the query:

8hd0A Cell divisome spg hydrolysis machinery ftsex-envc
45% identity, 86% coverage: 24:222/232 of query aligns to 18:215/218 of 8hd0A

query
sites
8hd0A
L
 
L
Q
 
Q
D
 
G
V
 
V
T
 
T
F
 
F
D
 
H
I
 
M
E
 
Q
K
 
P
D
 
G
E
 
E
F
 
M
V
 
A
F
 
F
L
 
L
I
 
T
G
 
G
R
 
H
T
 
S
G
 
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
K
 
K
T
 
L
L
 
I
Y
 
C
A
 
G
D
 
I
L
 
E
P
 
R
L
 
P
K
 
S
M
 
A
G
 
G
Y
 
K
G
 
I
K
 
W
I
 
F
S
 
S
G
 
G
Y
 
H
D
 
D
L
 
I
K
 
T
E
 
R
I
 
L
K
 
K
T
 
N
K
 
R
D
 
E
V
 
V
P
 
P
F
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
H
Q
 
H
L
 
L
F
 
L
T
 
M
D
 
D
R
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
V
Y
 
A
F
 
I
V
 
P
M
 
L
R
 
I
A
 
I
T
 
A
G
 
G
W
 
A
K
 
S
D
 
G
K
 
D
A
 
-
K
 
D
M
 
I
K
 
R
T
 
R
R
 
R
M
 
V
V
 
S
E
 
A
V
 
A
L
 
L
M
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
L
G
 
D
A
 
K
A
 
A
T
 
K
K
 
N
M
 
F
P
 
P
H
 
I
Q
 
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
L
 
V
N
 
N
H
 
K
P
 
P
S
 
A
I
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
D
E
 
A
V
 
L
A
 
S
D
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
L
K
 
R
L
 
L
F
 
F
Q
 
E
E
 
E
I
 
F
N
 
N
K
 
R
Q
 
V
G
 
G
T
 
V
A
 
T
V
 
V
L
 
L
M
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
N
 
D
H
 
I
D
 
N
L
 
L
L
 
I
N
 
S
K
 
R
Y
 
R
P
 
S
Y
 
Y
R
 
R
I
 
M
L
 
L
K
 
T
C
 
L
E
 
S
K
 
D
G
 
G
K
 
H
L
 
L

Sites not aligning to the query:

8i6rB Cryo-em structure of pseudomonas aeruginosa ftse(e163q)x/envc complex with atp in peptidisc (see paper)
41% identity, 89% coverage: 24:229/232 of query aligns to 18:222/222 of 8i6rB

query
sites
8i6rB
L
 
L
Q
 
H
D
 
E
V
 
V
T
 
S
F
 
F
D
 
R
I
 
V
E
 
H
K
 
R
D
 
G
E
 
E
F
 
I
V
 
L
F
 
F
L
 
V
I
 
T
G
 
G
R
 
H
T
x
S
G
 
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
K
 
R
T
 
L
L
 
I
Y
 
L
A
 
A
D
 
M
L
 
E
P
 
R
L
 
P
K
 
T
M
 
S
G
 
G
Y
 
K
G
 
L
K
 
L
I
 
L
S
 
G
G
 
G
Y
 
Q
D
 
D
L
 
L
K
 
G
E
 
R
I
 
I
K
 
T
T
 
T
K
 
A
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
F
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
N
F
 
H
Q
 
Q
L
 
L
F
 
L
T
 
T
D
 
D
R
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
D
N
 
N
L
 
I
Y
 
A
F
 
L
V
 
P
M
 
L
R
 
Q
A
 
I
T
 
L
G
 
G
W
 
M
K
 
P
D
 
-
K
 
K
A
 
P
K
 
E
M
 
I
K
 
A
T
 
K
R
 
R
M
 
V
V
 
A
E
 
S
V
 
A
L
 
L
M
 
E
R
 
R
V
 
V
G
 
N
L
 
L
G
 
K
G
 
E
A
 
K
A
 
G
T
 
E
K
 
A
M
 
L
P
 
P
H
 
S
Q
x
D
L
 
L
S
|
S
G
x
T
G
|
G
E
x
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
L
 
V
N
 
H
H
 
Q
P
 
P
S
 
A
I
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
R
V
 
L
A
 
A
D
 
S
G
 
E
I
 
I
F
 
M
K
 
G
L
 
V
F
 
F
Q
 
E
E
 
D
I
 
I
N
 
N
K
 
R
Q
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
T
V
 
V
L
 
L
M
 
I
A
 
A
T
 
S
H
 
H
N
 
D
H
 
L
D
 
A
L
 
L
L
 
I
N
 
A
K
 
R
Y
 
M
P
 
R
Y
 
H
R
 
R
I
 
M
L
 
L
K
 
T
C
 
L
E
 
Q
K
 
R
G
 
G
K
 
R
L
 
I
L
 
I
D
 
A
S
 
D
K
 
R
T
 
E
T
 
D
E
 
E

Sites not aligning to the query:

2pclA Crystal structure of abc transporter with complex (aq_297) from aquifex aeolicus vf5
41% identity, 88% coverage: 23:227/232 of query aligns to 18:221/223 of 2pclA

query
sites
2pclA
I
 
I
L
 
L
Q
 
K
D
 
G
V
 
I
T
 
S
F
 
L
D
 
S
I
 
V
E
 
K
K
 
K
D
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
V
F
 
S
L
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
A
T
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
S
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
Y
T
 
I
L
 
L
-
 
G
Y
 
L
A
 
L
D
 
D
L
 
A
P
 
P
L
 
T
K
 
E
M
 
-
G
 
-
Y
 
-
G
 
G
K
 
K
I
 
V
-
 
F
-
 
L
S
 
E
G
 
G
Y
 
K
D
 
E
L
 
V
K
 
D
E
 
Y
I
 
T
K
 
N
T
 
E
K
 
K
D
 
E
V
 
L
P
 
S
F
 
L
L
 
L
R
 
R
-
 
N
R
 
R
K
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
F
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
F
F
 
H
Q
 
Y
L
 
L
F
 
I
T
 
P
D
 
E
R
 
L
T
 
T
V
 
A
A
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
Y
 
I
F
 
V
V
 
P
M
 
M
R
 
L
A
 
K
T
 
M
G
 
G
W
 
-
K
 
K
D
 
P
K
 
K
A
 
K
K
 
E
M
 
A
K
 
K
T
 
E
R
 
R
M
 
G
V
 
E
E
 
Y
V
 
L
L
 
L
M
 
S
R
 
E
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
D
A
 
K
A
 
L
T
 
S
K
 
R
M
 
K
P
 
P
H
 
Y
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
A
N
 
N
H
 
E
P
 
P
S
 
I
I
 
L
L
 
L
L
 
F
A
 
A
D
 
D
E
|
E
P
|
P
T
|
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
S
E
 
A
V
 
N
A
 
T
D
 
K
G
 
R
I
 
V
F
 
M
K
 
D
L
 
I
F
 
F
Q
 
L
E
 
K
I
 
I
N
 
N
K
 
E
Q
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
S
V
 
I
L
 
V
M
 
M
A
 
V
T
|
T
H
 
H
N
 
E
H
 
R
D
 
E
L
 
-
L
 
L
N
 
A
K
 
E
Y
 
L
P
 
T
Y
 
H
R
 
R
I
 
T
L
 
L
K
 
E
C
 
M
E
 
K
K
 
D
G
 
G
K
 
K
L
 
V
L
 
V
D
 
G
S
 
E
K
 
I
T
 
T

7arlD Lolcde in complex with lipoprotein and adp (see paper)
41% identity, 87% coverage: 21:222/232 of query aligns to 19:220/222 of 7arlD

query
sites
7arlD
T
 
T
A
 
D
I
 
V
L
 
L
Q
 
H
D
 
N
V
 
V
T
 
S
F
 
F
D
 
S
I
 
V
E
 
G
K
 
E
D
 
G
E
 
E
F
 
M
V
 
M
F
 
A
L
 
I
I
 
V
G
 
G
R
 
S
T
 
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
H
T
 
L
L
 
L
Y
 
G
A
 
G
-
 
L
D
 
D
L
 
T
P
 
P
L
 
T
K
 
S
M
 
-
G
 
G
Y
 
D
G
 
V
K
 
I
I
 
F
S
 
N
G
 
G
Y
 
Q
D
 
P
L
 
M
K
 
S
E
 
K
I
 
L
K
 
S
T
 
S
K
 
A
D
 
A
V
 
K
P
 
A
F
 
E
L
 
L
R
 
R
-
 
N
R
 
Q
K
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
F
V
 
I
F
 
Y
Q
 
Q
D
 
F
F
 
H
Q
 
H
L
 
L
F
 
L
T
 
P
D
 
D
R
 
F
T
 
T
V
 
A
A
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
Y
 
A
F
 
M
V
 
P
M
 
L
R
 
-
A
 
L
T
 
I
G
 
G
W
 
K
K
 
K
D
 
K
K
 
P
A
 
A
K
 
E
M
 
I
K
 
N
T
 
S
R
 
R
M
 
A
V
 
L
E
 
E
V
 
M
L
 
L
M
 
K
R
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
D
G
 
H
A
 
R
A
 
A
T
 
N
K
 
H
M
 
R
P
 
P
H
 
S
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
N
 
N
H
 
N
P
 
P
S
 
R
I
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
E
 
R
V
 
N
A
 
A
D
 
D
G
 
S
I
 
I
F
 
F
K
 
Q
L
 
L
F
 
L
Q
 
G
E
 
E
I
 
L
N
 
N
K
 
R
-
 
L
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
F
L
 
L
M
 
V
A
 
V
T
 
T
H
 
H
N
 
D
H
 
L
D
 
Q
L
 
L
L
 
A
N
 
K
K
 
R
Y
 
M
P
 
S
Y
 
-
R
 
R
I
 
Q
L
 
L
K
 
E
C
 
M
E
 
R
K
 
D
G
 
G
K
 
R
L
 
L

P75957 Lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD; EC 7.6.2.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
41% identity, 87% coverage: 21:222/232 of query aligns to 22:223/233 of P75957

query
sites
P75957
T
 
T
A
 
D
I
 
V
L
 
L
Q
 
H
D
 
N
V
 
V
T
 
S
F
 
F
D
 
S
I
 
V
E
 
G
K
 
E
D
 
G
E
 
E
F
 
M
V
 
M
F
 
A
L
 
I
I
 
V
G
|
G
R
 
S
T
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
S
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
H
T
 
L
L
 
L
Y
 
G
A
 
G
-
 
L
D
 
D
L
 
T
P
 
P
L
 
T
K
 
S
M
 
-
G
 
G
Y
 
D
G
 
V
K
 
I
I
 
F
S
 
N
G
 
G
Y
 
Q
D
 
P
L
 
M
K
 
S
E
 
K
I
 
L
K
 
S
T
 
S
K
 
A
D
 
A
V
 
K
P
 
A
F
 
E
L
 
L
R
 
R
-
 
N
R
 
Q
K
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
F
V
 
I
F
 
Y
Q
 
Q
D
 
F
F
 
H
Q
 
H
L
 
L
F
 
L
T
 
P
D
 
D
R
 
F
T
 
T
V
 
A
A
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
Y
 
A
F
 
M
V
 
P
M
 
L
R
 
-
A
 
L
T
 
I
G
 
G
W
 
K
K
 
K
D
 
K
K
 
P
A
 
A
K
 
E
M
 
I
K
 
N
T
 
S
R
 
R
M
 
A
V
 
L
E
 
E
V
 
M
L
 
L
M
 
K
R
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
D
G
 
H
A
 
R
A
 
A
T
 
N
K
 
H
M
 
R
P
 
P
H
 
S
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
N
 
N
H
 
N
P
 
P
S
 
R
I
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
E
 
R
V
 
N
A
 
A
D
 
D
G
 
S
I
 
I
F
 
F
K
 
Q
L
 
L
F
 
L
Q
 
G
E
 
E
I
 
L
N
 
N
K
 
R
-
 
L
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
F
L
 
L
M
 
V
A
 
V
T
 
T
H
 
H
N
 
D
H
 
L
D
 
Q
L
 
L
L
 
A
N
 
K
K
 
R
Y
 
M
P
 
S
Y
 
-
R
 
R
I
 
Q
L
 
L
K
 
E
C
 
M
E
 
R
K
 
D
G
 
G
K
 
R
L
 
L

7mdyC Lolcde nucleotide-bound
41% identity, 87% coverage: 21:222/232 of query aligns to 19:220/226 of 7mdyC

query
sites
7mdyC
T
 
T
A
 
D
I
 
V
L
 
L
Q
 
H
D
 
N
V
 
V
T
 
S
F
 
F
D
 
S
I
 
V
E
 
G
K
 
E
D
 
G
E
 
E
F
 
M
V
 
M
F
 
A
L
 
I
I
 
V
G
 
G
R
 
S
T
 
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
K
 
H
T
 
L
L
 
L
Y
 
G
A
 
G
-
 
L
D
 
D
L
 
T
P
 
P
L
 
T
K
 
S
M
 
-
G
 
G
Y
 
D
G
 
V
K
 
I
I
 
F
S
 
N
G
 
G
Y
 
Q
D
 
P
L
 
M
K
 
S
E
 
K
I
 
L
K
 
S
T
 
S
K
 
A
D
 
A
V
 
K
P
 
A
F
 
E
L
 
L
R
 
R
-
 
N
R
 
Q
K
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
F
V
 
I
F
 
Y
Q
|
Q
D
 
F
F
 
H
Q
 
H
L
 
L
F
 
L
T
 
P
D
 
D
R
 
F
T
 
T
V
 
A
A
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
Y
 
A
F
 
M
V
 
P
M
 
L
R
 
-
A
 
L
T
 
I
G
 
G
W
 
K
K
 
K
D
 
K
K
 
P
A
 
A
K
 
E
M
 
I
K
 
N
T
 
S
R
 
R
M
 
A
V
 
L
E
 
E
V
 
M
L
 
L
M
 
K
R
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
D
G
 
H
A
 
R
A
 
A
T
 
N
K
x
H
M
 
R
P
 
P
H
 
S
Q
x
E
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
N
 
N
H
 
N
P
 
P
S
 
R
I
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
|
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
E
 
R
V
 
N
A
 
A
D
 
D
G
 
S
I
 
I
F
 
F
K
 
Q
L
 
L
F
 
L
Q
 
G
E
 
E
I
 
L
N
 
N
K
 
R
-
 
L
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
F
L
 
L
M
 
V
A
 
V
T
 
T
H
|
H
N
 
D
H
 
L
D
 
Q
L
 
L
L
 
A
N
 
K
K
 
R
Y
 
M
P
 
-
Y
 
S
R
 
R
I
 
Q
L
 
L
K
 
E
C
 
M
E
 
R
K
 
D
G
 
G
K
 
R
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7v8iD Lolcd(e171q)e with bound amppnp in nanodiscs (see paper)
40% identity, 87% coverage: 21:222/232 of query aligns to 21:222/229 of 7v8iD

query
sites
7v8iD
T
 
T
A
 
D
I
x
V
L
 
L
Q
 
H
D
 
N
V
 
V
T
 
S
F
 
F
D
 
S
I
 
V
E
 
G
K
 
E
D
 
G
E
 
E
F
 
M
V
 
M
F
 
A
L
 
I
I
 
V
G
 
G
R
 
S
T
x
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
K
 
H
T
 
L
L
 
L
Y
 
G
A
 
G
-
 
L
D
 
D
L
 
T
P
 
P
L
 
T
K
 
S
M
 
-
G
 
G
Y
 
D
G
 
V
K
 
I
I
 
F
S
 
N
G
 
G
Y
 
Q
D
 
P
L
 
M
K
 
S
E
 
K
I
 
L
K
 
S
T
 
S
K
 
A
D
 
A
V
 
K
P
 
A
F
 
E
L
 
L
R
 
R
-
 
N
R
 
Q
K
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
F
V
 
I
F
 
Y
Q
|
Q
D
 
F
F
 
H
Q
 
H
L
 
L
F
 
L
T
 
P
D
 
D
R
 
F
T
 
T
V
 
A
A
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
Y
 
A
F
 
M
V
 
P
M
 
L
R
 
-
A
 
L
T
 
I
G
 
G
W
 
K
K
 
K
D
 
K
K
 
P
A
 
A
K
 
E
M
 
I
K
 
N
T
 
S
R
 
R
M
 
A
V
 
L
E
 
E
V
 
M
L
 
L
M
 
K
R
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
D
G
 
H
A
x
R
A
 
A
T
 
N
K
x
H
M
 
R
P
 
P
H
 
S
Q
x
E
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
|
E
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
N
 
N
H
 
N
P
 
P
S
 
R
I
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
E
 
R
V
 
N
A
 
A
D
 
D
G
 
S
I
 
I
F
 
F
K
 
Q
L
 
L
F
 
L
Q
 
G
E
 
E
I
 
L
N
 
N
K
 
R
-
 
L
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
F
L
 
L
M
 
V
A
 
V
T
 
T
H
|
H
N
 
D
H
 
L
D
 
Q
L
 
L
L
 
A
N
 
K
K
 
R
Y
 
M
P
 
S
Y
 
-
R
 
R
I
 
Q
L
 
L
K
 
E
C
 
M
E
 
R
K
 
D
G
 
G
K
 
R
L
 
L

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
33% identity, 97% coverage: 7:231/232 of query aligns to 1:223/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
P
 
P
V
 
I
V
 
I
R
 
R
L
 
I
D
 
R
K
 
N
A
 
L
C
 
H
I
 
K
F
 
W
Q
x
F
G
 
G
I
 
P
T
 
L
A
 
H
I
x
V
L
 
L
Q
 
K
D
 
G
V
 
I
T
 
H
F
 
L
D
 
E
I
 
V
E
 
A
K
 
P
D
 
G
E
 
E
F
 
K
V
 
L
F
 
V
L
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
P
T
x
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
I
K
 
R
T
 
T
L
 
I
Y
 
N
A
 
R
D
 
L
L
 
E
P
 
D
L
 
F
K
 
Q
M
 
E
G
 
G
Y
 
E
G
 
V
K
 
V
I
 
V
S
 
D
G
 
G
Y
 
L
D
 
S
L
 
V
K
 
K
E
 
D
I
 
-
K
 
-
T
 
D
K
 
R
D
 
A
V
 
L
P
 
R
F
 
E
L
 
I
R
 
R
R
 
R
K
 
E
L
 
V
G
 
G
I
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
Q
F
 
F
Q
 
N
L
 
L
F
 
F
T
 
P
D
 
H
R
 
M
T
 
T
V
 
V
A
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
Y
 
T
F
 
L
V
 
A
-
 
P
M
 
M
R
 
R
A
 
V
T
 
R
G
 
R
W
 
W
K
 
P
D
 
-
K
 
R
A
 
E
K
 
K
M
 
A
K
 
E
T
 
K
R
 
K
M
 
A
V
 
L
E
 
E
V
 
L
L
 
L
M
 
E
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
I
G
 
L
G
 
D
A
 
Q
A
 
A
T
 
R
K
 
K
M
 
Y
P
 
P
H
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
A
N
 
M
H
 
E
P
 
P
S
 
K
I
 
I
L
 
M
L
 
L
A
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
M
A
 
V
D
 
G
G
 
E
I
 
V
F
 
L
K
 
D
L
 
V
F
 
M
Q
 
R
E
 
D
I
 
L
N
 
A
K
 
Q
Q
 
G
G
 
G
T
 
M
A
 
T
V
 
M
L
 
V
M
 
V
A
 
V
T
 
T
H
 
H
N
 
E
H
 
M
D
 
G
L
 
F
L
 
A
N
 
R
K
 
E
Y
 
V
P
 
A
Y
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
V
K
 
F
C
 
M
E
 
D
K
 
G
G
 
G
K
 
Q
L
 
I
L
 
V
D
 
E
S
 
E
K
 
G
T
 
R
T
 
P
E
 
E
I
 
E
I
 
I

5lj7A Structure of aggregatibacter actinomycetemcomitans macb bound to atp (p21) (see paper)
33% identity, 87% coverage: 23:224/232 of query aligns to 22:222/592 of 5lj7A

query
sites
5lj7A
I
x
V
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
V
 
I
T
 
S
F
 
L
D
 
S
I
 
I
E
 
E
K
 
R
D
 
G
E
 
D
F
 
F
V
 
V
F
 
A
L
 
I
I
 
M
G
 
G
R
 
Q
T
x
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
M
K
 
N
T
 
I
L
 
I
Y
 
G
A
 
C
D
 
L
L
 
D
P
 
T
L
 
A
K
 
T
M
 
G
G
 
G
Y
 
S
G
 
S
K
 
K
I
 
I
S
 
D
G
 
G
Y
 
K
D
 
E
L
 
T
K
 
I
E
 
E
I
 
L
K
 
T
T
 
N
K
 
D
D
 
Q
V
 
L
P
 
S
F
 
D
L
 
L
R
 
R
-
 
S
R
 
Q
K
 
K
L
 
F
G
 
G
I
 
F
V
 
I
F
 
F
Q
|
Q
D
 
R
F
 
Y
Q
 
N
L
 
L
F
 
L
T
 
S
D
 
S
R
 
L
T
 
T
V
 
A
A
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
V
Y
 
A
F
 
L
V
 
P
M
 
A
R
 
I
A
 
Y
T
 
A
G
 
G
W
 
M
K
 
P
D
 
Q
K
 
S
A
 
Q
K
 
R
M
 
L
K
 
E
T
 
-
R
 
R
M
 
A
V
 
K
E
 
Q
V
 
L
L
 
L
M
 
E
R
 
K
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
D
A
x
K
A
 
W
T
 
Q
K
 
N
M
 
K
P
 
P
H
 
N
Q
|
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
x
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
M
N
 
N
H
 
G
P
 
G
S
 
E
I
 
I
L
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
S
E
 
H
V
 
S
A
 
G
D
 
E
G
 
N
I
 
V
F
 
M
K
 
E
L
 
I
F
 
L
Q
 
R
E
 
Q
I
 
L
N
 
H
K
 
E
Q
 
E
G
 
G
T
 
H
A
 
T
V
 
I
L
 
I
M
 
M
A
 
V
T
 
T
H
 
H
N
 
D
H
 
K
D
 
H
L
 
I
L
 
A
N
 
-
K
 
A
Y
 
S
P
 
A
Y
 
N
R
 
R
I
 
I
L
 
I
K
 
E
C
 
I
E
 
K
K
 
D
G
 
G
K
 
E
L
 
I
L
 
I
D
 
S

5lilA Structure of aggregatibacter actinomycetemcomitans macb bound to atpys (p21) (see paper)
33% identity, 87% coverage: 23:224/232 of query aligns to 22:222/615 of 5lilA

query
sites
5lilA
I
x
V
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
V
 
I
T
 
S
F
 
L
D
 
S
I
 
I
E
 
E
K
 
R
D
 
G
E
 
D
F
 
F
V
 
V
F
 
A
L
 
I
I
 
M
G
 
G
R
 
Q
T
x
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
M
K
 
N
T
 
I
L
 
I
Y
 
G
A
 
C
D
 
L
L
 
D
P
 
T
L
 
A
K
 
T
M
 
G
G
 
G
Y
 
S
G
 
S
K
 
K
I
 
I
S
 
D
G
 
G
Y
 
K
D
 
E
L
 
T
K
 
I
E
 
E
I
 
L
K
 
T
T
 
N
K
 
D
D
 
Q
V
 
L
P
 
S
F
 
D
L
 
L
R
 
R
-
 
S
R
 
Q
K
 
K
L
 
F
G
 
G
I
 
F
V
 
I
F
 
F
Q
|
Q
D
 
R
F
 
Y
Q
 
N
L
 
L
F
 
L
T
 
S
D
 
S
R
 
L
T
 
T
V
 
A
A
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
V
Y
 
A
F
 
L
V
 
P
M
 
A
R
 
I
A
 
Y
T
 
A
G
 
G
W
 
M
K
 
P
D
 
Q
K
 
S
A
 
Q
K
 
R
M
 
L
K
 
E
T
 
-
R
 
R
M
 
A
V
 
K
E
 
Q
V
 
L
L
 
L
M
 
E
R
 
K
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
D
A
x
K
A
 
W
T
 
Q
K
 
N
M
 
K
P
 
P
H
 
N
Q
|
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
x
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
M
N
 
N
H
 
G
P
 
G
S
 
E
I
 
I
L
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
S
E
 
H
V
 
S
A
 
G
D
 
E
G
 
N
I
 
V
F
 
M
K
 
E
L
 
I
F
 
L
Q
 
R
E
 
Q
I
 
L
N
 
H
K
 
E
Q
 
E
G
 
G
T
 
H
A
 
T
V
 
I
L
 
I
M
 
M
A
 
V
T
 
T
H
 
H
N
 
D
H
 
K
D
 
H
L
 
I
L
 
A
N
 
-
K
 
A
Y
 
S
P
 
A
Y
 
N
R
 
R
I
 
I
L
 
I
K
 
E
C
 
I
E
 
K
K
 
D
G
 
G
K
 
E
L
 
I
L
 
I
D
 
S

Sites not aligning to the query:

5ws4A Crystal structure of tripartite-type abc transporter macb from acinetobacter baumannii (see paper)
33% identity, 88% coverage: 23:226/232 of query aligns to 23:225/650 of 5ws4A

query
sites
5ws4A
I
 
I
L
 
L
Q
 
K
D
 
G
V
 
I
T
 
D
F
 
L
D
 
T
I
 
I
E
 
Y
K
 
E
D
 
G
E
 
E
F
 
L
V
 
V
F
 
A
L
 
I
I
 
V
G
 
G
R
 
Q
T
x
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
|
S
S
 
T
L
 
L
L
 
M
K
 
N
T
 
I
L
 
L
Y
 
G
A
 
C
-
 
L
D
 
D
L
 
R
P
 
P
L
 
T
K
 
S
M
 
G
G
 
S
Y
 
Y
G
 
-
K
 
K
I
 
V
S
 
N
G
 
G
Y
 
Q
D
 
E
L
 
T
K
 
G
E
 
K
I
 
L
K
 
E
T
 
P
K
 
D
D
 
Q
V
 
L
P
 
A
F
 
Q
L
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
E
-
 
Y
L
 
F
G
 
G
I
 
F
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
R
F
 
Y
Q
 
H
L
 
L
F
 
L
T
 
G
D
 
D
R
 
L
T
 
S
V
 
A
A
 
E
E
 
G
N
 
N
L
 
V
Y
 
E
F
 
V
V
 
P
M
 
A
R
 
V
A
 
Y
T
 
A
G
 
G
W
 
V
K
 
T
D
 
-
K
 
P
A
 
A
K
 
D
M
 
R
K
 
K
T
 
Q
R
 
R
M
 
A
V
 
T
E
 
A
V
 
L
L
 
L
M
 
T
R
 
E
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
T
A
 
K
A
 
T
T
 
Q
K
 
N
M
 
R
P
 
P
H
 
S
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
M
N
 
N
H
 
G
P
 
G
S
 
D
I
 
V
L
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
S
E
 
H
V
 
S
A
 
G
D
 
V
G
 
E
I
 
V
F
 
M
K
 
R
L
 
I
F
 
L
Q
 
R
E
 
E
I
 
L
N
 
N
K
 
A
Q
 
A
G
 
G
T
 
H
A
 
T
V
 
I
L
 
I
M
 
L
A
 
V
T
 
T
H
 
H
N
 
D
H
 
M
D
 
Q
L
 
V
L
 
A
N
 
-
K
 
K
Y
 
N
P
 
A
Y
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
I
K
 
E
C
 
I
E
 
S
K
 
D
G
 
G
K
 
E
L
 
I
L
 
I
D
 
S
S
 
D
K
 
R

Query Sequence

>Echvi_2498 FitnessBrowser__Cola:Echvi_2498
MVFSSEPVVRLDKACIFQGITAILQDVTFDIEKDEFVFLIGRTGSGKSSLLKTLYADLPL
KMGYGKISGYDLKEIKTKDVPFLRRKLGIVFQDFQLFTDRTVAENLYFVMRATGWKDKAK
MKTRMVEVLMRVGLGGAATKMPHQLSGGEQQRVVIARALLNHPSILLADEPTGNLDPEVA
DGIFKLFQEINKQGTAVLMATHNHDLLNKYPYRILKCEKGKLLDSKTTEIIK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory